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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2051_low_12 (Length: 238)

Name: NF2051_low_12
Description: NF2051
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2051_low_12
NF2051_low_12
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (5-222)||(24421159-24421382)
chr4 (5-222)||(24470533-24470756)
chr4 (5-223)||(24470341-24470565)
chr4 (5-136)||(24477388-24477519)
chr4 (14-223)||(24477121-24477339)
chr4 (9-156)||(24477464-24477611)
chr4 (5-222)||(24420967-24421190)
chr4 (2-177)||(24420874-24421049)
chr4 (17-180)||(24470689-24470852)
chr4 (2-132)||(24421111-24421241)
chr4 (5-177)||(24420490-24420662)
chr4 (5-177)||(24470964-24471136)
chr4 (2-132)||(24470818-24470947)
chr4 (17-132)||(24420679-24420794)
chr4 (5-180)||(24420775-24420950)
chr4 (5-156)||(24470437-24470588)
chr4 (5-159)||(24470725-24470878)
chr4 (5-141)||(24421150-24421286)
chr4 (5-223)||(24470629-24470853)
chr4 (26-126)||(24420589-24420689)
chr4 (13-156)||(24470253-24470396)
chr4 (2-132)||(24420631-24420761)
chr4 (1-142)||(24406468-24406609)
chr4 (2-67)||(24477004-24477069)
chr4 (23-144)||(24477620-24477741)
chr4 (5-177)||(24420394-24420566)
chr4 (5-177)||(24471060-24471232)
chr4 (23-142)||(24406366-24406485)
chr4 (13-132)||(24420343-24420462)
chr4 (2-141)||(24420958-24421097)
chr4 (13-156)||(24421327-24421470)
chr4 (17-126)||(24470928-24471037)
chr4 (53-130)||(24481477-24481553)
chr4 (95-132)||(24481522-24481559)
chr4 (2-125)||(24477447-24477570)
chr4 (2-159)||(24420748-24420905)
chr4 (8-67)||(24421368-24421427)
chr4 (8-67)||(24470296-24470355)
chr4 (1-60)||(24470769-24470828)
chr4 (13-120)||(24471164-24471271)
chr4 (2-45)||(24476978-24477021)
chr4 (185-223)||(24421350-24421388)
chr4 (5-67)||(24481492-24481553)
chr4 (77-114)||(24421486-24421523)
chr4 (77-114)||(24470200-24470237)
chr4 (185-222)||(24470335-24470372)
chr4 (83-132)||(24477074-24477123)
chr4 (5-66)||(24477092-24477153)
chr4 (74-111)||(24482206-24482243)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (38-222)||(4425-4615)
scaffold0879 (5-222)||(4584-4807)
scaffold0879 (2-132)||(4533-4663)
scaffold0879 (2-135)||(4725-4858)
scaffold0879 (5-141)||(4488-4624)
scaffold0879 (2-141)||(4677-4816)
scaffold0879 (2-117)||(4437-4552)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (14-132)||(41900280-41900398)
chr2 (8-117)||(41899959-41900068)
chr2 (17-132)||(41900472-41900587)
chr2 (15-131)||(41900089-41900205)
chr2 (1-135)||(41899893-41900027)
chr2 (2-92)||(41900272-41900362)
chr2 (5-129)||(41899851-41899975)
chr2 (2-156)||(41900016-41900170)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (8-135)||(11879532-11879659)
chr1 (14-144)||(52821068-52821198)
chr1 (14-135)||(11879442-11879563)
chr1 (38-138)||(11902350-11902450)
chr1 (70-144)||(11879690-11879764)
chr1 (62-150)||(11902278-11902366)
chr1 (17-147)||(11882303-11882433)
chr1 (17-147)||(11891537-11891667)
chr1 (8-150)||(11902080-11902222)
chr1 (8-105)||(11879484-11879581)
chr1 (71-144)||(11882501-11882574)
chr1 (71-144)||(11891735-11891808)
chr1 (13-150)||(52821302-52821439)
chr1 (70-150)||(11879642-11879722)
chr1 (13-57)||(11881951-11881995)
chr1 (13-57)||(11891185-11891229)
[»] scaffold1918 (2 HSPs)
scaffold1918 (6-48)||(121-163)
scaffold1918 (14-59)||(425-470)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24421382 - 24421159
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24421382 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccat 24421283  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc-----cacc-cctcctccatatgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||     |||| ||||||||||||||    
T  24421282 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgt 24421183  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||    
T  24421182 ctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 24470533 - 24470756
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24470533 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccat 24470632  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc-----cacc-cctcctccatatgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || | || |||||||||||     |||| ||||||||||||||    
T  24470633 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgt 24470732  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||    
T  24470733 ctacaagtcaccacctccaccatc 24470756  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 24470341 - 24470565
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24470341 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccat 24470440  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc-----cacc-cctcctccatatgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||  || |||| |||||||| ||     |||| ||||||||||||||    
T  24470441 atgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgt 24470540  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatct 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  24470541 ctacaagtcaccacctcctccatct 24470565  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24477519 - 24477388
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24477519 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccat 24477420  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24477419 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccc 24477388  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24477339 - 24477121
Alignment:
Q  14 tacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctaca 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||   || |||||||| || |  ||||| || || |||||||| || |    
T  24477339 tacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtctacaagtccccaccaccaccgtcacactcaccccctccaccatatgtatata 24477240  T
Q  114 agtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgc------cacctccatcc---acccctcctccatatgtctataa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  24477239 agtctcttcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccaccgccacctccatcccctacccctcctccatatgtctataa 24477140  T
Q  205 ggcaccacctcctccatct 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24477139 ggcaccacctcctccatct 24477121  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24477611 - 24477464
Alignment:
Q  9 atgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24477611 atgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgt 24477512  T
Q  109 ctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 156  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24477511 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 24477464  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24421190 - 24420967
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || |||||| | ||||||   || |||||||| || |||||||| || || ||||    
T  24421190 ccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccat 24421091  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatga------gccaccgccacctccatccacccctcctccatatgt 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |       ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  24421090 atatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgt 24420991  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||    
T  24420990 ctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24421049 - 24420874
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||||   || || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24421049 ccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctc 24420950  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctcc 177  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| || |||| ||||||||    
T  24420949 catatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctcc 24420874  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24470689 - 24470852
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24470689 aagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaat 24470788  T
Q  117 ctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc 180  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| || |||| || ||||||||    
T  24470789 ctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatc 24470852  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24421241 - 24421111
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24421241 ccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctc 24421142  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  24421141 catatatttacaagtccccaccaccaccatc 24421111  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24420662 - 24420490
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  24420662 ccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccat 24420563  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctcc 177  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| ||| || |||| ||||||||    
T  24420562 atgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctcc 24420490  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 24470964 - 24471136
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  24470964 ccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccat 24471063  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctcc 177  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||  || || |||| ||||||||    
T  24471064 atgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctcc 24471136  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 24470818 - 24470947
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  24470818 ccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcct-ccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctc 24470916  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    |||| || || ||||| ||||||||| ||||    
T  24470917 catacgtttataagtcacctcctccagcatc 24470947  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24420794 - 24420679
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || |    
T  24420794 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 24420695  T
Q  117 ctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||||||||||||||    
T  24420694 ctcctcctccaccatc 24420679  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24420950 - 24420775
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||   || ||||| ||||| || || || || |||||||    
T  24420950 ccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccat 24420851  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc 180  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| || | || |||||||||||    
T  24420850 atgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatc 24420775  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 24470437 - 24470588
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||||   || ||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  24470437 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccat 24470536  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 156  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24470537 atgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 24470588  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 24470725 - 24470878
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||   ||| || ||||| || || ||||| || || ||||    
T  24470725 ccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccat 24470824  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgttta 159  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24470825 atgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcct-ccccaccatatgttta 24470878  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24421286 - 24421150
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||   || ||||| || || || ||||| || |||||||    
T  24421286 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccat 24421187  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcc 141  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  24421186 atgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctcc 24421150  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 24470629 - 24470853
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||   || ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  24470629 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccat 24470728  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc-----cacccc-tcctccatatgt 198  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  |  | || || || |||||     |||||| ||| ||||||||    
T  24470729 atgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgt 24470828  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatct 223  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  24470829 atataagtcaccacctcctccatct 24470853  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24420689 - 24420589
Alignment:
Q  26 cctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctc 125  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||   || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24420689 cctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctc 24420590  T
Q  126 c 126  Q
    |    
T  24420589 c 24420589  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 24470253 - 24470396
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctac 112  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||   || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||    
T  24470253 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24470352  T
Q  113 aagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470353 aagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgt 24470396  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24420761 - 24420631
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| || || ||   |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24420761 ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctc 24420662  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  24420661 catatatctacaagtcaccaccaccaccatc 24420631  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24406609 - 24406468
Alignment:
Q  1 accaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacct 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||   || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  24406609 accaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacct 24406510  T
Q  101 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcct 142  Q
    || ||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||    
T  24406509 ccttatatctacaagactccacctccacctccaccatctcct 24406468  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24477069 - 24477004
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 67  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24477069 ccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtatacaag 24477004  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477620
Alignment:
Q  23 ccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 122  Q
    |||||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  123 ctccaccatcaccctctcctcc 144  Q
    | || ||||| | |||||||||    
T  24477641 cacctccatctctctctcctcc 24477620  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24420566 - 24420394
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||   |||||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  24420566 ccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccat 24420467  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctcc 177  Q
    |   |||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||  ||| || |||||||||||||    
T  24420466 actactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcc 24420394  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 24471060 - 24471232
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||   |||||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  24471060 ccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccat 24471159  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctcc 177  Q
    |   |||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||  | |||||||||||||    
T  24471160 actactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcc 24471232  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24406485 - 24406366
Alignment:
Q  23 ccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||   || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  24406485 ccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406386  T
Q  123 ctccaccatcaccctctcct 142  Q
    |||||||  |||| ||||||    
T  24406385 ctccacctccaccatctcct 24406366  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24420462 - 24420343
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctac 112  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||   || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | |||    
T  24420462 ctacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttac 24420363  T
Q  113 aagtctcctcctccaccatc 132  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  24420362 aagtctccacctccaccatc 24420343  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24421097 - 24420958
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||    || ||||| || |||||||| || || || |    
T  24421097 ccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccac 24420998  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcc 141  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  24420997 catatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctcc 24420958  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24421470 - 24421327
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctac 112  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||   || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||    
T  24421470 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24421371  T
Q  113 aagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 156  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24421370 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 24421327  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 24470928 - 24471037
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| || || |||||| ||||||||   || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24470928 aagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagt 24471027  T
Q  117 ctcctcctcc 126  Q
    | ||||||||    
T  24471028 cccctcctcc 24471037  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24481553 - 24481477
Alignment:
Q  53 ccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 130  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  24481553 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481522
Alignment:
Q  95 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 24481522  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24477570 - 24477447
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    |||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||   || || || || ||||| ||||| || || |    
T  24477570 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccac 24477471  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctc 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  24477470 catatgtctacaagagtcctcctc 24477447  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24420905 - 24420748
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||   || || ||||| || || || || || || |    
T  24420905 ccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccac 24420806  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgttta 159  Q
    | ||| | || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24420805 cctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgttta 24420748  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24421427 - 24421368
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 67  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  24421427 tatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaag 24421368  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 24470296 - 24470355
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 67  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  24470296 tatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaag 24470355  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 24470769 - 24470828
Alignment:
Q  1 accaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgt 60  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24470769 accaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgt 24470828  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 24471164 - 24471271
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctac 112  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |   || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | |||    
T  24471164 ctacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttac 24471263  T
Q  113 aagtctcc 120  Q
    ||||||||    
T  24471264 aagtctcc 24471271  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 24477021 - 24476978
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacc 45  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24477021 ccaccatatgtatacaagtcaccacctccaccatctacttcacc 24476978  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24421388 - 24421350
Alignment:
Q  185 cctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatct 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24421388 cctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatct 24421350  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24481553 - 24481492
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaag 67  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24481553 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcacc-accccaccatatgtatacaag 24481492  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24421523 - 24421486
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaa 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24421523 ccaccttctccatcgccaccacctccatatgtccacaa 24421486  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Original strand, 24470200 - 24470237
Alignment:
Q  77 ccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaa 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24470200 ccaccttctccatcgccaccacctccatatgtccacaa 24470237  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 24470335 - 24470372
Alignment:
Q  185 cctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24470335 cctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24470372  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24477123 - 24477074
Alignment:
Q  83 tctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  24477123 tctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 24477074  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24477153 - 24477092
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaa 66  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  24477153 ccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaa 24477092  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24482243 - 24482206
Alignment:
Q  74 ccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtcta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24482243 ccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtcta 24482206  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4615
Alignment:
Q  38 ccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  138 ctcctcccccaccgtatgtttatgagccaccgccacctccatc-----cacc-cctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    | ||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||     |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 4615  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 4584 - 4807
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || |||||| | ||||||   || |||||||| || |||||||| || || ||||    
T  4584 ccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccat 4683  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgtttatga------gccaccgccacctccatccacccctcctccatatgt 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |       ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  4684 atatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgt 4783  T
Q  199 ctataaggcaccacctcctccatc 222  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||    
T  4784 ctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 4533 - 4663
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4533 ccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctc 4632  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  4633 catatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 4725 - 4858
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||||   || || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  4725 ccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctc 4824  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcacc 135  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4825 catatgtctacaaatctccacccccaccatcacc 4858  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 4488 - 4624
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   || ||||| || || || ||||| || |||||||    
T  4488 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccat 4587  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcc 141  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  4588 atgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctcc 4624  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 4677 - 4816
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||    || ||||| || |||||||| || || || |    
T  4677 ccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccac 4776  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcc 141  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  4777 catatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctcc 4816  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 4437 - 4552
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    |||||||||||||| |||   ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||  |||||| ||||| || || ||||| || || |    
T  4437 ccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccac 4536  T
Q  102 catatgtctacaagtc 117  Q
    ||||||| ||||||||    
T  4537 catatgtttacaagtc 4552  T

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Target: chr2 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41900398 - 41900280
Alignment:
Q  14 tacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctaca 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41900398 tacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctaca 41900299  T
Q  114 agtctcctcctccaccatc 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41900298 agtctcctcctccaccatc 41900280  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899959
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatg 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  108 tctacaagtc 117  Q
    | ||||||||    
T  41899968 tttacaagtc 41899959  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41900587 - 41900472
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  41900587 aagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccatcaccacaacctaagtatgtctataagt 41900488  T
Q  117 ctcctcctccaccatc 132  Q
    ||||||||||||||||    
T  41900487 ctcctcctccaccatc 41900472  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41900205 - 41900089
Alignment:
Q  15 acaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaa 114  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  41900205 acaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 41900106  T
Q  115 gtctcctcctccaccat 131  Q
     |||||||| |||||||    
T  41900105 atctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41900027 - 41899893
Alignment:
Q  1 accaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || || |||||||| ||||||   || ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  41900027 accaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcct 41899928  T
Q  101 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcacc 135  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  41899927 ccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcacc 41899893  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 41900362 - 41900272
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcac 92  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||    
T  41900362 ccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcac 41900272  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41899975 - 41899851
Alignment:
Q  5 ccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccat 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| || || |||||||  ||||||  |||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41899975 ccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccat 41899876  T
Q  105 atgtctacaagtctcctcctccacc 129  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  41899875 atgtttacaagtctccacctccacc 41899851  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41900170 - 41900016
Alignment:
Q  2 ccaccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctc 101  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||   |||||||||||| | | |||| | ||| | |     
T  41900170 ccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcctccaccaccatatgcatcgctaccccttt 41900071  T
Q  102 catatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccaccgtatgt 156  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||    
T  41900070 cttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgt 41900016  T

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Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 11879532 - 11879659
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||      
T  11879532 tatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctccttact 11879631  T
Q  108 tctacaagtctcctcctccaccatcacc 135  Q
     |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11879632 actacaaatctcctccaccaccctcacc 11879659  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52821198 - 52821068
Alignment:
Q  14 tacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctaca 113  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||   |||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||   |||||    
T  52821198 tacaagtctccccctccaccttctccctcacctccaccaccttactactacaagtctcctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactaca 52821099  T
Q  114 agtctcctcctccaccatcaccctctcctcc 144  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  52821098 agtctcccccaccaccctcaccctcccctcc 52821068  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879563
Alignment:
Q  14 tacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctaca 113  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||| || || || ||||| ||||||   || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  114 agtctcctcctccaccatcacc 135  Q
    |||| || || ||||| |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcacc 11879563  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 11902350 - 11902450
Alignment:
Q  38 ccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 137  Q
    ||||| ||||||||||||||    ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  11902350 ccttcccctcccccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatattactacaagtctcccacaccaccttcaccct 11902449  T
Q  138 c 138  Q
    |    
T  11902450 c 11902450  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Original strand, 11879690 - 11879764
Alignment:
Q  70 tcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcc 144  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  11879690 tcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccaccctcaccctcccctcc 11879764  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 150
Target Start/End: Original strand, 11902278 - 11902366
Alignment:
Q  62 tacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccacc 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||   ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  11902278 tacaagagtcctccaccaccctctccttcacctccacctccttactactataaatcgcctccaccaccctcaccttcccctcccccacc 11902366  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882433
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||    |||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    ||||| |    
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattacaaat 11882402  T
Q  117 ctcctcctccaccatcaccctctcctccccc 147  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11882403 cacctccaccaccatcaccatcacctccccc 11882433  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891667
Alignment:
Q  17 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 116  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||    |||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    ||||| |    
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactattacaaat 11891636  T
Q  117 ctcctcctccaccatcaccctctcctccccc 147  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11891637 cacctccaccaccatcaccatcacctccccc 11891667  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 11902080 - 11902222
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||||   || ||||| || || |||||||| |||||||| || |    
T  11902080 tatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacg 11902179  T
Q  108 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccacc 150  Q
    | |||||||| || || ||||| || || || || ||||||||    
T  11902180 tgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccacc 11902222  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 11879484 - 11879581
Alignment:
Q  8 tatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccata 105  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||||   || |||||||| || || || |||||||| |||||    
T  11879484 tatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 11882501 - 11882574
Alignment:
Q  71 cctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||   ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11882501 cctccaccaccatccccatcaccaccacctccatactactacaaaagtccccctccaccatctccatctcctcc 11882574  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 11891735 - 11891808
Alignment:
Q  71 cctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||   ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11891735 cctccaccaccatccccatcaccaccacctccatactactacaaaagtccccctccaccatctccatctcctcc 11891808  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 52821439 - 52821302
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctac 112  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || ||   |||||||   ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||   ||||    
T  52821439 ctacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactac 52821340  T
Q  113 aagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccacc 150  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  52821339 aagtcacctccaccaccttcaccttcacctcctccacc 52821302  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Original strand, 11879642 - 11879722
Alignment:
Q  70 tcctccaccaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctctcctcccccacc 150  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11879642 tcctccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccacc 11879722  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 11881951 - 11881995
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccata 57  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11881951 ctacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccaccata 11881995  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 11891185 - 11891229
Alignment:
Q  13 ctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccata 57  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891185 ctacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccaccata 11891229  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 121
Alignment:
Q  6 catatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcc 48  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  163 catatgtgtacaagtcaccacctcctccatccccatcacctcc 121  T

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Target: scaffold1918; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 470 - 425
Alignment:
Q  14 tacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 59  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  470 tacaagtcaccaccacctccatcaccgtcacctccaccaccatatg 425  T

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