View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20405_low_4 (Length: 378)

Name: NF20405_low_4
Description: NF20405
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20405_low_4
NF20405_low_4
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-378)||(40146992-40147370)
chr5 (1-378)||(213199-213574)
chr5 (1-378)||(5057779-5058154)
chr5 (4-378)||(38746736-38747111)
chr5 (1-378)||(28278046-28278425)
chr5 (1-378)||(27015263-27015632)
chr5 (9-371)||(27637679-27638045)
chr5 (1-165)||(533713-533878)
chr5 (1-165)||(39468608-39468773)
chr5 (1-154)||(13488157-13488312)
chr5 (1-154)||(42428489-42428644)
chr5 (5-378)||(316497-316868)
chr5 (16-264)||(16641011-16641263)
chr5 (1-164)||(42426294-42426458)
chr5 (1-154)||(33831634-33831789)
chr5 (3-164)||(537970-538132)
chr5 (51-378)||(4160365-4160690)
chr5 (1-165)||(25412706-25412869)
chr5 (2-378)||(35615903-35616278)
chr5 (1-154)||(8566005-8566160)
chr5 (1-154)||(32636778-32636933)
chr5 (1-165)||(28750714-28750879)
chr5 (1-165)||(13239696-13239860)
chr5 (5-165)||(31182917-31183076)
chr5 (3-375)||(33906091-33906462)
chr5 (16-165)||(5887490-5887640)
chr5 (1-154)||(16452035-16452189)
chr5 (1-165)||(13343005-13343169)
chr5 (1-165)||(30182533-30182697)
chr5 (2-165)||(3075718-3075882)
chr5 (1-164)||(9049401-9049565)
chr5 (1-165)||(36074102-36074268)
chr5 (1-154)||(42309994-42310149)
chr5 (1-172)||(13695749-13695923)
chr5 (43-165)||(19806328-19806449)
chr5 (1-154)||(30682981-30683134)
chr5 (151-378)||(14689622-14689844)
chr5 (1-109)||(16409475-16409584)
chr5 (161-365)||(21205873-21206076)
chr5 (1-165)||(37439078-37439250)
chr5 (1-109)||(18441707-18441816)
chr5 (1-109)||(26177883-26177991)
chr5 (1-109)||(9789283-9789392)
chr5 (267-378)||(10055032-10055143)
chr5 (271-378)||(16642208-16642313)
chr5 (97-164)||(42926838-42926905)
chr5 (268-378)||(30802673-30802782)
chr5 (47-238)||(10700753-10700945)
chr5 (18-104)||(30802835-30802920)
chr5 (9-66)||(42926911-42926968)
chr5 (268-378)||(30792972-30793080)
chr5 (18-167)||(3325855-3326005)
chr5 (40-109)||(26170774-26170842)
chr5 (138-233)||(8019464-8019557)
chr5 (2-104)||(10054876-10054978)
chr5 (1-109)||(22536349-22536457)
chr5 (1-109)||(29720364-29720473)
chr5 (1-109)||(29722524-29722633)
chr5 (1-109)||(29751219-29751328)
chr5 (1-97)||(22097877-22097972)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-378)||(1631791-1632169)
chr2 (1-378)||(35446943-35447321)
chr2 (1-378)||(45726661-45727038)
chr2 (5-378)||(42288173-42288546)
chr2 (30-378)||(17450322-17450670)
chr2 (5-378)||(24397788-24398163)
chr2 (4-378)||(33647900-33648278)
chr2 (1-167)||(33162509-33162676)
chr2 (1-154)||(36318068-36318223)
chr2 (1-165)||(38312184-38312349)
chr2 (1-165)||(723803-723968)
chr2 (1-165)||(29867813-29867978)
chr2 (1-165)||(36773506-36773671)
chr2 (1-165)||(42362296-42362461)
chr2 (1-154)||(17057428-17057583)
chr2 (1-154)||(17085411-17085566)
chr2 (1-165)||(34139829-34139995)
chr2 (1-165)||(11690445-11690610)
chr2 (1-165)||(14633884-14634050)
chr2 (1-165)||(2334477-2334641)
chr2 (9-165)||(11067249-11067406)
chr2 (1-165)||(11151650-11151815)
chr2 (1-165)||(5723315-5723478)
chr2 (1-165)||(13121712-13121876)
chr2 (1-165)||(45099699-45099863)
chr2 (8-165)||(24885605-24885763)
chr2 (1-165)||(36988135-36988299)
chr2 (1-155)||(6595065-6595221)
chr2 (155-378)||(42261826-42262046)
chr2 (1-165)||(4503192-4503356)
chr2 (3-165)||(11049493-11049661)
chr2 (18-317)||(30218121-30218410)
chr2 (7-165)||(36205730-36205887)
chr2 (1-165)||(7815332-7815498)
chr2 (1-167)||(17490207-17490368)
chr2 (1-165)||(4484389-4484554)
chr2 (251-378)||(7451031-7451158)
chr2 (2-165)||(12123644-12123809)
chr2 (1-165)||(30833290-30833455)
chr2 (66-165)||(39284829-39284929)
chr2 (40-165)||(14202503-14202631)
chr2 (1-115)||(26353178-26353293)
chr2 (3-109)||(32289565-32289671)
chr2 (1-62)||(7451166-7451227)
chr2 (2-88)||(42261545-42261632)
chr2 (161-266)||(43730991-43731093)
chr2 (2-88)||(34811281-34811368)
chr2 (1-109)||(6266691-6266800)
chr2 (22-88)||(41446161-41446227)
chr2 (98-165)||(5700279-5700347)
chr2 (6-145)||(7597074-7597217)
chr2 (2-88)||(41454256-41454343)
chr2 (138-176)||(24197829-24197867)
chr2 (18-64)||(42019949-42019995)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-378)||(7059-7436)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (1-378)||(54882751-54883129)
chr4 (1-378)||(8665138-8665517)
chr4 (1-378)||(50673906-50674283)
chr4 (3-378)||(50262762-50263135)
chr4 (5-378)||(8647869-8648244)
chr4 (1-378)||(12073124-12073501)
chr4 (1-378)||(46703232-46703610)
chr4 (1-378)||(6655687-6656065)
chr4 (19-371)||(55085442-55085795)
chr4 (1-378)||(379110-379489)
chr4 (1-378)||(41964148-41964525)
chr4 (1-378)||(35662173-35662550)
chr4 (1-378)||(2209439-2209823)
chr4 (1-378)||(27417024-27417388)
chr4 (1-368)||(12119281-12119649)
chr4 (152-378)||(26363996-26364222)
chr4 (1-220)||(40632334-40632554)
chr4 (109-378)||(33989594-33989862)
chr4 (215-378)||(40630715-40630878)
chr4 (1-190)||(41639345-41639535)
chr4 (1-165)||(26175695-26175860)
chr4 (2-165)||(54199966-54200130)
chr4 (18-378)||(26699519-26699884)
chr4 (1-154)||(36994478-36994633)
chr4 (1-378)||(33089630-33089988)
chr4 (1-167)||(36463448-36463615)
chr4 (1-378)||(22882809-22883189)
chr4 (1-378)||(22934473-22934853)
chr4 (1-165)||(5429623-5429788)
chr4 (1-165)||(9927517-9927681)
chr4 (1-165)||(47038470-47038633)
chr4 (5-169)||(21688188-21688354)
chr4 (1-165)||(24969055-24969221)
chr4 (1-165)||(34570473-34570638)
chr4 (1-165)||(37740570-37740734)
chr4 (1-165)||(52095421-52095586)
chr4 (1-165)||(56178696-56178860)
chr4 (1-164)||(12745495-12745659)
chr4 (211-378)||(46569816-46569983)
chr4 (1-165)||(12739609-12739774)
chr4 (1-165)||(12747815-12747980)
chr4 (1-154)||(48893697-48893856)
chr4 (1-165)||(48142986-48143152)
chr4 (1-165)||(5871764-5871929)
chr4 (1-165)||(52467413-52467579)
chr4 (163-378)||(3785822-3786034)
chr4 (22-165)||(41639207-41639351)
chr4 (3-163)||(31474096-31474258)
chr4 (1-165)||(52082716-52082881)
chr4 (1-122)||(26364223-26364345)
chr4 (1-148)||(3913408-3913557)
chr4 (1-165)||(4587902-4588068)
chr4 (1-165)||(29254438-29254603)
chr4 (1-165)||(37229780-37229947)
chr4 (1-120)||(46147450-46147570)
chr4 (1-164)||(5207901-5208066)
chr4 (1-165)||(6542238-6542405)
chr4 (1-163)||(5370142-5370308)
chr4 (1-154)||(29999865-30000019)
chr4 (43-211)||(35369542-35369711)
chr4 (1-165)||(45687241-45687407)
chr4 (5-167)||(48142440-48142605)
chr4 (1-97)||(12743984-12744080)
chr4 (1-97)||(12745373-12745469)
chr4 (165-328)||(34112392-34112555)
chr4 (1-88)||(12744106-12744193)
chr4 (2-154)||(51337018-51337172)
chr4 (18-264)||(32091324-32091570)
chr4 (151-256)||(41961264-41961368)
chr4 (43-378)||(35370449-35370774)
chr4 (60-165)||(13009549-13009655)
chr4 (1-165)||(13992352-13992509)
chr4 (18-136)||(53345189-53345309)
chr4 (18-96)||(5349924-5350002)
chr4 (315-378)||(10072002-10072065)
chr4 (18-165)||(29056301-29056450)
chr4 (318-378)||(10071616-10071676)
chr4 (18-165)||(6677412-6677561)
chr4 (152-378)||(25723433-25723653)
chr4 (3-109)||(31495377-31495485)
chr4 (18-98)||(34788851-34788930)
chr4 (267-378)||(38811405-38811515)
chr4 (2-88)||(34112839-34112926)
chr4 (324-378)||(8653331-8653385)
chr4 (18-87)||(33989867-33989936)
chr4 (4-104)||(44570427-44570527)
chr4 (2-165)||(52065540-52065706)
chr4 (2-97)||(16422666-16422761)
chr4 (21-97)||(1983250-1983325)
chr4 (198-371)||(22629147-22629318)
chr4 (216-368)||(6200139-6200291)
chr4 (18-98)||(44967906-44967985)
chr4 (160-212)||(6719479-6719531)
[»] chr1 (87 HSPs)
chr1 (1-378)||(37168028-37168407)
chr1 (1-378)||(13547148-13547526)
chr1 (1-378)||(11348429-11348807)
chr1 (1-378)||(37033131-37033510)
chr1 (1-378)||(13549059-13549437)
chr1 (1-378)||(29135979-29136356)
chr1 (1-378)||(42298034-42298412)
chr1 (40-378)||(37879009-37879348)
chr1 (1-378)||(193343-193720)
chr1 (1-378)||(34603307-34603686)
chr1 (1-378)||(47114903-47115281)
chr1 (1-378)||(47255399-47255771)
chr1 (2-378)||(7482290-7482668)
chr1 (1-362)||(19754238-19754604)
chr1 (1-334)||(31925766-31926099)
chr1 (4-365)||(19752430-19752792)
chr1 (113-378)||(28242120-28242385)
chr1 (158-378)||(34602557-34602776)
chr1 (1-154)||(31659192-31659347)
chr1 (1-165)||(834226-834391)
chr1 (1-149)||(49918309-49918459)
chr1 (1-163)||(13138035-13138196)
chr1 (1-154)||(28220285-28220440)
chr1 (1-165)||(28265613-28265778)
chr1 (1-154)||(3156820-3156974)
chr1 (16-165)||(10925167-10925317)
chr1 (1-165)||(44455104-44455269)
chr1 (1-165)||(50169269-50169434)
chr1 (1-165)||(41360859-41361023)
chr1 (18-378)||(41135552-41135912)
chr1 (2-167)||(15820249-15820415)
chr1 (1-165)||(196967-197132)
chr1 (1-165)||(3847180-3847345)
chr1 (1-165)||(28223480-28223645)
chr1 (1-165)||(50167234-50167399)
chr1 (1-164)||(1833467-1833631)
chr1 (1-154)||(37503616-37503768)
chr1 (5-154)||(4552700-4552851)
chr1 (1-154)||(8550846-8551001)
chr1 (1-154)||(13659395-13659550)
chr1 (1-154)||(46064872-46065027)
chr1 (1-165)||(928035-928202)
chr1 (2-154)||(37559928-37560083)
chr1 (1-165)||(23555324-23555489)
chr1 (1-165)||(3189275-3189439)
chr1 (1-165)||(3198092-3198256)
chr1 (1-165)||(3206931-3207095)
chr1 (1-154)||(45644413-45644569)
chr1 (1-165)||(20762616-20762781)
chr1 (1-378)||(6808179-6808562)
chr1 (1-145)||(16455585-16455730)
chr1 (5-274)||(22079158-22079422)
chr1 (5-165)||(30476509-30476672)
chr1 (5-164)||(40122261-40122421)
chr1 (1-109)||(13316411-13316520)
chr1 (18-150)||(37282768-37282901)
chr1 (23-153)||(8871129-8871259)
chr1 (2-263)||(25651931-25652195)
chr1 (179-324)||(12318720-12318864)
chr1 (220-378)||(9109680-9109838)
chr1 (18-99)||(3460706-3460788)
chr1 (5-124)||(12318585-12318706)
chr1 (1-154)||(51765349-51765506)
chr1 (18-166)||(44650239-44650389)
chr1 (250-327)||(4535783-4535861)
chr1 (29-98)||(36683702-36683771)
chr1 (155-235)||(3331428-3331505)
chr1 (2-104)||(16914234-16914338)
chr1 (1-109)||(9987202-9987310)
chr1 (40-109)||(20622337-20622406)
chr1 (18-165)||(1050520-1050668)
chr1 (152-378)||(16216709-16216930)
chr1 (1-109)||(9036417-9036525)
chr1 (18-124)||(9109496-9109603)
chr1 (1-109)||(40282377-40282486)
chr1 (1-73)||(2263033-2263106)
chr1 (330-370)||(3331283-3331323)
chr1 (338-378)||(22079066-22079106)
chr1 (343-378)||(31928210-31928245)
chr1 (3-88)||(4535541-4535627)
chr1 (189-231)||(6068471-6068512)
chr1 (1-104)||(13938143-13938247)
chr1 (1-85)||(32471486-32471570)
chr1 (1-38)||(37876825-37876862)
chr1 (40-166)||(44646882-44647010)
chr1 (152-224)||(10157501-10157571)
chr1 (26-88)||(35109496-35109557)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (1-378)||(42435050-42435428)
chr8 (1-372)||(40221482-40221854)
chr8 (5-378)||(11383717-11384090)
chr8 (1-378)||(40328510-40328889)
chr8 (1-313)||(4283320-4283633)
chr8 (1-361)||(44353540-44353902)
chr8 (1-264)||(18655246-18655509)
chr8 (1-166)||(10930258-10930424)
chr8 (1-154)||(27811232-27811387)
chr8 (1-165)||(4731602-4731767)
chr8 (5-165)||(15212730-15212891)
chr8 (1-165)||(18141764-18141929)
chr8 (1-165)||(33352094-33352259)
chr8 (1-165)||(43036367-43036532)
chr8 (1-165)||(30143286-30143449)
chr8 (1-165)||(19491758-19491922)
chr8 (1-165)||(9765693-9765854)
chr8 (1-165)||(30291549-30291716)
chr8 (1-165)||(1292522-1292687)
chr8 (1-167)||(1345430-1345597)
chr8 (1-167)||(5689213-5689380)
chr8 (1-167)||(40321022-40321189)
chr8 (1-165)||(3303729-3303894)
chr8 (1-153)||(42498149-42498303)
chr8 (2-163)||(8965751-8965914)
chr8 (1-165)||(31218201-31218366)
chr8 (1-154)||(34254390-34254543)
chr8 (1-154)||(34256566-34256719)
chr8 (2-165)||(18106139-18106302)
chr8 (4-154)||(4162454-4162603)
chr8 (1-165)||(17982597-17982762)
chr8 (1-165)||(6598916-6599081)
chr8 (1-165)||(6674369-6674534)
chr8 (5-165)||(12702697-12702862)
chr8 (1-165)||(44303798-44303964)
chr8 (1-165)||(1746278-1746442)
chr8 (1-154)||(19945418-19945574)
chr8 (1-136)||(3772164-3772301)
chr8 (253-378)||(22976265-22976389)
chr8 (1-164)||(41366673-41366837)
chr8 (177-378)||(40585456-40585656)
chr8 (40-154)||(10929753-10929869)
chr8 (29-165)||(4743291-4743427)
chr8 (21-165)||(41364926-41365071)
chr8 (244-378)||(2999823-2999957)
chr8 (18-119)||(1822282-1822384)
chr8 (18-119)||(1856727-1856829)
chr8 (44-265)||(33655407-33655628)
chr8 (3-165)||(8153705-8153865)
chr8 (1-205)||(10240061-10240264)
chr8 (1-72)||(10015119-10015189)
chr8 (1-109)||(2627735-2627845)
chr8 (189-378)||(3846068-3846254)
chr8 (220-329)||(9633816-9633925)
chr8 (155-235)||(10020321-10020398)
chr8 (1-76)||(11712059-11712135)
chr8 (18-88)||(3231872-3231943)
chr8 (18-76)||(7597648-7597706)
chr8 (139-265)||(10101351-10101475)
chr8 (128-235)||(40535713-40535819)
chr8 (1-109)||(25689955-25690063)
chr8 (289-328)||(3817680-3817720)
chr8 (338-378)||(4283277-4283317)
chr8 (330-370)||(10020179-10020219)
chr8 (18-62)||(11137073-11137117)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-372)||(2361031-2361402)
chr7 (1-378)||(34310775-34311153)
chr7 (1-378)||(6431702-6432080)
chr7 (1-378)||(4512449-4512826)
chr7 (1-378)||(2390013-2390391)
chr7 (1-378)||(29608472-29608846)
chr7 (1-351)||(48599393-48599744)
chr7 (1-353)||(4508765-4509117)
chr7 (1-353)||(4510607-4510959)
chr7 (1-378)||(22269706-22270082)
chr7 (1-378)||(3258727-3259104)
chr7 (1-326)||(8359375-8359703)
chr7 (102-376)||(6360073-6360347)
chr7 (21-376)||(22328470-22328834)
chr7 (1-154)||(47674002-47674157)
chr7 (3-165)||(1113601-1113764)
chr7 (1-165)||(27347761-27347926)
chr7 (1-153)||(30024791-30024945)
chr7 (5-165)||(31733032-31733193)
chr7 (1-165)||(47676195-47676360)
chr7 (1-165)||(48491523-48491688)
chr7 (1-165)||(4586105-4586270)
chr7 (1-165)||(43864188-43864353)
chr7 (1-164)||(26417261-26417425)
chr7 (1-154)||(14069892-14070047)
chr7 (1-154)||(14379920-14380075)
chr7 (1-165)||(36146467-36146633)
chr7 (1-165)||(18126588-18126753)
chr7 (1-165)||(38671281-38671446)
chr7 (1-154)||(31105452-31105607)
chr7 (1-165)||(8153286-8153451)
chr7 (1-165)||(35853859-35854023)
chr7 (1-165)||(41317493-41317658)
chr7 (1-167)||(23554982-23555149)
chr7 (1-151)||(31518752-31518904)
chr7 (1-165)||(41649070-41649234)
chr7 (1-165)||(48489375-48489540)
chr7 (1-164)||(496042-496206)
chr7 (1-165)||(29990999-29991162)
chr7 (24-165)||(12097941-12098083)
chr7 (1-165)||(4178719-4178882)
chr7 (29-165)||(4538627-4538764)
chr7 (1-159)||(23565120-23565280)
chr7 (5-165)||(4253591-4253754)
chr7 (1-165)||(19502122-19502287)
chr7 (31-165)||(24525985-24526121)
chr7 (5-149)||(23343934-23344080)
chr7 (1-164)||(25767019-25767180)
chr7 (294-378)||(32358189-32358273)
chr7 (1-165)||(36574574-36574740)
chr7 (1-78)||(32358113-32358190)
chr7 (1-165)||(48408747-48408913)
chr7 (1-84)||(2759256-2759339)
chr7 (1-98)||(25615865-25615962)
chr7 (17-266)||(1360226-1360479)
chr7 (1-165)||(39731321-39731478)
chr7 (3-67)||(6360013-6360077)
chr7 (46-165)||(5514113-5514234)
chr7 (1-98)||(31518915-31519011)
chr7 (79-165)||(2761439-2761526)
chr7 (192-378)||(5116366-5116551)
chr7 (2-109)||(43504214-43504323)
chr7 (97-165)||(24514917-24514984)
chr7 (193-368)||(43363667-43363839)
chr7 (2-160)||(3904676-3904837)
chr7 (151-231)||(37545121-37545199)
chr7 (2-88)||(5116626-5116713)
chr7 (294-370)||(22552791-22552866)
chr7 (138-285)||(23794024-23794169)
chr7 (24-98)||(43363556-43363629)
chr7 (1-109)||(20343897-20344006)
chr7 (1-36)||(24525561-24525596)
chr7 (40-109)||(6592440-6592509)
chr7 (98-165)||(30843389-30843457)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (1-378)||(6095658-6096036)
chr3 (1-378)||(34490944-34491321)
chr3 (1-378)||(49199528-49199908)
chr3 (1-378)||(30235856-30236234)
chr3 (1-378)||(54593436-54593813)
chr3 (1-378)||(46860202-46860583)
chr3 (1-378)||(47303983-47304360)
chr3 (1-378)||(4569682-4570061)
chr3 (9-378)||(36018582-36018954)
chr3 (1-378)||(43401860-43402227)
chr3 (9-378)||(41819589-41819958)
chr3 (1-378)||(43403803-43404170)
chr3 (40-378)||(55302079-55302402)
chr3 (18-376)||(5433952-5434313)
chr3 (102-378)||(40913069-40913350)
chr3 (9-197)||(31340268-31340457)
chr3 (5-165)||(5236519-5236680)
chr3 (1-165)||(44700537-44700703)
chr3 (1-165)||(40734442-40734607)
chr3 (1-165)||(44331489-44331654)
chr3 (1-164)||(46173311-46173466)
chr3 (1-165)||(29196445-29196612)
chr3 (1-154)||(40735337-40735492)
chr3 (1-165)||(22835061-22835226)
chr3 (1-154)||(51398768-51398923)
chr3 (1-165)||(19683948-19684113)
chr3 (1-165)||(29810812-29810977)
chr3 (1-165)||(31314389-31314554)
chr3 (1-165)||(9581227-9581391)
chr3 (1-165)||(760791-760956)
chr3 (1-165)||(29682303-29682468)
chr3 (1-165)||(45095109-45095272)
chr3 (1-154)||(16498984-16499138)
chr3 (1-154)||(53921562-53921717)
chr3 (1-165)||(5258203-5258368)
chr3 (1-166)||(9666525-9666693)
chr3 (1-154)||(7762220-7762374)
chr3 (1-154)||(29813017-29813172)
chr3 (1-165)||(37408403-37408567)
chr3 (1-165)||(39153420-39153585)
chr3 (1-163)||(32891049-32891213)
chr3 (1-165)||(5260382-5260547)
chr3 (1-154)||(7764422-7764573)
chr3 (1-326)||(35138764-35139091)
chr3 (2-247)||(26323133-26323381)
chr3 (155-326)||(1683270-1683440)
chr3 (1-165)||(23391968-23392133)
chr3 (2-165)||(23200198-23200360)
chr3 (1-154)||(9636185-9636340)
chr3 (2-165)||(23197999-23198161)
chr3 (16-154)||(23410403-23410543)
chr3 (237-378)||(28074348-28074488)
chr3 (5-322)||(20937444-20937762)
chr3 (43-378)||(39127290-39127614)
chr3 (157-378)||(34795601-34795819)
chr3 (58-151)||(26386597-26386692)
chr3 (1-96)||(32744495-32744589)
chr3 (17-141)||(5373198-5373326)
chr3 (1-124)||(51352170-51352293)
chr3 (1-109)||(801091-801201)
chr3 (1-106)||(7780063-7780168)
chr3 (2-90)||(25491027-25491116)
chr3 (18-159)||(8166533-8166677)
chr3 (40-165)||(2075156-2075281)
chr3 (6-104)||(3148054-3148153)
chr3 (1-104)||(4055822-4055926)
chr3 (40-98)||(28253365-28253423)
chr3 (313-368)||(31340448-31340503)
chr3 (1-109)||(6716500-6716608)
chr3 (249-378)||(26323821-26323949)
chr3 (1-51)||(40913352-40913402)
chr3 (1-109)||(54635125-54635233)
chr3 (22-88)||(4386876-4386941)
chr3 (155-213)||(36796692-36796749)
chr3 (207-265)||(50432840-50432898)
chr3 (1-88)||(54739012-54739100)
chr3 (1-76)||(33191866-33191940)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-378)||(2972998-2973376)
chr6 (1-378)||(21593397-21593773)
chr6 (3-378)||(5043359-5043734)
chr6 (1-378)||(17762718-17763099)
chr6 (1-378)||(3808767-3809146)
chr6 (1-378)||(603147-603517)
chr6 (1-372)||(26830182-26830555)
chr6 (9-374)||(22424892-22425260)
chr6 (198-378)||(17757813-17757995)
chr6 (1-165)||(9183090-9183255)
chr6 (1-165)||(28137467-28137632)
chr6 (1-127)||(21588913-21589040)
chr6 (1-137)||(17757994-17758132)
chr6 (1-165)||(26954345-26954509)
chr6 (1-165)||(3038962-3039127)
chr6 (1-165)||(5406259-5406422)
chr6 (1-165)||(5410584-5410747)
chr6 (1-165)||(2171591-2171754)
chr6 (9-165)||(33211252-33211409)
chr6 (1-165)||(5413453-5413616)
chr6 (1-154)||(31404734-31404887)
chr6 (1-154)||(30834595-30834750)
chr6 (1-154)||(16452388-16452543)
chr6 (1-213)||(25073463-25073678)
chr6 (1-167)||(4045364-4045533)
chr6 (249-378)||(26800502-26800630)
chr6 (1-165)||(33160411-33160577)
chr6 (129-271)||(5740978-5741120)
chr6 (2-109)||(3072819-3072928)
chr6 (217-378)||(25072917-25073076)
chr6 (40-105)||(16569037-16569104)
chr6 (1-109)||(412101-412211)
chr6 (141-265)||(11660452-11660574)
chr6 (40-109)||(6097539-6097608)
chr6 (42-154)||(16567160-16567265)
chr6 (9-67)||(26800630-26800689)
chr6 (18-104)||(5740074-5740160)
chr6 (1-109)||(27647861-27647969)
chr6 (1-109)||(16554869-16554978)
chr6 (1-109)||(16631425-16631534)
chr6 (18-88)||(186736-186806)
chr6 (1-34)||(5409128-5409161)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (2-378)||(80343-80720)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-378)||(18063-18438)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-378)||(11289-11666)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-154)||(149156-149311)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-165)||(114547-114711)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-136)||(434504-434642)
scaffold0002 (155-378)||(490661-490881)
scaffold0002 (2-88)||(490380-490467)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (5-154)||(20478-20629)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (1-165)||(861-1024)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-165)||(11220-11385)
scaffold0491 (1-165)||(8794-8959)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (135-377)||(1591-1841)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-124)||(10475-10598)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (2-161)||(25000-25162)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (18-65)||(27519-27566)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40147370 - 40146992
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40147370 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttccca 40147271  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147270 atctcaccaatgaacaagacactcatgatttccactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 40147171  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40147170 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 40147071  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40147070 atcttccccaaaaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 40146992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 213574 - 213199
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  213574 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 213475  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||    
T  213474 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc----ct 213379  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  213378 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 213279  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttct-ctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  213278 atcttctccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagctttga 213199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5058154 - 5057779
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5058154 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaacaaccctaatttctacccattttccca 5058057  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058056 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactcttccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 5057957  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5057956 tagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatga 5057857  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5057856 atcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaaaagc-ccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctttga 5057779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38747111 - 38746736
Alignment:
Q  4 ctatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatc 102  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38747111 ctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 38747012  T
Q  103 tcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 202  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38747011 tcattaatgaacaagatactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 38746912  T
Q  203 cctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatc 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  38746911 cctttgatttcaataaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatc 38746812  T
Q  303 ttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38746811 ttccccaaaaggcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttga 38746736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28278425 - 28278046
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  28278425 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttccca 28278326  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28278325 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaaccct 28278226  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28278225 tagcatttgatttcactaacaatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatga 28278126  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-ctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28278125 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 28278046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27015632 - 27015263
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  27015632 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt--------attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttccca 27015541  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015540 atctcaccaatgaccaa-acactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 27015442  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27015441 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 27015342  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27015341 ttcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttga 27015263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 27637679 - 27638045
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatctcac 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27637679 aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcac 27637778  T
Q  107 caatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcct 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  27637779 caatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaacaaacttttagtct 27637878  T
Q  206 ttgatttcactaaggatct--tctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct 303  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27637879 ttgatttcactaaggatcttctctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaatct 27637978  T
Q  304 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaa 371  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27637979 t-cccaaaatgcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaa 27638045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 533878 - 533713
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  533878 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttccca 533779  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  533778 atctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 39468608 - 39468773
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39468608 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 39468707  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  39468708 atctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13488312 - 13488157
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13488312 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 13488213  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13488212 atcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaat 13488157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 42428489 - 42428644
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||    
T  42428489 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttccca 42428588  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42428589 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 316868 - 316497
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  316868 tatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttcta-cctttttctcaatc 316770  T
Q  103 tca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 200  Q
    |   ||  | ||||||| || || |||||| ||||| ||| || | ||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316769 ttttcccctaaacaagagacccaatgattt-cactcacccgagtttttcccaattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 316671  T
Q  201 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaa 300  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||| | |||||  |||||    
T  316670 agcctttgatttc-ct-aggattttctcttttggtctcccaagattc-accaagttgctcac-aaagactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaa 316575  T
Q  301 tct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  316574 tctctccccaaaaggcaccaaccc-tctcccaagagcccccccttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 316497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Original strand, 16641011 - 16641263
Alignment:
Q  16 tcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacc-ctaatttctatccattttc----caatctcaccaat 110  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     ||||||| |||||    
T  16641011 tcttacaaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttcta-ccatttttttctcaatctcgccaat 16641109  T
Q  111 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttga 209  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16641110 gaacaagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttga 16641209  T
Q  210 tttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaa 264  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16641210 ttt-tttaagtatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgttcacaa 16641263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 42426294 - 42426458
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42426294 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 42426393  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42426394 atctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42426458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33831789 - 33831634
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  33831789 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttcca 33831690  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33831689 atctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 33831634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 538132 - 537970
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  538132 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaat 538033  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  538032 ctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4160690 - 4160365
Alignment:
Q  51 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa-tctcacca-atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtt 148  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |  |||| ||| ||| ||||   ||||||||  |||| |||||    
T  4160690 agcttcaacaagttctccaagaacaaacctaatttcta-ccattttccaaatctcctctcatgagcaaaacattcattgatttcactcaaccaatgtgtt 4160592  T
Q  149 tacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcg 248  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  4160591 tacaattgtttctcaactctg-aatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttaattac-ctaaggatcttctcttttggtttcccaagattca 4160494  T
Q  249 cccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttg 347  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||  |||| | || ||||||| |||| ||||     
T  4160493 ccctagttgctcacaaatgactctccacttacgtgttcc-caaccctatgaatctctccccaaaagacacttaccc-tctcccaagagccccctctttta 4160396  T
Q  348 gttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| | ||||||| |||| || ||||||    
T  4160395 gttctccaggattcacttctttaaactttga 4160365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25412869 - 25412706
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  25412869 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaa 25412770  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25412769 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 25412706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35615903
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||  |||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcatttctcaa 35616179  T
Q  101 tctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||  ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||     
T  35616178 tctcttcccgtgaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaaccac-aaaagagaatcaact 35616081  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    || |||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||| |||||| |  | ||||||| | |||| ||||    
T  35616080 ct-agcctttgatttct-tgatgatcttcgcttttggtttcccaagactcaccaaagttgattacaaa-gactcttcttttatgtgtttctcaactccat 35615984  T
Q  298 gaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35615983 gaatctctccccaaaaggcatcacccctttcc-caagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 35615903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 8566005 - 8566160
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  8566005 ccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctca 8566104  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8566105 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32636933 - 32636778
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  32636933 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttccca 32636834  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32636833 atctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28750714 - 28750879
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28750714 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttccca 28750813  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28750814 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaa-tgtttcccaac 28750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13239860 - 13239696
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca--ttttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  13239860 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttcta-ccattttttcc 13239762  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13239761 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31183076 - 31182917
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctc 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31183076 tatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggt-tacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccattttccaatctc 31182978  T
Q  105 accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  31182977 acaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 375
Target Start/End: Original strand, 33906091 - 33906462
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaat 101  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || | |||||||| || ||||||  ||||    
T  33906091 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccatttcacaat 33906190  T
Q  102 ctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctataatctaaccccc-aaaagagaaccaacc 197  Q
     ||  || ||||    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||   |||  |    
T  33906191 ttcttcccatga----gacactcaatgatgttcactctcgcaaggtgtttctcatttgtttcacaactctagaatatatccccccaaaagaacgccagtc 33906286  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  33906287 attagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcac-taagtctctcctttgatgtgtttctcaaccccat 33906384  T
Q  298 gaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctt 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  33906385 gaatctctccccaaaaggcaccaaccc-tctcccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggctt 33906462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 5887490 - 5887640
Alignment:
Q  16 tcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatctcaccaatgaac 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5887490 tcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaac 5887589  T
Q  115 aagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5887590 aagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5887640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16452189 - 16452035
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  16452189 ccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttcca 16452090  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16452089 atctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcact-taccaaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13343169 - 13343005
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  13343169 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 13343071  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343070 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30182697 - 30182533
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  30182697 ccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccc 30182599  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30182598 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttgcaa-tgtttcccaac 30182533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 3075718 - 3075882
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caa 100  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||    
T  3075718 cactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaa 3075817  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3075818 tctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatcaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3075882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 9049401 - 9049565
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  9049401 ccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttctatcattttcccaa 9049500  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9049501 actcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttacaaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 36074102 - 36074268
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---- 96  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||        
T  36074102 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttc 36074200  T
Q  97 ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074201 ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36074268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 42309994 - 42310149
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||| |||| ||    
T  42309994 ccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctca 42310093  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  42310094 atctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaat 42310149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 13695749 - 13695923
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||    
T  13695749 ccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttccc 13695848  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataa 172  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  13695849 aatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcacacaaggtgtttacaaatgttttccagctcaataa 13695923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19806449 - 19806328
Alignment:
Q  43 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  19806449 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcaccc 19806352  T
Q  141 aaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  19806351 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19806328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 30682981 - 30683134
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgaga--tcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-c 97  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || |||| |    
T  30682981 ccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag---aaccctaatttctaccctttttcc 30683077  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30683078 caatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 378
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689844
Alignment:
Q  151 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcc 250  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||   |    
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcccc-aaaagagaaccaacccctagcctttgattt-tctaaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatc 14689719  T
Q  251 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggtt 350  Q
     ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| | ||  | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||    
T  14689720 taagttgctcac-aaatactctccttttatgtgtttcccattctcacgaatc-tctccaaaaggcaccaaccc-tttcacaagaaccccttcttttggtt 14689816  T
Q  351 ctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  14689817 ctccaaaattcacatcttgaaactttga 14689844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16409584 - 16409475
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16409584 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcca 16409485  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  16409484 atctcaccaa 16409475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 365
Target Start/End: Original strand, 21205873 - 21206076
Alignment:
Q  161 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctc 260  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || | || ||||| || ||     
T  21205873 ccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttgatttca-taaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctg 21205971  T
Q  261 acaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagat 359  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||| || |||  ||||| |||||||||||| || |||| | || | |||||||||||||||||    
T  21205972 acaaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaacctctccgaaaaagacaccaaccctttcca-aagaaccccatcttttggttctctaagat 21206070  T
Q  360 tcacat 365  Q
    ||||||    
T  21206071 tcacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37439250 - 37439078
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta---tccatttt- 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||   |  |||||     
T  37439250 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttattttt 37439151  T
Q  97 -----ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37439150 ccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 37439078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18441707 - 18441816
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  18441707 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccctttttcca 18441806  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  18441807 atctcaccaa 18441816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26177991 - 26177883
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26177991 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-cccttttcca 26177893  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  26177892 atctcaccaa 26177883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 9789283 - 9789392
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  9789283 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccctttttcca 9789382  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  9789383 atctcaccaa 9789392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Original strand, 10055032 - 10055143
Alignment:
Q  267 gactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacat 365  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  10055032 gactctctactcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacctttcc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacat 10055130  T
Q  366 cttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||    
T  10055131 cttgaagctttga 10055143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 378
Target Start/End: Original strand, 16642208 - 16642313
Alignment:
Q  271 ctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttg 369  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16642208 ctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttcc-caagagc--cctcttttggttcttcaagattcacttcttg 16642304  T
Q  370 aagctttga 378  Q
    |||||||||    
T  16642305 aagctttga 16642313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42926905 - 42926838
Alignment:
Q  97 ccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926905 ccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30802782 - 30802673
Alignment:
Q  268 actctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatc 366  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  30802782 actctccactcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccctttcc-caagagcctcctcttttggttctctaaga-taacatc 30802685  T
Q  367 ttgaagctttga 378  Q
     |||||||||||    
T  30802684 atgaagctttga 30802673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 10700753 - 10700945
Alignment:
Q  47 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatct-caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 144  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||      |||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||    
T  10700753 aattagcttcaacaagctctctaagaacaaacctaatttctaccttttttccaatctattttcatgaacaaaatactcaatgattttcacgcacccaagg 10700852  T
Q  145 tgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttc 238  Q
    ||||| | ||||||||||||  | || |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||    
T  10700853 tgtttcctaattgtttcccatttttagaatctagcccccaaaag-tcaccaaaccttagccttttatttc-ctgaggatcttcacgtttggtttc 10700945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 30802920 - 30802835
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctc 104  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  30802920 ttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttcaatctc 30802835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926911
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctca 66  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctca 42926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30793080 - 30792972
Alignment:
Q  268 actctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatc 366  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  | ||||||||||||| |||| | |||||    
T  30793080 actctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaa-ccttttcccaa-agccacatattttggttctccaaga-taacatc 30792984  T
Q  367 ttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||    
T  30792983 ttgaagctttga 30792972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3326005 - 3325855
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctc-accaatgaacaa 116  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| |  |||| |||| ||  || | ||||||    
T  3326005 ttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaatttctacctttttttcaatttcttcctaagaacaa 3325906  T
Q  117 gacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    || || ||    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3325905 gatacccaatggtttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttctcaactc 3325855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26170842 - 26170774
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26170842 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-cccttttccaatctcaccaa 26170774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8019557 - 8019464
Alignment:
Q  138 cccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttg 233  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  8019557 cccaaggtgtttcctaattatttcccaactatagaatctaacccccaaaa-ataaccaa-ccttagcctttgattt-tctaaggatcttcacttttg 8019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 10054876 - 10054978
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatc-ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||   |||||||| | ||||||||| ||||||  |||    
T  10054876 cactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaaggt-tataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaacaaacataatttctacccatttctcaa 10054974  T
Q  101 tctc 104  Q
    ||||    
T  10054975 tctc 10054978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22536349 - 22536457
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  22536349 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 22536446  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  22536447 aatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29720473 - 29720364
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  29720473 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttccc 29720375  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  29720374 aatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29722633 - 29722524
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  29722633 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttccc 29722535  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  29722534 aatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 29751219 - 29751328
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  29751219 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 29751317  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  29751318 aatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22097972 - 22097877
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22097972 ccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctaccctttttc 22097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 1631791 - 1632169
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  1631791 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttcca 1631890  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631891 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 1631990  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1631991 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 1632090  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1632091 atcttccccaaaagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctttga 1632169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 35446943 - 35447321
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  35446943 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttacca 35447042  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447043 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 35447142  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35447143 tagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 35447242  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctct-aagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35447243 atctttcccaaaaggcaccaacccttttcacaagagc-ccctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagctttga 35447321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45727038 - 45726661
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  45727038 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttccca 45726939  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726938 atctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 45726839  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  45726838 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacatgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatga 45726739  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45726738 atcttccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 45726661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Original strand, 42288173 - 42288546
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42288173 tatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatct 42288272  T
Q  104 caccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42288273 caccaatgcacaagacactcgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagc 42288372  T
Q  204 ctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42288373 ctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct 42288472  T
Q  304 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  42288473 t-cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttttga 42288546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17450670 - 17450322
Alignment:
Q  30 acaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa-tctcaccaatgaacaagacactca-tga 127  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  17450670 acaaatgggttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 17450572  T
Q  128 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 227  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17450571 ttttcactcacccaaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctttgatttc-ctaatgatcttct 17450473  T
Q  228 cttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagact-ctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttt 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| || | |||||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  17450472 cttttggtttcacaagactcacccaagtttctcacaattgactccttcgctcatgtgtttcccatccccatgaatctttcacaaagggcaccaaccc-tt 17450374  T
Q  327 tcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17450373 tcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 17450322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24398163 - 24397788
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccct-aatttctatccatt-ttc-caa 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||| |||    
T  24398163 tatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaa 24398064  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactcat-gattttcactctcccaa-ggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24398063 tctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaa---gaaccaaccc 24397967  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||   || ||| |||    
T  24397966 ttagc-tttgacttt-ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatg 24397869  T
Q  299 aatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24397868 agtctctccctaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttga 24397788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33648278 - 33647900
Alignment:
Q  4 ctatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc-caa 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  33648278 ctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaa 33648180  T
Q  101 tctcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||  |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  33648179 tctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactctcccaagatgttttacggttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaagataattaacc 33648080  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||   ||||| | |    
T  33648079 cttg--ctttgatttccctaaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaagtagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgt 33647982  T
Q  298 gaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33647981 gaatctctcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaactttga 33647900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 33162509 - 33162676
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33162509 ccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccta 33162608  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33162609 atttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 36318068 - 36318223
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36318068 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 36318167  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36318168 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38312349 - 38312184
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38312349 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 38312250  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38312249 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaa-tgtttcccaac 38312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 723803 - 723968
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  723803 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttcca 723902  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  723903 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29867978 - 29867813
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29867978 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 29867879  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29867878 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29867813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36773671 - 36773506
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  36773671 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttccca 36773572  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36773571 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36773506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42362461 - 42362296
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  42362461 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 42362362  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42362361 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 42362296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 17057428 - 17057583
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17057428 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 17057527  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17057528 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 17085411 - 17085566
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17085411 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 17085510  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17085511 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34139829 - 34139995
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34139829 ccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctc 34139928  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34139929 aatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 34139995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11690610 - 11690445
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  11690610 ccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 11690511  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11690510 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11690445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 14633884 - 14634050
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  14633884 ccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttacc 14633983  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14633984 aatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14634050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2334477 - 2334641
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  2334477 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttccca 2334576  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2334577 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2334641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11067406 - 11067249
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaatctcacc 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11067406 aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcacc 11067307  T
Q  108 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11067306 aatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11067249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 11151650 - 11151815
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  11151650 ccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttccca 11151749  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11151750 atttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5723315 - 5723478
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||  |||    
T  5723315 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctacccttttctcaa 5723414  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723415 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13121876 - 13121712
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  13121876 ccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccc 13121780  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13121779 agtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45099863 - 45099699
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  45099863 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 45099765  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45099764 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885605
Alignment:
Q  8 caatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcac 106  Q
    ||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  107 caatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 36988135 - 36988299
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcc-attttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  36988135 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttcca 36988234  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36988235 atcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacta-tgtttcccaac 36988299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 6595065 - 6595221
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---c 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  6595065 ccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttttcc 6595163  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaatt 155  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6595164 taatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactct-ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 378
Target Start/End: Original strand, 42261826 - 42262046
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaag 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  42261826 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 42261923  T
Q  255 ttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctc 353  Q
    ||||||| |||| |||||||  | ||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||    
T  42261924 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctc 42262021  T
Q  354 taagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  42262022 caagattcacatcttgaagctttga 42262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 4503192 - 4503356
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---c 97  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  4503192 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttttcc 4503289  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503290 caatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4503356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11049661 - 11049493
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatac-aaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa---gaacaa-ccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  11049661 actatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttata-ccattttc 11049563  T
Q  98 c-aatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049562 ctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 317
Target Start/End: Original strand, 30218121 - 30218410
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcac-caatgaacaa 116  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||   | ||||||||    
T  30218121 ttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaagaacaaacctaacttctacccatttctcaatctccttccatgaacaa 30218220  T
Q  117 gacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcac 215  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||||          ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |    
T  30218221 gacactcaatgatttccactctgtcaaggtgtt----------tcccaactctagagcctaacccccaaaagagaaccaatatttagcttttgatttc-c 30218309  T
Q  216 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaagg 314  Q
    ||||||||  | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||  |  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30218310 taaggatc-ccccttttggtttcgcaagactcactcaagttgctcac-aaagattctcctttggtgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 30218407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 36205730 - 36205887
Alignment:
Q  7 tcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--ccaatctc 104  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  36205730 tcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttcccaatctc 36205827  T
Q  105 accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36205828 accaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacca-tgtttcccaac 36205887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7815332 - 7815498
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| | || ||||| |    
T  7815332 ccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttc-aacctttttctc 7815430  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7815431 aatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 7815498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 17490207 - 17490368
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  17490207 ccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttcta-ccattttccaa 17490301  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||  |||||| ||| ||||| |||||||    
T  17490302 tctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccacccactgtgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 4484389 - 4484554
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt--ttc 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |    
T  4484389 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcc 4484488  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4484489 caatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4484554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7451031
Alignment:
Q  251 caagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggtt 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatcttctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggtt 7451059  T
Q  351 ctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7451058 ctccaagattcacatcctgaagctttga 7451031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123809
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||| |||| |||| |||||  |||||||| | | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcattttccaa 12123743  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  12123744 tctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30833455 - 30833290
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt--ttc 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |    
T  30833455 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcc 30833356  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  30833355 caatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 30833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284829
Alignment:
Q  66 acaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 39284831  T
Q  164 ac 165  Q
    ||    
T  39284830 ac 39284829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 165
Target Start/End: Original strand, 14202503 - 14202631
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcact 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |   || |||||||||    
T  14202503 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcact 14202602  T
Q  136 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14202603 cacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14202631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26353293 - 26353178
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||    
T  26353293 ccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttca 26353194  T
Q  100 atctcaccaatgaaca 115  Q
    |||||||||| |||||    
T  26353193 atctcaccaaagaaca 26353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32289671 - 32289565
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32289671 actatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-cccttttccaat 32289573  T
Q  102 ctcaccaa 109  Q
    ||||||||    
T  32289572 ctcaccaa 32289565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7451227 - 7451166
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaag 62  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7451227 ccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagcttcaacaag 7451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 42261545 - 42261632
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  42261545 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttcta 42261632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43731093 - 43730991
Alignment:
Q  161 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctc 260  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  43731093 ccaactctagaatttaacccc-aaaaga-aaccaacctttagactttgatttc-ctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctc 43730997  T
Q  261 acaaaa 266  Q
    ||||||    
T  43730996 acaaaa 43730991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811368
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagat-cttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttcta 34811368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6266800 - 6266691
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  6266800 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 6266702  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  6266701 aatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 41446227 - 41446161
Alignment:
Q  22 aaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  41446227 aaagagatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttcta 41446161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Original strand, 5700279 - 5700347
Alignment:
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5700279 caatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaac 5700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 145
Target Start/End: Original strand, 7597074 - 7597217
Alignment:
Q  6 atcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||| || |||||||||||| |||||  ||||||    
T  7597074 atcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttcataaggaacaaaacctaatttctattcatttctcaatct 7597173  T
Q  104 c-accaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggt 145  Q
    |  || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  7597174 cttcccatgaacaagacactgagtgattttcactcacctaaggt 7597217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 41454343 - 41454256
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | | | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  41454343 cactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaacaaatctaatttcta 41454256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24197867 - 24197829
Alignment:
Q  138 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatcta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24197867 cccaaggtgtttacaattgtttcccagccctataatcta 24197829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 42019949 - 42019995
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagct 64  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  42019949 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagct 42019995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7436 - 7059
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7436 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttcca 7337  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7336 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc-agctctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 7238  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  7237 tagcctttgattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatga 7138  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7137 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 7059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54883129 - 54882751
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  54883129 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttccca 54883030  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883029 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 54882930  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  54882929 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacccaagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccccatga 54882830  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54882829 atcttctccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttga 54882751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8665517 - 8665138
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  8665517 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 8665418  T
Q  101 t-ctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8665417 ttctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaacac 8665318  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  8665317 ataacctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatg 8665218  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8665217 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 8665138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 50673906 - 50674283
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||    
T  50673906 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga-caatcctaatttctactcattttctca 50674004  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674005 atctcacaaatgaacacgacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 50674104  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50674105 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 50674204  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50674205 atctttcccataaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 50674283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 378
Target Start/End: Original strand, 50262762 - 50263135
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  50262762 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaat 50262861  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 201  Q
    ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50262862 ctca---ataaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccatta 50262958  T
Q  202 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaat 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50262959 gcctttgatttcactaagggtcttctcttttggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaat 50263058  T
Q  302 cttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50263059 cttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 50263135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8648244 - 8647869
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaat-ct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8648244 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattct 8648145  T
Q  104 caccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  8648144 caccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaacacataa 8648045  T
Q  203 cctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatc 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  8648044 catttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatc 8647945  T
Q  303 ttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8647944 ttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 8647869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12073501 - 12073124
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  12073501 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 12073402  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073401 atctcaccaataagcaagacactcatgattttcacactcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 12073302  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  12073301 tagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaaccccatga 12073202  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12073201 atctt-cccaaaaggcaccaaccctttttcccaagagc-ccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagctttga 12073124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46703610 - 46703232
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  46703610 ccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttccc 46703511  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46703510 aatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaact 46703411  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  46703410 tttagcctttgatttc-ctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctgacaaaagactctccattcatgttttcc-catccccat 46703313  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46703312 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttga 46703232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6656065 - 6655687
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||    
T  6656065 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttca 6655966  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  6655965 atctcacaagtgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctt 6655866  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6655865 tagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 6655766  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  6655765 atcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttttga 6655687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085795
Alignment:
Q  19 tacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttccaatctcaccaatgaacaaga 55085541  T
Q  119 cactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacta 217  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55085542 cagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttgatttcacta 55085641  T
Q  218 aggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085642 aggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcac 55085741  T
Q  318 caacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaa 371  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  55085742 caaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaa 55085795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 379489 - 379110
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  379489 ccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctca 379390  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatg--attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  379389 atctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacc 379290  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | |||    
T  379289 cttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccattctcat 379191  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  379190 gaatcttccccaaaaggcaccgacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttga 379110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41964525 - 41964148
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41964525 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 41964426  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41964425 aatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccc-aaaagagaaccaacc 41964327  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  41964326 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaaccccat 41964227  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41964226 gaatctttcccaaaag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttga 41964148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35662550 - 35662173
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  35662550 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttca 35662451  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgatttt-cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35662450 atctcaccaatgaacaagacactcatgatttttcacactctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaaccc 35662351  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  35662350 ttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaaccccatg 35662253  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35662252 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagctttga 35662173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2209823 - 2209439
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  2209823 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttccc 2209724  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209723 aatctcaacaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 2209624  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaa-----agactctccactcatgtgttccacaacc 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       | || |      ||||||||||||||||||| | |||||    
T  2209623 atagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgctgagaaccaacccatagcctttgactctccactcatgtgtttcccaacc 2209524  T
Q  294 ccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2209523 ccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 2209439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 27417024 - 27417388
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  27417024 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttacca 27417123  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27417124 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc----tgtttacaattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 27417219  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27417220 tagtctttgatttcactaaggatcttcttttttggttttacaagactcaccca----------aaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 27417309  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27417310 atcttccccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttga 27417388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12119649 - 12119281
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccc-taatttcta-tccattttc 97  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||    
T  12119649 ccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttc 12119550  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactcat-gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaac 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119549 caatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaac 12119450  T
Q  197 ccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccca 296  Q
    |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||    
T  12119449 cctta-acttcgatttc-ttaaggatcttctcttttggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgtttcgcaacccca 12119352  T
Q  297 tgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatctt 368  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  12119351 tgaatcttcccaaaagggaaccaaccc-tttcccaagagttcccttttttaattctccaagattcatatctt 12119281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26363996
Alignment:
Q  152 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgccc 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 26364123  T
Q  252 aagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttc 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26364122 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggttc 26364023  T
Q  352 tctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  26364022 tccaagattcacatcttgaagctttga 26363996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40632554 - 40632334
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  40632554 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttccca 40632455  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632454 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 40632355  T
Q  200 tagcctttgatttcactaagg 220  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  40632354 taacatttgatttcactaagg 40632334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 109 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33989862 - 33989594
Alignment:
Q  109 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 207  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  33989862 atgaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagccttt 33989763  T
Q  208 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccc 307  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||    
T  33989762 gattac-ctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctctcc 33989664  T
Q  308 caaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33989663 caaaaggcaccaa-ccttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagctttga 33989594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 215 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40630878 - 40630715
Alignment:
Q  215 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaagg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40630878 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagg 40630779  T
Q  315 caccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40630778 caccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 40630715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41639535 - 41639345
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41639535 ccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 41639436  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagaga 190  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41639435 atcttaccaataaacaagacactcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 26175695 - 26175860
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26175695 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttccca 26175794  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26175795 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26175860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 54199966 - 54200130
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54199966 cactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 54200065  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54200066 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 54200130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 26699519 - 26699884
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc--aatctcaccaatgaac 114  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || || | |  |||||| | ||| |||    
T  26699519 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaac 26699618  T
Q  115 aagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 213  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  26699619 aagacattcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttgattac 26699718  T
Q  214 actaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaa 312  Q
    | ||| |||| |||||||| ||||   |||||||  |  ||||| |||| || || ||||||||||||| |  | | ||||||||||||| | |  ||||    
T  26699719 a-taaagatcatctcttttagttttctaagactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgtatctcccgaccccatgaatctcttctgaaaa 26699817  T
Q  313 ggcaccaacccttttcacaagagctccc-tattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26699818 ggcaccaaccctttttccaagatcccccttcatttggctctctaagattcacatcttgaagttttga 26699884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36994633 - 36994478
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  36994633 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccca 36994534  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36994533 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33089988 - 33089630
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |  ||    
T  33089988 ccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacataatttctattcatctctca 33089889  T
Q  100 atctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33089888 atctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaaggtgttt----------cccaactctataatctaacctccaaaagagaaccaacc 33089799  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||    
T  33089798 tttagcctttgattt-tctaaggatcttctcttttgg-----------tctcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccat 33089711  T
Q  298 gaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| | || ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  33089710 gaatctctctccaaaagacaccaaccc-tctcccaagagccccctcttttgattctccaagattcacatcttcaaactttga 33089630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 36463448 - 36463615
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36463448 ccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttccca 36463547  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463548 atctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 22882809 - 22883189
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22882809 ccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttca 22882908  T
Q  100 atctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaa 195  Q
    |||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| | |||  | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22882909 atctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaa 22883008  T
Q  196 cccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccc 295  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||| |  |||||     
T  22883009 ccattatcctttgattt-tctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcac-aaagactctcatttgatgtgtttcctaaccct 22883106  T
Q  296 atgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||| ||| || |||||||| | || ||| | || ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22883107 atgagtctctctccaaaaggtatcagccc-tctcccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttga 22883189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 22934473 - 22934853
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22934473 ccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttttca 22934572  T
Q  100 atctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaa 195  Q
    |||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| | |||  | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22934573 atctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaa 22934672  T
Q  196 cccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccc 295  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||| |  |||||     
T  22934673 ccattatcctttgattt-tctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcac-aaagactctcatttgatgtgtttcctaaccct 22934770  T
Q  296 atgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||| ||| || |||||||| | || ||| | || ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22934771 atgagtctctctccaaaaggtatcagccc-tctcccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttga 22934853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5429788 - 5429623
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||    
T  5429788 ccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttccca 5429689  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5429688 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5429623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9927517 - 9927681
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9927517 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 9927616  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9927617 atctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9927681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47038470 - 47038633
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47038470 ccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatgat-tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccaa 47038568  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  47038569 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 47038633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21688354 - 21688188
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc--aatc 102  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||    
T  21688354 tatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatc 21688255  T
Q  103 tcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21688254 tcaccgatgaacaagacactcatgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactcta 21688188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24969221 - 24969055
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  24969221 ccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccatttttcca 24969122  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24969121 atctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34570473 - 34570638
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  34570473 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttccca 34570572  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  34570573 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgttttcaa-tgtttcccaac 34570638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37740734 - 37740570
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  37740734 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaa 37740635  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37740634 atctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37740570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 52095421 - 52095586
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  52095421 ccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 52095520  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52095521 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52095586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 56178696 - 56178860
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  56178696 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 56178795  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56178796 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 56178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 12745495 - 12745659
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12745495 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccta 12745594  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12745595 atctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 378
Target Start/End: Original strand, 46569816 - 46569983
Alignment:
Q  211 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaa 310  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  46569816 ttcaataaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaaccccatgaatctttcccaa 46569915  T
Q  311 aaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46569916 aaggcaccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 46569983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12739609 - 12739774
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12739609 ccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccca 12739708  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12739709 atctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12739774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12747815 - 12747980
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12747815 ccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccca 12747914  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12747915 atctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12747980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 48893697 - 48893856
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa----gaacaaccctaatttctatccatttt 96  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  48893697 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccatttt 48893796  T
Q  97 c-caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48893797 ctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48143152 - 48142986
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||    
T  48143152 ccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttccc 48143053  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48143052 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48142986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5871929 - 5871764
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  5871929 ccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttcca 5871830  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5871829 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5871764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 52467413 - 52467579
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||||||||  || | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  52467413 ccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 52467512  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52467513 acctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785822
Alignment:
Q  163 aactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcac 262  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  3786034 aactctagaatcta-cccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttc-ctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcac 3785937  T
Q  263 aaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattc 361  Q
    ||| ||||||||  | | ||||||| | ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  3785936 aaa-gactctcctttgaagtgttcctcgaccccataattctctcctcaaaaggcaccaacccttttc-caagagccccctcttttggttcttcaagattc 3785839  T
Q  362 acatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  3785838 acatcttgaagctttga 3785822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639207
Alignment:
Q  22 aaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagaca 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  121 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41639251 ctcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31474258 - 31474096
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc-caa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31474258 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaa 31474159  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31474158 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 52082716 - 52082881
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  52082716 ccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttccca 52082815  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52082816 atctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52082881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26364345 - 26364223
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26364345 ccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 26364246  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacact 122  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26364245 atctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3913557 - 3913408
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||    
T  3913557 ccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctactcattttccca 3913458  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3913457 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4588068 - 4587902
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |  |||| ||    
T  4588068 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttccc 4587969  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4587968 aatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4587902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29254603 - 29254438
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcc-attttcca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||| |||    
T  29254603 ccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttccca 29254504  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29254503 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 29254438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 37229780 - 37229947
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaat-gggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaca-accctaatttctatccatttt-c 97  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  37229780 ccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta-ccattttcc 37229878  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37229879 caatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 46147450 - 46147570
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46147450 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttcca 46147549  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagaca 120  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  46147550 atctcaccgatgaacaagaca 46147570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 5207901 - 5208066
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  5207901 ccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttcca 5208000  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5208001 atcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 6542238 - 6542405
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt--- 96  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||       
T  6542238 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttcta-ccattttttc 6542336  T
Q  97 ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6542337 ccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6542405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 5370142 - 5370308
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagc-ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta----tccattt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    |   |||    
T  5370142 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttt 5370241  T
Q  96 tccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  5370242 tccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaagtgtttacaa-tgtttccca 5370308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 29999865 - 30000019
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaaga-gatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  29999865 ccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttccca 29999964  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29999965 atctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc-accaaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 35369542 - 35369711
Alignment:
Q  43 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctccc 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  35369542 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactcatttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactctac- 35369640  T
Q  141 aaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 211  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369641 aaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatccaacccc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatt 35369711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 45687241 - 45687407
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||    
T  45687241 ccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttccc 45687340  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45687341 aatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 48142440 - 48142605
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||    
T  48142440 tatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatc 48142539  T
Q  103 tcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  48142540 tcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12743984 - 12744080
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12743984 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12745373 - 12745469
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12745373 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34112555 - 34112392
Alignment:
Q  165 ctctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaa 264  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||||     
T  34112555 ctctataatctaccttccaaaagagaaccaaactttagcctttgatttc-ctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacag 34112457  T
Q  265 aagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttc 328  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34112456 atgactctccactcatgtgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaaggcaccaacccttttc 34112392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 12744106 - 12744193
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12744106 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 12744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51337172 - 51337018
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--ccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| ||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||| |    
T  51337172 cactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttataataaattatcttaaa--agctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctc 51337075  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51337074 aatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 51337018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32091570 - 32091324
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatc-tcaccaatgaacaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| || || ||||||||    
T  32091570 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctagcattttcccaatcttctcccatgaacaa 32091471  T
Q  117 gacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttca 214  Q
    || |||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||     
T  32091470 gagactcaatga-tttcgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatctta-ccccaaaaaagaaccaacactttgcctttgatttc- 32091374  T
Q  215 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaa 264  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||| |||  ||||||||| ||||||    
T  32091373 ctaaggatcttctcctctggtctcccaaaacttacccaagttgttcacaa 32091324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961264
Alignment:
Q  151 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcc 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactcacc 41961270  T
Q  251 caagtt 256  Q
    ||||||    
T  41961269 caagtt 41961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370774
Alignment:
Q  43 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctccc 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactcatttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaataattttcactcttac 35370548  T
Q  141 aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 240  Q
    |||||||||          ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||      
T  35370549 aaggtgttt----------cccaattctataatctaactcc-aaaagagaaccaaccattagcctttgatttc-ccaaagatcttctattttggtatcca 35370636  T
Q  241 aagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctcc 339  Q
     |||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||| ||   ||||| ||||||||| |  | |||||| |||||||| | || ||||| | ||    
T  35370637 tagactcacccaagttgcttac-aaagactctcctttgatgtttttatcaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaaccc-tctcccaagaacccc 35370734  T
Q  340 ctatttt-ggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35370735 ctcttttaggttctccaagattcacatcttaaagctttga 35370774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Original strand, 13009549 - 13009655
Alignment:
Q  60 aagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 157  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13009549 aagctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgt 13009647  T
Q  158 ttcccaac 165  Q
    ||||||||    
T  13009648 ttcccaac 13009655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13992352 - 13992509
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  13992352 ccactatcaatgagttcttacaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 13992450  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||       |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13992451 aatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53345309 - 53345189
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-caaccctaatttctatccattttc-caatctcaccaatgaaca 115  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||    
T  53345309 ttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaatttctat-cattttctcaatctctccgataaaca 53345211  T
Q  116 agacactc-atgattttcactc 136  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  53345210 agacactcaatgattttcactc 53345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 5350002 - 5349924
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt 96  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5350002 ttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10072065 - 10072002
Alignment:
Q  315 caccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10072065 caccaacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttga 10072002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29056450 - 29056301
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacc-ctaatttctatccattttcc-aatctcaccaatgaaca 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  29056450 ttacaaagagatataaaaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattccta-ccattttcccaatctctctaatgaaca 29056352  T
Q  116 agacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29056351 aaacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10071676 - 10071616
Alignment:
Q  318 caacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10071676 caacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttga 10071616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6677561 - 6677412
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag--aacaaccctaatttctatccattttccaatctc-accaatgaac 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || || ||||||||||| |||||||||||| ||  || | ||||    
T  6677561 ttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacctaatttcta-ccattttccaatttcttcccaagaac 6677463  T
Q  115 aagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||| |||||    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  6677462 aagagactcaattatttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 6677412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723653
Alignment:
Q  152 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgccc 251  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    || || |||||||| |  ||||| |||||||||| ||| |  ||| |||| |      
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc----ctcagtctttgattact-taagggtcttctctttcggtctaccaaaactcactt 25723527  T
Q  252 aagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggtt 350  Q
    |||||| ||||||| |||||||   | ||||||| | |||||||| ||| || || ||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  25723528 aagttgttcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccccacgaagctctctccaaaaggcattaaccattatc-caagagctccctcttttggtt 25723625  T
Q  351 ctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25723626 ctccaagattcacattttgaagctttga 25723653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 31495377 - 31495485
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  31495377 actatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctacccttttcccaa 31495476  T
Q  101 tctcaccaa 109  Q
    |||||||||    
T  31495477 tctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788930
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttcta-ccattttcc 34788930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Original strand, 38811405 - 38811515
Alignment:
Q  267 gactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacat 365  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  38811405 gactctccacttatgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttcc-caagagc-ccctctttgggttctccaagattcacat 38811502  T
Q  366 cttgaagctttga 378  Q
    ||| |||||||||    
T  38811503 cttaaagctttga 38811515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 34112926 - 34112839
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||    
T  34112926 cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttcta 34112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653331
Alignment:
Q  324 ttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 8653331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33989936 - 33989867
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 87  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||    
T  33989936 ttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaactctctaagaacaaacctagtttct 33989867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570527
Alignment:
Q  4 ctatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatc 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttcta-ccatttttcaatc 44570525  T
Q  103 tc 104  Q
    ||    
T  44570526 tc 44570527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52065706 - 52065540
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagat-cttacaaagagatacaaatgggct-acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  52065706 cactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaacaacc-taatttctacctgtttccca 52065608  T
Q  100 atctca-ccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    || ||  ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52065607 atatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaac 52065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Original strand, 16422666 - 16422761
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatc-ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc 97  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16422666 cactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttcta-ccattttc 16422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1983325 - 1983250
Alignment:
Q  21 caaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc 97  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  1983325 caaagtgatacaaaggggttacaagaaattagctt--gcaagctcacaaagaacaaaacataatttctatcctttttc 1983250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 371
Target Start/End: Original strand, 22629147 - 22629318
Alignment:
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||| || ||||| || | ||| ||||||| | |  ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22629147 cttagcctttgatttt-ctaaggatcttttatgttggtctcccaagattcactcaaattgctcagagat-actctcctctcatgtgtttctcaaccccat 22629244  T
Q  298 gaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaa 371  Q
     ||| | | |||||||||||| |||| ||||  ||| |    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22629245 aaatatcttcccaaaaggcactaaccattttt-caatattctcctattttggttctccaagattcacatcttgaa 22629318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Original strand, 6200139 - 6200291
Alignment:
Q  216 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaagg 314  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||  || |||||||  |||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||    
T  6200139 taaggatcttctcttttggtatctcaagattcatccaaattgctca-taaggactctcatctcatgtgtttctcaaccccacatatctctccccaaaagg 6200237  T
Q  315 caccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatctt 368  Q
     ||| | |  | || |||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6200238 aacccaactctgtcccaagagctccatcttttagttctccaagatacacatctt 6200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 44967906 - 44967985
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  44967906 ttacaaagagatacaaat-ggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttcc 44967985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6719531 - 6719479
Alignment:
Q  160 cccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattt 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  6719531 cccaactctatattctaacccccaaaaaggaatcaacccttaagctttgattt 6719479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 87)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37168407 - 37168028
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37168407 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 37168308  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  37168307 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacct 37168208  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37168207 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 37168108  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37168107 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 37168028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 13547148 - 13547526
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13547148 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 13547247  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547248 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 13547347  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13547348 tagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatga 13547447  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13547448 attttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttga 13547526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11348807 - 11348429
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  11348807 ccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttccca 11348708  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348707 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 11348608  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11348607 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatga 11348508  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11348507 atcttctccaaaaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttga 11348429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 37033131 - 37033510
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37033131 ccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 37033230  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37033231 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaaccc 37033330  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  37033331 atagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatg 37033430  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37033431 aatcttcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 37033510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 13549059 - 13549437
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13549059 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 13549158  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549159 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 13549258  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13549259 tagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatga 13549358  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13549359 attttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttga 13549437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29136356 - 29135979
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29136356 ccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 29136257  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136256 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaaccct 29136157  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29136156 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaaaactctccactcatgtttttc-caaccccatga 29136058  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29136057 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 29135979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 42298034 - 42298412
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  42298034 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttccca 42298133  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42298134 atctcaccaatgaacaagacactcatgatttttactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactct 42298233  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42298234 tagcctttgatttcacttaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 42298333  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42298334 atcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 42298412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 37879009 - 37879348
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879009 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctc 37879108  T
Q  139 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37879109 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttc 37879208  T
Q  239 acaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctc 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37879209 acaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattttccccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccc 37879308  T
Q  339 cctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37879309 cctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttga 37879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 193720 - 193343
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  193720 ccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctca 193621  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  193620 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcaccctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 193521  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  193520 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaaccccatga 193421  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  193420 atctt-cccaaaaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttga 193343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34603686 - 34603307
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  34603686 ccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttc 34603587  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34603586 aatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacc 34603487  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||    
T  34603486 cttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccat 34603388  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34603387 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 34603307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47115281 - 47114903
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  47115281 ccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttccc 47115182  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115181 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 47115082  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  47115081 ttagcctttgatttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaaccccatg 47114982  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47114981 aatctt-cccaaaaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagctttga 47114903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 47255399 - 47255771
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47255399 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 47255498  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255499 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 47255598  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  47255599 tagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactc-actaagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaa-cccatga 47255696  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47255697 atcttccccaaaaggcacca----ttttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 47255771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 2 - 378
Target Start/End: Original strand, 7482290 - 7482668
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  7482290 cactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttaccca 7482389  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482390 atctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 7482489  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7482490 ttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 7482587  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-ctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7482588 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 7482668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19754604 - 19754238
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-- 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |      
T  19754604 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctc 19754505  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  19754504 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacca 19754405  T
Q  199 ttagcctttgatttcact---aaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccc 295  Q
    ||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19754404 ttatcctttgatttcacttataaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaacccc 19754305  T
Q  296 atgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  19754304 atgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattca 19754238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 31925766 - 31926099
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  31925766 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttcca 31925865  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31925866 ctctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaactgcttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccat 31925964  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  31925965 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactcacgtgtttcccaaacccatga 31926064  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaaga 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31926065 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaaga 31926099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19752792 - 19752430
Alignment:
Q  4 ctatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc--aat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  19752792 ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaat 19752693  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19752692 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcatta 19752593  T
Q  202 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaat 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||    
T  19752592 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagttgctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaat 19752493  T
Q  302 cttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacat 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  19752492 cttccccaaaaggcaccaa-ccttttcataagagccccatcttttggttctccaagattcacat 19752430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 113 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242120
Alignment:
Q  113 acaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttgatt 28242286  T
Q  212 tcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaa 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||    
T  28242285 tcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaatctt-cccaaa 28242187  T
Q  312 aggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28242186 aggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttga 28242120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602776
Alignment:
Q  158 ttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttg 257  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttg 34602655  T
Q  258 ctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaag 357  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34602656 ctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaag 34602755  T
Q  358 attcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34602756 attcacatcttgaagctttga 34602776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31659347 - 31659192
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  31659347 ccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttcca 31659248  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31659247 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 834226 - 834391
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  834226 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccca 834325  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  834326 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 834391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49918459 - 49918309
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  49918459 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 49918360  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49918359 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13138035 - 13138196
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  13138035 ccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttttcaa 13138133  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13138134 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 28220285 - 28220440
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28220285 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccga 28220384  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28220385 atctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28265613 - 28265778
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  28265613 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttccca 28265712  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28265713 atctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3156974 - 3156820
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3156974 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 3156875  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3156874 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accagggtgtttacaat 3156820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10925317 - 10925167
Alignment:
Q  16 tcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaatctcaccaatgaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10925317 tcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaac 10925218  T
Q  115 aagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10925217 aagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 10925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44455269 - 44455104
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  44455269 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 44455170  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44455169 atctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44455104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 50169269 - 50169434
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50169269 ccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 50169368  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50169369 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtatttacaa-tgtttcccaac 50169434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41361023 - 41360859
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  41361023 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 41360924  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41360923 atctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 41360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41135912 - 41135552
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcacca-atgaacaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||  || | ||||||    
T  41135912 ttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagttcttcaagaacaaatctaatttctaccctttttctattctcctcacaggaacaa 41135813  T
Q  117 gacactca-tgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttca 214  Q
    || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  41135812 gagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttaatttc- 41135715  T
Q  215 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaag 313  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||    
T  41135714 caaatgatcttctcttttggtttcctaagactcacccaagtttctcac-aaagactctcctttgatgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaag 41135616  T
Q  314 gcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||| | || ||| | || ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  41135615 gcaccaaccc-tctcccaaaatcttcctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttga 41135552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15820415 - 15820249
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccat-tttccaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  15820415 cactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaa 15820316  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15820315 tatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 196967 - 197132
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  196967 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctca 197066  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  197067 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 197132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 3847180 - 3847345
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3847180 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 3847279  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3847280 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28223480 - 28223645
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  28223480 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttccca 28223579  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  28223580 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtcttcaa-tgtttcccaac 28223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 50167234 - 50167399
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||    
T  50167234 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttccca 50167333  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50167334 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 50167399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1833631 - 1833467
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1833631 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 1833532  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1833531 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 1833467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 37503616 - 37503768
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  37503616 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttccca 37503712  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37503713 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 4552700 - 4552851
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatct 103  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4552700 tatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatct 4552799  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4552800 caccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccaaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 8550846 - 8551001
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  8550846 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 8550945  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8550946 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 13659395 - 13659550
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13659395 ccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttccca 13659494  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13659495 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 46065027 - 46064872
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  46065027 ccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttccca 46064928  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46064927 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 928035 - 928202
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatc-cattttcc 98  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  928035 ccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttcc 928134  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  928135 aatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Original strand, 37559928 - 37560083
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagc-ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  37559928 cactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttccta 37560027  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37560028 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23555324 - 23555489
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23555324 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 23555423  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23555424 atctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23555489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3189439 - 3189275
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  3189439 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaa 3189340  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3189339 atctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3198256 - 3198092
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  3198256 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaa 3198157  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3198156 atctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3198092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3207095 - 3206931
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  3207095 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaa 3206996  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3206995 atctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3206931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 45644413 - 45644569
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |    
T  45644413 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctc 45644512  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45644513 aatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacccaagatgtttacaat 45644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20762781 - 20762616
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  20762781 ccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctc 20762682  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20762681 aatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 20762616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6808562 - 6808179
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaat------ttctatccat 93  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||      ||||| ||||    
T  6808562 ccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatcctaatttcta-ccat 6808464  T
Q  94 tttcc-aatctc-accaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagaga 190  Q
    || || |||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  6808463 ttccctaatctctactcatgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtttctcaactctagaatctaacctcgaaa-gaga 6808365  T
Q  191 accaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccaca 290  Q
    ||||||| |  | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||  |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||   ||    
T  6808364 accaaccttccgtctttgattaca-taatgatcttctcttttggttttccattactcaccctagttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttcca 6808266  T
Q  291 accccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| ||  || |   ||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6808265 accccatgaatctcttcccaaaagacacaaaatctct--ccaagagcccaatcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttga 6808179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16455730 - 16455585
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||  ||||||| |||    
T  16455730 ccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcaccattttacca 16455632  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16455631 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22079422 - 22079158
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||    
T  22079422 tatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaacataatttctaccatttttccaatct 22079323  T
Q  104 ca-ccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 201  Q
    |  || |||||||||| |    || ||| ||||| ||  | || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22079322 cttcccatgaacaagaaa----tggttt-cactcacctgaagtttttcccaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatcctta 22079229  T
Q  202 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctcc 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22079228 gcctttgatttca-taagcatcttatattttggtttgccaagactcacctaagttgctcac-aaagactctcc 22079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 30476509 - 30476672
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  30476509 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatct 30476608  T
Q  104 caccaa---tgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30476609 caccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacccacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 30476672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 40122261 - 40122421
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaatct 103  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||    
T  40122261 tatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatct 40122360  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40122361 cacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 13316411 - 13316520
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  13316411 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 13316510  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  13316511 atctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 37282768 - 37282901
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaa 116  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37282768 ttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttata-ccatttttcaatctctccaatgaacaa 37282866  T
Q  117 gacactc-atgattttcactctcccaaggtgttta 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||||||||||    
T  37282867 gacactcaatggttttcactcatacaaggtgttta 37282901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Original strand, 8871129 - 8871259
Alignment:
Q  23 aagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc-aatctcaccaatgaacaagaca 120  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8871129 aagagttacaaaatggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccaaatctcacaaaagaacaagaca 8871227  T
Q  121 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaa 153  Q
    || ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8871228 ct-atgattttcgctcatccaaggtgtttacaa 8871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25651931
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  | ||||||||| | ||||  |||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaatttctcaa 25652096  T
Q  101 tctcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaac-ccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    | |   |  |||||||| | ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||||||||||      
T  25652095 tattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaccttcataaaagagaaccaatt 25651996  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcaca 263  Q
    ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  25651995 cttaatatttgattt-tctaaggatcttcacttttgctttcccaagattcacccaagttgctcaca 25651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 324
Target Start/End: Original strand, 12318720 - 12318864
Alignment:
Q  179 ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactc 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |     
T  12318720 cccccaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-caaaagattttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctcataaaa-actctcctttg 12318817  T
Q  279 atgtgttccacaaccccatgaa-tcttccccaaaaggcaccaaccct 324  Q
    ||||||| | ||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  12318818 atgtgtttctcaatcctatgaacttctccccaaaaggcaccaaccct 12318864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 378
Target Start/End: Original strand, 9109680 - 9109838
Alignment:
Q  220 gatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcacc 318  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   | ||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||| || |    
T  9109680 gatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctcatttgatgtgtctcccaacctcatgaatctctccccaaaagacatc 9109779  T
Q  319 aacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9109780 aaccc-tctcccatgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttga 9109838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3460788 - 3460706
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||    
T  3460788 ttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaccctttttcca 3460706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318706
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttaca-aagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    |||||||||| ||||| | |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||| | |||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctacccatttccaaatct 12318684  T
Q  104 c-accaatgaacaagacactca 124  Q
    | ||| |||||||||| |||||    
T  12318685 ctacccatgaacaagaaactca 12318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51765506 - 51765349
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggct-acaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctatccatt--t 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||  |    
T  51765506 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttct 51765407  T
Q  96 tccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51765406 cccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 44650239 - 44650389
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccc-taatttctatccattttc-caatctcaccaatgaaca 115  Q
    ||||||||||||| ||| |   ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  44650239 ttacaaagagatataaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta-catttttctcaatctctccaatgaaca 44650337  T
Q  116 agacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 166  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  44650338 agacactcaataattttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Original strand, 4535783 - 4535861
Alignment:
Q  250 ccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttt 327  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4535783 ccaagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttt 4535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36683771 - 36683702
Alignment:
Q  29 tacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||    
T  36683771 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcc 36683702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3331505 - 3331428
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3331505 tgtttcccaactctagaatccaacccc-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggt 3331428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914338
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaa-ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||| | |||||||| | |||||| || |||||| |||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttacccatttccca 16914333  T
Q  100 atctc 104  Q
    |||||    
T  16914334 atctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9987310 - 9987202
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||  | ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  9987310 ccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggt-tgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttccca 9987212  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  9987211 atctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 20622337 - 20622406
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20622337 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 1050520 - 1050668
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcacca-atgaacaa 116  Q
    ||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||  | |||||| ||||||||  || ||||||||    
T  1050520 ttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcacccatttcccaatctcttcacatgaacaa 1050619  T
Q  117 gacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    || |||||  | ||||||||   ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1050620 gagactcaataatttcactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaac 1050668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Original strand, 16216709 - 16216930
Alignment:
Q  152 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgccc 251  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||| | || | |    
T  16216709 aattgtttctcaactctagaatctaaccct--aaactaaaccaactcgtagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactc 16216805  T
Q  252 aagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggtt 350  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| | |  |||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  16216806 aagttgctcac-aatgactctcctctcatgtgtttgccaa-cacatgaatttctatccaaaatgcaccaacccttttc-gaagagccccctcttttggtt 16216902  T
Q  351 ctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||||    
T  16216903 cttcaagatatacatcttgaacctttga 16216930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9036525 - 9036417
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  9036525 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 9036428  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  9036427 aatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 9109496 - 9109603
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatctc--accaatgaac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || | ||| | || | |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  9109496 ttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagttctccaagtaaaaacttaatttct-tccattttctcaatctcctacc-atgaac 9109593  T
Q  115 aagacactca 124  Q
    ||||||||||    
T  9109594 aagacactca 9109603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40282486 - 40282377
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  40282486 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttccc 40282388  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  40282387 aatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 2263033 - 2263106
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa 73  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2263033 ccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3331323 - 3331283
Alignment:
Q  330 caagagctccctattttggttctctaagattcacatcttga 370  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331323 caagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttga 3331283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22079106 - 22079066
Alignment:
Q  338 ccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22079106 ccctcttttggttctttaagattcacatcttgaagctttga 22079066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 31928210 - 31928245
Alignment:
Q  343 ttttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31928210 ttttggttttctaagattcacatcttgaagctttga 31928245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Original strand, 4535541 - 4535627
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||   | |||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| | |||||||||    
T  4535541 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttcta 4535627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6068512 - 6068471
Alignment:
Q  189 gaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6068512 gaaccaactcttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttt 6068471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13938247 - 13938143
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagat-cttacaaagagatacaaatg-ggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||  ||  ||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  13938247 ccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttctccaagaacaacc-taatttctacccatttccc 13938149  T
Q  99 aatctc 104  Q
    ||||||    
T  13938148 aatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 32471570 - 32471486
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagat-cttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaattt 85  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | ||| |||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||    
T  32471570 ccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaattt 32471486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 37876825 - 37876862
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatggg 38  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37876825 ccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatggg 37876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Original strand, 44646882 - 44647010
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccc-taatttctatccattttc-caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 136  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44646882 tacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta-catttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactc 44646980  T
Q  137 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 166  Q
      |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  44646981 atccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10157571 - 10157501
Alignment:
Q  152 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatct 224  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10157571 aattgtttttcaactttagaatctaaccccctaaat-gaaccaacccttagtctttgatttc-ctaaggatct 10157501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35109557 - 35109496
Alignment:
Q  26 agatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35109557 agatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttcta 35109496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 42435050 - 42435428
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42435050 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 42435149  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435150 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaaccct 42435249  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  42435250 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccccatga 42435349  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42435350 atcttccccaaaagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 42435428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40221854 - 40221482
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40221854 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttacca 40221755  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40221754 atctcaccaaagaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctt 40221655  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40221654 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 40221555  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaag 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221554 atcttccccaaaaggcactaacccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaag 40221482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11384090 - 11383717
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatct 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11384090 tatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatct 11383991  T
Q  104 caccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 203  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383990 cat-aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 11383892  T
Q  204 ctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  11383891 ctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccccatgaatct 11383792  T
Q  304 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11383791 tcctcaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 11383717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40328889 - 40328510
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  40328889 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccc 40328790  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40328789 aatctcacaaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactc 40328690  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  40328689 atagcctttgatttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccatccccatg 40328590  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40328589 aatcttccctaaaaggcaccaacccttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttga 40328510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4283633 - 4283320
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4283633 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttccca 4283534  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283533 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 4283434  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  4283433 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaaccccatga 4283334  T
Q  300 atcttccccaaaag 313  Q
    ||||| ||||||||    
T  4283333 atctttcccaaaag 4283320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44353902 - 44353540
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44353902 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 44353803  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353802 atctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 44353703  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  44353702 ttagcctttgatttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccactcatgtgttttccaaccccatg 44353603  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattc 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  44353602 aatcttctccaaaaggcaccaaccctcttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc 44353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18655509 - 18655246
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  18655509 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctca 18655410  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18655409 atctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaagtctagaatctaa-ccccaaaagagtatcaaccct 18655311  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18655310 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 10930258 - 10930424
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10930258 ccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttccca 10930357  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10930358 atctcaccgatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaaatgtttacaattgtttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27811387 - 27811232
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27811387 ccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 27811288  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27811287 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4731767 - 4731602
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4731767 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttccca 4731668  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4731667 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15212891 - 15212730
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15212891 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 15212792  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15212791 caccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15212730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18141929 - 18141764
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  18141929 ccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcaca 18141831  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18141830 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33352259 - 33352094
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  33352259 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttccca 33352160  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33352159 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43036532 - 43036367
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43036532 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 43036433  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43036432 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30143449 - 30143286
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30143449 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 30143350  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30143349 atctggccaatgaacaagacac-aatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 30143286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19491758 - 19491922
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  19491758 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 19491857  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19491858 atctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 19491922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9765854 - 9765693
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9765854 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 9765755  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9765754 atctcaccaatgaacaagacactc---aatttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9765693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30291716 - 30291549
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  30291716 ccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctc 30291617  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30291616 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1292522 - 1292687
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  1292522 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctca 1292621  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||    
T  1292622 atctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgttcac-agtgtttcccaac 1292687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 1345430 - 1345597
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  1345430 ccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttccca 1345529  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1345530 atctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tatttcccaactc 1345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5689380 - 5689213
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  5689380 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttcca 5689281  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5689280 atctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccaaactc 5689213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40321189 - 40321022
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40321189 ccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 40321090  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40321089 atctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 3303729 - 3303894
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  3303729 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttccca 3303828  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3303829 atctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3303894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42498303 - 42498149
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||    
T  42498303 ccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttccc 42498204  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42498203 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Original strand, 8965751 - 8965914
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||    
T  8965751 cactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaa 8965850  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8965851 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31218366 - 31218201
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---c 97  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  31218366 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttttcc 31218268  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31218267 caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 34254390 - 34254543
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  34254390 ccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttcccaa 34254489  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34254490 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 34256566 - 34256719
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  34256566 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttccaa 34256665  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34256666 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacac-accaaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 18106139 - 18106302
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  18106139 cactatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaa 18106237  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18106238 tctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 18106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4162603 - 4162454
Alignment:
Q  4 ctatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||    
T  4162603 ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc--tct 4162506  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4162505 cactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaat 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17982762 - 17982597
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  17982762 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 17982663  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17982662 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 17982597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6599081 - 6598916
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  6599081 ccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttccca 6598982  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6598981 atctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6598916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6674534 - 6674369
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  6674534 ccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttccca 6674435  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6674434 atctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6674369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 12702697 - 12702862
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt------cc 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||      ||    
T  12702697 tatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttccc 12702796  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12702797 aatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12702862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44303964 - 44303798
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---c 97  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||   |    
T  44303964 ccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcc 44303865  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44303864 caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44303798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1746278 - 1746442
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta--tccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |   |||| |    
T  1746278 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttc 1746376  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1746377 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 1746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 19945418 - 19945574
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatg-ggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--c 97  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |    
T  19945418 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcc 19945517  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19945518 caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3772301 - 3772164
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  3772301 ccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctca 3772202  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3772201 atctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactc 3772164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976265
Alignment:
Q  253 agttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttct 352  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgtttt-caaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttct 22976291  T
Q  353 ctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  22976290 ccaagattcacatcttgaagctttga 22976265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 41366673 - 41366837
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  41366673 ccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctca 41366772  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41366773 atctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40585656 - 40585456
Alignment:
Q  177 acccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||      
T  40585656 acccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcac-aaagactctcctt 40585559  T
Q  277 tcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctt 375  Q
    | |||||||    |||||||||||||| || ||||||| || ||||||| | || |||||| | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  40585558 tgatgtgttttcaaaccccatgaatctctcaccaaaagacatcaaccctctccaaaagagcccactcttttgattctcaaatattcacatcttgaagctt 40585459  T
Q  376 tga 378  Q
    |||    
T  40585458 tga 40585456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10929869 - 10929753
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca-atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  10929869 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaa 10929770  T
Q  138 cccaaggtgtttacaat 154  Q
     ||||||||||||||||    
T  10929769 tccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 4743291 - 4743427
Alignment:
Q  29 tacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 126  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4743291 tacaaatgggttacaagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4743389  T
Q  127 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743390 attttcgctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365071
Alignment:
Q  21 caaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagac 119  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    ||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  120 actc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 378
Target Start/End: Original strand, 2999823 - 2999957
Alignment:
Q  244 actcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatc-ttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctcccta 342  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||| || | || ||||| | ||||     
T  2999823 actcgcccaagttgctcacaattgactctctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaa-ccatatcccaagaaccccctc 2999921  T
Q  343 ttttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2999922 ttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 2999957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1822384 - 1822282
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  1822384 ttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctctcaaatgaacaa 1822285  T
Q  117 gac 119  Q
    |||    
T  1822284 gac 1822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1856829 - 1856727
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  1856829 ttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctctcaaatgaacaa 1856730  T
Q  117 gac 119  Q
    |||    
T  1856729 gac 1856727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 33655407 - 33655628
Alignment:
Q  44 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaa 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||| ||||   ||| ||  | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||    
T  33655407 agaaatcagcttcaacaaactctctaagaacaaatctaatttctatctatttcttaatatcttccatgaacaagacactcaatgattt-cactcatccaa 33655505  T
Q  143 ggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcaca 241  Q
    | ||||| ||| || ||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |    
T  33655506 gatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaacccttaacctttgattt-tctaaggatcttctcttttgttctccta 33655604  T
Q  242 agactcgcccaagttgctcacaaa 265  Q
    ||| || ||||| |||||||||||    
T  33655605 agattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8153865 - 8153705
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaa-gctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||      |||||||||||| |||||||| |||    
T  8153865 actatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttagcttcaacaaagctcagaaa------ccctaatttcta-ccattttctcaa 8153773  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8153772 tctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgtatacaaatgtttcccaac 8153705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240061
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | | ||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttctatctttgtccc 10240165  T
Q  99 aatct-caccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaac 196  Q
    ||||| | || | |||||||| ||||  || |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10240164 aatctcctcccaagaacaagagactc--ga-tttcgctcacctaagatgtttctcaattgtttcccaaatctagaatctaacccc--aaagagaaccaac 10240070  T
Q  197 ccttagcct 205  Q
     ||||||||    
T  10240069 tcttagcct 10240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10015189 - 10015119
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga 72  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10015189 ccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2627845 - 2627735
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttaca-aagagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | | | ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  2627845 ccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttccc 2627746  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  2627745 aatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 3846068 - 3846254
Alignment:
Q  189 gaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttcca 288  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||  |||| |  ||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||| |     
T  3846068 gaaccaaccatttacctttgatttc-caaaagatcgtctcttttggtatccaaagatttacccaatttgctcacaaa-gaatcttctctcatgtgtttcc 3846165  T
Q  289 caaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||    
T  3846166 caaccccatgaatctctccccaaaagacaccaactcttttc-caagagct-cttcttttggttcttcaagattcacattatgaacctttga 3846254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 9633816 - 9633925
Alignment:
Q  220 gatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcacca 319  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||   ||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  9633816 gatcttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactctcatcttatgtgtttaccaaccccattaatctctcccaaaaggtacca 9633915  T
Q  320 acccttttca 329  Q
    ||| ||||||    
T  9633916 acctttttca 9633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10020398 - 10020321
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggt 235  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10020398 tgtttcccaactctagaatccaaccca-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggt 10020321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 11712059 - 11712135
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 76  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11712059 ccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagctctcaaggaacaa 11712135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 3231872 - 3231943
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  3231872 ttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttcta 3231943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7597706 - 7597648
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 76  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7597706 ttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaa 7597648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Original strand, 10101351 - 10101475
Alignment:
Q  139 ccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttt 237  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  10101351 ccaaggtgtttacaaattatttcctaacactagaatctaaccccaaaacgt--accaacccttagactttgattt-aataaggatctcctcttttgatct 10101447  T
Q  238 cacaagactcgcccaagttgctcacaaa 265  Q
    |  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  10101448 cctaagattcatccaagttgctcacaaa 10101475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40535819 - 40535713
Alignment:
Q  128 ttttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 226  Q
    ||||||||  || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||  |||||||||| || |||||||||    
T  40535819 ttttcactacccaaaggtgtttcctaattgttttccaactctataatctaacctc-aaaaga-aaccaatcgataaactttgatttctcttaggatcttc 40535722  T
Q  227 tcttttggt 235  Q
    |||||||||    
T  40535721 tcttttggt 40535713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25690063 - 25689955
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| |  ||| ||    
T  25690063 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttccc 25689966  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  25689965 aatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 328
Target Start/End: Original strand, 3817680 - 3817720
Alignment:
Q  289 caaccccatgaatcttcc-ccaaaaggcaccaacccttttc 328  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3817680 caaccccatgaatctttctccaaaaggcaccaacccttttc 3817720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4283317 - 4283277
Alignment:
Q  338 ccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4283317 ccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttga 4283277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10020219 - 10020179
Alignment:
Q  330 caagagctccctattttggttctctaagattcacatcttga 370  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10020219 caagagccccctcttttggttctctaagattcacatattga 10020179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11137117 - 11137073
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaag 62  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  11137117 ttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaag 11137073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 2361031 - 2361402
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2361031 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 2361130  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2361131 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctc-aaaagagaaccaaccct 2361229  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2361230 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 2361329  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaag 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2361330 atcatccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaag 2361402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 34310775 - 34311153
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34310775 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 34310874  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34310875 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctt 34310974  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  34310975 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatga 34311074  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34311075 accttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 34311153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6432080 - 6431702
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  6432080 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttccca 6431981  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6431980 atctaaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaaccct 6431881  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  6431880 tagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccccatga 6431781  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6431780 atcttccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttga 6431702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 4512449 - 4512826
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4512449 ccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaa 4512548  T
Q  101 -tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4512549 atctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaaccct 4512648  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  4512649 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatga 4512748  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512749 atcttccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 4512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2390391 - 2390013
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  2390391 ccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcga 2390292  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390291 atttcaccaatgaacaagacacttatgattttcgctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 2390192  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  2390191 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaaccccatga 2390092  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2390091 atcttccccaaaagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttga 2390013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29608846 - 29608472
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29608846 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 29608747  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgat-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608746 atctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 29608647  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29608646 ttagcctttgatttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 29608547  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29608546 aat-----ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttga 29608472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 48599393 - 48599744
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  48599393 ccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 48599492  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48599493 atatcaccaatgaacaagacaatcatgattttcactcctccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaaccct 48599592  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||    
T  48599593 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaaccccatga 48599692  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48599693 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttc 48599744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 4508765 - 4509117
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  4508765 ccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttccca 4508864  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  4508865 atctcaccaatcaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcct 4508964  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4508965 tagcctttgatttcactaaggatcttatcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 4509064  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4509065 atcttccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttctc 4509117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 4510607 - 4510959
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4510607 ccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaa 4510706  T
Q  101 -tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  4510707 atctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgt 4510806  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4510807 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 4510906  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4510907 atcttccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttctc 4510959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22270082 - 22269706
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22270082 ccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 22269983  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22269982 atctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttagaattgtttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 22269884  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  22269883 atagcctatgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatg 22269784  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22269783 aatcttccccaaaaggcaccaactc-tttcccaagagc-ccctcttttggttctccaagattcacatcttgtagctttga 22269706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3259104 - 3258727
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  3259104 ccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttccca 3259005  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3259004 atctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaaccc 3258905  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | || |||||||    
T  3258904 ttagg-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctaataaaagactctccactcatatgtttcccatccccatg 3258807  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3258806 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctttga 3258727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 8359375 - 8359703
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  8359375 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttccc 8359474  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||     
T  8359475 aatctccccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaact 8359574  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8359575 cttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccat 8359674  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359675 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttt 8359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360347
Alignment:
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactcatgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 6360172  T
Q  202 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||    
T  6360173 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaat 6360272  T
Q  302 cttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagcttt 376  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6360273 cttcttcaaaaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttt 6360347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 376
Target Start/End: Original strand, 22328470 - 22328834
Alignment:
Q  21 caaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccat--tttccaatctcaccaatg----aa 113  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |  || |||||||| | ||||    ||    
T  22328470 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaa 22328569  T
Q  114 caagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 211  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22328570 caagacactcaatgattttcattccctcaaggtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttgatt 22328669  T
Q  212 tcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaa 310  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| |||||||    
T  22328670 aca-taaggatattctcttttagtttcccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccctatgaatctctccccaa 22328768  T
Q  311 aaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagcttt 376  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22328769 aaggcaccaactcttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagcttt 22328834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 47674002 - 47674157
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47674002 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 47674101  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674102 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 47674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1113764 - 1113601
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1113764 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaat 1113665  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1113664 ctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 1113601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27347926 - 27347761
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  27347926 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttccca 27347827  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27347826 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 27347761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 30024791 - 30024945
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30024791 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctca 30024890  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30024891 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 31733032 - 31733193
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  31733032 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtct 31733131  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31733132 caccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31733193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47676195 - 47676360
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47676195 ccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 47676294  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47676295 atctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 47676360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48491688 - 48491523
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  48491688 ccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 48491589  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48491588 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 48491523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4586270 - 4586105
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4586270 ccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 4586171  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4586170 atctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4586105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43864353 - 43864188
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43864353 ccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttcca 43864254  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43864253 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43864188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26417425 - 26417261
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26417425 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 26417326  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26417325 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 14069892 - 14070047
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  14069892 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 14069991  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14069992 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 14379920 - 14380075
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  14379920 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 14380019  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14380020 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 36146467 - 36146633
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  36146467 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttccc 36146565  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36146566 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18126753 - 18126588
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  18126753 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttcca 18126654  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18126653 atctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 18126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 38671281 - 38671446
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38671281 ccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 38671380  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38671381 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 38671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 31105452 - 31105607
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||    
T  31105452 ccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttccca 31105551  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31105552 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8153451 - 8153286
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  8153451 ccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttccca 8153352  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153351 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 8153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35854023 - 35853859
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  35854023 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 35853924  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35853923 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 35853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41317493 - 41317658
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  41317493 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttccca 41317592  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41317593 atctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23555149 - 23554982
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt---c 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  23555149 ccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttttcc 23555051  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23555050 caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31518904 - 31518752
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||    
T  31518904 ccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccca 31518805  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518804 atctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41649070 - 41649234
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||    
T  41649070 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttcca 41649168  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41649169 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41649234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48489540 - 48489375
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  48489540 ccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 48489441  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagaca-ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48489440 atctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 496042 - 496206
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  496042 ccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttccca 496141  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  496142 atctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaa-tgtttcccaa 496206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29991162 - 29990999
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29991162 ccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatccttttcccaa 29991063  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29991062 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29990999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 12097941 - 12098083
Alignment:
Q  24 agagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacact 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12097941 agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacact 12098040  T
Q  123 c-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12098041 caatgattttcactcacccaagatgtttacaa-tgtttcccaac 12098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4178882 - 4178719
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  4178882 ccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttccca 4178784  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4178783 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4178719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538764
Alignment:
Q  29 tacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  127 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatt-tttcccaac 4538764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 23565120 - 23565280
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccatttt--- 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||       
T  23565120 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttc 23565219  T
Q  97 ccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 159  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23565220 ctaatctcaccaatgaacaagacact--tcatgttcactcacccaaggtgtttacaaatgttt 23565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 4253591 - 4253754
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttac-aaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-ccaat 101  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4253591 tatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttaccaat 4253689  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  4253690 ttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19502287 - 19502122
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||   |    
T  19502287 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgc 19502188  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502187 aatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526121
Alignment:
Q  31 caaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 127  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatga 24526084  T
Q  128 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24526085 ttttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23344080 - 23343934
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-caaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||| | |||||    
T  23344080 tatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatct 23343981  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt 149  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23343980 caccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 25767019 - 25767180
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggct-acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcc-attttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  25767019 ccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcc 25767118  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25767119 aatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 32358189 - 32358273
Alignment:
Q  294 ccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32358189 ccatgaattttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 32358273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 36574574 - 36574740
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || ||  ||    
T  36574574 ccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttcccc 36574672  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  36574673 aatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 36574740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 32358113 - 32358190
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacc 78  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32358113 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48408913 - 48408747
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggct-acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  48408913 ccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcc 48408814  T
Q  99 -aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48408813 caatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48408747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 2759256 - 2759339
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatt 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2759256 ccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25615962 - 25615865
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25615962 ccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcc 25615865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360479
Alignment:
Q  17 cttacaaagagatacaaat--gggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcac-caatgaa 113  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||  || ||||||||||| |  ||| |||||||||  | |||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacctttttcccaatctcattccatgaa 1360325  T
Q  114 caagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccc-caaaagagaaccaacccttagcctttgat 210  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  1360326 caagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttgat 1360424  T
Q  211 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaa 266  Q
    ||| | ||  || ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||    
T  1360425 ttc-ccaaaaatattctcttttggttttccaagactcactcaagttgctcgcaaaa 1360479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39731478 - 39731321
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39731478 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcca 39731379  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||       |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39731378 atctcac-------caagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39731321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 6360013 - 6360077
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcac 67  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360013 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514234
Alignment:
Q  46 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactcttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaag 5514212  T
Q  144 gtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5514213 gtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 31519011 - 31518915
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  31519011 ccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcc 31518915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761526
Alignment:
Q  79 ctaatttctatccattttcc-aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 2761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5116551 - 5116366
Alignment:
Q  192 ccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaa 291  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||  ||||||| ||| |||   | | |||||   |||    
T  5116551 ccaactcttaacctttgatttc-ctgaggatcttctcttttggttacccaagactcacctaagtttatcacaaatgaccctcatttgaagtgtttaccaa 5116453  T
Q  292 ccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     || |||||||| || |||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5116452 tccaatgaatctctctccaaaaggcaccgaccctctcc-caagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttga 5116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 43504214 - 43504323
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  43504214 cactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttccca 43504313  T
Q  100 atctcaccaa 109  Q
    ||||||||||    
T  43504314 atctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 165
Target Start/End: Original strand, 24514917 - 24514984
Alignment:
Q  97 ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24514917 ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24514984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 368
Target Start/End: Original strand, 43363667 - 43363839
Alignment:
Q  193 caacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaac 292  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||| | ||||    
T  43363667 caacccttagcatttaatttc-ctaaagatcttctcttttggtctctcaagattcacccaaattgctcacaag-gactctcatctcatgtgtttctcaac 43363764  T
Q  293 cccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatctt 368  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||  | | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  43363765 cct-tgaatctcttcccaaaaggaaccaacaatgtcc-caagagctccctcttttagttctccaagatacacatctt 43363839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 3904676 - 3904837
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaac-cctaatttctatccattttcc- 98  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  3904676 cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaaattacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttcta-ccattttccc 3904774  T
Q  99 aatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 160  Q
    ||||||  || | |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3904775 aatctcttcctaagaacaagagactcaatgattt-cactcgcccaaggtgtttacaaatgtttc 3904837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 37545121 - 37545199
Alignment:
Q  151 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttt 231  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37545121 caattgtttcctaactctgtaatctaacct--aaaaaagaaccaactcttagcctttgatttttgtaaggatcttctcttt 37545199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5116713 - 5116626
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||    
T  5116713 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaacctaatttcta 5116626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 22552791 - 22552866
Alignment:
Q  294 ccatgaatcttc-cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttga 370  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22552791 ccatgaatcttttcccaaaaggcaccaaccgtttcca--agagccccctcttttggttctctaagattcacattttga 22552866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 285
Target Start/End: Original strand, 23794024 - 23794169
Alignment:
Q  138 cccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtt 236  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  23794024 cccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccacaaaatga--accaaccattagcctttgattt-tctaaggatctcctcttttggtc 23794120  T
Q  237 tcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactc-tccactcatgtgtt 285  Q
    ||  | || || ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  23794121 tcttacgattcacccaaattgctcac-aaagactcatccgctcatgtgtt 23794169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 43363556 - 43363629
Alignment:
Q  24 agagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43363556 agagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttcta-ccattttcc 43363629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20344006 - 20343897
Alignment:
Q  1 ccactatcaa-tgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| |    
T  20344006 ccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 20343909  T
Q  98 caatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||    
T  20343908 caatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 24525561 - 24525596
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatg 36  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24525561 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 6592440 - 6592509
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttccaatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6592440 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Original strand, 30843389 - 30843457
Alignment:
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  30843389 caatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 30843457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 6095658 - 6096036
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  6095658 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttccca 6095757  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6095758 atctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctt 6095857  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6095858 tagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatga 6095957  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6095958 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 6096036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34491321 - 34490944
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34491321 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 34491222  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491221 atctcaccaatgaataacacactca-gaatttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 34491123  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  34491122 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatga 34491023  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34491022 atcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 34490944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 49199528 - 49199908
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  49199528 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccc 49199627  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  49199628 aatctcaccaacgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacca 49199727  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactc-gcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  49199728 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccat 49199827  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49199828 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttga 49199908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30236234 - 30235856
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30236234 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 30236135  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30236134 atctcatcaatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcat 30236035  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  30236034 tagccttcgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaaccccatga 30235935  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30235934 atattccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 30235856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54593813 - 54593436
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  54593813 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttccca 54593714  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54593713 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaac-aaccct 54593615  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  54593614 tagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatga 54593515  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54593514 atcttccccaaaaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 54593436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46860583 - 46860202
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  46860583 ccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctca 46860484  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatg--attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46860483 atctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacc 46860384  T
Q  198 ct--tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccc 295  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||     
T  46860383 ctcttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccatccct 46860285  T
Q  296 atgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  46860284 atgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttga 46860202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47304360 - 47303983
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  47304360 ccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctca 47304261  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304260 atctcacaaatgaacaagacactcatgattttcactctcccagggtgtttaaaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 47304161  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47304160 tagtttttgatttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccccatga 47304062  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47304061 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 47303983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4570061 - 4569682
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4570061 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccca 4569962  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4569961 atctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaaccc 4569862  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4569861 ttagcctttgatttcactaaagatcatctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 4569762  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4569761 aatcttccccaataggcacacccccttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctttga 4569682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36018954 - 36018582
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatctcac 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  36018954 aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcaacccattttcccaatttcac 36018855  T
Q  107 caatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcct 205  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  36018854 caatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcct 36018755  T
Q  206 ttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  36018754 ttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccattcatgtgtttcccatccccatggatcttc 36018655  T
Q  306 cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36018654 cccaaaaggcaccaacccttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 36018582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 43401860 - 43402227
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43401860 ccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 43401959  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||            ||||||||||||||    
T  43401960 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaatcgtttcccaactctagaa------------aagagaaccaaccc 43402047  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43402048 atagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaaccccatg 43402147  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43402148 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 43402227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 41819589 - 41819958
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatctcac 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41819589 aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 41819688  T
Q  107 caatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcct 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  41819689 caatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttag-ct 41819787  T
Q  206 ttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttc 305  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  41819788 ttgatttca-taaagatcttctcttttggtttcataagactcactcaagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt- 41819885  T
Q  306 cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819886 cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 41819958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 43403803 - 43404170
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaa-atgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  43403803 ccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttccc 43403902  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||            ||||||||||||||    
T  43403903 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactttagaa------------aagagaaccaaccc 43403990  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  43403991 atagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatg 43404090  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43404091 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttga 43404170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 55302079 - 55302402
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||               |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302079 tacaagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat---------------atgaacaagacactcatgattttcactctcc 55302163  T
Q  140 caaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302164 caaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 55302263  T
Q  240 caagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctcc 339  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55302264 caagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaatttttcccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctcc 55302363  T
Q  340 ctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55302364 ctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 55302402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 5433952 - 5434313
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc---caatctcaccaatgaa 113  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  5433952 ttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttctcccaatctcaccaatgaa 5434050  T
Q  114 caagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattt 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||     
T  5434051 caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttgatta 5434149  T
Q  213 cactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaa 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| |||    
T  5434150 ca-taaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaacttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctctccctaaa 5434248  T
Q  312 aggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagcttt 376  Q
    |  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5434249 aaacactaacccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagcttt 5434313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40913350 - 40913069
Alignment:
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcac----tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40913350 ctcaccaatgaacaagacactcataattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacc 40913251  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40913250 cttaacctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccat 40913151  T
Q  298 gaatcttc-cccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40913150 gaatcttctccaaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttga 40913069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340457
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatctcacc 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  108 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 5236519 - 5236680
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5236519 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 5236618  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5236619 caccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5236680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 44700537 - 44700703
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  44700537 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 44700636  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44700637 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40734607 - 40734442
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40734607 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 40734508  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40734507 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44331654 - 44331489
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44331654 ccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttccta 44331555  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44331554 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 46173466 - 46173311
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  46173466 ccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta--------ccaa 46173375  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 164  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173374 ttttaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 29196445 - 29196612
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  29196445 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttccc 29196544  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196545 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40735492 - 40735337
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40735492 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 40735393  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40735392 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 22835061 - 22835226
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  22835061 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 22835160  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22835161 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgattacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51398923 - 51398768
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51398923 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttcca 51398824  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51398823 atctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19683948 - 19684113
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19683948 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 19684047  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19684048 atctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19684113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29810977 - 29810812
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |    
T  29810977 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacatattttccta 29810878  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29810877 atctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31314554 - 31314389
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31314554 ccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctca 31314455  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31314454 atctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 31314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9581391 - 9581227
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  9581391 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttccgaa 9581292  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9581291 tcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9581227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 760956 - 760791
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  760956 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttccca 760857  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  760856 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 760791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29682468 - 29682303
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  29682468 ccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttccca 29682369  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682368 atctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29682303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45095272 - 45095109
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  45095272 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttccca 45095174  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45095173 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45095109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16499138 - 16498984
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16499138 ccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgttttccca 16499040  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16499039 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 53921562 - 53921717
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  53921562 ccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttcca 53921661  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53921662 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtttttacaat 53921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5258203 - 5258368
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  5258203 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 5258302  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258303 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 9666525 - 9666693
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatcca-ttttcc 98  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||    
T  9666525 ccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttcc 9666624  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9666625 aatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7762374 - 7762220
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  7762374 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctca 7762275  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7762274 atctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-accaaggtgttcacaat 7762220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29813172 - 29813017
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca-ttttcca 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  29813172 ccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttcca 29813073  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29813072 atctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37408567 - 37408403
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  37408567 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccca 37408468  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  37408467 atctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactc-actaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37408403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 39153420 - 39153585
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  39153420 ccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttccca 39153519  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39153520 atctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39153585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32891213 - 32891049
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc-c 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |    
T  32891213 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctc 32891114  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 163  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32891113 aatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5260382 - 5260547
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  5260382 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 5260481  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5260482 aatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5260547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7764573 - 7764422
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||      
T  7764573 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttccc-- 7764476  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7764475 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 35138764 - 35139091
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||    
T  35138764 ccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacataatttctacccatttctca 35138863  T
Q  100 atctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaac 196  Q
    |||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||  |||    
T  35138864 atctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattgttt-ccaactttaaaatttaa-ccccaaaagagaattaac 35138961  T
Q  197 ccttagc-ctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaacccc 295  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||   |||||||||||  ||||||||||   | || ||||   ||||| |    
T  35138962 ccttagcttttttatttc-ctaaggatcttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctca-taaagactctcatttgatttgttttccaacctc 35139059  T
Q  296 atgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttt 326  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  35139060 atgaatctctcctcaaaaggcatcaacccttt 35139091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Original strand, 26323133 - 26323381
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    ||||||||||||| | || || |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| || || |||  |||    
T  26323133 cactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttacccttttctcaa 26323232  T
Q  101 tctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26323233 tctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaagagaaccaacc 26323332  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactc 247  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  26323333 cttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactc 26323381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683270
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaag 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacccc-aaaagataaccaacccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaag 1683343  T
Q  255 ttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttt 326  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  1683342 ttgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatgcaccaacccttt 1683270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23391968 - 23392133
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||    
T  23391968 ccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttccca 23392067  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23392068 aactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23392133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 23200198 - 23200360
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cca 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||    
T  23200198 cactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttcta-ccatttttccca 23200296  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23200297 atctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23200360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 9636185 - 9636340
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt--ttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||    
T  9636185 ccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctccc 9636284  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9636285 aatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 23197999 - 23198161
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cca 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||    
T  23197999 cactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttcta-ccatttttccca 23198097  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23198098 atctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23198161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 23410403 - 23410543
Alignment:
Q  16 tcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aatctcaccaatgaac 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23410403 tcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaac 23410502  T
Q  115 aagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23410503 aagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 23410543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28074488 - 28074348
Alignment:
Q  237 tcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagc 336  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||    
T  28074488 tcacaagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccccaaaacgcaccaa-ctatttcccaagagc 28074390  T
Q  337 tccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28074389 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttga 28074348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20937762 - 20937444
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatctta-caaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatct 103  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||    
T  20937762 tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataatttctacctattttccgatct 20937663  T
Q  104 cac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 200  Q
    |   | |||||||||| ||||| |||||  |||||  | ||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  20937662 ctttctatgaacaagagactcaatgattg-cactcatctaagctgttttccaattatttctcaactctagaatcta-ctcccaaaagagaaccaaccttt 20937565  T
Q  201 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaa 300  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| |||||||| |   | |||||||   ||||| ||||||    
T  20937564 atcctttgatttc-ctaagaatcttctcttttggtctcccaagaatcacccaagtttgtcac-aaagactcccttttgatgtgtttttcaaccacatgaa 20937467  T
Q  301 tct-tccccaaaaggcaccaacc 322  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  20937466 tctctcctcaaaaggcaccaacc 20937444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39127614 - 39127290
Alignment:
Q  43 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctccc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||   ||||  |||||||  |  ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  39127614 aagaaattagcttcaacaagctcaccaagaacaaacataatttatacttatttctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttcc 39127515  T
Q  141 aaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 239  Q
    ||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||         
T  39127514 aaggtattttccaattgtttccaaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcctttgatttc-ctaagggtattctcttttgg----- 39127422  T
Q  240 caagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctc 338  Q
          || | |||||||| ||| ||||||||     | ||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||  |    
T  39127421 ------tctctcaagttgcccac-aaagactcatatttgatgtgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaactctcttc-caagagtcc 39127330  T
Q  339 cctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39127329 cctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttga 39127290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34795819 - 34795601
Alignment:
Q  157 tttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagtt 256  Q
    |||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  34795819 tttcccaactttagaatttaaccac-aaaagagaaccatcccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagtt 34795722  T
Q  257 gctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctcta 355  Q
     || |||||| |||||||  | ||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||  || || | || | ||| | |||| || |||||||| |    
T  34795721 tcttacaaaa-actctcctttgatgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaaggcatgaaacc-tctccctagaaccccctcttctggttctcca 34795624  T
Q  356 agattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  34795623 agattcagatcttgaagctttga 34795601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386692
Alignment:
Q  58 acaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 32744495 - 32744589
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt 96  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  32744495 ccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccatttt 32744589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5373326 - 5373198
Alignment:
Q  17 cttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt--ccaatctcaccaatgaa 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||||    
T  5373326 cttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttctacccttttttcccaatctcttcaatgaa 5373227  T
Q  114 caagacactc-atgattttcactctccca 141  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  5373226 caagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 51352170 - 51352293
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  51352170 ccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatggt-tacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccctaacttctatc-attttcct 51352267  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactca 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  51352268 aatctcaccaataaacaagacactca 51352293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 801201 - 801091
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  801201 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttccc 801102  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  801101 aatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 7780063 - 7780168
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  7780063 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggt-tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacccttttccca 7780161  T
Q  100 atctcac 106  Q
    |||||||    
T  7780162 atctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Original strand, 25491027 - 25491116
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatc 90  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25491027 cactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttctatc 25491116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 8166533 - 8166677
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaatgaacaag 117  Q
    |||||||||||||||||  || || |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  8166533 ttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactcatttatcaatctcttccatgaacaag 8166632  T
Q  118 acactc---atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 159  Q
    |||| |   ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  8166633 acacactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaaatgttt 8166677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 165
Target Start/End: Original strand, 2075156 - 2075281
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt--ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 135  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2075156 tacaataaattagcttaaa--agctcacaaagaaccaactctaattacta-ccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 2075252  T
Q  136 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |   ||||||||||| || |||||||||||    
T  2075253 c-agcaaggtgtttataaatgtttcccaac 2075281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Original strand, 3148054 - 3148153
Alignment:
Q  6 atcaatgagat-cttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctc 104  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  3148054 atcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttctatccatttctcaatctc 3148153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 4055822 - 4055926
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagat-cttacaaagagatacaaatg-ggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||  ||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  4055822 ccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa-cctaatttctacccatttccc 4055920  T
Q  99 aatctc 104  Q
    ||||||    
T  4055921 aatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 98
Target Start/End: Original strand, 28253365 - 28253423
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28253365 tacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttcta-ccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 368
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  313 ggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatctt 368  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6716608 - 6716500
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  6716608 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 6716511  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  6716510 aatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 378
Target Start/End: Original strand, 26323821 - 26323949
Alignment:
Q  249 cccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttg 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| | |  |||| |||||||||| |||| ||| ||| | || |||||    
T  26323821 cccaagttgctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctgctgaaaatgcaccaaccc-tttcccaatagccctctcttttg 26323918  T
Q  348 gttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  26323919 attcttcaagatttacatcttgaagctttga 26323949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 40913402 - 40913352
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaatta 51  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40913402 ccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 54635233 - 54635125
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  54635233 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 54635136  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  54635135 aatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386876
Alignment:
Q  22 aaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 88  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacctaatttcta 4386876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36796749 - 36796692
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 213  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36796749 tgtttcccaactcttgaatctaaccctcaaaagt-aatcaacccttagcctttgatttc 36796692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 50432840 - 50432898
Alignment:
Q  207 tgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaa 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  50432840 tgatttcactaaggatctccttttttggtctctcaagattcaaccaagttgctcacaaa 50432898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 54739012 - 54739100
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54739012 ccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttacat-aaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttcta 54739100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33191940 - 33191866
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 76  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33191940 ccactatcaatgagttctttacaaagacata-aaatggt-tacaagaacttagcttcaacaagctctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 2972998 - 2973376
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  2972998 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttccca 2973097  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2973098 atctcaccaatgaacacgacacttatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaaccct 2973197  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  2973198 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaaccccatga 2973297  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2973298 atcttcccaaaaaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 2973376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21593773 - 21593397
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-a 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21593773 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 21593674  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593673 atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 21593574  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  21593573 tagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatga 21593476  T
Q  300 atcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21593475 atcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctttga 21593397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5043734 - 5043359
Alignment:
Q  3 actatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-caat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  5043734 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaat 5043635  T
Q  102 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5043634 ctcacgaatgaacaagacactcatgattttcactctcacaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta 5043535  T
Q  202 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaat 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5043534 gcctttgattccactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaat 5043435  T
Q  302 cttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5043434 ctt-cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctttga 5043359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17763099 - 17762718
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17763099 ccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 17763000  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762999 atctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctctcaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 17762900  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17762899 ttagcctttgatttcactaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 17762800  T
Q  299 aatct--tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17762799 aatctaacccccaaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagccttga 17762718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 3808767 - 3809146
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  3808767 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttccc 3808866  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808867 aatctcaccaatgaacaagacacttgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaaccc 3808965  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3808966 ttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatg 3809065  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-ctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3809066 aatcttctccaaaaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 3809146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 603147 - 603517
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||       |    
T  603147 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttctaccca-------a 603239  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  603240 tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccatt 603339  T
Q  201 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  603340 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaa 603439  T
Q  301 tcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  603440 tcttctccaaaaggcaccaaccctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 603517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 26830182 - 26830555
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  26830182 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttcca 26830281  T
Q  100 atctcacc-aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccc 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830282 atctcacccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccc 26830381  T
Q  199 ttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||||||    
T  26830382 ttagcctttgatttcactaagaatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccccatg 26830481  T
Q  299 aatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaag 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26830482 aatcttctccaaaaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggttctccaagattcacatcttgaag 26830555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Original strand, 22424892 - 22425260
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaa--tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctca 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22424892 aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca 22424991  T
Q  106 ccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22424992 ccaacgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccc-aaaagagaaccaacccttagc- 22425089  T
Q  205 tttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatctt 304  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22425090 tttgatttc-ctaaggatattctcttttggtttcacaagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatctt 22425188  T
Q  305 ccccaaaaggcaccaacccttttcacaagag--ctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagct 374  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22425189 ccccaaaatgcaccaacccttatcccaagaggcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 22425260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 198 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17757995 - 17757813
Alignment:
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17757995 cttagcctttgatttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccat 17757896  T
Q  298 gaatct--tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  17757895 gaatctaacccccaaaatgcaccaacccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttga 17757813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9183090 - 9183255
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttc-ca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9183090 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 9183189  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9183190 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 28137467 - 28137632
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28137467 ccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 28137566  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28137567 ttctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28137632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21589040 - 21588913
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21589040 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 21588941  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588940 atctcaccaatgaacaagacactcatga 21588913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17758132 - 17757994
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17758132 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 17758033  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactct 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17758032 atctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactct 17757994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 26954345 - 26954509
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  26954345 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttataccaatttcccaa 26954444  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  26954445 tctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactccccaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26954509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 3038962 - 3039127
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  3038962 ccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttccca 3039061  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3039062 atctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3039127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5406259 - 5406422
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5406259 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttccca 5406357  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5406358 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5410584 - 5410747
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5410584 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttccca 5410682  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5410683 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2171591 - 2171754
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2171591 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccc 2171688  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2171689 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 33211252 - 33211409
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatctcacc 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  33211252 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcacc 33211351  T
Q  108 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33211352 aatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5413453 - 5413616
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||    
T  5413453 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacctttttcccaa 5413552  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5413553 tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 5413616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 31404734 - 31404887
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31404734 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttccca 31404832  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31404833 atctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 31404887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 30834595 - 30834750
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  30834595 ccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 30834694  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  30834695 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accgaggtgtttacaat 30834750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 16452388 - 16452543
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  16452388 ccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 16452487  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16452488 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25073678 - 25073463
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcca 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||| ||    
T  25073678 ccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatctaatttctaccattttttca 25073579  T
Q  100 atctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaac 196  Q
    |||||  || |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25073578 atctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaac 25073480  T
Q  197 ccttagcctttgatttc 213  Q
    ||||||||||| |||||    
T  25073479 ccttagcctttaatttc 25073463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4045533 - 4045364
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-c 97  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  4045533 ccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcc 4045435  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 167  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4045434 caatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaactc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26800630 - 26800502
Alignment:
Q  249 cccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttgg 348  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  26800630 cccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccc-atgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctcttttgg 26800532  T
Q  349 ttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    || || | ||| ||||||||||||||||||    
T  26800531 ttatccatgatccacatcttgaagctttga 26800502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 33160411 - 33160577
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||  ||    
T  33160411 ccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttccc 33160510  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33160511 aatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33160577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 271
Target Start/End: Original strand, 5740978 - 5741120
Alignment:
Q  129 tttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 227  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5740978 tttcactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttgattt-actaaggatcttca 5741076  T
Q  228 cttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactc 271  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  5741077 ctttttgtttctcaagattcacccaaattgctcacaaaagactc 5741120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 3072819 - 3072928
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3072819 cactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttccc 3072917  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  3072918 aatctcaccaa 3072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25073076 - 25072917
Alignment:
Q  217 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcaca-aaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaagg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||  ||||| |||||||||||  | ||||||| |  ||||| |||||||| | ||||| |||    
T  25073076 aaggatcttctcttttggtttcccaagacctatccaagtt--tcacataaagactctcctttgatgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagagg 25072979  T
Q  315 caccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||| | |||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25072978 cacaatcccttttc-caagagcccccc-tttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttga 25072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16569104 - 16569037
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttc-caatctca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16569104 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctca 16569037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 412211 - 412101
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgg-gctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  412211 ccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttctacctttttccc 412112  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  412111 aatctcaccaa 412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660452
Alignment:
Q  141 aaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 239  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| || | | |||||||||| ||     
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacccc--aaaatgaaccaacccttagcctttgaattc-ctatggttatcctcttttggtctcc 11660478  T
Q  240 caagactcgcccaagttgctcacaaa 265  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  11660477 caagattcatccaaattgctcacaaa 11660452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 6097539 - 6097608
Alignment:
Q  40 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6097539 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaa 6097608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567160
Alignment:
Q  42 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||          |||||||||| ||||||||||||| |    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  139 ccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||||||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26800689 - 26800630
Alignment:
Q  9 aatgagatcttacaaagagatacaaa-tgggctacaagaaattagcttcaacaagctcac 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800689 aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 5740074 - 5740160
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaatctc 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| | |||||||||||| | || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5740074 ttacaaagaaatacaaaaggtttacaataaattggtttcaacaagctctctaaaagcaaacctagtttctatccattttccaatctc 5740160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27647969 - 27647861
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttcc 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  27647969 ccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 27647872  T
Q  99 aatctcaccaa 109  Q
    |||||||||||    
T  27647871 aatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16554978 - 16554869
Alignment:
Q  1 ccactatcaa-tgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| |    
T  16554978 ccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 16554881  T
Q  98 caatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||    
T  16554880 caatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16631534 - 16631425
Alignment:
Q  1 ccactatcaa-tgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttc 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||| |    
T  16631534 ccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggt-tacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 16631437  T
Q  98 caatctcaccaa 109  Q
    ||||||||||||    
T  16631436 caatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 186806 - 186736
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  186806 ttacaaagagatacaaaagagctataaaaatttaacttcaacaagctctccaagaacaaaccttatttcta 186736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 5409128 - 5409161
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaa 34  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5409128 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 2 - 378
Target Start/End: Original strand, 80343 - 80720
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-aa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  80343 cactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 80442  T
Q  101 tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  80443 tctcagcaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaaccaaccctt 80542  T
Q  201 agcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  80543 agcctttgatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaaccccatgaa 80642  T
Q  301 tcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  80643 tcttccccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctttga 80720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 18063 - 18438
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  18063 ccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttccca 18161  T
Q  101 -tctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccct 199  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18162 ctctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc-aactctataatctaacccc-aaaagagaaccaactct 18259  T
Q  200 tagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  18260 tagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgtt-ttcaacctcatga 18358  T
Q  300 atctt-ccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18359 atcttcccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttga 18438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11666 - 11289
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  11666 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccc 11568  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11567 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaat-gtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacc 11470  T
Q  198 cttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccat 297  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11469 tttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccat 11370  T
Q  298 gaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttga 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11369 gaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 149156 - 149311
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  149156 ccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttccca 149255  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  149256 atctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 114711 - 114547
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-cca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||    
T  114711 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttccca 114612  T
Q  100 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  114611 atctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 434642 - 434504
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  434642 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccc 434543  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  434542 aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 378
Target Start/End: Original strand, 490661 - 490881
Alignment:
Q  155 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaag 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  490661 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 490758  T
Q  255 ttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagctccctattttggttctc 353  Q
    ||||||| |||| |||||||  | ||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||    
T  490759 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctcca-aagagcccccttttttggttctc 490856  T
Q  354 taagattcacatcttgaagctttga 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  490857 caagattcacatcttgaagctttga 490881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 490380 - 490467
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 88  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  490380 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttcta 490467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 20478 - 20629
Alignment:
Q  5 tatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt-ccaatct 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||    
T  20478 tatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatct 20577  T
Q  104 caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 154  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20578 caccaatgaataataaactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 861
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatttt--cc 98  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  1024 ccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccc 926  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  925 aatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 11220 - 11385
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt--ttc 97  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |    
T  11220 ccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcc 11319  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11320 caatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 8794 - 8959
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaa-gagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt--ttc 97  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |    
T  8794 ccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcc 8893  T
Q  98 caatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8894 caatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactc-accaaggtctttacaa-tgtttcccaac 8959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1841
Alignment:
Q  135 tctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt----------agcctttgatttcactaaggatc 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||          ||| ||||||||| |||||||||    
T  1591 tctcccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaa-ccccaaaagagaaccaacacttataagttataagcttttgatttc-ctaaggatc 1688  T
Q  224 ttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttccacaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacc 322  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||   | ||||||| | ||||  ||||||||| ||| |||||| |||||| |    
T  1689 ttctcttttgatctcccaagactcgcccaagttgctcac-aatgactctcatatgatgtgtttctcaactacatgaatctctccacaaaagacaccaagc 1787  T
Q  323 cttttcacaagagctccctattttggttctctaagattcacatcttgaagctttg 377  Q
    | |  | ||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1788 c-tcgcccaagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttg 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10598 - 10475
Alignment:
Q  1 ccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccatttt-cc 98  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||    
T  10598 ccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataaattagca-caaga-gctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttcc 10501  T
Q  99 aatctcaccaatgaacaagacactca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  10500 aatctcacaaatgaacaagacactca 10475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25162 - 25000
Alignment:
Q  2 cactatcaatgagatctt-acaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcc-- 98  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||      
T  25162 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttcta-ccattttcccg 25064  T
Q  99 aatctcacca-atgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 161  Q
    |||||   ||  ||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25063 aatcttgtcatgtgatcaacagactcaatga-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 25000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 27519 - 27566
Alignment:
Q  18 ttacaaagagatacaaatgggctacaagaaattagcttcaacaagctc 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27519 ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctc 27566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University