View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF20464_low_1 (Length: 826)
Name: NF20464_low_1
Description: NF20464
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20464_low_1 |
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| [»] scaffold0428 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold1749 (1 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 781; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 781; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Original strand, 31560650 - 31561442
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
31560650 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttgggattaattctcctatagaagcat |
31560749 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
31560750 |
tacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgttcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgta |
31560849 |
T |
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| Q |
215 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatt |
314 |
Q |
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| T |
31560850 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatc |
31560949 |
T |
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| Q |
315 |
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414 |
Q |
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| T |
31560950 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
31561049 |
T |
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| Q |
415 |
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514 |
Q |
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| T |
31561050 |
ttcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatga |
31561149 |
T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
31561150 |
gcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagtt |
31561249 |
T |
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| Q |
615 |
gagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgt |
714 |
Q |
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| T |
31561250 |
gagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgt |
31561349 |
T |
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| Q |
715 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
807 |
Q |
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| T |
31561350 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
31561442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33274031 - 33273239
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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33274031 |
gagattaaaaagattgttcaaacgatcttgaatatattgaagtacaaatcttcatgtttttcaaaagatttagttgggatagattctcgtttagacggat |
33273932 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
33273931 |
tacaaaatcatttacttttggactcggttgacagtgttcgtgctataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacaacccttgctatggctttata |
33273832 |
T |
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| Q |
215 |
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314 |
Q |
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| T |
33273831 |
tgatcaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttatagatgatgtaagcaaaatttataaattacatgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatc |
33273732 |
T |
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| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
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| T |
33273731 |
ctacttcaaactctcggcatagaacaccatcaaatatgcaatcattacagcgtaactaatttgatacgaagtaggctatgtcgtgaaagggtccttctga |
33273632 |
T |
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| Q |
415 |
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514 |
Q |
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33273631 |
ttcttgataatgtggatcaagttgcacagttggaaaaaataggtgtgcatcgtgaatggttaggtgcaggtagtagaattataatcatttctagagatga |
33273532 |
T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
33273531 |
gcatatattgaaatactatggagtggatgcagtttacaaagttccacttttgaattggacagattctcacaagttattttgtcaaaaagctttcaaattt |
33273432 |
T |
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| Q |
615 |
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714 |
Q |
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33273431 |
gagaaagttattatgagtaattatgaaaacttagcgtatgagattctagattatgctaatggtctaccactagcaattatagtattgggctcatttttgt |
33273332 |
T |
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| Q |
715 |
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807 |
Q |
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| T |
33273331 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgccctggctagattgagagaaagtccaaataatgatatcatggatgtgctgcaattaagttttg |
33273239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33402853 - 33402061
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
33402853 |
gagattaaaaagattgttcaaaagataatgaatatattggagtgcaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttgggattgattctcctatagaagcat |
33402754 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
33402753 |
taaaaaatcatttggttttggacttggttgatggtgttcgtgctataagaatttgtggaatgggaggaatagggaagacaacccttgctatgaatttata |
33402654 |
T |
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| Q |
215 |
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314 |
Q |
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| T |
33402653 |
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33402554 |
T |
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| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
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| T |
33402553 |
ctacatcaaactctcggcatagaacaccatcaaatatgcaatcgttacagtgcaattgatttgatacaacgtaggctacgtcgtgaaaaggctcttctga |
33402454 |
T |
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| Q |
415 |
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514 |
Q |
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| T |
33402453 |
tttttgataatgtggatcaagttgaacaattggaaaaaataggtgtgcatcgtgaatgtttaggtgcgggtagtagaattattatcatttctagagatga |
33402354 |
T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
33402353 |
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33402254 |
T |
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| Q |
615 |
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714 |
Q |
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| T |
33402253 |
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33402154 |
T |
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| Q |
715 |
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807 |
Q |
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| T |
33402153 |
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33402061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33412192 - 33411400
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
33412192 |
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33412093 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
33412092 |
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33411993 |
T |
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| Q |
215 |
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314 |
Q |
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| T |
33411992 |
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33411893 |
T |
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| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
| |
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| T |
33411892 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacaccatcaaatatgcaatcgttacagtgcaactgatttgatacgacgtaggttacgtcatgaaaaggcccttctga |
33411793 |
T |
|
| Q |
415 |
ttcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatga |
514 |
Q |
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|
|
| T |
33411792 |
tttttgataatgtggatcaagttgaacaattggaaaaaatagctgtgcatcgtgaatggttaggtgcgggtagtagaatcgttatcatttctagagatga |
33411693 |
T |
|
| Q |
515 |
gcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagtt |
614 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33411692 |
gcatatattgaaagagtacggagtggatgtagtttacaaagttccacttatgaatagtacagattcttacgagttattttgtcgaaaagctttcaaagtt |
33411593 |
T |
|
| Q |
615 |
gagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgt |
714 |
Q |
| |
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|
| T |
33411592 |
gagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcaaatgagatactagattatgctaaaggtctaccactagcaattaaagtattgggctcatttttgt |
33411493 |
T |
|
| Q |
715 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
807 |
Q |
| |
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| T |
33411492 |
ttggtcatagtgtggctgaatggaagagtgcattggctagattgagagaaagtccgcataatgatgtcatggatgtgctgcacttaagttttg |
33411400 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33390313 - 33389519
Alignment:
| Q |
13 |
gtgagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagc |
112 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33390313 |
gtgagattaaaaagattgttcaaaggataatgaatatattggagtgcaattcttcatgtgtttcgaaagatttagtagggattgattctcctatagaagc |
33390214 |
T |
|
| Q |
113 |
attacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttg |
212 |
Q |
| |
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| T |
33390213 |
attacaaaatcatttgcttttggactcagttgatggtgttcatgctataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacaacccttgccatgacttta |
33390114 |
T |
|
| Q |
213 |
tatggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaa |
312 |
Q |
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| T |
33390113 |
tatgaccaaatatctcatcgatttagtgcaaattgttttattgatgatgtaagcaaaatatatagattatgtgatggtcctttggatgcacaaaagcaaa |
33390014 |
T |
|
| Q |
313 |
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412 |
Q |
| |
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| T |
33390013 |
ttctatttcaaactctcgacataaaacaccatcaaatatgcaatcgttacattgcaactgatttgatacgacgtaggctaagtcgtgaaaagaccctagt |
33389914 |
T |
|
| Q |
413 |
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512 |
Q |
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| T |
33389913 |
gattcttgataatgtggatcaaggtgaacaatcggaaaaaatagctgtgcatcgtgagtggttaggtgcaggtagtagaataattatcatttctagagat |
33389814 |
T |
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| Q |
513 |
gagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaag |
612 |
Q |
| |
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| T |
33389813 |
gagcatatattgaaagagtatggagtggacgtagtttacaaagttccacttttgaatcggaccgattctcacaagttattttgtcaaaaagctttcaaac |
33389714 |
T |
|
| Q |
613 |
ttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcattttt |
712 |
Q |
| |
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| T |
33389713 |
atgagaaaattattatgagtagttaccaaaatttggattttgagatactgagttatgctaatggtcttccactagcaattaaagtattgggctcattttt |
33389614 |
T |
|
| Q |
713 |
gtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
807 |
Q |
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33389613 |
gtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattggctagattgagagaaaggccagataacgatgtcatggatgtgctacagttaagttttg |
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T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 33059792 - 33059010
Alignment:
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124 |
Q |
| |
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agattgttcaaaagataatcaatatattggaatgcaaatattcatgtgtttcaaaagatttagttgggattgattctcctatacaagcattacaaaatca |
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T |
|
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tttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaata |
224 |
Q |
| |
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| T |
33059692 |
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33059593 |
T |
|
| Q |
225 |
tctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaa |
324 |
Q |
| |
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|
| T |
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tctcatcaatttagtgcatcttgttttattgacgatgtaaccaaaatttatggattacatgatgatccactcgatgtacaaaaacaaatcctatttcaaa |
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T |
|
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325 |
ctgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttgataa |
424 |
Q |
| |
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| T |
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ctctcggcatagaacaccaacaaatatgcaatcgttaccatgcaactactttgatacaaaggaagctatgtcatgaaagaacccttatgattcttgataa |
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T |
|
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tgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattg |
524 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
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aaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaatta |
624 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
|
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724 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33306719 - 33305933
Alignment:
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120 |
Q |
| |
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|
|
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T |
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| Q |
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220 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
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221 |
aatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctactt |
320 |
Q |
| |
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aatatctcatcgatttagtgcatcctgctatattgatgatgtaaccaaaatttatagtttacatgatggtccactcaatgcacaaaagcaaatcctattt |
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T |
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caaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttg |
420 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
|
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
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attgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaa |
620 |
Q |
| |
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|
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| T |
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|
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720 |
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| |
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|
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 9169006 - 9168218
Alignment:
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|
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T |
|
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220 |
Q |
| |
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| T |
9168907 |
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|
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Q |
| |
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T |
|
| Q |
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caaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttg |
420 |
Q |
| |
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| T |
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520 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
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attgaaagagtatggagt---ggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgag |
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Q |
| |
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|
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| T |
9168507 |
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T |
|
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aaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttg |
717 |
Q |
| |
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718 |
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| |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 794
Target Start/End: Original strand, 33642443 - 33643222
Alignment:
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|
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|
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T |
|
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tacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgta |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |
|
|
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tacaaaatcatttgcttttggactcagttgatggtgttcgtgctataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacaacccttgctacggctttata |
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T |
|
| Q |
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tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatt |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
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tgaccaaatatctcatcgatttagtgcatcatgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagattacatgatggtccactcgaagcacaaaagcaaatc |
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T |
|
| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
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ctatttcaaactcttggcatagaacaccatcaaatatgcaatcgtaacatggcaactgatttgatacgacgtaggctacgtcgtgagaaggcccttctga |
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T |
|
| Q |
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ttcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatga |
514 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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|
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gcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagtt |
614 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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|
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gagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgt |
714 |
Q |
| |
|
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|
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T |
|
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715 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctg |
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Q |
| |
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|
|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33287770 - 33286989
Alignment:
| Q |
26 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
126 |
ttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatat |
225 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
33287670 |
ttgcatttggattcggttgatggagttcgtgcaataggaatttgtggaatgggaggaatagggaaaacaaccctttctatggctttatatgatcaaatat |
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T |
|
| Q |
226 |
ctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaac |
325 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
33287570 |
cccatcgatttagtggatcttgttttattgaagatgttgccaaaaaatttagattacatgatggtcccctcgatgcacaaaaggaaatcctacttcaaac |
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T |
|
| Q |
326 |
tgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttgataat |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || |||| |||||||||| | || | |||||||||||||| | || | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33287470 |
cgtcggaatagaagaccatcatatatgcaatcgtcaccgtgcaactaatttgatacaaagtaggctacgtcgtgaaagggcccttcttattcttgataat |
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T |
|
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426 |
gtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattga |
525 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtagatcgagttgaacaattggaaaaaataggtgtgcatcgtgaatgtttaggcgtaggtagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgg |
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T |
|
| Q |
526 |
aagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaattat |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33287270 |
aagagtatggagtggatgtagtctacaaagttccactcttggattggaatgaagctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagaagagaaaattat |
33287171 |
T |
|
| Q |
626 |
tatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaat |
725 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
33287170 |
tatgagaaattatgaaagtttggtatatgagatactggattatgctaatggtctaccgttagcaattaaagtattgggctcatttttgtttggtcgtaat |
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T |
|
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726 |
gtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
807 |
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| |
|
||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 33264888 - 33264096
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| Q |
15 |
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114 |
Q |
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33264888 |
gagattaaaaagattgttcaaaagataatgagtacattggaatgcaaatcttcatgtgtttcaaaagacttagttgcgatagattctcgtttagaagcat |
33264789 |
T |
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115 |
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214 |
Q |
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| T |
33264788 |
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33264689 |
T |
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215 |
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314 |
Q |
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| T |
33264688 |
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33264589 |
T |
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315 |
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414 |
Q |
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33264489 |
T |
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415 |
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514 |
Q |
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| T |
33264488 |
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33264389 |
T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
33264388 |
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33264289 |
T |
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| Q |
615 |
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714 |
Q |
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| T |
33264288 |
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33264189 |
T |
|
| Q |
715 |
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807 |
Q |
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| T |
33264188 |
ttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtacattggctagtttgagagaaagtccagataatgatgtcatggatgtgttgcaattaagttttg |
33264096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 478
Target Start/End: Original strand, 31566969 - 31567432
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
31566969 |
gagattaaaaagattgctcaaacaataatgaatatattggagtgcaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttgggattgattctcctatagaagcgt |
31567068 |
T |
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| Q |
115 |
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214 |
Q |
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| T |
31567069 |
tacaaaatcatttgcttttggactcgattgatggtgttcgtgctataggaatttgtggaatggggggaatagggaagacagcccttgctgagactttata |
31567168 |
T |
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| Q |
215 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatt |
314 |
Q |
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| T |
31567169 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcttgttatattgatgatgtaagcaaaatttatagatcatatgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatc |
31567268 |
T |
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| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
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| T |
31567269 |
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31567368 |
T |
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| Q |
415 |
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478 |
Q |
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| T |
31567369 |
ttcttgaaaatgtagatcaagttgaacaaatggaaaaaatagttgtgcgtcgtgaatggttagg |
31567432 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33360295 - 33359916
Alignment:
| Q |
38 |
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137 |
Q |
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| T |
33360295 |
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33360196 |
T |
|
| Q |
138 |
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237 |
Q |
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| T |
33360195 |
tcggttgatggtgttcgtgctataggaatttgtggaattggaggaattgggaaaacaacccttgctacgactttatatggccaaatctctcaccaattta |
33360096 |
T |
|
| Q |
238 |
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337 |
Q |
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| T |
33360095 |
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33359996 |
T |
|
| Q |
338 |
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417 |
Q |
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| T |
33359995 |
acacaataaaatatgcgattgttaccatgcaactactttgatacaaaggaggctatgtcatgaaagagcccttttgattc |
33359916 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 613 - 807
Target Start/End: Original strand, 28869210 - 28869404
Alignment:
| Q |
613 |
ttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcattttt |
712 |
Q |
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| T |
28869210 |
ttgaaaaagttatcatgagtaattatcaaaatttggcaaatgtgatactggattatgctaaaggtctaccgctagcaattacaatattgtactcatattt |
28869309 |
T |
|
| Q |
713 |
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807 |
Q |
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| T |
28869310 |
gtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattggctagattgagagaaagtccagataatgatgtcatggatgtgctgcagttaagttttg |
28869404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Original strand, 13609093 - 13609166
Alignment:
| Q |
131 |
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204 |
Q |
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| T |
13609093 |
tttggactcagatgatgatgttcgagttgtagggatttgtggaatgggcggaataggaaagacaactcttgcta |
13609166 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 684 - 763
Target Start/End: Original strand, 13609640 - 13609719
Alignment:
| Q |
684 |
ctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagaga |
763 |
Q |
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| T |
13609640 |
ctagcaattgaagtgttgggctcatttttgtatggtcgagatgtctctgaatggagaagtgcattggccagattaagaga |
13609719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 807
Target Start/End: Original strand, 17438669 - 17439461
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
17438669 |
gagattaaaaagattgttcaaaagataatgaatatattggaatgcaaatcttcatgtaattcaaaagatttagttgggataaattctcgtatagaagcat |
17438768 |
T |
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| Q |
115 |
tacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgta |
214 |
Q |
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| T |
17438769 |
taaaaaatcatttacttttggactcggttgatggtgttcgtgctataggaatttgggggatgggaggaatagggaagacaacccttgctttggatttata |
17438868 |
T |
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| Q |
215 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatt |
314 |
Q |
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| T |
17438869 |
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17438968 |
T |
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| Q |
315 |
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413 |
Q |
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| T |
17438969 |
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17439067 |
T |
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| Q |
414 |
attcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatg |
513 |
Q |
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| T |
17439068 |
attcttgataatgtggatcaagttgaacaattggaaaaaatagatgtgcatcttgaatggttaggtgcaggtagtagaatcattatcatttctagagatg |
17439167 |
T |
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| Q |
514 |
agcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagt |
613 |
Q |
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| T |
17439168 |
agcatatattgaaaaagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaattggagagattcttacaagttattttgtcgaaaagctttcaaagt |
17439267 |
T |
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| Q |
614 |
tgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttg |
713 |
Q |
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| T |
17439268 |
tgagaacattattatgagtaattatcaaaatttggcaaatgagatactgagatatgctaatggtctaccactagcaattaaagtaatgggctcatttttg |
17439367 |
T |
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| Q |
714 |
tttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgctgcagataagttttg |
807 |
Q |
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| T |
17439368 |
tttggttgtaatgtgactgaatggaagagtgcattggctagattgagagagagtccagataaagatgtcatagacgtgctgcaattaagttttg |
17439461 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0428 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0428
Description:
Target: scaffold0428; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 8992 - 8221
Alignment:
| Q |
22 |
aaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcattacaaaa |
121 |
Q |
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| T |
8992 |
aaaagattgttcaaacgatcttgaatatattgaagtgcaaatcttcattcgtttcaaaagatttagttgggataaattctcgtacagaagcattaaaaca |
8893 |
T |
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| Q |
122 |
tcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaa |
221 |
Q |
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| T |
8892 |
tcagttacttttgaattcggttgatggtgttcgtgttataggaatttgggggatgggaggaatagggaagacaacccttgctatgaatttatatggccaa |
8793 |
T |
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| Q |
222 |
atatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttc |
321 |
Q |
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8792 |
atctgtcatcgatttgatgcatcctgtttcattgatgatgtaagcaaaatttttagattacatgatggtccaattgatgcacaaaagcaaatcctacatc |
8693 |
T |
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| Q |
322 |
aaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttga |
421 |
Q |
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8692 |
aaactcttggcatagaacaccatcaaatatgcaatcattatagtgcaactgatttgataagacataggctaagtcgtgaaaagacccttctaattcttga |
8593 |
T |
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| Q |
422 |
taatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatata |
521 |
Q |
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8592 |
taatgtggatcaagttgaacaattggaaagaataggtgtgcatcgtgaatggttaggtgcaggtagtagaatcgttatcatttcaagagatgaacatata |
8493 |
T |
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| Q |
522 |
ttgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaa |
621 |
Q |
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| T |
8492 |
ttgaaagaatataaagtggatgtagtttacaaagttccactgttggattggaccgagtctcacaagttattttgtcaaaaagctttcaaacttgagaaaa |
8393 |
T |
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| Q |
622 |
ttattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcg |
721 |
Q |
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| T |
8392 |
ttatcatgaaaaattatcaaaatttggcatatgagatactgaattacgctaatggtctaccactagcaattacagtattgggctcatttttgtctggtcg |
8293 |
T |
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| Q |
722 |
taatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtgct |
793 |
Q |
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| T |
8292 |
taatgtgactgaatggaagagtgcattggctagactgagacaaagtccaaataaagatgtcatggatgtgct |
8221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 566
Target Start/End: Original strand, 31496768 - 31497319
Alignment:
| Q |
15 |
gagatgaaaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcat |
114 |
Q |
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| T |
31496768 |
gagattaaaaaaattgttcaaaggataatggatattttggattgcaaatctatatgtgtttcaaatgatttagttgggatggactctcatatgcaaaaat |
31496867 |
T |
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| Q |
115 |
tacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgta |
214 |
Q |
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| T |
31496868 |
tagaaaagcttttacttttggactcggttaatgatggtcgtgtcataggaatttgtgggatgggaggaatagggaagactacccttgctactgctttgta |
31496967 |
T |
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| Q |
215 |
tggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaatt |
314 |
Q |
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| T |
31496968 |
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31497067 |
T |
|
| Q |
315 |
ctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctga |
414 |
Q |
| |
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| T |
31497068 |
ctacatcaaactctcaatgaagaacaccatcatatatgcaatcttcacatcgcatctaacttgatacgacgcaggctatgttgtcaaagtatccttttga |
31497167 |
T |
|
| Q |
415 |
ttcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatga |
514 |
Q |
| |
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| T |
31497168 |
tttttgataatgttgataaagttgaacaattagaaaaaatagttgttcgtcgtgattggttagatgtgggtagtaaaatcattatcatttctagagacga |
31497267 |
T |
|
| Q |
515 |
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566 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
31497268 |
gcatatactgaaagagtatggagtggatgaggtttacaaagttcctcttttg |
31497319 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 559
Target Start/End: Original strand, 31476862 - 31477359
Alignment:
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62 |
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161 |
Q |
| |
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| T |
31476862 |
atcttcaagtgcttcaaacgatttagttgggatggattctcctagacaagaattagaaaagcttttacttttggactctgttgatgatgttcatgttgta |
31476961 |
T |
|
| Q |
162 |
ggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatg |
261 |
Q |
| |
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| T |
31476962 |
ggaatttgtgggatgggtggaatagggaagacaacccttggcatggttctatatgatagaatttctcatcaatttggtgcatgctgttttattgatgatg |
31477061 |
T |
|
| Q |
262 |
taagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcatta |
361 |
Q |
| |
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| T |
31477062 |
taagcaaaatgtttagattacatgatgggccactcgatgttcaaaagcaaattctacatcaaactctcggtgaaaatcacaatcagatatgcaatctttc |
31477161 |
T |
|
| Q |
362 |
cagcgcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtg |
461 |
Q |
| |
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| T |
31477162 |
cactgcatctaacttgattagacgtagactatgtcgtcaaagggtccttatgatttttgataatgttgataaagttgaacaactggaaaaaataggtgtt |
31477261 |
T |
|
| Q |
462 |
cgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttcc |
559 |
Q |
| |
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| T |
31477262 |
tgtcgtgaatggctaggtgagggaagtaaaatcattataatttctagagatgagcatatattgaagaattatggagtagatgaagtttacaaagttcc |
31477359 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 404 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31150189 - 31149805
Alignment:
| Q |
404 |
ggcccttctgattcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatt |
503 |
Q |
| |
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||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||| | || ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
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| T |
31150189 |
ggcccttataattcttgacaatgttgatcaagttgaacaactcgagaaattagccgtgaatcgtgaatggttaggtgcggggagtagaatcattataatt |
31150090 |
T |
|
| Q |
504 |
tctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaag |
603 |
Q |
| |
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| T |
31150089 |
tctagagacgagcatatcttgaaagagtatggagtggatgttgtttacaaagttccactcctgaatcggactgactctcttcaattatttagtcgaaaag |
31149990 |
T |
|
| Q |
604 |
ctttcaaagttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattggg |
703 |
Q |
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| T |
31149989 |
ctttcaaacttgatca---tattatgagtagttatgataagttggcatctgagatactaaggtatgctaatggcctacctctagcaattaaagtattagg |
31149893 |
T |
|
| Q |
704 |
ctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatggatgtg |
791 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || ||| ||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |
|
|
| T |
31149892 |
ctcgtttttgtatgatcgaaatatttttgaatggaaaagtgcattggcaagattgagagaaagtccaaacaaagatatcatggatgtg |
31149805 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31159433 - 31158706
Alignment:
| Q |
58 |
acaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcattacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgt |
157 |
Q |
| |
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|
| T |
31159433 |
acaaattttcatgtcttccaaaagaattagttggaataaattatcctatagaaaaagtagcaaatctattacttttggactccgttgatgatgttcgggt |
31159334 |
T |
|
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||| |
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| T |
31159333 |
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31159234 |
T |
|
| Q |
258 |
gatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatc |
357 |
Q |
| |
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| T |
31159233 |
gatctaagcagaatatataga-ca--tgatggtccaattggtgcacaaaagcaaatcctacaccaaactcttggcggggaacactttcaaatatacaatc |
31159137 |
T |
|
| Q |
358 |
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457 |
Q |
| |
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| T |
31159136 |
tatatgacacaactaatttgatacaaagtaggctacgccgcctacgagcacttataatagttgataatgttgataaagttgaacaacttgataaattagc |
31159037 |
T |
|
| Q |
458 |
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557 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31159036 |
tgtgaatcgtgaatgcttaggtgcagggagtagaatcgttataatttctagagatgaacatatcttgaaagagtatggagttgatgtagtttacaaagtt |
31158937 |
T |
|
| Q |
558 |
ccacttttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgaga |
657 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | | | |||| || ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| || | | || ||| || ||| | |
|
|
| T |
31158936 |
ccactcttgaatgggactaactctcttcaattgttttgtcaaaaagctttcaaacttgatca---tattatgagtagttttgataagttgacatttgaca |
31158840 |
T |
|
| Q |
658 |
tactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagatt |
757 |
Q |
| |
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| T |
31158839 |
tactcagttatgctaatggtctaccgctagcaattaaagtattgggatcatttttgtttggtcgagacatctatgaatggaaaagtgcattggctagatt |
31158740 |
T |
|
| Q |
758 |
gagagaaagtccagataataatgtcatggatgtg |
791 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | || || ||||||||||| |
|
|
| T |
31158739 |
gagcaaaagtccaaacaaagatatcatggatgtg |
31158706 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 566
Target Start/End: Original strand, 31501988 - 31502491
Alignment:
| Q |
66 |
tcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcattacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaa |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||| || |||||||| | ||||| || || | | |||||| |
|
|
| T |
31501988 |
tcatgtgtttcaaaagacatagttggaattgtttctcatatacaagcattagaaaaacttttactcttggactctgttgatgatgttcaagctgtaggaa |
31502087 |
T |
|
| Q |
166 |
tttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaag |
265 |
Q |
| |
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| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || | | | |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31502088 |
tctgtgggatgggtggaatagggaagacaacccttggtagggttctatatgatagaatttctcatcaatttggtgcatgttgttttatcgatgatgtaag |
31502187 |
T |
|
| Q |
266 |
caaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaactgtcggcatagaacacaatcaaatatgcaatcattacagc |
365 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31502188 |
caaaatgtttagattacatgatggaccacttggtgttcaaaagcaaatactatatcaaacacacggtgaagaacacaatcaaatatgcaatctttctact |
31502287 |
T |
|
| Q |
366 |
gcaactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtc |
465 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||| | ||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| || |
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|
| T |
31502288 |
gcatctaacttgattcgacgcaggctatgtcgtcaaagggtccttttgatttttgataatgttgataaagttgaacaactggaaaaaataggtgtgtgtg |
31502387 |
T |
|
| Q |
466 |
----gtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccac |
561 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31502388 |
tgtggtgaatggttaggtgg-ggtagtaaaatcattataatttctagagatgagcatatattgaaattttttggagtggatgaagtttacaaagttcctc |
31502486 |
T |
|
| Q |
562 |
ttttg |
566 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
31502487 |
ttttg |
31502491 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31019581 - 31019278
Alignment:
| Q |
464 |
tcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccactt |
563 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31019581 |
tcgtgaatgtttaggtgtagggagtagaatcattataatttctagagatgagcatatcttgaatgagtatggagttgatgaagtttacaaagttccactc |
31019482 |
T |
|
| Q |
564 |
ttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactga |
663 |
Q |
| |
|
|||||| || || | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| | || ||||| ||| | || |
|
|
| T |
31019481 |
ttgaatgagaccaactctcttcaattattttgtcaaaaagctttcaaacttgatca---tattatgagtggttatgataaactggcacttgacacgctat |
31019385 |
T |
|
| Q |
664 |
attatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagaga |
763 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| | ||||||| ||| |
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|
| T |
31019384 |
cttatgccaatggcctaccactagcaattaaagtattgggctcatttttgtttggtcgagatatctccgaatggagaagtgcattggctagattgaaaga |
31019285 |
T |
|
| Q |
764 |
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770 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
31019284 |
aagtcca |
31019278 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 464 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31029462 - 31029159
Alignment:
| Q |
464 |
tcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccactt |
563 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31029462 |
tcgtgaatatttaggtgcagggagtagaatcattataatttctagagatgagcatatcttgaatgagtatggagttgatgaagtttacaaagttccactc |
31029363 |
T |
|
| Q |
564 |
ttgaatcaggccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactga |
663 |
Q |
| |
|
|||||| || || | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| | || ||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
31029362 |
ttgaatgagaccaactctcttcaattattttgtcaaaaagctttcaaacttgagca---tgttatgagtggttatgataaaatggcacttgacacactat |
31029266 |
T |
|
| Q |
664 |
attatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagaga |
763 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |
|
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| T |
31029265 |
cttatgccaatggcctaccactagctattaaagtattgggctcatttttgtttggtcgagatatctctgaatggagaagtaaattggctagattgagaga |
31029166 |
T |
|
| Q |
764 |
aagtcca |
770 |
Q |
| |
|
| ||||| |
|
|
| T |
31029165 |
atgtcca |
31029159 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 418 - 569
Target Start/End: Original strand, 31489919 - 31490070
Alignment:
| Q |
418 |
ttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagca |
517 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||| | || ||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |
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|
| T |
31489919 |
ttgataatgttgataaagttggacaacttgataaattgggtgtgaatcgtgaatggttaggtgcagggagtagaatcattataatttctggagatgaaca |
31490018 |
T |
|
| Q |
518 |
tatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaat |
569 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31490019 |
tatcttgaaagagtatggagttgatgtagtttacagagttccactcttgaat |
31490070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31019913 - 31019688
Alignment:
| Q |
129 |
cttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatatctc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||| |||| ||||| ||||| |||| |
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|
| T |
31019913 |
cttttggactcggttgatgatgttcgggttgtaggaatttgtgggatgggtggaatagggaagacaactctggctactgctttatatggtcaaatctctc |
31019814 |
T |
|
| Q |
229 |
atcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaactgt |
328 |
Q |
| |
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||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
31019813 |
atcaatttgatgcacgttgttttattgatgatctaagcaaaatatataga-ca--tgatggtcaagttggtgcacaaaagcaaattctacaccaaactct |
31019717 |
T |
|
| Q |
329 |
cggcatagaacacaatcaaatatgcaatc |
357 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||||||||| |
|
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| T |
31019716 |
tggcaaggaacactttcagatatgcaatc |
31019688 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 368 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31033858 - 31033694
Alignment:
| Q |
368 |
aactaatttgatgcgaataaatctatgtcatgaaagggcccttctgattcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgt |
467 |
Q |
| |
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| T |
31033858 |
aactaatttgatacgactcaagctaggtcatataagagcccttctagttcttgataatgttgatcaagttgaacagcaggagaaattagctgtgagtagt |
31033759 |
T |
|
| Q |
468 |
gaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagta |
532 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31033758 |
gaatgtttaggtgctgggagtagaattgttataacttctagagatgttcatatcttgaaagagta |
31033694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31029794 - 31029569
Alignment:
| Q |
129 |
cttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatatctc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31029794 |
cttttggactcggttgatgatgttcgggttgtaggaatttgtgggatgggtggaatagggaagacaactctgactactgctttatatggtcaaatctctc |
31029695 |
T |
|
| Q |
229 |
atcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttatagatcaggtgatggtcccctcgatgcacaaaagcaaattctacttcaaactgt |
328 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
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| T |
31029694 |
atcaatttgatgcacgttgttttattgatgatctaagcaaaatatataga-ca--tgatggtcaagttggtgcacaaaagcaaattctacaccaaacttt |
31029598 |
T |
|
| Q |
329 |
cggcatagaacacaatcaaatatgcaatc |
357 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
31029597 |
tggcaaggaacactttcagatatgcaatc |
31029569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 31161485 - 31161332
Alignment:
| Q |
414 |
attcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatg |
513 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
31161485 |
attcttgacaatgttgatcaagttgaacaactcgaaaaactagctgag--tcatgaatggttatgtgcggggagtagaatcattataacttttagagatg |
31161388 |
T |
|
| Q |
514 |
agcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaat |
569 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31161387 |
agcatatcttgaaagtgtttgttgtggatgttgtctacaaagttccattgttgaat |
31161332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 473 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 31528181 - 31527894
Alignment:
| Q |
473 |
gttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatcag |
572 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31528181 |
gttaggtgttgggagtagaatcattataatttcgagagatactcatatcttgaataggtatggagtggatgtagttttcaaagttccactcttgaatcaa |
31528082 |
T |
|
| Q |
573 |
gccgagtctcacatgttattttgtcgaaaagctttcaaagttgagaaaattattatgagtgattatcaaaatttggcagatgagatactgaattatgcta |
672 |
Q |
| |
|
| | |||| |||||||| | | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| | | |||| | |||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
31528081 |
actaattctcttcaattattttgccaacaagctttcaaacgtgataa---tattttgagtaattatgacgagttggtatatgagatactaaattatgcta |
31527985 |
T |
|
| Q |
673 |
aaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagaga |
763 |
Q |
| |
|
| || |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
31527984 |
atggcttaccactagcgattaaagcattgggctcatttttgtttggtcgagatatttatgaatggagaagtgcattgactagattgagaga |
31527894 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 278
Target Start/End: Original strand, 31489633 - 31489782
Alignment:
| Q |
129 |
cttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaaatatctc |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||| |||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31489633 |
cttttggactccattgatgatgttcgggttgtaggaatttgtgggatgggtggaatagggaagacaactctggctactgctttatatggtcaaatctctc |
31489732 |
T |
|
| Q |
229 |
atcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaatttataga |
278 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31489733 |
atcaatttgatgcacgttgttttattgatgatctaagcaaaatatataga |
31489782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Original strand, 31245323 - 31245479
Alignment:
| Q |
415 |
ttcttgataatgtagatcaagttggacaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatga |
514 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| | ||| || || |||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31245323 |
ttcttgataatgttgatcaagttgaacaactggataaattggctatgacacgagaatggctaggcacagggagtagaatcatcataatttctagagatgt |
31245422 |
T |
|
| Q |
515 |
gcatatattgaaagagtatggagtggatgtagtttacaaagttccacttttgaatca |
571 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
31245423 |
tcatatcttgagagagcatggagtagatgaagtgtacaaagttcgactcttggatca |
31245479 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 569
Target Start/End: Original strand, 31483094 - 31483223
Alignment:
| Q |
440 |
acaattggaaaaaatagctgtgcgtcgtgaatggttaggtgcagggagtagaattattatcatttctagagatgagcatatattgaaagagtatggagtg |
539 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31483094 |
acaattggagaaactagctgtgactcgtaaatcattagctgcagggagcagaatcattatagtttgtagagatgctcatatcttggaagagtatggagtg |
31483193 |
T |
|
| Q |
540 |
gatgtagtttacaaagttccacttttgaat |
569 |
Q |
| |
|
|| | | |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31483194 |
gacgcactttacaaagttccattcttgaat |
31483223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31150514 - 31150386
Alignment:
| Q |
76 |
caaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcattacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaat |
175 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| |||||||| || | | |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || |
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|
| T |
31150514 |
caaaaaatttagtcgggatgcattctcctctacatgaattagaaaaacatttacttttggactcgcttgatgatgtccgtgttgtaggaatttgtgggat |
31150415 |
T |
|
| Q |
176 |
gggaggaatagggaagacagcccttgcta |
204 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31150414 |
gggtggagtagggaagacaacccttgcta |
31150386 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 658 - 791
Target Start/End: Original strand, 31497408 - 31497541
Alignment:
| Q |
658 |
tactgaattatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagatt |
757 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || | | ||||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31497408 |
tactgcattatgtcaatggcctaccactggcaattaaagtattgggttcatttttgtttgatcgggatataattgaatgggaaagtgcattggttagatt |
31497507 |
T |
|
| Q |
758 |
gagagaaagtccagataataatgtcatggatgtg |
791 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
31497508 |
gagagaaagtccaaacaaagatgtcatggatgtg |
31497541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 31033577 - 31033470
Alignment:
| Q |
687 |
gcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagagaaagtccagataataatgtcatgg |
786 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| || | |||| |
|
|
| T |
31033577 |
gcaattaaagtattgggctcatttt-gtgtggtcgaaatatctctgaatggacaagtgcattggctagattgagagaaaatccaaataaagatattatgg |
31033479 |
T |
|
| Q |
787 |
atgtgctgc |
795 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
31033478 |
atgtgctgc |
31033470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 664 - 791
Target Start/End: Original strand, 31477461 - 31477588
Alignment:
| Q |
664 |
attatgctaaaggtctaccgctagcaattacagtattgggctcatttttgtttggtcgtaatgtgactgaatggaagagtgcattgtccagattgagaga |
763 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||| | ||| | | ||| |
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|
| T |
31477461 |
attatgccaatggcctaccacttgcaattaaagtattgggttcatttttgtttggtcgggatatatctgaatggagaagtgcattggctagactcaaaga |
31477560 |
T |
|
| Q |
764 |
aagtccagataataatgtcatggatgtg |
791 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
31477561 |
aagtccagagaaggatgttatggatgtg |
31477588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31161787 - 31161692
Alignment:
| Q |
97 |
attctcctatagaagcattacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaaga |
192 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| || || ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31161787 |
attctcttacagaagaattagaaaaacatttacttttggattcggttgatgatgtgcgggttgtaggagtttgtgggatgggtggaatagggaaga |
31161692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Original strand, 31245019 - 31245185
Alignment:
| Q |
108 |
gaagcattacaaaatcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatga |
207 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| | |||| || ||||||| ||||||| || ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
31245019 |
gaagaattagaaaagcttttgattatggactcagatgatgatgttcgagtggtagggatttgtggaatgggtggaatagggaagactactcttgctactg |
31245118 |
T |
|
| Q |
208 |
ctttgtatggccaaatatctcatcgatttagtgcatcctgttttattgatgatgtaagcaaaattta |
274 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| ||| |||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31245119 |
ctttgtatgatagaatctctaatcaatttgatgcttgctgctttattgaggatgtaagtaaaattta |
31245185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1749 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1749
Description:
Target: scaffold1749; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 231 - 3
Alignment:
| Q |
22 |
aaaagattgttcggacgataatgaatatattgaagtacaaatcttcatgtgtttcaaaagatttagttaggattaattctcctatagaagcattacaaaa |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| || | |
|
|
| T |
231 |
aaaagattgttcaaacgatcttgaatatattgaagtgcaaatcttcattcgtttcaaaagatttagttgggataaattctcgtacagaagcattaaaaca |
132 |
T |
|
| Q |
122 |
tcatttgcttttggactcggatgatggtgctcgtgttataggaatttgtggaatgggaggaatagggaagacagcccttgctatgactttgtatggccaa |
221 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
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| T |
131 |
tcagttacttttgaattcggttgatggtgttcgtgttataggaatttgggggatgggaggaatagggaagacaacccttgctatgaatttatatggccaa |
32 |
T |
|
| Q |
222 |
atatctcatcgatttagtgcatcctgttt |
250 |
Q |
| |
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|| | |||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
31 |
atctgtcatcgatttgatgcatcctgttt |
3 |
T |
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