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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20522_high_17 (Length: 240)

Name: NF20522_high_17
Description: NF20522
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20522_high_17
NF20522_high_17
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (10-198)||(45566237-45566426)
chr1 (10-198)||(48469835-48470024)
chr1 (13-198)||(17331783-17331969)
chr1 (10-198)||(49228714-49228904)
chr1 (10-54)||(23827949-23827993)
chr1 (10-50)||(24682502-24682542)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (10-198)||(41202297-41202486)
chr7 (10-196)||(49113046-49113232)
chr7 (15-198)||(17510720-17510904)
chr7 (15-198)||(17542310-17542494)
chr7 (10-187)||(4267354-4267532)
chr7 (10-198)||(17475131-17475320)
chr7 (10-198)||(17577894-17578083)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (10-198)||(3436140-3436328)
chr5 (36-198)||(20337930-20338093)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (10-188)||(9471336-9471515)
chr2 (36-198)||(17921196-17921358)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (10-198)||(50737358-50737549)
chr3 (10-198)||(50775306-50775497)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (10-198)||(12076071-12076253)
chr6 (10-198)||(12271636-12271825)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (10-112)||(16030229-16030332)
chr4 (133-198)||(16030177-16030242)
chr4 (10-104)||(50005298-50005389)
chr4 (134-168)||(50005232-50005266)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45566426 - 45566237
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  45566426 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttact 45566327  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45566326 atatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 45566237  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 48469835 - 48470024
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  48469835 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttact 48469934  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469935 atatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 48470024  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17331969 - 17331783
Alignment:
Q  13 aaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttaccata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  17331969 aaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgttaatcagtatagttactata 17331870  T
Q  112 tataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    |||||       |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17331869 tataatttttctagggaacatcatagtccctatattgtcttgcaagatccacatatataatataattaattaattagccaacacatg 17331783  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 49228714 - 49228904
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata--tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  49228714 aagagaataacaattattcatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaattagtataattac 49228813  T
Q  108 catatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
     ||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49228814 tatatataatttttttagggaacatcatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 49228904  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Original strand, 23827949 - 23827993
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataa 54  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827949 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataa 23827993  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 24682502 - 24682542
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaac 50  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24682502 aagagaataaaaattattcatactaacatagtaacattaac 24682542  T

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Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41202486 - 41202297
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  41202486 aagagaataacaattatccatactaagatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttact 41202387  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41202386 atatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 41202297  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 49113232 - 49113046
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  49113232 aagagaataacaattattcatactaacatagtaacat-aacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttact 49113134  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacaca 196  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113133 atatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacaca 49113046  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 17510720 - 17510904
Alignment:
Q  15 aataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttaccatata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  17510720 aataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatattcattaaattcatttgctaattagtatagttactatata 17510819  T
Q  114 taannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    |||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17510820 taatttttttagggaacagtatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 17510904  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17542494 - 17542310
Alignment:
Q  15 aataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttaccatata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  17542494 aataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatattcattaaattcatttgctaattagtatagttactatata 17542395  T
Q  114 taannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    |||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17542394 taatttttttagggaacagtatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 17542310  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4267532 - 4267354
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  4267532 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcaatatagttact 4267433  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaatta 187  Q
    ||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4267432 atatataattttttcagggaacagcatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaatta 4267354  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 17475131 - 17475320
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  17475131 aagagaataacaattatccatactaatatagtaacattaacataattgtacattaaaaaagtatattcattaaattcatttgctaattagtatagttact 17475230  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||       ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17475231 atatataatttttttagggaacagtatagtcactatattgtcttacaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 17475320  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17578083 - 17577894
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  17578083 aagagaataacaattatccatactaatatagtaacattaacataattgtacattaaaaaagtatattcattaaattcatttgctaattagtatagttact 17577984  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||       ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577983 atatataatttttttagggaacagtatagtcactatattgtcttacaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 17577894  T

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Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 3436140 - 3436328
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaatatatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacca 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  3436140 aagagaataataattatccatactaatatagtaacattgacataattgtacactaaaaaatatatttattaaattcatttgctaaccagtatagttacca 3436239  T
Q  110 tatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3436240 tatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 3436328  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 20337930 - 20338093
Alignment:
Q  36 catagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttaccatatataannnnnnnagggaacaaca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||| ||||||||       |||||||| ||    
T  20337930 catagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttactgatgagtatagttactatatataattcttttagggaacagca 20338029  T
Q  135 tagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20338030 tagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 20338093  T

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Target: chr2 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9471515 - 9471336
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  9471515 aagagaataacaattatccatactaagatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttact 9471416  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattag 188  Q
    ||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9471415 atatataatttttttagggaacatcatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattag 9471336  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17921358 - 17921196
Alignment:
Q  36 catagtaacattaacataattgtacactaaaatatatatttattaaatttatttgataatcagtatagttaccatatataannnnnnnagggaacaacat 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||    
T  17921358 catagtaacattaacacaattgtacactaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagttactatatataatttttgtagggaacaacat 17921259  T
Q  136 agtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17921258 agtcaatatattgtcttggaagatccacatatatgatataattaattaattagccaatacatg 17921196  T

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Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 50737358 - 50737549
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacact-aaaatatatatttattaaatttatttgataatcagtatagttac- 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  50737358 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaaatatatttattaaattcatttgctaatctgtatagttact 50737457  T
Q  108 -catatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
      ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50737458 atatatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagctaatacatg 50737549  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50775497 - 50775306
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacact-aaaatatatatttattaaatttatttgataatcagtatagttac- 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  50775497 aagagaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaaatatatttattaaattcatttgctaatctgtatagttact 50775398  T
Q  108 -catatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
      ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50775397 atatatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagctaatacatg 50775306  T

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Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 12076071 - 12076253
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaatatatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacca 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12076071 aagagaataacaattatacatactaacatagtaacattaacataattgaacaag------tatatttattaaatttatttgctaatcagtatagttacta 12076164  T
Q  110 tatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
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T  12076165 tatataatttttttagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 12076253  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Original strand, 12271636 - 12271825
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  12271636 aagagaataacaattatccatactaagataataacattaacataattgtacacgaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaattagtatagttact 12271735  T
Q  109 atatataannnnnnnagggaacaacatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
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T  12271736 atatataatttttttagggaacaaaatagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaaaacatg 12271825  T

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Target: chr4 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16030332 - 16030229
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagttacc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  16030332 aagaaaataacaattatccataccaacatagtaacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagcatagttact 16030233  T
Q  109 atat 112  Q
    ||||    
T  16030232 atat 16030229  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16030242 - 16030177
Alignment:
Q  133 catagtcactatattgtcttgcaagatccacatatatgatataattaattaattagccaacacatg 198  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16030242 catagttactatattgtcttccaagatccacatatataatataattaattaattagccaacacatg 16030177  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 50005389 - 50005298
Alignment:
Q  10 aagaaaataacaattatccatactaacatagtaacattaacataattgtacactaaaata-tatatttattaaatttatttgataatcagtatagt 104  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50005389 aagagaataacatttatccataccaac----taacattaacataattgtacactaaaaaagtatatttattaaattcatttgctaatcagtatagt 50005298  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50005266 - 50005232
Alignment:
Q  134 atagtcactatattgtcttgcaagatccacatata 168  Q
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T  50005266 atagtcactatattgtcttgcaagatccacatata 50005232  T

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