View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20475_high_10 (Length: 232)

Name: NF20475_high_10
Description: NF20475
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20475_high_10
NF20475_high_10
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (53-214)||(33496023-33496184)
chr6 (37-208)||(607982-608153)
chr6 (11-208)||(10100145-10100342)
chr6 (16-212)||(14030608-14030805)
chr6 (16-204)||(2065048-2065236)
chr6 (39-207)||(30031081-30031249)
chr6 (16-196)||(2689458-2689638)
chr6 (16-208)||(9706578-9706770)
chr6 (37-208)||(28085199-28085370)
chr6 (16-208)||(5631620-5631812)
chr6 (16-208)||(20427924-20428116)
chr6 (17-208)||(5258438-5258629)
chr6 (16-134)||(30679276-30679394)
chr6 (80-205)||(35043732-35043857)
chr6 (70-204)||(28027117-28027251)
chr6 (29-208)||(6056058-6056237)
chr6 (72-167)||(2079191-2079286)
chr6 (130-208)||(9594000-9594078)
chr6 (109-205)||(31818433-31818529)
chr6 (31-116)||(27790973-27791058)
chr6 (125-208)||(33998292-33998375)
chr6 (27-125)||(24631125-24631223)
chr6 (73-149)||(26291638-26291713)
chr6 (128-208)||(32755833-32755913)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (16-208)||(33072756-33072948)
chr7 (16-208)||(34869222-34869414)
chr7 (19-208)||(11593765-11593954)
chr7 (16-208)||(31005025-31005217)
chr7 (16-208)||(35906489-35906681)
chr7 (16-207)||(36651796-36651987)
chr7 (16-208)||(33350094-33350286)
chr7 (16-202)||(38606807-38606993)
chr7 (37-208)||(49029099-49029270)
chr7 (16-208)||(39906658-39906855)
chr7 (16-208)||(12841563-12841755)
chr7 (16-208)||(36869577-36869769)
chr7 (16-208)||(43281478-43281670)
chr7 (16-208)||(46356144-46356331)
chr7 (11-208)||(23404215-23404412)
chr7 (16-188)||(32630397-32630569)
chr7 (16-196)||(7272841-7273021)
chr7 (31-208)||(25579364-25579536)
chr7 (81-208)||(37617811-37617938)
chr7 (27-208)||(13859296-13859475)
chr7 (49-208)||(27021994-27022153)
chr7 (108-208)||(45836768-45836868)
chr7 (125-207)||(30200248-30200330)
chr7 (106-208)||(36514493-36514595)
chr7 (112-208)||(39811855-39811951)
chr7 (88-208)||(47848548-47848668)
chr7 (60-149)||(7189580-7189669)
chr7 (72-140)||(15681215-15681283)
chr7 (117-208)||(35559282-35559373)
chr7 (72-166)||(21517656-21517750)
chr7 (16-86)||(37616718-37616788)
chr7 (106-207)||(28542173-28542272)
chr7 (87-192)||(38135520-38135625)
chr7 (124-208)||(44855460-44855544)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (16-208)||(3865874-3866066)
chr2 (16-208)||(8180582-8180774)
chr2 (16-208)||(2610330-2610522)
chr2 (24-214)||(36183261-36183451)
chr2 (16-208)||(41763329-41763521)
chr2 (16-208)||(12734508-12734695)
chr2 (19-206)||(41197518-41197705)
chr2 (16-208)||(3243939-3244131)
chr2 (37-208)||(38429707-38429878)
chr2 (16-189)||(451929-452102)
chr2 (16-208)||(4807394-4807586)
chr2 (16-208)||(16097278-16097474)
chr2 (16-208)||(11992394-11992586)
chr2 (16-208)||(45367912-45368104)
chr2 (17-206)||(23997420-23997609)
chr2 (16-149)||(30743425-30743558)
chr2 (27-196)||(6238054-6238223)
chr2 (100-208)||(19337136-19337245)
chr2 (71-196)||(24583906-24584031)
chr2 (16-208)||(13149115-13149307)
chr2 (110-208)||(7825254-7825352)
chr2 (127-208)||(9556656-9556737)
chr2 (16-57)||(38453059-38453100)
chr2 (74-149)||(1456095-1456168)
chr2 (128-208)||(38452977-38453057)
chr2 (73-123)||(32443473-32443523)
chr2 (131-196)||(42092436-42092501)
chr2 (176-208)||(13241033-13241065)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (16-208)||(31960102-31960294)
chr4 (16-208)||(1211678-1211870)
chr4 (16-208)||(436031-436223)
chr4 (16-208)||(23906589-23906781)
chr4 (16-208)||(48174381-48174573)
chr4 (16-214)||(56375092-56375290)
chr4 (27-208)||(43433731-43433912)
chr4 (16-208)||(33227011-33227203)
chr4 (19-208)||(52569803-52569992)
chr4 (16-208)||(50286773-50286965)
chr4 (16-208)||(1777303-1777495)
chr4 (42-210)||(41009636-41009804)
chr4 (16-208)||(46583112-46583304)
chr4 (16-204)||(53707596-53707784)
chr4 (21-208)||(47265490-47265677)
chr4 (16-169)||(27450500-27450653)
chr4 (64-202)||(45205142-45205280)
chr4 (83-208)||(33191136-33191261)
chr4 (16-161)||(39708260-39708405)
chr4 (42-208)||(4440684-4440849)
chr4 (82-208)||(12494618-12494744)
chr4 (16-208)||(48622829-48623007)
chr4 (109-208)||(28236080-28236179)
chr4 (29-196)||(35690119-35690286)
chr4 (61-208)||(31458875-31459022)
chr4 (28-134)||(55578845-55578951)
chr4 (27-208)||(1793285-1793454)
chr4 (80-208)||(39100821-39100949)
chr4 (16-207)||(16002730-16002920)
chr4 (64-206)||(34233323-34233465)
chr4 (125-207)||(43070053-43070135)
chr4 (37-206)||(7092510-7092678)
chr4 (106-196)||(29398711-29398800)
chr4 (74-142)||(26037836-26037904)
chr4 (109-208)||(27983095-27983194)
chr4 (124-206)||(20105761-20105843)
chr4 (72-141)||(2414583-2414651)
chr4 (125-206)||(31403310-31403391)
chr4 (85-202)||(21106853-21106972)
chr4 (89-208)||(25967555-25967672)
chr4 (136-208)||(54470129-54470201)
chr4 (152-207)||(10208976-10209031)
chr4 (73-205)||(11389579-11389713)
chr4 (53-120)||(41427675-41427742)
chr4 (138-203)||(2588905-2588970)
chr4 (32-193)||(44860672-44860833)
chr4 (123-208)||(50662298-50662383)
chr4 (106-194)||(40933198-40933286)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (16-208)||(30202418-30202610)
chr1 (16-208)||(1210547-1210739)
chr1 (16-208)||(9592536-9592728)
chr1 (16-208)||(8671722-8671914)
chr1 (16-208)||(696071-696263)
chr1 (16-208)||(51441053-51441245)
chr1 (16-208)||(15085736-15085928)
chr1 (16-208)||(22089896-22090088)
chr1 (16-208)||(32083033-32083225)
chr1 (16-208)||(43240669-43240861)
chr1 (16-208)||(37463159-37463347)
chr1 (16-214)||(49347675-49347873)
chr1 (16-208)||(8391572-8391766)
chr1 (16-208)||(51601860-51602052)
chr1 (16-169)||(34827429-34827582)
chr1 (16-196)||(19936324-19936504)
chr1 (16-208)||(9599682-9599874)
chr1 (16-167)||(39140316-39140466)
chr1 (16-165)||(46226613-46226762)
chr1 (76-208)||(34792637-34792768)
chr1 (109-208)||(32231242-32231341)
chr1 (72-208)||(18469368-18469504)
chr1 (71-195)||(35672545-35672669)
chr1 (79-141)||(3192071-3192133)
chr1 (79-141)||(3200889-3200951)
chr1 (79-141)||(3209726-3209788)
chr1 (29-159)||(11331401-11331531)
chr1 (29-159)||(11489422-11489552)
chr1 (125-208)||(9509229-9509312)
chr1 (52-194)||(1661264-1661406)
chr1 (70-208)||(4379861-4379999)
chr1 (71-208)||(40419496-40419633)
chr1 (16-113)||(41560238-41560335)
chr1 (161-208)||(33561077-33561124)
chr1 (109-144)||(51812432-51812467)
chr1 (106-208)||(16142172-16142274)
chr1 (72-169)||(7814322-7814419)
chr1 (139-208)||(40920825-40920894)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (16-208)||(82523-82715)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (16-208)||(36565529-36565721)
chr8 (16-208)||(36395238-36395433)
chr8 (16-208)||(18124978-18125169)
chr8 (16-202)||(39946659-39946845)
chr8 (16-208)||(12492130-12492322)
chr8 (16-208)||(15215559-15215751)
chr8 (16-208)||(25288704-25288896)
chr8 (16-208)||(25300039-25300231)
chr8 (16-208)||(42854292-42854484)
chr8 (27-208)||(18752161-18752342)
chr8 (16-208)||(36544954-36545141)
chr8 (20-201)||(37077571-37077752)
chr8 (16-208)||(2796357-2796551)
chr8 (16-169)||(29735611-29735761)
chr8 (16-208)||(8879728-8879914)
chr8 (64-205)||(30783331-30783471)
chr8 (72-208)||(13171937-13172073)
chr8 (72-159)||(9905223-9905310)
chr8 (71-196)||(2518691-2518816)
chr8 (16-68)||(4032922-4032974)
chr8 (71-202)||(37256011-37256140)
chr8 (70-194)||(45512799-45512922)
chr8 (16-73)||(25439338-25439395)
chr8 (137-208)||(29520583-29520654)
chr8 (125-204)||(38328099-38328178)
chr8 (75-206)||(39760714-39760845)
chr8 (16-201)||(6510721-6510896)
chr8 (106-167)||(13986386-13986447)
chr8 (127-212)||(30456496-30456580)
chr8 (107-208)||(30748352-30748453)
chr8 (112-208)||(40813220-40813316)
chr8 (132-208)||(45419157-45419233)
chr8 (76-190)||(43732429-43732543)
chr8 (76-149)||(13589301-13589374)
chr8 (98-142)||(30113551-30113595)
chr8 (76-208)||(39953552-39953684)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (16-208)||(12492675-12492867)
chr5 (16-208)||(1287877-1288069)
chr5 (16-208)||(2075762-2075954)
chr5 (16-208)||(1275067-1275259)
chr5 (16-208)||(10639099-10639291)
chr5 (16-208)||(28977145-28977337)
chr5 (16-208)||(16347666-16347858)
chr5 (16-208)||(34272824-34273011)
chr5 (20-206)||(20318793-20318974)
chr5 (16-167)||(27696-27847)
chr5 (29-196)||(36200597-36200764)
chr5 (16-208)||(3301651-3301838)
chr5 (16-208)||(24178326-24178504)
chr5 (64-205)||(7678331-7678471)
chr5 (70-207)||(9234925-9235062)
chr5 (71-207)||(30588310-30588446)
chr5 (72-208)||(32516416-32516552)
chr5 (19-169)||(1525447-1525595)
chr5 (110-169)||(5848403-5848462)
chr5 (39-92)||(3394538-3394591)
chr5 (101-206)||(21093663-21093768)
chr5 (136-208)||(28186956-28187028)
chr5 (131-208)||(11002709-11002786)
chr5 (41-154)||(32516160-32516273)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (16-208)||(28245239-28245431)
chr3 (16-214)||(51447991-51448189)
chr3 (16-208)||(5168630-5168822)
chr3 (16-208)||(52138602-52138794)
chr3 (16-208)||(25191181-25191373)
chr3 (28-204)||(26490130-26490307)
chr3 (19-208)||(38849899-38850088)
chr3 (46-208)||(33272316-33272478)
chr3 (44-214)||(54278850-54279020)
chr3 (16-169)||(47542039-47542191)
chr3 (31-169)||(43695092-43695230)
chr3 (16-204)||(53519388-53519576)
chr3 (19-168)||(27917377-27917526)
chr3 (16-169)||(3186571-3186724)
chr3 (77-208)||(49503842-49503978)
chr3 (108-201)||(45728040-45728133)
chr3 (125-208)||(47233884-47233967)
chr3 (122-208)||(50621648-50621734)
chr3 (115-207)||(2341003-2341095)
chr3 (77-195)||(46431972-46432090)
chr3 (77-142)||(46227275-46227340)
chr3 (136-208)||(19736918-19736990)
chr3 (108-208)||(54128272-54128372)
chr3 (133-208)||(21992-22067)
chr3 (71-171)||(30345384-30345480)
chr3 (109-208)||(45236751-45236850)
chr3 (87-169)||(44134151-44134233)
chr3 (139-208)||(19676378-19676447)
chr3 (92-193)||(29919182-29919283)
chr3 (92-193)||(29968335-29968436)
chr3 (88-149)||(46367732-46367793)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (16-208)||(31270-31462)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (16-169)||(2597-2750)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (42-208)||(86895-87058)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (82-208)||(25733-25859)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (16-208)||(11886-12078)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (82-208)||(4560-4686)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (16-80)||(1-65)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 33496023 - 33496184
Alignment:
Q  53 ggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttaca 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33496023 ggacaacagtcagacctgcaatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgttgca 33496122  T
Q  153 ttggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33496123 ttggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtag 33496184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 607982 - 608153
Alignment:
Q  37 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 136  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  607982 aaagaaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcgg 608081  T
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  608082 agatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagaga 608153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10100342 - 10100145
Alignment:
Q  11 gagagaagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacca 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||    
T  10100342 gagataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaagagcca 10100243  T
Q  111 acatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || | |  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10100242 agacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagaga 10100145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 14030608 - 14030805
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  14030608 aagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaaactagcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacg 14030707  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtgg-taagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagt 212  Q
    ||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14030708 agagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagt 14030805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2065236 - 2065048
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |    
T  2065236 aagaaagtacatcttaagttgaaaggaaacttctatcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacggttaagagccaacacg 2065137  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2065136 agaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattaga 2065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 30031081 - 30031249
Alignment:
Q  39 aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggag 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30031081 aggaaagttctatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggag 30031180  T
Q  139 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||| | ||||   ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30031181 atgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagag 30031249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 2689458 - 2689638
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||  |    
T  2689458 aagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtcagaccgtcgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaacagccaacgcg 2689557  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2689558 agaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgaca 2689638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 9706578 - 9706770
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||| |  ||||| |    
T  9706578 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaacacg 9706677  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9706678 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 9706770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 28085199 - 28085370
Alignment:
Q  37 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28085199 aaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcag 28085298  T
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28085299 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagaga 28085370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 5631620 - 5631812
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||  |    
T  5631620 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagccaacgcg 5631719  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || ||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  5631720 agagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagaga 5631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20428116 - 20427924
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||| |    
T  20428116 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaactaaaaatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaagagccaacacg 20428017  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20428016 agagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 20427924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5258629 - 5258438
Alignment:
Q  17 agaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatga 116  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||| ||    
T  5258629 agaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaacacga 5258530  T
Q  117 gaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||   || |||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  5258529 gagcaaagtaagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagaga 5258438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 30679276 - 30679394
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  30679276 aagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgacgatgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacg 30679375  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagc 134  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  30679376 agaatcaagtaagtgtagc 30679394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35043857 - 35043732
Alignment:
Q  80 atggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaatagga 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| | | ||    
T  35043857 atggtacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatga 35043758  T
Q  180 taggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  35043757 taggattatgaatgacaccattagag 35043732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28027251 - 28027117
Alignment:
Q  70 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  28027251 gcgatgttgtatggtatggagtgttgggaggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaaga 28027152  T
Q  170 ttaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
     || || | |||||||||| |||||| || |||||    
T  28027151 ctagatggcataggattaggaatgacgtcgttaga 28027117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6056237 - 6056058
Alignment:
Q  29 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 128  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  6056237 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacaatgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 6056138  T
Q  129 tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
     ||||  || |||  |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||  |||||  ||||||| |||||||||||    
T  6056137 cgtagtagaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga 6056058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 2079191 - 2079286
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 167  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  2079191 gatgttgtatggaacatagtgatggacggtgaagaactaacacgagaataaaataagcgtagcggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaa 2079286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9594078 - 9594000
Alignment:
Q  130 gtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9594078 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagaga 9594000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 205
Target Start/End: Original strand, 31818433 - 31818529
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  31818433 caacatgagaataaaataagtgtagcagagatgagaatgttgcattggatatgtgttaagattagatgagataagattagaaatgaaattattagag 31818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Original strand, 27790973 - 27791058
Alignment:
Q  31 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatga 116  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||     | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27790973 aagtgtaaaggaaaattctattggacaatagtcatgttggagatgttgtatggtacaaagtgttggacgattaaaaaccaacatga 27791058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33998375 - 33998292
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33998375 taagcgtagcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagaga 33998292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24631223 - 24631125
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaat 125  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||| | |||| | |||||||||||    
T  24631223 acttaagttgaaatgaaagttatatcggacaacaatcaaacttgcaatgttgtatgctacagagggttgggtgattaagagccaaaacgagaatcaaat 24631125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 26291638 - 26291713
Alignment:
Q  73 atgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  26291638 atgttgtatggtacggagtgttaggcg-ttgaaaaccaacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgtt 26291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Original strand, 32755833 - 32755913
Alignment:
Q  128 gtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32755833 gtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagaga 32755913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 33072756 - 33072948
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  33072756 aagaaagtaccacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagaccggcgttgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatg 33072855  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33072856 agaatcaaataagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 33072948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 34869222 - 34869414
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  34869222 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 34869321  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34869322 agaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 34869414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 11593765 - 11593954
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  11593765 aaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgaga 11593864  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11593865 atcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagaga 11593954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 31005025 - 31005217
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |  |||||||    
T  31005025 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatg 31005124  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  31005125 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagaga 31005217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35906681 - 35906489
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  35906681 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggtggttaagagtcaacatg 35906582  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35906581 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 35906489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 36651796 - 36651987
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  36651796 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 36651895  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36651896 agaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagag 36651987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33350286 - 33350094
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  33350286 aagaaagtaccacttaagttgacaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 33350187  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33350186 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33350094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 38606807 - 38606993
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  38606807 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 38606906  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 202  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38606907 agagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta 38606993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 49029099 - 49029270
Alignment:
Q  37 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  49029099 aaaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcag 49029198  T
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49029199 agatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 49029270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39906855 - 39906658
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | || |||| |  |||||||    
T  39906855 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcgattaagagtcaacatg 39906756  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagc-----ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||||||      ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39906755 agaatcaagtaagtgtagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 39906658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12841755 - 12841563
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  12841755 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatg 12841656  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||| | || | | ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  12841655 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagaga 12841563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36869769 - 36869577
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||  ||| |  ||||| |    
T  36869769 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaacacg 36869670  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36869669 tgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36869577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 43281478 - 43281670
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||       
T  43281478 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgca 43281577  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43281578 agagtaaagtaagtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagaga 43281670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46356331 - 46356144
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  46356331 aagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccggcattgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 46356232  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||    ||||||||| ||||||  |||||| | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  46356231 agaatc----aagtgtagcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagaga 46356144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Original strand, 23404215 - 23404412
Alignment:
Q  11 gagagaagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacca 110  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||    
T  23404215 gagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgatattgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagcca 23404314  T
Q  111 acatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
     || ||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||| |  |||||||| ||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  23404315 gcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggaga 23404412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 32630397 - 32630569
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  32630397 aagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcggacatcaatcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagaaccaacacg 32630496  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattag 188  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  32630497 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattag 32630569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 7272841 - 7273021
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||| |    
T  7272841 aagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcggtcagcagtcaaaccgacaatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaacacg 7272940  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    |||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||    
T  7272941 agaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgaca 7273021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25579536 - 25579364
Alignment:
Q  31 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtg 130  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  25579536 aagttgaagggaaaattctatcggacagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcg 25579437  T
Q  131 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||     ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25579436 tagaggagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatacta-----gataggattagaaatgaccacattagagaga 25579364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Original strand, 37617811 - 37617938
Alignment:
Q  81 tggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggat 180  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||    
T  37617811 tggtacggagtcttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagat 37617910  T
Q  181 aggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37617911 aggattaggaatgacaccattagagaga 37617938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13859475 - 13859296
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||  |||||| |||||| || |||||| ||||||| |   |||| ||||||||| ||    
T  13859475 acttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagta 13859376  T
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||  ||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13859375 agt--agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 13859296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27022153 - 27021994
Alignment:
Q  49 tatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgt 148  Q
    |||| |||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||  | | ||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||  ||||    
T  27022153 tatcagacaactgtgagactggcgatgttgcatggaacagagtgttggcaggtatagagccagcatgagaatataataagtgtagcggcaatgagaatgt 27022054  T
Q  149 tacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | ||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27022053 tgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagaga 27021994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45836868 - 45836768
Alignment:
Q  108 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45836868 ccaacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagag 45836769  T
Q  208 a 208  Q
    |    
T  45836768 a 45836768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30200330 - 30200248
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30200330 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag 30200248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36514595 - 36514493
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    |||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  36514595 aaccaacacgaaaataaattaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagag 36514496  T
Q  206 aga 208  Q
    |||    
T  36514495 aga 36514493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Original strand, 39811855 - 39811951
Alignment:
Q  112 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||| || |   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39811855 catgagaataaaacaagcgtagcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagaga 39811951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 208
Target Start/End: Original strand, 47848548 - 47848668
Alignment:
Q  88 gagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggatta 187  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| || |  ||||||||| |    
T  47848548 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatca 47848647  T
Q  188 gaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  47848648 gaagtgataacattagagaga 47848668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7189669 - 7189580
Alignment:
Q  60 agtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||    
T  7189669 agtcagaccgacgatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgtt 7189580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 140
Target Start/End: Original strand, 15681215 - 15681283
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15681215 gatgttgtatggtatagagtgttgggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagtgtagtggagat 15681283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35559373 - 35559282
Alignment:
Q  117 gaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| |||||||||   |||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  35559373 gaatcaagtaagtgtagtaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagaga 35559282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21517750 - 21517656
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggta 166  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21517750 gatgttgtatggaacatagtgtttggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcataatggatatgatgatgttgcattagatgtgtggta 21517656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 37616718 - 37616788
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtac 86  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||    
T  37616718 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagaccgacattgttgtatggtac 37616788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28542272 - 28542173
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||| | | | |||||| |||||||||| ||  |||||||    
T  28542272 aaccaacatgagcat-aaataagtgtagcggagatgagggtgttgcgttggatgtgtggtaagact-agtgggatagaattagaaatggcaatattagag 28542175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38135625 - 38135520
Alignment:
Q  87 agagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggatt 186  Q
    |||||||||||  || || ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  38135625 agagtgttggatagtaaagaaccaacactagaataaaacaagcgtagcggagatgaggatcttttgttggatgtgtggtaagattagatgggataggatt 38135526  T
Q  187 agaaat 192  Q
    | ||||    
T  38135525 ataaat 38135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44855544 - 44855460
Alignment:
Q  124 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44855544 ataagtgtagcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 44855460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 3865874 - 3866066
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  3865874 aagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatg 3865973  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  3865974 agaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagaga 3866066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 8180582 - 8180774
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  8180582 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatg 8180681  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8180682 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 8180774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 2610330 - 2610522
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  2610330 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagactggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 2610429  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2610430 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagaga 2610522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 214
Target Start/End: Original strand, 36183261 - 36183451
Alignment:
Q  24 actacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaa 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  36183261 actacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaa 36183360  T
Q  124 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  36183361 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtag 36183451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41763521 - 41763329
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  41763521 aagaaagtaccacttaagctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacacg 41763422  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41763421 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 41763329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 12734508 - 12734695
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  12734508 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcg-acaacagtcaaaccatcgatgttgtatggtacagagtgttgggcggtttagagccaacatg 12734606  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||    |||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12734607 agaatc----aagtgtagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagaga 12734695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41197705 - 41197518
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  41197705 aaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagaccagcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgaga 41197606  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
     | || |||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41197605 gtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 41197518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3244131 - 3243939
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  3244131 aagaaagtaccacttatgttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatg 3244032  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  3244031 agaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 3243939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 38429707 - 38429878
Alignment:
Q  37 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 136  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||    
T  38429707 aaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagtgtagcgg 38429806  T
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38429807 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 38429878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 452102 - 451929
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  452102 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 452003  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattaga 189  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | || |||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  452002 agaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattaga 451929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 4807394 - 4807586
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||  ||||||| |  |||||||    
T  4807394 aagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaagagtcaacatg 4807493  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4807494 agaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagaga 4807586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16097474 - 16097278
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacgg----ttaaaaaccaa 111  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | | |||||||||||||  | | ||||||||    |||| | ||||    
T  16097474 aagaaggtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcaaacagcagtcagaccagtgttgttgtatggtacgaaatcttggacggacggttaagagccaa 16097375  T
Q  112 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  16097374 catgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagaga 16097278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11992586 - 11992394
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||| |    
T  11992586 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgaccggcaatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaacacg 11992487  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| | || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  11992486 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagaga 11992394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45368104 - 45367912
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||| || |||| | |||||| |    
T  45368104 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagagccaacacg 45368005  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || ||||| || |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  45368004 agagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 45367912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Original strand, 23997420 - 23997609
Alignment:
Q  17 agaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatga 116  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  |||||||| | ||||| |  ||||| ||    
T  23997420 agaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcagttaagagtcaacacga 23997519  T
Q  117 gaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23997520 gagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagaga 23997609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 30743425 - 30743558
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | | ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | || |||||| |||||| |    
T  30743425 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgtatggtacggagagttaggcgattaaaagccaacacg 30743524  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  30743525 agaatcaagtaagtgttgtggagatgaggatgtt 30743558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6238223 - 6238054
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 126  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  6238223 acttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagactgacgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaaata 6238124  T
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    | || |||| |  ||| |||||| |  |||||||| ||||||| || | | ||||| ||||| |||||||    
T  6238123 attgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgaca 6238054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19337245 - 19337136
Alignment:
Q  100 gttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga-ttaaataggataggattagaaatgacatc 198  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||   |||||||||||| |||||| | |    
T  19337245 gttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaac 19337146  T
Q  199 attagagaga 208  Q
    ||||||||||    
T  19337145 attagagaga 19337136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24584031 - 24583906
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     |||||||||||||||     
T  24584031 cgatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagac 24583932  T
Q  171 taaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    |||| | |||| |||||  |||||||    
T  24583931 taaacatgatatgattaagaatgaca 24583906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 13149115 - 13149307
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||| |   |||||||||| ||||||||||||  |  |||||| |||||||| |    
T  13149115 aagaaagtaccactcaagttaaaaggaaaattatattggacaacaaccaggctaacgatgttgtacggtacagagtgtcaggtggttaagaaccaacacg 13149214  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | ||||||  ||||||| | ||||||| | ||||   |||||  |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13149215 aaaatcaagcaagtgtaacagagatgagggtgttgtgttggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacaccatttgagaga 13149307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Original strand, 7825254 - 7825352
Alignment:
Q  110 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7825254 aacatgagaataaagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagaga 7825352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9556737 - 9556656
Alignment:
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||   ||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9556737 agtgtagtggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagaga 9556656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38453100 - 38453059
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggaca 57  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38453100 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggaca 38453059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Original strand, 1456095 - 1456168
Alignment:
Q  74 tgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1456095 tgttatatgggacggagtgttggaaggtaaagaaccaaca--agaataaaataagtgtagcggagatgaggatgtt 1456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38453057 - 38452977
Alignment:
Q  128 gtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38453057 gtgtagcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagaga 38452977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 123
Target Start/End: Original strand, 32443473 - 32443523
Alignment:
Q  73 atgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  32443473 atgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaatcaacacgagaatcaa 32443523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Original strand, 42092436 - 42092501
Alignment:
Q  131 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  42092436 tagcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgaca 42092501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13241065 - 13241033
Alignment:
Q  176 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13241065 aggataggattagaaatgacaacattagagaga 13241033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31960294 - 31960102
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  31960294 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 31960195  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31960194 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 31960102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1211870 - 1211678
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  1211870 aagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggtgatgttgtgtggtacagagtgttggacggttaagagccaacacg 1211771  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| | || | | |||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  1211770 agaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagaga 1211678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 436031 - 436223
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  436031 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 436130  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  436131 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 436223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23906781 - 23906589
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  |||||||    
T  23906781 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatg 23906682  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23906681 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 23906589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48174573 - 48174381
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  48174573 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatg 48174474  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  48174473 aaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagaga 48174381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 56375092 - 56375290
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  56375092 aagaaagtaccacttaatttgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagaccagcgttattgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 56375191  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  56375192 agaatcaaacaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtag 56375290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 43433731 - 43433912
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||    
T  43433731 acttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagta 43433830  T
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43433831 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 43433912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 33227011 - 33227203
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  33227011 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 33227110  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33227111 agaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33227203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52569992 - 52569803
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||    
T  52569992 aaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgaga 52569893  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52569892 atcaagtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 52569803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 50286773 - 50286965
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  50286773 aagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagatcgacgttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 50286872  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50286873 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 50286965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1777495 - 1777303
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| | |||||| |  |||||||    
T  1777495 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccgacgttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaagagtcaacatg 1777396  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1777395 aaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 1777303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41009804 - 41009636
Alignment:
Q  42 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41009804 aaagttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggaaatg 41009705  T
Q  142 atgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagata 210  Q
    | |||||| | ||||||||  ||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41009704 aggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagata 41009636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46583304 - 46583112
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  46583304 aagaaagtatcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagatcggcgctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 46583205  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| || | || |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46583204 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagaga 46583112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 53707596 - 53707784
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || || |||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  53707596 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggccagcattccgaccggcgttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaagagtcaacatg 53707695  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  53707696 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattaga 53707784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47265677 - 47265490
Alignment:
Q  21 agtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaat 120  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  47265677 agtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtcagaccagcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagtcaacacgagaat 47265578  T
Q  121 caaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| || |||||||  |||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | |||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  47265577 caagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagaga 47265490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27450653 - 27450500
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| |    
T  27450653 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacg 27450554  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  27450553 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaga 27450500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45205142
Alignment:
Q  64 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtg 45205181  T
Q  164 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 202  Q
    |||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  45205180 gtaagactagacgggataggattaggaatgacaccatta 45205142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33191261 - 33191136
Alignment:
Q  83 gtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatag 182  Q
    |||| ||||||||| || |||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33191261 gtacggagtgttgggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggatag 33191162  T
Q  183 gattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  33191161 gattaggaatgacaccattagagaga 33191136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 39708260 - 39708405
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  39708260 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcaacagtccgatcgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaggcaacacg 39708359  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgag 161  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||||| | |||||||||    
T  39708360 agaatcaagtaagtgtagtgcagatgaggatgttgcgttggatgag 39708405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 4440684 - 4440849
Alignment:
Q  42 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  4440684 aaagttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtgttgg-cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatt 4440782  T
Q  142 atgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |||||| | || |||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  4440783 aggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagaga 4440849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Original strand, 12494618 - 12494744
Alignment:
Q  82 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 181  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||    
T  12494618 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 12494717  T
Q  182 ggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12494718 ggattaggaatgacaccattagagaga 12494744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48623007 - 48622829
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||              |||||  |  |||||||    
T  48623007 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttattgtatggt--------------ggttaggagtcaacatg 48622922  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48622921 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 48622829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Original strand, 28236080 - 28236179
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28236080 caacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagaga 28236179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 35690119 - 35690286
Alignment:
Q  29 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 128  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||  || |||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35690119 ttaagttgagaggaaaattctatcagacaacagttagaccgacgatgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaatcaagtaag 35690218  T
Q  129 tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || |   ||||||||||| |||||||    
T  35690219 tgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgaca 35690286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31459022
Alignment:
Q  61 gtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatga 160  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || ||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttga 31458974  T
Q  161 gtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31458975 gtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagaga 31459022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 55578845 - 55578951
Alignment:
Q  28 cttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataa 127  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  55578845 cttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtatgaagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaatcaattaa 55578944  T
Q  128 gtgtagc 134  Q
    |||||||    
T  55578945 gtgtagc 55578951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 1793285 - 1793454
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||| ||    
T  1793285 acttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaca------------atgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagta 1793372  T
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1793373 agtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggaga 1793454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39100949 - 39100821
Alignment:
Q  80 atggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaatagga 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||| || | | ||    
T  39100949 atggtacagagtgttggacagttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatga 39100850  T
Q  180 taggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39100849 taggattaggaatgacaccattagagaga 39100821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 16002730 - 16002920
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  16002730 aagaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatgttgtat-gaacgaagtgttgggaggttaagagtcaacacg 16002828  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    |||||||||||||||| || |    |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  16002829 agaatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagag 16002920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34233465 - 34233323
Alignment:
Q  64 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 163  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | || || |||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  34233465 agaccagcgatgctgtatggaacagagagttgggcagtgaagaaccaacacgggaataagataagtgtagtggagatgatgatgttgtgttggatgtgtg 34233366  T
Q  164 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
     ||||| || ||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34233365 ataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagaga 34233323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43070135 - 43070053
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43070135 taagtgtagcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7092678 - 7092510
Alignment:
Q  37 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 136  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||| || | | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  7092678 aaaggaaaattctattagacagcagttagatcggcgatgttgtatggtacggagttttaggcagttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagcag 7092579  T
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    |||||| ||||||    |||||||||||||||  || |  ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  7092578 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagaga 7092510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Original strand, 29398711 - 29398800
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||| || | || |||||| ||||||||    
T  29398711 aaccaacatgagaataaaataagtgtagcggagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgaca 29398800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037836
Alignment:
Q  74 tgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 142  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatga 26037836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Original strand, 27983095 - 27983194
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||    | |||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983095 caacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 27983194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20105843 - 20105761
Alignment:
Q  124 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || |   |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20105843 ataaatgtagcggagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattagaga 20105761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Original strand, 2414583 - 2414651
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2414583 gatgttgtatggtacaaagtattgggcggttgagaaccatca-gagaatcaaataagtgcagcggagatg 2414651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31403391 - 31403310
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31403391 taagcgtagcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagaga 31403310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 21106853 - 21106972
Alignment:
Q  85 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata--agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||   || |||| ||||||||| || |   |||||    
T  21106853 acagagtgttgggcggttaagaaccaacatgacaataaaataagagtgtagtggtgatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatag 21106952  T
Q  183 gattagaaatgacatcatta 202  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  21106953 aattagaaatgacaacatta 21106972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25967672 - 25967555
Alignment:
Q  89 agtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattag 188  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||| || | | | |||||||||    
T  25967672 agtgttgggcagtaaaaaaccaacaagagaat--aataagcgtagtggaggtgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattag 25967575  T
Q  189 aaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  25967574 aaatgactacattagagaga 25967555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Original strand, 54470129 - 54470201
Alignment:
Q  136 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  54470129 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagaga 54470201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Original strand, 10208976 - 10209031
Alignment:
Q  152 attggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10208976 attggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag 10209031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 11389579 - 11389713
Alignment:
Q  73 atgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatta 172  Q
    ||||||||||| |   |||||||| ||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| | ||    
T  11389579 atgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaacta 11389678  T
Q  173 aatagg--ataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
     |  ||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11389679 gacgggatataggattagaaatgacaactttagag 11389713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 41427675 - 41427742
Alignment:
Q  53 ggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaat 120  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41427675 ggacaactgtcagaacaacgatgttgtatgaaacagagtgttggacgattaagaaccaacataagaat 41427742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2588970
Alignment:
Q  138 gatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattag 203  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattag 2588970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 44860672 - 44860833
Alignment:
Q  32 agtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgt 131  Q
    |||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||||   || ||| || |||||||    
T  44860672 agttgaaaggaaaattttattggtcaatagtaagatcggcgatgttgtatgggactgagtgttgggctgtgaagaaccaaggagaaaataaattaagtgt 44860771  T
Q  132 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatg 193  Q
    ||| || |||| ||||||   ||||||| ||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  44860772 agcagaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagatggaataagattagaaatg 44860833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Original strand, 50662298 - 50662383
Alignment:
Q  123 aataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||   | ||||| ||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50662298 aataagcgtagcggagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagaga 50662383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40933286 - 40933198
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatga 194  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||||  | | | ||||| |||||||||||    
T  40933286 aaccaacacgagagtaaaataagtgtagcgtagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30202610 - 30202418
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  30202610 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtgtggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatg 30202511  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30202510 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 30202418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 1210547 - 1210739
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  1210547 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 1210646  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1210647 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 1210739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 9592536 - 9592728
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  9592536 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaatagtcagactgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatg 9592635  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9592636 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 9592728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 8671722 - 8671914
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |  |||||||    
T  8671722 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccggcgttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaagagtcaacatg 8671821  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8671822 agaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 8671914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 696071 - 696263
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||| |    
T  696071 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaacacg 696170  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  696171 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 696263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 51441245 - 51441053
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  51441245 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 51441146  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  51441145 agaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 51441053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 15085736 - 15085928
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  15085736 aagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 15085835  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15085836 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagaga 15085928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 22089896 - 22090088
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  22089896 aagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 22089995  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22089996 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagaga 22090088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32083225 - 32083033
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  32083225 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacg 32083126  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || || ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32083125 agagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagaga 32083033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43240861 - 43240669
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  43240861 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaagagtcaacatg 43240762  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  43240761 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagaga 43240669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37463347 - 37463159
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||      
T  37463347 aagaaagcactgattaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacaca 37463248  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37463247 agaatc----aagtgtagaggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagaga 37463159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49347873 - 49347675
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  |||||||    
T  49347873 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgaccaaccttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatg 49347774  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  49347773 agaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtag 49347675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 8391572 - 8391766
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtat--ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  8391572 aagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagaccggcaatgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaaca 8391671  T
Q  114 tgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8391672 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 8391766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 51601860 - 51602052
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  51601860 aagaaagtaccccttaagttgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatg 51601959  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||  || |||| |||||| | || |||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  51601960 agaatcaagtaagtgtagtagatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagaga 51602052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34827582 - 34827429
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  34827582 aagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagatcaacgatgttgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaacacg 34827483  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    | || |||||||||||| | ||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  34827482 aaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaga 34827429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 19936324 - 19936504
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  |||||  | |||||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19936324 aagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttagaccagcaatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaaccaacatg 19936423  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  19936424 agaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgaca 19936504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9599874 - 9599682
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||| |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||||| | ||||||||      
T  9599874 aagaaagtaccgcttcagttgaaatgaaaattctatcagaccgcagtcagaccagcgatgtggtatgatacaaagtgttgtgcggttgagaaccaacaca 9599775  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9599774 ataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagaga 9599682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 39140316 - 39140466
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  39140316 aagaaagtaccgcttaaattgaaaggcaaattctatcggacagcagtcagaccggtgatgttgtatggtac-gagtgttgggcagttaagaaccatcatg 39140414  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 167  Q
    | |||||| |||| ||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  39140415 aaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 39140466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46226762 - 46226613
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| |    ||||||||||||||||  | |||||  |  |||| |||||||| |    
T  46226762 aagaaagtagtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatagtgacgatgttgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaaccaacacg 46226663  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggt 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46226662 agaatcaagtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggt 46226613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34792768 - 34792637
Alignment:
Q  76 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || |     
T  34792768 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagac 34792670  T
Q  176 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  34792669 atgataggattaggaatgaaaccattagagaga 34792637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32231341 - 32231242
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32231341 caacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 32231242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18469504 - 18469368
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 171  Q
    ||||||||||| |||  |||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||| |    
T  18469504 gatgttgtatgatactaagtactgggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagact 18469405  T
Q  172 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | | | |||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  18469404 agacatgatatgattaggaatgacacaattagagaga 18469368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 195
Target Start/End: Original strand, 35672545 - 35672669
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| || ||| |||||| ||||  ||| ||||||| |     
T  35672545 cgatgttgtgtggaacagactgttgaagggttaagaaccaacacgagaataaaataaatgtagcgaaggtgaagatgttgcatttaatgtgtggtaaaac 35672644  T
Q  171 taaataggataggattagaaatgac 195  Q
    || ||  ||||||||||||||||||    
T  35672645 tagatgagataggattagaaatgac 35672669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 3192071 - 3192133
Alignment:
Q  79 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3192071 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3192133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 3200889 - 3200951
Alignment:
Q  79 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3200889 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 3209726 - 3209788
Alignment:
Q  79 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3209726 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3209788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11331531 - 11331401
Alignment:
Q  29 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 128  Q
    ||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  |||||||| | ||    
T  11331531 ttaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagttag 11331432  T
Q  129 tgtagcggagatgatgatgttacattggatg 159  Q
      |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  11331431 catagcggagatgaggaagttatattggatg 11331401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11489552 - 11489422
Alignment:
Q  29 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 128  Q
    ||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  |||||||| | ||    
T  11489552 ttaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagttag 11489453  T
Q  129 tgtagcggagatgatgatgttacattggatg 159  Q
      |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  11489452 catagcggagatgaggaagttatattggatg 11489422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 208
Target Start/End: Original strand, 9509229 - 9509312
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9509229 taagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagaga 9509312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 1661264 - 1661406
Alignment:
Q  52 cggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttac 151  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||      
T  1661264 cggacagcagtaagaccaacgatattgtatgggatagagcgttgggcggtgaaaaaccaacacgagaataaaataagcatagcagagatgaagatgttgt 1661363  T
Q  152 attggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatga 194  Q
     ||| |||  || ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  1661364 gttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatga 1661406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Original strand, 4379861 - 4379999
Alignment:
Q  70 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | | || || |||||||| || ||| ||  |||  |||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  4379861 gcgatgttgtacgggacagagtgttaggcagtaaagaaccaacacgaaaataaataaagcttagctgagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaga 4379960  T
Q  170 ttaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
     || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4379961 ctagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagaga 4379999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 208
Target Start/End: Original strand, 40419496 - 40419633
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||  || || |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||  |||||| |     
T  40419496 cgatgttgtacggaacagagtgttgggtggtaaagaaccaacacgaacataaagtaagtgtagcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaac 40419595  T
Q  171 taaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    || ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40419596 tagatgagatagaattagaaatgacaacattagagaga 40419633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 41560238 - 41560335
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaaca 113  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||   | |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || |||||    
T  41560238 aagaaagtaccgcttaagttgaaaggaaaattctatccgaacgctgtcagaccagcgatgttgtatgatacggagtattgggcggttaagaatcaaca 41560335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33561124 - 33561077
Alignment:
Q  161 gtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33561124 gtggtaagactaaatgggataggattggaaatgacaacattagagaga 33561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 144
Target Start/End: Original strand, 51812432 - 51812467
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatg 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51812432 caacatgagaataaaataagtgtagcggagatgatg 51812467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16142274 - 16142172
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |  ||||||||| || |||| || ||||||||    
T  16142274 aaccaatacgagaatcaaataagcatagtggaaatgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagag 16142175  T
Q  206 aga 208  Q
    |||    
T  16142174 aga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 7814322 - 7814419
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |   |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  7814322 gatgttgtatggaacagaatgttggatggttaagaaccaacacgagaataaagtaattgttgtatagatgaggatgttacgttgaatgtgtgataaga 7814419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920825
Alignment:
Q  139 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagaga 40920825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 82523 - 82715
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  82523 aagaaagtactccttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatg 82622  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  82623 agaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 82715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36565721 - 36565529
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| |||    
T  36565721 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatg 36565622  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36565621 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 36565529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36395433 - 36395238
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  36395433 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 36395334  T
Q  116 agaatcaaataag---tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36395333 agaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 36395238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 18124978 - 18125169
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18124978 aagaaagtaccactta-gttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatg 18125076  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18125077 agaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagaga 18125169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 39946659 - 39946845
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |  ||||| |    
T  39946659 aagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacg 39946758  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 202  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||    
T  39946759 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccatta 39946845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12492322 - 12492130
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  12492322 aagaaagtaccacttaagatgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccggcgttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 12492223  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||  |||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  12492222 agaatcatgtaagtgtagcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15215751 - 15215559
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  15215751 aagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 15215652  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15215651 agagtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagaga 15215559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 25288704 - 25288896
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  25288704 aagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 25288803  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25288804 agaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagaga 25288896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 25300039 - 25300231
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  25300039 aagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 25300138  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25300139 agaatcaaataagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagaga 25300231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42854484 - 42854292
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  42854484 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacg 42854385  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || | |||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||| || | || |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  42854384 agagtaaagttagtgtagcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagaga 42854292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18752342 - 18752161
Alignment:
Q  27 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 126  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||| | || ||    
T  18752342 acttaagctcaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaagta 18752243  T
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  || ||||||| ||||| || | |  ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18752242 agtgtagcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagaga 18752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 36544954 - 36545141
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||     ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  36544954 aagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcggatagca-----accagcgttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtcaacatg 36545048  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36545049 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36545141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 37077571 - 37077752
Alignment:
Q  20 aagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaa 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| |||||    
T  37077571 aagtaccacttaagttgaaagggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatgctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaa 37077670  T
Q  120 tcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatt 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| | || |   ||||||||||| ||||||| ||||    
T  37077671 tcaagtaagtgtggcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccatt 37077752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 2796357 - 2796551
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || |||| |||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||| |    
T  2796357 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggtaccgagtcttgggtggttaagagtcaacacg 2796456  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga--ttaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |  ||||||||||||||||   || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2796457 agaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 2796551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 29735611 - 29735761
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||| |   |||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||| |    
T  29735611 aagaaagcactgcttaagttgaaatgaaaattctatcggacagtagtcagaac---gatgttgtatggtaaagagtgttgagtgattaaaaaccaacacg 29735707  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||||||    
T  29735708 agaatgaaataagcgtagtggagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaaga 29735761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8879914 - 8879728
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||      | ||||||| |||| || | ||| ||      
T  8879914 aagaaagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgttgtat------gtgtgttgggcggtgaagagccagcaca 8879821  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||||| |  |   ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8879820 agaatcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagaga 8879728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30783471 - 30783331
Alignment:
Q  64 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 163  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || | || |||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||  |||    
T  30783471 agaccagcgatgttgtatggaacaaagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgataatagaataagtgtagtggagatgaggatcttgcgttggatctgtg 30783373  T
Q  164 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30783372 gcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagag 30783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13172073 - 13171937
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| || ||||   | | |||||||  ||||| ||||||||| || |||||| |    
T  13172073 gatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacataaaaataaattaagcacatcagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagact 13171974  T
Q  172 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13171973 agacgggataggattagaaatgacaagattagagaga 13171937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9905310 - 9905223
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatg 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  9905310 gatgttgtatggtacatagtgttggacggttaataaccaacacgagaataaagttagtataacggagatgaggatgttgcattggatg 9905223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2518816 - 2518691
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaa-taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2518816 cgatgttgtatggaacagagagttgggcagtgaagaaccaatatgagaaaaaaaataagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaaga 2518718  T
Q  170 ttaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
     || ||  |||||||||||||||||||    
T  2518717 ctagatgagataggattagaaatgaca 2518691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4032974 - 4032922
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 68  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4032974 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagacc 4032922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37256140 - 37256011
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||| |||| |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |     
T  37256140 cgatgttgtatggtacagagtgttgagtagttaaaaacgaacaagaaaatcaagtaagcga--cggagatgatgatgttgcgttgaatgagtggttaaac 37256043  T
Q  171 taaataggataggattagaaatgacatcatta 202  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  37256042 taaatgagatagaattagaaatgacaccatta 37256011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45512922 - 45512799
Alignment:
Q  70 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  45512922 gcgatgttgtatggaacatagtgttggacattgaagaaccaacacgaaaataaaataagcatagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaaga 45512823  T
Q  170 ttaaataggataggattagaaatga 194  Q
     || ||||| |||| ||||||||||    
T  45512822 ctagatagg-tagggttagaaatga 45512799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Original strand, 25439338 - 25439395
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcga 73  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25439338 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagtcagaccggcga 25439395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520654
Alignment:
Q  137 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagaga 29520654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38328178 - 38328099
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  38328178 taagtgtagtggagatgacgatgttacgttggatgtatggtgagactaaagaggatagaattagaaatgacgacattaga 38328099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39760845 - 39760714
Alignment:
Q  75 gttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaa 174  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || |||||| | |||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |    
T  39760845 gttgtatgggacggggtgttggacggtaaagaaccaatacgagaaaaaatgaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattaga 39760746  T
Q  175 taggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  39760745 caagataggagtagaaatgataacattagaga 39760714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6510896 - 6510721
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||         ||| ||| ||||||||||||   |||||||     
T  6510896 aagaaagtactgcttaagttgaaaggaaagttctaacagacattagtcagaccgacgatg---------acatagtcttggacggttaagtgccaacata 6510806  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatt 201  Q
      |||| | |||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  6510805 ctaatcgagtaagtgtagcgg-gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccatt 6510721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 167
Target Start/End: Original strand, 13986386 - 13986447
Alignment:
Q  106 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 167  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13986386 aaccaacacgagaatcaggtaagcatagcggagatgaggatgttacactggatgagtggtaa 13986447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30456580 - 30456496
Alignment:
Q  127 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagt 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30456580 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagaccaa-tgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagt 30456496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Original strand, 30748352 - 30748453
Alignment:
Q  107 accaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    |||||||||| ||| || || | ||||| || |||| |||||| | ||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30748352 accaacatgataataaattaggcgtagcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacaga 30748451  T
Q  207 ga 208  Q
    ||    
T  30748452 ga 30748453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Original strand, 40813220 - 40813316
Alignment:
Q  112 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||||||||| || | |  |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  40813220 catgagaataaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagaga 40813316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 208
Target Start/End: Original strand, 45419157 - 45419233
Alignment:
Q  132 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  45419157 agcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga 45419233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 43732429 - 43732543
Alignment:
Q  76 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 175  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||  ||||| | ||| | ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  43732429 ttgtatggagcagaatgttggacggtgaagaaccaacacaagaataagatatgcgtagcagaaatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagactagat 43732528  T
Q  176 aggataggattagaa 190  Q
      ||||| |||||||    
T  43732529 gtgatagaattagaa 43732543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 13589301 - 13589374
Alignment:
Q  76 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  13589301 ttgtatagtacagagtgtttggcagtttaaaaccaacatgaaaatcaagtaagcgtagcatagatgaagatgtt 13589374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 30113595 - 30113551
Alignment:
Q  98 cggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  30113595 cggttaagaaccaacatgagaataaaataagcgtagaggagatga 30113551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39953684 - 39953552
Alignment:
Q  76 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 175  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||  || || | || ||||| |||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||     
T  39953684 ttgtatgggacagagtgttgagcggtaaagaaccaacacgaacataaagttagcgtagcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaac 39953585  T
Q  176 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | ||||  ||||||||| |   |||||||||||    
T  39953584 atgatataattagaaataatgacattagagaga 39953552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12492867 - 12492675
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  12492867 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggctttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 12492768  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  12492767 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagaga 12492675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1288069 - 1287877
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  1288069 aagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgatcggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 1287970  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1287969 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagaga 1287877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2075954 - 2075762
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  2075954 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 2075855  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2075854 agaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagaga 2075762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 1275067 - 1275259
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||    
T  1275067 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacgagtcaacatg 1275166  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1275167 agaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagaga 1275259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 10639099 - 10639291
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||||    
T  10639099 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaagagtcaacatg 10639198  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10639199 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagaga 10639291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28977337 - 28977145
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  28977337 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaacgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 28977238  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||||||||||||| | || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28977237 agaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagaga 28977145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16347858 - 16347666
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| |    
T  16347858 aagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttgagcggttaagagccaacacg 16347759  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |  ||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  16347758 agagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagaga 16347666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 34272824 - 34273011
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| |||    
T  34272824 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtccggccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatg 34272923  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||     || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34272924 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagacta-----gacaggattaggaatgacaccattagagaga 34273011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 20318793 - 20318974
Alignment:
Q  20 aagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaa 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||||||||    
T  20318793 aagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaagagtcaacatgagaa 20318892  T
Q  120 tcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 206  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |     |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20318893 tcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgacaccattagaga 20318974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27847
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27696 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaattctatctgacaatagtcggacagacgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatg 27795  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 167  Q
    ||||| || ||||  || ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  27796 agaattaagtaagcataacggagatgaggatgttgcattagatgagtggtaa 27847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 36200597 - 36200764
Alignment:
Q  29 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  36200597 ttaagttgaaaggaaaattctaccggacaacagtcaaactggcaatgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaag 36200696  T
Q  129 tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 196  Q
     ||| | ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  36200697 cgtatcagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 3301651 - 3301838
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||| |    
T  3301651 aagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagactgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagccaacacg 3301750  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |     || |||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  3301751 a-----aagtaagtgtagcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagaga 3301838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 24178326 - 24178504
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   || |||||           |||||| ||||||| |  |||||||    
T  24178326 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagacc---gacgttgt-----------tgttgggcggttaagagtcaacatg 24178411  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24178412 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 24178504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 7678331 - 7678471
Alignment:
Q  64 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 163  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || | || |||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||  |||    
T  7678331 agaccagcgatgttgtatggaacggagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgagaatagaacaagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtg 7678429  T
Q  164 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 205  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7678430 gcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagag 7678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 207
Target Start/End: Original strand, 9234925 - 9235062
Alignment:
Q  70 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9234925 gcgatgttatatggaacagagtgttggatggtaaaaaactaacacaagaataaaataagctgagcagagatggaaatgttgcattggatgtgtggtaaga 9235024  T
Q  170 ttaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
     || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9235025 ctagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Original strand, 30588310 - 30588446
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||  ||| |||||  | |||||| | | ||||| ||||||||||    
T  30588310 cgatgttgtacggaacagggtgttgggtggtaaaacaccaacacgagaataaaataagcatagtggagacaaggatgttgcgtgggatgtgtggtaagat 30588409  T
Q  171 taaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
     ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  30588410 caaatgagatatgattagaaatgacaatattagagag 30588446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 32516416 - 32516552
Alignment:
Q  72 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 171  Q
    |||||||||||| |  || |||| | ||||||| ||||| ||| ||||| || ||   ||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |    
T  32516416 gatgttgtatggaatggaatgtttggcggttaagaaccatcattagaataaagtacacgtaacggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagact 32516515  T
Q  172 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | | |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32516516 agacaggatagacttagaaatgacaacattagagaga 32516552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 1525447 - 1525595
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    |||||||  |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| || |||||||||||      
T  1525447 aaagtaccgcttaagttgaagggaaatttttatcgaacaacggtaagaccggcgatgttgtatgggac--agtgttgggcggtgaagaaccaacatgaac 1525544  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    || |||||||  | || || |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  1525545 ataaaataagctttgctgaaatgaggatgttacgtcggatgtgtggtaaga 1525595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5848462 - 5848403
Alignment:
Q  110 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5848462 aacatgagagtaaaataagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaaga 5848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Original strand, 3394538 - 3394591
Alignment:
Q  39 aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtg 92  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  3394538 aggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatagtacggagtg 3394591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Original strand, 21093663 - 21093768
Alignment:
Q  101 ttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcat 200  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||| || ||  ||| | |||||||||||||  ||    
T  21093663 ttaagaaccaacacgagaataaaataagtgtagtggatatgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactagatgtgatggaattagaaatgacaatat 21093762  T
Q  201 tagaga 206  Q
    ||||||    
T  21093763 tagaga 21093768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28187028 - 28186956
Alignment:
Q  136 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28187028 gagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11002786 - 11002709
Alignment:
Q  131 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11002786 tagcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagaga 11002709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32516273 - 32516160
Alignment:
Q  41 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 140  Q
    |||| ||||| |||||| | || |||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||| | | ||| |||| |||||| || |||| |||| ||||||    
T  32516273 gaaaattctaccggacagctgttagaccgacgatgttgtatggaatagagtgttgggcggcttagaactaacacgagaataaagtaagcgtagtggagat 32516174  T
Q  141 gatgatgttacatt 154  Q
    || |||||| ||||    
T  32516173 gaggatgtttcatt 32516160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 28245239 - 28245431
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  28245239 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacatg 28245338  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28245339 agaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagaga 28245431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51448189 - 51447991
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |  |||||||    
T  51448189 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatg 51448090  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  51448089 agaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtag 51447991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 5168630 - 5168822
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  5168630 aagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagagccaacatg 5168729  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5168730 agagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 5168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 52138602 - 52138794
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||| |||    
T  52138602 aagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatg 52138701  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52138702 agaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 52138794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 25191181 - 25191373
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  25191181 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagaccggaaatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaagagtcaacacg 25191280  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25191281 agagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagaga 25191373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 26490130 - 26490307
Alignment:
Q  28 cttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgt--atggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaat 125  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  26490130 cttaaatttaaaggaaaattatatcggacaacagtcagaccggcgatgttgtgtatggta-agtatgttgggcggttaagaaccaacaagagaatcaagt 26490228  T
Q  126 aagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  | |  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  26490229 aagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattaga 26490307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 38849899 - 38850088
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||| ||||    
T  38849899 aaagtaccacttaagttgaaagaaattttttatcggacaacagtcacaccgacgatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagtcaacacgaga 38849998  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| || | | |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  38849999 atcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagaga 38850088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33272478 - 33272316
Alignment:
Q  46 ttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatga 145  Q
    |||||||| |||||| |  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  33272478 ttctatcgaacaacacttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagga 33272379  T
Q  146 tgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33272378 tgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33272316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 54278850 - 54279020
Alignment:
Q  44 agttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgat 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  54278850 agttctatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgag 54278949  T
Q  144 gatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 214  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| || | | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  54278950 gatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtag 54279020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47542191 - 47542039
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||    
T  47542191 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatg 47542092  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  47542091 agaat-aagaaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 47542039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43695230 - 43695092
Alignment:
Q  31 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtg 130  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  43695230 aagttgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtg 43695131  T
Q  131 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    || | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  43695130 taacagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaaga 43695092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 53519388 - 53519576
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||| | |||| |||||||   ||||||| | |||||| |    
T  53519388 aagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtgttgtacggagtgttaagcggttaagagccaacacg 53519487  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 204  Q
    ||| | || | ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| | || | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  53519488 agagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattaga 53519576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 27917377 - 27917526
Alignment:
Q  19 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 118  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||  | ||||| |||||| | ||||    
T  27917377 aaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacaccggcgatgttgtatggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaaacgaga 27917476  T
Q  119 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaag 168  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  27917477 atcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaag 27917526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 3186571 - 3186724
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||| || | |||||||| || |||| |  ||||| |    
T  3186571 aagaaagtatcacttaagttgaaaggaaagttatatcggacaacagtcccaccaacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaacacg 3186670  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||  || |||  ||||||||| |||||||    
T  3186671 agaatcaagtaaatgtagcgtagatgagaatcttatgttggatgagcggtaaga 3186724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49503978 - 49503842
Alignment:
Q  77 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttac-----attggatgagtggtaagatt 171  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |     |||||||||||||||||| |    
T  49503978 tgtatggtatggagtgttggacggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagact 49503879  T
Q  172 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |   ||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  49503878 agacgagataggattgggaatgacaccattagagaga 49503842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 45728040 - 45728133
Alignment:
Q  108 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  | |    |||||||||||||||||||||||    
T  45728040 ccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatt 45728133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47233967 - 47233884
Alignment:
Q  125 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47233967 taagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagaga 47233884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50621734 - 50621648
Alignment:
Q  122 aaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  ||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50621734 aaataagtgtagcggagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagaga 50621648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2341095 - 2341003
Alignment:
Q  115 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || | | ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  2341095 gagaataaaataaggatagtggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagag 2341003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46432090 - 46431972
Alignment:
Q  77 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaata 176  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || ||| || |  ||||| |||||||  | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| || | |    
T  46432090 tgtatggaacagagtgttgggcggtaaacaactaatacaagaataaaataagcatggaggagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagaca 46431991  T
Q  177 ggataggattagaaatgac 195  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46431990 ggatagggttagaaatgac 46431972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 46227340 - 46227275
Alignment:
Q  77 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 142  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  46227340 tgtaaggtacggagtgttagacgattaaaaaccaacatgataatcaaataagcgtggtggagatga 46227275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19736990
Alignment:
Q  136 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagaga 19736990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 208
Target Start/End: Original strand, 54128272 - 54128372
Alignment:
Q  108 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| | || |||||||||||| | || |   ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  54128272 ccaacatgagaatcaagtaagcttagcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagag 54128371  T
Q  208 a 208  Q
    |    
T  54128372 a 54128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 208
Target Start/End: Original strand, 21992 - 22067
Alignment:
Q  133 gcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21992 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagaga 22067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Original strand, 30345384 - 30345480
Alignment:
Q  71 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 170  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||    ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||    
T  30345384 cgatgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatgaaaat----taagtatagcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagat 30345479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 208
Target Start/End: Original strand, 45236751 - 45236850
Alignment:
Q  109 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||| |||||| || ||||  |||| ||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45236751 caacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44134233 - 44134151
Alignment:
Q  87 agagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||   ||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||    
T  44134233 agagtgttggacggtgaaaaaccaacacgagaatgaaataagcttagataagatgataatgttatgttggatgtgtgataaga 44134151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676378
Alignment:
Q  139 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagaga 19676378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 193
Target Start/End: Original strand, 29919182 - 29919283
Alignment:
Q  92 gttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaa 191  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |   |||| |||||||||    
T  29919182 gttggagggtgaagaaccaacacgagaataaaatcagtgtagtggagatgacgatgttgtgttggatgtgtggtacgattagacgagatatgattagaaa 29919281  T
Q  192 tg 193  Q
    ||    
T  29919282 tg 29919283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 193
Target Start/End: Original strand, 29968335 - 29968436
Alignment:
Q  92 gttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaa 191  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |   |||| |||||||||    
T  29968335 gttggagggtgaagaaccaacacgagaataaaatcagtgtagtggagatgacgatgttgtgttggatgtgtggtacgattagacgagatatgattagaaa 29968434  T
Q  192 tg 193  Q
    ||    
T  29968435 tg 29968436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 46367793 - 46367732
Alignment:
Q  88 gagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 149  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  46367793 gagtgttggacggtaatgaaccaacacgagaataaaataagtgtagtagagatgaggatgtt 46367732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 31270 - 31462
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||| |  |||||||    
T  31270 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatg 31369  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  31370 agaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagaga 31462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2597
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  2750 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagactgacgttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaacatg 2651  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 169  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2650 ataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaaga 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 87058 - 86895
Alignment:
Q  42 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 141  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| ||||||| | || |||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  87058 aaagctctattggacagcagtcagaccaacgattttgtatggtacag--tgttgg-cggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatg 86962  T
Q  142 atgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  86961 aggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagaga 86895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25859 - 25733
Alignment:
Q  82 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 181  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||    
T  25859 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgata 25760  T
Q  182 ggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25759 ggattaggaatgacaccattagagaga 25733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12078 - 11886
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 115  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||| | | | ||||| |||||||| | |||||| ||| ||| |  |||||||    
T  12078 aagaaagtacctcttaagttaaaaggaaagttttatcggtcagcaatcagaacggagttgttgcatggtacaaaatgttgggcgggtaagagtcaacatg 11979  T
Q  116 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||||| || | |  |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  11978 agaatcaagtatgtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagaga 11886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4560
Alignment:
Q  82 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| ||| | || | || |||| |||||| | |||||||| |||||||| || | | ||||    
T  4686 ggtacggagtgttggacggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgata 4587  T
Q  182 ggattagaaatgacatcattagagaga 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4586 ggattataaatgacaccattagagaga 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  16 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgta 80  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||||||||||    
T  65 aagaaagtaccaattaagttgaaaggaaagttctatcacaaaacagttcgaccggcgatgttgta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University