View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20475_low_2 (Length: 500)

Name: NF20475_low_2
Description: NF20475
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20475_low_2
NF20475_low_2
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (13-482)||(33495734-33496184)
chr6 (19-476)||(5258438-5258899)
chr6 (90-476)||(10100145-10100541)
chr6 (19-476)||(9706309-9706770)
chr6 (19-476)||(5631350-5631812)
chr6 (90-476)||(20427924-20428320)
chr6 (180-464)||(2689354-2689638)
chr6 (226-476)||(607903-608153)
chr6 (234-480)||(14030558-14030805)
chr6 (271-472)||(2065048-2065249)
chr6 (307-475)||(30031081-30031249)
chr6 (232-402)||(30679224-30679394)
chr6 (305-476)||(28085199-28085370)
chr6 (197-476)||(6056058-6056337)
chr6 (348-473)||(35043732-35043857)
chr6 (177-384)||(27790851-27791058)
chr6 (177-417)||(26291474-26291713)
chr6 (338-472)||(28027117-28027251)
chr6 (90-160)||(30670486-30670556)
chr6 (340-435)||(2079191-2079286)
chr6 (398-476)||(9594000-9594078)
chr6 (377-473)||(31818433-31818529)
chr6 (121-169)||(3632645-3632693)
chr6 (393-476)||(33998292-33998375)
chr6 (295-393)||(24631125-24631223)
chr6 (396-476)||(32755833-32755913)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (19-476)||(31960102-31960563)
chr4 (13-476)||(23906589-23907056)
chr4 (13-476)||(435756-436223)
chr4 (90-476)||(33226807-33227203)
chr4 (13-476)||(1777303-1777770)
chr4 (13-476)||(48174381-48174848)
chr4 (13-472)||(53707321-53707784)
chr4 (13-482)||(56374817-56375290)
chr4 (19-437)||(27450500-27450922)
chr4 (13-476)||(48622829-48623282)
chr4 (177-476)||(1211678-1211977)
chr4 (19-429)||(39707990-39708405)
chr4 (91-476)||(47265490-47265887)
chr4 (191-476)||(46583112-46583397)
chr4 (191-476)||(50286680-50286965)
chr4 (207-476)||(43433643-43433912)
chr4 (95-475)||(16002532-16002920)
chr4 (195-478)||(41009636-41009922)
chr4 (287-476)||(52569803-52569992)
chr4 (188-464)||(35690016-35690286)
chr4 (177-402)||(55578729-55578951)
chr4 (332-470)||(45205142-45205280)
chr4 (351-476)||(33191136-33191261)
chr4 (310-476)||(4440684-4440849)
chr4 (350-476)||(12494618-12494744)
chr4 (377-476)||(28236080-28236179)
chr4 (329-476)||(31458875-31459022)
chr4 (295-476)||(1793285-1793454)
chr4 (348-476)||(39100821-39100949)
chr4 (332-474)||(34233323-34233465)
chr4 (393-475)||(43070053-43070135)
chr4 (175-292)||(3273115-3273232)
chr4 (305-474)||(7092510-7092678)
chr4 (93-284)||(17666518-17666716)
chr4 (374-464)||(29398711-29398800)
chr4 (177-335)||(54914618-54914775)
chr4 (342-410)||(26037836-26037904)
chr4 (377-476)||(27983095-27983194)
chr4 (392-474)||(20105761-20105843)
chr4 (92-388)||(41427439-41427742)
chr4 (340-409)||(2414583-2414651)
chr4 (185-262)||(20917685-20917762)
chr4 (393-474)||(31403310-31403391)
chr4 (180-248)||(17667845-17667913)
chr4 (353-470)||(21106853-21106972)
chr4 (357-476)||(25967555-25967672)
chr4 (404-476)||(54470129-54470201)
chr4 (420-475)||(10208976-10209031)
chr4 (341-473)||(11389579-11389713)
chr4 (406-471)||(2588905-2588970)
chr4 (300-461)||(44860672-44860833)
chr4 (391-476)||(50662298-50662383)
chr4 (129-166)||(55768985-55769022)
chr4 (129-166)||(55833241-55833278)
chr4 (187-259)||(1629136-1629208)
chr4 (93-165)||(17667935-17668006)
chr4 (138-166)||(39754979-39755007)
chr4 (374-462)||(40933198-40933286)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (13-476)||(8671447-8671914)
chr1 (19-476)||(32083033-32083494)
chr1 (13-482)||(49347675-49348149)
chr1 (90-476)||(1210343-1210739)
chr1 (13-476)||(43240669-43241136)
chr1 (13-476)||(51441053-51441519)
chr1 (13-476)||(51601585-51602052)
chr1 (177-476)||(30202418-30202717)
chr1 (91-437)||(34827429-34827785)
chr1 (88-476)||(37463159-37463548)
chr1 (227-476)||(9592479-9592728)
chr1 (214-476)||(22089826-22090088)
chr1 (177-464)||(19936216-19936504)
chr1 (237-476)||(8391525-8391766)
chr1 (282-476)||(696069-696263)
chr1 (276-476)||(15085728-15085928)
chr1 (90-322)||(27445496-27445738)
chr1 (177-433)||(46226613-46226868)
chr1 (253-476)||(9599682-9599905)
chr1 (281-435)||(39140313-39140466)
chr1 (91-274)||(32066761-32066951)
chr1 (195-427)||(11331401-11331633)
chr1 (195-427)||(11489422-11489654)
chr1 (344-476)||(34792637-34792768)
chr1 (123-263)||(35828894-35829044)
chr1 (188-266)||(52739965-52740043)
chr1 (377-476)||(32231242-32231341)
chr1 (340-476)||(18469368-18469504)
chr1 (339-463)||(35672545-35672669)
chr1 (278-381)||(41560232-41560335)
chr1 (347-409)||(3192071-3192133)
chr1 (347-409)||(3200889-3200951)
chr1 (347-409)||(3209726-3209788)
chr1 (393-476)||(9509229-9509312)
chr1 (177-272)||(52640917-52641012)
chr1 (320-462)||(1661264-1661406)
chr1 (338-476)||(4379861-4379999)
chr1 (339-476)||(40419496-40419633)
chr1 (93-165)||(52641060-52641132)
chr1 (429-476)||(33561077-33561124)
chr1 (377-412)||(51812432-51812467)
chr1 (374-476)||(16142172-16142274)
chr1 (340-437)||(7814322-7814419)
chr1 (88-141)||(32405146-32405199)
chr1 (407-476)||(40920825-40920894)
chr1 (220-351)||(32404941-32405073)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (13-476)||(36565529-36565996)
chr8 (13-476)||(12492130-12492597)
chr8 (19-476)||(42854292-42854762)
chr8 (88-476)||(36544748-36545141)
chr8 (19-476)||(15215559-15216019)
chr8 (184-476)||(18124878-18125169)
chr8 (90-336)||(4032922-4033178)
chr8 (227-470)||(39946602-39946845)
chr8 (195-476)||(25299950-25300231)
chr8 (195-476)||(25288613-25288896)
chr8 (207-469)||(37077490-37077752)
chr8 (90-476)||(8879728-8880118)
chr8 (274-476)||(36395238-36395443)
chr8 (195-341)||(25439249-25439395)
chr8 (122-437)||(29735447-29735761)
chr8 (295-476)||(18752161-18752342)
chr8 (253-476)||(2796326-2796551)
chr8 (177-354)||(13984730-13984906)
chr8 (180-417)||(13589138-13589374)
chr8 (195-410)||(30113551-30113766)
chr8 (245-469)||(6510721-6510936)
chr8 (332-473)||(30783331-30783471)
chr8 (268-427)||(9905223-9905383)
chr8 (340-476)||(13171937-13172073)
chr8 (91-284)||(28300588-28300788)
chr8 (180-281)||(33830716-33830817)
chr8 (339-464)||(2518691-2518816)
chr8 (339-470)||(37256011-37256140)
chr8 (338-462)||(45512799-45512922)
chr8 (405-476)||(29520583-29520654)
chr8 (393-472)||(38328099-38328178)
chr8 (343-474)||(39760714-39760845)
chr8 (374-435)||(13986386-13986447)
chr8 (395-480)||(30456496-30456580)
chr8 (375-476)||(30748352-30748453)
chr8 (91-167)||(18849722-18849798)
chr8 (380-476)||(40813220-40813316)
chr8 (400-476)||(45419157-45419233)
chr8 (188-287)||(30578704-30578803)
chr8 (91-166)||(41444912-41444987)
chr8 (245-303)||(10824549-10824607)
chr8 (189-267)||(18849624-18849697)
chr8 (177-251)||(38667252-38667326)
chr8 (344-458)||(43732429-43732543)
chr8 (245-303)||(45231207-45231265)
chr8 (344-476)||(39953552-39953684)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (13-476)||(11593480-11593954)
chr7 (13-476)||(31004751-31005217)
chr7 (13-475)||(36651521-36651987)
chr7 (13-476)||(33350094-33350561)
chr7 (20-470)||(38606540-38606993)
chr7 (13-476)||(46356144-46356606)
chr7 (13-476)||(39906658-39907134)
chr7 (194-476)||(33072666-33072948)
chr7 (177-476)||(35906489-35906788)
chr7 (13-476)||(36869577-36870044)
chr7 (19-456)||(32630140-32630569)
chr7 (13-354)||(37616443-37616788)
chr7 (19-476)||(49028800-49029270)
chr7 (227-476)||(34869165-34869414)
chr7 (195-476)||(43281389-43281670)
chr7 (90-327)||(48918986-48919233)
chr7 (266-476)||(12841563-12841773)
chr7 (226-464)||(7272784-7273021)
chr7 (244-476)||(23404180-23404412)
chr7 (19-239)||(24177720-24177944)
chr7 (299-476)||(25579364-25579536)
chr7 (349-476)||(37617811-37617938)
chr7 (295-476)||(13859296-13859475)
chr7 (245-417)||(7189580-7189751)
chr7 (317-476)||(27021994-27022153)
chr7 (177-434)||(21517656-21517911)
chr7 (376-476)||(45836768-45836868)
chr7 (393-475)||(30200248-30200330)
chr7 (374-476)||(36514493-36514595)
chr7 (380-476)||(39811855-39811951)
chr7 (356-476)||(47848548-47848668)
chr7 (178-284)||(23087582-23087688)
chr7 (340-408)||(15681215-15681283)
chr7 (385-476)||(35559282-35559373)
chr7 (374-475)||(28542173-28542272)
chr7 (355-460)||(38135520-38135625)
chr7 (392-476)||(44855460-44855544)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (13-476)||(2610055-2610522)
chr2 (90-476)||(3865670-3866066)
chr2 (19-476)||(41763329-41763798)
chr2 (88-476)||(8180376-8180774)
chr2 (24-476)||(4807130-4807586)
chr2 (19-476)||(45367912-45368374)
chr2 (91-476)||(11992394-11992789)
chr2 (13-457)||(451929-452371)
chr2 (116-476)||(3243939-3244304)
chr2 (23-417)||(30743160-30743558)
chr2 (203-474)||(41197518-41197792)
chr2 (13-325)||(38453059-38453373)
chr2 (90-464)||(24583906-24584290)
chr2 (183-464)||(6238054-6238334)
chr2 (292-482)||(36183261-36183451)
chr2 (93-476)||(13148914-13149307)
chr2 (284-476)||(12734508-12734695)
chr2 (305-476)||(38429707-38429878)
chr2 (281-476)||(16097278-16097477)
chr2 (271-474)||(23997406-23997609)
chr2 (13-164)||(12475031-12475176)
chr2 (178-284)||(17581164-17581270)
chr2 (91-255)||(37281706-37281882)
chr2 (368-476)||(19337136-19337245)
chr2 (89-167)||(36038817-36038895)
chr2 (192-276)||(6465431-6465515)
chr2 (100-164)||(13592958-13593022)
chr2 (188-276)||(33594757-33594845)
chr2 (378-476)||(7825254-7825352)
chr2 (395-476)||(9556656-9556737)
chr2 (342-417)||(1456095-1456168)
chr2 (396-476)||(38452977-38453057)
chr2 (341-391)||(32443473-32443523)
chr2 (399-464)||(42092436-42092501)
chr2 (444-476)||(13241033-13241065)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (90-476)||(12492675-12493071)
chr5 (13-476)||(1274792-1275259)
chr5 (13-476)||(1287877-1288344)
chr5 (21-476)||(10638833-10639291)
chr5 (13-476)||(2075762-2076229)
chr5 (13-474)||(20318518-20318974)
chr5 (13-476)||(28977145-28977612)
chr5 (19-476)||(3301382-3301838)
chr5 (19-360)||(3394244-3394591)
chr5 (13-476)||(24178051-24178504)
chr5 (114-464)||(36200404-36200764)
chr5 (227-476)||(34272767-34273011)
chr5 (91-288)||(16347879-16348085)
chr5 (210-435)||(27622-27847)
chr5 (282-476)||(16347666-16347860)
chr5 (332-473)||(7678331-7678471)
chr5 (181-259)||(43423578-43423656)
chr5 (90-294)||(27302420-27302631)
chr5 (338-475)||(9234925-9235062)
chr5 (88-164)||(27526-27602)
chr5 (192-284)||(20077297-20077389)
chr5 (90-166)||(17341809-17341885)
chr5 (92-164)||(23979832-23979904)
chr5 (339-475)||(30588310-30588446)
chr5 (340-476)||(32516416-32516552)
chr5 (287-437)||(1525447-1525595)
chr5 (378-437)||(5848403-5848462)
chr5 (207-293)||(16779407-16779493)
chr5 (369-474)||(21093663-21093768)
chr5 (89-165)||(37124166-37124243)
chr5 (227-427)||(3096921-3097120)
chr5 (404-476)||(28186956-28187028)
chr5 (399-476)||(11002709-11002786)
chr5 (309-422)||(32516160-32516273)
chr5 (177-293)||(43558285-43558401)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (90-476)||(25190977-25191373)
chr3 (13-476)||(38849621-38850088)
chr3 (90-482)||(51447991-51448393)
chr3 (13-437)||(47542039-47542466)
chr3 (177-476)||(28245132-28245431)
chr3 (93-436)||(27917173-27917526)
chr3 (235-476)||(52138553-52138794)
chr3 (253-476)||(5168599-5168822)
chr3 (177-472)||(26490012-26490307)
chr3 (88-336)||(29817101-29817358)
chr3 (91-396)||(48221383-48221698)
chr3 (253-472)||(53519357-53519576)
chr3 (177-321)||(54425349-54425493)
chr3 (314-476)||(33272316-33272478)
chr3 (14-167)||(52138356-52138503)
chr3 (312-482)||(54278850-54279020)
chr3 (187-439)||(30345232-30345480)
chr3 (213-437)||(3186500-3186724)
chr3 (299-437)||(43695092-43695230)
chr3 (88-230)||(19757664-19757816)
chr3 (88-167)||(19736762-19736841)
chr3 (245-437)||(40674440-40674632)
chr3 (345-476)||(49503842-49503978)
chr3 (376-469)||(45728040-45728133)
chr3 (19-150)||(19757517-19757642)
chr3 (393-476)||(47233884-47233967)
chr3 (46-131)||(9258443-9258522)
chr3 (390-476)||(50621648-50621734)
chr3 (91-164)||(43111626-43111699)
chr3 (383-475)||(2341003-2341095)
chr3 (345-463)||(46431972-46432090)
chr3 (345-410)||(46227275-46227340)
chr3 (404-476)||(19736918-19736990)
chr3 (376-476)||(54128272-54128372)
chr3 (401-476)||(21992-22067)
chr3 (377-476)||(45236751-45236850)
chr3 (355-437)||(44134151-44134233)
chr3 (407-476)||(19676378-19676447)
chr3 (360-461)||(29919182-29919283)
chr3 (360-461)||(29968335-29968436)
chr3 (356-417)||(46367732-46367793)
chr3 (235-323)||(50621801-50621889)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-476)||(30995-31462)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (119-476)||(82348-82715)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (93-437)||(2597-2951)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (19-476)||(11886-12347)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (177-476)||(86895-87196)
scaffold0045 (88-165)||(88532-88609)
scaffold0045 (13-62)||(88636-88685)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (195-348)||(1-156)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (350-476)||(25733-25859)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (113-167)||(5813-5867)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (350-476)||(4560-4686)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 482
Target Start/End: Original strand, 33495734 - 33496184
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  33495734 tgaacaggaggctagagacttggagtcaaaccttaaaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacaga------gtatatggaatgtaacttcat 33495827  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacacatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33495828 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacacatcttgggtccatagtacaaaataacggagaaatag 33495927  T
Q  213 aagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         
T  33495928 aagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagtttaaa----- 33496022  T
Q  313 gttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatg 412  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33496023 --------ggacaacagtcagacctgcaatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatg 33496114  T
Q  413 atgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 482  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33496115 atgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtag 33496184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5258899 - 5258438
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5258899 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggcttccgcctgagtagaagcaagacaaa------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 5258806  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258805 gagaagtgggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 5258706  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||| ||||||| | ||||    
T  5258705 atagaagctgatgtacatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttttgcgatgagaaagtaccacttaagctgaaag 5258606  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||| ||||   || |||||||||||||| |    
T  5258605 gaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaacacgagagcaaagtaagtgtagcggaggt 5258506  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  5258505 gagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagaga 5258438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 10100541 - 10100145
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||    
T  10100541 gagtatatggaatgtaactttagcaaaatgagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 10100442  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10100441 ttgggtccatagtacaaaatgtcggagaaatagaagctgatataaatcatcgtattcaagctgggtggttggaatggagaagagcctcatgtgttttgtg 10100342  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||    
T  10100341 agataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaagagccaa 10100242  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || | |  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10100241 gacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagaga 10100145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Original strand, 9706309 - 9706770
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||| | ||||||||||||  ||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9706309 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggttcccgcctgagtagaagcaaga----tg--gagtatatggaatgtaacttcagcaaaag 9706402  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9706403 gagaagtgggtataccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatggtacaaaatgatggagaa 9706502  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  9706503 atagaagcaggtgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcatcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaag 9706602  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||| |  ||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  9706603 gaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagat 9706702  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||||| || |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9706703 gaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 9706770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Original strand, 5631350 - 5631812
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||| ||||| || |||||| || || ||| |||||||||| || |||||||||  |||||| |      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5631350 ggaggctggagacctgtaggcaagccttagaagagtatggtttccgcatgagtagaagcaagacaaa------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 5631443  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca----------tcttgggtccatagtacaaaatgacggaga 207  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631444 gagaagtgggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatttttgggtccatagtacaaaatgacggaga 5631543  T
Q  208 aatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaa 307  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  5631544 aatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaa 5631643  T
Q  308 ggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggaga 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||  |||| | || ||||||||||| |||    
T  5631644 ggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagccaacgcgagagtaaagtaagtgtagcgaaga 5631743  T
Q  408 tgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  5631744 tgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagaga 5631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20428320 - 20427924
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |         ||     
T  20428320 gagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattaggtctacctaggaggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacgcggtttaaatata 20428221  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  20428220 ttgggtccacagtacaaaacgacggaaaaatagaagcagatgtaaatcatcgtatccaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtg 20428121  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||    
T  20428120 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaactaaaaatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaagagccaa 20428021  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20428020 cacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 20427924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 464
Target Start/End: Original strand, 2689354 - 2689638
Alignment:
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||  | |||||||    
T  2689354 ttgggtctatagtacaaaacgacggagaaatagaatcagatgtaaatcatcgtagtcaagctggatgattgaaatggagaagtgcctcatgtattttgtg 2689453  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||    
T  2689454 tgataagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtcagaccgtcgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaacagccaa 2689553  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    |  |||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2689554 cgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgaca 2689638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 476
Target Start/End: Original strand, 607903 - 608153
Alignment:
Q  226 tcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggaca 325  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  607903 tcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagacatgaccacttaaactgaaagaaaagttctatcggaca 608002  T
Q  326 acagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattgga 425  Q
     |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  608003 gcagtcagaccggcaatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgttccgttgga 608102  T
Q  426 tgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  608103 tgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagaga 608153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 480
Target Start/End: Original strand, 14030558 - 14030805
Alignment:
Q  234 ttcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcag 333  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  14030558 ttcaaactgggtggttgaaatggagaatagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaa 14030657  T
Q  334 acctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtgg- 432  Q
    ||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||     
T  14030658 actagcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggt 14030757  T
Q  433 taagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagt 480  Q
    ||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14030758 taagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagt 14030805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 271 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2065249 - 2065048
Alignment:
Q  271 tgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggtt 370  Q
    |||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2065249 tgttttatttgataagaaagtacatcttaagttgaaaggaaacttctatcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacggtt 2065150  T
Q  371 aaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  2065149 aagagccaacacgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccatta 2065050  T
Q  471 ga 472  Q
    ||    
T  2065049 ga 2065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 307 - 475
Target Start/End: Original strand, 30031081 - 30031249
Alignment:
Q  307 aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggag 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30031081 aggaaagttctatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggag 30031180  T
Q  407 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||| | ||||   ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30031181 atgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagag 30031249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 402
Target Start/End: Original strand, 30679224 - 30679394
Alignment:
Q  232 tattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtc 331  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30679224 tattcaagttgggtggttgaaatagagaagaggctcaggtgttttgagcgataagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtc 30679323  T
Q  332 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    |||||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30679324 agaccgacgatgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacgagaatcaagtaagtgtagc 30679394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 305 - 476
Target Start/End: Original strand, 28085199 - 28085370
Alignment:
Q  305 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 404  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28085199 aaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcag 28085298  T
Q  405 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28085299 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagaga 28085370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6056337 - 6056058
Alignment:
Q  197 aatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactac 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||  |||  |||||| || ||||||||| ||  |     
T  6056337 aatgacgaagaaatagaagcatatgtaaaatatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaagagcttcaagtgttttatgcgataagaaaatatcat 6056238  T
Q  297 ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataag 396  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  6056237 ttaagttgaaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacaatgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaag 6056138  T
Q  397 tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||  || |||  |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||  |||||  ||||||| |||||||||||    
T  6056137 cgtagtagaaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagaga 6056058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35043857 - 35043732
Alignment:
Q  348 atggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaatagga 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| | | ||    
T  35043857 atggtacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatga 35043758  T
Q  448 taggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  35043757 taggattatgaatgacaccattagag 35043732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 27790851 - 27791058
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||| | ||| ||  ||||||| || |||||||| ||||  ||||||    
T  27790851 atcttggatccatagtacaaaatgacgcataaatagaagcaagtctaaatcatcataataaagttgagtggttgaaatagagaagagcctcaagtgtttt 27790950  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
      ||||||||| | | |  || |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||     | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27790951 acgtgataagatattgcctctaaagtgtaaaggaaaattctattggacaatagtcatgttggagatgttgtatggtacaaagtgttggacgattaaaaac 27791050  T
Q  377 caacatga 384  Q
    ||||||||    
T  27791051 caacatga 27791058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 417
Target Start/End: Original strand, 26291474 - 26291713
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||  | ||||    
T  26291474 atcttgagtccatagtagaaaatgatggagaaatagaagcatacgcaaatcaacgtattcaagttggatggttgaaatgtagaataacctcatgtatttt 26291573  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
     ||||||||||||| ||   |||||||  ||| ||| || ||||| |||||  ||| ||   | |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||    
T  26291574 atgtgataagaaagcacatgttaagttggaagtaaaattatatcgaacaactatcatactaacaatgttgtatggtacggagtgttaggc-gttgaaaac 26291672  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 417  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  26291673 caacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgtt 26291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28027251 - 28027117
Alignment:
Q  338 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  28027251 gcgatgttgtatggtatggagtgttgggaggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaaga 28027152  T
Q  438 ttaaataggataggattagaaatgacatcattaga 472  Q
     || || | |||||||||| |||||| || |||||    
T  28027151 ctagatggcataggattaggaatgacgtcgttaga 28027117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 30670486 - 30670556
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatat 160  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30670486 gagtatatagaatgtatctttagcaaaaggagaagtaggtataccttggaggtgaaagttggagatcatat 30670556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 435
Target Start/End: Original strand, 2079191 - 2079286
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 435  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  2079191 gatgttgtatggaacatagtgatggacggtgaagaactaacacgagaataaaataagcgtagcggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaa 2079286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9594078 - 9594000
Alignment:
Q  398 gtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9594078 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagaga 9594000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 473
Target Start/End: Original strand, 31818433 - 31818529
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  31818433 caacatgagaataaaataagtgtagcagagatgagaatgttgcattggatatgtgttaagattagatgagataagattagaaatgaaattattagag 31818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Original strand, 3632645 - 3632693
Alignment:
Q  121 gaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632645 gaagtagttctacctttgaggtgaaagttggagatcatatcatacccta 3632693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33998375 - 33998292
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33998375 taagcgtagcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagaga 33998292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24631223 - 24631125
Alignment:
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaat 393  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||| | |||| | |||||||||||    
T  24631223 acttaagttgaaatgaaagttatatcggacaacaatcaaacttgcaatgttgtatgctacagagggttgggtgattaagagccaaaacgagaatcaaat 24631125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 476
Target Start/End: Original strand, 32755833 - 32755913
Alignment:
Q  396 gtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32755833 gtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagaga 32755913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 31960563 - 31960102
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||      |||||||||||||||||||| |  |||    
T  31960563 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacaga------gtatatggaatgtaacttcagcggaag 31960470  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagtt-acac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||         ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31960469 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaa 31960370  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31960369 atagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaag 31960270  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31960269 gaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagat 31960170  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31960169 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 31960102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23907056 - 23906589
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  23907056 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcaa 23906963  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23906962 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 23906863  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23906862 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 23906763  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23906762 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 23906663  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23906662 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 23906589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 435756 - 436223
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  | ||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  435756 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcacgacgga------gtatatggaatgtaacttcag 435849  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  435850 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtataaaatgac 435949  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  435950 ggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgagtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 436049  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  436050 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 436149  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  436150 agagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 436223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Original strand, 33226807 - 33227203
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||    
T  33226807 gagtatatggaatgtaacttcagcggaaggacaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 33226906  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  33226907 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgta 33227006  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||    
T  33227007 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 33227106  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33227107 catgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33227203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1777770 - 1777303
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||  || || ||      ||||||||||||||||||||     
T  1777770 tgaacgggaggctagagacctggaggcaaaccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaatacgga------gtatatggaatgtaacttcag 1777677  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  1777676 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacgttttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 1777577  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1777576 agagaaatagaagcaaatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 1777477  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| | |||||| |  |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1777476 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccgacgttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagc 1777377  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
      |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1777376 aaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 1777303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 48174848 - 48174381
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||  ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  48174848 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatgaattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 48174755  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  48174754 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaagtgac 48174655  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  48174654 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagt 48174555  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  48174554 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgaaaatcaagtaagtatagc 48174455  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
      |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  48174454 aaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagaga 48174381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 472
Target Start/End: Original strand, 53707321 - 53707784
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      |||||| |||||||||||||     
T  53707321 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatcgaatgtaacttcag 53707414  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  53707415 tggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttacacggtctaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 53707514  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53707515 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagactcagatgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 53707614  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||||||||||||||||| || || || |||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53707615 tgaaaggaaagttctatcggccagcattccgaccggcgttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 53707714  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 472  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  53707715 agagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattaga 53707784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 482
Target Start/End: Original strand, 56374817 - 56375290
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  56374817 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagtgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 56374910  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  56374911 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 56375010  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  56375011 ggagaaatagaagcagatataagccatcgtattcaagctgggtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaatt 56375110  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  56375111 tgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagaccagcgttattgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaacaagtgtagc 56375210  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 482  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  56375211 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtag 56375290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27450922 - 27450500
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||      |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27450922 ggaggctagagacctcgaggcaagccttagaagcgtatggtttccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatttggaatgtaacttcagcaaaag 27450829  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||         ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27450828 gagaagtgggtataccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttacatatcttgggtccatagtgcaaaatgatggagaa 27450729  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  27450728 atagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaag 27450629  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  27450628 gaaaattctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagat 27450529  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    || |||||| |  ||||||||||||||||    
T  27450528 gaggatgttgcgctggatgagtggtaaga 27450500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 48623282 - 48622829
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  48623282 tgaacgggaggctatagatctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 48623189  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctag-ttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  48623188 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacacgatttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 48623089  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48623088 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaaagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 48622989  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||              |||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48622988 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttattgtatggt--------------ggttaggagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 48622903  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48622902 agagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 48622829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1211977 - 1211678
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| | | | ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1211977 atcttgtgtccatagtacaaaataacagagaaatagaagcaggtgtaaatcatcgtattcaagttaggtagttgaaatggagaagagcctcaaatgtttt 1211878  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  1211877 gtatgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggtgatgttgtgtggtacagagtgttggacggttaagagc 1211778  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| | || | | |||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  1211777 caacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagaga 1211678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 39707990 - 39708405
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||      ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39707990 ggaggctagagacatggtgacaagccttagaagcgtatggtttctgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatataacttcagcaaaag 39708083  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||  |         |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39708084 gagaattaggtctatcttggaggtgaaatttggagatcatattatacctcaagttatgcggtttaaatatcttgggtcgatagtacaaaatgacggagaa 39708183  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatg-ttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaa 307  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39708184 atagaagcaggtgtaaatcctcgtattcaagctggatggttgaaatggataagagccttaggtggttttttgtgataagaaagtaccacttaagttgaaa 39708283  T
Q  308 ggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggaga 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||| | |||    
T  39708284 ggaaagttctatcgggcaacagtccgatcgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaggcaacacgagaatcaagtaagtgtagtgcaga 39708383  T
Q  408 tgatgatgttacattggatgag 429  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  39708384 tgaggatgttgcgttggatgag 39708405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 47265887 - 47265490
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tct 180  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| |         |||    
T  47265887 agtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaggtcatatcataccccaagttacatagtttaaatatct 47265788  T
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgt 280  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||| || |||| ||| ||||||| || || |||||||||     
T  47265787 tggatccatagtataaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagccatcgt-ttcaagctgggtgattgaaatgaagaagagccttaggtgttttgtgc 47265689  T
Q  281 gataagaaagtactac---ttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |    
T  47265688 gataagaaagtagtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtcagaccagcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagtc 47265589  T
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  |||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | |||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  47265588 aacacgagaatcaagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagaga 47265490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 46583397 - 46583112
Alignment:
Q  191 gtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  46583397 gtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtattttgtgcgataagaaag 46583298  T
Q  291 tactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatca 390  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  46583297 tatcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagatcggcgctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatca 46583198  T
Q  391 aataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| || | || |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46583197 agtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagaga 46583112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 476
Target Start/End: Original strand, 50286680 - 50286965
Alignment:
Q  191 gtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  50286680 gtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagtcacatgtgttttgtgcgataagaaag 50286779  T
Q  291 tactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatca 390  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  50286780 taccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagatcgacgttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatca 50286879  T
Q  391 aataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50286880 agtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 50286965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 207 - 476
Target Start/End: Original strand, 43433643 - 43433912
Alignment:
Q  207 aaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaa 306  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||    
T  43433643 aaatagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtgattgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtgtcacttaagttgaa 43433742  T
Q  307 aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggag 406  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43433743 aggaaagttctatcggacagcaatcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagag 43433842  T
Q  407 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43433843 atgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 43433912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 475
Target Start/End: Original strand, 16002532 - 16002920
Alignment:
Q  95 tatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctag-ttacac--------atcttgggt 185  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  ||||||        ||||||| |    
T  16002532 tatggaatataactttagcaaaaggagaagttagtctaccttggaggtaaaagttggaaatcatatcataccccaaattacacggtttaaaatcttggtt 16002631  T
Q  186 ccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataa 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16002632 ccatagtacaaaatgacggagacatagaagcagatgtaaatcatcgtatttaagctgagtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgtgataa 16002731  T
Q  286 gaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgag 385  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||  |||||| |  ||||| |||    
T  16002732 gaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatgttgtat-gaacgaagtgttgggaggttaagagtcaacacgag 16002830  T
Q  386 aatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||||||||    |||||||||||||||| || |    |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  16002831 aatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagag 16002920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41009922 - 41009636
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagt---ctcagatgttttgtgtgataagaaagt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| | | ||||||| |||||||||| |   || || || ||||| |||||||||| |    
T  41009922 aaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcttcgtattcaagttaggtggttgaaatggagaagattaatctgaggtgatttgtatgataagaaaat 41009823  T
Q  292 actacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaa 391  Q
    || |||||||||   |  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  41009822 accacttaagttgggaaaaaagttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaacatgagaatcaa 41009723  T
Q  392 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagata 478  Q
     ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||  ||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41009722 gtaagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagata 41009636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 287 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 52569992 - 52569803
Alignment:
Q  287 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 386  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||    
T  52569992 aaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgaga 52569893  T
Q  387 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52569892 atcaagtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 52569803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 464
Target Start/End: Original strand, 35690016 - 35690286
Alignment:
Q  188 atagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataaga 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||     ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | | |||||| ||||||||||    
T  35690016 atagtacaaaatgccggagaaatagaa-----tgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtg-cgggtgttttatgtgataaga 35690109  T
Q  288 aagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaa 387  Q
    |||| |   ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||  || |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  35690110 aagtgccgtttaagttgagaggaaaattctatcagacaacagttagaccgacgatgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaa 35690209  T
Q  388 tcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || |   ||||||||||| |||||||    
T  35690210 tcaagtaagtgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgaca 35690286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 402
Target Start/End: Original strand, 55578729 - 55578951
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||| | | ||||| | ||||||||||   |||||||||||    
T  55578729 atcttggatctatagtataaaatgactgagaaatagaagcatacataaatcatcgtatttaagttaggtggttaaaatggagaagatcttcagatgtttt 55578828  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
     |||||||| |   |    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   |||||||| ||||||| |||    
T  55578829 atgtgataaca---tgtcgcttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtatgaagtgttgggcggttaagaac 55578925  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55578926 caacacgagaatcaattaagtgtagc 55578951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45205142
Alignment:
Q  332 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtg 45205181  T
Q  432 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    |||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  45205180 gtaagactagacgggataggattaggaatgacaccatta 45205142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33191261 - 33191136
Alignment:
Q  351 gtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatag 450  Q
    |||| ||||||||| || |||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33191261 gtacggagtgttgggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggatag 33191162  T
Q  451 gattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  33191161 gattaggaatgacaccattagagaga 33191136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 310 - 476
Target Start/End: Original strand, 4440684 - 4440849
Alignment:
Q  310 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  4440684 aaagttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtgttgg-cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatt 4440782  T
Q  410 atgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |||||| | || |||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  4440783 aggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagaga 4440849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 350 - 476
Target Start/End: Original strand, 12494618 - 12494744
Alignment:
Q  350 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 449  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||    
T  12494618 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 12494717  T
Q  450 ggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12494718 ggattaggaatgacaccattagagaga 12494744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 28236080 - 28236179
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28236080 caacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagaga 28236179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 476
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31459022
Alignment:
Q  329 gtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatga 428  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || ||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttga 31458974  T
Q  429 gtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  31458975 gtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagaga 31459022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 476
Target Start/End: Original strand, 1793285 - 1793454
Alignment:
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||| ||    
T  1793285 acttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaca------------atgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagta 1793372  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1793373 agtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggaga 1793454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39100949 - 39100821
Alignment:
Q  348 atggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaatagga 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |     ||||||||||||| || | | ||    
T  39100949 atggtacagagtgttggacagttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatga 39100850  T
Q  448 taggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39100849 taggattaggaatgacaccattagagaga 39100821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34233465 - 34233323
Alignment:
Q  332 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 431  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | || || |||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  34233465 agaccagcgatgctgtatggaacagagagttgggcagtgaagaaccaacacgggaataagataagtgtagtggagatgatgatgttgtgttggatgtgtg 34233366  T
Q  432 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
     ||||| || ||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34233365 ataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagaga 34233323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43070135 - 43070053
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43070135 taagtgtagcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 3273115 - 3273232
Alignment:
Q  175 acatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtt 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||    
T  3273115 acatcttaggtccatagtacaaaacgacaaagaaatagaagcaaatataaaccatcgaattcaagttggatggttgaaatggagatgagcctcatttgtt 3273214  T
Q  275 ttgtgtgataagaaagta 292  Q
    || ||||||| |||||||    
T  3273215 ttatgtgatacgaaagta 3273232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 7092678 - 7092510
Alignment:
Q  305 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 404  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||| || | | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  7092678 aaaggaaaattctattagacagcagttagatcggcgatgttgtatggtacggagttttaggcagttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagcag 7092579  T
Q  405 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
    |||||| ||||||    |||||||||||||||  || |  ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  7092578 agatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagaga 7092510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17666716 - 17666518
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacaca---------tcttgg 183  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||   |||||||||         ||||||    
T  17666716 tatatgtaatgcaatttcatcaaaaggcgaagtatttctatcttagaggtgaacgttagagatcatatcataca--agttacacagtttaaatatcttgg 17666619  T
Q  184 gtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgat 283  Q
    || || ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||  |||||| ||||||    
T  17666618 gttcaaagtacaaaatgtcgaagaaataaaagcaaatgtaaatcatcgtattcaagttggattgttgaaatggagaagagcatcatgtgttttatgtgat 17666519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 464
Target Start/End: Original strand, 29398711 - 29398800
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||| || | || |||||| ||||||||    
T  29398711 aaccaacatgagaataaaataagtgtagcggagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgaca 29398800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 54914775 - 54914618
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| || |  |||||||      ||||||| |||||||| || ||  | ||||||    
T  54914775 atcttgggtccatggtataaaatgatggagaaatagaaacagatgtaaatccttgtattcaaatcatgtggttgaaatggagaaaag-ctttggtgtttt 54914677  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagac 335  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  54914676 atgtgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaaattctatcggtcaggagtcagac 54914618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037836
Alignment:
Q  342 tgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 410  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatga 26037836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 27983095 - 27983194
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||    | |||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983095 caacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 27983194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20105843 - 20105761
Alignment:
Q  392 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || |   |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20105843 ataaatgtagcggagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattagaga 20105761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 388
Target Start/End: Original strand, 41427439 - 41427742
Alignment:
Q  92 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atctt 181  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||         |||||    
T  41427439 gtatatgaaatgtaatttcagcaaaaaacgaagtagttctaccttaaaagtgaaaattgaagatcatatcataccccaagttacacgacttaaatatctt 41427538  T
Q  182 gggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtg 281  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||  ||||| ||||||| ||| ||||||| || || | ||| ||||||| |||| || |    
T  41427539 gtgctcatagtacagaatgacggagaaatataagcaagtacaa-acatcacattcaagttgggtggttgaaatagatacgagcctcagatattttatgcg 41427637  T
Q  282 ataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaaca 381  Q
    || | ||| |||  || ||||| || | ||| || ||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41427638 at-acaaaatacctctcaagttgaaggtaaaatt-tattggacaactgtcagaacaacgatgttgtatgaaacagagtgttggacgattaagaaccaaca 41427735  T
Q  382 tgagaat 388  Q
    | |||||    
T  41427736 taagaat 41427742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 2414583 - 2414651
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2414583 gatgttgtatggtacaaagtattgggcggttgagaaccatca-gagaatcaaataagtgcagcggagatg 2414651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Original strand, 20917685 - 20917762
Alignment:
Q  185 tccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaaga 262  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  20917685 tccatagtataaaacaacggagaaatagaaacatatgtaagtcatcgaattcaatctagatggttaaaatggagaaga 20917762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31403391 - 31403310
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31403391 taagcgtagcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagaga 31403310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17667913 - 17667845
Alignment:
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  17667913 ttgggttcatagtacaaaatgacttagaaataaacgcaaatgtaaatcatcgtattcaagttggatggt 17667845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 470
Target Start/End: Original strand, 21106853 - 21106972
Alignment:
Q  353 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata--agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatag 450  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||   || |||| ||||||||| || |   |||||    
T  21106853 acagagtgttgggcggttaagaaccaacatgacaataaaataagagtgtagtggtgatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatag 21106952  T
Q  451 gattagaaatgacatcatta 470  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  21106953 aattagaaatgacaacatta 21106972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25967672 - 25967555
Alignment:
Q  357 agtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattag 456  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||| || | | | |||||||||    
T  25967672 agtgttgggcagtaaaaaaccaacaagagaat--aataagcgtagtggaggtgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattag 25967575  T
Q  457 aaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  25967574 aaatgactacattagagaga 25967555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 476
Target Start/End: Original strand, 54470129 - 54470201
Alignment:
Q  404 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  54470129 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagaga 54470201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 475
Target Start/End: Original strand, 10208976 - 10209031
Alignment:
Q  420 attggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10208976 attggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag 10209031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 473
Target Start/End: Original strand, 11389579 - 11389713
Alignment:
Q  341 atgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatta 440  Q
    ||||||||||| |   |||||||| ||||||| |||||||  |||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| | ||    
T  11389579 atgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaacta 11389678  T
Q  441 aatagg--ataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
     |  ||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11389679 gacgggatataggattagaaatgacaactttagag 11389713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 471
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2588970
Alignment:
Q  406 gatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattag 471  Q
    ||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattag 2588970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 461
Target Start/End: Original strand, 44860672 - 44860833
Alignment:
Q  300 agtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgt 399  Q
    |||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||||   || ||| || |||||||    
T  44860672 agttgaaaggaaaattttattggtcaatagtaagatcggcgatgttgtatgggactgagtgttgggctgtgaagaaccaaggagaaaataaattaagtgt 44860771  T
Q  400 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatg 461  Q
    ||| || |||| ||||||   ||||||| ||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  44860772 agcagaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagatggaataagattagaaatg 44860833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 476
Target Start/End: Original strand, 50662298 - 50662383
Alignment:
Q  391 aataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||   | ||||| ||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50662298 aataagcgtagcggagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagaga 50662383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 55769022 - 55768985
Alignment:
Q  129 tctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55769022 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcatacc 55768985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 55833278 - 55833241
Alignment:
Q  129 tctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55833278 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcatacc 55833241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 259
Target Start/End: Original strand, 1629136 - 1629208
Alignment:
Q  187 catagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggaga 259  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||  ||||||| |||||||    
T  1629136 catagtataaaacgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaacttgagtggttgaaatggaga 1629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17668006 - 17667935
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac 165  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17668006 tatatgtaatgtaatttcaacaaa-ggcgaagtagttataccttagaggtgaaagttggatatcatatcatac 17667935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39755007 - 39754979
Alignment:
Q  138 gaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39755007 gaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 39754979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 40933286 - 40933198
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatga 462  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||||  | | | ||||| |||||||||||    
T  40933286 aaccaacacgagagtaaaataagtgtagcgtagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 8671447 - 8671914
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  8671447 tgaacgggaggctagagacttggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 8671540  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8671541 cagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 8671640  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8671641 gaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttaaaatggagaagagactcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 8671740  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8671741 tgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccggcgttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 8671840  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8671841 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 8671914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32083494 - 32083033
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32083494 ggaggctagagacctggaggcaagcctcagaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 32083401  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083400 gagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttgcacaatttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 32083301  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  32083300 atagaggcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttctatgcgataagaaagtaccacttaagctgaaag 32083201  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||| | || || |||||||||||||    
T  32083200 gaaagttctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtatgtgtagcggagat 32083101  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||||| |  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32083100 gaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagaga 32083033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 49348149 - 49347675
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||      |||||| |||||||||||||     
T  49348149 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattctgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatcgaatgtaacttcag 49348056  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac----------atcttgggtccatagtacaaaatga 201  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||| | |||||||||||    
T  49348055 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacactggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatga 49347956  T
Q  202 cggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaag 301  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49347955 cggagaaatagaagcaggtgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaag 49347856  T
Q  302 tttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtag 401  Q
    || ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  49347855 ttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgaccaaccttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtag 49347756  T
Q  402 cggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 482  Q
    |  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  49347755 caaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtag 49347675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Original strand, 1210343 - 1210739
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||         ||    
T  1210343 gagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 1210442  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || || |||||||||    
T  1210443 ttgggtctttcgtacaaaatgatggagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctgaggtgttttgtg 1210542  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||    
T  1210543 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 1210642  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1210643 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 1210739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 43241136 - 43240669
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||| |||  | |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  43241136 tgaacgggaggctagagacctggaggtaagccttagaagcgtatggattccacttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 43241043  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  43241042 cggaaggagaagtagatctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttggatccttcgtacaaaatgac 43240943  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43240942 ggagaaatggaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagt 43240843  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43240842 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 43240743  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  43240742 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagaga 43240669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 51441519 - 51441053
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  51441519 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 51441426  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||         |||||||||  |  |||||||||||    
T  51441425 cggaaggagaagtaggtctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatcttgggtctttcatacaaaatgac 51441326  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  51441325 ggagaaatagaagcagatctaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtttt-tgcgataagaaagtaccacttaagt 51441227  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  51441226 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtgagtgtagc 51441127  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  51441126 agagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 51441053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 51601585 - 51602052
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||| ||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  51601585 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtaaaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 51601678  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  51601679 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 51601778  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  51601779 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtggaaatagagaagagtctcaggtgttttgttcgataagaaagtaccccttaagt 51601878  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||     
T  51601879 tgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagt 51601978  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     || |||| |||||| | || |||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  51601979 agatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagaga 51602052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 177 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30202717 - 30202418
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  30202717 atcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagccgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtttt 30202618  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |      
T  30202617 gtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtgtggtacagagtgttgggcggttaagagt 30202518  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30202517 caacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 30202418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 34827785 - 34827429
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |   ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||          ||||    
T  34827785 agtatatggaatgtaacttcatcaaaagaagaagtggtcccatgatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccctaagttacaaggtttaaatatct 34827686  T
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||    
T  34827685 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcattgtattcaagttgaatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttatgt 34827586  T
Q  281 gataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 380  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34827585 gataagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagatcaacgatgttgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaac 34827486  T
Q  381 atgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    | || || |||||||||||| | ||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  34827485 acgaaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaga 34827429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37463548 - 37463159
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac-cctagttacaca--------- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||             
T  37463548 cagagtatatggaatgtaacttcagcaaaagccggagt---tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccgagttacacagtttaaata 37463452  T
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||| ||||| | ||||||| ||||||||||| || ||  || ||     
T  37463451 tcttgagtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtatatcattgtatttaagctaggtggttgatatggagaagagccttag--gtgtta 37463354  T
Q  278 tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacc 377  Q
     |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37463353 ggtgataagaaagcactgattaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaacc 37463254  T
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||  ||||||    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37463253 aacacaagaatc----aagtgtagaggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagaga 37463159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Original strand, 9592479 - 9592728
Alignment:
Q  227 catcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaa 326  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9592479 catcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaa 9592578  T
Q  327 cagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggat 426  Q
     ||||||||   || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9592579 tagtcagactgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggat 9592678  T
Q  427 gagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9592679 gagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 9592728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 214 - 476
Target Start/End: Original strand, 22089826 - 22090088
Alignment:
Q  214 agcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaag 313  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  22089826 agcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgcaataagaaaataccacttaagttgaaaggaaag 22089925  T
Q  314 ttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatga 413  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22089926 ttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagga 22090025  T
Q  414 tgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22090026 tgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagaga 22090088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 177 - 464
Target Start/End: Original strand, 19936216 - 19936504
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaa-tgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttt 275  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||  |||||    
T  19936216 atcttgggtccataatacaaaaatgaaggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggataagaacctcaagtgttt 19936315  T
Q  276 tgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaa 375  Q
    | ||||||||||||||||  |||||  | |||||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||    
T  19936316 tatgtgataagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttagaccagcaatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaa 19936415  T
Q  376 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  19936416 ccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgaca 19936504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 476
Target Start/End: Original strand, 8391525 - 8391766
Alignment:
Q  237 aagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  8391525 aagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagacc 8391624  T
Q  337 tgcgatgt--tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggta 434  Q
     || ||||  | |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  8391625 ggcaatgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggta 8391724  T
Q  435 agattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8391725 agactacacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 8391766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 282 - 476
Target Start/End: Original strand, 696069 - 696263
Alignment:
Q  282 ataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaaca 381  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||    
T  696069 ataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaaca 696168  T
Q  382 tgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  696169 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 696263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 276 - 476
Target Start/End: Original strand, 15085728 - 15085928
Alignment:
Q  276 tgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaa 375  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |     
T  15085728 tgtgcgataagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagag 15085827  T
Q  376 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15085828 ccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagag 15085927  T
Q  476 a 476  Q
    |    
T  15085928 a 15085928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 322
Target Start/End: Original strand, 27445496 - 27445738
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||         ||     
T  27445496 gagtatatggaatgtaactttagtcaaagaagaagtagctttaccttgcaggtgaaagttggagatcttatcataccccaagttacacggtttaattatg 27445595  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcaga-tgttttgt 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || |||||| |    
T  27445596 ttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagttggttggttgaaatggagaagagt-tccgagtgttttat 27445694  T
Q  279 gtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcgg 322  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27445695 gtgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcgg 27445738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46226868 - 46226613
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| | ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||    
T  46226868 atcttgtggccattgtacaaaatgatggagaaacaaaagcagatgtaaat-attgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcatcaagtgtttt 46226770  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
     |||| |||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| |    ||||||||||||||||  | |||||  |  |||| |||    
T  46226769 atgtgctaagaaagtagtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatagtgacgatgttgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaac 46226670  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggt 433  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46226669 caacacgagaatcaagtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggt 46226613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9599905 - 9599682
Alignment:
Q  253 atggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggt 352  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  9599905 atggataagagcctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttcagttgaaatgaaaattctatcagaccgcagtcagaccagcgatgtggtatgat 9599806  T
Q  353 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatagga 452  Q
    ||| |||||||  ||||| | ||||||||  | |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| ||    
T  9599805 acaaagtgttgtgcggttgagaaccaacacaataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatga 9599706  T
Q  453 ttagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  9599705 ttaggaatgacatcattagagaga 9599682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 435
Target Start/End: Original strand, 39140313 - 39140466
Alignment:
Q  281 gataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 380  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |    
T  39140313 gataagaaagtaccgcttaaattgaaaggcaaattctatcggacagcagtcagaccggtgatgttgtatggtac-gagtgttgggcagttaagaaccatc 39140411  T
Q  381 atgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 435  Q
    |||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  39140412 atgaaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa 39140466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32066951 - 32066761
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacaca---------tctt 181  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||         | ||    
T  32066951 agtatatgtaatgtaattttagcaaaaggtgaagtagttctaccttagaggtgaaaattggagatcatatcataca--agttacacagtttaaatatttt 32066854  T
Q  182 gggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtt 274  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  32066853 gggttcatagtacaaaatgacagagaaataaaagcaaatgtaaatcatcgtattcaagttggatggttaaaatggagaagagcctcaggtgtt 32066761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11331633 - 11331401
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | | |   || ||| ||||||||| | ||||||||  | |  || |||||| |||||||| || |||||    
T  11331633 aaaatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatggagaatggccgtaggtgttttatgtgataaaaatgtact 11331534  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
      ||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  |||||||| |     
T  11331533 gattaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagtt 11331434  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatg 427  Q
    ||  |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  11331433 agcatagcggagatgaggaagttatattggatg 11331401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11489654 - 11489422
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | | |   || ||| ||||||||| | ||||||||  | |  || |||||| |||||||| || |||||    
T  11489654 aaaatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatggagaatggccgtaggtgttttatgtgataaaaatgtact 11489555  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
      ||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  |||||||| |     
T  11489554 gattaagttgaaaggaaaattatatcagacaacaatcagattgacgatgttgtatggtacagagtgttgtgcggctaggaaccaacacaagaatcaagtt 11489455  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatg 427  Q
    ||  |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  11489454 agcatagcggagatgaggaagttatattggatg 11489422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 34792768 - 34792637
Alignment:
Q  344 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 443  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || |     
T  34792768 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagac 34792670  T
Q  444 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  34792669 atgataggattaggaatgaaaccattagagaga 34792637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35829044 - 35828894
Alignment:
Q  123 agtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttac---------acatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatag 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||         |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35829044 agtagttctaccttggaggtgaaagctagagatcatatcataccacaagttacgctgcttaaacatcttgggtccatagtacaaagcgacggagaaatag 35828945  T
Q  213 aagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagag 263  Q
    |||||||||||| |||||  |||| | |||  ||||||| ||||| |||||    
T  35828944 aagcatatgtaaatcatcgaattcgatctgtgtggttgaaatggaaaagag 35828894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52740043 - 52739965
Alignment:
Q  188 atagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtct 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52740043 atagtacaaagtgacggagaaatagaagtagatgtaagtcatcttactcaagttggatggttgaaatggagaagagtct 52739965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32231341 - 32231242
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32231341 caacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 32231242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18469504 - 18469368
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 439  Q
    ||||||||||| |||  |||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||| |    
T  18469504 gatgttgtatgatactaagtactgggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagact 18469405  T
Q  440 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | | | |||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  18469404 agacatgatatgattaggaatgacacaattagagaga 18469368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 463
Target Start/End: Original strand, 35672545 - 35672669
Alignment:
Q  339 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 438  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| || ||| |||||| ||||  ||| ||||||| |     
T  35672545 cgatgttgtgtggaacagactgttgaagggttaagaaccaacacgagaataaaataaatgtagcgaaggtgaagatgttgcatttaatgtgtggtaaaac 35672644  T
Q  439 taaataggataggattagaaatgac 463  Q
    || ||  ||||||||||||||||||    
T  35672645 tagatgagataggattagaaatgac 35672669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 381
Target Start/End: Original strand, 41560232 - 41560335
Alignment:
Q  278 tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||   | |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || |    
T  41560232 tgtgataagaaagtaccgcttaagttgaaaggaaaattctatccgaacgctgtcagaccagcgatgttgtatgatacggagtattgggcggttaagaatc 41560331  T
Q  378 aaca 381  Q
    ||||    
T  41560332 aaca 41560335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 3192071 - 3192133
Alignment:
Q  347 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3192071 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3192133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 3200889 - 3200951
Alignment:
Q  347 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3200889 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 3209726 - 3209788
Alignment:
Q  347 tatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3209726 tatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatg 3209788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 476
Target Start/End: Original strand, 9509229 - 9509312
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9509229 taagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagaga 9509312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 52641012 - 52640917
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatg 272  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  52641012 atcttgggtttatggtacaaaatgacagagagataaaagcatatgtaaattatcgtattcaagttgaattgttgaaatgaagaagagcctcagatg 52640917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 462
Target Start/End: Original strand, 1661264 - 1661406
Alignment:
Q  320 cggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttac 419  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||      
T  1661264 cggacagcagtaagaccaacgatattgtatgggatagagcgttgggcggtgaaaaaccaacacgagaataaaataagcatagcagagatgaagatgttgt 1661363  T
Q  420 attggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatga 462  Q
     ||| |||  || ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  1661364 gttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatga 1661406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 476
Target Start/End: Original strand, 4379861 - 4379999
Alignment:
Q  338 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | | || || |||||||| || ||| ||  |||  |||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  4379861 gcgatgttgtacgggacagagtgttaggcagtaaagaaccaacacgaaaataaataaagcttagctgagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaga 4379960  T
Q  438 ttaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4379961 ctagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagaga 4379999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 476
Target Start/End: Original strand, 40419496 - 40419633
Alignment:
Q  339 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 438  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||  || || |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||  |||||| |     
T  40419496 cgatgttgtacggaacagagtgttgggtggtaaagaaccaacacgaacataaagtaagtgtagcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaac 40419595  T
Q  439 taaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40419596 tagatgagatagaattagaaatgacaacattagagaga 40419633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52641132 - 52641060
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac 165  Q
    |||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52641132 tatatgtagtgtaatttcaataaaaggcgaagtagttcgaccttagaggtgaaagttggagatcatatcatac 52641060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33561124 - 33561077
Alignment:
Q  429 gtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33561124 gtggtaagactaaatgggataggattggaaatgacaacattagagaga 33561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 412
Target Start/End: Original strand, 51812432 - 51812467
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatg 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51812432 caacatgagaataaaataagtgtagcggagatgatg 51812467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16142274 - 16142172
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |  ||||||||| || |||| || ||||||||    
T  16142274 aaccaatacgagaatcaaataagcatagtggaaatgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagag 16142175  T
Q  474 aga 476  Q
    |||    
T  16142174 aga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Original strand, 7814322 - 7814419
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |   |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  7814322 gatgttgtatggaacagaatgttggatggttaagaaccaacacgagaataaagtaattgttgtatagatgaggatgttacgttgaatgtgtgataaga 7814419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32405199 - 32405146
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggagg 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  32405199 cagagtatatggaatgtaatttcagcaaaaggcaaagtagttctaccttagagg 32405146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920825
Alignment:
Q  407 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagaga 40920825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32405073 - 32404941
Alignment:
Q  220 tgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg-tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttcta 318  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||| | ||| ||| | ||||||  || |||| ||||| || ||| ||||| || ||||| |||||    
T  32405073 tgtaaatcatcatattcaatctaggtggttgaaatggatacgagcctcgggtgtttttatgcgatacgaaaggaccactcaagttgaagggaaaattcta 32404974  T
Q  319 tcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatgg 351  Q
    ||||||||  |||||| | ||| ||||||||||    
T  32404973 tcggacaattgtcagatcagcgttgttgtatgg 32404941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36565996 - 36565529
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  |||| |||      ||||||| ||||||||||||     
T  36565996 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagataga------gtatatgaaatgtaacttcaa 36565903  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36565902 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtcctttgtacaaaatgac 36565803  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36565802 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 36565703  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36565702 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagc 36565603  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36565602 agagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 36565529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12492597 - 12492130
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  12492597 tgaactggaggctagagacctggaggtaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 12492504  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  12492503 cggaaggataagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 12492404  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  12492403 ggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaggttgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaga 12492304  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12492303 tgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccggcgttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcatgtaagtgtagc 12492204  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     || |||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  12492203 agatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 42854762 - 42854292
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42854762 ggaggctagagacctggaggcaagccttaaaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 42854669  T
Q  119 gag---------aagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaat 199  Q
    |||         |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||||| |||||||||    
T  42854668 gagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatcgtacaaaat 42854569  T
Q  200 gacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactactta 299  Q
    |   |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42854568 gtttgagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccactta 42854469  T
Q  300 agtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgt 399  Q
    || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||| | || | |||||    
T  42854468 agctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgt 42854369  T
Q  400 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||| || | || |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  42854368 agcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagaga 42854292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 476
Target Start/End: Original strand, 36544748 - 36545141
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------a 177  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||          |    
T  36544748 cagagtatatggaatgtaactttagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacaaggtttaaata 36544847  T
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    || |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  36544848 tcatggggctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggataagagcctcaggtgttttg 36544947  T
Q  278 tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacc 377  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||     ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |    
T  36544948 tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcggatagca-----accagcgttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtc 36545042  T
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36545043 aacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36545141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15216019 - 15215559
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  15216019 ggaggctagagacctggaggcaaaacttagaagcatatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtacatgaaatgtaacttcagcaaaag 15215926  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         || |||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  15215925 gagaagtgggtctaccatggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaagttacacggtttaaatatattgggtccatagtacaaagtgac--agaa 15215828  T
Q  209 atagaa-gcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaa 307  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||| | |||    
T  15215827 atagaaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctccagtgtcttgtgcggtaagaaagtatcacttaagctgaaa 15215728  T
Q  308 ggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggaga 407  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||| | || |||||| ||||||||    
T  15215727 ggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgaagcggaga 15215628  T
Q  408 tgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| ||||||    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15215627 tgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagaga 15215559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Original strand, 18124878 - 18125169
Alignment:
Q  184 gtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgat 283  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||| ||||||    
T  18124878 gtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaactcatcgaattcaagctgaatggttgaaatggagaaaaacctcaggtgttttatgtgat 18124977  T
Q  284 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 383  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18124978 aagaaagtaccactta-gttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatg 18125076  T
Q  384 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18125077 agaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagaga 18125169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4033178 - 4032922
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||    
T  4033178 gagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagtagaaggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaagtatc 4033079  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4033078 ttgggttcatagtacacaatgatggagaaataaaagcatatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 4032979  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 336  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4032978 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagacc 4032922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Original strand, 39946602 - 39946845
Alignment:
Q  227 catcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaa 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||     
T  39946602 catcgtattcaagctggatggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacag 39946701  T
Q  327 cagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggat 426  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  39946702 cagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggat 39946801  T
Q  427 gagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||    
T  39946802 gagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccatta 39946845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 476
Target Start/End: Original strand, 25299950 - 25300231
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  25299950 aaaatgatggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtacc 25300049  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25300050 aattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaata 25300149  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||| || |||| ||||||    ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25300150 agtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagaga 25300231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 476
Target Start/End: Original strand, 25288613 - 25288896
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctgga--tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagta 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||   || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25288613 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 25288712  T
Q  293 ctacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaa 392  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  25288713 ccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaa 25288812  T
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| || |||| ||||||    ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25288813 taagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagaga 25288896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 469
Target Start/End: Original strand, 37077490 - 37077752
Alignment:
Q  207 aaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaa 306  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  37077490 aaatagaagccgatgtaaatcatcgtattcaagctaagtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgtgataagtaagtaccacttaagttgaa 37077589  T
Q  307 aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggag 406  Q
    ||| ||||| | || |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  37077590 agggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatgctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggag 37077689  T
Q  407 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatt 469  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||| | || |   ||||||||||| ||||||| ||||    
T  37077690 atgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccatt 37077752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8880118 - 8879728
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atc 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||         |||    
T  8880118 gagtacatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtcgaccgtgaaggtgaaagttgaaaatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatc 8880019  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |   |||| |||||| | ||||||||||| || |||||||  || || |||||||||    
T  8880018 ttgggctcatagtacaaaatgaaggagaaatagaaccagatgaatagcatcgtattcatgttggatggttgaaatagagaagaaccttaggtgttttgtg 8879919  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||      | ||||||| |||| || | |||     
T  8879918 cgataagaaagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgttgtat------gtgtgttgggcggtgaagagccag 8879825  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||||| |  |   ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8879824 cacaagaatcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagaga 8879728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36395443 - 36395238
Alignment:
Q  274 tttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaa 373  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  36395443 tttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 36395344  T
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataag---tgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    |  ||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36395343 agtcaacatgagaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta 36395244  T
Q  471 gagaga 476  Q
    ||||||    
T  36395243 gagaga 36395238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 25439249 - 25439395
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  25439249 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcaggatggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgtgataagaaagtacc 25439348  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcga 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25439349 acttaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagtcagaccggcga 25439395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 437
Target Start/End: Original strand, 29735447 - 29735761
Alignment:
Q  122 aagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacacatcttgg--gtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcat 218  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||   ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29735447 aagtagttctaccatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccccaagttatacgatttaaacgtccatagttcaaaatgacggagaaatagaagcat 29735546  T
Q  219 atgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttcta 318  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||  ||| || | || |||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  29735547 atgtaaatcatcttattcaagttgggtggttgaaatggagatgagt-tcatgtgtgttatctggtaagaaagcactgcttaagttgaaatgaaaattcta 29735645  T
Q  319 tcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtta 418  Q
    |||||||  |||||||    ||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||     
T  29735646 tcggacagtagtcaga---acgatgttgtatggtaaagagtgttgagtgattaaaaaccaacacgagaatgaaataagcgtagtggagatgaggatgttg 29735742  T
Q  419 cattggatgagtggtaaga 437  Q
      |||||||| ||||||||    
T  29735743 tgttggatgaatggtaaga 29735761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18752342 - 18752161
Alignment:
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||| | || ||    
T  18752342 acttaagctcaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaagta 18752243  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  || ||||||| ||||| || | |  ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18752242 agtgtagcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagaga 18752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 476
Target Start/End: Original strand, 2796326 - 2796551
Alignment:
Q  253 atggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggt 352  Q
    ||||||||||| ||  | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || |||| ||||||    
T  2796326 atggagaagagccttcggtgttctgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggt 2796425  T
Q  353 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga--ttaaataggatag 450  Q
    || |||| ||||  |||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |  ||||||||||||||||   || | | |||||    
T  2796426 accgagtcttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgatag 2796525  T
Q  451 gattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  2796526 gattaggaatgacaccattagagaga 2796551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 354
Target Start/End: Original strand, 13984730 - 13984906
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||    
T  13984730 atcttgggtccatagta-aaaatgacaaagaaataaaagcagatgtaaatcatcgtatttaagttggatggttgaaatgaagaagagcctcaagtgtttt 13984828  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtac 354  Q
     |||||||||||| || |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  13984829 atgtgataagaaaatattgtttaagttaaaaggaaaattctattggacaaccgtaagaccaacaatgttgtatggtac 13984906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 417
Target Start/End: Original strand, 13589138 - 13589374
Alignment:
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  |||||| ||    
T  13589138 ttgggtcgttagtataaaatgatgaagaaatagaagcatatgaaaatcaccatattcaaggtggatggttgaaatggagaagagcctgatgtgttttatg 13589237  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcga-tgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacca 378  Q
      |||||||||||||| ||||  || |||||||  |||| | |||| |||||||| |||  | | |||||| |||||||||||| | | ||| |||||||    
T  13589238 ctataagaaagtactatttaa-cttgaaggaaaaatctaacagacagcagtcaga-ctgatagtattgtatagtacagagtgtttggcagtttaaaacca 13589335  T
Q  379 acatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 417  Q
    |||||| |||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  13589336 acatgaaaatcaagtaagcgtagcatagatgaagatgtt 13589374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30113766 - 30113551
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaata-gaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtac 293  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  30113766 aaaatgacggagaaaaaagaagcagatgtaaatcattgtattcaagctaaatggttgaaatggagaagagtcgcaggtgttttatgtgataagaaa-tac 30113668  T
Q  294 tacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaat 393  Q
       ||||||| |||| ||| || ||||| |||||  ||| |    |||||||||||| ||  || ||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30113667 cgattaagttgaaagaaaaattatatcgaacaactatcaaattgacgatgttgtatgatatggaatgttatgcggttaagaaccaacatgagaataaaat 30113568  T
Q  394 aagtgtagcggagatga 410  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  30113567 aagcgtagaggagatga 30113551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6510936 - 6510721
Alignment:
Q  245 tggttgagatggagaagagtctcagatgttttg-tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatg 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||    
T  6510936 tggttgaaatggagaagagtctcatgtggtttgatgtgataagaaagtactgcttaagttgaaaggaaagttctaacagacattagtcagaccgacgatg 6510837  T
Q  344 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 443  Q
             ||| ||| ||||||||||||   |||||||   |||| | |||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||    
T  6510836 ---------acatagtcttggacggttaagtgccaacatactaatcgagtaagtgtagcgg-gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagat 6510747  T
Q  444 aggataggattagaaatgacatcatt 469  Q
      |||| |||||||||||||| ||||    
T  6510746 gagatatgattagaaatgacaccatt 6510721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30783471 - 30783331
Alignment:
Q  332 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 431  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || | || |||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||  |||    
T  30783471 agaccagcgatgttgtatggaacaaagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgataatagaataagtgtagtggagatgaggatcttgcgttggatctgtg 30783373  T
Q  432 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30783372 gcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagag 30783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9905383 - 9905223
Alignment:
Q  268 agatgttttgtgtgataagaaag-tactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggac 366  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||| ||| |||| || ||||   |||| |||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9905383 agatgttttatgtgataaaaaaaatactatttaagttgaaaagaaaattttatcaagcaactgtcagatcaaagatgttgtatggtacatagtgttggac 9905284  T
Q  367 ggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatg 427  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  9905283 ggttaataaccaacacgagaataaagttagtataacggagatgaggatgttgcattggatg 9905223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 340 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13172073 - 13171937
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| || ||||   | | |||||||  ||||| ||||||||| || |||||| |    
T  13172073 gatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacataaaaataaattaagcacatcagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagact 13171974  T
Q  440 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13171973 agacgggataggattagaaatgacaagattagagaga 13171937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28300788 - 28300588
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacaca---------tctt 181  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||         ||||    
T  28300788 agtatatttaatgtgatttcatcaaaagacgaagtagttcgaccttagaggtgaaagctggagatcatatcataca--agttacacagtttaaatatctt 28300691  T
Q  182 gggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtg 281  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  28300690 gggttcatggtacaaaatgactgagatataaaagcagatgtacatcatcgtattcaagttggatggttaaattggagaagagactcggatgttttatgtg 28300591  T
Q  282 ata 284  Q
    |||    
T  28300590 ata 28300588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33830817 - 33830716
Alignment:
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||    
T  33830817 ttgggtccattgtacaaaatgacgaagaaataaaagcatatgtaaatcatcgtgttcaagttggatggttaaaatgttgaagagtctcaagtgttttatg 33830718  T
Q  280 tg 281  Q
    ||    
T  33830717 tg 33830716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 2518816 - 2518691
Alignment:
Q  339 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaa-taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2518816 cgatgttgtatggaacagagagttgggcagtgaagaaccaatatgagaaaaaaaataagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaaga 2518718  T
Q  438 ttaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
     || ||  |||||||||||||||||||    
T  2518717 ctagatgagataggattagaaatgaca 2518691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37256140 - 37256011
Alignment:
Q  339 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||| |||| |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |     
T  37256140 cgatgttgtatggtacagagtgttgagtagttaaaaacgaacaagaaaatcaagtaagcga--cggagatgatgatgttgcgttgaatgagtggttaaac 37256043  T
Q  439 taaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  37256042 taaatgagatagaattagaaatgacaccatta 37256011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 45512922 - 45512799
Alignment:
Q  338 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  45512922 gcgatgttgtatggaacatagtgttggacattgaagaaccaacacgaaaataaaataagcatagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaaga 45512823  T
Q  438 ttaaataggataggattagaaatga 462  Q
     || ||||| |||| ||||||||||    
T  45512822 ctagatagg-tagggttagaaatga 45512799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 476
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520654
Alignment:
Q  405 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| |||||| | ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagaga 29520654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 38328178 - 38328099
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 472  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  38328178 taagtgtagtggagatgacgatgttacgttggatgtatggtgagactaaagaggatagaattagaaatgacgacattaga 38328099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 39760845 - 39760714
Alignment:
Q  343 gttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaa 442  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || |||||| | |||||  ||  ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |    
T  39760845 gttgtatgggacggggtgttggacggtaaagaaccaatacgagaaaaaatgaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattaga 39760746  T
Q  443 taggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  39760745 caagataggagtagaaatgataacattagaga 39760714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 435
Target Start/End: Original strand, 13986386 - 13986447
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaa 435  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13986386 aaccaacacgagaatcaggtaagcatagcggagatgaggatgttacactggatgagtggtaa 13986447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30456580 - 30456496
Alignment:
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagt 480  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30456580 agtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagaccaa-tgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagt 30456496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 476
Target Start/End: Original strand, 30748352 - 30748453
Alignment:
Q  375 accaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
    |||||||||| ||| || || | ||||| || |||| |||||| | ||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30748352 accaacatgataataaattaggcgtagcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacaga 30748451  T
Q  475 ga 476  Q
    ||    
T  30748452 ga 30748453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18849798 - 18849722
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccc 167  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | | |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18849798 agtatatggaatataacgtcaacaaaaggtgaagtagttatgccttagaggtaaaaattggagatcatatcataccc 18849722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 476
Target Start/End: Original strand, 40813220 - 40813316
Alignment:
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||||||||| || | |  |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  40813220 catgagaataaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagaga 40813316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 476
Target Start/End: Original strand, 45419157 - 45419233
Alignment:
Q  400 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  45419157 agcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga 45419233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30578803 - 30578704
Alignment:
Q  188 atagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataaga 287  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| ||||   |||||| |   |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30578803 atagtacaaaacgacagagaaacataagtatatgtaaatcatagaattcaaacaaaatggttgaaatgaagaagagtctcatatgttttatgtgataaga 30578704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 41444987 - 41444912
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 166  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  41444987 agtatatggaatgtaattttagcaaaaggcgaagcatttctaacttagaggtgaaaggtggagatcatatcatacc 41444912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10824607 - 10824549
Alignment:
Q  245 tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| | |||||||    
T  10824607 tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgtgatacgaaaataccagttaagtt 10824549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18849697 - 18849624
Alignment:
Q  189 tagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctc 267  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||     |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  18849697 tagtataaagtgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcatc-----caagctgggtggttgaaatggataagagtctc 18849624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Original strand, 38667252 - 38667326
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttga 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| | |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  38667252 atcttgggttcatagtacaaaacgatagagaaataaaagaagatgtaaatcatcgtattaaagttggatggttga 38667326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Original strand, 43732429 - 43732543
Alignment:
Q  344 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 443  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||  ||||| | ||| | ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  43732429 ttgtatggagcagaatgttggacggtgaagaaccaacacaagaataagatatgcgtagcagaaatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagactagat 43732528  T
Q  444 aggataggattagaa 458  Q
      ||||| |||||||    
T  43732529 gtgatagaattagaa 43732543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45231265 - 45231207
Alignment:
Q  245 tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  45231265 tggttgagatggagaagagtctcatgtattttatgtgataaaaaagtattgcttaagtt 45231207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39953684 - 39953552
Alignment:
Q  344 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 443  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||  || || | || ||||| |||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||     
T  39953684 ttgtatgggacagagtgttgagcggtaaagaaccaacacgaacataaagttagcgtagcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaac 39953585  T
Q  444 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | ||||  ||||||||| |   |||||||||||    
T  39953584 atgatataattagaaataatgacattagagaga 39953552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 11593480 - 11593954
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||     
T  11593480 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagtcttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacggagacggagtatatgaaatgtaacttcag 11593579  T
Q  113 ca-aaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatga 201  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||         ||||||||||| | |||||||||||    
T  11593580 cggaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttagacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatga 11593679  T
Q  202 cggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaag 301  Q
     ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  11593680 tggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccacttaag 11593779  T
Q  302 tttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtag 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  11593780 ttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtag 11593879  T
Q  402 cggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11593880 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagaga 11593954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 31004751 - 31005217
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||      ||||||||||||| ||||||     
T  31004751 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacaga------gtatatggaatgttacttcag 31004844  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac--------atcttgggtccatagtacaaaatgacg 203  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||        ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31004845 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacgtttaaatatcttggctccttcgtacaaaatgacg 31004944  T
Q  204 gagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31004945 gagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagtt 31005044  T
Q  304 taaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcg 403  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  31005045 gaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagca 31005144  T
Q  404 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  31005145 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagaga 31005217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 36651521 - 36651987
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      |||||||||||| |||||||     
T  36651521 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatggaacttcag 36651614  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36651615 cggaagaagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacgcggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 36651714  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36651715 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 36651814  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |    
T  36651815 tgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtaac 36651914  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36651915 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagag 36651987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33350561 - 33350094
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||     |||||||||||||||||||||     
T  33350561 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagac-ga-----agtatatggaatgtaacttcag 33350468  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||| |||||  | ||||||||||||    
T  33350467 cggaagaagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatctagggtctttcgtacaaaatgac 33350368  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33350367 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 33350268  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33350267 tgacaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 33350168  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33350167 agagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33350094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 470
Target Start/End: Original strand, 38606540 - 38606993
Alignment:
Q  20 gaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaagg 119  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||| ||   |||||||    
T  38606540 gaggctagagacctggaggcaagccttagaagtgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaatttttgcaaaagg 38606633  T
Q  120 agaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaa 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38606634 agaagtgggtctaccttg-aggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgacgaagaaa 38606732  T
Q  210 tagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaagg 309  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  38606733 tagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaagg 38606832  T
Q  310 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  38606833 aaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatg 38606932  T
Q  410 atgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38606933 ataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta 38606993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 46356606 - 46356144
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||| | | || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  46356606 tgaacgggaagctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggataccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 46356513  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  46356512 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtcctttgtacaaaatgac 46356413  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46356412 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtactacttaagt 46356313  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    |||||||||    
T  46356312 tgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccggcattgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatc----aagtgtagc 46356217  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||  |||||| | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  46356216 agagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagaga 46356144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39907134 - 39906658
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  39907134 tgaacgggaggctagagacctggaggcaaatcttagaagcatatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 39907041  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||         ||||||||||  | ||||||||||||    
T  39907040 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatatcccatgttacacggtttaaatatcttgggtcattcgtacaaaatgac 39906941  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttg----agatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactactt 298  Q
    ||||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39906940 ggagaaatagaagtagatgcaagccatcgtattcaagctgggtggttggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtgcgataagaaagtaccactt 39906841  T
Q  299 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtg 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | || |||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  39906840 aagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtg 39906741  T
Q  399 tagc-----ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||      ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39906740 tagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 39906658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 476
Target Start/End: Original strand, 33072666 - 33072948
Alignment:
Q  194 caaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtac 293  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33072666 caaaatgacggataattagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtac 33072765  T
Q  294 tacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaat 393  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  33072766 cacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagaccggcgttgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaat 33072865  T
Q  394 aagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33072866 aagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 33072948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 177 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35906788 - 35906489
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||| ||||||    
T  35906788 atcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagatcttcaggtgtttt 35906689  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||| |      
T  35906688 gtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggtggttaagagt 35906589  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35906588 caacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaga 35906489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36870044 - 36869577
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |  || |||||||||||||| || |||||||||  |||||| |      ||||||||||||||||||||     
T  36870044 tgaacgggaggctagaggcctggaggcaagctttagaagcgtatggtttccgcttgagtagaagcaagacata------gtatatggaatgtaacttcag 36869951  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctag----------ttacacatcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
     ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |           ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36869950 gaaaagggaaagtatgtctaccctggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacgcggtttaaatatcttggatccatagtacaaaatgac 36869851  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    | ||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36869850 gaagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggggttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 36869751  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||  ||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  36869750 tgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaacacgtgaatcaagtaagtgtagc 36869651  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36869650 agagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36869577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Original strand, 32630140 - 32630569
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32630140 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 32630233  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32630234 gagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatattacaaaatgatggagaa 32630333  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
     || |            ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||    
T  32630334 ttaca------------tcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcgagtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagctgaaag 32630421  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  32630422 gaaagttctatcggacatcaatcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagat 32630521  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattag 456  Q
    || ||||||    |||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  32630522 gaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattag 32630569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Original strand, 37616443 - 37616788
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  37616443 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 37616536  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  37616537 cagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacacgatttaaatatcttgggtcctttgtacaaaatgac 37616636  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37616637 ggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 37616736  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtac 354  Q
    | ||||||||||| |||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||    
T  37616737 tgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagaccgacattgttgtatggtac 37616788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Original strand, 49028800 - 49029270
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||    |||    
T  49028800 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcaggggaag 49028893  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  49028894 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcagatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtcctttgtacaaaatgatggagaa 49028993  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttg--------------agatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||              | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  49028994 atagaagcagatgtatgccatcgtattcaagctgggtggttggttgtggttggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaaatacc 49029093  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    |||| |     |||||||||||||||||||| |||||  ||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||    
T  49029094 acttga-----aaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagta 49029188  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49029189 agtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 49029270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Original strand, 34869165 - 34869414
Alignment:
Q  227 catcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaa 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  34869165 catcatattcaagctgggtggttgaattggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacag 34869264  T
Q  327 cagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggat 426  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | ||||||    
T  34869265 cagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggat 34869364  T
Q  427 gagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34869365 gagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 34869414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 476
Target Start/End: Original strand, 43281389 - 43281670
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtact 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||     
T  43281389 aaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtacc 43281488  T
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||   ||| | || ||    
T  43281489 acttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgcaagagtaaagta 43281588  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43281589 agtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagaga 43281670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 327
Target Start/End: Original strand, 48918986 - 48919233
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||| | |||| | |||||||         ||     
T  48918986 gagtatatggaatgtgacttcagcaaatggagaagtaggtctacattgaaggtaaaagtaggagatcatattacaccccaagttacacggtttaaatatt 48919085  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48919086 ttggatccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtgaatcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 48919185  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaac 327  Q
     |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  48919186 cgataagaaagtaccccttaagttgaaaggaaggttatatcggacaac 48919233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12841773 - 12841563
Alignment:
Q  266 tcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttgga 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||     
T  12841773 tcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggg 12841674  T
Q  366 cggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacat 465  Q
     |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||| | || | | ||||||||||| ||||||      
T  12841673 tggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccc 12841574  T
Q  466 cattagagaga 476  Q
    |||||||||||    
T  12841573 cattagagaga 12841563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 464
Target Start/End: Original strand, 7272784 - 7273021
Alignment:
Q  226 tcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggaca 325  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||    
T  7272784 tcatcgtattcaagctgggtggttgagattgagaa-agcctcaggtattttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcggtca 7272882  T
Q  326 acagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattgga 425  Q
     |||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    ||||    
T  7272883 gcagtcaaaccgacaatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaacacgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgctgga 7272982  T
Q  426 tgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    |||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||    
T  7272983 tgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgaca 7273021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 476
Target Start/End: Original strand, 23404180 - 23404412
Alignment:
Q  244 atggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatg 343  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||     
T  23404180 atggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttctgagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgata 23404279  T
Q  344 ttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaat 443  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||| |  |||||||| ||||||| || |     
T  23404280 ttgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatac 23404379  T
Q  444 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  23404380 atgataggattaggaatgacaccattagggaga 23404412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24177944 - 24177720
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| |  ||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177944 ggagactagagacctggaggcaagccttagaaacgtatggtttctgcatgagtagcatcaaga----tg--gagtatatggaatgtaacttcagcaaaag 24177851  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
     ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||         |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24177850 aagaagtaggtctagcttgtagatgaaggttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatcacgggtcaatagtacaaaatgacggagaa 24177751  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaag 239  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24177750 atagaagcagatgtaaatcatcatattcaag 24177720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25579536 - 25579364
Alignment:
Q  299 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtg 398  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  25579536 aagttgaagggaaaattctatcggacagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcg 25579437  T
Q  399 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||     ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25579436 tagaggagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatacta-----gataggattagaaatgaccacattagagaga 25579364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 476
Target Start/End: Original strand, 37617811 - 37617938
Alignment:
Q  349 tggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggat 448  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | |||    
T  37617811 tggtacggagtcttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagat 37617910  T
Q  449 aggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37617911 aggattaggaatgacaccattagagaga 37617938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13859475 - 13859296
Alignment:
Q  295 acttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaata 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||  |||||| |||||| || |||||| ||||||| |   |||| ||||||||| ||    
T  13859475 acttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagta 13859376  T
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||  ||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13859375 agt--agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 13859296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7189751 - 7189580
Alignment:
Q  245 tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgt 344  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||  || || ||| | |||  |||||||||  ||||||    
T  7189751 tggttgaaatggagaaaagtctcaggtgttttatttgataagaaagtattacttaaattgaaagagaaattttatag-acagtagtcagaccgacgatgt 7189653  T
Q  345 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 417  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||    
T  7189652 tgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgtt 7189580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27022153 - 27021994
Alignment:
Q  317 tatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgt 416  Q
    |||| |||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||  | | ||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||  ||||    
T  27022153 tatcagacaactgtgagactggcgatgttgcatggaacagagtgttggcaggtatagagccagcatgagaatataataagtgtagcggcaatgagaatgt 27022054  T
Q  417 tacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | ||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27022053 tgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagaga 27021994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21517911 - 21517656
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||||||||     
T  21517911 atcttggattcatagtacaaa-tgacgaagaaataataacatatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatcgagaagagccttagatgttta 21517813  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
     ||| |||  ||| ||| ||| ||||| || | ||| |||||||  | |   |||| | ||  |||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||    
T  21517812 atgtaatacaaaaatacaactcaagttgaaggaaaaattctatcaaatagttgtca-aactatgatgttgtatggaacatagtgtttggcggttaagaac 21517714  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggta 434  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||  ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  21517713 caacacgagaataaaataagcataatggatatgatgatgttgcattagatgtgtggta 21517656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45836868 - 45836768
Alignment:
Q  376 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45836868 ccaacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagag 45836769  T
Q  476 a 476  Q
    |    
T  45836768 a 45836768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30200330 - 30200248
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30200330 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag 30200248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36514595 - 36514493
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    |||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  36514595 aaccaacacgaaaataaattaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagag 36514496  T
Q  474 aga 476  Q
    |||    
T  36514495 aga 36514493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 476
Target Start/End: Original strand, 39811855 - 39811951
Alignment:
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||| || |   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39811855 catgagaataaaacaagcgtagcggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagaga 39811951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 476
Target Start/End: Original strand, 47848548 - 47848668
Alignment:
Q  356 gagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggatta 455  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| || |  ||||||||| |    
T  47848548 gagtgttgggtggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatca 47848647  T
Q  456 gaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| ||| | |||||||||||    
T  47848648 gaagtgataacattagagaga 47848668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23087688 - 23087582
Alignment:
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||     
T  23087688 tcttgggttcatagtacaaaatgaaggagaaataaaagtgtatgtaaatcattgtattcaagttagatggttgaaatggaaaagagcctcgtctgtttta 23087589  T
Q  278 tgtgata 284  Q
    |||||||    
T  23087588 tgtgata 23087582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Original strand, 15681215 - 15681283
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15681215 gatgttgtatggtatagagtgttgggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagtgtagtggagat 15681283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35559373 - 35559282
Alignment:
Q  385 gaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| |||||||||   |||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  35559373 gaatcaagtaagtgtagtaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagaga 35559282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28542272 - 28542173
Alignment:
Q  374 aaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||| | | | |||||| |||||||||| ||  |||||||    
T  28542272 aaccaacatgagcat-aaataagtgtagcggagatgagggtgttgcgttggatgtgtggtaagact-agtgggatagaattagaaatggcaatattagag 28542175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 38135625 - 38135520
Alignment:
Q  355 agagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggatt 454  Q
    |||||||||||  || || ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  38135625 agagtgttggatagtaaagaaccaacactagaataaaacaagcgtagcggagatgaggatcttttgttggatgtgtggtaagattagatgggataggatt 38135526  T
Q  455 agaaat 460  Q
    | ||||    
T  38135525 ataaat 38135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 44855544 - 44855460
Alignment:
Q  392 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44855544 ataagtgtagcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 44855460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 2610055 - 2610522
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||| ||||||||||||     
T  2610055 tgaacgggaggctagaaacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatgaaatgtaacttcag 2610148  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2610149 cagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 2610248  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  2610249 agagaaatagaagcagatgtaaaccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccacttaagt 2610348  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2610349 tgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagactggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 2610448  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2610449 agagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagaga 2610522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Original strand, 3865670 - 3866066
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atc 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||         | |    
T  3865670 gagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtacgtctaccttggaggtgaaagttggagatcatattgtatcccaagttacacggtttcaataac 3865769  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3865770 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtg 3865869  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  3865870 tgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaa 3865969  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  3865970 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagaga 3866066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41763798 - 41763329
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41763798 ggaggctagagacctggaggcaagccttagtagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 41763705  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||         |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41763704 gagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagattatatcataccccaagttgcacgatttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgtcggagaa 41763605  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgaga--------tggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaa 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |        |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41763604 atagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaaacttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaa 41763505  T
Q  301 gtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgta 400  Q
    | | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | || ||||||||    
T  41763504 gctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgta 41763405  T
Q  401 gcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41763404 gcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagaga 41763329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 88 - 476
Target Start/End: Original strand, 8180376 - 8180774
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac-cctagttacac---------a 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||         |    
T  8180376 cagagtatatggaatgtaatttcagtggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccaagttacacggtttaaata 8180475  T
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    | |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||    
T  8180476 ttttgggtccttcttataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagagttttg 8180575  T
Q  278 tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaacc 377  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  8180576 tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtc 8180675  T
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8180676 aacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 8180774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 476
Target Start/End: Original strand, 4807130 - 4807586
Alignment:
Q  24 ctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaa 123  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  4807130 ctagagacttggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaa 4807223  T
Q  124 gtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacaca---------tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaataga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||         |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  4807224 gtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatcttgggtctttcgtacaaaatgacggagaaataga 4807323  T
Q  214 agcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaag 313  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  4807324 agcagatgtaagccatcgtattcaagatgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaag 4807423  T
Q  314 ttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatga 413  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  4807424 ttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgagga 4807523  T
Q  414 tgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| | |||||||| |||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4807524 tgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagaga 4807586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45368374 - 45367912
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45368374 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggttttcgcctgagtagaagcaagacggg------gtatatggaatgtaacttcaacaaaag 45368281  T
Q  119 gagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggaga 207  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||         |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45368280 gagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaattacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggaga 45368181  T
Q  208 aatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaa 307  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  45368180 aatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaa 45368081  T
Q  308 ggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggaga 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||| || |||| | |||||| |||| | || ||||| || ||||||    
T  45368080 ggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggaga 45367981  T
Q  408 tgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  45367980 tgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 45367912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11992789 - 11992394
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atct 180  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||    
T  11992789 agtatatggaatgtaacttcagtaaaaagagaagtgggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatct 11992690  T
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgt 280  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  11992689 tgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgc 11992590  T
Q  281 gataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 380  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||    
T  11992589 gataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgaccggcaatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaac 11992490  T
Q  381 atgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| | || | | |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  11992489 acgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagaga 11992394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 452371 - 451929
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||  | |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  452371 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccacttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 452278  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  452277 cggaaggagaagtaggtctaccttggaggt------tggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 452184  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  452183 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 452084  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  452083 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 451984  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattaga 457  Q
     |||||||  ||||| | || |||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  451983 agagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattaga 451929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3244304 - 3243939
Alignment:
Q  116 aaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatca-----taccctagttacacatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |   ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3244304 aaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaat 3244205  T
Q  211 agaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaagga 310  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  3244204 agaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtagaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttatgttgaaagga 3244105  T
Q  311 aagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3244104 aagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataa 3244005  T
Q  411 tgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  3244004 ggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 3243939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Original strand, 30743160 - 30743558
Alignment:
Q  23 gctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggaga 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30743160 gctagagacttggagacaaaccttagaagcatatggtttccgcctgggtagaagaaagacaga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggaga 30743253  T
Q  123 agtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatag 212  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||         ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30743254 aattggtctaccttggaggtgaaagttggagatcataccatatcccaagttacacggtttaaatatcttaggtcaatagtacaaaatgacggataaatag 30743353  T
Q  213 aagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaa 312  Q
    ||| | || ||| ||||| |||||||||||  || |||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30743354 aagtagatataaatcatcgtattcaagctgagtgattgaaattgagaagagcctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaa 30743453  T
Q  313 gttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatg 412  Q
    ||| || |||| | | ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | || |||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  30743454 gttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgtatggtacggagagttaggcgattaaaagccaacacgagaatcaagtaagtgttgtggagatgagg 30743553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 203 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41197792 - 41197518
Alignment:
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcat---attcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactactta 299  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  41197792 ggagaaatagaagcatatgtgaatcatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccactta 41197693  T
Q  300 agtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgt 399  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||| | || |||||||    
T  41197692 agctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagaccagcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgt 41197593  T
Q  400 agcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
    ||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41197592 agcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 41197518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38453373 - 38453059
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||||||  ||||| ||      |||||||||||||||| |||     
T  38453373 tgaacgggaggctagagact-ggaggcaaaccatagaagcgtatggattccgcttaagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacatcag 38453281  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| |  |||||||||||    
T  38453280 cggaaggagaagtag-tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacgatttaaatatcttgggtccttcatacaaaatgac 38453182  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38453181 ggagaaatagaagcatatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 38453082  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggaca 325  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  38453081 tgaaaggaaagttctatcggaca 38453059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24584290 - 24583906
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||         |||    
T  24584290 gagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattatgtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcagaccgcaagttacacggtttaaatatc 24584191  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||   |||||||||    
T  24584190 ttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatataggcagatttaagccatcatattcaagctgggtggtggaaatggagaatagcctcgtgtgttttgtg 24584091  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     || |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |  || |  |  ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |  |||    
T  24584090 cgaaaagaaaataccacttaagttgaaagaaaagttctgttagatagtatccagaccgacgatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaagagtcaa 24583991  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||    
T  24583990 cacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgaca 24583906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 6238334 - 6238054
Alignment:
Q  183 ggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtga 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6238334 ggtccatagtacaaaatgtcggagaaataaaaacatatgtaaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgtga 6238235  T
Q  283 taagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacat 382  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||     
T  6238234 taa-aaaataccacttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagactgacgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacac 6238136  T
Q  383 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    ||||||||||||| || |||| |  ||| |||||| |  |||||||| ||||||| || | | ||||| ||||| |||||||    
T  6238135 gagaatcaaataattgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgaca 6238054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 292 - 482
Target Start/End: Original strand, 36183261 - 36183451
Alignment:
Q  292 actacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaa 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  36183261 actacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaa 36183360  T
Q  392 ataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 482  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  36183361 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtag 36183451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 476
Target Start/End: Original strand, 13148914 - 13149307
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttg 182  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||      
T  13148914 tatatggggtgtaacttcagcaaaaggagaaatagtttaaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatctca 13149013  T
Q  183 ggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtga 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||  | |||    
T  13149014 ggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagtagatacaaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatgaagaagagcttcaggtgtttcatatga 13149113  T
Q  283 taagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacat 382  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||| |   |||||||||| ||||||||||||  |  |||||| ||||||||     
T  13149114 taagaaagtaccactcaagttaaaaggaaaattatattggacaacaaccaggctaacgatgttgtacggtacagagtgtcaggtggttaagaaccaacac 13149213  T
Q  383 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || ||||||  ||||||| | ||||||| | ||||   |||||  |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13149214 gaaaatcaagcaagtgtaacagagatgagggtgttgtgttggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacaccatttgagaga 13149307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 284 - 476
Target Start/End: Original strand, 12734508 - 12734695
Alignment:
Q  284 aagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatg 383  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  12734508 aagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcg-acaacagtcaaaccatcgatgttgtatggtacagagtgttgggcggtttagagccaacatg 12734606  T
Q  384 agaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||    |||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12734607 agaatc----aagtgtagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagaga 12734695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 476
Target Start/End: Original strand, 38429707 - 38429878
Alignment:
Q  305 aaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcgg 404  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||    
T  38429707 aaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagtgtagcgg 38429806  T
Q  405 agatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38429807 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 38429878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16097477 - 16097278
Alignment:
Q  281 gataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacgg----ttaaaaac 376  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | | |||||||||||||  | | ||||||||    |||| | |    
T  16097477 gataagaaggtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcaaacagcagtcagaccagtgttgttgtatggtacgaaatcttggacggacggttaagagc 16097378  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  16097377 caacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagaga 16097278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 474
Target Start/End: Original strand, 23997406 - 23997609
Alignment:
Q  271 tgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggtt 370  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  23997406 tgttttgtgcgatgagaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcagtt 23997505  T
Q  371 aaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatta 470  Q
    || |  ||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  23997506 aagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccatta 23997605  T
Q  471 gaga 474  Q
    ||||    
T  23997606 gaga 23997609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12475176 - 12475031
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||  | |||||| ||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  12475176 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattcctcttgagtataagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 12475083  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata 164  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12475082 cggaaggagaagtaggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata 12475031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 284
Target Start/End: Original strand, 17581164 - 17581270
Alignment:
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||     
T  17581164 tcttgggttcattgtacaaaatgacaaagaaataaaagcagatgtaaatcctcatattcaagttggatggttcaaatggagaagagtctcaggtgtttta 17581263  T
Q  278 tgtgata 284  Q
    |||||||    
T  17581264 tgtgata 17581270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 37281706 - 37281882
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgta--acttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacacat--------- 178  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||             
T  37281706 agtatatgaaatgtagtacttcaacaaaagacaaagtagttctaccttggaggtgaaagtttgagatcatgtcataccccaagttacacattttaaatat 37281805  T
Q  179 cttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatg 255  Q
    ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  37281806 cttagctccatagtataaaatgaaggagaaatagaagtagatgtaaatcatcctattcaagttgggtggttgagatg 37281882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19337245 - 19337136
Alignment:
Q  368 gttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga-ttaaataggataggattagaaatgacatc 466  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||   |||||||||||| |||||| | |    
T  19337245 gttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaac 19337146  T
Q  467 attagagaga 476  Q
    ||||||||||    
T  19337145 attagagaga 19337136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 167
Target Start/End: Original strand, 36038817 - 36038895
Alignment:
Q  89 agagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccc 167  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36038817 agagtgtatggaatgtgatttcagcaaaaggcgaagtagttctaccttataactgaaagttgaagatcatatcataccc 36038895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 6465431 - 6465515
Alignment:
Q  192 tacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||   | ||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  6465431 tacaaaatgactgagaaattgaagcatatgcaaatcatcaaattcaagtcaggtggctgagatggagaagagtcttagctgtttt 6465515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13593022 - 13592958
Alignment:
Q  100 aatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata 164  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13593022 aatgtaacttcaacaaaagacgaagtagttcaaacttagaggtgaaagttgaagatcatatcata 13592958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33594845 - 33594757
Alignment:
Q  188 atagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||| || ||||||    
T  33594845 atagtacaaaacgtcggagaaatagaaggagatgtaaaacatcaaattcaaactgggtggttgagatggaggagtgtcttaggtgtttt 33594757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 476
Target Start/End: Original strand, 7825254 - 7825352
Alignment:
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7825254 aacatgagaataaagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagaga 7825352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9556737 - 9556656
Alignment:
Q  395 agtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||   ||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9556737 agtgtagtggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagaga 9556656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 1456095 - 1456168
Alignment:
Q  342 tgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 417  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1456095 tgttatatgggacggagtgttggaaggtaaagaaccaaca--agaataaaataagtgtagcggagatgaggatgtt 1456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 38453057 - 38452977
Alignment:
Q  396 gtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38453057 gtgtagcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagaga 38452977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 391
Target Start/End: Original strand, 32443473 - 32443523
Alignment:
Q  341 atgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  32443473 atgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaatcaacacgagaatcaa 32443523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 464
Target Start/End: Original strand, 42092436 - 42092501
Alignment:
Q  399 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  42092436 tagcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgaca 42092501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13241065 - 13241033
Alignment:
Q  444 aggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13241065 aggataggattagaaatgacaacattagagaga 13241033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12493071 - 12492675
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||    
T  12493071 gagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtagctctaccttggaggtaaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 12492972  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12492971 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 12492872  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
      |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||    
T  12492871 caataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggctttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 12492772  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  12492771 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagaga 12492675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 1274792 - 1275259
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| |  |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  1274792 tgaacatgaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccggttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 1274885  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  1274886 cgaaaggagaagtaggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 1274985  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1274986 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctaaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 1275085  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1275086 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacgagtcaacatgagaatcaagtaagcatagc 1275185  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1275186 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagaga 1275259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1288344 - 1287877
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||| || || |||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  1288344 tgaacgggagactagagacctggagacaagccttagaagcgtatggattctgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 1288251  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||||| |||| | ||||||||||||    
T  1288250 cggaaggagaagtaagtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgagtccttcgtacaaaatgac 1288151  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  1288150 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagt 1288051  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1288050 tgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgatcggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 1287951  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1287950 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagaga 1287877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 476
Target Start/End: Original strand, 10638833 - 10639291
Alignment:
Q  21 aggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaagga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||    |||||    
T  10638833 aggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattc-gcttgagtagaagaaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagtggaagga 10638925  T
Q  121 gaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10638926 gaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaat 10639025  T
Q  211 agaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaagga 310  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10639026 agaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagga 10639125  T
Q  311 aagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 410  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10639126 aagttctatcgaacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 10639225  T
Q  411 tgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10639226 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagaga 10639291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 2076229 - 2075762
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||      ||| ||||||||||||||||     
T  2076229 tgaacgggaggctagagagctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacaga------gtacatggaatgtaacttcag 2076136  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2076135 cggaaggagaagcagttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 2076036  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  2076035 agagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagt 2075936  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||    
T  2075935 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagc 2075836  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2075835 agagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagaga 2075762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Original strand, 20318518 - 20318974
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  20318518 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 20318611  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  20318612 cggaaggagaagtagttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 20318711  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  20318712 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataag----taccacttaagt 20318807  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20318808 tgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 20318907  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagaga 474  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |     |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20318908 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgacaccattagaga 20318974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 28977612 - 28977145
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  28977612 tgaacgggaggctataggcctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcaa 28977519  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  28977518 cggaaggagaagtaggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagtcacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 28977419  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28977418 ggagtaatagaagtagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 28977319  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28977318 tgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaacgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 28977219  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     |||||||  |||||   ||||||||||||||| | || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28977218 agagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagaga 28977145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Original strand, 3301382 - 3301838
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3301382 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagagtatggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagcaaaag 3301475  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3301476 gagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtaccaaatgaaggagaa 3301575  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||    
T  3301576 atagaagcagatgcaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatagagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaag 3301675  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||| ||     || ||||||||||||||||    
T  3301676 gaaagttctatcggacagtagtcagactgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagccaacacga-----aagtaagtgtagcggagat 3301770  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |  |||||| |  | |||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  3301771 ggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagaga 3301838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 360
Target Start/End: Original strand, 3394244 - 3394591
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3394244 ggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggtttccgcctgagtagaagcaagacaga------gtatatggaatgtaa-ttcagcaaaag 3394336  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394337 gagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 3394436  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaa-- 306  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||      
T  3394437 atagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaag 3394536  T
Q  307 -aggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtg 360  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  3394537 gaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatagtacggagtg 3394591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 24178051 - 24178504
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||| |||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  24178051 tgaacgggaggctagagacctgaaggcaagccttagaagtgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcag 24178144  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24178145 cggaaggagaagtaggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaagatcttgggtccttcgtacaaaatgac 24178244  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24178245 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 24178344  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||           |||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24178345 tgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagac---cgacgttgt-----------tgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 24178430  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24178431 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 24178504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 464
Target Start/End: Original strand, 36200404 - 36200764
Alignment:
Q  114 aaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacg 203  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||         || |||||| ||||||||||||||||     
T  36200404 aaaaggagaagtagttctactatggaggtgaaagtgggaggtcatatcatacctcaagttacaccgtttaaatattttgggttcatagtacaaaatgaca 36200503  T
Q  204 gagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtt 303  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| | ||  |||||||    
T  36200504 tagaaatagtagcatatgtaaatcatcatatttaagttgggtggttgaaatggagaagagactcatgtgttttatgtgataagaaaatgctgtttaagtt 36200603  T
Q  304 taaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcg 403  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |     
T  36200604 gaaaggaaaattctaccggacaacagtcaaactggcaatgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaagcgtatca 36200703  T
Q  404 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgaca 464  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  36200704 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 476
Target Start/End: Original strand, 34272767 - 34273011
Alignment:
Q  227 catcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaa 326  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  34272767 catcgtattcaagttgggtggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacag 34272866  T
Q  327 cagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggat 426  Q
    ||||| | ||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  34272867 cagtccggccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggat 34272966  T
Q  427 gagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| ||     || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34272967 gagtggtaagacta-----gacaggattaggaatgacaccattagagaga 34273011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16348085 - 16347879
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atct 180  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||         ||||    
T  16348085 agtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatct 16347986  T
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgt 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  16347985 tgtgtccatagtacaaaatgacggagaaataaaagcgtatgtaaatcatcgtattcaag-taggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgc 16347887  T
Q  281 gataagaa 288  Q
     |||||||    
T  16347886 aataagaa 16347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 210 - 435
Target Start/End: Original strand, 27622 - 27847
Alignment:
Q  210 tagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaagg 309  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27622 tagaatcaaatgtaaatcatcatattcaagttgggtggtggaaatagagaagagtctcgagtgttttacgtgataagaaagtaccacttaagttgaaagg 27721  T
Q  310 aaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatg 409  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27722 aaaattctatctgacaatagtcggacagacgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatg 27821  T
Q  410 atgatgttacattggatgagtggtaa 435  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||    
T  27822 aggatgttgcattagatgagtggtaa 27847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 282 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16347860 - 16347666
Alignment:
Q  282 ataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaaca 381  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||    
T  16347860 ataagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttgagcggttaagagccaaca 16347761  T
Q  382 tgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     |||| | || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | |  ||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  16347760 cgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagaga 16347666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 473
Target Start/End: Original strand, 7678331 - 7678471
Alignment:
Q  332 agacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtg 431  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || | || |||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||  |||    
T  7678331 agaccagcgatgttgtatggaacggagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgagaatagaacaagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtg 7678429  T
Q  432 gtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagag 473  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7678430 gcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagag 7678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43423656 - 43423578
Alignment:
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggaga 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  43423656 tgggtccgtagtacaaaatgacggagaaacagaagcagatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggaga 43423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27302631 - 27302420
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-----cta-----gttacacatc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||     |||      ||| | |||    
T  27302631 gagtatatggaatgtaacttcaacaaaaggtaaagtagttctaccttgaaggtgagtgttggagatcatatcatacctcaaactacacggtttaaatatc 27302532  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |  | ||| ||| ||    
T  27302531 ttgtgtccataatacaaaacggcggagaaatagaag---atgtaaatcatcgtattcaagttgagtggttgaaatggaaaagagccatatatgctttatg 27302435  T
Q  280 tgataagaaagtact 294  Q
    |||||||||||||||    
T  27302434 tgataagaaagtact 27302420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 475
Target Start/End: Original strand, 9234925 - 9235062
Alignment:
Q  338 gcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9234925 gcgatgttatatggaacagagtgttggatggtaaaaaactaacacaagaataaaataagctgagcagagatggaaatgttgcattggatgtgtggtaaga 9235024  T
Q  438 ttaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
     || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9235025 ctagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 164
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27602
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27526 cagagtatagggaatgtaacttcaacaataggcgaagtagttatgccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 27602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20077389 - 20077297
Alignment:
Q  192 tacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgata 284  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20077389 tacaaaatgacggagaaattaaagcagatgcaaatcatcattttcaggttggatggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttatgtgata 20077297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17341885 - 17341809
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc 166  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||  || | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17341885 gagtatatggaatgtaactttagaaaaaggccaaatggttctaccttggaggtggaagttggagatcatatcatacc 17341809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 164
Target Start/End: Original strand, 23979832 - 23979904
Alignment:
Q  92 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata 164  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||   |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23979832 gtatatgtaatgtaacttcaacaaaagacaaagtagttcaaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata 23979904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 475
Target Start/End: Original strand, 30588310 - 30588446
Alignment:
Q  339 cgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagat 438  Q
    |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||  ||| |||||  | |||||| | | ||||| ||||||||||    
T  30588310 cgatgttgtacggaacagggtgttgggtggtaaaacaccaacacgagaataaaataagcatagtggagacaaggatgttgcgtgggatgtgtggtaagat 30588409  T
Q  439 taaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
     ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  30588410 caaatgagatatgattagaaatgacaatattagagag 30588446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 476
Target Start/End: Original strand, 32516416 - 32516552
Alignment:
Q  340 gatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 439  Q
    |||||||||||| |  || |||| | ||||||| ||||| ||| ||||| || ||   ||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |    
T  32516416 gatgttgtatggaatggaatgtttggcggttaagaaccatcattagaataaagtacacgtaacggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagact 32516515  T
Q  440 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | | |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32516516 agacaggatagacttagaaatgacaacattagagaga 32516552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 437
Target Start/End: Original strand, 1525447 - 1525595
Alignment:
Q  287 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 386  Q
    |||||||  |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| || |||||||||||      
T  1525447 aaagtaccgcttaagttgaagggaaatttttatcgaacaacggtaagaccggcgatgttgtatgggac--agtgttgggcggtgaagaaccaacatgaac 1525544  T
Q  387 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    || |||||||  | || || |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  1525545 ataaaataagctttgctgaaatgaggatgttacgtcggatgtgtggtaaga 1525595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5848462 - 5848403
Alignment:
Q  378 aacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5848462 aacatgagagtaaaataagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaaga 5848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 293
Target Start/End: Original strand, 16779407 - 16779493
Alignment:
Q  207 aaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtac 293  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16779407 aaatagaaatatatgtaaaccatcaaattcaatttgagtggttgaaatggagaagagactcagatgttttatgtgatacgaaagtac 16779493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 474
Target Start/End: Original strand, 21093663 - 21093768
Alignment:
Q  369 ttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcat 468  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||| || ||  ||| | |||||||||||||  ||    
T  21093663 ttaagaaccaacacgagaataaaataagtgtagtggatatgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactagatgtgatggaattagaaatgacaatat 21093762  T
Q  469 tagaga 474  Q
    ||||||    
T  21093763 tagaga 21093768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 37124166 - 37124243
Alignment:
Q  89 agagtatatggaatgtaacttcatcaaaag-gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac 165  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37124166 agagtatatggaatgtaatttcagcaaaaatgtgaagtatttctaccttagaggtgaaagttggagatcaaatcatac 37124243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 427
Target Start/End: Original strand, 3096921 - 3097120
Alignment:
Q  227 catcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaa 326  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  |||| || || |||||| ||||||  |||| |||  |||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  3096921 catcaaattcaagttgggtggttgaaatggatgagagccttaggtgttttatgtgatgtgaaaataccgcttaagttgaa-ggaaatttttatcgaacaa 3097019  T
Q  327 cagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggat 426  Q
    | || |||||  |||||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| ||  || || |||||||  | |||| || |||||||| ||||||    
T  3097020 cggtaagaccgacgatgttgtacgggacaaaatgttggacggtaaataaccaacacgaacattaagtaagtgtgacagagacgaggatgttacgttggat 3097119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 28187028 - 28186956
Alignment:
Q  404 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28187028 gagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 11002786 - 11002709
Alignment:
Q  399 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11002786 tagcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagaga 11002709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32516273 - 32516160
Alignment:
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    |||| ||||| |||||| | || |||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||| | | ||| |||| |||||| || |||| |||| ||||||    
T  32516273 gaaaattctaccggacagctgttagaccgacgatgttgtatggaatagagtgttgggcggcttagaactaacacgagaataaagtaagcgtagtggagat 32516174  T
Q  409 gatgatgttacatt 422  Q
    || |||||| ||||    
T  32516173 gaggatgtttcatt 32516160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43558401 - 43558285
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || | || || |||||||| || || |  ||||||    
T  43558401 atcttaggtccattgtacaaaaccacagagaaatagaagcagatgtaaatcatcgaattcaagcagggtagtggaaatggagaatagcctaaagtgtttt 43558302  T
Q  277 gtgtgataagaaagtac 293  Q
     |||||||  |||||||    
T  43558301 atgtgatactaaagtac 43558285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 90 - 476
Target Start/End: Original strand, 25190977 - 25191373
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||         |||    
T  25190977 gagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatagcccaagttacacggtttaaatatc 25191076  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25191077 ttgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 25191176  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||    
T  25191177 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagaccggaaatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaagagtcaa 25191276  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25191277 cacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagaga 25191373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 38849621 - 38850088
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| || |||||| ||      ||||||||||||||||| |||    
T  38849621 tgaataggaggctagagatctggaggcaagccctataatcgtatggtttccgcttgagtaaaagtaagacgga------gtatatggaatgtaactacat 38849714  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||         |||||||||||| |||||||||||||    
T  38849715 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacctcaatttacacggtttaaatatcttgggtccacagtacaaaatgac 38849814  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38849815 ggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataacaaagtaccacttaagt 38849914  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | |||| ||  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38849915 tgaaagaaattttttatcggacaacagtcacaccgacgatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagc 38850014  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| || | | |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  38850015 agagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagaga 38850088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 90 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 51448393 - 51447991
Alignment:
Q  90 gagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atc 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         |||    
T  51448393 gagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 51448294  T
Q  180 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtg 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  51448293 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtg 51448194  T
Q  280 tgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaa 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |  |||    
T  51448193 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaa 51448094  T
Q  380 catgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatag 479  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  51448093 catgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 51447994  T
Q  480 tag 482  Q
    |||    
T  51447993 tag 51447991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 47542466 - 47542039
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      || |||||||||||||||||     
T  47542466 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattccgcttgagtagaagcaagacgga------gtgtatggaatgtaacttcag 47542373  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  47542372 cagaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatttcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgac 47542273  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47542272 ggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 47542173  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||||||| ||  |||||||||    
T  47542172 tgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaat-aagaaagtgtagc 47542074  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  47542073 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 47542039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 476
Target Start/End: Original strand, 28245132 - 28245431
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28245132 atcttggatccttcgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagttgtttt 28245231  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaac 376  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||      
T  28245232 gtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagt 28245331  T
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28245332 caacatgagaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagaga 28245431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 436
Target Start/End: Original strand, 27917173 - 27917526
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttacac---------atcttg 182  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||         ||||||    
T  27917173 tatatggattgtaacttcagtaaaaggagaactagttctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatcttg 27917272  T
Q  183 ggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtga 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||| | | ||| || |||||||| ||||  |||||| |||||    
T  27917273 agtccatagtacaaaatgacggagaaatataagcatatataaatcatcgtattcaagttgggtagctgaaatagagaagagcctcatgtgttttatgtga 27917372  T
Q  283 taagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacat 382  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||  | ||||| |||||| |     
T  27917373 taaaaaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacaccggcgatgttgtatggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaaac 27917472  T
Q  383 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaag 436  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  27917473 gagaatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaag 27917526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 235 - 476
Target Start/End: Original strand, 52138553 - 52138794
Alignment:
Q  235 tcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcaga 334  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  52138553 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtcttgtgcgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccga 52138652  T
Q  335 cctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggta 434  Q
    || ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  52138653 ccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta 52138752  T
Q  435 agattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52138753 agactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 52138794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 476
Target Start/End: Original strand, 5168599 - 5168822
Alignment:
Q  253 atggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggt 352  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5168599 atggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggt 5168698  T
Q  353 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatagga 452  Q
    || ||||| ||| ||||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||||| || | |||||||||    
T  5168699 acggagtgctgggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggatagga 5168798  T
Q  453 ttagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  5168799 ttaggaatgacaccattagagaga 5168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 472
Target Start/End: Original strand, 26490012 - 26490307
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||| || || ||| |||||    
T  26490012 atcttggttccatgatataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcatattgaagttgagtggttgagatgaagaatagccttaga-gtttt 26490110  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgt--atggtacagagtgttggacggttaaaa 374  Q
     ||| || ||||| |||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||| |    
T  26490111 atgtaatgagaaaataccgcttaaatttaaaggaaaattatatcggacaacagtcagaccggcgatgttgtgtatggta-agtatgttgggcggttaaga 26490209  T
Q  375 accaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattaga 472  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  | |  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  26490210 accaacaagagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattaga 26490307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 29817101 - 29817358
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccct-agttacac---------a 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||         |    
T  29817101 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggtgaagttgttctatcttggaggtgaaagttggagatcatatcataccataagttacacggttcaaata 29817200  T
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttg 277  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||   |||||||     
T  29817201 tctt-tgaccatagtacaaaatgacggataaataacggcagatgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaatagtctgttatgtttta 29817299  T
Q  278 tgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 336  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29817300 tgtgataagaaagtaacgcttaagttgaaagaaaatttctaccggacaacagttagacc 29817358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 396
Target Start/End: Original strand, 48221383 - 48221698
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacacat---------ct 180  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||         ||    
T  48221383 agtatatgtaatgtaatttcagcaaaaggtgtagtagttctatcttagaggtgaaagttgaagatcatatcataccacaagttacacattttaaatatct 48221482  T
Q  181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgt 280  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||  |||||||||||    
T  48221483 tggattcatagtacaaaatgacagagaagtagaagcatatgtaaatcatcgaattcaaactggatggttgaaatgaagaagaacctccaatgttttgtgt 48221582  T
Q  281 gataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 380  Q
    |||| ||||||||| || ||||| || | |   || |||  |||  | || ||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||    
T  48221583 gatacgaaagtactgctcaagttgaaggaatttttttattagacggcggttagaccagcgatgttgtatggaataaaatgttggacggtgaagaaccaac 48221682  T
Q  381 atgagaatcaaataag 396  Q
    || | ||| |||||||    
T  48221683 ataataataaaataag 48221698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 472
Target Start/End: Original strand, 53519357 - 53519576
Alignment:
Q  253 atggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggt 352  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||| | ||    
T  53519357 atggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtgttgt 53519456  T
Q  353 acagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggatagga 452  Q
    || |||||||   ||||||| | |||||| |||| | || | ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  53519457 acggagtgttaagcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggatagga 53519556  T
Q  453 ttagaaatgacatcattaga 472  Q
    |||  ||||||| |||||||    
T  53519557 ttaagaatgacaccattaga 53519576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54425493 - 54425349
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |  |||||| ||| | ||||||||||  ||||||    
T  54425493 atcttggatccatagtaaaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatttaagctaggcggttgaaatgaaaaagagtctcatgtgtttt 54425394  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcg 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  54425393 gtgtgataagaaagtaccacttaagttggaaggaaaattttatcg 54425349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33272478 - 33272316
Alignment:
Q  314 ttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatga 413  Q
    |||||||| |||||| |  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  33272478 ttctatcgaacaacacttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagga 33272379  T
Q  414 tgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33272378 tgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 33272316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 52138356 - 52138503
Alignment:
Q  14 gaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatc 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||  |||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| |    
T  52138356 gaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagcgtatggattctgtttgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcagc 52138449  T
Q  114 aaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccc 167  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52138450 ggaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc 52138503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 482
Target Start/End: Original strand, 54278850 - 54279020
Alignment:
Q  312 agttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgat 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  54278850 agttctatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgag 54278949  T
Q  412 gatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagagatagtag 482  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| || | | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  54278950 gatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtag 54279020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 439
Target Start/End: Original strand, 30345232 - 30345480
Alignment:
Q  187 catagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataag 286  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| || ||||| ||| ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  30345232 catagtacaaaaagaaagagaaataaaaacatatataaatcatagtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgcgataag 30345331  T
Q  287 aaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgaga 386  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| ||||| | ||| | | |||||    ||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  30345332 aaagtaccgcttaaattgaaaggaaaattctaccagacgaaaatcagattgacgatgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatgaaa 30345431  T
Q  387 atcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagatt 439  Q
    ||    ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||    
T  30345432 at----taagtatagcggagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagatt 30345480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 437
Target Start/End: Original strand, 3186500 - 3186724
Alignment:
Q  213 aagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaa 312  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||| | | |||  ||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  3186500 aagcagatgtaaaacatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaatattttcatgtgttttaggtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaa 3186599  T
Q  313 gttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatg 412  Q
    ||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||| || | |||||||| || |||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||      
T  3186600 gttatatcggacaacagtcccaccaacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaacacgagaatcaagtaaatgtagcgtagatgaga 3186699  T
Q  413 atgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    || |||  ||||||||| |||||||    
T  3186700 atcttatgttggatgagcggtaaga 3186724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 43695230 - 43695092
Alignment:
Q  299 aagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtg 398  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  43695230 aagttgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtg 43695131  T
Q  399 tagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    || | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  43695130 taacagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaaga 43695092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Original strand, 19757664 - 19757816
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata-ccctagttac---------aca 177  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||         | |    
T  19757664 cagagtatatggaatgtaactttagcaaaaggcaaagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaata 19757763  T
Q  178 tcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||    
T  19757764 tcttgggtccatagtacaaaataacagagaaataagagcagatgtaaatcatc 19757816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 167
Target Start/End: Original strand, 19736762 - 19736841
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19736762 cagagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggcagagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc 19736841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40674632 - 40674440
Alignment:
Q  245 tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgt 344  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | | ||| |||| |  | ||||    
T  40674632 tggttgaagtggggaagagtctgagatgttttatgtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaaattctatcgaatatcaggcagatcaacaatgt 40674533  T
Q  345 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||  |||| || | | | ||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  40674532 tgtatagtacggagtgttggactgataagaatcaacacgagcttcaagtacgcgcaacgaggatgaagatgttacattgtatgaatggtaaga 40674440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 49503978 - 49503842
Alignment:
Q  345 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttac-----attggatgagtggtaagatt 439  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |     |||||||||||||||||| |    
T  49503978 tgtatggtatggagtgttggacggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagact 49503879  T
Q  440 aaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    | |   ||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  49503878 agacgagataggattgggaatgacaccattagagaga 49503842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 469
Target Start/End: Original strand, 45728040 - 45728133
Alignment:
Q  376 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcatt 469  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  | |    |||||||||||||||||||||||    
T  45728040 ccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatt 45728133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 19757517 - 19757642
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||  || |||| |||||||  ||||||||      |||||||||||||||||| | ||||||    
T  19757517 ggaggttagagacttggagacaagccttagaagcgtatggcatccgccttagtagaagcaagacaga------gtatatggaatgtaactttagcaaaag 19757610  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttg 150  Q
    |  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19757611 gcaaagtagtcctaccttggaggtgaaagttg 19757642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 47233967 - 47233884
Alignment:
Q  393 taagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47233967 taagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagaga 47233884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 131
Target Start/End: Original strand, 9258443 - 9258522
Alignment:
Q  46 taaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtct 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9258443 taaaagcgtgtggtttccgcctgagtagaagcaagacgga------gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtaggtct 9258522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 50621734 - 50621648
Alignment:
Q  390 aaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  ||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50621734 aaataagtgtagcggagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagaga 50621648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43111699 - 43111626
Alignment:
Q  91 agtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcata 164  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43111699 agtatatgtaatgtaatttcagcaaaagaagaagtagttgtaccttagaggtgacagttggagatcatatcata 43111626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2341095 - 2341003
Alignment:
Q  383 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || | | ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  2341095 gagaataaaataaggatagtggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagag 2341003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 46432090 - 46431972
Alignment:
Q  345 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaata 444  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || ||| || |  ||||| |||||||  | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| || | |    
T  46432090 tgtatggaacagagtgttgggcggtaaacaactaatacaagaataaaataagcatggaggagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagaca 46431991  T
Q  445 ggataggattagaaatgac 463  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46431990 ggatagggttagaaatgac 46431972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46227340 - 46227275
Alignment:
Q  345 tgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatga 410  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  46227340 tgtaaggtacggagtgttagacgattaaaaaccaacatgataatcaaataagcgtggtggagatga 46227275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 476
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19736990
Alignment:
Q  404 gagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagaga 19736990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 476
Target Start/End: Original strand, 54128272 - 54128372
Alignment:
Q  376 ccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagag 475  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| | || |||||||||||| | || |   ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  54128272 ccaacatgagaatcaagtaagcttagcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagag 54128371  T
Q  476 a 476  Q
    |    
T  54128372 a 54128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 476
Target Start/End: Original strand, 21992 - 22067
Alignment:
Q  401 gcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21992 gcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagaga 22067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Original strand, 45236751 - 45236850
Alignment:
Q  377 caacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||| |||||| || ||||  |||| ||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45236751 caacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 44134233 - 44134151
Alignment:
Q  355 agagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||   ||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||    
T  44134233 agagtgttggacggtgaaaaaccaacacgagaatgaaataagcttagataagatgataatgttatgttggatgtgtgataaga 44134151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676378
Alignment:
Q  407 atgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagaga 19676378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 461
Target Start/End: Original strand, 29919182 - 29919283
Alignment:
Q  360 gttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaa 459  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |   |||| |||||||||    
T  29919182 gttggagggtgaagaaccaacacgagaataaaatcagtgtagtggagatgacgatgttgtgttggatgtgtggtacgattagacgagatatgattagaaa 29919281  T
Q  460 tg 461  Q
    ||    
T  29919282 tg 29919283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 461
Target Start/End: Original strand, 29968335 - 29968436
Alignment:
Q  360 gttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaa 459  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| |   |||| |||||||||    
T  29968335 gttggagggtgaagaaccaacacgagaataaaatcagtgtagtggagatgacgatgttgtgttggatgtgtggtacgattagacgagatatgattagaaa 29968434  T
Q  460 tg 461  Q
    ||    
T  29968435 tg 29968436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 46367793 - 46367732
Alignment:
Q  356 gagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgtt 417  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  46367793 gagtgttggacggtaatgaaccaacacgagaataaaataagtgtagtagagatgaggatgtt 46367732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50621889 - 50621801
Alignment:
Q  235 tcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcgga 323  Q
    ||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||| || |||| ||| ||| |||    
T  50621889 tcaagctgagtggttgaattggaaaagagtctcagatgttttatgtgatacgagagtaccactcaagttaaagggaacgttatattgga 50621801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 30995 - 31462
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcat 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||| ||| || |||||||||  ||||| ||      ||||||||||||||||||||     
T  30995 tgaacgggaggctagagacctggaggcaagccttagaagtgtatggattccgcttgagtagaagcaagactga------gtatatggaatgtaacttcag 31088  T
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgac 202  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||||||| | ||||||||||||    
T  31089 cggaaggagaagtaggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaacatcttgggtccttcgtacaaaatgac 31188  T
Q  203 ggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagt 302  Q
    ||||||||| ||| | |||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31189 ggagaaataaaagtagatgtaggccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagt 31288  T
Q  303 ttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagc 402  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289 tgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 31388  T
Q  403 ggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
     ||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  31389 agagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagaga 31462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 119 - 476
Target Start/End: Original strand, 82348 - 82715
Alignment:
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacc-ctagttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  82348 gagaagtaggtctgccttggaggcgaaagttggagattatatcataccacaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtaaaaaatgacggagaa 82447  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  82448 atagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgcaatgggaaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtactccttaagttgaaag 82547  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  82548 gaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagat 82647  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||||| || ||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  82648 gaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagaga 82715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2951 - 2597
Alignment:
Q  93 tatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttg 182  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||         ||||||    
T  2951 tatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtcagtctacattggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttg 2852  T
Q  183 ggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtga 282  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  2851 ggtccttcgtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcga 2752  T
Q  283 taagaaagtactacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacat 382  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  2751 taagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagactgacgttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaacat 2652  T
Q  383 gagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaaga 437  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2651 gataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaaga 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12347 - 11886
Alignment:
Q  19 ggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttctgcctgagtagaactaagacagatgcagagtatatggaatgtaacttcatcaaaag 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||      ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12347 ggaggctagagacctagaggcaagccttagaagcgtatggtttccgcttgagtagaagtaagacggat------tatatagaatgtaacttcagcaaaag 12254  T
Q  119 gagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatacccta-gttacac---------atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12253 gagaagtaggtctaccttcgcggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaa 12154  T
Q  209 atagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagtactacttaagtttaaag 308  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12153 atagaagcatatgtaagccatcgtatttaagctgggtcgttgaaatggagaagaacctcaagtgttttgtgcgataagaaagtacctcttaagttaaaag 12054  T
Q  309 gaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagat 408  Q
    ||||||| |||||| || || ||||| | | | ||||| |||||||| | |||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  12053 gaaagttttatcggtcagcaatcagaacggagttgttgcatggtacaaaatgttgggcgggtaagagtcaacatgagaatcaagtatgtgtagcagagat 11954  T
Q  409 gatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    || |||||| |  |||||||| ||||||| || | |  |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  11953 gaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagaga 11886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 87196 - 86895
Alignment:
Q  177 atcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgagatggagaagagtctcagatgtttt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || ||| |  |||||    
T  87196 atcttgggtccatagtataaaatgtcggagaaatagaatcagatgtaactcatcatattcatgtttgatggttgaaatggagaaaagcctcgggggtttt 87097  T
Q  277 gtgtgataagaaagtactacttaagtttaaaggaaa-----gttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgtatggtacagagtgttggacggtta 371  Q
     ||  |||||||||||  ||||||||| ||| ||||     | ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  87096 atgcaataagaaagtatcacttaagttgaaaagaaaaaaaagctctattggacagcagtcagaccaacgattttgtatggtacag--tgttgg-cggtta 87000  T
Q  372 aaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggataggattagaaatgacatcattag 471  Q
    | | || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  86999 agagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattag 86900  T
Q  472 agaga 476  Q
    |||||    
T  86899 agaga 86895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 88609 - 88532
Alignment:
Q  88 cagagtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcatac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  88609 cagagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtaggtttaccttggagatgaaagatggaaatcataccatac 88532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 88685 - 88636
Alignment:
Q  13 tgaacaggaggctagagacttggaggcaaaccctaaaagcgtatggtttc 62  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  88685 tgaacgggaggctagagatttggaggcaagccttagaagcgtatggtttc 88636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  195 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctgga--tggttgagatggagaagagtctcagatgttttgtgtgataagaaagta 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||   || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  156 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 57  T
Q  293 ctacttaagtttaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacctgcgatgttgta 348  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||||||||||    
T  56 ccaattaagttgaaaggaaagttctatcacaaaacagttcgaccggcgatgttgta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25859 - 25733
Alignment:
Q  350 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 449  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||||||||| || | | ||||    
T  25859 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgata 25760  T
Q  450 ggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25759 ggattaggaatgacaccattagagaga 25733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 167
Target Start/End: Original strand, 5813 - 5867
Alignment:
Q  113 caaaaggagaagtaggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccc 167  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5813 caaaaggagaagtagttatatcttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc 5867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4560
Alignment:
Q  350 ggtacagagtgttggacggttaaaaaccaacatgagaatcaaataagtgtagcggagatgatgatgttacattggatgagtggtaagattaaataggata 449  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| ||| | || | || |||| |||||| | |||||||| |||||||| || | | ||||    
T  4686 ggtacggagtgttggacggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgata 4587  T
Q  450 ggattagaaatgacatcattagagaga 476  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4586 ggattataaatgacaccattagagaga 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University