View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20551_high_19 (Length: 310)

Name: NF20551_high_19
Description: NF20551
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20551_high_19
NF20551_high_19
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (28-300)||(11651938-11652210)
chr6 (28-300)||(17684189-17684461)
chr6 (28-300)||(27380972-27381244)
chr6 (28-300)||(27471355-27471627)
chr6 (28-300)||(17691160-17691432)
chr6 (28-300)||(29309105-29309377)
chr6 (28-300)||(29316065-29316336)
chr6 (28-267)||(27296877-27297116)
chr6 (28-300)||(188697-188969)
chr6 (28-300)||(16394165-16394437)
chr6 (32-269)||(25536915-25537152)
chr6 (29-250)||(16559193-16559414)
chr6 (45-295)||(13359010-13359256)
chr6 (28-279)||(27508347-27508594)
chr6 (28-279)||(16789126-16789373)
chr6 (28-279)||(22859888-22860135)
chr6 (42-279)||(27527947-27528180)
chr6 (28-267)||(1586108-1586343)
chr6 (161-279)||(18019973-18020088)
chr6 (28-267)||(14074547-14074782)
chr6 (38-295)||(2669513-2669768)
chr6 (50-267)||(10359073-10359285)
chr6 (28-267)||(8612982-8613221)
chr6 (245-300)||(16566257-16566312)
chr6 (212-299)||(28172772-28172859)
chr6 (132-267)||(21994655-21994787)
chr6 (102-282)||(8510155-8510333)
chr6 (169-265)||(20736469-20736562)
chr6 (28-267)||(17120505-17120740)
chr6 (161-267)||(22560316-22560419)
chr6 (206-296)||(27925973-27926062)
chr6 (28-141)||(33317055-33317167)
chr6 (113-260)||(5758565-5758709)
chr6 (106-158)||(28172911-28172963)
chr6 (161-258)||(4073652-4073745)
chr6 (205-270)||(17850392-17850457)
chr6 (161-260)||(19218503-19218594)
chr6 (240-279)||(13995151-13995190)
chr6 (200-300)||(19347092-19347191)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-300)||(2041-2313)
scaffold0234 (28-300)||(10932-11204)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (28-300)||(24695186-24695458)
chr5 (28-300)||(19714218-19714490)
chr5 (28-288)||(18569581-18569841)
chr5 (28-300)||(19706939-19707210)
chr5 (28-294)||(17298621-17298885)
chr5 (150-300)||(39538803-39538953)
chr5 (28-300)||(17285470-17285740)
chr5 (24-202)||(27347252-27347428)
chr5 (28-135)||(24701950-24702057)
chr5 (115-295)||(18806843-18807021)
chr5 (28-279)||(20941082-20941329)
chr5 (28-267)||(22941317-22941552)
chr5 (28-279)||(25805385-25805632)
chr5 (28-279)||(31954-32201)
chr5 (28-279)||(12789663-12789910)
chr5 (28-279)||(23545977-23546224)
chr5 (28-267)||(31096883-31097118)
chr5 (161-300)||(22546872-22547008)
chr5 (28-267)||(24933306-24933541)
chr5 (40-265)||(20100255-20100476)
chr5 (28-260)||(12764990-12765222)
chr5 (28-260)||(5097725-5097953)
chr5 (28-267)||(7865430-7865669)
chr5 (28-267)||(26245169-26245404)
chr5 (28-260)||(9811733-9811965)
chr5 (28-260)||(12703874-12704106)
chr5 (122-277)||(18829377-18829530)
chr5 (24-113)||(28719471-28719558)
chr5 (115-253)||(18806483-18806619)
chr5 (115-253)||(18806663-18806799)
chr5 (24-267)||(26129689-26129928)
chr5 (28-109)||(39538954-39539035)
chr5 (255-300)||(27347425-27347470)
chr5 (203-279)||(33477193-33477269)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (28-300)||(868812-869084)
chr4 (28-300)||(18262427-18262699)
chr4 (28-300)||(18269288-18269560)
chr4 (28-300)||(55612898-55613170)
chr4 (28-300)||(8858382-8858654)
chr4 (28-300)||(26963855-26964127)
chr4 (28-300)||(26970678-26970950)
chr4 (28-300)||(19926480-19926752)
chr4 (28-300)||(5707535-5707807)
chr4 (28-300)||(5714163-5714435)
chr4 (28-300)||(10621053-10621325)
chr4 (28-300)||(10628132-10628404)
chr4 (28-300)||(28392854-28393126)
chr4 (28-300)||(8845418-8845690)
chr4 (28-300)||(4426336-4426596)
chr4 (28-296)||(5667849-5668115)
chr4 (28-296)||(35223779-35224047)
chr4 (28-260)||(10677303-10677534)
chr4 (28-260)||(10890943-10891174)
chr4 (24-296)||(20311511-20311781)
chr4 (28-279)||(15461552-15461799)
chr4 (28-279)||(34975606-34975853)
chr4 (28-279)||(2677068-2677315)
chr4 (28-279)||(15815076-15815323)
chr4 (28-279)||(18111043-18111290)
chr4 (44-267)||(19365586-19365806)
chr4 (28-279)||(3369023-3369270)
chr4 (28-279)||(17299959-17300206)
chr4 (130-279)||(21453962-21454110)
chr4 (28-267)||(20244004-20244239)
chr4 (28-267)||(26531680-26531915)
chr4 (28-267)||(1941791-1942026)
chr4 (28-267)||(4675983-4676218)
chr4 (28-267)||(18163229-18163464)
chr4 (28-279)||(5870473-5870720)
chr4 (28-248)||(30040489-30040705)
chr4 (129-266)||(32636552-32636686)
chr4 (203-300)||(56516271-56516368)
chr4 (45-267)||(19362477-19362695)
chr4 (44-260)||(5616469-5616681)
chr4 (28-260)||(9487625-9487853)
chr4 (44-267)||(5528495-5528714)
chr4 (173-288)||(34777862-34777975)
chr4 (161-267)||(4546147-4546250)
chr4 (44-260)||(9538033-9538244)
chr4 (28-279)||(32646523-32646772)
chr4 (106-156)||(24701361-24701411)
chr4 (133-279)||(33888594-33888735)
chr4 (28-245)||(11421096-11421309)
chr4 (253-299)||(24700245-24700291)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (28-300)||(6110279-6110551)
chr3 (28-300)||(8490710-8490982)
chr3 (28-300)||(16482203-16482475)
chr3 (28-300)||(10579075-10579347)
chr3 (28-300)||(15600604-15600876)
chr3 (28-300)||(15607149-15607421)
chr3 (28-300)||(10572312-10572584)
chr3 (28-300)||(13211517-13211789)
chr3 (28-300)||(18520190-18520462)
chr3 (28-300)||(15357306-15357578)
chr3 (32-300)||(18522878-18523146)
chr3 (28-300)||(13248822-13249094)
chr3 (28-300)||(15341939-15342211)
chr3 (28-300)||(17780838-17781110)
chr3 (28-300)||(32056619-32056892)
chr3 (24-300)||(17199900-17200176)
chr3 (28-300)||(13517026-13517294)
chr3 (28-300)||(1647241-1647513)
chr3 (28-300)||(17136574-17136840)
chr3 (28-297)||(29925189-29925458)
chr3 (28-297)||(29974342-29974611)
chr3 (28-299)||(16200646-16200917)
chr3 (28-279)||(21034293-21034540)
chr3 (28-279)||(15846536-15846783)
chr3 (28-279)||(20147554-20147801)
chr3 (28-279)||(21398847-21399094)
chr3 (28-279)||(14890446-14890693)
chr3 (28-267)||(55427088-55427323)
chr3 (28-266)||(12299978-12300212)
chr3 (28-267)||(25978728-25978963)
chr3 (28-267)||(11787654-11787889)
chr3 (28-267)||(15317176-15317408)
chr3 (113-292)||(24253197-24253372)
chr3 (130-260)||(14147095-14147222)
chr3 (62-260)||(15526827-15527021)
chr3 (28-213)||(28088227-28088408)
chr3 (161-294)||(32280313-32280444)
chr3 (165-296)||(28953965-28954095)
chr3 (224-296)||(8251933-8252005)
chr3 (113-181)||(30464147-30464215)
chr3 (162-256)||(4189223-4189314)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (28-300)||(18252245-18252517)
chr1 (28-300)||(18532234-18532506)
chr1 (28-300)||(27131130-27131401)
chr1 (28-300)||(27310297-27310569)
chr1 (28-300)||(16358755-16359027)
chr1 (28-300)||(3855639-3855911)
chr1 (28-300)||(36816354-36816625)
chr1 (28-297)||(22641594-22641859)
chr1 (28-296)||(27277278-27277545)
chr1 (160-300)||(21171085-21171225)
chr1 (28-279)||(19706439-19706686)
chr1 (28-279)||(28134723-28134970)
chr1 (28-279)||(43802365-43802612)
chr1 (28-220)||(9916497-9916688)
chr1 (28-279)||(9456171-9456418)
chr1 (28-279)||(20391239-20391486)
chr1 (28-279)||(20779645-20779892)
chr1 (28-279)||(22670257-22670504)
chr1 (28-279)||(42816989-42817236)
chr1 (195-294)||(22657108-22657207)
chr1 (28-279)||(22612547-22612794)
chr1 (48-267)||(634001-634216)
chr1 (28-296)||(23507119-23507385)
chr1 (134-260)||(21881481-21881604)
chr1 (28-260)||(8727741-8727969)
chr1 (115-267)||(29096789-29096938)
chr1 (226-296)||(9917837-9917906)
chr1 (203-296)||(12014179-12014272)
chr1 (207-260)||(51997353-51997406)
chr1 (28-279)||(47667485-47667721)
chr1 (203-267)||(35930649-35930713)
chr1 (28-141)||(28145723-28145835)
chr1 (235-295)||(12006466-12006526)
chr1 (113-175)||(12006350-12006413)
chr1 (201-256)||(26923553-26923608)
chr1 (163-220)||(31236398-31236452)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (29-300)||(21940880-21941151)
chr8 (28-297)||(22171705-22171974)
chr8 (28-300)||(6094338-6094610)
chr8 (28-291)||(15326422-15326685)
chr8 (28-291)||(15506791-15507054)
chr8 (28-300)||(24642864-24643135)
chr8 (28-165)||(28548397-28548534)
chr8 (102-296)||(14983717-14983908)
chr8 (143-279)||(24797224-24797359)
chr8 (28-279)||(8371253-8371500)
chr8 (28-279)||(12562178-12562425)
chr8 (28-279)||(21969388-21969635)
chr8 (28-279)||(25611250-25611497)
chr8 (28-279)||(27007517-27007764)
chr8 (28-279)||(27014660-27014907)
chr8 (28-279)||(27880487-27880734)
chr8 (28-279)||(28020668-28020915)
chr8 (28-279)||(22130609-22130856)
chr8 (28-267)||(22659494-22659729)
chr8 (28-279)||(21916731-21916978)
chr8 (28-267)||(45534273-45534508)
chr8 (44-296)||(38232115-38232365)
chr8 (28-267)||(6430953-6431188)
chr8 (28-267)||(26240551-26240786)
chr8 (113-259)||(8781959-8782102)
chr8 (125-260)||(18835424-18835556)
chr8 (38-135)||(24796731-24796826)
chr8 (28-267)||(2962932-2963171)
chr8 (44-232)||(20535226-20535410)
chr8 (192-295)||(2375231-2375332)
chr8 (24-141)||(2375411-2375528)
chr8 (208-300)||(32872741-32872833)
chr8 (23-141)||(36970439-36970556)
chr8 (28-89)||(8968015-8968076)
chr8 (236-288)||(10920427-10920479)
chr8 (238-294)||(29645575-29645631)
chr8 (235-267)||(36970332-36970364)
chr8 (40-88)||(41368106-41368154)
chr8 (40-88)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (28-300)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (28-300)||(6654-6926)
scaffold0390 (28-300)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-300)||(25706-25982)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (32-300)||(15152658-15152926)
chr7 (28-300)||(29327999-29328271)
chr7 (28-300)||(11535782-11536054)
chr7 (28-300)||(12751041-12751313)
chr7 (28-300)||(11542700-11542972)
chr7 (28-300)||(12738751-12739023)
chr7 (28-300)||(18561222-18561485)
chr7 (28-296)||(13392369-13392637)
chr7 (22-300)||(18257559-18257834)
chr7 (28-279)||(2204607-2204854)
chr7 (28-279)||(8465054-8465301)
chr7 (28-279)||(18400159-18400406)
chr7 (28-279)||(18407143-18407390)
chr7 (28-279)||(48808496-48808743)
chr7 (28-267)||(15729818-15730053)
chr7 (28-267)||(18139338-18139573)
chr7 (28-279)||(19230943-19231190)
chr7 (40-279)||(30254193-30254428)
chr7 (28-267)||(41680968-41681203)
chr7 (28-268)||(2365169-2365407)
chr7 (40-267)||(47166871-47167094)
chr7 (28-267)||(10668901-10669137)
chr7 (66-267)||(19393462-19393659)
chr7 (50-267)||(24443349-24443562)
chr7 (28-267)||(18259124-18259359)
chr7 (134-260)||(22969024-22969147)
chr7 (50-256)||(25845498-25845700)
chr7 (50-256)||(25845917-25846119)
chr7 (28-260)||(34128647-34128875)
chr7 (28-267)||(28130628-28130863)
chr7 (212-295)||(7662569-7662651)
chr7 (113-260)||(19388626-19388774)
chr7 (169-260)||(14591924-14592012)
chr7 (169-260)||(16011515-16011603)
chr7 (203-300)||(10235377-10235474)
chr7 (235-279)||(19859177-19859221)
chr7 (130-253)||(31190540-31190660)
chr7 (28-216)||(15169290-15169474)
chr7 (39-176)||(39112138-39112275)
chr7 (226-296)||(47833875-47833945)
chr7 (202-279)||(3132910-3132986)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-300)||(18503-18774)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (28-300)||(21329968-21330240)
chr2 (28-300)||(18796721-18796993)
chr2 (22-296)||(18620023-18620296)
chr2 (28-299)||(20978091-20978360)
chr2 (28-279)||(30174432-30174679)
chr2 (28-282)||(36270399-36270650)
chr2 (28-279)||(24250032-24250279)
chr2 (40-296)||(18822302-18822556)
chr2 (28-300)||(22183206-22183475)
chr2 (42-272)||(6991847-6992076)
chr2 (40-267)||(15342014-15342237)
chr2 (28-267)||(24229215-24229450)
chr2 (203-295)||(19279508-19279600)
chr2 (26-260)||(29800545-29800775)
chr2 (28-191)||(17241034-17241196)
chr2 (205-296)||(18851956-18852047)
chr2 (130-260)||(40301038-40301164)
chr2 (28-95)||(41661694-41661761)
chr2 (53-258)||(41316305-41316506)
chr2 (113-260)||(19616509-19616653)
chr2 (113-189)||(28740910-28740986)
chr2 (201-264)||(28718943-28719006)
chr2 (235-267)||(28741229-28741261)
chr2 (233-300)||(36801906-36801974)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (47-300)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-282)||(230111-230365)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-300)||(5744-6013)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-279)||(238-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (28-279)||(3675-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-279)||(119785-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (40-267)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-267)||(67374-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-279)||(130262-130471)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (161-279)||(8360-8475)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (28-267)||(26609-26844)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (130-258)||(8807-8932)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (28-218)||(102-288)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-267)||(39988-40223)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (28-260)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (125-260)||(83111-83243)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (205-296)||(45956-46051)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (212-296)||(90019-90104)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (28-267)||(53832-54066)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (161-218)||(9231-9285)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651938
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11651938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684461
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17684461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381244
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27381244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 17691432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309105
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29309105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316065
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29316065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188969
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 188969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394437
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtg 16394437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  232 taatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 269  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  129 atggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  229 atctaatataaatattactcct 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359256
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  || ||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  145 gggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatat 243  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||  |||||| |   ||||  ||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgat 13359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508594
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27508594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 16789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860135
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || || |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22860135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528180
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  142 gaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaat 241  Q
     ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  242 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27528180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586343
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 1586343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Original strand, 18019973 - 18020088
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18019973 tatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttata 18020069  T
Q  261 tctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  18020070 tctatgtatagacttgata 18020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074547
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  || ||||||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgt 14074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669513
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttca 137  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   || ||| ||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  138 ggtcgaagggtggaatacacctcta-tcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaata 236  Q
    |||| ||  |||||||||||  ||  ||| |||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  237 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgat 2669513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359285
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   |  |||||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  150 gaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcc 249  Q
    | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||| | ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  250 taatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10359268 taatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612982
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  || ||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 8612982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566312
Alignment:
Q  245 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16566312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172772
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgt 299  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgt 28172772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21994787 - 21994655
Alignment:
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  21994787 gtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgggtcattc 21994691  T
Q  232 taatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994690 cagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8510333 - 8510155
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataactttt 201  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  || ||| |||| | |||| ||||||| || || |||||||||  |||||| ||     
T  8510333 actcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacactta-cataacatt- 8510236  T
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 282  Q
     |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510235 -ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Original strand, 20736469 - 20736562
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctat 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736469 tgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagtattctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   || ||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catatagggatcat 17120603  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 22560316 - 22560419
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | |||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  22560316 tatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatatttaaa 22560412  T
Q  261 tctatgt 267  Q
     ||||||    
T  22560413 cctatgt 22560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925973
Alignment:
Q  206 tgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatc 27925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  128 aatggtttcaggtc 141  Q
    | ||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||| ||| ||||||||||||||| || | | |||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatct-cataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172911
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacc 158  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacacc 28172911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4073745 - 4073652
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatattta 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4073745 tatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtaggtcaatcaaatataaatattacctctaatattta 4073652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 270
Target Start/End: Original strand, 17850392 - 17850457
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 270  Q
    |||||||||||| | || || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17850392 atgtagtattcttaaggagggtcaatccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaa 17850457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19218594 - 19218503
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19218594 tatcattctgagaatatcttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc-----aatataaattttactcctaatatttata 19218503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 279
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995190
Alignment:
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 13995190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347191
Alignment:
Q  200 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || ||| |||| |||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatatta-ttctaatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2313
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11204
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695458
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24695458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714490
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 288
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569841
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttat 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttat 18569841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707210
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |  || ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtg 19707210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298885
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  || ||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatga 294  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatga 17298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538803
Alignment:
Q  150 gaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcc 249  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 39538803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  || ||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtg 17285740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347428
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 202  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  128 aatggttt 135  Q
    | ||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807021
Alignment:
Q  115 atctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  214 tctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 18807021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941082
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20941082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941317
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 22941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805632
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||  ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25805632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 31954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789910
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |  | |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgata 12789910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545977
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 23545977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096883
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgt 31096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22547008
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgata-tttacataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttata 22546968  T
Q  261 tctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22546969 tctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtg 22547008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933541
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 24933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100476
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  |  ||||||| || ||| |||||| |||  |||| |||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcc-acatcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| | | |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctat 265  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctat 20100476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 12765222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097725
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttata 5097725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865669
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  || ||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 7865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || |||||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||||   || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26245169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811965
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704106
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 12704106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  122 gtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    ||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  221 gcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 277  Q
    | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  115 atctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  214 tctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  115 atctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  214 tctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  |  ||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
     |||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||  ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  224 gatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    | |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgact 109  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347470
Alignment:
Q  255 tttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtg 27347470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477269
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgata 33477269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868812
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 868812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262427
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18262427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269288
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612898
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 55612898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858382
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8858382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963855
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26963855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970678
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26970678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926752
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19926752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707535
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714163
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5714163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621325
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10621325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628404
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10628404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 28393126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845418
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtg 8845418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426596
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||            ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 4426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668115
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatc 5668115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223779
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
      |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatc 35223779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311511
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 222  Q
    | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||   ||||| |  || ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  223 ggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
     | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 20311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461552
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15461552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975606
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 34975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677068
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2677068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15815076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111290
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18111290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365586
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |  ||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  144 agggtggaatacacctctatcatta-tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaata 242  Q
    || |||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  243 ttactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369270
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3369270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300206
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 17300206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Original strand, 21453962 - 21454110
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || ||||    
T  21453962 tggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtcaa 21454060  T
Q  230 tctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454061 ttcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20244004
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 20244004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531680
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 26531680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  || ||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 1941928  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676218
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 4676218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163229
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 18163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870473
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   || || |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 5870473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |||  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  228 aatctaatataaatattactc 248  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32636686 - 32636552
Alignment:
Q  129 atggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    ||||||||| |||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    || |||    
T  32636686 atggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacattgggtca 32636590  T
Q  229 atctaatataaatattactcctaatatttatatctatg 266  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636589 atccaatataaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516271
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtg 56516271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |  ||||| |  | |||| |||||| ||  |||| |||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  145 gggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatatt 244  Q
    | |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||| | ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  245 actcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616469
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |  ||||||| || |||| |||||||||  |||| ||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  144 agggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatat 243  Q
    ||  ||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||| | |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5616485 tacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   || ||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||| || |||| |||||||||  ||||   |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  144 agggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatat 243  Q
    || |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | |||  |||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Original strand, 34777862 - 34777975
Alignment:
Q  173 aatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaaga 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |   | | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||  ||| ||||||    
T  34777862 aatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttatacatatttgaaga 34777959  T
Q  273 cttgataactttttat 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  34777960 cttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4546250 - 4546147
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||  || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4546250 tatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttata 4546154  T
Q  261 tctatgt 267  Q
     ||||||    
T  4546153 cctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||| || |||| |||| | ||  |||  |||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  144 agggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatat 243  Q
    ||  ||||  || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||| | |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646772
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   || ||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| || | |||| || | ||||  | | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||  | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgata 32646772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaataca 156  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33888735 - 33888594
Alignment:
Q  133 tttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatct 232  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| || |||||      
T  33888735 tttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgggtcaattc 33888638  T
Q  233 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888637 a---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |  ||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| | | |||  |||||    ||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  228 aatctaatataaatatta 245  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700245
Alignment:
Q  253 tatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgt 24700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6110279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490710
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8490710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579347
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10579347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600876
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607421
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15607421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572584
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10572584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211517
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13211517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520190
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18520190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357578
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15357578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522878
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  232 taatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248822
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13248822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342211
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15342211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781110
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtg 17781110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 32056892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200176
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  224 gatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtg 17200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517026
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||      || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13517026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647513
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 1647513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136574
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17136574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925189
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatct 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974342
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatct 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29974342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200646
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgt 299  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgt 16200646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034293
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21034293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846783
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || || |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15846783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147801
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20147801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398847
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgata 21398847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890446
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | || ||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 14890446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427088
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 55427088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299978
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || || |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatg 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg 12299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 25978826  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317408
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   || ||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |   |||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 292
Target Start/End: Original strand, 24253197 - 24253372
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||    
T  24253197 acatctaaggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcatta 24253292  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccat 292  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24253293 ttctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccat 24253372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14147222 - 14147095
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| | ||||    
T  14147222 tggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcaggtcaa 14147126  T
Q  230 tctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  14147125 tccagtataaatattcctcctaatatttata 14147095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  62 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||| || ||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||  |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  162 atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    | |||| | |||||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||| ||||| |  || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088227
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || |||| || || ||| ||||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcc-acatctagggatcat 28088310  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32280444 - 32280313
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  |||||    
T  32280444 tatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac--tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattata 32280347  T
Q  261 tctatgtgaagacttgataactttttatccatga 294  Q
     ||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  32280346 cctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28954095 - 28953965
Alignment:
Q  165 attatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaa-tataaatattactcctaatatttatatct 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||  || | |||| ||  | |||||||||||||||| | ||||  |    
T  28954095 attatgagaatatcatatgacactttaaataac--ttattatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacat 28953998  T
Q  264 atgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  28953997 atgtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252005
Alignment:
Q  224 gatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatc 8252005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30464215 - 30464147
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatctta 181  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30464215 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4189314 - 4189223
Alignment:
Q  162 atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatt 256  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||  |||  |||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  4189314 atcaatatgagaatattttatgacacctt-cataatattt--tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252245
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18252245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532506
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18532506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310569
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtg 27310569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359027
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtg 16359027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtg 3855911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 36816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641859
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatct 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatct 22641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277545
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatc 27277545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 300
Target Start/End: Original strand, 21171085 - 21171225
Alignment:
Q  160 ctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttat 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21171085 ctatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 21171184  T
Q  260 atctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21171185 atctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21171225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706686
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19706686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28134970
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802612
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 43802612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  128 aatgg-tttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456171
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 9456171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391486
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20391337  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | || |||||    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgata 20391486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20779892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670504
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817236
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 42817236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 294
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657207
Alignment:
Q  195 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612547
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgata 22612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634001
Alignment:
Q  48 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaaggg 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  148 tggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattact 247  Q
     |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  248 cctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507119
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | || ||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||||||||||||||||| ||  |||| || || |||| |||||||||| |||||| |  ||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatc 23507119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Original strand, 21881481 - 21881604
Alignment:
Q  134 ttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcta 233  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||     
T  21881481 ttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctt 21881577  T
Q  234 atataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881578 gtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727741
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||| |||||| ||| |||  ||||||   ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29096938 - 29096789
Alignment:
Q  115 atctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtatt 214  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||    
T  29096938 atctagggatcatagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtatt 29096842  T
Q  215 ctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096841 cacacggtggatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 296
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917906
Alignment:
Q  226 tcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 9917906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Original strand, 12014179 - 12014272
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12014179 ctatgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatc 12014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||           ||| || || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgata 47667721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930649
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 35930649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  128 aatggtttcaggtc 141  Q
    | ||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Original strand, 12006466 - 12006526
Alignment:
Q  235 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  12006466 tataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgat 12006526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 12006350 - 12006413
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctc-tatcattatgagaat 175  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  12006350 acatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923608
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatt 256  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatatt 26923608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Original strand, 31236398 - 31236452
Alignment:
Q  163 tcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  31236398 tcattatgagaatatcttacgacac-tttcataa--tatactatgtagtattctcatg 31236452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940880
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  129 atggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  229 atctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21940880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatct 297  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 22171705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094338
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6094338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatcca 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatcca 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642864
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24642864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548397
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatca 165  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 28548397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Original strand, 14983717 - 14983908
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttt 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14983717 actcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt 14983815  T
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
      |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  14983816 --ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatc 14983908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797359
Alignment:
Q  143 aagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaata 242  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  243 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgata 24797359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371500
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgata 8371500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562178
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 12562178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969388
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21969388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611250
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |||  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25611250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007764
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27007764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014907
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27014907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880734
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020915
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28020915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130856
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22130856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659729
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916731
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgata 21916731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534508
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 45534508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232365
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   || ||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  144 agggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaata 242  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  243 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatc 38232365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 6431090  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | || |||||||||  || | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240551
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||| ||||| ||| | |  |||||     |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacag--actatgtagta 8782055  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttat 259  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835424
Alignment:
Q  125 cataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 18835424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggttt 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963171
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| | |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-cgtctagggatcat 2963030  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||| |   ||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||  |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535410
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||| || ||||  || || ||  |||| ||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  144 agggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatct 232  Q
    || |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatgcaatattctcatggtgggtcaatct 20535410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2375332 - 2375231
Alignment:
Q  192 cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatcca 291  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||    
T  2375332 cataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatcca 2375235  T
Q  292 tgat 295  Q
    ||||    
T  2375234 tgat 2375231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  || ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  124 acataatggtttcaggtc 141  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872833
Alignment:
Q  208 tagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtg 32872833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  23 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctaggg 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  || ||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  123 tacataatggtttcaggtc 141  Q
      |||| ||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  236 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttat 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645575
Alignment:
Q  238 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatga 294  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatga 29645575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36970364 - 36970332
Alignment:
Q  235 tataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970364 tataaatattactcctaatatttatacctatgt 36970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7322
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6926
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13942
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25982
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  224 gatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtg 25982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152658
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  232 taatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15152658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327999
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 29327999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtg 11536054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751041
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtg 12751041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542972
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 11542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738751
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 12738751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392369
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatc 13392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257834
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  || ||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  122 gtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |  |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  222 cggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
     || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18257834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204607
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2204607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8465054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 8465054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400159
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407143
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18407143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808743
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 48808743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729818
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 15729818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139573
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgt 18139573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230943
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  || || |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19230943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254193
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||| |||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    || ||| ||   |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30254193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   || ||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||| || |||||||| |||| |||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 268  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167094
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||| ||| || |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    || ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgt 47167094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669137
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatca-ttatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 10669137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393659
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatca 165  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| || ||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  ||||||   |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  166 ttatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctat 265  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443562
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    |  ||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  150 gaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcc 249  Q
      |||||||  ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  250 taatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgt 24443562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259359
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    || ||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22969147 - 22969024
Alignment:
Q  134 ttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcta 233  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||     
T  22969147 ttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctt 22969051  T
Q  234 atataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969050 gtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  |  ||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  150 gaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcc 249  Q
    | ||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||| | |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25845694 taatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  |  ||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  150 gaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcc 249  Q
    | ||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||| | |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25846113 taatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130628
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | || ||||||||| |||  ||  ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662651
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgat 7662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataactt--ttactatgtag 210  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||   || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  211 tattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||   |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14592012 - 14591924
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14592012 tgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16011603 - 16011515
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011603 tgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235377
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtg 10235377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859177
Alignment:
Q  235 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19859177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Original strand, 31190540 - 31190660
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||||||| ||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||    
T  31190540 tggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataacat--acaatgtagtattctcatggtgggtcaa 31190636  T
Q  230 tctaatataaatattactcctaat 253  Q
    || | |||||||||| ||||||||    
T  31190637 tccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  |  ||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 216  Q
    | |||||| ||| | ||| || | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  39 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcag 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   || ||  ||| || ||| |||||||| ||||||| || |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  139 gtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaata 176  Q
    || |||   ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 296
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833945
Alignment:
Q  226 tcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatc 47833945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132910
Alignment:
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgata 3132910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18503
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330240
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21330240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18796721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620023
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  122 gtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacacttt-cataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  222 cggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatc 18620023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    | ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | | || ||| ||| ||| |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30174432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270399
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  || ||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataact 36270399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || || |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 24250279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822302
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatata 238  Q
    ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||  |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  239 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatc 18822302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     || ||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||  | | ||||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  227 caatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtg 22183475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 272
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992076
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaa-gcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  || || | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  141 cgaagggtggaatacacctct-atcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||  ||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcactta-cataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgtgaaga 272  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaaga 6992076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  |  ||||| | || | || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    || ||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || || | |||| | |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229450
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   || ||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| | | ||| | |  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 24229450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279508
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgat 295  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgat 19279508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800545
Alignment:
Q  26 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtac 125  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   |  ||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  126 ataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||| || |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  226 tcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  |||||  ||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacactttt 191  Q
    | |||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852047
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    ||||| |||||| || |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatc 18852047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 260
Target Start/End: Original strand, 40301038 - 40301164
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| || ||||    
T  40301038 tggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtgggtcaa 40301133  T
Q  230 tctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301134 tctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  53 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaa 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |  |||| ||  | |||| |||||||||  |||| ||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  153 tacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaa 252  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  253 tattta 258  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||  ||||||   ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||  |  |||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataaaat--actatgtagta 19616557  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || || |||||  |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  113 acatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| || |||  ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatcta 264  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Original strand, 28741229 - 28741261
Alignment:
Q  235 tataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28741229 tataaatattactcctaatatttatacctatgt 28741261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 300
Target Start/End: Original strand, 36801906 - 36801974
Alignment:
Q  233 aatataaatattactcctaatatttata-tctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  36801906 aatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtg 36801974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1208
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  147 gtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattac 246  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  247 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtg 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230365
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5744
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  124 acataatggtttcaggtcgaaggg-tggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  222 cggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtg 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 238
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3922
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119785
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13184
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  || ||||| | || |||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  140 tcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataa 239  Q
    || ||| |||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||   |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  240 atattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgt 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67609
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 67472  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130471
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatca 165  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |  |||||    |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  166 ttatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctat 265  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  266 gtgaagacttgata 279  Q
    ||  ||||||||||    
T  130458 gtatagacttgata 130471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8475 - 8360
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8475 tatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttata 8379  T
Q  261 tctatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  8378 tctatgtatagacttgata 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   |  |||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |||  ||||||   ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8932 - 8807
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||| | || ||||    
T  8932 tggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataacat--actaagtagtattctcattgggggtcaa 8836  T
Q  230 tctaatataaatattactcctaatattta 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8835 tctagtataaatattactcctaatattta 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  || ||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcag 190  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    | |||||||||||| ||| |||  ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40223
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||| ||| ||| ||   |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgt 40223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  || ||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    | |||||||||||| ||| | |   |||||   ||||||| |||||||||||||||||| |   |  ||||||   ||||||||||||||||||  | ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  125 cataatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  225 atcaatctaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatat----ttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatc 296  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90104
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataact-ttttatccatgatc 296  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatc 90104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53832
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacgaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |  ||||||| || |||| || ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggc-ataaagcacttgagtcca-cacctagggatcat 53969  T
Q  128 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacacctctatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| |    ||| ||   || |||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  228 aatctaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    || | | | | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53871 aacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgt 53832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9285 - 9231
Alignment:
Q  161 tatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9285 tatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 9231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University