View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20514_high_23 (Length: 255)

Name: NF20514_high_23
Description: NF20514
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20514_high_23
NF20514_high_23
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (18-255)||(39153143-39153380)
chr3 (38-255)||(29196188-29196405)
chr3 (37-255)||(31314594-31314810)
chr3 (39-255)||(9666270-9666485)
chr3 (37-255)||(23391710-23391928)
chr3 (37-255)||(22834805-22835021)
chr3 (45-255)||(44700290-44700498)
chr3 (38-255)||(29813212-29813431)
chr3 (37-253)||(29811019-29811239)
chr3 (37-251)||(23410129-23410344)
chr3 (38-255)||(760996-761212)
chr3 (51-255)||(7762415-7762622)
chr3 (57-255)||(29682508-29682707)
chr3 (37-255)||(40734647-40734867)
chr3 (50-255)||(9581432-9581640)
chr3 (58-255)||(19683706-19683907)
chr3 (39-223)||(21350811-21350991)
chr3 (50-254)||(7764615-7764822)
chr3 (37-255)||(51398963-51399184)
chr3 (37-223)||(32891284-32891460)
chr3 (38-255)||(40735532-40735751)
chr3 (38-255)||(5236256-5236476)
chr3 (50-255)||(16499178-16499371)
chr3 (37-253)||(9635921-9636142)
chr3 (39-223)||(27305519-27305698)
chr3 (39-251)||(37408612-37408827)
chr3 (62-255)||(5257966-5258162)
chr3 (38-223)||(51351940-51352121)
chr3 (39-219)||(2074883-2075059)
chr3 (66-255)||(5260149-5260341)
chr3 (62-182)||(9634644-9634764)
chr3 (71-255)||(32744288-32744455)
chr3 (62-255)||(45095313-45095509)
chr3 (63-255)||(23199960-23200156)
chr3 (154-223)||(53921422-53921491)
chr3 (63-255)||(23197767-23197957)
chr3 (37-85)||(4160057-4160105)
chr3 (37-108)||(37406989-37407059)
chr3 (62-108)||(801390-801436)
chr3 (39-94)||(6095390-6095446)
chr3 (37-94)||(43403528-43403586)
chr3 (45-94)||(34491505-34491554)
chr3 (45-94)||(47304575-47304623)
chr3 (39-94)||(40913591-40913646)
chr3 (37-74)||(44330950-44330987)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (37-255)||(14069631-14069852)
chr7 (37-255)||(14379659-14379880)
chr7 (39-255)||(41317238-41317453)
chr7 (39-251)||(19502332-19502547)
chr7 (39-255)||(47675936-47676155)
chr7 (38-255)||(41648813-41649030)
chr7 (38-255)||(36146211-36146427)
chr7 (39-255)||(38671025-38671241)
chr7 (39-255)||(8153491-8153705)
chr7 (39-254)||(1113807-1114021)
chr7 (45-255)||(47673750-47673963)
chr7 (36-254)||(18126794-18127018)
chr7 (38-255)||(23555190-23555411)
chr7 (39-255)||(31732768-31732988)
chr7 (37-255)||(4586310-4586532)
chr7 (62-255)||(24525328-24525521)
chr7 (40-255)||(48489580-48489798)
chr7 (39-255)||(25616003-25616223)
chr7 (39-212)||(26417511-26417685)
chr7 (45-255)||(43864393-43864607)
chr7 (38-255)||(27347966-27348186)
chr7 (39-223)||(31105200-31105381)
chr7 (46-255)||(495795-496002)
chr7 (46-197)||(30024569-30024714)
chr7 (39-249)||(48491733-48491944)
chr7 (62-255)||(29991203-29991399)
chr7 (62-255)||(35854064-35854262)
chr7 (39-221)||(23344155-23344332)
chr7 (62-249)||(4178929-4179119)
chr7 (157-255)||(12097789-12097886)
chr7 (39-182)||(31519116-31519258)
chr7 (81-223)||(23564910-23565050)
chr7 (38-223)||(36574323-36574504)
chr7 (45-159)||(12096972-12097084)
chr7 (62-187)||(48409027-48409153)
chr7 (62-180)||(25766779-25766898)
chr7 (37-94)||(6430441-6430498)
chr7 (53-223)||(4253349-4253516)
chr7 (140-255)||(39731519-39731638)
chr7 (81-223)||(40808768-40808909)
chr7 (37-94)||(4510337-4510394)
chr7 (37-94)||(4512179-4512236)
chr7 (45-94)||(2360778-2360827)
chr7 (146-212)||(43504058-43504123)
chr7 (45-94)||(22270266-22270315)
chr7 (38-94)||(30814715-30814771)
chr7 (169-255)||(2759127-2759216)
chr7 (62-108)||(43503974-43504020)
chr7 (63-108)||(24790304-24790349)
chr7 (62-94)||(6359768-6359800)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (46-255)||(13137787-13137995)
chr1 (38-255)||(40122000-40122215)
chr1 (38-255)||(50166979-50167194)
chr1 (39-255)||(833970-834186)
chr1 (39-255)||(28265359-28265573)
chr1 (37-255)||(28223219-28223440)
chr1 (39-255)||(45644158-45644373)
chr1 (40-255)||(30476247-30476465)
chr1 (39-255)||(196710-196926)
chr1 (38-255)||(28220025-28220245)
chr1 (62-255)||(50169037-50169229)
chr1 (37-255)||(4552446-4552656)
chr1 (37-255)||(3846919-3847140)
chr1 (39-240)||(1833677-1833876)
chr1 (37-251)||(10925379-10925592)
chr1 (38-255)||(8550583-8550805)
chr1 (37-255)||(37559662-37559886)
chr1 (37-255)||(41361063-41361280)
chr1 (37-223)||(23555069-23555254)
chr1 (68-255)||(3157014-3157205)
chr1 (46-255)||(49918499-49918711)
chr1 (45-255)||(3189480-3189706)
chr1 (45-255)||(3198297-3198523)
chr1 (45-255)||(3207136-3207362)
chr1 (39-251)||(46065071-46065278)
chr1 (45-255)||(13659157-13659355)
chr1 (37-223)||(16455801-16455986)
chr1 (37-255)||(31659387-31659608)
chr1 (39-251)||(37503362-37503572)
chr1 (38-254)||(44455310-44455529)
chr1 (37-255)||(20762822-20763039)
chr1 (45-223)||(15820487-15820655)
chr1 (39-223)||(927785-927964)
chr1 (82-207)||(8870570-8870695)
chr1 (62-255)||(13316174-13316370)
chr1 (63-255)||(51765547-51765744)
chr1 (39-223)||(37282498-37282679)
chr1 (93-232)||(5460079-5460215)
chr1 (81-207)||(44646655-44646779)
chr1 (81-207)||(44650013-44650137)
chr1 (82-132)||(36683885-36683935)
chr1 (37-86)||(19752985-19753034)
chr1 (63-108)||(40282682-40282727)
chr1 (78-108)||(20622071-20622101)
chr1 (222-255)||(19072918-19072951)
chr1 (222-255)||(19120808-19120841)
chr1 (45-94)||(19754787-19754836)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (39-255)||(26175436-26175655)
chr4 (37-255)||(46147193-46147410)
chr4 (45-255)||(52467163-52467373)
chr4 (37-255)||(12743726-12743944)
chr4 (45-255)||(47038222-47038430)
chr4 (39-255)||(48893443-48893657)
chr4 (39-255)||(36463196-36463408)
chr4 (38-255)||(45686986-45687201)
chr4 (37-254)||(5871970-5872185)
chr4 (37-255)||(12739351-12739569)
chr4 (45-255)||(56178442-56178655)
chr4 (38-255)||(9927257-9927477)
chr4 (62-255)||(29254643-29254838)
chr4 (37-251)||(34570212-34570429)
chr4 (110-255)||(36994673-36994816)
chr4 (39-255)||(31474300-31474512)
chr4 (46-255)||(37740774-37740987)
chr4 (50-255)||(48143193-48143405)
chr4 (38-255)||(5369880-5370101)
chr4 (37-255)||(52095160-52095381)
chr4 (39-251)||(54199708-54199922)
chr4 (38-246)||(52082462-52082673)
chr4 (39-255)||(6541987-6542198)
chr4 (37-223)||(4588139-4588322)
chr4 (98-255)||(5429828-5429989)
chr4 (45-223)||(37229535-37229709)
chr4 (62-255)||(13992113-13992311)
chr4 (52-223)||(5207664-5207828)
chr4 (37-255)||(24969814-24970032)
chr4 (38-120)||(29999627-29999709)
chr4 (201-254)||(13009409-13009462)
chr4 (62-223)||(48142209-48142364)
chr4 (38-94)||(50262486-50262542)
chr4 (37-223)||(5350089-5350270)
chr4 (39-86)||(36994851-36994898)
chr4 (50-94)||(2210040-2210084)
chr4 (151-223)||(29056539-29056610)
chr4 (143-206)||(31495209-31495271)
chr4 (39-94)||(41639746-41639801)
chr4 (105-209)||(3913775-3913876)
chr4 (66-108)||(31495130-31495172)
chr4 (85-224)||(44967677-44967816)
chr4 (86-141)||(51338337-51338392)
chr4 (149-223)||(37754874-37754947)
chr4 (222-255)||(12745300-12745333)
chr4 (81-161)||(5280635-5280714)
chr4 (148-212)||(29999719-29999782)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (27-255)||(538174-538401)
chr5 (45-255)||(32636973-32637186)
chr5 (37-255)||(42428228-42428449)
chr5 (39-255)||(28750455-28750674)
chr5 (38-255)||(42426034-42426254)
chr5 (37-255)||(533918-534129)
chr5 (38-255)||(31183120-31183342)
chr5 (40-255)||(13239901-13240118)
chr5 (38-255)||(5887234-5887453)
chr5 (39-255)||(8565748-8565965)
chr5 (39-255)||(19806512-19806729)
chr5 (39-255)||(13488352-13488569)
chr5 (38-255)||(30682721-30682941)
chr5 (62-255)||(37439291-37439489)
chr5 (39-255)||(16649635-16649849)
chr5 (39-255)||(39468348-39468568)
chr5 (39-255)||(33831829-33832046)
chr5 (37-197)||(42927103-42927262)
chr5 (37-255)||(30182738-30182959)
chr5 (62-255)||(13343210-13343406)
chr5 (63-255)||(36073866-36074061)
chr5 (62-255)||(25412910-25413106)
chr5 (62-212)||(16409675-16409825)
chr5 (37-212)||(26178082-26178257)
chr5 (81-255)||(16452229-16452402)
chr5 (37-119)||(3075547-3075629)
chr5 (54-212)||(26170962-26171119)
chr5 (39-94)||(40147555-40147610)
chr5 (37-108)||(9789019-9789090)
chr5 (39-94)||(38747298-38747353)
chr5 (94-204)||(9049209-9049317)
chr5 (54-108)||(18441457-18441510)
chr5 (39-138)||(12102534-12102637)
chr5 (51-94)||(28278609-28278652)
chr5 (45-147)||(42309830-42309931)
chr5 (222-255)||(10281741-10281774)
chr5 (50-91)||(40751298-40751339)
chr5 (50-94)||(40763300-40763344)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (37-255)||(723545-723763)
chr2 (38-255)||(34139572-34139789)
chr2 (39-255)||(39284985-39285202)
chr2 (39-255)||(33162254-33162469)
chr2 (39-255)||(11151395-11151610)
chr2 (37-255)||(36317811-36318028)
chr2 (39-255)||(2334218-2334436)
chr2 (39-255)||(29868018-29868237)
chr2 (73-255)||(11067454-11067635)
chr2 (37-255)||(11690650-11690858)
chr2 (39-247)||(42362505-42362713)
chr2 (38-255)||(14633627-14633844)
chr2 (39-228)||(24885765-24885953)
chr2 (38-255)||(36987874-36988094)
chr2 (38-255)||(14202223-14202440)
chr2 (39-255)||(36773711-36773926)
chr2 (47-255)||(38312389-38312600)
chr2 (37-255)||(17057167-17057388)
chr2 (37-255)||(17085150-17085371)
chr2 (37-221)||(2838132-2838315)
chr2 (39-255)||(6594804-6595024)
chr2 (56-255)||(5723072-5723274)
chr2 (62-255)||(36205487-36205683)
chr2 (62-255)||(45099904-45100100)
chr2 (38-223)||(11049734-11049913)
chr2 (62-255)||(4502955-4503151)
chr2 (140-255)||(1345615-1345730)
chr2 (62-212)||(4484150-4484300)
chr2 (82-223)||(12123434-12123573)
chr2 (45-232)||(13121938-13122120)
chr2 (54-212)||(32289764-32289921)
chr2 (62-212)||(30833544-30833694)
chr2 (83-223)||(26353363-26353495)
chr2 (39-223)||(17489958-17490136)
chr2 (82-172)||(36191103-36191192)
chr2 (27-135)||(41455184-41455290)
chr2 (39-108)||(41446433-41446500)
chr2 (63-108)||(6266994-6267039)
chr2 (45-90)||(26354127-26354170)
chr2 (186-223)||(41446320-41446357)
chr2 (40-94)||(45727249-45727305)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (37-255)||(6599121-6599335)
chr8 (37-255)||(6674574-6674788)
chr8 (39-255)||(40321229-40321442)
chr8 (45-255)||(41366424-41366634)
chr8 (45-255)||(43036572-43036785)
chr8 (39-255)||(5689420-5689635)
chr8 (39-254)||(1345176-1345389)
chr8 (38-255)||(12702430-12702653)
chr8 (45-255)||(3303476-3303689)
chr8 (39-255)||(15212935-15213155)
chr8 (39-250)||(30143494-30143708)
chr8 (39-255)||(4743027-4743233)
chr8 (37-255)||(19491501-19491718)
chr8 (37-255)||(4731807-4732028)
chr8 (45-222)||(18105882-18106058)
chr8 (39-223)||(10015259-10015443)
chr8 (62-255)||(42498344-42498541)
chr8 (39-255)||(33352299-33352518)
chr8 (63-255)||(34254154-34254349)
chr8 (62-255)||(17982803-17982999)
chr8 (62-255)||(27811427-27811626)
chr8 (63-255)||(34256330-34256525)
chr8 (62-251)||(44304009-44304201)
chr8 (39-255)||(4733855-4734075)
chr8 (48-255)||(1746028-1746237)
chr8 (116-222)||(18141999-18142105)
chr8 (82-223)||(1292311-1292452)
chr8 (37-253)||(19945156-19945375)
chr8 (62-255)||(31218407-31218603)
chr8 (38-202)||(3050924-3051090)
chr8 (39-223)||(8153967-8154147)
chr8 (146-255)||(30291757-30291865)
chr8 (39-172)||(8965492-8965621)
chr8 (44-223)||(3073685-3073862)
chr8 (38-206)||(32901988-32902152)
chr8 (63-212)||(2627935-2628084)
chr8 (38-180)||(4162692-4162833)
chr8 (39-219)||(11711805-11711980)
chr8 (39-227)||(29796131-29796313)
chr8 (37-122)||(3231644-3231728)
chr8 (38-99)||(7493296-7493353)
chr8 (74-107)||(6127876-6127909)
chr8 (63-108)||(25690260-25690305)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (37-255)||(14521476-14521697)
chr6 (39-255)||(26954091-26954305)
chr6 (45-244)||(3038733-3038931)
chr6 (66-255)||(33160177-33160370)
chr6 (39-255)||(16569171-16569389)
chr6 (66-255)||(9182857-9183050)
chr6 (39-215)||(28137211-28137386)
chr6 (62-255)||(5408892-5409087)
chr6 (62-255)||(5413217-5413412)
chr6 (116-255)||(33211066-33211204)
chr6 (37-255)||(16452125-16452347)
chr6 (57-255)||(31404492-31404693)
chr6 (62-253)||(5406025-5406216)
chr6 (62-253)||(5410350-5410541)
chr6 (48-255)||(30834343-30834554)
chr6 (62-180)||(2171349-2171468)
chr6 (38-94)||(602902-602958)
chr6 (62-212)||(3072579-3072728)
chr6 (37-94)||(17758346-17758404)
chr6 (63-108)||(412389-412434)
chr6 (52-99)||(22963522-22963568)
chr6 (52-99)||(23824825-23824871)
chr6 (56-94)||(3808512-3808550)
chr6 (38-94)||(21589252-21589309)
chr6 (45-94)||(22424621-22424670)
chr6 (39-94)||(17763313-17763369)
chr6 (37-104)||(257243-257308)
chr6 (62-93)||(5043951-5043982)
chr6 (149-223)||(4045598-4045671)
chr6 (52-96)||(33211014-33211058)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (38-255)||(20215-20434)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (39-240)||(1301-1502)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (45-255)||(148918-149116)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (62-254)||(114753-114950)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (62-255)||(1065-1262)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (62-255)||(434683-434880)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (63-255)||(10982-11179)
scaffold0491 (63-255)||(8556-8753)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (37-219)||(27248-27425)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (62-108)||(11866-11912)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (53-94)||(7646-7687)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (51-94)||(17806-17849)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 39153143 - 39153380
Alignment:
Q  18 gaatgtatcactcaaatgcattgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39153143 gaatgtatcactcaaatgcattgttgagaattcgggctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaa 39153242  T
Q  118 agtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga 217  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39153243 agtaaacacaagcggcagcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga 39153342  T
Q  218 aacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39153343 aacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcagtcc 39153380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 29196188 - 29196405
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaac 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29196188 ttgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 29196287  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29196288 aataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagat 29196386  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29196387 tgttgacccagttcggtcc 29196405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31314810 - 31314594
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31314810 attgttgtgaataccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtaataactaatattaaagtaaacacaagcaacaac 31314712  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31314711 aataataacaacacctaaatataatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagat 31314613  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31314612 tgttgactcagttcggtcc 31314594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 9666270 - 9666485
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |||    
T  9666270 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaataacaagcaactaca 9666368  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9666369 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaac-aaacacaccaaagatt 9666467  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9666468 gttgacccagttcggtcc 9666485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 23391710 - 23391928
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  23391710 attgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagaaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaac 23391809  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg-aaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23391810 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaaga 23391908  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23391909 ttgttgacccagttcggtcc 23391928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 22834805 - 22835021
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||    
T  22834805 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaggtaataac 22834903  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  22834904 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggaagaagagaaagaaaacacaccaaatat 22835003  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  22835004 tgttga-ccagttcggtcc 22835021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 44700290 - 44700498
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700290 gaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcatggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 44700388  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  44700389 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaggataaagagagaagagaaac-aaacacacgaaagattgttgacc 44700487  T
Q  245 cagttcggtcc 255  Q
     ||||||||||    
T  44700488 tagttcggtcc 44700498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29813431 - 29813212
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |    
T  29813431 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 29813332  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga--aacaaaacacaacaaag 234  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  29813331 aacaataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagggagaagagaggaac-aaacacatcaaag 29813233  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29813232 attgttgacccagttcggtcc 29813212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29811239 - 29811019
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||     
T  29811239 attgttgtgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaaatatgatttgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagagaacacaagcaataat 29811140  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagaga--aacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  29811139 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaac-aaacacacca 29811041  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggt 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29811040 aagattgttgacccaattcggt 29811019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 251
Target Start/End: Original strand, 23410129 - 23410344
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||     
T  23410129 attgttgtgaattcggacacaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggatcaaaggaaagtagtaacatatatcaaagtgaacacaagcaacaaa 23410228  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagt--gaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||    
T  23410229 aatattaacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaatataaac-aaacacaccaaag 23410327  T
Q  235 attgttgacccagttcg 251  Q
    |||||||||||| ||||    
T  23410328 attgttgacccaattcg 23410344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 761212 - 760996
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  761212 ttgttgtgaattcggactcaaa--tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataaca 761115  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagat 236  Q
    | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  761114 acaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 761015  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  761014 tgttaacccatttcagtcc 760996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7762622 - 7762415
Alignment:
Q  51 ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaaca 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||    
T  7762622 ggactcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaaca 7762524  T
Q  150 cctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgaccc 245  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  7762523 cctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacatcatagattgttcaccc 7762425  T
Q  246 agttcggtcc 255  Q
    ||||||||||    
T  7762424 agttcggtcc 7762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29682707 - 29682508
Alignment:
Q  57 aaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagat 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  29682707 aaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaaaattaaagtgaatacaagcaataacaacaatagcagcacctagat 29682608  T
Q  157 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29682607 ctaacctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagagaaacatacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 29682508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40734867 - 40734647
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||     
T  40734867 attgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaataat 40734769  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg-gagaagaga--aacaaaacacaacaa 232  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||  |||    
T  40734768 aaaaaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgcaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaac-aaacactccaa 40734670  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtcc 40734647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9581640 - 9581432
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaac 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||||||| |    
T  9581640 cggactcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagc 9581542  T
Q  149 acctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  9581541 acctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaac-aaacacatcaaagattgttcacc 9581443  T
Q  245 cagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||    
T  9581442 cagttcggtcc 9581432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Original strand, 19683706 - 19683907
Alignment:
Q  58 aaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  19683706 aaactcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagat 19683805  T
Q  157 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcgg 252  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19683806 ctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcgg 19683904  T
Q  253 tcc 255  Q
    |||    
T  19683905 tcc 19683907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 21350811 - 21350991
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21350811 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaataaagatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 21350909  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21350910 ta---acaacacttagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcataaccacaagcataagataaagtgagaagagaaacaaa 21350991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7764822 - 7764615
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaac 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  7764822 cggactcaaaact-acaccaatacaaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagc 7764724  T
Q  149 acctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  7764723 acctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacc 7764625  T
Q  245 cagttcggtc 254  Q
    ||||||||||    
T  7764624 cagttcggtc 7764615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51399184 - 51398963
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||| ||||| ||     
T  51399184 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagaaaacaatatcaaagtgagcactagcaataat 51399086  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||    
T  51399085 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacacca 51398987  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  51398986 aagattgttgaccaagttcggtcc 51398963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32891460 - 32891284
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||      
T  32891460 attgttgtgacttcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaaca-- 32891364  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
           |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  32891363 -------acaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaa 32891284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40735751 - 40735532
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |    
T  40735751 ttgttgtgaattcggtatcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 40735653  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg-gagaagaga--aacaaaacacaacaaa 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||| ||| ||||    
T  40735652 aacaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaac-aaatacaccaaa 40735554  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  40735553 gattgctgacccagttcggtcc 40735532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 5236256 - 5236476
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||| || |    
T  5236256 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtacaggaaagtagtaatcgatatcaaagtgaacacaagcaataatc 5236354  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  5236355 aacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaa 5236453  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5236454 agattgttgacccagtttggtcc 5236476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16499371 - 16499178
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaaca 149  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||         ||||||||    
T  16499371 cggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taacaaca 16499282  T
Q  150 cctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagtt 249  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16499281 cctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaatacaccaaagattgttgacccagtt 16499184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 9635921 - 9636142
Alignment:
Q  37 attgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  9635921 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataa 9636019  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagat-aaagggaga----agagaaacaaaacacaa 229  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||     
T  9636020 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc-ataaatcacaagcacaagataaaagggagagcagagagaaac-aaacacac 9636117  T
Q  230 caa-agattgttgacccagttcggt 253  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  9636118 caagagattgttcacccagttcggt 9636142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 27305519 - 27305698
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  27305519 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaata--aactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaacaacaa 27305615  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  27305616 caataacca-acctagatctaatctaggagt-aaagtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaatagagaagagaaacaaa 27305698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37408827 - 37408612
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||| || ||    
T  37408827 tgttgtgaattcggcctcaaag-tcacatcaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaaacaataatca 37408729  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||    
T  37408728 acaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaa 37408630  T
Q  234 gattgttgacccagttcg 251  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  37408629 gattgttcacccagttcg 37408612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 5257966 - 5258162
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5257966 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 5258065  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5258066 tctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtcc 5258162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Original strand, 51351940 - 51352121
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||    
T  51351940 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata-atactacgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaagcagcagca 51352037  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  51352038 acaataacaa-acctagatctaatctaggaatcaaa-tgaaaaacacaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa 51352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 2074883 - 2075059
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  2074883 tgttgtgaattcggacccaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataaccacaagcaacaataa 2074980  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaa 219  Q
     ||||| || ||| |||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2074981 caataataa-acccagatttaatctaggaaac-aagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaa 2075059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Original strand, 5260149 - 5260341
Alignment:
Q  66 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatcta 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  5260149 accaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaattta 5260248  T
Q  165 gtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5260249 ggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtcc 5260341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 182
Target Start/End: Original strand, 9634644 - 9634764
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  9634644 tcacaccaatacaaactatgat-tgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 9634742  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagc 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  9634743 tctaggaatcaaagtgaaaagc 9634764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 255
Target Start/End: Original strand, 32744288 - 32744455
Alignment:
Q  71 tacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatc 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32744288 tacaaactatgatgtatggagcaatagaaagtagtaaccaatttcaaa---------agcaacaacaatgataacaacacctagatctaatctagaaatc 32744378  T
Q  171 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||       ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32744379 aaagtga-------aaaaccacaagcaaaagataaagagatatgagaaac-aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 32744455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45095509 - 45095313
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  45095509 tcacatcaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacatagatctaa 45095410  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||  |||||||| | ||| | | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45095409 tctatgaatcaaagagtaaaacac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaac-aaatacgccaaagattgttcacccagttcggtcc 45095313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 23199960 - 23200156
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23199960 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataa-aacacctagatctaat 23200058  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaag-----agaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| || |||| |||||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| |     |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23200059 ctaggaaacaaaatgaaaaacac-aaaccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 23200156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 53921422 - 53921491
Alignment:
Q  154 gatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||    
T  53921422 gatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaatataaagagagaagagaaacaaa 53921491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 23197767 - 23197957
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||      ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23197767 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataataaag------caagcaataatcaacaataa-aacacatagatctaat 23197859  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga-aga----gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| || |||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||    ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23197860 ctaggaaacaaaatgaaaaacac-aaaccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 23197957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 85
Target Start/End: Original strand, 4160057 - 4160105
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgt 85  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160057 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgt 4160105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37407059 - 37406989
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407059 attgttgtgaattcggcctcaaag-tcacaccactacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 37406989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 801436 - 801390
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801436 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 801390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Original strand, 6095390 - 6095446
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095390 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 6095446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Original strand, 43403528 - 43403586
Alignment:
Q  37 attgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403528 attgttgtgaattccggactaaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 43403586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34491554 - 34491505
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34491554 gaattcggactcaaattttacaccaatacaaactataatgtgtggagcaa 34491505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 47304623 - 47304575
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47304623 gaattcggacttaaaa-tcacaacaatacaaactatgatgtgtggagcaa 47304575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40913646 - 40913591
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  40913646 tgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaacaataatgtgcggagcaa 40913591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 44330987 - 44330950
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaataca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44330987 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccagtaca 44330950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 14069631 - 14069852
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14069631 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaat 14069730  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | ||||||| ||||    
T  14069731 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaa 14069830  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14069831 gattgttgacccagttcggtcc 14069852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 14379659 - 14379880
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14379659 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaat 14379758  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | ||||||| ||||    
T  14379759 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaa 14379858  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14379859 gattgttgacccagttcggtcc 14379880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 41317238 - 41317453
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41317238 tgttgtgaattcgaactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtttggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 41317337  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  41317338 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaggagaaac-aaacacaccaaagattg 41317436  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  41317437 ttgacccagttcggtcc 41317453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19502547 - 19502332
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19502547 tgttgtgaattcagactcaaaactcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaa 19502448  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||| |||||    
T  19502447 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaag 19502349  T
Q  235 attgttgacccagttcg 251  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  19502348 attgttcacccacttcg 19502332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 47675936 - 47676155
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47675936 tgttgtgaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 47676035  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||||    
T  47676036 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaagagaggaac-aaacacaccaaag 47676134  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  47676135 attgttgatccagttcggtcc 47676155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 41648813 - 41649030
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41648813 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaagcaataaca 41648911  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagat 236  Q
    | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  41648912 acaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 41649011  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41649012 tgttgacccagttcggtcc 41649030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 36146211 - 36146427
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaac 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  36146211 ttgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 36146309  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36146310 aataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagat 36146408  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  36146409 tgttgacctagttcggtcc 36146427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 38671025 - 38671241
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38671025 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaacaaaaatcaaagtgaacacaagcaacgacaa 38671123  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  38671124 taatgacaacacctagatcaaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 38671223  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38671224 gttgacccagttcggtcc 38671241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8153705 - 8153491
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  8153705 tgttgggaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaacaacaa 8153607  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8153606 taataacaacacctagatctgatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaa-taaacacaccaaagattg 8153508  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||| ||||    
T  8153507 ttgacccagttcagtcc 8153491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1114021 - 1113807
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1114021 tgttgtgaattccgaatcaaaactcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaactaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 1113922  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1113921 caataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 1113823  T
Q  239 ttgacccagttcggtc 254  Q
    ||||| || |||||||    
T  1113822 ttgactcaattcggtc 1113807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 47673750 - 47673963
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47673750 gaattcggacacaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataa 47673849  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  47673850 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaagattgtt 47673948  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
    ||  |||||||||||    
T  47673949 gattcagttcggtcc 47673963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18127018 - 18126794
Alignment:
Q  36 cattgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  18127018 cattgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataa 18126919  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga------agagaaacaaaacaca 228  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      |||| ||| |||||||    
T  18126918 tcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagaggaac-aaacaca 18126820  T
Q  229 acaaagattgttgacccagttcggtc 254  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  18126819 ccaaagattgttgacccaggtcggtc 18126794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23555411 - 23555190
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  23555411 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 23555312  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||    
T  23555311 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacatcaa 23555213  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtcc 23555190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 31732768 - 31732988
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  31732768 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccagtacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataatca 31732867  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||| | || ||||    
T  31732868 acaataacaacctttagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-ctcaccaaa 31732966  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31732967 gattgttgacccagttcggtcc 31732988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4586532 - 4586310
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  4586532 attgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatgtaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataat 4586433  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    |||| ||| |||||||  |    
T  4586432 aaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacacga 4586334  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4586333 aagattgtcgacccagttcggtcc 4586310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 24525328 - 24525521
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaacaataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24525328 tcacatcaatacaaactatgatatgtgtagcaaagaaaagtagtaatcaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatcaaa 24525427  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24525428 tttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattattgacccagttccgtcc 24525521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48489798 - 48489580
Alignment:
Q  40 gttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caa 138  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| || |||    
T  48489798 gttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaataccaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacatgagcaataatcaa 48489700  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagaga--aacaaaacacaacaaag 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  48489699 caataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaac-aaacacaccaaag 48489601  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  48489600 attgtttacccagttcggtcc 48489580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25616223 - 25616003
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  25616223 tgttgtgaatacgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 25616125  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga-----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||| |||    
T  25616124 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaac-aaacacaccaa 25616026  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  25616025 agattgttcgcccagttcggtcc 25616003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26417685 - 26417511
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  26417685 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaataatca 26417586  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26417585 acaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggaga 26417511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43864607 - 43864393
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataata 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  43864607 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtggtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaata 43864508  T
Q  144 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||   |||||    
T  43864507 acagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccatctattgt 43864409  T
Q  240 tgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||    
T  43864408 tgacccagttcggtcc 43864393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27348186 - 27347966
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |    
T  27348186 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 27348088  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  27348087 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaac-aaacacaccaa 27347989  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27347988 agattgttgacccagttcggtcc 27347966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 31105200 - 31105381
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||      
T  31105200 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaac-- 31105296  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-acaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  31105297 -aataacaacaccaagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaagataaggagagaagagaaacaaa 31105381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 255
Target Start/End: Original strand, 495795 - 496002
Alignment:
Q  46 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 145  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  495795 aatttggactcaaaa-tcacactaatacaaattatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaataac 495893  T
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgaccc 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  495894 aacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaatagaaaatcacaagcaagagataaagagagaaaagaaac-aaacacaccaaagattgttgaccc 495992  T
Q  246 agttcggtcc 255  Q
     |||| ||||    
T  495993 ggttctgtcc 496002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 30024569 - 30024714
Alignment:
Q  46 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 145  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30024569 aattcggactcaaaa-tcataccaatataaactatgatg-----aacaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 30024662  T
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024663 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 30024714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48491944 - 48491733
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  48491944 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaataccaactataatgtgcggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 48491846  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  48491845 acaataacaacgcctagatctaatataggaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagaggaac-aaacacatcaaaga 48491747  T
Q  236 ttgttgacccagtt 249  Q
    ||||| ||| ||||    
T  48491746 ttgtttaccaagtt 48491733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29991399 - 29991203
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  29991399 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaa 29991300  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29991299 tataggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 29991203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35854262 - 35854064
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  35854262 tcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaa 35854163  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagat-aaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa-agattgttgacccagttcggtc 254  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  35854162 tctaggaagcaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaagagattgttcacccagttcggtc 35854065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23344332 - 23344155
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||     
T  23344332 tgttgtgaattcagacccaaaa-tcacatcaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatccaagtaaccacaagcaacaaca- 23344236  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaaca 221  Q
      ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  23344235 --ataacaaaacctagatttaatctacgaatcaaagtgaaaaacacaaaaccgcaagaaagagataaagagagaagagaaaca 23344155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4179119 - 4178929
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4179119 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4179020  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagtt 249  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4179019 tctaggaatcaaagtgaaaaacac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacctagtt 4178929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 12097789 - 12097886
Alignment:
Q  157 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12097789 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgacctagttcggtcc 12097886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31519258 - 31519116
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||| |||| || ||||| ||||||    
T  31519258 tgttgtgaatttggactcaaaactcacgccaatgaaaa-taagatgtgtggagcaaataaaaatagtaattaatatcaatgtaatcataagcagcaacaa 31519160  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31519159 taataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc 31519116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 223
Target Start/End: Original strand, 23564910 - 23565050
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23564910 gatgtgtggagtgaagaaaagtagtgaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaataa---caaaacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaa 23565006  T
Q  181 gctc-aaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
     | | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23565007 tcacaaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaa 23565050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Original strand, 36574323 - 36574504
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||| | || || ||||||    
T  36574323 ttgttgtgaattcagactcaattctcacaccaata--aacttagatgtgtggatcaaaggaaaatattaaccaatatcaaagtaatctcaggccacaaca 36574420  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  36574421 acaataacaa-acttagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaagagagaagaaaaacaaa 36574504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 12096972 - 12097084
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  12096972 gaattcggactcaaaa-tcacacca-tataaactatgatgcttggaataaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaataacaa 12097069  T
Q  145 caacacctagatcta 159  Q
    |||||||||||||||    
T  12097070 caacacctagatcta 12097084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48409153 - 48409027
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  48409153 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 48409054  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 187  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  48409053 tctaggtatcaaagtgaaaagcacaaa 48409027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 25766779 - 25766898
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25766779 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataacaaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 25766878  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  25766879 tctaggtatcaaagtgaaaa 25766898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6430498 - 6430441
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430498 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 6430441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 223
Target Start/End: Original strand, 4253349 - 4253516
Alignment:
Q  53 actcaaaa-ctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacc 151  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||| || |||    
T  4253349 actcaaaatctcacaccaata--aacttagatgtgtgtagcaaaagaaagtattaaccaatatcaaagtaacctcaggcaacaacaataataa-aaaacc 4253445  T
Q  152 tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  4253446 tagatctaatatagaaatc-aagcgaaaagtacaaaagcacaagcaaacgataaagagtgaagagaaacaaa 4253516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39731638 - 39731519
Alignment:
Q  140 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaaggga----gaaga-gaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||  ||| ||| |||||    
T  39731638 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 39731540  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  39731539 attgttcacccagttcggtcc 39731519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40808909 - 40808768
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaa-ggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaa 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||  | | ||||| ||    
T  40808909 gatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaacaaatatcaaagtattctcaagcaacaacaataataac-agacctaggtttaatctag-gacccaagtgtaa 40808812  T
Q  180 agctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  40808811 aacacaaaaccacaagcaaaagatatagagagaaaagaaacaaa 40808768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Original strand, 4510337 - 4510394
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4510337 attgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 4510394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Original strand, 4512179 - 4512236
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512179 attgttgtgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 4512236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Original strand, 2360778 - 2360827
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2360778 gaatttggactcaaaattcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 2360827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 212
Target Start/End: Original strand, 43504058 - 43504123
Alignment:
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43504058 aacagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 43504123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22270315 - 22270266
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22270315 gaattcggactcaaatttcacagcaatacaaactatgatgtgtggagcaa 22270266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30814771 - 30814715
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30814771 ttgttgtgaattcggactcaaatttcacaccagtacaaaatatgatgtgtggagcaa 30814715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Original strand, 2759127 - 2759216
Alignment:
Q  169 tcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagaga-aacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2759127 tcaaagttaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaagggagagaagagagaaagaaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtcc 2759216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 43503974 - 43504020
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43503974 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 43504020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24790349 - 24790304
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24790349 cacaccaatgcaaagtatgatgtgtggagcaacggaaagtggtaac 24790304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 94
Target Start/End: Original strand, 6359768 - 6359800
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6359768 tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaa 6359800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 255
Target Start/End: Original strand, 13137787 - 13137995
Alignment:
Q  46 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13137787 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataac 13137886  T
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgaccc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13137887 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaacctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacatcaaagattgttgaccc 13137985  T
Q  246 agttcggtcc 255  Q
    ||||||||||    
T  13137986 agttcggtcc 13137995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 40122000 - 40122215
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  40122000 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgcgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatctaagtgaacacaagcaacaaca 40122098  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40122099 ataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 40122197  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  40122198 gttgacctagttcggtcc 40122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 50166979 - 50167194
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50166979 ttgttgtgaactcgaactcaaaa-tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagaaacaaca 50167077  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50167078 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 50167176  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  50167177 gttgacctagttcggtcc 50167194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 833970 - 834186
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  833970 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 834068  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagatt 237  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  834069 caataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 834168  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  834169 gttgacccagttcggtcc 834186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 28265359 - 28265573
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28265359 tgttgggaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaaatagtagccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 28265457  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28265458 taataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 28265556  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  28265557 ttgacccagttcggtcc 28265573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 28223219 - 28223440
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28223219 attgttgtgaattcggactcaaaactcagaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaacgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaac 28223318  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||   | ||||||| ||||    
T  28223319 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaa 28223418  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28223419 gattgttgacccagttcggtcc 28223440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 45644158 - 45644373
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45644158 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 45644256  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45644257 ataataacaacatctagatctaatctagcaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaac-aagcacaccaaagatt 45644355  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45644356 gttgacccagttcggtcc 45644373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Original strand, 30476247 - 30476465
Alignment:
Q  40 gttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaat 139  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476247 gttgtgaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaat 30476346  T
Q  140 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| ||||||    
T  30476347 aataacaacacttagacctaatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaaaga 30476445  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30476446 ttgttgacccagttcggtcc 30476465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 196710 - 196926
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  196710 tgttgtgaattcgtactcaaat-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 196808  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  196809 taataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgagaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaaaaaacacaccaaagatt 196908  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  196909 gttgatccagttcggtcc 196926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 28220025 - 28220245
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  28220025 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaagaaaattagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacaaca 28220124  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||   | ||||||| |||||    
T  28220125 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaag 28220224  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28220225 attgttgacccagttcggtcc 28220245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 50169037 - 50169229
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50169037 tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctatatctaat 50169136  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50169137 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgatccagttcggtcc 50169229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 4552446 - 4552656
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4552446 attgttgcgaattcggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgcgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagtaacaac 4552545  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  4552546 aataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagata-------aagagaaac-aaacacaccaaagat 4552637  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4552638 tgttgacccagttcggtcc 4552656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 3846919 - 3847140
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3846919 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcatactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaac 3847017  T
Q  137 aata---ataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaa 232  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||    
T  3847018 aataataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaa 3847117  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtcc 3847140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1833876 - 1833677
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833876 tgttgtgaattcggactcaata-tcacaccaatacaaactatgatctgtggagtaaaggaaagtcgtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 1833778  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  1833777 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaagagagaaaataaac-aaacacaccaaagattg 1833679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10925592 - 10925379
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  10925592 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaacaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataat 10925494  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10925493 caacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagggaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagataaac-aaacacatcaaaga 10925395  T
Q  236 ttgttgacccagttcg 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  10925394 ttgttgacccagttcg 10925379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 8550583 - 8550805
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  8550583 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 8550681  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaaga-----gaaacaaaacacaaca 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||     ||||  ||||||| ||    
T  8550682 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaaacaaacacacca 8550781  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  8550782 aagattgttcacccagttcggtcc 8550805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 37559662 - 37559886
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  37559662 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataat 37559761  T
Q  136 caataataacaacacctagatct-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg---gagaagaga--aacaaaacacaa 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  ||| |||||||     
T  37559762 caacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggggagagaagagaggaac-aaacacac 37559860  T
Q  230 caaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37559861 caaagattgttgaccaagttcggtcc 37559886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41361280 - 41361063
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41361280 attgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaac 41361182  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa-aga 235  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | |    
T  41361181 aacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaac-aaacacaccaagata 41361083  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  41361082 ttgttgacctagttcggtcc 41361063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Original strand, 23555069 - 23555254
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23555069 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcgcaccaatagaaacaatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaatgtcaaagtaaacacaagcaacaac 23555167  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  23555168 aacaataacaacacctagatctaatttaggaatcatagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaacataaagagagaagagaaacaaa 23555254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3157205 - 3157014
Alignment:
Q  68 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  3157205 caatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagg 3157106  T
Q  167 aatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3157105 aatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 3157014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49918711 - 49918499
Alignment:
Q  46 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataa 144  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  49918711 aattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataa 49918613  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  49918612 cagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaaagattgtt 49918514  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
    |||| ||||||||||    
T  49918513 gacctagttcggtcc 49918499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3189706 - 3189480
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3189706 gaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataataa 3189608  T
Q  145 ca--------------acacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaaca 226  Q
     |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| |||||    
T  3189607 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaaca 3189509  T
Q  227 caacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3189508 caccaaagattgttcacccagttcggtcc 3189480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3198523 - 3198297
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3198523 gaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataataa 3198425  T
Q  145 ca--------------acacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaaca 226  Q
     |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| |||||    
T  3198424 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaaca 3198326  T
Q  227 caacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3198325 caccaaagattgttcacccagttcggtcc 3198297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3207362 - 3207136
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3207362 gaattcggacacaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtctggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaacaataataa 3207264  T
Q  145 ca--------------acacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaaca 226  Q
     |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| |||||    
T  3207263 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaaca 3207165  T
Q  227 caacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3207164 caccaaagattgttcacccagttcggtcc 3207136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46065278 - 46065071
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  46065278 tgttgtgaattcggactcaaaac-cacac-aatgaaaacaaagatgtgtggagcaaacgatagttgtaaccaatt-caaagtaaatacaagcaacaacaa 46065182  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46065181 taataacaacacctagatctaatctactaat-aatgtgaaaggctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 46065084  T
Q  239 ttgacccagttcg 251  Q
    || ||||||||||    
T  46065083 tttacccagttcg 46065071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 13659157 - 13659355
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||         |||    
T  13659157 gaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taa 13659246  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  13659247 caacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaatacaccaaagattgttgacc 13659344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16455986 - 16455801
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16455986 attgttgtgaattcggactcaaaatt-acaccaatgaaaacaaagatttgtgtagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacgtaagcaacaac 16455888  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16455887 aataataacaacatatagatctaatctggtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa 16455801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31659608 - 31659387
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||     
T  31659608 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatataaaatatgatgtgtggagaaaagaaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataat 31659510  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggag----aagagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    ||||| ||  ||||||| ||    
T  31659509 caacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaa-taaacacacca 31659411  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31659410 aagattgttgacccagttcggtcc 31659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 37503362 - 37503572
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  37503362 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtag-----aatatcaaagtgaacacaagcaataatca 37503455  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||    
T  37503456 acaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaa 37503554  T
Q  234 gattgttgacccagttcg 251  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  37503555 gattgttgacctagttcg 37503572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44455529 - 44455310
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |    
T  44455529 ttgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagaaaagaaaagtggtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatc 44455431  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagaga--aacaaaacacaacaa 232  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  44455430 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaac-aaacacaccaa 44455332  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtc 254  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  44455331 agatcgttgacccagttcggtc 44455310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20763039 - 20762822
Alignment:
Q  37 attgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||    
T  20763039 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaaccaatatcaaagtgaattcaagcaataa 20762941  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaac 230  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| |    
T  20762940 tcaacaataacagcacctagatctaatctag-----gaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacacc 20762847  T
Q  231 aaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  20762846 aaagattggtcacctagttcggtcc 20762822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15820655 - 15820487
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||    
T  15820655 gaattcggactcaaaactcac--caata--aacttagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaac------aa 15820566  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||   ||||| | |||||||||||||||    
T  15820565 caacacctagatctaatataggaatcaaatagaaaagctcataaacacaagcaatggataaggagagaagagaaacaaa 15820487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 927785 - 927964
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  927785 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaata--aactatgatgtgtggagtaaagggaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaaacaacaacaa 927881  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctag-taatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
     ||   ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  927882 caa---caaaacttagatctaatatagataatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaa 927964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Original strand, 8870570 - 8870695
Alignment:
Q  82 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaag 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  8870570 atgtgtggaacaaaggaaagtagtaactagtatcaaagtaatcacaagcaaaaacaataaaaaaaaaacctagatcaaatctaggaatcaaagtgaaaaa 8870669  T
Q  182 ctcaaaaccacaagcacaagataaag 207  Q
      |||||||||||||| |||||||||    
T  8870670 tacaaaaccacaagcaaaagataaag 8870695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 13316174 - 13316370
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13316174 tcacaccaatacgaaatataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 13316273  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  13316274 tctaggaatcaaagtgaaaaacac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaactcactaaagattgttcacccagttcggtcc 13316370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51765744 - 51765547
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||| |   ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51765744 cacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 51765645  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaaggga----gaaga-gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51765644 ctaggaaacaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 51765547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 37282498 - 37282679
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaa-gtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| | ||||||| |||||| | |||||    
T  37282498 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaata--aacttaaatgtgtggagcaaaagaaaagtaataattaatatgaaagtaaccacaagtaccaaca 37282594  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaag-cacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  | |||| |||  |||||||||||||||    
T  37282595 acaataacaa-acctagatctaatctagaaatc-aggtgaaaaacgcaaaaccacaagaaaaaagagaaatagagaagagaaacaaa 37282679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5460215 - 5460079
Alignment:
Q  93 aaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccac 192  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||| ||| | ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| || |||| || ||||| |||||||||    
T  5460215 aaagggaaatagtaaccaatatcaaaataatctcaaacaacaacaacaagaacaa-acctagatcgaatctaggaa-caaaatgtaaagcacaaaaccac 5460118  T
Q  193 aagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5460117 aagcaaaagataaagagagaatagaaac-aaacacaacaa 5460079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 44646655 - 44646779
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || | || | ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  44646655 gatgtgtgtagcaaaggaaagtagtaaccaatattaatgaaacctcaagcaacaccaaaaataacaa-acctaaatctaacatagaaat-aaagtgaaaa 44646752  T
Q  181 gctcaaaaccacaagcacaagataaag 207  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||    
T  44646753 gcacaaaatcacaagcaaaagataaag 44646779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 44650013 - 44650137
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | || | || | ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  44650013 gatgtgtgtagcaaagaaaagtagtaaccaatattaatgaaacctcaagcaacaccaaaaataacaa-acctaaatctaacatagaaat-aaagtgaaaa 44650110  T
Q  181 gctcaaaaccacaagcacaagataaag 207  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||    
T  44650111 gcacaaaatcacaagcaaaagataaag 44650137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36683935 - 36683885
Alignment:
Q  82 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  36683935 atgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaaaaacaagcaa 36683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19753034 - 19752985
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtg 86  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19753034 attgttgtgaattcagactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtg 19752985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40282727 - 40282682
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40282727 cacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 40282682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 108
Target Start/End: Original strand, 20622071 - 20622101
Alignment:
Q  78 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622071 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 20622101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 255
Target Start/End: Original strand, 19072918 - 19072951
Alignment:
Q  222 aaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19072918 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 19072951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 255
Target Start/End: Original strand, 19120808 - 19120841
Alignment:
Q  222 aaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120808 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 19120841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19754836 - 19754787
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19754836 gaattcagattcaaatttcacaccaatagaaactatgatgtgtggagcaa 19754787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 26175436 - 26175655
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26175436 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaatagcaa 26175535  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||    
T  26175536 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaag 26175634  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26175635 attgttgacccagttcggtcc 26175655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 46147193 - 46147410
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46147193 attgttgtgaattccgcctcaaaactcacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaac 46147292  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  46147293 aataataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagat 46147391  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46147392 tgttgacccagttcggtcc 46147410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 52467163 - 52467373
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaa-caacaataata 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  52467163 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaaagacaagcaatcatcaataata 52467262  T
Q  144 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgac 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  52467263 acaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgac 52467361  T
Q  244 ccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||    
T  52467362 ccagttcggtcc 52467373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 12743726 - 12743944
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  12743726 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgttgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaag---caac 12743822  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  12743823 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaac-aaacacaccaa 12743921  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12743922 agattgttgacccagttcggtcc 12743944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 47038222 - 47038430
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  47038222 gaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaataa 47038320  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47038321 caacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgacc 47038419  T
Q  245 cagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||    
T  47038420 cagttcggtcc 47038430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 48893443 - 48893657
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48893443 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaa 48893541  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48893542 caataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 48893640  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  48893641 ttgacccagttcggtcc 48893657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 36463196 - 36463408
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36463196 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 36463294  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  36463295 taataacaacacctagatctaatttggtaatcaaagcgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaa---acaccaaagattg 36463391  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  36463392 ttgacccagttcggtcc 36463408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 45686986 - 45687201
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaac 136  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  45686986 ttgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaac 45687084  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45687085 aataataacaacacctagatc-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaacagataaagagagaaaagaaac-aaacacaccaaagat 45687182  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45687183 tgttgacccagttcggtcc 45687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5872185 - 5871970
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  5872185 attgttgtgaatccggactcaaaa-tcacaccaatacaaact--gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaac 5872089  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  5872088 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaaaagcaaaagatagagagagaagagagaatcaaacacaccaaaga 5871989  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtc 254  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5871988 ttgttgacccagttcggtc 5871970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 12739351 - 12739569
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||     
T  12739351 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaag---caat 12739447  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  12739448 aataataacaacacctagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaa 12739546  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12739547 agattgttgacccagttcggtcc 12739569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 56178442 - 56178655
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataata 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  || ||||    
T  56178442 gaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataataaacaata 56178540  T
Q  144 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgt 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  56178541 acaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgt 56178639  T
Q  240 tgacccagttcggtcc 255  Q
    | ||||||||||||||    
T  56178640 tcacccagttcggtcc 56178655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 9927257 - 9927477
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |    
T  9927257 ttgttgtgaattcggactcaaaactcgcaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagttaccaatatcaaagtaaacacaagcaataatc 9927356  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg-gaga--agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||| ||||    
T  9927357 aacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaggagagaatagaggaac-aaacacaccaaa 9927455  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  9927456 gattgttgactcagttcggtcc 9927477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29254838 - 29254643
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29254838 tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaag-aaagtagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacgacaataataacaacacctagatctaat 29254740  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29254739 ctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaac-aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 29254643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 251
Target Start/End: Original strand, 34570212 - 34570429
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||     
T  34570212 attgttgcgaattcggattcaaaa-tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaaacaataat 34570310  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| ||    
T  34570311 caacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacacca 34570409  T
Q  232 aagattgttgacccagttcg 251  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34570410 aagattgttgacccagttcg 34570429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36994816 - 36994673
Alignment:
Q  110 aatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaaggg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36994816 aatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagag 36994717  T
Q  210 agaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  36994716 agaagagaaac-aaacacgccaaa-attgttgacccagttcggtcc 36994673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31474512 - 31474300
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31474512 tgttgtgaattcggactcaa---tcacaccaatacaaacaatgatgtgtgtagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 31474416  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat-t 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  31474415 caataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaatcaaaagctaaagataaagggagaagagaaac-aaacac-accaagatat 31474318  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  31474317 gtttacccagttcggtcc 31474300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37740987 - 37740774
Alignment:
Q  46 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||| || ||| || ||| |||||    
T  37740987 aattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcacaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacagaatcaataatcaacaataa 37740888  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| |||||||  ||| ||||||    
T  37740887 cagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacacaaaaaattgtt 37740789  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
    ||| |||||||||||    
T  37740788 gacacagttcggtcc 37740774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48143405 - 48143193
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaac 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  48143405 cggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaac 48143307  T
Q  149 acctagatctaatctagtaatcaaagtg----aaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48143306 acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgtt 48143208  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
     |||||||| |||||    
T  48143207 cacccagtttggtcc 48143193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 5369880 - 5370101
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  5369880 ttgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataat 5369978  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa--gggagaagaga-aacaaaacacaacaa 232  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||  ||||||| |||    
T  5369979 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacatcaa 5370078  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  5370079 agattgttcactcagttcggtcc 5370101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 52095160 - 52095381
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || ||     
T  52095160 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggaacaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagtaataat 52095258  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||    
T  52095259 caacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacacca 52095357  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  52095358 aaaattgttcacccagttcggtcc 52095381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 54199708 - 54199922
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  54199708 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaacgatgatgtatggagcaaaggaaagtagtaaccagtatcaaagtgaacacaagcaataatca 54199806  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg-gagaagaga--aacaaaacacaacaaag 234  Q
      ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||     
T  54199807 gcaataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaatataaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaaaa 54199905  T
Q  235 attgttgacccagttcg 251  Q
    |||||||||||||||||    
T  54199906 attgttgacccagttcg 54199922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Original strand, 52082462 - 52082673
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  52082462 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaattatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 52082560  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa--gggagaagaga-aacaaaacacaacaaa 233  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  52082561 aacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaa 52082660  T
Q  234 gattgttgaccca 246  Q
    ||||||| |||||    
T  52082661 gattgttcaccca 52082673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 6541987 - 6542198
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6541987 tgttgtgaattcggacataaaactcacatcaata-atactttgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaatcacaagcaacaacaa 6542085  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  | ||    
T  6542086 taa---caaaacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacacaaaatcacaagaaaaagataaagagataagagaaac-aaacacaccaagaaatg 6542181  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    || ||||||||||||||    
T  6542182 tttacccagttcggtcc 6542198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4588322 - 4588139
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaa-ctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| || ||||| ||||||    
T  4588322 attgttgtgaattcggactcaaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccactatcaaagcaatcacaaacaacaa 4588224  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||   ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  4588223 caataa---caaaaccaatatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaa 4588139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5429989 - 5429828
Alignment:
Q  98 aaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5429989 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagt 5429890  T
Q  197 acaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5429889 aaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacatcaaagattgttgacccagttcggtcc 5429828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 37229535 - 37229709
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  37229535 gaattcggactcaaaa-taaaaccaata-aaactatgttgtgtggagcaatgggaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaataacaacaataa 37229632  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  37229633 cca-acctagatctaatttaggaat-aaagtgaaaagcacaaaaccataagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa 37229709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 13992113 - 13992311
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13992113 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 13992212  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-acaagat-aaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtc 254  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||| |||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  13992213 tctaggtatcaaagtgaaaagcac-aaatcacaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacctagttcggtc 13992310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 5207664 - 5207828
Alignment:
Q  52 gactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacc 151  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||||||  ||    |||    
T  5207664 gactcaaaa-tcacaccaatataaa-tatggtgtgtggagcaaaggaaagtagtaattgatatcaaagtaacctcaagcaacaacaatatcaa----acc 5207757  T
Q  152 tagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||    
T  5207758 tagatctaatttaggaatcaa-gtgaaaagcacaaaaccacatgcaacagataaatagagaagagaaacaaa 5207828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24970032 - 24969814
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  24970032 attgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacactgatgaaaacaaagatgtgtg-agcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataatcacaaccaacaac 24969935  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaag---ctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    || ||     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||     
T  24969934 aagaaagtagacacctagatctaatctactaatctaagtgaaaaaaaactcaaaaccataagcaaacgataaagtgagaagagaaac-aaacacaccaag 24969836  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
     | |||| ||||||||||||||    
T  24969835 aaatgtttacccagttcggtcc 24969814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 29999627 - 29999709
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagt 120  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29999627 ttgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagt 29999709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 13009409 - 13009462
Alignment:
Q  201 gataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13009409 gataaagggagaagagaaacaaaacacgccaaagattgttgacacagttcggtc 13009462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 48142209 - 48142364
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaat 161  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||   ||| ||||| ||| |||||||||| | |    ||||    
T  48142209 tcacaccaata-aaacttagatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatattaaagtaacatcaaacaacagcaacaataacaacaacaa----taat 48142303  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||| |||| ||||||||| |   ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  48142304 ctaggaatc-aagtgaaaaacattaaaccacaatcaaaagataaagagagaagagaaacaaa 48142364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Original strand, 50262486 - 50262542
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262486 ttgttgtgaattcagactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 50262542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5350270 - 5350089
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||  | |||||| || |||||||||||||||| ||| | ||| |||   || | ||||||    
T  5350270 attgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaat--aaacttaggtgtgtgaagtaaaggaaagtagtaaccaatat-aaaataacatcacgtaacaac 5350174  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    || |||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||||||| | ||| || |||| || ||||||| | |||||||||||||||    
T  5350173 aacaataacaa-acctagatctcatacaggaatc-aagtgaaaaacacaagactacaaacaaaagataacgagagaagagaaacaaa 5350089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36994898 - 36994851
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtg 86  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36994898 tgttgtgaattctgactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtg 36994851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2210084 - 2210040
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2210084 cggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 2210040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29056610 - 29056539
Alignment:
Q  151 ctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  29056610 ctagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaagagaaaagagaaacaaa 29056539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Original strand, 31495209 - 31495271
Alignment:
Q  143 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  31495209 aacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaa 31495271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41639801 - 41639746
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41639801 tgttgtgaattcagactcaaatttcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaa 41639746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3913876 - 3913775
Alignment:
Q  105 taactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagata 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |   || ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| | |||| |    
T  3913876 taaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaataagagcatc---tatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtataaaaccacaagtaaaagaaa 3913780  T
Q  205 aaggg 209  Q
    |||||    
T  3913779 aaggg 3913775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Original strand, 31495130 - 31495172
Alignment:
Q  66 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495130 accaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 31495172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 44967677 - 44967816
Alignment:
Q  85 tgtggagca-aaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagct 183  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||  |||| ||||| ||| |     
T  44967677 tgtggagcataaagaaagtagtaactaatatcaaagtaacctcaagcaacaacaacactaataa-acatatatctaatctaaaaatc-aagtgtaaaaca 44967774  T
Q  184 caaaaccacaagcacaa-gataaagggagaagagaaacaaaa 224  Q
    ||||||||||| || ||  |||||| |||| |||||||||||    
T  44967775 caaaaccacaatcaaaattataaagagagaggagaaacaaaa 44967816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51338392 - 51338337
Alignment:
Q  86 gtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataa 141  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  51338392 gtggagcaaatgaaagtagtaatcaatatcaaagtagtcacaagcaacaacaataa 51338337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 37754874 - 37754947
Alignment:
Q  149 acctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||    
T  37754874 acctagatctaatctagggatcaa-gtataaagcccaaaaccacaaacataagataaagagagaagaaaaacaaa 37754947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 255
Target Start/End: Original strand, 12745300 - 12745333
Alignment:
Q  222 aaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12745300 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 12745333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Original strand, 5280635 - 5280714
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaat 161  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5280635 gatgtgtggagtaaaggtaagtagtaaccaatatcaaaataacctcgagcaacgacaacaataacaa-acctaaatctaat 5280714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 29999719 - 29999782
Alignment:
Q  148 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  29999719 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacac-aaaccacaagcaaaagacaaaaggaga 29999782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 538401 - 538174
Alignment:
Q  27 actcaaatgcattgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacac 126  Q
    |||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  538401 actcaaatacactattgtgaattcagactcaaaactcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtaaacac 538302  T
Q  127 aagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaaca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  538301 aagcaacaacaataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaa-gaaaca 538203  T
Q  227 caacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  538202 caccaaagattgttgatccagttcggtcc 538174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32637186 - 32636973
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  32637186 gaattcggattcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaacaaatttcacactaaacacaagcaacatcaataataa 32637087  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaaggga--gaagaga-aacaaaacacaacaaagattgttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  32637086 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggagggaagagagaaacaaacacaccaaagattgttg 32636987  T
Q  242 acccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||    
T  32636986 acccagttcggtcc 32636973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 42428228 - 42428449
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||     
T  42428228 attgttggaaattcgaactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaat 42428327  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||  | |||||||  |||    
T  42428328 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaagaagaacaaacacactaaa 42428427  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42428428 gattgttgacccagttcggtcc 42428449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 28750455 - 28750674
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28750455 tgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 28750554  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||    
T  28750555 taataacaacacctagatctaatctagtaatccaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaatataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaag 28750653  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  28750654 attattgacccaattcggtcc 28750674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 42426034 - 42426254
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  42426034 ttgttgtgaattcgaactcaaaactcacacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacatca 42426133  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| |||||||  |||    
T  42426134 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacacaaaa 42426232  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  42426233 gattgttgacctagttcagtcc 42426254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 534129 - 533918
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  534129 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatagaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtagacacaagcaacaat 534030  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  534029 aataataacaacaccta------atctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaaccacaagcaaaagataaaaagagaagagaagc-aaagacaccaaagat 533937  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  533936 tgttgacccagttcggtcc 533918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31183342 - 31183120
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |    
T  31183342 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaccatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagggaacacaagcaacaaaa 31183244  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaag-----cacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||    
T  31183243 ataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaattcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacacca 31183144  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  31183143 aagaatgttgacccagttcggtcc 31183120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13240118 - 13239901
Alignment:
Q  40 gttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaat 139  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13240118 gttgtgaattcgaactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaac 13240020  T
Q  140 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||| |    
T  13240019 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaaaa 13239921  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13239920 ttgttcacccagttcggtcc 13239901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 5887234 - 5887453
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5887234 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 5887332  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccac--aagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  5887333 ataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaaatgaaaaacttaaaaccacaaaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaag 5887432  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  5887433 attgttgatccaattcggtcc 5887453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 8565748 - 8565965
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8565748 tgttgtgaatttggattcaaaa-tcacactaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaacaacaa 8565846  T
Q  139 ta---ataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| || ||||    
T  8565847 taataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaaacaaacac-accaaga 8565945  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  8565946 ttgttgacctagttcggtcc 8565965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19806729 - 19806512
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||| | |||    
T  19806729 tgttgtgaattcggactcaaaactcac--caatacaaactatgatgtgtggggcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtgaacataggcaatagcaa 19806632  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||| |||  |||||    
T  19806631 taataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaa-caccccaaag 19806533  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19806532 attgttgacccagttcggtcc 19806512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13488569 - 13488352
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  13488569 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagtaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtgaacacaatcaatagcaa 13488470  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga--aacaaa-acacaacaaaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  | |||||||||  |||||| |||||  |||||    
T  13488469 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagaaagggagagaagagaggaacaaagacaca--aaaga 13488372  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    || |||||||||||||||||    
T  13488371 ttattgacccagttcggtcc 13488352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 30682721 - 30682941
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  30682721 ttgttgtgaatacggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatc 30682820  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  30682821 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaac-aaacacaccaa 30682919  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  30682920 agattgttga-ccagttcggtcc 30682941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37439489 - 37439291
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaa---ctatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatct 158  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37439489 tcacaccaatacaaaaaactatgatgtgtggagcaaaagaa-gtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctaggtct 37439391  T
Q  159 aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtc 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37439390 aatctagtaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcataagataaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtc 37439292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 16649635 - 16649849
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||| |  | |||    
T  16649635 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacaatcaaagtgaacacaagtagtagcaa 16649733  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  16649734 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaacggaaaagagaaac-aaacacaccaaggattg 16649832  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| |||| |||||    
T  16649833 ttgacctagtttggtcc 16649849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 39468348 - 39468568
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||    
T  39468348 tgttgtgaattcgaactcaaaacttacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 39468447  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||| |||||||  |||    
T  39468448 acaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacactaaa 39468546  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  39468547 gattgttgacccagttcagtcc 39468568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33832046 - 33831829
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  33832046 tgttgtgaattcggactcaaaatt-acacaaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaacacaagcaataacaa 33831948  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtg-aaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
     |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  33831947 caatagcagcacctaaatctaatctaggaatcaaagtgaaaaagctcaaagccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaaa-acaccaaaga 33831849  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33831848 ttgttgacccagttcagtcc 33831829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42927262 - 42927103
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||   |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42927262 attgttgtgaattcgaactcaaaa-tcataccaacgaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaaagtagcaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaac 42927164  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42927163 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagca 42927103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30182959 - 30182738
Alignment:
Q  37 attgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||| ||| ||    
T  30182959 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaaacaataa 30182861  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaac 230  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||| |    
T  30182860 tcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaa-cacaagcacaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacacc 30182763  T
Q  231 aaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||| | ||||||||||||    
T  30182762 aaagattgttcatccagttcggtcc 30182738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13343406 - 13343210
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  13343406 tcacactaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 13343307  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13343306 tctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacatcaaagattgttcacccagttcggtcc 13343210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 36073866 - 36074061
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36073866 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 36073965  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36073966 ctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaatcacaagcaaaacataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcatccagttcggtcc 36074061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25413106 - 25412910
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||| | ||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  25413106 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaattagtaatcaatatccaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaa 25413007  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25413006 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcagtcc 25412910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16409825 - 16409675
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  16409825 tcacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 16409726  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16409725 tctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 16409675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26178257 - 26178082
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| ||    
T  26178257 attgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataa 26178159  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26178158 tcaatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 26178082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16452402 - 16452229
Alignment:
Q  81 gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16452402 gatgtgtggagtaaaggaaaatagtaaccaatattaacgtaaacacaagcaacaacaataa---caacagttagatctaatctaggaatcaaattgaaaa 16452306  T
Q  181 gctcaaaaccacaagc-acaagataaagg--gagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||  ||||||| |||| ||||||| |||  | |||| ||||||||||||||    
T  16452305 gctcaaaaccacaagcaaaaaaataaaggaagagaagataaac-aaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtcc 16452229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 119
Target Start/End: Original strand, 3075547 - 3075629
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaag 119  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  3075547 attgttgtgaattcggactaaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaag 3075629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26171119 - 26170962
Alignment:
Q  54 ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacct 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||     ||||||| || | || ||||||||||||    
T  26171119 ctcaaaac-cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcgatgataacaacacct 26171021  T
Q  153 agatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26171020 agatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 26170962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40147610 - 40147555
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147610 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 40147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Original strand, 9789019 - 9789090
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789019 attgttgtgaattccgatctcaaaac-cacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 9789090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38747353 - 38747298
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38747353 tgttgtgaatttggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 38747298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 204
Target Start/End: Original strand, 9049209 - 9049317
Alignment:
Q  94 aaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaca 193  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| | ||||||||||    
T  9049209 aaggaaaatagtaaccaatatcaaagtaaccacaagaaacaacaacaataacaa-atctaaatctaatatagaaattaa-gtgaaaaacacaaaaccaca 9049306  T
Q  194 agcacaagata 204  Q
    |||| ||||||    
T  9049307 agcaaaagata 9049317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Original strand, 18441457 - 18441510
Alignment:
Q  54 ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441457 ctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 18441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12102637 - 12102534
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaa-----ggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaac 133  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||     ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12102637 tgttgtgaattcgtacccaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagcaaattaaaggaaagtataaaccaatatcaaagtaatcacaaccaac 12102539  T
Q  134 aacaa 138  Q
    |||||    
T  12102538 aacaa 12102534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28278652 - 28278609
Alignment:
Q  51 ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28278652 ggactcaaatttcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaa 28278609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 42309830 - 42309931
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||| || |||||||||||||  ||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42309830 gaattaggactcaaaa-tcacatcaatgaaaacaaagatgtatgcagcaaaggaaagtgataacctatatcatagtaatcacaagcaacaacaataacaa 42309928  T
Q  145 caa 147  Q
    |||    
T  42309929 caa 42309931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 255
Target Start/End: Original strand, 10281741 - 10281774
Alignment:
Q  222 aaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10281741 aaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 10281774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40751339 - 40751298
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggag 91  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40751339 cggacttaaatctcacaccaatacaaactatgatttgtggag 40751298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40763344 - 40763300
Alignment:
Q  50 cggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40763344 cggacttaaatctcacaccaatataaactatgatctgtggagcaa 40763300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 723545 - 723763
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  723545 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaac 723643  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  723644 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 723743  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtcc 723763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 34139572 - 34139789
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34139572 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 34139670  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  34139671 ataataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagat 34139770  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtcc 34139789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39285202 - 39284985
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285202 tgttgtgaattcggacttaaaactcataccaatacaa-ctatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 39285104  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa-aca-caacaaagat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  39285103 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccattaaagat 39285004  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtcc 39284985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 33162254 - 33162469
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  33162254 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 33162352  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33162353 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 33162451  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  33162452 gttgacctagttcggtcc 33162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 11151395 - 11151610
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11151395 tgttgtgaattcgaactcaaaactcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaataaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaa 11151494  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11151495 taataacaacagctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 11151593  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  11151594 ttgacccagttcggtcc 11151610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 36317811 - 36318028
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36317811 attgttgtgaatttggactcaaaactcacaccaatacaaacaatgatgtgtagaacaaatgaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacagc 36317910  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  36317911 aataataacaacacctagatttaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagataaac-aaacacaccaaagat 36318009  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36318010 tgttgacccagttcggtcc 36318028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 2334218 - 2334436
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334218 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 2334316  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||| |||||    
T  2334317 taataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaacttcaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaag 2334415  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  2334416 attgttcccccagttcggtcc 2334436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29868237 - 29868018
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29868237 tgttgtgaattcggactcaaatttcacagcaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaatcaattttaaagtaaacacaagcaacaacaa 29868138  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||||    
T  29868137 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagagaagagagaaac-aaacacatcaaag 29868039  T
Q  235 attgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  29868038 attattgacccagttcggtcc 29868018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11067635 - 11067454
Alignment:
Q  73 caaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11067635 caaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaa 11067536  T
Q  173 agtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11067535 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgaccgagttcggtcc 11067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11690858 - 11690650
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||        
T  11690858 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaa-gtgaacacaagcaa---- 11690764  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11690763 -----taacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagat 11690669  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11690668 tgttgatccagttcggtcc 11690650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42362713 - 42362505
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42362713 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaacaacaa 42362615  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  42362614 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagatt 42362515  T
Q  238 gttgacccag 247  Q
    ||||||||||    
T  42362514 gttgacccag 42362505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 14633627 - 14633844
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14633627 ttgttgtgatttcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaaca 14633725  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaacaaaacacaacaaaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  14633726 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcaaaagataaagagagaatagagaaac-aaacacaccaaaga 14633824  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14633825 ttgttgactcagttcggtcc 14633844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24885953 - 24885765
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24885953 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtgtagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaa 24885855  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacaca 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885854 tgataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacaca 24885765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 36987874 - 36988094
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  36987874 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataatc 36987972  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||    
T  36987973 aacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaa 36988071  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  36988072 agattgttcacccagttcggtcc 36988094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 14202223 - 14202440
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14202223 ttgttgtgaattcggagtcaaaa-tcataccaacacaaactatgatatgtggagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacgcaagcaacaaca 14202321  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  14202322 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcttaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagataaacaaacacaccaaagat 14202421  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14202422 tgttgacccagttcggtcc 14202440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36773926 - 36773711
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacac-aagcaacaaca 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  36773926 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaatgaaagtagtaaccaatatcaaagccaacaagaagcaacaaca 36773828  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36773827 ataataacaacacctagatctaatctagtaataaaaaagaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagaaagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 36773729  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36773728 gttgacccagttcggtcc 36773711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38312600 - 38312389
Alignment:
Q  47 attcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataac 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  38312600 attcggactcaaaa-tcacaccaatataaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaatcaacaataac 38312502  T
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttg 241  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  38312501 agcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacatcaaagattgttg 38312403  T
Q  242 acccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||    
T  38312402 acccagttcggtcc 38312389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 17057167 - 17057388
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  17057167 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataat 17057265  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||    
T  17057266 caacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaac-aaacacacca 17057364  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17057365 aagattgttgacccagttcggtcc 17057388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 17085150 - 17085371
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  17085150 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataat 17085248  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||    
T  17085249 caacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaac-aaacacacca 17085347  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17085348 aagattgttgacccagttcggtcc 17085371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2838315 - 2838132
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  2838315 attgttgtgagttcggacacaaaactcacaccaata-atactttgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccactatcaaagtaaacacaaacaacaac 2838217  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaaca 221  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2838216 aacaataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagtgagaagagaaaca 2838132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 6594804 - 6595024
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||    
T  6594804 tgttgtgaatttggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatca 6594902  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagat-aaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||| ||||||| |||    
T  6594903 acaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaa 6595001  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  6595002 agattgttcactcagttcggtcc 6595024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Original strand, 5723072 - 5723274
Alignment:
Q  56 caaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctag 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  5723072 caaaaatcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacaacacctag 5723171  T
Q  155 atctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttc 250  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5723172 atctaatctaggaatcaaaaagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttc 5723269  T
Q  251 ggtcc 255  Q
    |||||    
T  5723270 ggtcc 5723274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 36205487 - 36205683
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  36205487 tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 36205586  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36205587 tctaggaatcaaagtgaaaagc-agaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 36205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45100100 - 45099904
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  45100100 tcacaccaatacgaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 45100001  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45100000 tctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaatcacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 45099904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11049913 - 11049734
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  11049913 ttgttgtgagttcggacgcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatatcaaagtaatcataagcaacaaca 11049816  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  11049815 ataataa----acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa 11049734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 4502955 - 4503151
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4502955 tcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 4503054  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4503055 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaa-cacaagcacaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 4503151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1345730 - 1345615
Alignment:
Q  140 aataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa-agattg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||    
T  1345730 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcataagataaagtgagaagagaaac-aaacacaccaagaaattg 1345632  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  1345631 ttgacccagttcggtcc 1345615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 4484150 - 4484300
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  4484150 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 4484249  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4484250 tctaggaaacaaagtgaaaagc-aaaaaccacaagcacaagataaaaggaga 4484300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 12123434 - 12123573
Alignment:
Q  82 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||     
T  12123434 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacctcaaacaacaacaacaataacaa-acctatatctaatctagaaatc-aagtgaaaaa 12123531  T
Q  182 ctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
      ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  12123532 tacaaaatcacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaa 12123573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13122120 - 13121938
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||| |||   ||||||  ||||| |||||    
T  13122120 gaattcggacacaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtactaatcaatatcaaaataacatcaagcagtaacaacaataa 13122023  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13122022 caa-acctagatgtaatctagaaatcaa-gtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaacaa 13121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32289921 - 32289764
Alignment:
Q  54 ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacct 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  32289921 ctcaaaac-cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacct 32289823  T
Q  153 agatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32289822 agatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 32289764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30833694 - 30833544
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    | || |   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  30833694 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaattatgtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 30833595  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30833594 tctaggaaacaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcacaagataaaaggaga 30833544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26353495 - 26353363
Alignment:
Q  83 tgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagc 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||     |||||||||||||| |    
T  26353495 tgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaatcacaaggaacaacaataa---caaaacttagatctaat-----aatcaaagtgaaaaac 26353404  T
Q  183 tcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
     |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  26353403 acaaaaccacaagcaaaagataaggagaggagagaaacaaa 26353363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 17489958 - 17490136
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtg--tggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  17489958 tgttgtgaattcggactcaaaattg-caccaata-aaactatgatgtgtgtggagcaagagaaaatagtaaccaatatcaaagtaaccaca---aacaac 17490052  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaa--agctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||    |||||||| |||| |||  ||  ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  17490053 aataataa----acctagatttaatttagggat-taagtgaaaacaactcaaaaccacaagcaaatgataaagagagaagagaaacaaa 17490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 172
Target Start/End: Original strand, 36191103 - 36191192
Alignment:
Q  82 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaa 172  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||  || | |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36191103 atgtgtggagcaaagaaaatcagtaaccaatatcaaatcaacctcaagcaacaataacaataacaa-acctagatctaatctaggaatcaa 36191192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41455290 - 41455184
Alignment:
Q  27 actcaaatgcattgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacac 126  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||  ||  ||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||  | |    
T  41455290 actcaaatacattgttgtgaattcagactcaaaactcacaacaat--aaacttagacatgtggagcaaaaggaagtagtaaccgatatcaaagtagcctc 41455193  T
Q  127 aagcaacaa 135  Q
    |||||||||    
T  41455192 aagcaacaa 41455184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41446500 - 41446433
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41446500 tgttgtgaattcagactcaaaactcacaacaata--aacttaaatgtgtggagcaaaagaaagtagtaac 41446433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6267039 - 6266994
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6267039 cacaccaatgtaaactatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 6266994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26354170 - 26354127
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtgga 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26354170 gaattcggactcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgtgtgga 26354127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41446357 - 41446320
Alignment:
Q  186 aaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41446357 aaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaa 41446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45727305 - 45727249
Alignment:
Q  40 gttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaac--tatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45727305 gttgtgaattcagactcaaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaa 45727249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6599335 - 6599121
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||    
T  6599335 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaa---acaac 6599240  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6599239 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagat 6599140  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6599139 tgttgacccagttcggtcc 6599121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6674788 - 6674574
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||    
T  6674788 attgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaa---acaac 6674693  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6674692 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagat 6674593  T
Q  237 tgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6674592 tgttgacccagttcggtcc 6674574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40321442 - 40321229
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40321442 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcacac-aatacaaactatgatatgtggagcaaaggaaagtagcaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaa 40321345  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40321344 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacatcaaagattg 40321246  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  40321245 ttgacccagttcggtcc 40321229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 41366424 - 41366634
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41366424 gaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaataa 41366522  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa-gggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgac 243  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41366523 caacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatgggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgttgtc 41366622  T
Q  244 ccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||    
T  41366623 ccagttcggtcc 41366634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43036785 - 43036572
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43036785 gaatttggactcaaaactcacaccaatacaaaaaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataacaa 43036686  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  43036685 caccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaagattgtt 43036587  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||    
T  43036586 gacccagttcggtcc 43036572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5689635 - 5689420
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5689635 tgttgtgaattccgactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaaca 5689537  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5689536 ataataacaacatctaaatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacatcaaagatt 5689438  T
Q  238 gttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5689437 gttgacccagttcggtcc 5689420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Original strand, 1345176 - 1345389
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1345176 tgttgtgaattcggattcaaaa-tcacacaaatacaaacaataatctgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaa 1345274  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1345275 taataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 1345373  T
Q  239 ttgacccagttcggtc 254  Q
    |||||| |||||||||    
T  1345374 ttgacctagttcggtc 1345389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 12702430 - 12702653
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12702430 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 12702528  T
Q  138 ataataaca---acacctagatctaatctag-taatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaa 229  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |     
T  12702529 ataataacaacgacacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaac-aaacatac 12702627  T
Q  230 caaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12702628 caaagattgttgacccagttcggtcc 12702653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 3303476 - 3303689
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3303476 gaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaaacaaacacaagcaacaacaataataa 3303575  T
Q  145 caacacctagatctaatctag----taatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgtt 240  Q
    | |||||||||||||||||||     |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3303576 ctacacctagatctaatctaggaatcaatcaaagtgaaaagtacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgtt 3303674  T
Q  241 gacccagttcggtcc 255  Q
     ||||||||||||||    
T  3303675 tacccagttcggtcc 3303689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15213155 - 15212935
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||    
T  15213155 tgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatca 15213056  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||    
T  15213055 acaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaa 15212957  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15212956 gattgttgacccagttcggtcc 15212935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30143708 - 30143494
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  30143708 tgttgtgaattcagactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 30143610  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||||    
T  30143609 acaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaaa 30143511  T
Q  234 gattgttgacccagttc 250  Q
    |||||||||| ||||||    
T  30143510 gattgttgactcagttc 30143494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 4743027 - 4743233
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||          
T  4743027 tgttgtgaattcggactcaaatctcacaccaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtggtaaccaataccaaagtaaacacaagcaa------ 4743120  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4743121 ---taacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcgaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattg 4743216  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  4743217 ttgacccagttcggtcc 4743233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 19491501 - 19491718
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19491501 attgttgtgaattcggactcaaaactctaaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaac 19491599  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa-aga 235  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | |    
T  19491600 aacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaac-aaacacaccaagata 19491698  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  19491699 ttgttgacctagttcggtcc 19491718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4732028 - 4731807
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa- 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||| ||     
T  4732028 attgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatacaaacaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccgatatcaaagtgaacacaaacaataat 4731930  T
Q  136 caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaaca 231  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| ||    
T  4731929 caacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacacca 4731831  T
Q  232 aagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4731830 aagattgttgacccaattcggtcc 4731807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Original strand, 18105882 - 18106058
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18105882 gaattcagactcaaaa-tcacactaatacaaactatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaataacaacaataa 18105980  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaa 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18105981 catcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaa 18106058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10015443 - 10015259
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  10015443 tgttgtgaattcggatttaaaacttacaccaatgaaaacaaagatgtgtggagcagaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaaaaacaa 10015344  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  10015343 taataacaatacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaa 10015259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42498541 - 42498344
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac-aataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  42498541 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacaacacctagatctaa 42498442  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||    || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42498441 tctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagggaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 42498344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33352518 - 33352299
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-ca 137  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  33352518 tgttgtgaattcgtactcaaaa-tcacaccaatataaattatgatatgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatca 33352420  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaa 233  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||    |||| ||| ||||||| ||||    
T  33352419 acaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaac-aaacacatcaaa 33352321  T
Q  234 gattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33352320 gattgttgacccagttcggtcc 33352299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 34254154 - 34254349
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34254154 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34254253  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34254254 ctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 34254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17982999 - 17982803
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17982999 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaacgtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 17982900  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17982899 tctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 17982803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27811626 - 27811427
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatct 158  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27811626 tcacaccaatacaaactatatgatgtgtggaggaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatct 27811527  T
Q  159 aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaag--ggagaaga-gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27811526 aatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagagaagaggggaaaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 27811427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 34256330 - 34256525
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34256330 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaat 34256429  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34256430 ctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 34256525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44304201 - 44304009
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44304201 tcacaccaatacatactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 44304102  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcg 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  44304101 tctagaaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacctagttcg 44304009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4734075 - 4733855
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| || |    
T  4734075 tgttgtgaattcggattcaaaatt-acaccaatacaaaccaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatc 4733977  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagg--gagaagaga--aacaaaacacaacaa 232  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  4733976 aacaataacaacacctagatcaaatgtaggaaacaaaatgaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaggtagagaagagaggaac-aaacacaccaa 4733878  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4733877 agactgttgacccagttcggtcc 4733855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 255
Target Start/End: Original strand, 1746028 - 1746237
Alignment:
Q  48 ttcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataaca 146  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  1746028 ttcggtctcaaaa-tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataaca 1746126  T
Q  147 acacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttga 242  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| ||| ||||||| |    
T  1746127 gcacctagatctaatctaggaatcaaagtcaaaagcgc-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaacgattgttca 1746224  T
Q  243 cccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||    
T  1746225 cccagttcggtcc 1746237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18142105 - 18141999
Alignment:
Q  116 aaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaaga 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18142105 aaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagcaga 18142006  T
Q  216 gaaacaa 222  Q
    |||||||    
T  18142005 gaaacaa 18141999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 1292311 - 1292452
Alignment:
Q  82 atgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaag 181  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292311 atgtggggagcaaagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagtagtaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaag 1292410  T
Q  182 ctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  1292411 ctcaaaaccacgagcaaaagataaggagagaagagaaacaaa 1292452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Original strand, 19945156 - 19945375
Alignment:
Q  37 attgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||  ||||||| ||    
T  19945156 attgttgtgaattccggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactttgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataa 19945254  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaac 230  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    |||||||| ||||||| |    
T  19945255 tcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacacc 19945352  T
Q  231 aaagattgttgacccagttcggt 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  19945353 aaagattgttcacccagttcggt 19945375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31218603 - 31218407
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31218603 tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 31218504  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31218503 tctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaa-cataagcacaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 31218407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 3050924 - 3051090
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca----caagcaac 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |   |||||| || ||    ||||||||    
T  3050924 ttgttgtgaattgggactcaaatctcacaccaataaata--atgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccacaatcaaagcaagcaatcacaagcaac 3051021  T
Q  134 aacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3051022 aacaataataacaacacctagatctaatctagaaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataaga 3051090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8154147 - 8153967
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8154147 tgttgtgaattcgggctcaaaa-tcacactaata-aaactatgatgtgtgaagtaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaa 8154050  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||  ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  8154049 taataacaa-acctagatgtaatctaggaat-aaagtgaaaaacacaaaattacatgcaaaagataaacaaagaagagaaacaaa 8153967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30291865 - 30291757
Alignment:
Q  146 aacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgaccc 245  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  30291865 aacatctaaatctaatctagtaatcaaagtggaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagattgttgattc 30291767  T
Q  246 agttcggtcc 255  Q
    ||||||||||    
T  30291766 agttcggtcc 30291757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 8965492 - 8965621
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8965492 tgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaata-aaactatgatgcgtggagcaa-ggaacgtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaa 8965588  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaa 172  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  8965589 caataacaa-acctagatttaatctaggaatcaa 8965621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 223
Target Start/End: Original strand, 3073685 - 3073862
Alignment:
Q  44 agaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaa---gcaacaacaata 140  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||||   ||| |||||| |    
T  3073685 agaattcggactcaaaaa-cacaccaata--aactatcatatgtggagcaaaggaaagtaataaccagtatcaaagtaaccacaatgagcagcaacaaca 3073781  T
Q  141 ataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  3073782 acaacaa-acctagatttaatctaggaat-aaagtgaagagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaa 3073862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 32901988 - 32902152
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagga-aagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||    
T  32901988 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcagaccaata--aacttagatgtgtggagcaaaagagaagtagtaactaatatcaaagcaacctcaaacaacaac 32902084  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa 206  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  32902085 aacaacaacaa-acctagatctaatctaggaa-ccaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaa 32902152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2628084 - 2627935
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa--caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2628084 cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgggtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacacctagatctaa 2627985  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||| || | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2627984 tctaggaaac-aagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 2627935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4162833 - 4162692
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatt----tcaaagtaaacacaagcaac 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||    
T  4162833 ttgttgtgaattcggactcaaaa-tcataccagta-aaacaatgatgtgaggagcaaagaaaaatggtaaccaattaatatcaaagtaatcacaaacaac 4162736  T
Q  134 aacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4162735 aacaataataaaa---cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaa 4162692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 11711805 - 11711980
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaa-ggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaaca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||| | |||| |||||||    
T  11711805 tgttgtgaattcggactcaaaatt-acaccaata--aacttagatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaaccaagataaaagtaacctcaagaaacaaca 11711901  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaa 219  Q
    | ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||  |||||||||| || | ||||||| ||||| |||||    
T  11711902 acaat-acaa-acctagatctaatataggaat-agagtgtaaagcataaaaccacaaacaaaggataaagagagaaaagaaa 11711980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Original strand, 29796131 - 29796313
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||||| |||| | | ||||||||  | | |||||||||||    
T  29796131 tgttgtgaattcagactcaaca-tcacaccaata--aattttgatgtgtggagcaaaaggaagtaataaccagtatcaaagtattctcgagcaacaacaa 29796227  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacac 227  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  29796228 taataacaa-tcttagatttaatctagtaat-taagtgtaaagcacaaaatcataagcaaaagataaa-agagaagataaacaacacac 29796313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Original strand, 3231644 - 3231728
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggag-caaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaa 122  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3231644 attgttgtgaattcggactctaatctcacaccaat--aaacttggatgtgtggagtaaaatgaaagtagtaactaatatcaaagtaa 3231728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7493353 - 7493296
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaa 99  Q
    |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7493353 ttgttgtgaattcggac---aaaatcacaccaata-aaactatgatgtgtggagcaaaggaa 7493296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 107
Target Start/End: Original strand, 6127876 - 6127909
Alignment:
Q  74 aaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaa 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6127876 aaactatgatgtgtggaacaaaggaaagtagtaa 6127909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25690305 - 25690260
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25690305 cacaccaatacaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 25690260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 14521476 - 14521697
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagta----gtaactaatttcaaagtaaacacaagcaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14521476 attgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatg-aaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtacgtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaa 14521574  T
Q  133 caacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||    
T  14521575 caacaataacaacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataagataaagtgagaaaagaaa-taaacacaccaa 14521673  T
Q  233 -agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
     | | |||||||| ||||||||||    
T  14521674 gaaaatgttgacctagttcggtcc 14521697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 26954091 - 26954305
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  26954091 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaagaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagaaataacaa 26954189  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattg 238  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||| |||  || |||||||||    
T  26954190 caataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaaaaatgtaaagagagaagagaaac-aaagtcaccaaagattg 26954288  T
Q  239 ttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||| ||||||||||    
T  26954289 ttgacctagttcggtcc 26954305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Original strand, 3038733 - 3038931
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaaca-caagcaacaacaataata 143  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  3038733 gaattcgaactcaaaa-tcagaccaatacaaactatgatgtgtcgagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagcaaacaacaagtaacaacaataata 3038831  T
Q  144 acaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgac 243  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3038832 acaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaaagaaac-aaacacaccaaagattgttgac 3038930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Original strand, 33160177 - 33160370
Alignment:
Q  66 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33160177 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaatattaacaacacctagatctaatctag 33160276  T
Q  166 taatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaa---gggagaagaga-aacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   | ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  33160277 taatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagtttggtcc 33160370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16569389 - 16569171
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaataca-aactatgatgtgtggagcaaa-ggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||| |||    
T  16569389 tgttgtgaattcggactcaaaa-tcacaccaatattcaactatgatgtgtggagcaaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataac 16569291  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagaga-aacaaaacacaacaaaga 235  Q
    || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  16569290 aacaatagcagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaaga 16569191  T
Q  236 ttgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16569190 ttgttgacccagttcggtcc 16569171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 255
Target Start/End: Original strand, 9182857 - 9183050
Alignment:
Q  66 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaatcta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9182857 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatcta 9182956  T
Q  165 gtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga--agagaaaca-aaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9182957 ggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcc 9183050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 28137211 - 28137386
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaa 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  28137211 tgttgtgaattcggtctcaaaa-tcacaccaatacaaactatgacgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacga 28137309  T
Q  139 taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaaga 215  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28137310 caataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacataaccacaagcaaaagataaagggagaaga 28137386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 5408892 - 5409087
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  5408892 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5408991  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  5408992 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttca-ccagttcggtcc 5409087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 5413217 - 5413412
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  5413217 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaa 5413316  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  5413317 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttca-ccagttcggtcc 5413412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 33211066 - 33211204
Alignment:
Q  116 aaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaaga 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33211066 aaagtaaacacaagcaataacaacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaatcacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaaga 33211165  T
Q  216 gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33211166 gaaac-aaacataccaaagattgttgacccagttcggtcc 33211204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 16452125 - 16452347
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcgga-ctcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa 135  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||    
T  16452125 attgttgtgaattccgatctcaaaa-tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatacaagcaataa 16452223  T
Q  136 -caataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc-acaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaa 229  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||||    |||||||| |||||||     
T  16452224 tcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcaaaaatataaaaggagagaagagagaaac-aaacacac 16452321  T
Q  230 caaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452322 caaagattgttcacccagttcggtcc 16452347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Original strand, 31404492 - 31404693
Alignment:
Q  57 aaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctaga 155  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  31404492 aaaaatcactccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctaga 31404591  T
Q  156 tctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcg 251  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31404592 tctaatctaggaatcaaagaggaaagcac-aaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcg 31404689  T
Q  252 gtcc 255  Q
    ||||    
T  31404690 gtcc 31404693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 253
Target Start/End: Original strand, 5406025 - 5406216
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| || |||||||   | |||||||||||||    
T  5406025 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataat---agcacctagatctaa 5406121  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggt 253  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5406122 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggt 5406216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 253
Target Start/End: Original strand, 5410350 - 5410541
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| || |||||||   | |||||||||||||    
T  5410350 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaagaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaataat---agcacctagatctaa 5410446  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggt 253  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5410447 tctaggaatcaaagagaaaagcac-aaaccacaaacaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aaacacaccaaagattgttcacccagttcggt 5410541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 255
Target Start/End: Original strand, 30834343 - 30834554
Alignment:
Q  48 ttcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataaca 146  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||  ||||||| || ||| |||||||    
T  30834343 ttcggtctcaaaa-tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataaca 30834441  T
Q  147 acacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctca-aaaccacaagcacaagataaa--gggagaagaga-aacaaaacacaacaaagattgttga 242  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||| || |||||  | ||||||||| ||  ||||||| |||||||| || |    
T  30834442 gcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaagattattca 30834541  T
Q  243 cccagttcggtcc 255  Q
    |||||||||||||    
T  30834542 cccagttcggtcc 30834554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 2171349 - 2171468
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2171349 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 2171448  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaa 180  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  2171449 tctaggaatcaaagtgaaaa 2171468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Original strand, 602902 - 602958
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  602902 ttgttgtgaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 602958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 3072579 - 3072728
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||     ||||||| || ||| || || | ||| |||||||||    
T  3072579 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaacaaagtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaa 3072678  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga 212  Q
    ||||| || | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3072679 tctaggaaac-aagtgaaaagcataaaa-cacaagcacaagataaaaggaga 3072728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17758404 - 17758346
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758404 attgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 17758346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 412434 - 412389
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412434 cacaccaataccaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 412389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Original strand, 22963522 - 22963568
Alignment:
Q  52 gactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22963522 gactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagctaaggaa 22963568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23824871 - 23824825
Alignment:
Q  52 gactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23824871 gactcaaaa-tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagctaaggaa 23824825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 94
Target Start/End: Original strand, 3808512 - 3808550
Alignment:
Q  56 caaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3808512 caaaactcacaccaatacaaactatgatatgtggagcaa 3808550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21589309 - 21589252
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589309 ttgttgtgaattctggactcaaatttcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaa 21589252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Original strand, 22424621 - 22424670
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22424621 gaattcggactcaaatttcacattaatacaaactatgatgtgtggagcaa 22424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17763369 - 17763313
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcgg-actcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17763369 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaa 17763313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Original strand, 257243 - 257308
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtag 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  257243 attgttgtgaattcgaactcaaaa-tcacaccaatataat-tataatgtgtggagcaaaggaaagtag 257308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5043982 - 5043951
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagca 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043982 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagca 5043951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4045671 - 4045598
Alignment:
Q  149 acctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  4045671 acctagatctaatctaagaatcaa-gtgaaaaaaacaaaaccacgagtaaaagataaagagagaagagaaacaaa 4045598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 96
Target Start/End: Original strand, 33211014 - 33211058
Alignment:
Q  52 gactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaag 96  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  33211014 gactcaaaattcacaccaatataaactataatgtgtggagtaaag 33211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 20215 - 20434
Alignment:
Q  38 ttgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-c 136  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||      
T  20215 ttgttgtgaattcggactcaa--ctcataccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaggtagtaaccaatgtcaaagtgaacacaagcaataatt 20312  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaa 232  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||    
T  20313 aacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaac-aaacacaccaa 20411  T
Q  233 agattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  20412 aaattgttgacccagttcggtcc 20434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 240
Target Start/End: Original strand, 1301 - 1502
Alignment:
Q  39 tgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagt-aaacacaagcaacaaca 137  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| || ||||    
T  1301 tgttgtgaattcgaacacaaaactcacaccaatacaatctatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaatattaaagttaaacacaagtaataaca 1400  T
Q  138 ataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagatt 237  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1401 acgataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacataaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaacacaccaaagatt 1499  T
Q  238 gtt 240  Q
    |||    
T  1500 gtt 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 255
Target Start/End: Original strand, 148918 - 149116
Alignment:
Q  45 gaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataa 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||         |||    
T  148918 gaattcggactcaaaa-tcacatcaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taa 149007  T
Q  145 caacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacc 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  149008 caacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaac-aaatacaccaaagattgttgacc 149105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 114950 - 114753
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaa-ctatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatcta 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  114950 tcacaccaatacaaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatcta 114851  T
Q  160 atctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtc 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||    |||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  114850 atctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagagaagagagaaac-aagcacaccaaagattgttcatccagttcggtc 114753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1065
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||| || ||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1262 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggaacaaaggatagtagtaaccaatgacaatgtgaatgcaagcaataatcaacaataacaccacctagatctaa 1163  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||| |||||    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1162 tctaggtatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaagtataaaaggagagaagagagaaacaaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 434880 - 434683
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||     ||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  434880 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattattaaagtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaa 434781  T
Q  161 tctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagat-aaagggaga----agagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  434780 tctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaa-cacaagcacaagataaaagggagagaagagagaaac-aaacacaccaaatattgttcacccagttcggtcc 434683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 10982 - 11179
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||     ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10982 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 11081  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaaggga----gaaga-gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11082 ctaggaaacaaagtgaaaaacac-aaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8753
Alignment:
Q  63 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaa-caataataacaacacctagatctaat 161  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||     ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8556 cacaccaatacaaagtatgatacgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaagtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaat 8655  T
Q  162 ctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagata----aagggagaaga-gaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcggtcc 255  Q
    |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||| | ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8656 ctaggaaacaaagtgaaaagcac-aaaccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtcc 8753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 27248 - 27425
Alignment:
Q  37 attgttgagaattcggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaac 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||  || |||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||| |||     
T  27248 attgttgtgaattcggactcaaatctcacatcaata--aacttagaagtgtggagaaaaggaa-gtagtaaccaatatgaaagtaacctcaagcagcaaa 27344  T
Q  137 aataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcacaagataaagggagaagagaaa 219  Q
    ||||||||||| || ||||   ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  27345 aataataacaa-acttagaagaaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaaggtaaagagagaagagaaa 27425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11912 - 11866
Alignment:
Q  62 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7687 - 7646
Alignment:
Q  53 actcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7687 actcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 94
Target Start/End: Original strand, 17806 - 17849
Alignment:
Q  51 ggactcaaaactcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaa 94  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17806 ggactcaaatttcacaccaatacaaactatgatgtgtgtagcaa 17849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University