View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF20529_high_2 (Length: 643)
Name: NF20529_high_2
Description: NF20529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20529_high_2 |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 552; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 7403613 - 7403022
Alignment:
| Q |
48 |
tggggttcactttcttgttattgttacttcatttgataattatccatatacttccatttcatcgatataagtgtcaaatcaaaagtttttaccttctaga |
147 |
Q |
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| T |
7403613 |
tggggttcactttcttgttattgttacttcatttgataattatccatatacttgcatttcatcgatataagtgtcaaatcaaaagtttttaccttctaga |
7403514 |
T |
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| Q |
148 |
gaaaatctactaagtttcaaacattttttagtatttcatcaatagttcaagttaacagataatatatacacattttgaaatataagtaaatataatgagt |
247 |
Q |
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| T |
7403513 |
gaaaatctactaagtttcaaatattatttagtatttcatcaatagttcaagttaacagataatatatacacattttgaaatataagtaaatataatgagt |
7403414 |
T |
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| Q |
248 |
gattatattttaaatttatgaaagtacaatttatttgaaatttgtcgaatttataagtttataaggtacaccattcagtattattttatcgaccaattgt |
347 |
Q |
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| T |
7403413 |
gattatattttaaatttatgaaagtacaatttatttgaaatttgtcgaatttataagtttatacggtacaccattcagtattattttatcgagcaattgt |
7403314 |
T |
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| Q |
348 |
gttacaagatgtagtgttaagactcaaaattaatatcatattaggttatttttataaagttaaacaaaaattgcagaatatttagtggctatgagataca |
447 |
Q |
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| T |
7403313 |
gttacaagatgtagtgttaagacttaaaattaatatcatattaggttatttttataaagttatacaaaaattgcagaatatttagtggctatgagataca |
7403214 |
T |
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| Q |
448 |
tcgatattaacttcatatgcacggcagaagtcaacggcactagttagtcaacaaataatttggcttatttcactttcaacgtctacaattttcaaatgaa |
547 |
Q |
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| T |
7403213 |
tcgatattaacttcatatgcacggaagaagtcaacggcactagttagtcaacaaataatttggcttatttcactttcaacatctacaattttcaaatgaa |
7403114 |
T |
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| Q |
548 |
tgaaaatttatgactttgtgaagtaagaaagaaataatgtcataaatagataatagaatgttattatgctcttcaatcttcctttgcttctc |
639 |
Q |
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| T |
7403113 |
tgaaaatttatgactttgtgaagtaagaaagaaataatgtcataaatagataatagaatgttattatgttcttcaatcttcctttgcttctc |
7403022 |
T |
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