View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20433_high_1 (Length: 821)

Name: NF20433_high_1
Description: NF20433
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20433_high_1
NF20433_high_1
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (10-804)||(8654237-8655031)
chr7 (10-804)||(8667206-8668000)
chr7 (12-804)||(10493961-10494753)
chr7 (21-804)||(13333043-13333826)
chr7 (16-803)||(8659156-8659943)
chr7 (12-803)||(1301249-1302044)
chr7 (23-804)||(8585293-8586074)
chr7 (300-804)||(8628609-8629113)
chr7 (412-804)||(8671217-8671609)
chr7 (73-802)||(17267789-17268518)
chr7 (47-804)||(27830462-27831219)
chr7 (88-804)||(8646742-8647455)
chr7 (73-799)||(17260091-17260817)
chr7 (247-724)||(8636010-8636487)
chr7 (72-804)||(3147113-3147853)
chr7 (49-804)||(6789338-6790093)
chr7 (194-804)||(8545604-8546213)
chr7 (286-705)||(8602037-8602456)
chr7 (194-596)||(8382671-8383073)
chr7 (194-672)||(8576297-8576775)
chr7 (194-705)||(7877419-7877930)
chr7 (297-804)||(8581774-8582281)
chr7 (194-671)||(8570282-8570759)
chr7 (194-724)||(29581508-29582038)
chr7 (298-705)||(8590713-8591120)
chr7 (514-775)||(8640165-8640424)
chr7 (199-419)||(29577644-29577864)
chr7 (51-306)||(8616509-8616764)
chr7 (297-419)||(8559407-8559529)
chr7 (462-569)||(8538275-8538382)
chr7 (298-584)||(8609992-8610278)
chr7 (456-641)||(39985879-39986064)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (12-803)||(9335479-9336270)
chr4 (26-804)||(30775055-30775833)
chr4 (250-804)||(35132475-35133027)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (34-804)||(16657104-16657874)
chr2 (51-804)||(16661579-16662332)
chr2 (70-804)||(7542073-7542807)
chr2 (72-804)||(43625261-43625991)
chr2 (49-804)||(12234515-12235270)
chr2 (49-804)||(12258168-12258923)
chr2 (49-794)||(14703234-14703979)
chr2 (99-803)||(12244994-12245698)
chr2 (99-804)||(11999283-11999975)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (34-804)||(4678145-4678914)
chr1 (49-796)||(15594860-15595610)
chr1 (85-804)||(34466380-34467091)
chr1 (50-134)||(52549269-52549353)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (47-350)||(28219742-28220045)
chr5 (466-804)||(28220194-28220532)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (371-804)||(43744997-43745428)
chr8 (49-343)||(43744642-43744936)
chr8 (194-419)||(12528475-12528700)
chr8 (465-640)||(12528746-12528921)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (291-802)||(28910650-28911161)
chr6 (297-353)||(11133068-11133124)
chr6 (459-540)||(11170806-11170887)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 775; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 775; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 804
Target Start/End: Original strand, 8654237 - 8655031
Alignment:
Q  10 acatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654237 acatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatt 8654336  T
Q  110 tagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654337 tagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctc 8654436  T
Q  210 acaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgtta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654437 acaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgtta 8654536  T
Q  310 tcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccac 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654537 tcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccac 8654636  T
Q  410 caagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaat 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654637 caagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaat 8654736  T
Q  510 gacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgat 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8654737 gacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggtgat 8654836  T
Q  610 ccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaa 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8654837 ccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttgacctttgtacttaacagtaa 8654936  T
Q  710 tcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654937 tcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 8655031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 804
Target Start/End: Original strand, 8667206 - 8668000
Alignment:
Q  10 acatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8667206 acatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaactatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatt 8667305  T
Q  110 tagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctc 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8667306 tagcacgagtaattgatgaacaaaagtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctc 8667405  T
Q  210 acaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgtta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  8667406 acaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgtta 8667505  T
Q  310 tcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccac 409  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  8667506 tcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccac 8667605  T
Q  410 caagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaat 509  Q
    | |||||||| || |||||||| ||  |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8667606 ccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaat 8667705  T
Q  510 gacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgat 609  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||     
T  8667706 gacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacggcattcttgaccggcgac 8667805  T
Q  610 ccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaa 709  Q
    || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8667806 cccagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttaacagtaa 8667905  T
Q  710 tcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||    
T  8667906 tcataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaacggggtcactaaacttcctaccaattaac 8668000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10494753 - 10493961
Alignment:
Q  12 atcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaattta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10494753 atcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttg 10494654  T
Q  112 gcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10494653 gcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcac 10494554  T
Q  212 aggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  10494553 aggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattctgttatc 10494454  T
Q  312 aaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccacca 411  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10494453 gaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccaccc 10494354  T
Q  412 agatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatga 511  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10494353 agatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatga 10494254  T
Q  512 cgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatcc 611  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| || || ||    
T  10494253 cattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttgaagtaagccggcacagtaacaacagcattcttgactggtgaccc 10494154  T
Q  612 aaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatc 711  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  10494153 caaatatgcctctgcaacctctcgcatctttataaggaccatagatgatatttcctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgtacttagcggtaatc 10494054  T
Q  712 atgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10494053 ataggtttgtcattgacacctgaagtaaccttgaatggccacaacattatatcgttttgaacaaccggatcactaaacttcctgccaattaac 10493961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 13333826 - 13333043
Alignment:
Q  21 atcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtg 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13333826 atcactcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtg 13333727  T
Q  121 attgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13333726 attgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttc 13333627  T
Q  221 tcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13333626 tcaacctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttc 13333527  T
Q  321 tccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaat 420  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13333526 tcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaag 13333427  T
Q  421 accaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtc 520  Q
    || |||||||| || ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |    
T  13333426 acaaaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggc 13333327  T
Q  521 cagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgc 620  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || || |  |||||    
T  13333326 cagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcacagtaacaacggcattcttgactggtgaccccatatatgc 13333227  T
Q  621 ctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttg 720  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||| || |||    
T  13333226 ctctgcaacctctcgcatctttgtaaggaccatagatgatatttcctcggcacaaaagtgcttctcttgacccttgcacttagcggtaatcataggcttg 13333127  T
Q  721 tcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13333126 tcgttgacaccagaagtaaccttgaatggccacaacattatatcattttgaacaaccggatcactaaacttcctaccaattaac 13333043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 803
Target Start/End: Original strand, 8659156 - 8659943
Alignment:
Q  16 tcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcac 115  Q
    ||||||||| || | | ||| |||||||| || |||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||  | ||||    
T  8659156 tcaatatcactcatctgtatttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcac 8659255  T
Q  116 gagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggc 215  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8659256 gagtgattaatgaacagaagtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggc 8659355  T
Q  216 agttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8659356 agttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaag 8659455  T
Q  316 tcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagat 415  Q
    || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659456 tcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagat 8659555  T
Q  416 caaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgtt 515  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  8659556 caaagaccaaaatattttgtttaccatcacagtcacctctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacatt 8659655  T
Q  516 aagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaagg 615  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| || || || ||    ||     
T  8659656 aaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaactatgcaggcactgtaacaacagcattcttcacaggtgacattaga 8659755  T
Q  616 tatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgg 715  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||     
T  8659756 tatgtctctgcaacttctcgcatttttgtaagtaccatagatgatatttcctccgcacaaaagtgcttctcctgacccttgtactgaacattaatcatga 8659855  T
Q  716 gtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaa 803  Q
    ||||||| || |||||||   ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8659856 gtttgtcgttcacaccagcgataaccttgaatggccacaacatcatgtctttttgaacaactgaatcactaaacttcctaccaattaa 8659943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 12 - 803
Target Start/End: Original strand, 1301249 - 1302044
Alignment:
Q  12 atcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaattta 111  Q
    |||||| |||||| || || |||| |||||||| || |||||||| |||||  | ||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||     
T  1301249 atcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttg 1301348  T
Q  112 gcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcac 211  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1301349 gcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcac 1301448  T
Q  212 aggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatc 311  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  1301449 acgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatc 1301548  T
Q  312 aaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccacca 411  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1301549 aaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgcca 1301648  T
Q  412 agatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcag----taggttcattgagtatccga 507  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    |||||||||| | |||| ||    
T  1301649 aggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaaccatacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctga 1301748  T
Q  508 atgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcg 607  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| | || || |    
T  1301749 atgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaatgtgcaggcacagtaacaacagcatttgtcactggtg 1301848  T
Q  608 atccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagt 707  Q
    |    || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||      
T  1301849 acattagatatgtctctgcaatttctcgcatcttcgtaaggaccatagatgatatttcctccacgcaaaagtgcttctcctgacccttgtacttaacaac 1301948  T
Q  708 aatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaa 803  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |   | ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  1301949 aatcacgggtttgtcattcacaccggcgatgaccttgaatggccacaacatcatgtctttttgaacaactgaatcactaaacttcctaccaattaa 1302044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 8586074 - 8585293
Alignment:
Q  23 cattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgat 122  Q
    ||||||| | |||||| |||||  | |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||    
T  8586074 cattcttctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgat 8585975  T
Q  123 tgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctc 222  Q
    ||||||||| || ||||  |||  | |||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||     
T  8585974 tgatgaagagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttctt 8585875  T
Q  223 aacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctc 322  Q
    |||| ||| || | | |||||||     |||| ||||| || |||||  | || || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  |||    
T  8585874 aaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctc 8585775  T
Q  323 cccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaatac 422  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8585774 ccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacac 8585675  T
Q  423 caaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtcca 522  Q
     |||||||| |||| ||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || || ||||| |||    
T  8585674 aaaaatatttcgttcaccatcacagttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggcca 8585575  T
Q  523 gcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcct 622  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  ||||||  || || |||   |  |||| ||    
T  8585574 gcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacagtcacaactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtct 8585475  T
Q  623 ctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtc 722  Q
    |||||||||    ||| ||||| || |    ||||||||||||||||||||| |  | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8585474 ctgcaatcttcttcatgtttgtgaggatgatagatgatatttcctcagcacataggttcttttcttgacccttgtacttaacagtaatcataggtttgtc 8585375  T
Q  723 attaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8585374 attaacaccagagataaccttgaatggccacaacattatatcattttgaacaacgggatcactaaacttcctaccaattaac 8585293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 300 - 804
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8629113
Alignment:
Q  300 cattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaa 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 8628708  T
Q  400 gtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattga 499  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |  ||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  8628709 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattga 8628808  T
Q  500 gtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacattttt 599  Q
     |||||  || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||  |||||||    
T  8628809 ttatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcattttt 8628908  T
Q  600 gacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtac 699  Q
     || || |||   |  || |||||||||||||    ||| |||| ||| |    ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||||||    
T  8628909 tacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctcagcacataggttcttctcttgacccttgtac 8629008  T
Q  700 ttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaa 799  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8629009 ttaacagcaatcataggcttgtcattaagaccagaaataaccttgaatggccagaacatgatatccttttgaacaacaggatcactaaacttcctaccaa 8629108  T
Q  800 ttaac 804  Q
    |||||    
T  8629109 ttaac 8629113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 412 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 8671609 - 8671217
Alignment:
Q  412 agatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatga 511  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8671609 agatcaaagacaaaaatatttcggttaccttcacggtcatttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatga 8671510  T
Q  512 cgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatcc 611  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||  |    
T  8671509 cattaagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggtgactc 8671410  T
Q  612 aaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatc 711  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  8671409 cagatatgcctccgcaacctctcgcatctttgtaagcaccatagaagatatttcctcagcacaaaattgcttctctagaccttcgtacttgacagtaatc 8671310  T
Q  712 atgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8671309 ataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaaccggatcactaaacttcctaccaattaac 8671217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 73 - 802
Target Start/End: Original strand, 17267789 - 17268518
Alignment:
Q  73 cactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtgg 172  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  17267789 cactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattgg 17267888  T
Q  173 tgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctt 272  Q
    | ||| | |  ||||| ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||   ||| | || ||| || ||| |    
T  17267889 tcacagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcccaacaattttcaatttttttttcct 17267988  T
Q  273 tttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcaccc 372  Q
    |||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||| | ||||| || || |||||||| | | ||    
T  17267989 tttgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatcc 17268088  T
Q  373 ttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatg 472  Q
    |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||   || || ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17268089 ttaattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatg 17268188  T
Q  473 caatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagta 572  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || |   |  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  17268189 caatagctgcagcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagta 17268288  T
Q  573 tgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagca 672  Q
     ||||| |||||||  ||  ||||  | || |  ||| | || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||  ||| || |||||||| |||    
T  17268289 agccgggacagtaatgacagcattcataaccgatgattctagatattcctcagcaatctcccgcatctttgtgagtaccatagacgaaatttcctctgca 17268388  T
Q  673 caaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaa 772  Q
    ||||| || |||||    || |||||||| |  | |||||| ||||||||||| | | | | | | ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  17268389 caaaagtgtttctcccgtcccttgtacttgagggaaatcattggtttgtcattcatatccgcaatgaccttgaatggccacgacattatatctttttgga 17268488  T
Q  773 caataggatcactatacttcctaccaatta 802  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  17268489 ccacaggatcactaaacttcctaccaatta 17268518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27831219 - 27830462
Alignment:
Q  47 tgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccat 146  Q
    |||||||||| |||||| | |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||   |||| | ||||| || |||      
T  27831219 tgagacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctc 27831120  T
Q  147 aaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggtta 246  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| |||| | |||||||     
T  27831119 aaataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttc 27831020  T
Q  247 ccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcag 346  Q
    || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27831019 ccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcag 27830920  T
Q  347 tggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcata 446  Q
    | || || || | |||||| | | |||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||  |||    
T  27830919 ttgccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtata 27830820  T
Q  447 gttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggtt 546  Q
     ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||||| || || ||||| |||||||||||||| | |||||  ||     
T  27830819 ttttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtg 27830720  T
Q  547 gcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaa 646  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |  ||  |||| || || || |||   |  |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27830719 gcttttcgttgagagtcattgaaataagctggcacggttattactgcattcttaaccggtgattgcaaatatgcctccgcgatctctcgcatctttgtaa 27830620  T
Q  647 gaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaa 746  Q
    | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||  ||||||||||||  || |||||||||||  || ||| ||| | | ||  ||||    
T  27830619 ggaccattgatgaaatttcctccgcacataagtgtttctcctgactcttgtacttaacaacaaacatgggtttgttgtttacatcagtaatgactttgaa 27830520  T
Q  747 tggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    | |||||||  | ||||| |||||||||| |  ||| ||  |||||||||||||||||    
T  27830519 tagccacaagtttatatctttttgaacaacatcatcgctgaacttcctaccaattaac 27830462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 88 - 804
Target Start/End: Original strand, 8646742 - 8647455
Alignment:
Q  88 tccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaag 187  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||  ||||  ||||||  | ||| |||||    
T  8646742 tccatattgattgcgtcaaatttggcacgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaag 8646841  T
Q  188 agagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctac 287  Q
    | ||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||  |||||||||| || |||||||| || || || | | |    
T  8646842 atagtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgc 8646941  T
Q  288 aaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtata 387  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| | | |||||||||| || | |    
T  8646942 aaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggaga 8647041  T
Q  388 gacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcag 487  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |  || ||||| ||||   || || | ||  ||| |||||||||||||||||| | ||| || || |    
T  8647042 gacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatttgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctg 8647141  T
Q  488 taggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaac 587  Q
    | |||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  8647142 ttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggcttttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacagtaac 8647241  T
Q  588 aacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctct 687  Q
    |||  |||| || || || ||    |  |||  |||||||| ||||||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  8647242 aactgcattctttacaggggacattaaatatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatcgatgatatttcctcagcacaataacgcttctct 8647341  T
Q  688 tcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactat 787  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||   | | ||| |||||||||||||| |  |||| || ||||||| || ||||  |     
T  8647342 tcacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaacttcttatcattctgaacaacagaatcaaaaa 8647438  T
Q  788 acttcctaccaattaac 804  Q
    |||||||||| ||||||    
T  8647439 acttcctaccgattaac 8647455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 73 - 799
Target Start/End: Original strand, 17260091 - 17260817
Alignment:
Q  73 cactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtgg 172  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  17260091 cactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattgg 17260190  T
Q  173 tgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctt 272  Q
    | ||| | | |||||| ||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||| |  |    
T  17260191 tcacagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttct 17260290  T
Q  273 tttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcaccc 372  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||| | ||||| || || |||||||| | | ||    
T  17260291 tttgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatcc 17260390  T
Q  373 ttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatg 472  Q
    |||||||| |  | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||     | || | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17260391 ttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatatg 17260490  T
Q  473 caatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagta 572  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || |   |  || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17260491 caatagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaata 17260590  T
Q  573 tgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagca 672  Q
     || || ||||||| ||| |||||  | || |  ||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||   ||| |||  ||| || |||||||| |||    
T  17260591 agcaggaacagtaataacaacattaataaccgatgattcaagatatacctcagcaatctcccgcatcttcacaagtaccatagacgagatttcctctgca 17260690  T
Q  673 caaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaa 772  Q
    ||||| || |||||    || |||||||| |  | |||||| ||||||||||| | | | | | | ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  17260691 caaaagtgtttctcccgtcccttgtacttgagggaaatcattggtttgtcattcatatccgcaatgaccttgaatggccacgacattatatctttttgga 17260790  T
Q  773 caataggatcactatacttcctaccaa 799  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||    
T  17260791 ccacaggatcactaaacttcctaccaa 17260817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 247 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 8636487 - 8636010
Alignment:
Q  247 ccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcag 346  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  8636487 ccgctaatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcag 8636388  T
Q  347 tggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcata 446  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |    | || |    
T  8636387 tggctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacaca 8636288  T
Q  447 gttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggtt 546  Q
    ||||| || ||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  8636287 gttacctctcttttgaagtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtg 8636188  T
Q  547 gcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaa 646  Q
    | ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||  ||  |||| ||||| |  ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  8636187 gatttacgctgagaatcattgaaataagcgggcacagtaatgactgcattcttgacagatgattccagatatgcctcagcaatctctcgcatctttgtca 8636088  T
Q  647 gaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcat 724  Q
    | |||  ||| ||||||||||||| | ||| |||||| | |||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  8636087 ggaccatagacgatatttcctcaggaaaaagttgcttttgttcacccttgtatttcacaacaatcatgggtttgtcat 8636010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 804
Target Start/End: Original strand, 3147113 - 3147853
Alignment:
Q  72 acactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtg 171  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||  |||||||| ||||| |||||  |||    
T  3147113 acactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaatggtg 3147212  T
Q  172 gtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttct 271  Q
    ||||  | || |||||| ||||| | |||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| | ||| |||  | |||||||| || || |||||||    
T  3147213 gtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttct 3147312  T
Q  272 ttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacc 371  Q
    | || || |||  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || || |  ||||| | | |    
T  3147313 tcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatc 3147412  T
Q  372 cttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccg------tttaccat--catagttacttcgcttgtcaa 463  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  |||||||| ||      |  || ||  || | ||| ||| |||||| |    
T  3147413 cttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaattacacaattagttctcttgtcca 3147512  T
Q  464 ggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtc 563  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||    
T  3147513 gtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctattgtcgctttccgctgagcatc 3147612  T
Q  564 attgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatt 663  Q
    |||||| || || || || ||||||||  |||| ||||| ||| || | |   |  |||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||| |||    
T  3147613 attgaaataagcaggtacggtaacaactgcattcttgacaggcaattctaaaaactcctctgcagtcttgcgcatctttgttagaaccatagatgagatt 3147712  T
Q  664 tcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatat 763  Q
    || |||||||| |  |||||||| |  || ||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||  || | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  3147713 tcttcagcacataggtgcttctcctgtcccttgcacttaaccgaaatcatgggtttgtcattcactccgcaaatgaccttgaatggccacaacatcatat 3147812  T
Q  764 ccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  3147813 cattttgaacaacagaatcaccaaacttcctaccaattaac 3147853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 804
Target Start/End: Original strand, 6789338 - 6790093
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| |||||  | || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||   |||||||| |||  ||    
T  6789338 agacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaa 6789437  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||| ||    
T  6789438 ataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttcc 6789537  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtg 348  Q
      |||| |||||||| |||||| | || || |||||| |||||||||  |||| || |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||    
T  6789538 agtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtg 6789637  T
Q  349 gcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagt 448  Q
    || || || | |||||| | | | || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||   ||  ||| | || |    
T  6789638 gccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaat 6789737  T
Q  449 tacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgc 548  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| ||| || || || |||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  6789738 tagttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggc 6789837  T
Q  549 ttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaag 647  Q
    ||| || ||||| |||||||| || || |||||||||| |||  ||||||| |     || | |||  |||  ||| |||||||| |||||||| || ||    
T  6789838 tttccgttgagaatcattgaaataagcaggcacagtaataactgcattttttatctctgactgcaa-atatttctcagcaatctcccgcatcttggtgag 6789936  T
Q  648 aaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaat 747  Q
     | |  ||| || | ||||||| |||| | ||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||||||| |||||||| || |||| | | ||| |||||    
T  6789937 gatcatagacgaaacttcctcaacacatagttgcttctcctcacccttatactcaacaacaatcatgggcttgtcattgacgccagcaatgaccttgaat 6790036  T
Q  748 ggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  6790037 ggccaaaacatcatatcattttgaacaacagaatcactaaacttcctaccaattaac 6790093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 804
Target Start/End: Original strand, 8545604 - 8546213
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||||  ||||||||    
T  8545604 tcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagta 8545703  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
     | |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| || || || ||||| | |   |||||||| || |||||||||    
T  8545704 attcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatagacaca 8545803  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggtt 493  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  ||| || |  | |||  || ||| | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  8545804 tcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaac-caattagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtcggtt 8545902  T
Q  494 cattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgac 593  Q
    |||||| |||||| ||||| || || || |||||  |||| |||||| | || | | || | || || ||||| || || || || |||||||  ||  |    
T  8545903 cattgattatccgcatgacatttagaccggcaatttcacctgcatcttttgtggatctttgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgc 8546002  T
Q  594 atttttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacc 692  Q
    ||| || || || || |||||   |||||||||||||||||||||||| ||  || | | ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| || |||||    
T  8546003 attcttaacaggtgactccaa-aaatgcctctgcaatctctcgcatctgtgagaggatcacagatgatatttcttcagcaacaaagtgcttttcctcacc 8546101  T
Q  693 tttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttc 792  Q
     ||||| || |||  |||  | ||||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||||  | ||| || |||||||  | ||||||||| |||    
T  8546102 cttgtagttcacaagaattgtcggtttgtcattaacaccggaaatgaccttaaagggccacaacagtagatcattctgaacaaaggaatcactatatttc 8546201  T
Q  793 ctaccaattaac 804  Q
    || |||||||||    
T  8546202 cttccaattaac 8546213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 705
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602456
Alignment:
Q  286 acaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagta 385  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || || || |||| || |  |||||||||||| |    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  386 tagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggc 485  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |  |   || || | |||  || ||| | |||||||||||||| ||| || ||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  486 agtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagta 585  Q
    ||| || ||||||| |||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagta 8602336  T
Q  586 acaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttct 685  Q
    |||||  |||| ||||| || ||  | ||  |   ||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  8602337 acaactgcattcttgacaggtgactccagaaacttctctgcaatttcacgcatctttgtaaggaccattgatgagatttcctcagcacagaagtgctttt 8602436  T
Q  686 cttcacctttgtacttaaca 705  Q
    |  |||| || |||||||||    
T  8602437 ccccacccttatacttaaca 8602456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 8383073 - 8382671
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |  |  |||||||| || |||||||||   |||| |||| | ||||| || || ||||||||    
T  8383073 tcctttttgccctctcgcaagccgttcttaaccttctaagagcctttgggttcccactaatgtccttattatgcttcctcttgaactcgtcaacaaagta 8382974  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
     | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| ||| |||||||| || ||  | ||||||| |  |||||||||||| | |||||||    
T  8382973 cttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagacattattcttaattgtgaggagagacaca 8382874  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggtt 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |  |   ||  | | |||  || ||| | |||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  8382873 tcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgcaagagcagcggcagttggct 8382774  T
Q  494 cattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgac 593  Q
    |||||| |||||| || || || || |||||||| |||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  8382773 cattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatatgcaggcacggtaacaactac 8382674  T
Q  594 att 596  Q
    |||    
T  8382673 att 8382671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 672
Target Start/End: Original strand, 8576297 - 8576775
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  | ||||| ||| |||| | ||| ||  |||| ||||  |||||||     
T  8576297 tcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaaagtg 8576396  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
     | ||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||    ||||| |||||| |||||||||    
T  8576397 atccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaatagacaca 8576496  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggtt 493  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| | |||| || || | |||  || ||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  8576497 tcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgcagtcggtt 8576596  T
Q  494 cattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgac 593  Q
    |||||| |||| | ||||| || || |||||||| ||||| |||||| | || ||| |||| || || ||||| || || || ||||||| ||  ||  |    
T  8576597 cattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacagaaatcactgc 8576696  T
Q  594 atttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagca 672  Q
    ||| || || || |     ||  | |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  8576697 attcttaacaggtgtctgcagaaaagcctctgcaatctctcgcatctttgagagaatcacagatgatatttcttcagca 8576775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 7877930 - 7877419
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||   | ||||| || | ||||||||||||||||||| | || || |||   || || |     
T  7877930 tccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatg 7877831  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| |||| || |||  |||| | || | |||||| | |||||||    
T  7877830 gttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacaca 7877731  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttacc-atcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggt 492  Q
    || ||||| ||||||||||||||||  |  || | ||| ||||| || ||  || ||| ||| ||| | ||||||||||||||  || || ||||| |||    
T  7877730 tcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttattta-ttctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggt 7877632  T
Q  493 tcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacga 592  Q
    ||||| | |||||| || || || || || ||||  |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||      
T  7877631 tcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggcttttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaacaactg 7877532  T
Q  593 catttttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcac 691  Q
    |||| ||||| || || |||||   |   |||||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  7877531 cattcttgacaggtgactccaa-aaacttctctgcaatctcgcgcatctttgtaaggatcatggatgatatttcctcggcacaaaagtgcttttcctcgc 7877433  T
Q  692 ctttgtacttaaca 705  Q
    | || |||||||||    
T  7877432 ccttatacttaaca 7877419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 297 - 804
Target Start/End: Original strand, 8581774 - 8582281
Alignment:
Q  297 caccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatca 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||| || || ||  || | | |  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8581774 caccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaatagacacatca 8581873  T
Q  397 aaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcat 496  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  ||| || || | |||  || ||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  8581874 aaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttcat 8581973  T
Q  497 tgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatt 596  Q
    ||| |||||| || || || || || |||||  |||| |||||| | || ||| |||| || || ||||| || || || || |||||||  ||  ||||    
T  8581974 tgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgcatt 8582073  T
Q  597 tttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcaccttt 695  Q
     || || || || |||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||||  ||| || || || | ||| ||    
T  8582074 cttaacaggtgactccaaaa-atgcctctgcaatctctcgcatctgtgtcagaataacagatgatatttcttcagcaagaaagtgtttttccttaccctt 8582172  T
Q  696 gtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttccta 795  Q
    ||| || |||   ||  | |||||||||||| |||| |  || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||     
T  8582173 gtagttcacaacgattgtcggtttgtcattagcacctgcggtgaccttgaagggccacaacttgatatccttttgaacaatggaatcactatatttcctt 8582272  T
Q  796 ccaattaac 804  Q
    |||||||||    
T  8582273 ccaattaac 8582281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 671
Target Start/End: Original strand, 8570282 - 8570759
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagt- 292  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||| |  ||||| ||| | || |||||||| ||||| | ||  |||||||     
T  8570282 tcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaaagtg 8570381  T
Q  293 agtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacac 392  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||| || || ||  ||   | | |||||| |||||| ||||||||    
T  8570382 agt-caacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaatagacac 8570480  T
Q  393 atcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggt 492  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||| |  ||| || || | |||  || ||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  8570481 atcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggt 8570580  T
Q  493 tcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacga 592  Q
    ||||||| |||||| || || || || ||||||||  |||| |||||| | || ||| |||| || || ||||| || || || || |||||||  ||      
T  8570581 tcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactg 8570680  T
Q  593 catttttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagc 671  Q
    |||| || || || || |||||   |||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||    
T  8570681 cattcttaacaggagactccaa-aaatgcttctgcaatctctcgcatctttgagagaatcacagatgatatttcttcagc 8570759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 29582038 - 29581508
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||||||||| || ||||||||||  || |||||| | || || || |   |||||||    
T  29582038 tcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaaagta 29581939  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
     | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || ||   |||| |||| | |||||| | |||||||    
T  29581938 attcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaagagacaca 29581839  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggtt 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||| || | |||| || ||| | ||  ||||||||||  || || ||||| ||||    
T  29581838 tcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagcagttggtt 29581739  T
Q  494 cattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgac 593  Q
    | |||| |||||  || || || || ||||| ||    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||  ||  |    
T  29581738 cgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaatcactgc 29581639  T
Q  594 atttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacct 693  Q
    ||| || || ||| || | |   ||  ||||||||| ||  |||||||||  || | |  |||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||     
T  29581638 attctttacaggcaattccaaaaatttctctgcaatatcatgcatctttgagaggatcatagatgatatttcctcagcaacaaacctcttctcttcaccc 29581539  T
Q  694 ttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcat 724  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  29581538 ttgtacttaacaaggatcatgggattgtcat 29581508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 705
Target Start/End: Original strand, 8590713 - 8591120
Alignment:
Q  298 accattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaa 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||| || |||  |||||| || | |||||| | |||||||||||    
T  8590713 accattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaa 8590812  T
Q  398 aagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttacc-atcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcat 496  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || | ||| ||||| || ||  || || | || ||| | ||||||||||||||   | |||||||| |||||||    
T  8590813 aagtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgttactttc-tctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagttggttcat 8590911  T
Q  497 tgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatt 596  Q
    | | |||||| || || || |  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||  ||||    
T  8590912 taattatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaacaactgcatt 8591011  T
Q  597 tttgacgggcga-tccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcaccttt 695  Q
     ||||| || || |||||   |    || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||| |||||||   |||| || ||||| ||    
T  8591012 cttgacaggtgactccaa-aaacttttcagcaatctctcgcatctttgtgagaaccatggatgagatttcctccgcacaaagacgcttttcctcaccctt 8591110  T
Q  696 gtacttaaca 705  Q
    ||||||||||    
T  8591111 gtacttaaca 8591120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 514 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 8640424 - 8640165
Alignment:
Q  514 ttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcg---atc 610  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||  |||| || ||||| |   ||     
T  8640424 ttaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcattctttacggggggacatt 8640325  T
Q  611 caaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaat 710  Q
     ||  |||  |||||||| |||||||||||| | ||| | |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  8640324 aaa--tatttctctgcaacctctcgcatcttcgaaaggatcatagatgatatttcctcggcacaaaaacgcttctcttcacccttgtatttaacaataat 8640227  T
Q  711 catgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaa 775  Q
    | ||||||||||||| || ||   | | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  8640226 cgtgggtttgtcattcacccc---aatgaccttgaatggccacaacttcatatcattttgaacaa 8640165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29577864 - 29577644
Alignment:
Q  199 tttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtaca 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||    ||||||||||| || |||||| | || || || |  ||||||| |  ||    
T  29577864 tttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaaagcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctca 29577765  T
Q  299 ccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaa 398  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||   |||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  29577764 ccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggcctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaa 29577665  T
Q  399 agtaccaccaccaagatcaaa 419  Q
     || |||||||||||||||||    
T  29577664 ggtgccaccaccaagatcaaa 29577644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 306
Target Start/End: Original strand, 8616509 - 8616764
Alignment:
Q  51 acaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaat 150  Q
    |||||| |||||| | || |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||  | ||    
T  8616509 acaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccctcacat 8616608  T
Q  151 aaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgc 250  Q
    |||  ||| | ||||| ||| ||||| ||  | || || || |||| ||| ||| | || || |||||| |||||| ||| || ||| ||||||| |       
T  8616609 aaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaacgatcttgggttcctag 8616708  T
Q  251 taatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctg 306  Q
    |||| ||||| || |||||| | || |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  8616709 taatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 419
Target Start/End: Original strand, 8559407 - 8559529
Alignment:
Q  297 caccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatca 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || || || |||| || |  |||||||||||| | ||| ||||||    
T  8559407 caccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaagagaaacatca 8559506  T
Q  397 aaagtaccaccaccaagatcaaa 419  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  8559507 aaagttccaccaccgagatcaaa 8559529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 569
Target Start/End: Original strand, 8538275 - 8538382
Alignment:
Q  462 aaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagag 561  Q
    |||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||| || || || || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||     
T  8538275 aaggccgtatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaa 8538374  T
Q  562 tcattgaa 569  Q
    ||||||||    
T  8538375 tcattgaa 8538382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 584
Target Start/End: Original strand, 8609992 - 8610278
Alignment:
Q  298 accattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaa 397  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||||| || || || |||||  |||     ||||||||||| | ||||||||| |    
T  8609992 accattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacagacacatcga 8610091  T
Q  398 aagtaccaccaccaagatcaaataccaaaata-ttccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcat 496  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||  ||| ||| || | |||  || ||| | ||| |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  8610092 aagtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttctattttcca-cacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgttggttcat 8610190  T
Q  497 tgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagt 584  Q
    |||  ||||| || || ||||| |||| |||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  8610191 tgataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcacagt 8610278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 641
Target Start/End: Original strand, 39985879 - 39986064
Alignment:
Q  456 cttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgc 555  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||  || || ||||| ||||| || |||||  | ||||||||  |||| ||||  |||    
T  39985879 cttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttgacgc 39985978  T
Q  556 tgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctt 641  Q
    || |||||||| ||||| || || |||||||||||  |||| || | ||  || |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  39985979 tgggagtcattaaagtaagcagggacagtaacaacagcattcttaatggcagaaccaaggtacgcttcggcaatctcacgcatctt 39986064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 9336270 - 9335479
Alignment:
Q  12 atcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaattta 111  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  9336270 atcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttg 9336171  T
Q  112 gcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9336170 gcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcac 9336071  T
Q  212 aggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgcta-atgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  9336070 aggcagttctcaacctccttaaggattttgggtt-ctgcttgatgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttat 9335972  T
Q  311 caaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccacc 410  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9335971 caaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacc 9335872  T
Q  411 aagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatg 510  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9335871 cagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatg 9335772  T
Q  511 acgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatc 610  Q
    || ||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  9335771 acattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcattcttgaccggcgacc 9335672  T
Q  611 caaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaat 710  Q
    | |  |||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  9335671 ccaaatatgcctccgcaacctctctcatctttgtaagcaacatagaagatatttcctcagcacaaaagtgcttctcttgacccttgtagttaacagtaat 9335572  T
Q  711 catgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaa 803  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||    
T  9335571 cataggtttgtcattaacaccagaaataaccttgaatggccacaacaatatatctctttgaacaaccagatcactaaacttcctaccagttaa 9335479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 804
Target Start/End: Original strand, 30775055 - 30775833
Alignment:
Q  26 tcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattga 125  Q
    |||||| || |||||||||  | |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  30775055 tcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattga 30775154  T
Q  126 tgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaac 225  Q
    |||||||||||| ||  |   |||||||  ||||| |||||||   |||| |||  | || |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  30775155 tgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaac 30775254  T
Q  226 ctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctcccc 325  Q
       || || | | |||| || ||| |||||||||| || |||||| | || || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||    
T  30775255 tgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccc 30775354  T
Q  326 ctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaa 425  Q
    | | ||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  30775355 cgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaa 30775454  T
Q  426 aatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagca 525  Q
    ||||||||  | | ||||| |  ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  || || ||||| ||||||    
T  30775455 aatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagca 30775554  T
Q  526 atggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctg 625  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || || |||||||| | |||  ||||||| || || ||| | |  ||   |||||    
T  30775555 atggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacagtgataactgcatttttaactggggattccaaatacatctctg 30775654  T
Q  626 caatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcatt 725  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |   | ||||| |  || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30775655 caatctctctcatatttgtgaggactattgatgaaatttcctcggcacagaggagtttctcctggcccttgaacttaagggaaatcatgggtttgtcatt 30775754  T
Q  726 aacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||    
T  30775755 aacaccagaaacaaccttgaatggccacaacaaaatatctttttgaacaacagggtcgctaaatttcctaccaattaac 30775833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 804
Target Start/End: Original strand, 35132475 - 35133027
Alignment:
Q  250 ctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtgg 349  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||    
T  35132475 ctaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcagtgg 35132574  T
Q  350 cttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagtt 449  Q
    | || || | |||||||| | ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  |||  ||| || | |     
T  35132575 ccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcacaatc 35132674  T
Q  450 acttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgct 549  Q
    |  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||  |  || || ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  35132675 agatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggct 35132774  T
Q  550 tttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaa 649  Q
    ||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||  |||| || || |  ||| | |  |||||  ||||||| |||||||||||||| || |    
T  35132775 tttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaacaactgcattcttaacagttgattctaaatatgc--ctgcaatttctcgcatctttgtgagta 35132872  T
Q  650 ccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatgg 749  Q
    ||   ||||||| ||| || ||| | | |||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||    
T  35132873 ccatggatgatacttcttccgcatagagttgcttttcctcatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcatttacaccggcagtgaccttgaatgg 35132972  T
Q  750 ccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35132973 ccatagcagtatatcatcttgaacaataggatcactaaacttcctaccaattaac 35133027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16657874 - 16657104
Alignment:
Q  34 atctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaa 133  Q
    ||||||||||| |  |||||| | |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16657874 atctttgaatcacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaa 16657775  T
Q  134 agtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 233  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16657774 agtcaattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaa 16657675  T
Q  234 ggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgc 333  Q
    || | ||| ||| || || |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  16657674 ggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtga 16657575  T
Q  334 gtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattcc 433  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16657574 gtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattcc 16657475  T
Q  434 gtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcacc 533  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16657474 gtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcacc 16657375  T
Q  534 agcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctct 633  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| |||||  | |   ||||||| ||||  |||    
T  16657374 agcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttgacaggcgactccataaatgcctcagcaacttct 16657275  T
Q  634 cgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccag 733  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||| || ||||||||| ||||||||||| || || |    
T  16657274 cgcatctttgtaaggatcatagatgatatttcctcagcacaaaattggctctcttgacccttatactgaagagtaatcattggtttgtcattcactccgg 16657175  T
Q  734 aagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
     | | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16657174 caatgaccttgaatggccacaagatgatatcattttgaacaacaggatcactaaacttcctaccgattaac 16657104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 51 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16662332 - 16661579
Alignment:
Q  51 acaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaat 150  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||| | ||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||    ||    
T  16662332 acaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtat 16662233  T
Q  151 aaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgc 250  Q
    |||  ||| | ||||| || |||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || |       
T  16662232 aaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctag 16662133  T
Q  251 taatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggc 350  Q
    | || |||||||| |||||| | || || || |  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16662132 tgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggc 16662033  T
Q  351 ttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagtta 450  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||| | |||    
T  16662032 tttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaatta 16661933  T
Q  451 cttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgctt 550  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16661932 cttcttttgtcaaggccatatgcaatagctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggctt 16661833  T
Q  551 ttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaac 650  Q
    |||||||||| || || || || || || ||||| |||||  ||||||| || || ||| | |  || |||||||||| |||   ||| ||||| || ||    
T  16661832 ttcgctgagaatcgttaaaataagcaggaacagtgacaactgcatttttaaccggtgattccaaataagcctctgcaacctccttcatgtttgtgaggac 16661733  T
Q  651 cgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggc 750  Q
       |||||| |||||||| |||||||   ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  16661732 aatagatgagatttcctcggcacaaaggagcttctcctgacccttgtacttaacactaatcgtaggtttgtcattaacaccagcaataaccttgaacggc 16661633  T
Q  751 cacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  16661632 cacaacagtatatctttttgaacaacggggtcactaaatttcctaccaattaac 16661579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 70 - 804
Target Start/End: Original strand, 7542073 - 7542807
Alignment:
Q  70 atacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacag 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || || | | |||| |||||||||||||| || ||   |||||||| ||||||||||| ||    
T  7542073 atacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatag 7542172  T
Q  170 tggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattctt 269  Q
    |||  |||| |   ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  7542173 tggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctt 7542272  T
Q  270 ctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatca 369  Q
      | ||||| || | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||   |      
T  7542273 tctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttg 7542372  T
Q  370 cccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccat 469  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |  |||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  7542373 cccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggccat 7542472  T
Q  470 atgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaa 569  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||  || || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  7542473 atgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaaa 7542572  T
Q  570 gtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctca 669  Q
     || || || |||||||||||  ||||  | || |  | | | |  || | ||| ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  || |||    
T  7542573 ataagcaggtacagtaacaactgcattcgtcacagttgtttctaaatacgactcagcaatttctcgcatctttgtgagtaccatagatgatacctcttca 7542672  T
Q  670 gcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatcctttt 769  Q
    |||   | ||| ||||| | | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | ||| ||| |||||||||| ||||  ||||| | ||    
T  7542673 gcatggagttgtttctcctgatccttgtacttaacggtaatcatgggtctgtcattgtcacccgcagtcaccttgaatggccataacagtatatcatctt 7542772  T
Q  770 gaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7542773 gaacaacaggatcactaaacttcctaccaattaac 7542807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 804
Target Start/End: Original strand, 43625261 - 43625991
Alignment:
Q  72 acactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtg 171  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43625261 acactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaataccacggaataaagaatctacctcaatagtg 43625360  T
Q  172 gtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttct 271  Q
     |||   ||| |||||| ||| |||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||| || | ||| ||| ||  |||| ||||| || |||||||    
T  43625361 ctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttct 43625460  T
Q  272 ttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacc 371  Q
    | |  || || ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||| |   |    
T  43625461 tctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtc 43625560  T
Q  372 cttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatat 471  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||  ||| || | ||| ||| ||||| |||||| |||    
T  43625561 cttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaattaattctcttgttaaggccgtat 43625660  T
Q  472 gcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagt 571  Q
    || | ||| || || || |||||||||| ||  || |  || ||||| ||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43625661 gctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaagt 43625760  T
Q  572 atgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcg---atccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctc 668  Q
    | || ||||| ||||||||  |||| || ||||| |   ||  ||   ||  |||||||| ||||||||||||||| || | |  ||| |||||||||||    
T  43625761 aagcaggcacggtaacaactgcattctttacggggggacattaaa--aatttctctgcaacctctcgcatctttgtgaggatcatagacgatatttcctc 43625858  T
Q  669 agcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttt 768  Q
    || ||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||  || ||   | | ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  43625859 aggacaaaaacgcttctcttgacccttgtattttacaataatcattggtttgtcatccacccc---aatgaccctgaatggccacaacatgatatcattt 43625955  T
Q  769 tgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  43625956 tgaacaacagaatcactaaacttcctaccgattaac 43625991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 804
Target Start/End: Original strand, 12234515 - 12235270
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||| || || | | |||| ||||||||||| || || ||   ||    
T  12234515 agacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaa 12234614  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    |||||| |||||||||||  || |  |||| |   ||||| | |   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| || ||    
T  12234615 ataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttcc 12234714  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtg 348  Q
     || ||||||||||| |||||  | ||||| || |   ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  12234715 actcatgtccacttttttctttctattgaactcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtg 12234814  T
Q  349 gcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagt 448  Q
    ||||| || | |||||||| ||| || ||||| || | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||  ||| || | |    
T  12234815 gctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaat 12234914  T
Q  449 tacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgc 548  Q
     | ||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||  | ||||| || | || ||  || || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12234915 cagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgc 12235014  T
Q  549 ttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaaga 648  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||  |||| || || ||  ||   |  |||||||| || || |||||||||||||| ||     
T  12235015 ttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcacggtaacaactgcattcttaactggaaattgtaaatatgcctcagcgatttctcgcatctttgtgagt 12235114  T
Q  649 accgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatg 748  Q
    |||  |||||||| ||| || | ||| |  |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||    
T  12235115 accatagatgatacttcttcgggacatagctgcttctctcgacccttgtacttgacaataatcatgggtttgtcattgacaccagcagcgaccttgaatg 12235214  T
Q  749 gccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  12235215 gccacaacatcacatcatcttgaacaacttgatcactaaacttcctaccaattaac 12235270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 12258923 - 12258168
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| |||||| | || || || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| || || ||   |     
T  12258923 agacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcac 12258824  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |  |||| |  | |||| |||   |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| || | | |||| || ||    
T  12258823 ataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttcc 12258724  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtg 348  Q
     || || || ||||| |||||  | ||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  12258723 acttatatctactttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgta 12258624  T
Q  349 gcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagt 448  Q
    || || || |  ||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |  || | |    
T  12258623 gccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcgacacaat 12258524  T
Q  449 tacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgc 548  Q
    || |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||   || || || || ||| ||||   |||  ||||||| || ||    
T  12258523 taattcttttgtcaaggccatatgcaaaagctgcagcagtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggc 12258424  T
Q  549 ttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaaga 648  Q
    ||| |  || || ||| | || ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||| ||| | |  |||||||| ||||| |||||||||||||| |      
T  12258423 tttcctttgtgaatcactaaaatatgcaggcacagtaacaactgcattcttaacgggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgtcaat 12258324  T
Q  649 accgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatg 748  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |   |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||  | ||||    
T  12258323 accacagatgatacttcctcggcacaaagctgcttctcttgattcttgtactttaccgtaatcatgggtttgccattgacaccagcagtgactttaaatg 12258224  T
Q  749 gccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  12258223 gccacaacattatatcatcttgaactacttgatcactaaacttcctaccaattaac 12258168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 794
Target Start/End: Original strand, 14703234 - 14703979
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || | | |||| |||||||||||||| || |    ||    
T  14703234 agacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgcattgaa 14703333  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||     ||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  14703334 ataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggatttcc 14703433  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtg 348  Q
     |||||||||| | | || ||  | ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14703434 actaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagta 14703533  T
Q  349 gcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagt 448  Q
    || || |  | ||||||    ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||  ||| |||| |    
T  14703534 gccttaatttggaagacggtgcccttaattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataat 14703633  T
Q  449 tacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgc 548  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||  || || || || || |||||  |||||||||| || || ||    
T  14703634 cagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggc 14703733  T
Q  549 ttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaaga 648  Q
    |||||  ||||| ||| | || || || ||||| ||||||||  |||| || || |  ||  | |  |||| ||| ||||| |||||||||||    ||     
T  14703734 ttttctttgagaatcactaaaataagcaggcaccgtaacaactgcattcttaacagttgactctaaatatgtctcagcaatttctcgcatcttcaccagt 14703833  T
Q  649 accgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatg 748  Q
    |||  |||||||| ||| || ||| | |  | |||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| | ||||    
T  14703834 accatagatgatacttcttcggcatagagcttcttctcctgatccttgtacttaaccgtaatcatgggtttgtcatcgactccagcagtgaccttaaatg 14703933  T
Q  749 gccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcct 794  Q
    |||| || |  ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14703934 gccataaaagtatatcatcttgaacaataggatcgctaaacttcct 14703979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 12245698 - 12244994
Alignment:
Q  99 ttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctt 198  Q
    ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| || || ||   |||||||| ||||||||||| ||| |  |||| |  ||| || ||||| |||    
T  12245698 ttcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaacgaaagtattctt 12245599  T
Q  199 tttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtaca 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||   |  | ||||| |||| ||| |||||  | ||||| |||| | |||||||||  |    
T  12245598 tttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagttta 12245499  T
Q  299 ccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaa 398  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  | | ||||||| || || ||||| || |||||    
T  12245498 ccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaaa 12245399  T
Q  399 agtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattg 498  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||  ||| || | | |  || ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  12245398 agtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgcaacagctgcagcagtgggttcattc 12245299  T
Q  499 agtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttt 598  Q
    | || ||  || || || || |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || || |||||||||||  |||| |    
T  12245298 attaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataagcaggtacagtaacaacagcattct 12245199  T
Q  599 tgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgta 698  Q
    | || || ||| | |  |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |  ||||||||    
T  12245198 ttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatctttgttagtaccatagatgatacttcttcagcacatagctgcttctcctggcctttgta 12245099  T
Q  699 cttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctacca 798  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||| || |    ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12245098 gttaacagtaattattggtttgtcattgacaccagcagtgaccttgaacggccataataatgcatcatccagaacaataggatcactaaacttcctacca 12244999  T
Q  799 attaa 803  Q
    |||||    
T  12244998 attaa 12244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 804
Target Start/End: Original strand, 11999283 - 11999975
Alignment:
Q  99 ttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctt 198  Q
    ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| || || ||   |||||||| ||||||||||| ||| |  |||| |  ||| || ||||| |||    
T  11999283 ttcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaatgatagtattctt 11999382  T
Q  199 tttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtaca 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||   | || ||||| |||||||  |||||  | ||||| || | |||||||||         
T  11999383 tttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaacttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaagta----- 11999477  T
Q  299 ccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaa 398  Q
            |||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11999478 --------ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaa 11999569  T
Q  399 agtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattg 498  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || | ||  ||| || | | |  || |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||     
T  11999570 agtgccaccgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattc 11999669  T
Q  499 agtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttt 598  Q
    | || ||  || || || |  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  11999670 attacccttataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattct 11999769  T
Q  599 tgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgta 698  Q
    | || || ||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||  |||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |  ||||||||    
T  11999770 ttaccggtgattctaaatatgcctcagcaatttctcgcatcttcgttagtaccatagatgatacttcttcagcacatagctgcttctcctggcctttgta 11999869  T
Q  699 cttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctacca 798  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||    ||| | |||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  11999870 cttaacagtaattattggtttgtcattgacatcagcagtgaccttgaatggccataacaatccatcatcttgaacaacaagatcactaaacttccaacca 11999969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 4678914 - 4678145
Alignment:
Q  34 atctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaa 133  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| | |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  4678914 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 4678815  T
Q  134 agtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 233  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4678814 agtctattccctgaaataaagaatctac-tcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaa 4678716  T
Q  234 ggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgc 333  Q
    || ||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  4678715 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtga 4678616  T
Q  334 gtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattcc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  4678615 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 4678516  T
Q  434 gtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcacc 533  Q
    |||||| ||||   | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4678515 gtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 4678416  T
Q  534 agcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctct 633  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||    || ||||  || ||||  |||    
T  4678415 agcatctatggtagcttttcgttgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaacgacattcttcacagacgaagttagatatgtttcggcaacttct 4678316  T
Q  634 cgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccag 733  Q
    | |||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||    
T  4678315 ctcatctttgtaaggatcatcgatgatatttcctcaacactaacttgcttctcttgacccttgtacttaacactaatcatcggtttatcattctcaccag 4678216  T
Q  734 aagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
       | ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  4678215 tgatgaccctaaatggccacaacatgatgtctttttgaacaacagaatcactatacctcctaccaattaac 4678145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 796
Target Start/End: Original strand, 15594860 - 15595610
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || | |||||| |  |||||| | ||||| || ||  |||    
T  15594860 agacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaa 15594959  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  15594960 ataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttccc 15595059  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtg 348  Q
      |||| |||||||| |||||| | ||||| ||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||    
T  15595060 agtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtg 15595159  T
Q  349 gcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagt 448  Q
    || || || | |||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||  ||| || |||    
T  15595160 gccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagt 15595259  T
Q  449 tacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctg-------cggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatcta 541  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||       | || || |||||||||| || ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15595260 taatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatcta 15595359  T
Q  542 tggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctt 641  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||  || || ||||| ||||||||  |||| || ||||| ||  | |   ||  |||||||| ||||||||||||    
T  15595360 tagtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcacggtaacaactgcattgtttacgggaga--ctaaaaatttctctgcaacctctcgcatctt 15595457  T
Q  642 tgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaacc 741  Q
    | | |||| |  ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||   | | |||    
T  15595458 tttgagaatcatagacgatatttcctcagcacaaaagcgcttttcttgacccttgtatttaacaataatcatgggtttgtcattcacacc---aatgacc 15595554  T
Q  742 atgaatggccacaacatgatatccttttgaac-aataggatcactatacttcctac 796  Q
     |||||||||||||| | ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  15595555 ttgaatggccacaactttatatcattttgaacaaacagaatcactaaacttcctac 15595610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 34467091 - 34466380
Alignment:
Q  85 aagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaa 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||| ||| ||  | |||||| |||||  |||||||| | ||||||||       
T  34467091 aagtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgacaaaag--- 34466995  T
Q  185 aagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctc 284  Q
         ||| |||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| || | | | ||||| || ||||| |||   |||| |||| | ||||| ||||     
T  34466994 -----agtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctt 34466900  T
Q  285 tacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagt 384  Q
    | |||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |||| |||||| || || || ||||||| | |||||||||| ||     
T  34466899 tgcaaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaagg 34466800  T
Q  385 atagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaata-ttccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcg 483  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| | | ||| || ||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  34466799 agagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttcca-caaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgca 34466701  T
Q  484 gcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacag 583  Q
    ||||| |||||||||| |||  | |  || ||||| |||||||| | ||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  34466700 gcagtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacgg 34466601  T
Q  584 taacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgctt 683  Q
    | | |||  |||| || |  || ||| | |  ||| |||||||| | || |||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||| |  |||||    
T  34466600 tgataactgcattcttaattggtgattccaaatattcctctgcagtatcccgcatctttgaaaggatcatagatgagatttcctcagcacataggtgctt 34466501  T
Q  684 ctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatca 783  Q
    ||| | ||| || |||||||  | |||||| || |||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||    
T  34466500 ctcctgacccttatacttaagggaaatcattggcttgtcattaacaccagcaataactttgaatggccataacatcatatctgtttgaacatcaggatca 34466401  T
Q  784 ctatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||| | || || |||||||||    
T  34466400 ctaaattttctgccaattaac 34466380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52549353 - 52549269
Alignment:
Q  50 gacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaa 134  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || || | | |||| |||||||||||    
T  52549353 gacaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaa 52549269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 350
Target Start/End: Original strand, 28219742 - 28220045
Alignment:
Q  47 tgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccat 146  Q
    ||||||| || |||||| | || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || || ||       
T  28219742 tgagacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttc 28219841  T
Q  147 aaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggtta 246  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| | ||| |||     
T  28219842 aaataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagttt 28219941  T
Q  247 ccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcag 346  Q
    ||  |||||||||| || |||||||| || || |||||| | ||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  28219942 ccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcgg 28220041  T
Q  347 tggc 350  Q
    ||||    
T  28220042 tggc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 466 - 804
Target Start/End: Original strand, 28220194 - 28220532
Alignment:
Q  466 ccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcat 565  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  |  || || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  28220194 ccatatgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcat 28220293  T
Q  566 tgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttc 665  Q
    |||| || || |||||||||| |||  |||| ||||| ||  || | |   | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||    
T  28220294 tgaaataagcaggcacagtaataactgcattcttgacaggaaattccaaaaaggcctctgcaatctcacgcatctttgttagaaccatagatgagatttc 28220393  T
Q  666 ctcagcacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatcc 765  Q
     || ||||| |  |||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    || ||| | ||| |||||||||||||| | |||||     
T  28220394 ttcggcacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcatgggtttgtcgttcgttccggaaatgaccttgaatggccacaactttatatca 28220493  T
Q  766 ttttgaacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  28220494 tcttgaacaacagagtcactaaacttcctaccaattaac 28220532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 804
Target Start/End: Original strand, 43744997 - 43745428
Alignment:
Q  371 ccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccata 470  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  |||||||| | |   |   || ||||| ||| ||| || || |||||    
T  43744997 ccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccata 43745096  T
Q  471 tgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaag 570  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   || || | ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | ||||||||     
T  43745097 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatcta--gtggctttccgctgataatcattgaaa 43745194  T
Q  571 tatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcag 670  Q
    || |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||   |   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||| ||||| || |    
T  43745195 taagccggcacagtaacaactgcattcttgacaggcaattgcaaaaatgtctctgcaatctcacgcatctttgttagaatcatagatgagatttcttcgg 43745294  T
Q  671 cacaaaattgcttctcttcacctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttg 770  Q
    |||| |  |||||||| |  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  43745295 cacataggtgcttctcctgtcccttgtacttaacagaaatcacgggtttgtcattcaatccggaaatgaccttgaacggccacaacttcatatcattttg 43745394  T
Q  771 aacaataggatcactatacttcctaccaattaac 804  Q
    ||||  || |||| || |||||||||||||||||    
T  43745395 aacatcagaatcattaaacttcctaccaattaac 43745428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Original strand, 43744642 - 43744936
Alignment:
Q  49 agacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataa 148  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || | | || || || |||  ||    
T  43744642 agacaactctcaacaattttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaa 43744741  T
Q  149 ataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttacc 248  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | | |||||||||| || || || || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  43744742 ataaagaatctacctcaatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttcc 43744841  T
Q  249 gctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccag 343  Q
      |||||||||| || |||||||| || || |||||| | ||||||| |||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  43744842 agtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 419
Target Start/End: Original strand, 12528475 - 12528700
Alignment:
Q  194 tcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatgtccactttattcttctttttgaaatcctctacaaagta 293  Q
    ||||||| ||| |||| |||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||| | || || || |  |||||||     
T  12528475 tccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtg 12528574  T
Q  294 gtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagacaca 393  Q
     | ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||| |  ||| | ||| || | |||||||    
T  12528575 attcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctttactgtaagaagagacaca 12528674  T
Q  394 tcaaaagtaccaccaccaagatcaaa 419  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12528675 tcaaaagttccaccgccaaggtcaaa 12528700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 640
Target Start/End: Original strand, 12528746 - 12528921
Alignment:
Q  465 gccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtca 564  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||| |||||| || || || || ||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||| || |||    
T  12528746 gccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatca 12528845  T
Q  565 ttgaagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatct 640  Q
    ||||| || || ||||| ||||  ||  |||| || || || ||  ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  12528846 ttgaaatacgctggcaccgtaatcactgcattcttaacaggtgactcaagaaatgcatctgcaatctctcgcatct 12528921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 802
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28911161
Alignment:
Q  291 gtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcgaagacatcacccttaattgtgagtatagac 390  Q
    ||||| |||||| || ||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||| | | ||| |||||| || | |||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  391 acatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtag 490  Q
    ||||||||||| |||| ||| || || || |  ||| |||| ||||  ||| || | | |  || |||||| |||||||||| ||||||| | |||||      
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  491 gttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcacagtaacaac 590  Q
    | ||||||| |||||| || || ||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||||| ||  | | || ||||||||     
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataaccagtcaaagtaacaat 28910949  T
Q  591 gacatttttgacgggcgatccaaggtatgcctctgcaatctctcgcatctttgtaagaaccgcagatgatatttcctcagcacaaaattgcttctcttca 690  Q
      |||| ||||||||| || | |   ||| | |||||||||| || |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | |    
T  28910950 tgcattcttgacgggcaattccaaaaatgtcactgcaatctcgcgaatctttgagagaaccacagatgagatttcctcagcacataatttcttctcctga 28911049  T
Q  691 cctttgtacttaacagtaatcatgggtttgtcattaacaccagaagtaaccatgaatggccacaacatgatatccttttgaacaataggatcactatact 790  Q
     | |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| | | | ||| |||| ||| |||||||   ||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  28911050 tccttgtacttgacagatatcatggggttgtcattgacaccggcaatgaccttgaacggcgacaacattgaatcgttttgaacaacgggatcactaaact 28911149  T
Q  791 tcctaccaatta 802  Q
    ||||| ||||||    
T  28911150 tcctatcaatta 28911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 353
Target Start/End: Original strand, 11133068 - 11133124
Alignment:
Q  297 caccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttt 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  11133068 caccattgtgttatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtatctccagcagtggcttt 11133124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 540
Target Start/End: Original strand, 11170806 - 11170887
Alignment:
Q  459 gtcaaggccatatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatct 540  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |  || || || |||||||| ||||| ||||||    
T  11170806 gtcaaggccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatct 11170887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University