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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF20460_low_1 (Length: 815)
Name: NF20460_low_1
Description: NF20460
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20460_low_1 |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 729; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 729; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 32203987 - 32203208
Alignment:
| Q |
17 |
aaacatctccaacaaattcaatcagttccagttttatctcaaattaagaatatcaatagtgtgtacaacgttacaat------ggtcgcaacaaattcta |
110 |
Q |
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| T |
32203987 |
aaacatctccaaccaattcaatcagttccagttttatctcaaattaagaatatcaataatgtgtacaacgttacaattacaatggtcgcaacaaattcta |
32203888 |
T |
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| Q |
111 |
ttatcaataaattcatggtgtggactaattaaattaaagagctttcaattacatctaactcagctgcctctaagaaacgagacatatccatttccaggca |
210 |
Q |
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| T |
32203887 |
ttatcaataaattcatggtgtggactaattaaattaaagagctttcaattacatctaactcagctgcctctaagaaacgagacatatccatttccaagca |
32203788 |
T |
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| Q |
211 |
cttttgttgtatcagagatgtacttagcacaagattccattcctatcttatgaatgaggtcagggattatttccatcatcttcatcatcacggacgagtt |
310 |
Q |
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| T |
32203787 |
cttttgttgtatcagagatgttcttagcacaagattccattcctatcttatgaatgaggtcagggattatttccatcatcttcatcatcacggacgagtt |
32203688 |
T |
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| Q |
311 |
taacaccattgtacttaagagcatttaccacagccaaaatcttggtttggctcttaaatcctttcttttctatttccttattaacatttacatgaatacc |
410 |
Q |
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| T |
32203687 |
taacaccattgtacttaagagcatttaccacagccaaaatcttggtttggctcttaaatcctttcttttctatttccttatttacatttacatgaatacc |
32203588 |
T |
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| Q |
411 |
tcttccttctccttcattaagcccctcaactttgagccgtctggccaatacttccccaacaacagcagctgcttttgcattgcagggccggccacactcg |
510 |
Q |
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| T |
32203587 |
tcttccttctccttcattaagcccctcaactttgagccgtctggccaatacttccccaacaacagcagctgcttttgcattgcaggaccggccacactcg |
32203488 |
T |
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| Q |
511 |
agagactgcttgatgtcatgttctgcggtggatgatgttgctactattcgtccgctgtttcgatctaccacatttgcagtaatgtactttattgatatga |
610 |
Q |
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| T |
32203487 |
agagactgcttgatgtcatgttcagcggtggatgatgttgctactattcgtccgctgtttcgatctaccacatttgcagtaatgtactttattgatatga |
32203388 |
T |
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| Q |
611 |
acaatctcagcacataccgtttcgttaaagtcattcttcaatcatctgataagtgggtttaaaatcaagcacataaatgataaatcagtttcctacaaac |
710 |
Q |
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| T |
32203387 |
acaatctcagcacataccgtttcgttaaagtcattcttcaatcatctgataagtgggtttaaaatcaagcacataaatgataaatcagtttcctacaaac |
32203288 |
T |
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| Q |
711 |
agaaaggaaaaaacaatgacagaataggtaatgtcccacatattaaaggaattcaggtacttgatacacagaggttaatt |
790 |
Q |
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| T |
32203287 |
agaaaggaaaaaacaatgacagaataggtaatgtcccacatattaaaggaattcaggtacttgatacacagaggttaatt |
32203208 |
T |
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Target: chr1 (Bit Score: 582; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 790
Target Start/End: Original strand, 35566184 - 35566784
Alignment:
| Q |
189 |
gagacatatccatttccaggcacttttgttgtatcagagatgtacttagcacaagattccattcctatcttatgaatgaggtcagggattatttccatca |
288 |
Q |
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| T |
35566184 |
gagacatatccatttccaggcacttttgttgtatcagagatgttcttagcacaagattccattcctatcttatgaatgaggtcagggattatttccatca |
35566283 |
T |
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| Q |
289 |
tcttcatcatcacggacgagtttaacaccattgtacttaagagcatttaccacagccaaaatcttggtttggctcttaaatcctttcttttctatttcct |
388 |
Q |
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| T |
35566284 |
tcttcatcatcacggacgagtttaacaccattgtacttaagagcatttaccacagccaaaatcttggtttggctcttaaatcctttcttttctatttcct |
35566383 |
T |
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| Q |
389 |
tattaacatttacatgaatacctcttccttctccttcattaagcccctcaactttgagccgtctggccaatacttccccaacaacagcagctgcttttgc |
488 |
Q |
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| T |
35566384 |
tatttacatttacatgaatacctcttccttctccttcattaagcccctcaactttgagccgtctggccaatacttccccaacaacagcagctgcttttgc |
35566483 |
T |
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| Q |
489 |
attgcagggccggccacactcgagagactgcttgatgtcatgttctgcggtggatgatgttgctactattcgtccgctgtttcgatctaccacatttgca |
588 |
Q |
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| T |
35566484 |
att-cagggccggccacactcgagagactgcttgatgtcatgttctgcggtggatgatgttgctactattcgtccgctgtttcgatctaccacatttgca |
35566582 |
T |
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| Q |
589 |
gtaatgtactttattgatatgaacaatctcagcacataccgtttcgttaaagtcattcttcaatcatctgataagtgggtttaaaatcaagcacataaat |
688 |
Q |
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| T |
35566583 |
gtaatgtactttattgatatgaacaatctcagcacataccgtttcgttaaagtcattcttcaatcatctgataagtgggtttaaaatcaagcacataaat |
35566682 |
T |
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| Q |
689 |
gataaatcagtttcctacaaacagaaaggaaaaaacaatgacagaataggtaatgtcccacatattaaaggaattcaggtacttgatacacagaggttaa |
788 |
Q |
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| T |
35566683 |
gataaatcagtttcctacgaacagaaaggaaaaaacaatgacagaataggtaatgtcccacatattaaaggaattcaggtacttgatacacagaggttaa |
35566782 |
T |
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| Q |
789 |
tt |
790 |
Q |
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35566783 |
tt |
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T |
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