View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2046_low_6 (Length: 429)

Name: NF2046_low_6
Description: NF2046
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2046_low_6
NF2046_low_6
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (1-410)||(5146287-5146694)
chr4 (1-408)||(9225701-9226110)
chr4 (1-410)||(16625290-16625701)
chr4 (196-408)||(18860153-18860367)
chr4 (37-390)||(15313695-15314050)
chr4 (37-149)||(4559582-4559694)
chr4 (285-356)||(4559832-4559903)
chr4 (37-266)||(16633867-16634096)
chr4 (308-361)||(48099321-48099374)
chr4 (285-333)||(41900579-41900627)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-410)||(18412037-18412448)
chr7 (1-410)||(49090067-49090478)
chr7 (1-408)||(21987301-21987710)
chr7 (1-410)||(9186442-9186853)
chr7 (1-410)||(21644416-21644827)
chr7 (1-408)||(24262620-24263029)
chr7 (1-408)||(16883308-16883717)
chr7 (1-257)||(5818482-5818738)
chr7 (37-268)||(7071428-7071659)
chr7 (37-408)||(44012961-44013334)
chr7 (34-390)||(3323236-3323594)
chr7 (37-378)||(25352729-25353072)
chr7 (37-390)||(25406791-25407146)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-409)||(888-1297)
scaffold0006 (76-409)||(9044-9378)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (2-410)||(1309250-1309660)
chr3 (1-410)||(3324833-3325246)
chr3 (1-407)||(16262744-16263152)
chr3 (1-408)||(2673517-2673926)
chr3 (1-408)||(32478721-32479130)
chr3 (1-408)||(8515475-8515884)
chr3 (1-408)||(28490470-28490879)
chr3 (1-222)||(9603144-9603365)
chr3 (37-268)||(10898382-10898613)
chr3 (37-390)||(16458842-16459197)
chr3 (37-268)||(29912528-29912759)
chr3 (37-390)||(22624428-22624783)
chr3 (37-268)||(54189885-54190116)
chr3 (37-390)||(10097255-10097610)
chr3 (37-390)||(6304688-6305043)
chr3 (37-149)||(10204383-10204495)
chr3 (40-268)||(10611350-10611578)
chr3 (305-410)||(40771530-40771635)
chr3 (37-266)||(47881463-47881692)
chr3 (290-390)||(10204141-10204241)
chr3 (293-408)||(10611208-10611323)
chr3 (288-356)||(47881371-47881439)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (1-410)||(47100115-47100526)
chr1 (1-408)||(41396620-41397029)
chr1 (1-304)||(9025095-9025400)
chr1 (37-266)||(2399799-2400028)
chr1 (37-390)||(9523105-9523460)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (1-410)||(24556881-24557292)
chr5 (1-410)||(24597913-24598324)
chr5 (1-410)||(28836671-28837082)
chr5 (1-408)||(27448204-27448612)
chr5 (1-408)||(31398289-31398698)
chr5 (1-408)||(43595502-43595911)
chr5 (1-408)||(43628296-43628705)
chr5 (1-345)||(37557921-37558267)
chr5 (196-408)||(33789737-33789951)
chr5 (1-158)||(33789948-33790105)
chr5 (37-268)||(25446864-25447095)
chr5 (290-401)||(31334968-31335079)
chr5 (287-401)||(31302657-31302771)
chr5 (37-149)||(10628736-10628848)
chr5 (367-408)||(37558267-37558308)
chr5 (37-149)||(31781151-31781263)
chr5 (59-118)||(34841293-34841352)
chr5 (192-266)||(10628891-10628965)
chr5 (309-353)||(27641905-27641949)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-405)||(18866967-18867373)
chr8 (1-408)||(10685561-10685970)
chr8 (1-408)||(35743770-35744179)
chr8 (1-300)||(26299839-26300140)
chr8 (1-268)||(18856572-18856839)
chr8 (321-410)||(26299752-26299841)
chr8 (37-380)||(28892141-28892486)
chr8 (37-266)||(21038807-21039036)
chr8 (37-266)||(33034018-33034247)
chr8 (37-149)||(15946040-15946152)
chr8 (37-149)||(16755952-16756064)
chr8 (56-404)||(454276-454625)
chr8 (37-130)||(28329285-28329378)
chr8 (290-390)||(16755709-16755809)
chr8 (290-390)||(28329527-28329627)
chr8 (290-408)||(33034273-33034391)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (1-408)||(14738869-14739278)
chr6 (1-408)||(33332373-33332782)
chr6 (1-410)||(24432618-24433029)
chr6 (1-213)||(29485165-29485377)
chr6 (24-405)||(24077309-24077697)
chr6 (37-390)||(17693304-17693659)
chr6 (37-390)||(13880116-13880471)
chr6 (37-268)||(25943046-25943277)
chr6 (40-266)||(22349546-22349772)
chr6 (110-268)||(35204636-35204794)
chr6 (290-390)||(35204512-35204612)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (1-408)||(15606-16015)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-408)||(19347659-19348068)
chr2 (97-410)||(25394265-25394580)
chr2 (37-390)||(2737582-2737937)
chr2 (37-390)||(22715682-22716037)
chr2 (56-265)||(17933517-17933726)
chr2 (37-390)||(20053209-20053564)
chr2 (37-390)||(39683625-39683980)
chr2 (96-390)||(45568826-45569122)
chr2 (323-388)||(34749910-34749975)
chr2 (288-356)||(17933751-17933819)
chr2 (37-149)||(28456194-28456306)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-410)||(35389-35800)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (37-356)||(17702-18023)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (37-268)||(49779-50010)
[»] scaffold0777 (1 HSPs)
scaffold0777 (333-408)||(187-262)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5146694 - 5146287
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5146694 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggttggttcccgcacttaagcaaaatt 5146595  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5146594 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggtta--gggtc 5146497  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctcaataattctgaattgtggcatttgag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146496 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtatctcaataattctgaattgtggcatttgag 5146397  T
Q  301 attggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcata 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5146396 attggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctaaaaaaagataaattggacaagttagaattttgtgagcattgcata 5146297  T
Q  401 ctaggcaagc 410  Q
    ||||||||||    
T  5146296 ctaggcaagc 5146287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 9225701 - 9226110
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  9225701 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 9225800  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9225801 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaggggtc 9225900  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9225901 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 9226000  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9226001 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattgaacaagctagaattttgtgagcattgca 9226100  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  9226101 tactaggcaa 9226110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 16625290 - 16625701
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16625290 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatgaccgtgaatttattttaagggatttgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 16625389  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  16625390 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgaggtttgtaaagtttcgcatggtgcattgattacgattaaagagtc 16625489  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||     
T  16625490 taaaatgaatggtctatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcaacggtagctagtgttgtacctcataataattttgaattgtggcattta 16625589  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625590 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 16625689  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  16625690 tactaggcaagc 16625701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 196 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18860367 - 18860153
Alignment:
Q  196 gggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctca--ataattctgaattgtggc 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  18860367 gggtctagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggc 18860268  T
Q  294 atttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagca 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18860267 atttgagattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagccaaacaaggtttgctagggaaagataaattggataaactagaattttgtgagca 18860168  T
Q  394 ttgcatactaggcaa 408  Q
    |||||||||||||||    
T  18860167 ttgcatactaggcaa 18860153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 15313695 - 15314050
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15313695 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggctatt 15313794  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||     
T  15313795 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggcttatatattttagaaggttccac 15313894  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctcaataatt--ctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
      |||| | | ||||||||||  |||||||||   ||| | |  |  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  15313895 tataatagctcatgcatcggttcctagtgttgacactctagacataactaaactatggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgag 15313994  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||| ||||| || |||||    
T  15313995 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtga 15314050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 4559582 - 4559694
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4559582 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctagggtatt 4559681  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    | |||||||||||    
T  4559682 gtactagaattga 4559694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 356
Target Start/End: Original strand, 4559832 - 4559903
Alignment:
Q  285 aattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctag 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4559832 aattgtggcatttgaggttgggtcatgtcagtgagaggggtttggttgagctagctaaacaaggtttgctag 4559903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 16633867 - 16634096
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||| | | ||||||||| | ||| | || |||||  ||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16633867 atgtttgatgactgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcataaagttaagagaaaattaatatctataagcatgtttgatggtctaggatatt 16633966  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    | ||||||||||| | |||  |   || ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||     
T  16633967 gtactagaattgaacgtggtatgattagaatttctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacattgtttatatattttagaaggttccac 16634066  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
     || || | | |||||||||| ||||||||    
T  16634067 tgttatagctgatgcatcggttgctagtgt 16634096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48099374 - 48099321
Alignment:
Q  308 catgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaa 361  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  48099374 catgttaattaaagaggttttgttgaactagctaaacaaaatttacttgaaaaa 48099321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41900627 - 41900579
Alignment:
Q  285 aattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttga 333  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41900627 aattatggcatttgaggttatggcatgttagtgaaagagttttagttga 41900579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18412448 - 18412037
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18412448 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 18412349  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18412348 taatttccctaagcatgtttgatggtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaggggtc 18412249  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18412248 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 18412149  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412148 aggttggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 18412049  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  18412048 tactaggcaagc 18412037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49090478 - 49090067
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49090478 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggctgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 49090379  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49090378 taatttccttaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattaagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 49090279  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49090278 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 49090179  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49090178 agattggagcatgttagtgaaagaggtttagttgaactaactaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtaagcattgca 49090079  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  49090078 tactaggcaagc 49090067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21987710 - 21987301
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  21987710 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaaacgaaatt 21987611  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21987610 taatttccctaagaatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaaggatc 21987511  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21987510 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttatacctcataataattctgaattgtggcatttg 21987411  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21987410 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttaaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagatacattggacaagctagaattttgtaagcattgca 21987311  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  21987310 tactaggcaa 21987301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 9186442 - 9186853
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  9186442 tgcaaagtccaaggcatgggcatcgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaagtttgttcccgaacttaagcgaaatt 9186541  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9186542 taatttccctaagcatgtttgatagtataggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 9186641  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9186642 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcgtttgctagtgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 9186741  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9186742 agtttggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggttttctagtaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 9186841  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  9186842 tactaggcaagc 9186853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21644827 - 21644416
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21644827 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 21644728  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  21644727 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttgaggggtc 21644628  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21644627 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctaatgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 21644528  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21644527 aggttggggcatgttagtgaaagagatttagttgaactagctaaacaagatttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcaatgca 21644428  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  21644427 tactaggcaagc 21644416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 24262620 - 24263029
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  24262620 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 24262719  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  24262720 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 24262819  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24262820 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 24262919  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24262920 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 24263019  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  24263020 tactaggcaa 24263029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16883717 - 16883308
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16883717 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 16883618  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16883617 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 16883518  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16883517 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 16883418  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16883417 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggataagctagaattttgtgaacattgca 16883318  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  16883317 tactaggcaa 16883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5818482 - 5818738
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| | | |||||    
T  5818482 tgcaaagtccaaggcatgggaaacgttcgtctaaagatgtttgatggtcgtgaattccttctaacggatgtgacgtttgttcccgaacttgaacgaaatt 5818581  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5818582 taattttcctaagcatgttagatagtataggttattgcactaaaattgagcatggagtttgtcaaattttgcatgatgcattcattacagttaaagggtc 5818681  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggt 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5818682 taagatgaatggtttatacattttagatgatttcatagtaattggtaatgcatcggt 5818738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 7071428 - 7071659
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7071428 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgagaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 7071527  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  7071528 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 7071627  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  7071628 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttg 7071659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44013334 - 44012961
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44013334 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaagataaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggatatt 44013235  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    | ||||||||||| | |||  |    | |||    |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  44013234 gtactagaattgaacgtggtatgataagaatctctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 44013135  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
      | || | | |||||||||| |||||||| |   |||     ||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  44013134 cattatagctcatgcatcggttgctagtgtagacgctctggacataa--ctaaattgtggcatttgaggttgggtcatgttagtgagagcggtttggttg 44013037  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaa 408  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||| ||||| || |||||  |||||| | |||||||    
T  44013036 agctagctaaacaagttttgctagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtgataattgcacattaggcaa 44012961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3323594 - 3323236
Alignment:
Q  34 aagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggtt 133  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  3323594 aagatgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggct 3323495  T
Q  134 attgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttc 233  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||||| |||||    
T  3323494 attgcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctgaaatacaaggtctatatattttagaaggttc 3323395  T
Q  234 catagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttag 329  Q
     |  ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |    
T  3323394 taccgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactcgggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgaaaggggtttgg 3323297  T
Q  330 ttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  3323296 tggagctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 3323236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 378
Target Start/End: Original strand, 25352729 - 25353072
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25352729 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 25352828  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  25352829 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaaaggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 25352928  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctcaataatt--ctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | ||||||| || |||||||  |   ||| | |  |  || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  25352929 cgtaatagctcatgcatcagttgctagtggagacactctagacgtaactaaattgtggcatttgaggttgggtcatgtcagtgagaggggtttggttgag 25353028  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagct 378  Q
    |||||||||||||  |||||||  || || |||||| |||||||    
T  25353029 ctagctaaacaagggttgctagggaatgaaaaattgaacaagct 25353072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 25406791 - 25407146
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25406791 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 25406890  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |     
T  25406891 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctgaaatacaaggtctatatattttagaaggttctac 25406990  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  25406991 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtgg 25407088  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  25407089 agctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 25407146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1297 - 888
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1297 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggtcttgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 1198  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1197 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgcgg-ttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 1099  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1098 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagcgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 999  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  998 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacagggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 899  T
Q  399 tactaggcaag 409  Q
    ||||| |||||    
T  898 tactaagcaag 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9378 - 9044
Alignment:
Q  76 tttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatg 175  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  9378 tttgttcccgaacttaagcgaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgcggtt-gtaaaatttcgcatg 9280  T
Q  176 atgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctca 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | ||||    
T  9279 gtgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagagttaaaactca 9180  T
Q  276 --ataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggac 373  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  9179 taataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacagggtttgctaggaaaagataaattggac 9080  T
Q  374 aagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9079 aagctagaattttgtgagcattgcatactaagcaag 9044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1309660 - 1309250
Alignment:
Q  2 gcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaattt 101  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  1309660 gcaacgtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaattt 1309561  T
Q  102 aatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  1309560 aatttccctaagcatgtttgatagcctaggttattgcactagaattgagcatgggatttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaagggatct 1309461  T
Q  202 aaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1309460 aaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttga 1309361  T
Q  300 gattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcat 399  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1309360 ggttgaggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcat 1309261  T
Q  400 actaggcaagc 410  Q
    |||||| ||||    
T  1309260 actaggaaagc 1309250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 3324833 - 3325246
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3324833 tgcaaagcccaaggcatgggcaccgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 3324932  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3324933 taatttccctaagcatgtttgatagtataggttattgtactagaattgagcatggggtttgtaaaatctcacatggtgcattgattacggttaaagggtc 3325032  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  3325033 taaaatgaatggtttatacattttagatggttctatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattctaaattgtggcatttg 3325132  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtt--tagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3325133 agattggggcatgttagtgaaagaggtttatagttgaactagctaaacaagatttgttaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattg 3325232  T
Q  397 catactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||||    
T  3325233 catactaggcaagc 3325246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16263152 - 16262744
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16263152 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 16263053  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  16263052 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactaaaatttggcatggggtttgtaaaatttcgaatggtgcattgataacgattaaagggtc 16262953  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  16262952 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcagtagctagtgttgtacctcataatagttctgaattgtggcatttg 16262853  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16262852 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagccaaacaaggttttctaggaaaaaataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 16262753  T
Q  399 tactaggca 407  Q
    |||||||||    
T  16262752 tactaggca 16262744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 2673517 - 2673926
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  2673517 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggttttttcccgaacttaagcgaaatt 2673616  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2673617 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 2673716  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2673717 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 2673816  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2673817 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 2673916  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  2673917 tactaggcaa 2673926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32479130 - 32478721
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  32479130 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 32479031  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  32479030 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 32478931  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32478930 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 32478831  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32478830 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 32478731  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  32478730 tactaggcaa 32478721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8515884 - 8515475
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  8515884 tgcaaagtccaaggcatgggaaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 8515785  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  8515784 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 8515685  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8515684 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 8515585  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8515584 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 8515485  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  8515484 tactaggcaa 8515475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 28490470 - 28490879
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  28490470 tgcaaagtccaaggtatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggttttttcccgaacttaagcgtaatt 28490569  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28490570 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaggggtc 28490669  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28490670 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccttagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 28490769  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28490770 agattggggtatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattgtacaagctagaattttgtgagcattgca 28490869  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  28490870 tactaggcaa 28490879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9603144 - 9603365
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||| ||| |  |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  9603144 tgcaaagtccaaagcatggacaatattcgtctatagatgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgctcccaaacttaagcgaaatt 9603243  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  9603244 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcacatggtgcattgattatggttaaatggtc 9603343  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9603344 taaaatgaatggtttatacatt 9603365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 10898382 - 10898613
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10898382 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 10898481  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10898482 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatatatggtttatatattttagaaggttccat 10898581  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  10898582 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttg 10898613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 16458842 - 16459197
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | |||||||| || | |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16458842 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaagtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatgatctaggctatt 16458941  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  16458942 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 16459041  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||   |||   || || | ||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| |||||     
T  16459042 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctggatataactaaactttggcatttgaggttaggtcatgttagtgagagggatttggttgag 16459141  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  16459142 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 16459197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29912759 - 29912528
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29912759 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctaaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 29912660  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| |||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  29912659 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattgattatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 29912560  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  29912559 cgtaatagctgatgcatcggttgctagtgttg 29912528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22624783 - 22624428
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22624783 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 22624684  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  22624683 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 22624584  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  22624583 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactatggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttg 22624486  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | ||||||||||||| |||||||   || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  22624485 agctagctaaacaaggtttgctatggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 22624428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 54189885 - 54190116
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54189885 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 54189984  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||     
T  54189985 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggcttatatattttagaaggttccac 54190084  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  54190085 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttg 54190116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10097610 - 10097255
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10097610 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 10097511  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |     
T  10097510 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctaaaatacaaggtctatatattttagaaggttctac 10097411  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  10097410 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtgg 10097313  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  10097312 agctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttttgtga 10097255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 6304688 - 6305043
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6304688 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 6304787  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || ||| |||||| ||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |     
T  6304788 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaggggtctgaaatacaaggtctatatattttagaaggttctac 6304887  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |    
T  6304888 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactcgggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgaaaggggtttggtgg 6304985  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | | ||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  6304986 agcgagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 6305043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10204495 - 10204383
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10204495 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 10204396  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    |||||||||||||    
T  10204395 gcactagaattga 10204383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10611578 - 10611350
Alignment:
Q  40 tttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgca 139  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10611578 tttgatgcccgtgatttccttttgaaggatatgaggtatattcctgaactgaagagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggatattgca 10611479  T
Q  140 ctagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagt 239  Q
    |||||||||| |||||  |    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||  ||    
T  10611478 ctagaattgaacatggtatgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggcttatatattttagaaggttccactgt 10611379  T
Q  240 aattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
    ||| | | |||||||  | ||||||||||    
T  10611378 aatagctcatgcatcaattgctagtgttg 10611350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40771635 - 40771530
Alignment:
Q  305 gggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactag 404  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  40771635 gggcatgttagtgaaaggagtttggttgtactagctaagaaagatttgtaaggaaaagataaattggagaaactaaaattttgtgataattgcaaactag 40771536  T
Q  405 gcaagc 410  Q
    | ||||    
T  40771535 gaaagc 40771530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47881692 - 47881463
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| || |||  | ||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||   ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47881692 atgtttgatgaccttgatttgcttttgaaggatgcgaggtatattcctgaacttaaaagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggatatt 47881593  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    | ||||||||||| | |||  |    | ||||   |||| ||||||| |||    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  47881592 gtactagaattgaacgtggtatgatgagaatttctcatggtgcattggttataactaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 47881493  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  47881492 tgtaatagctcatgcatcggttgctagtgt 47881463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10204241 - 10204141
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || ||||    
T  10204241 tggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtggagctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtg 10204142  T
Q  390 a 390  Q
    |    
T  10204141 a 10204141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10611323 - 10611208
Alignment:
Q  293 catttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagc 392  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  10611323 catttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgagctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtgatc 10611224  T
Q  393 attgcatactaggcaa 408  Q
    | |||| | |||||||    
T  10611223 actgcacattaggcaa 10611208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47881439 - 47881371
Alignment:
Q  288 tgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctag 356  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  47881439 tgtggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgagctagccaaacaaggtttgctag 47881371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 47100115 - 47100526
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47100115 tgcaaagtccaaggcatgggcactgttcgtctaaagatgtttgatgaccgtgaattcctattaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 47100214  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  47100215 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgtattgattacgattaaagggtc 47100314  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  47100315 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattctaaattgtggcatttg 47100414  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47100415 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 47100514  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    || |||||||||    
T  47100515 tattaggcaagc 47100526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 41397029 - 41396620
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41397029 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgtttgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 41396930  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  41396929 taatttccataagcatgtttgacaatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 41396830  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41396829 tagaatgaacggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcgatagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 41396730  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41396729 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 41396630  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  41396629 tactaggcaa 41396620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 9025095 - 9025400
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  9025095 tgcaaagtccaaggcatgggcaccgttcgtctaaagatgtttgattgttgtgaattccttctaaggtatgtgaggtttgttcccgaacttatgcgaaatt 9025194  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||  ||||| ||| || |||||  ||||||||||    
T  9025195 taatttccctaaacatgtttgatagtctagattattgcattagaattgaatatggggtttatgaaatttcgcatggtgctttaattactcttaaagggtc 9025294  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  9025295 taaaatgaatggtttatacattttagatggttctatagtaattggtaatgtatcggcagctagtgtagtacctcataataattctgaattatggcatttg 9025394  T
Q  299 agattg 304  Q
    ||||||    
T  9025395 agattg 9025400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2400028 - 2399799
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2400028 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatttataagcatgtttgatggtctaggatatt 2399929  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||     
T  2399928 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatgatttatatattttagaaggttccac 2399829  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  2399828 tgtaatagctcatgcatcggttgctagtgt 2399799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 9523105 - 9523460
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| |  ||| |||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9523105 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaatgatttgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 9523204  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||     
T  9523205 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatatctaaagggtctaaaatacatgctttatatattttagaaggttccac 9523304  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||   |||   || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  9523305 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctggatataactaaactatggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgag 9523404  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||| ||||| || |||||    
T  9523405 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtga 9523460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 24556881 - 24557292
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24556881 tgcaaagtccaaggcatgggcaccgttcgtctaaagatgtttgatagccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 24556980  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24556981 taatttcccttagcatgtttgatagtttaggatattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 24557080  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24557081 taaaatgaatggtttatacatttcagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattatgaattgtggcatttg 24557180  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24557181 agattggggcatgttagtgaaagagatttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattagacaagctagaattttgtgagcattgca 24557280  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||| ||||    
T  24557281 tactaggaaagc 24557292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 24597913 - 24598324
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24597913 tgcaaagtccaaggcatgggcaccgttcgtctaaagatgtttgatagccgtgaattccttttaaaggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 24598012  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24598013 taatttcccttagcatgtttgatagtttaggatattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 24598112  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24598113 taaaatgaatggtttatacatttcagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgtacctcataataattatgaattgtggcatttg 24598212  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24598213 agattggggcatgttagtgaaagagatttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattagacaagctagaattttgtgagcattgca 24598312  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||| ||||    
T  24598313 tactaggaaagc 24598324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28837082 - 28836671
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28837082 tgcaaagtccaaggcatgggcaccgtttgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaaaggatgtgagatttgttcccgaacttaagcgaaatt 28836983  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28836982 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgaggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 28836883  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28836882 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcaccggtagctagtgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 28836783  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28836782 agattggagcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagttaaacaaggtttgctgggaaaagatgaattggacaagatagaattttgtgagcattgca 28836683  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||| ||||    
T  28836682 tactaggaaagc 28836671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27448612 - 27448204
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  27448612 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 27448513  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  27448512 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaggggta 27448413  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27448412 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 27448313  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448312 agatt-gggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 27448214  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  27448213 tactaggcaa 27448204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 31398289 - 31398698
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  31398289 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 31398388  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  31398389 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcagtagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 31398488  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31398489 tagaatgaatggtttatacattttagatggttctatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 31398588  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31398589 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 31398688  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  31398689 tactaggcaa 31398698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43595911 - 43595502
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43595911 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaatatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtaaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 43595812  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  43595811 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcactgattacggttaaggggtc 43595712  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43595711 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 43595612  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43595611 agattggggcatgttcgtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 43595512  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||| ||||    
T  43595511 tactaagcaa 43595502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43628705 - 43628296
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43628705 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaatatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtaaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 43628606  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  43628605 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcactgattacggttaaggggtc 43628506  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43628505 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 43628406  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43628405 agattggggcatgttcgtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 43628306  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||| ||||    
T  43628305 tactaagcaa 43628296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 37557921 - 37558267
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37557921 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 37558020  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  37558021 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattactattaaggggtc 37558120  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37558121 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 37558220  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaaca 345  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37558221 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaaca 37558267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 196 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33789951 - 33789737
Alignment:
Q  196 gggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctca--ataattctgaattgtggc 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  33789951 gggtctagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggc 33789852  T
Q  294 atttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagca 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  33789851 atttgagattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggataagctagaattttgtaaaca 33789752  T
Q  394 ttgcatactaggcaa 408  Q
    |||||||||||||||    
T  33789751 ttgcatactaggcaa 33789737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33790105 - 33789948
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33790105 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcatctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 33790006  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggt 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33790005 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggt 33789948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 25446864 - 25447095
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25446864 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaatgatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 25446963  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    |  |||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  25446964 gcactagaattgaacgtggtgtgatgaggatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 25447063  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  25447064 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttg 25447095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31335079 - 31334968
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    |||||||| || || ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31335079 tggcatttaaggttagggaatgctagtgaaagtgatttagtagaactagctaaacaagatttcctaggaaaatataaattggaaaagctagaattttatg 31334980  T
Q  390 agcattgcatac 401  Q
    |  |||||||||    
T  31334979 atgattgcatac 31334968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31302771 - 31302657
Alignment:
Q  287 ttgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaatttt 386  Q
    ||||||||||| || || ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31302771 ttgtggcatttaaggttagggaatgctagtgaaagtgatttagtagaactagctaaacaaggttttctaggaaaatataaattggaaaagctagaatttt 31302672  T
Q  387 gtgagcattgcatac 401  Q
     |||  |||||||||    
T  31302671 atgatgattgcatac 31302657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 10628736 - 10628848
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10628736 atgtttgatgaccgtgatttctttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggatatt 10628835  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    | |||||||||||    
T  10628836 gtactagaattga 10628848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Original strand, 37558267 - 37558308
Alignment:
Q  367 attggacaagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaa 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37558267 attggacaagctagaattttgtgaacattgcatactaggcaa 37558308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31781263 - 31781151
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||| ||| ||||||  ||||||| | | |||||| || | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  31781263 atgtttaatgaccgtgatttccttttgaagaatgtgatgtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttaatggtctaggatatt 31781164  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    | |||||||||||    
T  31781163 gtactagaattga 31781151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34841352 - 34841293
Alignment:
Q  59 ttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgt 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34841352 ttttaagggatgtgaggtatgctcctaaaatttagcaaaatttaatttccataagcatgt 34841293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Original strand, 10628891 - 10628965
Alignment:
Q  192 taaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || || | | |||||||||| ||||||||    
T  10628891 taaagggtctaaaatacatggtttatatattttagacggttccattgttatagctcatgcatcggttgctagtgt 10628965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27641949 - 27641905
Alignment:
Q  309 atgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgc 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  27641949 atgttagtgaaaggggtttagttgaactaattaaacaagttttgc 27641905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 18866967 - 18867373
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18866967 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 18867066  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18867067 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaggggtc 18867166  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18867167 tagaatgaatggtttatatattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 18867266  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18867267 aggttggggcatgttagtgaaaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 18867366  T
Q  399 tactagg 405  Q
    |||||||    
T  18867367 tactagg 18867373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 10685561 - 10685970
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  10685561 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtatgttcccgaacttaagcgaaatt 10685660  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  10685661 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 10685760  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10685761 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 10685860  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10685861 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 10685960  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  10685961 tactaggcaa 10685970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35744179 - 35743770
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35744179 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 35744080  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  35744079 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacgattaaggggtc 35743980  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35743979 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagcaagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 35743880  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35743879 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggataagctagaattttgtgaacattgca 35743780  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  35743779 tactaggcaa 35743770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26300140 - 26299839
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  26300140 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtgtaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 26300041  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26300040 taatttccataaccatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgaacatggggtttgtaaaatttcgtatggtgcattgattacggttaaggggtc 26299941  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26299940 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcgatagctagcgttgtacctcataataattctgaattgtggcatttg 26299841  T
Q  299 ag 300  Q
    ||    
T  26299840 ag 26299839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 18856572 - 18856839
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18856572 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 18856671  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18856672 taatttccctatgtatgtttgataatctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattttgcatggtgcattgattacggttaaggggtc 18856771  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18856772 tagaatgaatggtttatatattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttg 18856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 321 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26299841 - 26299752
Alignment:
Q  321 gaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaagc 410  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299841 gaggtttagttgaattagcaaaacaaggtttgataggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaagc 26299752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Original strand, 28892141 - 28892486
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28892141 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 28892240  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  28892241 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 28892340  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  28892341 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactatggcatttgagattaggtcatgtcagtgagaggggtttggtgg 28892438  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctag 380  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||    
T  28892439 agctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctag 28892486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 21038807 - 21039036
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21038807 atgtttgatgaccatgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggcaaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggctatt 21038906  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | |||  |    | ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  21038907 gcactagaattgaacgtggtatgatgagaatttctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 21039006  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  21039007 tgtaatagctcatgcatcggttgctagtgt 21039036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 33034018 - 33034247
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||| ||| ||||||  ||||||| | || |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||    
T  33034018 atgtttaatgaccgtgatttccttttgaagggtgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggatttt 33034117  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | |||  |    | ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  33034118 gcactagaattgaacgtggtatgatgagaatttttcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 33034217  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  33034218 tgtaatagctcatgcatcggttgctagtgt 33034247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Original strand, 15946040 - 15946152
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | | ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15946040 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctaaacttaagagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggttatt 15946139  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    | |||||||||||    
T  15946140 gtactagaattga 15946152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16756064 - 16755952
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16756064 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 16755965  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    |||||||||||||    
T  16755964 gcactagaattga 16755952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 404
Target Start/End: Original strand, 454276 - 454625
Alignment:
Q  56 tccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgg 155  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||| || |||||||  |||| || | | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||   |||     
T  454276 tccttttaaggcatgtgacatatgatcctgaacctatgcaaaatgcaattcccattaacatgtttgataatctaagttattgcactaaaattgtatatga 454375  T
Q  156 ggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcg 255  Q
    | | |||||| ||  | ||| |||||| |||||  ||||| | | ||| |||  || ||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||| ||||    
T  454376 gatgtgtaaatttc-gaatggtgcattaattactcttaaatgttttaagatgtttgatttatacattttagatggttttattgtaattgatcatgtatcg 454474  T
Q  256 gtggctagtgttgtacctca--ataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgc 353  Q
     | |||||||  | | ||||  |||| | ||||||||||||||| || |     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||      
T  454475 ttagctagtgcagcatctcataataaatttgaattgtggcatttaaggtgacaacatgttagtgaaagaggtttagtagaactagccaaacaaggttttt 454574  T
Q  354 tagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactag 404  Q
    ||| || ||| || ||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  454575 taggaagagaaaatttggataagctagaatttcgcaatcattgcatactag 454625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Original strand, 28329285 - 28329378
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctag 130  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28329285 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctag 28329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16755809 - 16755709
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || ||||    
T  16755809 tggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtggagctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtg 16755710  T
Q  390 a 390  Q
    |    
T  16755709 a 16755709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Original strand, 28329527 - 28329627
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || ||||    
T  28329527 tggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtggagctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtg 28329626  T
Q  390 a 390  Q
    |    
T  28329627 a 28329627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 408
Target Start/End: Original strand, 33034273 - 33034391
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||  || || |||||| |||| ||||| || ||||    
T  33034273 tggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgagctagctaaacaaggtttgttagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtg 33034372  T
Q  390 agcattgcatactaggcaa 408  Q
    |  |||||| | |||||||    
T  33034373 ataattgcacattaggcaa 33034391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 14738869 - 14739278
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  14738869 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgtaatt 14738968  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  14738969 taatttccctaagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 14739068  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14739069 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 14739168  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14739169 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 14739268  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  14739269 tactaggcaa 14739278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 33332373 - 33332782
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33332373 tgcaaagtccaaggcacgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 33332472  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  33332473 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 33332572  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg--tacctcaataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33332573 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagccagtgttgcatatcataataattctgaattgtggcatttg 33332672  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33332673 aggttggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagcttgaattttgtgaacattgca 33332772  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  33332773 tactaggcaa 33332782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 24432618 - 24433029
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||| ||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24432618 tgcacagtccaaggcgtgggcaccgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 24432717  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24432718 taatttccataagcatatttgatagtctaggttattgtactagaattgagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggttaaagggtc 24432817  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  24432818 taaaatgattggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcagtagctagtgtagtacctcataataattccaaattgtggcatttg 24432917  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24432918 aaattgggtcatgttagtgaaagagttttagttgaactatctaaacaaggtttgctaggaaaatatagattggacaagctagaattttgtgagagttgca 24433017  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||||||||    
T  24433018 tactaggcaagc 24433029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29485377 - 29485165
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29485377 tgcaaagtccaaggcatgggcaacattcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 29485278  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29485277 taatttccctaagcatgtttaatagtctaggttattgcactagaattgagcatgaggtttgtaaaatttcgcagggtgcattgattacggttaaagggtc 29485178  T
Q  201 taaaatgaatggt 213  Q
    |||||||||||||    
T  29485177 taaaatgaatggt 29485165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24077697 - 24077309
Alignment:
Q  24 cgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgat 123  Q
    ||||||| |||| |||||||||  || |||| || || ||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  24077697 cgttcgtttaaatatgtttgatatccatgaattcattctaagggatgtgagataggttcttgaacataagcgaactttaatttccataagcatgtttgat 24077598  T
Q  124 agtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaa-attgagcatgatgcattgattacggt----taaagggtctaaaatgaatggtttata 218  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||| | |||| |||| | |    |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24077597 agtctaggttattgtactaggattgagcatgaggtttgtaaattttttgcatggtacattaattaggttattgtaaaaggtctaagatgaatggtttata 24077498  T
Q  219 cattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  ||| ||| | | | |  |  |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||  ||    
T  24077497 cattttagatggttccattgtaattggtcatgcatcattaactactgtagcatcacatacaaattctaaattgtggcatttaaggttagggaatgtcggt 24077398  T
Q  317 gaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactagg 405  Q
    ||| |||||||| |  ||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24077397 gaacgaggtttaatataatgagctaaacaaggtttgcaaggaaaagataaattggataagttagaattttgtgatcattgcatactagg 24077309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17693659 - 17693304
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17693659 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 17693560  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||     
T  17693559 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggcttatatattttagaaggttccac 17693460  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||  ||||   || || | || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  17693459 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctgaatataactaaactatgacatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggttgag 17693360  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  17693359 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagaattctgtga 17693304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 13880116 - 13880471
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13880116 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 13880215  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |     
T  13880216 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctaaaatacaaggtctatatattttagaaggttctac 13880315  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  13880316 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtgg 13880413  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13880414 agctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttttgtga 13880471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 25943046 - 25943277
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25943046 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 25943145  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    |  |||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  25943146 gcactagaattgaacgtggtgtgatgaggatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatatatggtttatatattttagaaggttctac 25943245  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  25943246 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttg 25943277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22349772 - 22349546
Alignment:
Q  40 tttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgca 139  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22349772 tttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggttaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggctattgca 22349673  T
Q  140 ctagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagt 239  Q
    |||||||||| | |||  |    | ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||  ||    
T  22349672 ctagaattgaacgtggtatgatgagaatttctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattgtagaaggttccactgt 22349573  T
Q  240 aattggtaatgcatcggtggctagtgt 266  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||    
T  22349572 aatagctcatgcatcggttgctagtgt 22349546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35204794 - 35204636
Alignment:
Q  110 taagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaa 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  |    
T  35204794 taagcatgtttgatggtctaggctattgcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctaaaataca 35204695  T
Q  210 tggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||| | ||||||||    
T  35204694 gggtttatatattttagaaggttctaccgtaatagcaaatgcatcggttgatagtgttg 35204636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35204612 - 35204512
Alignment:
Q  290 tggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtg 389  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||  || || |||||| |||||||||| || ||||    
T  35204612 tggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtggagctagctaaacaaggttttctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtg 35204513  T
Q  390 a 390  Q
    |    
T  35204512 a 35204512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 15606 - 16015
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15606 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 15705  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  15706 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacggtaaaggggtc 15805  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15806 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 15905  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15906 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggacaagctagaattttgtgaacattgca 16005  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  16006 tactaggcaa 16015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19348068 - 19347659
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19348068 tgcaaagtccaaggcatgggcaacgttcgtctaaagatgtttgatggccgtgaattccttttaagggatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 19347969  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  19347968 taatttccataagcatgtttgataatctaggttattgcactagaatagagcatggggtttgtaaaatttcgcatggtgcattgattacgattaaggggtc 19347869  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19347868 tagaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtagctagtgttgcatctcataataattctgaattgtggcatttg 19347769  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19347768 agattggggcatgttagtgagaggggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctagggaaagataaattggataagctagaattttgtgaacattgca 19347669  T
Q  399 tactaggcaa 408  Q
    ||||||||||    
T  19347668 tactaggcaa 19347659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 97 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25394580 - 25394265
Alignment:
Q  97 aatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |    
T  25394580 aatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcacggggtttgtaaaattttgcatggtgcattgattacggttaagg 25394481  T
Q  197 ggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggca 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25394480 ggtcttaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtaactagtgttgtacctcataataattctgaattgtggca 25394381  T
Q  295 tttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25394380 tttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaaggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgcgagcat 25394281  T
Q  395 tgcatactaggcaagc 410  Q
    ||||| ||||||||||    
T  25394280 tgcatgctaggcaagc 25394265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 2737582 - 2737937
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2737582 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctaaacttaggagaaatttaatatccgtaagcatgtttgatggtctaggctatt 2737681  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  2737682 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 2737781  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |    
T  2737782 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactctggacataa--ctaaactttggcatttgaggttaggtcatgtcagtgagagaggtttggtgg 2737879  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  2737880 agctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 2737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22716037 - 22715682
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | |||||||| || | |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22716037 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaaggatgtgaagtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatgttctaggctatt 22715938  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| |||    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||     
T  22715937 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatatctaaagggtctaaaatacatgttttatatattttagaaggttccac 22715838  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||   |||   || || | ||||||||||| || || ||||||||||| || | ||| |||||     
T  22715837 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctggatataactaaactttggcatttgaggttaggtcatgttagtgagagggatttggttgag 22715738  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  22715737 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 22715682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 265
Target Start/End: Original strand, 17933517 - 17933726
Alignment:
Q  56 tccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatgg 155  Q
    ||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  17933517 tccttttgaaggatgttaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctattgcactagaattgaacgtgg 17933616  T
Q  156 ggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcg 255  Q
     ||    | ||||   |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | | ||||||||    
T  17933617 tgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccaccgtaatagctcatgcatcg 17933716  T
Q  256 gtggctagtg 265  Q
    || |||||||    
T  17933717 gttgctagtg 17933726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20053564 - 20053209
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20053564 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaaggatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatctataagcatgtttgatggtctaggctatt 20053465  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | |||  |    | ||||   |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||     
T  20053464 gcactagaattgaacgtggtatgatgagaatttctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggcttatatattttagaaggttccac 20053365  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||   |||  ||     || || | ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||     
T  20053364 cgtaatagctcatgcatcggttgctagtgttgacactctgaacgtaactaaactatggcatttgaggttaggtcatgttagtgagaggggtttggttgag 20053265  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  || || |||||| |||| ||||| || |||||    
T  20053264 ctagctaaacaaggttttctagggaatgaaaaattgaacaaactagatttctgtga 20053209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 390
Target Start/End: Original strand, 39683625 - 39683980
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39683625 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 39683724  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || ||| |||||| ||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |     
T  39683725 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaggggtctgaaatacaaggtctatatattttagaaggttctac 39683824  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc--aataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaa 334  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||  || |   || || | || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||     
T  39683825 cgtaatagcaaatgcatcggttgctagtgttgacactcggaacataactaaactttgacatttgaggttaggtcatgtcagtgagaggggtttggtggag 39683924  T
Q  335 ctagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  39683925 ctagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 39683980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 390
Target Start/End: Original strand, 45568826 - 45569122
Alignment:
Q  96 aaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaa 195  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||| || ||||    
T  45568826 aaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctattgcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttatggctaaa 45568925  T
Q  196 gggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacctc----aataattctgaattgtg 291  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||| ||||||||||   |||     ||||  || || | ||    
T  45568926 gggtctaaaatacaaggtctatatattttagaaggttctaccgtaatagaaaatgcatcggttgctagtgttgacactcgggacataa--ctaaactttg 45569023  T
Q  292 gcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtga 390  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||  || || |||||| |||||||||| || |||||    
T  45569024 gcatttgaggttaggtcatgtcagtgaaaggggtttggtggagcaagctaaacaaggtttgctagggaatgaaaaattgaacaagctagatttctgtga 45569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34749975 - 34749910
Alignment:
Q  323 ggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgt 388  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  34749975 ggtttagttgaactagtttaacaagatttgctaggaatagataaattagagaaactataattttgt 34749910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 17933751 - 17933819
Alignment:
Q  288 tgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctag 356  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  17933751 tgtggcatttgaggttgggtcatgtcagtgagaggggtttggttgagctagctaaacaagggttgctag 17933819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28456306 - 28456194
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | | ||||||||| | || | |||||| ||  ||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  28456306 atgtttgatgaccgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatatttccgaacttgagagaaatttaatatctataagcatatttgatggtctaggatatt 28456207  T
Q  137 gcactagaattga 149  Q
    | |||||||||||    
T  28456206 gtactagaattga 28456194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35800 - 35389
Alignment:
Q  1 tgcaaagtccaaggcacgagcaacgttcgtataaagatgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatt 100  Q
    |||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35800 tgcaaaatccaagtcatgggcaccgttcgtctaaagatctttgatggccgtgaattccttctaagagatgtgaggtttgttcccgaacttaagcgaaatt 35701  T
Q  101 taatttccctaagcatgtttgatagtctaggttattgcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtc 200  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||| | ||||    
T  35700 taatttccagaagcatgttttataggctaggttattgcactataattgagcatggggtttgtaaaattttgcatggtgcattaattacagttataaggtc 35601  T
Q  201 taaaatgaatggtttatacattttagatggttccatagtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacct--caataattctgaattgtggcatttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  35600 taaaattaatggtttatatattttaaatggttccatagtaattggtaatgcatcggtaggtagtgtagcaccttataataattatgaattgtggcatttg 35501  T
Q  299 agattggggcatgttagtgaaagaggtttagttgaactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 398  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35500 agattgggaaatgttagtgaaagaggtttagttgaacaagctaaacacggtttgctaggaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgca 35401  T
Q  399 tactaggcaagc 410  Q
    ||||||| ||||    
T  35400 tactaggaaagc 35389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 356
Target Start/End: Original strand, 17702 - 18023
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| | |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17702 atgtttgatgaccgtgatttccttgtgaaagatgtgaggtatattcctgaacttaagagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggatatt 17801  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | |||    |||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  17802 gcactagaattgaacgtggagtgatgagaatctctcatggtgcattagttatagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttccac 17901  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttgtacct----caataattctgaattgtggcatttgagattggggcatgttagtgaaagaggtttagttg 332  Q
     ||||| | | |||||||||| |||||||| |   ||      ||||  || || | | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17902 tgtaatagctcatgcatcggttgctagtgtagacactttggacataa--ctaaactttagcatttgaggttgggtcatgtcagtgaaagaggtttggttg 17999  T
Q  333 aactagctaaacaagatttgctag 356  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  18000 agctagctaaacaaggtttgctag 18023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50010 - 49779
Alignment:
Q  37 atgtttgatggccgtgaaatccttttaagggatgtgaggtttgttcctgaacttaagcaaaatttaatttccctaagcatgtttgatagtctaggttatt 136  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50010 atgtttgatgatcgtgatttccttttgaagaatgtgaggtatattcctgaacttaggagaaatttaatatccataagcatgtttgatggtctaggctatt 49911  T
Q  137 gcactagaattgagcatggggtttgtaaaattgagcatgatgcattgattacggttaaagggtctaaaatgaatggtttatacattttagatggttccat 236  Q
    ||||||||||||| | ||| ||    | ||||   |||| ||||||| ||   | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  49910 gcactagaattgaacgtggtgtgatgagaatttctcatggtgcattggttctagctaaagggtctaaaatacatggtttatatattttagaaggttctac 49811  T
Q  237 agtaattggtaatgcatcggtggctagtgttg 268  Q
     ||||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  49810 cgtaatagctcatgcatcggtagctagtgttg 49779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0777 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0777
Description:

Target: scaffold0777; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Original strand, 187 - 262
Alignment:
Q  333 aactagctaaacaagatttgctagaaaaagataaattggacaagctagaattttgtgagcattgcatactaggcaa 408  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  187 aactaactaaacaaggtttgctagaaaaagatgaatcagacaagctagaattttgtgatcattgcattctaggcaa 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University