View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20501_low_1 (Length: 883)

Name: NF20501_low_1
Description: NF20501
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20501_low_1
NF20501_low_1
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (4-376)||(43648035-43648411)
chr2 (4-314)||(41960940-41961253)
chr2 (4-376)||(11366170-11366547)
chr2 (4-376)||(4166959-4167335)
chr2 (1-373)||(19289110-19289486)
chr2 (16-376)||(37905745-37906112)
chr2 (4-374)||(2325168-2325534)
chr2 (4-373)||(3176979-3177352)
chr2 (1-376)||(29241932-29242304)
chr2 (4-388)||(33709022-33709410)
chr2 (6-373)||(26357617-26357988)
chr2 (4-371)||(33660167-33660529)
chr2 (32-374)||(33550801-33551150)
chr2 (4-366)||(4763678-4764045)
chr2 (4-376)||(19424432-19424794)
chr2 (4-374)||(44913700-44914080)
chr2 (6-376)||(31570526-31570900)
chr2 (4-314)||(18494071-18494383)
chr2 (5-376)||(27349744-27350104)
chr2 (16-376)||(35958946-35959293)
chr2 (1-313)||(31861953-31862268)
chr2 (1-313)||(41465602-41465917)
chr2 (15-376)||(43770649-43771005)
chr2 (65-376)||(4478406-4478717)
chr2 (5-342)||(39167160-39167495)
chr2 (64-376)||(4263926-4264243)
chr2 (16-376)||(13711501-13711860)
chr2 (81-373)||(44285989-44286285)
chr2 (123-376)||(17071646-17071903)
chr2 (15-342)||(5881610-5881931)
chr2 (4-315)||(7006728-7007025)
chr2 (123-376)||(17054005-17054262)
chr2 (78-376)||(19313889-19314186)
chr2 (112-376)||(36642023-36642293)
chr2 (112-314)||(45327820-45328025)
chr2 (1-219)||(19500704-19500923)
chr2 (161-376)||(33902105-33902319)
chr2 (144-376)||(41463780-41464016)
chr2 (26-172)||(41051112-41051260)
chr2 (125-273)||(18258198-18258349)
chr2 (20-129)||(18257344-18257453)
chr2 (32-114)||(33902317-33902399)
chr2 (32-142)||(41463408-41463518)
chr2 (674-809)||(11084315-11084450)
chr2 (674-783)||(21253025-21253135)
chr2 (674-783)||(29408397-29408504)
chr2 (4-79)||(45328028-45328102)
chr2 (674-783)||(3309475-3309583)
chr2 (674-778)||(25713877-25713982)
chr2 (231-311)||(19501760-19501839)
chr2 (674-762)||(36243580-36243667)
chr2 (269-317)||(41051263-41051311)
chr2 (721-807)||(16806138-16806224)
chr2 (721-807)||(16845419-16845505)
chr2 (674-778)||(44898631-44898735)
chr2 (674-749)||(27746964-27747039)
chr2 (685-807)||(4700743-4700864)
chr2 (674-751)||(4959045-4959122)
chr2 (674-778)||(41541621-41541725)
chr2 (674-760)||(1397952-1398033)
chr2 (674-751)||(7485762-7485839)
chr2 (674-751)||(34424444-34424521)
chr2 (44-88)||(17053961-17054005)
chr2 (44-88)||(17071602-17071646)
chr2 (674-760)||(15507922-15508008)
chr2 (674-749)||(45271905-45271979)
chr2 (740-813)||(149973-150046)
chr2 (736-773)||(157735-157772)
chr2 (1-57)||(36642296-36642352)
chr2 (674-717)||(20170980-20171023)
chr2 (677-754)||(42871973-42872048)
chr2 (697-763)||(37360748-37360816)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (4-392)||(42505847-42506241)
chr3 (4-376)||(26941032-26941408)
chr3 (1-378)||(48354967-48355348)
chr3 (4-373)||(37203098-37203472)
chr3 (4-372)||(40552031-40552403)
chr3 (4-376)||(46297534-46297910)
chr3 (20-376)||(52040710-52041071)
chr3 (4-376)||(53228924-53229301)
chr3 (1-376)||(3362281-3362662)
chr3 (4-373)||(37157739-37158112)
chr3 (4-368)||(39282689-39283056)
chr3 (8-376)||(47481550-47481923)
chr3 (4-374)||(21009573-21009948)
chr3 (5-376)||(4761421-4761797)
chr3 (4-373)||(4015491-4015863)
chr3 (24-371)||(3654991-3655345)
chr3 (4-373)||(54505839-54506212)
chr3 (55-376)||(34132963-34133288)
chr3 (7-359)||(24707890-24708246)
chr3 (6-376)||(11357155-11357513)
chr3 (4-291)||(22622490-22622780)
chr3 (4-314)||(33378557-33378870)
chr3 (5-376)||(22445838-22446212)
chr3 (6-376)||(44891534-44891899)
chr3 (26-376)||(22450996-22451350)
chr3 (392-609)||(34669371-34669587)
chr3 (4-373)||(2007964-2008343)
chr3 (15-293)||(33698265-33698546)
chr3 (4-374)||(7327252-7327629)
chr3 (4-376)||(29099383-29099751)
chr3 (4-376)||(21193634-21194011)
chr3 (61-376)||(46994490-46994798)
chr3 (4-373)||(11466855-11467214)
chr3 (13-374)||(24488742-24489108)
chr3 (15-371)||(32373505-32373862)
chr3 (4-287)||(1089811-1090097)
chr3 (77-376)||(54828546-54828848)
chr3 (5-314)||(25579830-25580142)
chr3 (4-298)||(36012244-36012544)
chr3 (4-373)||(43975664-43976033)
chr3 (10-376)||(44186295-44186649)
chr3 (55-371)||(38591727-38592051)
chr3 (1-313)||(14586449-14586754)
chr3 (93-376)||(45174531-45174821)
chr3 (16-376)||(40936019-40936365)
chr3 (32-311)||(29163912-29164178)
chr3 (157-376)||(35844354-35844574)
chr3 (1-376)||(27480127-27480527)
chr3 (102-317)||(43348346-43348563)
chr3 (203-376)||(51212955-51213129)
chr3 (1-248)||(20373032-20373263)
chr3 (674-832)||(34669073-34669231)
chr3 (1-195)||(51212546-51212737)
chr3 (233-376)||(20373300-20373444)
chr3 (93-303)||(11835494-11835702)
chr3 (4-219)||(11356930-11357140)
chr3 (674-832)||(2599453-2599611)
chr3 (27-195)||(50475021-50475199)
chr3 (175-314)||(53176145-53176284)
chr3 (674-811)||(45667851-45667988)
chr3 (674-811)||(45647010-45647146)
chr3 (674-811)||(27817850-27817992)
chr3 (95-200)||(53811597-53811701)
chr3 (687-789)||(2094206-2094308)
chr3 (674-765)||(45759128-45759219)
chr3 (4-78)||(35844577-35844651)
chr3 (674-789)||(16237058-16237173)
chr3 (685-754)||(42735096-42735165)
chr3 (676-760)||(37030439-37030523)
chr3 (674-760)||(633101-633186)
chr3 (687-788)||(5494061-5494161)
chr3 (674-811)||(6749358-6749494)
chr3 (674-751)||(13779145-13779222)
chr3 (676-773)||(21916015-21916112)
chr3 (683-778)||(376162-376257)
chr3 (683-783)||(19578487-19578584)
chr3 (674-751)||(21959390-21959467)
chr3 (678-773)||(9589211-9589309)
chr3 (674-760)||(19229326-19229411)
chr3 (685-747)||(27264278-27264340)
chr3 (332-374)||(33698218-33698260)
chr3 (332-370)||(41585411-41585449)
chr3 (262-296)||(53811695-53811729)
chr3 (674-751)||(7259368-7259445)
chr3 (674-754)||(21933972-21934050)
chr3 (674-773)||(6472307-6472403)
chr3 (612-658)||(34669296-34669341)
chr3 (729-778)||(1405329-1405378)
chr3 (721-754)||(38750569-38750602)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (1-376)||(37970294-37970673)
chr8 (4-371)||(16446653-16447024)
chr8 (4-352)||(1149410-1149762)
chr8 (4-376)||(1204963-1205339)
chr8 (1-376)||(43643370-43643749)
chr8 (1-373)||(5299721-5300097)
chr8 (1-376)||(23854207-23854585)
chr8 (4-373)||(34895006-34895374)
chr8 (24-376)||(6098311-6098672)
chr8 (32-376)||(16222899-16223247)
chr8 (24-376)||(27082636-27082992)
chr8 (4-376)||(38644014-38644390)
chr8 (6-373)||(36694746-36695117)
chr8 (4-376)||(11727060-11727437)
chr8 (4-376)||(8803594-8803964)
chr8 (4-374)||(7890735-7891100)
chr8 (4-376)||(30654361-30654737)
chr8 (1-376)||(10554979-10555356)
chr8 (4-376)||(465878-466244)
chr8 (11-373)||(12876148-12876515)
chr8 (1-376)||(31933661-31934040)
chr8 (1-288)||(4132461-4132750)
chr8 (55-376)||(9864184-9864509)
chr8 (4-317)||(1953766-1954084)
chr8 (12-376)||(40862455-40862824)
chr8 (6-319)||(44869591-44869907)
chr8 (5-309)||(33906316-33906621)
chr8 (6-319)||(35459491-35459807)
chr8 (4-315)||(39098897-39099211)
chr8 (102-376)||(13307659-13307936)
chr8 (4-187)||(35859160-35859346)
chr8 (1-263)||(18259233-18259494)
chr8 (132-315)||(41910895-41911080)
chr8 (62-219)||(1149756-1149912)
chr8 (208-376)||(1150090-1150259)
chr8 (20-183)||(12587812-12587978)
chr8 (4-186)||(34951835-34952020)
chr8 (32-232)||(24823200-24823395)
chr8 (157-389)||(43025725-43025958)
chr8 (4-156)||(33198062-33198214)
chr8 (1-115)||(41362723-41362837)
chr8 (225-376)||(41362554-41362703)
chr8 (225-376)||(34952033-34952185)
chr8 (674-808)||(5871260-5871394)
chr8 (674-787)||(7694961-7695074)
chr8 (674-806)||(34146692-34146824)
chr8 (674-807)||(27232096-27232229)
chr8 (13-116)||(43025974-43026078)
chr8 (674-780)||(1530270-1530376)
chr8 (95-183)||(34463704-34463792)
chr8 (225-306)||(7998401-7998483)
chr8 (674-811)||(32234107-32234242)
chr8 (674-807)||(11087585-11087717)
chr8 (223-315)||(33197947-33198031)
chr8 (674-754)||(3742208-3742288)
chr8 (674-778)||(14897023-14897127)
chr8 (674-806)||(38401960-38402090)
chr8 (685-749)||(1256314-1256378)
chr8 (674-751)||(3443387-3443464)
chr8 (674-751)||(9455560-9455637)
chr8 (674-754)||(29315303-29315383)
chr8 (677-760)||(35970514-35970594)
chr8 (1-64)||(13307931-13307994)
chr8 (686-760)||(34039347-34039421)
chr8 (290-376)||(4133077-4133162)
chr8 (139-213)||(7998478-7998555)
chr8 (677-760)||(35970147-35970229)
chr8 (721-807)||(30887514-30887600)
chr8 (687-747)||(39140050-39140111)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (4-373)||(7927-8300)
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (4-376)||(27283756-27284134)
chr7 (4-373)||(30055542-30055915)
chr7 (4-376)||(37109884-37110262)
chr7 (4-376)||(24211753-24212130)
chr7 (1-376)||(31578834-31579218)
chr7 (1-376)||(18797341-18797718)
chr7 (4-376)||(17842357-17842735)
chr7 (37-376)||(11071218-11071558)
chr7 (1-373)||(7334809-7335184)
chr7 (1-376)||(9355596-9355975)
chr7 (7-376)||(32820830-32821202)
chr7 (4-374)||(15612532-15612905)
chr7 (14-376)||(37347034-37347399)
chr7 (1-373)||(10481619-10481996)
chr7 (4-363)||(41764851-41765214)
chr7 (15-378)||(21991646-21992004)
chr7 (4-376)||(4582931-4583307)
chr7 (8-376)||(23111202-23111576)
chr7 (4-374)||(6546533-6546907)
chr7 (6-374)||(5657255-5657628)
chr7 (4-372)||(8861301-8861673)
chr7 (6-376)||(29173552-29173908)
chr7 (4-376)||(32432469-32432840)
chr7 (24-373)||(22687254-22687599)
chr7 (1-376)||(31520511-31520872)
chr7 (1-281)||(37703268-37703551)
chr7 (121-376)||(38258557-38258816)
chr7 (4-314)||(10358987-10359300)
chr7 (4-296)||(15672532-15672830)
chr7 (4-376)||(48928070-48928445)
chr7 (32-374)||(25691345-25691692)
chr7 (4-389)||(35353107-35353496)
chr7 (7-281)||(46480905-46481182)
chr7 (61-376)||(12165764-12166074)
chr7 (4-378)||(26980333-26980694)
chr7 (4-376)||(12390422-12390779)
chr7 (102-375)||(43686054-43686330)
chr7 (4-317)||(44598738-44599054)
chr7 (15-270)||(26587876-26588126)
chr7 (32-374)||(43925120-43925455)
chr7 (86-371)||(33688117-33688406)
chr7 (1-195)||(44411310-44411507)
chr7 (1-184)||(37704387-37704573)
chr7 (20-366)||(32592996-32593327)
chr7 (161-376)||(27421313-27421528)
chr7 (159-305)||(37704241-37704387)
chr7 (159-376)||(48928495-48928712)
chr7 (200-373)||(44413351-44413525)
chr7 (102-376)||(38053498-38053751)
chr7 (22-173)||(34361967-34362123)
chr7 (4-104)||(38258867-38258967)
chr7 (674-811)||(16197268-16197404)
chr7 (674-809)||(10534490-10534625)
chr7 (674-811)||(41690202-41690339)
chr7 (674-773)||(3835318-3835417)
chr7 (674-789)||(4567822-4567936)
chr7 (674-804)||(8614587-8614717)
chr7 (265-376)||(26524364-26524476)
chr7 (675-784)||(10025876-10025985)
chr7 (674-808)||(28226735-28226869)
chr7 (674-811)||(2798784-2798921)
chr7 (674-751)||(14771098-14771174)
chr7 (674-751)||(15221550-15221626)
chr7 (674-783)||(37124624-37124732)
chr7 (674-789)||(35792574-35792688)
chr7 (674-760)||(47541922-47542010)
chr7 (674-751)||(4962618-4962694)
chr7 (674-747)||(39618171-39618244)
chr7 (284-371)||(34362205-34362292)
chr7 (674-749)||(15643633-15643708)
chr7 (674-773)||(27723738-27723832)
chr7 (674-784)||(33258861-33258972)
chr7 (676-772)||(39599424-39599521)
chr7 (686-756)||(1719595-1719665)
chr7 (674-807)||(2273304-2273434)
chr7 (674-751)||(39429997-39430074)
chr7 (674-751)||(39434426-39434503)
chr7 (275-319)||(34362149-34362193)
chr7 (674-809)||(2271406-2271539)
chr7 (686-789)||(12394664-12394767)
chr7 (674-751)||(24393764-24393840)
chr7 (687-811)||(43368966-43369088)
chr7 (674-747)||(46671702-46671775)
chr7 (722-778)||(41747023-41747079)
chr7 (674-752)||(372404-372481)
chr7 (674-751)||(4678857-4678933)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (4-373)||(19089251-19089624)
chr4 (8-373)||(37663543-37663910)
chr4 (4-376)||(19440446-19440822)
chr4 (4-376)||(6864072-6864448)
chr4 (1-376)||(25184150-25184529)
chr4 (1-376)||(879343-879722)
chr4 (1-376)||(36493484-36493862)
chr4 (4-376)||(25700854-25701231)
chr4 (4-376)||(32912377-32912754)
chr4 (4-376)||(34361289-34361665)
chr4 (32-376)||(55477717-55478069)
chr4 (4-376)||(29583998-29584372)
chr4 (4-376)||(49376004-49376380)
chr4 (6-376)||(28002786-28003160)
chr4 (4-376)||(35020829-35021209)
chr4 (34-372)||(34947923-34948267)
chr4 (15-374)||(50697281-50697644)
chr4 (4-376)||(3042648-3043032)
chr4 (4-376)||(42199766-42200143)
chr4 (4-373)||(17173330-17173703)
chr4 (4-373)||(46887956-46888328)
chr4 (4-371)||(23761114-23761484)
chr4 (4-373)||(17167753-17168126)
chr4 (7-306)||(1815409-1815710)
chr4 (4-376)||(7703554-7703922)
chr4 (7-337)||(33341475-33341808)
chr4 (4-376)||(37775706-37776071)
chr4 (4-374)||(55240903-55241276)
chr4 (20-376)||(47253786-47254137)
chr4 (6-376)||(33816316-33816707)
chr4 (4-376)||(5047764-5048139)
chr4 (32-376)||(27396653-27396999)
chr4 (4-314)||(32579547-32579859)
chr4 (4-376)||(30002439-30002798)
chr4 (4-373)||(32592133-32592497)
chr4 (4-376)||(37287771-37288142)
chr4 (22-373)||(50764772-50765115)
chr4 (4-314)||(17272068-17272377)
chr4 (4-376)||(4598030-4598395)
chr4 (5-376)||(9139284-9139639)
chr4 (20-388)||(4934026-4934387)
chr4 (102-376)||(38011891-38012169)
chr4 (20-217)||(7152018-7152218)
chr4 (4-216)||(26896285-26896501)
chr4 (4-272)||(46883911-46884177)
chr4 (4-182)||(4205216-4205397)
chr4 (8-186)||(39400236-39400417)
chr4 (5-142)||(23431830-23431967)
chr4 (20-155)||(35025381-35025515)
chr4 (145-376)||(54499177-54499413)
chr4 (144-376)||(35025534-35025762)
chr4 (5-111)||(38012568-38012674)
chr4 (208-378)||(39397953-39398115)
chr4 (674-811)||(45666724-45666859)
chr4 (674-807)||(9808039-9808171)
chr4 (686-784)||(24073413-24073511)
chr4 (674-809)||(49299389-49299524)
chr4 (685-811)||(38839975-38840100)
chr4 (685-807)||(53393792-53393913)
chr4 (113-175)||(56050169-56050234)
chr4 (321-374)||(4396365-4396418)
chr4 (674-751)||(38433909-38433985)
chr4 (685-753)||(37209623-37209691)
chr4 (332-376)||(53124324-53124368)
chr4 (674-760)||(2685087-2685173)
chr4 (675-754)||(20782916-20782995)
chr4 (721-807)||(6949450-6949536)
chr4 (674-760)||(17330885-17330970)
chr4 (674-773)||(19443114-19443208)
chr4 (674-811)||(54982224-54982361)
chr4 (674-751)||(55344059-55344136)
chr4 (683-747)||(46430478-46430542)
chr4 (674-754)||(47944028-47944103)
chr4 (674-778)||(50721384-50721487)
chr4 (687-751)||(24537984-24538047)
chr4 (674-749)||(37371090-37371166)
chr4 (674-754)||(41503034-41503114)
chr4 (721-760)||(1821184-1821223)
chr4 (674-745)||(9088813-9088884)
chr4 (721-811)||(25494215-25494303)
chr4 (723-766)||(26625701-26625744)
chr4 (674-707)||(1191233-1191266)
chr4 (320-373)||(4205156-4205209)
chr4 (729-770)||(22349398-22349439)
chr4 (674-747)||(31104820-31104893)
chr4 (685-778)||(46250303-46250395)
chr4 (729-778)||(53370173-53370222)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (4-387)||(32216077-32216464)
chr1 (8-376)||(15382966-15383339)
chr1 (5-376)||(19899536-19899912)
chr1 (4-374)||(32267069-32267443)
chr1 (4-373)||(2959784-2960157)
chr1 (8-374)||(8222166-8222533)
chr1 (13-373)||(28564559-28564921)
chr1 (4-376)||(37451319-37451694)
chr1 (9-376)||(42721072-42721439)
chr1 (4-376)||(15752062-15752438)
chr1 (4-373)||(30254460-30254832)
chr1 (1-376)||(23999380-23999760)
chr1 (15-374)||(51128894-51129255)
chr1 (1-376)||(10922760-10923139)
chr1 (4-373)||(9902821-9903194)
chr1 (1-376)||(10181771-10182151)
chr1 (4-374)||(46931446-46931819)
chr1 (22-376)||(16415678-16416037)
chr1 (13-374)||(28769688-28770053)
chr1 (25-335)||(27227273-27227587)
chr1 (37-374)||(30326751-30327093)
chr1 (8-374)||(27763081-27763451)
chr1 (4-378)||(34012149-34012522)
chr1 (1-374)||(27563669-27564046)
chr1 (1-376)||(27266965-27267340)
chr1 (4-366)||(4330323-4330690)
chr1 (36-330)||(25160711-25161010)
chr1 (24-376)||(238300-238655)
chr1 (4-376)||(38823247-38823623)
chr1 (24-376)||(47279222-47279578)
chr1 (4-376)||(15168122-15168505)
chr1 (1-376)||(47682258-47682636)
chr1 (4-376)||(27532749-27533123)
chr1 (4-376)||(14758074-14758441)
chr1 (51-376)||(18422684-18423006)
chr1 (8-338)||(7078834-7079168)
chr1 (7-373)||(39393419-39393790)
chr1 (4-374)||(3534967-3535332)
chr1 (24-314)||(22170807-22171100)
chr1 (32-373)||(41926199-41926537)
chr1 (51-376)||(3309181-3309515)
chr1 (15-374)||(31621326-31621694)
chr1 (37-376)||(37618705-37619039)
chr1 (15-376)||(1547320-1547669)
chr1 (1-376)||(11742132-11742493)
chr1 (1-376)||(40884846-40885226)
chr1 (6-317)||(33725380-33725683)
chr1 (4-218)||(48353735-48353951)
chr1 (44-218)||(1359742-1359919)
chr1 (157-374)||(48620672-48620881)
chr1 (1-181)||(21289829-21290012)
chr1 (100-291)||(38759652-38759846)
chr1 (4-173)||(31962853-31963026)
chr1 (674-811)||(41117404-41117541)
chr1 (683-767)||(39386994-39387078)
chr1 (266-352)||(21289729-21289816)
chr1 (687-806)||(45925834-45925953)
chr1 (683-809)||(13254223-13254349)
chr1 (4-86)||(48620916-48620998)
chr1 (677-761)||(1394823-1394906)
chr1 (674-806)||(6295259-6295391)
chr1 (685-760)||(10430163-10430237)
chr1 (674-747)||(4395596-4395669)
chr1 (674-751)||(31622845-31622922)
chr1 (674-783)||(36319508-36319616)
chr1 (674-754)||(11795531-11795610)
chr1 (687-767)||(23698924-23699004)
chr1 (674-756)||(19270149-19270230)
chr1 (674-751)||(11237661-11237738)
chr1 (674-784)||(2752101-2752210)
chr1 (332-373)||(30254894-30254935)
chr1 (674-754)||(32769466-32769547)
chr1 (674-754)||(52415624-52415705)
chr1 (674-749)||(43021437-43021510)
chr1 (1-39)||(42663236-42663274)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (4-373)||(699190-699563)
chr5 (1-376)||(12910387-12910771)
chr5 (8-376)||(22255218-22255591)
chr5 (4-373)||(38527999-38528371)
chr5 (4-376)||(31705374-31705749)
chr5 (1-376)||(31786405-31786784)
chr5 (1-376)||(22980830-22981209)
chr5 (4-376)||(36866799-36867175)
chr5 (4-376)||(40133422-40133798)
chr5 (1-376)||(24886141-24886503)
chr5 (8-374)||(17157797-17158166)
chr5 (9-351)||(35504427-35504773)
chr5 (4-373)||(35511244-35511612)
chr5 (4-373)||(23115992-23116357)
chr5 (1-376)||(22973841-22974220)
chr5 (6-376)||(7208628-7209001)
chr5 (4-376)||(27330343-27330717)
chr5 (4-376)||(33908270-33908645)
chr5 (3-376)||(5837592-5837969)
chr5 (32-381)||(30969114-30969467)
chr5 (4-359)||(5829955-5830305)
chr5 (4-376)||(19119896-19120272)
chr5 (1-376)||(27318247-27318625)
chr5 (4-376)||(36860460-36860837)
chr5 (32-374)||(35826276-35826619)
chr5 (4-376)||(25500688-25501064)
chr5 (3-376)||(8741646-8742025)
chr5 (6-376)||(8437003-8437376)
chr5 (4-373)||(35933942-35934309)
chr5 (4-314)||(15992302-15992615)
chr5 (10-376)||(7693267-7693628)
chr5 (4-376)||(9200270-9200637)
chr5 (2-371)||(43308420-43308784)
chr5 (4-371)||(39572861-39573224)
chr5 (1-352)||(23954561-23954904)
chr5 (4-373)||(32563189-32563553)
chr5 (4-376)||(22019669-22020036)
chr5 (15-373)||(14919312-14919663)
chr5 (4-266)||(2888207-2888472)
chr5 (4-376)||(14409103-14409464)
chr5 (4-371)||(42342775-42343134)
chr5 (49-352)||(21088576-21088880)
chr5 (24-376)||(15724527-15724881)
chr5 (66-376)||(1428983-1429283)
chr5 (4-292)||(13956126-13956415)
chr5 (4-263)||(25669737-25669989)
chr5 (6-200)||(25889584-25889781)
chr5 (1-376)||(8466782-8467142)
chr5 (157-376)||(26268111-26268331)
chr5 (90-356)||(6824329-6824599)
chr5 (175-376)||(5112250-5112451)
chr5 (1-118)||(43254154-43254271)
chr5 (4-156)||(28416313-28416465)
chr5 (4-152)||(26269074-26269222)
chr5 (202-374)||(28416490-28416663)
chr5 (674-808)||(8544196-8544330)
chr5 (674-778)||(6428534-6428638)
chr5 (259-386)||(25668677-25668804)
chr5 (674-811)||(32474589-32474725)
chr5 (674-785)||(17201945-17202056)
chr5 (676-808)||(11991749-11991881)
chr5 (674-811)||(12436203-12436339)
chr5 (678-811)||(19804176-19804309)
chr5 (674-783)||(28620492-28620600)
chr5 (674-760)||(39940188-39940273)
chr5 (674-751)||(20202161-20202238)
chr5 (674-751)||(36059619-36059695)
chr5 (674-789)||(18412835-18412950)
chr5 (674-748)||(1584179-1584253)
chr5 (687-789)||(13219885-13219989)
chr5 (320-373)||(13956427-13956480)
chr5 (332-373)||(22255615-22255656)
chr5 (688-811)||(1583927-1584049)
chr5 (686-760)||(42673550-42673623)
chr5 (674-751)||(16366043-16366120)
chr5 (332-376)||(26317778-26317822)
chr5 (674-781)||(11825248-11825355)
chr5 (169-220)||(11898148-11898199)
chr5 (1-47)||(1428932-1428978)
chr5 (277-314)||(11898102-11898139)
chr5 (1-42)||(34853854-34853895)
chr5 (336-376)||(16004474-16004514)
chr5 (721-789)||(17200507-17200575)
chr5 (711-811)||(25612816-25612916)
chr5 (332-370)||(5748478-5748516)
chr5 (1-39)||(12080407-12080445)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (4-376)||(1945871-1946249)
chr6 (4-376)||(3879710-3880086)
chr6 (4-376)||(5627428-5627805)
chr6 (4-376)||(20768123-20768495)
chr6 (4-376)||(6090953-6091329)
chr6 (4-375)||(7234803-7235180)
chr6 (37-376)||(4318626-4318970)
chr6 (32-376)||(21016917-21017259)
chr6 (4-376)||(8513270-8513634)
chr6 (15-374)||(33892794-33893147)
chr6 (5-373)||(29182203-29182573)
chr6 (13-317)||(33618931-33619237)
chr6 (27-376)||(6088945-6089286)
chr6 (157-376)||(7055142-7055362)
chr6 (157-374)||(15491654-15491872)
chr6 (131-376)||(30353256-30353505)
chr6 (4-156)||(7054543-7054696)
chr6 (674-806)||(2437292-2437424)
chr6 (674-809)||(23410950-23411085)
chr6 (674-806)||(14093277-14093409)
chr6 (674-778)||(25057014-25057117)
chr6 (674-751)||(21526987-21527064)
chr6 (674-807)||(8049778-8049913)
chr6 (283-376)||(18498470-18498565)
chr6 (674-751)||(7972325-7972402)
chr6 (674-778)||(6110690-6110794)
chr6 (36-91)||(33724062-33724117)
chr6 (674-760)||(31660917-31661003)
chr6 (725-807)||(8049675-8049757)
chr6 (674-760)||(9353620-9353704)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (26-359)||(408223-408559)
scaffold0002 (32-376)||(171-513)
scaffold0002 (4-185)||(93873-94056)
scaffold0002 (177-373)||(94331-94528)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (6-376)||(43994-44367)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-376)||(154420-154793)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (4-376)||(145787-146164)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (4-376)||(11944-12321)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-365)||(267331-267692)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (674-813)||(558-697)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (674-760)||(257253-257339)
scaffold0005 (674-751)||(271928-272006)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (674-807)||(5664-5798)
[»] scaffold1327 (1 HSPs)
scaffold1327 (683-807)||(1195-1318)
[»] scaffold0841 (2 HSPs)
scaffold0841 (674-778)||(4215-4319)
scaffold0841 (674-778)||(3897-4002)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (72-138)||(100994-101058)
scaffold0009 (229-270)||(100894-100935)
scaffold0009 (332-376)||(42385-42429)
scaffold0009 (157-193)||(100948-100984)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (674-751)||(48552-48629)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (682-758)||(3822-3896)
[»] scaffold1130 (1 HSPs)
scaffold1130 (674-751)||(707-783)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 43648035 - 43648411
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648035 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 43648134  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43648135 tcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 43648234  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43648235 aagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatga 43648334  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648335 ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41961253 - 41960940
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41961253 ggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 41961154  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  41961153 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatctt 41961054  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41961053 aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtgga 41960954  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  41960953 ctgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 11366170 - 11366547
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11366170 ggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 11366269  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  11366270 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 11366369  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |   ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11366370 taagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagg 11366469  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11366470 gctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcacca 11366547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4167335 - 4166959
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4167335 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 4167236  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4167235 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 4167136  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4167135 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatgggga 4167036  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4167035 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcacca 4166959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 19289110 - 19289486
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19289110 tatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagt 19289209  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19289210 aattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagt 19289309  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19289310 cttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtga 19289409  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19289410 gaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttca 19289486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37906112 - 37905745
Alignment:
Q  16 aaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37906112 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaa 37906013  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  37906012 ttcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacac 37905913  T
Q  212 tttgtgggg--tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 309  Q
    |||||||||  | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905912 tttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 37905813  T
Q  310 tgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37905812 tgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcacca 37905745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 2325168 - 2325534
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2325168 ggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaat 2325267  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2325268 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtctt 2325367  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  2325368 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgagga 2325459  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2325460 ctgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcac 2325534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3177352 - 3176979
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3177352 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaat 3177253  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3177252 tcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 3177153  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3177152 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgagga 3177053  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3177052 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttca 3176979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 29241932 - 29242304
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29241932 tatggtgcagtcaggaaactgaactttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagt 29242031  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||| |       |||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  29242032 aattcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagt 29242124  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242125 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatga 29242224  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29242225 agactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcacca 29242304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 388
Target Start/End: Original strand, 33709022 - 33709410
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33709022 ggtgcagtcatgatactgaattttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaat 33709121  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  33709122 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 33709221  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||    
T  33709222 aagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatgggga 33709321  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatataattttcct 388  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||| |||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33709322 ctgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaattttcct 33709410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26357988 - 26357617
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357988 tgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 26357889  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26357888 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaa 26357789  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||| || |||    
T  26357788 gtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaact 26357689  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26357688 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttca 26357617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 33660167 - 33660529
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660167 ggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 33660266  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||            
T  33660267 tcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg-------- 33660358  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33660359 -ggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagagga 33660457  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33660458 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Original strand, 33550801 - 33551150
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga----tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 127  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  33550801 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacata 33550900  T
Q  128 ttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtata 224  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |     
T  33550901 ttggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 33550999  T
Q  225 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-taca 323  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  33551000 acgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtaca 33551099  T
Q  324 aacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33551100 aacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcac 33551150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4764045 - 4763678
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaa-gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764045 ggtgcagtaaggaaactgactttttaaaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaa 4763946  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  4763945 ttcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtct 4763846  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  4763845 taagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatggga 4763746  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 366  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  4763745 actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgtt 4763678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 19424432 - 19424794
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424432 ggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 19424531  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||           |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||     
T  19424532 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat-----------ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaa 19424620  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19424621 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacta 19424720  T
Q  304 aacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| | || ||||  || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424721 aacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 19424794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44914080 - 44913700
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44914080 ggtgcagtcagcaaactggtttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 44913981  T
Q  104 tca---tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44913980 tcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 44913881  T
Q  198 cttaagtgttacactttgt-ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat- 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44913880 cttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 44913781  T
Q  296 gaggactgaacttttgatgcca-tttacaaac-ggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    | ||| ||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44913780 ggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttcac 44913700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 31570526 - 31570900
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31570526 tgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattc 31570625  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  31570626 atctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaa 31570725  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31570726 gtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggact 31570825  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| || | || |||  ||| ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31570826 gaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcacca 31570900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 18494071 - 18494383
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18494071 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaat 18494170  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||    
T  18494171 tcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtctt 18494270  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| || ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494271 aagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgagga 18494369  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18494370 ctgaacttttgatg 18494383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 27349744 - 27350104
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27349744 gtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaatt-----ttaaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 27349838  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||            
T  27349839 catctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga-------- 27349930  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27349931 -gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggac 27350028  T
Q  302 tgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27350029 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcacca 27350104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35959293 - 35958946
Alignment:
Q  16 aaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959293 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 35959194  T
Q  116 gcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact 212  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35959193 gcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacact 35959098  T
Q  213 ttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 312  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| |    
T  35959097 ttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaa 35959011  T
Q  313 tgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  35959010 tgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcacca 35958946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31862268 - 31861953
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31862268 tatggtgcagtcgggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagt 31862169  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |   || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31862168 aattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataat 31862069  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
     ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31862068 tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataa 31861969  T
Q  298 ggactgaacttttgat 313  Q
     ||||||| |||||||    
T  31861968 tgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41465917 - 41465602
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41465917 tatggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagt 41465818  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |    
T  41465817 aattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagt 41465718  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||      
T  41465717 cttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatag 41465618  T
Q  298 ggactgaacttttgat 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  41465617 ggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 43770649 - 43771005
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43770649 gaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaa 43770748  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||         ||||||||||    
T  43770749 tgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacac 43770839  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  43770840 tttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttg 43770939  T
Q  312 atgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| | || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770940 atgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 43771005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478406
Alignment:
Q  65 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tcttt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||   |||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  162 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagt 260  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  261 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  ||  ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgtta 4478423  T
Q  360 tagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||    
T  4478422 tagtgttaacttcacca 4478406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 342
Target Start/End: Original strand, 39167160 - 39167495
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39167160 gtgcaatcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaatt 39167259  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |        
T  39167260 catctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt---- 39167355  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
      |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39167356 --tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggac 39167453  T
Q  302 tgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactca 342  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39167454 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactca 39167495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264243
Alignment:
Q  64 tttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||   ||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  161 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgt-gataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  260 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtt 358  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || | ||||||| ||| | |||||||||  ||| |||||||| |    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  359 atagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4264226 atagtgttaactttacca 4264243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13711860 - 13711501
Alignment:
Q  16 aaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 115  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13711860 aaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtatt 13711761  T
Q  116 gcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact 212  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| |||||| | ||| |||    
T  13711760 gtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatact 13711661  T
Q  213 ttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 312  Q
    || |||||| | |||||||||||     | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13711660 ttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttga 13711566  T
Q  313 tgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13711565 tgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcacca 13711501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44286285 - 44285989
Alignment:
Q  81 actgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||    
T  44286285 actgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagt 44286186  T
Q  178 tgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctg 277  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44286185 tgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctg 44286086  T
Q  278 atgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| | || |||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44286085 atgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttca 44285989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071903
Alignment:
Q  123 acatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 219  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  220 gtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 319  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  320 -tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||   |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcacca 17071903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5881931 - 5881610
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881931 gaaactgatttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaa 5881832  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||         ||||||||||    
T  5881831 tgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg---------agtgttacac 5881741  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5881740 tttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttg 5881642  T
Q  312 atgcca-tttacaaacggtgaggtgttactca 342  Q
    ||| || | ||||||| ||| |||||||||||    
T  5881641 atgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 5881610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 7006728 - 7007025
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7006728 ggtgcaatcatgaaaatgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaat 7006827  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  7006828 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattctt 7006927  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  7006928 aagtgtt-----------------acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaa 7007010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054262
Alignment:
Q  123 acatcttggacttacaggtattattttatcgttgt---ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 219  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  220 gtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 319  Q
    || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  320 -tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcacca 17054262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313889
Alignment:
Q  78 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  172 caaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgtt 271  Q
    || ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgata-------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgtt 19313994  T
Q  272 aatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||  || ||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  19313993 aatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaact 19313895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642023
Alignment:
Q  112 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgtta 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  209 cactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa--ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 306  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  307 ttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcacca 36642023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327820
Alignment:
Q  112 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgtta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  209 cactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 308  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  309 ttgatg 314  Q
    ||||||    
T  45327825 ttgatg 45327820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19500704 - 19500923
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500704 tatggtgcagtcaaaaaatt-acttttttgaaaaaat-aattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 19500801  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |    
T  19500802 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagt 19500901  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  19500902 cttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902105
Alignment:
Q  161 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 260  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  261 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||      
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt-- 33902122  T
Q  360 tagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||    
T  33902121 tagtgttaacttcacca 33902105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41464016
Alignment:
Q  144 tattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggt 240  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||| ||    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagt 41463879  T
Q  241 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttac 339  Q
    | |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  41463880 atgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttac 41463979  T
Q  340 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41463980 tcacaacacttttgattttatagtattaacttcacca 41464016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 172
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051260
Alignment:
Q  26 ttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 125  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  126 tcttggacttacaggtattattttatcgttgtc--tttaacatgcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatccttggcattttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Original strand, 18258198 - 18258349
Alignment:
Q  125 atcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggt 221  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18258198 atcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggt 18258297  T
Q  222 ataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 273  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18258298 gttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 18257344 - 18257453
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    |||||||| || ||||||||||| | || |||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18257344 tgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgctt 18257443  T
Q  120 gcaacatctt 129  Q
    ||||||||||    
T  18257444 gcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33902399 - 33902317
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902399 aaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 41463408 - 41463518
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |    
T  41463408 aaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttag 41463507  T
Q  132 acttacaggta 142  Q
    ||||| |||||    
T  41463508 acttagaggta 41463518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 11084450 - 11084315
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  11084450 attataccctcattttaatctaccaatatattcatattattttgcacacactttctctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 11084351  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
     |||| ||||| |||  ||| | |||||||||||||    
T  11084350 tttgttaattaatatttttttctccaacaaattcct 11084315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 21253135 - 21253025
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaat-tcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  21253135 attataccttcattttaatccaccaataaatattttttttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatttttctctagtaacaaac 21253036  T
Q  773 agttgtcaatt 783  Q
    | |||| ||||    
T  21253035 aattgttaatt 21253025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Original strand, 29408397 - 29408504
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  29408397 attataccctcattttaatccaccaacaaattcttatttttt--catacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttctctcataacaaaca 29408494  T
Q  774 gttgtcaatt 783  Q
     |||||||||    
T  29408495 attgtcaatt 29408504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 45328102 - 45328028
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 79  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328102 ggtgcagtcag-aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Original strand, 3309475 - 3309583
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  3309475 attataccctcattttaattcatcaataaattcctacttttt-gcacacattttatattttcaatcaatttaatatgttatctttctctcttaacaaaca 3309573  T
Q  774 gttgtcaatt 783  Q
     |||||||||    
T  3309574 attgtcaatt 3309583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Original strand, 25713877 - 25713982
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  25713877 attataccctcattttaatccaccaatatattccttttttttttgcacacactttctctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaac 25713976  T
Q  773 agttgt 778  Q
    | ||||    
T  25713977 atttgt 25713982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  231 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 674 - 762
Target Start/End: Original strand, 36243580 - 36243667
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttt 762  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36243580 attataccctcattttaatcaaccaatgtattccta-ttttttgcatacactttctctttccaataaatttaatatgttatctttcttt 36243667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051311
Alignment:
Q  269 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 41051311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 807
Target Start/End: Original strand, 16806138 - 16806224
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||| ||| | | |||||||||    
T  16806138 acactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaacaattgtcagttattatctttttctctaacaaattc 16806224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 807
Target Start/End: Original strand, 16845419 - 16845505
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||| ||| | | |||||||||    
T  16845419 acactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaacaattgtcagttattatctttttctctaacaaattc 16845505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 44898735 - 44898631
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||    
T  44898735 attataccctcattttaatccaccaataaattcttattttttttcttacactttccctttttaataaatttaatatattatttttctctcgtaacaaaca 44898636  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  44898635 attgt 44898631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 27747039 - 27746964
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27747039 attataccctcattttaatccactaataatttcctatttttttgcacacactttatttttccaataaatttaatat 27746964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 685 - 807
Target Start/End: Original strand, 4700743 - 4700864
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaatta 784  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| | |||    
T  4700743 attttaatccaccaatatattcatatttttttacacacactttctctttacaataa-tttaatatgttatctttctttcgtaacaaataattgttagtta 4700841  T
Q  785 ttatcatttacgccaacaaattc 807  Q
     |||| ||| | |||||||||||    
T  4700842 gtatctttttctccaacaaattc 4700864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 4959045 - 4959122
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4959045 attataccctcattttaatccactaataatttcctttttttttgcacacactttatctttccattaaatttaatatgt 4959122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 41541725 - 41541621
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||| || | |||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  41541725 attatacccttattttaatccaccaatatattcttattctttttcacacactttctctttccaataaatttaatatgttatttttctcctgtaacaaaca 41541626  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  41541625 tttgt 41541621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 1398033 - 1397952
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |     |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1398033 attataccctcattttaatccaccaataaattcctatct-----cacacactttatctttccaataaatttaatatgttatgtttct 1397952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 7485762 - 7485839
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7485762 attatactctcattttaatctactaataatttcctatttttttgcatacactttatctttgcaataaatttagtatgt 7485839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 34424444 - 34424521
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||| |||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34424444 attatacccttattttaatccactgataatttcctatttctttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgt 34424521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 17053961 - 17054005
Alignment:
Q  44 tgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17053961 tgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 17071602 - 17071646
Alignment:
Q  44 tgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17071602 tgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15508008 - 15507922
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaata-aattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15508008 attataccttcattttaatccaccaatatattttctatttttttgcatacacttcct-ttttccattaatttaatatgttatctttct 15507922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 749
Target Start/End: Original strand, 45271905 - 45271979
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||  || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45271905 attataccctcattttaatccaccattacattttta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatat 45271979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 813
Target Start/End: Original strand, 149973 - 150046
Alignment:
Q  740 aatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctatat 813  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| ||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  149973 aatttaatatgctagctttctcttgtaacaaacaattgttagttattatcttttactccaacaaattcatatat 150046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Original strand, 157735 - 157772
Alignment:
Q  736 aataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  157735 aataaatttaatatgttatctttcttttgtaacaaaca 157772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 36642352 - 36642296
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgttt 57  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  36642352 tatggtgcattcatgaaattgacttttttgaaaaagctaattttaattttaatgttt 36642296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 717
Target Start/End: Original strand, 20170980 - 20171023
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttg 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20170980 attataccctcattttaatccaccaatatattcctatttttttg 20171023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 754
Target Start/End: Original strand, 42871973 - 42872048
Alignment:
Q  677 ataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  42871973 ataccctcattttaatccaccaatatattcctattattttgc--acactttctcactctaataaatttaatatgttat 42872048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 697 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 37360816 - 37360748
Alignment:
Q  697 caataaattcctacttttttgcggacactttatcttt--tcaataaatttaatatgttatctttctttt 763  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37360816 caataaattcctatttttttgcaaacattttctctctattcaataaatttaataggttatctttctttt 37360748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 392
Target Start/End: Original strand, 42505847 - 42506241
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505847 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 42505946  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42505947 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtctt 42506046  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506047 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 42506146  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtta--acttcaccatataattttccttatt 392  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  42506147 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgttatgacttcaccatagaattttccatatt 42506241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 26941032 - 26941408
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941032 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 26941131  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  26941132 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtttt 26941231  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26941232 aagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgagga 26941331  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26941332 ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcacca 26941408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48355348 - 48354967
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48355348 tatggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataat 48355249  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  48355248 aattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 48355149  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48355148 cttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 48355049  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccata 378  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48355048 gaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccata 48354967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37203472 - 37203098
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37203472 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaat 37203373  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  37203372 tcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtct 37203273  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37203272 taagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgagg 37203173  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37203172 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttca 37203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Original strand, 40552031 - 40552403
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40552031 ggtgcagtctggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaat 40552130  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  40552131 tcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcct 40552230  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| | | || |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40552231 aagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgagga 40552330  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 372  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552331 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 40552403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 46297534 - 46297910
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46297534 ggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaat 46297633  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46297634 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 46297733  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  46297734 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgggga 46297833  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297834 ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcacca 46297910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Original strand, 52040710 - 52041071
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  52040710 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgttt 52040809  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  52040810 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgt 52040909  T
Q  217 ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52040910 ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcc 52041009  T
Q  317 a-tttacaaac-ggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | | |||||||   || || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52041010 actatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcacca 52041071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 53228924 - 53229301
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53228924 ggtgcagtcaggcaactgatttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaat 53229023  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53229024 tcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtctt 53229123  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  53229124 aagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatga 53229223  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtga-ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||  ||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53229224 ctgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcacca 53229301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3362662 - 3362281
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362662 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 3362563  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  3362562 aattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagt 3362463  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta--agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  3362462 cttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccat 3362363  T
Q  296 gaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||| | ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3362362 gaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcacca 3362281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37158112 - 37157739
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37158112 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaat 37158013  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  37158012 tcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtct 37157913  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  37157912 taagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatg 37157813  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37157812 actgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttca 37157739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39283056 - 39282689
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39283056 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaat 39282957  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  39282956 tcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtctt 39282857  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  39282856 aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaa 39282757  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaa 368  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  39282756 ctgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactca-cacagttttgatgttatagtgttaa 39282689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47481923 - 47481550
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attca 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47481923 cagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattca 47481824  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47481823 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaag 47481724  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    ||||||||||||| |||| | |  |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  47481723 tgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggcta 47481624  T
Q  304 aacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481623 aacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 47481550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 21009573 - 21009948
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21009573 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 21009672  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  21009673 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtct 21009772  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| | || | |  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21009773 taagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagg 21009872  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21009873 gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtcaaattcac 21009948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 4761421 - 4761797
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4761421 gtgcattcaagaaagttactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaatt 4761520  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4761521 catctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtctta 4761620  T
Q  202 agtgttacactttgt-ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4761621 agtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgagga 4761720  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4761721 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcacca 4761797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4015863 - 4015491
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015863 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 4015764  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||    
T  4015763 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaac-aagttgttgatacaatgcgatagtctt 4015665  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4015664 aagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagga 4015565  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4015564 ctgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttca 4015491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 371
Target Start/End: Original strand, 3654991 - 3655345
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat--ctagtaatgcttg 120  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3654991 ttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttg 3655090  T
Q  121 caacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtg 217  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3655091 caacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtg 3655190  T
Q  218 gggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 317  Q
    | || | || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3655191 gtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 3655290  T
Q  318 tt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3655291 ttgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 3655345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54506212 - 54505839
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54506212 ggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 54506113  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  54506112 ttcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtct 54506013  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| | || | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  54506012 taagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg 54505913  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     ||||| |||||||| |||| || |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54505912 -ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 54505839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 55 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34132963
Alignment:
Q  55 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  155 tg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaatt 251  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 34133089  T
Q  252 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacattt 350  Q
    | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  34133088 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 34132989  T
Q  351 ttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||    
T  34132988 ttgatactatagtgttaatttcacca 34132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 24707890 - 24708246
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24707890 gcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattta 24707989  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  24707990 tctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaag 24708089  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagat--taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24708090 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagac 24708189  T
Q  302 tgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
    ||||||||||||| || | |||  || ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  24708190 tgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgatgtta 24708246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 11357155 - 11357513
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357155 tgcagtcagacaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 11357254  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11357255 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa 11357354  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||                 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11357355 gtgtt-----------------acacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgact 11357437  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| || | ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11357438 gaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcacca 11357513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 22622490 - 22622780
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622490 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaat 22622589  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22622590 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 22622689  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622690 aagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 33378557 - 33378870
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33378557 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaat 33378656  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33378657 tcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtctt 33378756  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33378757 aagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgggga 33378856  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  33378857 ctgaacttttgatg 33378870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 22445838 - 22446212
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22445838 gtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 22445937  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||     
T  22445938 catccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttg 22446037  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gga 300  Q
    ||||||| || |||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||     
T  22446038 agtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggt 22446136  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22446137 ttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcacca 22446212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44891899 - 44891534
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44891899 tgcagtcatcaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattc 44891800  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  44891799 atctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa 44891700  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44891699 gtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggact 44891600  T
Q  303 gaacttttgatgccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||        || ||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44891599 aaacttttgatgcc--------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 44891534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22450996
Alignment:
Q  26 ttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  126 tcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggta 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||  ||||||     
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtg 22451151  T
Q  223 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ttta 321  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  22451150 ttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccata 22451051  T
Q  322 caaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22451050 caaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 22450996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 392 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 34669587 - 34669371
Alignment:
Q  392 ttgtttatatgttcttaattattaagactgctcataacatttagcacgttctgctgtggggggagttattaaagatctaaaaaggtcttgaaattgctgc 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34669587 ttgtttatatgttcttaattattaagactgctcataacatttagcactttctgcggtggggggagttattaaagatctaaaaaggtcttgaaattgctgc 34669488  T
Q  492 ggcaaccgtcttctattttatgtctctacggtaccagcagacgtaacgtcgatgccttatatataccagcagagatgcatatactcgcatgctcgtcttt 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34669487 ggcaaccgtcttctattttatgtctctacggtaccagcagacgtaacgtcgatgccttatatataccagcagagatgcatatactc-catgctcgtcttt 34669389  T
Q  592 tattcttttaatcatact 609  Q
     |||||||||||||||||    
T  34669388 cattcttttaatcatact 34669371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2008343 - 2007964
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------ctgattaatgatcaa 96  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  2008343 ggtgcaatcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaa 2008244  T
Q  97 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 193  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2008243 tattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 2008144  T
Q  194 taatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 293  Q
    || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2008143 tagtcttaagtgttacactttgtggagtgta-cacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgct 2008045  T
Q  294 atgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  2008044 atggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33698546 - 33698265
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33698546 gaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaa 33698447  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  33698446 tgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacac 33698347  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 293  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698346 tttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 7327252 - 7327629
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaa--gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 101  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7327252 ggtgcagttatgaaattgacttttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagta 7327351  T
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||    
T  7327352 attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 7327451  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7327452 ttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggg 7327551  T
Q  299 gactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtg-ttaacttcac 374  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||   ||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7327552 gactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcac 7327629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29099751 - 29099383
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaa-gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29099751 ggtgcagtcatgaaactgactttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaa 29099652  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |        
T  29099651 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa---- 29099556  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
         ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  29099555 -----gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagggg 29099461  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||| |||| || | ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29099460 actgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcacca 29099383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21194011 - 21193634
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21194011 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaat 21193912  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgt---tgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc-t 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||     ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| || |    
T  21193911 tcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctt 21193812  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  21193811 taagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatgggg 21193712  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  21193711 actgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcacca 21193634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 376
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994798
Alignment:
Q  61 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---t 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |   |    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  158 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 257  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  258 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgt 357  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt--------gt-atgtgttactcattaca-ttttgatgt 46994779  T
Q  358 tatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  46994780 tatagtattaacttcacca 46994798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11467214 - 11466855
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  11467214 ggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaat 11467122  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  11467121 tcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtctt 11467029  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11467028 aagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 11466929  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    || |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  11466928 ctaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttca 11466855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 24488742 - 24489108
Alignment:
Q  13 aggaaattgactttt-ttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 111  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  24488742 aggaaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctag 24488841  T
Q  112 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgtta 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24488842 taatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgtta 24488941  T
Q  209 cactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 308  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24488942 caccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaactt 24489041  T
Q  309 ttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||| |||| | ||||| |||   |||||||||  |||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  24489042 ttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcac 24489108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32373862 - 32373505
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32373862 gaaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaa 32373764  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  32373763 tgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacac 32373664  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||    
T  32373663 tttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttg 32373564  T
Q  312 atgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    |||||| | ||||||| ||  || ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32373563 atgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 32373505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1090097 - 1089811
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1090097 ggtgtagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 1089998  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1089997 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtctt 1089899  T
Q  201 aagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 287  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089898 aagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 376
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828848
Alignment:
Q  77 gattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   | |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  174 aagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 273  Q
     ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  274 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 372  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  54828746 tatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaacttt 54828844  T
Q  373 acca 376  Q
    ||||    
T  54828845 acca 54828848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25580142 - 25579830
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25580142 gtgcagtcttgaaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaatt 25580043  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||   |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  25580042 catctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtctta 25579943  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||| |||| ||||    
T  25579942 agtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggac 25579843  T
Q  302 tgaacttttgatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  25579842 tgaacttttgatg 25579830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36012544 - 36012244
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaa-ttatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36012544 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 36012445  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  36012444 ttcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtc 36012345  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36012344 ttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatga 36012245  T
Q  298 g 298  Q
    |    
T  36012244 g 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 43975664 - 43976033
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43975664 ggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaat 43975763  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaa---agttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||       
T  43975764 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgat--- 43975860  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
        ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43975861 ----agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatga 43975956  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccat-ttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||| | ||||||||||| |||  ||||||  |||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43975957 ggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca 43976033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 376
Target Start/End: Original strand, 44186295 - 44186649
Alignment:
Q  10 gtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct 109  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44186295 gtcatgaaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatct 44186394  T
Q  110 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||               
T  44186395 agtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgata----------- 44186483  T
Q  207 tacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 306  Q
          ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44186484 -----gttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaac 44186578  T
Q  307 ttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||| || | || |||| | | |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44186579 ttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 44186649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591727
Alignment:
Q  55 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  155 tgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaatt 251  Q
    ||||   ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaatt 38591852  T
Q  252 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaa----acggtgaggtgttactcattac 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    ||  |||| ||||||||  ||     
T  38591851 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctat 38591752  T
Q  347 atttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  38591751 aattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14586449 - 14586754
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14586449 tatggtgcactcgtgaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagt 14586548  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |         
T  14586549 aatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacg----- 14586642  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
        |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  14586643 ----agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg 14586738  T
Q  298 ggactgaacttttgat 313  Q
    ||||  ||||||||||    
T  14586739 ggacaaaacttttgat 14586754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 93 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174531
Alignment:
Q  93 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  190 gtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 288  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  289 atactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttact--cattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174621 atactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 45174531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40936365 - 40936019
Alignment:
Q  16 aaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40936365 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 40936266  T
Q  116 gcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact 212  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40936265 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 40936166  T
Q  213 ttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttga 312  Q
    |                  ||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936165 t------------------aaaaaaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttga 40936084  T
Q  313 tgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || || | || ||||  |||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40936083 tgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 40936019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29164178 - 29163912
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29164178 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttag 29164086  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| | ||||    
T  29164085 acttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacac 29163995  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29163994 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 157 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35844574 - 35844354
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagat 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35844574 tctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagat 35844476  T
Q  256 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttga 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  35844475 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgt 35844376  T
Q  355 tgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35844375 tgttatagtgttaacttcacca 35844354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 27480127 - 27480527
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||  ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27480127 tatggtgcagggaggaaattgattttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagt 27480226  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttg----caacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaac----aaagttgatgatattat 189  Q
    |||||||||||||||| |||     ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    | |||||||||||||||    
T  27480227 aattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattat 27480326  T
Q  190 gtgataatcttaagtgttacactt-----tgt--------ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 276  Q
    | |||| |||||||||||||||||     |||         |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27480327 gcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatat 27480426  T
Q  277 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacc 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||  |  | || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||    
T  27480427 gatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttacc 27480526  T
Q  376 a 376  Q
    |    
T  27480527 a 27480527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348346
Alignment:
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaa 43348365  T
Q  299 gactgaacttttgatgcca 317  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgcca 43348346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 376
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213129
Alignment:
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  303 gaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcacca 51213129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 20373032 - 20373263
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373032 tatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 20373131  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||                   ||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20373132 aatt-------------------catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 20373212  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaa 248  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  20373213 tttaagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 674 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 34669231 - 34669073
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  34669231 attatactctcattttaatccatcaataaatttctacttttttgcagacactttattttttcaataaatttaatatgatatctttcttttgtaacagaca 34669132  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctatataaaaattatattgatgaaa 832  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34669131 gttgtcaattattatcttttacaccaacaaattcctatataaaaattatattgatgaaa 34669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 51212546 - 51212737
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  51212546 tatggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagt 51212639  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51212640 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgata 51212737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 376
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373444
Alignment:
Q  233 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtga 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||     
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcacca 20373444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 303
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835702
Alignment:
Q  93 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  | |   |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat---catgcaaatagagttgatgatatcatgtg 11835590  T
Q  193 ataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaa-attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 291  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  11835591 atagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgata 11835690  T
Q  292 ctatgaggactg 303  Q
    ||||| ||||||    
T  11835691 ctatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 11356930 - 11357140
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11356930 ggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaat 11357029  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||   | |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11357030 --------taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtctt 11357121  T
Q  201 aagtgttacactttgtggg 219  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11357122 gagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 674 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 2599611 - 2599453
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||     
T  2599611 attataccctcattttaatccaccaataaattcatacttttttgcagactctttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaacc 2599512  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctatataaaaattatattgatgaaa 832  Q
     |||||| |||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2599511 attgtcagttattatctttttcaccaacaaattcttacataaaaattatattgatgaaa 2599453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  27 tttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176145
Alignment:
Q  175 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 274  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || | | | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 53176185  T
Q  275 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53176184 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 53176145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 45667988 - 45667851
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  45667988 attataccttcattttaatccaccaataaattcttattttcttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttccgtaacaaaca 45667889  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  45667888 attgtcagttattatatttttctccaacaaattcctat 45667851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 45647146 - 45647010
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  45647146 attataccctcattttaatccgtcaataaattcata-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcataacaaaca 45647048  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  45647047 attgtcacttattatctttttctccaacaaattcctat 45647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 27817992 - 27817850
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaattta-----atatgttatctttcttttgtaaa 768  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||     
T  27817992 attatacccttattttaatccaccaataaattcctatttttttgcacacattttatcttttcaataaatttaatataatatgttatctttcttttgtaac 27817893  T
Q  769 aaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    ||||| || ||| |||||| | ||| | |||||||||| ||||    
T  27817892 aaacaattatcagttattaactttttctccaacaaatttctat 27817850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  95 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg----caaagttgatgatattatgt 53811692  T
Q  192 gataatctt 200  Q
    |||| ||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 687 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 2094308 - 2094206
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattatt 786  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||| |||||    
T  2094308 tttaatccaccaataaatttctatttttttggacacactttatcttttcaaaaaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaataattgtcagttatt 2094209  T
Q  787 atc 789  Q
    |||    
T  2094208 atc 2094206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 674 - 765
Target Start/End: Original strand, 45759128 - 45759219
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgt 765  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45759128 attataccctcaatttaatccaccaataaattactatttttttacacacactttattttttccataaatttaatatgttatctttctcttgt 45759219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35844651 - 35844577
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttga 78  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844651 ggtgcagttatgaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 674 - 789
Target Start/End: Original strand, 16237058 - 16237173
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||    
T  16237058 attataccctcattttaatccataaataaattcctattttcttgcacacactttatctctccaataaatttaaaatgttatttttctctcgtaacaaaca 16237157  T
Q  774 gttgtcaattattatc 789  Q
      ||||| ||||||||    
T  16237158 actgtcagttattatc 16237173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 685 - 754
Target Start/End: Original strand, 42735096 - 42735165
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42735096 attttaatccatcaataaattcctatttttttgcatacactttatctttttgataaatttaatatgttat 42735165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 676 - 760
Target Start/End: Original strand, 37030439 - 37030523
Alignment:
Q  676 tataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37030439 tataccctcattttaatccactaataaatttcaattgttttgcaaacactttatctttccaataaatttaatatgttatatttct 37030523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Original strand, 633101 - 633186
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttc-aataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633101 attatactctcattttaatccaccaataaattcttactttttt-cacacacttt-tcttttctaataaatttaatatgttatctttct 633186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 5494161 - 5494061
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattatt 786  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||| |||||    
T  5494161 tttactccaccaataaattccttttttttt-ctcacactttatctttataataaatttaatatgttatctttttctcgtaacaaacaattgtcacttatt 5494063  T
Q  787 at 788  Q
    ||    
T  5494062 at 5494061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 6749494 - 6749358
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||   || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  6749494 attataccctcgttttaatgcaccaataaattctta-ttttttgcgcacattttcctttctcaataaatttaatatgttatttttctcttgtaacaaaca 6749396  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     || | | ||| ||||  || | |||||||||||||||    
T  6749395 atttttagttactatctctttctccaacaaattcctat 6749358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 13779222 - 13779145
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13779222 attataccctcattttaatctactaataatttcctatttttttgcacaccctttatctttccaataaatttaatatgt 13779145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21916112 - 21916015
Alignment:
Q  676 tataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||    
T  21916112 tataccttcaatttaacccaccaatatattcctattttttgacacacactttatctttccaataaatttaatattttatatttttcttgtaacaaaca 21916015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 376257 - 376162
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgt 778  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  376257 tcattttaatccatcaatatatttttatttttttgcacacactttctctttccaacaaatttaatatgttatctttctctggtaacaaacatttgt 376162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 19578584 - 19578487
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaat 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  19578584 tcattttaatccaacaataaattcctatttttttc---acaatttctatttccaataaattcaatatgttatctttctcttgtaacaaacatttgtaaat 19578488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 21959390 - 21959467
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  21959390 attataccctcattttaatccactaataatttcctatttttttgcacacactttatatttctaataaatataatatgt 21959467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 9589309 - 9589211
Alignment:
Q  678 taccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt---gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||   ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  9589309 taccctcattttaatccaccaatatataccttctttttttttgcacaaactttctcttttcaataaatttaatatgttatttttatcttgtaacaaaca 9589211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Original strand, 19229326 - 19229411
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19229326 attataccctcattttaatccactaatatacaccta-ttttttgcacagactttctctttccaataaatttaatatgttatttttct 19229411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 685 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27264340 - 27264278
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27264340 attttaatccaccaataaattcctatttatttgcacacactatatctttccaataaatctaat 27264278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33698260 - 33698218
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698260 ggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcac 33698218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 370
Target Start/End: Original strand, 41585411 - 41585449
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41585411 ggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 296
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811729
Alignment:
Q  262 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 53811729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 7259368 - 7259445
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7259368 attataccctcattttaatccactaataattttttatttttttgcacccactttatctttccaataaaattaatatgt 7259445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Original strand, 21933972 - 21934050
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21933972 attataccctcaatttaatccactaatatatctctattttttggc--acactttatctttccaataaatttaatatgttat 21934050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Original strand, 6472307 - 6472403
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||   || ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  6472307 attataccctcgttttaatccaccaataaattctta-ttttttgcgcacattttcctttctcaataaattta--atgttatttttctcttgtaacaaaca 6472403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 34669341 - 34669296
Alignment:
Q  612 tataaaattttgagtttatttaaaattatattccctccgttcttttt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  34669341 tataaaattttgagtttatttaaaattat-tttcatccgttcttttt 34669296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 1405378 - 1405329
Alignment:
Q  729 tcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgt 778  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  1405378 tctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaacaattgt 1405329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 754
Target Start/End: Original strand, 38750569 - 38750602
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38750569 acactttatctttccaataaatttaatatgttat 38750602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 37970294 - 37970673
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37970294 tatggtgcagtcaggaaagtgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagt 37970393  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37970394 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 37970493  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37970494 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatga 37970593  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970594 gggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 37970673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 16446653 - 16447024
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446653 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 16446752  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  16446753 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 16446852  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16446853 aagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgggga 16446952  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16446953 ctaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactt 16447024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 352
Target Start/End: Original strand, 1149410 - 1149762
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149410 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaat 1149509  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1149510 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtctt 1149609  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1149610 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagga 1149709  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacattttt 352  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  1149710 cagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1205339 - 1204963
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1205339 ggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaat 1205240  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  1205239 tcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtctt 1205140  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1205139 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgagga 1205040  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1205039 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcacca 1204963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 43643370 - 43643749
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43643370 tatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagt 43643469  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |   | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  43643470 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagt 43643569  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43643570 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 43643669  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     || |||||||| |||| |||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643670 agattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43643749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 5299721 - 5300097
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5299721 tatggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagt 5299820  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgt---ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  5299821 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataat 5299920  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5299921 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataa 5300020  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||   ||| |||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5300021 ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttca 5300097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 23854207 - 23854585
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23854207 tatggtgtagtcaggaaattga-ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagt 23854305  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  23854306 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgt 23854405  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23854406 cttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatga 23854505  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23854506 ggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 23854585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34895374 - 34895006
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895374 ggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 34895275  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |       
T  34895274 tcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt--- 34895178  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
      |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34895177 --gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatga 34895080  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34895079 ctgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttca 34895006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Original strand, 6098311 - 6098672
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098311 ttttttgggaaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 6098410  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttat-----cgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttg 215  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||     |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6098411 catcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 6098510  T
Q  216 tggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 315  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  6098511 tggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgt 6098610  T
Q  316 ca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6098611 cactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcacca 6098672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16223247 - 16222899
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16223247 aaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 16223148  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||      
T  16223147 acttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgt 16223048  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  16223047 ttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaact 16222948  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| ||   |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16222947 gtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcacca 16222899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27082992
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcgggg 27082835  T
Q  221 tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tt 319  Q
    | | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  27082836 tgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactg 27082935  T
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27082936 cacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 27082992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38644390 - 38644014
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644390 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaat 38644291  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||    
T  38644290 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctt 38644191  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38644190 gagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggaga 38644091  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38644090 ctgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgacca 38644014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 373
Target Start/End: Original strand, 36694746 - 36695117
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  36694746 tgcagtgaagaaactgatttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattc 36694845  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36694846 atctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa 36694945  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36694946 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggact 36695045  T
Q  303 gaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36695046 gaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttca 36695117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11727437 - 11727060
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgac-ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727437 ggtgcagtcatgaaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 11727338  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  11727337 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtct 11727238  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11727237 taagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgagg 11727138  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727137 actgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 11727060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 8803594 - 8803964
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  8803594 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtata 8803693  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |    
T  8803694 ttcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtat 8803793  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||| | |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||       |    
T  8803794 taagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------g 8803886  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803887 gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 8803964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 7890735 - 7891100
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890735 ggtgcggtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 7890834  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7890835 tcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatctt 7890934  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7890935 aagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgagga 7891034  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7891035 ccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtt---------atttttgatgttatagtgttaacttcac 7891100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 30654361 - 30654737
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  30654361 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatata 30654459  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||    
T  30654460 ttcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtct 30654559  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  30654560 taagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaag 30654659  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30654660 gctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 30654737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 10554979 - 10555356
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaag-ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatag 99  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  10554979 tatggtgcggtcagaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatag 10555075  T
Q  100 t--aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 194  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555076 tgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 10555175  T
Q  195 aatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 294  Q
    | ||  |||||||||  |||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555176 agtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 10555273  T
Q  295 tgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10555274 tgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 10555356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 466244 - 465878
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466244 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 466145  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||            
T  466144 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtg-------- 466054  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  466053 -agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga 465955  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  465954 ctgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcacca 465878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12876515 - 12876148
Alignment:
Q  11 tcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatcta 110  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12876515 tcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatcta 12876416  T
Q  111 gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt-aagtgt 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12876415 gtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgt 12876316  T
Q  207 tacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 306  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876315 tacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 12876216  T
Q  307 ttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12876215 ttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttca 12876148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 31933661 - 31934040
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31933661 tatggtgcagttgggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataat 31933760  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||   || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31933761 aattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataat 31933860  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31933861 tttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataa 31933960  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||| |||| || |||  ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31933961 tgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcacca 31934040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 4132461 - 4132750
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4132461 tatggtgcagtcagcaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagt 4132560  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4132561 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 4132660  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132661 cttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 55 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864184
Alignment:
Q  55 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  155 tg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaatt 251  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9864310  T
Q  252 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacattt 350  Q
    | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  9864309 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 9864210  T
Q  351 ttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||    
T  9864209 ttgatactatagtgttaatttcacca 9864184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Original strand, 1953766 - 1954084
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1953766 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 1953865  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  1953866 tcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtctt 1953965  T
Q  201 aagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgag 298  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1953966 aagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgag 1954065  T
Q  299 gactgaacttttgatgcca 317  Q
    | |||||||||||||||||    
T  1954066 ggctgaacttttgatgcca 1954084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40862824 - 40862455
Alignment:
Q  12 caggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatcta 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  40862824 caggaaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatcta 40862725  T
Q  111 gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40862724 gtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgtt 40862625  T
Q  208 acactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 307  Q
    ||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  40862624 acactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaact 40862526  T
Q  308 tttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattaca-tttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40862525 tttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcacca 40862455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44869907 - 44869591
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44869907 tgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattc 44869808  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  44869807 atctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaa 44869708  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  44869707 gtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgat 44869609  T
Q  302 tgaacttttgatgccatt 319  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  44869608 tgaacttttgatgtcatt 44869591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33906621 - 33906316
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33906621 gtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaatt 33906524  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  33906523 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctta 33906424  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    ||||||||||||| |||  | | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33906423 agtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagac 33906324  T
Q  302 tgaacttt 309  Q
    ||||||||    
T  33906323 tgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 35459491 - 35459807
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35459491 tgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattc 35459590  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |   |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35459591 atctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaa 35459690  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||| | | |||||| | | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35459691 gtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggact 35459790  T
Q  303 gaacttttgatgccatt 319  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  35459791 gaacttttaatgtcatt 35459807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 39098897 - 39099211
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||| ||| |||| ||| ||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39098897 ggtgcaatcatgaaactgatttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaat 39098996  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  39098997 tcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 39099096  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| | |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39099097 aagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgagga 39099196  T
Q  301 ctgaacttttgatgc 315  Q
    |||||||||||||||    
T  39099197 ctgaacttttgatgc 39099211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307659
Alignment:
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc--tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacattttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 13307837  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13307836 taagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatgggg 13307737  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13307736 actgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 13307659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35859346 - 35859160
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35859346 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaat 35859247  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859246 tcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18259494 - 18259233
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |    
T  18259494 tatggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaat 18259395  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   | |||||||||||||  || ||| ||||||  |||||        
T  18259394 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga---- 18259299  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 263  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  18259298 cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 315
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911080
Alignment:
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg--tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacact 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgcatctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacact 41910994  T
Q  230 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  41910995 taaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgc 41911080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 219
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149912
Alignment:
Q  62 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  159 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg----tcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150259
Alignment:
Q  208 acactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 307  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  308 tttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||| | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcacca 1150259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12587978 - 12587812
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587978 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 12587879  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatga 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587878 gcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 34951835 - 34952020
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951835 ggtgcaatcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 34951934  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 186  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951935 tcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Original strand, 24823200 - 24823395
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823200 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 24823299  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||   |||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||    
T  24823300 acttacatgtactattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacac 24823391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 43025958 - 43025725
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 256  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43025958 tctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagatt 43025859  T
Q  257 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgat 355  Q
    || |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||| ||||||  ||| ||| ||| |||  ||| |||||||    
T  43025858 aaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgat 43025759  T
Q  356 gttatagtgttaacttcaccatataattttcctt 389  Q
      ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43025758 actatatcgttaacttcaccataaaattttcctt 43025725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33198214 - 33198062
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33198214 ggtgcaatcatgaaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 33198115  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  33198114 tcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttg 33198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41362837 - 41362723
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41362837 tatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagt 41362738  T
Q  101 aattcatctagtaat 115  Q
    |||||||||||||||    
T  41362737 aattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41362703 - 41362554
Alignment:
Q  225 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttaca 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||    
T  41362703 acacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactataca 41362604  T
Q  324 aacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  41362603 aatagtggggtgttactcactacattttt-atg--ctagtgttaacttcacca 41362554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Original strand, 34952033 - 34952185
Alignment:
Q  225 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttaca 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | ||||    
T  34952033 acacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtaca 34952132  T
Q  324 aacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| ||| | |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34952133 aacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgacca 34952185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 674 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 5871394 - 5871260
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  5871394 attataccttcattttaatccaccaataaattcctattttttcgcacacattttatttttccaatgaatttaatatgttatttttctcttgtaacaaaca 5871295  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcc 808  Q
     ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  5871294 attgtcaattattatttttttctccaacaaattcc 5871260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 674 - 787
Target Start/End: Original strand, 7694961 - 7695074
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7694961 attatatcctcattttaatctacaaataaattcctatttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttctcttgtaacaaaca 7695060  T
Q  774 gttgtcaattatta 787  Q
     |||||| ||||||    
T  7695061 attgtcagttatta 7695074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 674 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 34146824 - 34146692
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  34146824 attataccctcattttaatccaccaataaattcttatttttttgcacacattttatctttccaataaatttaatatgttatctttctttcgcaacaaaca 34146725  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaatt 806  Q
     |||||  |||||||| ||| | ||||||||||    
T  34146724 attgtctgttattatctttttctccaacaaatt 34146692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 27232229 - 27232096
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  27232229 attataccctcattttaatcaaccaataaattactagttttttgcacacattttatctttcaaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 27232130  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
     |||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  27232129 attgtcagttattatctttttctccaacaaattc 27232096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43026078 - 43025974
Alignment:
Q  13 aggaaattgacttttttggaaaa-gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 111  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  43026078 aggaaattgatttttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaa 43025979  T
Q  112 taatg 116  Q
    |||||    
T  43025978 taatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 780
Target Start/End: Original strand, 1530270 - 1530376
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1530270 attataccttcattttaatctacaaataacttcctatttttttccacacattttatcttttcaataaatttaatatgttatctttctttcgtaacaaaca 1530369  T
Q  774 gttgtca 780  Q
     ||||||    
T  1530370 attgtca 1530376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  95 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatga 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaaca---tggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7998483 - 7998401
Alignment:
Q  225 acacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  7998483 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 32234242 - 32234107
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  32234242 attataccctcatttcaatccaccaataaattcctatttttttgc--acactttatttttttaataaatttaatatgttatttttctctcgtaacaaaca 32234145  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||| | || ||||| ||| | | |||||||| ||||    
T  32234144 attgttagtttttatctttttctctaacaaatttctat 32234107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 11087717 - 11087585
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  11087717 attatatcctcattttaatccaccaataaattcttattttttt-catacattttatctttttaataaatttaacatgttatctttctcttataacaaaca 11087619  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
     |||||| ||| |||| ||| | |||||||||||    
T  11087618 attgtcagttactatctttttctccaacaaattc 11087585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33198031 - 33197947
Alignment:
Q  223 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33198031 taacacttaaaacaaggtaggataaaat--------gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3742288 - 3742208
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3742288 attataccctcaatttaatccaccaatatatctctactttttgacgcacactttatctttccaataaatttaatatgttat 3742208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 14897127 - 14897023
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  14897127 attatgccctcattttaatccaccaatatattcttattttcttgcacacgctttctcttttcaataaatttaatatgttatatttctctcgtaacaaaca 14897028  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  14897027 tttgt 14897023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 38402090 - 38401960
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| |||||    
T  38402090 attataccctcattttaatccaccgataaattcttaattttt-gcacacactttatctttccaataaacttaatatgttatcattctctcataacaaaca 38401992  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaatt 806  Q
     |||||  |||||||| ||| | ||||||||||    
T  38401991 attgtc-gttattatctttttctccaacaaatt 38401960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 685 - 749
Target Start/End: Original strand, 1256314 - 1256378
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1256314 attttaatccaccaataaattcttattttttagcacacactttatctttccaataaatttaatat 1256378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 3443387 - 3443464
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3443387 attataccctcattttaatccactaataatttcctattctttttcacacactttatctatccaataaatttaatatgt 3443464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 9455637 - 9455560
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9455637 attataccctcattttaatacactaataatttcttacttttttgcacacattttatttttccaataaatttaatatgt 9455560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Original strand, 29315303 - 29315383
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||   || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315303 attataccctcaatttaatccaccaatatatatttattttttggcacatactttatcttttcaataaatttaatatgttat 29315383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 35970594 - 35970514
Alignment:
Q  677 ataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35970594 ataccctcgttttaatccaccaatatattcct--ttttttccgcacactttctttttt-aataaatttaatatgttatctttct 35970514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13307994 - 13307931
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcat 64  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  13307994 tatggtgcaatcatgaaattgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 34039421 - 34039347
Alignment:
Q  686 ttttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  34039421 ttttaatccaccaatatattcctattttcttgcacacattttctctttccaataagtttaatatattatctttct 34039347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133162
Alignment:
Q  290 tactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||| ||  ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatg--ctagtgttaacttcacca 4133162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998478
Alignment:
Q  139 ggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactt 213  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 760
Target Start/End: Original strand, 35970147 - 35970229
Alignment:
Q  677 ataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  || |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35970147 ataccctcgttttaatccaccaatatattccta-tttttttcacacgctttctttttccaataaatttaatatgttatcattct 35970229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 807
Target Start/End: Original strand, 30887514 - 30887600
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |  ||| ||||| |||| | ||| |||| ||| | |||||||||||    
T  30887514 acactttatctttttaataaatttaatatgtaatttttctctcctaacaaacatttgttagttactatctttttctccaacaaattc 30887600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 747
Target Start/End: Original strand, 39140050 - 39140111
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  39140050 tttaatccaccaataaattccaattttttttgcacaaaatttatcttttcaataaatttaat 39140111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8300 - 7927
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8300 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 8201  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8200 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtctt 8101  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 8001  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8000 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27284134 - 27283756
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaag-ttaattatgattttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27284134 ggtgcagtcaggaaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagta 27284035  T
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  27284034 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagtt 27283935  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27283934 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgag 27283835  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283834 gactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 27283756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30055915 - 30055542
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055915 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 30055816  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30055815 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtctt 30055716  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30055715 aagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgagga 30055616  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30055615 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttca 30055542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37110262 - 37109884
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110262 ggtgcagtcaagaaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 37110163  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  37110162 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 37110063  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  37110062 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataat 37109963  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37109962 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 37109884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24212130 - 24211753
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24212130 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 24212031  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24212030 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtct 24211931  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    || |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24211930 taggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagg 24211831  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24211830 gctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 24211753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 31578834 - 31579218
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31578834 tatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagt 31578933  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31578934 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagt 31579033  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579034 cttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 31579133  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-ta-----caaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||| |||| ||      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579134 agactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 31579218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18797718 - 18797341
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797718 tatgatgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 18797619  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18797618 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 18797519  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797518 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 18797419  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  18797418 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcacca 18797341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 17842357 - 17842735
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842357 ggtgcagtcaagaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 17842456  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  17842457 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 17842556  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  17842557 aagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataat 17842656  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17842657 gactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 17842735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071218
Alignment:
Q  37 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  137 caggtattattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaaca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgttgtctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaaca 11071359  T
Q  237 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||  |||    
T  11071358 aggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtg 11071259  T
Q  336 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||  || |||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  11071258 ttactcgctatatttttgatgatatagtactaactttacca 11071218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7335184 - 7334809
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7335184 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagt 7335085  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |   |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  7335084 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataat 7334986  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7334985 cttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatga 7334886  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7334885 gaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttca 7334809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 9355596 - 9355975
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9355596 tatggtgcaggcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagc 9355695  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9355696 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 9355795  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9355796 tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatga 9355895  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | ||| ||||||||||| || | ||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  9355896 gaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcacca 9355975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Original strand, 32820830 - 32821202
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    |||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  32820830 gcagtcagaaaattaattttttta-aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattca 32820928  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32820929 tctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaag 32821028  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32821029 tgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactg 32821128  T
Q  304 aacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32821129 aacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcacca 32821202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 15612532 - 15612905
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15612532 ggtgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataat 15612631  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  15612632 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt 15612731  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  15612732 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattataggga 15612831  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15612832 ctgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-ctttgatgttatagtgttaacttcac 15612905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37347399 - 37347034
Alignment:
Q  14 ggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37347399 ggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagta 37347300  T
Q  114 atgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37347299 atgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 37347200  T
Q  211 ctttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 310  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37347199 ctttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaactttt 37347101  T
Q  311 gatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||| || | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37347100 gatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcacca 37347034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10481996 - 10481619
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10481996 tatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagt 10481897  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||   ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  10481896 aattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagt 10481797  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10481796 cttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataa 10481697  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     ||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10481696 agactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttca 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Original strand, 41764851 - 41765214
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41764851 ggtggagtcgggaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataat 41764950  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41764951 tcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 41765050  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765051 aagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 41765150  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagt 363  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41765151 ctggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21992004 - 21991646
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||         
T  21992004 gaaactgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct----- 21991914  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21991913 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacac 21991814  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21991813 tttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttg 21991714  T
Q  312 atgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccata 378  Q
    ||| || | ||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21991713 atgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccata 21991646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4583307 - 4582931
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  4583307 ggtgcagccagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaat 4583208  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4583207 tcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 4583108  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  4583107 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatgggga 4583008  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  4583007 ctgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcacca 4582931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23111576 - 23111202
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23111576 cagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattctt 23111477  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23111476 ctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 23111377  T
Q  205 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtagg--ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |    
T  23111376 gttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggtt 23111277  T
Q  303 gaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111276 gaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcacca 23111202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6546907 - 6546533
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546907 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 6546808  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||    
T  6546807 tcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatatt 6546708  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6546707 aagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggata 6546608  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     | |||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6546607 gtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcac 6546533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 374
Target Start/End: Original strand, 5657255 - 5657628
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgat-tttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    |||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5657255 tgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaatt 5657354  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  5657355 catctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtctta 5657454  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5657455 agtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagac 5657554  T
Q  302 tgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5657555 tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 5657628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8861673 - 8861301
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8861673 ggtgcagtgatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatt 8861574  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||    
T  8861573 tcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtctt 8861474  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  8861473 gagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatgggga 8861374  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 372  Q
    || |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8861373 cttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttc 8861301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29173908 - 29173552
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29173908 tgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattc 29173809  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc--tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29173808 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 29173709  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    ||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173708 tg-----------------taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactg 29173626  T
Q  304 aacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  29173625 aacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcacca 29173552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32432840 - 32432469
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  32432840 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataat 32432741  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  32432740 tcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtctt 32432641  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  32432640 aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggaga 32432541  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||||    
T  32432540 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcacca 32432469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687254
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtat 223  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |   | |   |||| ||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatc--ctt---aacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgt 22687405  T
Q  224 aacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttac 322  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||    
T  22687404 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcac 22687305  T
Q  323 aaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687304 aaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttca 22687254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 31520511 - 31520872
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31520511 tatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagt 31520610  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  31520611 aattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagt 31520710  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||                 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  31520711 cttaagtgtt-----------------acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg- 31520792  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||  ||  |||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31520793 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca 31520872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 37703268 - 37703551
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37703268 tatggtgcagtcagtaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagt 37703367  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37703368 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 37703467  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 281  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37703468 cttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 121 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258557
Alignment:
Q  121 caacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtg 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  218 gggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 317  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  318 tt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 38258557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 10358987 - 10359300
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10358987 ggtgcagttaagaaactaacttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaa 10359086  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  10359087 tcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtctt 10359186  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattaga-ttaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  10359187 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-g 10359285  T
Q  300 actgaacttttgatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  10359286 actgaacttttgatg 10359300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 15672532 - 15672830
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  15672532 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaat 15672631  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggta---ttattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  15672632 tcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagt 15672731  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672732 cttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 48928070 - 48928445
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48928070 ggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 48928169  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  48928170 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 48928269  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||  ||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  48928270 aagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-gga 48928368  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||  ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48928369 ctgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcacca 48928445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Original strand, 25691345 - 25691692
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  25691345 aaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttga 25691444  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| || |||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  25691445 acttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacac 25691544  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacg 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||     
T  25691545 ttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaaca 25691644  T
Q  328 gtgaggt-gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25691645 gtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcac 25691692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35353496 - 35353107
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35353496 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgat 35353397  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  35353396 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtctt 35353297  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| |    |  |  | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35353296 aagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctagtaa-tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatgggga 35353198  T
Q  301 ctg-aacttttgatgccat-ttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatataattttcctt 389  Q
    | | |||||||||| ||||  |||||||  || |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35353197 cagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccatagaattttcctt 35353107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 46480905 - 46481182
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46480905 gcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 46481004  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46481005 tctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaag 46481104  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 281  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  46481105 tgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 61 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165764
Alignment:
Q  61 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---t 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||   |    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  158 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 257  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 12165884  T
Q  258 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatg 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatg 12165784  T
Q  357 ttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||||||    
T  12165783 ctatagtgttaacttcacca 12165764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26980694 - 26980333
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26980694 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataat 26980595  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  26980594 tcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtctt 26980495  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||                 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  26980494 aagtgtt-----------------acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggga 26980412  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccata 378  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26980411 ctgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccata 26980333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 12390422 - 12390779
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  12390422 ggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaat 12390521  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||||    
T  12390522 tcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtctt 12390619  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||                 |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12390620 aagtgtt-----------------acacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgggga 12390702  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |  ||||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12390703 cataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 12390779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686054
Alignment:
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacc 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtg-ggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacc 43686054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44599054 - 44598738
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact---gattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| | || |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  44599054 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt 44598956  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |    
T  44598955 --ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 44598858  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  44598857 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgg 44598758  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca 317  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  44598757 ggattgaatttttgatgcca 44598738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 26587876 - 26588126
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26587876 gaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 26587975  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||        |||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  26587976 tgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacac 26588067  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 270  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26588068 tttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43925455 - 43925120
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925455 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 43925356  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||      |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || ||||| ||| |  |||    
T  43925355 ac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcac 43925262  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||        
T  43925261 ttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca---- 43925167  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  || | ||||||||||||    
T  43925166 gtgaggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcac 43925120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688406
Alignment:
Q  86 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatg 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  183 atattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaa 282  Q
    |||| || ||||| |||| | ||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  283 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  |||||| ||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33688317 ttgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44411310 - 44411507
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  44411310 tatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatatt 44411409  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411410 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 44411507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37704573 - 37704387
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37704573 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagt 37704474  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgat 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704473 aattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593327
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgt 216  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||             
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgtt--------- 32593185  T
Q  217 ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 316  Q
            ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  32593186 --------acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgatacc 32593276  T
Q  317 a-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 366  Q
    |   || |||| ||| |||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  32593277 accatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 376
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421528
Alignment:
Q  161 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  261 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtta 27421511  T
Q  360 tagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||    
T  27421512 tagtgttaacttcacca 27421528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704241
Alignment:
Q  159 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  259 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 376
Target Start/End: Original strand, 48928495 - 48928712
Alignment:
Q  159 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| || ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48928495 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaa 48928594  T
Q  259 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgt 357  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  48928595 gtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgt 48928693  T
Q  358 tatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  48928694 tatagtgttgacttcacca 48928712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 373
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413525
Alignment:
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    || |||||||||||  || | |||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttca 44413525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053498
Alignment:
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||||                 ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||    
T  38053651 ttaagtgttac-----------------acttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgag 38053577  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38053576 aactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcacca 38053498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  22 acttttttggaaaagttaattatga--ttttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaaca 173  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38258967 - 38258867
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258967 ggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 38258868  T
Q  104 t 104  Q
    |    
T  38258867 t 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 16197404 - 16197268
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16197404 attataccctcattttaatccatcaataaattccta-ttttttgcataaactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctcttgtaacaaaca 16197306  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||||| |||||||| |||   |||||||||||||||    
T  16197305 attgtcagttattatctttttttccaacaaattcctat 16197268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 674 - 809
Target Start/End: Original strand, 10534490 - 10534625
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  10534490 attataccttcattttaatccaccaataaattcctatttttttgcacacattttatttttttaataaatttaatatgttatctttatgtcgtaacaaaca 10534589  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
     |||||  |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10534590 attgtctgttattatctttttctccaacaaattcct 10534625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 41690339 - 41690202
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||    
T  41690339 attataccctcattttaattcacgaataaattcctactttttagcacaaactttatatttccaataaatttaatatgttatatttatctcgtaacaaaca 41690240  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41690239 attgtcaattattatctttttctccaacaaattcctat 41690202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Original strand, 3835318 - 3835417
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3835318 attatatcctcattttaatccacgaataaattcctatttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctcttgtaacaaaca 3835417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 674 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 4567936 - 4567822
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||    
T  4567936 attataccctcattttaatccaccactaaattctta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatatttctctcataacaaaca 4567838  T
Q  774 gttgtcaattattatc 789  Q
     |||||||||||||||    
T  4567837 attgtcaattattatc 4567822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 804
Target Start/End: Original strand, 8614587 - 8614717
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcct-acttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||    
T  8614587 attataccttcattttaatccaccaataaattcctcttttttttgcacacactttatctttctaataaa-ttaatatattatctttctctcgtaacaaac 8614685  T
Q  773 agttgtcaattattatcatttacgccaacaaa 804  Q
    | |||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  8614686 aattgtcagttattatctttttctccaacaaa 8614717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524476
Alignment:
Q  265 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagt 363  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  ||  |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  364 gttaacttcacca 376  Q
    |||||| ||||||    
T  26524464 gttaacatcacca 26524476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 675 - 784
Target Start/End: Original strand, 10025876 - 10025985
Alignment:
Q  675 ttataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacag 774  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |  ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10025876 ttatacccttattttaatccatcaatacattcatgttttttagcacacaatttctcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaacaaacaa 10025975  T
Q  775 ttgtcaatta 784  Q
    |||| |||||    
T  10025976 ttgttaatta 10025985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 28226869 - 28226735
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||| | ||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  28226869 attatacccttattttaatccaataatatattcctattgttttgcacacattatatctttccaataaatttaatatgttatctttctatcgtaacaaaca 28226770  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcc 808  Q
     |||| | ||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  28226769 attgttagttaatatctttttctccaacaaattcc 28226735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 2798921 - 2798784
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||    
T  2798921 attatacccttattctaatccaccaatatatttctatttttttgcacacactttctctttctaataaatttaatatgttatctttcgctcgtaacaaaca 2798822  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     || | ||||| |||  ||| | |||||||||||||||    
T  2798821 atttttaattactatatttttctccaacaaattcctat 2798784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 14771098 - 14771174
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14771098 attataccctcattttaatccactaataatttccta-ttttttgcacacactttatcttttcaataaattaaatatgt 14771174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 15221550 - 15221626
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15221550 attataccctcattttaatccactaataatttccta-ttttttgcacacactttatcttttcaataaattaaatatgt 15221626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 37124732 - 37124624
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  37124732 attataccctgattttaatcaacaaataaattcatt-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcataacaaaca 37124634  T
Q  774 gttgtcaatt 783  Q
     |||||||||    
T  37124633 attgtcaatt 37124624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 789
Target Start/End: Original strand, 35792574 - 35792688
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  35792574 attataccctcattt-actccaccaataaattcctattttttatttcacactttatctttctaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 35792672  T
Q  774 gttgtcaattattatc 789  Q
     |||| | ||||||||    
T  35792673 attgtaacttattatc 35792688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 47542010 - 47541922
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctac---ttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47542010 attatacct-cattttaatccaccaataaatttctctgttttttttgcgcacactttatctttccaataaatttaatatgttatatttct 47541922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 4962618 - 4962694
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4962618 attataccctcattttaatcaactaataatttccta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgt 4962694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 39618244 - 39618171
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  39618244 attataccctcattttaatccaccaataaattcttatttttttgcacatattttatctttccaataaatttaat 39618171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 371
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362292
Alignment:
Q  284 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 34362292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15643708 - 15643633
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15643708 attataccctcattttaatccactaataattttctatttttttgcacacattttatctttccaataaatttaatat 15643633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27723832 - 27723738
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||     |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  27723832 attataccctcattttaatccaccaataaatttctattt-----cacacactttatctttccaataaatttaatatgttatttttctcctgtaacaaaca 27723738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 33258972 - 33258861
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt----gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaa 769  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||  ||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  33258972 attataccctcattttaatccaccaatatattcctatttttttttttgcatacatttt---ttttcaataaatttaatatggtatctttctcttgtaaca 33258876  T
Q  770 aacagttgtcaatta 784  Q
    |||| |||| |||||    
T  33258875 aacatttgttaatta 33258861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 772
Target Start/End: Original strand, 39599424 - 39599521
Alignment:
Q  676 tataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatct--tttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  39599424 tataccctaattttaatccaccaatatattccta-ttttttgcacacactttctctcttttcaataaatttaatatcttatttttctttcgtaacaaac 39599521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 756
Target Start/End: Original strand, 1719595 - 1719665
Alignment:
Q  686 ttttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatct 756  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1719595 ttttaatccaccaataaattcttatatttttacatacactttctcttttcaataaatttaatgtgttatct 1719665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Original strand, 2273304 - 2273434
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||    
T  2273304 attatacccttattttaatgtaccaatatattcctattttttt-cacacactttctcttttcaataaattta--atgttatctttctctcgtaacaaaca 2273400  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
     |||| | |||||||| ||| |  ||||||||||    
T  2273401 attgttagttattatctttttcttcaacaaattc 2273434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 39429997 - 39430074
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| | ||||||||| || | ||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39429997 attatacccttattttaatcaactattaatttcctatttttgtgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgt 39430074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 39434503 - 39434426
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39434503 attatacccttattttaatcgactaataatttcctatttttgtgcacacactttatctttccaataaatttaatatgt 39434426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 319
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362193
Alignment:
Q  275 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgccatt 34362193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 809
Target Start/End: Original strand, 2271406 - 2271539
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||| || | |||| |  || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  2271406 attatatcctcattttaatctaccactaaattcttattgttttccacaccctttatctttccaat-aatttaatatgttat-tttctctcgtaacaaaca 2271503  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
     |||||| ||||||||  || | |||||||||||||    
T  2271504 attgtcagttattatctctttctccaacaaattcct 2271539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 12394767 - 12394664
Alignment:
Q  686 ttttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattat 785  Q
    |||||||||||||||||  || || | ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||    
T  12394767 ttttaatccaccaataacatcttattgttttgcacacattttagctttccaataaatttaacatgttatctttctctcttaacaaacaattgtcagttat 12394668  T
Q  786 tatc 789  Q
    ||||    
T  12394667 tatc 12394664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 24393764 - 24393840
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24393764 attataccgtcattttaatccactaataattttttaatttttt-cacacactttatctttccaataaatttaatatgt 24393840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 43369088 - 43368966
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattatt 786  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || || |||| | |||||    
T  43369088 tttaatccacaaatatatttctatttttttgcacacactct--cttttcaataaatttaatatgttatttttctctcgtaacaagcaattgttagttatt 43368991  T
Q  787 atcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    ||  ||| | |||||||||| ||||    
T  43368990 atttttttctccaacaaatttctat 43368966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 747
Target Start/End: Original strand, 46671702 - 46671775
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46671702 attataccctcattttaagccactaataattttctatttttttgcacacactttatttttccaataaatttaat 46671775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 722 - 778
Target Start/End: Original strand, 41747023 - 41747079
Alignment:
Q  722 cactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgt 778  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  41747023 cactttctcttttcaataaatttaatattttatctttctctcgtaacaaacaattgt 41747079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 752
Target Start/End: Original strand, 372404 - 372481
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgtt 752  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  372404 attatacccttattttaatctaccaatatattgctatttttttatgcacactttctcttt-caataaatttaatatgtt 372481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 4678933 - 4678857
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||| | |||||||||||||| || || ||| || |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4678933 attatatcctcattttaatccactaacaatttcata-ttttttgtacacactttatctttccaataaatttaatatgt 4678857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 19089251 - 19089624
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089251 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 19089350  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19089351 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtctt 19089450  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||||| |||| | || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089451 aagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 19089550  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19089551 ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttca 19089624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Original strand, 37663543 - 37663910
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663543 cagtcaggaaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 37663642  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37663643 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagt 37663742  T
Q  205 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 304  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663743 gttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 37663842  T
Q  305 acttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||    
T  37663843 acttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttca 37663910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 19440446 - 19440822
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440446 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaat 19440545  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  19440546 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaactt 19440645  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19440646 aagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgagga 19440745  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19440746 ctgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcacca 19440822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6864448 - 6864072
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864448 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 6864349  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6864348 tcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 6864249  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6864248 aagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgagga 6864149  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6864148 ctggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcacca 6864072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25184529 - 25184150
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25184529 tatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagt 25184430  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |   | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  25184429 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagt 25184330  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25184329 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 25184230  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     || |||||||| |||| |||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184229 agattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 25184150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 879343 - 879722
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  879343 tatggtgtagtcagaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataat 879442  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  879443 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 879542  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  879543 cttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 879642  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     || | ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  879643 agattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcacca 879722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 36493484 - 36493862
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36493484 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagt 36493583  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  36493584 aattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagt 36493683  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  36493684 cttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg 36493782  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||  || ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36493783 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca 36493862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 25700854 - 25701231
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  25700854 ggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaat 25700953  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| || |||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25700954 tcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatctt 25701053  T
Q  201 aagtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701054 aagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 25701153  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25701154 actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttacca 25701231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 32912377 - 32912754
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32912377 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 32912476  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  32912477 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 32912576  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  32912577 taagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagt 32912676  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||  |||| ||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912677 gctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32912754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 34361289 - 34361665
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34361289 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 34361388  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |    
T  34361389 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctt 34361488  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  34361489 taagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg 34361588  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34361589 -ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 34361665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Original strand, 55477717 - 55478069
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477717 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 55477816  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||    
T  55477817 acttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacac 55477916  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-----taca 323  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||    
T  55477917 ttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaaca 55478016  T
Q  324 aacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55478017 aacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 55478069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 29583998 - 29584372
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29583998 ggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaat 29584097  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  29584098 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtctt 29584197  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29584198 aagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaaga 29584297  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584298 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcacca 29584372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49376380 - 49376004
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49376380 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaat 49376281  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49376280 tcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 49376181  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49376180 aagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga 49376081  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49376080 ctgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcacca 49376004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 28002786 - 28003160
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28002786 tgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattc 28002885  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28002886 atctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaa 28002985  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28002986 gtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgact 28003085  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| || | ||||||| |||  ||  |||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28003086 gaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 28003160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 35020829 - 35021209
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata----g 99  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |    
T  35020829 ggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatag 35020928  T
Q  100 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35020929 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 35021028  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35021029 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacg 35021128  T
Q  297 aggactgaacttttgatgcc-atttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||  ||||||||| ||| || ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35021129 aggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcacca 35021209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 372
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948267
Alignment:
Q  34 aagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 133  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  134 ttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt--gttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |  |||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcac 34948122  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacg 327  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34948123 tttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaaca 34948222  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 372  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948223 gtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 34948267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50697644 - 50697281
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697644 gaaactgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 50697545  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaaca-tgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 210  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  50697544 tgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgca 50697445  T
Q  211 ctttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttt 310  Q
    ||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  50697444 ctttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaactttt 50697346  T
Q  311 gatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50697345 gatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcac 50697281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3043032 - 3042648
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3043032 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaat 3042933  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3042932 tcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 3042833  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga--------tgatac 292  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||        ||||||    
T  3042832 aagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatac 3042733  T
Q  293 tatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | | | ||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3042732 tctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcacca 3042648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42200143 - 42199766
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |    
T  42200143 ggtgcaatcaggaaattgacctttttgaaaaagttaatt-tgattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtata 42200045  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca-ggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||    
T  42200044 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc 42199945  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199944 ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 42199845  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | |||||||||| ||| |||| ||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42199844 ggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcacca 42199766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17173703 - 17173330
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  17173703 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 17173604  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17173603 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 17173504  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  17173503 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggaga 17173404  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17173403 ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttca 17173330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 46887956 - 46888328
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46887956 ggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 46888055  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |    
T  46888056 tcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-t 46888154  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  46888155 aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatgggga 46888254  T
Q  301 ctgaacttttgatgcc-atttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46888255 ctgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttca 46888328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23761484 - 23761114
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23761484 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataat 23761385  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  23761384 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 23761285  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    || ||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23761284 aaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 23761186  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23761185 ctgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17168126 - 17167753
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17168126 ggtgcagtaaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaat 17168027  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17168026 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtctt 17167927  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  17167926 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggaga 17167827  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17167826 atgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttca 17167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1815710 - 1815409
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1815710 gcagtcagaaaattgactttttaa-aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattca 1815612  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1815611 tctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaag 1815512  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815511 tgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactg 1815412  T
Q  304 aac 306  Q
    |||    
T  1815411 aac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7703922 - 7703554
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7703922 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaat 7703823  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  7703822 tcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt 7703723  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||| |||    
T  7703722 aagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgggga 7703631  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703630 ctgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 7703554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33341808 - 33341475
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    ||||||| || | ||||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341808 gcagtcatgatactgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 33341709  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33341708 tctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 33341609  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33341608 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactg 33341510  T
Q  304 aacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgtt 337  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  33341509 aacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37776071 - 37775706
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776071 ggtgcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 37775972  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||            
T  37775971 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg-------- 37775880  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  37775879 -agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggg 37775783  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
      ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  37775782 gggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcacca 37775706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 55240903 - 55241276
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55240903 ggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaat 55241002  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||    
T  55241003 ttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtctt 55241102  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  55241103 aagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatgggga 55241201  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  55241202 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcac 55241276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47254137 - 47253786
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47254137 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 47254038  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgt 216  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47254037 gcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 47253938  T
Q  217 ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc 316  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47253937 ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 47253846  T
Q  317 a-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | | || ||||  || |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47253845 actgtataaacaatg-ggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcacca 47253786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 33816316 - 33816707
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33816316 tgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattc 33816415  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33816416 atctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa 33816515  T
Q  203 gtgttacactttgtggggta-----------------taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 285  Q
    ||||||||||||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  33816516 gtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattg 33816615  T
Q  286 atgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||  |||||||| |||||| |||| |||||||| || | |||| |||||||||    
T  33816616 atgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcacca 33816707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 5047764 - 5048139
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||    
T  5047764 ggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataat 5047863  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5047864 ttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtctt 5047963  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  5047964 aagtgttacattttg-cgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaa 5048062  T
Q  301 ctgaacttttgatgccat-ttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5048063 ctgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcacca 5048139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27396999 - 27396653
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27396999 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttgg 27396902  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||| |||||  | ||||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||||    
T  27396901 acttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacac 27396802  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||     
T  27396801 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaaca 27396702  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  27396701 gtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcacca 27396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32579859 - 32579547
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32579859 ggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat 32579760  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||    
T  32579759 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtctt 32579660  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  32579659 aagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-ga 32579561  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    || |||||||||||    
T  32579560 ctaaacttttgatg 32579547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 30002439 - 30002798
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30002439 ggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaat 30002538  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||            
T  30002539 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg-------- 30002630  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||| || ||    
T  30002631 -agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaaga 30002721  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30002722 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcacca 30002798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32592497 - 32592133
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32592497 ggtgcagtcataaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaat 32592398  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||            
T  32592397 tcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatg-------- 32592306  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32592305 -agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga 32592207  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||  |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  32592206 ctgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttca 32592133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37288142 - 37287771
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatt-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37288142 ggtgcagtcatgaaagtgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaa 37288043  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  37288042 ttcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtct 37287943  T
Q  200 taagtgttacactttgt-ggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||        | |||||| |||||    
T  37287942 taagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatga 37287851  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37287850 ggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacca 37287771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764772
Alignment:
Q  22 acttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 121  Q
    ||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  122 aacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgg 218  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtgg 50764916  T
Q  219 ggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca- 317  Q
    ||| | ||||          |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  50764915 ggtgttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcac 50764826  T
Q  318 tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
      ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  50764825 cgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt--tagtgttaacttca 50764772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17272377 - 17272068
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17272377 ggtgcagtcatgaaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaat 17272278  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17272277 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtctt 17272178  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    ||    
T  17272177 aagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----ga 17272082  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  17272081 ctgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4598395 - 4598030
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4598395 ggtgcagtcatgaaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat 4598296  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||            
T  4598295 taatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtg-------- 4598204  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||    
T  4598203 -agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaagggga 4598106  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4598105 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca-ctttgatgttatagtgttaacttcacca 4598030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9139639 - 9139284
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9139639 gtgcagtgaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaat--tagattattgattaatgatcaatagtaatt 9139542  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||| |||                | ||||||    
T  9139541 cgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagt----------------ttatctta 9139458  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  9139457 agtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggat 9139358  T
Q  302 tgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  9139357 tgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcacca 9139284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 388
Target Start/End: Original strand, 4934026 - 4934387
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 118  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||     
T  4934026 tgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcg 4934125  T
Q  119 tgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttg 215  Q
    ||||||||           ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4934126 tgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttg 4934214  T
Q  216 tggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 315  Q
    || ||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4934215 tgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgc 4934314  T
Q  316 ca-tttacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatataattttcct 388  Q
    || | |||||||  | | ||||||||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4934315 cagtgtacaaacaatgggggtgttactcactacattttt--tatactagtgttaacttcaccatagaattttcct 4934387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011891
Alignment:
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  299 gactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcacca 38011891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 7152018 - 7152218
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    ||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7152018 tgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgctt 7152117  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  7152118 gcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgt 7152217  T
Q  217 g 217  Q
    |    
T  7152218 g 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26896501 - 26896285
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26896501 ggtgcagtcaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 26896402  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatctt-ggacttacaggtattattttatcgttg--tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||| |||    
T  26896401 ttcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaattttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtct 26896302  T
Q  200 taagtgttacactttgt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  26896301 taagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 46883911 - 46884177
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaag-ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46883911 ggtgcagtcaaaaaattgattttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 46884010  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||| |||   | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  46884011 ttcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-t 46884105  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgtta 272  Q
    ||||||||||| |||||| | | | |  |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46884106 taagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4205397 - 4205216
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  4205397 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 4205298  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205297 tcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39400417 - 39400236
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39400417 cagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcat 39400318  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400317 ctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23431967 - 23431830
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23431967 gtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatt 23431868  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggta 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23431867 catctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggta 23431830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025515
Alignment:
Q  20 tgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 119  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgattt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  120 gcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 376
Target Start/End: Original strand, 54499177 - 54499413
Alignment:
Q  145 attttatcgttgtc--tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtag 242  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||  | |||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||     
T  54499177 attttatcgttggcattttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtat 54499276  T
Q  243 gataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt--tacaaacggtgaggtgttac 339  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  54499277 gataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttac 54499376  T
Q  340 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  54499377 tcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 54499413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 376
Target Start/End: Original strand, 35025534 - 35025762
Alignment:
Q  144 tattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggt 240  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  35025534 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagat 35025633  T
Q  241 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg-ccatttacaaacggtgaggtgttac 339  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  || |||| ||| |||| |||    
T  35025634 aggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctac 35025725  T
Q  340 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35025726 tcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 35025762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38012674 - 38012568
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38012674 gtgcagtcaggaaactaatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt 38012575  T
Q  105 catctag 111  Q
    |||||||    
T  38012574 catctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397953
Alignment:
Q  208 acactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaact 307  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||  || |||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtt---------aattgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  308 tttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccata 378  Q
    ||||||| || | |||||||  || |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccata 39397953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 45666859 - 45666724
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||| |||||    
T  45666859 attataccctcattttaatccaccaataaattcctatttttttgcacacactttatcttttcaataaaattaacatgttatc--tctcttgtaacaaaca 45666762  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||| | || ||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  45666761 attgttagttgttatctttttctccaacaaatttctat 45666724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 9808171 - 9808039
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9808171 attatatcctcattttaatccactaataaattccta-ttttttgcacacactttatctttctaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 9808073  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
     || ||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  9808072 attatcagttattatctttttctccaacaaattc 9808039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 686 - 784
Target Start/End: Original strand, 24073413 - 24073511
Alignment:
Q  686 ttttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaatta 784  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  24073413 ttttaatccaccaataaatttctatttctttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatatttctctcgtaacaaacaattgtcaatta 24073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 809
Target Start/End: Original strand, 49299389 - 49299524
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||    
T  49299389 attataccctcattttaatccatcaataaattactatttttttgcactcactttatttttccaataaatttaatatgttatctttcactcgtaacaaaca 49299488  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
     |||||| |||||||| |||   | |||||||||||    
T  49299489 attgtcagttattatctttttatctaacaaattcct 49299524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 685 - 811
Target Start/End: Original strand, 38839975 - 38840100
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaatta 784  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  ||||| |||    
T  38839975 attttaatccaccaataaatttcta-ttttttgcacacaccttatctttccaataaatttaatatattatctttttcttgtaacaaacaaatgtcagtta 38840073  T
Q  785 ttatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||||    
T  38840074 ttatctttttctcaaacaaattcctat 38840100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 685 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 53393913 - 53393792
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaatta 784  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  53393913 attttaatccacctttaaattcctattattttgcacacactttatctattcaataattttaatatgttatatttttcttgtaataaacaattgtcagtta 53393814  T
Q  785 ttatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||| ||| | |||||||||||    
T  53393813 ttatc-ttttctccaacaaattc 53393792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050169
Alignment:
Q  113 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaacaaa 56050169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396365
Alignment:
Q  321 acaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 4396365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 38433909 - 38433985
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38433909 attataccctcattttaatccactaataatttccta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgt 38433985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 685 - 753
Target Start/End: Original strand, 37209623 - 37209691
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgtta 753  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37209623 attttaatccgccaataaattcttattcttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgtta 37209691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53124368 - 53124324
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53124368 ggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcacca 53124324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 2685173 - 2685087
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcgg-acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2685173 attatatcttcattttaaaccaccaataaattttta-ttttttgcgatacactttctcttttcaataaatttaacgtgttatctttct 2685087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 675 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 20782995 - 20782916
Alignment:
Q  675 ttataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| | |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20782995 ttataccctcattttaatccaccaataaaatcatatttttctacacacattttctcttttcaataaatttaatatgttat 20782916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 721 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 6949536 - 6949450
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||  |||| ||| ||| | |||||||||||    
T  6949536 acactttatctttccaataaatttaatatgttatctttcgttcataacaaacaattgtcggttataatctttttctccaacaaattc 6949450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17330970 - 17330885
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17330970 attataccctaattttaatgcatcaataaattcctattttttt-cacacactttatctttccaataaatttaatatattatttttct 17330885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 773
Target Start/End: Original strand, 19443114 - 19443208
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||  |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  19443114 attataccctcattttaatccaccaataaatttcta---tttaac--acattttatctttccaataaatttaatatgttatgtttctttcgtaacaaaca 19443208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Original strand, 54982224 - 54982361
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||   |||| ||||    
T  54982224 attatgccctcattttaatccac-aataaatttctattttttttgcacatactttatctttccaataaattcaataagttatatttctcacgtaacaaac 54982322  T
Q  773 agttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    | || ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  54982323 aattatcagttattatctttttctccaacaaattcctat 54982361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 55344136 - 55344059
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  55344136 attataccctcattttaatccactaataatttcctatatttttgcacacactttatctgtctaataaatttaatatgt 55344059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 747
Target Start/End: Original strand, 46430478 - 46430542
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46430478 tcattttaatctaccaataaatttctattttttagcacacactttatctttccaataaatttaat 46430542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Original strand, 47944028 - 47944103
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     || |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47944028 attataccctcattttaatccaccaataaattccta-----tttcacacactttatctttctaataaatttaatatgttat 47944103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 50721487 - 50721384
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | |||| |||| |||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  50721487 attatacccttatttcaatctaccaataaatttttagttttt-gcacacactttatctttccactaaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 50721389  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  50721388 attgt 50721384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 751
Target Start/End: Original strand, 24537984 - 24538047
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24537984 tttaatccactaataatttcctattttttt-cacacactttatctttccaataaatttaatatgt 24538047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 749
Target Start/End: Original strand, 37371090 - 37371166
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37371090 attataccctcaatttaatccactaataatttacttttttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatat 37371166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 41503114 - 41503034
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||  |||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41503114 attataccctcaatttaatccaccaatatatttatatattttggcacacactttatctttctaataaatttaatatgttat 41503034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 760
Target Start/End: Original strand, 1821184 - 1821223
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1821184 acactttatctttccaataaatttaatatgttatgtttct 1821223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 745
Target Start/End: Original strand, 9088813 - 9088884
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaattta 745  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  9088813 attataccctcattttaatccaccaaaaaattcttttttttttgcacacacttcatttttccaataaattta 9088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 25494303 - 25494215
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | |  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25494303 acactttatattttcaataaatttaat--gttatcttcatctcataacaaacaattgtcatttattatctttttctccaacaaattcctat 25494215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 766
Target Start/End: Original strand, 26625701 - 26625744
Alignment:
Q  723 actttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgta 766  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26625701 actttctctttccaataaatttaatatgttatctttctcttgta 26625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 1191266 - 1191233
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcc 707  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1191266 attatacctccattttaatccaccaataaattcc 1191233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4205209 - 4205156
Alignment:
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4205209 tacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttca 4205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 22349439 - 22349398
Alignment:
Q  729 tcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaa 770  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  22349439 tcttttcaataaattaaatatgttatctttctctcgtaaaaa 22349398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 747
Target Start/End: Original strand, 31104820 - 31104893
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  31104820 attataccctcattttaatcaaggaataaatttctaactttttgcacacactttcacttttcaataaatttaat 31104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 685 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 46250395 - 46250303
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgt 778  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| |  ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  46250395 attttaatccaccaatatattcata-tttttttcacacactttctctttccaataaattgagtatattatctttttttcgtaagaaacaattgt 46250303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 778
Target Start/End: Original strand, 53370173 - 53370222
Alignment:
Q  729 tcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgt 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||    
T  53370173 tcttttcaataaatttaatatgttatatttctctcgtaataaacatttgt 53370222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32216464 - 32216077
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216464 ggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 32216365  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  32216364 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 32216265  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32216264 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagga 32216165  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatataattttcc 387  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32216164 ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatagaattttcc 32216077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15383339 - 15382966
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15383339 cagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattca 15383240  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15383239 tctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaag 15383140  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15383139 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactg 15383040  T
Q  304 aacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15383039 aacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcacca 15382966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 376
Target Start/End: Original strand, 19899536 - 19899912
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-at 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19899536 gtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatat 19899635  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19899636 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtctt 19899735  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19899736 aagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaggg 19899835  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899836 ttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 19899912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32267443 - 32267069
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32267443 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaat 32267344  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32267343 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 32267244  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  32267243 gagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgagga 32267144  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32267143 gtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcac 32267069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2960157 - 2959784
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960157 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 2960058  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  2960057 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtctt 2959958  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2959957 aagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgagga 2959858  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2959857 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttca 2959784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8222533 - 8222166
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8222533 cagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattca 8222435  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8222434 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaag 8222335  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8222334 tgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactg 8222235  T
Q  304 aacttttgatgccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8222234 aacttttgatgccatt--gtaacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 8222166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 28564559 - 28564921
Alignment:
Q  13 aggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564559 aggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagt 28564658  T
Q  113 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttac 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  28564659 aatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgata--gttaagtgttac 28564756  T
Q  210 actttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 309  Q
    |||||  ||||| | |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564757 actttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 28564856  T
Q  310 tgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564857 tgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 28564921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37451694 - 37451319
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451694 ggtgcagtgaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 37451595  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37451594 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 37451495  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  37451494 aagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gagga 37451396  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37451395 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttacca 37451319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42721439 - 42721072
Alignment:
Q  9 agtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 108  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42721439 agtcagaaaattga-ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatc 42721341  T
Q  109 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgtta 208  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42721340 tagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttgtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgtta 42721241  T
Q  209 cactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 308  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42721240 tactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaactt 42721141  T
Q  309 ttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||  | | ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  42721140 ttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcacca 42721072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15752438 - 15752062
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||   |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752438 ggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 15752339  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15752338 tcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactctt 15752239  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752238 aagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 15752139  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15752138 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcacca 15752062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30254832 - 30254460
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30254832 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaat 30254733  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||    
T  30254732 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtctt 30254633  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| | |||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30254632 aagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgagga 30254533  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30254532 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg-tgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttca 30254460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23999760 - 23999380
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999760 tatggtgcagtcaggaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 23999661  T
Q  101 a-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  23999660 atattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag 23999561  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23999560 tcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatg 23999461  T
Q  297 aggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23999460 agggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcacca 23999380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51129255 - 51128894
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129255 gaaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 51129158  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  51129157 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacac 51129058  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51129057 tttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttg 51128958  T
Q  312 atgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51128957 atgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 51128894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10923139 - 10922760
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10923139 tatggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 10923040  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  10923039 aattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagt 10922940  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10922939 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatga 10922840  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10922839 ggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca 10922760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 9902821 - 9903194
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902821 ggtgcagtcaagaatttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 9902920  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9902921 tcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtctt 9903020  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  9903021 aagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtgga 9903120  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     ||||||||||||| || | ||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9903121 ttgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttca 9903194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 10181771 - 10182151
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  10181771 tatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagt 10181870  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca-ggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||   |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||     
T  10181871 aattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatag 10181970  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10181971 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatg 10182070  T
Q  297 aggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  10182071 aggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcacca 10182151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46931819 - 46931446
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  46931819 ggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatata 46931720  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  46931719 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 46931620  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46931619 taagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagg 46931522  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     ||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931521 gctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16416037 - 16415678
Alignment:
Q  22 acttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 121  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16416037 acttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgc 16415938  T
Q  122 aacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||    
T  16415937 aacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtgg 16415838  T
Q  219 ggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca- 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  16415837 ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccac 16415738  T
Q  318 tttacaaacggtga-ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | |||||||  | | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16415737 tgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 16415678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28770053 - 28769688
Alignment:
Q  13 aggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagt 112  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  28770053 aggaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagc 28769954  T
Q  113 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttac 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28769953 aatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttac 28769854  T
Q  210 actttgt-ggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactt 308  Q
    ||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28769853 actttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacct 28769754  T
Q  309 ttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28769753 ttgatgccattgtacaaacggtg-ggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcac 28769688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Original strand, 27227273 - 27227587
Alignment:
Q  25 tttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227273 tttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27227372  T
Q  125 atcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggt 221  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggt 27227472  T
Q  222 ataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ttt 320  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  27227473 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgt 27227572  T
Q  321 acaaacggtgaggtg 335  Q
    |||||| ||||||||    
T  27227573 acaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30327093
Alignment:
Q  37 ttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 135  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  136 acaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaa 232  Q
    | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||     
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttat 30326950  T
Q  233 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtga 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||      
T  30326951 aacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttg 30327050  T
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30327051 ggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcac 30327093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 374
Target Start/End: Original strand, 27763081 - 27763451
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attca 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27763081 cagtcaggaaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattta 27763180  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27763181 tctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaag 27763280  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 303  Q
    | ||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27763281 tattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctg 27763380  T
Q  304 aacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     |||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763381 gacttttgatgtcattctacaaactatg-ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 27763451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Original strand, 34012149 - 34012522
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012149 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 34012248  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |       
T  34012249 tcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt--- 34012345  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
      |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34012346 --gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatga 34012443  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccata 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34012444 ctgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcata 34012522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 27563669 - 27564046
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27563669 tatggtgcagtcaggaaactgatttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatatt 27563768  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  27563769 aattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagt 27563868  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      
T  27563869 cttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcg 27563968  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    | ||||||||||||||| || | ||||||| |||  |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27563969 gaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcac 27564046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 27266965 - 27267340
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  27266965 tatggtgcattcaggaaactgactttt-tggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagt 27267063  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27267064 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 27267163  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27267164 cttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 27267262  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  27267263 agactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatg--ctagtgttaacttcacca 27267340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4330690 - 4330323
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4330690 ggtgcagtcagacaactgatttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaat 4330591  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4330590 tcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtctt 4330491  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4330490 aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatga 4330391  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 366  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||  | | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4330390 ctgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtt 4330323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 36 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25161010 - 25160711
Alignment:
Q  36 gttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggact 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25161010 gttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggact 25160911  T
Q  135 tacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacactta 231  Q
    |||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  25160910 tacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacactta 25160811  T
Q  232 aaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtg 330  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25160810 taacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtg 25160711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238655
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 238499  T
Q  221 tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt- 319  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  238500 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 238599  T
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||| ||| | |||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  238600 tacaaacagtg-gatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcacca 238655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38823623 - 38823247
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823623 ggtgcagtcatgaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 38823524  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  38823523 tcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt 38823424  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38823423 aagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 38823324  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||| || | ||||||  ||| ||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38823323 ttgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaacca 38823247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47279578 - 47279222
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47279578 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaa 47279479  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  47279478 catcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggga 47279379  T
Q  221 tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tt 319  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactg 47279279  T
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  47279278 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcacca 47279222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15168505 - 15168122
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15168505 ggtgcagttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat 15168406  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||    
T  15168405 tcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagcctt 15168306  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15168305 aagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 15168206  T
Q  301 ctgaacttttgatgcc--------atttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||        |  ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15168205 ctgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 15168122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 47682258 - 47682636
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47682258 tatggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagt 47682357  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  47682358 aattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagt 47682457  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682458 cttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 47682557  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgag-gtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||||||||||| ||| | ||||| | ||| | ||||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  47682558 ggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcacca 47682636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 27532749 - 27533123
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532749 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaat 27532847  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||    
T  27532848 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtctt 27532947  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27532948 gagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 27533046  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||||| | ||||||  ||| | |||||| ||  | | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27533047 ttgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcacca 27533123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14758441 - 14758074
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14758441 ggtgcagtcacgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 14758342  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14758341 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 14758242  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||         ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  14758241 aa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatgggga 14758151  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14758150 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcacca 14758074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422684
Alignment:
Q  51 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattatttta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  151 tcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataa 247  Q
    ||||||   ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataa 18422814  T
Q  248 aattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattac 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||     
T  18422813 aattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttat 18422714  T
Q  347 atttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422713 atttttgatgttatagtgttaacttcacca 18422684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 338
Target Start/End: Original strand, 7078834 - 7079168
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7078834 cagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcat 7078933  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt 204  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  7078934 ctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagt 7079033  T
Q  205 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 304  Q
     ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7079034 cttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactga 7079133  T
Q  305 acttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgtta 338  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  7079134 acttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgtta 7079168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39393790 - 39393419
Alignment:
Q  7 gcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39393790 gcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 39393691  T
Q  107 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaag 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||| |||||||    
T  39393690 tctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaag 39393591  T
Q  204 tgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  39393590 tgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggatt 39393491  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     |||||||||||||| | |||||||  ||| || |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39393490 aaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttca 39393419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3535332 - 3534967
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||  |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3535332 ggtgtagtcatgaaactgattttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 3535233  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||         |    
T  3535232 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------t 3535142  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  3535141 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaagggga 3535042  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3535041 ctgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 3534967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22171100 - 22170807
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22171100 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaa 22171001  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22171000 catcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg 22170901  T
Q  221 tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 314  Q
    | | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22170900 tgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926199
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||      |||||||||||||||| || | ||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaataa------gtgttacactttgtggagtgttacac 41926345  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacg 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  41926344 ttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaaca 41926245  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||| | | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41926244 gtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttca 41926199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3309515 - 3309181
Alignment:
Q  51 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattatttta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  3309515 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactatttta 3309416  T
Q  151 tcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact-----ttgtggggtataacacttaaaacaaggtag 242  Q
    ||||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||     | ||| ||| | ||| ||||||||| ||||    
T  3309415 tcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtag 3309316  T
Q  243 gat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttact 340  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  3309315 gttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagtg-ggtgttact 3309217  T
Q  341 cattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3309216 cacaacacttttgatgttatagtgttaactttacca 3309181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Original strand, 31621326 - 31621694
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31621326 gaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctacta 31621425  T
Q  114 atgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaac-----atgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtg 205  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||     ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31621426 atgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtg 31621525  T
Q  206 ttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 305  Q
    | ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31621526 tcacacttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaa 31621624  T
Q  306 cttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     |||||||||||   ||||||  | | |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  31621625 tttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcac 31621694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Original strand, 37618705 - 37619039
Alignment:
Q  37 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618705 ttaattttgattttaatgtttgaat----tttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 37618800  T
Q  137 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaa 233  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||         |||||||||||| |||| | | |  |||| |    
T  37618801 catgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatga---------gtgttacactttatgggatgttatgcttata 37618891  T
Q  234 acaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg--atactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  37618892 acaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtg 37618991  T
Q  331 aggtg--ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618992 gggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcacca 37619039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1547669 - 1547320
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1547669 gaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaa 1547570  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||        |||| ||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  1547569 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacac 1547478  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1547477 tttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatc--------tgatgatactatgagaactgaacttttg 1547386  T
Q  312 atgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| |  |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1547385 atgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcacca 1547320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 11742132 - 11742493
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742132 tatggcgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 11742231  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||| |    
T  11742232 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagt 11742331  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||| ||||                 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  11742332 cttaattgtt-----------------acacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg- 11742413  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  11742414 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcacca 11742493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40885226 - 40884846
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaa-ttatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatag 99  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  ||| ||||| || | |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  40885226 tatggtgcaattagaaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatag 40885127  T
Q  100 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  40885126 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 40885027  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40885026 tcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactata 40884927  T
Q  297 aggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40884926 gggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcacca 40884846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 317
Target Start/End: Original strand, 33725380 - 33725683
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcattttta-aattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33725380 tgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat- 33725478  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
               | ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  33725479 -----------gtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctta 33725567  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33725568 aatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggac 33725667  T
Q  302 tgaacttttgatgcca 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  33725668 tgaacttttgatgcca 33725683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48353951 - 48353735
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48353951 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataat 48353852  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  48353851 tcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt 48353752  T
Q  201 aagtgttacactttgtgg 218  Q
     |||||||||||||||||    
T  48353751 -agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 218
Target Start/End: Original strand, 1359742 - 1359919
Alignment:
Q  44 tgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtat 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  1359742 tgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtac 1359841  T
Q  144 tattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgg 218  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359842 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 157 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48620881 - 48620672
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48620881 tctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagatt 48620791  T
Q  257 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgat 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  48620790 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 48620691  T
Q  356 gttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  48620690 gttatattgttaacttcac 48620672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21290012 - 21289829
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21290012 tatggtgcagttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataat 21289913  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgat 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||    
T  21289912 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttgat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759652
Alignment:
Q  100 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 291  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31963026 - 31962853
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  31963026 ggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtag 31962927  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaaca 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31962926 ttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 41117541 - 41117404
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41117541 attataccctcattttaatccaccaataaatttttatttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 41117442  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
       |||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  41117441 aacgtcacttattatctttttcttcaacaaattcctat 41117404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 683 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 39387078 - 39386994
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaa 767  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39387078 tcattttaatccacgaataaattcctacttttttgcacacactttatctttcgaataaattttatatgttatctttctcttgtaa 39386994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289729
Alignment:
Q  266 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacattttt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttt 21289729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 687 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 45925953 - 45925834
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattatt 786  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||| | |||||    
T  45925953 tttaatccaccaatatattcctatttttttgcacacactttctcttttcaataaatttaatatgttatctttctctcctaacaaacatttgttagttatt 45925854  T
Q  787 atcatttacgccaacaaatt 806  Q
    ||| ||| | ||||| ||||    
T  45925853 atctttttctccaaccaatt 45925834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 683 - 809
Target Start/End: Original strand, 13254223 - 13254349
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaat 782  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| |    
T  13254223 tcattttaatccatcaataaattcctattttttttcacacactatatctttccaataaatttaatatgttatttttctctcgtaacaaacaattgtcagt 13254322  T
Q  783 tattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
    | ||||| ||| | |||| ||||||||    
T  13254323 ttttatctttttctccaaaaaattcct 13254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 48620998 - 48620916
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 86  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48620998 ggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 677 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 1394906 - 1394823
Alignment:
Q  677 ataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttctt 761  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1394906 ataccctcattttaatccaccaatatattccta-tttttttcgcacactttctttttccaataaatttaatatgttaactttctt 1394823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 806
Target Start/End: Original strand, 6295259 - 6295391
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6295259 attataccctcatgttactccaccaataaatttctatttttttacacacattttatctttctaaaaaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 6295358  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaatt 806  Q
     |||||  |||||||  ||| | ||||||||||    
T  6295359 attgtcggttattatttttttctccaacaaatt 6295391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 685 - 760
Target Start/End: Original strand, 10430163 - 10430237
Alignment:
Q  685 attttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10430163 attttaatccaccaatatattcctacttttt-gcacacactttttctttccaataaatttaatacgttatctttct 10430237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 747
Target Start/End: Original strand, 4395596 - 4395669
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaat 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4395596 attataccatcattttaatccaccaatatattcctatttttctacgcacactttctctttccaataaatttaat 4395669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 31622845 - 31622922
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31622845 attattccctcattttactccactaataatttcctatttttttgcacacactttatctttacaataaatttaatatgt 31622922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Original strand, 36319508 - 36319616
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||    
T  36319508 attatactctcattttaatccacca-taagttccaatttttttgcacacaccttatctttccaataaatttaatatgttatatttatctcgtaacaaaca 36319606  T
Q  774 gttgtcaatt 783  Q
     |||||||||    
T  36319607 attgtcaatt 36319616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Original strand, 11795531 - 11795610
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11795531 attataccctcattttaatccaccaatatattactt-ttttttgcacacactttctctttccaataaatttaatatgttat 11795610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 687 - 767
Target Start/End: Original strand, 23698924 - 23699004
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaa 767  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  23698924 tttaatccaccaatatattcttattttttggcacacactttatcttttcaatgaatttaatatgttatatttatcttgtaa 23699004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 19270230 - 19270149
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatct 756  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19270230 attataccctcattttaatccaccaataaattgtta-ttttttgcataaactttctctttccaataaatttaatattttatct 19270149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 11237661 - 11237738
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11237661 attataccatcattttaatccactaataattttcaatttttttgcacacattttatctttccaataaatttaatatgt 11237738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 2752210 - 2752101
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||    
T  2752210 attataccctcattttaatcgaccaataagtttata-ttttttgcacacactttctctttcaaataaattttatgtgttgtctttctcttgtaataaaca 2752112  T
Q  774 gttgtcaatta 784  Q
     |||| |||||    
T  2752111 attgttaatta 2752101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30254935 - 30254894
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254935 ggtgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttca 30254894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 32769547 - 32769466
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttg-cggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32769547 attatatcctcaatttaatccaccaatatatctctatttttttggcacacactttatctttccaataaatttaatatgttat 32769466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 52415705 - 52415624
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttg-cggacactttatcttttcaataaatttaatatgttat 754  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||||| | |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52415705 attataccctcaatttaatccaccaatatatccctattttttcggcacacactttttctttccaataaatttaatatgttat 52415624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 43021510 - 43021437
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatat 749  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43021510 attatacccttagtttaatccaccaatatattcatatttttttgc--acactttctctttccaataaatttaatat 43021437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 42663236 - 42663274
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagtta 39  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42663236 tatggtgcagtcacgaaattgacttttttgaaaaagtta 42663274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 699563 - 699190
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  699563 ggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaat 699464  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  699463 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 699364  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  699363 aagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatga 699264  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  699263 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttca 699190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12910771 - 12910387
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12910771 tatggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagt 12910672  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||   |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  12910671 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagt 12910572  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12910571 cttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatga 12910472  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca------tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| ||      | ||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12910471 ggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcacca 12910387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22255591 - 22255218
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255591 cagtcaggaaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 22255492  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  22255491 ctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagt 22255392  T
Q  205 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 304  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22255391 gttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactga 22255292  T
Q  305 acttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattaca-tttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22255291 acttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcacca 22255218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 38527999 - 38528371
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527999 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 38528098  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38528099 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtctt 38528198  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38528199 aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ga 38528297  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | || ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38528298 ctgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 38528371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 31705374 - 31705749
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705374 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 31705473  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  31705474 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtctt 31705573  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||| |||||| | | | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31705574 aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagga 31705672  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705673 ctggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 31705749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 31786405 - 31786784
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31786405 tatggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagt 31786504  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  31786505 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagt 31786604  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786605 tttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 31786704  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31786705 ggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcacca 31786784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22981209 - 22980830
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22981209 tatggtgcagtcaggaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataat 22981110  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  22981109 aattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagt 22981010  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22981009 cttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 22980910  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| ||| ||| ||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22980909 ggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcacca 22980830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36867175 - 36866799
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36867175 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 36867076  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  36867075 tcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36866976  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||    
T  36866975 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcggga 36866876  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36866875 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcacca 36866799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40133798 - 40133422
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40133798 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 40133699  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  40133698 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 40133599  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  40133598 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatgggga 40133499  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  40133498 ctgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcacca 40133422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24886503 - 24886141
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24886503 tatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagt 24886404  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24886403 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 24886304  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||                 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24886303 cttaagtgtt-----------------acacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatga 24886221  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24886220 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcacca 24886141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 374
Target Start/End: Original strand, 17157797 - 17158166
Alignment:
Q  8 cagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcat 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17157797 cagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcat 17157896  T
Q  108 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17157897 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagt 17157996  T
Q  205 gttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga 304  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||    
T  17157997 gttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-ga 17158095  T
Q  305 acttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17158096 acttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35504773 - 35504427
Alignment:
Q  9 agtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35504773 agtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatc 35504674  T
Q  109 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35504673 tagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtg 35504574  T
Q  206 ttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 305  Q
    |||||||||||||||| | || |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  35504573 ttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaa 35504474  T
Q  306 cttttgatgccat-ttacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 351  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504473 cttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacatttt 35504427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 35511244 - 35511612
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35511244 ggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 35511343  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |       
T  35511344 tcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt--- 35511440  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
      |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  35511441 --gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatga 35511538  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  35511539 ctgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttca 35511612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Original strand, 23115992 - 23116357
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23115992 ggtgaagtcaggaaaatgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca- 23116090  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  23116091 -------gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 23116183  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  23116184 aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaa 23116283  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23116284 ctgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttca 23116357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 22973841 - 22974220
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973841 tatggtgcagtcagaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 22973940  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |    
T  22973941 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagt 22974040  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  22974041 cttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatga 22974140  T
Q  298 ggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | | |||||||||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22974141 gaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcacca 22974220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 7208628 - 7209001
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    |||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7208628 tgcagttaagaaactgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattc 7208727  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  7208728 atctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaa 7208827  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7208828 gtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggact 7208926  T
Q  303 gaacttttgatg-ccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7208927 gaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcacca 7209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27330717 - 27330343
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27330717 ggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaat 27330618  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  27330617 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtctt 27330518  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27330517 aagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaaga 27330418  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330417 ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcacca 27330343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33908645 - 33908270
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33908645 ggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat 33908546  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  33908545 t-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtctt 33908447  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33908446 aagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgagga 33908347  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33908346 ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcacca 33908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5837969 - 5837592
Alignment:
Q  3 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5837969 tggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaa 5837870  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||    
T  5837869 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtct 5837770  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  5837769 taagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggag 5837670  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5837669 actgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcacca 5837592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 381
Target Start/End: Original strand, 30969114 - 30969467
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||     
T  30969114 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttga 30969213  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  30969214 acttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacac 30969313  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||      
T  30969314 ttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaata 30969413  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccatataa 381  Q
    ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30969414 gtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataa 30969467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5830305 - 5829955
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830305 ggtgcagtcagaaaattgacatttt-ggaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 5830207  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  5830206 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttt 5830107  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  5830106 taagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgagg 5830016  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5830015 actaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19120272 - 19119896
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19120272 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaat 19120173  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  19120172 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtctt 19120073  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19120072 aagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatgggga 19119973  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19119972 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 19119896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 27318247 - 27318625
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatag 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  27318247 tatggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatag 27318346  T
Q  100 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataa 196  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||   ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27318347 taattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 27318444  T
Q  197 tcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27318445 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtg 27318544  T
Q  297 aggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27318545 agaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcacca 27318625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36860837 - 36860460
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36860837 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaat 36860738  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  36860737 tcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36860638  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacactt-aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  36860637 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatgggg 36860538  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  36860537 actgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcacca 36860460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 374
Target Start/End: Original strand, 35826276 - 35826619
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826276 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 35826375  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || | || |    
T  35826376 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgc 35826473  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacg 327  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||     
T  35826474 ttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaaca 35826572  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35826573 atgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcac 35826619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 25500688 - 25501064
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  25500688 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatt 25500787  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  25500788 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatctt 25500887  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25500888 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactataggga 25500987  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25500988 cttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttacca 25501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 8741646 - 8742025
Alignment:
Q  3 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 102  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8741646 tggtgcagtcatgaaacagacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat 8741745  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgat-attatgtgataatc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||| ||    
T  8741746 ttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtc 8741845  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8741846 ttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgga 8741945  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8741946 gactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca 8742025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8437376 - 8437003
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8437376 tgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 8437277  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8437276 atctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaa 8437177  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  8437176 gtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggact 8437078  T
Q  303 gaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| || | |||||||  || | ||||||||| |||| ||| || | ||||||||||| |||||||    
T  8437077 gaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcacca 8437003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35934309 - 35933942
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35934309 ggtgcagttatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataat 35934210  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  35934209 tcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtctt 35934110  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35934109 aagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtg 35934010  T
Q  300 actgaacttttgatgccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||| ||||||||||||| | |      |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  35934009 actggacttttgatgccactaa------gtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttca 35933942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 15992302 - 15992615
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15992302 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaat 15992401  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  15992402 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtctt 15992501  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15992502 aagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga 15992601  T
Q  301 ctgaacttttgatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  15992602 ctgaacttttgatg 15992615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7693628 - 7693267
Alignment:
Q  10 gtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatct 109  Q
    |||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7693628 gtcatgaaactgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatct 7693529  T
Q  110 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||         |||||    
T  7693528 agtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg---------agtgt 7693438  T
Q  207 tacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 306  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7693437 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaac 7693338  T
Q  307 ttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693337 ttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 7693267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9200637 - 9200270
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200637 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 9200538  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||            
T  9200537 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg-------- 9200446  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9200445 -agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagagga 9200347  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || ||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200346 ctaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 9200270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 43308420 - 43308784
Alignment:
Q  2 atggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 101  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43308420 atggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagta 43308519  T
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||  | ||||||||||        ||| ||    
T  43308520 attcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--------atagtc 43308611  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43308612 ttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgag 43308711  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43308712 gactgaacttttgatgccattgtacgaacagtg-ggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaactt 43308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39573224 - 39572861
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573224 ggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 39573125  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||||        |||| ||||| |||||| |||||||| |||     
T  39573124 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctc 39573033  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39573032 gagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaa 39572933  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| |||  ||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||    
T  39572932 ctgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaactt 39572861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 23954561 - 23954904
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  23954561 tatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagt 23954653  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc--tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||| ||||||| |     ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23954654 aattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 23954748  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  23954749 ttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgga 23954848  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt--tacaaacggtgaggtgttactcattacattttt 352  Q
     |||||||||||||||||| |  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  23954849 aactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatattttt 23954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32563553 - 32563189
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32563553 ggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataat 32563454  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||            
T  32563453 ttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg-------- 32563362  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  32563361 -agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaagggga 32563263  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | |||| || |||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32563262 ctgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 32563189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22020036 - 22019669
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22020036 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 22019937  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||            
T  22019936 tcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtg-------- 22019845  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  22019844 -agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaagggga 22019746  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || ||||||||||| || | |||||||  || |||||||||||  ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  22019745 cttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcacca 22019669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 14919312 - 14919663
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||         
T  14919312 gaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct----- 14919405  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
     | |||||| ||||||||||||    ||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  14919406 -gattgcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaa 14919500  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919501 tttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttg 14919600  T
Q  312 atgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14919601 atgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttca 14919663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 2888207 - 2888472
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2888207 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 2888306  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  2888307 tcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtctt 2888406  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtc 266  Q
    |||||||||||||| |||  | | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2888407 aagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 14409103 - 14409464
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14409103 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaat 14409202  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14409203 tcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 14409302  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||| ||   | ||           |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14409303 aagagt---agtt-----------acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ga 14409387  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||   ||  ||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14409388 ctgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcacca 14409464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42343134 - 42342775
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42343134 ggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaat 42343035  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||            
T  42343034 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg-------- 42342943  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42342942 -agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga 42342845  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaactt 371  Q
       |  |||||||| || | || |||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42342844 --aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 352
Target Start/End: Original strand, 21088576 - 21088880
Alignment:
Q  49 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  21088576 ttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattt 21088672  T
Q  149 tatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat 245  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  21088673 tatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggat 21088772  T
Q  246 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcatt 344  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||      
T  21088773 aaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcaca 21088872  T
Q  345 acattttt 352  Q
    ||||||||    
T  21088873 acattttt 21088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724527
Alignment:
Q  24 ttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  124 catcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
     || ||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||| || ||||||||| || |    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcg 15724682  T
Q  221 tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt- 319  Q
    | | | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  15724681 tgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattg 15724584  T
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724583 tataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcacca 15724527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 376
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429283
Alignment:
Q  66 tttaaattgttga---ttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tct 159  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  160 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 259  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgtt-----------------acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 1429165  T
Q  260 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtt 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |    
T  1429166 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgct 1429265  T
Q  359 atagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1429266 atagtgttaacttcacca 1429283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 13956126 - 13956415
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956126 ggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 13956223  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13956224 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtctt 13956323  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 292  Q
    ||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956324 aagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25669989 - 25669737
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669989 ggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 25669890  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||            
T  25669889 tcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg-------- 25669798  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 263  Q
     |||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25669797 -agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25889781 - 25889584
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25889781 tgcagtcaggaaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 25889682  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25889681 atctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8467142 - 8466782
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||| |||  ||| ||| ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8467142 tatggtgcaatcattaaactgattttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagt 8467043  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt--gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  8467042 aattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgttacacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtc 8466943  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||                 ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8466942 ttaagtgtt-----------------acatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggg 8466860  T
Q  299 gactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    || |||||||||||| ||| | |||||| |  | ||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8466859 gattgaacttttgataccactgtacaaa-gagggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcacca 8466782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 157 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26268331 - 26268111
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26268331 tctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgatt 26268232  T
Q  257 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgat 355  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  26268231 aattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgat 26268132  T
Q  356 gttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26268131 gctatagtgttaacttcacca 26268111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 356
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824599
Alignment:
Q  90 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 186  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  187 tatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 286  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  287 tgatactatgaggactga--acttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| || | ||||||| |||  ||||||||||  ||| ||||||||    
T  6824527 tgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 376
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112451
Alignment:
Q  175 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 274  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggttta-cacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  275 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 5112448  T
Q  374 cca 376  Q
    |||    
T  5112449 cca 5112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43254271 - 43254154
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254271 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 43254172  T
Q  101 aattcatctagtaatgct 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43254171 aattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 28416313 - 28416465
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28416313 ggtgcagtcatgaagctgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 28416412  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  28416413 tcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttg 28416465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26269222 - 26269074
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26269222 ggtgcagtcatgaaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaat 26269123  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 152  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  26269122 ttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 374
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416663
Alignment:
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  302 tgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 674 - 808
Target Start/End: Original strand, 8544196 - 8544330
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8544196 attataccctcattttaatccaccaataaattcctgattttttgcacacaccttatatttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaagaaaca 8544295  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcc 808  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  8544296 attgtcaattattatctttttctccaacaaattcc 8544330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 6428638 - 6428534
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6428638 attataccttcattttaatccaccaataagttcctatttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaaca 6428539  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  6428538 attgt 6428534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668677
Alignment:
Q  259 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgt 357  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  358 tatagtgttaacttcaccatataattttc 386  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttcaccatagaattttc 25668677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 32474725 - 32474589
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  32474725 attataccctcattttaatccaacaataaattcatattttttcgcaaacactttatctttccaataaatttaatatgttatcttt-tatcgtaataaaca 32474627  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||||| |||||||| ||| |  ||||||||| ||||    
T  32474626 attgtcagttattatctttttcttcaacaaatttctat 32474589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 785
Target Start/End: Original strand, 17201945 - 17202056
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||     
T  17201945 attataccctcattttaatccaccaataaattcctatttttttacacaaactttatctttccaataaatttaatatgttatttttctctcgtaacaaacg 17202044  T
Q  774 gttgtcaattat 785  Q
     |||||| ||||    
T  17202045 attgtcagttat 17202056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 676 - 808
Target Start/End: Original strand, 11991749 - 11991881
Alignment:
Q  676 tataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagt 775  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||  | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  11991749 tataccttcattttaatctaccaaaaaattcatgtttttttgcacaaactttatatttctaataaatttaatatgttatctttctcttgtaacaaacaat 11991848  T
Q  776 tgtcaattattatcatttacgccaacaaattcc 808  Q
    |||||  ||||||| |||||  ||| |||||||    
T  11991849 tgtcagatattatcttttacttcaaaaaattcc 11991881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 811
Target Start/End: Original strand, 12436203 - 12436339
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||     
T  12436203 attatacactcattttaatccaccaataaattcatatttttttaac-acactttattttttcaatatatttaatatgttatctttctctggtaacaaact 12436301  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
     |||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  12436302 attgtcggttattatctttttcttcaacaaattcctat 12436339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 678 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 19804309 - 19804176
Alignment:
Q  678 taccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttg 777  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||    
T  19804309 taccctcattttaatcgacaaataaattcttatttttttgtacacactttatctttccaacaaatttaatatgttatatttctctggtaacaaataattg 19804210  T
Q  778 tcaattattatcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    |||  ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19804209 tcagctattatctttttctccaacaaattcctat 19804176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28620600 - 28620492
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||    
T  28620600 attataccctcattttaatccgcca-taagttcctatttttttgcacacaccttatcttttcaataaatttaataagttatatttctctcgtaacaaaca 28620502  T
Q  774 gttgtcaatt 783  Q
     |||||||||    
T  28620501 attgtcaatt 28620492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Original strand, 39940188 - 39940273
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39940188 attataccctcattttaatccaccaataaattccta-tttttttcacacacttgatctttccaataaatttaatattttatttttct 39940273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 20202238 - 20202161
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20202238 attataccctcattttaattcactaataatttcatatttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgt 20202161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 36059619 - 36059695
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36059619 attataccctcattttaatccactaataatttccta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgt 36059695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 674 - 789
Target Start/End: Original strand, 18412835 - 18412950
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttc-aataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||    
T  18412835 attatacctttattttaatccaccaataaattttta-ttttttgcacatactttattttttttaataaatttaatatattatctttctctcgtaacaaac 18412933  T
Q  773 agttgtcaattattatc 789  Q
    | |||||| ||||||||    
T  18412934 aattgtcagttattatc 18412950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 674 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 1584253 - 1584179
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaata 748  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1584253 attataccctcattttaatccaccgataaatttctatttttctgcacacactttatctttccaataaatttaata 1584179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 789
Target Start/End: Original strand, 13219885 - 13219989
Alignment:
Q  687 tttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatctttt--caataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaatta 784  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| |||| |||||    
T  13219885 tttaatccaccaatatatttctatttttttgcacacactttatttttttccaataaatttaatatgttatctttttatcataacaaacaattgtgaatta 13219984  T
Q  785 ttatc 789  Q
    |||||    
T  13219985 ttatc 13219989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 13956427 - 13956480
Alignment:
Q  320 tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13956427 tacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttca 13956480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22255656 - 22255615
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255656 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 1584049 - 1583927
Alignment:
Q  688 ttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattatta 787  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| | ||||| |  ||| ||||| |||||  ||||||    
T  1584049 ttaatccaccaataaattcctatttttttgcacacactttatctttctaataaatttcata-gttgtatttctctcataacaaacaattgtccgttatta 1583951  T
Q  788 tcatttacgccaacaaattcctat 811  Q
    || ||| | |||| ||||||||||    
T  1583950 tctttttctccaataaattcctat 1583927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 760
Target Start/End: Original strand, 42673550 - 42673623
Alignment:
Q  686 ttttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  42673550 ttttaatccaccaataaattctta-ttttttgcacacactttatcattctaataaatttaatatgttatatttct 42673623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 16366120 - 16366043
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16366120 attataccctcattttaatcttctaataatttcatatatttttgcgcacactttatctttccaataaatttaatatgt 16366043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 376
Target Start/End: Original strand, 26317778 - 26317822
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26317778 ggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcacca 26317822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 781
Target Start/End: Original strand, 11825248 - 11825355
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||| |||| || ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||    
T  11825248 attataccctcaatgtaatccacaaatatattcttattttttggcacatactttatcttctcaataaatttaatatgttatttttatctcataaaaaaca 11825347  T
Q  774 gttgtcaa 781  Q
     |||||||    
T  11825348 attgtcaa 11825355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898148
Alignment:
Q  169 aaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg 220  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtgggg 11898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 1428932 - 1428978
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgat 47  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428932 tatggtgcactcatgaaactgacttttttggaaaagttaattatgat 1428978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898102
Alignment:
Q  277 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatg 11898102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 34853854 - 34853895
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaatt 42  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34853854 tatggtgcagtcgggaaactgacttttttggaaaagttaatt 34853895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004514
Alignment:
Q  336 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 16004514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 721 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 17200575 - 17200507
Alignment:
Q  721 acactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatc 789  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  17200575 acactttctctttctaataaatataatatgttatctttctttcgtaacaaacatttgttaattactatc 17200507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 711 - 811
Target Start/End: Original strand, 25612816 - 25612916
Alignment:
Q  711 ttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattccta 810  Q
    ||||||||  || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |  | |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  25612816 ttttttgcacacgcttcatctttagaataaatttaatatgttatctttctctcgtaagaaacaatcgctagttattatctttttctccaacaaattccta 25612915  T
Q  811 t 811  Q
    |    
T  25612916 t 25612916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5748516 - 5748478
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 370  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5748516 ggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaact 5748478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 12080407 - 12080445
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagtta 39  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12080407 tatggtgtagtcaggaaattgacttttttgaaaaagtta 12080445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1946249 - 1945871
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaa-gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta- 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1946249 ggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat 1946150  T
Q  102 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc 198  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  1946149 attcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 1946050  T
Q  199 ttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1946049 ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgag 1945950  T
Q  299 gactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945949 ggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 1945871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 3879710 - 3880086
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3879710 ggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaat 3879809  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3879810 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 3879909  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3879910 aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggga 3880009  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3880010 ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcacca 3880086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5627805 - 5627428
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5627805 ggtgcagtcaggaaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 5627706  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  5627705 ttcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 5627606  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5627605 taagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagg 5627506  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5627505 gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcacca 5627428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20768495 - 20768123
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768495 ggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 20768396  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  20768395 tcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatctt 20768296  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20768295 aagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgagga 20768198  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  || | || |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20768197 ctgaacttttgatgccactaacaaacaatg-gatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcacca 20768123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 6090953 - 6091329
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090953 ggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 6091052  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatc-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  6091053 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 6091152  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  6091153 taagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagt 6091252  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  6091253 actgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttacca 6091329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 375
Target Start/End: Original strand, 7234803 - 7235180
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg---attaatgatcaatagt 100  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  7234803 ggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagt 7234902  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  7234903 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagt 7235002  T
Q  198 cttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 297  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7235003 cttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga 7235102  T
Q  298 ggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacc 375  Q
     |||||||||||||||| ||   ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7235103 -gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcacc 7235180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 376
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318970
Alignment:
Q  37 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 136  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  137 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaa 233  Q
    |  ||| ||||| |||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaa 4318825  T
Q  234 acaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtga 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | ||||||| |||     
T  4318826 acaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 4318925  T
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318926 ggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 4318970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Original strand, 21016917 - 21017259
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21016917 aaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 21017016  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    || |||      ||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21017017 acgtac------tattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacac 21017110  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  21017111 ttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaata 21017210  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     || |||||||||||  |||||||| ||  || | ||||||||||||||    
T  21017211 atggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcacca 21017259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8513634 - 8513270
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  8513634 ggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaat 8513542  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  8513541 tcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt 8513442  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  8513441 aagtgttacactttgtagggt------gttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgggg 8513348  T
Q  300 actgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8513347 actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcacca 8513270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Original strand, 33892794 - 33893147
Alignment:
Q  15 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33892794 gaaactgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaa 33892893  T
Q  115 tgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||         ||||||||||    
T  33892894 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtg---------agtgttacac 33892984  T
Q  212 tttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 311  Q
    |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  33892985 tttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaactttta 33893083  T
Q  312 atgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 374  Q
    ||  |||| ||||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33893084 atatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 33893147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29182573 - 29182203
Alignment:
Q  5 gtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 104  Q
    |||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||    
T  29182573 gtgcaggcatgaaactaacttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaatt 29182477  T
Q  105 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  29182476 catctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtctta 29182377  T
Q  202 agtgttacactttgtgggg-tataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  29182376 agtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggaga 29182277  T
Q  301 ctgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
    |||||||||||||| || | || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29182276 ctgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 29182203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33619237 - 33618931
Alignment:
Q  13 aggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---taatgatcaatagtaattcatct 109  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  33619237 aggaaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatct 33619138  T
Q  110 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tct-----ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctta 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  33619137 agtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactctta 33619038  T
Q  202 agtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggac 301  Q
    ||||| |||| || | |||| | |||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33619037 agtgtcacac-ttctagggtgttacact--------ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaac 33618947  T
Q  302 tgaacttttgatgcca 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  33618946 tgaacttttgatgcca 33618931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6088945
Alignment:
Q  27 tttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 126  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacat 6089194  T
Q  127 cttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtat 223  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||| | ||      
T  6089193 tttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagt-- 6089096  T
Q  224 aacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ttta 321  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  6089095 ----gttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccacttta 6089000  T
Q  322 caaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||| ||| || ||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  6088999 caaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcacca 6088945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 376
Target Start/End: Original strand, 7055142 - 7055362
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 256  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  7055142 tctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatatt 7055241  T
Q  257 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgat 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  7055242 aagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttat 7055341  T
Q  356 gttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7055342 gttatagtgttaacttcacca 7055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 157 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15491872 - 15491654
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 256  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15491872 tctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 15491773  T
Q  257 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgat 355  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  15491772 aagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgat 15491673  T
Q  356 gttatagtgttaacttcac 374  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  15491672 gttacaatgttaacttcac 15491654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 376
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353505
Alignment:
Q  131 gacttacaggtattattttatcgttgtc---tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataaca 227  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  228 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaac 326  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  327 ggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     ||||| | ||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcacca 30353505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 7054543 - 7054696
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7054543 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtata 7054642  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7054643 ttcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttg 7054696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 674 - 806
Target Start/End: Original strand, 2437292 - 2437424
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||     
T  2437292 attataccatcattttaatccaccaataaattcctatttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatatgttatctatctctcataacaaact 2437391  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaatt 806  Q
     ||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  2437392 attgtcaattattatctttttcttcaacaaatt 2437424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 674 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 23411085 - 23410950
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |    
T  23411085 attataccctcattttaatccaccaatatattcctatttttttgcatacactttctctttccaataaatttaatatgttatctttctctcgtaacaaata 23410986  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcct 809  Q
     || | | ||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  23410985 tttcttagttactatctttttctccaacaaattcct 23410950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 674 - 806
Target Start/End: Original strand, 14093277 - 14093409
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||    
T  14093277 attataccctcattttaatccatcaataaacttctatttttttgcacacactttatccttccaataaatttaatatgtcatctttctctcgtaacaaaca 14093376  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaatt 806  Q
     |||||  |||||||| ||| |  |||||||||    
T  14093377 attgtcggttattatctttttctacaacaaatt 14093409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 25057117 - 25057014
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||    
T  25057117 attataccttcaatttaatccatcaataaattctta-ttttttgcacacactttatctttccaataaatttaatgtgttatctttctctcataacaaaca 25057019  T
Q  774 gttgt 778  Q
    |||||    
T  25057018 gttgt 25057014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 21526987 - 21527064
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21526987 attacaccctcattttaatccactaataatttcctatttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgt 21527064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 8049913 - 8049778
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt--gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaa 771  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||    
T  8049913 attataccctcattttgatccaccaataaattcttatttttttttgcacacactttatatttccaataaatttaatatgttatctttctctcataacaaa 8049814  T
Q  772 cagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    || |||| | |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  8049813 caattgttacttattatctttttctccatcaaattc 8049778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498470
Alignment:
Q  283 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcacca 18498470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 7972325 - 7972402
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7972325 attataccctcattttaatccactaataatttcctatttttttgcacacattttatctttccaataaatttaatatgt 7972402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Original strand, 6110690 - 6110794
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  || ||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  6110690 attatactttcattttaatccactaatgaattattattttcttgcacacactttccgttttcaataaatttaatatgtcatctttctcttgtaacaaaca 6110789  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  6110790 attgt 6110794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  36 gttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 91  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 31661003 - 31660917
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||   ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31661003 attataccttcattttaatctaccaattgattcctatctttctggacacactttctctttccaataaatttaatgtgttatctttct 31660917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 725 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 8049757 - 8049675
Alignment:
Q  725 tttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||   |||||||| ||| | |||||||||||    
T  8049757 tttatatttccaataaatttaatatgttatctttctctcataacaaacaattgttgcttattatctttttctccaacaaattc 8049675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 9353704 - 9353620
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |   |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9353704 attataccctcattttaa-ccaccaataagttcctattttttcgac-acacattatctttaaaataaatttaatatattatctttct 9353620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408559
Alignment:
Q  26 ttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 125  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  126 tcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggta 222  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||     
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtg 408422  T
Q  223 taacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-ttta 321  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||    
T  408423 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcatttta 408521  T
Q  322 caaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgtta 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  408522 caaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 513 - 171
Alignment:
Q  32 aaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 131  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 414  T
Q  132 acttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacac 228  Q
    || |||      |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  413 acgtac------tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacac 320  T
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt-tacaaacg 327  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  319 ttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaaca 220  T
Q  328 gtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||  ||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  219 gtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcacca 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 93873 - 94056
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  93873 ggtgcagtaaggaaacggacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaat 93971  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  93972 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 373
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94528
Alignment:
Q  177 ttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 276  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  277 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca-tttacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 373  Q
     |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  94431 catgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttca 94528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44367 - 43994
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44367 tgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 44268  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44267 attcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat-agcttaa 44169  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44168 gtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggact 44069  T
Q  303 gaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||| |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44068 gaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcacca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Original strand, 154420 - 154793
Alignment:
Q  6 tgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 105  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154420 tgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 154519  T
Q  106 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaa 202  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  154520 attcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat-agcttaa 154618  T
Q  203 gtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact 302  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154619 gtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggact 154718  T
Q  303 gaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||| |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  154719 gaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcacca 154793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 145787 - 146164
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-a 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |    
T  145787 ggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtata 145886  T
Q  103 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatct 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  145887 ttcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 145986  T
Q  200 taagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  145987 taagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaag 146086  T
Q  300 actgaacttttgatgccatt-tacaaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  146087 gctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaacca 146164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12321 - 11944
Alignment:
Q  4 ggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 103  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321 ggtgcagtcatgaaacttacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 12223  T
Q  104 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataatctt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  12222 tcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 12123  T
Q  201 aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga 300  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12122 aagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgagga 12023  T
Q  301 ctgaacttttgatgccatt--tacaaacggt-gaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||  | | |||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  12022 ctgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcacca 11944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 267692 - 267331
Alignment:
Q  1 tatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |         |    
T  267692 tatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------t 267602  T
Q  101 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgataat 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  267601 aattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 267502  T
Q  198 ctt-aagtgttacactttgtggggtataacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  267501 ctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattata 267402  T
Q  297 aggactgaacttttgatgcca-tttac-aaacggtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 365  Q
      |||||||||||||||| || | ||| |||| ||  | ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  267401 gagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 674 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 558
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||    
T  697 attataccctaattttaatccaccaataaatttctatttttttacacacactttatctttccaataaattaagtatgttatctttctctcgtaataaaca 598  T
Q  774 gttgtcaattattatcatttacgccaacaaattcctatat 813  Q
     |||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  597 cttgtctgttattatctttttctccaacaaattcctatat 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 674 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 257339 - 257253
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttct 760  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  257339 attataccctcatattaatccatcaataaattcctatttttttgcacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatccttct 257253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 271928 - 272006
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttg-cggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271928 attataccctcattttaatccactaataatttcttttttttttttcacacactttatcttttcaataaatttaatatgt 272006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 674 - 807
Target Start/End: Original strand, 5664 - 5798
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  5664 attataccatcattttaattcactaatatattcctaatttttttgcacacactttctcttttcaataaatttaatatgttatttttctcttgtaacaaac 5763  T
Q  773 agttgtcaattattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    | |||| | ||| |||| ||| | |||||||||||    
T  5764 atttgttagttactatctttttctccaacaaattc 5798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1327 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1327
Description:

Target: scaffold1327; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 683 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1195
Alignment:
Q  683 tcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaacagttgtcaat 782  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||| |    
T  1318 tcattttaatc-accaataaatttttattttttgacacacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttctctcttaacaaacaattgtcact 1220  T
Q  783 tattatcatttacgccaacaaattc 807  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||    
T  1219 tattatctttttctccaacaaattc 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0841 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0841
Description:

Target: scaffold0841; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4319
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaaca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  4215 attataccctcattttaatccaccaatatattcctttttttttgcacacactttctctttccaataaatttaatatattatctttctctcgtaacaaaca 4314  T
Q  774 gttgt 778  Q
     ||||    
T  4315 tttgt 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0841; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 778
Target Start/End: Original strand, 3897 - 4002
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctactttttt-gcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatctttcttttgtaaaaaac 772  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||  |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||    
T  3897 attataccctcattttaatctaacaatatattccttttttttttgcacacactttctctttccaataaatttaacatgttatttttctctcgtaacaaac 3996  T
Q  773 agttgt 778  Q
    | ||||    
T  3997 atttgt 4002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100994
Alignment:
Q  72 ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  229 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42429 - 42385
Alignment:
Q  332 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42429 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 42385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 100984 - 100948
Alignment:
Q  157 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  100984 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Original strand, 48552 - 48629
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48552 attataccctcattttaatccattaataattttctatttttttgcacacactatattttttcaataaatttaatatgt 48629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3896 - 3822
Alignment:
Q  682 ttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgttatcttt 758  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3896 ttcattttaatccaccaataaaatctt--tttttttcacacactttctctttccgataaatttaatatgttatcttt 3822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1130 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1130
Description:

Target: scaffold1130; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 707
Alignment:
Q  674 attataccttcattttaatccaccaataaattcctacttttttgcggacactttatcttttcaataaatttaatatgt 751  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  783 attataccctcaatttaatctactaataatttcctt-ttttttgcaaacattttatctttccaataaatttaatatgt 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University