View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2047_low_15 (Length: 272)

Name: NF2047_low_15
Description: NF2047
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2047_low_15
NF2047_low_15
[»] chr1 (103 HSPs)
chr1 (4-255)||(51750011-51750262)
chr1 (16-254)||(21948247-21948484)
chr1 (4-255)||(2617488-2617739)
chr1 (15-255)||(31735579-31735819)
chr1 (16-255)||(28840664-28840902)
chr1 (16-254)||(28842479-28842716)
chr1 (6-254)||(15823520-15823768)
chr1 (4-247)||(38925544-38925787)
chr1 (25-255)||(46431766-46431995)
chr1 (16-272)||(24325648-24325906)
chr1 (4-255)||(20302431-20302681)
chr1 (4-254)||(13761809-13762058)
chr1 (4-255)||(6822987-6823237)
chr1 (16-255)||(10399886-10400125)
chr1 (16-252)||(15294895-15295131)
chr1 (9-255)||(16226144-16226390)
chr1 (16-255)||(27336998-27337235)
chr1 (16-254)||(39932057-39932295)
chr1 (25-254)||(48665170-48665400)
chr1 (16-252)||(12302566-12302802)
chr1 (16-252)||(47906254-47906490)
chr1 (16-255)||(27339189-27339427)
chr1 (4-254)||(13215053-13215308)
chr1 (4-252)||(41646892-41647140)
chr1 (16-255)||(47177346-47177585)
chr1 (16-255)||(47179697-47179936)
chr1 (4-255)||(20291429-20291679)
chr1 (17-246)||(16428638-16428867)
chr1 (16-255)||(9463302-9463541)
chr1 (4-252)||(17324697-17324945)
chr1 (6-252)||(50307607-50307854)
chr1 (16-255)||(9459475-9459714)
chr1 (4-252)||(39462491-39462739)
chr1 (7-254)||(50076730-50076978)
chr1 (7-254)||(50078879-50079127)
chr1 (7-246)||(18307084-18307323)
chr1 (4-255)||(51752337-51752586)
chr1 (16-252)||(2510386-2510621)
chr1 (15-246)||(18839570-18839801)
chr1 (8-252)||(14098030-14098275)
chr1 (4-252)||(6995761-6996009)
chr1 (4-248)||(28998318-28998562)
chr1 (4-248)||(29004034-29004278)
chr1 (16-254)||(4131434-4131676)
chr1 (4-246)||(17186195-17186437)
chr1 (7-246)||(31425082-31425325)
chr1 (4-254)||(9241144-9241395)
chr1 (4-246)||(25251342-25251584)
chr1 (4-231)||(6823856-6824091)
chr1 (7-252)||(11457536-11457781)
chr1 (7-246)||(31422940-31423180)
chr1 (9-252)||(2949292-2949535)
chr1 (16-246)||(25127856-25128086)
chr1 (7-246)||(6756502-6756740)
chr1 (7-252)||(50248633-50248878)
chr1 (7-246)||(3579683-3579924)
chr1 (8-247)||(28207132-28207371)
chr1 (7-248)||(31489890-31490129)
chr1 (4-252)||(47451620-47451862)
chr1 (6-246)||(17318867-17319101)
chr1 (4-246)||(17324037-17324277)
chr1 (23-246)||(40133935-40134158)
chr1 (4-246)||(42922206-42922444)
chr1 (4-254)||(14183650-14183895)
chr1 (7-243)||(8347343-8347575)
chr1 (4-246)||(18800640-18800878)
chr1 (99-255)||(16231630-16231786)
chr1 (56-254)||(15669452-15669648)
chr1 (99-243)||(25248622-25248766)
chr1 (9-254)||(8349110-8349352)
chr1 (25-246)||(16432398-16432608)
chr1 (129-255)||(23785936-23786062)
chr1 (4-246)||(49495278-49495508)
chr1 (124-255)||(51757623-51757753)
chr1 (4-254)||(13125516-13125765)
chr1 (117-246)||(16429042-16429171)
chr1 (112-246)||(6115170-6115304)
chr1 (114-248)||(30738695-30738830)
chr1 (173-255)||(23816027-23816109)
chr1 (112-254)||(30790459-30790602)
chr1 (4-220)||(26520206-26520427)
chr1 (4-71)||(25248756-25248823)
chr1 (110-246)||(16561544-16561681)
chr1 (114-254)||(26613298-26613440)
chr1 (32-191)||(27916500-27916653)
chr1 (55-254)||(28279292-28279489)
chr1 (9-72)||(16231578-16231641)
chr1 (114-191)||(155788-155865)
chr1 (114-191)||(2232580-2232658)
chr1 (128-191)||(14997039-14997101)
chr1 (114-191)||(2401342-2401420)
chr1 (114-191)||(4144804-4144882)
chr1 (114-191)||(9526449-9526527)
chr1 (114-191)||(21353467-21353545)
chr1 (114-191)||(25134054-25134132)
chr1 (118-254)||(43104245-43104384)
chr1 (114-191)||(9521698-9521776)
chr1 (32-156)||(26332719-26332836)
chr1 (8-49)||(6115343-6115384)
chr1 (24-156)||(13127790-13127918)
chr1 (114-190)||(2393404-2393481)
chr1 (114-191)||(14353047-14353126)
chr1 (114-189)||(26332613-26332688)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (16-255)||(8631475-8631714)
chr4 (4-255)||(22044447-22044697)
chr4 (9-255)||(22046742-22046987)
chr4 (4-254)||(22802791-22803041)
chr4 (16-252)||(5637524-5637760)
chr4 (4-255)||(11434981-11435231)
chr4 (16-255)||(24348256-24348495)
chr4 (4-255)||(51015272-51015522)
chr4 (4-254)||(22800919-22801169)
chr4 (4-255)||(6764865-6765121)
chr4 (16-255)||(38409243-38409481)
chr4 (4-254)||(40637100-40637350)
chr4 (4-255)||(2484929-2485180)
chr4 (16-255)||(11006293-11006532)
chr4 (16-255)||(7941359-7941600)
chr4 (4-254)||(47868427-47868677)
chr4 (4-252)||(14633346-14633592)
chr4 (4-252)||(48486345-48486593)
chr4 (16-254)||(3824627-3824863)
chr4 (24-255)||(22132448-22132677)
chr4 (9-255)||(44599894-44600140)
chr4 (16-254)||(9148291-9148528)
chr4 (16-255)||(11008624-11008861)
chr4 (16-254)||(37089429-37089666)
chr4 (6-252)||(40091474-40091720)
chr4 (8-252)||(47274757-47275000)
chr4 (9-255)||(18847184-18847430)
chr4 (4-254)||(24888822-24889072)
chr4 (16-255)||(22782794-22783033)
chr4 (16-255)||(31849655-31849894)
chr4 (4-254)||(36921550-36921802)
chr4 (4-255)||(5198446-5198697)
chr4 (16-255)||(22780429-22780668)
chr4 (16-255)||(18709220-18709458)
chr4 (24-255)||(22134673-22134902)
chr4 (4-254)||(36919641-36919894)
chr4 (7-252)||(12395904-12396149)
chr4 (4-251)||(38928237-38928485)
chr4 (9-255)||(9176530-9176776)
chr4 (9-255)||(16934199-16934445)
chr4 (7-252)||(12400866-12401111)
chr4 (5-252)||(24879016-24879264)
chr4 (5-252)||(24880478-24880726)
chr4 (4-252)||(33415547-33415794)
chr4 (9-255)||(16931845-16932091)
chr4 (16-255)||(47210808-47211035)
chr4 (9-255)||(9174202-9174448)
chr4 (8-254)||(36378322-36378569)
chr4 (16-246)||(16453347-16453577)
chr4 (16-255)||(17662301-17662529)
chr4 (6-254)||(37313122-37313371)
chr4 (4-252)||(619506-619754)
chr4 (16-252)||(14787490-14787726)
chr4 (4-248)||(56030470-56030714)
chr4 (7-252)||(19095911-19096157)
chr4 (51-255)||(26086033-26086236)
chr4 (16-252)||(13543997-13544233)
chr4 (4-254)||(19322723-19322970)
chr4 (4-246)||(41997518-41997760)
chr4 (8-254)||(53405157-53405411)
chr4 (8-233)||(52942537-52942748)
chr4 (27-246)||(18409413-18409631)
chr4 (4-204)||(3937316-3937516)
chr4 (4-254)||(18537531-18537778)
chr4 (54-254)||(36380425-36380626)
chr4 (4-254)||(8756308-8756557)
chr4 (7-192)||(6132902-6133086)
chr4 (4-233)||(18534911-18535136)
chr4 (91-246)||(16455354-16455509)
chr4 (7-135)||(38270162-38270290)
chr4 (58-254)||(38890282-38890476)
chr4 (120-246)||(2891433-2891559)
chr4 (61-246)||(27499128-27499310)
chr4 (7-135)||(24446760-24446883)
chr4 (129-252)||(13547305-13547428)
chr4 (4-246)||(15032614-15032843)
chr4 (173-255)||(5635532-5635614)
chr4 (32-254)||(28453742-28453959)
chr4 (155-254)||(4215483-4215582)
chr4 (7-95)||(2891346-2891434)
chr4 (7-114)||(5101026-5101133)
chr4 (172-255)||(11437557-11437639)
chr4 (113-254)||(12102221-12102364)
chr4 (32-244)||(40999017-40999226)
chr4 (66-246)||(30136640-30136817)
chr4 (114-254)||(47150950-47151092)
chr4 (113-254)||(31983584-31983727)
chr4 (114-254)||(16185892-16186035)
chr4 (179-251)||(5101130-5101202)
chr4 (58-246)||(9863791-9863974)
chr4 (117-254)||(3982233-3982374)
chr4 (114-191)||(7050378-7050456)
chr4 (114-191)||(11853532-11853610)
chr4 (114-246)||(25357772-25357909)
chr4 (32-190)||(10112927-10113080)
chr4 (114-191)||(8529250-8529328)
chr4 (114-191)||(16689061-16689139)
chr4 (114-191)||(18586949-18587027)
chr4 (114-191)||(31300407-31300485)
chr4 (114-191)||(55822248-55822326)
chr4 (132-191)||(4556180-4556238)
chr4 (132-191)||(4558314-4558372)
chr4 (128-191)||(5336903-5336965)
chr4 (32-191)||(9022362-9022516)
chr4 (132-191)||(15316961-15317019)
chr4 (198-252)||(24446700-24446754)
chr4 (114-191)||(4570077-4570155)
chr4 (114-191)||(13072102-13072180)
chr4 (114-191)||(15831124-15831202)
chr4 (114-191)||(16489332-16489410)
chr4 (114-191)||(25699732-25699810)
chr4 (58-156)||(10114412-10114505)
chr4 (114-191)||(36771379-36771457)
chr4 (128-167)||(16638826-16638865)
chr4 (132-191)||(47566496-47566554)
chr4 (114-177)||(4884857-4884922)
chr4 (114-167)||(54906722-54906776)
chr4 (59-191)||(36769406-36769540)
chr4 (114-191)||(15312299-15312377)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (4-254)||(14807779-14808029)
chr8 (16-255)||(608774-609013)
chr8 (4-255)||(27827014-27827264)
chr8 (4-255)||(27829325-27829575)
chr8 (9-255)||(44720876-44721122)
chr8 (6-255)||(28251623-28251872)
chr8 (16-255)||(3874050-3874289)
chr8 (16-255)||(15809259-15809497)
chr8 (4-255)||(18810736-18810986)
chr8 (16-255)||(32339349-32339588)
chr8 (8-254)||(15072742-15072989)
chr8 (8-254)||(15068013-15068259)
chr8 (8-252)||(27106956-27107200)
chr8 (4-255)||(4424046-4424297)
chr8 (25-255)||(43079651-43079881)
chr8 (16-254)||(22684710-22684951)
chr8 (7-252)||(30480562-30480807)
chr8 (16-255)||(43082013-43082252)
chr8 (7-252)||(27911046-27911290)
chr8 (7-252)||(27957465-27957709)
chr8 (16-255)||(24873237-24873476)
chr8 (7-252)||(1225197-1225443)
chr8 (7-246)||(14419256-14419495)
chr8 (16-255)||(28283276-28283514)
chr8 (4-255)||(18812921-18813160)
chr8 (4-246)||(13858550-13858791)
chr8 (7-246)||(36865569-36865805)
chr8 (4-220)||(14477304-14477520)
chr8 (14-246)||(5372243-5372474)
chr8 (4-254)||(25952549-25952799)
chr8 (16-255)||(43530168-43530394)
chr8 (7-193)||(33541506-33541692)
chr8 (14-252)||(41384783-41385020)
chr8 (4-252)||(41382701-41382938)
chr8 (66-246)||(15956051-15956227)
chr8 (4-153)||(26775229-26775378)
chr8 (8-167)||(5622882-5623041)
chr8 (4-246)||(21480542-21480772)
chr8 (4-246)||(21482350-21482580)
chr8 (4-246)||(15185780-15186017)
chr8 (7-254)||(3005688-3005931)
chr8 (67-254)||(31162303-31162488)
chr8 (7-135)||(35872559-35872682)
chr8 (99-247)||(181622-181772)
chr8 (7-192)||(37214319-37214514)
chr8 (16-87)||(12517248-12517319)
chr8 (114-254)||(31578334-31578476)
chr8 (4-76)||(3886153-3886225)
chr8 (58-243)||(31573794-31573975)
chr8 (111-254)||(31035252-31035396)
chr8 (32-148)||(31035126-31035238)
chr8 (114-191)||(9021228-9021306)
chr8 (114-191)||(16752643-16752721)
chr8 (114-191)||(16757388-16757466)
chr8 (114-191)||(28327891-28327969)
chr8 (114-191)||(28895485-28895563)
chr8 (8-71)||(181569-181632)
chr8 (6-156)||(2468261-2468403)
chr8 (114-191)||(590777-590855)
chr8 (182-246)||(2468195-2468259)
chr8 (114-191)||(4812608-4812686)
chr8 (114-191)||(28332614-28332692)
chr8 (114-191)||(33032637-33032715)
chr8 (114-191)||(13985199-13985278)
chr8 (114-189)||(29554908-29554984)
chr8 (198-252)||(35872499-35872553)
chr8 (132-191)||(3276347-3276405)
chr8 (114-177)||(17799558-17799623)
chr8 (114-180)||(23179692-23179760)
chr8 (114-191)||(17847661-17847740)
chr8 (114-191)||(21033853-21033930)
chr8 (114-191)||(30423195-30423274)
chr8 (128-191)||(2267144-2267206)
chr8 (214-252)||(33541469-33541507)
chr8 (114-254)||(6376124-6376267)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (16-255)||(38393980-38394219)
chr7 (4-255)||(1049352-1049602)
chr7 (16-272)||(7472016-7472275)
chr7 (16-255)||(1046981-1047219)
chr7 (16-255)||(1849975-1850214)
chr7 (16-255)||(7470078-7470317)
chr7 (16-254)||(48457647-48457885)
chr7 (16-255)||(3878571-3878810)
chr7 (16-255)||(20626032-20626271)
chr7 (16-255)||(20629923-20630162)
chr7 (16-255)||(20642342-20642581)
chr7 (7-254)||(44724564-44724811)
chr7 (4-254)||(35611-35861)
chr7 (4-254)||(27306287-27306536)
chr7 (4-254)||(31435103-31435354)
chr7 (16-255)||(40836799-40837037)
chr7 (25-255)||(40946331-40946561)
chr7 (16-255)||(3035715-3035957)
chr7 (16-255)||(11757222-11757463)
chr7 (16-255)||(20299452-20299693)
chr7 (4-255)||(25542513-25542761)
chr7 (4-254)||(44546-44796)
chr7 (16-255)||(18345535-18345774)
chr7 (16-252)||(28487547-28487783)
chr7 (7-254)||(11355243-11355490)
chr7 (9-255)||(31155967-31156213)
chr7 (4-246)||(20137174-20137416)
chr7 (7-252)||(21680012-21680257)
chr7 (16-255)||(7351708-7351947)
chr7 (16-255)||(20297356-20297595)
chr7 (7-252)||(4295993-4296239)
chr7 (7-252)||(21592202-21592447)
chr7 (16-249)||(28485560-28485793)
chr7 (4-252)||(443577-443825)
chr7 (16-255)||(7349329-7349568)
chr7 (7-246)||(24748579-24748818)
chr7 (8-252)||(42331056-42331302)
chr7 (7-252)||(21678051-21678296)
chr7 (4-254)||(37412182-37412435)
chr7 (26-255)||(43253573-43253801)
chr7 (4-254)||(25276123-25276374)
chr7 (5-215)||(26804552-26804765)
chr7 (7-246)||(39146052-39146291)
chr7 (4-246)||(24258445-24258687)
chr7 (6-246)||(13099540-13099781)
chr7 (4-252)||(42223138-42223388)
chr7 (4-254)||(21990133-21990382)
chr7 (16-252)||(9679053-9679289)
chr7 (16-252)||(9680813-9681050)
chr7 (28-246)||(27832698-27832916)
chr7 (5-243)||(22828701-22828939)
chr7 (4-254)||(22251602-22251849)
chr7 (7-254)||(24817410-24817652)
chr7 (4-254)||(7188525-7188772)
chr7 (100-255)||(38396713-38396867)
chr7 (92-252)||(7092271-7092431)
chr7 (4-140)||(18567595-18567731)
chr7 (4-247)||(20091609-20091848)
chr7 (92-252)||(7094519-7094678)
chr7 (51-254)||(24813555-24813755)
chr7 (129-255)||(2935375-2935501)
chr7 (7-246)||(24465534-24465760)
chr7 (129-255)||(1606487-1606612)
chr7 (129-255)||(9027250-9027375)
chr7 (129-255)||(22137185-22137310)
chr7 (129-255)||(40552212-40552337)
chr7 (4-167)||(22392455-22392606)
chr7 (129-255)||(22108174-22108299)
chr7 (129-255)||(40549934-40550059)
chr7 (173-246)||(6348933-6349006)
chr7 (114-254)||(6332311-6332453)
chr7 (176-246)||(22393876-22393946)
chr7 (173-246)||(26295598-26295671)
chr7 (114-190)||(16297146-16297222)
chr7 (25-83)||(38396319-38396377)
chr7 (113-191)||(2120881-2120960)
chr7 (114-191)||(3320171-3320249)
chr7 (114-191)||(3324919-3324997)
chr7 (114-191)||(7069763-7069841)
chr7 (114-191)||(7074770-7074848)
chr7 (114-191)||(25351336-25351414)
chr7 (114-191)||(25357030-25357108)
chr7 (114-191)||(25405376-25405454)
chr7 (114-191)||(25410113-25410191)
chr7 (114-191)||(42006646-42006724)
chr7 (32-244)||(11081522-11081731)
chr7 (114-191)||(8378625-8378703)
chr7 (114-191)||(15541116-15541194)
chr7 (114-191)||(30246953-30247031)
chr7 (114-191)||(44512646-44512724)
chr7 (32-191)||(6048885-6049039)
chr7 (117-222)||(40281466-40281572)
chr7 (114-180)||(44143997-44144065)
chr7 (16-71)||(7094662-7094717)
chr7 (132-191)||(34546984-34547042)
chr7 (114-191)||(11084467-11084544)
chr7 (92-167)||(12310160-12310234)
chr7 (114-191)||(21369625-21369703)
chr7 (31-191)||(26210555-26210710)
chr7 (170-254)||(6046641-6046726)
chr7 (7-107)||(6348804-6348903)
chr7 (113-156)||(2990786-2990830)
chr7 (4-44)||(3677262-3677301)
chr7 (16-71)||(7092414-7092470)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (16-255)||(4816287-4816526)
chr6 (4-252)||(28241380-28241628)
chr6 (9-254)||(1230306-1230551)
chr6 (4-255)||(11983085-11983336)
chr6 (4-255)||(14458823-14459072)
chr6 (4-252)||(14507235-14507482)
chr6 (16-255)||(30967220-30967459)
chr6 (16-255)||(30034659-30034898)
chr6 (7-246)||(13057204-13057443)
chr6 (4-252)||(9019933-9020181)
chr6 (16-255)||(20915412-20915651)
chr6 (8-246)||(3390390-3390628)
chr6 (16-255)||(19704623-19704864)
chr6 (9-255)||(12195571-12195817)
chr6 (7-241)||(25477284-25477518)
chr6 (8-252)||(15532740-15532984)
chr6 (4-254)||(15530180-15530429)
chr6 (16-255)||(26065005-26065240)
chr6 (16-255)||(26084974-26085209)
chr6 (8-252)||(15541199-15541443)
chr6 (7-246)||(3632003-3632242)
chr6 (24-255)||(2628942-2629172)
chr6 (7-246)||(13039764-13040003)
chr6 (14-252)||(3629923-3630161)
chr6 (6-244)||(32280006-32280243)
chr6 (4-254)||(30728881-30729135)
chr6 (4-204)||(19227515-19227715)
chr6 (16-255)||(26932618-26932857)
chr6 (7-252)||(3233789-3234035)
chr6 (7-251)||(12161617-12161858)
chr6 (7-246)||(24338512-24338752)
chr6 (7-246)||(22490649-22490889)
chr6 (8-246)||(15719665-15719891)
chr6 (6-254)||(3027910-3028155)
chr6 (96-255)||(5273272-5273431)
chr6 (4-121)||(1072067-1072184)
chr6 (32-254)||(16455482-16455701)
chr6 (117-246)||(1069784-1069913)
chr6 (4-124)||(32447502-32447623)
chr6 (74-246)||(14466399-14466572)
chr6 (5-244)||(17012052-17012287)
chr6 (129-255)||(26066180-26066306)
chr6 (129-255)||(33308989-33309114)
chr6 (129-255)||(33311258-33311383)
chr6 (4-125)||(13870608-13870728)
chr6 (129-255)||(29754765-29754891)
chr6 (4-105)||(17852549-17852650)
chr6 (4-96)||(8995486-8995578)
chr6 (113-254)||(12186128-12186271)
chr6 (63-252)||(15367101-15367286)
chr6 (129-255)||(26068451-26068577)
chr6 (112-246)||(26945258-26945393)
chr6 (32-254)||(19696479-19696698)
chr6 (115-247)||(28037794-28037927)
chr6 (114-191)||(13878710-13878788)
chr6 (114-191)||(13883458-13883536)
chr6 (114-191)||(16785902-16785980)
chr6 (114-191)||(26887345-26887423)
chr6 (114-191)||(31248835-31248913)
chr6 (114-191)||(35201447-35201525)
chr6 (114-254)||(20526922-20527063)
chr6 (114-191)||(3577636-3577713)
chr6 (31-88)||(10584155-10584212)
chr6 (114-246)||(25078623-25078755)
chr6 (7-142)||(15346401-15346524)
chr6 (172-252)||(15346522-15346602)
chr6 (114-191)||(17036038-17036116)
chr6 (114-191)||(17694972-17695050)
chr6 (137-191)||(12166267-12166320)
chr6 (114-189)||(11138423-11138499)
chr6 (132-191)||(22351973-22352031)
chr6 (58-191)||(22858075-22858203)
chr6 (137-191)||(25941652-25941704)
chr6 (132-191)||(26643179-26643237)
chr6 (132-191)||(26749145-26749203)
chr6 (173-254)||(30445699-30445782)
chr6 (114-189)||(19701985-19702061)
chr6 (114-191)||(13467585-13467662)
chr6 (128-191)||(5165936-5165999)
chr6 (114-191)||(33215810-33215888)
chr6 (132-191)||(22342922-22342980)
chr6 (7-48)||(12186330-12186372)
chr6 (196-255)||(28078251-28078310)
[»] chr5 (97 HSPs)
chr5 (4-255)||(4236601-4236852)
chr5 (4-255)||(38882077-38882328)
chr5 (4-255)||(2174891-2175141)
chr5 (4-254)||(25921530-25921780)
chr5 (9-255)||(16776135-16776380)
chr5 (4-252)||(21947999-21948246)
chr5 (4-255)||(39854456-39854706)
chr5 (16-254)||(18468995-18469233)
chr5 (4-252)||(10529158-10529406)
chr5 (16-255)||(6745053-6745291)
chr5 (9-255)||(31545057-31545303)
chr5 (16-254)||(18466668-18466906)
chr5 (16-254)||(25804009-25804247)
chr5 (4-252)||(2818394-2818643)
chr5 (9-255)||(31542712-31542957)
chr5 (4-254)||(40221494-40221745)
chr5 (16-254)||(27912520-27912758)
chr5 (16-255)||(34477109-34477349)
chr5 (9-255)||(31179427-31179673)
chr5 (4-254)||(26097705-26097954)
chr5 (16-255)||(34479474-34479714)
chr5 (16-252)||(18511271-18511507)
chr5 (16-255)||(21684508-21684746)
chr5 (16-254)||(27910435-27910672)
chr5 (16-255)||(15552229-15552468)
chr5 (4-252)||(36402387-36402635)
chr5 (16-255)||(6747290-6747527)
chr5 (8-252)||(18509377-18509622)
chr5 (7-252)||(25904078-25904323)
chr5 (4-254)||(18596619-18596868)
chr5 (4-254)||(34530722-34530973)
chr5 (54-252)||(658412-658610)
chr5 (16-246)||(16092265-16092495)
chr5 (7-252)||(10474382-10474627)
chr5 (16-243)||(1189677-1189904)
chr5 (7-246)||(17072858-17073097)
chr5 (7-239)||(39398065-39398296)
chr5 (7-246)||(31472678-31472917)
chr5 (8-246)||(6756470-6756706)
chr5 (8-250)||(31466040-31466281)
chr5 (7-252)||(24126831-24127076)
chr5 (7-252)||(37705839-37706084)
chr5 (7-254)||(17818547-17818793)
chr5 (7-252)||(2954391-2954636)
chr5 (7-246)||(695864-696091)
chr5 (4-244)||(12555990-12556230)
chr5 (9-190)||(20043027-20043208)
chr5 (4-192)||(20044982-20045170)
chr5 (99-255)||(4410090-4410245)
chr5 (8-255)||(10586815-10587054)
chr5 (4-243)||(6661254-6661489)
chr5 (111-252)||(20505900-20506041)
chr5 (4-159)||(26098403-26098558)
chr5 (4-252)||(21288736-21288981)
chr5 (99-252)||(41585803-41585956)
chr5 (108-255)||(39798123-39798270)
chr5 (129-255)||(10749797-10749923)
chr5 (56-255)||(9020246-9020442)
chr5 (4-108)||(20507665-20507769)
chr5 (129-255)||(3373193-3373319)
chr5 (129-255)||(10757274-10757399)
chr5 (129-255)||(23665141-23665266)
chr5 (129-255)||(23793321-23793446)
chr5 (19-246)||(20053834-20054049)
chr5 (129-255)||(15354631-15354756)
chr5 (129-255)||(15356907-15357032)
chr5 (129-255)||(38960188-38960313)
chr5 (94-252)||(2723964-2724113)
chr5 (32-254)||(17413223-17413441)
chr5 (114-254)||(15143547-15143689)
chr5 (113-246)||(36208656-36208790)
chr5 (137-255)||(23741915-23742032)
chr5 (173-247)||(42770951-42771025)
chr5 (16-72)||(4410045-4410101)
chr5 (132-246)||(4897828-4897943)
chr5 (32-191)||(4754159-4754312)
chr5 (114-191)||(1170794-1170872)
chr5 (114-191)||(35385573-35385651)
chr5 (114-191)||(2298122-2298200)
chr5 (114-191)||(25452478-25452556)
chr5 (4-71)||(41585946-41586013)
chr5 (137-191)||(25445504-25445557)
chr5 (114-191)||(1240411-1240489)
chr5 (16-156)||(2144720-2144856)
chr5 (114-191)||(28786387-28786465)
chr5 (114-191)||(31782578-31782656)
chr5 (5-190)||(42770746-42770924)
chr5 (128-254)||(15445323-15445454)
chr5 (114-190)||(16093413-16093489)
chr5 (114-167)||(10627347-10627402)
chr5 (114-191)||(17841370-17841448)
chr5 (114-191)||(22672817-22672895)
chr5 (132-191)||(11962554-11962612)
chr5 (32-186)||(29748352-29748502)
chr5 (4-48)||(36208552-36208597)
chr5 (114-167)||(26406617-26406672)
chr5 (137-189)||(40222771-40222822)
[»] chr3 (137 HSPs)
chr3 (4-255)||(43228243-43228494)
chr3 (4-254)||(4308336-4308586)
chr3 (4-249)||(22114365-22114610)
chr3 (16-255)||(38890004-38890243)
chr3 (9-255)||(5191610-5191855)
chr3 (4-254)||(11170356-11170606)
chr3 (16-255)||(4103950-4104188)
chr3 (4-254)||(18099225-18099476)
chr3 (4-255)||(43226038-43226288)
chr3 (4-272)||(3859480-3859750)
chr3 (16-255)||(25533406-25533645)
chr3 (16-254)||(30005805-30006043)
chr3 (16-255)||(10084443-10084682)
chr3 (16-254)||(18096955-18097193)
chr3 (4-254)||(51727062-51727311)
chr3 (16-248)||(42990268-42990500)
chr3 (6-254)||(45882893-45883141)
chr3 (4-254)||(10956082-10956332)
chr3 (16-255)||(746721-746960)
chr3 (9-272)||(6065830-6066097)
chr3 (4-254)||(28102057-28102307)
chr3 (16-254)||(29956650-29956888)
chr3 (7-252)||(1626740-1626985)
chr3 (7-252)||(43423520-43423765)
chr3 (4-254)||(10958378-10958628)
chr3 (16-254)||(27101236-27101474)
chr3 (16-255)||(455871-456110)
chr3 (16-255)||(458248-458487)
chr3 (4-252)||(1313362-1313609)
chr3 (16-255)||(10621584-10621823)
chr3 (28-255)||(25388882-25389108)
chr3 (16-255)||(50493963-50494202)
chr3 (56-255)||(1321483-1321682)
chr3 (16-255)||(6063500-6063739)
chr3 (4-254)||(6561762-6562014)
chr3 (8-252)||(53917721-53917965)
chr3 (16-255)||(9604661-9604899)
chr3 (16-255)||(10191364-10191602)
chr3 (4-254)||(26720500-26720749)
chr3 (4-252)||(24979659-24979908)
chr3 (7-252)||(43421472-43421717)
chr3 (16-255)||(38210334-38210573)
chr3 (7-249)||(5926824-5927066)
chr3 (10-254)||(32264092-32264338)
chr3 (9-217)||(35777378-35777587)
chr3 (7-246)||(3314639-3314878)
chr3 (42-255)||(28413086-28413299)
chr3 (4-255)||(5522681-5522920)
chr3 (5-252)||(18162618-18162864)
chr3 (16-252)||(47148952-47149188)
chr3 (13-254)||(35917998-35918245)
chr3 (7-247)||(39715425-39715664)
chr3 (4-252)||(51943323-51943570)
chr3 (4-252)||(53915553-53915801)
chr3 (7-251)||(880509-880754)
chr3 (4-204)||(28100146-28100346)
chr3 (7-254)||(36011782-36012029)
chr3 (4-246)||(28761492-28761733)
chr3 (7-246)||(53468519-53468757)
chr3 (74-255)||(7606642-7606822)
chr3 (6-251)||(48361729-48361973)
chr3 (4-252)||(12268032-12268271)
chr3 (7-252)||(889830-890073)
chr3 (4-254)||(15780812-15781078)
chr3 (7-249)||(51674826-51675057)
chr3 (8-252)||(32219051-32219285)
chr3 (4-251)||(54691632-54691878)
chr3 (7-243)||(31151303-31151534)
chr3 (16-272)||(42992250-42992493)
chr3 (7-254)||(54884112-54884357)
chr3 (103-252)||(25688217-25688367)
chr3 (7-204)||(28180979-28181174)
chr3 (1-252)||(53591144-53591384)
chr3 (65-252)||(6484372-6484560)
chr3 (116-254)||(11168165-11168303)
chr3 (59-243)||(13420252-13420432)
chr3 (4-229)||(23636979-23637200)
chr3 (4-120)||(11163102-11163218)
chr3 (4-192)||(28137423-28137600)
chr3 (4-254)||(53597193-53597439)
chr3 (17-144)||(41849117-41849244)
chr3 (4-246)||(23633412-23633647)
chr3 (59-246)||(25635391-25635575)
chr3 (113-255)||(5886261-5886401)
chr3 (113-255)||(5899734-5899874)
chr3 (100-246)||(6231849-6231994)
chr3 (73-246)||(4666535-4666710)
chr3 (7-246)||(17795225-17795452)
chr3 (7-246)||(19103665-19103892)
chr3 (25-254)||(561831-562056)
chr3 (25-254)||(36871356-36871582)
chr3 (4-106)||(27635830-27635932)
chr3 (52-240)||(1673975-1674160)
chr3 (7-106)||(47701798-47701897)
chr3 (6-161)||(24177233-24177385)
chr3 (14-105)||(6231411-6231502)
chr3 (96-246)||(4560355-4560497)
chr3 (130-246)||(3306839-3306955)
chr3 (179-252)||(47701728-47701801)
chr3 (7-95)||(3306754-3306842)
chr3 (170-254)||(24181498-24181583)
chr3 (175-252)||(27635715-27635792)
chr3 (114-247)||(14634504-14634638)
chr3 (114-191)||(1620580-1620657)
chr3 (114-191)||(10094195-10094273)
chr3 (114-191)||(10201075-10201153)
chr3 (114-191)||(16462186-16462264)
chr3 (114-191)||(22626105-22626183)
chr3 (114-191)||(47883003-47883081)
chr3 (59-156)||(25633930-25634024)
chr3 (114-191)||(10100212-10100290)
chr3 (114-191)||(10208121-10208199)
chr3 (114-191)||(29914074-29914152)
chr3 (114-191)||(47878292-47878370)
chr3 (114-191)||(54193209-54193287)
chr3 (128-191)||(4535613-4535675)
chr3 (51-156)||(13419883-13419983)
chr3 (114-177)||(6303293-6303358)
chr3 (4-48)||(1321393-1321437)
chr3 (114-154)||(7768632-7768672)
chr3 (114-191)||(10896988-10897066)
chr3 (114-191)||(20031439-20031517)
chr3 (114-191)||(54188492-54188570)
chr3 (6-65)||(4560509-4560568)
chr3 (195-246)||(25634030-25634081)
chr3 (132-191)||(27762107-27762165)
chr3 (114-189)||(38002852-38002928)
chr3 (114-191)||(5858529-5858605)
chr3 (114-191)||(10612899-10612977)
chr3 (114-191)||(27544256-27544334)
chr3 (92-154)||(31021300-31021361)
chr3 (132-191)||(10595155-10595213)
chr3 (114-191)||(11066652-11066731)
chr3 (128-191)||(11079516-11079578)
chr3 (128-191)||(16996874-16996936)
chr3 (137-191)||(10949381-10949434)
chr3 (141-191)||(11007633-11007683)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-252)||(41542-41790)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (4-255)||(2861-3111)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (4-255)||(19504402-19504652)
chr2 (4-255)||(19502067-19502318)
chr2 (4-255)||(45280040-45280292)
chr2 (4-255)||(27104747-27104996)
chr2 (16-255)||(23452293-23452532)
chr2 (4-255)||(42064463-42064713)
chr2 (4-272)||(13910081-13910351)
chr2 (4-255)||(42452731-42452980)
chr2 (16-252)||(21520752-21520988)
chr2 (4-246)||(40032119-40032365)
chr2 (4-272)||(24162259-24162519)
chr2 (6-252)||(19007590-19007836)
chr2 (16-255)||(35215642-35215881)
chr2 (16-255)||(35218019-35218258)
chr2 (16-252)||(42923568-42923804)
chr2 (4-252)||(28196585-28196833)
chr2 (6-252)||(22287395-22287641)
chr2 (4-254)||(43623637-43623875)
chr2 (8-243)||(6258885-6259118)
chr2 (7-254)||(34979635-34979883)
chr2 (7-246)||(17849068-17849307)
chr2 (4-246)||(31732842-31733072)
chr2 (7-254)||(11739616-11739864)
chr2 (7-233)||(15539553-15539779)
chr2 (8-246)||(6264214-6264448)
chr2 (14-252)||(17848401-17848636)
chr2 (16-252)||(45239036-45239271)
chr2 (4-246)||(3022111-3022352)
chr2 (7-246)||(14837224-14837457)
chr2 (14-246)||(11578174-11578401)
chr2 (9-246)||(44289133-44289370)
chr2 (106-254)||(5375403-5375550)
chr2 (7-153)||(22163106-22163251)
chr2 (16-213)||(38020162-38020349)
chr2 (7-246)||(18800379-18800606)
chr2 (16-246)||(22874102-22874320)
chr2 (4-127)||(22407593-22407716)
chr2 (66-246)||(28459255-28459435)
chr2 (32-254)||(20146665-20146884)
chr2 (33-246)||(17897311-17897519)
chr2 (129-255)||(36558920-36559046)
chr2 (129-255)||(36561197-36561323)
chr2 (129-252)||(45332240-45332363)
chr2 (16-109)||(5377631-5377724)
chr2 (112-254)||(40699429-40699573)
chr2 (66-241)||(27136195-27136368)
chr2 (128-246)||(20589762-20589881)
chr2 (170-252)||(22407513-22407595)
chr2 (1-246)||(37963007-37963237)
chr2 (51-254)||(35107294-35107493)
chr2 (182-255)||(7463004-7463077)
chr2 (32-246)||(43139356-43139564)
chr2 (99-198)||(38414194-38414291)
chr2 (194-252)||(22707812-22707870)
chr2 (113-246)||(15693958-15694094)
chr2 (114-191)||(17462419-17462497)
chr2 (114-191)||(20054886-20054964)
chr2 (114-191)||(22712637-22712715)
chr2 (114-191)||(22717346-22717424)
chr2 (114-191)||(39686966-39687044)
chr2 (114-191)||(45567392-45567470)
chr2 (128-191)||(2736204-2736266)
chr2 (114-191)||(17921754-17921833)
chr2 (114-191)||(17932617-17932695)
chr2 (114-191)||(17943520-17943598)
chr2 (114-191)||(27517760-27517838)
chr2 (115-167)||(27583483-27583535)
chr2 (128-191)||(2740940-2741002)
chr2 (132-191)||(12781342-12781400)
chr2 (7-70)||(38020094-38020157)
chr2 (196-252)||(23870956-23871012)
chr2 (114-191)||(28458949-28459028)
chr2 (114-191)||(39680028-39680106)
chr2 (132-191)||(37170873-37170931)
chr2 (114-177)||(38190980-38191045)
chr2 (113-189)||(26345661-26345738)
chr2 (114-191)||(30478977-30479055)
chr2 (114-177)||(20050156-20050221)
chr2 (222-252)||(22163081-22163111)
chr2 (4-47)||(12342673-12342717)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (16-255)||(69348-69586)
scaffold0025 (16-131)||(73203-73318)
scaffold0025 (90-135)||(73163-73208)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (4-254)||(79166-79416)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (4-252)||(183700-183946)
scaffold0005 (16-252)||(52004-52240)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (9-255)||(6185-6431)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (8-252)||(3982-4225)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (16-254)||(14439-14677)
scaffold0131 (4-254)||(15000-15250)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (25-252)||(2044-2270)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (4-255)||(11529-11780)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (16-255)||(29164-29402)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (16-255)||(34-273)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-252)||(79843-80088)
scaffold0004 (114-191)||(188363-188441)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (28-203)||(35644-35819)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (90-255)||(1509-1673)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (6-254)||(85214-85462)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (4-246)||(15887-16125)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (4-246)||(16716-16954)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (7-254)||(1699-1935)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (4-144)||(993-1138)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (129-255)||(22222-22347)
scaffold0140 (129-255)||(24497-24622)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (114-254)||(4901-5043)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (114-191)||(224802-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (114-191)||(16308-16386)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (128-243)||(57497-57614)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (132-191)||(17107-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 103)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 51750011 - 51750262
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750011 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 51750110  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51750111 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 51750210  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750211 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 51750262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21948484 - 21948247
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21948484 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 21948385  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21948384 gattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 21948286  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948285 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 21948247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 2617488 - 2617739
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2617488 agagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 2617587  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2617588 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttat 2617687  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617688 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 2617739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31735819 - 31735579
Alignment:
Q  15 tgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 114  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735819 tgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 31735720  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  31735719 tgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 31735620  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31735619 attgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 31735579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 28840664 - 28840902
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840664 gagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 28840763  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28840764 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28840863  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840864 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 28840902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 28842479 - 28842716
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842479 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 28842578  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28842579 gattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28842678  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842679 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 28842716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 15823520 - 15823768
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15823520 agtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 15823619  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15823620 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 15823719  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15823720 ttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtgga 15823768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38925787 - 38925544
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38925787 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 38925688  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38925687 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttat 38925588  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38925587 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 38925544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 46431995 - 46431766
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431995 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 46431896  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttct 224  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46431895 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 46431796  T
Q  225 cttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46431795 c-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 46431766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 24325648 - 24325906
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24325648 gagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 24325846  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  24325847 ttgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccc 24325906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 20302431 - 20302681
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302431 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 20302530  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20302531 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttat 20302630  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20302631 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggat 20302681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 13761809 - 13762058
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13761809 agagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 13761908  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13761909 ggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttat 13762008  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762009 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 13762058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 6822987 - 6823237
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6822987 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actag 6823085  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6823086 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttat 6823185  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823186 tcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 6823237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10400125 - 10399886
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  10400125 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggtt 10400026  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10400025 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 10399926  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399925 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 10399886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294895
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 15294895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 16226144 - 16226390
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16226144 aaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggttt 16226243  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16226244 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16226343  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16226344 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 16226390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27337235 - 27336998
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337036 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 27336998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 39932057 - 39932295
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39932057 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 39932156  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  39932157 gattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 39932256  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39932257 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 39932295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Original strand, 48665170 - 48665400
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48665170 ggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 48665269  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta-ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48665270 tgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 48665369  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665370 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12302802 - 12302566
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  12302802 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggtt 12302703  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  12302702 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactca 12302603  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302602 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 12302566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 47906254 - 47906490
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  47906254 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 47906353  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47906354 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47906453  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906454 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 47906490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27339427 - 27339189
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27339427 gagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27339328  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27339327 gattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaaccca 27339228  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339227 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 27339189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 13215053 - 13215308
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13215053 agagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 13215152  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13215153 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 13215252  T
Q  204 tattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  13215253 tcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtgga 13215308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 41646892 - 41647140
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41646892 agagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttg 41646991  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41646992 gtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttat 41647091  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647092 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 41647140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177585
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggat-tgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47177546 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 47177585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47179936
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47179897 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 47179936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 20291429 - 20291679
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20291429 agagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaa 20291528  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20291529 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttat 20291628  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20291629 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggat 20291679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 16428638 - 16428867
Alignment:
Q  17 agatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16428638 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttg 16428737  T
Q  117 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16428738 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 16428837  T
Q  217 tgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16428838 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat 16428867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9463541 - 9463302
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  9463541 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9463442  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9463441 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9463342  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463341 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 9463302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17324945 - 17324697
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17324945 agagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactag 17324846  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324845 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 17324746  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324745 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 17324697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50307854 - 50307607
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagg 104  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50307854 agtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg 50307755  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50307754 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttatt 50307655  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307654 cttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 50307607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9459714 - 9459475
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  9459714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9459615  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9459614 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9459515  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9459514 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 9459475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 39462491 - 39462739
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39462491 agagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 39462590  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39462591 gtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattat 39462690  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  39462691 tcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtg 39462739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50076978 - 50076730
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50076978 gtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 50076879  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  50076878 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattct 50076779  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50076778 tgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 50076730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50079127 - 50078879
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50079127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 50079028  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  50079027 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattct 50078928  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  50078927 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgga 50078879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 18307084 - 18307323
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18307084 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggt 18307183  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  18307184 ttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattct 18307283  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18307284 tgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18307323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 51752337 - 51752586
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752337 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 51752436  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752437 gttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 51752535  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51752536 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggat 51752586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2510621 - 2510386
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2510621 gagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 2510522  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2510521 gattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca-gagacttattcttgtaaccca 2510423  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2510422 ttgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtg 2510386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 18839570 - 18839801
Alignment:
Q  15 tgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  18839570 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggt 18839669  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18839670 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 18839769  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18839770 attgatatctcttttgtaaggttactcatcat 18839801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14098275 - 14098030
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14098275 taaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtt 14098176  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  14098175 tgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattctt 14098076  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098075 gtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtg 14098030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6996009 - 6995761
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6996009 agagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 6995910  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  6995909 ggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttt 6995810  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6995809 tcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtg 6995761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28998562 - 28998318
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  28998562 agagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactag 28998463  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28998462 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 28998363  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    | ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28998362 tcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatat 28998318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29004278 - 29004034
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  29004278 agagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactag 29004179  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29004178 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 29004079  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    | ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29004078 tcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatat 29004034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131434
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccca 4131478  T
Q  216 ttga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4131477 ttgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 4131434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17186437 - 17186195
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17186437 agagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactag 17186338  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17186337 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttat 17186238  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  17186237 tcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcat 17186195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31425325 - 31425082
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  31425325 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactaggg 31425226  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgag---tctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31425225 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggctta 31425126  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31425125 ttcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 31425082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9241395 - 9241144
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9241395 agagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacta 9241297  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  9241296 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagactta 9241197  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9241196 ttcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 9241144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25251584 - 25251342
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25251584 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactag 25251485  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  25251484 ggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttat 25251385  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  25251384 tcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcat 25251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 6823856 - 6824091
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823856 agagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 6823955  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt-------ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||       |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |     
T  6823956 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggc 6824055  T
Q  196 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6824056 agacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11457781 - 11457536
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  ||||||||    
T  11457781 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggt 11457682  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11457681 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattct 11457582  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11457581 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 11457536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31423180 - 31422940
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaac-aaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  31423180 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactaggg 31423081  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    ||||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31423080 tttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 31422981  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31422980 ttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2949535 - 2949292
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2949535 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggtt 2949436  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  2949435 gatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttg 2949336  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949335 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 2949292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128086
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcat 25128086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 6756502 - 6756740
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6756502 gtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 6756601  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6756602 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 6756699  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6756700 ttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 6756740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50248878 - 50248633
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50248878 gtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 50248779  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  50248778 ttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattct 50248679  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50248678 tgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 50248633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3579924 - 3579683
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaagggg--ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3579924 gtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 3579825  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3579824 gtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttatt 3579725  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3579724 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 3579683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28207371 - 28207132
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28207371 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 28207272  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||  || ||||| || |||||||| || ||    
T  28207271 tgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttctt 28207172  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28207171 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 28207132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Original strand, 31489890 - 31490129
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31489890 gtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggt 31489987  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  31489988 ttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattct 31490087  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  31490088 tgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatat 31490129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 47451620 - 47451862
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47451620 agagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 47451719  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg-ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    |||||| |||||||||||| ||       | || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||     
T  47451720 ggtttgagggttgattcacatt-------agtgtttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaacttt 47451812  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451813 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 47451862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Original strand, 17318867 - 17319101
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17318867 agtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 17318966  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  17318967 ttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattc 17319060  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  17319061 ttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcat 17319101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 17324037 - 17324277
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17324037 agagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 17324134  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17324135 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttat 17324234  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  17324235 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcat 17324277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 40133935 - 40134158
Alignment:
Q  23 aaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40133935 aaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcac 40134034  T
Q  123 cttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgattt 222  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||||  || |  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  40134035 cttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatat 40134134  T
Q  223 ctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  40134135 ctcttttgtaaagttactcatcat 40134158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 42922206 - 42922444
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  42922206 agagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactag 42922303  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||    |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42922304 ggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttat 42922401  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42922402 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42922444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14183895 - 14183650
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  14183895 agagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-tgcaacac--aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactag 14183800  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  | | | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14183799 ggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttat 14183702  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14183701 tcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 14183650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8347575 - 8347343
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||    
T  8347575 gtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggt 8347478  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    | |  |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  8347477 tag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattct 8347380  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8347379 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 8347343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18800878 - 18800640
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||    
T  18800878 agagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaagt-caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactag 18800781  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||| |  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18800780 ggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttat 18800683  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18800682 tcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18800640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 255
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231786
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  198 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 16231786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669452
Alignment:
Q  56 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 155  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  156 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248622
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  199 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcat 25248622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8349352 - 8349110
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  8349352 aaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg 8349255  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| || |||||||  | ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||    
T  8349254 g--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttg 8349157  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  8349156 taactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtgga 8349110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 16432398 - 16432608
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16432398 ggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcacct 16432486  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttct 224  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||  |||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  16432487 tgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatct 16432586  T
Q  225 cttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16432587 cttttgtaatgttactcatcat 16432608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786062
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 23786034  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23786062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49495508 - 49495278
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||     
T  49495508 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactat 49495418  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||   | ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| ||||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  49495417 ggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcat 49495321  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49495320 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 49495278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 255
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757753
Alignment:
Q  124 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcaccatatagtggat 51757753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13125765 - 13125516
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  13125765 agagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacacta 13125668  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagactt 201  Q
    |||||    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||    
T  13125667 gggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactt 13125570  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13125569 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 13125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 246
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429171
Alignment:
Q  117 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccat 216  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  217 tgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat 16429171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115170
Alignment:
Q  112 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  212 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6115170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816109
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggat 23816109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790459
Alignment:
Q  112 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattattgta 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 30790459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26520427 - 26520206
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaagggg-ctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  26520427 agagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacact 26520330  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttg------gttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cag 194  Q
    | | ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || || |||||||  ||||||||||||||||||||||   |    
T  26520329 aagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttg 26520232  T
Q  195 gagacttattattgtaacccattgat 220  Q
    || ||||||| |||||||||||||||    
T  26520231 gaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25248823 - 25248756
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 71  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248823 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561681
Alignment:
Q  110 tgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattg 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || | || ||  || |||||||||||||| ||||   || |||||||| |||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613298
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtgga 26613298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916653
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  27916500 aaacaagggtttagaagc-cagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 254
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279489
Alignment:
Q  55 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  154 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagt 251  Q
    ||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 16231578 - 16231641
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgt 72  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16231578 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232658
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997101
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401342
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144804
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526527
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353467
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaac--actgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 21353467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104384
Alignment:
Q  118 ttcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggaga-cttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||||||   | |||  || || |||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 43104384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521776
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115343
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaat 49  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat 6115343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13127918 - 13127790
Alignment:
Q  24 aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||||  || || | |||||||||||||||| |  | | ||||||||    
T  13127918 aggggttgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagtttc-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcacc 13127823  T
Q  124 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    |||| ||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  13127822 ttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393404
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631475
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631514 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 8631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22044697 - 22044447
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044697 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 22044598  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22044597 ggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 22044498  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044497 ttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 22044447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22046987 - 22046742
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22046987 aaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggttt 22046888  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22046887 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 22046788  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046787 taacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 22046742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22803041 - 22802791
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22803041 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattag 22802942  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22802941 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 22802842  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22802841 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgga 22802791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5637760 - 5637524
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  5637760 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 5637661  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5637660 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 5637561  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637560 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 11434981 - 11435231
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434981 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 11435080  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11435081 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttat 11435180  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435181 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 11435231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 24348256 - 24348495
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24348256 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggtt 24348355  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24348356 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaaccca 24348455  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348456 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 24348495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 51015272 - 51015522
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51015272 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactag 51015371  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51015372 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 51015471  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51015472 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 51015522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22801169 - 22800919
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22801169 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 22801070  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22801069 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 22800970  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800969 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 22800919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 6764865 - 6765121
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc-----ggaacaaac 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  6764865 agagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaac 6764964  T
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 198  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6764965 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggaga 6765064  T
Q  199 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765065 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 6765121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 38409243 - 38409481
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409243 gagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38409342  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38409343 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaaccca 38409442  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38409443 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 38409481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 40637100 - 40637350
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40637100 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 40637199  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40637200 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 40637299  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637300 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 40637350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2485180 - 2484929
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485180 agagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 2485081  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2485080 gggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagactta 2484981  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484980 ttcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 2484929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006293
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11006332 attgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggat 11006293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 7941359 - 7941600
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtggg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||    
T  7941359 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtggg 7941458  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7941558  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7941559 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 7941600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 47868427 - 47868677
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47868427 agagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactag 47868526  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47868527 gttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 47868626  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47868627 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 47868677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 14633346 - 14633592
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633346 agagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 14633444  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14633445 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 14633543  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14633544 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 14633592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 48486345 - 48486593
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48486345 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactag 48486444  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48486445 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 48486544  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486545 tcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 48486593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824627
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824665 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22132677 - 22132448
Alignment:
Q  24 aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132677 aggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 22132579  T
Q  124 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22132578 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 22132479  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132478 tc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 22132448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44600140 - 44599894
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600140 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 44600041  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44600040 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 44599941  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44599940 gtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 44599894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 9148291 - 9148528
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9148291 gagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 9148390  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9148391 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9148490  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148491 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 9148528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008624
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11008661 attgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggat 11008624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37089666 - 37089429
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  37089666 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 37089567  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37089566 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 37089467  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089466 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 37089429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40091720 - 40091474
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40091720 agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatgg 40091621  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  40091620 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 40091521  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40091520 ttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 40091474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 47274757 - 47275000
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47274757 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtt 47274855  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47274856 tgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 47274955  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47274956 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 47275000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 18847184 - 18847430
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18847184 aaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagttt 18847283  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18847284 gtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 18847383  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18847384 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 18847430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 24888822 - 24889072
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24888822 agagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 24888921  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24888922 gctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttat 24889021  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24889022 tcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgga 24889072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782794
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 22782794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849655
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccc 31849695  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31849694 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 31849655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36921802 - 36921550
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagataga-aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacact 101  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36921802 agagtaaactttgagagatagagggggtgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacact 36921703  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36921702 agggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 36921603  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921602 attcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 36921550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 5198446 - 5198697
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5198446 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 5198545  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5198546 gttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttat 5198645  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5198646 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 5198697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780429
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 22780429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709220
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18709258 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 18709220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22134902 - 22134673
Alignment:
Q  24 aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134902 aggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 22134804  T
Q  124 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22134803 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 22134704  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22134703 tc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 22134673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36919894 - 36919641
Alignment:
Q  4 agagtaaactttga--gatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacac 100  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  36919894 agagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacac 36919795  T
Q  101 tagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagact 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36919794 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagact 36919695  T
Q  201 tattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36919694 tattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtgga 36919641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12396149 - 12395904
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  12396149 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggt 12396050  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12396049 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgt 12395950  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12395949 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 12395904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38928485 - 38928237
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38928485 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacta 38928386  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38928385 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagactta 38928286  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928285 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 38928237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9176776 - 9176530
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9176776 aaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggttt 9176677  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9176676 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 9176577  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9176576 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 9176530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16934445 - 16934199
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16934445 aaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 16934346  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16934345 gtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16934246  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16934245 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 16934199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12401111 - 12400866
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  12401111 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggt 12401012  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12401011 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgt 12400912  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12400911 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 12400866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 24879016 - 24879264
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24879016 gagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagg 24879115  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24879116 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 24879215  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24879216 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtg 24879264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 24880478 - 24880726
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24880478 gagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 24880577  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24880578 gtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 24880677  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24880678 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtg 24880726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33415794 - 33415547
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33415794 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaa 33415696  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33415695 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttat 33415596  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33415595 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 33415547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16932091 - 16931845
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16932091 aaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggttt 16931992  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16931991 gtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16931892  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16931891 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 16931845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47211035 - 47210808
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  47211035 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg---- 47210940  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
            |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47210939 --------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47210848  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47210847 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 47210808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9174448 - 9174202
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  9174448 aaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttc 9174349  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  9174348 gtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 9174249  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9174248 gtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 9174202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 36378322 - 36378569
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36378322 taaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 36378421  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  36378422 tgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattctt 36378521  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36378522 gtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtgga 36378569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 16453347 - 16453577
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16453347 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 16453446  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16453447 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16453546  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16453547 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcat 16453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17662529 - 17662301
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  17662529 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 17662441  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17662440 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 17662341  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662340 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 17662301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37313371 - 37313122
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37313371 agtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 37313272  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37313271 tttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattc 37313172  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37313171 ttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 37313122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 619754 - 619506
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  619754 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 619655  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  619654 ggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattat 619555  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619554 tcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 619506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14787726 - 14787490
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  14787726 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggatt 14787627  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||    
T  14787626 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactca 14787527  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787526 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 14787490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 56030470 - 56030714
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56030470 agagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 56030569  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  56030570 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttt 56030669  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    | ||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  56030670 tcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcatat 56030714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 19095911 - 19096157
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19095911 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 19096010  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  19096011 tttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattc 19096110  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19096111 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtg 19096157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086033
Alignment:
Q  51 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  151 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 250  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  251 tggat 255  Q
    |||||    
T  26086037 tggat 26086033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544233
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 13544195  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544196 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 13544233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 19322723 - 19322970
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19322723 agagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactag 19322820  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19322821 ggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 19322918  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19322919 ttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 19322970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 41997518 - 41997760
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41997518 agagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 41997617  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41997618 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttat 41997717  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41997718 tcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcat 41997760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 53405157 - 53405411
Alignment:
Q  8 taaactttgagataga---aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  53405157 taaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actagg 53405255  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga------ 198  Q
     |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||          
T  53405256 ttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttatt 53405355  T
Q  199 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53405356 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtgga 53405411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52942748 - 52942537
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52942748 taaactttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtt 52942650  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  52942649 tgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 52942563  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaa 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52942562 gtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18409631 - 18409413
Alignment:
Q  27 ggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  18409631 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttc 18409532  T
Q  127 gaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctct 226  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18409531 gggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctct 18409432  T
Q  227 tttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  18409431 tttgtaa-gttacccatcat 18409413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3937516 - 3937316
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3937516 agagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactag 3937417  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3937416 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttat 3937317  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  3937316 t 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18537778 - 18537531
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  18537778 agagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccacta 18537682  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||| |  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18537681 gggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagactta 18537584  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18537583 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 18537531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380626
Alignment:
Q  54 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  154 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 252  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  253 ga 254  Q
    ||    
T  36380625 ga 36380626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8756557 - 8756308
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8756557 agagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 8756460  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt-ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    ||||| |  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||  || ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  8756459 gggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagactt 8756362  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  8756361 attcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtgga 8756308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 6132902 - 6133086
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  6132902 gtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggt 6133000  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 192  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6133001 ttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 6133086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18535136 - 18534911
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18535136 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 18535040  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||| |  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18535039 gggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactta 18534942  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaa 233  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18534941 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 18534911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455509
Alignment:
Q  91 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  191 gcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcat 16455509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38270290 - 38270162
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  38270290 gtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggt 38270191  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacact 135  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38270190 ttgagggttgattcaccttggaaaacact 38270162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890282
Alignment:
Q  58 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  158 actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || |||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 38890282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891559
Alignment:
Q  120 caccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  220 tttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcat 2891559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499310
Alignment:
Q  61 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttact 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  161 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
      |||||  || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcat 27499310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24446883 - 24446760
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24446883 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggt 24446789  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacact 135  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24446788 ttgagggttgattcaccttgggaaacact 24446760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547428
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  229 tgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtg 13547428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15032843 - 15032614
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||          
T  15032843 agagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa------ 15032752  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
        || || ||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15032751 ----tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttat 15032657  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15032656 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15032614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635532
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 5635532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 28453742 - 28453959
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  28453742 aaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 28453835  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  28453836 cactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgt 28453935  T
Q  232 aacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  28453936 aaagttactcatcattatagtgga 28453959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215582
Alignment:
Q  155 gttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 2891346 - 2891434
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 95  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2891346 gtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 5101026 - 5101133
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5101026 gtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggt 5101125  T
Q  107 ttgtgggt 114  Q
    ||| ||||    
T  5101126 ttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437639
Alignment:
Q  172 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 11437639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102364
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  212 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 12102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40999226 - 40999017
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| ||||||    
T  40999226 aaacaagggtttagacgt-caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaa 40999131  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 230  Q
    || | |||||||||||||||||||| || |||||||   | |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  40999130 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttg 40999031  T
Q  231 taacgttactcatc 244  Q
    ||| ||||||||||    
T  40999030 taaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136817
Alignment:
Q  66 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 165  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||| ||  ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  166 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |   || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcat 30136817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150950
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtgga 47150950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983584
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  212 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtgga 31983584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185892
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 210  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||| ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16185935 accctttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 16185892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101202
Alignment:
Q  179 gggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagt 5101202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 246
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9863974
Alignment:
Q  58 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 157  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||     
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtc 9863885  T
Q  158 actggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || |||||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  9863886 acgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 9863974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982233
Alignment:
Q  117 attcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag-gctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 3982233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050378
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853610
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357909
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg----gtagaatt-aggcaggagacttattattg 208  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||     ||||||| ||   | ||||||||| |||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25357909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113080
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| | |||    
T  10112927 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaa 10113020  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttac-tggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  10113021 cactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529328
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689061
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587027
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300485
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822326
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336903
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022516
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aa 130  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  131 acactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||| | ||||||| || | ||||||| || |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattagg 9022516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446700
Alignment:
Q  198 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 24446700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570155
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072102
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831202
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489410
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  58 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771457
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 16638826 - 16638865
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16638826 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagag 16638865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884922
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 177  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906776
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagag 54906776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Original strand, 36769406 - 36769540
Alignment:
Q  59 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg---tgggttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||| | |||||||||||||||| |   ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  36769406 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttctt 36769503  T
Q  154 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36769504 ggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattagg 36769540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312377
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattagg 15312377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 14807779 - 14808029
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14807779 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 14807878  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14807879 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 14807978  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807979 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 14808029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 608774 - 609013
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608974 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 27827014 - 27827264
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27827014 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 27827113  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27827114 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27827213  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27827214 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 27827264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 27829325 - 27829575
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27829325 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 27829424  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27829425 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27829524  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27829525 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 27829575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 44720876 - 44721122
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720876 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggttt 44720975  T
Q  109 gtgggttgattcacctt-ggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44720976 gtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 44721075  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44721076 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 44721122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28251872 - 28251623
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28251872 agtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggt 28251773  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  28251772 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattc 28251673  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28251672 ttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggat 28251623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 3874050 - 3874289
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3874249  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874250 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 3874289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15809259 - 15809497
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15809259 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggtt 15809357  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15809358 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 15809457  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809458 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 15809497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 18810736 - 18810986
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18810736 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactag 18810835  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18810836 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttat 18810935  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18810936 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 18810986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 32339349 - 32339588
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32339349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 32339448  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32339449 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 32339548  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32339549 ttgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 32339588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 15072742 - 15072989
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15072742 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 15072841  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaaga-ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15072842 ttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattct 15072941  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15072942 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtgga 15072989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 15068013 - 15068259
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15068013 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 15068112  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15068113 tgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15068212  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15068213 gtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatgga 15068259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27107200 - 27106956
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27107200 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtt 27107101  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27107100 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 27107001  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27107000 gtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtg 27106956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 4424046 - 4424297
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4424046 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactag 4424145  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4424146 ggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttat 4424245  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4424246 tcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggat 4424297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Original strand, 43079651 - 43079881
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079651 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 43079750  T
Q  125 tggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43079751 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 43079850  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43079851 tc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 43079881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684710
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc- 214  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  215 --attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtgga 22684710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30480807 - 30480562
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30480807 gtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 30480708  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30480707 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 30480608  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30480607 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtg 30480562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082252
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43082213 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 43082252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 27911046 - 27911290
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27911046 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 27911144  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27911145 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattct 27911244  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27911245 tgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtg 27911290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 27957465 - 27957709
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27957465 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 27957563  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27957564 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattct 27957663  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27957664 tgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtg 27957709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24873476 - 24873237
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24873476 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggtt 24873377  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  24873376 gattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccg 24873277  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24873276 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 24873237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 1225197 - 1225443
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1225197 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggt 1225296  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  1225297 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattct 1225396  T
Q  207 tgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1225397 tgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtg 1225443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14419495 - 14419256
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||    
T  14419495 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggt 14419396  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14419395 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 14419296  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  14419295 tgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcat 14419256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28283514 - 28283276
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28283514 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggtt 28283415  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  28283414 gattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccca 28283315  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283314 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 28283276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 18812921 - 18813160
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||    
T  18812921 agagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactag 18813009  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18813010 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttat 18813109  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18813110 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 18813160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13858791 - 13858550
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13858791 agagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactag 13858692  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13858691 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttat 13858592  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||| | |||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  13858591 tcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcat 13858550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 36865569 - 36865805
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  36865569 gtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggt 36865668  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36865669 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattct 36865765  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  36865766 tgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcat 36865805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 14477304 - 14477520
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14477304 agagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactag 14477403  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477404 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 14477503  T
Q  204 tattgtaacccattgat 220  Q
    | |||||| ||||||||    
T  14477504 tcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5372474 - 5372243
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  5372474 ttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgaggg 5372376  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||     
T  5372375 ttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaact 5372276  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  5372275 cattgatatcttttttgtaaggttactcatcat 5372243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 25952549 - 25952799
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  25952549 agaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactag 25952647  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25952648 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttat 25952747  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  25952748 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 25952799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 43530168 - 43530394
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||             || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  43530168 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggtt 43530254  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  43530255 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaaccca 43530354  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43530355 ttgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggat 43530394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33541692 - 33541506
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33541692 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 33541593  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca 193  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33541592 ttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggca 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 41384783 - 41385020
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  41384783 ttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaagg 41384881  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||| ||||||||||||  ||||| || || |||||||     
T  41384882 ttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaact 41384981  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384982 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 41385020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 41382701 - 41382938
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41382701 agagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactag 41382800  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| |||||| |||||           || ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41382801 ggtttgagggttgtttcac-----------ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 41382889  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382890 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 41382938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956227
Alignment:
Q  66 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  166 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15956227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 26775229 - 26775378
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775229 agagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactag 26775328  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26775329 ggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5623041 - 5622882
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5623041 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtt 5622942  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    || ||||||||||| ||| | ||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5622941 tgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 21480542 - 21480772
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21480542 agagtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactag 21480632  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | ||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  21480633 gttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttat 21480729  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21480730 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 21480772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 21482350 - 21482580
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21482350 agagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactag 21482440  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||   ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  21482441 ggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttat 21482537  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21482538 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 21482580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15186017 - 15185780
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15186017 agagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactag 15185918  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagt--ctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||  ||||| |    
T  15185917 ggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag-------atttgggtagaattaggcgagagacct 15185825  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15185824 attcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcat 15185780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005688
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |   ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3005834 t---tggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 3005738  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3005737 ttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 3005688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162488
Alignment:
Q  67 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaaga 166  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaaga 31162399  T
Q  167 ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31162400 gattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 31162488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35872682 - 35872559
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35872682 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggt 35872588  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacact 135  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35872587 ttgagggttgattcaccttgggaaacact 35872559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt-aggattgagtctcttggttact--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagg 195  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  196 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214319
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctct 87  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctct 37214415  T
Q  88 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaat 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  37214414 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaat 37214324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12517319 - 12517248
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517319 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578334
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 31578334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3886225 - 3886153
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 76  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3886225 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573794
Alignment:
Q  58 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 157  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtc 31573881  T
Q  158 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    || |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31573880 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035396
Alignment:
Q  111 gggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  210 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 31035396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 31035126 - 31035238
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||    
T  31035126 aaacaatggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaa 31035221  T
Q  132 cactgttaggattgagt 148  Q
    |||  ||||||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021228
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752643
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757388
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28327969
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895563
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 181569 - 181632
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 71  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  181569 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2468403 - 2468261
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata----gagtttgtctcttcggaacaaacact 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||    ||||||| ||||| | |||||| |||    
T  2468403 agtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaatc--------aaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatact 2468313  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2468312 agggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590855
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468195
Alignment:
Q  182 tagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 2468195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812608
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332692
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032715
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985199
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa-cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 13985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554908
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872499
Alignment:
Q  198 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 35872499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799558
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 177  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179692
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg 180  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847740
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033930
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaatagg 21033930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423274
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2267206 - 2267144
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  2267206 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541469
Alignment:
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 33541469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376267
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 210  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   | ||||| ||| ||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6376224 accttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 6376267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 38393980 - 38394219
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38393980 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38394079  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38394080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38394179  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394180 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 38394219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1049602 - 1049352
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1049602 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactag 1049503  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049502 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 1049403  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1049402 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 1049352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7472275 - 7472016
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccc 7472016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046981
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 1046981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850214
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1850214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7470317 - 7470078
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7470317 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7470218  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7470217 gattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7470118  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470117 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 7470078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 48457647 - 48457885
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  48457647 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48457746  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48457747 cattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 48457846  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457847 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48457885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878810
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878771 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 3878810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626271
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20626231  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626232 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 20626271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630162
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20630122  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630123 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 20630162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642581
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20642541  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642542 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 20642581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 44724564 - 44724811
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44724564 gtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 44724663  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44724664 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 44724763  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724764 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 44724811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 35611 - 35861
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35611 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 35710  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35711 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35810  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35811 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 35861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27306536 - 27306287
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27306536 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactag 27306438  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27306437 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttat 27306338  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306337 tcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 27306287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31435354 - 31435103
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31435354 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctag 31435255  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  31435254 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttat 31435155  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31435154 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 31435103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40837037 - 40836799
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837037 gagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 40836938  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40836937 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 40836838  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40836837 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 40836799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Original strand, 40946331 - 40946561
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40946331 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactt 40946430  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttct 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40946431 tggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttct 40946530  T
Q  225 cttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946531 cttttgtaacgttactcatcatatagtggat 40946561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 3035715 - 3035957
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactg---gaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggat 3035957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 11757222 - 11757463
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaaggg-tttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtggg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  11757222 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 11757321  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11757322 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 11757421  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757422 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 20299452 - 20299693
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaaggg-tttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtggg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  20299452 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 20299551  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20299651  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299652 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 20299693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 25542513 - 25542761
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25542513 agagcaaactttgagataga-ggggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactag 25542611  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25542612 ggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttat 25542710  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542711 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 25542761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 44546 - 44796
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44546 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 44645  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  44646 gttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttat 44745  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44746 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 44796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 18345535 - 18345774
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||    
T  18345535 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggtt 18345634  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18345635 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18345734  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18345735 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 18345774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487783
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 28487783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 11355243 - 11355490
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  11355243 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggt 11355342  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11355343 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 11355442  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11355443 tgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtgga 11355490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31156213 - 31155967
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  31156213 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggattt 31156114  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31156113 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 31156014  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31156013 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggat 31155967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20137416 - 20137174
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20137416 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 20137317  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137316 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 20137217  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20137216 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 20137174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 21680012 - 21680257
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21680012 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggt 21680111  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  21680112 ttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattct 21680211  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21680212 tgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 21680257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351708
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7351747 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 7351708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297595
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaaccca 20297555  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20297556 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 20297595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4296239 - 4295993
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4296239 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 4296140  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4296139 tttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 4296040  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296039 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 4295993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21592447 - 21592202
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21592447 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 21592348  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21592347 ttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattct 21592248  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592247 tgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 21592202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 28485560 - 28485793
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28485560 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggtt 28485659  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  28485660 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatcca 28485759  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485760 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 28485793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 443577 - 443825
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  443577 agagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 443676  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  443677 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttat 443776  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  443777 tcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtg 443825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7349568 - 7349329
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349568 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7349469  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7349468 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7349369  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7349368 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 7349329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 24748579 - 24748818
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24748579 gtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 24748678  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24748679 ttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattct 24748778  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24748779 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 24748818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42331302 - 42331056
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42331302 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtt 42331203  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt--actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42331202 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 42331103  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42331102 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtg 42331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 21678051 - 21678296
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21678051 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 21678150  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |    
T  21678151 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattct 21678250  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21678251 tgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtg 21678296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37412435 - 37412182
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacacta 102  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  37412435 agagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacacta 37412336  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412335 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagactta 37412236  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37412235 ttcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtgga 37412182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253573
Alignment:
Q  26 gggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 125  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  126 ggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc 225  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43253702 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 43253603  T
Q  226 ttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253602 ttttgtaacgttactcatcatatagtggat 43253573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 25276123 - 25276374
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25276123 agagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 25276222  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25276223 ggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 25276322  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25276323 tcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 26804552 - 26804765
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac---t 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  26804552 gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagt 26804651  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26804652 agggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 26804751  T
Q  202 attattgtaaccca 215  Q
    ||| ||||||||||    
T  26804752 attcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39146291 - 39146052
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39146291 gtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 39146192  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39146191 ttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattct 39146092  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39146091 tgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 39146052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 24258445 - 24258687
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  24258445 agagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactat 24258544  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||    
T  24258545 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttat 24258644  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24258645 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 24258687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13099781 - 13099540
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13099781 agtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagag 13099682  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  13099681 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattc 13099582  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  13099581 ttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 13099540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 42223138 - 42223388
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaag-gggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacact 101  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42223138 agagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacact 42223237  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||||||||| | | ||||    
T  42223238 agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaactt 42223337  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223338 attcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 42223388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 21990133 - 21990382
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21990133 agagtaaacctggagataga-ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 21990231  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  21990232 ggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttt 21990331  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990332 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 21990382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679289
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9679251  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9679252 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 9679289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 9680813 - 9681050
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggt 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  9680813 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 9680912  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |    
T  9680913 tgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactc 9681012  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9681013 attgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtg 9681050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832698
Alignment:
Q  28 gctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 127  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27832816 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcat 246  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  27832716 ctgtaaagttactcatcat 27832698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22828939 - 22828701
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||     
T  22828939 gagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactaga 22828840  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    |||||  ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828839 gtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 22828740  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  22828739 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcat 22828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22251849 - 22251602
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22251849 agagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactag 22251750  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22251749 ggtttaagggttgattcaccttgg--------gataggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttat 22251658  T
Q  204 tattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251657 tcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24817652 - 24817410
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24817652 gtaaaccttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggt 24817556  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |   |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24817555 t---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 24817459  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24817458 tgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 24817410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 7188525 - 7188772
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7188525 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactag 7188622  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7188623 ggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttat 7188720  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  7188721 ttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtgga 7188772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396867
Alignment:
Q  100 ctagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  200 ttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggat 38396867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092271
Alignment:
Q  92 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  192 caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 7092271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 18567595 - 18567731
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18567595 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctag 18567694  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18567695 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20091848 - 20091609
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||    
T  20091848 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcggag-gcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagatta 20091752  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20091751 gggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactta 20091654  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20091653 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 20091609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094519
Alignment:
Q  92 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  192 caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 7094519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813555
Alignment:
Q  51 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  151 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 249  Q
    |||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  250 gtgga 254  Q
    |||||    
T  24813559 gtgga 24813555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935501
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 2935473  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 2935501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 24465534 - 24465760
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24465534 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggt 24465624  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |   |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  24465625 t---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattct 24465721  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  24465722 tttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcat 24465760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606612
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 1606584  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 1606612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027250
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 9027278  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 9027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137310
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22137282  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552337
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40552309  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 40552337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 22392455 - 22392606
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||    
T  22392455 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactag 22392545  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    ||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22392546 ggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108299
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22108271  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22108299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550059
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40550031  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 40550059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 6348933 - 6349006
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6348933 gactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332453
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattattgtaac 212  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 6332453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 246
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393946
Alignment:
Q  176 tttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 22393946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295671
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26295671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Original strand, 38396319 - 38396377
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396319 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320171
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324919
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069841
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074848
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351414
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357108
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405454
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410191
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006724
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081731
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||| |||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaaccc--attgatttctcttt 228  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || |||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| ||| |||||||||   ||||| ||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  229 tgtaacgttactcatc 244  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatc 11081731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378625
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541116
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247031
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512646
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049039
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aa 130  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  131 acactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||   || |||||||| ||||||||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattagg 6049039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  117 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||| ||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  216 ttgattt 222  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg 180  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7094717 - 7094662
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 71  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310160
Alignment:
Q  92 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369703
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Original strand, 26210555 - 26210710
Alignment:
Q  31 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-a 129  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| |    
T  26210555 gaaacaaggttttagaa-tccaacctcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaa-cactagggtt-gtga-ttgattcaccttggaga 26210647  T
Q  130 aacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 191  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || | |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26210648 aatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 254
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046726
Alignment:
Q  170 tgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 6046726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 6348804 - 6348903
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  6348804 gtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagtaaaa-aagaaaactagggtttgtatcgagtttg-ctcttggcaacaaacattaggg 6348901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2990830 - 2990786
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2990830 gttgattcaccttgaataaacactgttaggattgagtatcttggt 2990786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 3677262 - 3677301
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggttta 44  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677262 agagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7092470 - 7092414
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaa-actagggtttg 71  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  7092470 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816287
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggat 4816287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28241628 - 28241380
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28241628 agagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 28241529  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  28241528 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttat 28241429  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241428 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 28241380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1230551 - 1230306
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1230551 aaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 1230452  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1230451 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 1230352  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230351 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1230306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11983336 - 11983085
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11983336 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 11983237  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11983236 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 11983137  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983136 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11983085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14459072 - 14458823
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14459072 agagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 14458973  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14458972 ggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 14458875  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458874 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 14458823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14507482 - 14507235
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507482 agagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 14507383  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14507382 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttat 14507283  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14507282 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtg 14507235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967459
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 30967419  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967420 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 30967459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30034898 - 30034659
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034898 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 30034799  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30034798 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 30034699  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30034698 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggat 30034659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 13057204 - 13057443
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13057204 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 13057303  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13057304 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 13057403  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13057404 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 13057443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 9019933 - 9020181
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9019933 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactag 9020032  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9020033 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 9020132  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9020133 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 9020181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915412
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915451 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 20915412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 3390390 - 3390628
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3390390 taaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtt 3390489  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3390490 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 3390589  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3390590 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 3390628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19704864 - 19704623
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  19704864 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggtt 19704765  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19704764 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19704665  T
Q  215 attgatttctct-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19704664 attgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggat 19704623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12195817 - 12195571
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12195817 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 12195718  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||    
T  12195717 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattctt 12195618  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12195617 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 12195571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 25477284 - 25477518
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25477284 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 25477383  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25477384 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 25477483  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25477484 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc 25477518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15532984 - 15532740
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15532984 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtt 15532885  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15532884 tgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattctt 15532785  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15532784 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 15532740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15530429 - 15530180
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15530429 agagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 15530330  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15530329 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttat 15530230  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530229 tcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 15530180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065240
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26065202 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggat 26065240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085209
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26085171 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggat 26085209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15541443 - 15541199
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15541443 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtt 15541344  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  15541343 tgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattctt 15541244  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15541243 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtg 15541199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3632242 - 3632003
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3632242 gtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 3632143  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3632142 ttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattct 3632043  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3632042 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 3632003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2629172 - 2628942
Alignment:
Q  24 aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  2629172 aggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcacc 2629073  T
Q  124 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag-acttattattgtaacccattgattt 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  2629072 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaacccattgattt 2628974  T
Q  223 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2628973 ctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 2628942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 13039764 - 13040003
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13039764 gtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 13039863  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  13039864 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattct 13039963  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13039964 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 13040003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3630161 - 3629923
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  3630161 ttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgaggg 3630062  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3630061 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacc 3629962  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  3629961 cattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtg 3629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 244
Target Start/End: Original strand, 32280006 - 32280243
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  32280006 agtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttggg 32280104  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  32280105 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattc 32280204  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32280205 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 32280243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30729135 - 30728881
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30729135 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 30729036  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30729035 gatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttat 30728936  T
Q  204 tattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30728935 ttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtgga 30728881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19227715 - 19227515
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19227715 agagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactag 19227616  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19227615 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 19227516  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  19227515 t 19227515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26932857 - 26932618
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26932857 gagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggtt 26932758  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26932757 gattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26932658  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26932657 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 26932618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3234035 - 3233789
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3234035 gtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactaggg 3233936  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||     
T  3233935 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattc 3233836  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3233835 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtg 3233789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12161858 - 12161617
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12161858 gtaaaccttgagata-aaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggt 12161762  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||  || |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| |    
T  12161761 ttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattct 12161662  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12161661 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagt 12161617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24338752 - 24338512
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta-ggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  24338752 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactagggg 24338653  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | |||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  24338652 tttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattc 24338553  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24338552 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 24338512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 22490649 - 22490889
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggttta-gaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22490649 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactaggg 22490748  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||    || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  22490749 tttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattc 22490848  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  22490849 ttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719891
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
       | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15719891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3028155 - 3027910
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  3028155 agtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg 3028059  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  3028058 gttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatt 3027961  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3027960 tttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 3027910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273272
Alignment:
Q  96 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  195 gagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggat 5273272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1072184 - 1072067
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1072184 agagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 1072085  T
Q  104 ggtttgtgggttgattca 121  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1072084 ggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455482
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  232 aacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||  |||||||||| |||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtgga 16455482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069784
Alignment:
Q  117 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccat 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  217 tgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat 1069784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32447623 - 32447502
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32447623 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 32447524  T
Q  104 -ggtttgtgggttgattcacct 124  Q
     | |||| ||||||||||||||    
T  32447523 agttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 246
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466572
Alignment:
Q  74 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgg 172  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcat 14466572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 17012052 - 17012287
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaa-acaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  17012052 gagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactag 17012148  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||    ||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17012149 ggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttat 17012246  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 244  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17012247 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066180
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26066208  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggat 26066180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309114
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33309086  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 33309114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311383
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33311355  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 33311383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13870728 - 13870608
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |    
T  13870728 agagcaaaccttgagataga-ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttg 13870630  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcacctt 125  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  13870629 ggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754765
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 29754793  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 29754765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 17852549 - 17852650
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17852549 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactag 17852648  T
Q  104 gg 105  Q
    ||    
T  17852649 gg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Original strand, 8995486 - 8995578
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 96  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995486 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186128
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  212 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 12186128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 252
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367286
Alignment:
Q  63 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgg 162  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  163 aagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||  ||  |||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg 15367286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068451
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26068479  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggat 26068451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945393
Alignment:
Q  112 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 19696479 - 19696698
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||||||||| |||    
T  19696479 aaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaa 19696573  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  19696574 cactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttg 19696673  T
Q  231 taacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||    
T  19696674 taaagttattcatcattatagtgga 19696698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga-cttattattgtaacc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || | || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||| ||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878788
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883536
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785980
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887345
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201447
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527063
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  20527022 cttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtgga 20527063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577636
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 88
Target Start/End: Original strand, 10584155 - 10584212
Alignment:
Q  31 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 88  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584155 gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078623
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||  || || |||  |||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 25078623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 15346401 - 15346524
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |         ||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  15346401 gtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaattc--------aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt 15346491  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagga 142  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15346492 t---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346602
Alignment:
Q  172 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg 15346602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694972
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12166320 - 12166267
Alignment:
Q  137 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166320 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22858075
Alignment:
Q  58 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 157  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtc 22858109  T
Q  158 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||    
T  22858108 acaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Original strand, 25941652 - 25941704
Alignment:
Q  137 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941652 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643237
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26643237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749203
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26749203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 254
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445782
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 30445782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701985
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467585
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5165999 - 5165936
Alignment:
Q  128 aaaacactgtt-aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5165999 aaaacactgtttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33215888
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 12186372 - 12186330
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaa 48  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12186372 gtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078251
Alignment:
Q  196 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggat 255  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggat 28078251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 97)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 4236601 - 4236852
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4236601 agagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 4236700  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4236701 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 4236800  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236801 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 4236852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 38882077 - 38882328
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38882077 agagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacacta 38882176  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882177 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 38882276  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882277 ttcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 38882328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 2174891 - 2175141
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174891 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 2174990  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2174991 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 2175090  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2175091 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggat 2175141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25921780 - 25921530
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25921780 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 25921681  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25921680 ggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttat 25921581  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921580 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 25921530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 16776135 - 16776380
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16776135 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggttt 16776234  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16776235 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 16776334  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16776335 taa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggat 16776380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 21947999 - 21948246
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21947999 agagtaaattttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 21948097  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21948098 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttat 21948197  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948198 tcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 21948246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 39854456 - 39854706
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39854456 agagcaaactttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 39854554  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39854555 gttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttat 39854654  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39854655 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggat 39854706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 18468995 - 18469233
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtgga 18469233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10529406 - 10529158
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10529406 agagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactag 10529307  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10529306 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttat 10529207  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529206 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 10529158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745291
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 6745291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 31545057 - 31545303
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545057 aaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 31545156  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31545157 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 31545256  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31545257 gtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggat 31545303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 18466668 - 18466906
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  18466668 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 18466767  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18466768 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18466867  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18466868 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatgga 18466906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804247
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 25804247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2818643 - 2818394
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2818643 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 2818544  T
Q  104 ggtttgtgggtt-gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2818543 ggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttt 2818444  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818443 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 2818394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 31542712 - 31542957
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542712 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 31542811  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  31542812 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctc 31542911  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31542912 g-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggat 31542957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 40221494 - 40221745
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40221494 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 40221593  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  40221594 gatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttat 40221693  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40221694 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 27912520 - 27912758
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  27912520 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggtt 27912619  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27912620 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27912719  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27912720 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 27912758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477109
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 34477109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31179673 - 31179427
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31179673 aaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 31179574  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31179573 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 31179474  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31179473 gtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 31179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 26097705 - 26097954
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26097705 agagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactag 26097804  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097805 ggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 26097903  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097904 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 26097954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479474
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 34479474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18511507 - 18511271
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18511507 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 18511408  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18511407 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccg 18511308  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18511307 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 18511271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684508
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21684546 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 21684508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 27910435 - 27910672
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatgga 27910672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552468
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15552429 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 15552468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36402635 - 36402387
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36402635 agagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 36402536  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36402535 ggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttat 36402436  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402435 tattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 36402387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747527
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6747489 ttgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggat 6747527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18509622 - 18509377
Alignment:
Q  8 taaactttgagataga-aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18509622 taaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 18509523  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  18509522 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattct 18509423  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18509422 tgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtg 18509377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 25904078 - 25904323
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25904078 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 25904177  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  25904178 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattct 25904277  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25904278 tgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtg 25904323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 18596619 - 18596868
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  18596619 agagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatat 18596716  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18596717 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttat 18596816  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18596817 ttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 18596868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34530973 - 34530722
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34530973 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 34530874  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  34530873 ggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttat 34530774  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530773 tcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658412
Alignment:
Q  54 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  154 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092265
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcat 16092265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10474627 - 10474382
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10474627 gtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggt 10474528  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  10474527 ttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttt 10474428  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10474427 tgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtg 10474382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1189904 - 1189677
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1189904 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 1189805  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  1189804 gattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 1189705  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1189704 ttgatatctcttttgtaaggttactcat 1189677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 17072858 - 17073097
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17072858 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 17072957  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  17072958 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattct 17073057  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17073058 tgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 17073097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39398296 - 39398065
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  39398296 gtaaaccttgagataga-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg- 39398199  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39398198 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattc 39398099  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39398098 ttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttac 39398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31472917 - 31472678
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31472917 gtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggt 31472818  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  | | || |    
T  31472817 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttct 31472718  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31472717 tctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 31472678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756706
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6756470 taaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 6756569  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6756570 tgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 6756669  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  6756670 gtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcat 6756706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31466281 - 31466040
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31466281 taaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtt 31466182  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  31466181 tgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattctt 31466083  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 250  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31466082 gtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag 31466040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 24126831 - 24127076
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  24126831 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggt 24126930  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  | |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  24126931 ttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattct 24127030  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24127031 tgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 24127076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37706084 - 37705839
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  37706084 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggt 37705985  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
T  37705984 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattct 37705885  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37705884 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 37705839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17818793 - 17818547
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17818793 gtaaaccttgagaaaga-ggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggt 17818695  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  17818694 ttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattct 17818595  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17818594 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtgga 17818547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 2954391 - 2954636
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  2954391 gtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactaggg 2954490  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  2954491 tttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattc 2954590  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2954591 ttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtg 2954636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 695864 - 696091
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  695864 gtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggt 695952  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  695953 ttgagggttgattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 696051  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  696052 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 696091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12556230 - 12555990
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12556230 agagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaa 12556131  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |    
T  12556130 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaaga-gattggagttttggtagaattagacaagagactttt 12556032  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatc 244  Q
    | ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  12556031 tcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 12555990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Original strand, 20043027 - 20043208
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20043027 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 20043126  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043127 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 20044982 - 20045170
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20044982 agagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 20045081  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20045082 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 20045170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 255
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410245
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  199 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 4410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 10586815 - 10587054
Alignment:
Q  8 taaactttgagataga---aggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactag 103  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||           |||||||||||| || |||||||  |||    
T  10586815 taaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgggaacaaacgatag 10586903  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586904 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttat 10587003  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10587004 tcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 10587054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6661489 - 6661254
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  6661489 agagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactag 6661392  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
     ||| |  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6661391 agttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttat 6661294  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  6661293 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcat 6661254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505900
Alignment:
Q  111 gggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgta 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 20505900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26098558 - 26098403
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098558 agagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 26098459  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttac 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26098458 ggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttac 26098403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 21288736 - 21288981
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac--- 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       
T  21288736 agagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 21288835  T
Q  101 ---tagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag 197  Q
       ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||| || ||||    
T  21288836 ggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggag 21288934  T
Q  198 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | || || ||||||| ||        ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21288935 attttttcttgtaactca--------tcttttgtaacgttactcatcttatagtg 21288981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585803
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  199 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 41585803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798270
Alignment:
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggat 39798270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749923
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 10749895  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 10749923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020442
Alignment:
Q  56 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  156 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | || |||||||  |||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20507769 - 20507665
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20507769 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaag 20507670  T
Q  104 ggttt 108  Q
    |||||    
T  20507669 ggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373193
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattga-gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 3373221  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggat 3373193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757399
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-t 10757371  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 10757399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665266
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23665238  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23665266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793321
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23793349  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23793321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054049
Alignment:
Q  19 atagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  119 tcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattg 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||   |||  |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--tg---gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  219 atttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcat 20054049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354631
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15354659  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggat 15354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356907
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15356935  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggat 15356907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960188
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 38960216  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 38960188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 252
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724113
Alignment:
Q  94 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca 193  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||          | |||||||||||||     
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag---------attggtagaattaggcg 2724054  T
Q  194 ggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtg 2724113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413223
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  || |||||| ||||||||||||   | | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  231 taacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtgga 17413223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143689
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 15143689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208790
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  212 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 36208790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23742032 - 23741915
Alignment:
Q  137 ttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacg 235  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23742032 ttaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacg 23741935  T
Q  236 ttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  23741934 ttactcatcaaatagtggat 23741915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 42770951 - 42771025
Alignment:
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42770951 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Original strand, 4410045 - 4410101
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgt 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4410045 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 246
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  231 taacgttactcatcat 246  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170872
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385573
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298122
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452556
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41586013 - 41585946
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 71  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586013 agagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Original strand, 25445504 - 25445557
Alignment:
Q  137 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25445504 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240489
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2144856 - 2144720
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggt 114  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | |    
T  2144856 gagagagaaggggcaaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gat 2144763  T
Q  115 tgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2144762 tgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 2144720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786465
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782578
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 42770746 - 42770924
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||     
T  42770746 gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaa 42770841  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    |||| |  |||| ||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  42770842 ggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15445454 - 15445323
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggtt---actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||  ||||||  || ||||||| |||||||||||   || || | ||| ||||||||| ||||| ||    
T  15445454 aaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatc 15445355  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15445354 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 15445323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093413
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa-cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 190  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627402
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10627402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841370
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22672895
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 22672895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aa 130  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||  |||||| ||    
T  29748352 aaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  131 acactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaa 186  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 36208552 - 36208597
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaa 48  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36208552 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 36208597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406617
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagag 26406617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 189
Target Start/End: Original strand, 40222771 - 40222822
Alignment:
Q  137 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40222771 ttaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 137)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 43228243 - 43228494
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228243 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 43228342  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228343 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 43228442  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228443 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 43228494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4308586 - 4308336
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4308586 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 4308487  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4308486 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 4308387  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308386 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4308336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22114610 - 22114365
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114610 agagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 22114511  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22114510 gttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttat 22114411  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114410 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 22114365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890243
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 38890243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 5191610 - 5191855
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191610 aaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 5191709  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  5191710 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttg 5191809  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5191810 taacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 5191855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 11170356 - 11170606
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11170356 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 11170455  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11170456 ggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttat 11170555  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170556 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 11170606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4104188 - 4103950
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4104089  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4104088 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4103989  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4103988 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 4103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18099476 - 18099225
Alignment:
Q  4 agagtaaacttt-gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18099476 agagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 18099377  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18099376 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 18099277  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18099276 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtgga 18099225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 43226038 - 43226288
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43226038 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactag 43226136  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43226137 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 43226236  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226237 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 43226288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 3859480 - 3859750
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859480 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 3859579  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3859580 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 3859679  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat-gt--ggctgctctctcccc 272  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3859680 tcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccc 3859750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533645
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533606 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 25533645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006043
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 30006043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084443
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084482 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 10084443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18097193 - 18096955
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18097193 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18097094  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  18097093 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccta 18096994  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096993 ttgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtgga 18096955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51727311 - 51727062
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51727311 agagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-g 51727213  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51727212 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 51727113  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727112 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 51727062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990500
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 42990500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 45882893 - 45883141
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||    
T  45882893 agtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataagg 45882992  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45882993 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 45883092  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883093 ttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 45883141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10956332 - 10956082
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10956332 agagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 10956233  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10956232 ggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 10956133  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956132 tcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 10956082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 746721 - 746960
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  746721 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 746820  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  746821 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 746920  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  746921 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 746960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6066097 - 6065830
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066097 aaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtt 6065998  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6065997 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 6065898  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  6065897 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccc 6065830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28102307 - 28102057
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28102307 agagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 28102208  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28102207 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttat 28102108  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28102107 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtgga 28102057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956888
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 29956888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1626985 - 1626740
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1626985 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggt 1626886  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  1626885 ttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattct 1626786  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1626785 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 1626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43423765 - 43423520
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43423765 gtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 43423666  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  43423665 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattct 43423566  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423565 tgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 43423520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10958628 - 10958378
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10958628 agagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 10958529  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10958528 ggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttat 10958429  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10958428 tcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtgga 10958378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101236
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtgga 27101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 455871 - 456110
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  455871 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 455970  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  455971 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 456070  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  456071 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 456110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 458248 - 458487
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  458248 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 458347  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  458348 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 458447  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  458448 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 458487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 1313362 - 1313609
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313362 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 1313460  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1313461 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 1313560  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313561 tcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 1313609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621584
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10621623 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 10621584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389108
Alignment:
Q  28 gctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 25388981  T
Q  128 aaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctct 226  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  25388982 -aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc- 25389079  T
Q  227 tttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggat 25389108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 50493963 - 50494202
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493963 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 50494062  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  50494063 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 50494162  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50494163 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 50494202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321682
Alignment:
Q  56 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  156 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6063739 - 6063500
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6063739 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 6063640  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6063639 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6063540  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6063539 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 6063500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 6561762 - 6562014
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6561762 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgg 6561861  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6561862 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 6561961  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | |||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6561962 tcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtgga 6562014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 53917965 - 53917721
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53917965 taaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 53917866  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  53917865 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattctt 53917766  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53917765 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 53917721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604661
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 9604661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10191602 - 10191364
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10191602 gagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10191503  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  10191502 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10191404  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191403 ttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 10191364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 26720500 - 26720749
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26720500 agagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactag 26720599  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||   | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26720600 ggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 26720698  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720699 tcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 26720749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 24979659 - 24979908
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24979659 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 24979758  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979759 ggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttat 24979858  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||  ||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24979859 tcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtg 24979908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43421717 - 43421472
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43421717 gtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggt 43421618  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  43421617 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattct 43421518  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421517 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 43421472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210573
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38210534 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 38210573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5927066 - 5926824
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5927066 gtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggt 5926967  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5926966 ttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattct 5926867  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 249  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  5926866 tgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatata 5926824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32264338 - 32264092
Alignment:
Q  10 aactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32264338 aactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 32264239  T
Q  110 tgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgt 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32264238 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgt 32264139  T
Q  210 aacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32264138 aacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgga 32264092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 35777378 - 35777587
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777378 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 35777477  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35777478 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 35777577  T
Q  208 gtaacccatt 217  Q
    ||||| ||||    
T  35777578 gtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 3314639 - 3314878
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3314639 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 3314738  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  3314739 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattct 3314838  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  3314839 tgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcat 3314878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413086
Alignment:
Q  42 ttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagg 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  142 attg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 240  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  241 catcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggat 28413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5522920 - 5522681
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| |    
T  5522920 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcg 5522832  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5522831 ggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 5522732  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5522731 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 5522681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 18162618 - 18162864
Alignment:
Q  5 gagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18162618 gagtaaacttggagataga--gggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagg 18162715  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18162716 gtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttatt 18162815  T
Q  205 attgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
     ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18162816 cttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtg 18162864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148952
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47149088 tgattcaccttggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47148990  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47148989 attgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtg 47148952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35918245 - 35917998
Alignment:
Q  13 tttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggt 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||| ||    
T  35918245 tttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagt 35918146  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  35918145 ttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattct 35918046  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35918045 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtgga 35917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 39715425 - 39715664
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  39715425 gtaaaccttgagataga-ggggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggt 39715523  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39715524 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 39715623  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39715624 tgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 39715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 51943323 - 51943570
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51943323 agagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactag 51943422  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  51943423 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-t 51943521  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943522 tcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 51943570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 53915801 - 53915553
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53915801 agagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactag 53915702  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53915701 ggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 53915602  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53915601 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtg 53915553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 880754 - 880509
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  880754 gtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactaggg 880655  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  880654 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattc 880555  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  880554 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagt 880509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28100346 - 28100146
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28100346 agagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 28100247  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28100246 ggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttat 28100147  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  28100146 t 28100146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 36011782 - 36012029
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36011782 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggt 36011881  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  36011882 ttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattct 36011981  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36011982 tgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 36012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28761733 - 28761492
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  28761733 agagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaag 28761635  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28761634 ggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttat 28761535  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28761534 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28761492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53468757 - 53468519
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53468757 gtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggt 53468659  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  53468658 ttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattct 53468559  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  53468558 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 53468519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606642
Alignment:
Q  74 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  174 actttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggat 7606642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48361973 - 48361729
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48361973 agtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactaggg 48361875  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||     
T  48361874 tttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttc 48361775  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48361774 ttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagt 48361729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12268271 - 12268032
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacact 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12268271 agagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacact 12268172  T
Q  102 agggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12268171 agggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactt 12268072  T
Q  202 attattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268071 attcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 12268032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 890073 - 889830
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  890073 gtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactgggg 889976  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  889975 tttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt-tggggctttgggtagaattaggcaggagagttattc 889877  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  889876 ttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 889830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 15780812 - 15781078
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttcgga 92  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||    
T  15780812 agagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttgga 15780911  T
Q  93 acaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15780912 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggc 15781011  T
Q  193 aggagacttattattgtaacccattg----atttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
     | ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  15781012 ggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtgga 15781078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51675057 - 51674826
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||           | ||| |||||||||||||||||    
T  51675057 gtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt-----------ccctttggaacaaacactagggt 51674969  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  51674968 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattct 51674869  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 249  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51674868 tgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatata 51674826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 32219051 - 32219285
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32219051 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtt 32219139  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  32219140 tgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttattttt 32219239  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32219240 gtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtg 32219285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54691878 - 54691632
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  54691878 agagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 54691780  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||  |||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  54691779 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttat 54691680  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 251  Q
    | |||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54691679 tcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagt 54691632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 31151303 - 31151534
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  31151303 gtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccaggg 31151400  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  31151401 ttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattc 31151498  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  31151499 ttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcat 31151534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992493
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||               ||||| ||||||| ||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||    
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccc 42992493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Original strand, 54884112 - 54884357
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  54884112 gtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggt 54884209  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||  ||||||||||  ||||||||||| |    
T  54884210 ttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-t 54884308  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54884309 tgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688217
Alignment:
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 252  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtg 25688217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 28180979 - 28181174
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  28180979 gtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggat 28181076  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 204  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28181077 ttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtatt 28181174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 53591144 - 53591384
Alignment:
Q  1 ataagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||           |||||||  ||||||||||    
T  53591144 ataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt-----------gtctctttagaacaaacac 53591232  T
Q  101 tagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagact 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| ||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53591233 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagact 53591332  T
Q  201 tattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53591333 tattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtg 53591384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 252
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484560
Alignment:
Q  65 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgga 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  164 agaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtg 6484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 254
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168303
Alignment:
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattgga 11168303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420252
Alignment:
Q  59 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  159 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcat 13420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 23636979 - 23637200
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  23636979 agagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactag 23637076  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||  |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23637077 ggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttat 23637174  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctctttt 229  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    
T  23637175 tcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 11163102 - 11163218
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11163102 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 11163201  T
Q  104 ggtttgtgggttgattc 120  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11163202 ggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28137600 - 28137423
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28137600 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacactag 28137512  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 192  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28137511 ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggc 28137423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 53597193 - 53597439
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  53597193 agagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactag 53597289  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |   ||| ||  || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53597290 ggtt--gaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttat 53597387  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53597388 tcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 53597439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  17 agatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  117 attcaccttggaaaacactgttaggatt 144  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 23633412 - 23633647
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23633412 agagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactag 23633509  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||| |  |||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23633510 ggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttat 23633605  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  23633606 tcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 23633647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 246
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635575
Alignment:
Q  59 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  159 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 255
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886401
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggat 5886401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 255
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899874
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggat 5899874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231994
Alignment:
Q  100 ctagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  200 ttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcat 6231994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666710
Alignment:
Q  73 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgg 172  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  173 gactttgggtagaattaggcaggaga--cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 4666710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 17795225 - 17795452
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||         ||||||| || ||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  17795225 gtaaacctggagatagatggggttgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggt 17795315  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |   |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||  || | |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  17795316 t---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattct 17795412  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17795413 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17795452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 19103665 - 19103892
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||         ||||||| || ||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  19103665 gtaaacctggagatagatggggttgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggt 19103755  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |   |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||  || | |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  19103756 t---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattct 19103852  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19103853 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 19103892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 562056 - 561831
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |    
T  562056 ggggttgaaacaagggtttagaagt-caac-atgaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcacat 561962  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttct 224  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  561961 tgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatct 561862  T
Q  225 cttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  561861 tttttgtaaagttactcatcattatagtgga 561831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36871582 - 36871356
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  36871582 ggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacct 36871487  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttc 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||| | ||    
T  36871486 tggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatc 36871387  T
Q  224 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  36871386 tc-tttgtaaagttaatcatcattatagtgga 36871356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27635932 - 27635830
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaa-caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27635932 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-tgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacacta 27635834  T
Q  103 gggt 106  Q
    ||||    
T  27635833 gggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  52 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctc 151  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  152 ttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 240  Q
    ||| | || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 47701897 - 47701798
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701897 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 24177233 - 24177385
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 104  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  24177233 agtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaag 24177330  T
Q  105 gtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactg 161  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24177331 gttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcactg 24177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Original strand, 6231411 - 6231502
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231411 ttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  96 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  196 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
       |||    |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 246
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306955
Alignment:
Q  130 aacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctttt 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  230 gtaacgttactcatcat 246  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcat 3306955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701728
Alignment:
Q  179 gggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 47701728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 3306754 - 3306842
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 95  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3306754 gtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 254
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181583
Alignment:
Q  170 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 24181583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635715
Alignment:
Q  175 ctttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 27635715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||  ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 247  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620580
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094195
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201075
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626105
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 156
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  59 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100212
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208121
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29914074
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878292
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193287
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 4535613 - 4535675
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4535613 aaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 156
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419983
Alignment:
Q  51 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  151 cttggt 156  Q
    ||||||    
T  13419978 cttggt 13419983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303358
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 177  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 1321393 - 1321437
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaa 48  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321393 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897066
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031439
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188570
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4560568 - 4560509
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactag 65  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4560568 agtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 246
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634081
Alignment:
Q  195 gagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25634081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    ||||||||||||| |  ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858605
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612899
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10612899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544334
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  92 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttg 154  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | || |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 11079516 - 11079578
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  11079516 aaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 16996874 - 16996936
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  16996874 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10949434 - 10949381
Alignment:
Q  137 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10949434 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattagg 10949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  141 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41790 - 41542
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41790 agagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 41691  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  41690 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttat 41591  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 41542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 2861 - 3111
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2861 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 2960  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2961 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttat 3060  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3061 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19504652 - 19504402
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19504652 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaag 19504553  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19504552 ggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 19504454  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19504453 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 19504402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19502318 - 19502067
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502318 agagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactag 19502219  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19502218 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 19502119  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19502118 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 19502067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45280292 - 45280040
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaat-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45280292 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 45280193  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    || || | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45280192 ggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 45280093  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280092 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 45280040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 27104747 - 27104996
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27104747 agagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actag 27104845  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104846 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 27104945  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27104946 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggat 27104996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23452532 - 23452293
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452532 gagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 23452433  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23452432 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 23452333  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23452332 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggat 23452293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 42064463 - 42064713
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064463 agagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 42064562  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42064563 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttat 42064662  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42064663 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 42064713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13910351 - 13910081
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910351 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 13910252  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13910251 ggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttat 13910152  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  13910151 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccc 13910081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Original strand, 42452731 - 42452980
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  42452731 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactag 42452828  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42452829 agtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 42452928  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452929 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 42452980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21520988 - 21520752
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21520988 gagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21520889  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  21520888 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 21520789  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520788 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 21520752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40032365 - 40032119
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40032365 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 40032266  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40032265 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttat 40032166  T
Q  204 tattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  40032165 tcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcat 40032119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24162519 - 24162259
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162519 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 24162420  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24162419 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 24162330  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 272  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  24162329 tcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccc 24162259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 19007590 - 19007836
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19007590 agtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 19007689  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19007690 tttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19007789  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007790 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 19007836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215642
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 35215682  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35215681 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 35215642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218019
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
     |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35218058 gttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 35218019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42923804 - 42923568
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42923804 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 42923705  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  42923704 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 42923605  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42923604 ttgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtg 42923568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 28196585 - 28196833
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  28196585 agagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattag 28196684  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  28196685 ggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttat 28196784  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28196785 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 28196833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22287641 - 22287395
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  22287641 agtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattaggg 22287542  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||     
T  22287541 tttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattc 22287442  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287441 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 22287395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43623875 - 43623637
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  43623875 agagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actag 43623788  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43623787 gttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 43623688  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623687 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 43623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6259118 - 6258885
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  6259118 taaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtt 6259019  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  6259018 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattctt 6258921  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6258920 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 6258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34979883 - 34979635
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34979883 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggt 34979784  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34979783 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattct 34979684  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34979683 tgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtgga 34979635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 17849068 - 17849307
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  17849068 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggt 17849167  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17849168 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttt 17849267  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17849268 tgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 17849307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31733072 - 31732842
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  31733072 agagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaa 31732973  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31732972 ggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttat 31732885  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31732884 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 31732842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11739864 - 11739616
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11739864 gtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggt 11739765  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  11739764 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattct 11739665  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  11739664 tggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtgga 11739616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15539779 - 15539553
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15539779 gtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 15539680  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15539679 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 15539580  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaa 233  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15539579 tgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6264448 - 6264214
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6264448 taaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtt 6264353  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   || ||  |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  6264352 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattctt 6264253  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6264252 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 6264214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 17848401 - 17848636
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgg 112  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  17848401 ttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagg 17848500  T
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 212  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||     
T  17848501 gttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa- 17848596  T
Q  213 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848597 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 17848636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239036
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccca 45239073  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45239072 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 45239036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 3022111 - 3022352
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  3022111 agagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactac 3022210  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3022211 ggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttat 3022310  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | |||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3022311 tcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcat 3022352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 14837224 - 14837457
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14837224 gtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggt 14837323  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      |||||||  || ||||||  |||||||||||| || |||||||| |    
T  14837324 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------ggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattct 14837417  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14837418 tgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 14837457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11578401 - 11578174
Alignment:
Q  14 ttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||    
T  11578401 ttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--gg 11578307  T
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  11578306 ttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 11578207  T
Q  214 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11578206 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 11578174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44289370 - 44289133
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    |||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  44289370 aaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggttt 44289271  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattg 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |  | | ||||||| |||    
T  44289270 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttg 44289171  T
Q  209 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  44289170 taacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcat 44289133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375403
Alignment:
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgga 5375403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22163251 - 22163106
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22163251 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggt 22163152  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 153  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22163151 ttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||         ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttgg-tattg---------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18800606 - 18800379
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18800606 gtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggt 18800516  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  18800515 t---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattct 18800419  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18800418 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 18800379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 22874102 - 22874320
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||    
T  22874102 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggtt 22874189  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22874190 gattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaaccca 22874289  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22874290 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 22874320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22407716 - 22407593
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22407716 agagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 22407617  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttgg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  22407616 ggtttgagggttgattcaccttgg 22407593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459255
Alignment:
Q  66 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  166 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||  |||| |||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcat 28459255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146665
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  20146884 aaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt 231  Q
    || |  ||||||||||||||||||| || |||| ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  232 aacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtgga 20146665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897311
Alignment:
Q  33 aacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaac 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  | |||||||||||||| ||||    
T  17897519 aacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttg-agattgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  133 actgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgta 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |   ||| ||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  17897424 actattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgta 17897325  T
Q  233 acgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||    
T  17897324 aagttactcatcat 17897311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558920
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36558948  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 36558920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561197
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36561225  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 36561197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332240
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-t 45332265  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtg 45332240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377631
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699573
Alignment:
Q  112 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  211 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 40699573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  66 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 165  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  166 aggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 241  Q
    |   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589881
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  227 tttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407513
Alignment:
Q  170 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 22407513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37963237 - 37963007
Alignment:
Q  1 ataagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||||    
T  37963237 ataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat--------caaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacac 37963147  T
Q  101 tagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagact 200  Q
     | |||   || |||||||| |||| ||||||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| |  ||||||    
T  37963146 catggt---tgtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagact 37963050  T
Q  201 tattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    |||| |||||| ||||||||||   |||||||| |||| |||||||    
T  37963049 tattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttattcatcat 37963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107493
Alignment:
Q  51 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  151 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag--gcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-ta 247  Q
    |||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||     | ||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463004
Alignment:
Q  182 tagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggat 7463004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  32 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||| ||||| |||    
T  43139356 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 230  Q
    || | |||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttg 43139548  T
Q  231 taacgttactcatcat 246  Q
    ||| ||||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707812
Alignment:
Q  194 ggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 22707812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgt 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  210 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462497
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054886
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687044
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736266
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932695
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943598
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517760
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  115 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 191
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2741002
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 38020094 - 38020157
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggttt 70  Q
    |||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020094 gtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871012
Alignment:
Q  196 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtg 23871012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680106
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191045
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 177  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  113 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaatta 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479055
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050156
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 177  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt 20050156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163081
Alignment:
Q  222 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 22163081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 12342717 - 12342673
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaac-aagggtttagaa 47  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12342717 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 69586 - 69348
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  69586 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 69487  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  69486 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 69387  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69386 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 69348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 73318 - 73203
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  73318 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 73219  T
Q  116 gattcaccttggaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||    
T  73218 gattcaccttggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73163
Alignment:
Q  90 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 135  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 73163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 79166 - 79416
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79166 agagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 79265  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79266 ggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttat 79365  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79366 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 79416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 183946 - 183700
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  183946 agagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 183848  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  183847 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 183749  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  183748 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 183700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 52004 - 52240
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  52004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggatt 52103  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||    
T  52104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactca 52203  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52204 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 52240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6431
Alignment:
Q  9 aaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6185 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 6284  T
Q  109 gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6285 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattctt 6384  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6385 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggat 6431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 3982 - 4225
Alignment:
Q  8 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3982 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtt 4080  T
Q  108 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 207  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4081 tgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 4180  T
Q  208 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4181 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14439
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 15000 - 15250
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15000 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactag 15099  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15100 agtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttat 15199  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 254  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15200 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgga 15250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 2044 - 2270
Alignment:
Q  25 ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2044 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcacct 2142  T
Q  125 tggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttct 224  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2143 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttct 2242  T
Q  225 cttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2243 cttttgtaacgttcctcatcatatagtg 2270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11780 - 11529
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11780 agagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactag 11681  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11680 ggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttat 11581  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29402
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 215  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  216 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29364 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 29402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 34 - 273
Alignment:
Q  16 gagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  116 gattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  215 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  234 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 252
Target Start/End: Original strand, 79843 - 80088
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactaggg 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||    
T  79843 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattaggg 79942  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  79943 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattc 80041  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 252  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80042 ctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 80088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  28 gctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1509
Alignment:
Q  90 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  190 ggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 85214 - 85462
Alignment:
Q  6 agtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  85214 agtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaag 85312  T
Q  106 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||  || ||||||| ||||||| || | |||||||||||     
T  85313 tttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattc 85412  T
Q  206 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  85413 ttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtgga 85462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16125 - 15887
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 103  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  16125 agagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactag 16028  T
Q  104 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 203  Q
    ||||    |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16027 ggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttat 15930  T
Q  204 tattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15929 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16954 - 16716
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 102  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  16954 agagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 16858  T
Q  103 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 202  Q
    ||||| |  | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16857 gggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagactta 16760  T
Q  203 ttattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 246  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16759 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1935 - 1699
Alignment:
Q  7 gtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 106  Q
    |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  1935 gtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggt 1846  T
Q  107 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattat 206  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  1845 t-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattct 1748  T
Q  207 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1747 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 1699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 993
Alignment:
Q  4 agagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-----ttcggaacaaac 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||    
T  1138 agagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaac 1039  T
Q  99 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt 144  Q
    |||| | || | |||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1038 actacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22347
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 22319  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24622
Alignment:
Q  129 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 24594  T
Q  228 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 24622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5043
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 213  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  214 cattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 254  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtgga 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224880
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16386
Alignment:
Q  114 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57497
Alignment:
Q  128 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctc 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||||||| ||||||||   | |||  |||| ||||||||| ||||| |||     
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  226 ttttgtaacgttactcat 243  Q
    |||||||| |||||||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcat 57497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17107
Alignment:
Q  132 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattagg 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University