View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2042_low_1 (Length: 933)

Name: NF2042_low_1
Description: NF2042
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2042_low_1
NF2042_low_1
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (610-924)||(250722-251036)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (617-925)||(31414806-31415114)
chr8 (617-925)||(23657063-23657371)
chr8 (614-925)||(27356672-27356983)
chr8 (610-924)||(21323609-21323923)
chr8 (610-925)||(22052999-22053314)
chr8 (615-925)||(16269559-16269869)
chr8 (623-925)||(20008264-20008566)
chr8 (610-925)||(31569173-31569487)
chr8 (623-925)||(28983047-28983349)
chr8 (623-925)||(28988266-28988568)
chr8 (610-924)||(21927565-21927879)
chr8 (623-925)||(4984178-4984480)
chr8 (610-848)||(22061009-22061247)
chr8 (722-925)||(6605794-6605997)
chr8 (662-925)||(19861571-19861834)
chr8 (610-852)||(19984389-19984631)
chr8 (610-852)||(20390295-20390537)
chr8 (614-924)||(29301760-29302070)
chr8 (617-888)||(22522719-22522990)
chr8 (610-925)||(32602281-32602596)
chr8 (620-918)||(20016603-20016901)
chr8 (614-898)||(22422226-22422510)
chr8 (610-890)||(23887199-23887479)
chr8 (614-921)||(30311478-30311785)
chr8 (610-882)||(22246763-22247035)
chr8 (620-918)||(18858720-18859018)
chr8 (614-915)||(22375787-22376088)
chr8 (757-925)||(14567278-14567446)
chr8 (612-918)||(17672355-17672661)
chr8 (623-898)||(19980130-19980405)
chr8 (610-873)||(21164868-21165131)
chr8 (630-925)||(22131391-22131686)
chr8 (620-918)||(22118515-22118813)
chr8 (620-918)||(22127299-22127597)
chr8 (614-898)||(15535546-15535830)
chr8 (614-898)||(22041990-22042274)
chr8 (617-780)||(22989326-22989489)
chr8 (632-898)||(21253107-21253373)
chr8 (614-783)||(21392195-21392364)
chr8 (614-783)||(21781521-21781690)
chr8 (614-783)||(21782754-21782923)
chr8 (614-783)||(21786689-21786858)
chr8 (623-810)||(20394476-20394663)
chr8 (610-761)||(22373168-22373319)
chr8 (612-915)||(19482404-19482699)
chr8 (634-898)||(23652204-23652468)
chr8 (818-925)||(22373067-22373174)
chr8 (633-873)||(19864446-19864686)
chr8 (721-873)||(21920189-21920341)
chr8 (610-753)||(16875425-16875568)
chr8 (623-750)||(16414402-16414529)
chr8 (623-753)||(21848680-21848810)
chr8 (610-750)||(20650685-20650825)
chr8 (614-694)||(22030470-22030550)
chr8 (632-753)||(23155394-23155515)
chr8 (610-750)||(21194870-21195010)
chr8 (632-748)||(24932176-24932292)
chr8 (610-750)||(22436614-22436754)
chr8 (845-886)||(19869868-19869909)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (614-925)||(16948350-16948661)
chr7 (610-925)||(13023417-13023732)
chr7 (617-924)||(13675513-13675820)
chr7 (610-924)||(15100477-15100791)
chr7 (615-925)||(12458700-12459010)
chr7 (623-925)||(26092685-26092987)
chr7 (614-925)||(49154361-49154672)
chr7 (610-925)||(12204674-12204989)
chr7 (623-925)||(11301100-11301402)
chr7 (610-924)||(18051827-18052141)
chr7 (610-925)||(14139739-14140054)
chr7 (610-921)||(15342495-15342806)
chr7 (610-925)||(23503744-23504059)
chr7 (610-924)||(14262119-14262433)
chr7 (610-925)||(16070171-16070484)
chr7 (614-925)||(11386307-11386618)
chr7 (615-925)||(13966547-13966857)
chr7 (610-924)||(19614736-19615050)
chr7 (627-921)||(26116481-26116775)
chr7 (623-924)||(14284263-14284564)
chr7 (653-924)||(20748671-20748940)
chr7 (653-924)||(19149272-19149541)
chr7 (610-888)||(15146780-15147058)
chr7 (620-918)||(11235119-11235417)
chr7 (620-918)||(14334462-14334760)
chr7 (620-898)||(15256-15534)
chr7 (620-918)||(15158963-15159261)
chr7 (610-898)||(11550998-11551286)
chr7 (614-898)||(14041781-14042065)
chr7 (614-898)||(14351811-14352095)
chr7 (612-898)||(10872776-10873062)
chr7 (610-898)||(12689588-12689876)
chr7 (610-890)||(48813148-48813428)
chr7 (610-925)||(14956613-14956928)
chr7 (620-898)||(8709691-8709969)
chr7 (620-918)||(13688107-13688405)
chr7 (620-898)||(18179831-18180109)
chr7 (610-873)||(9590479-9590742)
chr7 (612-898)||(44789249-44789535)
chr7 (610-890)||(15626619-15626899)
chr7 (620-918)||(18588077-18588375)
chr7 (610-708)||(11770298-11770396)
chr7 (610-753)||(7826131-7826274)
chr7 (610-753)||(27105670-27105813)
chr7 (610-753)||(27172512-27172655)
chr7 (614-691)||(16727283-16727360)
chr7 (614-691)||(17704355-17704432)
chr7 (610-753)||(4442159-4442302)
chr7 (610-753)||(13379114-13379257)
chr7 (614-655)||(21754742-21754783)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (610-925)||(10466881-10467196)
chr6 (610-924)||(19436937-19437251)
chr6 (610-925)||(14377948-14378263)
chr6 (610-925)||(14379498-14379813)
chr6 (18-233)||(16530102-16530318)
chr6 (610-925)||(25769778-25770093)
chr6 (614-925)||(24366346-24366657)
chr6 (610-924)||(19454959-19455272)
chr6 (614-925)||(21568027-21568338)
chr6 (610-925)||(21473535-21473849)
chr6 (618-924)||(28280853-28281159)
chr6 (610-924)||(19881233-19881546)
chr6 (617-922)||(18796627-18796932)
chr6 (610-925)||(15461270-15461585)
chr6 (610-924)||(34643618-34643932)
chr6 (230-428)||(16529949-16530167)
chr6 (618-843)||(24516448-24516673)
chr6 (612-888)||(27189407-27189683)
chr6 (612-888)||(27259557-27259833)
chr6 (614-873)||(18183403-18183662)
chr6 (610-888)||(23085803-23086081)
chr6 (612-898)||(28261231-28261517)
chr6 (612-898)||(28284399-28284685)
chr6 (612-898)||(28339980-28340266)
chr6 (623-898)||(5837264-5837539)
chr6 (610-925)||(18405976-18406291)
chr6 (614-925)||(20633976-20634287)
chr6 (610-873)||(18963120-18963383)
chr6 (620-898)||(2872845-2873123)
chr6 (611-925)||(25607894-25608208)
chr6 (614-898)||(16961518-16961802)
chr6 (623-925)||(19866621-19866923)
chr6 (610-898)||(22828387-22828675)
chr6 (611-791)||(30679040-30679220)
chr6 (620-898)||(25114513-25114791)
chr6 (610-766)||(8761784-8761940)
chr6 (620-898)||(16925681-16925958)
chr6 (620-918)||(24293824-24294122)
chr6 (610-898)||(22760487-22760775)
chr6 (641-924)||(25763291-25763574)
chr6 (614-781)||(27563869-27564036)
chr6 (632-870)||(16573879-16574117)
chr6 (632-870)||(16621263-16621501)
chr6 (623-783)||(22435945-22436105)
chr6 (623-783)||(21755009-21755168)
chr6 (416-576)||(4129084-4129246)
chr6 (610-753)||(16648001-16648144)
chr6 (614-709)||(23080573-23080668)
chr6 (610-753)||(23998354-23998497)
chr6 (528-609)||(16529869-16529952)
chr6 (610-753)||(16380405-16380548)
chr6 (472-576)||(4101226-4101334)
chr6 (472-576)||(4126589-4126697)
chr6 (660-925)||(18450437-18450702)
chr6 (770-894)||(23080434-23080558)
chr6 (610-753)||(1646846-1646989)
chr6 (782-873)||(19487486-19487577)
chr6 (343-393)||(4128852-4128902)
chr6 (623-753)||(14130575-14130705)
chr6 (623-753)||(16100121-16100251)
chr6 (623-753)||(23025791-23025921)
chr6 (409-458)||(4100462-4100508)
chr6 (409-458)||(4125793-4125839)
chr6 (612-670)||(28311819-28311877)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (610-925)||(31209-31524)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (614-924)||(24097566-24097876)
chr1 (615-925)||(21952994-21953304)
chr1 (610-925)||(20833859-20834174)
chr1 (610-924)||(20938022-20938336)
chr1 (610-924)||(19661095-19661409)
chr1 (623-925)||(48424989-48425291)
chr1 (623-925)||(52987857-52988159)
chr1 (610-925)||(20854719-20855034)
chr1 (615-925)||(20296497-20296807)
chr1 (623-925)||(38910798-38911100)
chr1 (610-922)||(21743511-21743823)
chr1 (623-925)||(37679165-37679467)
chr1 (610-920)||(19856395-19856705)
chr1 (623-925)||(31537969-31538271)
chr1 (614-924)||(16378181-16378491)
chr1 (614-895)||(41310672-41310953)
chr1 (617-898)||(20140195-20140476)
chr1 (633-873)||(50618380-50618620)
chr1 (614-925)||(17042978-17043289)
chr1 (620-925)||(21839035-21839340)
chr1 (612-918)||(33388990-33389296)
chr1 (612-898)||(16348556-16348843)
chr1 (610-925)||(19108453-19108768)
chr1 (614-873)||(22360207-22360466)
chr1 (612-918)||(51331454-51331760)
chr1 (614-898)||(21233694-21233978)
chr1 (610-898)||(21751052-21751340)
chr1 (614-898)||(22503252-22503536)
chr1 (614-897)||(21862336-21862619)
chr1 (620-918)||(21832394-21832692)
chr1 (653-925)||(24792618-24792890)
chr1 (614-872)||(430079-430337)
chr1 (612-915)||(41351629-41351926)
chr1 (610-753)||(20829351-20829494)
chr1 (610-753)||(35930784-35930927)
chr1 (610-749)||(20527314-20527453)
chr1 (610-753)||(20927311-20927454)
chr1 (613-673)||(21739998-21740058)
chr1 (610-753)||(41215815-41215958)
chr1 (830-898)||(20944142-20944210)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (610-925)||(19717444-19717759)
chr2 (620-925)||(19650487-19650792)
chr2 (610-924)||(23278478-23278792)
chr2 (610-916)||(25255629-25255935)
chr2 (623-925)||(31832359-31832661)
chr2 (610-925)||(27789441-27789756)
chr2 (623-925)||(1065452-1065754)
chr2 (610-924)||(12576055-12576369)
chr2 (614-925)||(23098449-23098760)
chr2 (610-925)||(23112437-23112755)
chr2 (722-925)||(24950291-24950494)
chr2 (610-898)||(24677217-24677505)
chr2 (620-918)||(24264078-24264376)
chr2 (620-918)||(24711742-24712040)
chr2 (610-888)||(24818657-24818935)
chr2 (610-897)||(23073592-23073879)
chr2 (620-898)||(24875187-24875465)
chr2 (614-925)||(23106159-23106470)
chr2 (612-918)||(10870558-10870864)
chr2 (612-918)||(27219724-27220030)
chr2 (620-918)||(41606822-41607120)
chr2 (610-925)||(30209344-30209659)
chr2 (612-918)||(9337290-9337596)
chr2 (612-898)||(16927088-16927374)
chr2 (612-898)||(17000728-17001014)
chr2 (612-898)||(9485944-9486230)
chr2 (620-898)||(21143478-21143756)
chr2 (620-918)||(27372977-27373275)
chr2 (612-898)||(44383999-44384285)
chr2 (632-898)||(21323715-21323981)
chr2 (811-925)||(27208800-27208914)
chr2 (665-898)||(23189646-23189879)
chr2 (614-873)||(22734205-22734464)
chr2 (632-925)||(30010633-30010926)
chr2 (614-873)||(24705913-24706172)
chr2 (856-924)||(23295637-23295705)
chr2 (610-753)||(22279978-22280121)
chr2 (610-753)||(24829615-24829758)
chr2 (665-729)||(23611070-23611134)
chr2 (610-750)||(24568095-24568235)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (617-925)||(24315-24623)
scaffold0104 (610-924)||(44307-44621)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (610-925)||(11959284-11959599)
chr3 (610-924)||(12358642-12358956)
chr3 (610-924)||(31693300-31693614)
chr3 (610-924)||(31940603-31940917)
chr3 (610-925)||(11950023-11950338)
chr3 (610-921)||(18132461-18132772)
chr3 (623-925)||(47125643-47125945)
chr3 (615-925)||(12510603-12510913)
chr3 (610-924)||(44778947-44779261)
chr3 (610-925)||(13943723-13944038)
chr3 (610-925)||(41179221-41179536)
chr3 (610-924)||(16834630-16834939)
chr3 (614-925)||(13318621-13318932)
chr3 (617-924)||(17188074-17188381)
chr3 (623-925)||(28756017-28756319)
chr3 (610-925)||(10418160-10418475)
chr3 (610-924)||(14088373-14088687)
chr3 (610-924)||(12180038-12180358)
chr3 (610-925)||(16379043-16379358)
chr3 (615-925)||(16327780-16328090)
chr3 (610-925)||(15229302-15229617)
chr3 (610-925)||(15235170-15235485)
chr3 (613-924)||(16826399-16826705)
chr3 (617-852)||(24189076-24189311)
chr3 (610-924)||(13970235-13970549)
chr3 (623-872)||(10407720-10407969)
chr3 (610-883)||(8745505-8745776)
chr3 (716-924)||(12269910-12270118)
chr3 (612-921)||(16754829-16755138)
chr3 (610-858)||(14291647-14291895)
chr3 (612-918)||(15587520-15587826)
chr3 (614-898)||(15261346-15261630)
chr3 (610-925)||(15013882-15014197)
chr3 (612-898)||(53383146-53383432)
chr3 (614-898)||(16805077-16805361)
chr3 (610-853)||(14579534-14579777)
chr3 (612-918)||(15346373-15346679)
chr3 (612-918)||(20060182-20060488)
chr3 (620-925)||(15400653-15400958)
chr3 (610-810)||(11888480-11888680)
chr3 (612-898)||(5423058-5423344)
chr3 (612-898)||(6602452-6602738)
chr3 (612-898)||(10007316-10007602)
chr3 (612-898)||(10907926-10908212)
chr3 (612-898)||(12888425-12888711)
chr3 (614-898)||(16693880-16694164)
chr3 (612-898)||(3687659-3687945)
chr3 (620-898)||(5108747-5109025)
chr3 (612-898)||(48427163-48427449)
chr3 (620-783)||(15357914-15358077)
chr3 (612-918)||(13254386-13254692)
chr3 (612-898)||(16637489-16637775)
chr3 (614-873)||(17491591-17491850)
chr3 (610-753)||(24185051-24185194)
chr3 (661-925)||(14874676-14874940)
chr3 (610-708)||(12272254-12272352)
chr3 (620-709)||(15714192-15714281)
chr3 (612-709)||(43164580-43164677)
chr3 (721-925)||(15723171-15723375)
chr3 (614-710)||(18437044-18437140)
chr3 (610-753)||(30139677-30139820)
chr3 (610-753)||(30149228-30149371)
chr3 (633-753)||(8272548-8272668)
chr3 (610-753)||(13965478-13965621)
chr3 (610-753)||(15611974-15612117)
chr3 (610-753)||(15948596-15948739)
chr3 (610-670)||(12844229-12844289)
chr3 (610-753)||(6150979-6151122)
chr3 (623-753)||(17200505-17200635)
chr3 (345-410)||(32510104-32510169)
chr3 (833-925)||(15340958-15341050)
chr3 (612-684)||(26791541-26791613)
chr3 (409-505)||(34376222-34376315)
chr3 (623-753)||(25768189-25768319)
chr3 (864-925)||(10385370-10385431)
chr3 (353-398)||(34376360-34376405)
chr3 (456-542)||(32510208-32510288)
chr3 (833-898)||(12499964-12500029)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (610-924)||(2843-3157)
scaffold0034 (614-925)||(69471-69782)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (610-921)||(16149785-16150096)
chr4 (610-921)||(16153931-16154242)
chr4 (617-924)||(15357014-15357321)
chr4 (615-925)||(11205124-11205434)
chr4 (623-925)||(3262694-3262996)
chr4 (610-925)||(15257998-15258312)
chr4 (623-925)||(29451437-29451739)
chr4 (610-924)||(15001252-15001566)
chr4 (610-925)||(51604679-51604994)
chr4 (610-925)||(1647164-1647479)
chr4 (614-922)||(27902459-27902767)
chr4 (610-925)||(15072429-15072744)
chr4 (623-921)||(44659766-44660064)
chr4 (615-925)||(14161540-14161850)
chr4 (617-898)||(16218327-16218608)
chr4 (617-898)||(16221647-16221928)
chr4 (610-924)||(8707982-8708292)
chr4 (620-918)||(8051260-8051558)
chr4 (620-925)||(14301616-14301921)
chr4 (614-921)||(18225077-18225384)
chr4 (610-918)||(27713413-27713721)
chr4 (612-898)||(8388509-8388795)
chr4 (612-898)||(12478697-12478983)
chr4 (612-898)||(16234621-16234907)
chr4 (612-898)||(19776422-19776708)
chr4 (610-898)||(14682664-14682952)
chr4 (610-898)||(14848993-14849281)
chr4 (612-918)||(17092778-17093084)
chr4 (620-918)||(23957824-23958122)
chr4 (620-925)||(40475110-40475415)
chr4 (610-874)||(14696234-14696498)
chr4 (633-810)||(23443290-23443467)
chr4 (614-783)||(22631916-22632085)
chr4 (614-735)||(16251481-16251602)
chr4 (830-925)||(15323287-15323382)
chr4 (623-925)||(15145533-15145827)
chr4 (632-753)||(15291067-15291188)
chr4 (721-898)||(16353245-16353422)
chr4 (371-432)||(56338866-56338929)
chr4 (610-697)||(16353157-16353244)
chr4 (857-924)||(15422374-15422441)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (610-924)||(99452-99766)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (610-925)||(11222-11537)
scaffold0074 (610-921)||(5217-5527)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (610-924)||(9163-9477)
scaffold0222 (615-925)||(1384-1694)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (615-925)||(515248-515558)
scaffold0001 (610-924)||(453103-453417)
scaffold0001 (617-915)||(495129-495427)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (624-924)||(759-1058)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (610-921)||(45317-45628)
scaffold0010 (623-925)||(40236-40538)
scaffold0010 (614-898)||(4042-4326)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (610-924)||(328-642)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (610-924)||(37750-38064)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (610-925)||(2162-2477)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (610-925)||(29175-29490)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (611-924)||(747-1058)
scaffold0420 (611-826)||(7814-8027)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (610-924)||(9948-10261)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (610-924)||(324806-325120)
scaffold0004 (610-925)||(201358-201673)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (615-925)||(22504663-22504973)
chr5 (617-925)||(20344266-20344574)
chr5 (617-925)||(24796473-24796781)
chr5 (610-925)||(28893011-28893326)
chr5 (610-925)||(28921837-28922152)
chr5 (617-925)||(14885067-14885375)
chr5 (610-925)||(17267403-17267718)
chr5 (610-925)||(20777897-20778212)
chr5 (610-925)||(22463935-22464250)
chr5 (610-925)||(20823437-20823752)
chr5 (614-925)||(25850059-25850370)
chr5 (623-925)||(37541463-37541765)
chr5 (627-924)||(22234006-22234303)
chr5 (610-888)||(21562094-21562371)
chr5 (617-898)||(23473256-23473537)
chr5 (614-888)||(26736800-26737074)
chr5 (612-918)||(27520415-27520721)
chr5 (614-899)||(21337367-21337652)
chr5 (620-918)||(22136677-22136975)
chr5 (620-918)||(37289575-37289873)
chr5 (620-918)||(14997818-14998116)
chr5 (620-925)||(29474152-29474457)
chr5 (770-925)||(28914642-28914797)
chr5 (770-925)||(28929910-28930065)
chr5 (620-918)||(22330966-22331264)
chr5 (620-898)||(22349948-22350226)
chr5 (620-918)||(27683479-27683777)
chr5 (612-898)||(27666561-27666847)
chr5 (612-918)||(40710789-40711095)
chr5 (612-918)||(41772851-41773157)
chr5 (610-925)||(25428435-25428750)
chr5 (612-898)||(16358531-16358817)
chr5 (610-888)||(20466168-20466446)
chr5 (612-898)||(27612383-27612669)
chr5 (612-898)||(34568523-34568809)
chr5 (614-898)||(18781143-18781427)
chr5 (610-771)||(21676903-21677064)
chr5 (768-924)||(21679005-21679161)
chr5 (620-915)||(19771972-19772267)
chr5 (610-898)||(20801426-20801708)
chr5 (610-925)||(21409136-21409451)
chr5 (610-753)||(21935257-21935400)
chr5 (610-753)||(23507840-23507983)
chr5 (610-753)||(24583366-24583509)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (610-919)||(21981-22290)
scaffold0114 (610-775)||(39307-39472)
scaffold0114 (614-783)||(18235-18404)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (610-925)||(43018-43332)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (610-924)||(33436-33751)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (617-924)||(28724-29031)
scaffold0067 (614-925)||(59108-59419)
scaffold0067 (614-925)||(50074-50385)
scaffold0067 (614-925)||(65496-65807)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (615-925)||(1053-1363)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (615-921)||(729-1035)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (610-924)||(5241-5554)
scaffold0149 (610-924)||(9672-9985)
scaffold0149 (623-783)||(70-230)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (610-925)||(21221-21536)
scaffold0058 (610-925)||(27138-27453)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (610-924)||(602-916)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (610-924)||(13226-13540)
scaffold0261 (610-924)||(21405-21719)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (610-844)||(54301-54535)
scaffold0076 (610-924)||(31567-31881)
scaffold0076 (839-925)||(55019-55105)
scaffold0076 (610-753)||(42531-42674)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (610-925)||(6035-6350)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (614-925)||(28626-28937)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (617-924)||(2818-3125)
scaffold0079 (610-898)||(35624-35912)
scaffold0079 (721-898)||(28227-28404)
scaffold0079 (610-697)||(28405-28492)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (610-925)||(268709-269024)
scaffold0007 (632-925)||(84432-84724)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (610-921)||(262329-262640)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (610-924)||(19524-19838)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (610-924)||(150671-150985)
scaffold0011 (614-897)||(24427-24710)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (610-924)||(14302-14622)
scaffold0124 (610-753)||(5696-5839)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (614-925)||(10680-10991)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (614-925)||(79725-80036)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (610-924)||(1971-2285)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (615-925)||(29033-29343)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (610-925)||(53146-53461)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (610-924)||(4851-5165)
scaffold0035 (613-925)||(42000-42312)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (610-924)||(109732-110046)
scaffold0031 (620-898)||(54891-55169)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (614-925)||(4983-5294)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (614-925)||(25214-25525)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (610-924)||(19454-19768)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (610-924)||(41798-42112)
scaffold0102 (623-873)||(51248-51498)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (610-924)||(55737-56051)
scaffold0053 (623-925)||(46937-47239)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (613-925)||(9354-9662)
scaffold0235 (613-925)||(19568-19876)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (610-924)||(16214-16528)
scaffold0266 (632-753)||(7773-7894)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (610-924)||(49206-49520)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (610-924)||(49765-50079)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (610-924)||(48404-48718)
scaffold0028 (610-898)||(10602-10890)
scaffold0028 (610-898)||(17064-17352)
scaffold0028 (620-898)||(45279-45557)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (610-924)||(50912-51226)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (610-922)||(4280-4595)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (610-924)||(1375-1689)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (617-924)||(1442-1749)
scaffold0476 (678-873)||(10319-10514)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (614-924)||(10930-11240)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (636-925)||(11894-12184)
scaffold0309 (632-873)||(16794-17035)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (610-924)||(114661-114975)
scaffold0029 (610-871)||(94784-95045)
scaffold0029 (632-898)||(107723-107989)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (610-924)||(64409-64712)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (617-924)||(20951-21258)
scaffold0090 (830-924)||(25113-25207)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (610-924)||(477-791)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (628-924)||(6852-7140)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (677-903)||(9831-10057)
scaffold0348 (610-859)||(18373-18622)
scaffold0348 (610-711)||(5739-5840)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (610-924)||(176234-176548)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (610-873)||(7374-7637)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (610-810)||(114928-115128)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (610-925)||(8121-8436)
scaffold0120 (632-753)||(24449-24570)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (614-873)||(217314-217573)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (610-888)||(5779-6057)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (610-796)||(11188-11374)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (614-924)||(58117-58427)
scaffold0017 (614-782)||(17960-18128)
scaffold0017 (677-925)||(195444-195692)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (610-899)||(14369-14658)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (614-898)||(24839-25123)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (614-898)||(6981-7265)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (633-873)||(55908-56148)
scaffold0022 (614-898)||(40760-41044)
scaffold0022 (614-898)||(74480-74764)
scaffold0022 (610-764)||(8716-8870)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (725-924)||(6-205)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (614-873)||(20391-20650)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (610-888)||(10631-10909)
scaffold0018 (620-888)||(24198-24466)
scaffold0018 (764-888)||(16977-17101)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (620-925)||(9039-9344)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (632-925)||(2700-2993)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (610-815)||(22076-22281)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (617-898)||(2402-2683)
scaffold0023 (632-783)||(151353-151504)
scaffold0023 (713-924)||(86870-87081)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (654-898)||(1-245)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (610-898)||(669-957)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (610-890)||(3035-3315)
scaffold0647 (614-898)||(7553-7837)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (610-898)||(37710-37998)
scaffold0042 (610-888)||(22843-23121)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (614-921)||(16263-16570)
scaffold0044 (620-898)||(2549-2828)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (610-888)||(8924-9202)
scaffold0083 (610-734)||(1324-1448)
scaffold0083 (610-734)||(6628-6752)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (610-810)||(15868-16068)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (610-898)||(14596-14884)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (633-873)||(6024-6264)
scaffold0270 (633-873)||(13154-13394)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (614-898)||(11133-11417)
scaffold0080 (623-925)||(36449-36751)
scaffold0080 (614-873)||(53788-54047)
scaffold0080 (623-898)||(31010-31285)
scaffold0080 (614-711)||(13788-13885)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (610-925)||(3533-3848)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (620-898)||(9494-9772)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (770-922)||(12349-12501)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (820-924)||(44885-44989)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (610-925)||(1098-1413)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (617-810)||(96-289)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (633-898)||(3709-3974)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (610-898)||(15111-15399)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (620-898)||(17777-18054)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (785-925)||(16214-16354)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (614-898)||(14018-14302)
scaffold0109 (620-924)||(40255-40559)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (633-898)||(894-1157)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (785-925)||(8873-9013)
scaffold0130 (610-790)||(4779-4959)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (620-888)||(17015-17282)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (614-872)||(213-471)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (620-918)||(21353-21651)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (614-873)||(85124-85383)
scaffold0008 (633-898)||(85709-85974)
scaffold0008 (610-753)||(132379-132522)
scaffold0008 (610-749)||(26044-26183)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (620-898)||(29815-30093)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (610-912)||(703-1001)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (632-873)||(8202-8443)
scaffold0358 (632-873)||(17398-17639)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (614-925)||(551-862)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (614-925)||(20703-21014)
scaffold0081 (614-925)||(36127-36438)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (614-898)||(103361-103637)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (653-783)||(8675-8805)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (610-783)||(15884-16058)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (614-783)||(8615-8783)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (614-783)||(13105-13274)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (610-738)||(9844-9972)
scaffold0146 (610-738)||(17511-17639)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (830-925)||(1425-1520)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (614-873)||(1276-1535)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (841-924)||(1096-1179)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (858-924)||(378-444)
scaffold0180 (858-924)||(4698-4764)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (858-924)||(414-480)
scaffold0089 (821-925)||(14814-14918)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (610-753)||(25667-25810)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (610-753)||(15181-15324)
scaffold0162 (610-753)||(11064-11207)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (614-747)||(11052-11186)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (633-753)||(1797-1917)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (610-753)||(1511-1654)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (623-753)||(13528-13658)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (771-888)||(1900-2017)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (614-699)||(12250-12335)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (860-925)||(8923-8988)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (610-753)||(7426-7569)
scaffold0302 (610-753)||(484-627)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (610-753)||(34358-34501)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (614-697)||(41399-41482)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (610-679)||(4060-4129)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (633-750)||(1865-1982)
scaffold0218 (623-753)||(26600-26730)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (633-753)||(859-979)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (610-750)||(16334-16474)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (610-753)||(7017-7160)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (689-783)||(28451-28545)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (833-925)||(4295-4387)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (610-666)||(2817-2873)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (610-753)||(693-836)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (610-717)||(401-508)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (623-753)||(7143-7273)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (741-918)||(23095-23272)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (632-699)||(4838-4905)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (634-753)||(89773-89892)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (839-925)||(1808-1894)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (610-671)||(36292-36353)


Alignment Details
Target: scaffold0009 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 251036 - 250722
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  251036 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgca 250937  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  250936 aaggtgttcagcaagattgacttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 250837  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  250836 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 250737  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  250736 tgtgtttattgatga 250722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Original strand, 31414806 - 31415114
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414806 tgcattaattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 31414905  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  31414906 tcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 31415005  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31415006 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgttt 31415105  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  31415106 attgatgat 31415114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 23657371 - 23657063
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  23657371 tgcattgattatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttt 23657272  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  23657271 tcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 23657172  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  23657171 taaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtattt 23657072  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  23657071 attgatgat 23657063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 27356983 - 27356672
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  27356983 ttgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 27356884  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27356883 tttttagtaagattgacttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 27356784  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27356783 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 27356684  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  27356683 tttattgatgat 27356672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 21323609 - 21323923
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21323609 gaggttatgtattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 21323708  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323709 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 21323808  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  21323809 acgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 21323908  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||| |||||    
T  21323909 tgtgtttatcgatga 21323923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 22053314 - 22052999
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  22053314 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgca 22053215  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22053214 aagattttcaataagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 22053115  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |     
T  22053114 acgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtggg 22053015  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| || |||||||||    
T  22053014 tgtattcattgatgat 22052999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 16269559 - 16269869
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  16269559 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagat 16269658  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  16269659 ttttagtaagattgatttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 16269758  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16269759 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 16269858  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    | |||||||||    
T  16269859 tcattgatgat 16269869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 20008264 - 20008566
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||  |    
T  20008264 gattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagta 20008363  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||    
T  20008364 agattgatttgagctcaggttaccatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggt 20008463  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20008464 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgat 20008563  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  20008564 gat 20008566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 31569173 - 31569487
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31569173 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 31569272  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31569273 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcag-ttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 31569371  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  31569372 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 31569471  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  31569472 ggtatttattgatgat 31569487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 28983349 - 28983047
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  28983349 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagta 28983250  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  28983249 agattgatttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 28983150  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  28983149 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 28983050  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  28983049 gat 28983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 28988568 - 28988266
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  28988568 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagta 28988469  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  28988468 agattgatttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 28988369  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  28988368 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 28988269  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  28988268 gat 28988266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 21927879 - 21927565
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21927879 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgatgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgct 21927780  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  21927779 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcact 21927680  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21927679 atgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 21927580  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  21927579 tgtgtttattgatga 21927565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 4984480 - 4984178
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  4984480 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 4984381  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  4984380 agattgatttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 4984281  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  4984280 gatgcctttcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaat 4984181  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  4984180 gat 4984178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 610 - 848
Target Start/End: Original strand, 22061009 - 22061247
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  22061009 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgca 22061108  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22061109 aaagttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcatt 22061208  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgc 848  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22061209 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 22061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 722 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 6605997 - 6605794
Alignment:
Q  722 aagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaagg 821  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| |    
T  6605997 aagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaag 6605898  T
Q  822 tgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 921  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  6605897 tgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattga 6605798  T
Q  922 tgat 925  Q
    ||||    
T  6605797 tgat 6605794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 662 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861571
Alignment:
Q  662 tatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtga 761  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||     |||||||   | ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  762 aggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcat 861  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  862 ggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 19861571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 610 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 19984631 - 19984389
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19984631 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 19984532  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19984531 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19984432  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  19984431 atgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaattcgcctgg 19984389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 610 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 20390537 - 20390295
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  20390537 gaggttgtgtatagtttaccgtcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttca 20390438  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20390437 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 20390338  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
    | ||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20390337 acaaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgtgcctgg 20390295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 614 - 924
Target Start/End: Original strand, 29301760 - 29302070
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||   |    
T  29301760 ttgtgcatcgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtg 29301859  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||  |    
T  29301860 tgttcagtaaaattgacttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatga 29301959  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     |  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  | ||| | |||||||| ||     
T  29301960 gtataaggtgatgccttttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggta 29302059  T
Q  914 tttattgatga 924  Q
    |||||||||||    
T  29302060 tttattgatga 29302070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 617 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 22522990 - 22522719
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  22522990 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgt 22522891  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||  | |     
T  22522890 ttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagta 22522791  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22522790 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 32602596 - 32602281
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32602596 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgca 32602497  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || |    
T  32602496 aaagttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcact 32602397  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||    
T  32602396 atgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgt 32602297  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  32602296 tgtgtttatcgatgat 32602281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 20016603 - 20016901
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  20016603 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 20016702  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  20016703 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 20016802  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  20016803 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 20016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 22422226 - 22422510
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  22422226 ttgtgtattgactatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 22422325  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||||||  |    
T  22422326 tgtttagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatga 22422425  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  22422426 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 22422510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 610 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 23887479 - 23887199
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23887479 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 23887380  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23887379 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacatt 23887280  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 890  Q
    |  | |     |||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  23887279 acgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgctt 23887199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 614 - 921
Target Start/End: Original strand, 30311478 - 30311785
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  30311478 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 30311577  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  30311578 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 30311677  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||||||    
T  30311678 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtg 30311777  T
Q  914 tttattga 921  Q
    ||||||||    
T  30311778 tttattga 30311785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 882
Target Start/End: Original strand, 22246763 - 22247035
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22246763 gaggttgtgtattgattatcgacaattgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgca 22246862  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||    
T  22246863 cgtgtgttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacatt 22246962  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaatttt 882  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22246963 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttt 22247035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 18859018 - 18858720
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  18859018 attgattatcggcagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 18858919  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||  |||  ||    
T  18858918 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataa 18858819  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  18858818 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 18858720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 614 - 915
Target Start/End: Original strand, 22375787 - 22376088
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  22375787 ttgtgtattgattatcgatagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 22375886  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  22375887 tattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatta 22375986  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || |||||| | ||| |  |||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| ||||||    
T  22375987 atataaagtgatgcctttcagcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtg 22376086  T
Q  914 tt 915  Q
    ||    
T  22376087 tt 22376088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 757 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14567446 - 14567278
Alignment:
Q  757 ggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtg 856  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||     
T  14567446 ggtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtt 14567347  T
Q  857 ttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14567346 tttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgat 14567278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 17672355 - 17672661
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  17672355 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 17672454  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  17672455 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 17672554  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  17672555 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 17672654  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  17672655 tgtttat 17672661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 623 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 19980405 - 19980130
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  19980405 gattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 19980306  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||| |||||||  | || || ||||  ||||| || ||  |||  || ||    
T  19980305 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagt 19980206  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  19980205 tatgccttttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 19980130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 873
Target Start/End: Original strand, 21164868 - 21165131
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21164868 gaggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 21164967  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
        | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  21164968 cgcattttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcact 21165067  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21165068 atgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaa 21165131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 630 - 925
Target Start/End: Original strand, 22131391 - 22131686
Alignment:
Q  630 gtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattga 729  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  22131391 gtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 22131490  T
Q  730 cttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcg 829  Q
     |||||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |  || || || ||  |||  || || ||| |     
T  22131491 tttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcct 22131590  T
Q  830 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||    
T  22131591 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgat 22131686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 22118515 - 22118813
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22118515 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22118614  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  22118615 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataa 22118714  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22118715 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22118813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 22127299 - 22127597
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22127299 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22127398  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  22127399 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataa 22127498  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22127499 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22127597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 15535830 - 15535546
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15535830 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 15535731  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |   | || || || ||||| || ||  |    
T  15535730 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatga 15535631  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  15535630 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 15535546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 22042274 - 22041990
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  22042274 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaag 22042175  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || ||  |    
T  22042174 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatga 22042075  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22042074 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 22041990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 617 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 22989489 - 22989326
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  22989489 tgcattgattatcgacggttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgt 22989390  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaa 780  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22989389 ttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaa 22989326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 632 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21253107
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 21253107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 21392195 - 21392364
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392195 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21392294  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21392295 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21392364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 21781521 - 21781690
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21781521 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21781620  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21781621 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21781690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 21782754 - 21782923
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21782754 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21782853  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21782854 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21782923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 21786689 - 21786858
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21786689 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21786788  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21786789 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21786858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 623 - 810
Target Start/End: Original strand, 20394476 - 20394663
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |    
T  20394476 gattaccggcaattgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttatta 20394575  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20394576 agattgatttgagatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacatta 20394663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 610 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 22373319 - 22373168
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  22373319 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 22373220  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtga 761  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22373219 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 612 - 915
Target Start/End: Original strand, 19482404 - 19482699
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||       
T  19482404 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcagttagtgggtgcgcg 19482495  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  19482496 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 19482595  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || ||||    
T  19482596 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttg 19482695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 634 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 23652468 - 23652204
Alignment:
Q  634 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttg 733  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||     
T  23652468 gttgaaaaaagtgacaataaagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattta 23652369  T
Q  734 aggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcg 833  Q
    || || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| |  || || || || |||||||||||  | | ||| || ||| | || |    
T  23652368 agatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttg 23652269  T
Q  834 gtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  23652268 gtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 23652204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 818 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 22373174 - 22373067
Alignment:
Q  818 aaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttta 917  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22373174 aaggtgatgcctttgggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgttta 22373075  T
Q  918 ttgatgat 925  Q
     |||||||    
T  22373074 ctgatgat 22373067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 633 - 873
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864686
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| || ||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | |  || || ||| | |||    
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 19864686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 721 - 873
Target Start/End: Original strand, 21920189 - 21920341
Alignment:
Q  721 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 820  Q
    |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||  | |  |||    
T  21920189 caagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataag 21920288  T
Q  821 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||| |||||    
T  21920289 gtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaa 21920341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 16875425 - 16875568
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  16875425 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 16875524  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16875525 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16875568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 623 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 16414529 - 16414402
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  16414529 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 16414430  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||    
T  16414429 agattgatttgagatcaggatatcatca 16414402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Original strand, 21848680 - 21848810
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |    
T  21848680 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagta 21848779  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21848780 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 21848810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Original strand, 20650685 - 20650825
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  20650685 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgca 20650784  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  20650785 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 20650825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 614 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 22030550 - 22030470
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggat 694  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22030550 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155515
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| |    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    |||| || || |||||||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagat 23155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Original strand, 21194870 - 21195010
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| || ||||||||| | || ||||||    
T  21194870 gaggttgtgtgtggattaccgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgca 21194969  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
     ||||||| |  |||||||| || || || || ||||||||    
T  21194970 gaggtgtttagtaagattgatttcagatcaggatatcatca 21195010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 632 - 748
Target Start/End: Original strand, 24932176 - 24932292
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||    |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  24932176 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaatgattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24932275  T
Q  732 tgaggtctggttatcat 748  Q
    |||| || || ||||||    
T  24932276 tgagatcaggatatcat 24932292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22436754 - 22436614
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||  | | |||||||| |||||||||| | | || ||||||    
T  22436754 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttatgaggattgatgatttgatggatcggctggttggtgca 22436655  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  22436654 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 22436614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 845 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 19869909 - 19869868
Alignment:
Q  845 gcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccat 886  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19869909 gcgccaggagtgtttatggagtatatgaacagaattttccat 19869868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 16948350 - 16948661
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16948350 ttgtgcattgattaccgtcagttgaataaagttatgataaagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaagg 16948449  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16948450 tgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacga 16948549  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16948550 ataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtg 16948649  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  16948650 tttattgatgat 16948661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 13023732 - 13023417
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  13023732 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcg 13023633  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13023632 aaggtgtttagcaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 13023533  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13023532 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 13023433  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||||||||||    
T  13023432 ggtgtttattgatgat 13023417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 13675820 - 13675513
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13675820 tgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttt 13675721  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  13675720 tcaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 13675621  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  13675620 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtattt 13675521  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  13675520 attgatga 13675513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 15100477 - 15100791
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15100477 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgct 15100576  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15100577 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcatt 15100676  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  15100677 acaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 15100776  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  15100777 tgtgtttattgatga 15100791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 12459010 - 12458700
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||    
T  12459010 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagt 12458911  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  12458910 gttcagtaagatcgatttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaa 12458811  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12458810 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgt 12458711  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  12458710 ttattgatgat 12458700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 26092685 - 26092987
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  26092685 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 26092784  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  26092785 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 26092884  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26092885 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 26092984  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  26092985 gat 26092987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 49154672 - 49154361
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  49154672 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 49154573  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  49154572 tatttagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 49154473  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49154472 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 49154373  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  49154372 tttattgatgat 49154361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 12204674 - 12204989
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12204674 gaggttgtgcatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 12204773  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12204774 tgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacatt 12204873  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  12204874 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggt 12204973  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||||||||||    
T  12204974 cgtgtttattgatgat 12204989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 11301100 - 11301402
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  11301100 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagta 11301199  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  11301200 agattgatttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 11301299  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11301300 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 11301399  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  11301400 gat 11301402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 18051827 - 18052141
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18051827 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 18051926  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18051927 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 18052026  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18052027 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 18052126  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
     || |||||||||||    
T  18052127 ggtatttattgatga 18052141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14140054 - 14139739
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  14140054 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgca 14139955  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14139954 aaggtttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 14139855  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  14139854 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 14139755  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  14139754 ggtatttattgatgat 14139739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 15342806 - 15342495
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15342806 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgca 15342707  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15342706 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 15342607  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  15342606 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggt 15342507  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||| || |||||    
T  15342506 tgtattcattga 15342495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 23503744 - 23504059
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23503744 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 23503843  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23503844 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 23503943  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  23503944 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 23504043  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  23504044 ggtatttattgatgat 23504059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 14262119 - 14262433
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  14262119 gaggttgtgtatagattactgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 14262218  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14262219 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcatattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcatt 14262318  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14262319 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 14262418  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  14262419 tgtgtttattgatga 14262433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 16070171 - 16070484
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16070171 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaagtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgct 16070270  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||| | |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16070271 cgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 16070370  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||    
T  16070371 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggt 16070468  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  16070469 tgtgtttattgatgat 16070484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 11386307 - 11386618
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  11386307 ttgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 11386406  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||  |    
T  11386407 tttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacga 11386506  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||    
T  11386507 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtg 11386606  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  11386607 tttattgatgat 11386618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 13966547 - 13966857
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |    
T  13966547 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaat 13966646  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  13966647 ttttagtaagattgatttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgag 13966746  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13966747 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 13966846  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  13966847 ttattgatgat 13966857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19615050 - 19614736
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  19615050 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 19614951  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19614950 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 19614851  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  19614850 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 19614751  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  19614750 tgtattcattgatga 19614736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 627 - 921
Target Start/End: Original strand, 26116481 - 26116775
Alignment:
Q  627 accgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagat 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |||||    
T  26116481 accgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagat 26116580  T
Q  727 tgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatg 826  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | | ||| ||||||    
T  26116581 tgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatg 26116680  T
Q  827 tcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 921  Q
     | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  26116681 cctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattga 26116775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 623 - 924
Target Start/End: Original strand, 14284263 - 14284564
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||| | || |  |    
T  14284263 gattaccgtcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttgatggatcagttggtttgtgcaaagatttttagta 14284362  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  |||||    
T  14284363 atatcgacttgaggtatggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggt 14284462  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14284463 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgat 14284562  T
Q  923 ga 924  Q
    ||    
T  14284563 ga 14284564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 653 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748671
Alignment:
Q  653 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 752  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |||||||||||||    |||| |  || ||||| |||||||| ||||| | | |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttacc-taaga 20748842  T
Q  753 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  853 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 20748671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 653 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149272
Alignment:
Q  653 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 752  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |||||||||||||    |||| |  || ||||| |||||||| ||||| | | |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttacc-taaga 19149443  T
Q  753 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  853 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 19149272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 15146780 - 15147058
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146780 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 15146879  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  15146880 cgtgttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacatt 15146979  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  | |  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15146980 acgagtataaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgc 15147058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 11235119 - 11235417
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  11235119 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 11235218  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |||  ||    
T  11235219 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 11235318  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  11235319 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 11235417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 14334760 - 14334462
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  14334760 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 14334661  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14334660 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 14334561  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  14334560 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 14334462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 15256 - 15534
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15256 attgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttca 15355  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15356 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15455  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  15456 agttatgcctttcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 15534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 15158963 - 15159261
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  15158963 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 15159062  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15159063 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15159162  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  15159163 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 15159261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 11550998 - 11551286
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11550998 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 11551097  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |    
T  11551098 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcact 11551197  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  11551198 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 11551286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 14042065 - 14041781
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14042065 ttgtgcattgactatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 14041966  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||  |    
T  14041965 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatga 14041866  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||    
T  14041865 gtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggat 14041781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 14352095 - 14351811
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14352095 ttgtgcattgactatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 14351996  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||  |    
T  14351995 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatga 14351896  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||    
T  14351895 gtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggat 14351811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 10873062 - 10872776
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10873062 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10872963  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  10872962 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 10872863  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  10872862 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggat 10872776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 12689876 - 12689588
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12689876 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 12689777  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| || |    
T  12689776 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcact 12689677  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12689676 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12689588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 610 - 890
Target Start/End: Original strand, 48813148 - 48813428
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48813148 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgca 48813247  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  48813248 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacatt 48813347  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 890  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||||||    
T  48813348 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgctt 48813428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14956928 - 14956613
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14956928 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 14956829  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || |||||  ||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  14956828 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 14956729  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||    
T  14956728 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagt 14956629  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||| || ||||||    
T  14956628 tgtgttcatcgatgat 14956613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 8709969 - 8709691
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  8709969 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 8709870  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  8709869 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 8709770  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  8709769 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 8709691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 13688405 - 13688107
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  13688405 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 13688306  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |  ||  |||  ||    
T  13688305 gcaagattgatttgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataa 13688206  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  13688205 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 13688107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 18180109 - 18179831
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  18180109 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttca 18180010  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  18180009 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataa 18179910  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  18179909 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 18179831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 9590742 - 9590479
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590742 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 9590643  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||  | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  9590642 aaatttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 9590543  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |  |||  || || ||| | || ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  9590542 atgaatataaagttatgccttttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaa 9590479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 44789249 - 44789535
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  44789249 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 44789348  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  44789349 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 44789448  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  44789449 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 44789535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 610 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 15626899 - 15626619
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||| |||| |  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15626899 gaggttatgcattaattatcagcagttgaataaaatgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15626800  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  15626799 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacatt 15626700  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 890  Q
    |  |||    ||||||| | ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15626699 acgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgctt 15626619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 18588077 - 18588375
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  18588077 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 18588176  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  ||   ||    
T  18588177 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataa 18588276  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  18588277 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 18588375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 610 - 708
Target Start/End: Original strand, 11770298 - 11770396
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 708  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11770298 gaggttatgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 11770396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 7826274 - 7826131
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7826274 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 7826175  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7826174 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7826131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 27105670 - 27105813
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27105670 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 27105769  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27105770 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 27105813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 27172655 - 27172512
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27172655 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 27172556  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27172555 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 27172512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 614 - 691
Target Start/End: Original strand, 16727283 - 16727360
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatg 691  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16727283 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 614 - 691
Target Start/End: Original strand, 17704355 - 17704432
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatg 691  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17704355 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 4442302 - 4442159
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  4442302 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 4442203  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  4442202 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 4442159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 13379257 - 13379114
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || || || ||||||   ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  13379257 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 13379158  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13379157 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 13379114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 614 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21754783 - 21754742
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaag 655  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21754783 ttgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttacgataaag 21754742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-127; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 10466881 - 10467196
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466881 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 10466980  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  10466981 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcatt 10467080  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10467081 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgt 10467180  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||||||||||    
T  10467181 ggtgtttattgatgat 10467196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19437251 - 19436937
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19437251 gaggtcgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgca 19437152  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
     |||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19437151 gaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacatt 19437052  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  19437051 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 19436952  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  19436951 tgtgtttattgatga 19436937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 14377948 - 14378263
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14377948 gaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgca 14378047  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14378048 aaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 14378147  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14378148 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggt 14378247  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14378248 tgtatttattgatgat 14378263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 14379498 - 14379813
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14379498 gaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgca 14379597  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14379598 aaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 14379697  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14379698 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggt 14379797  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14379798 tgtatttattgatgat 14379813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16530318 - 16530102
Alignment:
Q  18 tttggatggttatttatttt-ctttcttatgatgtagcctttgtttttgtatcccggtgcttatagtaccaagtttttgtctccctttaattaattaatt 116  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530318 tttggatcgttatttgtttttctttcttatgatgtaacctttgtttttgtatcccggtgcttatagtaccaagtttttgtctccctttaattaattaatt 16530219  T
Q  117 gtacttgtaaaataaaggaaaatatttcatatacattcaatatttattctacaatttgagagagaaaggaacagaattggtgatctaatagacgtgatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530218 gtacttgtaaaataaaggaaaatatttcctatacatccaatatttattctacaatttgagagagaaaggaacagaattggtgatctaatagacgtgatat 16530119  T
Q  217 gtttgtgtaagctcaat 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  16530118 gtttgtgtaagctcaat 16530102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 25770093 - 25769778
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  25770093 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 25769994  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25769993 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacatt 25769894  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  25769893 atgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggt 25769794  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  25769793 tgtgtttattgatgat 25769778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24366657 - 24366346
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  24366657 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 24366558  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  24366557 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 24366458  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24366457 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 24366358  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  24366357 tttattgatgat 24366346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19455272 - 19454959
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19455272 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 19455174  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || || |  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19455173 cgtgtatttagtaagatttacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19455074  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||    
T  19455073 acgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggt 19454974  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  19454973 tgtatttattgatga 19454959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 21568027 - 21568338
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||     
T  21568027 ttgtgcatagactaccgttagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaaga 21568126  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |    
T  21568127 tttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacga 21568226  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21568227 atacaaagtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgta 21568326  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  21568327 tttattgatgat 21568338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21473849 - 21473535
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||     
T  21473849 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgct 21473750  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21473749 cgtgtgttcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 21473650  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | |  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21473649 atgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatgcg-ctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggt 21473551  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||||| |||||    
T  21473550 tgtgtttatttatgat 21473535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 618 - 924
Target Start/End: Original strand, 28280853 - 28281159
Alignment:
Q  618 gcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgtt 717  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  28280853 gcattgactaccgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgtt 28280952  T
Q  718 caacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatcc 817  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  28280953 cagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatac 28281052  T
Q  818 aaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttta 917  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  28281053 aaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtattta 28281152  T
Q  918 ttgatga 924  Q
    |||||||    
T  28281153 ttgatga 28281159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19881546 - 19881233
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19881546 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaa-aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgca 19881448  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19881447 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 19881348  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  19881347 acaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 19881248  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||| ||||||||    
T  19881247 tgtgttcattgatga 19881233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 617 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 18796932 - 18796627
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  18796932 tgcattgactatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattt 18796833  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | |  || |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  18796832 ttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaata 18796733  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||     
T  18796732 taaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattc 18796633  T
Q  917 attgat 922  Q
    ||||||    
T  18796632 attgat 18796627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15461585 - 15461270
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  15461585 gaggttgtgcattgactatcggcagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 15461486  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15461485 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcatt 15461386  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15461385 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggt 15461286  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||| ||||||    
T  15461285 ggtgtttatagatgat 15461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 34643618 - 34643932
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  34643618 gaggttgtgtattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgcc 34643717  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34643718 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 34643817  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34643818 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggt 34643917  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||  ||||||||    
T  34643918 tgtgtacattgatga 34643932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16530167 - 16529949
Alignment:
Q  230 caatttgagagagaaaggaacacaattagtgatctaatagacgtgataagtttgtgtaagctcaatttga--------------------ggaacaatat 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||                    ||||||||||    
T  16530167 caatttgagagagaaaggaacagaattggtgatctaatagacgtgatatgtttgtgtaagctcaatgtgaattacttaagacaaaagaagggaacaatat 16530068  T
Q  310 ctacttttagaggagaatcctcgaacatgatgatgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcattatatacaca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530067 ctacttttagaggagaatcctcgaacatgatgatgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcattatatacaca 16529968  T
Q  410 tgtaataagctctcttgtt 428  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16529967 tgtaataagctctcttgtt 16529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 618 - 843
Target Start/End: Original strand, 24516448 - 24516673
Alignment:
Q  618 gcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgtt 717  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24516448 gcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttt 24516547  T
Q  718 caacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatcc 817  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  24516548 tagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatac 24516647  T
Q  818 aaggtgatgtcgttcggtgttactaa 843  Q
    || |||||| | ||||||||||||||    
T  24516648 aaagtgatgcctttcggtgttactaa 24516673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 612 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 27189683 - 27189407
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27189683 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaca 27189584  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27189583 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactac 27189484  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  27189483 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 27189407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 612 - 888
Target Start/End: Original strand, 27259557 - 27259833
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27259557 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaca 27259656  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27259657 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactac 27259756  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  27259757 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 27259833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 18183403 - 18183662
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  18183403 ttgtgtattgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtg 18183502  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||  |    
T  18183503 tgtttagcaagattgatttgaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatga 18183602  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  18183603 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaa 18183662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 23085803 - 23086081
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23085803 gaggttatgcattggttatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 23085902  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23085903 cgtgtgtttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 23086002  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  23086003 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 23086081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 28261231 - 28261517
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28261231 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28261330  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28261331 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28261430  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28261431 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 28284685 - 28284399
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28284685 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28284586  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28284585 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28284486  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28284485 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28284399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 28339980 - 28340266
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28339980 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28340079  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28340080 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28340179  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28340180 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28340266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 623 - 898
Target Start/End: Original strand, 5837264 - 5837539
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  5837264 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagca 5837363  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| ||    
T  5837364 agattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagt 5837463  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5837464 tatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5837539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 18405976 - 18406291
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18405976 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 18406075  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| |||||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||    
T  18406076 agtgttttcagcaagatagatttgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacatt 18406175  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  18406176 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 18406275  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| || |||||||||    
T  18406276 tgttttcattgatgat 18406291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 20633976 - 20634287
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20633976 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 20634075  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  |    
T  20634076 ttttcagcaagatagatttgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatga 20634175  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   || || |||||     
T  20634176 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtt 20634275  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  20634276 tttattgatgat 20634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 610 - 873
Target Start/End: Original strand, 18963120 - 18963383
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18963120 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgca 18963219  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18963220 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacatt 18963319  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  18963320 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaa 18963383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 2872845 - 2873123
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  2872845 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 2872944  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  2872945 gcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 2873044  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  2873045 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 2873123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 611 - 925
Target Start/End: Original strand, 25607894 - 25608208
Alignment:
Q  611 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25607894 aggttgtgtattgattatcgacaattgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcat 25607993  T
Q  711 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
      || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  25607994 gtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacatta 25608093  T
Q  811 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 910  Q
      | | |||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | || || ||||| ||| |||||  ||| || |||    
T  25608094 tgagtacaaggtaatgctgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagtt 25608193  T
Q  911 gtgtttattgatgat 925  Q
    || ||||||||||||    
T  25608194 gtttttattgatgat 25608208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 16961518 - 16961802
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || ||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16961518 ttgtgtattgactatcgttagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaag 16961617  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16961618 tttttagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 16961717  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || |||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16961718 atataaagttatgtcgttcggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16961802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 19866923 - 19866621
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  19866923 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 19866824  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| || || || ||||||||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || ||    
T  19866823 agattgatttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagt 19866724  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| |||    
T  19866723 tatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgat 19866624  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  19866623 gat 19866621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 22828387 - 22828675
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22828387 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 22828486  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  22828487 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 22828586  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22828587 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggat 22828675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 611 - 791
Target Start/End: Original strand, 30679040 - 30679220
Alignment:
Q  611 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  30679040 aggttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacac 30679139  T
Q  711 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttta 791  Q
      ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30679140 gtgtgtttagcaagattgatttgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagccttta 30679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 25114791 - 25114513
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  25114791 attgattaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 25114692  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||| || | |||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  25114691 gcaagattgatttggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataa 25114592  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  25114591 agttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 25114513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 610 - 766
Target Start/End: Original strand, 8761784 - 8761940
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8761784 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcg 8761883  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggat 766  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  8761884 aaagttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagttgaaggat 8761940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 16925681 - 16925958
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16925681 attgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttta 16925779  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  16925780 gcaagattgatttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataa 16925879  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16925880 tgttatgccgttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggat 16925958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 24293824 - 24294122
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| ||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  24293824 attgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 24293923  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || ||  |||  ||    
T  24293924 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataa 24294023  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24294024 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 24294122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 22760487 - 22760775
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22760487 gaggttgtgtattgattatcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 22760586  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||  ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||    
T  22760587 cgtgttgtcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacatt 22760686  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  | |  || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  22760687 atgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 22760775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 641 - 924
Target Start/End: Original strand, 25763291 - 25763574
Alignment:
Q  641 aaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctg 740  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |    
T  25763291 aaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcag 25763390  T
Q  741 gttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttac 840  Q
    ||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | |  || || ||| | |||||||||||    
T  25763391 gttatcaccagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 25763490  T
Q  841 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||   ||| | ||||| |||||||||||    
T  25763491 aaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatga 25763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 614 - 781
Target Start/End: Original strand, 27563869 - 27564036
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  27563869 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 27563968  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaag 781  Q
    | |||| ||||||||| || || || |||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  27563969 ttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaag 27564036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 632 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573879
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||| |    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 870  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16573879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 632 - 870
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621501
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||| |    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 870  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 623 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 22436105 - 22435945
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  22436105 gattatcgtcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagca 22436006  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22436005 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 22435945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 623 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 21755168 - 21755009
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  21755168 gattatcgtcagttgaacaa-gtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagca 21755070  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    |||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21755069 agatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21755009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 576
Target Start/End: Original strand, 4129084 - 4129246
Alignment:
Q  416 aagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaatgaataggtggagaaaa-ggttgtttgatagaagtgatagagtcggtt---caatgc 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  4129084 aagctctcttgttatagttaaata---tgattggttttaaaaatgagcatgaggagaaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgt 4129180  T
Q  512 cctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgttacttgtgtaa 576  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  4129181 tatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagttacttgtgtaa 4129246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 16648001 - 16648144
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16648001 gaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 16648100  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16648101 aaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16648144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 614 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 23080668 - 23080573
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23080668 ttgtgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 23998497 - 23998354
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23998497 gaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 23998398  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23998397 gaggtgtttagcaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 23998354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 528 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 16529952 - 16529869
Alignment:
Q  528 tgttccaataaaaagtggagag--tggtgtggcaagctgttacttgtgtaactagttttcataacttttaacaattgataagta 609  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16529952 tgttccaataaaaagtggagagagtggtgtggcaagttgctacttgtgtaactagttttcataacttttaacaatcgataagta 16529869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 16380405 - 16380548
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16380405 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 16380504  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16380505 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16380548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 576
Target Start/End: Original strand, 4101226 - 4101334
Alignment:
Q  472 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaat---gccctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||    
T  4101226 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgttatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagtt 4101324  T
Q  567 acttgtgtaa 576  Q
    ||||||||||    
T  4101325 acttgtgtaa 4101334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 576
Target Start/End: Original strand, 4126589 - 4126697
Alignment:
Q  472 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaat---gccctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgtt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||    
T  4126589 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgttatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagtt 4126687  T
Q  567 acttgtgtaa 576  Q
    ||||||||||    
T  4126688 acttgtgtaa 4126697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 660 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450437
Alignment:
Q  660 ggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggt 759  Q
    |||||||||||||| | ||  | || ||||||||||| |||||||||||    |||||||  || |||||||| || || || |||||  |||| || ||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  760 gaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttc 859  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||  |||     |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtattt 18450503  T
Q  860 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18450502 atggaatatattaaccgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgat 18450437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 770 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 23080558 - 23080434
Alignment:
Q  770 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 869  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  23080558 gatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtaca 23080459  T
Q  870 tgaaccgaattttccatgcttttct 894  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||    
T  23080458 tgaatcgcatttttcatgcatttct 23080434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 1646846 - 1646989
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  1646846 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 1646945  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  1646946 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 1646989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 782 - 873
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487577
Alignment:
Q  782 acggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||     |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaa 19487577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 393
Target Start/End: Original strand, 4128852 - 4128902
Alignment:
Q  343 tgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaaccta 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4128852 tgacttttccttttatgttggtcttaaataatcatgtattagttaaaccta 4128902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 14130705 - 14130575
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||  | ||||| | ||    
T  14130705 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagca 14130606  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  14130605 agattgatttgaggtcaagatatcatcagat 14130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 16100251 - 16100121
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |  |    
T  16100251 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagta 16100152  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16100151 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 16100121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Original strand, 23025791 - 23025921
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || ||||   ||||||| |  |    
T  23025791 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagta 23025890  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  23025891 agattgatttgaggtcaagatatcatcagat 23025921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Original strand, 4100462 - 4100508
Alignment:
Q  409 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaa 458  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  4100462 atgtaaaaagctctcttgttatggtta---aatatgattggttttaaaaa 4100508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Original strand, 4125793 - 4125839
Alignment:
Q  409 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaa 458  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  4125793 atgtaaaaagctctcttgttatggtta---aatatgattggttttaaaaa 4125839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28311877 - 28311819
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccactt 670  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  28311877 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 31209 - 31524
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31209 gaggttgtgcattgattaccgtcaatttaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 31308  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31309 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacatt 31408  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31409 acgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggt 31508  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||||||||||    
T  31509 ggtgtttattgatgat 31524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 614 - 924
Target Start/End: Original strand, 24097566 - 24097876
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24097566 ttgtgcattgattaccgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaagg 24097665  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  24097666 tgttcagcaagatcgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacga 24097765  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  24097766 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggta 24097865  T
Q  914 tttattgatga 924  Q
    |||||||||||    
T  24097866 tttattgatga 24097876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21953304 - 21952994
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  21953304 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 21953205  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  21953204 ttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 21953105  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21953104 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 21953005  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  21953004 ttattgatgat 21952994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 20833859 - 20834174
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20833859 gaggttgtgcattgactatcgtcagtttaataaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 20833958  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20833959 aaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 20834058  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  20834059 acgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 20834158  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  20834159 tgtgtttattgatgat 20834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 20938022 - 20938336
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20938022 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 20938121  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20938122 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcatt 20938221  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||    
T  20938222 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggt 20938321  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  20938322 tgtgtttattgatga 20938336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 19661095 - 19661409
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19661095 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 19661194  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  19661195 aatgttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcact 19661294  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||    
T  19661295 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggt 19661394  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  19661395 tgtgtttattgatga 19661409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 48425291 - 48424989
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  48425291 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 48425192  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  48425191 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 48425092  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48425091 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 48424992  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  48424991 gat 48424989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 52988159 - 52987857
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  52988159 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 52988060  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  52988059 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 52987960  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  52987959 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 52987860  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  52987859 gat 52987857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 20854719 - 20855034
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  20854719 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 20854818  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20854819 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 20854918  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20854919 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20855018  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||| ||||||    
T  20855019 ggtatttatagatgat 20855034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 20296807 - 20296497
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  20296807 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagat 20296708  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  20296707 ttttagtaagattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 20296608  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20296607 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 20296508  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  20296507 ttattgatgat 20296497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 38910798 - 38911100
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  38910798 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 38910897  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  38910898 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggt 38910997  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  38910998 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgat 38911097  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  38911098 gat 38911100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 610 - 922
Target Start/End: Original strand, 21743511 - 21743823
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21743511 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgca 21743610  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21743611 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 21743710  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21743711 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 21743810  T
Q  910 tgtgtttattgat 922  Q
    |||||||||||||    
T  21743811 tgtgtttattgat 21743823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 37679467 - 37679165
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  37679467 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagta 37679368  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  37679367 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 37679268  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37679267 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 37679168  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  37679167 gat 37679165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 19856705 - 19856395
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19856705 gaggttatgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgca 19856606  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |    
T  19856605 aaggttttcagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttact 19856506  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  19856505 atgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggt 19856406  T
Q  910 tgtgtttattg 920  Q
    |||||||||||    
T  19856405 tgtgtttattg 19856395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 31537969 - 31538271
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||| | || |  |    
T  31537969 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagta 31538068  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  31538069 agatagatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 31538168  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31538169 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 31538268  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  31538269 gat 31538271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 614 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 16378491 - 16378181
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16378491 ttgtgtattgattaccgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcg 16378392  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |    
T  16378391 tgttcaacaagattgatttgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatga 16378292  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||||   || || ||||||    
T  16378291 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtg 16378192  T
Q  914 tttattgatga 924  Q
    |||||||||||    
T  16378191 tttattgatga 16378181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 614 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 41310953 - 41310672
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||   |    
T  41310953 ttgtgtatagattaccatcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtg 41310854  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    ||||    || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |    
T  41310853 tgtttcgtaaaactgatttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatga 41310754  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctg 895  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41310753 atataacgtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctg 41310672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 617 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 20140476 - 20140195
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |    
T  20140476 tgcattgcttatcgtcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttt 20140377  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  | |     
T  20140376 tcagcaagattgatttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagta 20140277  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  20140276 caaggtaatgtcgttcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 20140195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 633 - 873
Target Start/End: Original strand, 50618380 - 50618620
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  50618380 agttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgattt 50618479  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  | |  || |||||| | |||    
T  50618480 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 50618579  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50618580 ggtgttacaaatgcccctggagtgtttatggagtacatgaa 50618620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 17042978 - 17043289
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042978 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 17043077  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  17043078 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatga 17043177  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||||||    
T  17043178 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtg 17043277  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||| ||||||    
T  17043278 tttatcgatgat 17043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21839340 - 21839035
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  21839340 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 21839241  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21839240 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 21839141  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  21839140 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 21839041  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  21839040 gatgat 21839035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 33388990 - 33389296
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  33388990 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 33389089  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  33389090 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 33389189  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  33389190 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 33389289  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  33389290 tgtttat 33389296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 16348556 - 16348843
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16348556 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16348655  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16348656 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16348755  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtc-gttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16348756 gaatataaagttatgccttttgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 19108768 - 19108453
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19108768 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 19108669  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| ||      
T  19108668 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcacc 19108569  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||| |||||   || || ||    
T  19108568 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagt 19108469  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  19108468 tgtgtttatcgatgat 19108453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 22360207 - 22360466
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22360207 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 22360306  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  |    
T  22360307 ttttcaacaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatga 22360406  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||    
T  22360407 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaa 22360466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 51331454 - 51331760
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  51331454 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 51331553  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  51331554 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 51331653  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  51331654 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 51331753  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  51331754 tgtttat 51331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 21233694 - 21233978
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21233694 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21233793  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  21233794 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatga 21233893  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21233894 atataaagttatgcctttcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21233978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 21751340 - 21751052
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21751340 gaggttgtgtatttattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgca 21751241  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || ||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  21751240 agtgttttcaacaagatagatttgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacatt 21751141  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  | |  || || ||| | || |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  21751140 atgagtataaagttatgccttttggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 21751052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 22503252 - 22503536
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |    
T  22503252 ttgtgtattgattatcgtaagttgaatagagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtg 22503351  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  22503352 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 22503451  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22503452 atataaagttatgtctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 22503536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 897
Target Start/End: Original strand, 21862336 - 21862619
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  21862336 ttgtgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtg 21862435  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||||| ||||||  | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||  |    
T  21862436 tgttcagcaagatacatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatga 21862535  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 897  Q
     |  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  21862536 gtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttgga 21862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 21832692 - 21832394
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  21832692 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 21832593  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21832592 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 21832493  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  21832492 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 21832394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 653 - 925
Target Start/End: Original strand, 24792618 - 24792890
Alignment:
Q  653 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 752  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24792618 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaga 24792717  T
Q  753 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || |  ||| | || ||||| || ||||| |||||    
T  24792718 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaatgcacctgg 24792817  T
Q  853 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||||||||||    
T  24792818 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgat 24792890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 872
Target Start/End: Original strand, 430079 - 430337
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  430079 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 430178  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||  |    
T  430179 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatga 430278  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 872  Q
     | |||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  430279 gtacaaggttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatga 430337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 612 - 915
Target Start/End: Original strand, 41351629 - 41351926
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaa-taggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||      
T  41351629 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgc 41351721  T
Q  711 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
      || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||    
T  41351722 gagttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcacta 41351821  T
Q  811 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 910  Q
      ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || |||    
T  41351822 tgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggtt 41351921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 20829351 - 20829494
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20829351 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 20829450  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20829451 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 20829494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 35930784 - 35930927
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  35930784 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 35930883  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  35930884 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 35930927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 20527453 - 20527314
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||  | | ||    
T  20527453 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagaagataca 20527354  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatc 749  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||    
T  20527353 aaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatc 20527314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 20927454 - 20927311
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||   | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  20927454 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 20927355  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| | |||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  20927354 gaggtgtttagcaagattgatatgagatcaggatatcatcagat 20927311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 673
Target Start/End: Original strand, 21739998 - 21740058
Alignment:
Q  613 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 673  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21739998 gttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 21740058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 41215815 - 41215958
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  41215815 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 41215914  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  41215915 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 41215958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 830 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 20944210 - 20944142
Alignment:
Q  830 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  20944210 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 20944142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 19717444 - 19717759
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19717444 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 19717543  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19717544 aaggtttttaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19717643  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19717644 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggt 19717743  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  19717744 tgtgtttattgatgat 19717759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Original strand, 19650487 - 19650792
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19650487 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttca 19650586  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
      ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | | |||    
T  19650587 gtaagattgacttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaa 19650686  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19650687 ggtgatgcctttcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttatt 19650786  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  19650787 gatgat 19650792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 23278792 - 23278478
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23278792 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23278693  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23278692 aaggtttttagtaagattgacttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacatt 23278593  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  23278592 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggt 23278493  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  23278492 tgtttttattgatga 23278478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 25255935 - 25255629
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25255935 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 25255836  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25255835 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 25255736  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  25255735 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggt 25255636  T
Q  910 tgtgttt 916  Q
    |||||||    
T  25255635 tgtgttt 25255629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 31832661 - 31832359
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  31832661 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagta 31832562  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||    
T  31832561 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggt 31832462  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31832461 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 31832362  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  31832361 gat 31832359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 27789756 - 27789441
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27789756 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 27789657  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27789656 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 27789557  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27789556 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 27789457  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  27789456 ggtatttattgatgat 27789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 1065754 - 1065452
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  1065754 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 1065655  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  1065654 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 1065555  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  1065554 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 1065455  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  1065454 gat 1065452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 12576369 - 12576055
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12576369 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 12576270  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12576269 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 12576170  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  12576169 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggt 12576070  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
     || |||||||||||    
T  12576069 ggtatttattgatga 12576055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 23098449 - 23098760
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  23098449 ttgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 23098548  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  23098549 tttttagtaagattgacttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 23098648  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||    
T  23098649 atagaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtg 23098748  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  23098749 tttattgatgat 23098760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 23112755 - 23112437
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23112755 gaggttgtgtatagattatcgtcaactgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 23112656  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgac---ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggac 806  Q
        | |||| |||||||||    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23112655 cgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggac 23112556  T
Q  807 attagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgt 906  Q
    ||||  |||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  23112555 attatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgt 23112456  T
Q  907 tgttgtgtttattgatgat 925  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23112455 agttgtgtttattgatgat 23112437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 722 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24950494 - 24950291
Alignment:
Q  722 aagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaagg 821  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||    
T  24950494 aagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaagg 24950395  T
Q  822 tgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 921  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  24950394 tgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttga 24950295  T
Q  922 tgat 925  Q
    ||||    
T  24950294 tgat 24950291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 24677505 - 24677217
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24677505 gaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24677406  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || |  |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||  || || || || || ||||| || |    
T  24677405 aaagatttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcact 24677306  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  24677305 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 24677217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 24264376 - 24264078
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  24264376 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 24264277  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24264276 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24264177  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24264176 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttat 24264078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 24712040 - 24711742
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| ||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  24712040 attgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttca 24711941  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24711940 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24711841  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24711840 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 24711742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 24818657 - 24818935
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24818657 gaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24818756  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24818757 cgtgtattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 24818856  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  24818857 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgc 24818935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 23073879 - 23073592
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23073879 gaggttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 23073780  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |   | |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||    
T  23073779 agtattttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccatt 23073680  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 897  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| ||| ||||    
T  23073679 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttgga 23073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 24875187 - 24875465
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||   || ||||    
T  24875187 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttca 24875286  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24875287 gcaagattgatttgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24875386  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  24875387 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 24875465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 23106159 - 23106470
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23106159 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaag 23106258  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  23106259 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatga 23106358  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||     
T  23106359 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtt 23106458  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  23106459 ttcattgatgat 23106470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 10870864 - 10870558
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||      
T  10870864 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacg 10870765  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10870764 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10870665  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  10870664 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 10870565  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  10870564 tgtttat 10870558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 27220030 - 27219724
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  27220030 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 27219931  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||     
T  27219930 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactat 27219831  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  27219830 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 27219731  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  27219730 tgtttat 27219724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 41606822 - 41607120
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  41606822 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 41606921  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  41606922 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 41607021  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  41607022 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 41607120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 30209344 - 30209659
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||     
T  30209344 gaggttatgtatagattactgacagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcg 30209443  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  30209444 cgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacatt 30209543  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    | ||||     |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||   ||||||||    
T  30209544 acaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgt 30209643  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  30209644 tgtgtttatagatgat 30209659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 9337596 - 9337290
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  9337596 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 9337497  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  9337496 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 9337397  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  9337396 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 9337297  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  9337296 tgtttat 9337290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16927374 - 16927088
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16927374 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16927275  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16927274 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16927175  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16927174 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16927088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 17001014 - 17000728
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  17001014 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 17000915  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  17000914 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 17000815  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  17000814 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 17000728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 9486230 - 9485944
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  9486230 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 9486131  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  9486130 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 9486031  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  9486030 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 9485944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 21143478 - 21143756
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  21143478 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 21143577  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21143578 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 21143677  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21143678 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21143756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 27373275 - 27372977
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  27373275 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 27373176  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  27373175 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 27373076  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  27373075 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 27372977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 44383999 - 44384285
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  44383999 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 44384098  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  44384099 agttttcagcaagattgatttgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 44384198  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  44384199 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 44384285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 632 - 898
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21323981
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  | |  || || ||| | ||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21323981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 811 - 925
Target Start/End: Original strand, 27208800 - 27208914
Alignment:
Q  811 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 910  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  27208800 gaaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtg 27208899  T
Q  911 gtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| ||||||    
T  27208900 gtgtttatagatgat 27208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 665 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189646
Alignment:
Q  665 ccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaagg 764  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| || || || |    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  765 atgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatgga 864  Q
    |||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  865 gtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 23189646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 22734205 - 22734464
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |    
T  22734205 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtg 22734304  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||||||  |    
T  22734305 ttttcaacaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatga 22734404  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  22734405 gtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaa 22734464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 632 - 925
Target Start/End: Original strand, 30010633 - 30010926
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | || || || |||||||||| ||||||||||||    |||||||  || || ||||    
T  30010633 cagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggact 30010732  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    | || |  || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||     |||||| | ||    
T  30010733 taagattaggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgccttt 30010832  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  30010833 cagtgttactaatgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgat 30010926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 24705913 - 24706172
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  24705913 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaag 24706012  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  24706013 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 24706112  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||  || || ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24706113 atataaagttatgccttttggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaa 24706172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 856 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 23295705 - 23295637
Alignment:
Q  856 gttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23295705 gttnatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 23295637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 22280121 - 22279978
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22280121 gaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 22280022  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22280021 gaggtgtttagtaagattgatttgagatctggatatcatcagat 22279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 24829615 - 24829758
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  24829615 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 24829714  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  24829715 gaggtgtttagtaagattgattagagatcagaatatcatcagat 24829758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 665 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611070
Alignment:
Q  665 ccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattga 729  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 23611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Original strand, 24568095 - 24568235
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||  | |||||||| || |||||| || | || ||||||    
T  24568095 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatgatttaatggattagctggttggtgca 24568194  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  24568195 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 24568235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24623 - 24315
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24623 tgcattgattactgtcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgt 24524  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  24523 tcagtaagattgacttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaata 24424  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24423 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgttt 24324  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  24323 attgatgat 24315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 44307 - 44621
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  44307 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgct 44406  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  44407 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 44506  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  44507 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggt 44606  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  44607 tgtgtttattgatga 44621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 11959284 - 11959599
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11959284 gaggttgtgcattgactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgca 11959383  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  11959384 aaggtgttcagtaagattgatttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcatt 11959483  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11959484 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagt 11959583  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  11959584 tgtgtttattgatgat 11959599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 12358642 - 12358956
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358642 gaggttatgcattgattattgtcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 12358741  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12358742 aaggttttcagtaagaatgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacatt 12358841  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  12358842 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggt 12358941  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  12358942 tgtatttattgatga 12358956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 31693300 - 31693614
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31693300 gaggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 31693399  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31693400 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacatt 31693499  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  31693500 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggt 31693599  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  31693600 tgtatttattgatga 31693614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 31940917 - 31940603
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31940917 gaggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 31940818  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31940817 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacatt 31940718  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  31940717 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggt 31940618  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  31940617 tgtatttattgatga 31940603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 11950023 - 11950338
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11950023 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgca 11950122  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    | ||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11950123 agggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 11950222  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  11950223 acgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 11950322  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  11950323 tgtgtttattgatgat 11950338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Original strand, 18132461 - 18132772
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||  || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18132461 gaggttatgcattgtctatcgttaattgaataaagttacaattaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 18132560  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18132561 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 18132660  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  18132661 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 18132760  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||||||||||||    
T  18132761 tgtgtttattga 18132772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 47125945 - 47125643
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  47125945 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagta 47125846  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  47125845 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 47125746  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47125745 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 47125646  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  47125645 gat 47125643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 12510603 - 12510913
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  12510603 tgtgcatagattaccgtcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagat 12510702  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |     
T  12510703 tttcagtaagattgacttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgag 12510802  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | |||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12510803 tacaaaatgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 12510902  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  12510903 ttattgatgat 12510913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 44779261 - 44778947
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44779261 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 44779162  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44779161 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 44779062  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  44779061 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 44778962  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
     || |||||||||||    
T  44778961 ggtatttattgatga 44778947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 13944038 - 13943723
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13944038 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 13943939  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13943938 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 13943839  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  13943838 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 13943739  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  13943738 ggtatttattgatgat 13943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 41179536 - 41179221
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41179536 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 41179437  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41179436 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 41179337  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | | ||| |||||| | |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  41179336 acgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 41179237  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  41179236 ggtatttattgatgat 41179221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 16834630 - 16834939
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||     |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16834630 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgca 16834724  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16834725 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 16834824  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |   || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16834825 acgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggt 16834924  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  16834925 tgtatttattgatga 16834939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 13318621 - 13318932
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13318621 ttgtgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaag 13318720  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  13318721 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacga 13318820  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  13318821 atacaaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggta 13318920  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  13318921 tttattgatgat 13318932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 17188381 - 17188074
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17188381 tgcattgactatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttt 17188282  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||     
T  17188281 ttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 17188182  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| ||     
T  17188181 taaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattc 17188082  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  17188081 attgatga 17188074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 28756319 - 28756017
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||| | || |  |    
T  28756319 gattaccgtcaattgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagta 28756220  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||    
T  28756219 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagt 28756120  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28756119 gatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 28756020  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  28756019 gat 28756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 10418160 - 10418475
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  10418160 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 10418259  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10418260 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 10418359  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10418360 acgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 10418459  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||| ||||||    
T  10418460 ggtatttatagatgat 10418475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 14088687 - 14088373
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  14088687 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 14088588  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14088587 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 14088488  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  14088487 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 14088388  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  14088387 tgtattcattgatga 14088373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 12180358 - 12180038
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12180358 gaggttattcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 12180259  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12180258 cgtgtatttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 12180159  T
Q  810 aga------aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatt 903  Q
    | |      |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  12180158 atatatatgaatataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaatt 12180059  T
Q  904 tgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     || ||||||| |||||||||    
T  12180058 cgtggttgtgtctattgatga 12180038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 16379043 - 16379358
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  16379043 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgca 16379142  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16379143 aaggtttttagtaagattgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 16379242  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  16379243 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggt 16379342  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  16379343 ggtatttattgatgat 16379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 16327780 - 16328090
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  16327780 tgtgcatagattaccgtcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 16327879  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |     
T  16327880 ttttagtaagattgacttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgag 16327979  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  16327980 tacaaggtgatgcctttcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgt 16328079  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  16328080 ttattgatgat 16328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15229617 - 15229302
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15229617 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgca 15229518  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229517 cgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15229418  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15229417 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggt 15229318  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  15229317 tgtgtttattgatgat 15229302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15235485 - 15235170
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15235485 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgca 15235386  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15235385 cgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15235286  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15235285 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggt 15235186  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  15235185 tgtgtttattgatgat 15235170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 613 - 924
Target Start/End: Original strand, 16826399 - 16826705
Alignment:
Q  613 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 712  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||       
T  16826399 gttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgt 16826498  T
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||      
T  16826499 gtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatg 16826598  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||    
T  16826599 aatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatg-----ctggataaatttgtggttgt 16826693  T
Q  913 gtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||    
T  16826694 gtttattgatga 16826705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 617 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 24189311 - 24189076
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24189311 tgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttt 24189212  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||     
T  24189211 ttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 852  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24189111 taaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 13970235 - 13970549
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||     
T  13970235 gaggttatgtattgactaccgtcaattgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcg 13970334  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13970335 aagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 13970434  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  13970435 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 13970534  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  13970535 tgtattcattgatga 13970549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 623 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 10407969 - 10407720
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  10407969 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 10407870  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  10407869 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 10407770  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 872  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  10407769 aatgcctttctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 610 - 883
Target Start/End: Original strand, 8745505 - 8745776
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8745505 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 8745604  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  8745605 aaggtgttcagtaagattgacttgaggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcatt 8745704  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttc 883  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8745705 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccgtngtg-tcatggag-atatgaatcgaattttc 8745776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 716 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 12270118 - 12269910
Alignment:
Q  716 ttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaat 815  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12270118 ttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaat 12270019  T
Q  816 ccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 915  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12270018 ataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtt 12269919  T
Q  916 tattgatga 924  Q
    |||||||||    
T  12269918 tattgatga 12269910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 612 - 921
Target Start/End: Original strand, 16754829 - 16755138
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  16754829 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 16754928  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  16754929 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 16755028  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  16755029 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 16755128  T
Q  912 tgtttattga 921  Q
    ||||||||||    
T  16755129 tgtttattga 16755138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 610 - 858
Target Start/End: Original strand, 14291647 - 14291895
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  14291647 gaggttgagtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 14291746  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  14291747 tgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcact 14291846  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgtt 858  Q
    |  |||  ||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14291847 atgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14291895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 15587520 - 15587826
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  15587520 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 15587619  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || ||     
T  15587620 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactat 15587719  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15587720 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttg 15587819  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  15587820 tgtttat 15587826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 15261630 - 15261346
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  15261630 ttgtgcattgattatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtg 15261531  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  15261530 tgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatga 15261431  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  15261430 atataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggat 15261346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 15013882 - 15014197
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15013882 gaggttgtgtatagatcaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgca 15013981  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  |||||||| || || || || ||||| || || |  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  15013982 cgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacatt 15014081  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||| | |||||  |||||||||    
T  15014082 acgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgt 15014181  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  15014182 tgtgtttatagatgat 15014197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 53383146 - 53383432
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  53383146 ggttgtgtattgattatcggccgttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 53383245  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  53383246 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 53383345  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  53383346 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 53383432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 16805077 - 16805361
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16805077 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 16805176  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16805177 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatga 16805276  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16805277 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16805361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 853
Target Start/End: Original strand, 14579534 - 14579777
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14579534 gaggttatgcattgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgca 14579633  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||||||||    
T  14579634 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacatt 14579733  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgga 853  Q
    |  | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14579734 atgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 15346373 - 15346679
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  15346373 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 15346472  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  15346473 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15346572  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  15346573 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 15346672  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  15346673 tgtttat 15346679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 20060182 - 20060488
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  20060182 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 20060281  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  20060282 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 20060381  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  20060382 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttg 20060481  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  20060482 tgtttat 20060488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Original strand, 15400653 - 15400958
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  15400653 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 15400752  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15400753 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15400852  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  15400853 agttatgccttttggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15400952  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  15400953 gatgat 15400958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 610 - 810
Target Start/End: Original strand, 11888480 - 11888680
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11888480 gaggttatgcattgattatcgacagttgattaaagtaacgataaacaataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 11888579  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11888580 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacatt 11888679  T
Q  810 a 810  Q
    |    
T  11888680 a 11888680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 5423058 - 5423344
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  5423058 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 5423157  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||     
T  5423158 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactat 5423257  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5423258 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5423344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 6602738 - 6602452
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  6602738 ggttgtgtattgattatcggcagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 6602639  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||     
T  6602638 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 6602539  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  6602538 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 6602452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 10007602 - 10007316
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10007602 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10007503  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10007502 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10007403  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10007402 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10007316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 10908212 - 10907926
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10908212 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10908113  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10908112 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10908013  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10908012 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10907926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 12888711 - 12888425
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  12888711 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 12888612  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  12888611 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 12888512  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12888511 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12888425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16694164 - 16693880
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16694164 ttgtgtattgactatcgtcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaag 16694065  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16694064 tcttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatga 16693965  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16693964 atataaagttatgccattcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16693880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 3687945 - 3687659
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||      
T  3687945 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacg 3687846  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  3687845 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 3687746  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  3687745 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 3687659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 5108747 - 5109025
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  5108747 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 5108846  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  5108847 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 5108946  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5108947 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5109025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 48427449 - 48427163
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  48427449 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 48427350  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  48427349 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 48427250  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  48427249 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 48427163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 620 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 15358077 - 15357914
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  15358077 attgattatcgacagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 15357978  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15357977 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagac 15357914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 13254692 - 13254386
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||      
T  13254692 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacg 13254593  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  13254592 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 13254493  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  13254492 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 13254393  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  13254392 tgtttat 13254386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16637775 - 16637489
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16637775 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16637676  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16637675 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16637576  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16637575 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16637489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17491850 - 17491591
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  17491850 ttgtgtattgactatcgacatttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 17491751  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||||||||  |    
T  17491750 ttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatga 17491651  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  17491650 gtacaaagttatgcctttcagtgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaa 17491591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 24185194 - 24185051
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24185194 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24185095  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  24185094 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagat 24185051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 661 - 925
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14874940
Alignment:
Q  661 gtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtg 760  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||     
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  761 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttca 860  Q
    || || || ||| ||||||||||  | || || || || ||||| || ||  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  861 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| ||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgat 14874940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 610 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12272352 - 12272254
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 708  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12272352 gaggttatgcattgattattgtccgtttaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 620 - 709
Target Start/End: Original strand, 15714192 - 15714281
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15714192 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 43164677 - 43164580
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43164677 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 43164580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 721 - 925
Target Start/End: Original strand, 15723171 - 15723375
Alignment:
Q  721 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 820  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |||  ||     
T  15723171 caagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaa 15723270  T
Q  821 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattg 920  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| |    
T  15723271 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcg 15723370  T
Q  921 atgat 925  Q
    |||||    
T  15723371 atgat 15723375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 614 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18437140 - 18437044
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18437140 ttgtgtattgattatcgacagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaa 18437044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 30139820 - 30139677
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30139820 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 30139721  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  30139720 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 30139677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 30149371 - 30149228
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30149371 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 30149272  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  30149271 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 30149228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272668
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  8272648 gagatcaggatatcatcagat 8272668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 13965478 - 13965621
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13965478 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 13965577  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| | ||| || || |||||||||||    
T  13965578 gaggtgtttagtaagattgattcgagatcaggatatcatcagat 13965621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 15612117 - 15611974
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  15612117 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 15612018  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  15612017 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 15611974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 15948596 - 15948739
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  15948596 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 15948695  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  15948696 gaggtgtttagtaagattgatttgagattaggatatcatcagat 15948739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 610 - 670
Target Start/End: Original strand, 12844229 - 12844289
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccactt 670  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12844229 gaggttgtgcattgactatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccactt 12844289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 6150979 - 6151122
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  6150979 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 6151078  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6151079 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 6151122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 17200635 - 17200505
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |    
T  17200635 gattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagta 17200536  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  17200535 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 17200505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 32510104 - 32510169
Alignment:
Q  345 acttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcattatatacacat 410  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32510104 acttttccttttatgttgatcttaaataatcatgtgctagttaaacctttatcattatatacacat 32510169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 833 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15341050 - 15340958
Alignment:
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15341050 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgat 15340958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 612 - 684
Target Start/End: Original strand, 26791541 - 26791613
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatga 684  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791541 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34376315 - 34376222
Alignment:
Q  409 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaatgaataggtggagaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtt 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  34376315 atgtaataagctctcttgttatggtta---aatataattggttttaaaaatgagcatgtggagagaagatagtttgatcgaagggccagagtcggtt 34376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25768319 - 25768189
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||   | |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  25768319 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 25768220  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  25768219 acattgatttgagatcaggatatcatcagat 25768189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 864 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 10385431 - 10385370
Alignment:
Q  864 agtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  10385431 agtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgat 10385370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34376405 - 34376360
Alignment:
Q  353 ttttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatca 398  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34376405 ttttatgttgatcttaagtaatcatgtattagttaaacctatatca 34376360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 542
Target Start/End: Original strand, 32510208 - 32510288
Alignment:
Q  456 aaatgaataggtggagaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaatgccctgcaggcaattatatgttccaataaaaag 542  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32510208 aaatgagtatgtggagagaagtttgtttgatagaagtgctagagtcggtt------agtgcaagcaattatatgttccaataaaaag 32510288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 833 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 12500029 - 12499964
Alignment:
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12500029 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12499964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 2843 - 3157
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2843 gaggttatgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaataaataacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 2942  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2943 aaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacatt 3042  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  3043 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggt 3142  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  3143 tgtgtttattgatga 3157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 69782 - 69471
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||| |    
T  69782 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaag 69683  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  69682 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacga 69583  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  69582 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggta 69483  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  69482 tttattgatgat 69471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 16150096 - 16149785
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16150096 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 16149997  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16149996 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 16149897  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  16149896 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggt 16149797  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||||||||||||    
T  16149796 tgtgtttattga 16149785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 16154242 - 16153931
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16154242 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 16154143  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16154142 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 16154043  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  16154042 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggt 16153943  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||||||||||||    
T  16153942 tgtgtttattga 16153931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Original strand, 15357014 - 15357321
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15357014 tgcatcgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttt 15357113  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||     
T  15357114 tcagcaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaata 15357213  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |  ||||| |||    
T  15357214 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtattt 15357313  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  15357314 attgatga 15357321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 11205124 - 11205434
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  11205124 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagat 11205223  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  11205224 ctttagcaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 11205323  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11205324 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 11205423  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  11205424 ttattgatgat 11205434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 3262694 - 3262996
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  3262694 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 3262793  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  3262794 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 3262893  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3262894 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 3262993  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  3262994 gat 3262996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15258312 - 15257998
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  15258312 gaggttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatga-ttaatcgatcagttagtgggtgct 15258214  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15258213 cgtgtgtttagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 15258114  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  15258113 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggt 15258014  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  15258013 tgtgtttattgatgat 15257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 29451437 - 29451739
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  29451437 gattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 29451536  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  29451537 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 29451636  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  29451637 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgat 29451736  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  29451737 gat 29451739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 15001252 - 15001566
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15001252 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgca 15001351  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  15001352 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcact 15001451  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15001452 atgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 15001551  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  15001552 tgtgtttattgatga 15001566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 51604679 - 51604994
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51604679 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 51604778  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  51604779 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcatt 51604878  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  51604879 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 51604978  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  51604979 ggtatttattgatgat 51604994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 1647164 - 1647479
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1647164 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgca 1647263  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1647264 aaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcatt 1647363  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1647364 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggt 1647463  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || || |||||||||    
T  1647464 ggtattcattgatgat 1647479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 614 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 27902767 - 27902459
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  | || |||||||| |    
T  27902767 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaag 27902668  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27902667 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 27902568  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||     
T  27902567 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggta 27902468  T
Q  914 tttattgat 922  Q
    |||||||||    
T  27902467 tttattgat 27902459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15072744 - 15072429
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  15072744 gaggttgtgtataggttaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 15072645  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072644 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15072545  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15072544 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggt 15072445  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  15072444 tgtgtttattgatgat 15072429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 623 - 921
Target Start/End: Original strand, 44659766 - 44660064
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  44659766 gattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 44659865  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  44659866 agattgatttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 44659965  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 921  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44659966 gatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattga 44660064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14161850 - 14161540
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  14161850 tgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgt 14161751  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||    
T  14161750 gttcaacaagattgatttgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaa 14161651  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    |     |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |    
T  14161650 ttttcagtgatgcctttcggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtat 14161551  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  14161550 ttattgatgat 14161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 617 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16218608 - 16218327
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  16218608 tgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgt 16218509  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  16218508 ttagcaagattgacttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaata 16218409  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  16218408 taaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 16218327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 617 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16221928 - 16221647
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  16221928 tgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgt 16221829  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  16221828 ttagcaagattgacttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaata 16221729  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  16221728 taaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 16221647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 8708292 - 8707982
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8708292 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 8708193  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  |||||    |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8708192 cgcgtgtttagtaagat----ttgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacatt 8708097  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||| ||    
T  8708096 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggt 8707997  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  8707996 tgtgtttattgatga 8707982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 8051260 - 8051558
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  8051260 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 8051359  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  8051360 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 8051459  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  8051460 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 8051558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Original strand, 14301616 - 14301921
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  14301616 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 14301715  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14301716 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 14301815  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  14301816 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 14301915  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  14301916 gatgat 14301921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 921
Target Start/End: Original strand, 18225077 - 18225384
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18225077 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 18225176  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  18225177 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 18225276  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||    
T  18225277 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtg 18225376  T
Q  914 tttattga 921  Q
    ||||||||    
T  18225377 tttattga 18225384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 610 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 27713721 - 27713413
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  27713721 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgca 27713622  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  27713621 cgagttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 27713522  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  27713521 atgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggt 27713422  T
Q  910 tgtgtttat 918  Q
    |||||||||    
T  27713421 tgtgtttat 27713413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 8388795 - 8388509
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  8388795 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 8388696  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  8388695 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 8388596  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  8388595 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 8388509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 12478983 - 12478697
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  12478983 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 12478884  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  12478883 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 12478784  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12478783 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12478697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 16234621 - 16234907
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16234621 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16234720  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  16234721 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 16234820  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16234821 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16234907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 19776422 - 19776708
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  19776422 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 19776521  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  19776522 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 19776621  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  19776622 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 19776708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 14682952 - 14682664
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14682952 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 14682853  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  14682852 cgtgttttcagcaagattgatctgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 14682753  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  ||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  14682752 atgaatataaggttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 14682664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 14848993 - 14849281
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14848993 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcg 14849092  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || || | |||| |||| ||||| || |||||||| || || || ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14849093 cgtgtatttagcaaggttgatttgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacatt 14849192  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || | |||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  14849193 atgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 14849281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Original strand, 17092778 - 17093084
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||      
T  17092778 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacg 17092877  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  17092878 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 17092977  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  17092978 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 17093077  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  17093078 tgtttat 17093084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 23958122 - 23957824
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  23958122 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 23958023  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  23958022 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 23957923  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  23957922 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 23957824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 40475415 - 40475110
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  40475415 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 40475316  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  40475315 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataa 40475216  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||     
T  40475215 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatc 40475116  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  40475115 gatgat 40475110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 14696498 - 14696234
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  14696498 gaggttatgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgta 14696399  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14696398 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacatt 14696299  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaac 874  Q
    |  |||     |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  14696298 attaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaac 14696234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 633 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443290
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
    ||| |  |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacatta 23443290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 22632085 - 22631916
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  22632085 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 22631986  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22631985 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 22631916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 614 - 735
Target Start/End: Original strand, 16251481 - 16251602
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16251481 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaag 16251580  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgag 735  Q
    | |||| ||||||||| |||||    
T  16251581 ttttcagcaagattgatttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 830 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15323382 - 15323287
Alignment:
Q  830 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15323382 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 15323287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 15145533 - 15145827
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  15145533 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaa--------ttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 15145624  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || ||    
T  15145625 acattgatttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagt 15145724  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| |||    
T  15145725 tatgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgat 15145824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291188
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    |||| || || |||||||||||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagat 15291188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 898
Target Start/End: Original strand, 16353245 - 16353422
Alignment:
Q  721 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 820  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| |||     
T  16353245 caagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaa 16353344  T
Q  821 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16353345 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16353422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 56338929 - 56338866
Alignment:
Q  371 taatcatgtattggttaaacctatatcattatatacaca--tgtaataagctctcttgttatgg 432  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56338929 taatcatgtactagttaaacctatatcattatatacacatgtgtaataagctctcttgttatgg 56338866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Original strand, 16353157 - 16353244
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 697  Q
    |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16353157 gaggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 857 - 924
Target Start/End: Original strand, 15422374 - 15422441
Alignment:
Q  857 ttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15422374 ttcatggattacatgaatcgaatattccatccctttttggacaaatttgttgtagtgtttattgatga 15422441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 99452 - 99766
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  99452 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgca 99551  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  99552 aaggtttttagtaagattgaattgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacatt 99651  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  99652 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 99751  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  99752 tgtgtttattgatga 99766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 11537 - 11222
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11537 gaggttgtgcattgattattgtcaattgaataaagttacgataaagaacatgtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 11438  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 11338  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  11337 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggt 11238  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  11237 tgtgtttattgatgat 11222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 5527 - 5217
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5527 gaggttatgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgca 5428  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  5427 cgtgtgtttagcaagattgatttgagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggcttt 5328  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| ||    
T  5327 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcat-gagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggt 5229  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    |||||| |||||    
T  5228 tgtgttcattga 5217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 9477 - 9163
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9477 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgca 9378  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9377 aaggtttttagtaagattgacttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 9278  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  9277 acgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 9178  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  9177 tgtatttattgatga 9163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 1384 - 1694
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1384 tgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagt 1483  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  1484 ttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaa 1583  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  1584 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaggatatgaaccaaattttccatgcttttcaggataaatttgtggttgtat 1683  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  1684 ttattgatgat 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Original strand, 515248 - 515558
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  515248 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 515347  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  515348 ttttagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgat 515447  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  515448 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgt 515547  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  515548 ttattgatgat 515558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 453103 - 453417
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  453103 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 453202  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  453203 agtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacact 453302  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  453303 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 453402  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  453403 tgtgtttattgatga 453417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 617 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 495427 - 495129
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  495427 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgt 495328  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | ||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  495327 ttagcaatatttatttgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaata 495228  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 915  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  495227 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgtt 495129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 624 - 924
Target Start/End: Original strand, 759 - 1058
Alignment:
Q  624 attaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaa 723  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  759 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggt-ttcagcaa 857  T
Q  724 gattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtg 823  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  858 gattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtg 957  T
Q  824 atgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatg 923  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  958 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatg 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Original strand, 45317 - 45628
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45317 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 45416  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45417 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcatt 45516  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  45517 aagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggt 45616  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||||||||||||    
T  45617 tgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 40236 - 40538
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  40236 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagta 40335  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  40336 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 40435  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40436 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 40535  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  40536 gat 40538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 4326 - 4042
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||   |    
T  4326 ttgtgtattgattatcgacagttgaatagagtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtg 4227  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |    
T  4226 tgtttagcaagattgatttaagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatga 4127  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  4126 atataaagtgatgtctttcggtgttacaaatacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 4042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 328
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  642 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 543  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  542 aaggttttcagcaagattgacttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 443  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||    
T  442 aagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggt 343  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  342 tgtatttattgatga 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 38064 - 37750
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38064 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgca 37965  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37964 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcatt 37865  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  37864 acgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggt 37765  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||  |||||||||||    
T  37764 tgaatttattgatga 37750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2477
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  2162 gaggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 2261  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2262 tgtgtattcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacatt 2361  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  2362 atgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggt 2461  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  2462 tgtgtttattgatgat 2477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 29175 - 29490
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  29175 gaggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 29274  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29275 tgtgtattcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacatt 29374  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  29375 atgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggt 29474  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  29475 tgtgtttattgatgat 29490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 611 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 747
Alignment:
Q  611 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  1058 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caa 961  T
Q  711 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
    || | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  960 agttttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatta 861  T
Q  811 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 910  Q
      ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  860 cgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtg 761  T
Q  911 gtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||||    
T  760 gtgtttattgatga 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 611 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 8027 - 7814
Alignment:
Q  611 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 710  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  8027 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaa 7930  T
Q  711 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
    || | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7929 agttttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatta 7830  T
Q  811 gaaatccaaggtgatg 826  Q
      ||| ||||||||||    
T  7829 cgaatacaaggtgatg 7814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 9948 - 10261
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9948 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 10047  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10048 aaggttttcagcaagattgacttaaggtcaggt-accatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcatt 10146  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||    
T  10147 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggt 10246  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  10247 tgtgtttattgatga 10261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 325120 - 324806
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  325120 gaggttgtgcattgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcg 325021  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  325020 aaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 324921  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  324920 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggt 324821  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  324820 tgtatttattgatga 324806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 201358 - 201673
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  201358 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtaca 201457  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  201458 cgagtgtttagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 201557  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||| ||    
T  201558 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggt 201657  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  201658 tgtgtttattgatgat 201673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 22504973 - 22504663
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | | |    
T  22504973 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggat 22504874  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  22504873 tttcagtaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgag 22504774  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22504773 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 22504674  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  22504673 ttattgatgat 22504663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 20344574 - 20344266
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  20344574 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattt 20344475  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  20344474 ttagcaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 20344375  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20344374 caaagtgatgcctttcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttt 20344275  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  20344274 attgatgat 20344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Original strand, 24796473 - 24796781
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  24796473 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattt 24796572  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  24796573 tcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 24796672  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24796673 caaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttt 24796772  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  24796773 attgatgat 24796781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 28893011 - 28893326
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  28893011 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 28893110  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28893111 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 28893210  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28893211 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 28893310  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||| ||||||    
T  28893311 ggtatttatagatgat 28893326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 28921837 - 28922152
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  28921837 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 28921936  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28921937 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 28922036  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28922037 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 28922136  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||| ||||||    
T  28922137 ggtatttatagatgat 28922152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 617 - 925
Target Start/End: Original strand, 14885067 - 14885375
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  14885067 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattt 14885166  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  14885167 tcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 14885266  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  14885267 caaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtattt 14885366  T
Q  917 attgatgat 925  Q
    |||||||||    
T  14885367 attgatgat 14885375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 17267403 - 17267718
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17267403 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 17267502  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17267503 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 17267602  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17267603 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggt 17267702  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  17267703 ggtatttattgatgat 17267718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 20778212 - 20777897
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||     
T  20778212 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgct 20778113  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20778112 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacatt 20778013  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20778012 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20777913  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||| ||||||    
T  20777912 ggtgtttatagatgat 20777897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 22464250 - 22463935
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  22464250 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 22464151  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22464150 aaagtttttagtaagattgacctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 22464051  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22464050 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 22463951  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||| ||||||    
T  22463950 ggtatttatagatgat 22463935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 20823752 - 20823437
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  20823752 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 20823653  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20823652 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 20823553  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20823552 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20823453  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||| ||||||    
T  20823452 ggtgtttatagatgat 20823437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 25850370 - 25850059
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||      
T  25850370 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaa 25850271  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  25850270 tttttagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 25850171  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25850170 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtg 25850071  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  25850070 ttcattgatgat 25850059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 37541463 - 37541765
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  37541463 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagta 37541562  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  37541563 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 37541662  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  37541663 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgat 37541762  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  37541763 gat 37541765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 627 - 924
Target Start/End: Original strand, 22234006 - 22234303
Alignment:
Q  627 accgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagat 726  Q
    |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||| |  || ||    
T  22234006 accgtccgctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaat 22234105  T
Q  727 tgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatg 826  Q
    ||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || ||  |||  |||||||||    
T  22234106 tgatttgaggttaggttaccatcagattaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatg 22234205  T
Q  827 tcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22234206 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 22234303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 21562094 - 21562371
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  21562094 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgca 21562192  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21562193 cgcgtgttcagcaagattgatttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 21562292  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21562293 atgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgc 21562371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 617 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 23473537 - 23473256
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  23473537 tgcattgattatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgt 23473438  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | ||||||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  23473437 ttagcaagattgatttgagatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaata 23473338  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  23473337 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 23473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 614 - 888
Target Start/End: Original strand, 26736800 - 26737074
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  26736800 ttgtgtattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatg 26736899  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||  |    
T  26736900 tatttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatga 26736999  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  26737000 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgc 26737074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 27520721 - 27520415
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  27520721 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 27520622  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  27520621 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 27520522  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  27520521 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 27520422  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  27520421 tgtttat 27520415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 614 - 899
Target Start/End: Original strand, 21337367 - 21337652
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  21337367 ttgtgcattgattatcgacagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtg 21337466  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||  |    
T  21337467 tgtttagcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatga 21337566  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggata 899  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  21337567 atataaagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggata 21337652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 22136975 - 22136677
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22136975 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22136876  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||  |||  ||    
T  22136875 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataa 22136776  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22136775 agttatgccttttggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22136677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 37289575 - 37289873
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  37289575 attgattatcgacagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 37289674  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  |||  ||    
T  37289675 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataa 37289774  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  37289775 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 37289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 14997818 - 14998116
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  14997818 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 14997917  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14997918 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 14998017  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  14998018 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 14998116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Original strand, 29474152 - 29474457
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  29474152 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 29474251  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  29474252 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 29474351  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||     
T  29474352 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatc 29474451  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  29474452 gatgat 29474457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 770 - 925
Target Start/End: Original strand, 28914642 - 28914797
Alignment:
Q  770 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 869  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28914642 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtata 28914741  T
Q  870 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28914742 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgat 28914797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 770 - 925
Target Start/End: Original strand, 28929910 - 28930065
Alignment:
Q  770 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 869  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28929910 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtata 28930009  T
Q  870 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28930010 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgat 28930065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 22330966 - 22331264
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22330966 attgattatcggcatttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22331065  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  22331066 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 22331165  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22331166 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22331264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 22350226 - 22349948
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  22350226 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 22350127  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  22350126 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 22350027  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  22350026 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 22349948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Original strand, 27683479 - 27683777
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  27683479 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 27683578  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  27683579 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 27683678  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  27683679 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 27683777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Original strand, 27666561 - 27666847
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27666561 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacg 27666660  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27666661 agttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 27666760  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || ||  || | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  27666761 gaatataaagttttgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 27666847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 40711095 - 40710789
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  40711095 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 40710996  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  40710995 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 40710896  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  40710895 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 40710796  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  40710795 tgtttat 40710789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 41773157 - 41772851
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  41773157 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 41773058  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  41773057 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 41772958  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 911  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  41772957 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 41772858  T
Q  912 tgtttat 918  Q
    |||||||    
T  41772857 tgtttat 41772851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 25428750 - 25428435
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25428750 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 25428651  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || |    
T  25428650 agtgttttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccact 25428551  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| ||||   ||| || ||    
T  25428550 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggt 25428451  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25428450 tgtttttattgatgat 25428435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 16358817 - 16358531
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16358817 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16358718  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16358717 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16358618  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16358617 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16358531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 20466168 - 20466446
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20466168 gaggttatgcatttattatcgacagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgca 20466267  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466268 cgtgtgtttagcaagattgatttaagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacatt 20466367  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||     |||||| | || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  20466368 acgaatattcagtgatgccttttggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgc 20466446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 27612669 - 27612383
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||      
T  27612669 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacg 27612570  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  27612569 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 27612470  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  27612469 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 27612383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 612 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 34568809 - 34568523
Alignment:
Q  612 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  34568809 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 34568710  T
Q  712 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 811  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  34568709 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 34568610  T
Q  812 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  34568609 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 34568523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 18781427 - 18781143
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  18781427 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaag 18781328  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  18781327 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 18781228  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  18781227 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 18781143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 610 - 771
Target Start/End: Original strand, 21676903 - 21677064
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21676903 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacggtaaagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 21677002  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgagga 771  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21677003 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgagga 21677064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 768 - 924
Target Start/End: Original strand, 21679005 - 21679161
Alignment:
Q  768 aggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagta 867  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679005 aggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagta 21679104  T
Q  868 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21679105 tatgaacagaatttttcatgtttacctagataaatttgtggttgtattcattgatga 21679161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 620 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 19772267 - 19771972
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||   || || |    
T  19772267 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgttttta 19772168  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  19772167 gcaagattgatttgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 19772068  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 915  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  19772067 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtt 19771972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 20801708 - 20801426
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||      || |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20801708 gaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagt------aatgaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgca 20801615  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || |    
T  20801614 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcact 20801515  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  20801514 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 20801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21409451 - 21409136
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||||||||||||  |||||||     
T  21409451 gaggttatgtatagattaccggaagttgaataaagtgacaataaagaatagatatccacctccgaggatcgacgatttgatggatcagttgatgggtgcg 21409352  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || |||||||| || |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||     
T  21409351 cgtgtgttcagtaaaattgacttaagatggggctatcaccatatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacata 21409252  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||    
T  21409251 acgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatttatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgt 21409152  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21409151 tgtgtttatagatgat 21409136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 21935257 - 21935400
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21935257 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 21935356  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21935357 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 21935400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 23507983 - 23507840
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23507983 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 23507884  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23507883 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 23507840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 24583509 - 24583366
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  24583509 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 24583410  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24583409 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 24583366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 610 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 22290 - 21981
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22290 gaggttgtgcattgattatcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaa 22191  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22190 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 22091  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | | |||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22090 atgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 21991  T
Q  910 tgtgtttatt 919  Q
    ||| ||||||    
T  21990 tgtatttatt 21981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 610 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 39472 - 39307
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  39472 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgca 39373  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatg 775  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39372 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 18235 - 18404
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18235 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaag 18334  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || ||||||||  |||| |  || || ||||| ||||||||||||||    
T  18335 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagac 18404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 43332 - 43018
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43332 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 43233  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43232 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcatt 43133  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  43132 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaa-tttctatgcttacctggataaatttgtggt 43034  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||||||    
T  43033 tgtgtttattgatgat 43018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 33751 - 33436
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgat-aaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 708  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33751 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgc 33652  T
Q  709 aaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacat 808  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33651 acgtgtgtttaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacat 33552  T
Q  809 tagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttg 908  Q
    ||  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| || |    
T  33551 tacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtgg 33452  T
Q  909 ttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33451 ttgtgttcattgatga 33436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 29031 - 28724
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |    
T  29031 tgcattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtat 28932  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  28931 tcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 28832  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28831 taaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgttt 28732  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  28731 attgatga 28724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 59108 - 59419
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  59108 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 59207  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  59208 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacga 59307  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  59308 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 59407  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  59408 ttcattgatgat 59419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 50074 - 50385
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  50074 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 50173  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  50174 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacga 50273  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  50274 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 50373  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  50374 ttcattgatgat 50385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 65496 - 65807
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  65496 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 65595  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  65596 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacga 65695  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  65696 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 65795  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  65796 ttcattgatgat 65807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1053
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  1363 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 1264  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  1263 ttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgag 1164  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1163 tacaaagtaatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtat 1064  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  1063 ttattgatgat 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 615 - 921
Target Start/End: Original strand, 729 - 1035
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  729 tgtgcattgattaccgttagttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 828  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  829 ttttagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgag 928  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  929 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtat 1028  T
Q  915 ttattga 921  Q
    | |||||    
T  1029 tcattga 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5554
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  5241 gaggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgct 5340  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5341 cgtgtattcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcact 5440  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  |||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5441 atgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 5539  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  5540 tgtgtttattgatga 5554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 9672 - 9985
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  9672 gaggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgct 9771  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9772 cgtgtattcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcact 9871  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  |||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9872 atgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 9970  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  9971 tgtgtttattgatga 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 623 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 70
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || |||| ||    
T  230 gattatcgtcacttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagca 131  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  130 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21536 - 21221
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  | |||||||||    
T  21536 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgca 21437  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  21436 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcatt 21337  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21336 atgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagt 21237  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  21236 tgtatttcttgatgat 21221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 27138 - 27453
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27138 gaggttatgtatagattaccggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgca 27237  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  || |||||||| || || || ||||| | ||| ||  |||| |||||||| || ||||||| || |||||||| ||| || ||| |||    
T  27238 cgtgtgttcagtaaaattgacttaagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaatt 27337  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||    
T  27338 atgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgt 27437  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  27438 tgtgtttatagatgat 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 916 - 602
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  916 gaggttgtgtatagattaatgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgct 817  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  816 cgtgtgtttagcaaaattggtttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcatt 717  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  716 atgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggt 617  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  616 tgtgtttattgatga 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13540
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  13226 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgct 13325  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13326 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacatt 13425  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  13426 acgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggt 13525  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  13526 tgtgtttattgatga 13540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 21405 - 21719
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  21405 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgct 21504  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21505 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacatt 21604  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  21605 acgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggt 21704  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  21705 tgtgtttattgatga 21719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 610 - 844
Target Start/End: Original strand, 54301 - 54535
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  54301 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgca 54400  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54401 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 54500  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaat 844  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54501 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaat 54535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 31567 - 31881
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31567 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgca 31666  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31667 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 31766  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  31767 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 31866  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  31867 tgtattcattgatga 31881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 839 - 925
Target Start/End: Original strand, 55019 - 55105
Alignment:
Q  839 actaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||||    
T  55019 actaatgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctagttaaattcgtggtggtatttattgatgat 55105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 42674 - 42531
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  42674 gaggttgtgtgtggattatcgccagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 42575  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  42574 taggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 42531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Original strand, 6035 - 6350
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  6035 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgca 6134  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6135 aagatttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcatt 6234  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  6235 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggt 6334  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     || ||||||||||||    
T  6335 ggtatttattgatgat 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 28937 - 28626
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||   |    
T  28937 ttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcg 28838  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  28837 tgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatga 28738  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  28737 gtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtg 28638  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  28637 tttattgatgat 28626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 3125 - 2818
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  3125 tgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgt 3026  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||     
T  3025 ttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaata 2926  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  2925 taaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgttt 2826  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  2825 attgatga 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 35912 - 35624
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35912 gaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 35813  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  35812 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 35713  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  35712 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 35624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 28404 - 28227
Alignment:
Q  721 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 820  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| |||     
T  28404 caagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaa 28305  T
Q  821 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28304 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28492 - 28405
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 697  Q
    |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28492 gaggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 269024 - 268709
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  269024 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 268925  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  268924 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcatt 268825  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  268824 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggt 268725  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
     |||||||| ||||||    
T  268724 ggtgtttatagatgat 268709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 632 - 925
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84724
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||| |||||||||||||    |||||||| || |||||||    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||     |||||| | ||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgat 84724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 610 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 262640 - 262329
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  262640 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgca 262541  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  262540 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 262441  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  262440 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggt 262341  T
Q  910 tgtgtttattga 921  Q
    ||| || |||||    
T  262340 tgtattcattga 262329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 19524 - 19838
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19524 gaggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 19623  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19624 aaagttttcagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 19723  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||    
T  19724 acgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggt 19823  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  19824 tgtgtttattgatga 19838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 150985 - 150671
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  150985 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 150886  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  150885 cgtgtatttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacact 150786  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  150785 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggt 150686  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||  |||||||||||    
T  150685 tgaatttattgatga 150671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 614 - 897
Target Start/End: Original strand, 24427 - 24710
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |    
T  24427 ttgtgcattgattattgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtg 24526  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |    
T  24527 tgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatga 24626  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 897  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  24627 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttgga 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 14622 - 14302
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14622 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 14523  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  14522 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 14423  T
Q  810 aga------aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatt 903  Q
    | |      |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  14422 atatatatgaatataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaatt 14323  T
Q  904 tgttgttgtgtttattgatga 924  Q
     || ||||||| |||||||||    
T  14322 cgtggttgtgtctattgatga 14302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 5696 - 5839
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5696 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 5795  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  5796 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 10680 - 10991
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  10680 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaata 10779  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  10780 tttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 10879  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||     
T  10880 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggta 10979  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||||||||||    
T  10980 tttattgatgat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 79725 - 80036
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  79725 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 79824  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  79825 ttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 79924  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  79925 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagta 80024  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  80025 ttcattgatgat 80036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 2285 - 1971
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  2285 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgca 2186  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  2185 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 2086  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  2085 atgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggt 1986  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  1985 tgtgtttattgatga 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 615 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 29343 - 29033
Alignment:
Q  615 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| | | |    
T  29343 tgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggat 29244  T
Q  715 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 814  Q
     ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  29243 tttcagtaagattgacttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgag 29144  T
Q  815 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 914  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29143 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 29044  T
Q  915 ttattgatgat 925  Q
    |||||||||||    
T  29043 ttattgatgat 29033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 164; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 53461 - 53146
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53461 gaggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgca 53362  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53361 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 53262  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | | |||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  53261 acgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggt 53162  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| ||||||||||||    
T  53161 tgtatttattgatgat 53146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 5165 - 4851
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  5165 gaggttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgca 5066  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  | |    
T  5065 cgtgtgtttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttact 4966  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  4965 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagt 4866  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  4865 tgtgtttattgatga 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 613 - 925
Target Start/End: Original strand, 42000 - 42312
Alignment:
Q  613 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 712  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | || || || ||||||||||||||||||||||||       
T  42000 gttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcattt 42099  T
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    ||||||   ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||      
T  42100 gtgttctttaagattgacttaagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacg 42199  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    |||    ||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  42200 aatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgt 42299  T
Q  913 gtttattgatgat 925  Q
    |||||| ||||||    
T  42300 gtttatagatgat 42312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 110046 - 109732
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  110046 gaggttatgcattgattatcgtaagttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgca 109947  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  109946 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 109847  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  109846 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggt 109747  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  109746 tgtgtttattgatga 109732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 54891 - 55169
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  54891 attgattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 54990  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||| | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||  ||    
T  54991 gcaagattgatttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataa 55090  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| ||| |||||    
T  55091 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggat 55169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Original strand, 4983 - 5294
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    |    
T  4983 ttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtg 5082  T
Q  714 tgttca-acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  5083 tgttcagacaa-attgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatg 5181  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5182 agtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgt 5281  T
Q  913 gtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||    
T  5282 gtttattgatgat 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 25525 - 25214
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  25525 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaag 25426  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || |  || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  25425 tttttagtaaaattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacga 25326  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    || ||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||     
T  25325 atacaaagtgatgcctttcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggta 25226  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    ||||| ||||||    
T  25225 tttatagatgat 25214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 19768 - 19454
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||     
T  19768 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgct 19669  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19668 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 19569  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  19568 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggt 19469  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    | |||||||||||||    
T  19468 tatgtttattgatga 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 42112 - 41798
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  42112 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 42013  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  42012 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcact 41913  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  41912 atgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggt 41813  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  41812 tgtgtttattgatga 41798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 623 - 873
Target Start/End: Original strand, 51248 - 51498
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  51248 gattatcgttagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 51347  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  51348 agattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagt 51447  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  51448 catgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaa 51498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 55737 - 56051
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  55737 gaggttgtgcattgattaccgtcagttaaacaaagttatgataaagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgca 55836  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  55837 aagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcatt 55936  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  ||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  55937 acgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggt 56036  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  56037 tgtattcattgatga 56051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Original strand, 46937 - 47239
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||| |||||||||||   ||||| |  |    
T  46937 gattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagta 47036  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||  |||||    
T  47037 aaattgattggaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggt 47136  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47137 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgat 47236  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  47237 gat 47239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 613 - 925
Target Start/End: Original strand, 9354 - 9662
Alignment:
Q  613 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 712  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9354 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaag 9453  T
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    || ||     | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  9454 gttttttgttaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacg 9553  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||   ||||||||| |||||    
T  9554 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgt 9649  T
Q  913 gtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||    
T  9650 gtttattgatgat 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 613 - 925
Target Start/End: Original strand, 19568 - 19876
Alignment:
Q  613 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 712  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19568 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaag 19667  T
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    || ||     | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  19668 gttttttgttaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacg 19767  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||   ||||||||| |||||    
T  19768 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgt 19863  T
Q  913 gtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||    
T  19864 gtttattgatgat 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 16528 - 16214
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  16528 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 16429  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16428 tgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 16329  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16328 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 16229  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  16228 tgtgtttattgatga 16214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Original strand, 7773 - 7894
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  7773 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7872  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  7873 tgaggtcaggatatcatcagat 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 49520 - 49206
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | || ||||  || ||||||||||||||||||||     
T  49520 gaggttatgtattgattaccgttagttgaataaagtgacgataaagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgct 49421  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  49420 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 49321  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  49320 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 49221  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  49220 tgtgtttattgatga 49206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 49765 - 50079
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  49765 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgct 49864  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49865 cgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcatt 49964  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  49965 atgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 50064  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  50065 tgtgtttattgatga 50079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 48404 - 48718
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  48404 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacagtaaagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 48503  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  48504 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcatt 48603  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  48604 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 48703  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  48704 tgtattcattgatga 48718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 10890 - 10602
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10890 gaggttatgtattgattatcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 10791  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | || || || || ||||| || |    
T  10790 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcact 10691  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10690 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 17352 - 17064
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17352 gaggttatgtattgattatcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 17253  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || |    
T  17252 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcact 17153  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  17152 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 17064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 45557 - 45279
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||| ||||||| || || || |||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  45557 attgattatcgacaggtgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 45458  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  45457 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 45358  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  45357 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 45279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 51226 - 50912
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  51226 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaagaaagtgacgataaagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgct 51127  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51126 cttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 51027  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||    
T  51026 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggt 50927  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  50926 tgtgtttattgatga 50912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 610 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 4595 - 4280
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  4595 gaggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgca 4496  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4495 cctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 4396  T
Q  810 agaaat---ccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgt 906  Q
    |  |||     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4395 atgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgt 4296  T
Q  907 tgttgtgtttattgat 922  Q
     |||||||||||||||    
T  4295 ggttgtgtttattgat 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1689
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||||     
T  1375 gaggttatgcatttattatcgtcagttaaataaagtgacgataaagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgct 1474  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||  |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  1475 cgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacact 1574  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  1575 atgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 1674  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  1675 tgtgtttattgatga 1689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Original strand, 1442 - 1749
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  1442 tgcattgaatatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacagacatccgctcccgaggattgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttt 1541  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    |||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  1542 tcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1641  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||     
T  1642 taaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattc 1741  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  1742 attgatga 1749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 678 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10319
Alignment:
Q  678 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgca 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  778 gaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||| || ||||| || ||  |||| |||||  | |  ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 10319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 614 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 11240 - 10930
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   |    
T  11240 ttgtgtatagattaccttcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcg 11141  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |    
T  11140 tgttcaacaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatga 11041  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  11040 atataaagtgatgcctttcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtg 10941  T
Q  914 tttattgatga 924  Q
    |||||||||||    
T  10940 tttattgatga 10930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 636 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 12184 - 11894
Alignment:
Q  636 tgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt-ga 734  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||   ||||| |  || ||||| || ||    
T  12184 tgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttga 12085  T
Q  735 ggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcgg 834  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||||||| | |||||    
T  12084 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcgg 11985  T
Q  835 tgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11984 tgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 11894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 632 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16794
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | | ||| || ||| | ||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaa 16794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 114975 - 114661
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  114975 gaggttgtgtattgactaccatcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 114876  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    ||| | || |  || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  114875 aagatttttagtaaaattgacttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 114776  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  114775 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 114676  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  114675 tgtattcattgatga 114661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 610 - 871
Target Start/End: Original strand, 94784 - 95045
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  94784 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 94883  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  94884 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcact 94983  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatg 871  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  94984 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatg 95045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 632 - 898
Target Start/End: Original strand, 107723 - 107989
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||  || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggat 107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 64409 - 64712
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  || || ||||||||||||| |||     
T  64409 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgct 64508  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  64509 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcatt 64608  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| ||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  64609 acgaatataaggtgatgccgttcg-----------gcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 64697  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    |||||||||||||||    
T  64698 tgtgtttattgatga 64712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 140; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 617 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 21258 - 20951
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |    
T  21258 tgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagattt 21159  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | |  || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||     
T  21158 ttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaata 21059  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 916  Q
     |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||     
T  21058 taaggtgatgcttttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattc 20959  T
Q  917 attgatga 924  Q
    ||||||||    
T  20958 attgatga 20951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 830 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 25207 - 25113
Alignment:
Q  830 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  25207 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatga 25113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 477 - 791
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  477 gaggttgtgcattgactaccgtcaactgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgca 576  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  577 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 676  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||    
T  677 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggt 776  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| || ||||||||    
T  777 tgtattcattgatga 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 628 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 7140 - 6852
Alignment:
Q  628 ccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagatt 727  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||        |||| ||||||||||||    || |||   ||||||    
T  7140 ccgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatg--------gatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagatt 7049  T
Q  728 gacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgt 827  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||     
T  7048 gatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgc 6949  T
Q  828 cgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6948 ctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatga 6852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 677 - 903
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10057
Alignment:
Q  677 attgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgc 776  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  777 agaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccg 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtatatgaaccg 10030  T
Q  877 aattttccatgcttttctggataaatt 903  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10031 aatttttcatgcttttctggttaaatt 10057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 610 - 859
Target Start/End: Original strand, 18373 - 18622
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18373 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgca 18472  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18473 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcatt 18572  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttc 859  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18573 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccaggtgtgttc 18622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 610 - 711
Target Start/End: Original strand, 5739 - 5840
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5739 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgca 5838  T
Q  710 aa 711  Q
    ||    
T  5839 aa 5840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 610 - 924
Target Start/End: Original strand, 176234 - 176548
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||| ||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  176234 gaggttgtgtatagattactgtcacctgaataaagtggcgataaagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 176333  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | || |||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  176334 cgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattagattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacatt 176433  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||||||    
T  176434 acgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgt 176533  T
Q  910 tgtgtttattgatga 924  Q
    ||| |||||||||||    
T  176534 tgtatttattgatga 176548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 610 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 7637 - 7374
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7637 gaggttgtgtgttgactatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgct 7538  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||    
T  7537 aatgttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacatt 7438  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |  | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  7437 atgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaa 7374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 610 - 810
Target Start/End: Original strand, 114928 - 115128
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114928 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 115027  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  115028 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacatt 115127  T
Q  810 a 810  Q
    |    
T  115128 a 115128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 8436 - 8121
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8436 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 8337  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || |||||| |||    
T  8336 agtgttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagatt 8237  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  8236 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 8137  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| || |||||||||    
T  8136 tgttttcattgatgat 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 632 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24449
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24471  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    | || || || |||||||||||    
T  24470 taagatcaggatatcatcagat 24449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 217314 - 217573
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  217314 ttgtgtattgattatcgacaattgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 217413  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    ||||   ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  217414 tgttttgcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatga 217513  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  217514 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaa 217573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 5779 - 6057
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5779 gaggttatgtattgattatcgacaattgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 5878  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  5879 cgtgtgtttagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacatt 5978  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    || |||    ||||||| | ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  5979 aggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgc 6057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 610 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 11374 - 11188
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  11374 gaggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 11275  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 796  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11274 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 614 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 58427 - 58117
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  58427 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaag 58328  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  58327 tttttagcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 58228  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || ||||||    
T  58227 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtg 58128  T
Q  914 tttattgatga 924  Q
    ||||| |||||    
T  58127 tttatcgatga 58117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 614 - 782
Target Start/End: Original strand, 17960 - 18128
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17960 ttgtgtattgattaccatcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 18059  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaaga 782  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||    
T  18060 ttttcagcaagattgatttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaga 18128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 677 - 925
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195692
Alignment:
Q  677 attgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgc 776  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  777 agaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccg 876  Q
    |||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| || | ||| || |||||||||||||| ||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  877 aattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
     || |||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgat 195692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 610 - 899
Target Start/End: Original strand, 14369 - 14658
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  14369 gaggttatgcattgattatcgacacttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgca 14468  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  14469 cgtgtgttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacatt 14568  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggata 899  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  14569 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggata 14658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 24839 - 25123
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  24839 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 24938  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| ||  |    
T  24939 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatga 25038  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  25039 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 25123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 6981 - 7265
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |    
T  6981 ttgtgtattgattatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 7080  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||  |    
T  7081 tgtttagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatga 7180  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  7181 gtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggat 7265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 633 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 56148 - 55908
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  56148 agttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgattt 56049  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  | |  || |||||| | |||    
T  56048 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 55949  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  55948 ggtgttacaaatgcccctggagtgtttatggagtacatgaa 55908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 41044 - 40760
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41044 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 40945  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||  |    
T  40944 ttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatga 40845  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  40844 gtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 40760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 74764 - 74480
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  74764 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 74665  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||  |    
T  74664 ttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatga 74565  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  74564 gtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 74480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 764
Target Start/End: Original strand, 8716 - 8870
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||  | || || |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  8716 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 8815  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaagg 764  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  8816 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagataagggtaaagg 8870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 725 - 924
Target Start/End: Original strand, 6 - 205
Alignment:
Q  725 attgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtga 824  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||    
T  6 attgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtga 105  T
Q  825 tgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  106 tgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatga 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20650 - 20391
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    
T  20650 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtg 20551  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||||||  |    
T  20550 ttttcagcaagattgacttgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatga 20451  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  20450 gtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaa 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 10631 - 10909
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10631 gaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 10730  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10731 cgtgtattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 10830  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  10831 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgc 10909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 620 - 888
Target Start/End: Original strand, 24198 - 24466
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  24198 attgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttta 24297  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||||||||| |  ||||||||  |||| || || || || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| |||| || ||||        
T  24298 gcaagattgacttgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattc 24397  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
     |||||| | ||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24398 agtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 24466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 764 - 888
Target Start/End: Original strand, 16977 - 17101
Alignment:
Q  764 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatgg 863  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  16977 gatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 17076  T
Q  864 agtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||    
T  17077 agtacttgaatcgtatttttcatgc 17101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 620 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 9344 - 9039
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  9344 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 9245  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  9244 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 9145  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  9144 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 9045  T
Q  920 gatgat 925  Q
    ||||||    
T  9044 gatgat 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 632 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2700
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| |||||| || |    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||| || ||||||||||| ||  |||  || |||||| ||||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| || || | || || ||||| ||||||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 610 - 815
Target Start/End: Original strand, 22076 - 22281
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22076 gaggttgtgtatagattaccggaagttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 22175  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22176 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacatt 22275  T
Q  810 agaaat 815  Q
    | ||||    
T  22276 acaaat 22281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 617 - 898
Target Start/End: Original strand, 2402 - 2683
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||    
T  2402 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgt 2501  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 816  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  | |     
T  2502 ttagcaagattgatttgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagta 2601  T
Q  817 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || |||||| | |  |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  2602 taaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 632 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151353
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 151353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 713 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 87081 - 86870
Alignment:
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 812  Q
    |||||||  |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  87081 gtgttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattaca 86982  T
Q  813 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 912  Q
    |||    | ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||| | || ||  |||||||||| |    
T  86981 aatattcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttat 86882  T
Q  913 gtttattgatga 924  Q
    |||||| |||||    
T  86881 gtttatagatga 86870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 654 - 898
Target Start/End: Original strand, 1 - 245
Alignment:
Q  654 agaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  754 aaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgga 853  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||||||  | |  || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  854 gtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 669 - 957
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  669 gaggttgtgtattgattaccgacagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaa 768  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||||||||    
T  769 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacatt 868  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  869 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 3315 - 3035
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3315 gaggttatgtattgattatcggcagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgca 3216  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  3215 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacatt 3116  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 890  Q
    | ||||     |||||| | ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||    
T  3115 acaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 3035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 7553 - 7837
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7553 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatg 7652  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | |||||||||||  |    
T  7653 ttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatga 7752  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  7753 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 7837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 37710 - 37998
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37710 gaggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 37809  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
     | || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  37810 catgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcact 37909  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||| |||||    
T  37910 atgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggat 37998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 23121 - 22843
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23121 gaggttgtgtatagattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaa 23022  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
        |||| | ||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021 tgtctgtttagcaagattgatttgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 22922  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||    ||||||| | |||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22921 acgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 22843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 614 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 16570 - 16263
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16570 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 16471  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || | ||| || ||  |    
T  16470 ttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatga 16371  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
    ||  || || ||| | ||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||    
T  16370 atataaagttatgcctttccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtg 16271  T
Q  914 tttattga 921  Q
    ||||||||    
T  16270 tttattga 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 2828 - 2549
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |   || || |    
T  2828 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgttttta 2729  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  2728 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 2629  T
Q  820 ggtgatgtcgtt-cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  2628 agttatgcctttccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 2549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 610 - 888
Target Start/End: Original strand, 8924 - 9202
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8924 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 9023  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9024 cgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacatt 9123  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  9124 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1448 - 1324
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1448 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 1349  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttga 734  Q
       ||||| | ||||||||| ||||    
T  1348 cgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 6752 - 6628
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6752 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 6653  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttga 734  Q
       ||||| | ||||||||| ||||    
T  6652 cgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 610 - 810
Target Start/End: Original strand, 15868 - 16068
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15868 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 15967  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  15968 catgtgttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacatt 16067  T
Q  810 a 810  Q
    |    
T  16068 a 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14596
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14884 gaggttatgcattgattaccgtcaagtgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtaca 14785  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||| ||  | ||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  14784 cgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacatt 14685  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || |||||| | |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  14684 atgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggat 14596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 633 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 6024
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||  |||  || |||||||| |||    
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaa 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 633 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 13154
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||  |||  || |||||||| |||    
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaa 13154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11417
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11133 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 11232  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  11233 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatga 11332  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  11333 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 11417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 623 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 36751 - 36449
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  36751 gattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 36652  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  36651 agattaatttgagattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagt 36552  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
     ||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| |||||||||    
T  36551 tatgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgat 36452  T
Q  923 gat 925  Q
    |||    
T  36451 gat 36449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 54047 - 53788
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54047 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 53948  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||| ||||| |  ||  |    
T  53947 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatga 53848  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  53847 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 53788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 623 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 31285 - 31010
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  31285 gattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 31186  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 822  Q
    ||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  31185 agattaatttgagattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagt 31086  T
Q  823 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     ||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  31085 tatgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 614 - 711
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13885
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 711  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13788 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaa 13885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 3848 - 3533
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3848 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 3749  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||||||||    
T  3748 agtgttttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacatt 3649  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  | |  || || ||| | ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  3648 atgagtataaagttatgcctttcggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 3549  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||| || |||||||||    
T  3548 tgttttcattgatgat 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 9772 - 9494
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   || ||||    
T  9772 attgattaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttca 9673  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  9672 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 9573  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  9572 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 9494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 770 - 922
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12501
Alignment:
Q  770 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 869  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  870 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 922  Q
     ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgat 12501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 820 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 44989 - 44885
Alignment:
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44989 ggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttatt 44890  T
Q  920 gatga 924  Q
    |||||    
T  44889 gatga 44885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 610 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 1413 - 1098
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1413 gaggttttgtatagattatcggcagttgaacaaagtgacaataaattacaggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgca 1314  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       |||||||  |||||||| || || || ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  1313 cgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacatt 1214  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    | ||||    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  1213 acaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgt 1114  T
Q  910 tgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||||| ||||||    
T  1113 tgtgtttatagatgat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 617 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 96
Alignment:
Q  617 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 716  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |    
T  289 tgcattgattattgtcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttt 190  T
Q  717 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 810  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  189 tcaacaagatagatttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacatta 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 633 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3709
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||  |||  || |||||| | |||    
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggat 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 610 - 898
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15399
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15111 gaggttatgcattgattatcgacggttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 15210  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
       ||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||    
T  15211 cgtgtgtttagcaagattgctttgagatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacatt 15310  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |  |||  || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  15311 atgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 15399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 18054 - 17777
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   || ||||    
T  18054 attgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttca 17956  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||  | |  ||    
T  17955 gcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataa 17856  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  17855 ggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 17777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 785 - 925
Target Start/End: Original strand, 16214 - 16354
Alignment:
Q  785 gcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttcc 884  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16214 gcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcctagagtatatgaaccgaattttcc 16313  T
Q  885 atgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16314 atgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgat 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Original strand, 14018 - 14302
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14018 ttgtgtattgactatcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 14117  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || ||||| || ||  |    
T  14118 ttttcagcaagattgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatga 14217  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  14218 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 14302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 620 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40255
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  40559 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 40460  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  40459 gcaagattgatttgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 40360  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 919  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || |||||||||||     
T  40359 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatc 40260  T
Q  920 gatga 924  Q
    |||||    
T  40259 gatga 40255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 633 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 894
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |  ||||||||| |||||    
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 785 - 925
Target Start/End: Original strand, 8873 - 9013
Alignment:
Q  785 gcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttcc 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  8873 gcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttcc 8972  T
Q  885 atgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8973 atgcttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgat 9013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 610 - 790
Target Start/End: Original strand, 4779 - 4959
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4779 gaggttgtgcatagattaccgtcaactgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 4878  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttt 790  Q
       || |||| ||| ||| | |||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4879 cgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctgattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagccttt 4959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 620 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 17282 - 17015
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |    
T  17282 attgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgttta 17183  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
      |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||        
T  17182 gtaagattaatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattc 17083  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 888  Q
     |||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  17082 agtgat-cctttcggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 17015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 614 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 213
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  471 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 372  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||  |    
T  371 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatga 272  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 872  Q
     | |||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  271 gtacaaggttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatga 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 620 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 21651 - 21353
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  21651 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 21552  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||  || ||||||||||| || || || || || |||||  | ||  |||  ||    
T  21551 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataa 21452  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  21451 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 21353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 85124 - 85383
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  85124 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaag 85223  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |    
T  85224 ttttcagcaagatagatttgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatga 85323  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  85324 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 85383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 633 - 898
Target Start/End: Original strand, 85709 - 85974
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||  |||||||| ||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 832  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||     
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 85974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 132379 - 132522
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  132379 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 132478  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  132479 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 132522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 26183 - 26044
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||  | || ||||||    
T  26183 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatgtatcatcttgttggtgca 26084  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatc 749  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||    
T  26083 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatc 26044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 620 - 898
Target Start/End: Original strand, 29815 - 30093
Alignment:
Q  620 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 719  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  29815 attgactatcgttagttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttca 29914  T
Q  720 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 819  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||| ||||||| || || |  || |||||||| || ||  |||  ||    
T  29915 gcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataa 30014  T
Q  820 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  30015 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 30093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 610 - 912
Target Start/End: Original strand, 703 - 1001
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  703 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 802  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 809  Q
    |  || |||| |||||| || |||||     |    ||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |    
T  803 agtgttttcagcaagatagatttgagaaagtg----cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcact 898  T
Q  810 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 909  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||    
T  899 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggt 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 632 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8202
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaa 8202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 632 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17398
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 731  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  732 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 831  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  832 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaa 17398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 551
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |    
T  862 ttgtgtattgactatcgacagctgaataaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtg 763  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||  |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||| |  |  |||||||||||  |    
T  762 ttttccgcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatga 663  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     |  ||||| ||| | ||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||||| | || || |||||     
T  662 gtataaggtaatgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtt 563  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    |||||| |||||    
T  562 tttatttatgat 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 21014 - 20703
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  21014 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaag 20915  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  20914 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 20815  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     | ||| |  ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||| ||| |||||  |||||| |||||     
T  20814 gtacaaagatatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgtt 20715  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  20714 ttcattgatgat 20703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 36438 - 36127
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  36438 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaag 36339  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  36338 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 36239  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 913  Q
     |  || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||| ||| |||||  |||||| |||||     
T  36238 gtataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgtt 36139  T
Q  914 tttattgatgat 925  Q
    || |||||||||    
T  36138 ttcattgatgat 36127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 103637 - 103361
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||| ||||||||||||   |    
T  103637 ttgtgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaa--------ttgatggatcaattagtgggtgcacgtg 103546  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| || || |||||||| ||  |    
T  103545 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatga 103446  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 898  Q
     |  || |||||| | ||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  103445 gtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 103361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 653 - 783
Target Start/End: Original strand, 8675 - 8805
Alignment:
Q  653 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 752  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8675 aagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaga 8774  T
Q  753 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8775 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 8805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 610 - 783
Target Start/End: Original strand, 15884 - 16058
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15884 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15983  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga-taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||   || ||||| ||||||||||||||    
T  15984 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagac 16058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8783 - 8615
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8783 ttgtgtattgactatcgacagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 8684  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  8683 t-ttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 614 - 783
Target Start/End: Original strand, 13105 - 13274
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13105 ttgtgtattgattatccgcagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 13204  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    | ||||  |  || || ||||| || |||||||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13205 ttttcagaagaatagatttgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 610 - 738
Target Start/End: Original strand, 9844 - 9972
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  9844 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgct 9943  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtc 738  Q
       ||||| |  |||||||||||||||||    
T  9944 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtc 9972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 610 - 738
Target Start/End: Original strand, 17511 - 17639
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  17511 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgct 17610  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtc 738  Q
       ||||| |  |||||||||||||||||    
T  17611 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtc 17639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 830 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 1520 - 1425
Alignment:
Q  830 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  1520 ttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgat 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 614 - 873
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1535
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 713  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  1276 ttgtgtattgactatcgacagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaag 1375  T
Q  714 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 813  Q
    | |||| |||||| |  ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| |||||  |    
T  1376 ttttcagcaagatagctttgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatga 1475  T
Q  814 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 873  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  1476 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 841 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 1179 - 1096
Alignment:
Q  841 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1179 taatgtgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 924
Target Start/End: Original strand, 378 - 444
Alignment:
Q  858 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  378 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 924
Target Start/End: Original strand, 4698 - 4764
Alignment:
Q  858 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4698 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 4764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 924
Target Start/End: Original strand, 414 - 480
Alignment:
Q  858 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 924  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  414 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 821 - 925
Target Start/End: Original strand, 14814 - 14918
Alignment:
Q  821 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattg 920  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14814 gtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattg 14913  T
Q  921 atgat 925  Q
    |||||    
T  14914 atgat 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25810 - 25667
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25810 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 25711  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  25710 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 25667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 15324 - 15181
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15324 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 15225  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  15224 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11207
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | || ||| ||    
T  11064 gaggttgtgtgtggattatcggcacttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggttca 11163  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     |||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  11164 gaggtgttcagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 614 - 747
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11186
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaa-gttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 712  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  11052 ttgtgtatcgattaacatcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacat 11151  T
Q  713 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatca 747  Q
    || |||| |||||| || ||||| || ||||||||    
T  11152 gttttcagcaagatagatttgagatcaggttatca 11186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1917
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagat 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 1511 - 1654
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1511 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgca 1610  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| |||| ||  || |||||||||||    
T  1611 gaggtgtttagtaagattgatttgaagttaggatatcatcagat 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Original strand, 13528 - 13658
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |    
T  13528 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagta 13627  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13628 agattgaattgagatcaggatatcatcagat 13658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 771 - 888
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2017
Alignment:
Q  771 atatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  871 gaaccgaattttccatgc 888  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgc 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 614 - 699
Target Start/End: Original strand, 12250 - 12335
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagtt 699  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12250 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 860 - 925
Target Start/End: Original strand, 8923 - 8988
Alignment:
Q  860 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8923 atggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgat 8988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 7569 - 7426
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| | || ||||||    
T  7569 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgca 7470  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7469 taggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 627 - 484
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| | | || ||||||    
T  627 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgca 528  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  527 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcaccagat 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 34501 - 34358
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  34501 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgca 34402  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  34401 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 34358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 614 - 697
Target Start/End: Original strand, 41399 - 41482
Alignment:
Q  614 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 697  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41399 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 610 - 679
Target Start/End: Original strand, 4060 - 4129
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaatt 679  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  4060 gaggttgtgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaatt 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 750
Target Start/End: Original strand, 1865 - 1982
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| ||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 1964  T
Q  733 gaggtctggttatcatca 750  Q
    ||| || || ||||||||    
T  1965 gagatcgggatatcatca 1982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 26730 - 26600
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || ||||||||||  || || ||||||||| ||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||  ||||  || | |||| ||    
T  26730 gattatcggcagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagttagtgcggagatattcagca 26631  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  26630 agattgatttaaggtcaggatatcttcagat 26600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 633 - 753
Target Start/End: Original strand, 859 - 979
Alignment:
Q  633 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 732  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| ||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 958  T
Q  733 gaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  959 gagatcgggatatcatcagat 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 16474 - 16334
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  16474 gaggttgtgtgtggattatcgttagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 16375  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 750  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  16374 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 16334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 7160 - 7017
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  7160 gaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 7061  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7060 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 783
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28545
Alignment:
Q  689 atggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 783  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  28451 atggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 833 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 4387 - 4295
Alignment:
Q  833 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4387 ggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgat 4295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 666
Target Start/End: Original strand, 2817 - 2873
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatcc 666  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  2817 gaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Original strand, 693 - 836
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  693 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcg 792  T
Q  710 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
     |  |||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  793 gaaatgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 401
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 709  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||   |||||||| |||||||||||  | || ||||||    
T  508 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatcaactggttggtgca 409  T
Q  710 aaggtgtt 717  Q
     |||||||    
T  408 gaggtgtt 401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 623 - 753
Target Start/End: Original strand, 7143 - 7273
Alignment:
Q  623 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 722  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  7143 gattatcggcagttgaacaaagtgacaattaagaatcggtatccgcttccaaggatttatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 7242  T
Q  723 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 753  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||    
T  7243 agattgatttaagatcaggatatcatcagat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 918
Target Start/End: Original strand, 23095 - 23272
Alignment:
Q  741 gttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttac 840  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| || ||| | |||||||||||    
T  23095 gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 23194  T
Q  841 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 918  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || |||||||||||    
T  23195 caatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttat 23272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 632 - 699
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  632 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagtt 699  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 634 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 89892 - 89773
Alignment:
Q  634 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttg 733  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || |||||  | ||||| |  |||||||| |||    
T  89892 gttgaataaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttcatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatttg 89793  T
Q  734 aggtctggttatcatcagat 753  Q
    || || || |||||||||||    
T  89792 agatcaggatatcatcagat 89773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 839 - 925
Target Start/End: Original strand, 1808 - 1894
Alignment:
Q  839 actaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 925  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1808 actaatgcaccaggagtgttcatggagcacatgaatagaattttccatccctacctagataaatttgtggttgtctttatagatgat 1894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 36353 - 36292
Alignment:
Q  610 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttc 671  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  36353 gaggttatgcattgattattgtcaattgaataaggttacgataaacaacaggtatccacttc 36292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University