View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20496_low_29 (Length: 386)

Name: NF20496_low_29
Description: NF20496
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20496_low_29
NF20496_low_29
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (19-375)||(9171844-9172194)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (19-306)||(9257000-9257271)
chr1 (19-348)||(9466177-9466500)
chr1 (19-308)||(9300435-9300721)
chr1 (43-363)||(9364762-9365076)
chr1 (43-363)||(9337903-9338214)
chr1 (43-305)||(9242026-9242282)
chr1 (19-236)||(8962645-8962856)
chr1 (19-308)||(8927292-8927578)
chr1 (19-308)||(8939718-8940001)
chr1 (172-276)||(8861325-8861429)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (43-363)||(15909824-15910135)
[»] scaffold0690 (2 HSPs)
scaffold0690 (43-363)||(1971-2282)
scaffold0690 (52-142)||(4979-5069)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 9171844 - 9172194
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171844 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 9171943  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171944 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatcccaatagat------gatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 9172037  T
Q  219 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaaccct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9172038 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaaccct 9172137  T
Q  319 tatggacctacaacttcatctaatacaactactaatattgttgcaccaccacctatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9172138 tatggacctacaacttcatctaatacaactactaatattgttgcaccaccacctatg 9172194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9257271 - 9257000
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9257271 atatatagctatggtatattgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaatccaaccacaaatgaagaaaactttcaagttctatatccagatt 9257172  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9257171 ggatccacggtttgcttaaaggagaagaaatacatatcgctatagatgaa------gagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 9257078  T
Q  219 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagtt 306  Q
    |||||||||          |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9257077 ttggtgcat----------cctatgcatcatcggtctatgaaagatgtgatgcaaatgctgaaaggagatggagacaacttaaaagtt 9257000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9466500 - 9466177
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9466500 atatatagttatggtatgttgttgttggagatggttgcaggaagaaagaatacaaacacaaccacaggtgaagaaaatttacaagttctatatccagatt 9466401  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||      ||||||||||| || ||| | |||||| |||| || || |||||    
T  9466400 ggatccacgatttgcttgaagggggagacatacaaatccctattgacgaa------gagggagatttcaggattccaaaaaaaatggcgattgttggact 9466307  T
Q  219 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaaccct 318  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||    || |||    
T  9466306 tcggtgcatccagtggcaacctatgcatcgtccatccatgaaaactgtgatacaaatgctacaaggtgatggagacaagttaaaagtccccagcaatcct 9466207  T
Q  319 tatggacctacaacttcatctaatacaact 348  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  9466206 tttgggcctacaacttcaactaattcaact 9466177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 9300435 - 9300721
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| || |   |||||| | ||||||||||    
T  9300435 atatatagttatggcatgttgttgctggagatggttgggggaaggaagaattcgaacacaaccacaagtgaaggaagtccacaagttttatatccagatt 9300534  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |   |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  9300535 ggatccacagtttagttgaaggaggagacatacaaatccctatagatgaagaacaggatg---atttcagaattgcaaaaaaaatggcaattgtgggatt 9300631  T
Q  219 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttcc 308  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  9300632 atggtgcattcagtggcaacctatgcatcgtccgtccatgaaaactgtgttgcaaatgttacaaggagagggagacaagctaaaagttcc 9300721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 363
Target Start/End: Original strand, 9364762 - 9365076
Alignment:
Q  43 ttggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |     ||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9364762 ttggaaatggttggaggaagaaagaatacaaaaacaattagtggcgaagaaaatatacaagttgagtatccagactggatccacaatttgcttgaaggag 9364861  T
Q  143 gagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctat 242  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||      |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  9364862 gagatatacatatccctattgatgaaga------gggagattttagaattccaaaaaaattggcaactgtgggactatggtgtatccaatggcacccttt 9364955  T
Q  243 gcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaacccttatggacctacaacttcatctaat 342  Q
    ||| |||||| | ||||||  |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||| | || || |  ||||| |||||| || |||||    
T  9364956 gcaccgtccgacaatgaaatatgtgatacaaatgcttcaaggagagggggacaagttaaaagtgcctactaatccgttcggaccaacaactacaactaat 9365055  T
Q  343 acaactactaatattgttgca 363  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  9365056 acaaatgctaatattgttgca 9365076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 363
Target Start/End: Original strand, 9337903 - 9338214
Alignment:
Q  43 ttggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |     ||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9337903 ttggaaatggttggaggaagaaagaatacaaaaacaattagtggcgaagaaaatatacaagttgagtatccagactggatccacaatttgcttgaaggag 9338002  T
Q  143 gagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctat 242  Q
       | |||||||||||||| |||||||| |      |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  9338003 ---agatacaaatccctattgatgaagacg------gagattttagaattccaaaaaaattggcaactgtgggactatggtgtatccaatggcacccttt 9338093  T
Q  243 gcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaacccttatggacctacaacttcatctaat 342  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||| | || || | |||||| |||||| || |||||    
T  9338094 gcatcgtccgacaatgaaatctgtgatgcaaatgctccaaggagagggggacaagttaaaagtgcctactaatccgtttggaccaacaactacaactaat 9338193  T
Q  343 acaactactaatattgttgca 363  Q
    | || |  |||||||||||||    
T  9338194 aaaaatgttaatattgttgca 9338214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9242282 - 9242026
Alignment:
Q  43 ttggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9242282 ttggagatggttggaggaagaaagaatacaaaaacaacaggtggtgaagaaaatatacaaattgagtatccagactggatccacaatttgcttgaaggag 9242183  T
Q  143 gagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctat 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  9242182 gagatatacaaatccctattgatgaaga------gggagattttagaattccaaaaaaattggcaactgtgggactatggtgtatccaatggcacccttt 9242089  T
Q  243 gcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagt 305  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || |||||||| || |||| |||| ||||    
T  9242088 gcatcgtccggcaatgaaatttgtgatacaaatacttcaaggagagggggacatgttaaaagt 9242026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 8962645 - 8962856
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8962645 atatacagctatggaatgttgctgctggagatggtcggaggaagaaagaatactaagacagtcacagatgaagaaaattttcaagttttgtatccagatt 8962744  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||      ||||||| ||||||||| || ||| | ||||| || |||||    
T  8962745 ggatccacggtttgtttgaagggggagatatacatatccctattgatgaagat------ggagattatagaattgcaaagaaactagcaattgtcggact 8962838  T
Q  219 ttggtgcatccaatggca 236  Q
    ||||||||| || |||||    
T  8962839 ttggtgcattcagtggca 8962856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 8927292 - 8927578
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatg---aagaaaattttcaagttctgtatccag 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |  | || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8927292 atatacagctacggtatgttgttgctagagatggttggaggaagaaagaatactaaaacaactactggtggcgaagaaaatttccaagttctgtatccag 8927391  T
Q  116 attggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtggg 215  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||  || | ||||| || ||||||||      |||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || ||    
T  8927392 attggatccatggtttacttgaaggtggagacgtatatatcccaattgatgaaga------gggagattgtagaattgcaaaaaaactagcaattgtcgg 8927485  T
Q  216 actttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttcc 308  Q
    |||||||||||| || |||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  8927486 actttggtgcattcagtggcactccgtgcatcggccgtccatgaaaactgtggtgcagatgcttcaaggagagggagacaaattaaaagttcc 8927578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 8939718 - 8940001
Alignment:
Q  19 atatatagctatggtatgttgctattggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagatt 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||  ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8939718 atatacagctacggtatgttgctgctggagatggttggaggaagaaagaatactaagacagtcacaggtgaagaaaattttcaagtattgtatccagatt 8939817  T
Q  119 ggatccacagtttgcttgaaggaggagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggact 218  Q
    |||||||  ||||  ||||||| |||||  || | ||||| || ||||||      |||||||||||||||||||| || ||| | || || || |||||    
T  8939818 ggatccatggtttatttgaaggtggagacgtatatatcccaattgatgaa------gagggagattttagaattgcaaagaaactagcgattgtcggact 8939911  T
Q  219 ttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttcc 308  Q
    ||||||||| || |||||  |  ||||||| ||||| |||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  8939912 ttggtgcattcagtggcactccgtgcatcgaccgtccatgaaatctgtggttcagatgcttcaaggagagggagacaaattaaaagttcc 8940001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8861429 - 8861325
Alignment:
Q  172 gatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctatgcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgc 271  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || |||| |||  |||    
T  8861429 gatgaaggagatcttaaaattgcaaagaaacttgcaattgttggactttggtgcattcaatggcaaccgataaatcgtccatcaataaaaaatgttgtgc 8861330  T
Q  272 aaatg 276  Q
    |||||    
T  8861329 aaatg 8861325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15910135 - 15909824
Alignment:
Q  43 ttggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||| |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  15910135 ttggagatggttggaggaagaaagaatacaaaaacaacaagtggtgatgaaaacatacaagttgagtatccagactggatccacaatttgtttgaaggag 15910036  T
Q  143 gagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctat 242  Q
       | |||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15910035 ---atatacaaatccctattgatgaaga------gggagattttagaattccaaaaaaattggcaaccgtcggtctgtggtgtatccaatggcacccttt 15909945  T
Q  243 gcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaacccttatggacctacaacttcatctaat 342  Q
     ||||| ||  | |||||| |||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||| |||| ||  |||| ||||  ||||| ||||||  | ||||     
T  15909944 acatcgaccaacaatgaaatctgtgataaaaatgcttcaagcagaggcggacaagttaaaagtaccaacaaatcctttcggaccaacaactaaaactaag 15909845  T
Q  343 acaactactaatattgttgca 363  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  15909844 acaaattccaatattgttgca 15909824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 363
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2282
Alignment:
Q  43 ttggaaattgttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    ||| |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  1971 ttggagatggttggaggaagaaagaatacgaaaacaacaagtggtgatgaaaacatacaagttgagtatccagactggatccacaatttgtttgaaggag 2070  T
Q  143 gagaaatacaaatccctatagatgaagatgatgagggagattttagaattgcgaaaaaattggcaatcgtgggactttggtgcatccaatggcaacctat 242  Q
       | |||||||||||||| ||||||||      | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||| |    
T  2071 ---atatacaaatccctattgatgaaga------gagagattttagaattccaaaaaaattggcaaccgtcggtctgtggtgtatccaatggcacccttt 2161  T
Q  243 gcatcgtccgtctatgaaaactgtgatgcaaatgctgcaaggagatggagacaagttacaagttccttcaaacccttatggacctacaacttcatctaat 342  Q
     ||||| ||| | |||||| |||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||| |||| ||  |||| ||||  ||||| ||||||  | ||||     
T  2162 acatcgaccgacaatgaaatctgtgataaaaatgcttcaagcagaggcggacaagttaaaagtaccaacaaatcctttcggaccaacaactaaaactaag 2261  T
Q  343 acaactactaatattgttgca 363  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  2262 acaaattccaatattgttgca 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Original strand, 4979 - 5069
Alignment:
Q  52 gttggaggaagaaagaatacaaacacaaccacaaatgaagaaaattttcaagttctgtatccagattggatccacagtttgcttgaaggag 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |     |||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4979 gttggaggaagaaagaatacaaaaacaaacggtggtgaagaaaatatacaagttgagtatccagactggatccacaatttgcttgaaggag 5069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University