View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20435_high_40 (Length: 294)

Name: NF20435_high_40
Description: NF20435
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20435_high_40
NF20435_high_40
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-274)||(8401409-8401682)
chr7 (1-274)||(47062789-47063062)
chr7 (1-274)||(10707561-10707835)
chr7 (4-274)||(42501318-42501588)
chr7 (4-274)||(18107299-18107569)
chr7 (4-274)||(15067800-15068070)
chr7 (4-274)||(30788450-30788720)
chr7 (4-274)||(43622015-43622285)
chr7 (4-274)||(45765290-45765560)
chr7 (4-274)||(616629-616899)
chr7 (104-274)||(12113436-12113606)
chr7 (123-243)||(43826556-43826676)
chr7 (1-108)||(12116418-12116525)
chr7 (1-81)||(43826682-43826762)
chr7 (1-55)||(3762835-3762889)
chr7 (196-258)||(43378183-43378245)
chr7 (199-258)||(1298113-1298172)
chr7 (186-258)||(25569530-25569602)
chr7 (186-258)||(46792439-46792511)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-274)||(21357233-21357506)
chr6 (1-274)||(23961215-23961488)
chr6 (4-274)||(31148230-31148500)
chr6 (3-274)||(18607896-18608167)
chr6 (4-274)||(28358229-28358498)
chr6 (4-274)||(1610631-1610901)
chr6 (5-266)||(254299-254560)
chr6 (3-140)||(34110718-34110855)
chr6 (5-55)||(26684104-26684154)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (1-253)||(17238732-17238984)
chr4 (1-274)||(38462720-38462993)
chr4 (1-274)||(51642887-51643160)
chr4 (1-274)||(4770039-4770309)
chr4 (4-274)||(3405701-3405971)
chr4 (5-269)||(4977846-4978110)
chr4 (4-274)||(19071537-19071807)
chr4 (34-274)||(9891813-9892053)
chr4 (61-274)||(11503392-11503606)
chr4 (4-176)||(4977662-4977834)
chr4 (1-140)||(6183592-6183730)
chr4 (166-258)||(17917280-17917372)
chr4 (4-55)||(13896851-13896902)
chr4 (199-258)||(32717420-32717479)
chr4 (191-233)||(20970438-20970480)
chr4 (186-239)||(1591947-1592000)
chr4 (2-55)||(17497453-17497506)
chr4 (186-258)||(4618669-4618741)
chr4 (9-53)||(20970616-20970660)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-272)||(11691715-11691986)
chr2 (4-274)||(24603972-24604242)
chr2 (4-274)||(24940533-24940803)
chr2 (1-274)||(41006859-41007132)
chr2 (4-274)||(9656063-9656333)
chr2 (4-274)||(27274240-27274510)
chr2 (4-274)||(28347280-28347550)
chr2 (1-274)||(45477263-45477536)
chr2 (1-269)||(12906380-12906648)
chr2 (4-274)||(24751570-24751840)
chr2 (1-253)||(34919686-34919938)
chr2 (3-274)||(17996070-17996341)
chr2 (4-274)||(7264891-7265161)
chr2 (1-274)||(437225-437498)
chr2 (4-274)||(3797682-3797951)
chr2 (4-274)||(211321-211591)
chr2 (4-274)||(10622334-10622604)
chr2 (4-274)||(38947674-38947944)
chr2 (4-274)||(39795881-39796151)
chr2 (4-274)||(41561923-41562193)
chr2 (4-274)||(5349078-5349348)
chr2 (130-274)||(43946021-43946165)
chr2 (1-135)||(43948305-43948439)
chr2 (1-150)||(25618093-25618242)
chr2 (7-94)||(1097889-1097976)
chr2 (196-274)||(25615286-25615364)
chr2 (1-113)||(24683979-24684091)
chr2 (1-55)||(25855455-25855509)
chr2 (28-73)||(19989370-19989415)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-274)||(22585924-22586198)
chr8 (1-274)||(22582062-22582335)
chr8 (27-274)||(7169811-7170058)
chr8 (4-274)||(43371675-43371945)
chr8 (4-274)||(2144882-2145152)
chr8 (1-274)||(43683120-43683393)
chr8 (4-274)||(35964629-35964898)
chr8 (4-274)||(8421736-8422006)
chr8 (4-274)||(7341990-7342260)
chr8 (4-274)||(32430745-32431015)
chr8 (4-274)||(32376788-32377058)
chr8 (4-274)||(30303490-30303760)
chr8 (1-55)||(17317388-17317442)
chr8 (186-258)||(44321952-44322024)
chr8 (1-55)||(17340936-17340990)
chr8 (186-236)||(43611200-43611250)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (1-274)||(19497347-19497620)
chr1 (1-274)||(38690822-38691095)
chr1 (1-274)||(36074681-36074955)
chr1 (7-274)||(37016825-37017091)
chr1 (5-269)||(12648464-12648728)
chr1 (4-274)||(29354568-29354838)
chr1 (49-274)||(46976762-46976987)
chr1 (1-269)||(51664163-51664431)
chr1 (4-274)||(5079846-5080116)
chr1 (1-274)||(13175686-13175958)
chr1 (4-272)||(50115648-50115916)
chr1 (4-274)||(3991516-3991786)
chr1 (4-274)||(38773994-38774264)
chr1 (4-274)||(44467493-44467763)
chr1 (4-274)||(3946341-3946611)
chr1 (4-274)||(13631327-13631597)
chr1 (4-274)||(20351367-20351637)
chr1 (1-146)||(32105679-32105824)
chr1 (1-46)||(46975069-46975114)
chr1 (166-258)||(36359395-36359487)
chr1 (84-274)||(25232222-25232409)
chr1 (199-258)||(18886832-18886891)
chr1 (166-236)||(7404714-7404784)
chr1 (186-236)||(27284154-27284204)
chr1 (186-236)||(28864004-28864054)
chr1 (2-55)||(27283970-27284023)
chr1 (1-53)||(25232139-25232191)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-274)||(4198786-4199059)
chr5 (4-274)||(7798898-7799168)
chr5 (4-274)||(7019846-7020116)
chr5 (4-274)||(13565987-13566257)
chr5 (4-274)||(25894977-25895247)
chr5 (4-274)||(27865725-27865995)
chr5 (4-274)||(37818757-37819027)
chr5 (4-271)||(1037262-1037529)
chr5 (4-274)||(11031332-11031602)
chr5 (4-274)||(28884318-28884588)
chr5 (4-274)||(38858070-38858340)
chr5 (1-274)||(20288176-20288447)
chr5 (1-99)||(18536395-18536492)
chr5 (4-55)||(34079691-34079742)
chr5 (186-258)||(6553903-6553975)
chr5 (199-258)||(11820343-11820402)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (1-274)||(76903-77176)
chr3 (4-274)||(36815396-36815666)
chr3 (1-267)||(29949889-29950155)
chr3 (1-267)||(29999043-29999309)
chr3 (4-274)||(46991128-46991398)
chr3 (4-274)||(48248749-48249019)
chr3 (4-274)||(13745601-13745871)
chr3 (5-266)||(14400469-14400730)
chr3 (4-274)||(6503838-6504108)
chr3 (4-274)||(21954120-21954392)
chr3 (4-274)||(3950654-3950924)
chr3 (4-274)||(6742798-6743068)
chr3 (4-274)||(8158863-8159133)
chr3 (4-274)||(30945522-30945792)
chr3 (4-274)||(16446531-16446801)
chr3 (165-258)||(33940934-33941027)
chr3 (186-258)||(4119669-4119741)
chr3 (186-258)||(51547408-51547480)
chr3 (1-55)||(8118518-8118572)
chr3 (186-236)||(32426942-32426992)
chr3 (186-235)||(10286165-10286214)
chr3 (199-231)||(9555666-9555698)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (4-274)||(15237-15507)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (4-274)||(2792-3062)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (4-274)||(34720-34990)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (178-274)||(17778-17874)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (1-267)||(959-1223)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (186-258)||(4950-5022)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (1-56)||(2100-2155)
scaffold0297 (176-232)||(1923-1979)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 8401409 - 8401682
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8401409 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcagaaccaccaacatggtagaatcagctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 8401508  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8401509 gtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 8401608  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8401609 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaaatatgctttagacaaca 8401682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 47062789 - 47063062
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  47062789 atagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 47062888  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||    
T  47062889 gtgtaggtgatttgggtacttgttggaagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacttttggtcagaacgttagcgtgtt 47062988  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062989 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 47063062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10707835 - 10707561
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatgg-tagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10707835 atagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggaccaccaacagggataaaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaat 10707736  T
Q  100 agtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  10707735 agtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttgccgtgt 10707636  T
Q  200 tggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707635 tggaacatagattcaaagatatcactttgtactccagcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 10707561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 42501318 - 42501588
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  42501318 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgaccacaaacatggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 42501417  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||| ||  || |||| |||||    
T  42501418 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcatttggtcacagtgtttccgtgttgga 42501517  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501518 acatagattcaaagatgtcaccttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 42501588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 18107299 - 18107569
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  18107299 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 18107398  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  18107399 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcaaagcgtttgcgtgttgga 18107498  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18107499 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtttagaaatgctttggacaaca 18107569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 15067800 - 15068070
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  15067800 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 15067899  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  15067900 tggatgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcacagcgtttgcgtgttgga 15067999  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068000 aaatagattcaaagatgtcactttatactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 15068070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 30788450 - 30788720
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  30788450 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 30788549  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  30788550 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 30788649  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30788650 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 30788720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43622285 - 43622015
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  43622285 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 43622186  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  43622185 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 43622086  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43622085 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 43622015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 45765290 - 45765560
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  45765290 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 45765389  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  45765390 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 45765489  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45765490 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 45765560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 616899 - 616629
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  616899 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaatagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 616800  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  616799 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcatatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 616700  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  616699 acatagattcaaacatgtcactttgtactcggggttaggtggtcaagtgtctagaaatgctttggacaaca 616629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12113606 - 12113436
Alignment:
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  12113606 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgtgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccatgttgga 12113507  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12113506 acatagattcaaatatgtcactttgtactccggcctaggtggttatgtgtctagatatgctttggacaaca 12113436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43826676 - 43826556
Alignment:
Q  123 ttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43826676 ttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacatttggtcaaagcgtcaccgtattggaacatagattcaaagatgtc 43826577  T
Q  223 actttgtactccggattaggt 243  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  43826576 actttgtactcctggttaggt 43826556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12116525 - 12116418
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12116525 atagtgagggcatggacagaccatgtgctgcatcttggttgcaggaccactaacagggtagaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 12116426  T
Q  101 gtgtgggt 108  Q
    ||||||||    
T  12116425 gtgtgggt 12116418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 43826762 - 43826682
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagta 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  43826762 atagcgagggcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgtagaactaccaacagggtagaatcgactcatgttttagta 43826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 3762835 - 3762889
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3762835 atagtgggggcatggtcagaccatgtcttgcatcttggctgcagaaccaccaaca 3762889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43378245 - 43378183
Alignment:
Q  196 gtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  43378245 gtattggaaaatcgatacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacgtgtctaga 43378183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Original strand, 1298113 - 1298172
Alignment:
Q  199 ttggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  1298113 ttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 1298172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25569602 - 25569530
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  25569602 gagcgttacggtcttggaacataagtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 25569530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 46792439 - 46792511
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||||  ||||||||    
T  46792439 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtacttcgggttggggggtcacatgtctaga 46792511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21357506 - 21357233
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21357506 atagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaatatttggacaata 21357407  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21357406 atgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcaatgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccgtatt 21357307  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21357306 ggaacataggttcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtccagatatgctttggacaaca 21357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23961488 - 23961215
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23961488 atagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaatatttggacaata 23961389  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23961388 atgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcaatgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccgtatt 23961289  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23961288 ggaacataggttcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtccagatatgctttggacaaca 23961215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 31148230 - 31148500
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  31148230 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaagagggtcgaatcagctcacgatttattgaagaaatatttggacaatagtg 31148329  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  31148330 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcattgctatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgttgga 31148429  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31148430 acatagattcaaatatgtcactttgtactcggggataggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 31148500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 18607896 - 18608167
Alignment:
Q  3 agtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  18607896 agtgagggcatgaacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaactgggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagt 18607995  T
Q  103 gtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgg 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||    
T  18607996 gtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagatcactgcgatacaaacaacctttggtccaagcgttagcgtgttgg 18608095  T
Q  203 aacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18608096 aacatggattcaaagatgtcactttgtactccaatttaggtggtcatgcgtttagatatgctttggacaaca 18608167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 28358229 - 28358498
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  28358229 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcgactcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 28358328  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  28358329 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatataaacatcctttggtcaaagcgtttgcgtgttgga 28358428  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28358429 aaatagattcaaagatgtcactttgtact-cgggttaggtggtcatgtgtctagatatggtttggacaaca 28358498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1610901 - 1610631
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  1610901 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 1610802  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  1610801 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 1610702  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1610701 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 1610631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 254560 - 254299
Alignment:
Q  5 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgt 104  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||    
T  254560 tgagagcatggacagactatgtgttgcatcttggatgcagaaccaccaacaaggtagaattggctcatgctatagtaaataaatatttgagcaatagtgt 254461  T
Q  105 gggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | | ||||||||| |||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  254460 gggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgattcagttaactacgatacaaacatcatttgatcagagttacaccatattggaa 254361  T
Q  205 catagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgcttt 266  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  254360 catagattcaaatacgtcactttgtactatggattagggggttatgtgtctagatatgcttt 254299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34110855 - 34110718
Alignment:
Q  3 agtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagt 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||| |  || |||  | |||||| |  | | | ||||||||||  |||||||    
T  34110855 agtgaaggcatgggcagaccgtgtcttgcatcttggctacaaaaccaccaatagagttgaaaggactcatggtgaattgaagaaatatttgagcaatagt 34110756  T
Q  103 gtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatga 140  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34110755 gtggatgatttggatacttgttgggagaaaatacatga 34110718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26684154 - 26684104
Alignment:
Q  5 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26684154 tgagggcatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaaca 26684104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17238984 - 17238732
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17238984 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaata 17238885  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17238884 gcgtgggtgttttgggtacttgttgggagaaaataaatgacatgttggtgcttcagttcactgcaatacaaacaacatttggtcagagcgttaccgtatt 17238785  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17238784 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgt 17238732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38462993 - 38462720
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38462993 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccagcaacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 38462894  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  38462893 gtgtgggtgatttgggtactttttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccgtgtt 38462794  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38462793 ggagcatagattcaaagatgtcattttgtactccgacttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 38462720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51643160 - 51642887
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  51643160 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagagtagaatcgactcatgctttattgaagaaatatttggacaata 51643061  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  51643060 gtgtaggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaaccgttggtcagagcgttaccgtgtt 51642961  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642960 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccagctcaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 51642887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 4770039 - 4770309
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  4770039 atagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacaaggtcgaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaaca 4770138  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||    
T  4770139 gtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatgcatgacatgt---tgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttgccgtgtt 4770235  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4770236 ggaacatagattcaaatatgtcattttgtactctgaattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 4770309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 3405701 - 3405971
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  3405701 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaatagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 3405800  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  3405801 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcacttctatacaaacatcctttggtcaaagcgtttgcgtgttgga 3405900  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405901 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 3405971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4978110 - 4977846
Alignment:
Q  5 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||    
T  4978110 tgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccagcagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaagtatttggtcaatagtgt 4978011  T
Q  105 gggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaa 204  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||  || |||||||| ||| | | ||||||    
T  4978010 gagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaaccattagtcagagcgttagcatgttggaa 4977911  T
Q  205 catagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977910 catagattcaaagatgtcactctgtactccgggtaaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 4977846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19071807 - 19071537
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  19071807 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 19071708  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  19071707 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 19071608  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19071607 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 19071537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Original strand, 9891813 - 9892053
Alignment:
Q  34 cttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaa 133  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9891813 cttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaa 9891912  T
Q  134 tacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891913 tacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttggaacatagattcaaagatgtcactttgtactc 9892012  T
Q  234 cggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9892013 ggggttaggtggtcatgtgtatagatatgctttggacaaca 9892053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 274
Target Start/End: Original strand, 11503392 - 11503606
Alignment:
Q  61 gaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttatt-gggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattc 159  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  11503392 gaatcagctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgtttgggagaaaatacatgacatgctgttgcttcagttc 11503491  T
Q  160 aatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagat 259  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11503492 actgcgatacaaacaaccattggtcagagcgttagcatgttggaacatagattcaaagatgtcattttgtactccagcttaggtggtcatgtgtctagat 11503591  T
Q  260 atgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||| ||||    
T  11503592 atgctttggaaaaca 11503606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 4977662 - 4977834
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||     
T  4977662 gtgagggcatggacagactgtgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagta 4977761  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaac 176  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  4977762 tgggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcatttcactgcgatacaaacaac 4977834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6183592 - 6183730
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||| |||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||  |||||||| | |||| | ||||||||||  |||||    
T  6183592 atagtgacggcatgaacaaactgtgtcttgcatcttggttacagaaccactaacagagttgaaa-ggctcatggtatagtgaagaaatatttgagcaata 6183690  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatga 140  Q
    |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6183691 gtgctggtgatttggatgcttgttgggagaaaatacatga 6183730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 258
Target Start/End: Original strand, 17917280 - 17917372
Alignment:
Q  166 atacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||||| |||| ||||||  |||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  17917280 atacaatcaacgtttggtaggagcgttacggtcttggaaaatagatacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 17917372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13896902 - 13896851
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13896902 gtgaaggcatggacataccgtgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaaca 13896851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Original strand, 32717420 - 32717479
Alignment:
Q  199 ttggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  32717420 ttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 32717479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20970480 - 20970438
Alignment:
Q  191 ttaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactc 233  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20970480 ttactgtattggaacatagatacaaagatgtcattttgtactc 20970438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Original strand, 1591947 - 1592000
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggatt 239  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1591947 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgttactttgtactccggatt 1592000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 17497453 - 17497506
Alignment:
Q  2 tagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17497453 tagtgagggcatggacataccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaaca 17497506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 4618669 - 4618741
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || |||||  ||||||||    
T  4618669 gagcgttacagtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactctgggttggggggtcacatgtctaga 4618741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20970660 - 20970616
Alignment:
Q  9 ggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaa 53  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20970660 ggcatggacataccttgtgttgcatcttgggtgcaggaccaccaa 20970616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11691986 - 11691715
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11691986 atagttagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaata 11691887  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||    
T  11691886 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttatcttgtt 11691787  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaa 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691786 tgaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaa 11691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24604242 - 24603972
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24604242 gtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 24604143  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24604142 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgttgga 24604043  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604042 acatagattcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 24603972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24940803 - 24940533
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24940803 gtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 24940704  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24940703 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgttgga 24940604  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940603 acatagattcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 24940533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41007132 - 41006859
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  41007132 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggatcaccaacagggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 41007033  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  41007032 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatagatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgtt 41006933  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41006932 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgacttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 41006859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 9656063 - 9656333
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  9656063 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 9656162  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  9656163 tgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgctgcttcagttcaatgcgatacaaacaacctttggttagagcgttagcgtgttgga 9656262  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9656263 acatagattcaaagatgtcactttgtactccaggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 9656333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27274510 - 27274240
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  27274510 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 27274411  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  27274410 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcatagcgttagcgtgttgga 27274311  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274310 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 27274240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28347550 - 28347280
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  28347550 gtgagggcatggacagaccatgtcttgcatcttggttgcaggaccaccaatagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 28347451  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  28347450 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacttgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcaaagcattagcgtgttgga 28347351  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28347350 acatggattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 28347280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 45477263 - 45477536
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  45477263 atagcgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttagtgaataaatatttggaaaata 45477362  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  45477363 gtgtgggtgatttgggtacttgtttggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccttgtt 45477462  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45477463 ggaacatagattcaaagatatcattttgtactccagcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 45477536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12906648 - 12906380
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  12906648 atagtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggttgaatcggctcatgttttagtgaagaaatatttggacaata 12906549  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  12906548 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatggcatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccgtgtt 12906449  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 269  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12906448 tgaacatagattcaaagatgtcattttgtactccggcttaggtggtcaggtgtctagatttgctttgga 12906380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 24751570 - 24751840
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  24751570 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 24751669  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  24751670 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactactatacaaacatcctttggtcacagcgttagcgtgttgga 24751769  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751770 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctatatatgctttggacaaca 24751840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34919938 - 34919686
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34919938 atagtgagagcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaata 34919839  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||    
T  34919838 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgtttcagttcactacgatacaaacaacctttggtccgagcgttaccgtgtt 34919739  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  34919738 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtgctctggcttaggtagtcatgtgt 34919686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17996341 - 17996070
Alignment:
Q  3 agtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagt 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17996341 agtgaaggcatggacagaccatgtgttgcatcttgattgcagaacgaccaaccgggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaataat 17996242  T
Q  103 gtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgg 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  17996241 gtgggtgatttgggtactttttgggagaaaatacatgatatgttggtgattcaattaactgcgatacaaacatcatttggtcagagtgttatcgtattgg 17996142  T
Q  203 aacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17996141 aacatagattcaaagatgtcactttgtactcttggttagggtgttatgtgtcaagatatgttttggacaaca 17996070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 7264891 - 7265161
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  7264891 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 7264990  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||| ||| |||||    
T  7264991 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagtgttagcgtgttgga 7265090  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7265091 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 7265161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 437225 - 437498
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  437225 atagtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacatggttgaatcttctcatgttttattgaagaaatatttggacaata 437324  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  437325 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgctttagttcactatgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgtt 437424  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  437425 agaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcttaggtggtcatgtgtataggtatgctttgaacaaca 437498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3797951 - 3797682
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  3797951 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 3797852  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  3797851 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagtgtt-gcgtgttgga 3797753  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797752 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 3797682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 211591 - 211321
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  211591 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 211492  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  211491 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 211392  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  211391 acatagattcaaagatgtcaccttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 211321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10622604 - 10622334
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  10622604 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 10622505  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  10622504 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 10622405  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10622404 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 10622334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 38947674 - 38947944
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  38947674 gtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 38947773  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  38947774 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 38947873  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38947874 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 38947944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 39795881 - 39796151
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  39795881 gtgagagcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 39795980  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  39795981 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcaattcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 39796080  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39796081 acatagattcaaagatgtcagcttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgccttggacaaca 39796151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 41561923 - 41562193
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  41561923 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 41562022  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  41562023 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 41562122  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41562123 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 41562193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 5349078 - 5349348
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  5349078 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 5349177  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  5349178 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 5349277  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5349278 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatatgtctagaaatgctttggacaaca 5349348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43946165 - 43946021
Alignment:
Q  130 aaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgt 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43946165 aaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaaccattggtcagagcgttagcgtgttggaacatagattcaaagatgtcattttgt 43946066  T
Q  230 actccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43946065 actccggcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggaaaaca 43946021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43948439 - 43948305
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  43948439 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttgggcaata 43948340  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaata 135  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  43948339 gtgtgggtgatttgggtacttgttaggagaaaata 43948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25618242 - 25618093
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||| || |||||||   ||||    
T  25618242 atagtgagggcatggaaagaccatgtgttgcatcttggctgcataaccaccaacagagttgaatcagctcatactttagtaaagatatatttgagtaata 25618143  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtg 150  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25618142 gtgtgggtgatctgggtacttgttgggagaaaatacatgatatgttggtg 25618093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1097976 - 1097889
Alignment:
Q  7 agggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttgg 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  1097976 agggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttgg 1097889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25615364 - 25615286
Alignment:
Q  196 gtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || || || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25615364 gtattggaatatagattcaaagacgtcactttttactatgggttggggggttatgtgtctagatatgctttgggcaaca 25615286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24683979 - 24684091
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||  |||||||| |  | | | ||||||||||  |||||    
T  24683979 atagtgagggcatggacacaccgtgtcttgcatcttagttgcagaaccacaaacaaagttgaaggggctcatggtaaattgaagaaatatttgagcaata 24684078  T
Q  101 gtgtgggtgattt 113  Q
    |||||| ||||||    
T  24684079 gtgtggatgattt 24684091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25855509 - 25855455
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25855509 atagtgaaggcatagacagaccgtgtgtttcatcttgggtgcagaaccaccaaca 25855455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 19989370 - 19989415
Alignment:
Q  28 ttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatg 73  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19989370 ttgcatctagggtgcagaaccaccaacattgttgaatcggctcatg 19989415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22585924 - 22586198
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22585924 atagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaata 22586023  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatactta-ttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |    
T  22586024 gtgtgggtgatttgggtactttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgtgatacaaacaacctttggacagagcgttaccgtgt 22586123  T
Q  200 tggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22586124 tggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgacttaggtggtcatgtgtctagatatgctttcgacaaca 22586198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22582062 - 22582335
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22582062 atagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttgtttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaata 22582161  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||    
T  22582162 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgtgatacaaacaacctttggatagagcgttaccgtgtt 22582261  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22582262 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcttaggtgctcatgtgtctagatatgctttcgacaaca 22582335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 7169811 - 7170058
Alignment:
Q  27 gttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttattgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7169811 gttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgg 7169910  T
Q  127 gagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7169911 gagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcattaccgtcttggaacatagattcaaatatgtcactt 7170010  T
Q  227 tgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7170011 tgtactccgggttaggttgtcatgtttctagatatgttttggacaaca 7170058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 43371675 - 43371945
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  43371675 gtgagggcatggagagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaatagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 43371774  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  43371775 tgggtgatttgggtacttgttggaagaaaatatatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcgtgttgga 43371874  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371875 acatagattcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 43371945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2145152 - 2144882
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  2145152 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtg 2145053  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||  ||| ||| |||||    
T  2145052 tgggtgatttaggtacttgttgggagaaaatacataacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaatctttggtgagagagttagcgtgttgga 2144953  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2144952 acatagattcaaagatgtcactttgtactctgggttaggtggtcatgcgtctagatatgctttggacaaca 2144882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43683393 - 43683120
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  43683393 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgacaaccaacagggtcgaatctgcttatgctttattgaagaaatatttggacaata 43683294  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  43683293 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactacgatacaaacaacctttggtcagagcgttaccgtgtt 43683194  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43683193 ggaacatagattcaaagatgtcattttgtactccagcttaggtggtcatgtgtctagatatgatttggacaaca 43683120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35964898 - 35964629
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | | |||||| || ||||||||||    
T  35964898 gtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttgatttcaggaccacgaaca-ggtcgaatcagctcatgctttattgaagaaatactttgacaatagtg 35964800  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  35964799 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacattatttggtcacagcgttagcgtgttgga 35964700  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35964699 acatagattcaaagatgtcactttgtactcagggttaggtggtcatgtgtctagatatgttttggacaaca 35964629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8422006 - 8421736
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  8422006 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 8421907  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  8421906 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 8421807  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8421806 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 8421736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 7341990 - 7342260
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  7341990 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 7342089  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  7342090 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 7342189  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7342190 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 7342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32431015 - 32430745
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  32431015 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 32430916  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  32430915 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 32430816  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32430815 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 32430745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32377058 - 32376788
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  32377058 gtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 32376959  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  32376958 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 32376859  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32376858 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtgatcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 32376788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30303760 - 30303490
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  30303760 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaaaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 30303661  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  30303660 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 30303561  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30303560 acatagattcaaatatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctataaatgctttggacaaca 30303490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17317388 - 17317442
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17317388 atagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatcttgggtgcagaatcaccaaca 17317442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 44321952 - 44322024
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  44321952 gagcgttacggtattggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 44322024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17340936 - 17340990
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17340936 atagtgagggcaaggacataccgtgtgttgtatcttgggtgcagaaccaccaaca 17340990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43611250 - 43611200
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43611250 gagcgttacagtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgg 43611200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19497620 - 19497347
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19497620 atagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggtggcagaaccaccaacagggtagaataggctcatgctttagtaaagaaatttttggacaata 19497521  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  19497520 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaaccttttgtcagagcgttaccgtatt 19497421  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19497420 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccaggtgaggtggtcatatgtctagatatgttttggacaaca 19497347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38691095 - 38690822
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | ||   | ||||||||| |||||||    
T  38691095 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagagtagaataggctcatgttctatggaagaaatattttgacaata 38690996  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38690995 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcattaccgtgtt 38690896  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38690895 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcgtaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 38690822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36074955 - 36074681
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatgg-tagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36074955 atagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggaccaccaacagggataaaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaat 36074856  T
Q  100 agtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |    
T  36074855 agtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaataaatgacatgttggtgcttcaattcactgcgatacaaacaacctttggtcatagcgttaccgtgt 36074756  T
Q  200 tggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36074755 aggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggcttaggtggtcatgtgtctaaatatgttttggacaaca 36074681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 274
Target Start/End: Original strand, 37016825 - 37017091
Alignment:
Q  7 agggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  37016825 agggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtga 37016924  T
Q  107 gtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaaca 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  37016925 gtgatttgggtacttgttgggagaaa-tacatgacatgttgttgcttcagttcattgctatacaaacatcctttggtcacagcgttagcgtgttggaaca 37017023  T
Q  207 tagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37017024 tagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 37017091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12648728 - 12648464
Alignment:
Q  5 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  12648728 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgt 12648629  T
Q  105 gggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| | | ||| ||| ||||||    
T  12648628 gggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacaacgttagcgtgttggaa 12648529  T
Q  205 catagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648528 catagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 12648464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29354838 - 29354568
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  29354838 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 29354739  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  29354738 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 29354639  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354638 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 29354568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 274
Target Start/End: Original strand, 46976762 - 46976987
Alignment:
Q  49 accaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttgg 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46976762 accaacaaggtagaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgg 46976861  T
Q  149 tgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtca 248  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46976862 tgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcaaagcattaccgtgttagaacatagattcaaaaatgtcactttgtactccggcttaggtggtca 46976961  T
Q  249 tgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  46976962 tgtgtctagatatgctttggacaaca 46976987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 51664163 - 51664431
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  51664163 atagtgaaggcatggacaaaccatatgttgcatcttggttgcaggaccactaacagggtcgaatcggctcatgctttattggataaatatttggacaata 51664262  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  51664263 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatatatgacatgttgttgcttcagttcattgcgatacaaacaacatttggtcagagcgttactgtgtt 51664362  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttgga 269  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51664363 ggaacataaatttaaagatgtcattttgtactccggcttaggttgtcatgtgtctagatatgctttgga 51664431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 5079846 - 5080116
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  5079846 gtgaaggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaataattggacaatagtg 5079945  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||  |  ||  ||| |||||    
T  5079946 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcaccgtgtttgcgtgttgga 5080045  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5080046 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 5080116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 13175686 - 13175958
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  13175686 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaagaccatcaacagggtcgaactagctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatg 13175785  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  13175786 gtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcgatgcaaacaacctttggtcagagcgttaccgtgtt 13175885  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13175886 gg-acatagattcatagatgtcattttgtactctggcttaggtggtcatgtgtctagatttactttggacaaca 13175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50115916 - 50115648
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || | | ||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  50115916 gtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccactaacagggtcgatttgtctcatgcttttttgaagaaatacttggacaatagtg 50115817  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  50115816 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacattttttggtcacagcgttagcgtgttgga 50115717  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaa 272  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50115716 acatagatttaaagatgtcattttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatactttggacaa 50115648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 3991516 - 3991786
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  3991516 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 3991615  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  3991616 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 3991715  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3991716 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 3991786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38774264 - 38773994
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  38774264 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 38774165  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  38774164 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 38774065  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38774064 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 38773994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 44467493 - 44467763
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  44467493 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 44467592  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  44467593 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 44467692  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44467693 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 44467763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3946611 - 3946341
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  3946611 gtgagggcatagacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 3946512  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  3946511 tgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 3946412  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3946411 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 3946341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 13631327 - 13631597
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  13631327 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 13631426  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  13631427 tgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaagtgtttgcgtgttgga 13631526  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13631527 acatagattcaaagatgtcagcttgtacttggggttgggtggtcatgtgtctagatatgccttggacaaca 13631597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 20351367 - 20351637
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  20351367 gtgagggcatggacagaccatgtattgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 20351466  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  20351467 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 20351566  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20351567 acatagattcaaagatgtcgccttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 20351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32105824 - 32105679
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || |||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||    
T  32105824 atagtgagggcatggacatatcatgtcttgcatcttggatacagaaccaccaacagagttgaaggggctcatgctataataaagaaatattcgagcaata 32105725  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgtt 146  Q
     |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  32105724 atgtgggtgatttgggtacttgctgagagaaaatacatgatatgtt 32105679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 46975069 - 46975114
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaa 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975069 atagtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcagaa 46975114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36359487 - 36359395
Alignment:
Q  166 atacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  36359487 atacaatcatcatttggtaggagcgttacggtcttggaacataggtataaagatgtcactttgtactccgggttagggggtcacgtgtctaga 36359395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 274
Target Start/End: Original strand, 25232222 - 25232409
Alignment:
Q  84 gaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggt 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||| |  | || | ||  ||||||||| |||||||     
T  25232222 gaaatatttgagcaatagtgtggatgatttgggtactt---gggagaaaatacatgatatgttggtgatctagttaactgagatacaaacatcatttggg 25232318  T
Q  184 cagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
      |||   ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  || |  |  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25232319 aggagttgtactgtattagaacatatattcaaagacgtcattttgtactttgggtcggtgggttatgtgtctagatatgctctgggcaaca 25232409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18886891 - 18886832
Alignment:
Q  199 ttggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  18886891 ttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 18886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 7404714 - 7404784
Alignment:
Q  166 atacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgg 236  Q
    |||||| || ||||||||  |||| ||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7404714 atacaatcatcatttggtaggagcgttacgatcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgg 7404784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Original strand, 27284154 - 27284204
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27284154 gagcgttacggtcttggaacatcgatacaaagatgtcactttgtactccgg 27284204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Original strand, 28864004 - 28864054
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28864004 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgg 28864054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 27283970 - 27284023
Alignment:
Q  2 tagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27283970 tagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaaca 27284023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 25232139 - 25232191
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaa 53  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  25232139 atagtgagggaatggacagaccgtgtcttgcatcctggctgcaaaaccaccaa 25232191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4199059 - 4198786
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  4199059 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 4198960  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||    
T  4198959 gtgtgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgcgatacaaacaacctttggtcagagcgttagcatgtt 4198860  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198859 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtacaccggcttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 4198786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7799168 - 7798898
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  7799168 gtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatattg 7799069  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||  |||||||||||| ||| | | |||||    
T  7799068 tgggtaatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgctttagttcactacgatacaaacaaactttggtcagagcgttagcatgttgga 7798969  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798968 acatagattcaaagatgtcactttgtactccgggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 7798898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7020116 - 7019846
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||    
T  7020116 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcatgcattattgaagaaatacttggacaatagtg 7020017  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  7020016 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcatagtgtttgcgtgttgga 7019917  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7019916 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 7019846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13566257 - 13565987
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  13566257 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 13566158  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  13566157 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatatatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcaaagcgtttgcgtgttgga 13566058  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13566057 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatggtttggacaaca 13565987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25895247 - 25894977
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  25895247 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 25895148  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  25895147 tgggtgatttgggtagttgttgggagaaaatacatggcatgttgttgcttcagttcactgctatacagacatcctttggtcacagcgttagcgtgttgga 25895048  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25895047 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgttttggacaaca 25894977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27865995 - 27865725
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  27865995 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccacaaacagggtcaaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 27865896  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  27865895 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcaaagcgtttgcgtgttgga 27865796  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27865795 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatattctttggacaaca 27865725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37819027 - 37818757
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||    
T  37819027 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaatacttggaaaatagtg 37818928  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| | | ||||||||| | |||||||||||  ||  ||| |||||    
T  37818927 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcactactatacaaacatcctttggtcagagtgtttgcgtgttgga 37818828  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37818827 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 37818757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 271
Target Start/End: Original strand, 1037262 - 1037529
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| | | || ||| ||||| |||||||    
T  1037262 gtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatactttattgaagacatacttggataatagtg 1037361  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| |||  || |||||    
T  1037362 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacaggttgttgcttcaattcactgctatacaaacatcctttggtcacagcgttagtgtgttgga 1037461  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggaca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1037462 acatagattcaaagatgtcactttatactcggggttaggtggtcatgtgtttagatatgctttggaca 1037529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11031602 - 11031332
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  11031602 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcaaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 11031503  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  11031502 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcaattcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 11031403  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11031402 acatagattcaaagatgtcagcttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgccttggacaaca 11031332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28884588 - 28884318
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  28884588 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 28884489  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||  || | ||| ||||||||| | || | ||| ||  ||  ||| |||||    
T  28884488 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatgcacgacatgttgttgcttccgtttactgctatacaaacatccttcgatcaaagtgtttgcgtgttgga 28884389  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884388 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 28884318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38858340 - 38858070
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  38858340 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccacaaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 38858241  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  38858240 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 38858141  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38858140 acatagattcaaagatgtcagcttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgccttggacaaca 38858070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 20288176 - 20288447
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||    
T  20288176 atagtgagggcatggataaaccatgtgttatatcttggttgcagaaccaccaatagggtagaatcggctcatgatttagtaaataaatattggagcaata 20288275  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| | || || | ||  ||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  20288276 gtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacttgatatgctggtgatgcagttaactgtgatacaaacatcatttggtcagagttgtaccgtatt 20288375  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  20288376 ggaagat--attcaaagatgtcactttttactcttggttagggggttatatgtctagatatgctttgggcaaca 20288447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18536492 - 18536395
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  18536492 atagtgagggcatgaacagaccatatgttgcatcttggttgcaggacca-caacgaggtagaaacggctcatgctttattgaagaaatatttggacaat 18536395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 34079691 - 34079742
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34079691 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaaca 34079742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 6553903 - 6553975
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  6553903 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 6553975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Original strand, 11820343 - 11820402
Alignment:
Q  199 ttggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||    
T  11820343 ttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttgggggatcacgtgtctaga 11820402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 77176 - 76903
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  77176 atagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaata 77077  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  77076 gtgcgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcagttcactgcaatacaaacaacctttggtcatagcgttaccgtgtt 76977  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  76976 gaaacataaattcaaagatgtcactttgtactccgacttaggtggtcatgtgtctagaggggctttggacaaca 76903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36815666 - 36815396
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  36815666 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 36815567  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  36815566 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 36815467  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815466 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 36815396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 29949889 - 29950155
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  29949889 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacagggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 29949988  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  29949989 gtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgagatacaaacaacctttggtcagagcgttaccatgtt 29950088  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29950089 ggaacatagattcaaagatgtcattttgtactcccgcttaggtggtcatgtttccagatatgctttg 29950155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 29999043 - 29999309
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  29999043 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacagggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaata 29999142  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  29999143 gtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgagatacaaacaacctttggtcagagcgttaccatgtt 29999242  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29999243 ggaacatagattcaaagatgtcattttgtactcccgcttaggtggtcatgtttccagatatgctttg 29999309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46991398 - 46991128
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  46991398 gtgagggcatggacaggccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 46991299  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| ||| |    
T  46991298 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagcgttagcgtgttgaa 46991199  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991198 atatagattcaaagatgtcactttgtactcggtgttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 46991128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48249019 - 48248749
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  48249019 gtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacaaggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtg 48248920  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||| |||| | | ||| ||| |||||    
T  48248919 tgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttagtcataacgttagcgtgttgga 48248820  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48248819 acatagattcaaagatgtcattttgtactcggggttaggtggttatgtgtctagatatgctttggacaaca 48248749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13745871 - 13745601
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  13745871 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 13745772  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  13745771 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcgtgttgga 13745672  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745671 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 13745601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 14400469 - 14400730
Alignment:
Q  5 tgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgt 104  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  14400469 tgagggcatagaaagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgt 14400568  T
Q  105 gggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaa 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  14400569 gggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagcgttagcgtgttggaa 14400668  T
Q  205 catagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgcttt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400669 catagattcaaagatgtcactttatactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgcttt 14400730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6504108 - 6503838
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |    
T  6504108 gtgagggcatagacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaacaacaggttcaaattggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagag 6504009  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| || ||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  6504008 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcacttctatacaaacatcaattggtcacagcgttagcgtgttgga 6503909  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6503908 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 6503838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21954392 - 21954120
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||| ||    
T  21954392 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgaaggaccacaaacagagtcgaatcggcacatgctttattgaagaaataattggacaataatg 21954293  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattacc--gtattg 201  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| | |  || |||    
T  21954292 tgagtaatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcatttcactgcgatacaaacaatctttggtcagagcatgagcgtgtgttg 21954193  T
Q  202 gaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954192 gaacatagattgaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 21954120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 3950654 - 3950924
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  3950654 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 3950753  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  3950754 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 3950853  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3950854 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 3950924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 6742798 - 6743068
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  6742798 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 6742897  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  6742898 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 6742997  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6742998 acatagattcaaagatgtcgccttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 6743068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8159133 - 8158863
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  8159133 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 8159034  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  8159033 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacataacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 8158934  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8158933 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgttttggacaaca 8158863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30945792 - 30945522
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| || ||||||||||    
T  30945792 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatactttgacaatagtg 30945693  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  30945692 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 30945593  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30945592 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 30945522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 16446531 - 16446801
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  16446531 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 16446630  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  16446631 tgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcaccgctatacaaacatcctttggtcaaagtgtttgcgtgttgga 16446730  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16446731 acatagattcaaagatgtcagcttgtacttggggttgggtggtcatgtgtctagatatgccttggacaaca 16446801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 258
Target Start/End: Original strand, 33940934 - 33941027
Alignment:
Q  165 aatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    ||||||| || ||||||||  |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  33940934 aatacaatcatcatttggtaggagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 33941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4119741 - 4119669
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  4119741 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 4119669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51547480 - 51547408
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  51547480 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 51547408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 8118518 - 8118572
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaaca 55  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8118518 atagtgagggcatgggcataccttgtattgcatcttggatgcaggaccaccaaca 8118572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Original strand, 32426942 - 32426992
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccgg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32426942 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgg 32426992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10286214 - 10286165
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccg 235  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10286214 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccg 10286165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9555698 - 9555666
Alignment:
Q  199 ttggaacatagattcaaagatgtcactttgtac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9555698 ttggaacatagatacaaagatgtcactttgtac 9555666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15507 - 15237
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  15507 gtgagggaatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 15408  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||  ||  | | |||||    
T  15407 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacatgttgttgcttcagttcactgctatacaaacatcctttggtcacagtgtttgcatgttgga 15308  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 15237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 2792 - 3062
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  2792 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 2891  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  2892 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 2991  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2992 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 3062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 34720 - 34990
Alignment:
Q  4 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  34720 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtg 34819  T
Q  104 tgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtattgga 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |  || ||||||||| | |||||||| |   ||  ||| |||||    
T  34820 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacatgttgttgctccagttgaccgctatacaaacatcctttggtcaaaatgtttgcgtgttgga 34919  T
Q  204 acatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34920 acatagattcaaagatgtcactttgtactcggggttaggtggtcatgtgtctagaaatgctttggacaaca 34990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Original strand, 17778 - 17874
Alignment:
Q  178 tttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttggacaaca 274  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17778 tttggtcagagcgttagcgtgttggaacatagattcaaagatgtcagtttgtacttcgggttaggtggtcatgtgtctagatatactttgtacaaca 17874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1223 - 959
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacatggtagaatcggctcatgctttagtaatgaaatatttggacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||  ||||  || |  ||| | |||  ||||    ||||    
T  1223 atagtgagggcatggacagaccatgtcttgcatcttggctgccgaaccaccaacagagttgaaggggcttttggtagagtgaagaataatttaagtaata 1124  T
Q  101 gtgtgggtgatttggatacttattgggagaaaatacatgacatgttggtgcttcaattcaatgcaatacaaacaacatttggtcagagcattaccgtatt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | || || | ||  ||||||||| |||||||   |||    || |||||    
T  1123 gtgtggatgatttgggtact--ttgggagaaaatacatgatatgttggtgatccagttaactgagatacaaacatcatttgggaggagttgcactgtatt 1026  T
Q  201 ggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctagatatgctttg 267  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||  |||||||    
T  1025 agaacatagatacaaagacgtcattttgtactctaggttagggggttatgtatctagacgtgctttg 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Original strand, 4950 - 5022
Alignment:
Q  186 gagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtactccggattaggtggtcatgtgtctaga 258  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||    
T  4950 gagcgttacggtcttggaacataggtacaaagatgtcactttgtactccgggttggggggtcacatgtctaga 5022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 2155 - 2100
Alignment:
Q  1 atagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacat 56  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2155 atagtgagggtatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacat 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1979 - 1923
Alignment:
Q  176 catttggtcagagcattaccgtattggaacatagattcaaagatgtcactttgtact 232  Q
    ||||||||  |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1979 catttggtaggagcgttacggtcttggaacatagatacaaagatgtcattttgtact 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University