View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20573_low_2 (Length: 637)

Name: NF20573_low_2
Description: NF20573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20573_low_2
NF20573_low_2
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (1-619)||(27591993-27592612)
chr6 (1-619)||(27676592-27677211)
chr6 (1-619)||(28792950-28793569)
chr6 (1-619)||(28786829-28787448)
chr6 (1-618)||(27717472-27718090)
chr6 (5-618)||(27610093-27610707)
chr6 (1-619)||(27603676-27604295)
chr6 (12-525)||(28781703-28782217)
chr6 (1-619)||(27679541-27680160)
chr6 (1-612)||(27426591-27427203)
chr6 (1-619)||(31285150-31285769)
chr6 (3-619)||(26803039-26803656)
chr6 (1-619)||(26623862-26624481)
chr6 (1-619)||(26729839-26730458)
chr6 (1-585)||(27530307-27530892)
chr6 (1-595)||(27697582-27698177)
chr6 (1-446)||(27705549-27705995)
chr6 (52-588)||(27337098-27337635)
chr6 (52-588)||(27397838-27398375)
chr6 (50-588)||(26647119-26647658)
chr6 (50-588)||(26753087-26753626)
chr6 (60-606)||(26862230-26862777)
chr6 (140-618)||(26143599-26144077)
chr6 (50-618)||(26656605-26657171)
chr6 (50-618)||(26762576-26763142)
chr6 (60-607)||(25580372-25580920)
chr6 (60-618)||(25483709-25484268)
chr6 (50-618)||(26884710-26885276)
chr6 (60-618)||(26076542-26077101)
chr6 (60-618)||(26056572-26057131)
chr6 (51-607)||(25492303-25492860)
chr6 (50-592)||(26824459-26825002)
chr6 (162-618)||(25511645-25512100)
chr6 (140-606)||(25539274-25539740)
chr6 (444-619)||(27705226-27705401)
chr6 (50-277)||(27215092-27215320)
chr6 (356-522)||(28326425-28326591)
chr6 (356-522)||(28504061-28504227)
chr6 (355-578)||(28243741-28243964)
chr6 (358-577)||(28182067-28182286)
chr6 (149-262)||(28140275-28140388)
chr6 (356-585)||(28235512-28235741)
chr6 (376-503)||(27215419-27215546)
chr6 (431-578)||(28227974-28228121)
chr6 (414-494)||(28240359-28240439)
chr6 (134-225)||(29843353-29843444)
chr6 (170-223)||(26937790-26937843)
chr6 (432-517)||(29827009-29827094)
chr6 (458-590)||(26938078-26938210)
chr6 (448-491)||(27664305-27664348)
chr6 (458-495)||(26976000-26976037)
chr6 (134-227)||(29826711-29826804)
chr6 (553-617)||(27215596-27215660)
chr6 (177-225)||(28097809-28097857)
chr6 (545-601)||(28186530-28186586)
chr6 (464-495)||(25074922-25074953)
chr6 (458-493)||(26849761-26849796)
chr6 (460-495)||(31289320-31289355)
chr6 (168-225)||(26849471-26849528)
chr6 (168-225)||(26975710-26975767)
chr6 (356-485)||(28296846-28296975)
chr6 (356-485)||(28515098-28515227)
chr6 (189-225)||(25074647-25074683)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-618)||(2512-3130)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (12-619)||(8089-8697)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (12-619)||(12647-13255)
scaffold0277 (1-619)||(3684-4303)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-618)||(18698369-18698987)
chr4 (1-618)||(18678529-18679147)
chr4 (1-612)||(18074352-18074964)
chr4 (1-618)||(18730473-18731091)
chr4 (1-618)||(18654446-18655064)
chr4 (1-618)||(18723054-18723672)
chr4 (356-592)||(5089949-5090185)
chr4 (557-618)||(18688595-18688656)
chr4 (168-225)||(5090319-5090376)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-612)||(60160-60772)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-594)||(267337-267931)
chr1 (50-618)||(28163349-28163917)
chr1 (51-612)||(28126654-28127216)
chr1 (554-590)||(26137033-26137069)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-607)||(29272822-29273429)
chr8 (48-109)||(16440691-16440753)
chr8 (376-493)||(12589639-12589756)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (356-592)||(57293-57529)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (355-578)||(43903-44126)
scaffold0038 (356-585)||(35674-35903)
scaffold0038 (431-578)||(28472-28619)
scaffold0038 (414-494)||(40521-40601)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (320-519)||(16691778-16691977)
chr5 (129-225)||(16691587-16691683)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (464-589)||(17992217-17992342)
chr2 (168-225)||(3280418-3280475)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27592612 - 27591993
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27592612 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27592513  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27592512 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttat 27592413  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27592412 aactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttt 27592313  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27592312 taaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttga 27592213  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| |  || | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27592212 tgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacactta 27592113  T
Q  500 ctaagaat-tcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaa 598  Q
    || ||| | ||||||||| ||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27592112 ct-agactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaa 27592014  T
Q  599 gttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  27592013 gttccttcaagttatgaagac 27591993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27677211 - 27676592
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27677211 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaat 27677112  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27677111 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttat 27677012  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27677011 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttt 27676912  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27676911 taaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttga 27676812  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| |  || | || ||| | || ||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27676811 tgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacactta 27676712  T
Q  500 ctaagaat-tcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaa 598  Q
    || ||| | ||||||||| ||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27676711 ct-agactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaa 27676613  T
Q  599 gttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  27676612 gttccttcaagttatgaagac 27676592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 28792950 - 28793569
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28792950 ttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 28793049  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28793050 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttat 28793149  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  28793150 aattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttt 28793249  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  28793250 taaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcga 28793349  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28793350 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacactta 28793449  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||    
T  28793450 ctaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaag 28793549  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    | |||||| |||| ||||||    
T  28793550 taccttcaagttatgaagac 28793569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 28786829 - 28787448
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28786829 ttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 28786928  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28786929 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttat 28787028  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  28787029 aattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttt 28787128  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  28787129 taaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcga 28787228  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28787229 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacactta 28787328  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||    
T  28787329 ctaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaag 28787428  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    | |||||| |||| ||||||    
T  28787429 taccttcaagttatgaagac 28787448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27718090 - 27717472
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27718090 ttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27717991  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717990 gaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 27717891  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  27717890 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttt 27717791  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| | ||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  27717790 taaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttga 27717691  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717690 tgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacactta 27717591  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||    |||||||||  ||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  27717590 ctaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatg 27717491  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27717490 ttccttcaggttacgaaga 27717472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27610707 - 27610093
Alignment:
Q  5 tggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaa 103  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  27610707 tggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaa 27610608  T
Q  104 tcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatt 203  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610607 tcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatt 27610508  T
Q  204 ttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||  |    
T  27610507 ttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaa 27610408  T
Q  304 aatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgat 403  Q
    || |||||||||  |||||||| | ||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  27610407 aacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgat 27610308  T
Q  404 gttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaa 503  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27610307 gttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaa 27610208  T
Q  504 gaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttcc 603  Q
        |||||||||  ||||||  |||  ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  27610207 cctgtcatgggataaaaagtatgcataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttcc 27610108  T
Q  604 ttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||||||||||    
T  27610107 ttcaggttacgaaga 27610093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27604295 - 27603676
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||||||||||| |||   | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27604295 ttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagt 27604196  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604195 gaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 27604096  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  27604095 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttt 27603996  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||| || || | |||||||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||    
T  27603995 taaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcga 27603896  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27603895 tgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacactta 27603796  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||  | |||||  || ||||| |   || || |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  27603795 ctaaccagtcatgatatagaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaag 27603696  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    | ||||||| ||| ||||||    
T  27603695 taccttcagtttatgaagac 27603676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 525
Target Start/End: Original strand, 28781703 - 28782217
Alignment:
Q  12 atagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttc 110  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28781703 atagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttc 28781802  T
Q  111 ttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgc 210  Q
    ||| |||||||| |||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  28781803 ttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgc 28781902  T
Q  211 tgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatactt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||  ||||    
T  28781903 tgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcactt 28782002  T
Q  311 caactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacg 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28782003 caactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacg 28782102  T
Q  411 atatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattca 510  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28782103 atatggagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtca 28782202  T
Q  511 tgggattgaaagtac 525  Q
    |||||| ||||||||    
T  28782203 tgggatagaaagtac 28782217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 27679541 - 27680160
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27679541 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27679640  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||| |||    
T  27679641 gaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctat 27679740  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||    
T  27679741 aattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttt 27679840  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |       || |||||||| |||    |||||| || ||| ||||    |||||||||||  ||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27679841 taaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcga 27679940  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27679941 tgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagactta 27680040  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  27680041 ctaagcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaag 27680140  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27680141 ttccttcaggttacgaagac 27680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27427203 - 27426591
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27427203 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27427104  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27427103 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 27427004  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||  ||||||||    
T  27427003 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctccttt 27426904  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
       | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||| || || ||| |  | |  |||||||||||| |   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27426903 caaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcga 27426804  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27426803 tgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacactta 27426704  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    |||     ||||| ||| ||||  ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27426703 ctagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaag 27426604  T
Q  600 ttccttcaggtta 612  Q
    |||||||| ||||    
T  27426603 ttccttcaagtta 27426591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 31285150 - 31285769
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||    
T  31285150 ttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagt 31285249  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||  ||||||||| | | | || || | ||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31285250 gaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 31285349  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||    
T  31285350 aattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttt 31285449  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| | ||  | || |||||||| |||    |||||| || ||| |||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31285450 tgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcga 31285549  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285550 tgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 31285649  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31285650 ctaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaag 31285749  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31285750 ttccttcaggttacgaagac 31285769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 619
Target Start/End: Original strand, 26803039 - 26803656
Alignment:
Q  3 attggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagtta 101  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  26803039 attggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtga 26803138  T
Q  102 aatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataa 201  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  26803139 aatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataa 26803238  T
Q  202 ttttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttttt 301  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||| ||| |     
T  26803239 ttttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttcta 26803338  T
Q  302 gaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatg 401  Q
     ||| |  |  | ||||||| ||| |||    |||| | || ||  |||| |  ||||||||||| ||   | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26803339 aaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatg 26803438  T
Q  402 atgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttact 501  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26803439 atgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact 26803538  T
Q  502 aagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagtt 601  Q
     |  | |||||  || ||||| ||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  26803539 gaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagta 26803638  T
Q  602 ccttcaggttacgaagac 619  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  26803639 ccttcaagttatgaagac 26803656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 26623862 - 26624481
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  26623862 ttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagt 26623961  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  26623962 gaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctat 26624061  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||    
T  26624062 aactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttt 26624161  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    || ||| |  |  | || |||||||| | |    |||||| || ||| || | |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26624162 ttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcga 26624261  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||| |||  ||| | ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  26624262 tgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacaccta 26624361  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26624362 ctaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaag 26624461  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26624462 ttccttcaggttatgaagac 26624481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Original strand, 26729839 - 26730458
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  26729839 ttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagt 26729938  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  26729939 gaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctat 26730038  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||    
T  26730039 aactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttt 26730138  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    || ||| |  |  | || |||||||| | |    |||||| || ||| || | |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26730139 ttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcga 26730238  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||| |||  ||| | ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  26730239 tgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacaccta 26730338  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26730339 ctaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaag 26730438  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26730439 ttccttcaggttatgaagac 26730458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27530892 - 27530307
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||  || |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  27530892 ttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgt 27530793  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     |||   | ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530792 gaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 27530693  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| | |||||||||| || || |||  ||||| ||||||||||| |||||||  ||   |||||||    
T  27530692 aatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttt 27530593  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| | ||  | || | |||||| ||||| |||||||  | ||| |||| |  || ||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||    
T  27530592 taaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttga 27530493  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| |  || | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27530492 tgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacactta 27530393  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttt 585  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27530392 ctaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggcttt 27530307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27698177 - 27697582
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||    
T  27698177 ttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagt 27698078  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  27698077 gaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctat 27697978  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| || | ||||||| |  || |||||||  |||||||||| || |||||||  ||  ||||||||    
T  27697977 aatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctccttt 27697878  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    || ||| |  |  |  | |||||||  |||    |||||| || ||| |||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27697877 ttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcga 27697778  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
     ||||||||| |  || | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27697777 cgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacactta 27697678  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgac 595  Q
    |||     ||||||||| ||||  ||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27697677 ctagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgac 27697582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27705995 - 27705549
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27705995 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27705896  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27705895 gaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttat 27705796  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||  ||  ||| |||     
T  27705795 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttc 27705696  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |  |  |  |||||| ||| |||    |||| | || ||  ||||    ||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  27705695 taaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcga 27705596  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttg 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27705595 tgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggctgggggacttg 27705549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337098
Alignment:
Q  52 tacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaat 150  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| | ||||| ||| |    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  151 ttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaa 250  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| ||| || | ||||| | |    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27337436  T
Q  251 gagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttc 350  Q
    |||| |||||||   || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||| | |||||||||| |||||| || ||  ||||   || ||| |||    
T  27337435 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27337336  T
Q  351 ctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattg 450  Q
    | |  || ||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || | || ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  27337335 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27337236  T
Q  451 gttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgag 550  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| || |||||  |||| |  ||| |    
T  27337235 gttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatggg 27337136  T
Q  551 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaa 588  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27337135 aaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaa 27337098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27397838
Alignment:
Q  52 tacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaat 150  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| | ||||| ||| |    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  151 ttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaa 250  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| ||| || | ||||| | |    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27398176  T
Q  251 gagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttc 350  Q
    |||| |||||||   || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||| | |||||||||| |||||| || ||  ||||   || ||| |||    
T  27398175 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27398076  T
Q  351 ctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattg 450  Q
    | |  || ||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || | || ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  27398075 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27397976  T
Q  451 gttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgag 550  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| || |||||  |||| |  ||| |    
T  27397975 gttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatggg 27397876  T
Q  551 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaa 588  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27397875 aaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaa 27397838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 588
Target Start/End: Original strand, 26647119 - 26647658
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  26647119 tttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtagga 26647218  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| ||| || | ||||| |    
T  26647219 ctttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtca 26647318  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||| | || || |||| |||||| | |||  | || | || ||| |    
T  26647319 gagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaat 26647418  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    ||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || | || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  26647419 tccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgat 26647518  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| || |||||  |||| |  |||    
T  26647519 tggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatg 26647618  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaa 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26647619 ggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaa 26647658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 588
Target Start/End: Original strand, 26753087 - 26753626
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  26753087 tttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtagga 26753186  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| ||| || | ||||| |    
T  26753187 ctttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtca 26753286  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||| | || || |||| |||||| | |||  | || | || ||| |    
T  26753287 gagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaat 26753386  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    ||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  || | || ||| | || ||||||||||||||||||    
T  26753387 tccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgat 26753486  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| || |||||  |||| |  |||    
T  26753487 tggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatg 26753586  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaa 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26753587 ggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaa 26753626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 606
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862777
Alignment:
Q  60 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 158  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||  |||||||||   | ||||||| | ||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  159 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttc 258  Q
      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||||| || | || || | ||||| |||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattc 26862429  T
Q  259 agcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaata 358  Q
    | ||   |||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||  ||| | || || |||| |||||| |||||  || ||| || ||| ||||    |||    
T  26862430 aactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttata 26862529  T
Q  359 aaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggcc 458  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  || | || ||| | || || |||||||||||||||||||| || |    
T  26862530 aaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtc 26862629  T
Q  459 atggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagc 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||| || | ||| | ||| |  |||||||||||||    
T  26862630 atggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagc 26862729  T
Q  559 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttc 606  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26862730 ttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttc 26862777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 140 - 618
Target Start/End: Original strand, 26143599 - 26144077
Alignment:
Q  140 atggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttg 239  Q
    ||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||     
T  26143599 atggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttc 26143698  T
Q  240 aaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttag 339  Q
    | ||||| | ||||| ||||  |   |||||| ||||| |||||||| | |  ||||||||   || | || || ||||   |||| |||||  ||||||    
T  26143699 ataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttag 26143798  T
Q  340 cgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctgga 439  Q
     || ||| || | |  || |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | || |||||||||    
T  26143799 tgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctgga 26143898  T
Q  440 ggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaag 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26143899 ggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaag 26143998  T
Q  540 ggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26143999 aattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaga 26144077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 618
Target Start/End: Original strand, 26656605 - 26657171
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| |  ||| ||| |  ||||| |||    
T  26656605 tttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtagga 26656704  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| |    
T  26656705 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtca 26656804  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||||||   ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||   |||   ||  | |||| |||||| |||||  |||||| || ||| |    
T  26656805 gagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaat 26656904  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    ||| |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  26656905 tccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgat 26657004  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    ||| ||||| ||||  ||| || | ||| ||||| |  |||    
T  26657005 tggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatg 26657104  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||| |||||    
T  26657105 ggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaaga 26657171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 618
Target Start/End: Original strand, 26762576 - 26763142
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| |  ||| ||| |  ||||| |||    
T  26762576 tttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtagga 26762675  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| |    
T  26762676 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtca 26762775  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||||||   ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||   |||   ||  | |||| |||||| |||||  |||||| || ||| |    
T  26762776 gagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaat 26762875  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    ||| |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  26762876 tccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgat 26762975  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    ||| ||||| ||||  ||| || | ||| ||||| |  |||    
T  26762976 tggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatg 26763075  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||| |||||    
T  26763076 ggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaaga 26763142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 607
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580920
Alignment:
Q  60 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 158  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  159 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttc 258  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| | ||||| |||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttc 25580571  T
Q  259 agcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaata 358  Q
    |  |   |||||||||||| |||||||  |    ||||||||   |||| || || |  |  ||||| ||| |  |||||| || ||| || | |  ||     
T  25580572 aattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatt 25580671  T
Q  359 aaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggcc 458  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |  || |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25580672 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25580771  T
Q  459 atggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagc 558  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  25580772 atggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagc 25580871  T
Q  559 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttca 607  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25580872 tcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttca 25580920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 618
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25484268
Alignment:
Q  60 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 158  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||| |||||    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  159 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttc 258  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| | ||||| |||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 25483908  T
Q  259 agcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaata 358  Q
    |  |   |||||| ||||| |||||||  ||  ||||||||   ||||| || || |  |   |||| ||| |  |||||| || ||| | || |  |||    
T  25483909 aagtcataataacctgaaacatctccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcata 25484008  T
Q  359 aaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggcc 458  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |  || |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484009 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25484108  T
Q  459 atggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagc 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  25484109 atggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagc 25484208  T
Q  559 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25484209 tcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaga 25484268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 618
Target Start/End: Original strand, 26884710 - 26885276
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||||  ||||||||| | | |||| |  | ||||| || ||||| |||    
T  26884710 tttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtagga 26884809  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||| |  | || || |    
T  26884810 atttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtca 26884909  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
      |||| |||| ||   |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||  ||| | || || | || |||||| |||||  |||||| || ||| |    
T  26884910 gggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaat 26885009  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    |||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  26885010 tccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgat 26885109  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||     ||| || | || || ||| ||  |||||||||| |  |||    
T  26885110 tggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatg 26885209  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  26885210 ggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaa---gacaaagttcctttaggttatgaaga 26885276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 60 - 618
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26077101
Alignment:
Q  60 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  159 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttc 258  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| | ||||| |||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26076741  T
Q  259 agcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaata 358  Q
    | ||   || ||||||||| |||||||| ||  ||||||||   ||||| || || |  |   | |||||| |  |||||| || ||| | || |  |||    
T  26076742 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattata 26076841  T
Q  359 aaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggcc 458  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |  || |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26076842 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26076941  T
Q  459 atggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagc 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076942 ttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagc 26077041  T
Q  559 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
    ||||||||| |||||  | |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26077042 tcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaga 26077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 618
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26057131
Alignment:
Q  60 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  159 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttc 258  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| | ||||| |||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26056771  T
Q  259 agcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaata 358  Q
    | ||   || ||||||||| |||||||| ||  ||||||||   ||||| || || |  |   | || ||| |  |||||| || ||| | || |  |||    
T  26056772 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattata 26056871  T
Q  359 aaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggcc 458  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |  || |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26056872 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26056971  T
Q  459 atggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagc 558  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056972 ttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagc 26057071  T
Q  559 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
    ||||||||| |||||  | |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26057072 tcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaga 26057131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492303
Alignment:
Q  51 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| | ||||||  ||| | |||| ||||| |||     
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  150 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaa 249  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||| | | | ||||||     
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgag 25492661  T
Q  250 agagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggactt 349  Q
    ||||| |||| || |||  ||||||||| |||||||| |    |||||||   ||||  ||  | |  | |||||| || |||||||||| || ||| ||    
T  25492660 agagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaatt 25492561  T
Q  350 cctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgatt 449  Q
     | |  |||||  || | |||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    || |||| ||| | |  ||||||| |||||||||||    
T  25492560 gcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttggctgaaggacttgatt 25492461  T
Q  450 ggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatga 549  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||| |||     
T  25492460 ggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcagtagaagagttgcatgg 25492361  T
Q  550 gacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttca 607  Q
    |  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25492360 ggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttca 25492303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 592
Target Start/End: Original strand, 26824459 - 26825002
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  26824459 tttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtagga 26824558  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||   |  |||||| |||| || ||||    
T  26824559 ctttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtga 26824658  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||||||    ||  |||| ||||||||||  ||   ||||||||  ||| | ||  |    |||||||| ||||| |||||||  ||||  |    
T  26824659 gagagaattcagctaagcatggcttggaaaatctccaagagcaactccttttaaaaacaattggagaagaaattaagttaggaggtgttagtcaaggtat 26824758  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    ||  |  ||||| || || ||||   |||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| |  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26824759 tcaaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgat 26824858  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||| |||   |   ||  ||||||||||||| |||    
T  26824859 tggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgagatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatg 26824958  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaat 592  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26824959 ggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaat 26825002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 618
Target Start/End: Original strand, 25511645 - 25512100
Alignment:
Q  162 gaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || | ||||| | ||||| |||| |    
T  25511645 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaac 25511744  T
Q  262 ttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaag 361  Q
    |   || ||||||||| |||||||| ||  ||||||||   ||||| || || |  |   | |||||| |  |||||| || ||| | || |  ||||||    
T  25511745 tcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaag 25511844  T
Q  362 gaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatg 461  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |  || |||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25511845 gaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctg 25511944  T
Q  462 gaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctct 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25511945 gaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcat-ggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagatagaagctct 25512043  T
Q  562 tgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |   ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25512044 tattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaaga 25512100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 606
Target Start/End: Original strand, 25539274 - 25539740
Alignment:
Q  140 atggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttg 239  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     ||||||| ||     
T  25539274 atggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttc 25539373  T
Q  240 aaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttag 339  Q
    | ||||| | ||||| ||||  |   |||||||||||| |||||||  ||  ||||||||   ||||| || || |  |   |||| ||| |  ||||||    
T  25539374 ataatgtcagagagaattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttag 25539473  T
Q  340 cgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctgga 439  Q
     || ||| |  | |  ||||||||||| |||  |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |  |||| ||| | || |||||||||    
T  25539474 tgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctgga 25539573  T
Q  440 ggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaag 539  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||     ||||||||||  ||||||||||  |||| |||    
T  25539574 ggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaagtacacatgtagtaaaag 25539673  T
Q  540 ggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25539674 ggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttc 25539740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27705401 - 27705226
Alignment:
Q  444 ttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggtt 543  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||     |||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27705401 ttgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggtt 27705302  T
Q  544 gaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaagac 619  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  27705301 gaatgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagac 27705226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 277
Target Start/End: Original strand, 27215092 - 27215320
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgcat-ctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||  ||||||||  | |||||| |  | | |||||| ||||| |||    
T  27215092 tttacatgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtagga 27215191  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     || ||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||| ||||||    
T  27215192 cttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtga 27215291  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaa 277  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27215292 aagagaattcaactttaaataacttgaaa 27215320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 356 - 522
Target Start/End: Original strand, 28326425 - 28326591
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  28326425 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcg 28326524  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaag 522  Q
    | | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||    
T  28326525 gtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaacatttgctaaaaagtcacgggattgaaag 28326591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 356 - 522
Target Start/End: Original strand, 28504061 - 28504227
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  28504061 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcg 28504160  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaag 522  Q
    | | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||    
T  28504161 gtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaacatttgctaaaaagtcacgggattgaaag 28504227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 355 - 578
Target Start/End: Original strand, 28243741 - 28243964
Alignment:
Q  355 aataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttc 454  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| | || |  || |||||||||||||||||||||    
T  28243741 aataaagaaaaggcttcaccgaaacaaggttctgctaattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttc 28243840  T
Q  455 ggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacag 554  Q
    || | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||  || ||  | ||     ||| |||||||| |    
T  28243841 ggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagacagacatttgctaaaaagtcatgggattgaaagagcatatgaattacctaagttaaatgagaccg 28243940  T
Q  555 aagctcttgaattgttgaggtgga 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28243941 aagctcttgaattgttgaggtgga 28243964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 577
Target Start/End: Original strand, 28182067 - 28182286
Alignment:
Q  358 aaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggc 457  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||  |||||||| | || |  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  28182067 aaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggt 28182166  T
Q  458 catggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaag 557  Q
    | ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||  || ||  | ||||   ||| ||||||| |||||    
T  28182167 cctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagtaggtcatgggattgaaagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaag 28182266  T
Q  558 ctcttgaattgttgaggtgg 577  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28182267 ctcttgaattgttgaggtgg 28182286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 262
Target Start/End: Original strand, 28140275 - 28140388
Alignment:
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| || | |||||||    
T  28140275 atttatgggatgggagggtcgggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtga 28140374  T
Q  249 aagagagttcagct 262  Q
     ||| | |||||||    
T  28140375 gagaaatttcagct 28140388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 585
Target Start/End: Original strand, 28235512 - 28235741
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||| | || |  ||||| |||| | |||||||||| |    
T  28235512 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttg 28235611  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacaga 555  Q
    | | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||| ||  |   | ||||   ||| |||||||  ||    
T  28235612 gtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacga 28235711  T
Q  556 agctcttgaattgttgaggtggatggcttt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28235712 agctcttgaattgttgaggtggaaggcttt 28235741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 376 - 503
Target Start/End: Original strand, 27215419 - 27215546
Alignment:
Q  376 aaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||    
T  27215419 aaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatc 27215518  T
Q  476 attaccactcgagacaaacacttactaa 503  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  27215519 attacgactcgaaacagacagttactaa 27215546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 578
Target Start/End: Original strand, 28227974 - 28228121
Alignment:
Q  431 ttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  || |||||||||||||||  || ||     
T  28227974 ttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagagcatatg 28228073  T
Q  531 cagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtgga 578  Q
     | ||||   ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28228074 aaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgaggtgga 28228121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Original strand, 28240359 - 28240439
Alignment:
Q  414 tgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 494  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28240359 tgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 28240439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29843444 - 29843353
Alignment:
Q  134 gtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29843444 gtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatg 29843353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937843
Alignment:
Q  170 ggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 223  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaa 26937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 517
Target Start/End: Original strand, 29827009 - 29827094
Alignment:
Q  432 tggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggatt 517  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||    
T  29827009 tggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactcgagaccaacatttgctaacaagtcatgggatt 29827094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 590
Target Start/End: Original strand, 26938078 - 26938210
Alignment:
Q  458 catggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaag 557  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || |||  |  ||||||||||||||| | | ||  |||||| || || || |||  |||||    
T  26938078 catggaagcaaagtcattgttaccactcgagacaaacatttgctatcatgtcatgggattgaaagaatatatgtagtagatggcttaaaggaggaagaag 26938177  T
Q  558 ctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 590  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  26938178 ctcttgaactatttaggtggatggctttcaaaa 26938210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27664348 - 27664305
Alignment:
Q  448 ttggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 491  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664348 ttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 27664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 495
Target Start/End: Original strand, 26976000 - 26976037
Alignment:
Q  458 catggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 495  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976000 catggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 29826711 - 29826804
Alignment:
Q  134 gtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgct 227  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  29826711 gtccagatggtggggatttatggaattggcggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgct 29826804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Original strand, 27215596 - 27215660
Alignment:
Q  553 agaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaag 617  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  27215596 agaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaag 27215660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097809
Alignment:
Q  177 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatg 28097809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 601
Target Start/End: Original strand, 28186530 - 28186586
Alignment:
Q  545 aatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagtt 601  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||    
T  28186530 aatgagaaagaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagtt 28186586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 495
Target Start/End: Original strand, 25074922 - 25074953
Alignment:
Q  464 agcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074922 agcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 25074953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 493
Target Start/End: Original strand, 26849761 - 26849796
Alignment:
Q  458 catggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849761 catggtagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 495
Target Start/End: Original strand, 31289320 - 31289355
Alignment:
Q  460 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289320 tggaagcagagtcatcattaccacttgagacaaaca 31289355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 26849471 - 26849528
Alignment:
Q  168 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26849471 tgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatg 26849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 26975710 - 26975767
Alignment:
Q  168 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26975710 tgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatg 26975767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28296975 - 28296846
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| || | || ||||| ||||||||| | ||  |||||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  28296975 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagcaattgcaagttttggctggacgacttgattggtttg 28296876  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactc 485  Q
    | | |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28296875 gtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28296846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 485
Target Start/End: Original strand, 28515098 - 28515227
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| || | || ||||| ||||||||| | ||  |||||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  28515098 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagcaattgcaagttttggctggacgacttgattggtttg 28515197  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactc 485  Q
    | | |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28515198 gtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Original strand, 25074647 - 25074683
Alignment:
Q  189 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25074647 aagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatg 25074683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 3130 - 2512
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  3130 ttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagt 3031  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3030 gaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 2931  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||  || ||||||||    
T  2930 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttt 2831  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| | ||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  2830 taaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttga 2731  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2730 tgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacactta 2631  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||    |||||||||  ||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  2630 ctaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatg 2531  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2530 ttccttcaggttacgaaga 2512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 619
Target Start/End: Original strand, 8089 - 8697
Alignment:
Q  12 atagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttc 110  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  8089 atagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttc 8188  T
Q  111 ttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8189 ttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttc 8288  T
Q  211 tgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatactt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||  ||| ||||    
T  8289 tgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactt 8388  T
Q  311 caactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacg 410  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8389 caacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacg 8488  T
Q  411 atatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8489 atatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtca 8588  T
Q  511 tgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggt 610  Q
    ||||||  ||||||| |||  |||  ||||| || |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||    
T  8589 tgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagt 8688  T
Q  611 tacgaagac 619  Q
    || ||||||    
T  8689 tatgaagac 8697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13255 - 12647
Alignment:
Q  12 atagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttc 110  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13255 atagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttc 13156  T
Q  111 ttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13155 ttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttc 13056  T
Q  211 tgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatactt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||  ||| ||||    
T  13055 tgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactt 12956  T
Q  311 caactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacg 410  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12955 caacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacg 12856  T
Q  411 atatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattca 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12855 atatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtca 12756  T
Q  511 tgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggt 610  Q
    ||||||  ||||||| |||  |||  ||||| || |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||    
T  12755 tgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagt 12656  T
Q  611 tacgaagac 619  Q
    || ||||||    
T  12655 tatgaagac 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4303 - 3684
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| ||||||||||   || ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  4303 ttattggagagatagtcaagaacatctccaacaagatcagtcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgt 4204  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4203 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttat 4104  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  4103 aattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttt 4004  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||| || || | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  4003 taaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcga 3904  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3903 tgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttg 3804  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||  |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||    
T  3803 ctaagaagtcatgggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaag 3704  T
Q  600 ttccttcaggttacgaagac 619  Q
    | |||||| |||| ||||||    
T  3703 taccttcaagttatgaagac 3684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18698987 - 18698369
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| | |||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18698987 ttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 18698888  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| | ||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18698887 gaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttat 18698788  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  18698787 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttt 18698688  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18698687 taaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcga 18698588  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18698587 tgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacactta 18698488  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||  | ||||| ||| |||| ||  |||  |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18698487 ctaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaag 18698388  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  18698387 ttccttcaagttatgaaga 18698369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18679147 - 18678529
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18679147 ttattggagagatagtcaaatacgtctctaacaagatcagtcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 18679048  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18679047 gaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttat 18678948  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  18678947 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttt 18678848  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18678847 taaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcga 18678748  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||||||  || || || | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18678747 tgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacactta 18678648  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | ||||| ||| |||| ||  |||  |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  18678647 ctaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaag 18678548  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  18678547 ttccttcaagttatgaaga 18678529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Original strand, 18074352 - 18074964
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18074352 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 18074451  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18074452 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 18074551  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||  ||||||||    
T  18074552 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctccttt 18074651  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
       | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||| || || ||| |  | |  |||||||||||| |   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  18074652 caaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcga 18074751  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18074752 tgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacactta 18074851  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    |||     ||||| ||| ||||  ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18074852 ctagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaag 18074951  T
Q  600 ttccttcaggtta 612  Q
    |||||||| ||||    
T  18074952 ttccttcaagtta 18074964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18731091 - 18730473
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18731091 ttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 18730992  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| ||||  ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18730991 gaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttat 18730892  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  18730891 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttt 18730792  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18730791 taaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcga 18730692  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18730691 tgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacactta 18730592  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||  | ||||| ||| |||| ||  |||  |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18730591 ctaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaag 18730492  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  18730491 ttccttcaagttatgaaga 18730473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18655064 - 18654446
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18655064 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 18654965  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||  ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18654964 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaat 18654865  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  18654864 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttt 18654765  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18654764 taaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcga 18654665  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||| ||| || || | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18654664 tgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacactta 18654565  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||| | ||||| ||| |||| ||  |||  |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  18654564 ctaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaag 18654465  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  18654464 ttccttcaagttatgaaga 18654446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18723672 - 18723054
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||    |   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18723672 ttattggaaagatagtcaaatatgtcaacaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 18723573  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| ||||  ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18723572 gaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttat 18723473  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  18723472 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttt 18723373  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| ||||  ||||||||||||  ||||| ||||||| ||  || ||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18723372 taaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcga 18723273  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18723272 tgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaatta 18723173  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||  | ||||| | | |||| ||  |||  |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  18723172 ctaaccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaag 18723073  T
Q  600 ttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  18723072 ttccttcaagttatgaaga 18723054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 356 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5090185 - 5089949
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |  |||| |||||||| |  ||||| |||| || ||||||||| |    
T  5090185 ataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttg 5090086  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacaga 555  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  ||| |   |||||| || || |||||||  ||    
T  5090085 gtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatacgaagtagatggtttaaatgagaacga 5089986  T
Q  556 agctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaat 592  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  5089985 agctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaat 5089949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688595
Alignment:
Q  557 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||| |||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaaga 18688595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5090376 - 5090319
Alignment:
Q  168 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5090376 tgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatg 5090319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 612
Target Start/End: Original strand, 60160 - 60772
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60160 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 60259  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  60260 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 60359  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| | || | ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||  ||||||||    
T  60360 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctccttt 60459  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
       | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||| || || ||| |  | |  |||||||||||| |   | |||||||||||||||| ||||||||    
T  60460 caaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcga 60559  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  60560 tgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacactta 60659  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    |||     ||||| ||| ||||  ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  60660 ctagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaag 60759  T
Q  600 ttccttcaggtta 612  Q
    |||||||| ||||    
T  60760 ttccttcaagtta 60772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 267931 - 267337
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||    
T  267931 ttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagt 267832  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  267831 gaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctat 267732  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |  |||||| ||| | |||||||  || |||||||||| |||||||  ||  ||||||||    
T  267731 aattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttt 267632  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |  |  | || |||||||| |||    |||||| || ||  |||| |  || ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  267631 taaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcga 267532  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||    
T  267531 tgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaatta 267432  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatga 594  Q
    ||||    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  267431 ctaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatga 267337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28163917 - 28163349
Alignment:
Q  50 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 148  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| |||| ||| |||||| ||||| |||    
T  28163917 tttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28163818  T
Q  149 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 248  Q
     |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||    
T  28163817 ctttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28163718  T
Q  249 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggact 348  Q
     ||||| |||| || ||   ||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||| | ||  |  | | |||||| ||||| ||||||| || ||| |    
T  28163717 gagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctc-tttttgaaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28163619  T
Q  349 tcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgat 448  Q
    | | |  |||||  ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| |  || |||| ||  | || |||||||||||||| |||    
T  28163618 tacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgat 28163519  T
Q  449 tggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatg 548  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||| |||    
T  28163518 tggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatg 28163419  T
Q  549 agacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggttacgaaga 618  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  28163418 ggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaaga 28163349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28127216 - 28126654
Alignment:
Q  51 ttacatgttgccaattaccctgttggattgcatctcga-gtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 149  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||   | | ||||||||||| || |  ||||| ||| | |||| |||| ||| |||||| ||||| |||     
T  28127216 ttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28127117  T
Q  150 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaa 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||     
T  28127116 tttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgag 28127017  T
Q  250 agagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctcctttttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggactt 349  Q
    ||||| |||| || || |||| |||||| |||||||  |   |||||||||  ||| | ||  | || | |||||| ||||| ||||||| || ||| ||    
T  28127016 agagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaatt 28126917  T
Q  350 cctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgatt 449  Q
     | |  |||||  ||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  || |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  28126916 gcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgatt 28126817  T
Q  450 ggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatga 549  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||| |||     
T  28126816 ggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgcggtaaaagggttgtatgt 28126717  T
Q  550 gacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaagttccttcaggtta 612  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  28126716 aacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagtta 28126654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 554 - 590
Target Start/End: Original strand, 26137033 - 26137069
Alignment:
Q  554 gaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 590  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26137033 gaagctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaa 26137069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 29273429 - 29272822
Alignment:
Q  1 ttattggaaagatagtcaaatgcacctcaaacaagattagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagt 99  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||| || ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  29273429 ttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagt 29273330  T
Q  100 taaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 199  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  29273329 caaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctat 29273230  T
Q  200 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggcgctccttt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||   | ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||   |||||||    
T  29273229 aatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttt 29273130  T
Q  300 ttgaaatacttcaactgaaaattaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcga 399  Q
    |  ||| |  |  | || |||||||| |||    |||||| || ||  |||| |  |||||||| ||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  29273129 taaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcga 29273030  T
Q  400 tgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacactta 499  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29273029 tgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttg 29272930  T
Q  500 ctaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacgaag 599  Q
    ||||    |||||||||  ||||||  |||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  29272929 ctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaag 29272830  T
Q  600 ttccttca 607  Q
    | ||||||    
T  29272829 taccttca 29272822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 16440691 - 16440753
Alignment:
Q  48 cctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcactt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||||    
T  16440691 cctttacatgttgctaattaccctgttggattggagtctcgagtgcaccaagtaaactcactt 16440753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 493
Target Start/End: Original strand, 12589639 - 12589756
Alignment:
Q  376 aaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatc 475  Q
    ||||||| |||||||  |||| || ||||||||| || || ||||| || | ||| | |||||| ||  || |||||| || || || ||||||||||||    
T  12589639 aaagaaggttcttttgcttctagacgatgttgacaatttggagcaattagaggccgttgctggaagatctgtttggtttggacaaggcagcagagtcatc 12589738  T
Q  476 attaccactcgagacaaa 493  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12589739 attacgactcgagacaaa 12589756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 356 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 57529 - 57293
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| || | || ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |    
T  57529 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagcaattacaggttttggctggaggacttgattggtttg 57430  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacaga 555  Q
    | | ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||  || ||  | ||||   ||| ||||||| |||    
T  57429 gtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagcaggtcatgggattgaaagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaaga 57330  T
Q  556 agctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaat 592  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  57329 agctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaaaaat 57293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 355 - 578
Target Start/End: Original strand, 43903 - 44126
Alignment:
Q  355 aataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttc 454  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| | || |  || |||||||||||||||||||||    
T  43903 aataaagaaaaggcttcaccgaaacaaggttctgctaattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttc 44002  T
Q  455 ggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacag 554  Q
    || | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||  || ||  | ||     ||| |||||||| |    
T  44003 ggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagacagacatttgctaaaaagtcatgggattgaaagagcatatgaattacctaagttaaatgagaccg 44102  T
Q  555 aagctcttgaattgttgaggtgga 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44103 aagctcttgaattgttgaggtgga 44126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 585
Target Start/End: Original strand, 35674 - 35903
Alignment:
Q  356 ataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcg 455  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||  | |||||| | || |  ||||| |||| | |||||||||| |    
T  35674 ataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttg 35773  T
Q  456 gccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacaga 555  Q
    | | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||| ||  |   | ||||   ||| |||||||  ||    
T  35774 gtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacga 35873  T
Q  556 agctcttgaattgttgaggtggatggcttt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35874 agctcttgaattgttgaggtggaaggcttt 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 578
Target Start/End: Original strand, 28472 - 28619
Alignment:
Q  431 ttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  || |||||||||||||||  || ||     
T  28472 ttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagagcatatg 28571  T
Q  531 cagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtgga 578  Q
     | ||||   ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28572 aaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgaggtgga 28619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 494
Target Start/End: Original strand, 40521 - 40601
Alignment:
Q  414 tgaagcaactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 494  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40521 tgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcgagacaaac 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 519
Target Start/End: Original strand, 16691778 - 16691977
Alignment:
Q  320 attaagataggaagtgttagcgaaggacttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttaattctcgatgatgttgacgatatgaagc 419  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||| |||| | ||||||  ||||||||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||    
T  16691778 attaagttaggacatgttagtgaaggaattccaataataaaacaaaggctacaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagc 16691877  T
Q  420 aactacatgccttggctggaggacttgattggttcggccatggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattga 519  Q
    || | || |   ||| |||||  |  |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16691878 aattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacaagtcatggtattga 16691977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Original strand, 16691587 - 16691683
Alignment:
Q  129 atggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||||||  |||||||||| ||  |||| || |||||  | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16691587 atggggtatatatggttgggatccatggaattggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatg 16691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17992342 - 17992217
Alignment:
Q  464 agcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaattcatgggattgaaagtacacatccagtagaagggttgaatgagacagaagctcttg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |  |||||||||| |||  | | ||  |||||| || || ||||||  |||||||||||    
T  17992342 agcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggattaaaacaatatatgaagtagatggattaaatgaggaagaagctcttg 17992243  T
Q  564 aattgttgaggtggatggcttttaaa 589  Q
    || |||| ||||||| ||| ||||||    
T  17992242 aactgttaaggtggaaggcatttaaa 17992217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 3280418 - 3280475
Alignment:
Q  168 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 225  Q
    |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3280418 tgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatg 3280475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University