View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20457_low_11 (Length: 278)

Name: NF20457_low_11
Description: NF20457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20457_low_11
NF20457_low_11
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (10-256)||(49553407-49553653)
chr3 (10-276)||(49642658-49642926)
chr3 (10-278)||(6090727-6090997)
chr3 (26-278)||(13948347-13948601)
chr3 (10-234)||(2561183-2561407)
chr3 (10-278)||(14392900-14393168)
chr3 (12-278)||(28582103-28582372)
chr3 (12-278)||(52920403-52920670)
chr3 (10-278)||(18121515-18121786)
chr3 (10-230)||(38177587-38177807)
chr3 (10-249)||(37467328-37467567)
chr3 (10-234)||(47207701-47207924)
chr3 (10-234)||(40799869-40800091)
chr3 (10-249)||(18142677-18142916)
chr3 (10-278)||(31303381-31303651)
chr3 (10-234)||(47405363-47405585)
chr3 (10-234)||(53056669-53056891)
chr3 (10-278)||(20646149-20646420)
chr3 (10-249)||(12726155-12726394)
chr3 (27-249)||(17238847-17239069)
chr3 (10-234)||(20627373-20627595)
chr3 (29-234)||(14969341-14969546)
chr3 (13-278)||(15903196-15903464)
chr3 (10-234)||(11223559-11223780)
chr3 (26-195)||(41495010-41495179)
chr3 (10-234)||(24775474-24775698)
chr3 (10-234)||(46349786-46350009)
chr3 (37-209)||(13824091-13824263)
chr3 (26-249)||(12963010-12963233)
chr3 (10-164)||(13780594-13780748)
chr3 (26-275)||(29951335-29951586)
chr3 (26-275)||(30000489-30000740)
chr3 (25-234)||(2785074-2785282)
chr3 (20-234)||(14955432-14955644)
chr3 (10-234)||(16658558-16658782)
chr3 (10-129)||(16032520-16032639)
chr3 (10-234)||(29855404-29855627)
chr3 (10-249)||(22140759-22140996)
chr3 (10-134)||(25398295-25398419)
chr3 (31-249)||(19888869-19889088)
chr3 (20-278)||(20725092-20725349)
chr3 (10-234)||(33583225-33583448)
chr3 (20-263)||(5213582-5213822)
chr3 (13-234)||(21640865-21641083)
chr3 (10-136)||(22804061-22804187)
chr3 (11-226)||(12388821-12389035)
chr3 (77-234)||(11869130-11869285)
chr3 (10-234)||(46796319-46796531)
chr3 (28-155)||(23538185-23538312)
chr3 (10-234)||(49666357-49666569)
chr3 (10-102)||(21636742-21636834)
chr3 (10-80)||(11868264-11868334)
chr3 (27-119)||(11909079-11909171)
chr3 (10-102)||(21605726-21605818)
chr3 (28-226)||(19249361-19249558)
chr3 (37-165)||(50300245-50300373)
chr3 (10-80)||(30054311-30054381)
chr3 (63-119)||(45858804-45858860)
chr3 (15-119)||(51341011-51341107)
chr3 (15-105)||(15833404-15833486)
chr3 (179-278)||(25398169-25398268)
chr3 (61-119)||(12752683-12752741)
chr3 (10-102)||(9700108-9700200)
chr3 (20-128)||(12968311-12968419)
chr3 (37-102)||(40850990-40851055)
chr3 (10-102)||(1728087-1728179)
chr3 (61-105)||(15851048-15851092)
chr3 (20-115)||(26417738-26417833)
chr3 (11-105)||(6253415-6253508)
chr3 (15-53)||(9380657-9380695)
chr3 (236-278)||(13824255-13824297)
chr3 (16-50)||(24706558-24706592)
chr3 (15-60)||(37412605-37412650)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (10-278)||(37435388-37435656)
chr4 (10-277)||(16632430-16632697)
chr4 (10-234)||(19884692-19884915)
chr4 (10-278)||(45833384-45833654)
chr4 (10-278)||(14604759-14605028)
chr4 (10-278)||(12811029-12811296)
chr4 (26-256)||(12601107-12601337)
chr4 (26-263)||(29680410-29680649)
chr4 (13-249)||(56034567-56034803)
chr4 (10-234)||(10692841-10693063)
chr4 (10-234)||(10906607-10906829)
chr4 (10-234)||(3395580-3395804)
chr4 (10-218)||(37985525-37985733)
chr4 (10-231)||(22675422-22675642)
chr4 (10-234)||(13576013-13576235)
chr4 (10-232)||(10072925-10073146)
chr4 (12-200)||(29121362-29121550)
chr4 (10-215)||(19666362-19666567)
chr4 (25-234)||(413007-413214)
chr4 (52-234)||(3483753-3483935)
chr4 (19-234)||(54679929-54680140)
chr4 (10-249)||(55380280-55380519)
chr4 (10-230)||(19620962-19621182)
chr4 (19-234)||(17247243-17247455)
chr4 (10-205)||(9140902-9141097)
chr4 (84-231)||(14833460-14833607)
chr4 (10-278)||(6641674-6641941)
chr4 (26-230)||(19911781-19911986)
chr4 (10-200)||(8105628-8105819)
chr4 (10-234)||(14904253-14904477)
chr4 (10-234)||(6517475-6517697)
chr4 (26-278)||(40846105-40846359)
chr4 (10-242)||(3105311-3105540)
chr4 (10-173)||(56533019-56533182)
chr4 (117-256)||(23123528-23123669)
chr4 (10-119)||(16853493-16853602)
chr4 (10-234)||(17398583-17398795)
chr4 (10-151)||(25651084-25651224)
chr4 (16-164)||(16940012-16940159)
chr4 (20-155)||(11915700-11915835)
chr4 (76-234)||(55731836-55731991)
chr4 (10-102)||(22190836-22190928)
chr4 (10-232)||(23750512-23750732)
chr4 (10-102)||(38513868-38513960)
chr4 (10-102)||(40860657-40860749)
chr4 (89-268)||(15139296-15139478)
chr4 (10-102)||(9751569-9751661)
chr4 (10-102)||(20977447-20977539)
chr4 (15-129)||(1672384-1672498)
chr4 (15-129)||(1674859-1674973)
chr4 (10-155)||(11901177-11901322)
chr4 (12-101)||(3499682-3499771)
chr4 (15-105)||(33378406-33378488)
chr4 (10-109)||(14154015-14154115)
chr4 (19-110)||(17788067-17788159)
chr4 (10-78)||(39419787-39419855)
chr4 (10-102)||(15475172-15475264)
chr4 (20-155)||(17540395-17540530)
chr4 (186-234)||(3793289-3793335)
chr4 (186-234)||(14571190-14571236)
chr4 (10-102)||(27188667-27188760)
chr4 (25-65)||(8685509-8685549)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (13-278)||(21283271-21283536)
chr7 (10-278)||(22577919-22578187)
chr7 (13-249)||(24788136-24788372)
chr7 (13-278)||(28409034-28409300)
chr7 (10-234)||(44467056-44467281)
chr7 (26-275)||(10883072-10883323)
chr7 (10-278)||(15467908-15468178)
chr7 (29-278)||(12366646-12366895)
chr7 (10-234)||(33691654-33691878)
chr7 (10-234)||(9069554-9069778)
chr7 (10-278)||(16316455-16316723)
chr7 (11-234)||(15088513-15088736)
chr7 (10-244)||(30944257-30944489)
chr7 (10-234)||(13302802-13303026)
chr7 (14-249)||(30945285-30945518)
chr7 (10-249)||(13648721-13648960)
chr7 (10-234)||(13137837-13138061)
chr7 (10-278)||(13880096-13880366)
chr7 (13-249)||(14426542-14426776)
chr7 (10-234)||(23279901-23280125)
chr7 (10-234)||(48236846-48237068)
chr7 (10-234)||(21695393-21695617)
chr7 (13-268)||(11319400-11319657)
chr7 (10-234)||(9709746-9709968)
chr7 (10-268)||(11792899-11793159)
chr7 (10-263)||(29935272-29935524)
chr7 (10-234)||(2913550-2913774)
chr7 (10-230)||(21692279-21692499)
chr7 (10-234)||(33605677-33605900)
chr7 (10-234)||(16111828-16112050)
chr7 (10-234)||(28622300-28622522)
chr7 (12-227)||(13730624-13730839)
chr7 (13-234)||(35952631-35952851)
chr7 (10-214)||(2500030-2500234)
chr7 (10-234)||(30025897-30026121)
chr7 (39-278)||(13692372-13692602)
chr7 (10-234)||(4821466-4821687)
chr7 (10-234)||(331637-331860)
chr7 (15-198)||(19237022-19237204)
chr7 (12-147)||(14193108-14193243)
chr7 (10-278)||(13260521-13260781)
chr7 (20-234)||(2265463-2265675)
chr7 (10-234)||(12174284-12174506)
chr7 (43-234)||(16542964-16543153)
chr7 (43-234)||(16622509-16622698)
chr7 (13-234)||(39284507-39284727)
chr7 (13-209)||(5000788-5000985)
chr7 (10-234)||(8182922-8183143)
chr7 (10-249)||(41842201-41842439)
chr7 (63-232)||(15704445-15704612)
chr7 (10-122)||(16309961-16310073)
chr7 (13-129)||(19711060-19711176)
chr7 (146-230)||(4494634-4494718)
chr7 (11-226)||(13893949-13894162)
chr7 (34-198)||(13880604-13880768)
chr7 (26-256)||(13018425-13018655)
chr7 (13-105)||(1293025-1293117)
chr7 (10-102)||(27871710-27871803)
chr7 (10-102)||(19339324-19339416)
chr7 (63-150)||(16556664-16556751)
chr7 (63-150)||(16608911-16608998)
chr7 (15-234)||(14425444-14425651)
chr7 (185-278)||(14193241-14193336)
chr7 (10-105)||(48062891-48062986)
chr7 (10-102)||(24794788-24794881)
chr7 (10-69)||(4494569-4494628)
chr7 (10-102)||(48805953-48806045)
chr7 (37-136)||(9098286-9098385)
chr7 (91-200)||(13472555-13472665)
chr7 (11-102)||(21381502-21381594)
chr7 (157-231)||(7339821-7339893)
chr7 (10-234)||(32264670-32264884)
chr7 (15-50)||(26209632-26209667)
chr7 (13-59)||(4412079-4412125)
chr7 (38-80)||(13032168-13032210)
chr7 (178-234)||(27871870-27871924)
chr7 (186-234)||(48062773-48062819)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (10-278)||(22599997-22600267)
chr1 (10-276)||(33256170-33256436)
chr1 (10-276)||(33276342-33276608)
chr1 (10-278)||(22153852-22154122)
chr1 (10-278)||(48704199-48704467)
chr1 (10-278)||(19717519-19717787)
chr1 (10-278)||(38282562-38282831)
chr1 (10-220)||(1900340-1900550)
chr1 (10-263)||(1577862-1578115)
chr1 (10-234)||(22427220-22427442)
chr1 (10-278)||(35401803-35402072)
chr1 (10-230)||(28492269-28492489)
chr1 (10-278)||(2268526-2268792)
chr1 (10-234)||(29215792-29216014)
chr1 (14-234)||(32785799-32786018)
chr1 (26-278)||(20954288-20954542)
chr1 (13-249)||(2267087-2267321)
chr1 (10-234)||(39200855-39201077)
chr1 (10-230)||(22201601-22201821)
chr1 (10-249)||(12284418-12284657)
chr1 (27-278)||(23036344-23036595)
chr1 (10-217)||(36134185-36134391)
chr1 (10-234)||(22464671-22464894)
chr1 (10-209)||(16235182-16235381)
chr1 (10-220)||(25448443-25448651)
chr1 (10-234)||(2834684-2834907)
chr1 (10-249)||(10757416-10757656)
chr1 (10-234)||(2327302-2327525)
chr1 (10-234)||(35040161-35040383)
chr1 (10-234)||(48570095-48570316)
chr1 (10-234)||(44821408-44821630)
chr1 (25-263)||(7309829-7310068)
chr1 (10-234)||(21702809-21703030)
chr1 (10-163)||(14263383-14263537)
chr1 (27-249)||(30893104-30893327)
chr1 (13-115)||(21191845-21191947)
chr1 (10-234)||(30572192-30572413)
chr1 (10-234)||(46088984-46089197)
chr1 (30-249)||(17024811-17025029)
chr1 (13-234)||(10250984-10251193)
chr1 (10-198)||(12613713-12613899)
chr1 (27-234)||(26701990-26702197)
chr1 (10-234)||(21028788-21029012)
chr1 (25-234)||(7744953-7745160)
chr1 (10-102)||(21121057-21121149)
chr1 (10-102)||(21984590-21984683)
chr1 (10-102)||(21135153-21135245)
chr1 (10-102)||(37642243-37642335)
chr1 (29-102)||(42284642-42284715)
chr1 (27-115)||(18896577-18896665)
chr1 (10-102)||(23024783-23024875)
chr1 (20-102)||(21204916-21204998)
chr1 (15-105)||(17371042-17371124)
chr1 (10-102)||(19215607-19215699)
chr1 (215-278)||(21191694-21191757)
chr1 (211-249)||(12284651-12284689)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (10-277)||(16207294-16207563)
chr8 (26-278)||(16188988-16189240)
chr8 (28-278)||(23263506-23263757)
chr8 (10-278)||(39693523-39693793)
chr8 (37-278)||(33082872-33083113)
chr8 (13-278)||(17525623-17525889)
chr8 (13-277)||(19943226-19943494)
chr8 (10-234)||(23185167-23185389)
chr8 (10-278)||(16681198-16681466)
chr8 (10-234)||(21932871-21933095)
chr8 (13-234)||(12757702-12757923)
chr8 (10-234)||(19156184-19156408)
chr8 (10-278)||(29693303-29693573)
chr8 (11-273)||(17267463-17267724)
chr8 (10-262)||(18121018-18121269)
chr8 (10-278)||(17914447-17914717)
chr8 (10-278)||(24646326-24646596)
chr8 (10-234)||(15336029-15336251)
chr8 (10-234)||(15425094-15425316)
chr8 (10-234)||(15516398-15516620)
chr8 (11-234)||(30421369-30421591)
chr8 (10-234)||(17797410-17797632)
chr8 (13-263)||(18321067-18321319)
chr8 (10-234)||(602659-602883)
chr8 (11-278)||(20382289-20382556)
chr8 (10-234)||(45538380-45538602)
chr8 (13-234)||(24551265-24551484)
chr8 (13-263)||(17441716-17441967)
chr8 (10-232)||(1237625-1237845)
chr8 (10-268)||(17701733-17701993)
chr8 (10-234)||(40845329-40845550)
chr8 (10-249)||(18718989-18719228)
chr8 (10-234)||(9320557-9320780)
chr8 (10-234)||(36105183-36105405)
chr8 (10-249)||(18679803-18680042)
chr8 (84-267)||(20255472-20255654)
chr8 (20-234)||(24832997-24833210)
chr8 (13-278)||(19707497-19707761)
chr8 (141-275)||(22745606-22745742)
chr8 (13-234)||(22663107-22663326)
chr8 (10-234)||(6407714-6407926)
chr8 (10-234)||(22673766-22673988)
chr8 (10-234)||(14989401-14989614)
chr8 (20-136)||(18722683-18722799)
chr8 (20-136)||(18731028-18731144)
chr8 (10-110)||(43644884-43644984)
chr8 (10-106)||(18151713-18151809)
chr8 (20-136)||(18685434-18685550)
chr8 (15-129)||(45567945-45568059)
chr8 (10-102)||(13430699-13430791)
chr8 (11-136)||(19956378-19956502)
chr8 (28-155)||(22461656-22461783)
chr8 (144-234)||(3598287-3598375)
chr8 (11-110)||(18772610-18772707)
chr8 (15-119)||(21540945-21541041)
chr8 (10-80)||(25164058-25164128)
chr8 (10-234)||(43639770-43639984)
chr8 (10-102)||(21301010-21301102)
chr8 (10-100)||(21288391-21288481)
chr8 (37-102)||(33560295-33560360)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (10-278)||(7745570-7745838)
chr5 (10-278)||(17814960-17815228)
chr5 (10-249)||(21910548-21910787)
chr5 (10-230)||(20550887-20551107)
chr5 (10-234)||(33022656-33022878)
chr5 (10-249)||(23412880-23413119)
chr5 (10-245)||(31117869-31118103)
chr5 (10-249)||(6512337-6512573)
chr5 (10-220)||(13545455-13545657)
chr5 (10-234)||(11993880-11994102)
chr5 (10-278)||(19536177-19536446)
chr5 (10-249)||(89328-89567)
chr5 (10-263)||(21072131-21072385)
chr5 (10-230)||(41566359-41566579)
chr5 (10-234)||(4887014-4887236)
chr5 (10-229)||(30742973-30743189)
chr5 (10-234)||(42243673-42243895)
chr5 (10-232)||(14086462-14086684)
chr5 (10-234)||(26759142-26759363)
chr5 (10-234)||(29138331-29138551)
chr5 (26-234)||(26784362-26784570)
chr5 (10-234)||(15516962-15517183)
chr5 (10-234)||(33933259-33933485)
chr5 (13-234)||(3245365-3245583)
chr5 (10-250)||(21198910-21199148)
chr5 (10-131)||(30115861-30115982)
chr5 (10-278)||(23881059-23881328)
chr5 (10-149)||(28139599-28139738)
chr5 (13-234)||(28464272-28464481)
chr5 (25-278)||(642583-642837)
chr5 (10-278)||(21099580-21099849)
chr5 (10-234)||(9088961-9089173)
chr5 (11-202)||(25096777-25096969)
chr5 (11-202)||(25154747-25154939)
chr5 (20-154)||(26765500-26765634)
chr5 (10-234)||(25930088-25930301)
chr5 (15-119)||(32160763-32160867)
chr5 (15-129)||(11208012-11208125)
chr5 (10-102)||(35932059-35932151)
chr5 (10-108)||(6499231-6499329)
chr5 (10-105)||(10848765-10848860)
chr5 (10-105)||(12352845-12352940)
chr5 (126-234)||(5429991-5430098)
chr5 (10-80)||(9398809-9398879)
chr5 (215-278)||(12352693-12352758)
chr5 (10-102)||(23391656-23391749)
chr5 (186-234)||(30115799-30115845)
chr5 (10-102)||(35986284-35986377)
chr5 (179-239)||(9398661-9398721)
chr5 (10-102)||(21660204-21660296)
chr5 (178-234)||(10848924-10848978)
chr5 (25-110)||(16607519-16607603)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (10-278)||(13435528-13435798)
chr6 (12-278)||(9717841-9718109)
chr6 (10-276)||(15531509-15531777)
chr6 (10-234)||(32544261-32544485)
chr6 (10-244)||(29918013-29918246)
chr6 (10-234)||(22802137-22802359)
chr6 (10-230)||(14100373-14100592)
chr6 (26-278)||(23284576-23284830)
chr6 (10-234)||(26972157-26972379)
chr6 (11-234)||(20112628-20112852)
chr6 (10-278)||(13602168-13602438)
chr6 (10-249)||(12715333-12715573)
chr6 (10-234)||(18435552-18435776)
chr6 (16-277)||(21625103-21625363)
chr6 (37-244)||(19688789-19688994)
chr6 (26-249)||(15302212-15302435)
chr6 (10-278)||(24116824-24117094)
chr6 (14-234)||(20730635-20730853)
chr6 (26-263)||(19623991-19624228)
chr6 (13-232)||(15954702-15954919)
chr6 (10-234)||(16877209-16877431)
chr6 (10-234)||(20487848-20488071)
chr6 (10-234)||(21618239-21618462)
chr6 (10-234)||(16265081-16265303)
chr6 (43-234)||(34451597-34451788)
chr6 (13-217)||(15987232-15987437)
chr6 (10-234)||(16336123-16336345)
chr6 (10-234)||(22076338-22076560)
chr6 (20-234)||(19832963-19833176)
chr6 (93-278)||(25597558-25597745)
chr6 (10-234)||(19086154-19086368)
chr6 (16-230)||(12348995-12349206)
chr6 (10-196)||(18378310-18378496)
chr6 (14-182)||(12423261-12423428)
chr6 (27-278)||(19470683-19470933)
chr6 (10-118)||(21235120-21235229)
chr6 (10-278)||(26943572-26943828)
chr6 (27-198)||(10640384-10640555)
chr6 (10-101)||(25594064-25594155)
chr6 (10-91)||(17381517-17381598)
chr6 (10-123)||(33351967-33352079)
chr6 (10-102)||(19066079-19066171)
chr6 (15-120)||(14051425-14051529)
chr6 (141-234)||(21235240-21235331)
chr6 (19-120)||(14070106-14070206)
chr6 (13-102)||(19482751-19482840)
chr6 (15-102)||(20635720-20635799)
chr6 (15-105)||(22386803-22386885)
chr6 (10-102)||(17316586-17316678)
chr6 (10-85)||(26589595-26589671)
chr6 (16-50)||(11147264-11147298)
chr6 (15-53)||(25675307-25675345)
chr6 (15-53)||(25679383-25679421)
chr6 (15-53)||(25735570-25735608)
chr6 (16-50)||(25986229-25986263)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (10-249)||(25829124-25829363)
chr2 (10-278)||(22187942-22188212)
chr2 (10-278)||(23234997-23235267)
chr2 (26-268)||(20568600-20568844)
chr2 (10-278)||(30666979-30667249)
chr2 (10-278)||(10009591-10009860)
chr2 (10-263)||(19540406-19540659)
chr2 (10-278)||(38781388-38781657)
chr2 (10-234)||(13963864-13964088)
chr2 (10-278)||(25037099-25037369)
chr2 (10-278)||(25041206-25041476)
chr2 (10-278)||(24576025-24576294)
chr2 (26-278)||(9015211-9015462)
chr2 (10-234)||(18376792-18377016)
chr2 (26-275)||(24850508-24850760)
chr2 (37-234)||(20151922-20152118)
chr2 (10-234)||(6574010-6574235)
chr2 (46-278)||(22260432-22260664)
chr2 (26-278)||(21537088-21537342)
chr2 (10-234)||(22317583-22317808)
chr2 (26-234)||(30621222-30621430)
chr2 (26-234)||(30623843-30624051)
chr2 (10-234)||(24377091-24377315)
chr2 (10-234)||(28711586-28711808)
chr2 (10-234)||(31800775-31800997)
chr2 (10-234)||(28701117-28701339)
chr2 (10-234)||(30557207-30557430)
chr2 (10-230)||(28140509-28140729)
chr2 (10-278)||(40782467-40782729)
chr2 (10-199)||(6392624-6392814)
chr2 (10-263)||(23595427-23595677)
chr2 (10-263)||(41121577-41121829)
chr2 (10-249)||(22802451-22802687)
chr2 (10-234)||(35743890-35744110)
chr2 (98-274)||(7609039-7609216)
chr2 (10-234)||(34321824-34322046)
chr2 (35-234)||(45087070-45087269)
chr2 (10-234)||(33074216-33074438)
chr2 (10-234)||(31327853-31328075)
chr2 (10-234)||(31334574-31334796)
chr2 (10-234)||(39037528-39037752)
chr2 (10-275)||(22454833-22455100)
chr2 (10-202)||(24779333-24779525)
chr2 (10-249)||(44840424-44840650)
chr2 (10-234)||(1586930-1587142)
chr2 (13-202)||(25189391-25189579)
chr2 (20-155)||(26619066-26619201)
chr2 (10-105)||(28550933-28551028)
chr2 (10-249)||(22776171-22776398)
chr2 (10-249)||(22781549-22781776)
chr2 (10-105)||(40332077-40332172)
chr2 (27-278)||(22272139-22272390)
chr2 (10-102)||(31968061-31968153)
chr2 (10-105)||(14581505-14581600)
chr2 (10-263)||(23184170-23184414)
chr2 (27-234)||(3277037-3277233)
chr2 (25-263)||(44881172-44881409)
chr2 (25-105)||(22785670-22785750)
chr2 (15-119)||(1084009-1084105)
chr2 (10-102)||(23392686-23392778)
chr2 (25-226)||(18430835-18431035)
chr2 (25-154)||(19115088-19115217)
chr2 (20-115)||(18702738-18702833)
chr2 (15-50)||(22774530-22774565)
chr2 (15-50)||(22779908-22779943)
chr2 (186-234)||(22785553-22785599)
chr2 (10-50)||(24275192-24275232)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (10-249)||(27305-27544)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (10-278)||(20816-21086)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (10-234)||(22672-22896)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (26-278)||(487-741)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (10-278)||(60012-60280)
scaffold0026 (28-249)||(7940-8161)
scaffold0026 (201-278)||(115708-115785)
scaffold0026 (225-278)||(151735-151788)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (10-278)||(4792-5062)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (10-249)||(1656-1895)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (10-278)||(36620-36890)
scaffold0120 (10-278)||(42115-42385)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (12-278)||(18466-18734)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (10-278)||(14644-14912)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (10-278)||(212350-212619)
scaffold0005 (84-231)||(6092-6239)
scaffold0005 (186-234)||(246140-246186)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (10-278)||(5537-5805)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (27-263)||(103585-103821)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (10-278)||(377404-377674)
scaffold0004 (26-278)||(220250-220503)
scaffold0004 (10-249)||(211394-211631)
scaffold0004 (25-153)||(244256-244384)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (13-234)||(9998-10220)
scaffold0161 (13-80)||(14817-14884)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (10-278)||(1686-1954)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (10-264)||(49328-49584)
scaffold0084 (10-220)||(32481-32691)
scaffold0084 (15-129)||(341-455)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (13-278)||(25820-26087)
scaffold0083 (47-173)||(44656-44782)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (10-234)||(89948-90170)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (10-249)||(9965-10204)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (26-278)||(12221-12475)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (13-249)||(533-767)
scaffold1359 (15-234)||(1658-1865)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (10-234)||(6633-6855)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (13-278)||(19319-19584)
scaffold0035 (10-234)||(99101-99320)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (26-234)||(7715-7923)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (84-278)||(633-827)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-234)||(215390-215612)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (27-249)||(15130-15352)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (10-234)||(19027-19251)
scaffold0217 (13-234)||(9559-9777)
scaffold0217 (10-234)||(22024-22246)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (43-278)||(9824-10059)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (10-234)||(78259-78481)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (10-228)||(1598-1814)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (84-231)||(30294-30441)
scaffold0047 (10-263)||(9899-10151)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (13-234)||(60802-61021)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (10-219)||(5510-5717)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (10-234)||(3300-3522)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (10-182)||(13567-13739)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (55-218)||(143129-143292)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (10-234)||(9151-9372)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (10-249)||(6003-6241)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-230)||(15789-16011)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (26-234)||(9968-10176)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (84-234)||(39495-39645)
scaffold0022 (84-234)||(137555-137705)
scaffold0022 (10-75)||(37398-37463)
scaffold0022 (10-75)||(135458-135523)
scaffold0022 (10-230)||(159051-159270)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (20-234)||(7049-7261)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (131-278)||(4838-4987)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (15-278)||(36032-36294)
scaffold0056 (10-102)||(34827-34919)
scaffold0056 (13-102)||(25688-25777)
scaffold0056 (186-278)||(25520-25613)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (193-278)||(9253-9338)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (68-234)||(65322-65485)
scaffold0011 (68-234)||(144367-144530)
scaffold0011 (15-129)||(164942-165056)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (45-234)||(7963-8149)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (10-129)||(25395-25514)
scaffold0247 (141-234)||(23456-23546)
scaffold0247 (10-50)||(15814-15854)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-125)||(38085-38190)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (10-154)||(2702-2845)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (143-234)||(5830-5922)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (10-234)||(17668-17880)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (27-119)||(1803-1895)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-223)||(43822-44032)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (20-155)||(1491-1626)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (15-129)||(15618-15732)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (26-155)||(5639-5767)
scaffold0273 (221-263)||(5867-5909)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (10-102)||(7377-7469)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (15-224)||(40638-40846)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (195-263)||(60729-60799)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (10-100)||(846-935)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (10-115)||(74577-74682)
scaffold0025 (179-278)||(74732-74831)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (10-102)||(87623-87715)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (20-107)||(1323-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (20-107)||(1-88)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (30-93)||(2027-2090)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (195-265)||(13391-13462)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (10-102)||(719-812)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (10-78)||(2738-2806)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (19-105)||(3915-4001)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (15-101)||(20409-20487)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (15-50)||(2172-2207)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (15-119)||(16956-17052)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (19-102)||(31808-31890)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (10-48)||(2978-3016)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (19-80)||(7290-7351)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (10-102)||(5347-5440)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (10-50)||(6002-6042)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49553653 - 49553407
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49553653 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 49553554  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  49553553 tcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 49553454  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgctt 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  49553453 cctgatgaacttcggcttctggtgatcttacttctgatgagatgctt 49553407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642658
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090997
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6090927 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatga 6090997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 13948347 - 13948601
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13948347 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 13948446  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13948447 gttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 13948546  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  13948547 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 13948601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561407
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  2561383 cctgatgaactagagcttctggtga 2561407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392900
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  14392968 cctaatgaacttcagcttctagtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatga 14392900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582372
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||| |  ||||||||||||  ||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28582303 tgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 28582372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 52920403 - 52920670
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||     
T  52920403 cagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaata 52920502  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  52920503 cttt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcc 52920601  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52920602 tgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 52920670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121515
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||  || |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||| | ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18121586 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatga 18121515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38177807 - 38177587
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38177807 agcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 38177708  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38177707 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38177608  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    ||| || ||||  ||||||||    
T  38177607 cctaataaactagagcttctg 38177587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467567
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37467528 cctgatgaactactgcttctggtgatcttgcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 47207701 - 47207924
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207701 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 47207800  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgc-ttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  | |||||||    
T  47207801 tcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatc 47207898  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  47207899 tcctgatgaactgcagcttctggtga 47207924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800091
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatct 40800066  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  40800067 cttgatgaactgcagcttctggtga 40800091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142677
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||  || |||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18142716 cctgatgaactagagcttctgatgaacttgcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303651
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| |||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||  ||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31303581 cctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 31303651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405363
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  47405485 tcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 47405388  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  47405387 cgtgatgaactgcagcttctggtga 47405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056669
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| | |||||| | |||||  |||||||     
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcc 53056694  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||    
T  53056693 catgatgaactgcagcttctagtga 53056669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646420
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| |||||  | ||||  ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 20646420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726155
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgtttctcatga 12726155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17239069 - 17238847
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17239069 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 17238970  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
     || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  17238969 atgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatct 17238870  T
Q  227 tctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  17238869 tctggtgatcttgcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20627595 - 20627373
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  20627595 agcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaa 20627496  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  20627495 tccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatct 20627398  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  20627397 cctgatgaactgcaacttctggtga 20627373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969546
Alignment:
Q  29 tagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 128  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  129 gtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 228  Q
    | || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  229 tggtga 234  Q
    ||||||    
T  14969541 tggtga 14969546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903464
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaa-gcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| || | |||||| |||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15903396 tgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatga 15903464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 11223559 - 11223780
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11223559 agcagagacaaaac-agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 11223657  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || || | ||| |||| | |||||||||  |||  ||| ||||    
T  11223658 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatct 11223755  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  11223756 cctgatgaactgctgcttctggtga 11223780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Original strand, 41495010 - 41495179
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41495010 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 41495109  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctt 195  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  41495110 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775474
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 24775501  T
Q  210 cctgatgaact--tcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  24775500 cctgatgaactgcgcagcttctggtga 24775474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46350009 - 46349786
Alignment:
Q  10 agcagagacaaa-aatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46350009 agcagagacaaagaacatagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 46349910  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||| | |||||||  |||||  |||| ||    
T  46349909 atcctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttc 46349812  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  46349811 tcctgatgaactgcaacttctggtga 46349786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 13824091 - 13824263
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13824091 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcact 13824190  T
Q  137 atttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     || ||||||||| || || ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12963233 - 12963010
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||     
T  12963233 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccttctaaaatagtt 12963134  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |  |||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12963133 gttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 12963034  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12963033 ttctggtgatcttgcttctgatga 12963010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780594
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacga 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacga 13780594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29951586 - 29951335
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29951586 gagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 29951487  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| ||||||  |   ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  29951486 gttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagc 29951387  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    |||| |||| |||  |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  29951386 ttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30000740 - 30000489
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30000740 gagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 30000641  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| ||||||  |   ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  30000640 gttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagc 30000541  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    |||| |||| |||  |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30000540 ttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 2785074 - 2785282
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatag 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2785074 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 2785173  T
Q  124 tcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 223  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  2785174 ttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 2785271  T
Q  224 gcttctggtga 234  Q
     ||||||||||    
T  2785272 acttctggtga 2785282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 14955432 - 14955644
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14955432 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaa 14955531  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 219  Q
    ||||| |||| || ||  || ||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  14955532 atagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaac 14955629  T
Q  220 ttcagcttctggtga 234  Q
    | || ||||||||||    
T  14955630 tgcaacttctggtga 14955644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658558
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| || ||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  16658582 cctgatgaactacaacttctggtga 16658558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032639
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttg 16032639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855627
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855404 agcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29855503  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcac-tatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  29855504 ttctttcaaactagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcatc 29855601  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     | ||||||||| ||| || ||||||    
T  29855602 ccatgatgaactgcaggttttggtga 29855627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140996
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     || |||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||| |||  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||||    
T  22140957 cctgatgaactgtagcttctgatgaactagcttctgatga 22140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398295
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttca 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19889088 - 19888869
Alignment:
Q  31 gtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgt 130  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||  || |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19889088 gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgc 19888989  T
Q  131 ttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaaca-tcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttct 229  Q
    ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19888988 ttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactttagcttct 19888889  T
Q  230 ggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     |||| ||||||||| ||||    
T  19888888 agtgatcttgcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Original strand, 20725092 - 20725349
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaag-aacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  20725092 aaaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctct-tcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 20725190  T
Q  119 aatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    | ||||||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||||||   ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||  || ||  ||||||     
T  20725191 attagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgat 20725289  T
Q  219 cttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||  || ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20725290 cttcagcttctggtgatgtttcttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatga 20725349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 33583225 - 33583448
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  33583225 agcagagacaaaa-tagagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 33583323  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| | || ||||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  33583324 atcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcat 33583421  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |  |||||||||| || ||| ||||||    
T  33583422 cctctgatgaactacaacttttggtga 33583448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Original strand, 5213582 - 5213822
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5213582 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttt-tgaataataagcatctaatgccttcaaatccttccaaa 5213680  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 219  Q
    ||||| |||| |  ||| || ||||||||||||||  ||| ||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5213681 atagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 5213778  T
Q  220 ttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    | ||||||||| | | ||||||| | ||||  ||||| ||||||    
T  5213779 tacagcttctgataaacttgcttatgatgaactgcttctgatga 5213822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 21640865 - 21641083
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||  |||||    
T  21640865 agagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatcc 21640964  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || |||||||| ||||| |  ||| || ||||||||| |||| ||||| |||  || ||||  | ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21640965 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcct 21641061  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  21641062 gatgaactgcaacttctggtga 21641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804061
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcact 22804061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388821
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatg-ttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||  || ||||||| | |||||| ||    ||||||||||| | ||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagac-atgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 12388838  T
Q  210 cctgatgaacttcagct 226  Q
     || |||| ||||||||    
T  12388837 tcttatgatcttcagct 12388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Original strand, 11869130 - 11869285
Alignment:
Q  77 ctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctat 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||| | | |||||||||  || |||  ||    
T  11869130 ctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcat 11869229  T
Q  177 taaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||   |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11869230 taaacaaattttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtga 11869285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46796531 - 46796319
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||            
T  46796531 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatg-------- 46796440  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46796439 -cctttcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 46796344  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  46796343 cctgatgaactgcagcttcttgtga 46796319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538185
Alignment:
Q  28 gtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  128 tgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49666569 - 49666357
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||| ||||||| |         || |||  ||    
T  49666569 agcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaa 49666479  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  49666478 tcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 49666382  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  49666381 cctgatgaactgcagcttctggtga 49666357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636742
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868334
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctct 11868334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |   |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249361
Alignment:
Q  28 gtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 127  Q
    |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||  ||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  128 tgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    || |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaatgatcttcagct 19249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 50300245 - 50300373
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcac 135  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||| |||||    
T  50300245 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcac 50300343  T
Q  136 tatttcagtcttctgcaatgcttagacgat 165  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  50300344 ttttccagtcttctgcaatccttagacgat 50300373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054311
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct 30054311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45858860 - 45858804
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45858860 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 51341011 - 51341107
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||        |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  51341011 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac--------tttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctt 51341102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 15833404 - 15833486
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||        |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15833404 agacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt--------tgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 15833486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25398268 - 25398169
Alignment:
Q  179 aacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25398268 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatgaga--caacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 25398171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12752741 - 12752683
Alignment:
Q  61 ttgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12752741 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatccaatgccttcaattcctttcaaa 12752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9700200 - 9700108
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  9700200 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 9700108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 12968311 - 12968419
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| |||   ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12968311 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaa 12968410  T
Q  120 atagtcgtt 128  Q
     ||||||||    
T  12968411 ttagtcgtt 12968419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Original strand, 40850990 - 40851055
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40850990 gtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40851055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1728179 - 1728087
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||| | ||  ||| ||| |||||||||||||    
T  1728179 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaatgttccttgaggaataagcatccaatgc 1728087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 15851048 - 15851092
Alignment:
Q  61 ttgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15851048 ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 15851092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26417833 - 26417738
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  26417833 aaaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttt 26417738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 6253415 - 6253508
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||| ||||| ||||  ||||| |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  6253415 gcagacacaaaaatagagtaatggaggtagtggtagtacaatt-gtactattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagcatccaatgcctt 6253508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9380695 - 9380657
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacattt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9380695 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacattt 9380657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 278
Target Start/End: Original strand, 13824255 - 13824297
Alignment:
Q  236 cttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13824255 cttgcatctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13824297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24706592 - 24706558
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24706592 gacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 24706558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaa 60  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435388
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37435556 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37435457  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37435456 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 37435388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632697
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  || | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 277  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16632630 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatg 16632697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884915
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  19884891 cctgatgaactacagcttctggtga 19884915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 45833384 - 45833654
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45833384 agcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaa 45833483  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||  |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45833484 tactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 45833583  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  45833584 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatga 45833654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14605028 - 14604759
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14605028 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14604929  T
Q  110 tcc-tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  || |||| ||  || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  14604928 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 14604829  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14604828 tcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 14604759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811029
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12811099 cctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatga 12811029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 12601107 - 12601337
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601107 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 12601206  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| | |    
T  12601207 gttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatgagctttaac 12601306  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatgagatgctt 256  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  12601307 ttctagtgatcttgcttctgatgagatgctt 12601337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29680649 - 29680410
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29680649 gagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 29680550  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  29680549 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctggtaaactagagc 29680450  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  29680449 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034803
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  56034767 gatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693063
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10693039 cctgatgaactacagcttctggtga 10693063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906829
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10906805 cctgatgaactacagcttctggtga 10906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395804
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  3395780 cctgatgaactatagcttctagtga 3395804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22675642 - 22675422
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaata-gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22675642 agcagagacaaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaa 22675543  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  22675542 atcctttcaaactagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 22675445  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  22675444 tcctaatgaactgcagcttctgg 22675422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13576013
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||||  | ||||||||    
T  13576135 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 13576038  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  13576037 cctgatgaactgcagcttctggtga 13576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073146
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10073025 tcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 10073123  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    ||||||||||| | |||||||||    
T  10073124 cctgatgaactactgcttctggt 10073146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121550
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  29121462 ctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| || |||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  210 cctgat 215  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 413007 - 413214
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  413007 agagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagc 413106  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  413107 cgttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcag 413204  T
Q  225 cttctggtga 234  Q
    ||||||||||    
T  413205 cttctggtga 413214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Original strand, 3483753 - 3483935
Alignment:
Q  52 ttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  3483753 ttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgc 3483852  T
Q  152 aatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||    
T  3483853 aatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtga 3483935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 54679929 - 54680140
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54679929 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaa 54680028  T
Q  119 aatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || |  | |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54680029 aatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 54680124  T
Q  219 cttcagcttctggtga 234  Q
    || |||||||||||||    
T  54680125 ctgcagcttctggtga 54680140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380519
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatg-ttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||   ||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggc-atgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcat 55380477  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  55380478 ctcctaatgaacttcagcttctgatgatcttgcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19620982 cctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 17247243 - 17247455
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17247243 aaaaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaa 17247342  T
Q  119 aatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    | ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||| | ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  17247343 attagtcgttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaa 17247439  T
Q  219 cttcagcttctggtga 234  Q
    || |||||||||||||    
T  17247440 ctgcagcttctggtga 17247455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 14833460 - 14833607
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  14833460 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 14833559  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  14833560 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 14833607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641941
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatg-ttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||| ||    |||||| |||||| ||| | ||| |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||  ||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggc-atgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatc 6641871  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6641872 ttctgatgaaattcagcttctggtgatattgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatga 6641941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19911986 - 19911781
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaa-gaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19911986 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 19911887  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    ||||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19911886 cgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 19911787  T
Q  225 cttctg 230  Q
    ||||||    
T  19911786 cttctg 19911781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 8105628 - 8105819
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  8105628 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 8105726  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| | |||||||| ||||||    
T  8105727 atcctttcaaaatagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt 8105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904253
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||| || || ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||  |||||||  || || | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaacttctggtga 14904253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517697
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||| | | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  6517673 cctgatgaactacaacttctggtga 6517697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 40846105 - 40846359
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||| | | ||  || |||||    
T  40846105 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttcatttgaattagtc 40846204  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||| |||||| |    |||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40846205 gttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcag 40846303  T
Q  225 cttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40846304 cttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 40846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105311
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgctt 242  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  3105343 cctgatgaactgcagcttctgatgaacttgctt 3105311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 56533182 - 56533019
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||| |||||    
T  56533182 agcagagacaaaac-agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaa 56533084  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatc 173  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  56533083 atcctttcaaaatagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatc 56533019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 256
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123669
Alignment:
Q  117 aaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 216  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  217 aacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgctt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgctt 23123669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  110 tcctttcaaa 119  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398583
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  17398607 cctgatgaaccgcagcttctggtga 17398583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25651224 - 25651084
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25651224 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 25651126  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgc 151  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  25651125 tccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaagtcttctgc 25651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Original strand, 16940012 - 16940159
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  16940012 gacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatccttt 16940111  T
Q  116 caaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacga 164  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  16940112 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacga 16940159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 11915700 - 11915835
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  11915700 aaaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaa 11915799  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11915800 atagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 234
Target Start/End: Original strand, 55731836 - 55731991
Alignment:
Q  76 gctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatcta 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||||| ||||||  ||||||||  || |||| |    
T  55731836 gctctttgaagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatcca 55731934  T
Q  176 ttaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55731935 ttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttccggtga 55731991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190928
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaatcagcatccaatgc 22190928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750732
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct-ctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||   |||| || |  || |||||||||| |||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatccttt-gaagctttaagtcttgcat 207  Q
     | | ||  ||  |||||||| |||||| |    |||||||||| |||| || ||   ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaacttcagcttctggt 23750732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513960
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 15139296 - 15139478
Alignment:
Q  89 caagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatccttt 188  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||  || ||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  15139296 caagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacaaccttt 15139395  T
Q  189 gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac-ttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 268  Q
    ||| ||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| | ||| ||||| | |||||||||    
T  15139396 gaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttg 15139478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9751661 - 9751569
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||   |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  9751661 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 9751569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977539
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 20977539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 1672384 - 1672498
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||| | || || |||| || || || |||||    
T  1672384 agacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataaacacccaaagcttttaagtcctt 1672483  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| ||| |||||    
T  1672484 tcaaattagccgttg 1672498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 1674859 - 1674973
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||| | || || |||| || || || |||||    
T  1674859 agacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataaacacccaaagcttttaagtcctt 1674958  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| ||| |||||    
T  1674959 tcaaattagccgttg 1674973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 11901177 - 11901322
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  11901177 agcagacacaaatacagattagtgtagatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaa 11901276  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttc-agtcttctgcaatg 155  Q
      ||||  || ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  11901277 atcttttgaattagtcgttgcttca-tgtttctagtcttctgcaatg 11901322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3499771 - 3499682
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatg 101  Q
    ||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  3499771 cagagacaaactcagagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcattgaagaaatagcatccaatg 3499682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 33378406 - 33378488
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||        |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33378406 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt--------tgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 33378488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14154115 - 14154015
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  14154115 agcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaagttgtacaatatcaacgttctttgaagtataagcatccaatgctttcaa 14154016  T
Q  109 a 109  Q
    |    
T  14154015 a 14154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17788159 - 17788067
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgt-caacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  17788159 aaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaat 17788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15475264 - 15475172
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  15475264 agcagagacaaactcagagtagtggaagtattggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgc 15475172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 17540395 - 17540530
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| | ||||||| || ||||| |||| |   ||    
T  17540395 aaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaa 17540494  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
     |||| |||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  17540495 ttagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatg 17540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 3793289 - 3793335
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3793289 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctagtga 3793335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 14571190 - 14571236
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14571190 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtga 14571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27188760 - 27188667
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  27188760 agcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 27188667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8685549 - 8685509
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgta 65  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8685549 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21283536 - 21283271
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21283536 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcc 21283437  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||| | ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21283436 tttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcct 21283337  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21283336 gatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctgatga 21283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577919
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  22577987 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatga 22577919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 24788136 - 24788372
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24788136 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcc 24788235  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788236 tttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 24788335  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24788336 aatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 28409034 - 28409300
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28409034 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 28409133  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  28409134 tttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctctt 28409233  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgac-cttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28409234 gatgaactttagcttctggtgactgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 28409300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467281
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44467256 tcctgatgaacttcagcttttggtga 44467281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10883323 - 10883072
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10883323 gagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 10883224  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10883223 gttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactacagc 10883124  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10883123 ttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 15467908 - 15468178
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467908 agcagagacaaattcagagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15468007  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15468008 tccttttaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 15468107  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||  || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15468108 cctgatgaactagagcttctggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatga 15468178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12366895 - 12366646
Alignment:
Q  29 tagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12366895 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 12366796  T
Q  129 gtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 228  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12366795 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 12366696  T
Q  229 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12366695 tggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 12366646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691654
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  33691678 cctgatgaactagagcttctggtga 33691654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069778
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  9069754 cctgatgaaatagagcttctggtga 9069778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316455
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||   |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16316455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088736
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |  ||||||||||||    
T  15088713 ctgatgaattagagcttctggtga 15088736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944257
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||  |||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttct 244  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  30944291 cctgatgaactgcagcttctgatgaacgtgcttct 30944257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303026
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactacagcttctggtga 13303026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945285
Alignment:
Q  14 gagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  114 ttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || || |||||| |||| |||||||||  |||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30945320 atgaactgcagcttctgatgaacttgcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648960
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  13648921 cctgatgagctttagcttctgttgatcttgcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137837
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||    
T  13137861 ccttatgaactagagcttctggtga 13137837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880366
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13880296 cctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13880366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 14426542 - 14426776
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426542 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 14426641  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||| ||  || |||| |||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  14426642 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 14426739  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  14426740 gatgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 14426776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23280125 - 23279901
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23280125 agcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 23280026  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||| |  ||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23280025 atcctttcaaactagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatc 23279927  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  23279926 tcctgatgaactacaacttctggtga 23279901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236846
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  48236968 tcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 48236871  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  48236870 cctgatgaactgcagcttctggtga 48236846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695617
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||  |||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21695593 cttgatgaacttcagcttctggtga 21695617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319657
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 268  Q
    ||||| || || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11319600 gatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttg 11319657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709746
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||||  | ||||||||    
T  9709868 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 9709771  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  9709770 cctgatgaactgcagcttctggtga 9709746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 268
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793159
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||||||  |||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11793099 cctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttg 11793159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935272
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||| |||   |   |||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29935325 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913550
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||| || ||||| ||  ||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2913574 cctgatgaactacagtttctggtga 2913550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692499
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||  |||||   ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21692479 cctaatgaacttcagcttctg 21692499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 33605677 - 33605900
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33605677 agcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33605776  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | || ||||| |||||| |||||||||||  |||||||  || || | || ||||||||||||  | |||||||    
T  33605777 tcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatc 33605874  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  33605875 tcctgatgaactgcagcttctggtga 33605900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111828
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||||||| ||| |||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||     
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcc 16111853  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  16111852 tctgatcaactgcagcttctggtga 16111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622300
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28622324 cctgatgaactgcagcttctggtga 28622300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730624
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcc 13730640  T
Q  212 tgatgaacttcagctt 227  Q
    || ||| ||| |||||    
T  13730639 tggtgagctttagctt 13730624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35952851 - 35952631
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35952851 agagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcc 35952752  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| | |||||||| |||||  |||||||  |    
T  35952751 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctc 35952654  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  35952653 tgatgaactgcaacttctggtga 35952631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500234
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  210 cctga 214  Q
    |||||    
T  2500230 cctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026121
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | |||||||||  ||||||||||||    
T  30026097 cttgatgaactagagcttctggtga 30026121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692602
Alignment:
Q  39 agtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactat 138  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||         |||||||||| |||| |||||| |    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  139 ttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt 238  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  239 gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13692563 gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13692602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821687
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||| ||||| | |||| ||  ||||||||| |||  ||||||||  || ||| | ||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatct 4821662  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  4821663 ccggatgaactgcagcttctggtga 4821687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331860
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  110 tcctttc-aaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtga 331860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  115 tcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaa 198  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| |||||||  |||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtctt 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  14193208 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260521
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||||||||| |||| |    
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata 13260682  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
           | |||||| |||| || |||  |   |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13260681 -------agaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccattaa-cagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13260589 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatga 13260521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2265675 - 2265463
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  2265675 aaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaa 2265576  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 219  Q
    |||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2265575 atagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 2265478  T
Q  220 ttcagcttctggtga 234  Q
    | || ||||||||||    
T  2265477 tacaacttctggtga 2265463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12174506 - 12174284
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  12174506 agcagagacaaaac-agagtactaaaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 12174408  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | || ||||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  12174407 atcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagc-ttaag--ttgcat 12174311  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||    
T  12174310 cctctgatgaactgcagcttctggtga 12174284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16543153 - 16542964
Alignment:
Q  43 attgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttca 142  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  16543153 attgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 16543054  T
Q  143 gtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  || |||| |||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16543053 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtga 16542964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 16622509 - 16622698
Alignment:
Q  43 attgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttca 142  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  16622509 attgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 16622608  T
Q  143 gtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  || |||| |||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16622609 gtcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtga 16622698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284507
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
     ||  || |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||| ||   |||||||  || |||| ||||||||||||| | |||  ||||| ||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttct 39284529  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  39284528 gatgatcttcagcttctggtga 39284507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000788
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcac-tatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | |  ||||| |||||||||| | |||  || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183143
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||  || || || ||| ||| | ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  8183022 tcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatct 8183118  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  8183119 cctgatgaactgcagcttctggtga 8183143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842201
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| |     |||| |||| |||||||||||  | ||||| | | |||| |||||||||| ||||||||  |||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41842240 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgctactaatga 41842201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704445
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagac 162  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  163 gatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    ||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  110 tcctttcaaaata 122  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19711176 - 19711060
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19711176 agagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcc 19711077  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19711076 tttcaaattagtcgttg 19711060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  146 ttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13894162 - 13893949
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||| |||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13894162 gcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaat 13894064  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    |||||  || ||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  13894063 ccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatctt 13893965  T
Q  211 ctgatgaacttcagct 226  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13893964 ctgatgatcttcagct 13893949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Original strand, 13880604 - 13880768
Alignment:
Q  34 gaggtagtgattgtac-atttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgttt 132  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  13880604 gaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgctt 13880703  T
Q  133 cactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaa 198  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||| ||   |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  13880704 cactcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13018655 - 13018425
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | | |||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  13018655 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaacttcatttaaaatagtc 13018556  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||| |||||| |   ||||||||||||| | | | ||   ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||  | ||| |  |||||||||||    
T  13018555 gttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct--cgtcttcatatgaacttcag 13018459  T
Q  225 cttctggtgacct--tgcttctaatgagatgctt 256  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  13018458 cttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgctt 13018425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 1293025 - 1293117
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1293025 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 1293117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871803
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatccaatgc 27871803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19339416 - 19339324
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19339416 agcagagacaaactcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctg 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctg 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425651
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||         | ||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 14425534  T
Q  115 tcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    ||||||||| |||||    |||  | ||||||||||||||| |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14425535 tcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 14425631  T
Q  215 tgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  14425632 tgaactntagcttctggtga 14425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 278
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193336
Alignment:
Q  185 ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatga 14193336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062891
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794788
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaggaataagcatccaatgc 24794788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 4494569 - 4494628
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtacttt 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4494569 agcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 48806045 - 48805953
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  48806045 agcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaatagcatccaatgc 48805953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9098385 - 9098286
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || ||| ||||| ||||||    
T  9098385 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcact 9098286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13472665 - 13472555
Alignment:
Q  91 agcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttg 189  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || |||     
T  13472665 agcatcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttta 13472566  T
Q  190 aagctttaagt 200  Q
    |||||||||||    
T  13472565 aagctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21381594 - 21381502
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacattt-cgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  21381594 gcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacattttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatgc 21381502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339821
Alignment:
Q  157 ttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctgg 7339821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32264884 - 32264670
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgct-ctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |  ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||       
T  32264884 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataaacatccaatgcatt--- 32264788  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
          ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||   ||| |||  || ||||  | ||| | | ||||||||||||||||  |||||    
T  32264787 ------tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaataacttttgaagctttaagtc--gcatc 32264696  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  32264695 tcctgatgaactgcagcttctggtga 32264670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26209667 - 26209632
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26209667 agacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 26209632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 4412125 - 4412079
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtaca 59  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  4412125 agagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 4412079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13032210 - 13032168
Alignment:
Q  38 tagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13032210 tagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctct 13032168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Original strand, 27871870 - 27871924
Alignment:
Q  178 aaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27871870 aaacaacttttgaagctttaagt--tgcatttcctgatgaactgcagcttctggtga 27871924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48062819 - 48062773
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48062819 tttgaagctttaagt--tgcatctcttgatgaactgcagcttctggtga 48062773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22599997
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  22600067 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 22599997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256170
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 276  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33256236 cctgttgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33256170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276342
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 276  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33276408 cctggtgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154122
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| | | ||||||| |||| ||||    
T  22154052 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatga 22154122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704467
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  48704399 tctgatgaactttagcttctggtgatctagcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatga 48704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717787
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  || | |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  19717719 ccatatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatga 19717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282831
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||  || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38282761 cctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900550
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  1900540 cctgatgaact 1900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578115
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||||    
T  1578062 cctgataaactttagcttcttgtgatcttgcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427220
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||||||||    
T  22427342 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatct 22427245  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  22427244 cctgatgaactggagcttctggtga 22427220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 35401803 - 35402072
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35401803 agcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 35401902  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | || ||| ||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35401903 atcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatc 35402002  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35402003 ttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492269
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaacttctg 28492269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268792
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||   |||| || ||| || ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga-ccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2268723 cctaatgaactttagcttctagtgattgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 2268792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29216014
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| | || ||||||||||    
T  29215990 cctgatgaattgcaacttctggtga 29216014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785799
Alignment:
Q  14 gagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  114 ttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||| || ||||| ||||    
T  32785819 atgaactacaacttctagtga 32785799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20954542 - 20954288
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  20954542 gagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcctttcaaaatggcc 20954443  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
     ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20954442 attgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 20954343  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20954342 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatga 20954288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 2267087 - 2267321
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2267087 agagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 2267186  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2267187 tttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcct 2267284  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2267285 gatgaactgtagcttctgatgaacttgcttctaatga 2267321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39201077 - 39200855
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39201077 agcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 39200978  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  39200977 tcctttcaaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatct 39200880  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  39200879 cctaatgaactgcagcttttggtga 39200855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201601
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  22201621 cctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284657
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12284618 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036344
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 23036398  T
Q  227 tctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  23036397 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatga 23036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134391
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaa 36134283  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| || |||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  210 cctgatga 217  Q
     |||||||    
T  36134384 tctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22464894 - 22464671
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22464894 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22464795  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  || |||| || ||||||||||||  | || ||||    
T  22464794 tcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatc 22464697  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  22464696 tcctgatgaactgtagcatctggtga 22464671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16235381 - 16235182
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16235381 agcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaa 16235282  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16235281 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatct 16235182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448443
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 25448454  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  25448453 tctgatgaact 25448443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 2834684 - 2834907
Alignment:
Q  10 agcagagacaaa-aatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2834684 agcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 2834783  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||  || |||| ||| |||| | || |||||||||||  |||||||    
T  2834784 atcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatc 2834881  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  2834882 tcccgatgaactgcagcttctggtga 2834907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757656
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||    | |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  10757616 tcctgatgaacttcagcttttgatgatcttgcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2327525 - 2327302
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||| |    
T  2327525 agcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcga 2327426  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  2327425 atcctttcaaaatagtttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 2327328  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  2327327 tcctgatgaactgcagcttctggtga 2327302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040383
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||  |||||||| |||  ||| |||||||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 35040358  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||| | |||||||||||||    
T  35040359 catgatgaattgcagcttctggtga 35040383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570095
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  48570119 cctgatgaattacagcttctggtga 48570095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821408
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||  |||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  44821432 cctgatgaactacagcttatggtga 44821408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 7309829 - 7310068
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       
T  7309829 agagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttt-tgaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgac 7309927  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||   | |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7309928 cgttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttag 7310027  T
Q  225 cttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||| |||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||    
T  7310028 cttatggtgatcttcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703030
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||  ||||||||||||| |||||||||  || ||||  | |||||   ||||||||||||||  ||||||||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21703006 cctgatgaactgcagcttctggtga 21703030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14263537 - 14263383
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14263537 agcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaa 14263438  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  14263437 atcctttcaaaatagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacg 14263383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 30893104 - 30893327
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |     
T  30893104 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcctttcaaaatagcct 30893203  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    ||| ||||||  |    |||| |||||||||| |||||  || |||| | | |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30893204 ttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactttagc 30893303  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    || |||||| ||||||||| ||||    
T  30893304 ttttggtgatcttgcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191845
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  113 ttt 115  Q
    |||    
T  21191847 ttt 21191845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 30572192 - 30572413
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||| || |||||||||| ||  ||    
T  30572192 agcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaa 30572291  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||| || ||||||  || ||||  | ||||| |  |||||||||||||  ||| ||||    
T  30572292 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatct 30572388  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  30572389 cctgatgaactgcaacttctggtga 30572413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089197
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||            
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 46089075  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||  |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46089076 -cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  46089173 catgatgaactgcagcttctggtga 46089197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024811
Alignment:
Q  30 agtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  130 tttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttct 229  Q
     |||||| ||   ||||| ||||||| |||  ||   |||||||  || ||||  | |||||||||||| |||  || || ||||||| |||||||||||    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttct 17024831  T
Q  230 ggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  17024830 ggtgatgttgcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 10250984 - 10251193
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||  ||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||          
T  10250984 agagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc------ 10251077  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
       |||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10251078 ---caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 10251171  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  10251172 gatgaactgcagcttctggtga 10251193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaa 198  Q
    | ||||  || ||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26702197 - 26701990
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||   || | |||| ||||||||||||||| | | ||  || || | |    
T  26702197 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcatttgaattaattg 26702098  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||||| |    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  26702097 ttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctgatgaactttagct 26701998  T
Q  227 tctggtga 234  Q
    ||||||||    
T  26701997 tctggtga 26701990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21029012
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| || ||  ||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||  ||| |    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatat 21028987  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     || ||||  |||||||||||||||    
T  21028988 tctaatgatattcagcttctggtga 21029012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7745160 - 7744953
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      
T  7745160 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaac 7745061  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
     |||| | | ||  ||||||||| |||| |  ||||| ||  || |||| |||||||| | |||||| || || |  |||||||| |||||||||| |||    
T  7745060 tgttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaactgcag 7744963  T
Q  225 cttctggtga 234  Q
    ||||||||||    
T  7744962 cttctggtga 7744953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 21984590 - 21984683
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaata-gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21984590 agcagagacaaaaaaaagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642335
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  29 tagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896577
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttt 18896577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024875
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23024875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21204998 - 21204916
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  21204998 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 21204916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 17371042 - 17371124
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||        ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17371042 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttc--------gtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 17371124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215699
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttgaggaataagcatcaaatgc 19215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21191757 - 21191694
Alignment:
Q  215 tgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21191757 tgaacttcagcttcttgtgatattgtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatga 21191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Original strand, 12284651 - 12284689
Alignment:
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12284651 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207563
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  16207494 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttcagatg 16207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 16188988 - 16189240
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16188988 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtc 16189087  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16189088 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcggc 16189187  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16189188 ttctggtgatcttgcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatga 16189240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263506
Alignment:
Q  28 gtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  128 tgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagct-ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  227 tctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23263557 tctgatgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 23263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693793
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatga 39693793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 33082872 - 33083113
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33082872 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 33082971  T
Q  137 atttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacc 236  Q
     ||    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33082972 cttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 33083071  T
Q  237 ttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  33083072 ttgcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatga 33083113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525623
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  |||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  17525689 tgatgaactacagtttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 17525623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 19943226 - 19943494
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaag-aacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19943226 agagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatc 19943325  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  19943326 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctc 19943425  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19943426 ctgatgaacttcagcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatg 19943494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185167
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  23185289 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 23185192  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  23185191 cctgatgaactgcagcttctggtga 23185167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681198
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16681266 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16681198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933095
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  21933071 cctgatgaaatagagcttctggtga 21933095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757702
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||  |||| |||||||    
T  12757723 gatgaactagagctactggtga 12757702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156408
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| || ||||||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaacttctggtga 19156408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693573
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 29693573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267724
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||  | | ||||| |||||||||| |||||  || || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaacc-attgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattct 273  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17267662 ttgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 17267724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121018
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtg---gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatg 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  18121072 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914717
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| |||| || || ||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17914647 cctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 17914717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646596
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||  |||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24646526 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 24646596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15336251 - 15336029
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15336251 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15336152  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||  || | || |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  15336151 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15336054  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  15336053 cctgatgaactacagcttctggtga 15336029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15425316 - 15425094
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15425316 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15425217  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||  || | || |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  15425216 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15425119  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  15425118 cctgatgaactacagcttctggtga 15425094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15516620 - 15516398
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15516620 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15516521  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||  || | || |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  15516520 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15516423  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  15516422 cctgatgaactacagcttctggtga 15516398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421369
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaa--gaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  30421394 ttctgatgaactgcagcttctggtga 30421369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797632
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||| || |||||||||| |||| ||||||||  || |||| ||| |||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  17797608 cctgatgagctgcagcttctggtga 17797632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321067
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||| |||||||  |||| |||||| |||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18321119 gatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602659
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  || |||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  602683 cctgatgaactttagcttcttgtga 602659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382289
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||  || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| | | |||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  |  |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  20382356 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatga 20382289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538380
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  45538404 catgatgaactgcagcttctggtga 45538380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 24551265 - 24551484
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24551265 agagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatct 24551364  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  ||||||| | |    
T  24551365 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccat 24551462  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24551463 gatgaactgcagcttctggtga 24551484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441716
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcc 17441869  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  17441768 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 1237625 - 1237845
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1237625 agcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaa 1237724  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  1237725 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 1237822  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  1237823 catgatgaattgcagcttctggt 1237845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 268
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701993
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||   | |||  |||||||||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacc--ttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 268  Q
     |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  17701933 tctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttg 17701993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845329
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||   |||||||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatc-cttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  40845353 cctgatgaactatagcttctggtga 40845329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719228
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  |   ||||| ||||||||||  ||||  || |||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18719189 tctgaagaacttaagcttctggtgatcttgcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9320557 - 9320780
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  9320557 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaa 9320655  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | |||||||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  9320656 atcctttcaaaataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 9320753  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||    
T  9320754 cctctgatgaactgcagcttctggtga 9320780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 36105183 - 36105405
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  36105183 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 36105282  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||| || || |||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  36105283 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 36105380  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  36105381 cctgatgaactatagcttctggtga 36105405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 18679803 - 18680042
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18679803 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18679902  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||  |   ||||| ||||||||||||||||  || |||| | | |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18679903 tcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatct 18680002  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18680003 tctgatgaaatgaagcttctagtgatcttgcttctgatga 18680042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20255654 - 20255472
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||     
T  20255654 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattgaacag 20255555  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaactt 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20255554 cctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaactt 20255472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24833210 - 24832997
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-tctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24833210 aaaatagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaa 24833111  T
Q  119 aatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    | ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| | |||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  24833110 agtagccattgcttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatga 24833014  T
Q  218 acttcagcttctggtga 234  Q
    ||| |||||||||||||    
T  24833013 actgcagcttctggtga 24832997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707761
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatg-ttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
     ||  || ||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||| |  ||  ||| |||| ||  || |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttagga--atgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttc 19707694  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  19707695 tgatgatcttcagcttctggcgatcttgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatga 19707761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Original strand, 22745606 - 22745742
Alignment:
Q  141 cagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt-- 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||      
T  22745606 cagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttca 22745705  T
Q  239 gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22745706 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 22663107 - 22663326
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||     
T  22663107 agagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatct 22663206  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || ||||||||| |||| |  | | || ||||||||||||||  | ||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22663207 ttccaaaatagttgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcct 22663304  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     ||||||| || ||||| ||||    
T  22663305 aatgaactacaacttctagtga 22663326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407926
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
          |||||||| ||||||   ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6407811 ------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6407901  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6407902 cctgatgaactgcagcttctggtga 6407926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22673988
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaa 22673865  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||  |||||||||||||    ||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  22673866 tccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 22673963  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    || |||||||| || ||||||||||    
T  22673964 ccggatgaactacaacttctggtga 22673988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989401
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||       
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc--- 14989518  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
          |||| ||| |||||||  ||| || || ||||| |||||  | ||||||  || ||||  ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  14989517 ------caaattagccgttgttatacttttccaatcttcagcaatcttcagacgagtttgaatcctttaaacggcttttgaagctttaag--ttgcatct 14989426  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  14989425 cctgatgaattgcagcttctggtga 14989401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18722799 - 18722683
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18722799 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa 18722700  T
Q  120 atagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||||||| ||||||    
T  18722699 atagtcgttgcttcact 18722683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18731144 - 18731028
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18731144 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa 18731045  T
Q  120 atagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||||||| ||||||    
T  18731044 atagtcgttgcttcact 18731028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43644984
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  110 t 110  Q
    |    
T  43644984 t 43644984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttc 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18685550 - 18685434
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18685550 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaa 18685451  T
Q  120 atagtcgttgtttcact 136  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  18685450 atagttgttgcttcact 18685434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 45568059 - 45567945
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  45568059 agacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctt 45567960  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| ||| |||||    
T  45567959 tcaaattagccgttg 45567945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13430791 - 13430699
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  13430791 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19956502 - 19956378
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19956502 gcagagacaaaac-agggtattggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaat 19956404  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||  || ||||||||| ||||||    
T  19956403 cctttagaattagtcgttgcttcact 19956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461656
Alignment:
Q  28 gtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  128 tgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    || |||| | ||  ||||||||||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatg 22461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598287
Alignment:
Q  144 tcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 3598287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 18772610 - 18772707
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18772610 gcagacacaaaaa-agagtagtggaggtaatggttgtacattt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaat 18772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 21540945 - 21541041
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||        |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  21540945 agacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac--------tttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttctattcctt 21541036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164128
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactct 25164128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 43639770 - 43639984
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||  |||   |||||||||||| |||| || |||||| |||||           
T  43639770 agcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctttgaaaaataagcattcaatg------- 43639862  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
      ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||| ||||||  |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  43639863 --cctttcaaaatagtcgttgtcatacttttccagtcttttgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 43639958  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    || ||||||||| || ||||||||||    
T  43639959 tcatgatgaactgcatcttctggtga 43639984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 21301010 - 21301102
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  21301010 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgc 21301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 21288391 - 21288481
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaat 100  Q
    ||||||||||||   | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  21288391 agcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaat 21288481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33560360 - 33560295
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  33560360 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745570
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || |   ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7745638 cctgatgtacttcagcttcttgtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatga 7745570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815228
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  17815160 cttgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatga 17815228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910787
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21910748 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551107
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20551086 tcctgatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022878
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  33022756 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 33022853  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||    
T  33022854 cctgatgaactgcaaattctggtga 33022878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412880
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||| || ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23412919 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 23412880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118103
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||||||  | |||||||    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttcta 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  31118067 tcctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttcta 31118103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512337
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaa 6512477  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6512376 cctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13545657 - 13545455
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13545657 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13545558  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||        |||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13545557 tcctttcaaagtagttgttgcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13545466  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  13545465 cctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994102
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||  || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  11993980 tcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatct 11994077  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  11994078 cctgatgaactacagcttctggtga 11994102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536177
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcacta-tttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||  |||  ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19536246 tcctgatgaacttctgcttcttgcgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatga 19536177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89328
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| |||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  89367 cctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072131
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||||  || |   ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21072186 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566359
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaacttctg 41566359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887236
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||  | |||| |  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |    
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatat 4887211  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  4887212 cttgatgaactgcagcttctggtga 4887236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 30742973 - 30743189
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  30742973 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 30743071  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |  || ||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  30743072 tcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 30743169  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttct 229  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  30743170 cctgatgaactgcaacttct 30743189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 42243673 - 42243895
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaag-aacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  42243673 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaa 42243771  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  42243772 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 42243869  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  42243870 tcctgatgaactacagcttctggtga 42243895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086462
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    |||  |||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 14086487  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    |  |||||||||| |||||||||||    
T  14086486 cctctgatgaactgcagcttctggt 14086462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 26759142 - 26759363
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26759142 agcagagacaaaa-tagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 26759240  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||  |||| |||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  26759241 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 26759338  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  26759339 cctgatgaactacaacttctggtga 26759363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138331
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  29138355 cctgatgaactacaacttctggtga 29138331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 26784362 - 26784570
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  26784362 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttcaaaatagtc 26784461  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26784462 gttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctgaactacagc 26784561  T
Q  226 ttctggtga 234  Q
    |||||||||    
T  26784562 ttctggtga 26784570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 15516962 - 15517183
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15516962 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 15517060  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  15517061 tccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15517158  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     |||||||||| || ||||||||||    
T  15517159 tctgatgaactacaacttctggtga 15517183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933485
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaaca--tcctttgaagctttaagtcttgc 205  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  |  ||||||||||||||  ||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgc 33933456  T
Q  206 atctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||  |||||||||| || ||| ||||||    
T  33933457 atcctctgatgaactgcaacttatggtga 33933485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3245583 - 3245365
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||| |    
T  3245583 agagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattc 3245484  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  | |||||   || |||||||||||  |||||||||||    
T  3245483 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcct 3245387  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  3245386 gatgaactgcagcttctggtga 3245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198910
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||| |||||  ||| | ||   |||||||||| | | ||| ||   |||||||  || |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttg-ctcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgag 250  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  21198950 tctgatgaacttcagctcctggtgatattgcttctgatgag 21198910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115861
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttgtt 30115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881328
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| |    |||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  ||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  23881257 ttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatga 23881328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139738
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttct 149  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  28139699 tcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28464481 - 28464272
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||         ||    
T  28464481 agagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cc 28464391  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  28464390 tttcaaaatagccgttgttatacttttttagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatctcct 28464294  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  28464293 gatgaactgcagcttctggtga 28464272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 642837 - 642583
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |   ||  || |||     
T  642837 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagc 642738  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||||||||||| |     ||||||| ||||| |||  |   ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||     
T  642737 cgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaa 642639  T
Q  225 cttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||||| |||  || ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  642638 tttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 642583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099580
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||   ||   |||||||||||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatg-ttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||| || |||||| || | ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgct-aggc-atgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatc 21099652  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21099651 ttctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatga 21099580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089173
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||       
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 9089057  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
          |||||||||||||||   ||| || ||||||||| |||| | |||||||  || | ||  ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  9089058 ------caaaatagtcgttgtaatacttttccagtcttcttcaat-catagacgagtttgattcctttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 9089148  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  9089149 cctgatgaactgcagcttctggtga 9089173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25096969 - 25096777
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgt---caacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttca 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |   ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25096969 gcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25096871  T
Q  108 aatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||  || || |||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  25096870 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25154939 - 25154747
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgt---caacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttca 107  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |   ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25154939 gcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25154841  T
Q  108 aatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||  || || |||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  25154840 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 26765500 - 26765634
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26765500 aaaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaa 26765599  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaat 154  Q
    ||||| |||| |  ||| || ||||||||||||||    
T  26765600 atagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930088
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||       
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc--- 25930205  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
           ||| ||| |||||||  ||| || ||||||| ||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25930204 ------taaattagccgttgttatacttttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 25930113  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  25930112 cctgatgaattgcagcttctggtga 25930088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 32160763 - 32160867
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32160763 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 32160862  T
Q  115 tcaaa 119  Q
    |||||    
T  32160863 tcaaa 32160867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208012
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||||||  |    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctct 11208027  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    |||||||||||||||    
T  11208026 tcaaaatagtcgttg 11208012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499329
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||    
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaa 6499329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848860
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgcctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352845
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||||||||||||    
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctt 12352845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430098
Alignment:
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatct-attaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 5430088  T
Q  225 cttctggtga 234  Q
    ||||||||||    
T  5430089 cttctggtga 5430098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398809
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 9398809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352693
Alignment:
Q  215 tgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttttgatga 12352693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23391749 - 23391656
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  23391749 agcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23391656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30115845 - 30115799
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30115845 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 30115799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 35986377 - 35986284
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca-tttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  35986377 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttttgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatgc 35986284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9398721 - 9398661
Alignment:
Q  179 aacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttg 239  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9398721 aacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaacttctggtgatcttg 9398661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 21660204 - 21660296
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||    
T  21660204 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgatctttgaggactaagcatccaatgc 21660296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 234
Target Start/End: Original strand, 10848924 - 10848978
Alignment:
Q  178 aaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10848924 aaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcatgatgaactgcagcttctggtga 10848978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 16607519 - 16607603
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16607519 agagtagtggagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 13435528 - 13435798
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  13435528 agcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaa 13435627  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435628 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatct 13435727  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435728 cctgatgaacttcagcttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatga 13435798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718109
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||   ||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  9718041 tgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatga 9718109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531509
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 276  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||  || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15531577 tctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 15531509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544485
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||    
T  32544461 cctgatgaactagagcttatggtga 32544485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 29918013 - 29918246
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  29918013 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaa 29918112  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29918113 tcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 29918211  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttct 244  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  29918212 cctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttct 29918246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22802137 - 22802359
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22802137 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22802236  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  22802237 ttctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 22802334  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  22802335 cctgatgaactacaacttctggtga 22802359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14100592 - 14100373
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14100592 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaa 14100494  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14100493 tcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatct 14100394  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14100393 cctgatgaacttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 23284576 - 23284830
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23284576 gagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaataggc 23284675  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284676 gttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 23284775  T
Q  226 ttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| | || ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23284776 ttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 23284830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972157
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  26972181 cctgatgaaatagagcttctggtga 26972157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112628
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  20112652 cttgatgaacttcagcttcaggtga 20112628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602438
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13602368 cctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13602438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715333
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||| |||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  12715373 tcctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 18435552 - 18435776
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18435552 agcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18435651  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||| || | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18435652 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatct 18435751  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  18435752 cctgatgaactagagcttctagtga 18435776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 21625103 - 21625363
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21625103 gacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgcttt 21625202  T
Q  116 caaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 215  Q
    | |||||| ||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21625203 c-aaatagccgttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgat 21625301  T
Q  216 gaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 277  Q
    ||    || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21625302 ga--gacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg 21625363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 19688789 - 19688994
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19688789 gtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcact 19688888  T
Q  137 atttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacc 236  Q
     || |||| |||| |||||||| |||||   |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19688889 cttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagcttctgatgaac 19688986  T
Q  237 ttgcttct 244  Q
    ||||||||    
T  19688987 ttgcttct 19688994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 15302212 - 15302435
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15302212 gagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcc 15302311  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  15302312 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctaatgagctttagc 15302411  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    || |||||| ||||||||| ||||    
T  15302412 ttttggtgatcttgcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117094
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||  || |  ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaa-tgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24117024 ttctgatgaacttcatcttctggtgatcttgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 24117094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730635
Alignment:
Q  14 gagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  114 ttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||||||  || |||| |||||||||||||   | || |||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctg 20730656  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  20730655 atgaactgcagcttctagtga 20730635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 19623991 - 19624228
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19623991 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcagaatagt 19624089  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    ||||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19624090 cgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcag 19624189  T
Q  225 cttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19624190 cttctggtgatcttgtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 15954702 - 15954919
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15954702 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcc 15954801  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||||  ||||| ||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  15954802 tttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctctt 15954899  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggt 232  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15954900 gatgaactacagcttctggt 15954919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16877209 - 16877431
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  16877209 agcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaa 16877308  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  16877309 tccttttaagatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 16877406  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||    
T  16877407 cctgatgaactacaacttttggtga 16877431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20488071 - 20487848
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20488071 agcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20487972  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgtt-aaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | |||||||| | |||||||| |||||  |||||||    
T  20487971 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatc 20487874  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
      |||||||||| || ||||| ||||    
T  20487873 ctctgatgaactgcaacttctagtga 20487848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 21618239 - 21618462
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21618239 agcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaa 21618338  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||  ||||| ||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  21618339 atccttccaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 21618436  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  21618437 ttctgatgaactacagcttctggtga 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265081
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||  || |||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  | ||||||||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatct 16265106  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||    
T  16265105 cttgacgaactgcagcttctggtga 16265081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34451788 - 34451597
Alignment:
Q  43 attgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttca 142  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  34451788 attgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttca 34451689  T
Q  143 gtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34451688 gtcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 34451597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat-c 111  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  212 tgatga 217  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336345
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||| ||||||||  || ||||  ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| || || ||||||||||    
T  16336321 cctgatgatctacaacttctggtga 16336345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076338
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| ||  |||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  22076362 cctgatgaactacatcttctggtga 22076338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19833176 - 19832963
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19833176 aaaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaa 19833077  T
Q  119 aatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||| ||  || ||||  ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19833076 aatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 19832979  T
Q  219 cttcagcttctggtga 234  Q
    || || ||||||||||    
T  19832978 ctacatcttctggtga 19832963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 278
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597745
Alignment:
Q  93 catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
Q  193 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatga 25597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086368
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||           
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgc------- 19086246  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaa-catcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
       ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| || || || |||| |||||||||||||||||    
T  19086247 ---tttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttga-gctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaacttcagcttctggtga 19086368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349206
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatccttt 12349094  T
Q  116 caaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 215  Q
    |||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12349095 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgat 12349191  T
Q  216 gaacttcagcttctg 230  Q
    ||||| |||||||||    
T  12349192 gaactgcagcttctg 12349206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagcttt 196  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||| |||||| |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423428
Alignment:
Q  14 gagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcct 12423360  T
Q  114 ttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaaca 182  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || |||||||||  || |||| ||||||||    
T  12423361 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaaca 12423428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470933
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||| | ||   ||||| |||||||| ||| ||   |||||||| || |||| |||||||||||| |  |||  |||||  |||||| ||||| ||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaact 19470881  T
Q  227 tctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19470882 tcttgtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 19470933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Original strand, 21235120 - 21235229
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21235120 agcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaa 21235219  T
Q  109 atcctttcaa 118  Q
    || |||||||    
T  21235220 atgctttcaa 21235229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 26943572 - 26943828
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26943572 agcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaa 26943671  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| |  ||||||  |||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||        |||||  ||||||||||| | ||| |||  ||||     
T  26943672 tcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgc-tagac-atg--------attaa--atcctttgaagttataattctctcatca 26943759  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  26943760 tctgatgatcttcagcttttagtgatgttgcttctaatgaggtgcttctgacgaacttgcttctgatga 26943828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgt-caacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||    
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaa 198  Q
    |||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatg 101  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381598
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaa 91  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaa 17381598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351967
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctct-tgaagaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  110 tcctttcaaaatag 123  Q
    ||||||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag 33351967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14051529 - 14051425
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | |    
T  14051529 agacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaat-gtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattcct 14051431  T
Q  115 tcaaaa 120  Q
    ||||||    
T  14051430 tcaaaa 14051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 234
Target Start/End: Original strand, 21235240 - 21235331
Alignment:
Q  141 cagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21235240 cagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtga 21235331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14070206 - 14070106
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  14070206 aaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaat-gtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattccttcaa 14070108  T
Q  119 aa 120  Q
    ||    
T  14070107 aa 14070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 19482751 - 19482840
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  19482751 agagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 19482840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 102
Target Start/End: Original strand, 20635720 - 20635799
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||        |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  20635720 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt--------tgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgc 20635799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 22386803 - 22386885
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||        ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22386803 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtac--------tttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatgcctt 22386885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17316678 - 17316586
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||    
T  17316678 agcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccgatgc 17316586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Original strand, 26589595 - 26589671
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca-tttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaa 85  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| ||||    
T  26589595 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaa 26589671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11147298 - 11147264
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11147298 gacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 11147264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Original strand, 25675307 - 25675345
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacattt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25675307 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacattt 25675345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Original strand, 25679383 - 25679421
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacattt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25679383 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacattt 25679421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25735608 - 25735570
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacattt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25735608 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacattt 25735570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 50
Target Start/End: Original strand, 25986229 - 25986263
Alignment:
Q  16 gacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25986229 gacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 25986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829363
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25829324 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187942
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 22187942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235267
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||  ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23235197 catgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 23235267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20568844 - 20568600
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20568844 gagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaattgtt 20568745  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20568744 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagc 20568645  T
Q  226 ttctggtgaccttg--cttctaatgagatgcttttgatgaacttg 268  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20568644 ttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttg 20568600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667249
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||| || |||||| |   |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 30667249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009591
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatt-tcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | |  ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10009660 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctttcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 10009591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540659
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||| |||||| ||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19540606 catgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 38781388 - 38781657
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaa-atagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38781388 agcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaa 38781487  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || || ||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38781488 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 38781587  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
      |||||||    || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38781588 ctctgatga--gacatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 38781657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963864
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||    
T  13963888 actgatgaactagagcttctagtga 13963864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037099
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| ||| |  || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25037099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041206
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| || |||||||||||||||||| ||| |  || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25041206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576294
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| || |||||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacga-tgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  24576225 tcctaatgaactttagcttctggtgatcttgcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatga 24576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9015462 - 9015211
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9015462 gagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 9015365  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9015364 gttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagt 9015265  T
Q  226 ttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  9015264 ttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatga 9015211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376792
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 18376817  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     |  |||||||||| ||||||||||    
T  18376816 tcaaatgaacttcaacttctggtga 18376792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24850760 - 24850508
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  24850760 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcctttcaaaatattc 24850661  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||| |||||| ||   |||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24850660 gttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcag 24850561  T
Q  225 cttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    | |||||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24850560 catctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20152118 - 20151922
Alignment:
Q  37 gtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcact 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  20152118 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcact 20152019  T
Q  137 atttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20152018 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtga 20151922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6574235 - 6574010
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttca 107  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6574235 agcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttca 6574136  T
Q  108 aatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgc-ttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgca 206  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||    
T  6574135 aatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgca 6574038  T
Q  207 tctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  6574037 tcttctgatgaactgcaacttctagtga 6574010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 278
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260664
Alignment:
Q  46 gtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtc 145  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| || |||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  146 ttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttcta 245  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||     
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttccttctg 22260631  T
Q  246 atgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22260632 atgagatgcttttgatgaacttgcttctgatga 22260664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21537342 - 21537088
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21537342 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctttcaaaatagtc 21537243  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| ||   ||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21537242 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatc 21537143  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| |||| |||   ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||    
T  21537142 ttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatga 21537088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317808
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  110 tcctttc-aaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||    
T  22317783 tcttgatgaaatagagcttctggtga 22317808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 30621222 - 30621430
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30621222 gagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 30621321  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  30621322 gctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaac 30621421  T
Q  226 ttctggtga 234  Q
    |||| ||||    
T  30621422 ttctagtga 30621430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 30623843 - 30624051
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30623843 gagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 30623942  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  30623943 gctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaac 30624042  T
Q  226 ttctggtga 234  Q
    |||| ||||    
T  30624043 ttctagtga 30624051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377315
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  24377290 tcttgatgaacttcagcttctggtga 24377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711586
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||| |||||||||||| || ||| || ||||||||||||||  |||||| | ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 28711611  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | | ||||||| |||||||||||||    
T  28711610 cattatgaactgcagcttctggtga 28711586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800775
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||  ||  ||| | ||| || | ||||||||||||||  |||||||     
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcc 31800800  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||    
T  31800799 catgatgaactgcagtttctggtga 31800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28701339 - 28701117
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28701339 agcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28701240  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||   |||| || ||| || ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  28701239 tcctttcaaaatatctgttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 28701142  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  28701141 catgatgaactgcagcttctggtga 28701117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30557430 - 30557207
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||    
T  30557430 agcagagacaaaa-tagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaa 30557332  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||   |||||||| |||||  ||||||    
T  30557331 attctttcaaaatagtcgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcat 30557234  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||    
T  30557233 cctctgatgaactgcagcttctggtga 30557207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140509
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||       |||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  28140529 cccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782729
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| ||     |||  |||| ||||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  40782661 cctgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatga 40782729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 6392624 - 6392814
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctct-gaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  || |||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  6392624 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 6392722  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatc-tattaaacatcctttgaagctttaag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||| | |||||||| |||||    
T  6392723 atcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag 6392814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595427
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-tcag-agaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| ||   |||||||||||||| |||  |   |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23595480 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121577
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||| |||  ||||||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||  || ||||| ||| ||||||  | || ||||||||||||| ||| ||   |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||  || ||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagct 41121631  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  41121630 tctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 22802451 - 22802687
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22802451 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaa 22802549  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| | ||| || ||  ||  |||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||| | | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22802550 tcctttcaaaatagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatct 22802647  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||    
T  22802648 cctgatgaactgcaggttctgataaacttgcttctgatga 22802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743890
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || || | |||||||||  |||||||   || | ||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagacg--tttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatct 35743915  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  35743914 cctgatgaactacagcttctggtga 35743890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609216
Alignment:
Q  98 aatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatt-tcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagcttt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  | |  ||||| || ||||||| |||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  197 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34322046 - 34321824
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  34322046 agcagaaacaaaaatagagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaa 34321947  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  34321946 tcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatct 34321849  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||    
T  34321848 cctgatgaattacagcttctagtga 34321824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45087269 - 45087070
Alignment:
Q  35 aggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttca 134  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45087269 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 45087170  T
Q  135 ctatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaat-ctattaaacatc-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||  ||||||| ||    
T  45087169 cttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagt 45087072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074438
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||  | |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  33074414 cctgatgaactacaacttctagtga 33074438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31328075 - 31327853
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31328075 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31327977  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatc-ctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     || | |||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||  |||| |||  || ||||  || |||| |  |||||| |||||||  |||||||    
T  31327976 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31327879  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  31327878 tcctgatgaactgcagcttctggtga 31327853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31334796 - 31334574
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31334796 agcagagacaaaac-agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31334698  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatc-ctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     || | |||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||  |||| |||  || ||||  || |||| |  |||||| |||||||  |||||||    
T  31334697 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31334600  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  31334599 tcctgatgaactgcagcttctggtga 31334574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037528
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||| ||||| |||||| |   | |||||||||||||||||||||  | ||||| | | |||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     ||||| ||||| | |||| |||||    
T  39037552 tctgatcaactttaacttccggtga 39037528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454833
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   || | ||||||||||||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || ||   |||| |||||| ||   ||||||||||||| || | ||   ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 275  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  22454901 ttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtct 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| | |||||||| |||||  || |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840650
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||            
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 44840515  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||| |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  44840516 -cctttcaaaatagtcgttgccatactttttcagtc-tctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 44840610  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  44840611 cttgatgaactgcagcttctgatgaatttgcttctgatga 44840650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1587142 - 1586930
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||            
T  1587142 agcagagacaaaac-agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatg-------- 1587052  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||  | ||| ||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  || |||||    
T  1587051 -cctttcaaaatagccgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttccatct 1586955  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  1586954 cctgatgaactccagcttctggtga 1586930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189579
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtct 202  Q
     ||  || ||||| ||| |||||| |    |||||||||||||| |||  |   ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 25189579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26619201 - 26619066
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  26619201 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaa 26619102  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||    
T  26619101 atagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg 26619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550933
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28550933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776171
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||            
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 22776307  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacga-tgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     ||||||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||| ||||||  |||| ||| | | ||| || | ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  22776306 -cctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttttgcaat-tttaggcgagtctgaaacct-tgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 22776212  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22776211 tcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22776171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781549
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||            
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 22781685  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacga-tgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     ||||||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||| ||||||  |||| ||| | | ||| || | ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  22781684 -cctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttttgcaat-tttaggcgagtctgaaacct-tgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 22781590  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22781589 tcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22781549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272390
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaa-gcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| ||  || |||||    
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
     ||| |||| | || |||||||||||||||  ||||||   |||||||  || |||| |||||||| ||  || |||  || || ||||||| |||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagc 22272337  T
Q  226 ttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  22272338 ttctggtgatgttgcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatga 22272390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968061
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 31968061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 14581505 - 14581600
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14581505 agcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184170
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-tcag-agaac-agaatccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||||| || |||||| ||   ||||||||| |||| |||  | || | ||||  || |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgc-atgc-taggtg-tgattaatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattctt-catct 23184224  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23184223 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277233
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||         |||| ||| ||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagccg 3277127  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||  | |||| |  || |||   ||||||| | ||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||    
T  3277128 ttgttatactttttcagtcttctgcaatcttcagacaagtttgaattctttaaacaacttttgaagctttaag--ttccatctcctaatgaactccagct 3277225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 44881172 - 44881409
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  |  || || ||||||||||||||||| || ||  || |||     
T  44881172 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagc 44881271  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
     | || |||| | || |||||||||||||||  ||||||   |||| ||  || |||| |||||||||||| || | |  || || ||||||| ||||||    
T  44881272 tgctgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcag 44881370  T
Q  225 cttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44881371 cttttggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22785750 - 22785670
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| || ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22785750 agagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 1084009 - 1084105
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||        ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  1084009 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt--------tgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatctaatgccttcaattcctt 1084100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23392778 - 23392686
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||  |  |||||||||||||    
T  23392778 agcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctttgagaagaaagcatccaatgc 23392686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18431035 - 18430835
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  |||  ||||| | ||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  || |||     
T  18431035 agagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagc 18430936  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    ||||| ||||   ||  ||||||||||||||  ||| ||   ||||| |  || |||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||||    
T  18430935 cgttgcttcatgcttctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatgatcttcag 18430837  T
Q  225 ct 226  Q
    ||    
T  18430836 ct 18430835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 19115088 - 19115217
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| | ||||||| || ||||| |||| |   || ||||    
T  19115088 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagt 19115187  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaat 154  Q
     |||| |||| | || ||||||||||||||    
T  19115188 tgttgcttcattcttccagtcttctgcaat 19115217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Original strand, 18702738 - 18702833
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| | | ||||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18702738 aaaatagagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttt 18702833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Original strand, 22774530 - 22774565
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22774530 agacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 22774565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Original strand, 22779908 - 22779943
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22779908 agacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 22779943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22785599 - 22785553
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22785599 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtga 22785553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 24275192 - 24275232
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24275192 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 24275232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27305
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  27344 cctgatgaacttcagcatctggtgatcttgcttctgatga 27305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20816
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20886 cttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 20816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22896
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22872 cctgatgaactacagcctctggtga 22896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 487 - 741
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 586  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  587 gttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 686  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  687 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60280
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  60212 tctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatga 60280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 7940 - 8161
Alignment:
Q  28 gtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 127  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7940 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcctttcaaaatagtcgt 8039  T
Q  128 tgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctt 227  Q
    || |||||| || ||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8040 tgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactttagctt 8139  T
Q  228 ctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||| | ||||||||| ||||    
T  8140 ctggttatcttgcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 278
Target Start/End: Original strand, 115708 - 115785
Alignment:
Q  201 cttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  115708 cttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatga 115785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151735
Alignment:
Q  225 cttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  151788 cttctggtgatcttgcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 151735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5062 - 4792
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  5062 agcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaa 4963  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4962 tcctttcaaaatagtcgtcgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 4863  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||||||  |||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4862 tctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 4792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1895
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1756 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 1855  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1856 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36620
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36690 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 36620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42385
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  42315 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 42385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18466
Alignment:
Q  12 cagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  112 ctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18534 tgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14912
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| ||||  || |||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| | |||||||||    
T  14844 cctaatgatttttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatga 14912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 212350 - 212619
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  212350 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 212449  T
Q  110 tcc-tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  || |||| ||  || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  212450 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 212549  T
Q  209 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  212550 tcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 212619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 6092
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  6239 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 6140  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  6139 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 6092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 246186 - 246140
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  246186 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtga 246140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5537
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| || || |||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5605 cctgatgaacttcagcttcaggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103821
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| |  ||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 103784  T
Q  227 tctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  103785 tctggtgtccttgcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377404
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  377474 cctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 377404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 220250 - 220503
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||| | ||  || ||| |    
T  220250 gagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgc-ttcaaattcatttgaattagcc 220348  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||  ||||| | | | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  220349 gttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatgaacttcagc 220448  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  220449 ttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 220503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211631
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||   |||||||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| || ||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  211592 cctgatgagctacagcttctgataaacttgcttctgatga 211631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 244384 - 244256
Alignment:
Q  25 agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||    
T  244384 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagt 244285  T
Q  125 cgttgtttcactatttcagtcttctgcaa 153  Q
     |||| |||||| ||   |||||||||||    
T  244284 tgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 9998
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10020 tgatgaacttcagcttctggtga 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14817
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 14817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 278
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1954
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| ||||  || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| | |||||||||    
T  1886 cctaatgatttttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatga 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49584
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaa 264  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  49528 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32691
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  32681 cctgatgaact 32691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 341
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 356  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| ||| |||||    
T  355 tcaaattagccgttg 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25820
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  25887 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctgatga 25820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44656
Alignment:
Q  47 tacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtct 146  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  147 tctgcaatgcttagacgatgttaaatc 173  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatc 44656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89948
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||  ||||||  ||| | || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  89972 cctgatgaactgcagcttctggtga 89948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10204
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10165 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgcttctgatga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 12221 - 12475
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  12221 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagtt 12320  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  12321 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctgatgaactagagc 12420  T
Q  226 ttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||||||||| | |   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12421 ttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 12475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 533
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  767 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 668  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || |||| || ||||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  667 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 570  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  569 gatgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1658
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||         | ||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 1775  T
Q  115 tcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||| |||| |||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1774 tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 1678  T
Q  215 tgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  1677 tgaactgtagcttctggtga 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6633
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6855 agcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6756  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||| |  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6755 tcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6658  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6657 cctgatgaactacagcttctggtga 6633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19319
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  |||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19384 catgaactacaacttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 19319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99101
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||  || || ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtca--gcgctttgaagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || | ||| |||||||   ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||  |    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcactt 99126  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  99125 cctgatgaactacaacttctggtga 99101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 7715 - 7923
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7715 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaatagtc 7814  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 225  Q
    || | |||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7815 gtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagc 7914  T
Q  226 ttctggtga 234  Q
    |||||||||    
T  7915 ttctggtga 7923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 633
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||     
T  827 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacag 728  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  727 tctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 215612 - 215390
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  215612 agcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 215513  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  215512 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 215415  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  215414 cctgataaactgcagcttctggtga 215390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 15130 - 15352
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15130 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 15229  T
Q  127 ttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 226  Q
     || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  15230 atgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatct 15329  T
Q  227 tctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  15330 tctggtgatcttgcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19251
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  19227 cctgatgaaatagagcttctggtga 19251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 9559 - 9777
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |  |||||    
T  9559 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcc 9658  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |  |||||||||||||| ||||||| |  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9659 tttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 9755  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  9756 gatgaactgcagcttctggtga 9777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22024
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||  || |||||||||| |  |||  | ||||||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatct 22049  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     || ||||||| || ||||||||||    
T  22048 tctaatgaactacaacttctggtga 22024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 9824 - 10059
Alignment:
Q  43 attgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttca 142  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||      
T  9824 attgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttg 9923  T
Q  143 gtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgctt 242  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9924 gtcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatcttgctt 10023  T
Q  243 ctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
     | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  10024 atgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatga 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78481 - 78259
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  78481 agcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaa 78382  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  || ||||   |||| | | ||||||||||||||   |||||||    
T  78381 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatct 78284  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  78283 catgatgaactacagcttctggtga 78259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1598
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1814 agcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaa 1715  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||  ||| ||||  || |||| |||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||    
T  1714 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatct 1617  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttc 228  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  1616 cctgatgaactgcagcttc 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 30294 - 30441
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  30294 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 30393  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  30394 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 30441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10151
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||||| |||| ||    ||||||||||||| ||||||   |||||||  |  |||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10098 tctgatgaacttcagcttctggtgatattgcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 60802 - 61021
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  60802 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcc 60901  T
Q  113 tttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || |||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  60902 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcct 60999  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  61000 gatgaactacaacttctggtga 61021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5510
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaa 5618  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||| | |||||| ||||||   ||||||||    
T  5617 tcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatct 5520  T
Q  210 cctgatgaac 219  Q
     |||||||||    
T  5519 tctgatgaac 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3522
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  3300 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 3399  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||| || || |||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3400 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3497  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  3498 cctgatgaactatagcttctggtga 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13739
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaaca 182  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 143129 - 143292
Alignment:
Q  55 gtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaat 154  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  143129 gtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 143228  T
Q  155 gcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    |||| |||||  ||||||| ||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  143229 gctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaa 143292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 9151 - 9372
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9151 agcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 9250  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||||||||||| ||| || ||  || ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  9251 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 9347  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  9348 cctgatgaactacaacttctggtga 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6241
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||  || |||| |||| |||  | ||   |||||||||||||| ||| ||   |||||||  || ||||  |||||||||||||| |||  |||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 249  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||    
T  6202 tctgatgaacttcaacttctagtgatattgcttctgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16011
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  109 atcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaac-atcctttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
     ||||||||||||| | | || ||||||  |   ||||| |||||| ||| |||||  || |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  208 ctcctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  15989 ctcctgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 9968 - 10176
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| | ||  || ||| |    
T  9968 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatttgaattagcc 10067  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 224  Q
    |||| |||||| ||   |||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  10068 gttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctgatgaacttcag 10166  T
Q  225 cttctggtga 234  Q
    ||||||||||    
T  10167 cttctggtga 10176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Original strand, 39495 - 39645
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||  |||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||     
T  39495 aagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacag 39594  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39595 cctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Original strand, 137555 - 137705
Alignment:
Q  84 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacat 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||  |||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||     
T  137555 aagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacag 137654  T
Q  184 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  137655 cctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 137705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 37398 - 37463
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37398 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 135458 - 135523
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  135458 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159270
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||| ||||| |||||| ||    |||| ||||||| |||||||   |||||||  || |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatct 159249  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctg 230  Q
      |||||  ||||||||||||    
T  159250 tttgatggtcttcagcttctg 159270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7261 - 7049
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||  |||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  7261 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaa 7162  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 219  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||||||||  | |||||   || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7161 atagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 7064  T
Q  220 ttcagcttctggtga 234  Q
    | |||||||||||||    
T  7063 tacagcttctggtga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4838
Alignment:
Q  131 ttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| ||    
T  4987 ttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaacttttg 4888  T
Q  231 gtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4887 gtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgcttttgatga 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36294 - 36032
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||  | ||| |||||||||||||||| ||| || |    
T  36294 agacaaaaatcaggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccat 36195  T
Q  115 tcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    |  ||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||  ||||||   ||||||| ||| |||| |||||||||||| || | |  ||  | ||||    
T  36194 ttgaaatagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctga 36096  T
Q  215 tgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36095 tgatcttcagcttatggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 36032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25688
Alignment:
Q  13 agagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  25777 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25613 - 25520
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtg--accttgcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25613 tttgaaactttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatga 25520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9253
Alignment:
Q  193 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9338 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctgatga 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65322
Alignment:
Q  68 ttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgt 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||||| |||||||||  |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  168 taaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||  | ||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 65322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144367
Alignment:
Q  68 ttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgt 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||  |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  168 taaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    | ||||  | ||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 144367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164942
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 164957  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| |||| ||||    
T  164956 tcaaattagttgttg 164942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8149
Alignment:
Q  45 tgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagt 144  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  145 cttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtga 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25395
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttg 25395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23546 - 23456
Alignment:
Q  141 cagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23546 cagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 23456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15854 - 15814
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  15854 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 15814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 38190 - 38085
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38190 aaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 38091  T
Q  120 atagtc 125  Q
     |||||    
T  38090 ttagtc 38085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaat 154  Q
     |||| ||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5922 - 5830
Alignment:
Q  143 gtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5922 gtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtga 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17668
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||            
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatg-------- 17789  T
Q  110 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||||||| ||||| |  ||| ||  ||||||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||| ||||    
T  17788 -cctttcaaaatagacgttgctatacttttgtagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatct 17693  T
Q  210 cctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  17692 cctgatgaattgaagcttctggtga 17668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  27 agtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |   |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44032 - 43822
Alignment:
Q  11 gcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||    
T  44032 gcagagacaaaac-agagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaat 43934  T
Q  111 cctttcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    | |||  || ||| | ||| |||||| ||    |||||||||||| |||| ||   |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||  |||||     
T  43933 ctttttgaattagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatctt 43835  T
Q  211 ctgatgaacttca 223  Q
    ||||||| |||||    
T  43834 ctgatgatcttca 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1491
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||   ||||| || | |||||||||||||||||||||  ||    
T  1626 aaaataaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaa 1527  T
Q  120 atagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||    
T  1526 atagtcgttgcttcactcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15618
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctt 15633  T
Q  115 tcaaaatagtcgttg 129  Q
    ||||| ||| |||||    
T  15632 tcaaactagccgttg 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Original strand, 5639 - 5767
Alignment:
Q  26 gagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||    
T  5639 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagtc 5737  T
Q  126 gttgtttcactatttcagtcttctgcaatg 155  Q
    |||| |||| | ||  ||||||||| ||||    
T  5738 gttgcttcattcttctagtcttctggaatg 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 5867 - 5909
Alignment:
Q  221 tcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5867 tcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttttgatga 5909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 7377 - 7469
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  7377 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgatgaattagcatccaatgc 7469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40846
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||   |||||| | ||||  |||||||||||| |||    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  115 tcaaaatagtcgttgtttcactatttcagtcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    |  || ||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| |||  |   |||||||| || |||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctga 40836  T
Q  215 tgaacttcag 224  Q
    ||| ||||||    
T  40837 tgatcttcag 40846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  195 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 846
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaat 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  935 agcagagacaaaac-agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaat 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |   |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  110 tccttt 115  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 278
Target Start/End: Original strand, 74732 - 74831
Alignment:
Q  179 aacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 278  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  || || |||||||  |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  74732 aacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgttgtttctgatgaggtgcttatgatgaacttgcttatgatga 74831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87623
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaatttgcatccaatgc 87623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1410
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttca 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || || ||||||| ||||||||||    
T  1323 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  20 aaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttca 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || || ||||||| ||||||||||    
T  88 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2027
Alignment:
Q  30 agtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagc 93  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13391
Alignment:
Q  195 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaac 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13462 ttaagtcttgcatctc-tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaac 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 719 - 812
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaat-agagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  719 agcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2738
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4001 - 3915
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgcctt 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |  ||||||||| |||||    
T  4001 aaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctttgtaggatgagcatccaaagcctt 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 20487 - 20409
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||        |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  20487 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt--------tgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatccaatg 20409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Original strand, 2172 - 2207
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2172 agacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtaca 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 16956 - 17052
Alignment:
Q  15 agacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||        |||||||| ||||| ||||| | | | ||||||||||||||| |||||    
T  16956 agacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac--------tttgtcaatgctctttgaaggatatgaatccaatgccttcaattcctt 17047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31890 - 31808
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  31890 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgc 31808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Original strand, 2978 - 3016
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgta 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2978 agcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 7290 - 7351
Alignment:
Q  19 aaaaatagagtagtggaggtagtgattgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctct 80  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7290 aaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaacactct 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5440 - 5347
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca-tttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaagcatccaatgc 102  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||   ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  5440 agcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttttctacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcatccaatgc 5347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6042
Alignment:
Q  10 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtgattgtaca 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  6002 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 6042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University