View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20446_low_8 (Length: 382)

Name: NF20446_low_8
Description: NF20446
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20446_low_8
NF20446_low_8
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (82-365)||(54795546-54795828)
chr4 (82-365)||(13612909-13613191)
chr4 (82-365)||(50767093-50767375)
chr4 (82-365)||(27270412-27270694)
chr4 (82-365)||(11650783-11651065)
chr4 (100-365)||(31663984-31664248)
chr4 (84-365)||(41832437-41832718)
chr4 (82-363)||(36954829-36955109)
chr4 (82-365)||(12700385-12700667)
chr4 (82-365)||(38141374-38141656)
chr4 (82-365)||(43564477-43564759)
chr4 (83-365)||(4632521-4632803)
chr4 (88-365)||(36584488-36584764)
chr4 (82-365)||(6755888-6756169)
chr4 (82-365)||(13233289-13233571)
chr4 (82-365)||(16925165-16925447)
chr4 (83-365)||(31581567-31581848)
chr4 (82-365)||(18491246-18491528)
chr4 (82-365)||(44134553-44134834)
chr4 (82-365)||(44745407-44745689)
chr4 (82-365)||(40228247-40228529)
chr4 (82-365)||(10096274-10096555)
chr4 (100-365)||(22647189-22647452)
chr4 (82-365)||(2654727-2655009)
chr4 (82-365)||(52581515-52581798)
chr4 (82-365)||(19653462-19653743)
chr4 (82-290)||(44817442-44817648)
chr4 (82-230)||(45670019-45670166)
chr4 (203-365)||(51001542-51001703)
chr4 (209-361)||(36801795-36801947)
chr4 (88-237)||(31663998-31664147)
chr4 (206-361)||(13869211-13869366)
chr4 (98-228)||(13857687-13857817)
chr4 (202-336)||(45670025-45670158)
chr4 (210-355)||(7638698-7638842)
chr4 (205-336)||(13857680-13857811)
chr4 (201-336)||(36584487-36584621)
chr4 (88-218)||(22647289-22647419)
chr4 (210-361)||(10393896-10394047)
chr4 (95-228)||(13869214-13869347)
chr4 (202-331)||(18707742-18707875)
chr4 (202-361)||(133416-133574)
chr4 (96-214)||(10393896-10394014)
chr4 (84-214)||(36801828-36801958)
chr4 (86-238)||(133414-133565)
chr4 (82-218)||(51001535-51001670)
chr4 (96-237)||(7638702-7638842)
chr4 (202-331)||(18735245-18735378)
chr4 (259-357)||(9046034-9046131)
chr4 (84-218)||(18735241-18735379)
chr4 (204-329)||(44817517-44817640)
chr4 (88-180)||(44817438-44817530)
chr4 (100-219)||(26653098-26653217)
chr4 (271-355)||(7776903-7776987)
chr4 (202-331)||(18668994-18669127)
chr4 (294-361)||(5734193-5734260)
chr4 (214-365)||(26653066-26653217)
chr4 (84-217)||(9046060-9046178)
chr4 (84-219)||(18668990-18669129)
chr4 (84-219)||(18707738-18707877)
chr4 (160-237)||(7776906-7776983)
chr4 (249-331)||(18715045-18715127)
chr4 (307-365)||(45670168-45670226)
chr4 (84-158)||(5734121-5734195)
chr4 (209-273)||(5734132-5734196)
chr4 (88-120)||(45670138-45670170)
chr4 (88-123)||(2763033-2763068)
chr4 (184-217)||(5734197-5734230)
chr4 (84-121)||(18714841-18714878)
chr4 (142-219)||(18715052-18715129)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (84-365)||(43348695-43348975)
chr5 (82-365)||(8074055-8074337)
chr5 (82-365)||(3631318-3631600)
chr5 (82-365)||(7440297-7440579)
chr5 (82-365)||(16823190-16823472)
chr5 (82-365)||(26525046-26525328)
chr5 (82-365)||(32304469-32304751)
chr5 (82-365)||(41084398-41084680)
chr5 (82-365)||(9595982-9596264)
chr5 (82-365)||(30772938-30773220)
chr5 (82-365)||(43358469-43358751)
chr5 (82-365)||(26296825-26297107)
chr5 (82-365)||(25701238-25701519)
chr5 (82-365)||(10925568-10925850)
chr5 (161-365)||(26784968-26785171)
chr5 (82-365)||(13013071-13013353)
chr5 (82-365)||(13084459-13084741)
chr5 (82-365)||(15374174-15374441)
chr5 (205-365)||(20487040-20487200)
chr5 (111-365)||(15374301-15374568)
chr5 (202-365)||(9737637-9737799)
chr5 (202-361)||(19577114-19577273)
chr5 (84-219)||(19577142-19577277)
chr5 (84-237)||(9737651-9737803)
chr5 (212-360)||(22578869-22579017)
chr5 (209-361)||(41817525-41817677)
chr5 (205-350)||(37042497-37042643)
chr5 (82-219)||(29390328-29390464)
chr5 (84-217)||(41817514-41817647)
chr5 (200-365)||(20656787-20656952)
chr5 (96-237)||(37042496-37042638)
chr5 (84-237)||(20487033-20487186)
chr5 (90-237)||(26785010-26785157)
chr5 (202-341)||(29390334-29390472)
chr5 (82-218)||(20656820-20656956)
chr5 (84-217)||(22578898-22579031)
chr5 (202-317)||(5844171-5844285)
chr5 (205-344)||(28662185-28662324)
chr5 (96-228)||(28662190-28662322)
chr5 (202-313)||(30050074-30050184)
chr5 (212-322)||(20071186-20071296)
chr5 (98-172)||(20071222-20071296)
chr5 (82-203)||(5844165-5844285)
chr5 (96-135)||(20117490-20117529)
chr5 (84-127)||(30050145-30050188)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (82-365)||(7413091-7413373)
chr8 (82-365)||(5589991-5590273)
chr8 (82-365)||(43117408-43117691)
chr8 (82-365)||(2317121-2317403)
chr8 (82-365)||(41837772-41838054)
chr8 (82-365)||(7242453-7242734)
chr8 (82-365)||(21434899-21435181)
chr8 (82-365)||(22658164-22658446)
chr8 (82-365)||(42555911-42556193)
chr8 (82-365)||(3659640-3659922)
chr8 (82-365)||(4231279-4231561)
chr8 (82-365)||(28564944-28565226)
chr8 (82-365)||(28572567-28572849)
chr8 (82-365)||(24796871-24797153)
chr8 (83-365)||(10092315-10092596)
chr8 (84-365)||(1183884-1184164)
chr8 (82-365)||(36060417-36060699)
chr8 (82-365)||(41388065-41388347)
chr8 (82-350)||(3886613-3886880)
chr8 (107-365)||(4697891-4698148)
chr8 (82-361)||(6316936-6317214)
chr8 (82-356)||(7012397-7012670)
chr8 (82-365)||(1098117-1098399)
chr8 (89-315)||(41169764-41169989)
chr8 (82-365)||(7421873-7422148)
chr8 (82-290)||(38567189-38567396)
chr8 (205-344)||(36108837-36108976)
chr8 (205-355)||(11635828-11635978)
chr8 (205-350)||(25642678-25642823)
chr8 (202-365)||(197268-197431)
chr8 (202-365)||(312105-312268)
chr8 (96-237)||(4697993-4698134)
chr8 (207-336)||(17836498-17836627)
chr8 (95-219)||(8995043-8995167)
chr8 (203-350)||(41169764-41169911)
chr8 (204-361)||(25382973-25383129)
chr8 (95-228)||(36108841-36108974)
chr8 (201-336)||(4697871-4698005)
chr8 (85-219)||(197265-197399)
chr8 (85-219)||(312102-312236)
chr8 (95-217)||(25642697-25642819)
chr8 (82-218)||(11635819-11635955)
chr8 (202-365)||(9830673-9830835)
chr8 (202-336)||(38567195-38567328)
chr8 (205-341)||(8995039-8995175)
chr8 (82-219)||(9830667-9830803)
chr8 (86-179)||(38567306-38567399)
chr8 (84-219)||(25383001-25383135)
chr8 (88-201)||(41169877-41169989)
chr8 (98-217)||(17836503-17836622)
chr8 (84-215)||(32017942-32018073)
chr8 (202-360)||(32017911-32018069)
chr8 (98-237)||(8996424-8996561)
chr8 (292-365)||(34934302-34934375)
chr8 (205-350)||(8996417-8996560)
chr8 (221-331)||(43073118-43073227)
chr8 (173-237)||(34934316-34934380)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (82-365)||(9624055-9624337)
chr7 (82-365)||(17166925-17167208)
chr7 (82-365)||(22723593-22723875)
chr7 (82-365)||(31065440-31065722)
chr7 (82-365)||(36358127-36358409)
chr7 (82-365)||(45350110-45350392)
chr7 (82-365)||(44467838-44468120)
chr7 (82-365)||(46027739-46028021)
chr7 (82-365)||(26873762-26874044)
chr7 (87-365)||(36675304-36675581)
chr7 (83-365)||(44723880-44724161)
chr7 (82-365)||(44142821-44143102)
chr7 (95-365)||(23469213-23469482)
chr7 (82-365)||(43859150-43859432)
chr7 (82-365)||(39976380-39976662)
chr7 (82-365)||(31428796-31429078)
chr7 (98-365)||(40055666-40055932)
chr7 (82-365)||(42241746-42242028)
chr7 (82-365)||(29075012-29075284)
chr7 (88-365)||(41367724-41368000)
chr7 (82-365)||(16834092-16834376)
chr7 (202-365)||(31931841-31932004)
chr7 (202-365)||(8461764-8461927)
chr7 (206-355)||(25174216-25174365)
chr7 (82-237)||(31931855-31932010)
chr7 (99-237)||(25174223-25174361)
chr7 (88-237)||(40055769-40055918)
chr7 (205-365)||(46828767-46828926)
chr7 (202-365)||(23562578-23562740)
chr7 (175-361)||(29502066-29502254)
chr7 (233-365)||(29663010-29663142)
chr7 (119-237)||(29663010-29663128)
chr7 (88-237)||(23469227-23469376)
chr7 (84-218)||(8461760-8461894)
chr7 (206-361)||(16649531-16649685)
chr7 (206-361)||(17623892-17624046)
chr7 (202-365)||(18104249-18104411)
chr7 (205-361)||(22499716-22499868)
chr7 (84-218)||(29502095-29502229)
chr7 (98-219)||(16649559-16649679)
chr7 (98-219)||(17623920-17624040)
chr7 (82-219)||(23562610-23562746)
chr7 (208-336)||(23469356-23469483)
chr7 (205-361)||(30781079-30781234)
chr7 (82-205)||(18104295-18104417)
chr7 (209-355)||(28754878-28755023)
chr7 (220-331)||(9014475-9014586)
chr7 (209-360)||(8727794-8727945)
chr7 (84-222)||(28754867-28755004)
chr7 (96-219)||(30781084-30781206)
chr7 (95-218)||(46828800-46828922)
chr7 (212-318)||(4248977-4249083)
chr7 (200-356)||(9013879-9014034)
chr7 (273-344)||(4248869-4248940)
chr7 (107-218)||(9014476-9014587)
chr7 (160-228)||(4248871-4248939)
chr7 (84-188)||(22499771-22499875)
chr7 (268-350)||(6961163-6961245)
chr7 (91-217)||(8727790-8727916)
chr7 (252-361)||(24779575-24779684)
chr7 (208-276)||(22566599-22566667)
chr7 (95-155)||(22566606-22566666)
chr7 (84-188)||(40883343-40883447)
chr7 (204-355)||(40883349-40883499)
chr7 (107-237)||(9013900-9014029)
chr7 (87-136)||(6961111-6961160)
chr7 (115-237)||(9021516-9021638)
chr7 (202-255)||(6961112-6961165)
chr7 (174-219)||(6961183-6961228)
chr7 (245-308)||(14629632-14629695)
chr7 (100-193)||(14629633-14629726)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (84-350)||(11935207-11935473)
chr2 (84-365)||(26293221-26293501)
chr2 (84-365)||(36435999-36436279)
chr2 (82-365)||(16194311-16194593)
chr2 (82-365)||(34983335-34983617)
chr2 (82-365)||(2249640-2249922)
chr2 (82-365)||(26860479-26860761)
chr2 (82-355)||(31392606-31392877)
chr2 (88-365)||(1020885-1021161)
chr2 (82-365)||(12995025-12995307)
chr2 (82-365)||(23869722-23870004)
chr2 (82-365)||(44545546-44545828)
chr2 (82-365)||(7366210-7366492)
chr2 (82-365)||(11764853-11765135)
chr2 (82-365)||(13615780-13616062)
chr2 (82-365)||(42016562-42016844)
chr2 (88-365)||(1114855-1115131)
chr2 (82-365)||(6749823-6750105)
chr2 (82-365)||(38527233-38527514)
chr2 (96-365)||(3836158-3836425)
chr2 (84-320)||(28745355-28745589)
chr2 (82-270)||(38763773-38763960)
chr2 (202-365)||(43471384-43471547)
chr2 (202-365)||(22674670-22674833)
chr2 (82-219)||(43471416-43471553)
chr2 (210-365)||(2077563-2077718)
chr2 (204-361)||(31643545-31643702)
chr2 (82-218)||(22674703-22674839)
chr2 (202-350)||(28745439-28745585)
chr2 (202-365)||(34494406-34494568)
chr2 (173-336)||(36436142-36436306)
chr2 (202-336)||(38763779-38763912)
chr2 (82-237)||(41699243-41699395)
chr2 (210-365)||(19283861-19284015)
chr2 (90-237)||(31643555-31643702)
chr2 (99-237)||(29141875-29142013)
chr2 (96-217)||(2077563-2077684)
chr2 (202-365)||(41699249-41699409)
chr2 (82-218)||(34494439-34494574)
chr2 (221-355)||(32100015-32100154)
chr2 (204-331)||(3836304-3836431)
chr2 (82-213)||(19283899-19284029)
chr2 (205-355)||(29035340-29035490)
chr2 (213-355)||(29141871-29142013)
chr2 (84-218)||(32099992-32100131)
chr2 (85-222)||(29035359-29035496)
chr2 (84-169)||(17526038-17526123)
chr2 (92-124)||(11482970-11483002)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (82-365)||(44254418-44254700)
chr3 (92-365)||(32270736-32271009)
chr3 (82-365)||(22729279-22729561)
chr3 (82-365)||(29125861-29126143)
chr3 (87-365)||(11231972-11232249)
chr3 (88-365)||(21259138-21259415)
chr3 (82-365)||(1092695-1092977)
chr3 (82-365)||(27742545-27742827)
chr3 (82-365)||(52202041-52202323)
chr3 (82-365)||(12251325-12251607)
chr3 (82-365)||(28952209-28952491)
chr3 (87-365)||(35083857-35084134)
chr3 (82-327)||(13594729-13594973)
chr3 (82-331)||(21259286-21259534)
chr3 (82-365)||(16908636-16908908)
chr3 (82-357)||(49657037-49657311)
chr3 (82-365)||(50527451-50527733)
chr3 (82-365)||(36633546-36633821)
chr3 (98-350)||(45045284-45045535)
chr3 (82-365)||(52571250-52571524)
chr3 (82-273)||(49169852-49170042)
chr3 (202-365)||(7160221-7160384)
chr3 (203-365)||(25246155-25246317)
chr3 (82-237)||(7160235-7160390)
chr3 (202-365)||(18163783-18163945)
chr3 (223-361)||(31174494-31174632)
chr3 (205-344)||(34660814-34660952)
chr3 (88-237)||(32270750-32270900)
chr3 (82-218)||(18163777-18163912)
chr3 (88-219)||(13594723-13594854)
chr3 (202-336)||(45045274-45045408)
chr3 (202-365)||(44205477-44205640)
chr3 (185-287)||(744015-744116)
chr3 (202-336)||(13594834-13594967)
chr3 (202-331)||(49169858-49169986)
chr3 (82-218)||(25246188-25246324)
chr3 (84-228)||(34660807-34660950)
chr3 (205-361)||(2618953-2619108)
chr3 (102-219)||(31174522-31174639)
chr3 (88-237)||(45045388-45045536)
chr3 (82-237)||(4618210-4618362)
chr3 (95-219)||(2618957-2619080)
chr3 (82-237)||(44205471-44205626)
chr3 (98-182)||(52499197-52499281)
chr3 (202-365)||(4618216-4618376)
chr3 (221-355)||(576405-576538)
chr3 (106-217)||(576428-576539)
chr3 (294-361)||(18657974-18658041)
chr3 (88-185)||(744032-744128)
chr3 (212-289)||(52499204-52499281)
chr3 (281-331)||(743998-744047)
chr3 (84-158)||(18657902-18657976)
chr3 (209-273)||(18657913-18657977)
chr3 (295-365)||(49170168-49170238)
chr3 (184-217)||(18657978-18658011)
chr3 (315-360)||(25807136-25807181)
chr3 (319-360)||(25894576-25894617)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (82-365)||(16692765-16693047)
chr1 (82-365)||(51139745-51140027)
chr1 (82-365)||(44052275-44052557)
chr1 (87-365)||(25298904-25299181)
chr1 (99-365)||(40567042-40567307)
chr1 (82-365)||(919526-919808)
chr1 (82-365)||(23177401-23177683)
chr1 (82-365)||(33011873-33012155)
chr1 (88-365)||(24542596-24542873)
chr1 (82-331)||(24544568-24544816)
chr1 (82-365)||(8086289-8086571)
chr1 (88-331)||(24542744-24542987)
chr1 (88-331)||(24542858-24543101)
chr1 (88-331)||(24542972-24543215)
chr1 (88-331)||(24543086-24543329)
chr1 (88-331)||(24543200-24543443)
chr1 (88-331)||(24543314-24543557)
chr1 (88-331)||(24543428-24543671)
chr1 (88-331)||(24543542-24543785)
chr1 (88-331)||(24543656-24543899)
chr1 (88-331)||(24543770-24544013)
chr1 (88-331)||(24543884-24544127)
chr1 (88-331)||(24543998-24544241)
chr1 (88-331)||(24544112-24544355)
chr1 (88-331)||(24544226-24544469)
chr1 (88-331)||(24544340-24544583)
chr1 (88-331)||(24544454-24544697)
chr1 (82-365)||(47561786-47562068)
chr1 (82-365)||(48708233-48708515)
chr1 (82-365)||(24790494-24790777)
chr1 (82-365)||(29981523-29981805)
chr1 (82-365)||(37125752-37126034)
chr1 (82-365)||(40428597-40428879)
chr1 (82-365)||(42372029-42372311)
chr1 (82-365)||(45836903-45837185)
chr1 (82-365)||(17285109-17285392)
chr1 (82-365)||(29170001-29170283)
chr1 (84-365)||(46224578-46224856)
chr1 (88-365)||(9042235-9042510)
chr1 (82-365)||(6849812-6850093)
chr1 (82-365)||(8530142-8530430)
chr1 (88-237)||(40567144-40567293)
chr1 (87-228)||(9246853-9246994)
chr1 (232-365)||(37343082-37343215)
chr1 (202-361)||(9246834-9246993)
chr1 (82-237)||(44317626-44317780)
chr1 (201-365)||(49001411-49001576)
chr1 (204-344)||(32540544-32540684)
chr1 (202-365)||(44317632-44317794)
chr1 (84-218)||(32540556-32540690)
chr1 (205-355)||(21852069-21852219)
chr1 (84-219)||(21852062-21852197)
chr1 (98-237)||(29055877-29056015)
chr1 (201-331)||(9042383-9042511)
chr1 (232-346)||(29055882-29055996)
chr1 (87-237)||(25030323-25030466)
chr1 (257-350)||(25030372-25030465)
chr1 (226-350)||(46601091-46601215)
chr1 (88-237)||(49001425-49001575)
chr1 (92-237)||(46601071-46601216)
chr1 (118-237)||(37343082-37343201)
chr1 (95-180)||(42225374-42225459)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (88-365)||(65112-65389)
scaffold0014 (83-336)||(64994-65246)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (82-365)||(19105-19387)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (82-365)||(12698554-12698835)
chr6 (82-365)||(34127557-34127839)
chr6 (82-365)||(2660655-2660937)
chr6 (82-365)||(11450322-11450603)
chr6 (82-365)||(15469149-15469430)
chr6 (82-365)||(26468508-26468790)
chr6 (87-365)||(7021882-7022158)
chr6 (82-365)||(34023359-34023641)
chr6 (99-365)||(24130061-24130326)
chr6 (98-350)||(12996359-12996611)
chr6 (82-365)||(16461225-16461508)
chr6 (82-365)||(9078873-9079154)
chr6 (82-365)||(24635287-24635569)
chr6 (82-365)||(8560485-8560768)
chr6 (82-365)||(14882979-14883261)
chr6 (88-365)||(23258771-23259048)
chr6 (102-331)||(23258919-23259147)
chr6 (202-361)||(7536522-7536681)
chr6 (84-237)||(13405307-13405460)
chr6 (202-355)||(13405303-13405456)
chr6 (96-237)||(12996472-12996612)
chr6 (88-237)||(24130075-24130224)
chr6 (245-331)||(31968956-31969043)
chr6 (84-218)||(7536518-7536652)
chr6 (205-326)||(10290526-10290647)
chr6 (200-331)||(23259033-23259163)
chr6 (84-212)||(10290519-10290647)
chr6 (142-218)||(31968955-31969031)
chr6 (98-237)||(1398050-1398188)
chr6 (93-192)||(31489892-31489991)
chr6 (297-350)||(1398051-1398104)
chr6 (209-288)||(31489894-31489973)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (82-365)||(1163-1445)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (82-316)||(331831-332064)
scaffold0002 (202-336)||(331837-331970)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (82-290)||(11237-11444)
scaffold0131 (202-336)||(11243-11376)
scaffold0131 (99-179)||(11367-11447)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (212-322)||(303791-303901)
scaffold0003 (98-172)||(303827-303901)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (204-355)||(82785-82935)
scaffold0041 (84-188)||(82837-82941)
[»] scaffold0778 (1 HSPs)
scaffold0778 (91-123)||(1451-1483)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54795828 - 54795546
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  54795828 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 54795729  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54795728 caaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 54795630  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  54795629 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 54795546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13613191 - 13612909
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  13613191 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc 13613092  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13613091 caaaaa-tttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 13612993  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  13612992 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattt 13612909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 50767093 - 50767375
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  50767093 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacc 50767192  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50767193 caaaaaatttaattaattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 50767291  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  50767292 tgtagtagtccaccaaaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 50767375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 27270412 - 27270694
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  27270412 tcaatgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacc 27270511  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27270512 caaaaaatttaaataattcaattatagatctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 27270610  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  27270611 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 27270694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11651065 - 11650783
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  11651065 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacc 11650966  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11650965 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 11650867  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11650866 tgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 11650783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31664248 - 31663984
Alignment:
Q  100 ttttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaatt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  31664248 ttttgcgagattttatgcaattttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataatt 31664150  T
Q  200 caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31664149 caattataggtctattttgcaagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 31664050  T
Q  300 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31664049 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 31663984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Original strand, 41832437 - 41832718
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  41832437 aacgattatatgtctattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccca 41832536  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  41832537 aaacttttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattctcgcaaattggtg 41832636  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  41832637 tagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattt 41832718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 36955109 - 36954829
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  36955109 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 36955010  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36955009 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatccccgcaaattgg 36954911  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaat 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  36954910 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaat 36954829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12700667 - 12700385
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12700667 tcaacgattataggtttattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 12700568  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12700567 cgaaaa-tttaaatagttaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 12700469  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12700468 tgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 12700385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38141656 - 38141374
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38141656 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcaattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 38141557  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38141556 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 38141458  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38141457 tgtagtggcccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgatactttaaataatttttcaatagttaattt 38141374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 43564477 - 43564759
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||| |    
T  43564477 tcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatc 43564576  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43564577 caaaaa-tttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 43564675  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  43564676 tgtagtggaacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattt 43564759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4632803 - 4632521
Alignment:
Q  83 caacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |    
T  4632803 caacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgc 4632704  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggt 282  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  4632703 gaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattatatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttccgccaagtggt 4632604  T
Q  283 gtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  4632603 gtagtggaccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattt 4632521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Original strand, 36584488 - 36584764
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36584488 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 36584587  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36584588 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttagttgatccaaattcccgctaattggtgtagt 36584686  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  36584687 ggctcacccgaaaaatttaaatatttcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 36584764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 6755888 - 6756169
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6755888 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 6755987  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6755988 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatactattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 6756086  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  6756087 tgtagtggc-cacccgaaaaatttaaatgattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaattttttaattgttaattt 6756169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 13233289 - 13233571
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13233289 tcaacgattatagatctattttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 13233388  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13233389 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatcgg 13233487  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  13233488 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattt 13233571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 16925165 - 16925447
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16925165 tcaacgattataggtctaatttgcgagactttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacc 16925264  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16925265 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 16925363  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16925364 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattt 16925447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31581848 - 31581567
Alignment:
Q  83 caacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||| |    
T  31581848 caacgattataggtctattttgctagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggcccactc 31581749  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggt 282  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31581748 gaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 31581650  T
Q  283 gtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31581649 gtactggctcatccgaaaaatttaaataactcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 31581567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 18491246 - 18491528
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  18491246 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgtaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacc 18491345  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18491346 cgaaaa-tttaaataatttaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 18491444  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  18491445 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatgtttcaatagttaattt 18491528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 44134553 - 44134834
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||    
T  44134553 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatttt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc 44134651  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  44134652 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 44134750  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44134751 tgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44134834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44745689 - 44745407
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||     
T  44745689 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccact 44745590  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44745589 cgaaaa-tttaaataattcaattgtaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 44745491  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  44745490 tgtagtggtccactcaaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattt 44745407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40228529 - 40228247
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||     
T  40228529 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggcccact 40228430  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  40228429 cgaaaa-tttaaataattcaattgtaggtctatttggcgagattttatacgattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgt 40228331  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  40228330 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagtatttaaacaatttttcaatagttaattt 40228247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10096555 - 10096274
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |      
T  10096555 tcaacgattataggttcattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtgtcc-att 10096457  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10096456 caaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatgg 10096357  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  10096356 tgtagtggcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttctaaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 10096274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 365
Target Start/End: Original strand, 22647189 - 22647452
Alignment:
Q  100 ttttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaatt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22647189 ttttgcgagattttatgcaattttgtgtcg-ttttatatttttgttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa-tttaaataatt 22647286  T
Q  200 caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaa 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  22647287 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaa 22647386  T
Q  300 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22647387 aaaattaaataattcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaattttttaatggttaattt 22647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2655009 - 2654727
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |    
T  2655009 tcaacgattatagatctagtttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatc 2654910  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  2654909 cgaaaa-tttaaatagttcaattataggtctattttatgagattttatacaattttacgtcggttttagatttcggttgatcccaatttccgcaaattgg 2654811  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2654810 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 2654727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 52581515 - 52581798
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||  | |||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |    
T  52581515 tcaacgattataggtctattttgcaatattttatggagttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatc 52581614  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||    
T  52581615 caaaaa-tttaaataattcaattatatgtttattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaaattgg 52581713  T
Q  282 tgtagtgg-ctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  52581714 tgtagtggtcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 52581798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19653743 - 19653462
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   ||| | |||||  |||||||     
T  19653743 tcaacgattataggtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggcccact 19653644  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19653643 tgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattt-gtgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattgg 19653546  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19653545 tgtagtggtccatccgaaaaatttaaataactcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 19653462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44817648 - 44817442
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||| |    
T  44817648 tcaacgactataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatc 44817549  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  44817548 caaaaa-tttaaata-ttcaattataggtctattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattgg 44817451  T
Q  282 tgtagtggc 290  Q
    |||||||||    
T  44817450 tgtagtggc 44817442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 45670019 - 45670166
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45670019 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 45670118  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttata 230  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45670119 c-gaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttata 45670166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 365
Target Start/End: Original strand, 51001542 - 51001703
Alignment:
Q  203 ttataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaa 302  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  51001542 ttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaa 51001640  T
Q  303 tttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  51001641 tttaaataattcaattataggtctaatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattt 51001703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36801947 - 36801795
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaa 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36801947 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttata 36801848  T
Q  309 taattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  36801847 taattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttttcaatggtta 36801795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31664147 - 31663998
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  31664147 attataggtctattttgcaagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 31664048  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  31664047 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 31663998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 361
Target Start/End: Original strand, 13869211 - 13869366
Alignment:
Q  206 taggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattt 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  13869211 taggtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaattt 13869310  T
Q  306 aaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||| |||| |||||    
T  13869311 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttcaacggtta 13869366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Original strand, 13857687 - 13857817
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  13857687 tattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 13857786  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13857787 ttcaattataggtctattttgcgagatttta 13857817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 45670025 - 45670158
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  45670025 attataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 45670123  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45670124 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgag 45670158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638698
Alignment:
Q  210 tctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaattttaat 7638744  T
Q  310 aattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  7638743 aattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 336
Target Start/End: Original strand, 13857680 - 13857811
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13857680 ataggtgtattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 13857779  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13857780 taaataattcaattataggtctattttgcgag 13857811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 36584487 - 36584621
Alignment:
Q  201 aattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaa 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36584487 aattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aa 36584585  T
Q  301 aatttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36584586 aatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36584621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Original strand, 22647289 - 22647419
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22647289 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22647388  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  22647389 aattaaataattcaattatatgtctaatttg 22647419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 361
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394047
Alignment:
Q  210 tctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  310 aattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    || ||||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  10393996 aactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttttcaacggtta 10394047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 13869214 - 13869347
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||| |  ||||||| || || || |||||| ||||||||||     
T  13869214 gtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaatttaaa 13869313  T
Q  195 taattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13869314 taattcaattataggtctattttgcgagatttta 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 18707742 - 18707875
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttata----taattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccg 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| ||||| |   ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18707742 attataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccg 18707841  T
Q  298 aaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18707842 caaaatttaaattattcaattataggtctatttt 18707875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Original strand, 133416 - 133574
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  || || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  133416 attataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaaa 133515  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  133516 attt-aataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataattttacaatggtta 133574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 10393896 - 10394014
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  10393896 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 10393995  T
Q  196 aattcaattataggtctat 214  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  10393996 aactcaattataagtctat 10394014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36801958 - 36801828
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||  ||| | |||||| |||||||||     
T  36801958 aacgatcataagtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccg 36801859  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctat 214  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  36801858 aaaaatttatataattcaattataagtctat 36801828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Original strand, 133414 - 133565
Alignment:
Q  86 cgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaa 185  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  || || |||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||    
T  133414 cgattataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaa 133513  T
Q  186 aaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttta 238  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  133514 aaatttaa-taattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttta 133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Original strand, 51001535 - 51001670
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||||    
T  51001535 tcaacgtttataagtctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacc 51001633  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51001634 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 51001670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7638842 - 7638702
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||| || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  7638842 tctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaattttaa-t 7638744  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  7638743 aattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7638702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 18735245 - 18735378
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttata----taattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccg 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||| |   ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||    
T  18735245 attataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccacccg 18735344  T
Q  298 aaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18735345 caaaatttaaattattcaattataggtctatttt 18735378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9046131 - 9046034
Alignment:
Q  259 tgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatg 357  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9046131 tgatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccacca-aaaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttcaatg 9046034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 18735241 - 18735379
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaatt----ttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||   || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  18735241 aacgattataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtcca 18735340  T
Q  180 cccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18735341 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttg 18735379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44817640 - 44817517
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||||||||||| | | |||||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  44817640 tataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaaat 44817542  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctatt 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44817541 ttaaata-ttcaattataggtctatt 44817517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44817530 - 44817438
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccac 180  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  44817530 attataggtctattctgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccac 44817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653098
Alignment:
Q  100 ttttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaatt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| | | |||||||||| | ||  || || |||||||||| |||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  200 caattataggtctattttgc 219  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgc 26653098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Original strand, 7776903 - 7776987
Alignment:
Q  271 ccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  7776903 ccgcaaaatggtgtagtgtcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7776987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 18668994 - 18669127
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttata----taattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccg 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||| ||||| |   ||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||| |  ||||||    
T  18668994 attataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccg 18669093  T
Q  298 aaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18669094 caaaatttaaattattcaattataggtctatttt 18669127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 361
Target Start/End: Original strand, 5734193 - 5734260
Alignment:
Q  294 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||    
T  5734193 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaacggtta 5734260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653066
Alignment:
Q  214 ttttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataatt 313  Q
    |||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||  ||| || | ||||||||| |   |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  314 caattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
     |||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaattttttaatggtaaattt 26653066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9046178 - 9046060
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  9046178 aacgattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggt--------------gatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccacc-a 9046094  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9046093 aaaaatttaaataattcaattatatgtctatttt 9046060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 18668990 - 18669129
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaatt----ttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca 179  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||   || ||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||  | |||    
T  18668990 aacgattataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtcca 18669089  T
Q  180 cccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18669090 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgc 18669129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 18707738 - 18707877
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaatt----ttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca 179  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    |||||| |||   || ||| || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  18707738 aacgattataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgccca 18707837  T
Q  180 cccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18707838 cccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgc 18707877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 7776906 - 7776983
Alignment:
Q  160 caaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  7776906 caaaatggtgtagtgtcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 331
Target Start/End: Original strand, 18715045 - 18715127
Alignment:
Q  249 aggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18715045 aggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctatttt 18715127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 365
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670226
Alignment:
Q  307 aataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 45670226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 158
Target Start/End: Original strand, 5734121 - 5734195
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattccc 158  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5734121 aacgatcatatgtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattccc 5734195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Original strand, 5734132 - 5734196
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccg 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5734132 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 5734196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 120
Target Start/End: Original strand, 45670138 - 45670170
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670138 attatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 123
Target Start/End: Original strand, 2763033 - 2763068
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2763033 attatatgtctattttgagagattttatacaatttt 2763068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 217
Target Start/End: Original strand, 5734197 - 5734230
Alignment:
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5734197 aaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 5734230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Original strand, 18714841 - 18714878
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaatt 121  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18714841 aacgattataggtctactttgcgagattttatacaatt 18714878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 18715052 - 18715129
Alignment:
Q  142 ggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18715052 ggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctattttgc 18715129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Original strand, 43348695 - 43348975
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43348695 aacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccca 43348794  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43348795 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 43348893  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  43348894 tagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 43348975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8074337 - 8074055
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  8074337 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtccacc 8074238  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8074237 caaaaa-tttaaataattcaattataaatctattttgcgagattttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 8074139  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  8074138 tgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattt 8074055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 3631318 - 3631600
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3631318 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 3631417  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3631418 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 3631516  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3631517 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgggactttaaacaatttttcaatagttaattt 3631600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7440579 - 7440297
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7440579 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 7440480  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  7440479 cgaaaa-tttaaataattcaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcctgcaaattgg 7440381  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  7440380 tgtagtggcccacccgaaaattttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 7440297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 16823190 - 16823472
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  16823190 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacc 16823289  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16823290 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatatgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 16823388  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16823389 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 16823472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26525328 - 26525046
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  26525328 tcaacgattataggtctattttgcgagattttttgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc 26525229  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26525228 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattgg 26525130  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  26525129 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaataattaattt 26525046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32304751 - 32304469
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  32304751 tcaacgattataagtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggcccacc 32304652  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  32304651 caaaaa-ttgaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccggaaattgg 32304553  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  32304552 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaattt 32304469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41084680 - 41084398
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |    
T  41084680 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatagaattttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatc 41084581  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41084580 caaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttaattcaaattcccgcaaagtgg 41084482  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  41084481 tgtagtagtccaccggaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 41084398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9596264 - 9595982
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  9596264 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacc 9596165  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||    
T  9596164 caaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttgtgttgattcaaattcctgcaaattgg 9596066  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  9596065 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaattttttaatagttaattt 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 30772938 - 30773220
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  30772938 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 30773037  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30773038 caaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 30773136  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  30773137 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaattt 30773220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 43358469 - 43358751
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||    
T  43358469 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacc 43358568  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43358569 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttatacaattttatgtctgttttaggttacggttgatccaaattcccgcaaattgg 43358667  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  43358668 tgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattt 43358751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26297107 - 26296825
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  26297107 tcaacaattataggtctattttgcaagatcttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatc 26297008  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26297007 caaaatatttaaataattcaattataggcctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 26296909  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  26296908 tgtagtagtccacccgaaaaatgtaaacaattcaattatagatctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 26296825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25701519 - 25701238
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25701519 tcaacgattatagatctattttgcaagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 25701420  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25701419 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattt-atgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattgg 25701322  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25701321 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattttttagactttaaacaatttttcaatagttaattt 25701238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 10925568 - 10925850
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10925568 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacc 10925667  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
      |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  10925668 tgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattgg 10925766  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10925767 tgtagtggtctaccagaaaaatttaaataattcaattataggtctaacttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattt 10925850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 161 - 365
Target Start/End: Original strand, 26784968 - 26785171
Alignment:
Q  161 aaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttg 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26784968 aaagtggtgtagtggcccacccaaaaa-ttgaaataattcaactataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttg 26785066  T
Q  261 atccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26785067 atccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagtttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggtt 26785166  T
Q  361 aattt 365  Q
    |||||    
T  26785167 aattt 26785171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13013353 - 13013071
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||     
T  13013353 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttaagcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccact 13013254  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13013253 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattgg 13013155  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13013154 tatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 13013071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13084741 - 13084459
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||  |||| || | ||||||    
T  13084741 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccacc 13084642  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  13084641 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattgg 13084543  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13084542 tatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 13084459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 15374174 - 15374441
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||   ||||||||||||  || |||||    
T  15374174 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtccacc 15374273  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| ||               ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15374274 cacaaa-tttaaataattcaattatatgt---------------ttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 15374357  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15374358 tgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 15374441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 365
Target Start/End: Original strand, 20487040 - 20487200
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20487040 ataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatt 20487139  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  20487140 taaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattt 20487200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 365
Target Start/End: Original strand, 15374301 - 15374568
Alignment:
Q  111 tttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggt 210  Q
    |||||||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15374301 tttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggt 15374400  T
Q  211 ctattttgcaagattttatataatttt----------at----gtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcaccc 296  Q
    ||| ||||| ||| |||| | ||||||          ||    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |     
T  15374401 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtag-ttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaact 15374499  T
Q  297 gaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15374500 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 15374568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9737799 - 9737637
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9737799 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 9737701  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9737700 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 9737637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19577273 - 19577114
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19577273 attatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 19577174  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||| |||| |||||    
T  19577173 atttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttttcaacggtta 19577114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19577277 - 19577142
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |     
T  19577277 aacgattatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcg 19577178  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  19577177 aaaaatttaaataatttaattataggtctgttttgc 19577142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9737803 - 9737651
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  9737803 aacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc- 9737705  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  9737704 gaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9737651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22579017 - 22578869
Alignment:
Q  212 tattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataa 311  Q
    |||||| | ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22579017 tattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataa 22578918  T
Q  312 ttcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  22578917 ttcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttttcaacggtt 22578869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 361
Target Start/End: Original strand, 41817525 - 41817677
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaa 308  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||  ||||  |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41817525 gtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaa 41817624  T
Q  309 taattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41817625 taattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttttcaatggtta 41817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042497
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccga-aaaat 303  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||     
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaa 37042544  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  37042543 ttaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataattt 37042497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Original strand, 29390328 - 29390464
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29390328 tcaacgattataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 29390427  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29390428 c-gaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgc 29390464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Original strand, 41817514 - 41817647
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||     
T  41817514 aacgatcatatgtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 41817613  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  41817614 aaaaatttaaataattcaattgtaggtatatttt 41817647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20656952 - 20656787
Alignment:
Q  200 caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaa 299  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||    
T  20656952 caattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaa 20656853  T
Q  300 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20656852 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattt 20656787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37042638 - 37042496
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc-aaaaaatttaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||     
T  37042638 tctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaattaaa 37042539  T
Q  195 taattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  37042538 taattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Original strand, 20487033 - 20487186
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||     
T  20487033 aacgatcataggtatattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccg 20487132  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  20487133 aaaaatttaaaaaattcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttt 20487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Original strand, 26785010 - 26785157
Alignment:
Q  90 tatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaat 189  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| | |||| |    
T  26785010 tataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagt 26785109  T
Q  190 ttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||    
T  26785110 ttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttt 26785157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 341
Target Start/End: Original strand, 29390334 - 29390472
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29390334 attataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 29390432  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggcttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  29390433 atttaaataattcaattatagatctaatttgcgagacttt 29390472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20656956 - 20656820
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||| |    
T  20656956 tcaacaattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatc 20656857  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20656856 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 20656820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22579031 - 22578898
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||     
T  22579031 aacgatcataagtttattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccg 22578932  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22578931 aaaaatttaaataattcaattataaatctatttt 22578898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 5844171 - 5844285
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  5844171 attataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccg-aaa 5844269  T
Q  302 atttaaataattcaat 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  5844270 atttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Original strand, 28662185 - 28662324
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||   ||||| ||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  28662185 atagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatt 28662284  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaa 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  28662285 taaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaa 28662324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 28662190 - 28662322
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||||||    |||| |||||||  ||  |  || |||||||||| |    
T  28662190 tctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatttaaat 28662289  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28662290 aattcaattataggtttattttgcaagacttta 28662322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30050184 - 30050074
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||  |||| |||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||| || || ||||    
T  30050184 attataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaattttcgtaaagtggtgtagtggc-caacctaaaa 30050086  T
Q  302 atttaaataatt 313  Q
    ||||||||||||    
T  30050085 atttaaataatt 30050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071186
Alignment:
Q  212 tattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataa 311  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||  || |||||   ||| |||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 20071197  T
Q  312 ttcaattatag 322  Q
    |||||||||||    
T  20071196 ttcaattatag 20071186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20071296 - 20071222
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtag 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  20071296 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtag 20071222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 5844165 - 5844285
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||    |||| |||||| | ||||||||    
T  5844165 tcaacgattataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacc 5844264  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaat 203  Q
    |  ||||||||| |||||||||    
T  5844265 c-gaaaatttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 135
Target Start/End: Original strand, 20117490 - 20117529
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggtttta 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20117490 tctattgtgcgagattttatacaattttgtgttgatttta 20117529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30050188 - 30050145
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgt 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30050188 aacgattataggtctattttacgatattttatacaattttgtgt 30050145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 7413091 - 7413373
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7413091 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 7413190  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7413191 caaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt-cgagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccctcaaagtgg 7413289  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  7413290 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattt 7413373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5590273 - 5589991
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5590273 tcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 5590174  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5590173 ccaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 5590075  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5590074 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattt 5589991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 43117408 - 43117691
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |    
T  43117408 tcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatc 43117507  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43117508 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 43117607  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  43117608 tttagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattt 43117691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 2317121 - 2317403
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||    
T  2317121 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacc 2317220  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2317221 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 2317319  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2317320 tgtagtggttcacccgaaaaatttaaataattcagttatagatctagtttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 2317403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41838054 - 41837772
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  41838054 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacc 41837955  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41837954 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtttattttgggagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 41837856  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41837855 tgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 41837772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7242734 - 7242453
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||    
T  7242734 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacc 7242635  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7242634 cgaaa--tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 7242537  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  7242536 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 7242453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 21434899 - 21435181
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  21434899 tcaacgattataggtttattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 21434998  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21434999 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 21435097  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21435098 tgtagtggcccacccaaaaagtttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 21435181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22658446 - 22658164
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22658446 tcaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 22658347  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  22658346 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattgg 22658248  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  22658247 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 22658164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42556193 - 42555911
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  42556193 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacc 42556094  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42556093 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaatttgg 42555995  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  42555994 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattt 42555911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3659922 - 3659640
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3659922 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 3659823  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |  ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  3659822 cggaaa-tttaaataattcaattataggtctgttttgcgagattttatacaattttatatcggttttaggtttcggttgatcaaaatttccgcaaattgg 3659724  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3659723 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 3659640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 4231279 - 4231561
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4231279 tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 4231378  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4231379 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttacgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 4231477  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  4231478 tgtagtgccccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattt 4231561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 28564944 - 28565226
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  28564944 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28565043  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28565044 cgaaaa-tttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 28565142  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28565143 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 28565226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 28572567 - 28572849
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  28572567 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28572666  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28572667 cgaaaa-tttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 28572765  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28572766 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 28572849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24797153 - 24796871
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24797153 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 24797054  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24797053 caaaaa-tttaaataattcaattatagatataatttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattgg 24796955  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24796954 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 24796871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Original strand, 10092315 - 10092596
Alignment:
Q  83 caacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  10092315 caacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccaccc 10092414  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggt 282  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10092415 gaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagatccaaattcccgcaaattggt 10092513  T
Q  283 gtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10092514 atagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 10092596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Original strand, 1183884 - 1184164
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| || |||||||    
T  1183884 aacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggaccaccca 1183983  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1183984 aaaa-tttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 1184082  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1184083 tagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 1184164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 36060417 - 36060699
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  36060417 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacacc 36060516  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36060517 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 36060615  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  36060616 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattt 36060699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 41388065 - 41388347
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||||    
T  41388065 tcaactattataggtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc 41388164  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41388165 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattgg 41388263  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41388264 tgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatagttaattt 41388347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3886880 - 3886613
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  3886880 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaac 3886781  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  3886780 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatcccaattcccgcaaattgg 3886682  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  3886681 tgtactgacccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgtgagactttaaacaattt 3886613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Original strand, 4697891 - 4698148
Alignment:
Q  107 agattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattat 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  4697891 agattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaa-tttaaataattcaattat 4697989  T
Q  207 aggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattta 306  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697990 agatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaattta 4698089  T
Q  307 aataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4698090 aataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 4698148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 361
Target Start/End: Original strand, 6316936 - 6317214
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  6316936 tcaacaattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 6317035  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6317036 cgaaaa-tttaaataattcaattatagttttattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttaggtttcggatgatccaaattcccgcaaattgg 6317134  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6317135 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 6317214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 356
Target Start/End: Original strand, 7012397 - 7012670
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  7012397 tcaatgattataggtctattttgcgatatcttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 7012496  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7012497 ctaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattgg 7012595  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaat 356  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| |||||    
T  7012596 agtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaat 7012670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 1098117 - 1098399
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  1098117 tcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccacc 1098216  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  1098217 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattgg 1098315  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1098316 tgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 1098399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41169989
Alignment:
Q  89 ttatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaa 188  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  189 tttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtg 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtg 41169963  T
Q  289 gctcacccgaaaaatttaaataattca 315  Q
    || ||| || |||||||||||||||||    
T  41169964 gcccactcg-aaaatttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7422148 - 7421873
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||    
T  7422148 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacc 7422049  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||      || |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7422048 cgaaaaatttaaat-attcaattataggtctattttgcgagattttataaaattttatatc------agttttcggttaatctaaattcccgcaaagtgg 7421956  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  7421955 tgtagtgatccaccc-aaaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttcaacggataattt 7421873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 290
Target Start/End: Original strand, 38567189 - 38567396
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  38567189 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacc 38567288  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38567289 cgaaaa-tttaaataattcgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 38567387  T
Q  282 tgtagtggc 290  Q
    |||||||||    
T  38567388 tgtagtggc 38567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108976
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaa 36108976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 355
Target Start/End: Original strand, 11635828 - 11635978
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  11635828 ataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatt 11635927  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  11635928 taaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaa 11635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642678
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaattt 25642678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197431
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| || || ||||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattt 197431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312268
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| || || ||||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattt 312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 4697993 - 4698134
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |    
T  4697993 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 4698092  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  4698093 aattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttt 4698134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 336
Target Start/End: Original strand, 17836498 - 17836627
Alignment:
Q  207 aggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattta 306  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  17836498 aggtgtattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaattta 17836597  T
Q  307 aataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17836598 aataatttaattataggtctattttacgag 17836627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 8995043 - 8995167
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  8995043 gtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatttaaa 8995142  T
Q  195 taattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8995143 taattcaattataggtctattttgc 8995167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 350
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41169911
Alignment:
Q  203 ttataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaa 302  Q
    ||||| ||||||||| | | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || || |||||    
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  303 tttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattt 41169911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382973
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| |||| |||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttttcaacggtta 25382973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Original strand, 36108841 - 36108974
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||     
T  36108841 gtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaa 36108940  T
Q  195 taattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36108941 taattcaattataggtctattttgcgagacttta 36108974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 4697871 - 4698005
Alignment:
Q  201 aattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaa 300  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  4697871 aattataggtttactttacaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccg-aa 4697969  T
Q  301 aatttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4697970 aatttaaataattcaattatagatctattttgcgag 4698005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 197265 - 197399
Alignment:
Q  85 acgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||  |||||| ||||    
T  197265 acgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaa 197364  T
Q  185 aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  197365 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgc 197399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 312102 - 312236
Alignment:
Q  85 acgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||  |||||| ||||    
T  312102 acgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaa 312201  T
Q  185 aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  312202 aaaatttaaataattcaattataagtctaatttgc 312236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25642819 - 25642697
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||     
T  25642819 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatttaaa 25642720  T
Q  195 taattcaattataggtctatttt 217  Q
    ||||| | ||||||| |||||||    
T  25642719 taatttagttataggcctatttt 25642697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Original strand, 11635819 - 11635955
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  11635819 tcaatgatcataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacc 11635918  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11635919 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 11635955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 9830673 - 9830835
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  || ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||    
T  9830673 attataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctg-aaa 9830771  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  9830772 atttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattt 9830835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 38567195 - 38567328
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  38567195 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccg-aaa 38567293  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38567294 atttaaataattcgattataggtctattttgcgag 38567328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 341
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995175
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || ||| | ||| ||| |||||| |  |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggcttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgagacttt 8995175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Original strand, 9830667 - 9830803
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||      
T  9830667 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-t 9830765  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  9830766 ctgaaaatttaaataattcaatcataggtctaatttgc 9830803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 179
Target Start/End: Original strand, 38567306 - 38567399
Alignment:
Q  86 cgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  38567306 cgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccca 38567399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25383135 - 25383001
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||| ||     
T  25383135 aacgactataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccg 25383037  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  25383036 aaaaatttaaataatttagttataggcctattttgc 25383001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 201
Target Start/End: Original strand, 41169877 - 41169989
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  41169877 attataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactc-gaaa 41169975  T
Q  188 atttaagtaattca 201  Q
    |||||| |||||||    
T  41169976 atttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 17836503 - 17836622
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||    
T  17836503 tattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 17836602  T
Q  198 ttcaattataggtctatttt 217  Q
    || |||||||||||||||||    
T  17836603 tttaattataggtctatttt 17836622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32018073 - 32017942
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || |||  |     
T  32018073 aacgattataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcg 32017974  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatt 215  Q
    |||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  32017973 aaattttttaacaattcaattataggtctatt 32017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32018069 - 32017911
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||  |||||     
T  32018069 attataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaat 32017970  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||| |||| ||||    
T  32017969 tttttaacaattcaattataggtctattataaaagactttaaacaatttttcaacggtt 32017911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 8996424 - 8996561
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||  | ||| ||||||||  | | | || |||||||||| |||    
T  8996424 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttc--ataaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatttaaataa 8996521  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  8996522 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34934375 - 34934302
Alignment:
Q  292 cacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34934375 cacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 34934302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 350
Target Start/End: Original strand, 8996417 - 8996560
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt-ggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||    ||| ||||||||  |||| | |||||||||    
T  8996417 ataggtttattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggct-atccgaaaaat 8996513  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  8996514 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaattt 8996560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 43073118 - 43073227
Alignment:
Q  221 agattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattat 320  Q
    |||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||| |  |||||||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  43073118 agattttaaacaattttatttcagttttaagtttcaggcgatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaa-tttaaatatttaaattat 43073216  T
Q  321 aggtctatttt 331  Q
    |||||||||||    
T  43073217 aggtctatttt 43073227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34934380 - 34934316
Alignment:
Q  173 cggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  34934380 cggcccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 34934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 9624055 - 9624337
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  9624055 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc 9624154  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9624155 caaaaa-tttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 9624253  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  9624254 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattt 9624337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 17166925 - 17167208
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17166925 tcaacaattatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 17167024  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  17167025 caaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattga 17167124  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  17167125 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 17167208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22723875 - 22723593
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22723875 tcaacgattataggtctactttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 22723776  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22723775 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattgg 22723677  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22723676 tgtagtggcccacccgcaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattt 22723593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31065722 - 31065440
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  31065722 tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31065623  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31065622 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 31065524  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31065523 tgcagtggcccacccgaaaaatttaaataaatcaattacaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 31065440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36358409 - 36358127
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  36358409 tcaacgattatagatctattttgcgacattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 36358310  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36358309 caaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 36358211  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  36358210 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 36358127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 45350110 - 45350392
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||| |    
T  45350110 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatc 45350209  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  45350210 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattgg 45350308  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  45350309 tgtagtgtcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 45350392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44468120 - 44467838
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44468120 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 44468021  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  44468020 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcaattgatccaaattcccgcaaattgg 44467922  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44467921 tgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44467838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 46027739 - 46028021
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  46027739 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 46027838  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  46027839 cgaaaa-tttaaataattaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttagatttaggttgatccaaattcccgcaaattgg 46027937  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  46027938 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtataatttgcgagactttaaacgatttttcaatagttaattt 46028021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 26873762 - 26874044
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26873762 tcaatgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 26873861  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26873862 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctaatttgcgaggttttatacaattttatgtcagttttagatttcgattgatccaaattcccgcaaattgg 26873960  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  26873961 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattt 26874044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36675581 - 36675304
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  36675581 gattatagatctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaa 36675482  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 286  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36675481 a-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtag 36675383  T
Q  287 tggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  36675382 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaattttttaatagttaattt 36675304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44724161 - 44723880
Alignment:
Q  83 caacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  44724161 caactattataggtttattttgagagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccaccc 44724062  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggt 282  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44724061 gaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggt 44723963  T
Q  283 gtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  44723962 gtagtggcccatccgaagaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattt 44723880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 44142821 - 44143102
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |    
T  44142821 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcca--c 44142918  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  44142919 ctggaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaattgg 44143018  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44143019 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44143102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23469482 - 23469213
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||| |||| |||||     
T  23469482 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccgaaaa-tttaaa 23469384  T
Q  195 taattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23469383 taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccat 23469284  T
Q  295 ccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  23469283 ctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattt 23469213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 43859150 - 43859432
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |    
T  43859150 tcaacgattataggtcgaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc 43859249  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  43859250 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattgg 43859348  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  43859349 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 43859432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 39976380 - 39976662
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  39976380 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacc 39976479  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| | | ||| |||    
T  39976480 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattgatccaaatttctgtaaattgg 39976578  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39976579 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 39976662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 31428796 - 31429078
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  31428796 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31428895  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||    
T  31428896 cgaaaa-tttaaataatttaattatagatctattttgcgagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattcccgtaaattgg 31428994  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  31428995 tgtagtggtccacccgaaaaatgtaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 31429078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 365
Target Start/End: Original strand, 40055666 - 40055932
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||    
T  40055666 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatccgaaaa-tttaaataa 40055764  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  40055765 ttcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccaccca 40055864  T
Q  298 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  40055865 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattt 40055932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42242028 - 42241746
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||    
T  42242028 tcaacgattataggtttaatttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacc 42241929  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42241928 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattgg 42241830  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  42241829 tgtagtcgtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattt 42241746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29075284 - 29075012
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  29075284 tcaacgactataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 29075185  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||          |||    
T  29075184 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaat----------tgg 29075096  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  29075095 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaattttttaatagttaattt 29075012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Original strand, 41367724 - 41368000
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| || ||||    
T  41367724 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggtccatccgaaaa 41367823  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41367824 -tttaaataattcagttataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagt 41367922  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  41367923 gatccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaattt 41368000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16834376 - 16834092
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||  | ||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |    
T  16834376 tcaacgattataggtttattttgtaaaattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatc 16834277  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt--gcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagt 279  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |    
T  16834276 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctatattatgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattctcacaaatt 16834178  T
Q  280 ggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16834177 ggggtagtgtcccacccaaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 16834092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31932004 - 31931841
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  31932004 attataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 31931905  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31931904 atttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattt 31931841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 8461764 - 8461927
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  8461764 attataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 8461863  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8461864 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattt 8461927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 355
Target Start/End: Original strand, 25174216 - 25174365
Alignment:
Q  206 taggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattt 305  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25174216 taggtcaattttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaattt 25174315  T
Q  306 aaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  25174316 aaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 25174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31932010 - 31931855
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  31932010 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacc 31931911  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||| | ||||||    
T  31931910 caaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttt 31931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 25174223 - 25174361
Alignment:
Q  99 attttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaat 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||    
T  25174223 attttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 25174322  T
Q  199 tcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  25174323 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 25174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 40055769 - 40055918
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40055769 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaaaaa 40055868  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  40055869 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40055918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828767
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcg-aaaatt 46828828  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  46828827 taaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattt 46828767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23562740 - 23562578
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  || || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23562740 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaagtttt-gattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 23562642  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  23562641 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 23562578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29502254 - 29502066
Alignment:
Q  175 gcccacccaaaaaatttaagtaattca--attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattccc 272  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |  || |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||   |||||||||||||    
T  29502254 gcccacccgaaaaatttaaaaaattaacgataataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattccc 29502155  T
Q  273 gcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  |||| |||| |||||    
T  29502154 gcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttttcaacggtta 29502066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 365
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663142
Alignment:
Q  233 attttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttta 332  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  333 cgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | || ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattt 29663142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 237
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663128
Alignment:
Q  119 attttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  219 caagattttatataatttt 237  Q
    ||||| |||| | ||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttt 29663128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23469376 - 23469227
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  23469376 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctgaaaa 23469277  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  23469276 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttt 23469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 8461760 - 8461894
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||     
T  8461760 aacgattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccg 8461859  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  8461860 aaaaatttaaataattcaattatagatctaatttg 8461894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16649685 - 16649531
Alignment:
Q  206 taggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattt 305  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||| | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||    
T  16649685 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccc-caaaattt 16649587  T
Q  306 aaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  16649586 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaacggtta 16649531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17624046 - 17623892
Alignment:
Q  206 taggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaattt 305  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||| | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||    
T  17624046 taggtttattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccc-caaaattt 17623948  T
Q  306 aaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  17623947 aaataattcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaacggtta 17623892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18104411 - 18104249
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18104411 attataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaa 18104313  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  18104312 atttaaataattcaattaaagatctaatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattt 18104249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22499868 - 22499716
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||       
T  22499868 ataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa--- 22499772  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
     ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22499771 -aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttttcaatggtta 22499716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29502229 - 29502095
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||     
T  29502229 aacgataataggtatattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccg 29502130  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29502129 aaaaatttaaataattgaattataggtctattttg 29502095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16649679 - 16649559
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||    
T  16649679 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccc-caaaatttaaataa 16649581  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16649580 ttcaattataggtctattttgc 16649559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17624040 - 17623920
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||    
T  17624040 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccc-caaaatttaaataa 17623942  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17623941 ttcaattataggtctattttgc 17623920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23562746 - 23562610
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||  | |||||    
T  23562746 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaag-ttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacc 23562648  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23562647 cgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgc 23562610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23469483 - 23469356
Alignment:
Q  208 ggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  23469483 ggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccg-aaaatttaa 23469385  T
Q  308 ataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23469384 ataattcaattataggtctattttgcgag 23469356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 361
Target Start/End: Original strand, 30781079 - 30781234
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||  ||||| |||||||    
T  30781079 atagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatt 30781177  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  30781178 taaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaacggtta 30781234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18104417 - 18104295
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |    
T  18104417 tcaacgattataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatc 18104319  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaatta 205  Q
    | |||||||||| |||||||||||    
T  18104318 cgaaaaatttaaataattcaatta 18104295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Original strand, 28754878 - 28755023
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaa 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28754878 gtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatttt-gcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaa 28754976  T
Q  309 taattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  28754977 taattcaattataagtctattttccaagtctttaaacaatttttcaa 28755023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Original strand, 9014475 - 9014586
Alignment:
Q  220 aagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaatta 319  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9014475 aagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaatta 9014574  T
Q  320 taggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||    
T  9014575 taggtctatttt 9014586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 360
Target Start/End: Original strand, 8727794 - 8727945
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaa 308  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||    
T  8727794 gtctattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaa 8727893  T
Q  309 taattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  8727894 caattcgattgtaggtctattttacgaaactttaaacaatttttcaatggtt 8727945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 28754867 - 28755004
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||  |||||||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||    
T  28754867 aacgatcatatgtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaattttg-caaggtggtgtagtggcccaccca 28754965  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaag 222  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28754966 aaaaaattaaataattcaattataagtctattttccaag 28755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Original strand, 30781084 - 30781206
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||| |    
T  30781084 tctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggttttgg-tttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatttaaat 30781182  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30781183 aattcaattataggtctattttgc 30781206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46828922 - 46828800
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaag 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |  |||||||||     
T  46828922 gtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactc-gaaaatttaaa 46828824  T
Q  195 taattcaattataggtctattttg 218  Q
    ||| || ||||||| |||||||||    
T  46828823 taactcgattatagatctattttg 46828800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4249083 - 4248977
Alignment:
Q  212 tattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |   ||||||||||  | |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  4249083 tattttgcaagattttatataattttatgccggttttaggtttcagcaaatccaaattcttggaaagtggtgtagaggttcatccgaaaaatttaaataa 4248984  T
Q  312 ttcaatt 318  Q
     ||||||    
T  4248983 gtcaatt 4248977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 9013879 - 9014034
Alignment:
Q  200 caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaa 299  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| || |||| || |||| |||| || |||||    
T  9013879 caatcataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcc-caaaatgttgtaatggcccatccgaa 9013977  T
Q  300 aaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaat 356  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  9013978 aaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaat 9014034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4248940 - 4248869
Alignment:
Q  273 gcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaa 344  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  4248940 gcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaa 4248869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 218
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014587
Alignment:
Q  107 agattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||  | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  207 aggtctattttg 218  Q
    ||||||||||||    
T  9014576 aggtctattttg 9014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4248939 - 4248871
Alignment:
Q  160 caaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4248939 caaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagacttta 4248871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22499875 - 22499771
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  22499875 aacgatcataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccaccta 22499776  T
Q  184 aaaaa 188  Q
    |||||    
T  22499775 aaaaa 22499771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Original strand, 6961163 - 6961245
Alignment:
Q  268 ttcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    |||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  6961163 ttcccgcaaaatggtgcggtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaattt 6961245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Original strand, 8727790 - 8727916
Alignment:
Q  91 atatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatt 190  Q
    ||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  8727790 atatgtctattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatt 8727889  T
Q  191 taagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  8727890 taaacaattcgattgtaggtctatttt 8727916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24779684 - 24779575
Alignment:
Q  252 tttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattta 351  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||| | |||     
T  24779684 tttcggttgattcaaattcacgtaaagtggtctaatggtccacccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttgcgagtctttaaacattttt 24779585  T
Q  352 tcaatggtta 361  Q
    |||| |||||    
T  24779584 tcaacggtta 24779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22566667 - 22566599
Alignment:
Q  208 ggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaa 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22566667 ggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaattgccgcaa 22566599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22566666 - 22566606
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||    
T  22566666 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Original strand, 40883343 - 40883447
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||     
T  40883343 aacgactataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccg 40883442  T
Q  184 aaaaa 188  Q
    |||||    
T  40883443 aaaaa 40883447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 355
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883499
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||  || |||||||| |||||||  |||||||||||     
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 40883448  T
Q  304 --ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
      ||||| ||   || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  40883449 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 40883499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 237
Target Start/End: Original strand, 9013900 - 9014029
Alignment:
Q  107 agattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattat 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||| || |||| || ||||  |||||| || |||||||||  ||||| ||||||    
T  9013900 agattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcc-caaaatgttgtaatggcccatccgaaaaatttatataatttaattat 9013998  T
Q  207 aggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  9013999 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 9014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 136
Target Start/End: Original strand, 6961111 - 6961160
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttag 136  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6961111 gattatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttag 6961160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021638
Alignment:
Q  115 tacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctat 214  Q
    |||||||||||||   |||||  ||| || ||||| ||||| || |||| | |||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  215 tttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttt 9021638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 255
Target Start/End: Original strand, 6961112 - 6961165
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttc 255  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  6961112 attatatgtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttc 6961165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Original strand, 6961183 - 6961228
Alignment:
Q  174 ggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6961183 ggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgc 6961228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14629695 - 14629632
Alignment:
Q  245 ttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaa 308  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  14629695 ttttagtttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaaattaaa 14629632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14629726 - 14629633
Alignment:
Q  100 ttttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaa 193  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||    |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  14629726 ttttgcgagattttaaaaaaatttgtgactattttagtttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaaattaa 14629633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 84 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11935473 - 11935207
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  11935473 aacgattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccaccca 11935374  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935373 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggttttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 11935274  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  11935273 tattggcccaccagaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagactttaaacaattt 11935207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Original strand, 26293221 - 26293501
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  26293221 aacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 26293320  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26293321 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 26293419  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  26293420 tagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 26293501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36436279 - 36435999
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  36436279 aacgattataagtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 36436180  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36436179 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 36436081  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  36436080 tagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 36435999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 16194311 - 16194593
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  16194311 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacc 16194410  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16194411 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 16194509  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16194510 tgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 16194593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 34983335 - 34983617
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  34983335 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc 34983434  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34983435 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccagcaaattgg 34983533  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34983534 tgtagtgacccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 34983617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 2249640 - 2249922
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2249640 tcaatgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 2249739  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2249740 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 2249838  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2249839 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 2249922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26860761 - 26860479
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  26860761 tcaacaattataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacc 26860662  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||     
T  26860661 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaatttccgcaaattga 26860563  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  26860562 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 26860479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 355
Target Start/End: Original strand, 31392606 - 31392877
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31392606 tcaacgattataagtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 31392705  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||    
T  31392706 caaaa--tttaagtaattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctcgcaaattgg 31392803  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  31392804 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa 31392877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1021161 - 1020885
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1021161 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 1021062  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1021061 -tttaaataattcaattataggtctattttgagagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagt 1020963  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1020962 agcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 1020885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 12995025 - 12995307
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12995025 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacc 12995124  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  12995125 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattgg 12995223  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12995224 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 12995307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 23869722 - 23870004
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||    
T  23869722 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacc 23869821  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23869822 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtatattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 23869920  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23869921 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgaatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 23870004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44545828 - 44545546
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||     
T  44545828 tcaacgattataggtctattttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggcccact 44545729  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44545728 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 44545630  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44545629 tgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44545546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 7366210 - 7366492
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  7366210 tcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 7366309  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7366310 cgaaaa-tttaaataattcaattatacatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattgg 7366408  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7366409 tgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatggttaattt 7366492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 11764853 - 11765135
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||     
T  11764853 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaca 11764952  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  11764953 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaattcccgcaaattgg 11765051  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11765052 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 11765135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13616062 - 13615780
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  13616062 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacc 13615963  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  13615962 cgaaaa-tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatttccgcaaattgg 13615864  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13615863 tgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattcgcgagattttaaacaatttttcaatagttaattt 13615780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 42016562 - 42016844
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| || || || ||||||||    
T  42016562 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggcccacc 42016661  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  42016662 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 42016760  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  42016761 tgtagcggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 42016844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1115131 - 1114855
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1115131 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 1115032  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1115031 -tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttgattttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagt 1114933  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1114932 ggcctacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 1114855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6750105 - 6749823
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||||    
T  6750105 tcaacgattataggtctatttattgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgatccacc 6750006  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6750005 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 6749907  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  6749906 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacagtttttcaatagttaattt 6749823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 38527233 - 38527514
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  38527233 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacc 38527332  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38527333 cgaaaa-tttaaataattcaattataggt-tattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 38527430  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  38527431 tgtagtggtccacccaaaaaatttaaataatttatttataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 38527514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3836425 - 3836158
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  3836425 tctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaattttaaat 3836326  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacc 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3836325 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcccgcaaagtgatgtagtggc-cacc 3836227  T
Q  296 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  3836226 cg-aaaatttaaataattcaattatatatctattttacgaggctttaaacaattttttaacggttaattt 3836158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28745589 - 28745355
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||     
T  28745589 aacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccg 28745491  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28745490 aaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattcccgcaaattggtg 28745392  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattat 320  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28745391 tagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattat 28745355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Original strand, 38763773 - 38763960
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38763773 tcaacgattataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 38763872  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattc 270  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38763873 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43471547 - 43471384
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  43471547 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 43471448  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43471447 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 43471384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22674833 - 22674670
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22674833 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22674734  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22674733 atttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattt 22674670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43471553 - 43471416
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||    
T  43471553 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacc 43471454  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43471453 cgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgc 43471416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077718
Alignment:
Q  210 tctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 309  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  310 aattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttttcaacggttaattt 2077718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643545
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaaggtta 31643545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22674839 - 22674703
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22674839 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacc 22674740  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  22674739 caaaaaatttaaataattcaattgaaggtctaatttg 22674703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28745585 - 28745439
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745585 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 28745487  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  28745486 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattt 28745439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34494568 - 34494406
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34494568 attataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 34494470  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34494469 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 34494406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36436306 - 36436142
Alignment:
Q  173 cggcccacccaaaaaatttaagtaatt--caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattc 270  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||| ||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  36436306 cggcccacccaaaaaaattaaaaaattaacgattataagtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattc 36436207  T
Q  271 ccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36436206 ctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36436142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 38763779 - 38763912
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38763779 attataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 38763877  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38763878 atttaaataattcaattataggtctattttgcgag 38763912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 41699243 - 41699395
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    ||||| || |||||    
T  41699243 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaa---ttgtagaggtccacc 41699339  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  41699340 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 41699395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19284015 - 19283861
Alignment:
Q  210 tctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 309  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  19284015 tctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccg-aaaatttaaat 19283917  T
Q  310 aattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19283916 aattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 19283861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643555
Alignment:
Q  90 tatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaat 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  190 ttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 31643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141875
Alignment:
Q  99 attttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaat 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  199 tcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 29141875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 217
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077684
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||| |    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  196 aattcaattataggtctatttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctatttt 2077684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 41699249 - 41699409
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| ||  ||||||||||    
T  41699249 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaattg---tagaggtccacccgaaaa 41699345  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41699346 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 41699409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34494574 - 34494439
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  34494574 tcaacgattataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 34494475  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34494474 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 34494439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 355
Target Start/End: Original strand, 32100015 - 32100154
Alignment:
Q  221 agattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtgg-----ctcacccgaaaaatttaaataattca 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||    
T  32100015 agattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaaaaatttaaataattca 32100114  T
Q  316 attataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  32100115 attatagatctattttgtgagtctttaaataatttttcaa 32100154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3836431 - 3836304
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||  |||| |    
T  3836431 tatagatctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaatt 3836332  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3836331 ttaaataattcaattatagatctatttt 3836304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19284029 - 19283899
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  19284029 tcaacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 19283930  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtcta 213  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19283929 c-gaaaatttaaataattcaattataggtcta 19283899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035340
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttttcaa 29035340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141871
Alignment:
Q  213 attttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataat 312  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| || |||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  313 tcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 29141871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 32099992 - 32100131
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcgg-----ccc 178  Q
    |||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||     |||    
T  32099992 aacgatcataggtatactttacgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgaccc 32100091  T
Q  179 acccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32100092 acccgaaaaatttaaataattcaattatagatctattttg 32100131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29035496 - 29035359
Alignment:
Q  85 acgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaa 184  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||  | |||||||||||||   ||||| | |    
T  29035496 acgatcataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcga 29035397  T
Q  185 aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaag 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29035396 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcaag 29035359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17526123 - 17526038
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtg 169  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17526123 aacgattatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaattttcacaaagtggtg 17526038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11483002 - 11482970
Alignment:
Q  92 tatgtctattttgcgagattttatacaattttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11483002 tatgtctattttgcgagattttaaacaattttg 11482970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44254700 - 44254418
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44254700 tcaatgattatatatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 44254601  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44254600 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 44254502  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44254501 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44254418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 92 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32271009 - 32270736
Alignment:
Q  92 tatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaattt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  32271009 tatgtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa-ttt 32270911  T
Q  192 aagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggct 291  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  32270910 aaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcc 32270811  T
Q  292 ca-cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32270810 caccccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 32270736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 22729279 - 22729561
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22729279 tcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 22729378  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22729379 ccaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 22729477  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22729478 tgtagtggaccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattt 22729561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29126143 - 29125861
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  29126143 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc 29126044  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29126043 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 29125945  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29125944 tgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 29125861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11232249 - 11231972
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11232249 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaa 11232150  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 286  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11232149 a-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtag 11232051  T
Q  287 tggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11232050 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 11231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21259415 - 21259138
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| || ||||    
T  21259415 attataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaa 21259316  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21259315 atttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaat 21259216  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21259215 ggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 21259138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1092977 - 1092695
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  1092977 tcaacgactataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtgggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacc 1092878  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1092877 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 1092779  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  1092778 tgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctgatttgcgagacttaaaacaatttttcaatggttaattt 1092695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 27742545 - 27742827
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| | |    
T  27742545 tcaacgcttataggtctattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatc 27742644  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  27742645 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattgg 27742743  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  27742744 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 27742827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 52202041 - 52202323
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||    
T  52202041 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgacccacc 52202140  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  52202141 caaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcccaattcccgcaaattgg 52202239  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  52202240 tgtagtggcccactcaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 52202323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12251607 - 12251325
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12251607 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatataattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 12251508  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12251507 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagaatttatacaattttatgtcgattttagatttcggttgatccaaattccagcaaattgg 12251409  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12251408 tgtaatggcccactcgaaaaatttaaataattcaactataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 12251325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28952491 - 28952209
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    ||||| ||||||| ||||||||    
T  28952491 tcaacgattatgggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacc 28952392  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28952391 cgaaaa-tttaaataattcaattacaggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 28952293  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28952292 tgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatgggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 28952209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Original strand, 35083857 - 35084134
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||| |||    
T  35083857 gattataggtcaattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacccgaaa 35083956  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 286  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35083957 agttaaa-taattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtag 35084055  T
Q  287 tggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  35084056 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 35084134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13594973 - 13594729
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13594973 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 13594874  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13594873 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 13594775  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 327  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13594774 tgtagtggccaacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtcta 13594729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21259534 - 21259286
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  |||||    
T  21259534 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc 21259435  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21259434 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 21259336  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21259335 tgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 21259286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16908908 - 16908636
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||          || |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16908908 tcaacgattataggtctattttgcgagattttat----------gtcggttttatgttttggttgatccaaattccagcaaagtggtgtagtggcccacc 16908819  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16908818 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattgg 16908720  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16908719 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgctagactttaaacaatttttcaatagttaattt 16908636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 49657311 - 49657037
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| |||||||||  || ||||||| |||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  49657311 tcaacgactataggtctattttttgaaattttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 49657212  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
      |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49657211 tgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 49657113  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatg 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  49657112 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatg 49657037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50527733 - 50527451
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |    
T  50527733 tcaacgtttatagttctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc 50527634  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50527633 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgg 50527535  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  50527534 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattt 50527451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 36633546 - 36633821
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36633546 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacc 36633645  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36633646 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagatattatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 36633744  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||       |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36633745 tgtagtggtccaccagaaaaatttaaataattc-------ggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatggttaattt 36633821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 45045284 - 45045535
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||| |||||||||| |||    
T  45045284 tattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataa 45045383  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccg 297  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  45045384 tttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccc- 45045482  T
Q  298 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||| |||||    
T  45045483 aaaaattcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaattt 45045535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52571524 - 52571250
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  52571524 tcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccact 52571425  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||         || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  52571424 c-aaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag--------caaatttatgtcggttttagatttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 52571334  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  52571333 tgtagtggtctacccaaaaaatttaaacaattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaaattttcaatagttaattt 52571250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 273
Target Start/End: Original strand, 49169852 - 49170042
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||  ||||||||    
T  49169852 tcaacgattataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacc 49169951  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccg 273  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49169952 cgaaaa-tttaaataattcaattatgggtctattttgcaagactttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccg 49170042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7160384 - 7160221
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7160384 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 7160285  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  7160284 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattt 7160221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246155
Alignment:
Q  203 ttataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaa 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  303 tttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 25246155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7160390 - 7160235
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  7160390 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacc 7160291  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  7160290 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 7160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 18163783 - 18163945
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  18163783 attataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccg-aaa 18163881  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18163882 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattt 18163945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31174632 - 31174494
Alignment:
Q  223 attttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 322  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31174632 attttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattgtag 31174533  T
Q  323 gtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  31174532 gtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaacggtta 31174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Original strand, 34660814 - 34660952
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34660814 ataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatt 34660913  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaa 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34660914 taaat-attcaattataggtctattttgcgagactttaaa 34660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32270900 - 32270750
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca-cccaaaa 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  32270900 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccgaaa 32270801  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  32270800 aatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 32270750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Original strand, 18163777 - 18163912
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||    
T  18163777 tcaacgattataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacc 18163876  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18163877 c-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 18163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13594854 - 13594723
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  13594854 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaa 13594755  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13594754 atttaaataattcaattatatgtctaatttgc 13594723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 45045274 - 45045408
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||    
T  45045274 attatagatttattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaa 45045373  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45045374 atttaaataatttaattataggtctattttgcgag 45045408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 44205477 - 44205640
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataatttta-tgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaa 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||  ||||| ||||| || | |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44205477 attatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaa 44205576  T
Q  301 aatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44205577 a-tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44205640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 744015 - 744116
Alignment:
Q  185 aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  744015 aaaatttaaataattcaattataggtctattttggaagattttatacaattttacgtcg-gtttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgt 744113  T
Q  285 agt 287  Q
    |||    
T  744114 agt 744116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13594967 - 13594834
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13594967 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 13594868  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13594867 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgag 13594834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 331
Target Start/End: Original strand, 49169858 - 49169986
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  49169858 attataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccg-aaa 49169956  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49169957 atttaaataattcaattatgggtctatttt 49169986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25246324 - 25246188
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || | |||    
T  25246324 tcaacgtttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacc 25246225  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  25246224 cgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttg 25246188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 228
Target Start/End: Original strand, 34660807 - 34660950
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||| || ||||||     
T  34660807 aacgatcataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccg 34660906  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34660907 aaaaatttaaat-attcaattataggtctattttgcgagacttta 34660950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 361
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619108
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat- 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  || | ||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgt--gttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||| |||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttttcaacggtta 2619108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31174639 - 31174522
Alignment:
Q  102 ttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattca 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||  || || |||||||||| |||||||    
T  31174639 ttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattca 31174540  T
Q  202 attataggtctattttgc 219  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  31174539 attgtaggtctattttgc 31174522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 45045388 - 45045536
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  45045388 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccc-aaaa 45045486  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||| || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||| | ||||||    
T  45045487 attcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaatttt 45045536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 4618210 - 4618362
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||   |||||| |||||| || |||||    
T  4618210 tcaacgattatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggtttta-ttttttgttgatccaaactctttcaaagt-gtgtagtggtccacc 4618307  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4618308 c-gaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 4618362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Original strand, 2618957 - 2619080
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc-aaaaaatttaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  |||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  2618957 gtctattttgcgagattttatacaatt--gtgttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaattaa 2619054  T
Q  194 gtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  2619055 ataattcaattataggtctattttgc 2619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 44205471 - 44205626
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaa-ttttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccac 180  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||| |||    
T  44205471 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcac 44205570  T
Q  181 ccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  44205571 cc-gaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 44205626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499197
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtggtccaccc 52499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 4618216 - 4618376
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||  ||||||||||| ||   |||||| |||||||||  |||||| |||    
T  4618216 attatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggtttta-ttttttgttgatccaaactctttcaaagt-gtgtagtggtccacccg-aaa 4618312  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| | ||||| |||||  |||||||    
T  4618313 atttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttttcaataattaattt 4618376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 576538 - 576405
Alignment:
Q  221 agattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattat 320  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||||    
T  576538 agattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaattat 576439  T
Q  321 aggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  576438 aggtatatttt-cgagtctttaaacaatttttcaa 576405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 576539 - 576428
Alignment:
Q  106 gagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaatta 205  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| || | | | ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  576539 gagattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaatta 576440  T
Q  206 taggtctatttt 217  Q
    ||||| ||||||    
T  576439 taggtatatttt 576428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 361
Target Start/End: Original strand, 18657974 - 18658041
Alignment:
Q  294 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||    
T  18657974 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaacggtta 18658041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Original strand, 744032 - 744128
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaa 185  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||    
T  744032 attataggtctattttggaagattttatacaattttacgtcggttt-aggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtcgtccacccaaa 744128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499204
Alignment:
Q  212 tattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtgg 289  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtgg 52499204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 331
Target Start/End: Original strand, 743998 - 744047
Alignment:
Q  281 gtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  743998 gtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctatttt 744047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 158
Target Start/End: Original strand, 18657902 - 18657976
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattccc 158  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18657902 aacgatcatatgtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattccc 18657976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Original strand, 18657913 - 18657977
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccg 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18657913 gtctactttgcaagactttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 18657977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 365
Target Start/End: Original strand, 49170168 - 49170238
Alignment:
Q  295 ccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  49170168 ccgaaaaatttaaataactaaattataggtttaatttgcgaaactttaaacaatttttcaatgattaattt 49170238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 217
Target Start/End: Original strand, 18657978 - 18658011
Alignment:
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18657978 aaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 18658011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 360
Target Start/End: Original strand, 25807136 - 25807181
Alignment:
Q  315 aattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  25807136 aattataggtctattttacgagtttttaaacaatttttcaatggtt 25807181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25894617 - 25894576
Alignment:
Q  319 ataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtt 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25894617 ataggtctattttacgaggttttaaataatttttcaacggtt 25894576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16693047 - 16692765
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16693047 tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 16692948  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16692947 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 16692849  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  16692848 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatatttaattt 16692765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 51139745 - 51140027
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  51139745 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 51139844  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51139845 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttttacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 51139943  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  51139944 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 51140027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44052557 - 44052275
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  44052557 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacc 44052458  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||    
T  44052457 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgattcaaattctcgcaaattgg 44052359  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44052358 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 44052275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25299181 - 25298904
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  25299181 gattataggtctattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccggaaa 25299082  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 286  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25299081 a-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtag 25298983  T
Q  287 tggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25298982 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 25298904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 99 - 365
Target Start/End: Original strand, 40567042 - 40567307
Alignment:
Q  99 attttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaat 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  40567042 attttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa-tttaaatagt 40567140  T
Q  199 tcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccga 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40567141 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccga 40567240  T
Q  299 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  40567241 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 40567307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 919808 - 919526
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  919808 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 919709  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  919708 tgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttccattgatccaaattccagcaaattgg 919610  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  919609 tgtagtagtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 919526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 23177401 - 23177683
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  23177401 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacc 23177500  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23177501 caaaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 23177599  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23177600 tgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 23177683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33012155 - 33011873
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  33012155 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 33012056  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33012055 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 33011957  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33011956 tgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatttttctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 33011873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24542873 - 24542596
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24542873 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542774  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24542773 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542674  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24542673 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatagttctaattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 24542596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544816 - 24544568
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  24544816 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 24544717  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544716 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 24544618  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544617 tgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 8086289 - 8086571
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8086289 tcaacgactatagatctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 8086388  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8086389 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 8086487  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8086488 tgtagtggcccacacgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaattttttaatggttaattt 8086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24542987 - 24542744
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24542987 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542888  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24542887 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542788  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542787 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543101 - 24542858
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543101 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543002  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543001 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542902  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542901 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543215 - 24542972
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543215 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543116  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543115 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543016  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543015 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543329 - 24543086
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543329 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543230  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543229 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543130  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543129 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543443 - 24543200
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543443 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543344  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543343 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543244  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543243 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543557 - 24543314
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543557 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543458  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543457 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543358  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543357 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543671 - 24543428
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543671 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543572  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543571 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543472  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543471 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543785 - 24543542
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543785 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543686  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543685 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543586  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543585 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24543899 - 24543656
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24543899 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543800  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543799 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543700  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543699 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544013 - 24543770
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544013 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543914  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24543913 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543814  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543813 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544127 - 24543884
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544127 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544028  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544027 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543928  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543927 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544241 - 24543998
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544241 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544142  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544141 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544042  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544041 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24543998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544355 - 24544112
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544355 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544256  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544255 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544156  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544155 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544469 - 24544226
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544469 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544370  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544369 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544270  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544269 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544583 - 24544340
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544583 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544484  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544483 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544384  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544383 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24544697 - 24544454
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24544697 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544598  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24544597 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544498  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544497 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 24544454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 47561786 - 47562068
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |  ||| |    
T  47561786 tcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattactgcaaagtgatgtagtgaaccaac 47561885  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47561886 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 47561984  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47561985 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 47562068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48708515 - 48708233
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  48708515 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 48708416  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  48708415 tgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattgg 48708317  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  48708316 tgtagtgtctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 48708233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 24790494 - 24790777
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  24790494 tcaacgactataagtctgttttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 24790593  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcgg-ttgatccaaattcccgcaaagtg 280  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  24790594 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttacgttttgggttgatccaaattcccgcaaattg 24790692  T
Q  281 gtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24790693 gtgtagtggctcaagcgaaaaatttaaataattcaattataggtcaaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattt 24790777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29981805 - 29981523
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29981805 tcaacgattataggtctactttgtgatattttatgcaattttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 29981706  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29981705 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 29981607  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29981606 tatagtggtccacccgaaaaatttaaacaattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 29981523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 37125752 - 37126034
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||    
T  37125752 tcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccacc 37125851  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37125852 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatatcagttttaggtttcggttgatcaaaattcccgcaaattgg 37125950  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37125951 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 37126034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40428879 - 40428597
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||     
T  40428879 tcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccact 40428780  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40428779 c-gaaaatttaaataattcaattatagttctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 40428681  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  40428680 tgtagtggcccacccgaaaaattaaaataattcaattataaatttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 40428597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 42372029 - 42372311
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  42372029 tcaatgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 42372128  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42372129 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 42372227  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  42372228 tgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattattgatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 42372311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 45836903 - 45837185
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  45836903 tcaacgattataggtctatattgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 45837002  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  45837003 cgaaaa-tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattgg 45837101  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  45837102 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattt 45837185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17285392 - 17285109
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17285392 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 17285293  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17285292 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 17285194  T
Q  282 tgtagtggctca-cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17285193 tgtagtggtccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 17285109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 29170001 - 29170283
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  29170001 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtagcccacc 29170100  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29170101 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 29170199  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29170200 tgcagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaactataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 29170283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 84 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46224856 - 46224578
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  46224856 aacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg 46224757  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtg 283  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46224756 aaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 46224658  T
Q  284 tagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  46224657 tagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattt 46224578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9042510 - 9042235
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| || | | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  9042510 attataggtctaatttacgagattttatgcaattt-gtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacacccgaaaa 9042412  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9042411 -tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagt 9042313  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9042312 ggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattt 9042235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 6849812 - 6850093
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  6849812 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacc 6849911  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  6849912 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattag 6850010  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  6850011 tatagtggttcacccgaaaaatttaaataattcaattataggt-taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattt 6850093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 8530142 - 8530430
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |    
T  8530142 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggccca-c 8530240  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaag------attttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgca 275  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8530241 ctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttaattttatacaattttctgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgca 8530340  T
Q  276 aagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||| | ||||| ||||  ||||||||    
T  8530341 aattggtgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaaactttatacaatttttcaaaagttaattt 8530430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 40567144 - 40567293
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  40567144 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 40567243  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||    
T  40567244 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40567293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9246994 - 9246853
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  9246994 gattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaa 9246895  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagatttta 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9246894 aatttaaataattcaattataggtctattttgcaagacttta 9246853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343215
Alignment:
Q  232 aattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  332 acgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
     |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 37343215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9246993 - 9246834
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9246993 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 9246894  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||| |||| |||||    
T  9246893 atttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttttcaacggtta 9246834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 44317626 - 44317780
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  44317626 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacc 44317725  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44317726 c-gaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49001576 - 49001411
Alignment:
Q  201 aattataggtctattttgcaaga--ttttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccga 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  49001576 aattataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccga 49001478  T
Q  299 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  49001477 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattt 49001411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540544
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaa 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaa 32540544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 365
Target Start/End: Original strand, 44317632 - 44317794
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||    
T  44317632 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 44317730  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  44317731 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttttcaatagttaattt 44317794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32540690 - 32540556
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||     
T  32540690 aacgactataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccg 32540591  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32540590 aaaaatttaaataattcaattatatgtctattttg 32540556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 355
Target Start/End: Original strand, 21852069 - 21852219
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatt 304  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21852069 ataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 21852168  T
Q  305 taaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  21852169 taaattattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 21852219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 21852062 - 21852197
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||     |||||||||||| |||||| ||     
T  21852062 aacgatgataggtatactttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccg 21852161  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgc 219  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21852162 aaaaatttaaattattcaattataggtctattttgc 21852197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29056015 - 29055877
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||    
T  29056015 tattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataa 29055917  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  29055916 ttcaattataggtctattttgcgagactttaaatattttt 29055877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9042511 - 9042383
Alignment:
Q  201 aattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaa 300  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||  || ||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9042511 aattataggtctaatttacgagattttatgcaa-tttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacacccg-aa 9042414  T
Q  301 aatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9042413 aatttaaataattcaattataggtctatttt 9042383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 232 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29055996 - 29055882
Alignment:
Q  232 aattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29055996 aattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 29055897  T
Q  332 acgaggctttaaata 346  Q
     |||| |||||||||    
T  29055896 gcgagactttaaata 29055882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Original strand, 25030323 - 25030466
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||       ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||    
T  25030323 gattatatgtttatcttgcgagattttatacaatattgtgtcggttatag-------ttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaa 25030415  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  25030416 aatttaaataatttaattatagatctattttggaagactttaaataatttt 25030466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Original strand, 25030372 - 25030465
Alignment:
Q  257 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || |||||||||||||    
T  25030372 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttggaagactttaaataattt 25030465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 46601091 - 46601215
Alignment:
Q  226 ttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 325  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  46601091 ttatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatc 46601190  T
Q  326 tattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||    
T  46601191 tattttgcgagactttaaacaattt 46601215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49001575 - 49001425
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgaga--ttttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaa 185  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||| || ||| || ||    
T  49001575 attataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaa 49001477  T
Q  186 aaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  49001476 aaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttt 49001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 46601071 - 46601216
Alignment:
Q  92 tatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaattt 191  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  46601071 tatgtctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaattt 46601170  T
Q  192 aagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  46601171 aaataattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaatttt 46601216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343201
Alignment:
Q  118 aattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctatttt 217  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  218 gcaagattttatataatttt 237  Q
    || ||| |||| | ||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttt 37343201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 42225374 - 42225459
Alignment:
Q  95 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccac 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42225374 gtctattttgcgagattttaaacaattttgaggcagttttagtttttggcaaattcaaattcccccaaagtggtgtagcggtccac 42225459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Original strand, 65112 - 65389
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  65112 attataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 65211  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  65212 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagt 65311  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  65312 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattt 65389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 83 - 336
Target Start/End: Original strand, 64994 - 65246
Alignment:
Q  83 caacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  64994 caacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc 65093  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggt 282  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  65094 gaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggt 65192  T
Q  283 gtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65193 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 65246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 19105 - 19387
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  19105 tcaacgatcataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 19204  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||    
T  19205 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccaaaaaattgg 19303  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19304 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 19387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 12698554 - 12698835
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  12698554 tcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc 12698653  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12698654 cgaaaa-tttaaataattcaattat-ggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 12698751  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12698752 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 34127557 - 34127839
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||    
T  34127557 tcaactattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgccccacc 34127656  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34127657 caaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg 34127755  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  34127756 tgtagtggcccacccggaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaattt 34127839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2660937 - 2660655
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2660937 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 2660838  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2660837 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 2660739  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2660738 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 2660655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11450603 - 11450322
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  11450603 tcaacgattatatatctattttgcgagatcttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc 11450504  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11450503 cgaaaa-tttaaataattcaattattggtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 11450405  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11450404 tgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 11450322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 15469149 - 15469430
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  15469149 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 15469248  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  15469249 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atcccaattcccgcaaattgg 15469346  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15469347 tgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattt 15469430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 26468508 - 26468790
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26468508 tcaactattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 26468607  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26468608 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 26468706  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  26468707 tgtagtggacaaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 26468790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 365
Target Start/End: Original strand, 7021882 - 7022158
Alignment:
Q  87 gattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaa 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  7021882 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaa 7021981  T
Q  187 aatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtag 286  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7021982 a-tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtag 7022080  T
Q  287 tggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  7022081 tggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattt 7022158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34023641 - 34023359
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||    
T  34023641 tcaacgattataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 34023542  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34023541 caaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgg 34023443  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34023442 tgtagtgaaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 34023359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24130326 - 24130061
Alignment:
Q  99 attttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaat 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  24130326 attttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataat 24130228  T
Q  199 tcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccga 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  24130227 tcaattataggtctattttgcgagtttttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccga 24130128  T
Q  299 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24130127 aaaatttaaataattcaattatatgtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 24130061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 12996359 - 12996611
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  12996359 tattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatttaaataa 12996458  T
Q  198 -ttcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcaccc 296  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  12996459 attcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatcc 12996558  T
Q  297 gaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  12996559 g-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaattt 12996611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16461508 - 16461225
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||     
T  16461508 tcaacgattataagcctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccact 16461409  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgc-ttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtg 280  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  16461408 cgaaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatataattttatgtcgggttttaggtttcagttgattcaaattcccgcaaattg 16461310  T
Q  281 gtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16461309 gtgtagtggcctatccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 16461225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9079154 - 9078873
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9079154 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 9079055  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9079054 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagatttaa-acaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 9078957  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9078956 tgtagtggaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 9078873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24635569 - 24635287
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |    
T  24635569 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc 24635470  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24635469 cgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 24635371  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24635370 tgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 24635287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 8560485 - 8560768
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  8560485 tcaacgattataggtctaaattgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 8560584  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8560585 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattgg 8560683  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatagg-tctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   || ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8560684 tgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataattcaattataggatctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattt 8560768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14883261 - 14882979
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttg-tgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccac 180  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14883261 tcaacgattataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccac 14883162  T
Q  181 ccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtg 280  Q
    | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14883161 c-aaaaaatttaaataattcatttttaggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgc-aagag 14883064  T
Q  281 gtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  14883063 gtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgctaggctttaaacaatttttcaacggttaattt 14882979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23259048 - 23258771
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||| || ||| || ||||    
T  23259048 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaa 23258949  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagt 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23258948 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagt 23258849  T
Q  288 ggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23258848 ggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattt 23258771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23259147 - 23258919
Alignment:
Q  102 ttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattca 201  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||  ||||||||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23259147 ttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccacccaaaaa-tttaaataattca 23259049  T
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||    
T  23259048 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaa 23258949  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23258948 atttaaataattcaattataggtctatttt 23258919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Original strand, 7536522 - 7536681
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7536522 attatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaa 7536621  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggtta 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  7536622 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaacggtta 7536681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13405460 - 13405307
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||  |||  |||||| ||     
T  13405460 aacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccg 13405361  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13405360 aaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 13405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13405456 - 13405303
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| |||| || |||||||    
T  13405456 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaa 13405357  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||    
T  13405356 atttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttttcaa 13405303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 12996472 - 12996612
Alignment:
Q  96 tctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| |    
T  12996472 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatcc-gaaaatttaaat 12996570  T
Q  196 aattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  12996571 aattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 12996612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24130224 - 24130075
Alignment:
Q  88 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaa 187  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||    
T  24130224 attataggtctattttgcgagtttttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccgaaaa 24130125  T
Q  188 atttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||| ||| |||| | ||||||    
T  24130124 atttaaataattcaattatatgtttaatttgcgagactttaaacaatttt 24130075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31969043 - 31968956
Alignment:
Q  245 ttttaggtttcgg-ttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31969043 ttttaggtttcgggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctatttt 31968956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 7536518 - 7536652
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||   |||||| ||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  | |||||||     
T  7536518 aacgattatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccg 7536617  T
Q  184 aaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7536618 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 7536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 326
Target Start/End: Original strand, 10290526 - 10290647
Alignment:
Q  205 ataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcg-gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||| | |||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10290526 ataggtctactttgcgagattttatacaatttg-tgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaat 10290624  T
Q  304 ttaaataattcaattataggtct 326  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10290625 ttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23259163 - 23259033
Alignment:
Q  200 caattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaa 299  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  23259163 caattataggtccaacttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccaccc-aa 23259065  T
Q  300 aaatttaaataattcaattataggtctatttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23259064 aaatttaaataattcaattataggtctatttt 23259033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Original strand, 10290519 - 10290647
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttg-gttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccc 182  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||   ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||| ||    
T  10290519 aacgatcataggtctactttgcgagattttatacaattt-gtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatcc 10290617  T
Q  183 aaaaaatttaagtaattcaattataggtct 212  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10290618 gaaaaatttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31969031 - 31968955
Alignment:
Q  142 ggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttg 218  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31969031 ggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttg 31968955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1398188 - 1398050
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaatttaagtaa 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |  ||||||||||   | ||||    |||||||||| |||    
T  1398188 tattttacgagattttatccaattttgtgttggttttaga-tttagttgatctaaattttcgtaaagtggtgttttgtcccatttgaaaaatttaaataa 1398090  T
Q  198 ttcaattataggtctattttgcaagattttatataatttt 237  Q
    || ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  1398089 tttaattataggtctattttgcgagtgtttaaataatttt 1398050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Original strand, 31489892 - 31489991
Alignment:
Q  93 atgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacccaaaaaattta 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  31489892 atgtctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattctcacaaagtggtgtagtgatccatccaaaaaattta 31489991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1398104 - 1398051
Alignment:
Q  297 gaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataattt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  1398104 gaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagtgtttaaataattt 1398051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 31489894 - 31489973
Alignment:
Q  209 gtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtg 288  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  31489894 gtctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattctcacaaagtggtgtagtg 31489973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 365
Target Start/End: Original strand, 1163 - 1445
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1163 tcaacgactataggtctacttttcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 1262  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1263 cgaaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgg 1361  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaatggttaattt 365  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||  ||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  1362 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatttaatttgcgaaactttaaacagtttttcaatggtaaattt 1445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 316
Target Start/End: Original strand, 331831 - 332064
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||    
T  331831 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacc 331930  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  331931 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgg 332029  T
Q  282 tgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaa 316  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  332030 tgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaa 332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 331837 - 331970
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  331837 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 331936  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  331937 -tttaaataattcaattatagatctattttgcgag 331970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 290
Target Start/End: Original strand, 11237 - 11444
Alignment:
Q  82 tcaacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccacc 181  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| |    
T  11237 tcaacgattatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatc 11336  T
Q  182 caaaaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtgg 281  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11337 caaaaa-tttaaataattcaattatagatcaattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattag 11435  T
Q  282 tgtagtggc 290  Q
    |||||||||    
T  11436 tgtagtggc 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11376
Alignment:
Q  202 attataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaa 301  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || || ||||    
T  11243 attatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaa 11341  T
Q  302 atttaaataattcaattataggtctattttacgag 336  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11342 atttaaataattcaattatagatcaattttgcgag 11376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 179
Target Start/End: Original strand, 11367 - 11447
Alignment:
Q  99 attttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggccca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  11367 attttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggccca 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303791
Alignment:
Q  212 tattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataa 311  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||  || |||||   ||| |||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatttttttaataa 303802  T
Q  312 ttcaattatag 322  Q
    |||||||||||    
T  303801 ttcaattatag 303791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 303901 - 303827
Alignment:
Q  98 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtag 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  303901 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtag 303827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82785
Alignment:
Q  204 tataggtctattttgcaagattttatataattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaaat 303  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||  || |||||||| |||||||  |||||||||||     
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 82836  T
Q  304 --ttaaataattcaattataggtctattttacgaggctttaaataatttatcaa 355  Q
      ||||| ||   || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  82835 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 82785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 82941 - 82837
Alignment:
Q  84 aacgattatatgtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttagattttggttgatccaaattcccacaaagtggtgtagcggcccaccca 183  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||     
T  82941 aacgactataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccg 82842  T
Q  184 aaaaa 188  Q
    |||||    
T  82841 aaaaa 82837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1451
Alignment:
Q  91 atatgtctattttgcgagattttatacaatttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1483 atatgtctattttgcgagattttaaacaatttt 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University