View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2042_low_2 (Length: 670)

Name: NF2042_low_2
Description: NF2042
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2042_low_2
NF2042_low_2
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (347-661)||(250722-251036)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (354-662)||(31414806-31415114)
chr8 (354-662)||(23657063-23657371)
chr8 (351-662)||(27356672-27356983)
chr8 (347-661)||(21323609-21323923)
chr8 (347-662)||(22052999-22053314)
chr8 (352-662)||(16269559-16269869)
chr8 (360-662)||(20008264-20008566)
chr8 (347-662)||(31569173-31569487)
chr8 (360-662)||(28983047-28983349)
chr8 (360-662)||(28988266-28988568)
chr8 (347-661)||(21927565-21927879)
chr8 (360-662)||(4984178-4984480)
chr8 (347-585)||(22061009-22061247)
chr8 (459-662)||(6605794-6605997)
chr8 (399-662)||(19861571-19861834)
chr8 (347-589)||(19984389-19984631)
chr8 (347-589)||(20390295-20390537)
chr8 (351-661)||(29301760-29302070)
chr8 (354-625)||(22522719-22522990)
chr8 (347-662)||(32602281-32602596)
chr8 (357-655)||(20016603-20016901)
chr8 (351-635)||(22422226-22422510)
chr8 (347-627)||(23887199-23887479)
chr8 (351-658)||(30311478-30311785)
chr8 (347-619)||(22246763-22247035)
chr8 (357-655)||(18858720-18859018)
chr8 (351-652)||(22375787-22376088)
chr8 (494-662)||(14567278-14567446)
chr8 (349-655)||(17672355-17672661)
chr8 (360-635)||(19980130-19980405)
chr8 (347-610)||(21164868-21165131)
chr8 (367-662)||(22131391-22131686)
chr8 (357-655)||(22118515-22118813)
chr8 (357-655)||(22127299-22127597)
chr8 (351-635)||(15535546-15535830)
chr8 (351-635)||(22041990-22042274)
chr8 (354-517)||(22989326-22989489)
chr8 (369-635)||(21253107-21253373)
chr8 (351-520)||(21392195-21392364)
chr8 (351-520)||(21781521-21781690)
chr8 (351-520)||(21782754-21782923)
chr8 (351-520)||(21786689-21786858)
chr8 (360-547)||(20394476-20394663)
chr8 (347-498)||(22373168-22373319)
chr8 (349-652)||(19482404-19482699)
chr8 (371-635)||(23652204-23652468)
chr8 (555-662)||(22373067-22373174)
chr8 (370-610)||(19864446-19864686)
chr8 (458-610)||(21920189-21920341)
chr8 (347-490)||(16875425-16875568)
chr8 (360-487)||(16414402-16414529)
chr8 (360-490)||(21848680-21848810)
chr8 (347-487)||(20650685-20650825)
chr8 (351-431)||(22030470-22030550)
chr8 (369-490)||(23155394-23155515)
chr8 (347-487)||(21194870-21195010)
chr8 (369-485)||(24932176-24932292)
chr8 (347-487)||(22436614-22436754)
chr8 (582-623)||(19869868-19869909)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (351-662)||(16948350-16948661)
chr7 (347-662)||(13023417-13023732)
chr7 (354-661)||(13675513-13675820)
chr7 (347-661)||(15100477-15100791)
chr7 (352-662)||(12458700-12459010)
chr7 (360-662)||(26092685-26092987)
chr7 (351-662)||(49154361-49154672)
chr7 (347-662)||(12204674-12204989)
chr7 (360-662)||(11301100-11301402)
chr7 (347-661)||(18051827-18052141)
chr7 (347-662)||(14139739-14140054)
chr7 (347-658)||(15342495-15342806)
chr7 (347-662)||(23503744-23504059)
chr7 (347-661)||(14262119-14262433)
chr7 (347-662)||(16070171-16070484)
chr7 (351-662)||(11386307-11386618)
chr7 (352-662)||(13966547-13966857)
chr7 (347-661)||(19614736-19615050)
chr7 (364-658)||(26116481-26116775)
chr7 (360-661)||(14284263-14284564)
chr7 (390-661)||(20748671-20748940)
chr7 (390-661)||(19149272-19149541)
chr7 (347-625)||(15146780-15147058)
chr7 (357-655)||(11235119-11235417)
chr7 (357-655)||(14334462-14334760)
chr7 (357-635)||(15256-15534)
chr7 (357-655)||(15158963-15159261)
chr7 (347-635)||(11550998-11551286)
chr7 (351-635)||(14041781-14042065)
chr7 (351-635)||(14351811-14352095)
chr7 (349-635)||(10872776-10873062)
chr7 (347-635)||(12689588-12689876)
chr7 (347-627)||(48813148-48813428)
chr7 (347-662)||(14956613-14956928)
chr7 (357-635)||(8709691-8709969)
chr7 (357-655)||(13688107-13688405)
chr7 (357-635)||(18179831-18180109)
chr7 (347-610)||(9590479-9590742)
chr7 (349-635)||(44789249-44789535)
chr7 (347-627)||(15626619-15626899)
chr7 (357-655)||(18588077-18588375)
chr7 (347-445)||(11770298-11770396)
chr7 (347-490)||(7826131-7826274)
chr7 (347-490)||(27105670-27105813)
chr7 (347-490)||(27172512-27172655)
chr7 (351-428)||(16727283-16727360)
chr7 (351-428)||(17704355-17704432)
chr7 (347-490)||(4442159-4442302)
chr7 (347-490)||(13379114-13379257)
chr7 (351-392)||(21754742-21754783)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (347-662)||(10466881-10467196)
chr6 (347-661)||(19436937-19437251)
chr6 (347-662)||(14377948-14378263)
chr6 (347-662)||(14379498-14379813)
chr6 (347-662)||(25769778-25770093)
chr6 (351-662)||(24366346-24366657)
chr6 (347-661)||(19454959-19455272)
chr6 (351-662)||(21568027-21568338)
chr6 (347-662)||(21473535-21473849)
chr6 (355-661)||(28280853-28281159)
chr6 (347-661)||(19881233-19881546)
chr6 (354-659)||(18796627-18796932)
chr6 (347-662)||(15461270-15461585)
chr6 (347-661)||(34643618-34643932)
chr6 (355-580)||(24516448-24516673)
chr6 (37-165)||(16529949-16530077)
chr6 (349-625)||(27189407-27189683)
chr6 (349-625)||(27259557-27259833)
chr6 (351-610)||(18183403-18183662)
chr6 (347-625)||(23085803-23086081)
chr6 (349-635)||(28261231-28261517)
chr6 (349-635)||(28284399-28284685)
chr6 (349-635)||(28339980-28340266)
chr6 (360-635)||(5837264-5837539)
chr6 (347-662)||(18405976-18406291)
chr6 (351-662)||(20633976-20634287)
chr6 (347-610)||(18963120-18963383)
chr6 (357-635)||(2872845-2873123)
chr6 (348-662)||(25607894-25608208)
chr6 (351-635)||(16961518-16961802)
chr6 (360-662)||(19866621-19866923)
chr6 (347-635)||(22828387-22828675)
chr6 (348-528)||(30679040-30679220)
chr6 (357-635)||(25114513-25114791)
chr6 (347-503)||(8761784-8761940)
chr6 (357-635)||(16925681-16925958)
chr6 (357-655)||(24293824-24294122)
chr6 (347-635)||(22760487-22760775)
chr6 (378-661)||(25763291-25763574)
chr6 (351-518)||(27563869-27564036)
chr6 (369-607)||(16573879-16574117)
chr6 (369-607)||(16621263-16621501)
chr6 (360-520)||(22435945-22436105)
chr6 (360-520)||(21755009-21755168)
chr6 (153-313)||(4129084-4129246)
chr6 (347-490)||(16648001-16648144)
chr6 (351-446)||(23080573-23080668)
chr6 (347-490)||(23998354-23998497)
chr6 (265-346)||(16529869-16529952)
chr6 (347-490)||(16380405-16380548)
chr6 (209-313)||(4101226-4101334)
chr6 (209-313)||(4126589-4126697)
chr6 (397-662)||(18450437-18450702)
chr6 (507-631)||(23080434-23080558)
chr6 (347-490)||(1646846-1646989)
chr6 (519-610)||(19487486-19487577)
chr6 (80-130)||(4128852-4128902)
chr6 (360-490)||(14130575-14130705)
chr6 (360-490)||(16100121-16100251)
chr6 (360-490)||(23025791-23025921)
chr6 (146-195)||(4100462-4100508)
chr6 (146-195)||(4125793-4125839)
chr6 (349-407)||(28311819-28311877)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (347-662)||(31209-31524)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (351-661)||(24097566-24097876)
chr1 (352-662)||(21952994-21953304)
chr1 (347-662)||(20833859-20834174)
chr1 (347-661)||(20938022-20938336)
chr1 (347-661)||(19661095-19661409)
chr1 (360-662)||(48424989-48425291)
chr1 (360-662)||(52987857-52988159)
chr1 (347-662)||(20854719-20855034)
chr1 (352-662)||(20296497-20296807)
chr1 (360-662)||(38910798-38911100)
chr1 (347-659)||(21743511-21743823)
chr1 (360-662)||(37679165-37679467)
chr1 (347-657)||(19856395-19856705)
chr1 (360-662)||(31537969-31538271)
chr1 (351-661)||(16378181-16378491)
chr1 (351-632)||(41310672-41310953)
chr1 (354-635)||(20140195-20140476)
chr1 (370-610)||(50618380-50618620)
chr1 (351-662)||(17042978-17043289)
chr1 (357-662)||(21839035-21839340)
chr1 (349-655)||(33388990-33389296)
chr1 (349-635)||(16348556-16348843)
chr1 (347-662)||(19108453-19108768)
chr1 (351-610)||(22360207-22360466)
chr1 (349-655)||(51331454-51331760)
chr1 (351-635)||(21233694-21233978)
chr1 (347-635)||(21751052-21751340)
chr1 (351-635)||(22503252-22503536)
chr1 (351-634)||(21862336-21862619)
chr1 (357-655)||(21832394-21832692)
chr1 (390-662)||(24792618-24792890)
chr1 (351-609)||(430079-430337)
chr1 (349-652)||(41351629-41351926)
chr1 (347-490)||(20829351-20829494)
chr1 (347-490)||(35930784-35930927)
chr1 (347-486)||(20527314-20527453)
chr1 (347-490)||(20927311-20927454)
chr1 (350-410)||(21739998-21740058)
chr1 (347-490)||(41215815-41215958)
chr1 (567-635)||(20944142-20944210)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (347-662)||(19717444-19717759)
chr2 (357-662)||(19650487-19650792)
chr2 (347-661)||(23278478-23278792)
chr2 (347-653)||(25255629-25255935)
chr2 (360-662)||(31832359-31832661)
chr2 (347-662)||(27789441-27789756)
chr2 (360-662)||(1065452-1065754)
chr2 (347-661)||(12576055-12576369)
chr2 (351-662)||(23098449-23098760)
chr2 (347-662)||(23112437-23112755)
chr2 (459-662)||(24950291-24950494)
chr2 (347-635)||(24677217-24677505)
chr2 (357-655)||(24264078-24264376)
chr2 (357-655)||(24711742-24712040)
chr2 (347-625)||(24818657-24818935)
chr2 (347-634)||(23073592-23073879)
chr2 (357-635)||(24875187-24875465)
chr2 (351-662)||(23106159-23106470)
chr2 (349-655)||(10870558-10870864)
chr2 (349-655)||(27219724-27220030)
chr2 (357-655)||(41606822-41607120)
chr2 (347-662)||(30209344-30209659)
chr2 (349-655)||(9337290-9337596)
chr2 (349-635)||(16927088-16927374)
chr2 (349-635)||(17000728-17001014)
chr2 (349-635)||(9485944-9486230)
chr2 (357-635)||(21143478-21143756)
chr2 (357-655)||(27372977-27373275)
chr2 (349-635)||(44383999-44384285)
chr2 (369-635)||(21323715-21323981)
chr2 (548-662)||(27208800-27208914)
chr2 (402-635)||(23189646-23189879)
chr2 (351-610)||(22734205-22734464)
chr2 (369-662)||(30010633-30010926)
chr2 (351-610)||(24705913-24706172)
chr2 (593-661)||(23295637-23295705)
chr2 (347-490)||(22279978-22280121)
chr2 (347-490)||(24829615-24829758)
chr2 (402-466)||(23611070-23611134)
chr2 (347-487)||(24568095-24568235)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (354-662)||(24315-24623)
scaffold0104 (347-661)||(44307-44621)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (347-662)||(11959284-11959599)
chr3 (347-661)||(12358642-12358956)
chr3 (347-661)||(31693300-31693614)
chr3 (347-661)||(31940603-31940917)
chr3 (347-662)||(11950023-11950338)
chr3 (347-658)||(18132461-18132772)
chr3 (360-662)||(47125643-47125945)
chr3 (352-662)||(12510603-12510913)
chr3 (347-661)||(44778947-44779261)
chr3 (347-662)||(13943723-13944038)
chr3 (347-662)||(41179221-41179536)
chr3 (347-661)||(16834630-16834939)
chr3 (351-662)||(13318621-13318932)
chr3 (354-661)||(17188074-17188381)
chr3 (360-662)||(28756017-28756319)
chr3 (347-662)||(10418160-10418475)
chr3 (347-661)||(14088373-14088687)
chr3 (347-661)||(12180038-12180358)
chr3 (347-662)||(16379043-16379358)
chr3 (352-662)||(16327780-16328090)
chr3 (347-662)||(15229302-15229617)
chr3 (347-662)||(15235170-15235485)
chr3 (350-661)||(16826399-16826705)
chr3 (354-589)||(24189076-24189311)
chr3 (347-661)||(13970235-13970549)
chr3 (360-609)||(10407720-10407969)
chr3 (347-620)||(8745505-8745776)
chr3 (453-661)||(12269910-12270118)
chr3 (349-658)||(16754829-16755138)
chr3 (347-595)||(14291647-14291895)
chr3 (349-655)||(15587520-15587826)
chr3 (351-635)||(15261346-15261630)
chr3 (347-662)||(15013882-15014197)
chr3 (349-635)||(53383146-53383432)
chr3 (351-655)||(16805077-16805381)
chr3 (347-590)||(14579534-14579777)
chr3 (349-655)||(15346373-15346679)
chr3 (349-655)||(20060182-20060488)
chr3 (357-662)||(15400653-15400958)
chr3 (347-547)||(11888480-11888680)
chr3 (349-635)||(5423058-5423344)
chr3 (349-635)||(6602452-6602738)
chr3 (349-635)||(10007316-10007602)
chr3 (349-635)||(10907926-10908212)
chr3 (349-635)||(12888425-12888711)
chr3 (351-635)||(16693880-16694164)
chr3 (349-635)||(3687659-3687945)
chr3 (357-635)||(5108747-5109025)
chr3 (349-635)||(48427163-48427449)
chr3 (357-520)||(15357914-15358077)
chr3 (349-655)||(13254386-13254692)
chr3 (349-635)||(16637489-16637775)
chr3 (351-610)||(17491591-17491850)
chr3 (347-490)||(24185051-24185194)
chr3 (398-662)||(14874676-14874940)
chr3 (347-445)||(12272254-12272352)
chr3 (357-446)||(15714192-15714281)
chr3 (349-446)||(43164580-43164677)
chr3 (458-662)||(15723171-15723375)
chr3 (351-447)||(18437044-18437140)
chr3 (347-490)||(30139677-30139820)
chr3 (347-490)||(30149228-30149371)
chr3 (370-490)||(8272548-8272668)
chr3 (347-490)||(13965478-13965621)
chr3 (347-490)||(15611974-15612117)
chr3 (347-490)||(15948596-15948739)
chr3 (347-407)||(12844229-12844289)
chr3 (347-490)||(6150979-6151122)
chr3 (360-490)||(17200505-17200635)
chr3 (82-147)||(32510104-32510169)
chr3 (570-662)||(15340958-15341050)
chr3 (349-421)||(26791541-26791613)
chr3 (146-242)||(34376222-34376315)
chr3 (360-490)||(25768189-25768319)
chr3 (601-662)||(10385370-10385431)
chr3 (90-135)||(34376360-34376405)
chr3 (193-279)||(32510208-32510288)
chr3 (570-635)||(12499964-12500029)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (347-661)||(2843-3157)
scaffold0034 (351-662)||(69471-69782)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (347-658)||(16149785-16150096)
chr4 (347-658)||(16153931-16154242)
chr4 (354-661)||(15357014-15357321)
chr4 (352-662)||(11205124-11205434)
chr4 (360-662)||(3262694-3262996)
chr4 (347-662)||(15257998-15258312)
chr4 (360-662)||(29451437-29451739)
chr4 (347-661)||(15001252-15001566)
chr4 (347-662)||(51604679-51604994)
chr4 (347-662)||(1647164-1647479)
chr4 (351-659)||(27902459-27902767)
chr4 (347-662)||(15072429-15072744)
chr4 (360-658)||(44659766-44660064)
chr4 (352-662)||(14161540-14161850)
chr4 (354-635)||(16218327-16218608)
chr4 (354-635)||(16221647-16221928)
chr4 (347-661)||(8707982-8708292)
chr4 (357-655)||(8051260-8051558)
chr4 (357-662)||(14301616-14301921)
chr4 (351-658)||(18225077-18225384)
chr4 (347-655)||(27713413-27713721)
chr4 (349-635)||(8388509-8388795)
chr4 (349-635)||(12478697-12478983)
chr4 (349-635)||(16234621-16234907)
chr4 (349-635)||(19776422-19776708)
chr4 (347-635)||(14682664-14682952)
chr4 (347-635)||(14848993-14849281)
chr4 (349-655)||(17092778-17093084)
chr4 (357-655)||(23957824-23958122)
chr4 (357-662)||(40475110-40475415)
chr4 (347-611)||(14696234-14696498)
chr4 (370-547)||(23443290-23443467)
chr4 (351-520)||(22631916-22632085)
chr4 (351-472)||(16251481-16251602)
chr4 (567-662)||(15323287-15323382)
chr4 (360-662)||(15145533-15145827)
chr4 (369-490)||(15291067-15291188)
chr4 (458-635)||(16353245-16353422)
chr4 (108-169)||(56338866-56338929)
chr4 (347-434)||(16353157-16353244)
chr4 (594-661)||(15422374-15422441)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (347-661)||(99452-99766)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (347-662)||(11222-11537)
scaffold0074 (347-658)||(5217-5527)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (347-661)||(9163-9477)
scaffold0222 (352-662)||(1384-1694)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (352-662)||(515248-515558)
scaffold0001 (347-661)||(453103-453417)
scaffold0001 (354-652)||(495129-495427)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (361-661)||(759-1058)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (347-658)||(45317-45628)
scaffold0010 (360-662)||(40236-40538)
scaffold0010 (351-635)||(4042-4326)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (347-661)||(328-642)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (347-661)||(37750-38064)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (347-662)||(2162-2477)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (347-662)||(29175-29490)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (348-661)||(747-1058)
scaffold0420 (348-563)||(7814-8027)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (347-661)||(9948-10261)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (347-661)||(324806-325120)
scaffold0004 (347-662)||(201358-201673)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (352-662)||(22504663-22504973)
chr5 (354-662)||(20344266-20344574)
chr5 (354-662)||(24796473-24796781)
chr5 (347-662)||(28893011-28893326)
chr5 (347-662)||(28921837-28922152)
chr5 (354-662)||(14885067-14885375)
chr5 (347-662)||(17267403-17267718)
chr5 (347-662)||(20777897-20778212)
chr5 (347-662)||(22463935-22464250)
chr5 (347-662)||(20823437-20823752)
chr5 (351-662)||(25850059-25850370)
chr5 (360-662)||(37541463-37541765)
chr5 (364-661)||(22234006-22234303)
chr5 (347-625)||(21562094-21562371)
chr5 (354-635)||(23473256-23473537)
chr5 (351-625)||(26736800-26737074)
chr5 (349-655)||(27520415-27520721)
chr5 (351-636)||(21337367-21337652)
chr5 (357-655)||(22136677-22136975)
chr5 (357-655)||(37289575-37289873)
chr5 (357-655)||(14997818-14998116)
chr5 (357-662)||(29474152-29474457)
chr5 (507-662)||(28914642-28914797)
chr5 (507-662)||(28929910-28930065)
chr5 (357-655)||(22330966-22331264)
chr5 (357-635)||(22349948-22350226)
chr5 (357-655)||(27683479-27683777)
chr5 (349-635)||(27666561-27666847)
chr5 (349-655)||(40710789-40711095)
chr5 (349-655)||(41772851-41773157)
chr5 (347-662)||(25428435-25428750)
chr5 (349-635)||(16358531-16358817)
chr5 (347-625)||(20466168-20466446)
chr5 (349-635)||(27612383-27612669)
chr5 (349-635)||(34568523-34568809)
chr5 (351-635)||(18781143-18781427)
chr5 (347-508)||(21676903-21677064)
chr5 (505-661)||(21679005-21679161)
chr5 (357-652)||(19771972-19772267)
chr5 (347-635)||(20801426-20801708)
chr5 (347-662)||(21409136-21409451)
chr5 (347-490)||(21935257-21935400)
chr5 (347-490)||(23507840-23507983)
chr5 (347-490)||(24583366-24583509)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (347-656)||(21981-22290)
scaffold0114 (347-512)||(39307-39472)
scaffold0114 (351-520)||(18235-18404)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (347-662)||(43018-43332)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (347-661)||(33436-33751)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (354-661)||(28724-29031)
scaffold0067 (351-662)||(59108-59419)
scaffold0067 (351-662)||(50074-50385)
scaffold0067 (351-662)||(65496-65807)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (352-662)||(1053-1363)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (352-658)||(729-1035)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (347-661)||(5241-5554)
scaffold0149 (347-661)||(9672-9985)
scaffold0149 (360-520)||(70-230)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (347-662)||(21221-21536)
scaffold0058 (347-662)||(27138-27453)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (347-661)||(602-916)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (347-661)||(13226-13540)
scaffold0261 (347-661)||(21405-21719)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (347-581)||(54301-54535)
scaffold0076 (347-661)||(31567-31881)
scaffold0076 (576-662)||(55019-55105)
scaffold0076 (347-490)||(42531-42674)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (347-662)||(6035-6350)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (351-662)||(28626-28937)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (354-661)||(2818-3125)
scaffold0079 (347-635)||(35624-35912)
scaffold0079 (458-635)||(28227-28404)
scaffold0079 (347-434)||(28405-28492)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (347-662)||(268709-269024)
scaffold0007 (369-662)||(84432-84724)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (347-658)||(262329-262640)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (347-661)||(19524-19838)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (347-661)||(150671-150985)
scaffold0011 (351-634)||(24427-24710)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (347-661)||(14302-14622)
scaffold0124 (347-490)||(5696-5839)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (351-662)||(10680-10991)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (351-662)||(79725-80036)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (347-661)||(1971-2285)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (352-662)||(29033-29343)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (347-662)||(53146-53461)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (347-661)||(4851-5165)
scaffold0035 (350-662)||(42000-42312)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (347-661)||(109732-110046)
scaffold0031 (357-635)||(54891-55169)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (351-662)||(4983-5294)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (351-662)||(25214-25525)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (347-661)||(19454-19768)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (347-661)||(41798-42112)
scaffold0102 (360-610)||(51248-51498)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (347-661)||(55737-56051)
scaffold0053 (360-662)||(46937-47239)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (350-662)||(9354-9662)
scaffold0235 (350-662)||(19568-19876)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (347-661)||(16214-16528)
scaffold0266 (369-490)||(7773-7894)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (347-661)||(49206-49520)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (347-661)||(49765-50079)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (347-661)||(48404-48718)
scaffold0028 (347-635)||(10602-10890)
scaffold0028 (347-635)||(17064-17352)
scaffold0028 (357-635)||(45279-45557)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (347-661)||(50912-51226)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (347-659)||(4280-4595)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (347-661)||(1375-1689)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (354-661)||(1442-1749)
scaffold0476 (415-610)||(10319-10514)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (351-661)||(10930-11240)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (373-662)||(11894-12184)
scaffold0309 (369-610)||(16794-17035)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (347-661)||(114661-114975)
scaffold0029 (347-608)||(94784-95045)
scaffold0029 (369-635)||(107723-107989)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (347-661)||(64409-64712)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (354-661)||(20951-21258)
scaffold0090 (567-661)||(25113-25207)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (347-661)||(477-791)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (365-661)||(6852-7140)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (414-640)||(9831-10057)
scaffold0348 (347-596)||(18373-18622)
scaffold0348 (347-448)||(5739-5840)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (347-661)||(176234-176548)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (347-610)||(7374-7637)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (347-547)||(114928-115128)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (347-662)||(8121-8436)
scaffold0120 (369-490)||(24449-24570)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (351-610)||(217314-217573)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (347-625)||(5779-6057)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (347-533)||(11188-11374)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (351-661)||(58117-58427)
scaffold0017 (351-519)||(17960-18128)
scaffold0017 (414-662)||(195444-195692)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (347-636)||(14369-14658)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (351-635)||(24839-25123)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (351-635)||(6981-7265)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (370-610)||(55908-56148)
scaffold0022 (351-635)||(40760-41044)
scaffold0022 (351-635)||(74480-74764)
scaffold0022 (347-501)||(8716-8870)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (462-661)||(6-205)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (351-610)||(20391-20650)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (347-625)||(10631-10909)
scaffold0018 (357-625)||(24198-24466)
scaffold0018 (501-625)||(16977-17101)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (357-662)||(9039-9344)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (369-662)||(2700-2993)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (347-552)||(22076-22281)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (354-635)||(2402-2683)
scaffold0023 (369-520)||(151353-151504)
scaffold0023 (450-661)||(86870-87081)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (391-635)||(1-245)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (347-635)||(669-957)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (347-627)||(3035-3315)
scaffold0647 (351-635)||(7553-7837)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (347-635)||(37710-37998)
scaffold0042 (347-625)||(22843-23121)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (351-658)||(16263-16570)
scaffold0044 (357-635)||(2549-2828)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (347-625)||(8924-9202)
scaffold0083 (347-471)||(1324-1448)
scaffold0083 (347-471)||(6628-6752)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (347-547)||(15868-16068)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (347-635)||(14596-14884)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (370-610)||(6024-6264)
scaffold0270 (370-610)||(13154-13394)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (351-635)||(11133-11417)
scaffold0080 (360-662)||(36449-36751)
scaffold0080 (351-610)||(53788-54047)
scaffold0080 (360-635)||(31010-31285)
scaffold0080 (351-448)||(13788-13885)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (347-662)||(3533-3848)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (357-635)||(9494-9772)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (507-659)||(12349-12501)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (557-661)||(44885-44989)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (347-662)||(1098-1413)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (354-547)||(96-289)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (370-635)||(3709-3974)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (347-635)||(15111-15399)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (357-635)||(17777-18054)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (522-662)||(16214-16354)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (351-635)||(14018-14302)
scaffold0109 (357-661)||(40255-40559)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (370-635)||(894-1157)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (522-662)||(8873-9013)
scaffold0130 (347-527)||(4779-4959)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (357-625)||(17015-17282)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (351-609)||(213-471)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (357-655)||(21353-21651)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (351-610)||(85124-85383)
scaffold0008 (370-635)||(85709-85974)
scaffold0008 (347-490)||(132379-132522)
scaffold0008 (347-486)||(26044-26183)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (357-635)||(29815-30093)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (347-649)||(703-1001)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (369-610)||(8202-8443)
scaffold0358 (369-610)||(17398-17639)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (351-662)||(551-862)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (351-662)||(20703-21014)
scaffold0081 (351-662)||(36127-36438)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (351-635)||(103361-103637)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (390-520)||(8675-8805)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (347-520)||(15884-16058)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (351-520)||(8615-8783)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (351-520)||(13105-13274)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (347-475)||(9844-9972)
scaffold0146 (347-475)||(17511-17639)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (567-662)||(1425-1520)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (351-610)||(1276-1535)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (578-661)||(1096-1179)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (595-661)||(378-444)
scaffold0180 (595-661)||(4698-4764)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (595-661)||(414-480)
scaffold0089 (558-662)||(14814-14918)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (347-490)||(25667-25810)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (347-490)||(15181-15324)
scaffold0162 (347-490)||(11064-11207)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (351-484)||(11052-11186)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (370-490)||(1797-1917)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (347-490)||(1511-1654)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (360-490)||(13528-13658)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (508-625)||(1900-2017)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (351-436)||(12250-12335)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (597-662)||(8923-8988)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (347-490)||(7426-7569)
scaffold0302 (347-490)||(484-627)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (347-490)||(34358-34501)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (351-434)||(41399-41482)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (347-416)||(4060-4129)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (370-487)||(1865-1982)
scaffold0218 (360-490)||(26600-26730)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (370-490)||(859-979)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (347-487)||(16334-16474)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (347-490)||(7017-7160)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (426-520)||(28451-28545)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (570-662)||(4295-4387)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (347-403)||(2817-2873)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (347-490)||(693-836)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (347-454)||(401-508)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (360-490)||(7143-7273)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (478-655)||(23095-23272)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (369-436)||(4838-4905)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (371-490)||(89773-89892)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (576-662)||(1808-1894)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (453-635)||(8142-8324)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (347-408)||(36292-36353)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (567-635)||(450-518)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (374-434)||(2267-2327)


Alignment Details
Target: scaffold0009 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 251036 - 250722
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  251036 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgca 250937  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  250936 aaggtgttcagcaagattgacttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 250837  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  250836 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 250737  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  250736 tgtgtttattgatga 250722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Original strand, 31414806 - 31415114
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414806 tgcattaattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 31414905  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  31414906 tcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 31415005  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31415006 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgttt 31415105  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  31415106 attgatgat 31415114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 23657371 - 23657063
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  23657371 tgcattgattatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttt 23657272  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  23657271 tcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 23657172  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  23657171 taaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtattt 23657072  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  23657071 attgatgat 23657063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27356983 - 27356672
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  27356983 ttgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 27356884  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27356883 tttttagtaagattgacttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 27356784  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27356783 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 27356684  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  27356683 tttattgatgat 27356672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 21323609 - 21323923
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21323609 gaggttatgtattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 21323708  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323709 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 21323808  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  21323809 acgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 21323908  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||| |||||    
T  21323909 tgtgtttatcgatga 21323923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22053314 - 22052999
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  22053314 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgca 22053215  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22053214 aagattttcaataagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 22053115  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |     
T  22053114 acgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtggg 22053015  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| || |||||||||    
T  22053014 tgtattcattgatgat 22052999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 16269559 - 16269869
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  16269559 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagat 16269658  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  16269659 ttttagtaagattgatttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 16269758  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16269759 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 16269858  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    | |||||||||    
T  16269859 tcattgatgat 16269869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 20008264 - 20008566
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||  |    
T  20008264 gattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagta 20008363  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||    
T  20008364 agattgatttgagctcaggttaccatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggt 20008463  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20008464 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgat 20008563  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  20008564 gat 20008566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 31569173 - 31569487
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31569173 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 31569272  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31569273 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcag-ttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 31569371  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  31569372 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 31569471  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  31569472 ggtatttattgatgat 31569487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28983349 - 28983047
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  28983349 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagta 28983250  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  28983249 agattgatttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 28983150  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  28983149 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 28983050  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  28983049 gat 28983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28988568 - 28988266
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  28988568 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagta 28988469  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  28988468 agattgatttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 28988369  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  28988368 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 28988269  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  28988268 gat 28988266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 21927879 - 21927565
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21927879 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgatgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgct 21927780  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  21927779 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcact 21927680  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21927679 atgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 21927580  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  21927579 tgtgtttattgatga 21927565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 4984480 - 4984178
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  4984480 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 4984381  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  4984380 agattgatttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 4984281  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  4984280 gatgcctttcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaat 4984181  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  4984180 gat 4984178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 585
Target Start/End: Original strand, 22061009 - 22061247
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  22061009 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgca 22061108  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22061109 aaagttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcatt 22061208  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgc 585  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22061209 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 22061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 459 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 6605997 - 6605794
Alignment:
Q  459 aagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaagg 558  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| |    
T  6605997 aagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaag 6605898  T
Q  559 tgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 658  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  6605897 tgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattga 6605798  T
Q  659 tgat 662  Q
    ||||    
T  6605797 tgat 6605794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 399 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861571
Alignment:
Q  399 tatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtga 498  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||     |||||||   | ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  499 aggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcat 598  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  599 ggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 19861571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 347 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19984631 - 19984389
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19984631 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 19984532  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19984531 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19984432  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  19984431 atgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaattcgcctgg 19984389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20390537 - 20390295
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  20390537 gaggttgtgtatagtttaccgtcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttca 20390438  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20390437 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 20390338  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
    | ||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20390337 acaaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgtgcctgg 20390295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 351 - 661
Target Start/End: Original strand, 29301760 - 29302070
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||   |    
T  29301760 ttgtgcatcgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtg 29301859  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||  |    
T  29301860 tgttcagtaaaattgacttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatga 29301959  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     |  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  | ||| | |||||||| ||     
T  29301960 gtataaggtgatgccttttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggta 29302059  T
Q  651 tttattgatga 661  Q
    |||||||||||    
T  29302060 tttattgatga 29302070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 354 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22522990 - 22522719
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  22522990 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgt 22522891  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||  | |     
T  22522890 ttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagta 22522791  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22522790 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 32602596 - 32602281
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32602596 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgca 32602497  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || |    
T  32602496 aaagttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcact 32602397  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||    
T  32602396 atgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgt 32602297  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  32602296 tgtgtttatcgatgat 32602281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 20016603 - 20016901
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  20016603 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 20016702  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  20016703 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 20016802  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  20016803 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 20016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 22422226 - 22422510
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  22422226 ttgtgtattgactatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 22422325  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||||||  |    
T  22422326 tgtttagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatga 22422425  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  22422426 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 22422510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 23887479 - 23887199
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23887479 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 23887380  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23887379 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacatt 23887280  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 627  Q
    |  | |     |||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  23887279 acgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgctt 23887199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 658
Target Start/End: Original strand, 30311478 - 30311785
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  30311478 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 30311577  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  30311578 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 30311677  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||||||    
T  30311678 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtg 30311777  T
Q  651 tttattga 658  Q
    ||||||||    
T  30311778 tttattga 30311785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 619
Target Start/End: Original strand, 22246763 - 22247035
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22246763 gaggttgtgtattgattatcgacaattgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgca 22246862  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||    
T  22246863 cgtgtgttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacatt 22246962  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaatttt 619  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22246963 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttt 22247035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 18859018 - 18858720
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  18859018 attgattatcggcagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 18858919  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||  |||  ||    
T  18858918 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataa 18858819  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  18858818 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 18858720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 351 - 652
Target Start/End: Original strand, 22375787 - 22376088
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  22375787 ttgtgtattgattatcgatagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 22375886  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  22375887 tattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatta 22375986  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || |||||| | ||| |  |||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| ||||||    
T  22375987 atataaagtgatgcctttcagcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtg 22376086  T
Q  651 tt 652  Q
    ||    
T  22376087 tt 22376088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 494 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14567446 - 14567278
Alignment:
Q  494 ggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtg 593  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||     
T  14567446 ggtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtt 14567347  T
Q  594 ttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14567346 tttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgat 14567278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 17672355 - 17672661
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  17672355 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 17672454  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  17672455 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 17672554  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  17672555 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 17672654  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  17672655 tgtttat 17672661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19980405 - 19980130
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  19980405 gattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 19980306  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||| |||||||  | || || ||||  ||||| || ||  |||  || ||    
T  19980305 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagt 19980206  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  19980205 tatgccttttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 19980130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 610
Target Start/End: Original strand, 21164868 - 21165131
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21164868 gaggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 21164967  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
        | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  21164968 cgcattttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcact 21165067  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21165068 atgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaa 21165131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 367 - 662
Target Start/End: Original strand, 22131391 - 22131686
Alignment:
Q  367 gtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattga 466  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  22131391 gtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 22131490  T
Q  467 cttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcg 566  Q
     |||||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |  || || || ||  |||  || || ||| |     
T  22131491 tttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcct 22131590  T
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||    
T  22131591 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgat 22131686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 22118515 - 22118813
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22118515 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22118614  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  22118615 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataa 22118714  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22118715 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22118813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 22127299 - 22127597
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22127299 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22127398  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  22127399 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataa 22127498  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22127499 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22127597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15535830 - 15535546
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15535830 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 15535731  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |   | || || || ||||| || ||  |    
T  15535730 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatga 15535631  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  15535630 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 15535546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22042274 - 22041990
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  22042274 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaag 22042175  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || ||  |    
T  22042174 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatga 22042075  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22042074 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 22041990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 354 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22989489 - 22989326
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  22989489 tgcattgattatcgacggttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgt 22989390  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaa 517  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22989389 ttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaa 22989326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21253107
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 21253107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 21392195 - 21392364
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392195 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21392294  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21392295 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21392364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 21781521 - 21781690
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21781521 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21781620  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21781621 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21781690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 21782754 - 21782923
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21782754 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21782853  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21782854 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21782923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 21786689 - 21786858
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21786689 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21786788  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21786789 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21786858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 547
Target Start/End: Original strand, 20394476 - 20394663
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |    
T  20394476 gattaccggcaattgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttatta 20394575  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20394576 agattgatttgagatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacatta 20394663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22373319 - 22373168
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  22373319 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 22373220  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtga 498  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22373219 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 349 - 652
Target Start/End: Original strand, 19482404 - 19482699
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||       
T  19482404 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcagttagtgggtgcgcg 19482495  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  19482496 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 19482595  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || ||||    
T  19482596 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttg 19482695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23652468 - 23652204
Alignment:
Q  371 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttg 470  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||     
T  23652468 gttgaaaaaagtgacaataaagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattta 23652369  T
Q  471 aggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcg 570  Q
    || || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| |  || || || || |||||||||||  | | ||| || ||| | || |    
T  23652368 agatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttg 23652269  T
Q  571 gtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  23652268 gtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 23652204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 555 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22373174 - 22373067
Alignment:
Q  555 aaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttta 654  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22373174 aaggtgatgcctttgggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgttta 22373075  T
Q  655 ttgatgat 662  Q
     |||||||    
T  22373074 ctgatgat 22373067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 610
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864686
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| || ||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | |  || || ||| | |||    
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 19864686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 458 - 610
Target Start/End: Original strand, 21920189 - 21920341
Alignment:
Q  458 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 557  Q
    |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||  | |  |||    
T  21920189 caagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataag 21920288  T
Q  558 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||| |||||    
T  21920289 gtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaa 21920341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 16875425 - 16875568
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  16875425 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 16875524  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16875525 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16875568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16414529 - 16414402
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  16414529 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 16414430  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||    
T  16414429 agattgatttgagatcaggatatcatca 16414402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Original strand, 21848680 - 21848810
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |    
T  21848680 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagta 21848779  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21848780 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 21848810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Original strand, 20650685 - 20650825
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  20650685 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgca 20650784  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  20650785 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 20650825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22030550 - 22030470
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggat 431  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22030550 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 490
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155515
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| |    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    |||| || || |||||||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagat 23155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Original strand, 21194870 - 21195010
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| || ||||||||| | || ||||||    
T  21194870 gaggttgtgtgtggattaccgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgca 21194969  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
     ||||||| |  |||||||| || || || || ||||||||    
T  21194970 gaggtgtttagtaagattgatttcagatcaggatatcatca 21195010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 485
Target Start/End: Original strand, 24932176 - 24932292
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||    |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  24932176 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaatgattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24932275  T
Q  469 tgaggtctggttatcat 485  Q
    |||| || || ||||||    
T  24932276 tgagatcaggatatcat 24932292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22436754 - 22436614
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||  | | |||||||| |||||||||| | | || ||||||    
T  22436754 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttatgaggattgatgatttgatggatcggctggttggtgca 22436655  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  22436654 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 22436614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19869909 - 19869868
Alignment:
Q  582 gcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccat 623  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19869909 gcgccaggagtgtttatggagtatatgaacagaattttccat 19869868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 16948350 - 16948661
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16948350 ttgtgcattgattaccgtcagttgaataaagttatgataaagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaagg 16948449  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16948450 tgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacga 16948549  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16948550 ataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtg 16948649  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  16948650 tttattgatgat 16948661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 13023732 - 13023417
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  13023732 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcg 13023633  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13023632 aaggtgtttagcaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 13023533  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13023532 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 13023433  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||||||||||    
T  13023432 ggtgtttattgatgat 13023417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 13675820 - 13675513
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13675820 tgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttt 13675721  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  13675720 tcaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 13675621  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  13675620 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtattt 13675521  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  13675520 attgatga 13675513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 15100477 - 15100791
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15100477 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgct 15100576  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15100577 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcatt 15100676  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  15100677 acaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 15100776  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  15100777 tgtgtttattgatga 15100791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12459010 - 12458700
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||    
T  12459010 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagt 12458911  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  12458910 gttcagtaagatcgatttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaa 12458811  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12458810 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgt 12458711  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  12458710 ttattgatgat 12458700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 26092685 - 26092987
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  26092685 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 26092784  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  26092785 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 26092884  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26092885 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 26092984  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  26092985 gat 26092987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 49154672 - 49154361
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  49154672 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 49154573  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  49154572 tatttagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 49154473  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49154472 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 49154373  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  49154372 tttattgatgat 49154361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 12204674 - 12204989
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12204674 gaggttgtgcatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 12204773  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12204774 tgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacatt 12204873  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  12204874 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggt 12204973  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||||||||||    
T  12204974 cgtgtttattgatgat 12204989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 11301100 - 11301402
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  11301100 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagta 11301199  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  11301200 agattgatttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 11301299  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11301300 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 11301399  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  11301400 gat 11301402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 18051827 - 18052141
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18051827 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 18051926  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18051927 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 18052026  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18052027 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 18052126  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
     || |||||||||||    
T  18052127 ggtatttattgatga 18052141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14140054 - 14139739
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  14140054 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgca 14139955  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14139954 aaggtttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 14139855  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  14139854 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 14139755  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  14139754 ggtatttattgatgat 14139739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 15342806 - 15342495
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15342806 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgca 15342707  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15342706 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 15342607  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  15342606 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggt 15342507  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||| || |||||    
T  15342506 tgtattcattga 15342495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 23503744 - 23504059
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23503744 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 23503843  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23503844 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 23503943  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  23503944 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 23504043  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  23504044 ggtatttattgatgat 23504059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 14262119 - 14262433
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  14262119 gaggttgtgtatagattactgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 14262218  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14262219 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcatattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcatt 14262318  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14262319 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 14262418  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  14262419 tgtgtttattgatga 14262433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 16070171 - 16070484
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16070171 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaagtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgct 16070270  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||| | |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16070271 cgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 16070370  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||    
T  16070371 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggt 16070468  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  16070469 tgtgtttattgatgat 16070484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 11386307 - 11386618
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  11386307 ttgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 11386406  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||  |    
T  11386407 tttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacga 11386506  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||    
T  11386507 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtg 11386606  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  11386607 tttattgatgat 11386618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 13966547 - 13966857
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |    
T  13966547 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaat 13966646  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  13966647 ttttagtaagattgatttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgag 13966746  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13966747 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 13966846  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  13966847 ttattgatgat 13966857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19615050 - 19614736
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  19615050 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 19614951  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19614950 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 19614851  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  19614850 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 19614751  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  19614750 tgtattcattgatga 19614736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 364 - 658
Target Start/End: Original strand, 26116481 - 26116775
Alignment:
Q  364 accgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagat 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |||||    
T  26116481 accgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagat 26116580  T
Q  464 tgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatg 563  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | | ||| ||||||    
T  26116581 tgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatg 26116680  T
Q  564 tcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 658  Q
     | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  26116681 cctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattga 26116775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 360 - 661
Target Start/End: Original strand, 14284263 - 14284564
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||| | || |  |    
T  14284263 gattaccgtcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttgatggatcagttggtttgtgcaaagatttttagta 14284362  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||  |||||    
T  14284363 atatcgacttgaggtatggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggt 14284462  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14284463 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgat 14284562  T
Q  660 ga 661  Q
    ||    
T  14284563 ga 14284564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 390 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748671
Alignment:
Q  390 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 489  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |||||||||||||    |||| |  || ||||| |||||||| ||||| | | |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttacc-taaga 20748842  T
Q  490 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  590 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 20748671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 390 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149272
Alignment:
Q  390 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 489  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |||||||||||||    |||| |  || ||||| |||||||| ||||| | | |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttacc-taaga 19149443  T
Q  490 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  590 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 19149272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 15146780 - 15147058
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146780 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 15146879  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  15146880 cgtgttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacatt 15146979  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  | |  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15146980 acgagtataaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgc 15147058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 11235119 - 11235417
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  11235119 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 11235218  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |||  ||    
T  11235219 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 11235318  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  11235319 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 11235417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 14334760 - 14334462
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  14334760 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 14334661  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14334660 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 14334561  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  14334560 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 14334462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 15256 - 15534
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15256 attgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttca 15355  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15356 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15455  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  15456 agttatgcctttcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 15534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 15158963 - 15159261
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  15158963 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 15159062  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15159063 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15159162  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  15159163 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 15159261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 11550998 - 11551286
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11550998 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 11551097  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |    
T  11551098 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcact 11551197  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  11551198 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 11551286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14042065 - 14041781
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14042065 ttgtgcattgactatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 14041966  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||  |    
T  14041965 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatga 14041866  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||    
T  14041865 gtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggat 14041781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14352095 - 14351811
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14352095 ttgtgcattgactatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 14351996  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||  |    
T  14351995 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatga 14351896  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     | ||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||    
T  14351895 gtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggat 14351811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10873062 - 10872776
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10873062 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10872963  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  10872962 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 10872863  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  10872862 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggat 10872776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12689876 - 12689588
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12689876 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 12689777  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| || |    
T  12689776 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcact 12689677  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12689676 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12689588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 627
Target Start/End: Original strand, 48813148 - 48813428
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48813148 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgca 48813247  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  48813248 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacatt 48813347  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 627  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||||||    
T  48813348 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgctt 48813428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14956928 - 14956613
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14956928 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 14956829  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || |||||  ||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  14956828 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 14956729  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || ||    
T  14956728 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagt 14956629  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||| || ||||||    
T  14956628 tgtgttcatcgatgat 14956613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8709969 - 8709691
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  8709969 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 8709870  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  8709869 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 8709770  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  8709769 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 8709691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13688405 - 13688107
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  13688405 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 13688306  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |  ||  |||  ||    
T  13688305 gcaagattgatttgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataa 13688206  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  13688205 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 13688107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18180109 - 18179831
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  18180109 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttca 18180010  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  18180009 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataa 18179910  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  18179909 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 18179831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9590742 - 9590479
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590742 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 9590643  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||  | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  9590642 aaatttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 9590543  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |  |||  || || ||| | || ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  9590542 atgaatataaagttatgccttttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaa 9590479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 44789249 - 44789535
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  44789249 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 44789348  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  44789349 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 44789448  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  44789449 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 44789535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 15626899 - 15626619
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||| |||| |  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15626899 gaggttatgcattaattatcagcagttgaataaaatgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15626800  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  15626799 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacatt 15626700  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 627  Q
    |  |||    ||||||| | ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15626699 acgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgctt 15626619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 18588077 - 18588375
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  18588077 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 18588176  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  ||   ||    
T  18588177 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataa 18588276  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  18588277 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 18588375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 445
Target Start/End: Original strand, 11770298 - 11770396
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 445  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11770298 gaggttatgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 11770396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7826274 - 7826131
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7826274 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 7826175  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7826174 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7826131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 27105670 - 27105813
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27105670 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 27105769  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27105770 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 27105813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27172655 - 27172512
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27172655 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 27172556  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27172555 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 27172512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 428
Target Start/End: Original strand, 16727283 - 16727360
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatg 428  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16727283 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 428
Target Start/End: Original strand, 17704355 - 17704432
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatg 428  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17704355 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4442302 - 4442159
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  4442302 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 4442203  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  4442202 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 4442159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13379257 - 13379114
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || || || ||||||   ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  13379257 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 13379158  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13379157 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 13379114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21754783 - 21754742
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaag 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21754783 ttgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttacgataaag 21754742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 10466881 - 10467196
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466881 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 10466980  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  10466981 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcatt 10467080  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10467081 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgt 10467180  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||||||||||    
T  10467181 ggtgtttattgatgat 10467196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19437251 - 19436937
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19437251 gaggtcgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgca 19437152  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
     |||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19437151 gaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacatt 19437052  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  19437051 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 19436952  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  19436951 tgtgtttattgatga 19436937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 14377948 - 14378263
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14377948 gaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgca 14378047  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14378048 aaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 14378147  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14378148 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggt 14378247  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14378248 tgtatttattgatgat 14378263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 14379498 - 14379813
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14379498 gaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgca 14379597  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14379598 aaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 14379697  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14379698 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggt 14379797  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14379798 tgtatttattgatgat 14379813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25770093 - 25769778
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  25770093 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 25769994  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25769993 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacatt 25769894  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  25769893 atgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggt 25769794  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  25769793 tgtgtttattgatgat 25769778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 24366657 - 24366346
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  24366657 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaga 24366558  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  24366557 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 24366458  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| |||||| | |||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24366457 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtg 24366358  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  24366357 tttattgatgat 24366346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19455272 - 19454959
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19455272 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 19455174  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || || |  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19455173 cgtgtatttagtaagatttacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19455074  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||    
T  19455073 acgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggt 19454974  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  19454973 tgtatttattgatga 19454959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 21568027 - 21568338
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||     
T  21568027 ttgtgcatagactaccgttagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaaga 21568126  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |    
T  21568127 tttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacga 21568226  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  21568227 atacaaagtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgta 21568326  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  21568327 tttattgatgat 21568338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21473849 - 21473535
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||     
T  21473849 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgct 21473750  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21473749 cgtgtgttcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 21473650  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | |  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21473649 atgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatgcg-ctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggt 21473551  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||||| |||||    
T  21473550 tgtgtttatttatgat 21473535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 355 - 661
Target Start/End: Original strand, 28280853 - 28281159
Alignment:
Q  355 gcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgtt 454  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  28280853 gcattgactaccgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgtt 28280952  T
Q  455 caacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatcc 554  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  28280953 cagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatac 28281052  T
Q  555 aaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttta 654  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  28281053 aaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtattta 28281152  T
Q  655 ttgatga 661  Q
    |||||||    
T  28281153 ttgatga 28281159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19881546 - 19881233
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19881546 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaa-aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgca 19881448  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19881447 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 19881348  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  19881347 acaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 19881248  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||| ||||||||    
T  19881247 tgtgttcattgatga 19881233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 354 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 18796932 - 18796627
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  18796932 tgcattgactatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattt 18796833  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | |  || |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  18796832 ttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaata 18796733  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||     
T  18796732 taaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattc 18796633  T
Q  654 attgat 659  Q
    ||||||    
T  18796632 attgat 18796627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15461585 - 15461270
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  15461585 gaggttgtgcattgactatcggcagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 15461486  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15461485 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcatt 15461386  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15461385 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggt 15461286  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||| ||||||    
T  15461285 ggtgtttatagatgat 15461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 34643618 - 34643932
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  34643618 gaggttgtgtattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgcc 34643717  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34643718 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 34643817  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34643818 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggt 34643917  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||  ||||||||    
T  34643918 tgtgtacattgatga 34643932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 355 - 580
Target Start/End: Original strand, 24516448 - 24516673
Alignment:
Q  355 gcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgtt 454  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24516448 gcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttt 24516547  T
Q  455 caacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatcc 554  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  24516548 tagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatac 24516647  T
Q  555 aaggtgatgtcgttcggtgttactaa 580  Q
    || |||||| | ||||||||||||||    
T  24516648 aaagtgatgcctttcggtgttactaa 24516673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16530077 - 16529949
Alignment:
Q  37 ggaacaatatctacttttagaggagaatcctcgaacatgatgatgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530077 ggaacaatatctacttttagaggagaatcctcgaacatgatgatgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcat 16529978  T
Q  137 tatatacacatgtaataagctctcttgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16529977 tatatacacatgtaataagctctcttgtt 16529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 349 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 27189683 - 27189407
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27189683 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaca 27189584  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27189583 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactac 27189484  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  27189483 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 27189407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 349 - 625
Target Start/End: Original strand, 27259557 - 27259833
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27259557 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaca 27259656  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27259657 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactac 27259756  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  27259757 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 27259833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 18183403 - 18183662
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  18183403 ttgtgtattgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtg 18183502  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||  |    
T  18183503 tgtttagcaagattgatttgaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatga 18183602  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  18183603 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaa 18183662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 23085803 - 23086081
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23085803 gaggttatgcattggttatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 23085902  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23085903 cgtgtgtttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 23086002  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  23086003 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 23086081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 28261231 - 28261517
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28261231 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28261330  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28261331 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28261430  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28261431 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 28284685 - 28284399
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28284685 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28284586  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28284585 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28284486  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28284485 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28284399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 28339980 - 28340266
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28339980 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaca 28340079  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  28340080 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactat 28340179  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| ||| || ||| | |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28340180 gaatacaaagttatgcctttcgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28340266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 360 - 635
Target Start/End: Original strand, 5837264 - 5837539
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  5837264 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagca 5837363  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| ||    
T  5837364 agattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagt 5837463  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5837464 tatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5837539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 18405976 - 18406291
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18405976 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 18406075  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| |||||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||    
T  18406076 agtgttttcagcaagatagatttgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacatt 18406175  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  18406176 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 18406275  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| || |||||||||    
T  18406276 tgttttcattgatgat 18406291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 20633976 - 20634287
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20633976 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 20634075  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  |    
T  20634076 ttttcagcaagatagatttgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatga 20634175  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   || || |||||     
T  20634176 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtt 20634275  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  20634276 tttattgatgat 20634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 610
Target Start/End: Original strand, 18963120 - 18963383
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18963120 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgca 18963219  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18963220 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacatt 18963319  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  18963320 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaa 18963383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 2872845 - 2873123
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  2872845 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 2872944  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  2872945 gcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 2873044  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  2873045 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 2873123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 348 - 662
Target Start/End: Original strand, 25607894 - 25608208
Alignment:
Q  348 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25607894 aggttgtgtattgattatcgacaattgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcat 25607993  T
Q  448 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
      || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  25607994 gtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacatta 25608093  T
Q  548 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 647  Q
      | | |||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | || || ||||| ||| |||||  ||| || |||    
T  25608094 tgagtacaaggtaatgctgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagtt 25608193  T
Q  648 gtgtttattgatgat 662  Q
    || ||||||||||||    
T  25608194 gtttttattgatgat 25608208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 16961518 - 16961802
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || ||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16961518 ttgtgtattgactatcgttagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaag 16961617  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16961618 tttttagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 16961717  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || |||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16961718 atataaagttatgtcgttcggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16961802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19866923 - 19866621
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  19866923 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 19866824  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| || || || ||||||||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || ||    
T  19866823 agattgatttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagt 19866724  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||| |||    
T  19866723 tatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgat 19866624  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  19866623 gat 19866621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 22828387 - 22828675
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22828387 gaggttatgtattgattatcgacagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 22828486  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  22828487 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 22828586  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22828587 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggat 22828675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 528
Target Start/End: Original strand, 30679040 - 30679220
Alignment:
Q  348 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  30679040 aggttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacac 30679139  T
Q  448 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttta 528  Q
      ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30679140 gtgtgtttagcaagattgatttgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagccttta 30679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25114791 - 25114513
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  25114791 attgattaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 25114692  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||| || | |||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |   |||  ||    
T  25114691 gcaagattgatttggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataa 25114592  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  25114591 agttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 25114513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 503
Target Start/End: Original strand, 8761784 - 8761940
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8761784 gaggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcg 8761883  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggat 503  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  8761884 aaagttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagttgaaggat 8761940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 16925681 - 16925958
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16925681 attgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttta 16925779  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  16925780 gcaagattgatttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataa 16925879  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16925880 tgttatgccgttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggat 16925958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 24293824 - 24294122
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| ||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  24293824 attgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 24293923  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || ||  |||  ||    
T  24293924 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataa 24294023  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24294024 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 24294122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 22760487 - 22760775
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22760487 gaggttgtgtattgattatcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 22760586  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||  ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||    
T  22760587 cgtgttgtcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacatt 22760686  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  | |  || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  22760687 atgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 22760775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 378 - 661
Target Start/End: Original strand, 25763291 - 25763574
Alignment:
Q  378 aaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctg 477  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |    
T  25763291 aaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcag 25763390  T
Q  478 gttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttac 577  Q
    ||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | |  || || ||| | |||||||||||    
T  25763391 gttatcaccagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 25763490  T
Q  578 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||   ||| | ||||| |||||||||||    
T  25763491 aaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatga 25763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 518
Target Start/End: Original strand, 27563869 - 27564036
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  27563869 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 27563968  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaag 518  Q
    | |||| ||||||||| || || || |||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  27563969 ttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaag 27564036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573879
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||| |    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 607  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16573879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 607
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621501
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||| |    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 607  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22436105 - 22435945
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  22436105 gattatcgtcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagca 22436006  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22436005 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 22435945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21755168 - 21755009
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  21755168 gattatcgtcagttgaacaa-gtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagca 21755070  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    |||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  21755069 agatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 21755009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Original strand, 4129084 - 4129246
Alignment:
Q  153 aagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaatgaataggtggagaaaa-ggttgtttgatagaagtgatagagtcggtt---caatgc 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  4129084 aagctctcttgttatagttaaata---tgattggttttaaaaatgagcatgaggagaaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgt 4129180  T
Q  249 cctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgttacttgtgtaa 313  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  4129181 tatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagttacttgtgtaa 4129246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 16648001 - 16648144
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16648001 gaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 16648100  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16648101 aaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16648144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23080668 - 23080573
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23080668 ttgtgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23998497 - 23998354
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23998497 gaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 23998398  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23998397 gaggtgtttagcaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 23998354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16529952 - 16529869
Alignment:
Q  265 tgttccaataaaaagtggagag--tggtgtggcaagctgttacttgtgtaactagttttcataacttttaacaattgataagta 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16529952 tgttccaataaaaagtggagagagtggtgtggcaagttgctacttgtgtaactagttttcataacttttaacaatcgataagta 16529869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 16380405 - 16380548
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16380405 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 16380504  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16380505 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 16380548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Original strand, 4101226 - 4101334
Alignment:
Q  209 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaat---gccctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||    
T  4101226 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgttatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagtt 4101324  T
Q  304 acttgtgtaa 313  Q
    ||||||||||    
T  4101325 acttgtgtaa 4101334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Original strand, 4126589 - 4126697
Alignment:
Q  209 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaat---gccctgcaggcaattatatgttccaataaaaagtg--gagagtggtgtggcaagctgtt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||    
T  4126589 aaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtttaataatgttatgcaggcaattatatgttccaataaaaagtggagagagtggtgt-gcaaacagtt 4126687  T
Q  304 acttgtgtaa 313  Q
    ||||||||||    
T  4126688 acttgtgtaa 4126697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450437
Alignment:
Q  397 ggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggt 496  Q
    |||||||||||||| | ||  | || ||||||||||| |||||||||||    |||||||  || |||||||| || || || |||||  |||| || ||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  497 gaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttc 596  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||  |||     |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtattt 18450503  T
Q  597 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18450502 atggaatatattaaccgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgat 18450437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 507 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 23080558 - 23080434
Alignment:
Q  507 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 606  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||  |||  || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  23080558 gatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtaca 23080459  T
Q  607 tgaaccgaattttccatgcttttct 631  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||    
T  23080458 tgaatcgcatttttcatgcatttct 23080434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 1646846 - 1646989
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  1646846 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 1646945  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  1646946 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 1646989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 610
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487577
Alignment:
Q  519 acggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||     |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaa 19487577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 130
Target Start/End: Original strand, 4128852 - 4128902
Alignment:
Q  80 tgacttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaaccta 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4128852 tgacttttccttttatgttggtcttaaataatcatgtattagttaaaccta 4128902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14130705 - 14130575
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||  | ||||| | ||    
T  14130705 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagca 14130606  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  14130605 agattgatttgaggtcaagatatcatcagat 14130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16100251 - 16100121
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |  |    
T  16100251 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagta 16100152  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16100151 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 16100121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Original strand, 23025791 - 23025921
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || ||||   ||||||| |  |    
T  23025791 gattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagta 23025890  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  23025891 agattgatttgaggtcaagatatcatcagat 23025921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Original strand, 4100462 - 4100508
Alignment:
Q  146 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaa 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  4100462 atgtaaaaagctctcttgttatggtta---aatatgattggttttaaaaa 4100508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Original strand, 4125793 - 4125839
Alignment:
Q  146 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaa 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  4125793 atgtaaaaagctctcttgttatggtta---aatatgattggttttaaaaa 4125839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28311877 - 28311819
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccactt 407  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  28311877 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 31209 - 31524
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31209 gaggttgtgcattgattaccgtcaatttaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 31308  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31309 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacatt 31408  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31409 acgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggt 31508  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||||||||||    
T  31509 ggtgtttattgatgat 31524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 351 - 661
Target Start/End: Original strand, 24097566 - 24097876
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24097566 ttgtgcattgattaccgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaagg 24097665  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  24097666 tgttcagcaagatcgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacga 24097765  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  24097766 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggta 24097865  T
Q  651 tttattgatga 661  Q
    |||||||||||    
T  24097866 tttattgatga 24097876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21953304 - 21952994
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  21953304 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 21953205  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  21953204 ttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 21953105  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21953104 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 21953005  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  21953004 ttattgatgat 21952994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 20833859 - 20834174
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20833859 gaggttgtgcattgactatcgtcagtttaataaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 20833958  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20833959 aaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 20834058  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  20834059 acgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 20834158  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  20834159 tgtgtttattgatgat 20834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 20938022 - 20938336
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20938022 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 20938121  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20938122 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcatt 20938221  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||    
T  20938222 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggt 20938321  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  20938322 tgtgtttattgatga 20938336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 19661095 - 19661409
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19661095 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 19661194  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  19661195 aatgttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcact 19661294  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||    
T  19661295 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggt 19661394  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  19661395 tgtgtttattgatga 19661409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 48425291 - 48424989
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  48425291 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 48425192  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  48425191 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 48425092  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48425091 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 48424992  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  48424991 gat 48424989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 52988159 - 52987857
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  52988159 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 52988060  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  52988059 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 52987960  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  52987959 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 52987860  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  52987859 gat 52987857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 20854719 - 20855034
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  20854719 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 20854818  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20854819 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 20854918  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20854919 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20855018  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||| ||||||    
T  20855019 ggtatttatagatgat 20855034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20296807 - 20296497
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  20296807 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagat 20296708  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  20296707 ttttagtaagattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 20296608  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20296607 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 20296508  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  20296507 ttattgatgat 20296497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 38910798 - 38911100
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  38910798 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 38910897  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  38910898 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggt 38910997  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  38910998 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgat 38911097  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  38911098 gat 38911100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 659
Target Start/End: Original strand, 21743511 - 21743823
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21743511 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgca 21743610  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21743611 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 21743710  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21743711 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 21743810  T
Q  647 tgtgtttattgat 659  Q
    |||||||||||||    
T  21743811 tgtgtttattgat 21743823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 37679467 - 37679165
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  37679467 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagta 37679368  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  37679367 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 37679268  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37679267 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 37679168  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  37679167 gat 37679165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 19856705 - 19856395
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19856705 gaggttatgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgca 19856606  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |    
T  19856605 aaggttttcagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttact 19856506  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  19856505 atgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggt 19856406  T
Q  647 tgtgtttattg 657  Q
    |||||||||||    
T  19856405 tgtgtttattg 19856395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 31537969 - 31538271
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||| | || |  |    
T  31537969 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagta 31538068  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  31538069 agatagatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 31538168  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31538169 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 31538268  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  31538269 gat 31538271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 351 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16378491 - 16378181
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16378491 ttgtgtattgattaccgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcg 16378392  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |    
T  16378391 tgttcaacaagattgatttgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatga 16378292  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||||   || || ||||||    
T  16378291 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtg 16378192  T
Q  651 tttattgatga 661  Q
    |||||||||||    
T  16378191 tttattgatga 16378181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 351 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 41310953 - 41310672
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||   |    
T  41310953 ttgtgtatagattaccatcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtg 41310854  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    ||||    || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |    
T  41310853 tgtttcgtaaaactgatttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatga 41310754  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctg 632  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41310753 atataacgtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctg 41310672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 354 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20140476 - 20140195
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |    
T  20140476 tgcattgcttatcgtcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttt 20140377  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  | |     
T  20140376 tcagcaagattgatttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagta 20140277  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  20140276 caaggtaatgtcgttcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 20140195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 370 - 610
Target Start/End: Original strand, 50618380 - 50618620
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  50618380 agttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgattt 50618479  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  | |  || |||||| | |||    
T  50618480 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 50618579  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50618580 ggtgttacaaatgcccctggagtgtttatggagtacatgaa 50618620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 17042978 - 17043289
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042978 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 17043077  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  17043078 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatga 17043177  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || |||||||||    
T  17043178 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtg 17043277  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||| ||||||    
T  17043278 tttatcgatgat 17043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21839340 - 21839035
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  21839340 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 21839241  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21839240 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 21839141  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  21839140 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 21839041  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  21839040 gatgat 21839035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 33388990 - 33389296
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  33388990 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 33389089  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  33389090 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 33389189  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  33389190 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 33389289  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  33389290 tgtttat 33389296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 16348556 - 16348843
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16348556 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16348655  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16348656 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16348755  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtc-gttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16348756 gaatataaagttatgccttttgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19108768 - 19108453
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19108768 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 19108669  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| ||      
T  19108668 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcacc 19108569  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||| |||||   || || ||    
T  19108568 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagt 19108469  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  19108468 tgtgtttatcgatgat 19108453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 22360207 - 22360466
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22360207 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 22360306  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||  |    
T  22360307 ttttcaacaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatga 22360406  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||    
T  22360407 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaa 22360466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 51331454 - 51331760
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  51331454 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 51331553  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  51331554 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 51331653  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  51331654 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 51331753  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  51331754 tgtttat 51331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 21233694 - 21233978
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21233694 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 21233793  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  21233794 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatga 21233893  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21233894 atataaagttatgcctttcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21233978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21751340 - 21751052
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21751340 gaggttgtgtatttattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgca 21751241  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || ||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  21751240 agtgttttcaacaagatagatttgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacatt 21751141  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  | |  || || ||| | || |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  21751140 atgagtataaagttatgccttttggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 21751052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 22503252 - 22503536
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |    
T  22503252 ttgtgtattgattatcgtaagttgaatagagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtg 22503351  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  22503352 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 22503451  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22503452 atataaagttatgtctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 22503536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 634
Target Start/End: Original strand, 21862336 - 21862619
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  21862336 ttgtgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtg 21862435  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||||| ||||||  | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||  |    
T  21862436 tgttcagcaagatacatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatga 21862535  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 634  Q
     |  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  21862536 gtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttgga 21862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21832692 - 21832394
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  21832692 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 21832593  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21832592 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 21832493  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  21832492 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 21832394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 390 - 662
Target Start/End: Original strand, 24792618 - 24792890
Alignment:
Q  390 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 489  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24792618 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaga 24792717  T
Q  490 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || |  ||| | || ||||| || ||||| |||||    
T  24792718 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaatgcacctgg 24792817  T
Q  590 agtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||| ||||||||||||    
T  24792818 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgat 24792890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 609
Target Start/End: Original strand, 430079 - 430337
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  430079 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 430178  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||  |    
T  430179 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatga 430278  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 609  Q
     | |||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  430279 gtacaaggttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatga 430337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 652
Target Start/End: Original strand, 41351629 - 41351926
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaa-taggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||      
T  41351629 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgc 41351721  T
Q  448 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
      || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||    
T  41351722 gagttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcacta 41351821  T
Q  548 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 647  Q
      ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || |||    
T  41351822 tgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggtt 41351921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 20829351 - 20829494
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20829351 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 20829450  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20829451 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 20829494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 35930784 - 35930927
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  35930784 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 35930883  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  35930884 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 35930927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20527453 - 20527314
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||  | | ||    
T  20527453 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagaagataca 20527354  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatc 486  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||    
T  20527353 aaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatc 20527314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20927454 - 20927311
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||   | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  20927454 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 20927355  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| | |||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  20927354 gaggtgtttagcaagattgatatgagatcaggatatcatcagat 20927311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 21739998 - 21740058
Alignment:
Q  350 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 410  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21739998 gttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 21740058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 41215815 - 41215958
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  41215815 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 41215914  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  41215915 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 41215958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 567 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20944210 - 20944142
Alignment:
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  20944210 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 20944142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 19717444 - 19717759
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19717444 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 19717543  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19717544 aaggtttttaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 19717643  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19717644 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggt 19717743  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  19717744 tgtgtttattgatgat 19717759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Original strand, 19650487 - 19650792
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19650487 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttca 19650586  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
      ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | | |||    
T  19650587 gtaagattgacttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaa 19650686  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19650687 ggtgatgcctttcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttatt 19650786  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  19650787 gatgat 19650792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23278792 - 23278478
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23278792 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23278693  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23278692 aaggtttttagtaagattgacttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacatt 23278593  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  23278592 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggt 23278493  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  23278492 tgtttttattgatga 23278478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 25255935 - 25255629
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25255935 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 25255836  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25255835 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 25255736  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  25255735 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggt 25255636  T
Q  647 tgtgttt 653  Q
    |||||||    
T  25255635 tgtgttt 25255629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 31832661 - 31832359
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  31832661 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagta 31832562  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||||||    
T  31832561 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggt 31832462  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31832461 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 31832362  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  31832361 gat 31832359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27789756 - 27789441
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27789756 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 27789657  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27789656 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 27789557  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27789556 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 27789457  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  27789456 ggtatttattgatgat 27789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 1065754 - 1065452
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  1065754 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 1065655  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  1065654 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 1065555  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  1065554 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgat 1065455  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  1065454 gat 1065452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12576369 - 12576055
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12576369 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 12576270  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12576269 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 12576170  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  12576169 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggt 12576070  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
     || |||||||||||    
T  12576069 ggtatttattgatga 12576055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 23098449 - 23098760
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  23098449 ttgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 23098548  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  23098549 tttttagtaagattgacttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 23098648  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||    
T  23098649 atagaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtg 23098748  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  23098749 tttattgatgat 23098760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 23112755 - 23112437
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23112755 gaggttgtgtatagattatcgtcaactgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 23112656  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgac---ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggac 543  Q
        | |||| |||||||||    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23112655 cgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggac 23112556  T
Q  544 attagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgt 643  Q
    ||||  |||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  23112555 attatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgt 23112456  T
Q  644 tgttgtgtttattgatgat 662  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23112455 agttgtgtttattgatgat 23112437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 459 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 24950494 - 24950291
Alignment:
Q  459 aagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaagg 558  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||    
T  24950494 aagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaagg 24950395  T
Q  559 tgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 658  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  24950394 tgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttga 24950295  T
Q  659 tgat 662  Q
    ||||    
T  24950294 tgat 24950291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24677505 - 24677217
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24677505 gaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24677406  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || |  |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||  || || || || || ||||| || |    
T  24677405 aaagatttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcact 24677306  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  24677305 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 24677217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 24264376 - 24264078
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  24264376 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 24264277  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24264276 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24264177  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24264176 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttat 24264078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 24712040 - 24711742
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| ||  |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  24712040 attgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttca 24711941  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24711940 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24711841  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  24711840 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 24711742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 24818657 - 24818935
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24818657 gaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24818756  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24818757 cgtgtattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 24818856  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  24818857 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgc 24818935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 23073879 - 23073592
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23073879 gaggttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 23073780  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |   | |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||    
T  23073779 agtattttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccatt 23073680  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 634  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| ||| ||||    
T  23073679 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttgga 23073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 24875187 - 24875465
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||   || ||||    
T  24875187 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttca 24875286  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  24875287 gcaagattgatttgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 24875386  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  24875387 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 24875465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 23106159 - 23106470
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23106159 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaag 23106258  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  23106259 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatga 23106358  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||     
T  23106359 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtt 23106458  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  23106459 ttcattgatgat 23106470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10870864 - 10870558
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||      
T  10870864 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacg 10870765  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10870764 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10870665  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  10870664 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 10870565  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  10870564 tgtttat 10870558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 27220030 - 27219724
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  27220030 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 27219931  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||     
T  27219930 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactat 27219831  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  27219830 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 27219731  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  27219730 tgtttat 27219724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 41606822 - 41607120
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  41606822 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 41606921  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  41606922 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 41607021  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  41607022 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 41607120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 30209344 - 30209659
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||     
T  30209344 gaggttatgtatagattactgacagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcg 30209443  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  30209444 cgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacatt 30209543  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    | ||||     |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||   ||||||||    
T  30209544 acaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgt 30209643  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  30209644 tgtgtttatagatgat 30209659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 9337596 - 9337290
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  9337596 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 9337497  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  9337496 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 9337397  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  9337396 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 9337297  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  9337296 tgtttat 9337290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16927374 - 16927088
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16927374 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16927275  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16927274 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16927175  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16927174 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16927088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 17001014 - 17000728
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  17001014 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 17000915  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  17000914 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 17000815  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  17000814 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 17000728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9486230 - 9485944
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  9486230 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 9486131  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  9486130 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 9486031  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  9486030 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 9485944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 21143478 - 21143756
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  21143478 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 21143577  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  21143578 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 21143677  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21143678 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21143756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 27373275 - 27372977
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  27373275 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 27373176  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  27373175 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 27373076  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  27373075 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 27372977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 44383999 - 44384285
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  44383999 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 44384098  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  44384099 agttttcagcaagattgatttgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 44384198  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  44384199 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 44384285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 635
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21323981
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  | |  || || ||| | ||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 21323981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 548 - 662
Target Start/End: Original strand, 27208800 - 27208914
Alignment:
Q  548 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 647  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  27208800 gaaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtg 27208899  T
Q  648 gtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| ||||||    
T  27208900 gtgtttatagatgat 27208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 402 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189646
Alignment:
Q  402 ccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaagg 501  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||| || || || |    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  502 atgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatgga 601  Q
    |||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  602 gtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 23189646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 22734205 - 22734464
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |    
T  22734205 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtg 22734304  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||||||  |    
T  22734305 ttttcaacaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatga 22734404  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  22734405 gtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaa 22734464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 662
Target Start/End: Original strand, 30010633 - 30010926
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| | || || || |||||||||| ||||||||||||    |||||||  || || ||||    
T  30010633 cagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggact 30010732  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    | || |  || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||     |||||| | ||    
T  30010733 taagattaggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgccttt 30010832  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  30010833 cagtgttactaatgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgat 30010926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 24705913 - 24706172
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  24705913 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaag 24706012  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  24706013 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 24706112  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||  || || ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24706113 atataaagttatgccttttggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaa 24706172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 593 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23295705 - 23295637
Alignment:
Q  593 gttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23295705 gttnatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 23295637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22280121 - 22279978
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22280121 gaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 22280022  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22280021 gaggtgtttagtaagattgatttgagatctggatatcatcagat 22279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 24829615 - 24829758
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  24829615 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 24829714  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  24829715 gaggtgtttagtaagattgattagagatcagaatatcatcagat 24829758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611070
Alignment:
Q  402 ccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattga 466  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 23611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Original strand, 24568095 - 24568235
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||  | |||||||| || |||||| || | || ||||||    
T  24568095 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatgatttaatggattagctggttggtgca 24568194  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  24568195 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 24568235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 24623 - 24315
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24623 tgcattgattactgtcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgt 24524  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  24523 tcagtaagattgacttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaata 24424  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24423 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgttt 24324  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  24323 attgatgat 24315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 44307 - 44621
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  44307 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgct 44406  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  44407 cgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 44506  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  44507 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggt 44606  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  44607 tgtgtttattgatga 44621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 11959284 - 11959599
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11959284 gaggttgtgcattgactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgca 11959383  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  11959384 aaggtgttcagtaagattgatttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcatt 11959483  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11959484 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagt 11959583  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  11959584 tgtgtttattgatgat 11959599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 12358642 - 12358956
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358642 gaggttatgcattgattattgtcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 12358741  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12358742 aaggttttcagtaagaatgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacatt 12358841  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  12358842 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggt 12358941  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  12358942 tgtatttattgatga 12358956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 31693300 - 31693614
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31693300 gaggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 31693399  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31693400 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacatt 31693499  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  31693500 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggt 31693599  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  31693600 tgtatttattgatga 31693614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 31940917 - 31940603
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31940917 gaggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 31940818  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31940817 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacatt 31940718  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  31940717 atgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggt 31940618  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  31940617 tgtatttattgatga 31940603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 11950023 - 11950338
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11950023 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgca 11950122  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    | ||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11950123 agggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 11950222  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  11950223 acgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggt 11950322  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  11950323 tgtgtttattgatgat 11950338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Original strand, 18132461 - 18132772
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||  || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18132461 gaggttatgcattgtctatcgttaattgaataaagttacaattaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 18132560  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18132561 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 18132660  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  18132661 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 18132760  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||||||||||||    
T  18132761 tgtgtttattga 18132772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 47125945 - 47125643
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  47125945 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagta 47125846  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  47125845 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 47125746  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47125745 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 47125646  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  47125645 gat 47125643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 12510603 - 12510913
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  12510603 tgtgcatagattaccgtcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagat 12510702  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |     
T  12510703 tttcagtaagattgacttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgag 12510802  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | |||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12510803 tacaaaatgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 12510902  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  12510903 ttattgatgat 12510913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 44779261 - 44778947
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44779261 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 44779162  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44779161 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 44779062  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  44779061 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 44778962  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
     || |||||||||||    
T  44778961 ggtatttattgatga 44778947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 13944038 - 13943723
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13944038 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 13943939  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13943938 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 13943839  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  13943838 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 13943739  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  13943738 ggtatttattgatgat 13943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41179536 - 41179221
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41179536 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 41179437  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41179436 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 41179337  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | | ||| |||||| | |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  41179336 acgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 41179237  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  41179236 ggtatttattgatgat 41179221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 16834630 - 16834939
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||     |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16834630 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgca 16834724  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16834725 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 16834824  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |   || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16834825 acgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggt 16834924  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  16834925 tgtatttattgatga 16834939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 13318621 - 13318932
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13318621 ttgtgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaag 13318720  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  13318721 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacga 13318820  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  13318821 atacaaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggta 13318920  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  13318921 tttattgatgat 13318932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17188381 - 17188074
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17188381 tgcattgactatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttt 17188282  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||     
T  17188281 ttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 17188182  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| ||     
T  17188181 taaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattc 17188082  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  17188081 attgatga 17188074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28756319 - 28756017
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||| | || |  |    
T  28756319 gattaccgtcaattgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagta 28756220  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||    
T  28756219 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagt 28756120  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28756119 gatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 28756020  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  28756019 gat 28756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 10418160 - 10418475
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  10418160 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 10418259  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10418260 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 10418359  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10418360 acgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 10418459  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||| ||||||    
T  10418460 ggtatttatagatgat 10418475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14088687 - 14088373
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  14088687 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 14088588  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14088587 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 14088488  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  14088487 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 14088388  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  14088387 tgtattcattgatga 14088373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12180358 - 12180038
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12180358 gaggttattcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 12180259  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12180258 cgtgtatttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 12180159  T
Q  547 aga------aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatt 640  Q
    | |      |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  12180158 atatatatgaatataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaatt 12180059  T
Q  641 tgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     || ||||||| |||||||||    
T  12180058 cgtggttgtgtctattgatga 12180038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 16379043 - 16379358
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  16379043 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgca 16379142  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16379143 aaggtttttagtaagattgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 16379242  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  16379243 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggt 16379342  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  16379343 ggtatttattgatgat 16379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 16327780 - 16328090
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  16327780 tgtgcatagattaccgtcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 16327879  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |     
T  16327880 ttttagtaagattgacttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgag 16327979  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  16327980 tacaaggtgatgcctttcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgt 16328079  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  16328080 ttattgatgat 16328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15229617 - 15229302
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15229617 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgca 15229518  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229517 cgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15229418  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15229417 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggt 15229318  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  15229317 tgtgtttattgatgat 15229302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15235485 - 15235170
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15235485 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgca 15235386  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15235385 cgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15235286  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15235285 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggt 15235186  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  15235185 tgtgtttattgatgat 15235170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 350 - 661
Target Start/End: Original strand, 16826399 - 16826705
Alignment:
Q  350 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 449  Q
    |||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||       
T  16826399 gttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgt 16826498  T
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||      
T  16826499 gtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatg 16826598  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||    
T  16826599 aatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatg-----ctggataaatttgtggttgt 16826693  T
Q  650 gtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||    
T  16826694 gtttattgatga 16826705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 354 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24189311 - 24189076
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24189311 tgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttt 24189212  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||     
T  24189211 ttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgg 589  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24189111 taaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 13970235 - 13970549
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||     
T  13970235 gaggttatgtattgactaccgtcaattgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcg 13970334  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13970335 aagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 13970434  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  13970435 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 13970534  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  13970535 tgtattcattgatga 13970549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 360 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 10407969 - 10407720
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  10407969 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 10407870  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  10407869 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 10407770  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 609  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  10407769 aatgcctttctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 347 - 620
Target Start/End: Original strand, 8745505 - 8745776
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8745505 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 8745604  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  8745605 aaggtgttcagtaagattgacttgaggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcatt 8745704  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttc 620  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8745705 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccgtngtg-tcatggag-atatgaatcgaattttc 8745776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 453 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12270118 - 12269910
Alignment:
Q  453 ttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaat 552  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12270118 ttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaat 12270019  T
Q  553 ccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 652  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12270018 ataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtt 12269919  T
Q  653 tattgatga 661  Q
    |||||||||    
T  12269918 tattgatga 12269910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 349 - 658
Target Start/End: Original strand, 16754829 - 16755138
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  16754829 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 16754928  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  16754929 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 16755028  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  16755029 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 16755128  T
Q  649 tgtttattga 658  Q
    ||||||||||    
T  16755129 tgtttattga 16755138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 595
Target Start/End: Original strand, 14291647 - 14291895
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  14291647 gaggttgagtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 14291746  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  14291747 tgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcact 14291846  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgtt 595  Q
    |  |||  ||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14291847 atgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14291895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 15587520 - 15587826
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  15587520 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 15587619  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || ||     
T  15587620 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactat 15587719  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15587720 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttg 15587819  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  15587820 tgtttat 15587826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15261630 - 15261346
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  15261630 ttgtgcattgattatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtg 15261531  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  15261530 tgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatga 15261431  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  15261430 atataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggat 15261346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 15013882 - 15014197
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15013882 gaggttgtgtatagatcaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgca 15013981  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  |||||||| || || || || ||||| || || |  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  15013982 cgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacatt 15014081  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||| | |||||  |||||||||    
T  15014082 acgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgt 15014181  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  15014182 tgtgtttatagatgat 15014197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 53383146 - 53383432
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  53383146 ggttgtgtattgattatcggccgttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 53383245  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  53383246 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 53383345  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  53383346 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 53383432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 655
Target Start/End: Original strand, 16805077 - 16805381
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16805077 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 16805176  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16805177 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatga 16805276  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||    
T  16805277 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtg 16805376  T
Q  651 tttat 655  Q
    |||||    
T  16805377 tttat 16805381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 590
Target Start/End: Original strand, 14579534 - 14579777
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14579534 gaggttatgcattgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgca 14579633  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||||||||    
T  14579634 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacatt 14579733  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgga 590  Q
    |  | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14579734 atgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 15346373 - 15346679
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  15346373 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 15346472  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  15346473 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15346572  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  15346573 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 15346672  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  15346673 tgtttat 15346679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 20060182 - 20060488
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  20060182 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 20060281  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  20060282 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 20060381  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  20060382 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttg 20060481  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  20060482 tgtttat 20060488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Original strand, 15400653 - 15400958
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  15400653 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 15400752  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  15400753 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 15400852  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  15400853 agttatgccttttggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15400952  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  15400953 gatgat 15400958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 347 - 547
Target Start/End: Original strand, 11888480 - 11888680
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11888480 gaggttatgcattgattatcgacagttgattaaagtaacgataaacaataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 11888579  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11888580 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacatt 11888679  T
Q  547 a 547  Q
    |    
T  11888680 a 11888680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 5423058 - 5423344
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  5423058 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 5423157  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||     
T  5423158 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactat 5423257  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5423258 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5423344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6602738 - 6602452
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  6602738 ggttgtgtattgattatcggcagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacg 6602639  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||     
T  6602638 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 6602539  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| ||| || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  6602538 gaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 6602452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10007602 - 10007316
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10007602 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10007503  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10007502 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10007403  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10007402 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10007316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10908212 - 10907926
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  10908212 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 10908113  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  10908112 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 10908013  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10908012 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10907926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12888711 - 12888425
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  12888711 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 12888612  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  12888611 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 12888512  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12888511 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12888425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16694164 - 16693880
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16694164 ttgtgtattgactatcgtcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaag 16694065  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  16694064 tcttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatga 16693965  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16693964 atataaagttatgccattcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16693880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3687945 - 3687659
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||      
T  3687945 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacg 3687846  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  3687845 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 3687746  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  3687745 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 3687659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 5108747 - 5109025
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  5108747 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 5108846  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  5108847 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 5108946  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  5108947 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 5109025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 48427449 - 48427163
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  48427449 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 48427350  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  48427349 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 48427250  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  48427249 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 48427163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15358077 - 15357914
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  15358077 attgattatcgacagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 15357978  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15357977 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagac 15357914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13254692 - 13254386
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||      
T  13254692 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacg 13254593  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  13254592 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 13254493  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  13254492 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 13254393  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  13254392 tgtttat 13254386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16637775 - 16637489
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16637775 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16637676  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16637675 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16637576  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16637575 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16637489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17491850 - 17491591
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  17491850 ttgtgtattgactatcgacatttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 17491751  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||||||||  |    
T  17491750 ttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatga 17491651  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  17491650 gtacaaagttatgcctttcagtgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaa 17491591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24185194 - 24185051
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24185194 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 24185095  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  24185094 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagat 24185051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 398 - 662
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14874940
Alignment:
Q  398 gtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtg 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||     
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  498 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttca 597  Q
    || || || ||| ||||||||||  | || || || || ||||| || ||  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  598 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| ||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgat 14874940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12272352 - 12272254
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 445  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12272352 gaggttatgcattgattattgtccgtttaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 357 - 446
Target Start/End: Original strand, 15714192 - 15714281
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15714192 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43164677 - 43164580
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43164677 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 43164580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 458 - 662
Target Start/End: Original strand, 15723171 - 15723375
Alignment:
Q  458 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 557  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |||  ||     
T  15723171 caagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaa 15723270  T
Q  558 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattg 657  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| |    
T  15723271 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcg 15723370  T
Q  658 atgat 662  Q
    |||||    
T  15723371 atgat 15723375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18437140 - 18437044
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18437140 ttgtgtattgattatcgacagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaa 18437044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30139820 - 30139677
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30139820 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 30139721  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  30139720 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 30139677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30149371 - 30149228
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30149371 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 30149272  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  30149271 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 30149228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272668
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  8272648 gagatcaggatatcatcagat 8272668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 13965478 - 13965621
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13965478 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 13965577  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| | ||| || || |||||||||||    
T  13965578 gaggtgtttagtaagattgattcgagatcaggatatcatcagat 13965621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15612117 - 15611974
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  15612117 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 15612018  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  15612017 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 15611974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 15948596 - 15948739
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  15948596 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 15948695  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  15948696 gaggtgtttagtaagattgatttgagattaggatatcatcagat 15948739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Original strand, 12844229 - 12844289
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccactt 407  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12844229 gaggttgtgcattgactatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccactt 12844289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 6150979 - 6151122
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  6150979 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 6151078  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6151079 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 6151122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17200635 - 17200505
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |    
T  17200635 gattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagta 17200536  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  17200535 agattgatttgagatcaggatatcatcagat 17200505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 147
Target Start/End: Original strand, 32510104 - 32510169
Alignment:
Q  82 acttttcattttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatcattatatacacat 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32510104 acttttccttttatgttgatcttaaataatcatgtgctagttaaacctttatcattatatacacat 32510169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 570 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15341050 - 15340958
Alignment:
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15341050 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgat 15340958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 421
Target Start/End: Original strand, 26791541 - 26791613
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatga 421  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791541 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34376315 - 34376222
Alignment:
Q  146 atgtaataagctctcttgttatggttaaataatatgattggttttaaaaatgaataggtggagaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  34376315 atgtaataagctctcttgttatggtta---aatataattggttttaaaaatgagcatgtggagagaagatagtttgatcgaagggccagagtcggtt 34376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25768319 - 25768189
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||   | |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  25768319 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 25768220  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  25768219 acattgatttgagatcaggatatcatcagat 25768189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 10385431 - 10385370
Alignment:
Q  601 agtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  10385431 agtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgat 10385370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34376405 - 34376360
Alignment:
Q  90 ttttatgttggtcttaaataatcatgtattggttaaacctatatca 135  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34376405 ttttatgttgatcttaagtaatcatgtattagttaaacctatatca 34376360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 32510208 - 32510288
Alignment:
Q  193 aaatgaataggtggagaaaaggttgtttgatagaagtgatagagtcggttcaatgccctgcaggcaattatatgttccaataaaaag 279  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32510208 aaatgagtatgtggagagaagtttgtttgatagaagtgctagagtcggtt------agtgcaagcaattatatgttccaataaaaag 32510288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12500029 - 12499964
Alignment:
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12500029 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12499964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 2843 - 3157
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2843 gaggttatgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaataaataacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 2942  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2943 aaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacatt 3042  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  3043 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggt 3142  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  3143 tgtgtttattgatga 3157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 69782 - 69471
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||| |    
T  69782 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaag 69683  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  69682 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacga 69583  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  69582 atacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggta 69483  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  69482 tttattgatgat 69471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 16150096 - 16149785
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16150096 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 16149997  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16149996 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 16149897  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  16149896 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggt 16149797  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||||||||||||    
T  16149796 tgtgtttattga 16149785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 16154242 - 16153931
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16154242 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 16154143  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16154142 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 16154043  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  16154042 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggt 16153943  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||||||||||||    
T  16153942 tgtgtttattga 16153931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Original strand, 15357014 - 15357321
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15357014 tgcatcgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttt 15357113  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||     
T  15357114 tcagcaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaata 15357213  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |  ||||| |||    
T  15357214 caaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtattt 15357313  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  15357314 attgatga 15357321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 11205124 - 11205434
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  11205124 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagat 11205223  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |     
T  11205224 ctttagcaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgag 11205323  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11205324 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 11205423  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  11205424 ttattgatgat 11205434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 3262694 - 3262996
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  3262694 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagta 3262793  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  3262794 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 3262893  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3262894 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 3262993  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  3262994 gat 3262996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15258312 - 15257998
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  15258312 gaggttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatga-ttaatcgatcagttagtgggtgct 15258214  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15258213 cgtgtgtttagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 15258114  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  15258113 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggt 15258014  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  15258013 tgtgtttattgatgat 15257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 29451437 - 29451739
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  29451437 gattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 29451536  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  29451537 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 29451636  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  29451637 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgat 29451736  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  29451737 gat 29451739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 15001252 - 15001566
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15001252 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgca 15001351  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  15001352 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcact 15001451  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15001452 atgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 15001551  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  15001552 tgtgtttattgatga 15001566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 51604679 - 51604994
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51604679 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 51604778  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  51604779 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcatt 51604878  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  51604879 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggt 51604978  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  51604979 ggtatttattgatgat 51604994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 1647164 - 1647479
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1647164 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgca 1647263  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1647264 aaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcatt 1647363  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1647364 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggt 1647463  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || || |||||||||    
T  1647464 ggtattcattgatgat 1647479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 351 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 27902767 - 27902459
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  | || |||||||| |    
T  27902767 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaag 27902668  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27902667 tttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 27902568  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||     
T  27902567 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggta 27902468  T
Q  651 tttattgat 659  Q
    |||||||||    
T  27902467 tttattgat 27902459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15072744 - 15072429
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  15072744 gaggttgtgtataggttaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 15072645  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072644 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 15072545  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15072544 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggt 15072445  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  15072444 tgtgtttattgatgat 15072429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 658
Target Start/End: Original strand, 44659766 - 44660064
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  |    
T  44659766 gattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagta 44659865  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  44659866 agattgatttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 44659965  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattga 658  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44659966 gatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattga 44660064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14161850 - 14161540
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  14161850 tgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgt 14161751  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||    
T  14161750 gttcaacaagattgatttgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaa 14161651  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    |     |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |    
T  14161650 ttttcagtgatgcctttcggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtat 14161551  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  14161550 ttattgatgat 14161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 354 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16218608 - 16218327
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  16218608 tgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgt 16218509  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  16218508 ttagcaagattgacttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaata 16218409  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  16218408 taaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 16218327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 354 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16221928 - 16221647
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  16221928 tgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgt 16221829  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  16221828 ttagcaagattgacttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaata 16221729  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  16221728 taaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 16221647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 8708292 - 8707982
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8708292 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 8708193  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  |||||    |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8708192 cgcgtgtttagtaagat----ttgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacatt 8708097  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||| ||    
T  8708096 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggt 8707997  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  8707996 tgtgtttattgatga 8707982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 8051260 - 8051558
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||||    
T  8051260 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttca 8051359  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  8051360 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 8051459  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  8051460 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 8051558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Original strand, 14301616 - 14301921
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  14301616 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 14301715  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14301716 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 14301815  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  14301816 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 14301915  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  14301916 gatgat 14301921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 658
Target Start/End: Original strand, 18225077 - 18225384
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18225077 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 18225176  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  18225177 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 18225276  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||    
T  18225277 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtg 18225376  T
Q  651 tttattga 658  Q
    ||||||||    
T  18225377 tttattga 18225384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 347 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 27713721 - 27713413
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  27713721 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgca 27713622  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  27713621 cgagttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 27713522  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  27713521 atgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggt 27713422  T
Q  647 tgtgtttat 655  Q
    |||||||||    
T  27713421 tgtgtttat 27713413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8388795 - 8388509
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  8388795 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 8388696  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  8388695 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 8388596  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  8388595 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 8388509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12478983 - 12478697
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  12478983 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 12478884  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  12478883 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 12478784  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12478783 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 12478697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 16234621 - 16234907
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16234621 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16234720  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  16234721 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 16234820  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16234821 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16234907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 19776422 - 19776708
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  19776422 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 19776521  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  19776522 agttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 19776621  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  19776622 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 19776708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14682952 - 14682664
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14682952 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 14682853  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  14682852 cgtgttttcagcaagattgatctgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 14682753  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  ||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  14682752 atgaatataaggttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 14682664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 14848993 - 14849281
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14848993 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcg 14849092  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || || | |||| |||| ||||| || |||||||| || || || ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  14849093 cgtgtatttagcaaggttgatttgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacatt 14849192  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || | |||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  14849193 atgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 14849281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Original strand, 17092778 - 17093084
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||      
T  17092778 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacg 17092877  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  17092878 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 17092977  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  17092978 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 17093077  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  17093078 tgtttat 17093084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 23958122 - 23957824
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  23958122 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 23958023  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  23958022 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 23957923  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  23957922 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 23957824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 40475415 - 40475110
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  40475415 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 40475316  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  40475315 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataa 40475216  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||     
T  40475215 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatc 40475116  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  40475115 gatgat 40475110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 14696498 - 14696234
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  14696498 gaggttatgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgta 14696399  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14696398 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacatt 14696299  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaac 611  Q
    |  |||     |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  14696298 attaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaac 14696234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443290
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
    ||| |  |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacatta 23443290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22632085 - 22631916
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  22632085 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 22631986  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22631985 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 22631916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 472
Target Start/End: Original strand, 16251481 - 16251602
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16251481 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaag 16251580  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgag 472  Q
    | |||| ||||||||| |||||    
T  16251581 ttttcagcaagattgatttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 567 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15323382 - 15323287
Alignment:
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15323382 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 15323287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 15145533 - 15145827
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  15145533 gattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaa--------ttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 15145624  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || ||    
T  15145625 acattgatttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagt 15145724  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| ||||| |||    
T  15145725 tatgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgat 15145824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 490
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291188
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    |||| || || |||||||||||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagat 15291188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 458 - 635
Target Start/End: Original strand, 16353245 - 16353422
Alignment:
Q  458 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 557  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| |||     
T  16353245 caagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaa 16353344  T
Q  558 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16353345 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16353422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 56338929 - 56338866
Alignment:
Q  108 taatcatgtattggttaaacctatatcattatatacaca--tgtaataagctctcttgttatgg 169  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56338929 taatcatgtactagttaaacctatatcattatatacacatgtgtaataagctctcttgttatgg 56338866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 434
Target Start/End: Original strand, 16353157 - 16353244
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 434  Q
    |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16353157 gaggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 661
Target Start/End: Original strand, 15422374 - 15422441
Alignment:
Q  594 ttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15422374 ttcatggattacatgaatcgaatattccatccctttttggacaaatttgttgtagtgtttattgatga 15422441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 99452 - 99766
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  99452 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgca 99551  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  99552 aaggtttttagtaagattgaattgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacatt 99651  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  99652 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 99751  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  99752 tgtgtttattgatga 99766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 11537 - 11222
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11537 gaggttgtgcattgattattgtcaattgaataaagttacgataaagaacatgtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgca 11438  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 11338  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  11337 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggt 11238  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  11237 tgtgtttattgatgat 11222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 5527 - 5217
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5527 gaggttatgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgca 5428  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  5427 cgtgtgtttagcaagattgatttgagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggcttt 5328  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| ||    
T  5327 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcat-gagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggt 5229  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    |||||| |||||    
T  5228 tgtgttcattga 5217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 9477 - 9163
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9477 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgca 9378  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9377 aaggtttttagtaagattgacttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 9278  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  9277 acgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 9178  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  9177 tgtatttattgatga 9163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 1384 - 1694
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1384 tgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagt 1483  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  1484 ttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaa 1583  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  1584 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaggatatgaaccaaattttccatgcttttcaggataaatttgtggttgtat 1683  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  1684 ttattgatgat 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Original strand, 515248 - 515558
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  515248 tgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 515347  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  515348 ttttagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgat 515447  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  515448 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgt 515547  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  515548 ttattgatgat 515558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 453103 - 453417
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  453103 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 453202  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  453203 agtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacact 453302  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  453303 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 453402  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  453403 tgtgtttattgatga 453417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 354 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 495427 - 495129
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  495427 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgt 495328  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | ||| ||| | ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  495327 ttagcaatatttatttgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaata 495228  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 652  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  495227 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgtt 495129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 361 - 661
Target Start/End: Original strand, 759 - 1058
Alignment:
Q  361 attaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaa 460  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  759 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggt-ttcagcaa 857  T
Q  461 gattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtg 560  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  858 gattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtg 957  T
Q  561 atgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatg 660  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  958 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatg 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Original strand, 45317 - 45628
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45317 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 45416  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45417 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcatt 45516  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  45517 aagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggt 45616  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||||||||||||    
T  45617 tgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 40236 - 40538
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || |  |    
T  40236 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagta 40335  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  40336 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 40435  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40436 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgat 40535  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  40536 gat 40538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4326 - 4042
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||   |    
T  4326 ttgtgtattgattatcgacagttgaatagagtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtg 4227  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |    
T  4226 tgtttagcaagattgatttaagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatga 4127  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  4126 atataaagtgatgtctttcggtgttacaaatacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 4042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 328
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  642 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 543  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  542 aaggttttcagcaagattgacttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 443  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||    
T  442 aagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggt 343  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  342 tgtatttattgatga 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 38064 - 37750
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38064 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgca 37965  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37964 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcatt 37865  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  37864 acgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggt 37765  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||  |||||||||||    
T  37764 tgaatttattgatga 37750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2477
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  2162 gaggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 2261  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2262 tgtgtattcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacatt 2361  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  2362 atgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggt 2461  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  2462 tgtgtttattgatgat 2477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 29175 - 29490
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  29175 gaggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 29274  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29275 tgtgtattcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacatt 29374  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  29375 atgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggt 29474  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  29475 tgtgtttattgatgat 29490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 348 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 747
Alignment:
Q  348 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  1058 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caa 961  T
Q  448 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
    || | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  960 agttttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatta 861  T
Q  548 gaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgtt 647  Q
      ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  860 cgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtg 761  T
Q  648 gtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||||    
T  760 gtgtttattgatga 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 348 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8027 - 7814
Alignment:
Q  348 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaa 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  8027 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaa 7930  T
Q  448 aggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
    || | || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7929 agttttttagtaatattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatta 7830  T
Q  548 gaaatccaaggtgatg 563  Q
      ||| ||||||||||    
T  7829 cgaatacaaggtgatg 7814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 9948 - 10261
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9948 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 10047  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10048 aaggttttcagcaagattgacttaaggtcaggt-accatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcatt 10146  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||    
T  10147 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggt 10246  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  10247 tgtgtttattgatga 10261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 325120 - 324806
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  325120 gaggttgtgcattgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcg 325021  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  325020 aaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 324921  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  324920 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggt 324821  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  324820 tgtatttattgatga 324806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 201358 - 201673
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  201358 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtaca 201457  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  201458 cgagtgtttagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 201557  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||| ||    
T  201558 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggt 201657  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  201658 tgtgtttattgatgat 201673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22504973 - 22504663
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | | |    
T  22504973 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggat 22504874  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  22504873 tttcagtaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgag 22504774  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22504773 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 22504674  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  22504673 ttattgatgat 22504663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20344574 - 20344266
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  20344574 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattt 20344475  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  20344474 ttagcaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 20344375  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20344374 caaagtgatgcctttcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttt 20344275  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  20344274 attgatgat 20344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Original strand, 24796473 - 24796781
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  24796473 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattt 24796572  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  24796573 tcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 24796672  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24796673 caaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttt 24796772  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  24796773 attgatgat 24796781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 28893011 - 28893326
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  28893011 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 28893110  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28893111 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 28893210  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28893211 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 28893310  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||| ||||||    
T  28893311 ggtatttatagatgat 28893326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 28921837 - 28922152
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  28921837 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 28921936  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28921937 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 28922036  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28922037 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 28922136  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||| ||||||    
T  28922137 ggtatttatagatgat 28922152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 354 - 662
Target Start/End: Original strand, 14885067 - 14885375
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  14885067 tgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattt 14885166  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |     
T  14885167 tcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagta 14885266  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  14885267 caaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtattt 14885366  T
Q  654 attgatgat 662  Q
    |||||||||    
T  14885367 attgatgat 14885375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 17267403 - 17267718
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17267403 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgca 17267502  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17267503 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcatt 17267602  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17267603 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggt 17267702  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  17267703 ggtatttattgatgat 17267718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20778212 - 20777897
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||     
T  20778212 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgct 20778113  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20778112 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacatt 20778013  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20778012 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20777913  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||| ||||||    
T  20777912 ggtgtttatagatgat 20777897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22464250 - 22463935
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  22464250 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 22464151  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22464150 aaagtttttagtaagattgacctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 22464051  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22464050 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 22463951  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||| ||||||    
T  22463950 ggtatttatagatgat 22463935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20823752 - 20823437
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  20823752 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgct 20823653  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20823652 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 20823553  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20823552 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 20823453  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||| ||||||    
T  20823452 ggtgtttatagatgat 20823437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25850370 - 25850059
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||      
T  25850370 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaa 25850271  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  25850270 tttttagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 25850171  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25850170 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtg 25850071  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  25850070 ttcattgatgat 25850059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 37541463 - 37541765
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | || |  |    
T  37541463 gattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagta 37541562  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | ||| ||    
T  37541563 agattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 37541662  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  37541663 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgat 37541762  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  37541763 gat 37541765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 364 - 661
Target Start/End: Original strand, 22234006 - 22234303
Alignment:
Q  364 accgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagat 463  Q
    |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||| |  || ||    
T  22234006 accgtccgctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaat 22234105  T
Q  464 tgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatg 563  Q
    ||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || ||  |||  |||||||||    
T  22234106 tgatttgaggttaggttaccatcagattaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatg 22234205  T
Q  564 tcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22234206 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 22234303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 21562094 - 21562371
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  21562094 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgca 21562192  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21562193 cgcgtgttcagcaagattgatttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacatt 21562292  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21562293 atgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgc 21562371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 354 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23473537 - 23473256
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  23473537 tgcattgattatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgt 23473438  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | ||||||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||     
T  23473437 ttagcaagattgatttgagatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaata 23473338  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  23473337 taaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 23473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 625
Target Start/End: Original strand, 26736800 - 26737074
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  26736800 ttgtgtattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatg 26736899  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||  |    
T  26736900 tatttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatga 26736999  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  26737000 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgc 26737074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 27520721 - 27520415
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  27520721 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 27520622  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  27520621 agttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 27520522  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  27520521 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 27520422  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  27520421 tgtttat 27520415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 636
Target Start/End: Original strand, 21337367 - 21337652
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  21337367 ttgtgcattgattatcgacagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtg 21337466  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||  |    
T  21337467 tgtttagcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatga 21337566  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggata 636  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  21337567 atataaagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggata 21337652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 22136975 - 22136677
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22136975 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22136876  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||  |||  ||    
T  22136875 gcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataa 22136776  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22136775 agttatgccttttggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22136677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 37289575 - 37289873
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  37289575 attgattatcgacagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 37289674  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  |||  ||    
T  37289675 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataa 37289774  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  37289775 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 37289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 14997818 - 14998116
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  14997818 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 14997917  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  14997918 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 14998017  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  14998018 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 14998116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Original strand, 29474152 - 29474457
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  29474152 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 29474251  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  29474252 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 29474351  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||     
T  29474352 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatc 29474451  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  29474452 gatgat 29474457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 507 - 662
Target Start/End: Original strand, 28914642 - 28914797
Alignment:
Q  507 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 606  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28914642 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtata 28914741  T
Q  607 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28914742 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgat 28914797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 507 - 662
Target Start/End: Original strand, 28929910 - 28930065
Alignment:
Q  507 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 606  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28929910 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtata 28930009  T
Q  607 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  28930010 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgat 28930065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 22330966 - 22331264
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  22330966 attgattatcggcatttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 22331065  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  22331066 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 22331165  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  22331166 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 22331264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22350226 - 22349948
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  22350226 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 22350127  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  22350126 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 22350027  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  22350026 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 22349948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Original strand, 27683479 - 27683777
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |    
T  27683479 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttta 27683578  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  27683579 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 27683678  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  27683679 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 27683777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 27666561 - 27666847
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27666561 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacg 27666660  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  27666661 agttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 27666760  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || ||  || | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  27666761 gaatataaagttttgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 27666847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 40711095 - 40710789
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  40711095 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 40710996  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  40710995 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 40710896  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  40710895 gaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 40710796  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  40710795 tgtttat 40710789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 349 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 41773157 - 41772851
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  41773157 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 41773058  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||     
T  41773057 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 41772958  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttg 648  Q
     |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||    
T  41772957 gaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttg 41772858  T
Q  649 tgtttat 655  Q
    |||||||    
T  41772857 tgtttat 41772851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25428750 - 25428435
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25428750 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 25428651  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || |    
T  25428650 agtgttttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccact 25428551  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| ||||   ||| || ||    
T  25428550 atgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggt 25428451  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25428450 tgtttttattgatgat 25428435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16358817 - 16358531
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16358817 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 16358718  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  16358717 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 16358618  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  16358617 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 16358531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 20466168 - 20466446
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20466168 gaggttatgcatttattatcgacagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgca 20466267  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466268 cgtgtgtttagcaagattgatttaagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacatt 20466367  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||     |||||| | || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  20466368 acgaatattcagtgatgccttttggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgc 20466446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 27612669 - 27612383
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||      
T  27612669 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacg 27612570  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  27612569 agttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 27612470  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  27612469 gaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 27612383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 34568809 - 34568523
Alignment:
Q  349 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  34568809 ggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacg 34568710  T
Q  449 ggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattag 548  Q
     || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||     
T  34568709 agttttcagcaagattgatttgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactat 34568610  T
Q  549 aaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  34568609 gaatataaagttatgcccttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 34568523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18781427 - 18781143
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  18781427 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaag 18781328  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  18781327 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 18781228  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  18781227 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 18781143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 508
Target Start/End: Original strand, 21676903 - 21677064
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21676903 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacggtaaagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 21677002  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgagga 508  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21677003 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgagga 21677064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 505 - 661
Target Start/End: Original strand, 21679005 - 21679161
Alignment:
Q  505 aggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagta 604  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679005 aggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagta 21679104  T
Q  605 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21679105 tatgaacagaatttttcatgtttacctagataaatttgtggttgtattcattgatga 21679161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 357 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 19772267 - 19771972
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||   || || |    
T  19772267 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgttttta 19772168  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  19772167 gcaagattgatttgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 19772068  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtt 652  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  19772067 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtt 19771972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20801708 - 20801426
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||||||||      || |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20801708 gaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagt------aatgaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgca 20801615  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || |    
T  20801614 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcact 20801515  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  20801514 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 20801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21409451 - 21409136
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||||||||||||  |||||||     
T  21409451 gaggttatgtatagattaccggaagttgaataaagtgacaataaagaatagatatccacctccgaggatcgacgatttgatggatcagttgatgggtgcg 21409352  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || |||||||| || |  || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||     
T  21409351 cgtgtgttcagtaaaattgacttaagatggggctatcaccatatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacata 21409252  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||    
T  21409251 acgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatttatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgt 21409152  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21409151 tgtgtttatagatgat 21409136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 21935257 - 21935400
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21935257 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 21935356  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21935357 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 21935400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23507983 - 23507840
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23507983 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 23507884  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23507883 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 23507840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24583509 - 24583366
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  24583509 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 24583410  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24583409 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 24583366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22290 - 21981
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22290 gaggttgtgcattgattatcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaa 22191  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22190 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 22091  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | | |||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22090 atgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggt 21991  T
Q  647 tgtgtttatt 656  Q
    ||| ||||||    
T  21990 tgtatttatt 21981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39472 - 39307
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  39472 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgca 39373  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatg 512  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39372 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 18235 - 18404
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18235 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaag 18334  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || ||||||||  |||| |  || || ||||| ||||||||||||||    
T  18335 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagac 18404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 43332 - 43018
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43332 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgca 43233  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43232 aaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcatt 43133  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  43132 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaa-tttctatgcttacctggataaatttgtggt 43034  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||||||    
T  43033 tgtgtttattgatgat 43018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 33751 - 33436
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgat-aaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgc 445  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33751 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgc 33652  T
Q  446 aaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacat 545  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33651 acgtgtgtttaacaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacat 33552  T
Q  546 tagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttg 645  Q
    ||  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| || |    
T  33551 tacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtgg 33452  T
Q  646 ttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33451 ttgtgttcattgatga 33436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 29031 - 28724
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |    
T  29031 tgcattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtat 28932  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  28931 tcaacaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 28832  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28831 taaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgttt 28732  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  28731 attgatga 28724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 59108 - 59419
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  59108 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 59207  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  59208 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacga 59307  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  59308 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 59407  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  59408 ttcattgatgat 59419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 50074 - 50385
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  50074 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 50173  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  50174 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacga 50273  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  50274 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 50373  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  50374 ttcattgatgat 50385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 65496 - 65807
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  65496 ttgtgcatcgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaag 65595  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  65596 tttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacga 65695  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||     
T  65696 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgta 65795  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  65796 ttcattgatgat 65807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1053
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  1363 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 1264  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  1263 ttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgag 1164  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1163 tacaaagtaatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtat 1064  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  1063 ttattgatgat 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 352 - 658
Target Start/End: Original strand, 729 - 1035
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  729 tgtgcattgattaccgttagttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagat 828  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  829 ttttagtaagattgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgag 928  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  929 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtat 1028  T
Q  652 ttattga 658  Q
    | |||||    
T  1029 tcattga 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5554
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  5241 gaggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgct 5340  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5341 cgtgtattcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcact 5440  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  |||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5441 atgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 5539  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  5540 tgtgtttattgatga 5554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 9672 - 9985
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  9672 gaggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgct 9771  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9772 cgtgtattcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcact 9871  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  |||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9872 atgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaatgcgact-gcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 9970  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  9971 tgtgtttattgatga 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 70
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || |||| ||    
T  230 gattatcgtcacttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagca 131  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  130 agattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21536 - 21221
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  | |||||||||    
T  21536 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgca 21437  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  21436 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcatt 21337  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21336 atgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagt 21237  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  21236 tgtatttcttgatgat 21221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 27138 - 27453
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27138 gaggttatgtatagattaccggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgca 27237  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  || |||||||| || || || ||||| | ||| ||  |||| |||||||| || ||||||| || |||||||| ||| || ||| |||    
T  27238 cgtgtgttcagtaaaattgacttaagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaatt 27337  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||    
T  27338 atgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgt 27437  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  27438 tgtgtttatagatgat 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 916 - 602
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  916 gaggttgtgtatagattaatgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgct 817  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  816 cgtgtgtttagcaaaattggtttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcatt 717  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  716 atgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggt 617  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  616 tgtgtttattgatga 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13540
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  13226 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgct 13325  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13326 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacatt 13425  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  13426 acgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggt 13525  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  13526 tgtgtttattgatga 13540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 21405 - 21719
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  21405 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgct 21504  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21505 cgtgtgtttagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacatt 21604  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  21605 acgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggt 21704  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  21705 tgtgtttattgatga 21719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 581
Target Start/End: Original strand, 54301 - 54535
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  54301 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgca 54400  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54401 aaggtgttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 54500  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaat 581  Q
    |  ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54501 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaat 54535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 31567 - 31881
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31567 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgca 31666  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31667 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 31766  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  31767 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 31866  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  31867 tgtattcattgatga 31881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 576 - 662
Target Start/End: Original strand, 55019 - 55105
Alignment:
Q  576 actaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||||    
T  55019 actaatgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctagttaaattcgtggtggtatttattgatgat 55105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42674 - 42531
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  42674 gaggttgtgtgtggattatcgccagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgca 42575  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  42574 taggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 42531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Original strand, 6035 - 6350
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  6035 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgca 6134  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6135 aagatttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcatt 6234  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  6235 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggt 6334  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     || ||||||||||||    
T  6335 ggtatttattgatgat 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28937 - 28626
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||   |    
T  28937 ttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcg 28838  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    ||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  28837 tgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatga 28738  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  28737 gtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtg 28638  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  28637 tttattgatgat 28626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3125 - 2818
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||    
T  3125 tgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgt 3026  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||     
T  3025 ttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaata 2926  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  2925 taaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgttt 2826  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  2825 attgatga 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 35912 - 35624
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35912 gaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 35813  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  35812 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcact 35713  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  35712 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 35624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 458 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 28404 - 28227
Alignment:
Q  458 caagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaag 557  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| |||     
T  28404 caagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaa 28305  T
Q  558 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  28304 gttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 28227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28492 - 28405
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 434  Q
    |||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28492 gaggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 269024 - 268709
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  269024 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 268925  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  268924 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcatt 268825  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  268824 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggt 268725  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
     |||||||| ||||||    
T  268724 ggtgtttatagatgat 268709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 662
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84724
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||| |||||||||||||    |||||||| || |||||||    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||     |||||| | ||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgat 84724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 262640 - 262329
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  262640 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgca 262541  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  262540 aagattttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 262441  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  262440 acgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggt 262341  T
Q  647 tgtgtttattga 658  Q
    ||| || |||||    
T  262340 tgtattcattga 262329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 19524 - 19838
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19524 gaggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgca 19623  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19624 aaagttttcagcaagattgatttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 19723  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||    
T  19724 acgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggt 19823  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  19824 tgtgtttattgatga 19838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 150985 - 150671
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  150985 gaggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 150886  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  150885 cgtgtatttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacact 150786  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||    
T  150785 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggt 150686  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||  |||||||||||    
T  150685 tgaatttattgatga 150671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 634
Target Start/End: Original strand, 24427 - 24710
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |    
T  24427 ttgtgcattgattattgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtg 24526  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |    
T  24527 tgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatga 24626  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctgga 634  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  24627 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttgga 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14622 - 14302
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14622 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgca 14523  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  14522 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 14423  T
Q  547 aga------aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatt 640  Q
    | |      |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  14422 atatatatgaatataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaatt 14323  T
Q  641 tgttgttgtgtttattgatga 661  Q
     || ||||||| |||||||||    
T  14322 cgtggttgtgtctattgatga 14302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 5696 - 5839
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5696 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 5795  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  5796 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 10680 - 10991
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  10680 ttgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaata 10779  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  10780 tttttagtaagatcgacttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 10879  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||     
T  10880 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggta 10979  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||||||||||    
T  10980 tttattgatgat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 79725 - 80036
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  79725 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaaga 79824  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  79825 ttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacga 79924  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  79925 atacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagta 80024  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  80025 ttcattgatgat 80036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 2285 - 1971
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  2285 gaggttgtgtatatattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgca 2186  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  2185 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 2086  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  2085 atgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggt 1986  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  1985 tgtgtttattgatga 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 352 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 29343 - 29033
Alignment:
Q  352 tgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggt 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| | | |    
T  29343 tgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggat 29244  T
Q  452 gttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaa 551  Q
     ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  29243 tttcagtaagattgacttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgag 29144  T
Q  552 tccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgt 651  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29143 tacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgt 29044  T
Q  652 ttattgatgat 662  Q
    |||||||||||    
T  29043 ttattgatgat 29033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 53461 - 53146
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53461 gaggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgca 53362  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53361 aaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 53262  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | | |||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  53261 acgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggt 53162  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| ||||||||||||    
T  53161 tgtatttattgatgat 53146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 5165 - 4851
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  5165 gaggttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgca 5066  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  | |    
T  5065 cgtgtgtttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttact 4966  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  4965 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagt 4866  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  4865 tgtgtttattgatga 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 350 - 662
Target Start/End: Original strand, 42000 - 42312
Alignment:
Q  350 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 449  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | || || || ||||||||||||||||||||||||       
T  42000 gttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcattt 42099  T
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    ||||||   ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||      
T  42100 gtgttctttaagattgacttaagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacg 42199  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    |||    ||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  42200 aatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgt 42299  T
Q  650 gtttattgatgat 662  Q
    |||||| ||||||    
T  42300 gtttatagatgat 42312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 110046 - 109732
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  110046 gaggttatgcattgattatcgtaagttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgca 109947  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  109946 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcatt 109847  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  109846 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggt 109747  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  109746 tgtgtttattgatga 109732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 54891 - 55169
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  54891 attgattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 54990  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||| | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||  ||    
T  54991 gcaagattgatttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataa 55090  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| ||| |||||    
T  55091 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggat 55169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Original strand, 4983 - 5294
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    |    
T  4983 ttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtg 5082  T
Q  451 tgttca-acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  5083 tgttcagacaa-attgatttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatg 5181  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5182 agtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgt 5281  T
Q  650 gtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||    
T  5282 gtttattgatgat 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25525 - 25214
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  25525 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaag 25426  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || |  || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  25425 tttttagtaaaattgacttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacga 25326  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    || ||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||     
T  25325 atacaaagtgatgcctttcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggta 25226  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    ||||| ||||||    
T  25225 tttatagatgat 25214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19768 - 19454
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||     
T  19768 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgct 19669  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19668 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 19569  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  19568 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggt 19469  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    | |||||||||||||    
T  19468 tatgtttattgatga 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42112 - 41798
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  42112 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgct 42013  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  42012 cgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcact 41913  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  41912 atgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggt 41813  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  41812 tgtgtttattgatga 41798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 610
Target Start/End: Original strand, 51248 - 51498
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  51248 gattatcgttagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 51347  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  51348 agattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagt 51447  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     ||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  51448 catgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaa 51498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 55737 - 56051
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  55737 gaggttgtgcattgattaccgtcagttaaacaaagttatgataaagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgca 55836  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  55837 aagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaattcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcatt 55936  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  ||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  55937 acgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggt 56036  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  56037 tgtattcattgatga 56051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 46937 - 47239
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||| |||||||||||   ||||| |  |    
T  46937 gattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagta 47036  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    | ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||  |||||    
T  47037 aaattgattggaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggt 47136  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47137 gatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgat 47236  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  47237 gat 47239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 350 - 662
Target Start/End: Original strand, 9354 - 9662
Alignment:
Q  350 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 449  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9354 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaag 9453  T
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    || ||     | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  9454 gttttttgttaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacg 9553  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||   ||||||||| |||||    
T  9554 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgt 9649  T
Q  650 gtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||    
T  9650 gtttattgatgat 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 350 - 662
Target Start/End: Original strand, 19568 - 19876
Alignment:
Q  350 gttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 449  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19568 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaag 19667  T
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    || ||     | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  19668 gttttttgttaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacg 19767  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||   ||||||||| |||||    
T  19768 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgt 19863  T
Q  650 gtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||    
T  19864 gtttattgatgat 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16528 - 16214
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  16528 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 16429  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16428 tgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 16329  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16328 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 16229  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  16228 tgtgtttattgatga 16214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 490
Target Start/End: Original strand, 7773 - 7894
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  7773 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7872  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  7873 tgaggtcaggatatcatcagat 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 49520 - 49206
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | || ||||  || ||||||||||||||||||||     
T  49520 gaggttatgtattgattaccgttagttgaataaagtgacgataaagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgct 49421  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  49420 cgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcact 49321  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  49320 atgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 49221  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  49220 tgtgtttattgatga 49206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 49765 - 50079
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  49765 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgct 49864  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49865 cgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcatt 49964  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  49965 atgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 50064  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  50065 tgtgtttattgatga 50079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 48404 - 48718
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  48404 gaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacagtaaagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 48503  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  48504 aagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcatt 48603  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  48604 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 48703  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  48704 tgtattcattgatga 48718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10890 - 10602
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10890 gaggttatgtattgattatcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 10791  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | || || || || ||||| || |    
T  10790 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcact 10691  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  10690 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 10602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 17352 - 17064
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17352 gaggttatgtattgattatcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 17253  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| || |    
T  17252 cgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcact 17153  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  17152 atgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggat 17064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 45557 - 45279
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||| ||||||| || || || |||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  45557 attgattatcgacaggtgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 45458  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  45457 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 45358  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  45357 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 45279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 51226 - 50912
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  51226 gaggttgtgtatagattaccgtcagctgaagaaagtgacgataaagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgct 51127  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51126 cttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 51027  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||    
T  51026 atgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggt 50927  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  50926 tgtgtttattgatga 50912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 4595 - 4280
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  4595 gaggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgca 4496  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4495 cctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatt 4396  T
Q  547 agaaat---ccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgt 643  Q
    |  |||     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4395 atgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgt 4296  T
Q  644 tgttgtgtttattgat 659  Q
     |||||||||||||||    
T  4295 ggttgtgtttattgat 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1689
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||||     
T  1375 gaggttatgcatttattatcgtcagttaaataaagtgacgataaagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgct 1474  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||  |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  1475 cgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacact 1574  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  1575 atgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggt 1674  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  1675 tgtgtttattgatga 1689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Original strand, 1442 - 1749
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  1442 tgcattgaatatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacagacatccgctcccgaggattgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttt 1541  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    |||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  1542 tcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1641  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | ||     
T  1642 taaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattc 1741  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  1742 attgatga 1749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 415 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10319
Alignment:
Q  415 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgca 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  515 gaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||| || ||||| || ||  |||| |||||  | |  ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 10319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 351 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 11240 - 10930
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   |    
T  11240 ttgtgtatagattaccttcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcg 11141  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |    
T  11140 tgttcaacaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatga 11041  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  11040 atataaagtgatgcctttcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtg 10941  T
Q  651 tttattgatga 661  Q
    |||||||||||    
T  10940 tttattgatga 10930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 373 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12184 - 11894
Alignment:
Q  373 tgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt-ga 471  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||   ||||| |  || ||||| || ||    
T  12184 tgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttga 12085  T
Q  472 ggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcgg 571  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||||||| | |||||    
T  12084 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcgg 11985  T
Q  572 tgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11984 tgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgat 11894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 369 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16794
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | | ||| || ||| | ||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaa 16794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 114975 - 114661
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  114975 gaggttgtgtattgactaccatcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgca 114876  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    ||| | || |  || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  114875 aagatttttagtaaaattgacttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcatt 114776  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  114775 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggt 114676  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  114675 tgtattcattgatga 114661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 608
Target Start/End: Original strand, 94784 - 95045
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  94784 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgct 94883  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  94884 aaagtttttagcaagattgacttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcact 94983  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatg 608  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  94984 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatg 95045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 635
Target Start/End: Original strand, 107723 - 107989
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||  || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || |||||||| ||| |||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggat 107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 64409 - 64712
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  || || ||||||||||||| |||     
T  64409 gaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgct 64508  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  64509 cgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcatt 64608  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| ||||||           |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  64609 acgaatataaggtgatgccgttcg-----------gcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggt 64697  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    |||||||||||||||    
T  64698 tgtgtttattgatga 64712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 354 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 21258 - 20951
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |    
T  21258 tgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagattt 21159  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | |  || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||     
T  21158 ttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaata 21059  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgttt 653  Q
     |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||     
T  21058 taaggtgatgcttttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattc 20959  T
Q  654 attgatga 661  Q
    ||||||||    
T  20958 attgatga 20951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 567 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 25207 - 25113
Alignment:
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  25207 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatga 25113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 477 - 791
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  477 gaggttgtgcattgactaccgtcaactgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgca 576  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  577 aaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcatt 676  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||    
T  677 acgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggt 776  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| || ||||||||    
T  777 tgtattcattgatga 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 365 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 7140 - 6852
Alignment:
Q  365 ccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagatt 464  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||        |||| ||||||||||||    || |||   ||||||    
T  7140 ccgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatg--------gatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagatt 7049  T
Q  465 gacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgt 564  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||     
T  7048 gatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgc 6949  T
Q  565 cgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6948 ctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatga 6852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 414 - 640
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10057
Alignment:
Q  414 attgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgc 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  514 agaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccg 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtatatgaaccg 10030  T
Q  614 aattttccatgcttttctggataaatt 640  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10031 aatttttcatgcttttctggttaaatt 10057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 347 - 596
Target Start/End: Original strand, 18373 - 18622
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18373 gaggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgca 18472  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18473 aaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcatt 18572  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttc 596  Q
    |  ||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18573 acgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccaggtgtgttc 18622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 347 - 448
Target Start/End: Original strand, 5739 - 5840
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5739 gaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgca 5838  T
Q  447 aa 448  Q
    ||    
T  5839 aa 5840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 661
Target Start/End: Original strand, 176234 - 176548
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||| ||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  176234 gaggttgtgtatagattactgtcacctgaataaagtggcgataaagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 176333  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | || |||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  176334 cgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattagattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacatt 176433  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||     ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||   ||||||||    
T  176434 acgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgt 176533  T
Q  647 tgtgtttattgatga 661  Q
    ||| |||||||||||    
T  176534 tgtatttattgatga 176548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7637 - 7374
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7637 gaggttgtgtgttgactatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgct 7538  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||    
T  7537 aatgttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacatt 7438  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |  | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  7437 atgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaa 7374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 547
Target Start/End: Original strand, 114928 - 115128
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114928 gaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 115027  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  115028 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacatt 115127  T
Q  547 a 547  Q
    |    
T  115128 a 115128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 8436 - 8121
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8436 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 8337  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || |||||| |||    
T  8336 agtgttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagatt 8237  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  8236 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 8137  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| || |||||||||    
T  8136 tgttttcattgatgat 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24449
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||  | || |||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24471  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    | || || || |||||||||||    
T  24470 taagatcaggatatcatcagat 24449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 217314 - 217573
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  217314 ttgtgtattgattatcgacaattgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 217413  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    ||||   ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  217414 tgttttgcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatga 217513  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  217514 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaa 217573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 5779 - 6057
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5779 gaggttatgtattgattatcgacaattgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgca 5878  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  5879 cgtgtgtttagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacatt 5978  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    || |||    ||||||| | ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  5979 aggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgc 6057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11374 - 11188
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  11374 gaggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgct 11275  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 533  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11274 cgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 58427 - 58117
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  58427 ttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaag 58328  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  58327 tttttagcaagattgatttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 58228  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||| | || || ||||||    
T  58227 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtg 58128  T
Q  651 tttattgatga 661  Q
    ||||| |||||    
T  58127 tttatcgatga 58117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 351 - 519
Target Start/End: Original strand, 17960 - 18128
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17960 ttgtgtattgattaccatcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 18059  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaaga 519  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||    
T  18060 ttttcagcaagattgatttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaga 18128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 414 - 662
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195692
Alignment:
Q  414 attgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgc 513  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  514 agaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccg 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | || |||||||| ||||| || | ||| || |||||||||||||| ||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  614 aattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
     || |||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgat 195692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 636
Target Start/End: Original strand, 14369 - 14658
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  14369 gaggttatgcattgattatcgacacttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgca 14468  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  14469 cgtgtgttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacatt 14568  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggata 636  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  14569 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggata 14658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 24839 - 25123
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  24839 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtg 24938  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| ||  |    
T  24939 ttttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatga 25038  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  25039 atataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 25123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 6981 - 7265
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |    
T  6981 ttgtgtattgattatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 7080  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||  |    
T  7081 tgtttagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatga 7180  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||||    
T  7181 gtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggat 7265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 370 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 56148 - 55908
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  56148 agttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgattt 56049  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  | |  || |||||| | |||    
T  56048 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 55949  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  55948 ggtgttacaaatgcccctggagtgtttatggagtacatgaa 55908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 41044 - 40760
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41044 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 40945  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||  |    
T  40944 ttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatga 40845  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  40844 gtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 40760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 74764 - 74480
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  74764 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 74665  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||  |    
T  74664 ttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatga 74565  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |  || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  74564 gtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 74480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 501
Target Start/End: Original strand, 8716 - 8870
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||  | || || |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  8716 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgct 8815  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaagg 501  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  8816 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagataagggtaaagg 8870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 462 - 661
Target Start/End: Original strand, 6 - 205
Alignment:
Q  462 attgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtga 561  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||    
T  6 attgacttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtga 105  T
Q  562 tgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  106 tgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatga 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 20650 - 20391
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    
T  20650 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtg 20551  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||||||  |    
T  20550 ttttcagcaagattgacttgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatga 20451  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  20450 gtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaa 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 10631 - 10909
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10631 gaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 10730  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10731 cgtgtattcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 10830  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  10831 acgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgc 10909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 357 - 625
Target Start/End: Original strand, 24198 - 24466
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  24198 attgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttta 24297  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||||||||| |  ||||||||  |||| || || || || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| |||| || ||||        
T  24298 gcaagattgacttgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattc 24397  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
     |||||| | ||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24398 agtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 24466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 625
Target Start/End: Original strand, 16977 - 17101
Alignment:
Q  501 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatgg 600  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  16977 gatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 17076  T
Q  601 agtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||    
T  17077 agtacttgaatcgtatttttcatgc 17101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 9344 - 9039
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  9344 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 9245  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  9244 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 9145  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||     
T  9144 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 9045  T
Q  657 gatgat 662  Q
    ||||||    
T  9044 gatgat 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 369 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2700
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| |||||| || |    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||| || ||||||||||| ||  |||  || |||||| ||||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| || || | || || ||||| ||||||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 347 - 552
Target Start/End: Original strand, 22076 - 22281
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22076 gaggttgtgtatagattaccggaagttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 22175  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22176 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacatt 22275  T
Q  547 agaaat 552  Q
    | ||||    
T  22276 acaaat 22281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 354 - 635
Target Start/End: Original strand, 2402 - 2683
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||    
T  2402 tgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgt 2501  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatc 553  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  | |     
T  2502 ttagcaagattgatttgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagta 2601  T
Q  554 caaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || |||||| | |  |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  2602 taaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 369 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151353
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 151353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 87081 - 86870
Alignment:
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaga 549  Q
    |||||||  |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  87081 gtgttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattaca 86982  T
Q  550 aatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgt 649  Q
    |||    | ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||| | || ||  |||||||||| |    
T  86981 aatattcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttat 86882  T
Q  650 gtttattgatga 661  Q
    |||||| |||||    
T  86881 gtttatagatga 86870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 391 - 635
Target Start/End: Original strand, 1 - 245
Alignment:
Q  391 agaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  491 aaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctgga 590  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||||||  | |  || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  591 gtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 669 - 957
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  669 gaggttgtgtattgattaccgacagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaa 768  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||||||||    
T  769 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacatt 868  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  | |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  869 atgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 3315 - 3035
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3315 gaggttatgtattgattatcggcagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgca 3216  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  3215 cgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacatt 3116  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctt 627  Q
    | ||||     |||||| | ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||    
T  3115 acaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 3035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 7553 - 7837
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7553 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatg 7652  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | |||||||||||  |    
T  7653 ttttcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatga 7752  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  7753 gtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 7837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 37710 - 37998
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37710 gaggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 37809  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
     | || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || |    
T  37810 catgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcact 37909  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||| |||||    
T  37910 atgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggat 37998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 23121 - 22843
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23121 gaggttgtgtatagattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaa 23022  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
        |||| | ||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021 tgtctgtttagcaagattgatttgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacatt 22922  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||    ||||||| | |||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  22921 acgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 22843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 16570 - 16263
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16570 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 16471  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || | ||| || ||  |    
T  16470 ttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatga 16371  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
    ||  || || ||| | ||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || ||||||    
T  16370 atataaagttatgcctttccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtg 16271  T
Q  651 tttattga 658  Q
    ||||||||    
T  16270 tttattga 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2828 - 2549
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |   || || |    
T  2828 attgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgttttta 2729  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  2728 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 2629  T
Q  557 ggtgatgtcgtt-cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  2628 agttatgcctttccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 2549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 347 - 625
Target Start/End: Original strand, 8924 - 9202
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8924 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 9023  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9024 cgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacatt 9123  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
    |  |||     |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  9124 atgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1448 - 1324
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1448 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 1349  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttga 471  Q
       ||||| | ||||||||| ||||    
T  1348 cgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6752 - 6628
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6752 gaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgca 6653  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttga 471  Q
       ||||| | ||||||||| ||||    
T  6652 cgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 347 - 547
Target Start/End: Original strand, 15868 - 16068
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15868 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 15967  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  15968 catgtgttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacatt 16067  T
Q  547 a 547  Q
    |    
T  16068 a 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14596
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14884 gaggttatgcattgattaccgtcaagtgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtaca 14785  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||| ||  | ||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  14784 cgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacatt 14685  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || |||||| | |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  14684 atgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggat 14596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 370 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 6024
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||  |||  || |||||||| |||    
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaa 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 370 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 13154
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| ||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||  |||  || |||||||| |||    
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaa 13154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11417
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11133 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 11232  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || ||  |    
T  11233 ttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatga 11332  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  11333 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 11417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 36751 - 36449
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  36751 gattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 36652  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  36651 agattaatttgagattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagt 36552  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
     ||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| |||||||||    
T  36551 tatgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgat 36452  T
Q  660 gat 662  Q
    |||    
T  36451 gat 36449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 54047 - 53788
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54047 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 53948  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||| ||||| |  ||  |    
T  53947 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatga 53848  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  53847 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 53788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 31285 - 31010
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    
T  31285 gattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagca 31186  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggt 559  Q
    ||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||  ||| ||| ||    
T  31185 agattaatttgagattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagt 31086  T
Q  560 gatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     ||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  31085 tatgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13885
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaa 448  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13788 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaa 13885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 3848 - 3533
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3848 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 3749  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| |||||| ||  |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||||||||    
T  3748 agtgttttcagcaagatagatctgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacatt 3649  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  | |  || || ||| | ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||   ||||| ||    
T  3648 atgagtataaagttatgcctttcggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggt 3549  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||| || |||||||||    
T  3548 tgttttcattgatgat 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9772 - 9494
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   || ||||    
T  9772 attgattaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttca 9673  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  ||    
T  9672 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 9573  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  9572 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 9494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 507 - 659
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12501
Alignment:
Q  507 gatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtata 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  607 tgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgat 659  Q
     ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgat 12501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 557 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 44989 - 44885
Alignment:
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44989 ggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttatt 44890  T
Q  657 gatga 661  Q
    |||||    
T  44889 gatga 44885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 1413 - 1098
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1413 gaggttttgtatagattatcggcagttgaacaaagtgacaataaattacaggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgca 1314  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       |||||||  |||||||| || || || ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  1313 cgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacatt 1214  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    | ||||    ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  1213 acaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgt 1114  T
Q  647 tgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||||| ||||||    
T  1113 tgtgtttatagatgat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 354 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 96
Alignment:
Q  354 tgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgt 453  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |    
T  289 tgcattgattattgtcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttt 190  T
Q  454 tcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatta 547  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  189 tcaacaagatagatttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacatta 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 370 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3709
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||| || ||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||  |||  || |||||| | |||    
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggat 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15399
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15111 gaggttatgcattgattatcgacggttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 15210  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
       ||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||    
T  15211 cgtgtgtttagcaagattgctttgagatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacatt 15310  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |  |||  || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  15311 atgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggat 15399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18054 - 17777
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   || ||||    
T  18054 attgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttca 17956  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||  | |  ||    
T  17955 gcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataa 17856  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  17855 ggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 17777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 662
Target Start/End: Original strand, 16214 - 16354
Alignment:
Q  522 gcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttcc 621  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16214 gcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcctagagtatatgaaccgaattttcc 16313  T
Q  622 atgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16314 atgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgat 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Original strand, 14018 - 14302
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14018 ttgtgtattgactatcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 14117  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || ||||| || ||  |    
T  14118 ttttcagcaagattgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatga 14217  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||  || || ||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  14218 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggat 14302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 357 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40255
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  40559 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttca 40460  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || ||  |||  ||    
T  40459 gcaagattgatttgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataa 40360  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttatt 656  Q
     || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || |||||||||||     
T  40359 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatc 40260  T
Q  657 gatga 661  Q
    |||||    
T  40259 gatga 40255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 370 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 894
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |  ||||||||| |||||    
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggat 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 522 - 662
Target Start/End: Original strand, 8873 - 9013
Alignment:
Q  522 gcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttcc 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  8873 gcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttcc 8972  T
Q  622 atgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8973 atgcttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgat 9013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 527
Target Start/End: Original strand, 4779 - 4959
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4779 gaggttgtgcatagattaccgtcaactgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgca 4878  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttt 527  Q
       || |||| ||| ||| | |||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4879 cgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctgattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagccttt 4959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 357 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 17282 - 17015
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |    
T  17282 attgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgttta 17183  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
      |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||        
T  17182 gtaagattaatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattc 17083  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc 625  Q
     |||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  17082 agtgat-cctttcggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgc 17015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 213
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  471 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 372  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||  |    
T  371 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatga 272  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatga 609  Q
     | |||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  271 gtacaaggttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatga 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 357 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21651 - 21353
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   || || |    
T  21651 attgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgttttta 21552  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||  || ||||||||||| || || || || || |||||  | ||  |||  ||    
T  21551 gcaagattgatttgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataa 21452  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||    
T  21451 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttat 21353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 85124 - 85383
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  85124 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaag 85223  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||  |    
T  85224 ttttcagcaagatagatttgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatga 85323  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  85324 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 85383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 635
Target Start/End: Original strand, 85709 - 85974
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||  |||||||| ||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttc 569  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |||  || || ||| | ||     
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 85974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 132379 - 132522
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  132379 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 132478  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  132479 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 132522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26183 - 26044
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||  | || ||||||    
T  26183 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatgtatcatcttgttggtgca 26084  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatc 486  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||    
T  26083 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatc 26044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 29815 - 30093
Alignment:
Q  357 attgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttca 456  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  29815 attgactatcgttagttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttca 29914  T
Q  457 acaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaa 556  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||| ||||||| || || |  || |||||||| || ||  |||  ||    
T  29915 gcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataa 30014  T
Q  557 ggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     || ||| | || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  30015 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 30093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 347 - 649
Target Start/End: Original strand, 703 - 1001
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  703 gaggttgtgtattgattatcgacagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgca 802  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacatt 546  Q
    |  || |||| |||||| || |||||     |    ||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |    
T  803 agtgttttcagcaagatagatttgagaaagtg----cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcact 898  T
Q  547 agaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgt 646  Q
    |  |||  || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| ||||| | ||||| ||    
T  899 atgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggt 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8202
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaa 8202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17398
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgact 468  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  469 tgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgtt 568  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| || ||  | | ||| || ||| | ||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  569 cggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaa 17398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 551
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |    
T  862 ttgtgtattgactatcgacagctgaataaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtg 763  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||  |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||| |  |  |||||||||||  |    
T  762 ttttccgcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatga 663  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     |  ||||| ||| | ||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||| ||||| | || || |||||     
T  662 gtataaggtaatgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtt 563  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    |||||| |||||    
T  562 tttatttatgat 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 21014 - 20703
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  21014 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaag 20915  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  20914 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 20815  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     | ||| |  ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||| ||| |||||  |||||| |||||     
T  20814 gtacaaagatatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgtt 20715  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  20714 ttcattgatgat 20703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 36438 - 36127
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  36438 ttgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaag 36339  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  36338 ttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatga 36239  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtg 650  Q
     |  || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||| ||| |||||  |||||| |||||     
T  36238 gtataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgtt 36139  T
Q  651 tttattgatgat 662  Q
    || |||||||||    
T  36138 ttcattgatgat 36127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 103637 - 103361
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||| ||||||||||||   |    
T  103637 ttgtgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaa--------ttgatggatcaattagtgggtgcacgtg 103546  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| || || |||||||| ||  |    
T  103545 ttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatga 103446  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
     |  || |||||| | ||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  103445 gtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggat 103361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 520
Target Start/End: Original strand, 8675 - 8805
Alignment:
Q  390 aagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga 489  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8675 aagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggttatcaccaga 8774  T
Q  490 taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8775 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 8805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 347 - 520
Target Start/End: Original strand, 15884 - 16058
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15884 gaggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15983  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcaga-taaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
       || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||   || ||||| ||||||||||||||    
T  15984 cgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagac 16058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8783 - 8615
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8783 ttgtgtattgactatcgacagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaag 8684  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | |||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  8683 t-ttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 520
Target Start/End: Original strand, 13105 - 13274
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13105 ttgtgtattgattatccgcagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtg 13204  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    | ||||  |  || || ||||| || |||||||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13205 ttttcagaagaatagatttgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 475
Target Start/End: Original strand, 9844 - 9972
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  9844 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgct 9943  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtc 475  Q
       ||||| |  |||||||||||||||||    
T  9944 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtc 9972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 475
Target Start/End: Original strand, 17511 - 17639
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  17511 gaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgct 17610  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtc 475  Q
       ||||| |  |||||||||||||||||    
T  17611 cgtgtgtttagtaagattgacttgaggtc 17639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 567 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 1520 - 1425
Alignment:
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  1520 ttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgat 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 610
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1535
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaagg 450  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  1276 ttgtgtattgactatcgacagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaag 1375  T
Q  451 tgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaa 550  Q
    | |||| |||||| |  ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| |||||  |    
T  1376 ttttcagcaagatagctttgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatga 1475  T
Q  551 atccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaa 610  Q
     | ||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  1476 gtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaa 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 1179 - 1096
Alignment:
Q  578 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1179 taatgtgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 661
Target Start/End: Original strand, 378 - 444
Alignment:
Q  595 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  378 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 661
Target Start/End: Original strand, 4698 - 4764
Alignment:
Q  595 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4698 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 4764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 661
Target Start/End: Original strand, 414 - 480
Alignment:
Q  595 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatga 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  414 tcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatga 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 558 - 662
Target Start/End: Original strand, 14814 - 14918
Alignment:
Q  558 gtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattg 657  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14814 gtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattg 14913  T
Q  658 atgat 662  Q
    |||||    
T  14914 atgat 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25810 - 25667
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25810 gaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 25711  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  25710 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 25667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15324 - 15181
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15324 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgca 15225  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  15224 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11207
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | || ||| ||    
T  11064 gaggttgtgtgtggattatcggcacttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggttca 11163  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     |||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  11164 gaggtgttcagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 484
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11186
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaa-gttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaag 449  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  11052 ttgtgtatcgattaacatcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacat 11151  T
Q  450 gtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatca 484  Q
    || |||| |||||| || ||||| || ||||||||    
T  11152 gttttcagcaagatagatttgagatcaggttatca 11186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1917
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagat 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 1511 - 1654
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1511 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgca 1610  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| |||| ||  || |||||||||||    
T  1611 gaggtgtttagtaagattgatttgaagttaggatatcatcagat 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Original strand, 13528 - 13658
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  |    
T  13528 gattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagta 13627  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13628 agattgaattgagatcaggatatcatcagat 13658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 508 - 625
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2017
Alignment:
Q  508 atatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatat 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  608 gaaccgaattttccatgc 625  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgc 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 436
Target Start/End: Original strand, 12250 - 12335
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagtt 436  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12250 ttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 597 - 662
Target Start/End: Original strand, 8923 - 8988
Alignment:
Q  597 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8923 atggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgat 8988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7569 - 7426
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| | || ||||||    
T  7569 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgca 7470  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7469 taggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 627 - 484
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| | | || ||||||    
T  627 gaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgca 528  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  527 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcaccagat 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 34501 - 34358
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  34501 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgca 34402  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  34401 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 34358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 434
Target Start/End: Original strand, 41399 - 41482
Alignment:
Q  351 ttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 434  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41399 ttgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 416
Target Start/End: Original strand, 4060 - 4129
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaatt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  4060 gaggttgtgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaatt 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 487
Target Start/End: Original strand, 1865 - 1982
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| ||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 1964  T
Q  470 gaggtctggttatcatca 487  Q
    ||| || || ||||||||    
T  1965 gagatcgggatatcatca 1982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26730 - 26600
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || ||||||||||  || || ||||||||| ||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||  ||||  || | |||| ||    
T  26730 gattatcggcagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagttagtgcggagatattcagca 26631  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  26630 agattgatttaaggtcaggatatcttcagat 26600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Original strand, 859 - 979
Alignment:
Q  370 agttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgactt 469  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| |  |||||||| ||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 958  T
Q  470 gaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||| || || |||||||||||    
T  959 gagatcgggatatcatcagat 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16474 - 16334
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | || |||||     
T  16474 gaggttgtgtgtggattatcgttagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcg 16375  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatca 487  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  16374 gaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatca 16334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7160 - 7017
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  7160 gaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgca 7061  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  7060 gaggtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 7017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 520
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28545
Alignment:
Q  426 atggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 520  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  28451 atggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 4387 - 4295
Alignment:
Q  570 ggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4387 ggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgat 4295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 403
Target Start/End: Original strand, 2817 - 2873
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatcc 403  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  2817 gaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 490
Target Start/End: Original strand, 693 - 836
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  693 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcg 792  T
Q  447 aaggtgttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
     |  |||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  793 gaaatgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcagat 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 401
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 446  Q
    |||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||   |||||||| |||||||||||  | || ||||||    
T  508 gaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatcaactggttggtgca 409  T
Q  447 aaggtgtt 454  Q
     |||||||    
T  408 gaggtgtt 401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 490
Target Start/End: Original strand, 7143 - 7273
Alignment:
Q  360 gattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaaca 459  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  |    
T  7143 gattatcggcagttgaacaaagtgacaattaagaatcggtatccgcttccaaggatttatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagta 7242  T
Q  460 agattgacttgaggtctggttatcatcagat 490  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||    
T  7243 agattgatttaagatcaggatatcatcagat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 655
Target Start/End: Original strand, 23095 - 23272
Alignment:
Q  478 gttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaatccaaggtgatgtcgttcggtgttac 577  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||  | | ||| || ||| | |||||||||||    
T  23095 gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 23194  T
Q  578 taatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttat 655  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || |||||||||||    
T  23195 caatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttat 23272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  369 cagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagtt 436  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 89892 - 89773
Alignment:
Q  371 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcaacaagattgacttg 470  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || |||||  | ||||| |  |||||||| |||    
T  89892 gttgaataaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttcatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatttg 89793  T
Q  471 aggtctggttatcatcagat 490  Q
    || || || |||||||||||    
T  89792 agatcaggatatcatcagat 89773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 662
Target Start/End: Original strand, 1808 - 1894
Alignment:
Q  576 actaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgat 662  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1808 actaatgcaccaggagtgttcatggagcacatgaatagaattttccatccctacctagataaatttgtggttgtctttatagatgat 1894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8324 - 8142
Alignment:
Q  453 ttcaacaagattgacttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattagaaat 552  Q
    |||| ||||||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || || |  |  ||||| || ||  |||    
T  8324 ttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccatattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatgaat 8225  T
Q  553 ccaaggtgatgtcgttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
      || || ||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||    
T  8224 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggat 8142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36353 - 36292
Alignment:
Q  347 gaggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttc 408  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  36353 gaggttatgcattgattattgtcaattgaataaggttacgataaacaacaggtatccacttc 36292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 567 - 635
Target Start/End: Original strand, 450 - 518
Alignment:
Q  567 ttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 635  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  450 ttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2267
Alignment:
Q  374 gaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgtgaattgatgacttgatggatcag 434  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||    
T  2327 gaacaaagtgacgattaagaatcggtatccactcccaaggattgatgatttgatggatcag 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University