View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20545_low_4 (Length: 471)

Name: NF20545_low_4
Description: NF20545
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20545_low_4
NF20545_low_4
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (16-453)||(29272957-29273394)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (27-453)||(267459-267885)
chr1 (30-453)||(28126794-28127217)
chr1 (31-448)||(28163500-28163916)
chr1 (193-389)||(26136691-26136887)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (26-448)||(26623907-26624329)
chr6 (26-448)||(26729884-26730306)
chr6 (27-448)||(26803083-26803504)
chr6 (26-453)||(31285195-31285622)
chr6 (27-453)||(27679587-27680013)
chr6 (27-453)||(27697705-27698131)
chr6 (28-424)||(27705552-27705948)
chr6 (29-447)||(27426737-27427155)
chr6 (28-453)||(27610239-27610664)
chr6 (28-453)||(27717618-27718043)
chr6 (31-453)||(26656606-26657028)
chr6 (31-453)||(26762577-26762999)
chr6 (31-448)||(26884711-26885128)
chr6 (27-448)||(28786875-28787296)
chr6 (27-448)||(28792996-28793417)
chr6 (27-453)||(27592140-27592566)
chr6 (27-437)||(27530436-27530846)
chr6 (31-453)||(26647120-26647542)
chr6 (31-453)||(26753088-26753510)
chr6 (28-453)||(27676739-27677164)
chr6 (31-437)||(26824460-26824866)
chr6 (30-448)||(28781741-28782159)
chr6 (32-453)||(27337214-27337635)
chr6 (32-453)||(27397954-27398375)
chr6 (35-453)||(25539188-25539606)
chr6 (40-453)||(25483709-25484122)
chr6 (35-448)||(26143513-26143926)
chr6 (27-448)||(27603828-27604249)
chr6 (31-447)||(25492444-25492860)
chr6 (40-448)||(25580372-25580780)
chr6 (40-434)||(26862230-26862624)
chr6 (40-453)||(26056572-26056985)
chr6 (40-453)||(26076542-26076955)
chr6 (143-453)||(25511645-25511955)
chr6 (31-434)||(27215093-27215496)
chr6 (130-390)||(28140275-28140535)
chr6 (116-434)||(29826712-29827030)
chr6 (116-389)||(29843165-29843443)
chr6 (190-341)||(26724368-26724519)
chr6 (190-246)||(28186193-28186249)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (29-447)||(60208-60626)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (29-447)||(18074400-18074818)
chr4 (27-448)||(18698520-18698941)
chr4 (27-448)||(18678680-18679101)
chr4 (27-448)||(18730624-18731045)
chr4 (27-448)||(18723205-18723626)
chr4 (27-448)||(18654597-18655018)
chr4 (275-434)||(5090088-5090247)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (28-453)||(2658-3083)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (27-448)||(8124-8545)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (27-448)||(12799-13220)
scaffold0277 (27-448)||(3836-4257)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (119-390)||(16691596-16691867)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (313-383)||(17992404-17992474)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29273394 - 29272957
Alignment:
Q  16 atcagccgcatgcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatggga 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273394 atcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatggga 29273295  T
Q  116 tccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  29273294 tccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttt 29273195  T
Q  216 tcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273194 tcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcat 29273095  T
Q  316 gttagtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttgg 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273094 gttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttgg 29272995  T
Q  416 ctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29272994 ctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtc 29272957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 27 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 267885 - 267459
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  267885 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 267786  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  267785 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatg 267686  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  267685 tgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggg 267586  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  || | || ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  267585 cattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggactt 267486  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  267485 gattggttcggctatggaagcagagtc 267459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28126794
Alignment:
Q  30 cttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgga 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  130 atttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtga 229  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  230 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggat 329  Q
    |||||| |||| ||  | |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    |||||||||||| ||    
T  28127017 gagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28126918  T
Q  330 tccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgat 429  Q
    | ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  28126917 tgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgat 28126818  T
Q  430 tggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  28126817 tggttcggtcgtggaagcaaagtc 28126794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28163916 - 28163500
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||     
T  28163916 ttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28163817  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  28163816 tttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgag 28163717  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    |||||||||| ||  |   ||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||||  | ||| ||| ||||||||||    |||||||||||| |||    
T  28163716 agagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagct-ctttttgaaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaatt 28163618  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
     ||||||||||  | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||  | ||||||||||||||||  ||||    
T  28163617 acaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgatt 28163518  T
Q  431 ggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28163517 ggttcggtcgtggaagca 28163500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 389
Target Start/End: Original strand, 26136691 - 26136887
Alignment:
Q  193 gatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactg 292  Q
    |||||||||||||  || || || |||||  ||||| |||| ||||||| |||| ||  |||  || ||||||||||| | ||||| |  ||| |||  |    
T  26136691 gatcaatttgaaggattgtgcttccttcacaatgtgcgagaaaattcagttaaatatggcttagaatatctccaagagcagctcctctccaaatcaatcg 26136790  T
Q  293 gattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttga 389  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||  |  |||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  26136791 gattggagattaagttaggacatgttagtaaaggaattccaatcataaaagaaaggctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttga 26136887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Original strand, 26623907 - 26624329
Alignment:
Q  26 tgcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26623907 tgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggt 26624006  T
Q  126 tggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgat 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26624007 tggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgat 26624106  T
Q  226 gtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagg 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26624107 gtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagg 26624206  T
Q  326 ggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggaca 425  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | | | ||||||  |||||||||||||||| |     
T  26624207 gaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggct 26624306  T
Q  426 tgattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  26624307 tgattggttcggacgtggaagca 26624329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Original strand, 26729884 - 26730306
Alignment:
Q  26 tgcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26729884 tgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggt 26729983  T
Q  126 tggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgat 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26729984 tggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgat 26730083  T
Q  226 gtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagg 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26730084 gtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagg 26730183  T
Q  326 ggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggaca 425  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | | | ||||||  |||||||||||||||| |     
T  26730184 gaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggct 26730283  T
Q  426 tgattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  26730284 tgattggttcggacgtggaagca 26730306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 26803083 - 26803504
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26803083 gcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggtt 26803182  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26803183 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatg 26803282  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26803283 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggg 26803382  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26803383 gattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacct 26803482  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  26803483 gattggtttggccatggaagca 26803504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 26 - 453
Target Start/End: Original strand, 31285195 - 31285622
Alignment:
Q  26 tgcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggt 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||| |||||||||||| | | || || | ||| | || |||||    
T  31285195 tgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggt 31285294  T
Q  126 tggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgat 225  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31285295 aggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgat 31285394  T
Q  226 gtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31285395 gtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagg 31285494  T
Q  326 ggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggaca 425  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  31285495 gaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggact 31285594  T
Q  426 tgattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31285595 tgattggttcggccgtggaagcagagtc 31285622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 453
Target Start/End: Original strand, 27679587 - 27680013
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27679587 gcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggtt 27679686  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||       || |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  27679687 ggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatg 27679786  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27679787 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgaggg 27679886  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27679887 aattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggactt 27679986  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27679987 gattggttcggatgtggaagcagagtc 27680013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27698131 - 27697705
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27698131 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 27698032  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27698031 ggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatg 27697932  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27697931 tgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacgg 27697832  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  || | || ||||| ||||||||||||||||      
T  27697831 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactc 27697732  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||    
T  27697731 gattggtttggtcctggaagcagagtc 27697705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27705948 - 27705552
Alignment:
Q  28 cccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttg 127  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27705948 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttg 27705849  T
Q  128 gaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgt 227  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27705848 gaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgt 27705749  T
Q  228 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggg 327  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27705748 gagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgagggg 27705649  T
Q  328 attccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggac 424  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27705648 attccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggctgggggac 27705552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27427155 - 27426737
Alignment:
Q  29 ccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgg 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27427155 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 27427056  T
Q  129 aatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtg 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||     
T  27427055 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 27426956  T
Q  229 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggga 328  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| |||  |  | || ||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  27426955 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 27426856  T
Q  329 ttccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatga 428  Q
    |  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  27426855 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 27426756  T
Q  429 ttggttcggccgtggaagc 447  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  27426755 ttggttcggtcctggaagc 27426737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27610664 - 27610239
Alignment:
Q  28 cccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttg 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||| |    
T  27610664 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27610565  T
Q  128 gaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgt 227  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||    
T  27610564 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27610465  T
Q  228 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggg 327  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    ||||||||||||     
T  27610464 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27610365  T
Q  328 attccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatg 427  Q
    |||||    |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27610364 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27610265  T
Q  428 attggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27610264 attggttcggccgtggaagcaaagtc 27610239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27718043 - 27717618
Alignment:
Q  28 cccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttg 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||| |    
T  27718043 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27717944  T
Q  128 gaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgt 227  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||    
T  27717943 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27717844  T
Q  228 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggg 327  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||  || | |||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    ||||||||||||     
T  27717843 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27717744  T
Q  328 attccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatg 427  Q
    |||||    |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27717743 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27717644  T
Q  428 attggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27717643 attggttcggccgtggaagcaaagtc 27717618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 453
Target Start/End: Original strand, 26656606 - 26657028
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| | | |  ||||| |||     
T  26656606 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26656705  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||       |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||    
T  26656706 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26656805  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||   | || || | ||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26656806 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26656905  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  26656906 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgatt 26657005  T
Q  431 ggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||||  ||||||||| ||||    
T  26657006 ggttcggttgtggaagcagagtc 26657028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 453
Target Start/End: Original strand, 26762577 - 26762999
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| | | |  ||||| |||     
T  26762577 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26762676  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||       |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||    
T  26762677 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26762776  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||   | || || | ||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26762777 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26762876  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  26762877 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgatt 26762976  T
Q  431 ggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||||  ||||||||| ||||    
T  26762977 ggttcggttgtggaagcagagtc 26762999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Original strand, 26884711 - 26885128
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| | || ||| | || ||||| ||||    
T  26884711 ttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaa 26884810  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||  | |||||||||| ||| | || ||    
T  26884811 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcag 26884910  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
     ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||  | ||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26884911 ggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26885010  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    ||| |||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26885011 ccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26885110  T
Q  431 ggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||| || ||||||||||    
T  26885111 ggtttggtcgtggaagca 26885128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 28786875 - 28787296
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||  |||||     
T  28786875 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggta 28786974  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||        ||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  28786975 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 28787074  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||  |  | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  28787075 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 28787174  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| |||||   || |||||| | |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28787175 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 28787274  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28787275 gattggttcggccgtggaagca 28787296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 28792996 - 28793417
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||  |||||     
T  28792996 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggta 28793095  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||        ||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  28793096 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 28793195  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||| |||   |||||||||||||||  |  | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  28793196 tgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 28793295  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28793296 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 28793395  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28793396 gattggttcggccgtggaagca 28793417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27592566 - 27592140
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27592566 gcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggtt 27592467  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  27592466 ggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 27592367  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||  |  | | |||||||||||||    |||||| || ||    
T  27592366 tgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaagg 27592267  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||||| |  |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | || ||| |||||||||||||||||| |    
T  27592266 aattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggactt 27592167  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  27592166 gattggttcggtcctggaagcagagtc 27592140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27530846 - 27530436
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| || |||  || ||||||| |   ||||||||||| | |||| |||||     
T  27530846 gcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggta 27530747  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||    
T  27530746 ggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatg 27530647  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||| ||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||    ||||||| ||||    
T  27530646 tgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcaggg 27530547  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | || ||| | || ||||||||||||| |    
T  27530546 aattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggactt 27530447  T
Q  427 gattggttcgg 437  Q
    |||||||||||    
T  27530446 gattggttcgg 27530436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 453
Target Start/End: Original strand, 26647120 - 26647542
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||     
T  26647120 ttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggac 26647219  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || |||||       |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||    
T  26647220 tttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcag 26647319  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  |  | || | |||||||| |  ||| || ||||||| |||    
T  26647320 agagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaatt 26647419  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  |  || | || ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26647420 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26647519  T
Q  431 ggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||| | |||||||| ||||    
T  26647520 ggttcggtcctggaagcagagtc 26647542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 453
Target Start/End: Original strand, 26753088 - 26753510
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||     
T  26753088 ttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggac 26753187  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || |||||       |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||    
T  26753188 tttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcag 26753287  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  |  | || | |||||||| |  ||| || ||||||| |||    
T  26753288 agagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaatt 26753387  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  |  || | || ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26753388 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26753487  T
Q  431 ggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||| | |||||||| ||||    
T  26753488 ggttcggtcctggaagcagagtc 26753510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27677164 - 27676739
Alignment:
Q  28 cccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttg 127  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27677164 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttg 27677065  T
Q  128 gaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||    
T  27677064 gaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27676965  T
Q  228 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggg 327  Q
    || ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||  |  | | |||||||||||||    |||||| || ||     
T  27676964 gaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaagga 27676865  T
Q  328 attccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatg 427  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | || ||| | |||||||||||| |||  |    
T  27676864 attcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcg 27676765  T
Q  428 attggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||| || | |||||||| ||||    
T  27676764 attggtttggtcctggaagcagagtc 27676739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 437
Target Start/End: Original strand, 26824460 - 26824866
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||     
T  26824460 ttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggac 26824559  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||  | |||       |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  | |||||    
T  26824560 tttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgag 26824659  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    ||||||| | || |||    
T  26824660 agagaattcagctaagcatggcttggaaaatctccaagagcaactccttttaaaaacaattggagaagaaattaagttaggaggtgttagtcaaggtatt 26824759  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
    | ||||||||| || || ||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26824760 caaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgatt 26824859  T
Q  431 ggttcgg 437  Q
    |||||||    
T  26824860 ggttcgg 26824866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 28781741 - 28782159
Alignment:
Q  30 cttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgga 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||| ||||  ||   ||||| |||    
T  28781741 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtagga 28781840  T
Q  130 atttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtga 229  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||||    
T  28781841 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 28781940  T
Q  230 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggat 329  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||    |||||||||||| ||    
T  28781941 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28782040  T
Q  330 tccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgat 429  Q
    |||    |||||||| |||||   || |||||| | |||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28782041 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggaggacctgat 28782140  T
Q  430 tggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28782141 tggttcggccgtggaagca 28782159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337214
Alignment:
Q  32 tacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||| ||| || | ||||| ||| |    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  132 ttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgaga 231  Q
    |||||| | | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||       ||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27337436  T
Q  232 gagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattc 331  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  |  | || | |||||||||    |||||  |||||| ||||    
T  27337435 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27337336  T
Q  332 caatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattg 431  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |  || | || ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  27337335 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27337236  T
Q  432 gttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  27337235 gttcggtcctggaagcagagtc 27337214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27397954
Alignment:
Q  32 tacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||| ||| || | ||||| ||| |    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  132 ttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgaga 231  Q
    |||||| | | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||       ||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27398176  T
Q  232 gagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattc 331  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||  |  | || | |||||||||    |||||  |||||| ||||    
T  27398175 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27398076  T
Q  332 caatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattg 431  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |  || | || ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  27398075 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27397976  T
Q  432 gttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  27397975 gttcggtcctggaagcagagtc 27397954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 453
Target Start/End: Original strand, 25539188 - 25539606
Alignment:
Q  35 atgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaattta 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||| |||||||||    || ||||| |||| | |||  ||||| ||| ||||    
T  25539188 atgtggccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 25539287  T
Q  135 tgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagag 234  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  25539288 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagag 25539387  T
Q  235 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaa 334  Q
    ||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |  |  ||| ||   |||||||||  ||||||||||||| ||  |||    
T  25539388 aattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaa 25539487  T
Q  335 tcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggtt 434  Q
    |||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  25539488 tcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 25539587  T
Q  435 cggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||| | |||||||| ||||    
T  25539588 cggtcctggaagcagagtc 25539606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 453
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25484122
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatggga 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| |||| | |||  ||||| ||| ||| ||| |    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  140 ttggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 239  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 25483908  T
Q  240 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcata 339  Q
    |  | | |||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |  |  ||| ||   |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  25483909 aagtcataataacctgaaacatctccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcata 25484008  T
Q  340 aaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggcc 439  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25484009 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25484108  T
Q  440 gtggaagcaaagtc 453  Q
     |||||||| ||||    
T  25484109 atggaagcagagtc 25484122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 448
Target Start/End: Original strand, 26143513 - 26143926
Alignment:
Q  35 atgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaattta 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| | | || || |||| |||| ||||||||| |  || ||||| |||| | |||  ||||| ||| |||     
T  26143513 atgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttt 26143612  T
Q  135 tgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagag 234  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26143613 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 26143712  T
Q  235 aattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaa 334  Q
    ||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |||| |   ||||||||   ||||||||||||| ||| |||    
T  26143713 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 26143812  T
Q  335 tcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggtt 434  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  26143813 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtt 26143912  T
Q  435 cggccgtggaagca 448  Q
    ||| | ||||||||    
T  26143913 cggtcatggaagca 26143926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27604249 - 27603828
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||  |||| |||||     
T  27604249 gcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggta 27604150  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  27604149 ggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 27604050  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |  | | |||||||||||||    ||||||||||||    
T  27604049 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 27603950  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||| |    |||||||| |||||   |  || ||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||| |||||||| |||| || |    
T  27603949 aatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacct 27603850  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  27603849 gattggtttgggcttggaagca 27603828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492444
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| || |||| |||||| ||| | | |||||| |||| | |||| ||||| |||     
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||    
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgag 25492661  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    |||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||    | |||| || |||||||||     |||||||||||| |||    
T  25492660 agagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaatt 25492561  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
     ||||||||||  |  | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |   || |||| ||| | | |||||||| ||||| |||||    
T  25492560 gcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttggctgaaggacttgatt 25492461  T
Q  431 ggttcggccgtggaagc 447  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25492460 ggttcggtcgtggaagc 25492444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 448
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580780
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatggga 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| |||| | |||| ||||| ||| ||||||| |    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  140 ttggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 239  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttc 25580571  T
Q  240 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcata 339  Q
    |  |   ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| || |  |  |||  |  |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||     
T  25580572 aattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatt 25580671  T
Q  340 aaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggcc 439  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25580672 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25580771  T
Q  440 gtggaagca 448  Q
     ||||||||    
T  25580772 atggaagca 25580780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862624
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatggga 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| |    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  140 ttggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 239  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||       || ||||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattc 26862429  T
Q  240 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcata 339  Q
    | || | |||| |||||||||||||||  || | || ||||||||||||  |  |||| | ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| | |||    
T  26862430 aactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttata 26862529  T
Q  340 aaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggtt 434  Q
    ||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || | || ||| | || || |||||||||| |||||||||    
T  26862530 aaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtt 26862624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 453
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26056985
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatggga 139  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | | || ||||||| |||| ||||||||| |  || |||||  ||| | |||  ||||| ||||||| ||| |    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  140 ttggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 239  Q
      |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26056771  T
Q  240 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcata 339  Q
    | ||   || |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |  |  ||| ||   | |||||||  ||||||||||||| || ||||| |||    
T  26056772 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattata 26056871  T
Q  340 aaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggcc 439  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26056872 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26056971  T
Q  440 gtggaagcaaagtc 453  Q
     |||||||| ||||    
T  26056972 ttggaagcagagtc 26056985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 453
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26076955
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatggga 139  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | | || ||||||| |||| ||||||||| |  || |||||  ||| | |||  ||||| ||||||| ||| |    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  140 ttggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattc 239  Q
      |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||       |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26076741  T
Q  240 agctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcata 339  Q
    | ||   || |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |  |  ||| ||   | || ||||  ||||||||||||| || ||||| |||    
T  26076742 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattata 26076841  T
Q  340 aaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggcc 439  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26076842 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26076941  T
Q  440 gtggaagcaaagtc 453  Q
     |||||||| ||||    
T  26076942 ttggaagcagagtc 26076955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 453
Target Start/End: Original strand, 25511645 - 25511955
Alignment:
Q  143 gaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagc 242  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||       |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  25511645 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaac 25511744  T
Q  243 taaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcataaag 342  Q
    |   || |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |  |  ||| ||   | || ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  25511745 tcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaag 25511844  T
Q  343 gagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtg 442  Q
    || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  25511845 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctg 25511944  T
Q  443 gaagcaaagtc 453  Q
    |||||| ||||    
T  25511945 gaagcagagtc 25511955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 434
Target Start/End: Original strand, 27215093 - 27215496
Alignment:
Q  31 ttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | || | | |||| ||||| |||     
T  27215093 ttacatgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggac 27215192  T
Q  131 tttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgag 230  Q
    || ||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||       |||||||| ||||||| || || ||||||  | |||||||     
T  27215193 ttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaa 27215292  T
Q  231 agagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggatt 330  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| || || || ||  ||||| | |||||   | |||| ||   ||||||||    ||||||||||||||||    
T  27215293 agagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggatt 27215392  T
Q  331 ccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgatt 430  Q
     |||  |||||  | | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||| ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  27215393 acaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgatt 27215492  T
Q  431 ggtt 434  Q
    ||||    
T  27215493 ggtt 27215496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 390
Target Start/End: Original strand, 28140275 - 28140535
Alignment:
Q  130 atttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtga 229  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||  |||||| |||||       || ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  28140275 atttatgggatgggagggtcgggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtga 28140374  T
Q  230 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggat 329  Q
    |||| | |||||||||| ||  |||  || |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||| |||    ||||||| |  ||||| ||||| || ||    
T  28140375 gagaaatttcagctaaacatggcttagaagatctccaagaaaaactcctttctaaaacagttggtttgagcgttaagtttggacatgtaagtgaaggaat 28140474  T
Q  330 tccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgat 390  Q
     ||||| |||||||| |||||| |   ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28140475 accaataataaaggaaaggctacgactaaagaaggttcttttgattctcgatgacgttgat 28140535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 434
Target Start/End: Original strand, 29826712 - 29827030
Alignment:
Q  116 tccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttt 215  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||       | |||| ||||||||   || |||||    
T  29826712 tccagatggtggggatttatggaattggcggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgcttgtgttt 29826811  T
Q  216 tcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcat 315  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||| || ||||  ||||||  || |||||| | |||| |||   ||    
T  29826812 tcttcatgacttgagagaaagttcagctaaacatggcttagaacatctccaacagaagcttctttccaaaacagttgaattggacactaagctaggagat 29826911  T
Q  316 gttagtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttgg 415  Q
    ||||  || || |||||||| |||||| | |||||| |  |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||  ||| |||| | || | | |||    
T  29826912 gttaacgaaggaattccaataataaagcaaaggctaggacgaaagaaagtacttttgattcttgacgacgttgacaacatgaggcaattgcaagttatgg 29827011  T
Q  416 ctggaggacatgattggtt 434  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  29827012 cgggaggacttgattggtt 29827030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29843443 - 29843165
Alignment:
Q  116 tccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttt 215  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||       |||||| ||||||||  ||| |||||    
T  29843443 tccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttt 29843344  T
Q  216 tcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcat 315  Q
    |||||| || | |||||| | |||||||||| ||  |||  | |||||||||||||| || ||||  ||||||  ||  ||||| |||||| |||   ||    
T  29843343 tcttcacgacgggagagaaagttcagctaaacatggcttagagcatctccaagagaagcttctttccaaaacagttgatttggacattaagctaggagat 29843244  T
Q  316 gttagtgaggggattccaatcataaag-----gagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttga 389  Q
    |||| ||| || |||||||| ||||||      | |||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29843243 gttaatgaaggaattccaataataaagcaaattaaaggctaggacgaaagaaagttcttttgattcttgacgatgttga 29843165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 341
Target Start/End: Original strand, 26724368 - 26724519
Alignment:
Q  190 gctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaa 289  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||| ||||||  |||| ||  |||  || ||||||||||||| ||||| |  |||  ||    
T  26724368 gctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcaattaaatatggcttagaatatctccaagagaagctcctctccaaattaa 26724467  T
Q  290 ctggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcataaa 341  Q
      ||||||||| ||||||| |   |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26724468 tcggattggaatttaagttcggagatgttagtgaagggatttcaatcataaa 26724519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Original strand, 28186193 - 28186249
Alignment:
Q  190 gctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaa 246  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  28186193 gctgatcaatttgatgatttgtgttttcttcacgatgtaaggggaaattcagctaaa 28186249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 447
Target Start/End: Original strand, 60208 - 60626
Alignment:
Q  29 ccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgg 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  60208 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 60307  T
Q  129 aatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtg 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||     
T  60308 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 60407  T
Q  229 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggga 328  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| |||  |  | || ||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  60408 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 60507  T
Q  329 ttccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatga 428  Q
    |  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  60508 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 60607  T
Q  429 ttggttcggccgtggaagc 447  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  60608 ttggttcggtcctggaagc 60626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 447
Target Start/End: Original strand, 18074400 - 18074818
Alignment:
Q  29 ccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgg 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18074400 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 18074499  T
Q  129 aatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtg 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||     
T  18074500 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 18074599  T
Q  229 agagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggga 328  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| |||  |  | || ||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  18074600 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 18074699  T
Q  329 ttccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatga 428  Q
    |  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  18074700 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttga 18074799  T
Q  429 ttggttcggccgtggaagc 447  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  18074800 ttggttcggtcctggaagc 18074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18698941 - 18698520
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||| |     
T  18698941 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgtta 18698842  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  18698841 ggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18698742  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  18698741 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18698642  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| |||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18698641 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgt 18698542  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18698541 gattggttcggctgtggaagca 18698520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18679101 - 18678680
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||  |||  |||||     
T  18679101 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggta 18679002  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  18679001 ggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18678902  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  18678901 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18678802  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  18678801 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgt 18678702  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  18678701 gattggttcggttgtggaagca 18678680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18731045 - 18730624
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||  ||| |     
T  18731045 gcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgata 18730946  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | || ||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  18730945 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18730846  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  18730845 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18730746  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18730745 aattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgt 18730646  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18730645 gattggttcggctgtggaagca 18730624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18723626 - 18723205
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||  ||| |     
T  18723626 gcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgata 18723527  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  | |    
T  18723526 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacg 18723427  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |  | || ||||||| ||||    |||||||||| |    
T  18723426 tgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagag 18723327  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||| | ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18723326 aattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacct 18723227  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  18723226 gattggttcggctctggaagca 18723205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18655018 - 18654597
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||| |     
T  18655018 gcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgata 18654919  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||  ||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  18654918 ggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 18654819  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||    ||||||||||||    
T  18654818 tgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 18654719  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |    
T  18654718 aattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgt 18654619  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  18654618 gattggttcggttgtggaagca 18654597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5090247 - 5090088
Alignment:
Q  275 tccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgat 374  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |   || | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  5090247 tcctttttaaaacaattggattggaaattaggtttggagatatcagtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgat 5090148  T
Q  375 tcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggtt 434  Q
    ||| |||||| |||| ||  |||| |||||||| | |||||| |||| || |||||||||    
T  5090147 tctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtt 5090088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2658
Alignment:
Q  28 cccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttg 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||| |    
T  3083 cccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 2984  T
Q  128 gaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgt 227  Q
    || ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||       |||||||||||||||   | |||||||||| |  ||||    
T  2983 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 2884  T
Q  228 gagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgagggg 327  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||   | | |||||||||||||||  |  | | ||||||||||| |    ||||||||||||     
T  2883 gagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 2784  T
Q  328 attccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatg 427  Q
    |||||    |||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2783 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 2684  T
Q  428 attggttcggccgtggaagcaaagtc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 attggttcggccgtggaagcaaagtc 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 8124 - 8545
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||     
T  8124 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggta 8223  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||        ||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  8224 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 8323  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||    ||||||||||||    
T  8324 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgaggg 8423  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| |||||   || |||||| | |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8424 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 8523  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8524 gattggttcggccgtggaagca 8545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13220 - 12799
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||     
T  13220 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggta 13121  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||        ||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  13120 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 13021  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||    ||||||||||||    
T  13020 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgaggg 12921  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     |||||    |||||||| |||||   || |||||| | |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12920 aattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacct 12821  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12820 gattggttcggccgtggaagca 12799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 3836
Alignment:
Q  27 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattaaagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||   ||| |||||     
T  4257 gcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggta 4158  T
Q  127 ggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 226  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||       |||||| ||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  4157 ggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 4058  T
Q  227 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 326  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |  | | |||||||||||||    ||||||||||||    
T  4057 tgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgaggg 3958  T
Q  327 gattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 426  Q
     ||| |    |||||||| |||||   |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||||| |||| || |    
T  3957 aatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacct 3858  T
Q  427 gattggttcggccgtggaagca 448  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  3857 gattggtttggccttggaagca 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 390
Target Start/End: Original strand, 16691596 - 16691867
Alignment:
Q  119 atatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataannnnnnngctgatcaatttgaagatttatgttttct 218  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||||  | |||||| |||| |||||  ||||||| |||||       |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  16691596 atatggttgggatccatggaattggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttct 16691695  T
Q  219 tcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgtt 318  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||  |||  ||||||| ||||| |  |||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||  ||||||    
T  16691696 tcatgacgtgagagaaaattcatctaaacatggcttagaacatcttcaagaaaggctcctttccaaaaccattggattagacattaagttaggacatgtt 16691795  T
Q  319 agtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatgatgttgat 390  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | ||||||     ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16691796 agtgaaggaattccaataataaaacaaaggctacaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttgat 16691867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17992474 - 17992404
Alignment:
Q  313 catgttagtgaggggattccaatcataaaggagaggctatgtagaaagaaaattcttttgattcttgatga 383  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  17992474 catgttaatgaaggtattccaatcataaagcaaaggctatgtcaaaagaaagttctcttgattctcgatga 17992404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University