View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20525_high_12 (Length: 352)

Name: NF20525_high_12
Description: NF20525
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20525_high_12
NF20525_high_12
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (24-345)||(2041-2362)
scaffold0234 (24-345)||(10932-11253)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (24-345)||(17684189-17684510)
chr6 (24-345)||(27380972-27381293)
chr6 (24-345)||(27471355-27471676)
chr6 (24-345)||(11651889-11652210)
chr6 (24-345)||(17691160-17691481)
chr6 (24-345)||(29309056-29309377)
chr6 (24-345)||(29316016-29316336)
chr6 (24-345)||(188697-189018)
chr6 (106-345)||(27296877-27297116)
chr6 (72-345)||(16394165-16394438)
chr6 (104-341)||(25536915-25537152)
chr6 (123-344)||(16559193-16559414)
chr6 (20-328)||(13359010-13359314)
chr6 (24-128)||(16566257-16566361)
chr6 (38-345)||(16789071-16789373)
chr6 (38-345)||(22859888-22860190)
chr6 (38-345)||(27508347-27508649)
chr6 (38-345)||(1586108-1586410)
chr6 (38-331)||(27527947-27528235)
chr6 (41-335)||(2669476-2669768)
chr6 (38-345)||(14074480-14074782)
chr6 (38-301)||(18019885-18020143)
chr6 (30-323)||(10359073-10359359)
chr6 (38-345)||(8612915-8613221)
chr6 (39-211)||(27925935-27926103)
chr6 (39-242)||(17850321-17850521)
chr6 (56-267)||(28172754-28172963)
chr6 (108-260)||(20736413-20736562)
chr6 (91-276)||(8510155-8510338)
chr6 (106-345)||(17120505-17120740)
chr6 (30-162)||(20553492-20553622)
chr6 (106-248)||(21994655-21994794)
chr6 (36-248)||(19218427-19218630)
chr6 (37-217)||(22560311-22560487)
chr6 (52-173)||(19347092-19347212)
chr6 (232-345)||(33317055-33317167)
chr6 (113-260)||(5758565-5758709)
chr6 (24-76)||(25537148-25537200)
chr6 (38-133)||(13995151-13995245)
chr6 (36-248)||(4073574-4073781)
chr6 (189-328)||(28756145-28756283)
chr6 (38-74)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (24-345)||(18262378-18262699)
chr4 (24-345)||(18269239-18269560)
chr4 (24-345)||(55612849-55613170)
chr4 (24-345)||(26963806-26964127)
chr4 (24-345)||(26970629-26970950)
chr4 (24-345)||(868763-869084)
chr4 (24-345)||(19926480-19926801)
chr4 (24-345)||(5707486-5707807)
chr4 (24-345)||(5714114-5714435)
chr4 (24-345)||(8858333-8858654)
chr4 (24-345)||(10621053-10621374)
chr4 (30-345)||(10628132-10628447)
chr4 (24-345)||(28392854-28393175)
chr4 (24-345)||(8845369-8845690)
chr4 (24-345)||(4426336-4426645)
chr4 (30-345)||(35223732-35224047)
chr4 (34-345)||(5667849-5668156)
chr4 (24-349)||(20311458-20311781)
chr4 (113-345)||(10677303-10677534)
chr4 (113-345)||(10890943-10891174)
chr4 (38-345)||(15461497-15461799)
chr4 (38-345)||(34975551-34975853)
chr4 (38-345)||(2677013-2677315)
chr4 (38-345)||(15815021-15815323)
chr4 (38-345)||(18111043-18111345)
chr4 (38-345)||(3369023-3369325)
chr4 (38-345)||(17299959-17300261)
chr4 (38-345)||(18163162-18163464)
chr4 (38-345)||(20243937-20244239)
chr4 (38-345)||(26531613-26531915)
chr4 (38-345)||(4675983-4676285)
chr4 (34-170)||(56516232-56516368)
chr4 (39-345)||(5870419-5870720)
chr4 (94-244)||(21453961-21454110)
chr4 (38-329)||(19365519-19365806)
chr4 (38-345)||(1941724-1942026)
chr4 (59-345)||(32646523-32646807)
chr4 (30-329)||(5616387-5616681)
chr4 (106-328)||(19362477-19362695)
chr4 (38-243)||(32636484-32636685)
chr4 (113-345)||(9487625-9487853)
chr4 (125-345)||(30040489-30040705)
chr4 (106-329)||(5528495-5528714)
chr4 (38-260)||(4546080-4546298)
chr4 (42-120)||(24700213-24700291)
chr4 (113-329)||(9538033-9538244)
chr4 (128-345)||(11421096-11421309)
chr4 (94-248)||(33888594-33888743)
chr4 (85-212)||(34777850-34777975)
chr4 (217-267)||(24701361-24701411)
chr4 (30-82)||(10677538-10677590)
chr4 (30-82)||(10891178-10891230)
chr4 (26-96)||(9937933-9938003)
chr4 (236-317)||(9937745-9937826)
chr4 (115-206)||(9937830-9937923)
chr4 (38-74)||(11421016-11421052)
chr4 (30-74)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (24-345)||(6110230-6110551)
chr3 (24-345)||(16482203-16482524)
chr3 (24-345)||(10579075-10579396)
chr3 (24-345)||(15600604-15600925)
chr3 (24-345)||(15607149-15607470)
chr3 (24-345)||(10572312-10572633)
chr3 (24-345)||(18520141-18520462)
chr3 (39-345)||(8490676-8490982)
chr3 (31-341)||(18522836-18523146)
chr3 (24-345)||(15357306-15357627)
chr3 (24-345)||(17780838-17781159)
chr3 (24-345)||(13211468-13211789)
chr3 (24-345)||(15341939-15342260)
chr3 (30-345)||(13248779-13249094)
chr3 (24-345)||(32056619-32056941)
chr3 (24-349)||(17199900-17200225)
chr3 (24-345)||(13516977-13517294)
chr3 (30-345)||(1647241-1647556)
chr3 (24-345)||(17136525-17136840)
chr3 (24-345)||(29925137-29925458)
chr3 (24-345)||(29974290-29974611)
chr3 (55-345)||(16200627-16200917)
chr3 (38-345)||(21034238-21034540)
chr3 (38-345)||(15846536-15846838)
chr3 (38-345)||(20147554-20147856)
chr3 (38-345)||(21398792-21399094)
chr3 (38-345)||(14890391-14890693)
chr3 (38-345)||(55427021-55427323)
chr3 (30-327)||(24253130-24253423)
chr3 (38-345)||(12299911-12300212)
chr3 (106-345)||(25978728-25978963)
chr3 (30-247)||(14147013-14147226)
chr3 (113-311)||(15526827-15527021)
chr3 (106-345)||(11787654-11787889)
chr3 (41-345)||(15317176-15317472)
chr3 (160-345)||(28088227-28088408)
chr3 (79-271)||(32280313-32280507)
chr3 (24-76)||(19089734-19089786)
chr3 (77-206)||(28953965-28954093)
chr3 (30-123)||(9504455-9504548)
chr3 (34-149)||(8251933-8252048)
chr3 (192-307)||(30464147-30464261)
chr3 (24-97)||(16200291-16200363)
chr3 (184-248)||(36138033-36138097)
chr3 (184-248)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (24-345)||(18252196-18252517)
chr1 (24-345)||(18532234-18532555)
chr1 (24-345)||(27131130-27131450)
chr1 (24-345)||(27310297-27310618)
chr1 (24-345)||(16358755-16359076)
chr1 (30-345)||(3855639-3855954)
chr1 (30-345)||(36816354-36816668)
chr1 (64-345)||(22641594-22641871)
chr1 (30-345)||(27277278-27277592)
chr1 (24-217)||(21171081-21171274)
chr1 (38-345)||(19706439-19706741)
chr1 (38-345)||(43802365-43802667)
chr1 (38-345)||(28134723-28135025)
chr1 (54-345)||(23507096-23507385)
chr1 (38-345)||(9456116-9456418)
chr1 (38-345)||(20391239-20391541)
chr1 (38-345)||(20779645-20779947)
chr1 (38-345)||(22670257-22670559)
chr1 (38-345)||(42816989-42817291)
chr1 (24-178)||(22657108-22657262)
chr1 (153-345)||(9916497-9916688)
chr1 (30-267)||(12014084-12014319)
chr1 (38-345)||(22612492-22612794)
chr1 (29-325)||(633925-634216)
chr1 (38-345)||(8727667-8727969)
chr1 (31-147)||(9917837-9917952)
chr1 (38-345)||(47667485-47667776)
chr1 (106-329)||(29096789-29097008)
chr1 (38-170)||(35930582-35930713)
chr1 (54-278)||(12006332-12006550)
chr1 (113-245)||(21881475-21881604)
chr1 (232-345)||(28145723-28145835)
chr1 (113-248)||(51997353-51997485)
chr1 (46-172)||(26923553-26923678)
chr1 (93-258)||(24301691-24301855)
chr1 (184-243)||(10852402-10852461)
chr1 (127-206)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (24-344)||(21940831-21941151)
chr8 (24-345)||(22171653-22171974)
chr8 (24-345)||(6094289-6094610)
chr8 (24-345)||(24642815-24643135)
chr8 (82-345)||(15326422-15326685)
chr8 (82-345)||(15506791-15507054)
chr8 (204-345)||(28548393-28548534)
chr8 (35-278)||(14983710-14983950)
chr8 (30-345)||(8371253-8371563)
chr8 (38-345)||(21969333-21969635)
chr8 (33-230)||(24797224-24797419)
chr8 (38-345)||(12562123-12562425)
chr8 (38-345)||(27007517-27007819)
chr8 (38-345)||(27014660-27014962)
chr8 (38-345)||(27880487-27880789)
chr8 (38-345)||(28020668-28020970)
chr8 (30-329)||(38232115-38232412)
chr8 (38-345)||(22130609-22130911)
chr8 (38-345)||(25611195-25611497)
chr8 (39-345)||(22659494-22659795)
chr8 (38-345)||(21916676-21916978)
chr8 (38-345)||(45534273-45534575)
chr8 (38-345)||(26240484-26240786)
chr8 (30-248)||(18835342-18835556)
chr8 (106-345)||(6430953-6431188)
chr8 (114-260)||(8781959-8782102)
chr8 (26-165)||(32872741-32872880)
chr8 (61-236)||(2375214-2375386)
chr8 (106-345)||(2962932-2963171)
chr8 (238-335)||(24796731-24796826)
chr8 (142-329)||(20535226-20535409)
chr8 (41-135)||(29645537-29645631)
chr8 (232-350)||(36970439-36970556)
chr8 (232-349)||(2375411-2375528)
chr8 (38-145)||(36970265-36970371)
chr8 (196-318)||(29645675-29645797)
chr8 (85-137)||(10920427-10920479)
chr8 (57-112)||(24535514-24535569)
chr8 (24-59)||(28555049-28555084)
chr8 (112-171)||(34659059-34659118)
chr8 (284-345)||(8968015-8968076)
chr8 (285-333)||(41368106-41368154)
chr8 (285-333)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (30-345)||(24695186-24695501)
chr5 (24-345)||(19714218-19714539)
chr5 (24-345)||(19706939-19707259)
chr5 (24-345)||(18569581-18569904)
chr5 (24-223)||(39538754-39538953)
chr5 (54-345)||(17298621-17298912)
chr5 (54-345)||(17285470-17285759)
chr5 (30-258)||(18806843-18807069)
chr5 (171-349)||(27347252-27347428)
chr5 (38-345)||(20941027-20941329)
chr5 (38-345)||(25805385-25805687)
chr5 (238-345)||(24701950-24702057)
chr5 (38-345)||(31899-32201)
chr5 (38-345)||(12789663-12789965)
chr5 (38-345)||(22941250-22941552)
chr5 (38-345)||(23545922-23546224)
chr5 (35-212)||(22546872-22547046)
chr5 (38-345)||(24933306-24933608)
chr5 (38-345)||(31096816-31097118)
chr5 (40-333)||(20100255-20100543)
chr5 (38-345)||(12764990-12765296)
chr5 (38-345)||(5097651-5097953)
chr5 (38-345)||(7865430-7865736)
chr5 (38-345)||(9811733-9812039)
chr5 (38-345)||(12703874-12704180)
chr5 (120-258)||(18806483-18806619)
chr5 (120-258)||(18806663-18806799)
chr5 (96-345)||(18829281-18829530)
chr5 (38-345)||(26245102-26245404)
chr5 (106-349)||(26129689-26129928)
chr5 (30-118)||(27347425-27347513)
chr5 (260-349)||(28719471-28719558)
chr5 (264-345)||(39538954-39539035)
chr5 (34-212)||(31651917-31652090)
chr5 (41-170)||(33477193-33477321)
chr5 (39-83)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (24-345)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (24-345)||(6654-6975)
scaffold0390 (24-345)||(13670-13991)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (24-341)||(15152609-15152926)
chr7 (24-345)||(29327950-29328271)
chr7 (24-345)||(11535782-11536103)
chr7 (24-345)||(11542700-11543021)
chr7 (19-345)||(12750987-12751313)
chr7 (24-345)||(12738702-12739023)
chr7 (24-345)||(18561173-18561485)
chr7 (34-345)||(13392326-13392637)
chr7 (33-351)||(18257559-18257874)
chr7 (38-345)||(2204552-2204854)
chr7 (38-345)||(8464999-8465301)
chr7 (38-345)||(18400104-18400406)
chr7 (38-345)||(18407088-18407390)
chr7 (38-345)||(48808496-48808798)
chr7 (38-345)||(15729751-15730053)
chr7 (38-345)||(18139338-18139640)
chr7 (38-345)||(19230888-19231190)
chr7 (38-333)||(30254138-30254428)
chr7 (105-345)||(2365169-2365407)
chr7 (106-345)||(41680968-41681203)
chr7 (38-345)||(10668901-10669204)
chr7 (38-333)||(47166871-47167161)
chr7 (39-323)||(24443349-24443628)
chr7 (38-345)||(28130561-28130863)
chr7 (113-345)||(34128647-34128875)
chr7 (57-343)||(10235361-10235644)
chr7 (36-323)||(25845498-25845780)
chr7 (36-323)||(25845917-25846199)
chr7 (38-307)||(19393462-19393726)
chr7 (30-260)||(19388544-19388774)
chr7 (106-345)||(18259124-18259359)
chr7 (113-345)||(14591924-14592153)
chr7 (113-345)||(16011515-16011744)
chr7 (120-259)||(31190524-31190660)
chr7 (39-147)||(47833875-47833983)
chr7 (24-79)||(15148308-15148363)
chr7 (43-161)||(7662569-7662686)
chr7 (29-138)||(19859113-19859221)
chr7 (113-245)||(22969024-22969153)
chr7 (197-334)||(39112138-39112275)
chr7 (30-116)||(7396361-7396450)
chr7 (33-171)||(3132849-3132986)
chr7 (157-345)||(15169290-15169474)
chr7 (196-271)||(22948499-22948574)
chr7 (72-127)||(29983179-29983234)
chr7 (35-138)||(39111989-39112092)
chr7 (34-76)||(2365070-2365112)
chr7 (103-145)||(7396469-7396511)
chr7 (191-255)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (24-345)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-349)||(25706-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (24-345)||(21329968-21330289)
chr2 (24-345)||(18796672-18796993)
chr2 (30-351)||(18619976-18620296)
chr2 (30-345)||(36270338-36270650)
chr2 (30-345)||(22183206-22183518)
chr2 (74-345)||(20978091-20978360)
chr2 (33-331)||(6991847-6992146)
chr2 (24-333)||(18822249-18822556)
chr2 (38-345)||(30174377-30174679)
chr2 (38-345)||(24250032-24250334)
chr2 (38-345)||(24229215-24229517)
chr2 (106-333)||(15342014-15342237)
chr2 (39-168)||(18851956-18852085)
chr2 (30-170)||(19279460-19279600)
chr2 (39-347)||(29800468-29800775)
chr2 (182-345)||(17241034-17241196)
chr2 (38-260)||(19616435-19616653)
chr2 (44-147)||(36801899-36802003)
chr2 (113-247)||(40301034-40301164)
chr2 (115-320)||(41316305-41316506)
chr2 (113-248)||(21626824-21626955)
chr2 (198-278)||(36799745-36799826)
chr2 (40-147)||(28741220-28741326)
chr2 (278-345)||(41661694-41661761)
chr2 (184-260)||(28740910-28740986)
chr2 (30-147)||(24763751-24763867)
chr2 (34-74)||(12098609-12098649)
chr2 (109-172)||(28718943-28719006)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (24-326)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-349)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (89-345)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (38-345)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (38-345)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (38-345)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (38-333)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (38-307)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (38-345)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (38-345)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (38-248)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (106-345)||(26609-26844)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (30-317)||(8723-9005)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (30-161)||(90019-90151)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (155-345)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (113-345)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (113-248)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (39-345)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (77-168)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (125-221)||(11328-11421)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (30-74)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2041
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10932
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684189
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380972
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471355
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652210
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691160
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309377
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316336
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188697
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| |||||||| |||||||    
T  188718 gatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 72 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  72 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  172 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  272 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  104 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  204 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  304 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 123 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  123 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatcat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  20 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 119  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  319 tggttgatgg 328  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  124 ggagt 128  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789373
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  16789366 gaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859888
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  22859895 gaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508347
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  27508354 gaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586108
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  1586115 gaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 239  Q
     ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  240 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 335  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074782
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  14074775 gaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019885
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18019948  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 301  Q
    ||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019947 aaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10359359 - 10359073
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   |||    
T  10359359 aaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggta 10359262  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  10359261 atatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactct 10359166  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359165 tagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613221
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    | ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  235 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  335 catgaatcatg 345  Q
     ||||||||||    
T  8613211 gatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 211
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926103
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 211  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactacacag--aaaattatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
    ||||||||| || || | ||||||||||||  |     |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacat--tgggttttatg-taagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctga 17850325  T
Q  239 aacc 242  Q
    ||||    
T  17850324 aacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 267
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172963
Alignment:
Q  56 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccat 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  156 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 254  Q
    ||||||  ||||||   ||  |||||  ||   ||| | |  ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28172854 gagaatgttacatat--aactttatgtgaaac-tcacacgtcatctttatagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccct 28172950  T
Q  255 agatgttggagtc 267  Q
    |||| | ||||||    
T  28172951 agatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  108 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  208 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  91 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 189  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  190 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 276  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaata 162  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||||||     | || || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 atattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  236 tgaaaccactatg 248  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  37 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 136  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  137 tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 217  Q
    || || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  52 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 151  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  152 ccatgagaatactacatagtaa 173  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  332 ctccatgaatcatg 345  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537148
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||||| |||||| |  || |||||||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  236 tgaaaccactatg 248  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  189 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  289 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262699
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269560
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613170
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964127
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970950
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869084
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926480
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707807
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714435
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858654
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621053
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628132
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392854
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845690
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426336
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224047
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35224032 tactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 34 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667849
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 233  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  234 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  334 ccatgaatcatg 345  Q
    ||| ||||||||    
T  5667860 ccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311781
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | |||||||  || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461799
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  15461792 gaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975853
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  34975846 gaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677315
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  2677308 gaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815323
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  15815316 gaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111043
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  18111050 gaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369023
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  3369030 gaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299959
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgat 17299967  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  17299966 gaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163464
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  18163457 gaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244239
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  20244232 gaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531915
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  26531908 gaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675983
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  4675990 gaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 170
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  239 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  339 aatcatg 345  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  94 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  194 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 244  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 329
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  237 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942026
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 1941919  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1941920 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 1942018  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  1942019 gaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  59 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  159 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 257  Q
    ||| |||||||  ||| |||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  258 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 5616387 - 5616681
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||    
T  5616387 aaagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagta 5616485  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||    
T  5616486 atatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatct 5616582  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616583 tagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgg 328  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  238 aaacca 243  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  125 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 224  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  225 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 324  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  325 atgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  306 atgactataaagttggttgatggg 329  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||     
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgaccta 4546275  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  4546276 aaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  42 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  313 taaagttggttgatggg 329  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 345
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  128 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 227  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  228 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 327  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  328 ggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  94 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  194 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  85 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  185 agtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  217 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10677590 - 10677538
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 82  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677590 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10891230 - 10891178
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 82  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891230 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9938003 - 9937933
Alignment:
Q  26 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 96  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938003 catcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  236 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  115 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 206  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30040784 - 30040740
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040784 aaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110551
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482203
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579075
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600604
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607149
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572312
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520462
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490982
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  239 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  339 aatcatg 345  Q
    |||||||    
T  8490976 aatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 31 - 341
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  31 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  131 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  231 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  331 actccatgaat 341  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357306
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780838
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211789
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341939
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249094
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056619
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  123 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199900
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517294
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647241
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136840
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925458
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974611
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 55 - 345
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200917
Alignment:
Q  55 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 154  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  155 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  255 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034540
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  21034533 gaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846536
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  15846543 gaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147554
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  20147561 gaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427323
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  55427316 gaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300212
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  12300205 gaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactct 14147208  T
Q  230 tcgacctgaaaccactat 247  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14147209 tagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 311
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 311  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 240  Q
     ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  241 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 340  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 345
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  160 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 259  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  260 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
     |||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088324 -tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 271
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  79 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 178  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  179 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089734
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  77 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 175  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  176 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 206  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 9504455 - 9504548
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504455 aaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  134 ttatattggattgatc 149  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 307
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  192 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  292 ttgtccgtaacaggat 307  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Original strand, 16200291 - 16200363
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 97  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200291 atcattaaagcatggagactatt-tgtggagagactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252517
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532234
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131130
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310297
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358755
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855639
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816354
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||  |||||||    
T  36816369 tactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  64 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  164 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  264 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277278
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||| |||||||    
T  27277293 tactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706439
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  19706446 gaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802365
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  43802372 gaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134723
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  28134730 gaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507385
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  154 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 252  Q
    || ||||| ||||| ||  || ||| || |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagag--aacgttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  253 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456418
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  9456411 gaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391239
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  20391246 gaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779645
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  20779652 gaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670257
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  22670264 gaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816989
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  42816996 gaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 178  Q
     |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  153 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  251 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | | ||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccc 12014123  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 267  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014122 ttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612794
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  22612787 gaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 633925 - 634216
Alignment:
Q  29 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  633925 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 634023  T
Q  129 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 228  Q
    |||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  634024 aatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 634120  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 325  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634121 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727969
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||    
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctg 8727862  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
     ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  ||    
T  8727863 gaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgat 8727961  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  8727962 gaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  31 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  131 tatttatattggattga 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667485
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||           |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 329
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  306 atgactataaagttggttgatggg 329  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 170
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006332
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 153  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    || |||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactg----gacccgcc 12006455  T
Q  154 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 252  Q
    ||||||||  || | ||  |  |||||| |||  |||| |||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||     
T  12006454 atgagaatgttagagag--agcgttatgtaaa-agtcacaagtcattctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtact 12006358  T
Q  253 ctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006357 ctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  332 ctccatgaatcatg 345  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
     || | ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  46 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 145  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  146 gatccgccatgagaatactacatagta 172  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  93 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtca 191  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  192 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 243  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  127 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 206  Q
    |||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 344
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941151
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171974
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094610
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643135
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  82 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  82 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  204 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  304 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  135 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 233  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  234 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371253
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctct 8371368  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  8371367 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatggg 8371269  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||  ||||||||||    
T  8371268 tacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969635
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  21969628 gaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 230  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562425
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  12562418 gaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007517
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  27007524 gaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014660
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  27014667 gaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880487
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  27880494 gaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020668
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  28020675 gaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcc 38232216  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    |  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38232215 tcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgg 38232116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130609
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  22130616 gaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611497
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  25611490 gaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  239 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  339 aatcatg 345  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916978
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  21916971 gaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534273
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  45534280 gaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240786
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| |||||     
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagaccta 26240679  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  26240680 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 26240778  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  26240779 gaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835556
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactct 18835537  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatg 248  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  18835538 tagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  114 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  214 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32872880 - 32872741
Alignment:
Q  26 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||     
T  32872880 catcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagt 32872781  T
Q  126 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 165  Q
    | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872780 aataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375386
Alignment:
Q  61 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 160  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataa 2375313  T
Q  161 tactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | |||||||  |||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375314 ttctacata--aaaagttatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattct 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  |||||| |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  203 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 302  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  303 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  142 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 241  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  242 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 350
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  332 ctccatgaatcatgatgat 350  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  332 ctccatgaatcatgatga 349  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  138 attggatt 145  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 318
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  196 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  296 ccgtaacaggatgactataaagt 318  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  85 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  57 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 112  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 171
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  112 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  284 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  285 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  285 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695186
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  330 tactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714218
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706939
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569581
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  122 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  222 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  322 ttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298621
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 151  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  152 ccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 250  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  251 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285470
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  154 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 252  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  253 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccc 18806873  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806872 ttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  171 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  271 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941329
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  20941322 gaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805385
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  25805392 gaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32201
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  32194 gaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789663
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  12789670 gaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941552
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  22941545 gaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546224
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  23546217 gaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546872
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  135 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933306
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  24933313 gaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097118
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  31097111 gaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  40 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  140 tggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 239  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  240 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764990
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  235 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  335 catgaatcatg 345  Q
     ||||||||||    
T  12765000 gatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097953
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgat 5097945  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  5097946 gaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865430
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    | ||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  235 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  335 catgaatcatg 345  Q
     ||||||||||    
T  7865440 gatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811733
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  235 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  335 catgaatcatg 345  Q
     ||||||||||    
T  9811743 gatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703874
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  235 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  335 catgaatcatg 345  Q
     ||||||||||    
T  12703884 gatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  96 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 195  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  196 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 294  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  295 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245404
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  26245397 gaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  260 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  264 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31652090 - 31651917
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |  |||||| | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||| | || ||||||||||||||| ||    
T  31652090 catagagactactatgtatgtagactgatgactaagtctcacgggtcatagatat-gagatattaagtttatacattggtaaaaatattaggagtaacat 31651992  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    | ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31651991 taataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 83
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7594
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6654
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13670
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  324 gatgggtactccatgaat 341  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328271
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535782
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542700
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 345
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751313
Alignment:
Q  19 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  119 tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  319 tggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739023
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561485
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| |||||| || ||||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 345
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392637
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 233  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  234 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  334 ccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||||||    
T  13392626 ccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257559
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 232  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  233 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 332  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T
Q  333 tccatgaatcatgatgatg 351  Q
    |  | |||||||| |||||    
T  18257577 ttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204854
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  2204847 gaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400406
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  18400399 gaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407390
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  18407383 gaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808496
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  48808503 gaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730053
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  15730046 gaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139338
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  18139345 gaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231190
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  19231183 gaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 345
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  105 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  205 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  304 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668901
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  237 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 336  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  337 tgaatcatg 345  Q
    |||||||||    
T  10668909 tgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
     | |||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  239 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130863
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctg 28130756  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    ||| |||||||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28130757 aaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaat 28130855  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  28130856 gaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 343
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235644
Alignment:
Q  57 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  157 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttc-gacctgaaaccactatgtacccta 255  Q
    |||||  |||||||  |  ||||||  ||| |||||||| |||| |  || ||||| || || ||  || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||    
T  10235461 agaattatacatag--agtgttatg-taagagtcataagttattattgtaatgataatgatgcatatcatccttctgacatgaaaccactatcgacccta 10235557  T
Q  256 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| || ||||||  || |||  ||||| ||   |||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10235558 gatgtagg-gtcgagaactgtgttgccatttaattattgttcgtagcaggatgaccataaactcggttgatgggtactccataaatca 10235644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  236 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  236 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393462
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctg 19393531  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 307  Q
    || ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393530 aatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 227  Q
    ||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  228 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 312  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 219  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  220 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 259  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  139 ttggattga 147  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148363
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  43 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 142  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  143 attgatccgccatgagaat 161  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  29 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  129 aatatttata 138  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 334
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  197 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  297 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 7396361 - 7396450
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 116  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396361 aaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  157 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 256  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  257 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  196 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 127
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  72 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 138
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  135 tata 138  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 145
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  103 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 145  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  191 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 255  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18774
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25706
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  25731 gatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329968
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796993
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  324 gatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620296
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  330 tactccatgaatcatgatgatg 351  Q
    |||||||  ||||||| |||||    
T  18620275 tactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270650
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccc 36270533  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36270534 ttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgg 36270633  T
Q  329 gtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36270634 gtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183206
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T
Q  329 gtactccatgaatcatg 345  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  22183222 gtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 345
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  74 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  174 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 272  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  273 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  131 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  ||||| || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgtaa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 222  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||| ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtatt 18822445  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18822446 ccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggt 18822545  T
Q  323 tgatgggtact 333  Q
    | |||||||||    
T  18822546 taatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174679
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  30174672 gaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250032
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  24250039 gaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229215
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  24229222 gaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851956
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacat 168  Q
    |||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18851985 ttggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 19279460 - 19279600
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19279460 aaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagta 19279559  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279560 atatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 347
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  236 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 335  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  336 atgaatcatgat 347  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 345
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
      || ||||| || || ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  44 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  143 attga 147  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 247  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  115 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  215 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 314  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  315 aagttg 320  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  198 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  40 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  140 tggattga 147  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  278 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24763867 - 24763751
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  24763867 aaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagta 24763769  T
Q  130 atatttatattggattga 147  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24763768 atatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  109 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  324 gat 326  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6013
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  223 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 321  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  322 ttgatgggtactccatgaatcatgatga 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 89 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  89 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  189 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  289 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 183 - 485
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  478 gaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3675
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  3682 gaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120032
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  120025 gaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |  ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67374
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 67481  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  67480 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 67382  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  67381 gaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  238 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  338 gaatcatg 345  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  238 aaaccactatg 248  Q
    |||||||||||    
T  8501 aaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 305  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 317
Target Start/End: Original strand, 8723 - 9005
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | |||||||||||||||    
T  8723 aaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagta 8821  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |     
T  8822 atatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcc 8918  T
Q  230 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 317  Q
    | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8919 tagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90019
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  129 aatatttatattggattgatccgccatgagaat 161  Q
    || ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90051 aacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  155 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 254  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  255 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  210 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 309  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  310 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 345  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 248  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 345
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  239 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||||||  |||||| || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  339 aatcatg 345  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  77 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 168  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  125 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 221  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15133 - 15089
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15133 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University