View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20457_high_7 (Length: 389)

Name: NF20457_high_7
Description: NF20457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20457_high_7
NF20457_high_7
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (20-389)||(26655882-26656251)
chr6 (20-389)||(26761853-26762222)
chr6 (20-387)||(27337990-27338357)
chr6 (20-387)||(27398730-27399097)
chr6 (25-388)||(25579613-25579976)
chr6 (25-388)||(26142759-26143122)
chr6 (25-388)||(26055820-26056183)
chr6 (25-388)||(26075790-26076153)
chr6 (43-388)||(26048739-26049084)
chr6 (43-388)||(26069908-26070253)
chr6 (26-388)||(25538434-25538796)
chr6 (25-388)||(25481636-25481999)
chr6 (101-389)||(27698500-27698788)
chr6 (78-389)||(27718362-27718673)
chr6 (94-389)||(27611001-27611296)
chr6 (78-389)||(27724828-27725139)
chr6 (167-389)||(27229125-27229347)
chr6 (94-389)||(26802335-26802630)
chr6 (94-389)||(27531196-27531491)
chr6 (22-372)||(26646389-26646739)
chr6 (22-372)||(26752357-26752707)
chr6 (94-389)||(28781032-28781327)
chr6 (92-389)||(27593017-27593314)
chr6 (92-389)||(27604702-27604999)
chr6 (94-389)||(27678839-27679134)
chr6 (94-389)||(28786171-28786466)
chr6 (94-389)||(28792292-28792587)
chr6 (94-389)||(26884056-26884353)
chr6 (26-389)||(26622869-26623232)
chr6 (26-389)||(26728847-26729210)
chr6 (92-389)||(31284181-31284478)
chr6 (94-389)||(27677613-27677908)
chr6 (20-389)||(26823733-26824102)
chr6 (133-389)||(27706440-27706696)
chr6 (94-240)||(27427605-27427751)
chr6 (80-260)||(28139563-28139743)
chr6 (94-384)||(26861514-26861801)
chr6 (108-267)||(28149953-28150111)
chr6 (154-387)||(28234459-28234692)
chr6 (63-300)||(26937076-26937313)
chr6 (147-266)||(26341986-26342105)
chr6 (147-384)||(28242702-28242939)
chr6 (20-339)||(26848603-26848922)
chr6 (147-267)||(28181129-28181249)
chr6 (147-387)||(28226845-28227085)
chr6 (147-267)||(28185381-28185501)
chr6 (147-387)||(28325376-28325616)
chr6 (164-276)||(25506978-25507090)
chr6 (23-265)||(28098297-28098539)
chr6 (147-267)||(28297765-28297885)
chr6 (147-267)||(28514188-28514308)
chr6 (68-351)||(29825958-29826241)
chr6 (153-201)||(2184369-2184417)
chr6 (152-200)||(26975134-26975182)
chr6 (147-351)||(27665169-27665373)
chr6 (150-200)||(25071741-25071791)
chr6 (147-363)||(27214336-27214552)
chr6 (147-363)||(27234676-27234892)
chr6 (153-200)||(2184980-2185027)
chr6 (150-198)||(26949745-26949793)
chr6 (308-387)||(27427816-27427895)
chr6 (147-198)||(26635774-26635825)
chr6 (147-198)||(26741740-26741791)
chr6 (152-198)||(26959250-26959296)
chr6 (257-345)||(26617263-26617351)
chr6 (257-345)||(26723191-26723279)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (94-389)||(3420-3716)
scaffold0349 (78-389)||(14339-14649)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (22-389)||(18655391-18655758)
chr4 (22-389)||(18731418-18731785)
chr4 (22-389)||(18699314-18699681)
chr4 (22-389)||(18723999-18724366)
chr4 (23-389)||(18679482-18679848)
chr4 (94-240)||(18073804-18073950)
chr4 (146-240)||(17989091-17989185)
chr4 (62-200)||(5090921-5091059)
chr4 (308-387)||(17989250-17989329)
chr4 (308-387)||(18073660-18073739)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (81-389)||(4657-4965)
scaffold0277 (94-389)||(13631-13926)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (22-351)||(268271-268600)
chr1 (22-389)||(28127593-28127961)
chr1 (22-389)||(28164277-28164643)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (94-389)||(7418-7713)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (22-353)||(29273697-29274028)
chr8 (251-387)||(31903746-31903882)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (215-389)||(37-211)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (94-240)||(59612-59758)
scaffold0003 (308-387)||(59468-59547)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (147-387)||(34620-34860)
scaffold0038 (147-384)||(42864-43101)
scaffold0038 (147-387)||(27343-27583)
scaffold0038 (147-387)||(116691-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (147-351)||(58334-58538)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (147-275)||(3279695-3279823)
chr2 (147-200)||(17993736-17993789)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (154-349)||(16688944-16689139)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26656251 - 26655882
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656251 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 26656152  T
Q  120 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656151 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 26656052  T
Q  220 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656051 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 26655952  T
Q  320 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26655951 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 26655882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26762222 - 26761853
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762222 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 26762123  T
Q  120 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762122 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 26762023  T
Q  220 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762022 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 26761923  T
Q  320 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761922 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 26761853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 387
Target Start/End: Original strand, 27337990 - 27338357
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 119  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27337990 tccttgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacag 27338089  T
Q  120 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27338090 gcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaat 27338189  T
Q  220 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 319  Q
     |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  27338190 caaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 27338289  T
Q  320 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27338290 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacac 27338357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 387
Target Start/End: Original strand, 27398730 - 27399097
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 119  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27398730 tccttgttattttggaacttatcttcatgcttagtaagatgctcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacag 27398829  T
Q  120 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27398830 gcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaat 27398929  T
Q  220 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 319  Q
     |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  27398930 caaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtca 27399029  T
Q  320 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27399030 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacac 27399097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25579976 - 25579613
Alignment:
Q  25 gttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  25579976 gttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatactcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 25579877  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579876 actaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 25579777  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||    
T  25579776 tcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaag 25579677  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579676 agccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26143122 - 26142759
Alignment:
Q  25 gttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||     
T  26143122 gttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatgctcaccataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggaaat 26143023  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143022 actaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 26142923  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  26142922 tcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaag 26142823  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||| |||||||| ||||||||   ||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142822 agccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26056183 - 26055820
Alignment:
Q  25 gttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  26056183 gttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 26056084  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||  | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056083 actaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 26055984  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  26055983 tcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaag 26055884  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055883 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26076153 - 26075790
Alignment:
Q  25 gttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  26076153 gttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgctcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaat 26076054  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||  | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076053 actaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 26075954  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  26075953 tcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaag 26075854  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075853 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26049084 - 26048739
Alignment:
Q  43 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26049084 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26048985  T
Q  143 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatgg 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26048984 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26048885  T
Q  243 ccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 342  Q
    |||| || |||   ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  26048884 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattacc 26048785  T
Q  343 ggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||||  ||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048784 ggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26070253 - 26069908
Alignment:
Q  43 ttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||||||    
T  26070253 ttcatgcttagtaagatgctcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtc 26070154  T
Q  143 ttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatgg 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26070153 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatgg 26070054  T
Q  243 ccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgcc 342  Q
    |||| || |||   ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  26070053 ccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattacc 26069954  T
Q  343 ggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||||  ||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069953 ggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25538796 - 25538434
Alignment:
Q  26 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaa 125  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |    
T  25538796 ttattttgaaacctctcttcatgcttagtaaaatgctcaccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaata 25538697  T
Q  126 ccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaat 225  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25538696 ctaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaat 25538597  T
Q  226 cctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataaga 325  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||| |||| ||||    
T  25538596 tctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaaga 25538497  T
Q  326 gccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538496 gccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25481999 - 25481636
Alignment:
Q  25 gttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |  || ||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25481999 gttattttggaacccctcttcatgcttagtcagatattcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaat 25481900  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25481899 actaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaa 25481800  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  25481799 tcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaag 25481700  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 388  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481699 agccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 101 - 389
Target Start/End: Original strand, 27698500 - 27698788
Alignment:
Q  101 tccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698500 tccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 27698599  T
Q  201 tggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 300  Q
    ||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27698600 tgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 27698699  T
Q  301 agtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27698700 ggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacactt 27698788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 389
Target Start/End: Original strand, 27718362 - 27718673
Alignment:
Q  78 tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaa 177  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27718362 tctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaa 27718461  T
Q  178 acaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctg 277  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  27718462 acaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctt 27718561  T
Q  278 agaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaac 377  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  27718562 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaac 27718661  T
Q  378 tgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||    
T  27718662 tgaggaacactt 27718673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Original strand, 27611001 - 27611296
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27611001 agtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagag 27611100  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27611101 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcat 27611200  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27611201 caatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 27611296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 389
Target Start/End: Original strand, 27724828 - 27725139
Alignment:
Q  78 tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaa 177  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27724828 tctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaa 27724927  T
Q  178 acaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctg 277  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  27724928 acaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctt 27725027  T
Q  278 agaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaac 377  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27725028 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaac 27725127  T
Q  378 tgaggaacactt 389  Q
    | ||||||||||    
T  27725128 taaggaacactt 27725139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 167 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229125
Alignment:
Q  167 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgattt 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  267 catctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaat 366  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  367 gcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacactt 27229125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26802630 - 26802335
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||     
T  26802630 agtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagag 26802531  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26802530 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 26802431  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26802430 caatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 26802335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Original strand, 27531196 - 27531491
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531196 agtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 27531295  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27531296 gcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 27531395  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27531396 caatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacactt 27531491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26646739 - 26646389
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26646739 cttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggc 26646640  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  26646639 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26646540  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||| |    
T  26646539 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26646440  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccct 372  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  26646439 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccct 26646389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26752707 - 26752357
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26752707 cttgttattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggc 26752608  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  26752607 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26752508  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||| |    
T  26752507 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26752408  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccct 372  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  26752407 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccct 26752357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28781327 - 28781032
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  28781327 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 28781228  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28781227 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 28781128  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28781127 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 28781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Original strand, 27593017 - 27593314
Alignment:
Q  92 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 191  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27593017 tgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaag 27593116  T
Q  192 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 291  Q
    | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  27593117 aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtc 27593216  T
Q  292 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  27593217 atcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatactt 27593314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Original strand, 27604702 - 27604999
Alignment:
Q  92 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 191  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27604702 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaag 27604801  T
Q  192 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 291  Q
    | ||||| |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27604802 aggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttc 27604901  T
Q  292 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27604902 atcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacactt 27604999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27679134 - 27678839
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679134 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27679035  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||    
T  27679034 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttat 27678935  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  27678934 caatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatactt 27678839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28786466 - 28786171
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |      
T  28786466 agtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtg 28786367  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28786366 gcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 28786267  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28786266 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 28786171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28792587 - 28792292
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || |      
T  28792587 agtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtg 28792488  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28792487 gcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 28792388  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28792387 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 28792292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26884353 - 26884056
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatga--tgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||    | |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884353 agtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 26884254  T
Q  192 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 291  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||  |||||| ||| ||    
T  26884253 atgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatc 26884154  T
Q  292 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  26884153 atcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacactt 26884056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26623232 - 26622869
Alignment:
Q  26 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26623232 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26623134  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26623133 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26623034  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||| || ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  26623033 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26622934  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  26622933 agccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacactt 26622869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26729210 - 26728847
Alignment:
Q  26 ttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaa 124  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26729210 ttattatggaacctctttgcatgcttagcaag-tgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaa 26729112  T
Q  125 accgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaa 224  Q
    ||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  26729111 acgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaa 26729012  T
Q  225 tcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataag 324  Q
    |||| || ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  26729011 tcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaag 26728912  T
Q  325 agccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  26728911 agccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacactt 26728847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31284478 - 31284181
Alignment:
Q  92 tgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaag 191  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    | ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31284478 tgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaag 31284379  T
Q  192 atgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtc 291  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||    
T  31284378 aggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatc 31284279  T
Q  292 atcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  31284278 atcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatactt 31284181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Original strand, 27677613 - 27677908
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27677613 agtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 27677712  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    |||||||||  |||||| |  | |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  |  |    
T  27677713 gcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgt 27677812  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || || ||| ||||||| ||||    
T  27677813 caatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatactt 27677908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26824102 - 26823733
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacag 119  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||   | | ||||| |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26824102 tccttgttatttccgaacctcttttcatgcttagtgagatgtatagcataactcccacgctgatgtcgtatgtcaccaggatccacaccatagaaaacag 26824003  T
Q  120 gcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaat 219  Q
    |||||||    |  ||||||  ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  26824002 gcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaat 26823903  T
Q  220 aaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatca 319  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||| ||  ||||| ||| |||||  |||| |||   |||||||  || || ||||||||||| ||     
T  26823902 aaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtct 26823803  T
Q  320 ataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  26823802 gtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacactt 26823733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 133 - 389
Target Start/End: Original strand, 27706440 - 27706696
Alignment:
Q  133 accctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |  |||||||||||||| ||     
T  27706440 accctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagac 27706539  T
Q  233 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 332  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||  |  |||||||| || ||||||||||| |||  || ||||||||    
T  27706540 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgt 27706639  T
Q  333 agagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||||   || || ||||||||||| ||||    
T  27706640 agagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatactt 27706696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Original strand, 27427605 - 27427751
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27427605 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 27427704  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27427705 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28139743 - 28139563
Alignment:
Q  80 tgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaac 179  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28139743 tgatgtcgaatgtgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagc 28139644  T
Q  180 aaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtg 260  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |  || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  28139643 aaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtg 28139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26861801 - 26861514
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    | |||||||  |||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  26861801 agtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcctt---gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagag 26861705  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||  | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||    
T  26861704 gcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcat 26861605  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 384  Q
    | ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| | || || |||||||||||    
T  26861604 ccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaa 26861514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28150111 - 28149953
Alignment:
Q  108 catagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcaga 207  Q
    ||||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  28150111 catagaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgataga 28150012  T
Q  208 aaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
     || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28150011 gaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttc 28149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234459
Alignment:
Q  154 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |  |||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  254 gatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgt 353  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||  | ||||||||  |||||||||| |    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccat 28234493  T
Q  354 gccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
      || |||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28234492 agcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26937313 - 26937076
Alignment:
Q  63 caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtg 162  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    |  ||| ||||||||  |||||| || ||||||    
T  26937313 caccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtg 26937214  T
Q  163 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||  || ||   ||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  26937213 gacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtg 26937114  T
Q  263 atttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaa 300  Q
    ||||| |||||||   | || || ||||||||||||||    
T  26937113 atttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaa 26937076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Original strand, 26341986 - 26342105
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26341986 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcttt 26342085  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgattt 266  Q
     || |||||| |||||||||    
T  26342086 gacaagtgattgtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28242939 - 28242702
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28242939 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28242840  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||||||| ||||  || ||||   |||| ||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  28242839 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 28242740  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 384  Q
    ||||| |  || |||||| | || |||||||| |||||    
T  28242739 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26848922 - 26848603
Alignment:
Q  20 tccttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaaca 118  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |||| |||| ||||| | | |||||||||| |  |||| ||| || |  ||||||||||||    
T  26848922 tccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaag-tgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgccatagaaaaca 26848824  T
Q  119 ggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaa 218  Q
    || | ||||   | |||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||   |||    
T  26848823 ggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaa 26848724  T
Q  219 taaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatc 318  Q
    |  ||||||| || |||||||||  ||| | ||| || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||    
T  26848723 tggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtc 26848624  T
Q  319 aataagagccttgtagagatt 339  Q
    |  |||||| || ||||||||    
T  26848623 agaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28181129
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
     |  ||||||| ||| |||||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttc 28181129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28227085 - 28226845
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28227085 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 28226986  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||| ||| |||||||| ||||   |||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| || |||    
T  28226985 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 28226886  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||| |  || |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28226885 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28185501 - 28185381
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28185501 agcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28185402  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
     |  ||||||| ||| |||||    
T  28185401 gaaaagtgatgatgttatttc 28185381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325376
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||| ||||| ||||| || ||||   |||| || |||||||||||||| ||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 28325417  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||| |  || |||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28325416 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28325376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 276
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507090
Alignment:
Q  164 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtga 263  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  264 tttcatctcctct 276  Q
    |||||||||||||    
T  25507078 tttcatctcctct 25507090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Original strand, 28098297 - 28098539
Alignment:
Q  23 ttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||  || | |||| |||     
T  28098297 ttgttattttggaacctctcttcatgcttagcta-atgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaatagga 28098395  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtctta-tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaata 220  Q
    |||||  | ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || |  |||||     
T  28098396 aaaacgaagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaatt 28098494  T
Q  221 aaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatt 265  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  28098495 aaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgatt 28098539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 267
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297885
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| |||||||| |  |||||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
     |  ||||||||||| |||||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttc 28297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514188
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| |||||||| |  |||||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
     |  ||||||||||| |||||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttc 28514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29826241 - 29825958
Alignment:
Q  68 taacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaa 167  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||   || ||||||  ||||    || | ||  || || ||||    
T  29826241 taactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaa 29826142  T
Q  168 gttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttc 267  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||||    ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  29826141 gttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttc 29826042  T
Q  268 atctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaacc 351  Q
     || |||||  |||| || |||||||||||||| ||  | |||  ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29826041 gtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184369
Alignment:
Q  153 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtt 2184369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26975134
Alignment:
Q  152 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665373
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||   ||| |||||   |||   |||||| ||||||||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
       |||||| ||||||||||| || ||  |  |||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||  ||||||||| ||||| || |||||     
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtg 27665368  T
Q  347 aaacc 351  Q
    |||||    
T  27665369 aaacc 27665373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25071791 - 25071741
Alignment:
Q  150 agtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071791 agtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27214552 - 27214336
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||    || | ||||||| || ||||||||   |||    
T  27214552 agcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttctt 27214453  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
       ||| || | ||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| || |||  |||||| || |||||||| |||||     
T  27214452 gtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtg 27214353  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtc 363  Q
    |||||||| || |||||    
T  27214352 aaaccgtgtcgagtgtc 27214336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 363
Target Start/End: Original strand, 27234676 - 27234892
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||    || | ||||||| || ||||||||   |||    
T  27234676 agcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttctt 27234775  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
       ||| || | ||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| || |||  |||||| || |||||||| |||||     
T  27234776 gtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtg 27234875  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtc 363  Q
    |||||||| || |||||    
T  27234876 aaaccgtgtcgagtgtc 27234892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2185027 - 2184980
Alignment:
Q  153 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185027 gaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26949793 - 26949745
Alignment:
Q  150 agtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26949793 agtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 387
Target Start/End: Original strand, 27427816 - 27427895
Alignment:
Q  308 attcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| || || ||||||||||    
T  27427816 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 27427895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635774
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741740
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26959296 - 26959250
Alignment:
Q  152 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcata 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959296 tgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617263
Alignment:
Q  257 ggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggt 345  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||| ||| || |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26617263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723191
Alignment:
Q  257 ggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggt 345  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||| ||| || |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3716
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3420 agtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagag 3519  T
Q  194 gcatag-ttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtca 292  Q
    |||||| |||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3520 gcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtca 3619  T
Q  293 tcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3620 tcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacactt 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 389
Target Start/End: Original strand, 14339 - 14649
Alignment:
Q  78 tctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaa 177  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14339 tctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaa 14438  T
Q  178 acaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctg 277  Q
    |||||| |||||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  14439 acaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctt 14537  T
Q  278 agaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaac 377  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14538 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaac 14637  T
Q  378 tgaggaacactt 389  Q
    ||| ||||||||    
T  14638 tgatgaacactt 14649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 18655391 - 18655758
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18655391 cttgttattttggaaattctttctgtgcttagtgagatgttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacagga 18655490  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  18655491 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 18655590  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    | ||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||| || ||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  18655591 agatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18655690  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18655691 aagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 18655758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 18731418 - 18731785
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18731418 cttgttattttggaaactctttttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggc 18731517  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  18731518 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18731617  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  18731618 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18731717  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18731718 aagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 18731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 18699314 - 18699681
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18699314 cttgttattttggaaactctttccgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggc 18699413  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  18699414 aaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18699513  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| || ||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  18699514 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18699613  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18699614 aagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacactt 18699681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 18723999 - 18724366
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||  || |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18723999 cttgttattttggaaactcattttgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttggtgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggc 18724098  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||   || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  18724099 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18724198  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  18724199 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18724298  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18724299 aagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 18724366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 389
Target Start/End: Original strand, 18679482 - 18679848
Alignment:
Q  23 ttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggca 122  Q
    ||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18679482 ttgttattttggaaactctttcagtgattagtgagatgttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacatagaaaacaggca 18679581  T
Q  123 aaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaa 222  Q
    ||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| ||    
T  18679582 aaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaa 18679681  T
Q  223 aatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaata 322  Q
     ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  | || |||  |||||||||||| || |||||||| || ||| ||    
T  18679682 gatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagta 18679781  T
Q  323 agagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18679782 agagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 18679848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18073950 - 18073804
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18073950 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 18073851  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18073850 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 240
Target Start/End: Original strand, 17989091 - 17989185
Alignment:
Q  146 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17989091 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 200
Target Start/End: Original strand, 5090921 - 5091059
Alignment:
Q  62 tcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgt 161  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||  |||||||||| || |    
T  5090921 tcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatat 5091020  T
Q  162 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  5091021 ggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagt 5091059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 387
Target Start/End: Original strand, 17989250 - 17989329
Alignment:
Q  308 attcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| || || ||||||||||    
T  17989250 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 17989329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18073739 - 18073660
Alignment:
Q  308 attcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| || || ||||||||||    
T  18073739 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 18073660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 81 - 389
Target Start/End: Original strand, 4657 - 4965
Alignment:
Q  81 gatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaaca 180  Q
    ||||||| | || |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4657 gatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaaca 4756  T
Q  181 aaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgaga 280  Q
    ||| |||||| | ||||||  |  |||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  4757 aaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttga 4856  T
Q  281 agatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactga 380  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4857 agatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactga 4956  T
Q  381 ggaacactt 389  Q
    |||||||||    
T  4957 ggaacactt 4965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Original strand, 13631 - 13926
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  13631 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 13730  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13731 gcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 13830  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 13926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 351
Target Start/End: Original strand, 268271 - 268600
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  268271 cttgctattttggaaactctcttcgtgcttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggc 268370  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    ||||    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  268371 aaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 268470  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  268471 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 268570  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaacc 351  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  268571 aagagccttgtagagatggccaataaaacc 268600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 28127593 - 28127961
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |  ||||| ||||| || || |||| ||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28127593 cttgttattttggaacctctctccatgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggc 28127692  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  28127693 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataa 28127792  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtga-tttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaa 320  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||  ||||||||   ||||| |   ||||||||||| || ||||||||||| |||     
T  28127793 aaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcat 28127892  T
Q  321 taagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
     ||| ||||||||||||| ||| || |||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28127893 aaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 28127961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Original strand, 28164277 - 28164643
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||  |  || ||||| || || |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28164277 cttgttattttggaacctctcaccatgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgcca-agaaaacaggc 28164375  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    |||||    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |  |||||||    
T  28164376 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataa 28164475  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    |||| |  |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||||| || || |||||||| ||       
T  28164476 aaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtc 28164575  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28164576 aagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacactt 28164643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7713 - 7418
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  7713 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 7614  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 293  Q
    || ||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7613 gcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 7514  T
Q  294 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7513 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacactt 7418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Original strand, 29273697 - 29274028
Alignment:
Q  22 cttgttattttggaacttcttttcatgcttagtaagatgctcaccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggc 121  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29273697 cttgctattttggaaactctcttcgtacttagtgagatgttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggc 29273796  T
Q  122 aaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataa 221  Q
    ||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  29273797 aaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 29273896  T
Q  222 aaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaat 321  Q
    |||| || || ||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  29273897 aaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 29273996  T
Q  322 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgt 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  29273997 aagagtcttgtagagatggccaataaaaccgt 29274028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903746
Alignment:
Q  251 agtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaac 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |  || ||||| || || |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  351 cgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    | |  || ||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacac 31903746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 215 - 389
Target Start/End: Original strand, 37 - 211
Alignment:
Q  215 ggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattccct 314  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  37 ggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattccct 136  T
Q  315 tatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 389  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  137 tgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacactt 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 59758 - 59612
Alignment:
Q  94 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 193  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  59758 agtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagat 59659  T
Q  194 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59658 gcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 59547 - 59468
Alignment:
Q  308 attcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| || || ||||||||||    
T  59547 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacac 59468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34860 - 34620
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  34860 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 34761  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||||||| |||||||||||||   |||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||  | ||||||||  |||||    
T  34760 gaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggta 34661  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||| |  || |||||| | || |||||||| ||||||||    
T  34660 aaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43101 - 42864
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43101 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 43002  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||||||| ||||  || ||||   |||| ||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  43001 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 42902  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 384  Q
    ||||| |  || |||||| | || |||||||| |||||    
T  42901 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27583 - 27343
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27583 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgacctt 27484  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||| ||| |||||||| ||||   |||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| || |||    
T  27483 gaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagta 27384  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||| |  || |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27383 aaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116691
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||| ||||| ||||| || ||||   |||| || |||||||||||||| ||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| || |||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 116732  T
Q  347 aaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 387  Q
    ||||| |  || |||||| | || |||||||| ||||||||    
T  116731 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58538
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || | |||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggta 346  Q
     |  ||||||||||| ||||| || ||||   |||| ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||||| || |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  347 aaacc 351  Q
    |||||    
T  58534 aaacc 58538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279695
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggcctt 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || |  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  247 aacgagtgatggtgtgatttcatctcctc 275  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctc 3279695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993789
Alignment:
Q  147 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688944
Alignment:
Q  154 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagt 253  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||| | ||| ||   |||||| || |||||||| ||||| |  |||    
T  16689139 aatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagt 16689040  T
Q  254 gatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaa 349  Q
    |||||||||||||  || |||||  |||| || ||||||||||||||   | |||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  16689039 gatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtcacatagagctttgtacagattaccagtaaaa 16688944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University