View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20520_high_9 (Length: 341)

Name: NF20520_high_9
Description: NF20520
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20520_high_9
NF20520_high_9
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (23-341)||(2043-2362)
scaffold0234 (23-341)||(10934-11253)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (23-341)||(21940831-21941150)
chr8 (23-341)||(22171653-22171972)
chr8 (23-341)||(6094289-6094608)
chr8 (80-341)||(15326422-15326683)
chr8 (80-341)||(15506791-15507052)
chr8 (23-341)||(24642815-24643133)
chr8 (202-341)||(28548393-28548532)
chr8 (34-276)||(14983710-14983950)
chr8 (92-228)||(24797224-24797359)
chr8 (29-341)||(8371255-8371563)
chr8 (37-341)||(21969333-21969633)
chr8 (92-341)||(12562178-12562423)
chr8 (92-341)||(25611250-25611495)
chr8 (92-341)||(27007519-27007764)
chr8 (92-341)||(27014662-27014907)
chr8 (92-341)||(27880489-27880734)
chr8 (92-341)||(28020670-28020915)
chr8 (92-341)||(22130611-22130856)
chr8 (104-341)||(22659496-22659729)
chr8 (92-341)||(21916731-21916976)
chr8 (75-327)||(38232115-38232365)
chr8 (104-341)||(45534275-45534508)
chr8 (104-341)||(26240551-26240784)
chr8 (104-341)||(6430953-6431186)
chr8 (112-258)||(8781959-8782102)
chr8 (111-246)||(18835424-18835556)
chr8 (76-234)||(2375231-2375386)
chr8 (104-341)||(2962934-2963171)
chr8 (236-333)||(24796731-24796826)
chr8 (140-327)||(20535226-20535409)
chr8 (71-163)||(32872741-32872833)
chr8 (230-341)||(36970439-36970549)
chr8 (194-316)||(29645675-29645797)
chr8 (230-339)||(2375411-2375520)
chr8 (83-135)||(10920427-10920479)
chr8 (77-133)||(29645575-29645631)
chr8 (23-58)||(28555049-28555084)
chr8 (110-169)||(34659059-34659118)
chr8 (104-143)||(36970332-36970371)
chr8 (283-331)||(41368106-41368154)
chr8 (283-331)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (23-341)||(17684191-17684510)
chr6 (23-341)||(27380974-27381293)
chr6 (23-341)||(27471357-27471676)
chr6 (23-341)||(11651889-11652208)
chr6 (23-341)||(17691162-17691481)
chr6 (23-341)||(29309056-29309375)
chr6 (23-341)||(29316016-29316334)
chr6 (23-341)||(188699-189018)
chr6 (104-341)||(27296877-27297114)
chr6 (71-341)||(16394167-16394437)
chr6 (102-339)||(25536915-25537152)
chr6 (121-341)||(16559194-16559414)
chr6 (19-326)||(13359010-13359314)
chr6 (92-341)||(27508349-27508594)
chr6 (92-341)||(16789126-16789371)
chr6 (92-341)||(22859890-22860135)
chr6 (92-329)||(27527947-27528180)
chr6 (104-341)||(1586110-1586343)
chr6 (23-126)||(16566257-16566361)
chr6 (76-333)||(2669513-2669768)
chr6 (104-321)||(10359073-10359285)
chr6 (92-299)||(18019885-18020088)
chr6 (104-341)||(14074547-14074780)
chr6 (104-341)||(8612982-8613219)
chr6 (106-258)||(20736413-20736562)
chr6 (89-274)||(8510155-8510338)
chr6 (104-246)||(21994655-21994794)
chr6 (104-341)||(17120507-17120740)
chr6 (74-240)||(17850321-17850484)
chr6 (75-209)||(27925973-27926103)
chr6 (72-265)||(28172772-28172963)
chr6 (111-258)||(5758565-5758709)
chr6 (230-341)||(33317055-33317165)
chr6 (104-215)||(22560311-22560419)
chr6 (35-246)||(19218427-19218630)
chr6 (187-326)||(28756145-28756283)
chr6 (71-171)||(19347092-19347191)
chr6 (113-246)||(4073652-4073781)
chr6 (23-63)||(25537160-25537200)
chr6 (92-131)||(13995151-13995190)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (23-341)||(18262378-18262697)
chr4 (23-341)||(18269239-18269558)
chr4 (23-341)||(55612849-55613168)
chr4 (23-341)||(26963806-26964125)
chr4 (23-341)||(26970629-26970948)
chr4 (23-341)||(868763-869082)
chr4 (23-341)||(19926482-19926801)
chr4 (23-341)||(5707486-5707805)
chr4 (23-341)||(5714114-5714433)
chr4 (23-341)||(8858333-8858652)
chr4 (23-341)||(10621055-10621374)
chr4 (29-341)||(10628134-10628447)
chr4 (23-341)||(28392856-28393175)
chr4 (23-341)||(8845369-8845688)
chr4 (23-341)||(4426338-4426645)
chr4 (33-341)||(5667851-5668156)
chr4 (29-341)||(35223732-35224045)
chr4 (111-338)||(10677308-10677534)
chr4 (111-338)||(10890948-10891174)
chr4 (23-341)||(20311458-20311775)
chr4 (92-341)||(15461552-15461797)
chr4 (92-341)||(34975606-34975851)
chr4 (92-341)||(2677068-2677313)
chr4 (92-341)||(15815076-15815321)
chr4 (92-341)||(18111045-18111290)
chr4 (92-341)||(3369025-3369270)
chr4 (92-325)||(17299977-17300206)
chr4 (92-242)||(21453961-21454110)
chr4 (104-341)||(20244004-20244237)
chr4 (104-341)||(26531680-26531913)
chr4 (104-327)||(19365586-19365806)
chr4 (104-341)||(1941791-1942024)
chr4 (104-341)||(4675985-4676218)
chr4 (104-341)||(18163229-18163462)
chr4 (92-341)||(5870473-5870718)
chr4 (33-168)||(56516232-56516368)
chr4 (104-326)||(19362477-19362695)
chr4 (111-327)||(5616469-5616681)
chr4 (75-330)||(32646536-32646789)
chr4 (104-327)||(5528495-5528714)
chr4 (111-341)||(9487625-9487851)
chr4 (123-341)||(30040491-30040705)
chr4 (105-241)||(32636552-32636685)
chr4 (111-327)||(9538033-9538244)
chr4 (104-258)||(4546147-4546298)
chr4 (126-341)||(11421096-11421307)
chr4 (92-246)||(33888594-33888743)
chr4 (83-210)||(34777850-34777975)
chr4 (215-265)||(24701361-24701411)
chr4 (72-118)||(24700245-24700291)
chr4 (234-315)||(9937745-9937826)
chr4 (113-204)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (23-341)||(6110230-6110549)
chr3 (23-341)||(16482205-16482524)
chr3 (23-341)||(10579077-10579396)
chr3 (23-341)||(15600606-15600925)
chr3 (23-341)||(15607151-15607470)
chr3 (23-341)||(10572314-10572633)
chr3 (23-341)||(13211468-13211787)
chr3 (23-341)||(18520141-18520460)
chr3 (30-339)||(18522836-18523146)
chr3 (29-341)||(13248779-13249092)
chr3 (38-341)||(8490676-8490980)
chr3 (23-341)||(15357308-15357627)
chr3 (23-341)||(17780840-17781159)
chr3 (23-341)||(15341941-15342260)
chr3 (23-341)||(32056621-32056941)
chr3 (23-341)||(17199906-17200225)
chr3 (23-341)||(13516977-13517292)
chr3 (29-341)||(1647243-1647556)
chr3 (23-341)||(17136525-17136838)
chr3 (74-341)||(29925189-29925456)
chr3 (74-341)||(29974342-29974609)
chr3 (72-341)||(16200646-16200915)
chr3 (92-341)||(21034293-21034538)
chr3 (92-341)||(15846538-15846783)
chr3 (92-341)||(20147556-20147801)
chr3 (92-341)||(21398847-21399092)
chr3 (92-341)||(14890446-14890691)
chr3 (104-341)||(55427088-55427321)
chr3 (105-341)||(12299978-12300210)
chr3 (104-341)||(25978730-25978963)
chr3 (29-325)||(24253130-24253423)
chr3 (111-309)||(15526827-15527021)
chr3 (104-341)||(11787654-11787887)
chr3 (29-245)||(14147013-14147226)
chr3 (104-341)||(15317178-15317408)
chr3 (158-341)||(28088227-28088406)
chr3 (77-269)||(32280313-32280507)
chr3 (75-204)||(28953965-28954093)
chr3 (190-305)||(30464147-30464261)
chr3 (23-63)||(19089746-19089786)
chr3 (182-246)||(36138033-36138097)
chr3 (75-147)||(8251933-8252005)
chr3 (182-246)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (23-341)||(18252196-18252515)
chr1 (23-341)||(18532236-18532555)
chr1 (23-341)||(27131132-27131450)
chr1 (23-341)||(27310299-27310618)
chr1 (23-341)||(16358757-16359076)
chr1 (29-341)||(3855641-3855954)
chr1 (29-334)||(36816363-36816668)
chr1 (74-341)||(22641596-22641859)
chr1 (29-341)||(27277280-27277592)
chr1 (23-215)||(21171081-21171274)
chr1 (92-341)||(19706441-19706686)
chr1 (92-341)||(28134725-28134970)
chr1 (92-341)||(43802367-43802612)
chr1 (151-341)||(9916499-9916688)
chr1 (92-341)||(9456171-9456416)
chr1 (92-341)||(20391241-20391486)
chr1 (92-341)||(20779647-20779892)
chr1 (92-341)||(22670259-22670504)
chr1 (92-341)||(42816991-42817236)
chr1 (75-341)||(23507119-23507383)
chr1 (92-341)||(22612547-22612792)
chr1 (23-176)||(22657108-22657262)
chr1 (104-323)||(634001-634216)
chr1 (75-265)||(12014084-12014272)
chr1 (111-341)||(8727741-8727967)
chr1 (75-145)||(9917837-9917906)
chr1 (104-327)||(29096789-29097008)
chr1 (92-341)||(47667487-47667721)
chr1 (111-243)||(21881475-21881604)
chr1 (104-168)||(35930649-35930713)
chr1 (111-246)||(51997353-51997485)
chr1 (230-341)||(28145725-28145835)
chr1 (76-276)||(12006332-12006526)
chr1 (91-256)||(24301691-24301855)
chr1 (115-170)||(26923553-26923608)
chr1 (182-241)||(10852402-10852461)
chr1 (125-204)||(31236402-31236478)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (23-339)||(15152609-15152926)
chr7 (23-341)||(29327950-29328269)
chr7 (23-341)||(11535784-11536103)
chr7 (23-341)||(11542702-11543021)
chr7 (18-341)||(12750987-12751311)
chr7 (23-341)||(12738702-12739021)
chr7 (23-341)||(18561173-18561483)
chr7 (75-341)||(13392369-13392635)
chr7 (71-331)||(18257577-18257834)
chr7 (92-341)||(2204607-2204852)
chr7 (92-341)||(8465054-8465299)
chr7 (92-341)||(18400159-18400404)
chr7 (92-341)||(18407143-18407388)
chr7 (92-341)||(48808498-48808743)
chr7 (103-325)||(2365169-2365389)
chr7 (92-331)||(30254193-30254428)
chr7 (104-341)||(15729818-15730051)
chr7 (104-341)||(18139340-18139573)
chr7 (92-341)||(19230943-19231188)
chr7 (104-341)||(41680970-41681203)
chr7 (104-331)||(47166871-47167094)
chr7 (104-341)||(10668903-10669137)
chr7 (111-341)||(34128647-34128873)
chr7 (104-321)||(24443349-24443562)
chr7 (104-341)||(28130628-28130861)
chr7 (115-321)||(25845498-25845700)
chr7 (115-321)||(25845917-25846119)
chr7 (104-341)||(18259126-18259359)
chr7 (104-305)||(19393462-19393659)
chr7 (111-258)||(19388626-19388774)
chr7 (111-246)||(14591924-14592056)
chr7 (111-246)||(16011515-16011647)
chr7 (118-257)||(31190524-31190660)
chr7 (111-243)||(22969024-22969153)
chr7 (195-332)||(39112138-39112275)
chr7 (71-341)||(10235377-10235644)
chr7 (76-159)||(7662569-7662651)
chr7 (155-341)||(15169292-15169474)
chr7 (194-269)||(22948499-22948574)
chr7 (23-63)||(15148308-15148348)
chr7 (92-136)||(19859177-19859221)
chr7 (38-145)||(47833875-47833983)
chr7 (92-169)||(3132910-3132986)
chr7 (101-143)||(7396469-7396511)
chr7 (75-125)||(29983184-29983234)
chr7 (189-253)||(29984308-29984372)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (29-341)||(24695188-24695501)
chr5 (23-341)||(19714220-19714539)
chr5 (23-341)||(19706941-19707259)
chr5 (23-341)||(18569583-18569904)
chr5 (77-337)||(17298627-17298885)
chr5 (23-221)||(39538754-39538953)
chr5 (71-337)||(17285476-17285740)
chr5 (29-256)||(18806843-18807069)
chr5 (169-341)||(27347258-27347428)
chr5 (236-341)||(24701952-24702057)
chr5 (92-341)||(20941082-20941327)
chr5 (104-341)||(22941317-22941550)
chr5 (92-341)||(25805387-25805632)
chr5 (92-341)||(31954-32199)
chr5 (92-341)||(12789665-12789910)
chr5 (92-341)||(23545977-23546222)
chr5 (104-341)||(24933308-24933541)
chr5 (34-210)||(22546872-22547046)
chr5 (104-341)||(31096883-31097116)
chr5 (106-331)||(20100255-20100476)
chr5 (111-330)||(5097725-5097940)
chr5 (111-341)||(12764992-12765222)
chr5 (118-256)||(18806483-18806619)
chr5 (118-256)||(18806663-18806799)
chr5 (104-341)||(7865432-7865669)
chr5 (111-341)||(9811735-9811965)
chr5 (111-341)||(12703876-12704106)
chr5 (94-341)||(18829283-18829530)
chr5 (104-341)||(26129695-26129928)
chr5 (104-341)||(26245169-26245402)
chr5 (258-341)||(28719477-28719558)
chr5 (262-341)||(39538954-39539033)
chr5 (114-210)||(31651917-31652009)
chr5 (71-116)||(27347425-27347470)
chr5 (92-168)||(33477193-33477269)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (23-341)||(7273-7592)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (23-341)||(6656-6975)
scaffold0390 (23-341)||(13672-13991)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (23-341)||(18454-18772)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (23-341)||(25712-26031)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (23-341)||(21329970-21330289)
chr2 (23-341)||(18796672-18796991)
chr2 (29-334)||(18619976-18620281)
chr2 (72-334)||(20978091-20978351)
chr2 (85-341)||(36270395-36270648)
chr2 (83-329)||(6991847-6992094)
chr2 (29-329)||(22183220-22183518)
chr2 (75-331)||(18822302-18822556)
chr2 (92-341)||(30174432-30174677)
chr2 (92-341)||(24250034-24250279)
chr2 (104-331)||(15342014-15342237)
chr2 (104-341)||(24229217-24229450)
chr2 (111-327)||(29800545-29800757)
chr2 (180-314)||(17241034-17241167)
chr2 (76-168)||(19279508-19279600)
chr2 (111-258)||(19616509-19616653)
chr2 (75-166)||(18851956-18852047)
chr2 (111-245)||(40301034-40301164)
chr2 (113-318)||(41316305-41316506)
chr2 (111-246)||(21626824-21626955)
chr2 (196-276)||(36799745-36799826)
chr2 (276-338)||(41661694-41661756)
chr2 (182-258)||(28740910-28740986)
chr2 (71-145)||(36801899-36801974)
chr2 (107-170)||(28718943-28719006)
chr2 (104-145)||(24763751-24763792)
chr2 (104-145)||(28741220-28741261)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (23-324)||(1159-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (87-341)||(230113-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (23-341)||(5695-6007)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (92-341)||(238-483)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (92-341)||(3677-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (92-341)||(119785-120030)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (104-331)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (104-341)||(67376-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (92-305)||(130262-130471)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (104-341)||(26609-26842)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (92-246)||(8360-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (104-341)||(39990-40223)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (113-315)||(8807-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (153-341)||(102-286)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (111-341)||(11528-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (111-246)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (104-341)||(53832-54064)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (29-159)||(90019-90151)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (75-166)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (123-219)||(11328-11421)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2043
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatca 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10934
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatca 10934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941150
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatca 21941150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171972
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatca 22171972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094608
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatca 6094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 80 - 341
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326683
Alignment:
Q  80 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  280 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15326683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 80 - 341
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507052
Alignment:
Q  80 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  280 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15507052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643133
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatca 24643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 202 - 341
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548532
Alignment:
Q  202 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  302 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 28548532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 132  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaatatt 14983851  T
Q  133 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcga 231  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  14983850 -atattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  232 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797224
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 24797260  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797259 agatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371255
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgacc-gcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  127 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 226  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8371369  T
Q  227 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 326  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  8371368 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgg 8371270  T
Q  327 gtactccatgaatca 341  Q
    |||||  ||||||||    
T  8371269 gtacttgatgaatca 8371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969633
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcagcaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgacc-gcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatattta 21969430  T
Q  135 tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||    
T  21969431 tattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacct 21969527  T
Q  235 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 334  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  21969528 gaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttga 21969626  T
Q  335 tgaatca 341  Q
    |||||||    
T  21969627 tgaatca 21969633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 12562178 - 12562423
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12562178 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 12562274  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  12562275 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 12562373  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12562374 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12562423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611495
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcata 25611346  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25611347 agatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25611445  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25611446 gtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatca 25611495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27007764 - 27007519
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27007764 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27007668  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27007667 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27007569  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27007568 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 27007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014662
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27014907 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27014811  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27014810 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27014712  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27014711 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 27014662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27880734 - 27880489
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27880734 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27880638  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27880637 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27880539  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27880538 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 27880489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28020915 - 28020670
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28020915 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 28020819  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28020818 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28020720  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28020719 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 28020670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22130856 - 22130611
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22130856 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22130760  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22130759 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22130661  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22130660 gtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 22130611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659496
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 22659496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 21916731 - 21916976
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||    
T  21916731 tatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcata 21916827  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21916828 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21916926  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  21916927 gtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatgaatca 21916976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38232365 - 38232115
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38232365 gatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaag 38232268  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    ||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  38232267 ttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactt 38232169  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232168 tgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534275
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 45534412  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||    
T  45534411 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 45534313  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  45534312 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 45534275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240784
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||  |  |||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| |||    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 26240784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431186
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 6431186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  112 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 18835424 - 18835556
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18835424 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgata 18835520  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     ||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18835521 atggtgtatatcactcttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 234
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375386
Alignment:
Q  76 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||  ||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata--aaaagt 2375328  T
Q  176 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    |||| |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375329 tatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962934
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  |||||| |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  201 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 300  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  301 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatca 2962934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  140 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 239  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  240 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970549
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  36970538 cttgatgaatca 36970549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 316
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  194 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  294 ccgtaacaggatgactataaagt 316  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 339
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375520
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  330 ctccatgaat 339  Q
    ||||||||||    
T  2375511 ctccatgaat 2375520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  83 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 135  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  77 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 133  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  110 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 169  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 143
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  283 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  283 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684191
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatca 17684191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380974
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatca 27380974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471357
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatca 27471357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652208
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatca 11652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691162
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatca 17691162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309375
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatca 29309375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316334
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatca 29316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188699
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  188718 gatggatactccataaatca 188699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297114
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 27297114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 71 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394167
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  171 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  271 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 16394167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  102 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  202 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  302 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 121 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559194
Alignment:
Q  121 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatca 16559194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  19 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 117  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||   | | || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  118 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 216  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  217 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  317 tggttgatgg 326  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27508594 - 27508349
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27508594 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27508498  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27508497 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27508399  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27508398 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 27508349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 16789126 - 16789371
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  16789126 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 16789222  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  16789223 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 16789321  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16789322 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 16789371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22860135 - 22859890
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22860135 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22860039  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  22860038 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 22859940  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22859939 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 22859890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27528180 - 27527947
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27528180 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27528084  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27528083 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27527985  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27527984 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586110
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 1586247  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  1586246 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 1586148  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1586147 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 1586110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  122 ggagt 126  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 333
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669768
Alignment:
Q  76 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 175  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  176 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 274  Q
    | |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  275 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 333  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  304 atgactataaagttggtt 321  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18020088 - 18019885
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18020088 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18019992  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||    
T  18019991 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgtt 18019893  T
Q  292 gtccgtaa 299  Q
    ||| ||||    
T  18019892 gtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 14074547 - 14074780
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  14074547 acataggtataaatattgggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcac 14074643  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | |||||   ||||||    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| |||    
T  14074644 aatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaagg 14074742  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14074743 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 14074780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613219
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  201 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 300  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  301 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatca 8613219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  106 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  206 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 274
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  89 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 187  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  188 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 274  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 246
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120507
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatca 17120507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17850484 - 17850321
Alignment:
Q  74 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 173  Q
    ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||  |        
T  17850484 agatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat--tgggt 17850387  T
Q  174 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 240  Q
     |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850386 tttatg-taagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926103
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||     
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactacacag--aaaa 27926069  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 209  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926070 ttatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 265
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172963
Alignment:
Q  72 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 171  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||   |    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaatgttacatat--a 28172869  T
Q  172 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
    |  |||||  ||   ||| | |  ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172870 actttatgtgaaac-tcacacgtcatctttatagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317165
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  33317154 cttgatgaatca 33317165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  204 agtgatagtggt 215  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgagcagcaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgacca-cacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaatt 19218524  T
Q  133 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    |||||||     | || || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| |||    
T  19218525 tatattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagac 19218616  T
Q  233 ctgaaaccactatg 246  Q
    ||||||||||||||    
T  19218617 ctgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  187 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  287 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 326  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 4073652 - 4073781
Alignment:
Q  113 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 212  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||      
T  4073652 taaatattagaggtaatatttatatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataac 4073747  T
Q  213 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    | ||||| |||  ||| ||||| |||||||||||    
T  4073748 gatgtataccaatcttagacctaaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537160
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 63  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatga 25537160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13995190 - 13995151
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995190 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262697
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatca 18262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269558
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatca 18269558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613168
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatca 55613168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964125
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatca 26964125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970948
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatca 26970948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869082
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatca 869082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926482
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatca 19926482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707805
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatca 5707805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714433
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatca 5714433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858652
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatca 8858652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621055
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatca 10621055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628134
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatca 10628134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392856
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatca 28392856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845688
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatca 8845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426338
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatca 4426338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667851
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgagcagcaccacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| || | | || |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatcatctc-acggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatt 5668058  T
Q  133 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5668057 tatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagac 5667958  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667957 ctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactc 5667860  T
Q  333 catgaatca 341  Q
    || ||||||    
T  5667859 cacgaatca 5667851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224045
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||   | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||| ||||||    
T  35224032 tactccacgaatca 35224045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677308
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10677308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890948
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311775
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagc-accacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||   | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtatt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  | |||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttatgtaac-tatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || ||||||||| ||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatca 20311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 15461552 - 15461797
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15461552 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15461648  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15461649 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15461747  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  15461748 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 15461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 34975606 - 34975851
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  34975606 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 34975702  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  34975703 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgtt 34975801  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34975802 gtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 34975851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 2677068 - 2677313
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2677068 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 2677164  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2677165 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2677263  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  2677264 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 2677313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 15815076 - 15815321
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15815076 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15815172  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15815173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15815271  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15815272 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 15815321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18111290 - 18111045
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18111290 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18111194  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18111193 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18111095  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  18111094 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 18111045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3369270 - 3369025
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3369270 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 3369174  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3369173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3369075  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3369074 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 3369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17300206 - 17299977
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  17300206 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 17300110  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  17300109 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 17300011  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  17300010 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatg 17299977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 242  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244237
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20244100  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  20244101 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20244199  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20244200 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 20244237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531913
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26531776  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  26531777 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 26531875  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26531876 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 26531913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 327
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  203 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 302  Q
     | ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  303 gatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942024
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| |||    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 1942024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4675985
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 4676122  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||    
T  4676121 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaagg 4676023  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  4676022 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 4675985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 18163229 - 18163462
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18163229 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18163325  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18163326 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18163424  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18163425 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 5870473 - 5870718
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  5870473 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 5870569  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
     |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| ||||||    
T  5870570 tgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgtt 5870668  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5870669 gtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatca 5870718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  132 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 168  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgg 326  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 327
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  311 taaagttggttgatggg 327  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646536
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||  ||| |    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaagg 32646692  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    ||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || |||    
T  32646691 ttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactt 32646593  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 330  Q
    |||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32646592 tgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtac 32646536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  304 atgactataaagttggttgatggg 327  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487851
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatca 9487851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040491
Alignment:
Q  123 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 222  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  223 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 322  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  323 atgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||||  ||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatca 30040491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  105 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 241  Q
     ||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 327
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  311 taaagttggttgatggg 327  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546298
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 341
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421307
Alignment:
Q  126 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 225  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  226 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  326 ggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||| ||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatca 11421307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  83 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  183 agtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  215 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 118
Target Start/End: Original strand, 24700245 - 24700291
Alignment:
Q  72 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700245 acagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  234 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  113 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110549
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatca 6110549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482205
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatca 16482205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579077
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatca 10579077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600606
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatca 15600606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607151
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatca 15607151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572314
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatca 10572314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211787
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatca 13211787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520460
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatca 18520460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 339
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  129 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  329 actccatgaat 339  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249092
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatca 13249092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490980
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  137 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  8490976 aatca 8490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357308
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatca 15357308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780840
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatca 17780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatca 15341941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056621
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  121 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatca 32056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199906
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatca 17199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517292
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatca 13517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647243
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatca 1647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136838
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatca-catttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------t 17136617  T
Q  121 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136618 aggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 17136717  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136718 ccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 17136817  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  17136818 tgatggatactccatgaatca 17136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 74 - 341
Target Start/End: Original strand, 29925189 - 29925456
Alignment:
Q  74 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 173  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29925189 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29925288  T
Q  174 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29925289 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29925388  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29925389 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatca 29925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 74 - 341
Target Start/End: Original strand, 29974342 - 29974609
Alignment:
Q  74 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 173  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29974342 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29974441  T
Q  174 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29974442 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29974541  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29974542 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatca 29974609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 341
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200915
Alignment:
Q  72 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  172 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 271  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  272 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatca 16200915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 21034293 - 21034538
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21034293 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21034389  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21034390 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21034488  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21034489 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 21034538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15846783 - 15846538
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15846783 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15846687  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  15846686 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 15846588  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  15846587 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 15846538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20147801 - 20147556
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20147801 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20147705  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20147704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20147606  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20147605 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 20147556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21399092
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21398943  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21398944 agatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21399042  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21399043 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 21399092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 14890446 - 14890691
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  14890446 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 14890542  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  14890543 agatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 14890641  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14890642 gtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 14890691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427321
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 55427184  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  55427185 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 55427283  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  55427284 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 55427321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300210
Alignment:
Q  105 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12300210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978730
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 25978730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||   | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 309
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 309  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787887
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatca 11787887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 126  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| || || | ||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||     
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgacca-catctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagg 14147110  T
Q  127 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 226  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |    
T  14147111 aatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactc 14147207  T
Q  227 ttcgacctgaaaccactat 245  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14147208 ttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317178
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatca 15317178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 341
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088406
Alignment:
Q  158 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  258 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
     |||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28088324 -tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatca 28088406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 269
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  77 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 176  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  177 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 173  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  174 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  190 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  290 ttgtccgtaacaggat 305  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089746
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 63  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatga 19089746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8252005 - 8251933
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatc 147  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8252005 gatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatatttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252515
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatca 18252515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532236
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatca 18532236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131132
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatca 27131132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310299
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatca 27310299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358757
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatca 16358757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855641
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatca 3855641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816363
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  328 tactcca 334  Q
    |||||||    
T  36816369 tactcca 36816363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641596
Alignment:
Q  74 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  174 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatca 22641596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277280
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||    
T  27277293 tactccataaatca 27277280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19706686 - 19706441
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  19706686 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 19706590  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  19706589 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 19706491  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19706490 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 19706441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28134970 - 28134725
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28134970 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 28134874  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28134873 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28134775  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28134774 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 28134725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43802612 - 43802367
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  43802612 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 43802516  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  43802515 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 43802417  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  43802416 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 43802367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916499
Alignment:
Q  151 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 248  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  249 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatca 9916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 9456171 - 9456416
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  9456171 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 9456267  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  9456268 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 9456366  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9456367 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 9456416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20391486 - 20391241
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||    
T  20391486 tatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcata 20391390  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20391389 agatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20391291  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20391290 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 20391241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20779892 - 20779647
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20779892 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20779796  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20779795 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20779697  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20779696 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 20779647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22670504 - 22670259
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22670504 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22670408  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22670407 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22670309  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22670308 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 22670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42817236 - 42816991
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  42817236 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 42817140  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  42817139 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 42817041  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42817040 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 42816991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 341
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507383
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||  || |    
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacg 23507216  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    || || |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||    
T  23507217 ttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatca 23507383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612792
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22612643  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22612644 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22612742  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22612743 gtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatca 22612792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||   | || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 176  Q
     |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634216
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  304 atgactataaagttggttga 323  Q
    || || |||| |||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12014272 - 12014084
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  12014272 gatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaat 12014173  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
     | | ||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014172 atgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727967
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatca 8727967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 327
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  304 atgactataaagttggttgatggg 327  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47667721 - 47667487
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||           |||||  |||||||||  |||||||    
T  47667721 tatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaccgtga-----------agtaa--gttatgaaat-tgtcata 47667636  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  47667635 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 47667537  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  47667536 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 47667487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 243  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     || | ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145725
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  28145736 cttgatgaatca 28145725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006332
Alignment:
Q  76 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 175  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    || |||||||||||||  || | ||  |  ||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactg----gacccgccatgagaatgttagagag--agcgt 12006433  T
Q  176 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 274  Q
    |||| |||  |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||    
T  12006432 tatgtaaa-agtcacaagtcattctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtacttt 12006334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  91 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtca 189  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  190 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  115 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 241  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  125 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  322 gatgggtactccatgaat 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328269
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatca 29328269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535784
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatca 11535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542702
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatca 11542702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751311
Alignment:
Q  18 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  117 tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  217 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  317 tggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatca 12751311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739021
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatca 12739021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561483
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||||| || ||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatca 18561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 341
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392635
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  275 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatca 13392635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18257834 - 18257577
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||     
T  18257834 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt- 18257736  T
Q  171 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 270  Q
     | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||    
T  18257735 -atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtg 18257638  T
Q  271 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18257637 ctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtact 18257577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 2204607 - 2204852
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2204607 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 2204703  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2204704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2204802  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  2204803 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 2204852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 8465054 - 8465299
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  8465054 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 8465150  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||    
T  8465151 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacatt 8465249  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  8465250 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 8465299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 18400159 - 18400404
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18400159 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18400255  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18400256 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18400354  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  18400355 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 18400404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 18407143 - 18407388
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18407143 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18407239  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18407240 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18407338  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  18407339 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 18407388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48808743 - 48808498
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  48808743 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 48808647  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  48808646 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 48808548  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  48808547 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 48808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365389
Alignment:
Q  103 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  203 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 301  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  302 ggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatg 2365389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 331
Target Start/End: Original strand, 30254193 - 30254428
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  30254193 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 30254289  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30254290 agatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30254388  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254389 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15730051
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15729914  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15729915 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15730013  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  15730014 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 15730051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139340
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18139477  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18139476 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18139378  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18139377 ataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18139340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 19230943 - 19231188
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  19230943 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcata 19231039  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  19231040 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 19231138  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19231139 gtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 19231188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680970
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatca 41680970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    || || |||| |||||||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10669137 - 10668903
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-a 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  10669137 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgc 10669041  T
Q  203 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 302  Q
     | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||    
T  10669040 aattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaag 10668942  T
Q  303 gatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10668941 gataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 10668903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128873
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatca 34128873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443349
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  304 atgactataaagttggtt 321  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  24443366 atgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130861
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatca 28130861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845498
Alignment:
Q  115 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  215 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 314  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  315 gttggtt 321  Q
    |||||||    
T  25845504 gttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845917
Alignment:
Q  115 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  215 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 314  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  315 gttggtt 321  Q
    |||||||    
T  25845923 gttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259126
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393462
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaagg 19393464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388774
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  209 tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    || | |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  118 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 217  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  218 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 257  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 243  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  195 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  295 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 341
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235644
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||  |||||||      
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatgagaattatacatag-- 10235474  T
Q  171 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttc-gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    |  ||||||  ||| |||||||| |||| |  || ||||| || || ||  || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||     
T  10235475 agtgttatg-taagagtcataagttattattgtaatgataatgatgcatatcatccttctgacatgaaaccactatcgaccctagatgtagg-gtcgaga 10235572  T
Q  270 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
     || |||  ||||| ||   |||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10235573 actgtgttgccatttaattattgttcgtagcaggatgaccataaactcggttgatgggtactccataaatca 10235644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  76 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 159  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169292
Alignment:
Q  155 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 254  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  255 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatca 15169292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  194 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148348
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 63  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 15148348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 19859177 - 19859221
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 136  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859177 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 136  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  137 ttggattga 145  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 169  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  101 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 143  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Original strand, 29983184 - 29983234
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983184 gatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  189 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 253  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695188
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatca 24695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714220
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatca 19714220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatca 19706941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569583
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  120 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  220 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  320 ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatca 18569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298627
Alignment:
Q  77 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 176  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  177 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttg 275  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  276 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    |  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17298627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285476
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  171 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| ||||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  270 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17285476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatca-catttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagt 18806971  T
Q  127 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacc 225  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18806970 aatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacc 18806874  T
Q  226 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806873 cttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347258
Alignment:
Q  169 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  269 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 27347258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701952
Alignment:
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  336 gaatca 341  Q
    ||||||    
T  24701957 gaatca 24701952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 20941082 - 20941327
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20941082 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20941178  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  20941179 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 20941277  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20941278 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 20941327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941550
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 22941550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25805632 - 25805387
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25805632 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 25805536  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25805535 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25805437  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25805436 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 25805387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 31954 - 32199
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  31954 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 32050  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  32051 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 32149  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  32150 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 32199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12789910 - 12789665
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12789910 tatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 12789814  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  12789813 agatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 12789715  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12789714 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12789665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 23545977 - 23546222
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  23545977 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 23546073  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  23546074 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 23546172  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  23546173 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 23546222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933308
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24933445  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  24933444 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24933346  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  24933345 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 24933308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546872
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 132  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  133 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 31096883 - 31097116
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31096883 acataggtataaattataggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 31096979  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  31096980 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 31097078  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  31097079 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 31097116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20100476 - 20100255
Alignment:
Q  106 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 205  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  20100476 ataggtatcaatattaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaa 20100380  T
Q  206 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 305  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20100379 tgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggat 20100281  T
Q  306 gactataaagttggttgatgggtact 331  Q
     || |||| |||||||||||||||||    
T  20100280 aaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097940
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  311 taaagttggttgatgggtac 330  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtac 5097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764992
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  208 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 307  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  308 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12764992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  118 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  217 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  118 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  217 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865432
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  201 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 300  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  301 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatca 7865432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811735
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  208 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 307  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  308 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 9811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703876
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  208 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 307  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  308 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12703876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829283
Alignment:
Q  94 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 193  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  194 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 292  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  293 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatca 18829283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129695
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatca 26129695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245402
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | || || | ||||||  | | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatca 26245402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719477
Alignment:
Q  258 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 28719477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 341
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539033
Alignment:
Q  262 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatca 39539033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  114 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27347470 - 27347425
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347470 cacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33477269 - 33477193
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 168  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477269 tatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7592
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatca 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6656
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatca 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13672
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatca 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18772
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatca 18772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25712
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25731 gatgggtactccataaatca 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329970
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatca 21329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796991
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatca 18796991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620281
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||   | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  328 tactcca 334  Q
    |||||||    
T  18620275 tactcca 18620281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 334
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978351
Alignment:
Q  72 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  172 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 270  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  271 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 334  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactcca 20978351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 341
Target Start/End: Original strand, 36270395 - 36270648
Alignment:
Q  85 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaag 184  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||    
T  36270395 aaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag 36270492  T
Q  185 tgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 283  Q
     |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || |     
T  36270493 -gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgta 36270590  T
Q  284 caaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36270591 caaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatca 36270648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6992094 - 6991847
Alignment:
Q  83 ataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga 180  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  |||||     
T  6992094 ataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgt 6991997  T
Q  181 aaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtca 278  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||      
T  6991996 aa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgttt 6991898  T
Q  279 ccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6991897 ctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183220
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 127  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||| ||   | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  128 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 226  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  227 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 326  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 331
Target Start/End: Original strand, 18822302 - 18822556
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 174  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |    
T  18822302 gatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacg 18822399  T
Q  175 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 273  Q
    ||||| ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  18822400 ttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtactt 18822498  T
Q  274 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    | |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822499 ttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 30174432 - 30174677
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  30174432 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 30174528  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30174529 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30174627  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30174628 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 30174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24250279 - 24250034
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  24250279 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 24250183  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  24250182 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 24250084  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  24250083 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 24250034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24229450 - 24229217
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24229450 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24229354  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| | | |||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  24229353 aatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 24229255  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  24229254 ataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatca 24229217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 327
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800757
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
     |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  311 taaagttggttgatggg 327  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  29800741 taatgttggttaatggg 29800757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 314
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241167
Alignment:
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttca-ccttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  280 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 314  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaa 17241167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  76 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616653
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
     | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18852047 - 18851956
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18852047 gatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 245  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  113 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  213 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 312  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  313 aagttg 318  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  196 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661756
Alignment:
Q  276 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaa 41661756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36801974 - 36801899
Alignment:
Q  71 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga-tataaatattaggagtaatatttatattggattga 145  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  36801974 cacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  107 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 145  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 23 - 324
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  322 gat 324  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 87 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230113
Alignment:
Q  87 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  187 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  287 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatca 230113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6007
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  122 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  221 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 319  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  320 ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatca 6007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 238 - 483
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  238 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 334  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  335 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 433  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  434 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3922 - 3677
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3922 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 3826  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3825 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3727  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  3726 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 3677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 341
Target Start/End: Original strand, 119785 - 120030
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  119785 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 119881  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  119882 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 119980  T
Q  292 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  119981 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatca 120030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67376
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 67376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 130471 - 130262
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  130471 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 130375  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 291  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  130374 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 130276  T
Q  292 gtccgtaacaggat 305  Q
    ||| |||| |||||    
T  130275 gtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26842
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatca 26842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8511
Alignment:
Q  92 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  8360 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 8456  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  8457 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40223 - 39990
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40223 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 40127  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  40126 agtgataatggtgtatataactcttagacttgaaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaagg 40028  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||||||||| | |||| ||||  ||||||||    
T  40027 ataaccataaagttggctaatggttacttgatgaatca 39990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 315
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  113 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  213 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 312  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 102 - 286
Alignment:
Q  153 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 252  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  253 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11528
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  208 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 307  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  308 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 11528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  111 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54064
Alignment:
Q  104 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 54064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90019
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcagcac-cacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 126  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||   | ||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  127 aatatttatattggattgatccgccatgagaat 159  Q
    || ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90051 aacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 166
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  75 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 166  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  123 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 219  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University