View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20577_low_10 (Length: 277)

Name: NF20577_low_10
Description: NF20577
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20577_low_10
NF20577_low_10
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-254)||(10047094-10047349)
chr4 (95-254)||(25862149-25862309)
chr4 (96-254)||(54866993-54867154)
chr4 (96-254)||(3796647-3796808)
chr4 (97-254)||(39245805-39245964)
chr4 (96-254)||(24333621-24333779)
chr4 (96-213)||(6743589-6743706)
chr4 (96-254)||(42599701-42599863)
chr4 (112-254)||(5147504-5147647)
chr4 (96-251)||(5269321-5269481)
chr4 (112-246)||(16624144-16624279)
chr4 (112-246)||(38152573-38152710)
chr4 (112-254)||(5143086-5143229)
chr4 (112-244)||(16630817-16630950)
chr4 (130-206)||(5396849-5396926)
chr4 (99-215)||(1983464-1983581)
chr4 (112-206)||(8689658-8689748)
chr4 (96-198)||(28468710-28468813)
chr4 (96-198)||(31985816-31985919)
chr4 (152-246)||(3777417-3777512)
chr4 (96-251)||(34495952-34496108)
chr4 (127-198)||(36315394-36315467)
chr4 (127-198)||(36329603-36329676)
chr4 (96-166)||(5112052-5112121)
chr4 (116-200)||(29760470-29760556)
chr4 (130-247)||(18377216-18377335)
chr4 (112-145)||(5397069-5397102)
chr4 (116-198)||(24741769-24741852)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (94-254)||(9765947-9766108)
chr8 (98-254)||(26403357-26403515)
chr8 (109-254)||(5702610-5702756)
chr8 (96-254)||(6127029-6127190)
chr8 (112-254)||(19752521-19752665)
chr8 (103-254)||(4696723-4696882)
chr8 (112-246)||(19175890-19176027)
chr8 (96-254)||(23799704-23799863)
chr8 (112-198)||(4455855-4455941)
chr8 (96-220)||(5990722-5990843)
chr8 (99-254)||(9054964-9055117)
chr8 (114-187)||(7412166-7412239)
chr8 (96-198)||(26287713-26287816)
chr8 (96-198)||(26312964-26313067)
chr8 (96-198)||(31071412-31071516)
chr8 (96-254)||(6813489-6813652)
chr8 (116-198)||(1262135-1262217)
chr8 (96-151)||(28307368-28307422)
chr8 (96-198)||(26300958-26301061)
chr8 (116-198)||(36979205-36979289)
chr8 (96-166)||(7493284-7493352)
chr8 (116-198)||(30655469-30655552)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (96-254)||(47098951-47099111)
chr1 (96-254)||(775483-775642)
chr1 (96-254)||(47102968-47103127)
chr1 (96-254)||(40816859-40817020)
chr1 (98-254)||(27104499-27104653)
chr1 (96-254)||(19072737-19072897)
chr1 (96-254)||(19120627-19120787)
chr1 (112-254)||(47704063-47704208)
chr1 (96-254)||(13598206-13598368)
chr1 (96-254)||(29651620-29651781)
chr1 (100-254)||(16124644-16124799)
chr1 (112-254)||(32889266-32889408)
chr1 (96-254)||(9476073-9476231)
chr1 (96-254)||(9023959-9024116)
chr1 (113-246)||(26645033-26645166)
chr1 (112-198)||(21536753-21536839)
chr1 (114-190)||(37069597-37069673)
chr1 (112-198)||(3281537-3281621)
chr1 (96-203)||(13604800-13604909)
chr1 (96-253)||(50521231-50521389)
chr1 (130-198)||(19359029-19359098)
chr1 (130-196)||(22819270-22819336)
chr1 (116-208)||(24202940-24203033)
chr1 (130-198)||(19361619-19361688)
chr1 (130-198)||(19380259-19380328)
chr1 (96-140)||(47704222-47704266)
chr1 (96-166)||(17345735-17345805)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (96-254)||(2580199-2580357)
chr7 (96-254)||(29159613-29159773)
chr7 (96-254)||(9235682-9235843)
chr7 (96-254)||(20283900-20284059)
chr7 (99-254)||(4796794-4796953)
chr7 (96-251)||(23403143-23403299)
chr7 (96-254)||(9185290-9185449)
chr7 (96-254)||(46516437-46516597)
chr7 (96-246)||(49091472-49091624)
chr7 (96-254)||(9190135-9190294)
chr7 (98-254)||(33332577-33332734)
chr7 (112-254)||(35960641-35960786)
chr7 (130-254)||(2647823-2647949)
chr7 (112-254)||(21983109-21983253)
chr7 (112-254)||(21988733-21988877)
chr7 (114-206)||(2479168-2479261)
chr7 (110-198)||(55764-55852)
chr7 (96-196)||(3047063-3047162)
chr7 (114-198)||(47263509-47263593)
chr7 (96-147)||(2647962-2648013)
chr7 (114-198)||(44848869-44848953)
chr7 (96-198)||(18408576-18408679)
chr7 (96-198)||(18413453-18413556)
chr7 (96-166)||(28617444-28617512)
chr7 (130-198)||(21639654-21639723)
chr7 (130-198)||(21645852-21645921)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (96-254)||(19588557-19588716)
chr5 (90-254)||(42127537-42127701)
chr5 (96-254)||(11181959-11182120)
chr5 (96-254)||(28832071-28832229)
chr5 (96-254)||(3880113-3880270)
chr5 (98-254)||(17004087-17004244)
chr5 (112-246)||(14520056-14520191)
chr5 (140-254)||(24553633-24553748)
chr5 (92-254)||(31300723-31300886)
chr5 (96-254)||(15464343-15464501)
chr5 (96-164)||(42126625-42126693)
chr5 (96-198)||(36932533-36932635)
chr5 (114-206)||(9353505-9353599)
chr5 (112-254)||(11917099-11917245)
chr5 (96-150)||(10281673-10281727)
chr5 (130-198)||(38192017-38192086)
chr5 (130-198)||(38219242-38219311)
chr5 (96-150)||(6741665-6741718)
chr5 (130-198)||(35387508-35387577)
chr5 (96-140)||(24555833-24555877)
chr5 (96-140)||(24596864-24596908)
chr5 (95-206)||(24135658-24135771)
chr5 (112-149)||(213790-213827)
chr5 (182-246)||(12084311-12084376)
chr5 (96-196)||(28537430-28537530)
chr5 (94-196)||(33031132-33031233)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (96-254)||(10077292-10077451)
chr6 (96-254)||(31979324-31979483)
chr6 (93-238)||(5572739-5572885)
chr6 (96-254)||(18232655-18232815)
chr6 (96-254)||(21801476-21801634)
chr6 (112-254)||(31936414-31936557)
chr6 (89-221)||(31086622-31086756)
chr6 (112-246)||(5017603-5017742)
chr6 (89-254)||(24436097-24436259)
chr6 (136-254)||(22963550-22963670)
chr6 (136-254)||(23824723-23824843)
chr6 (96-254)||(4629772-4629923)
chr6 (114-244)||(5757615-5757744)
chr6 (114-206)||(21355867-21355960)
chr6 (130-254)||(22708863-22708988)
chr6 (130-198)||(26258183-26258252)
chr6 (128-166)||(27165545-27165583)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (93-254)||(8039867-8040030)
chr2 (96-254)||(10445571-10445732)
chr2 (96-254)||(20522031-20522190)
chr2 (96-254)||(33528748-33528907)
chr2 (96-221)||(21629762-21629886)
chr2 (91-254)||(17865009-17865173)
chr2 (127-254)||(31055884-31056012)
chr2 (95-243)||(34682472-34682622)
chr2 (96-254)||(39482746-39482901)
chr2 (96-254)||(16940336-16940496)
chr2 (96-254)||(17011001-17011161)
chr2 (96-248)||(14699127-14699285)
chr2 (112-246)||(36757898-36758031)
chr2 (123-254)||(33117974-33118106)
chr2 (112-246)||(23078606-23078742)
chr2 (89-246)||(13569130-13569291)
chr2 (112-246)||(42039805-42039939)
chr2 (112-246)||(34388686-34388821)
chr2 (96-246)||(8390284-8390441)
chr2 (112-196)||(10707439-10707523)
chr2 (114-198)||(28259361-28259445)
chr2 (101-215)||(40014744-40014858)
chr2 (96-198)||(3491563-3491666)
chr2 (130-198)||(25398339-25398408)
chr2 (130-198)||(25403477-25403546)
chr2 (96-248)||(35397325-35397475)
chr2 (95-150)||(32178403-32178459)
chr2 (96-196)||(27149052-27149150)
chr2 (116-198)||(11099112-11099196)
chr2 (133-196)||(40738688-40738752)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (96-254)||(6794830-6794988)
chr3 (96-254)||(40844464-40844622)
chr3 (96-254)||(48438025-48438184)
chr3 (109-254)||(1417607-1417752)
chr3 (95-251)||(1417075-1417232)
chr3 (96-254)||(40592900-40593063)
chr3 (96-254)||(26298792-26298958)
chr3 (96-254)||(3716119-3716279)
chr3 (96-254)||(24695281-24695439)
chr3 (112-246)||(30709916-30710051)
chr3 (112-238)||(36028932-36029059)
chr3 (112-246)||(27026772-27026907)
chr3 (96-233)||(47924010-47924146)
chr3 (96-246)||(27038100-27038252)
chr3 (96-198)||(47649551-47649654)
chr3 (96-254)||(8126512-8126671)
chr3 (112-246)||(8370612-8370747)
chr3 (94-246)||(39040118-39040271)
chr3 (96-183)||(3323752-3323839)
chr3 (96-254)||(37466102-37466261)
chr3 (96-194)||(18554465-18554563)
chr3 (110-246)||(16264174-16264311)
chr3 (123-210)||(21711064-21711149)
chr3 (96-254)||(33386784-33386942)
chr3 (112-243)||(35925309-35925441)
chr3 (170-254)||(3328473-3328558)
chr3 (94-254)||(27986563-27986722)
chr3 (130-207)||(27975114-27975191)
chr3 (96-206)||(32143133-32143245)
chr3 (96-198)||(1305761-1305864)
chr3 (95-160)||(25929635-25929700)
chr3 (96-196)||(27452770-27452870)
chr3 (98-198)||(1309668-1309769)
chr3 (185-254)||(25929559-25929628)
chr3 (95-166)||(4387239-4387308)
chr3 (195-254)||(18553000-18553059)
chr3 (96-136)||(3328561-3328601)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (96-254)||(17077-17233)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (93-254)||(10535-10699)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (96-254)||(5491-5653)
scaffold0006 (110-254)||(2317-2462)
scaffold0006 (96-203)||(133457-133566)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (112-246)||(85512-85646)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (114-244)||(44098-44227)
scaffold0087 (112-206)||(37007-37102)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (112-206)||(1234-1330)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (130-198)||(45100-45168)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (132-254)||(8547-8670)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (130-198)||(18135-18204)
scaffold0188 (130-198)||(24228-24297)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (96-196)||(29676-29777)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (96-196)||(43067-43168)
scaffold0078 (112-201)||(23357-23446)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 10047094 - 10047349
Alignment:
Q  1 caattttagattttcttttaattattctcaccaaattaaataaataatggatagttcttttctaagttaattactctgaccaacccacttgg-ttgtgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10047094 caattttagattttcttttaattattctcaccaaattaaataaataatggatagttcttttctaagttaattactctgaccaacccacttggattgtgtt 10047193  T
Q  100 gtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaa 198  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10047194 gtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaataacaacaaaaa 10047293  T
Q  199 cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10047294 tagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 10047349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25862309 - 25862149
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25862309 gtgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 25862210  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25862209 aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 25862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 54866993 - 54867154
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54866993 tgttgtgaattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 54867092  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  54867093 aaaaaacagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagat 54867154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3796808 - 3796647
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3796808 tgttgtgaattcatacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 3796709  T
Q  195 aaaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  3796708 aaaaatcagacctaaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagat 3796647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Original strand, 39245805 - 39245964
Alignment:
Q  97 gttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-- 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  39245805 gttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagcgaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaa 39245904  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  39245905 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaataaagat 39245964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 24333621 - 24333779
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24333621 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaac 24333720  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      |||||||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  24333721 aaaaaacagacctagatctaagtgtagag---caacacaagcataatcaaagcaataaagat 24333779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6743706 - 6743589
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6743706 tgttgtgaattcggacaaaatcatagcaatgaataacaaagaagtgtcgagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaaca 6743607  T
Q  196 aaacagacctaaatctaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  6743606 aaacaaacctaaatctaa 6743589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42599863 - 42599701
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42599863 tgttgtgaattcggacaaaatcacactaatgaataataaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgactccaagcaacaacaaca 42599764  T
Q  196 a----aacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |    |||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42599763 aaacaaacaaacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 42599701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 5147504 - 5147647
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaa-aacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5147504 aaaatcacaccaatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaataacagacctaaatc 5147603  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| |||||  |||||||||  |||| |||| ||||| ||||    
T  5147604 taagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaaacaatagagat 5147647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5269481 - 5269321
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5269481 tgttgtgaattcggacaaaaattacactaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac 5269382  T
Q  195 aa----aacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaa 251  Q
    ||    || | ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5269381 aacaaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaa 5269321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16624279 - 16624144
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  16624279 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatt 16624180  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  16624179 taagtgtagagcaacaccacaagaataatcaaagca 16624144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38152710 - 38152573
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac---aaaacagacctaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |    
T  38152710 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtagagcaaatgaagtggtaatcaatgtatgaagtgtttccaagcaacaacaacaataaaacagacctaga 38152611  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||    
T  38152610 tctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaaagca 38152573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 5143086 - 5143229
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5143086 aaaatcaaaccaatgaataacaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaacagacctaaatc 5143185  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| ||||   |||||||||  |||| |||| ||||| ||||    
T  5143186 taagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaaacaatagagat 5143229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16630950 - 16630817
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||    
T  16630950 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaactggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaacaaacctagatc 16630851  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaag 244  Q
    ||||| || ||  |||||||||| |||| |||||    
T  16630850 taagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaag 16630817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5396926 - 5396849
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5396926 aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta 5396849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1983581 - 1983464
Alignment:
Q  99 tgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca--a 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||  |    
T  1983581 tgtgaattcggacaaaatcacacaaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatggataaagtgggttcaagcaacaacaacaaca 1983483  T
Q  197 aacagacctaaatctaagt 215  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  1983482 aactgacttaaatctaagt 1983464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8689748 - 8689658
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8689748 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatc-----gtaaagtgtctccaagtaacaacaacaaaaacagaccta 8689658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28468813 - 28468710
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28468813 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 28468715  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  28468714 caaaa 28468710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31985919 - 31985816
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31985919 tgttgtgaattcggacaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggtgcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 31985821  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  31985820 caaaa 31985816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 3777417 - 3777512
Alignment:
Q  152 gaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||| |||| |||||||    
T  3777417 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaagca 3777512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34496108 - 34495952
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||| |  |  |||||||||||||||    
T  34496108 tgttgtgaattcggtcaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggtagcggtaatcaatggacaaaatagcctcaagcaacaacaaca 34496010  T
Q  196 --aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaa 251  Q
      |||||| || ||| |||||| || ||   || |||||| |||| ||||||||||||    
T  34496009 acaaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaacacaagcataatcaaagcaataaa 34495952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36315467 - 36315394
Alignment:
Q  127 aataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaa--gtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36315467 aataacaaaaatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 36315394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36329676 - 36329603
Alignment:
Q  127 aataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaa--gtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36329676 aataacaaaaatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 36329603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 5112052 - 5112121
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5112052 tgttgtgaattcggataaaatcacaccaatgaa-aacaaaaatgtgtggagcaaagggagtggtaatcaat 5112121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760556
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaaca 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  29760470 tcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaca 29760556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 247
Target Start/End: Original strand, 18377216 - 18377335
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca--aaacagacctaaatctaagtttagag-ataca 226  Q
    |||||| ||||||||||||||    || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| || || ||| |    
T  18377216 aacaaatatgtgtggagcaaagtttgtagtaatcaatggataaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaagcata-a 18377314  T
Q  227 ccacaagtataaccaaagcaa 247  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  18377315 ccacaagcataatcaaagcaa 18377335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5397102 - 5397069
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtgga 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5397102 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgga 5397069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 24741769 - 24741852
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  24741769 tcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaa 24741852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9766108 - 9765947
Alignment:
Q  94 tgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9766108 tgtgttgtgaattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa 9766009  T
Q  194 c-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9766008 caaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 9765947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26403515 - 26403357
Alignment:
Q  98 ttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-a 195  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  26403515 ttgtgaattcggacaaaaccacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataatgtgtctccaagcaataacaacaa 26403416  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26403415 aaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 26403357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5702756 - 5702610
Alignment:
Q  109 gacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  5702756 gacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgaataaagtgtctcctagcaacaacaacaaaaacagacctag 5702657  T
Q  208 atctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||| |||||   ||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  5702656 atctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaaagcaatagagat 5702610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 6127029 - 6127190
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6127029 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagattaagtgtctccaagcaacaacaac 6127128  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  6127129 aaaaaacagatataaatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcactaaagat 6127190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19752665 - 19752521
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19752665 aaaatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatatataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaat 19752566  T
Q  210 ctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||| ||| |  |||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  19752565 ctaagtgtagtgcaacaccacaagcataatcaaagcaatagagat 19752521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4696882 - 4696723
Alignment:
Q  103 aattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgata-------aagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  4696882 aattcggacaaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatagatactagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 4696783  T
Q  196 aaa-cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4696782 aaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagat 4696723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19176027 - 19175890
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattga----taaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19176027 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaattaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaagcagacctag 19175928  T
Q  208 atctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    | || ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  19175927 a-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 19175890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23799863 - 23799704
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  23799863 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaaaaa-aaatatgtgtggagcaaagaaagtgttaatcaatagataaagtgtctccaagaaacaacaaca 23799765  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  23799764 aaaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaacataatcaaagcaatagagat 23799704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 198
Target Start/End: Original strand, 4455855 - 4455941
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4455855 aaaatcacaccaatgaatatcaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaaaa 4455941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5990843 - 5990722
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||     
T  5990843 tgttgtgaattccgacaaaatcacatcaataaa--acaaagatgtgcggagcaaaggaagtagtaatcaatggataaagtagcatcaagcaacaacaac- 5990747  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttaga 220  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5990746 aaatagacctaaatctaagtgtaga 5990722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9055117 - 9054964
Alignment:
Q  99 tgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  9055117 tgtgaattcaaacaaaatcacatcaatgaa--acaatgatgtgtggagtaaaggaagtactaatcaatggataaagtagtctcaaaa-aacaacaacaaa 9055021  T
Q  198 acagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    | |||| ||| ||| ||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9055020 atagacataagtcttagcgtagaataacaccacaagtataatcaaagcaataaagat 9054964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Original strand, 7412166 - 7412239
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaa 187  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  7412166 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatgaatgtgtaaagtgtctccaagcaa 7412239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 26287713 - 26287816
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26287713 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 26287811  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  26287812 caaaa 26287816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 26312964 - 26313067
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26312964 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 26313062  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  26313063 caaaa 26313067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31071516 - 31071412
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa--tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaaca 192  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  31071516 tgttgtgaattcggataaaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaca 31071418  T
Q  193 acaaaa 198  Q
    ||||||    
T  31071417 acaaaa 31071412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 6813489 - 6813652
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagt-gtctcca-----agcaaca 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || ||| | ||||| |     | |||||    
T  6813489 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgttgagcaaagtgagtggtaatcaatggacaaaatagtctcaatcaacaacaaca 6813587  T
Q  190 acaacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  6813588 acaacaaaatagacttaagtcttagtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagat 6813652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1262217 - 1262135
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262217 tcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 1262135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 151
Target Start/End: Original strand, 28307368 - 28307422
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaat 151  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28307368 tgttgtgaattcggataaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaat 28307422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 26300958 - 26301061
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||  |||||||||||||    
T  26300958 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgcgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcaacaagcaacaacaa 26301056  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  26301057 caaaa 26301061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979289
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  36979205 tcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaa 36979289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7493352 - 7493284
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7493352 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaataaa--actatgatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaat 7493284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 30655469 - 30655552
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  30655469 tcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaa 30655552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47099111 - 47098951
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaat--cacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47099111 tgttgtgaattctgacaaaatatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagtaacaacaa 47099012  T
Q  194 caaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47099011 caaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagat 47098951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 775483 - 775642
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  775483 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaccaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 775582  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  775583 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 775642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47103127 - 47102968
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaa-atcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47103127 tgttgtgaactcggacaaatatcacaccaatgaataataaagacgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctcaaagcaacaacaac 47103028  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47103027 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagat 47102968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40817020 - 40816859
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaat-cacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40817020 tgttgtgaattcggacaaaaaacacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 40816921  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  40816920 aaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacgagcataatcaaagcaataaagat 40816859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27104653 - 27104499
Alignment:
Q  98 ttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaa 196  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  27104653 ttgtgaattctgtcaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa--- 27104557  T
Q  197 aacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27104556 aacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 27104499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 19072737 - 19072897
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19072737 tgttgagaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaaca 19072836  T
Q  196 aaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  19072837 aaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat 19072897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 19120627 - 19120787
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19120627 tgttgagaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatatgtggaacaaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaaca 19120726  T
Q  196 aaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  19120727 aaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat 19120787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47704208 - 47704063
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  47704208 aaaatcacatcaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaaatagacctaaa 47704109  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47704108 tctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagcaataaagat 47704063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 13598206 - 13598368
Alignment:
Q  96 tgttgtgaat-tcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  13598206 tgttgtgaatctgagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatag-ttaagtgtctccaaacaacaacaac 13598304  T
Q  195 ----aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
        |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13598305 aacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 13598368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 29651620 - 29651781
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  29651620 tgttgtgaattcggacaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctataatcaacaacaac 29651719  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29651720 aaaaaacagacttagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 29651781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16124799 - 16124644
Alignment:
Q  100 gtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaa 198  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16124799 gtgaatccggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaaatgtgtccaagcaacaacaacaaaaa 16124700  T
Q  199 cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||| |||||| | |||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16124699 cagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagat 16124644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 32889266 - 32889408
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaa-gtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32889266 aaaatcataccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaacagatctaaatc 32889364  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889365 taagtgtagagcaacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 32889408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 9476073 - 9476231
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-tgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9476073 tgttgtgaattcgaacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaatgaagtagtaattaatggataaagtgtctccaagcaacaataac 9476172  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  9476173 aaaacagacataaatataagtgtaga-aaacatcacaagcataatcaaagcaaaaaagat 9476231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9024116 - 9023959
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||     
T  9024116 tgttgtgaatttagacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagaagtgtggagcagagaaagtggtaatcaatggataaagtagccccaagcaataacaac- 9024018  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  9024017 aaacatacctaaatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaatgcaataaagat 9023959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26645166 - 26645033
Alignment:
Q  113 aaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatct 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  26645166 aaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctttaagcaacaacaacaaaagcagacctaga-ct 26645068  T
Q  212 aagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
     ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  26645067 tagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 26645033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21536839 - 21536753
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21536839 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaatcaacaacaacaaaa 21536753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 37069597 - 37069673
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaa 190  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  37069597 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaa 37069673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 198
Target Start/End: Original strand, 3281537 - 3281621
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281537 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtg--gagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 3281621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13604909 - 13604800
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa- 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||     
T  13604909 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaa 13604811  T
Q  194 -caaaacagac 203  Q
     ||||||||||    
T  13604810 gcaaaacagac 13604800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50521389 - 50521231
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat-tgataaagt-gtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  ||||| |||| ||| |||||||||    
T  50521389 tgttgtgaattcggacaaaatcacatcaataaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgagtaaaagtagtct-caaacaacaacaa 50521291  T
Q  194 caaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaaga 253  Q
    ||||| |||||||| ||  ||| ||||   |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  50521290 caaaatagacctaagtcctagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaagcaataaaga 50521231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19359098 - 19359029
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19359098 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 19359029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Original strand, 22819270 - 22819336
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  22819270 aacaaagatgtgtggagcaaagaaaatggtaatcaatggataaagtgtccttaagcaacaacaacaa 22819336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24203033 - 24202940
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagc-aacaacaacaaaacagacctaaa 208  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24203033 tcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaa 24202940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19361688 - 19361619
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19361688 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaa 19361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19380328 - 19380259
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19380328 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaa 19380259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47704266 - 47704222
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47704266 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgt 47704222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17345805 - 17345735
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaa--aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    |||||||||||| |||||  || |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17345805 tgttgtgaattcggacaagaaaccacaccaatgaa--acaaagatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaat 17345735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 2580199 - 2580357
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  2580199 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac 2580297  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580298 aaaacagacctaaatctaagtgtagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 2580357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 29159613 - 29159773
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa-tgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29159613 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 29159712  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29159713 aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 29159773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9235843 - 9235682
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9235843 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaca 9235744  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9235743 aaaaaacagacctaaatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 9235682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 20283900 - 20284059
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  20283900 tgttgtgaattcggacaaaatcacacctatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagaaacaacaaca 20283999  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20284000 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 20284059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4796953 - 4796794
Alignment:
Q  99 tgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac---- 194  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        
T  4796953 tgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtttctccaagcaacaacaacaaaa 4796854  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4796853 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 4796794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23403299 - 23403143
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  23403299 tgttgtgaattcggacaaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtttccaagcaacaacaaca 23403200  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaa 251  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23403199 aaaacagacctaaatgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaa 23403143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9185449 - 9185290
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9185449 tgttgtgaattcggtcaaaatcacactaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 9185350  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9185349 aaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataaacaaagcaataaagat 9185290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46516597 - 46516437
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  46516597 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaaca 46516498  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  46516497 aaaaacagacttaaatctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaaagcaatagagat 46516437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 49091472 - 49091624
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49091472 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 49091571  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
     |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  49091572 aaaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 49091624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9190294 - 9190135
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9190294 tgttgtgaattcggtcaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 9190195  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9190194 aaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagat 9190135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33332734 - 33332577
Alignment:
Q  98 ttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  33332734 ttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataaccaagatgtgtggaccaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtatccaaacaacaacaacaaa 33332635  T
Q  197 aacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  33332634 aacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaatcaataaagat 33332577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 35960641 - 35960786
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaag---caacaacaacaaaacagacctaaa 208  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  35960641 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaacaggcctaaa 35960740  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  35960741 tctaagtgtagagaaacaccaccagcataaataaagcaataaagat 35960786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2647949 - 2647823
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtttagagatacac 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2647949 aacaaagatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaaatatctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtttagagcaacac 2647850  T
Q  228 cacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  2647849 cacaagcataatcaaagcaataaagat 2647823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 21983109 - 21983253
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaa--acagacctaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  21983109 aaaatcacaccaatgaaaaacaatgatgtatggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtatctccaagcaacaacaacaaactccagacctaaat 21983208  T
Q  210 ctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||  || |||||  |||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  21983209 ctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaatagagat 21983253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 21988733 - 21988877
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaa--acagacctaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  21988733 aaaatcacaccaatgaaaaataatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcaccaagcaacaacaacaaactccagacctaaat 21988832  T
Q  210 ctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||  || |||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  21988833 ctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagat 21988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 2479168 - 2479261
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2479168 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaacagaccta 2479261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 198
Target Start/End: Original strand, 55764 - 55852
Alignment:
Q  110 acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55764 acaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaa 55852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 3047063 - 3047162
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||  |||||||||||||||    
T  3047063 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtgtcctcaagcaacaacaaca 3047161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Original strand, 47263509 - 47263593
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47263509 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgcgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaacaaaa 47263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2648013 - 2647962
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2648013 tgttgtgaattcagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagc 2647962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44848953 - 44848869
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44848953 aatcacaccaatgaaaaacaaggatgtgtggagcaaaggtagtgctaatcaatgtgcaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 44848869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 18408576 - 18408679
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  18408576 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccacgcaacaacaa 18408674  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  18408675 caaaa 18408679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 18413453 - 18413556
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  18413453 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgaggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 18413551  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  18413552 caaaa 18413556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28617512 - 28617444
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28617512 tgttgtgaattcggacaaaatcacattaatcaa--acaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaat 28617444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 21639654 - 21639723
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639654 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 21639723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 21645852 - 21645921
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645852 aacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 21645921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 19588557 - 19588716
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  19588557 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagcgtctccaagcaacaacaaca 19588656  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19588657 aaaaaagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 19588716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42127701 - 42127537
Alignment:
Q  90 tggttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaaca 189  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42127701 tggttttgttgtgaattcggacaaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaca 42127602  T
Q  190 acaacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  42127601 acaacaaaacagacttaaatctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat 42127537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11182120 - 11181959
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11182120 tgttgtgaatttgaacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagtaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 11182021  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11182020 aaaaaacagacttaaatctaagtgtagagcaataccacaagcataatcaaagcaataaagat 11181959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 28832071 - 28832229
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  28832071 tgttgtgaaatcggacaaaatcataccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtcttcaagcaacaacaaca 28832170  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  28832171 aaaacagacct-aatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaatcaataaagat 28832229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 3880113 - 3880270
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||      
T  3880113 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaatcaacaaca-- 3880210  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3880211 aaaacagacctaaatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 3880270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17004244 - 17004087
Alignment:
Q  98 ttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-a 195  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17004244 ttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagaggtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaa 17004145  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  17004144 aaacagacctaaatctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagcaaaaaagat 17004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 14520056 - 14520191
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14520056 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 14520155  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  14520156 taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 14520191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24553748 - 24553633
Alignment:
Q  140 tgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataa 238  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  24553748 tgtggagcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagcaacatcaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcataa 24553649  T
Q  239 ccaaagcaataaagat 254  Q
     |||||||||||||||    
T  24553648 tcaaagcaataaagat 24553633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31300886 - 31300723
Alignment:
Q  92 gttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaa 190  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| || |||||||| | ||||||| | || ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  31300886 gttgtgttgtgaattcggtcaaaatcacactaatgaaaaataaagatgtattgagcaaaaggaactggtaatcaatagataaagtgttttcaagcaaaaa 31300787  T
Q  191 caacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  31300786 caacaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaacaataaagat 31300723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 15464343 - 15464501
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15464343 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 15464441  T
Q  194 c-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    | ||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15464442 caaaaacagacct-agtct-agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagat 15464501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42126693 - 42126625
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatca 164  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42126693 tgttgtgaattcggataaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatca 42126625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36932635 - 36932533
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  36932635 tgttgtgaattcggacaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 36932537  T
Q  195 aaaa 198  Q
    ||||    
T  36932536 aaaa 36932533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9353599 - 9353505
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9353599 aatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaaacaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta 9353505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11917245 - 11917099
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagc----aacaacaacaaaacagacctaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||    || || || |||| |||||||     
T  11917245 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagacctag 11917146  T
Q  208 atctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  11917145 atcttagtgtagagcaacaccacaagcataaacagtgcaataaagat 11917099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Original strand, 10281673 - 10281727
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa 150  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281673 tgttgtgaatttggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa 10281727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 38192017 - 38192086
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192017 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 38192086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 38219242 - 38219311
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219242 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 38219311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Original strand, 6741665 - 6741718
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6741665 tgttgtgaattcagacaaaataacatcaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaa 6741718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 35387508 - 35387577
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387508 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 35387577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24555877 - 24555833
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24555877 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgt 24555833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24596908 - 24596864
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24596908 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgt 24596864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 206
Target Start/End: Original strand, 24135658 - 24135771
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagc-aacaac 191  Q
    ||||||||||| | || |||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||    
T  24135658 gtgttgtgaatccggataaaactcacaccaatgaa-aataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaagagtctccaagcaaacaac 24135756  T
Q  192 aacaaaacagaccta 206  Q
    |||||||||| ||||    
T  24135757 aacaaaacagcccta 24135771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 213827 - 213790
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaa 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  213827 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtagagcaa 213790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12084376 - 12084311
Alignment:
Q  182 aagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  12084376 aagcaacaaaaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 12084311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 28537430 - 28537530
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||  | || |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28537430 tgttgtgaatttggtcaaaatcataccaatgaattacaaagatgtatggagcaaaaaaggtagtaatcaatgagtaaagtagtct-caagcaacaacaac 28537528  T
Q  195 aa 196  Q
    ||    
T  28537529 aa 28537530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33031233 - 33031132
Alignment:
Q  94 tgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtg-tctccaagcaacaaca 192  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||| ||  |||||| |||||    
T  33031233 tgtgttgtgaatttggacaaaaacacaccaataaa--ataaagatgtgtggagcaaaggaaatagtaattaatggataaagtgatcctcaagcaccaaca 33031136  T
Q  193 acaa 196  Q
    ||||    
T  33031135 acaa 33031132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10077451 - 10077292
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  10077451 tgttgtgaattcggacaaaatcacactaatgaatagcgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 10077352  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10077351 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 10077292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 31979324 - 31979483
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  31979324 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccactaaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaaca 31979423  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  31979424 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaaagcaataaagat 31979483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5572885 - 5572739
Alignment:
Q  93 ttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaaca 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5572885 ttgtgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaaca 5572786  T
Q  193 ac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataa 238  Q
     | ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  5572785 gcaaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataa 5572739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 18232655 - 18232815
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcaga-caaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18232655 tgttgtgaattcggaacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 18232754  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18232755 aaaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 18232815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21801634 - 21801476
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21801634 tgttgagaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggag--aaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 21801537  T
Q  196 aaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||   | |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  21801536 aaaatcagacctaaatctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagcaataaagat 21801476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 31936414 - 31936557
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31936414 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagaccttaatc 31936513  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31936514 aaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagat 31936557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31086756 - 31086622
Alignment:
Q  89 ttggttgtgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaa 187  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31086756 ttggatgtgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaagaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaa 31086657  T
Q  188 caacaac-aaaacagacctaaatctaagtttagag 221  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31086656 aaacaacaaaaacagacataaatctaagtgtagag 31086622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5017742 - 5017603
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaac-----aacaaaacagaccta 206  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||    
T  5017742 aaaatcacactaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaacagaccta 5017643  T
Q  207 aatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
     |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  5017642 gatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 5017603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24436259 - 24436097
Alignment:
Q  89 ttggttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaac 188  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24436259 ttggtagtgttgtgaattcggacaaaataacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaagggaaatggtaatcaatagataaagtgtctacaaacaac 24436160  T
Q  189 aacaacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  24436159 aacaa-aaataagatctaaatctaagtgtagag--acacaacaagcataaacaaagcaacaaagat 24436097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Original strand, 22963550 - 22963670
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaag 233  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  22963550 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaag 22963649  T
Q  234 tataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||| |||||||||| ||||    
T  22963650 cataatcaaagcaatagagat 22963670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23824843 - 23824723
Alignment:
Q  136 gatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaag 233  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  23824843 gatgtgtggagctaaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaag 23824744  T
Q  234 tataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||| |||||||||| ||||    
T  23824743 cataatcaaagcaatagagat 23824723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 4629772 - 4629923
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggag-caaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||            
T  4629772 tgttgtggattcggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaaaca-------- 4629863  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4629864 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 4629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5757744 - 5757615
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatcta 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  5757744 aatcacaccaatgaaaaacaaagaagtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacct-aatct- 5757647  T
Q  213 agtttagagatacaccacaagtataaccaaag 244  Q
    ||| |||||  |||||||||| |||| |||||    
T  5757646 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 5757615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 21355867 - 21355960
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21355867 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagaccta 21355960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 254
Target Start/End: Original strand, 22708863 - 22708988
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacac 227  Q
    ||||||||||||| | ||||| |  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||  ||||    
T  22708863 aacaaagatgtgtagtgcaaaggggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatctaa-tgtagagcaacac 22708961  T
Q  228 cacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  22708962 cacaagtgtatccaaagcaataaagat 22708988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26258252 - 26258183
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26258252 aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaaccaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 26258183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 166
Target Start/End: Original strand, 27165545 - 27165583
Alignment:
Q  128 ataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27165545 ataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtcgtaatcaat 27165583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 8039867 - 8040030
Alignment:
Q  93 ttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaac 191  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8039867 ttgtgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaac 8039966  T
Q  192 aac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8039967 aacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 8040030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10445732 - 10445571
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10445732 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac 10445633  T
Q  195 --aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10445632 aaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaataaagat 10445571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 20522031 - 20522190
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  20522031 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaaca 20522130  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20522131 aaaaaagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 20522190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33528907 - 33528748
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  33528907 tgttgtgaattcggacaaaattccaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtccccaagcaacaacaaca 33528808  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33528807 aaaacagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 33528748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 21629762 - 21629886
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21629762 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaa-aacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 21629860  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagag 221  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21629861 aaacagacctagatctaagtgtagag 21629886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Original strand, 17865009 - 17865173
Alignment:
Q  91 ggttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaa 190  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  17865009 ggttatgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaaaatgtgtggagaaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaaccaacaa 17865108  T
Q  191 caac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17865109 caacaaaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 17865173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 254
Target Start/End: Original strand, 31055884 - 31056012
Alignment:
Q  127 aataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  31055884 aataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaac 31055983  T
Q  226 accacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31055984 accacaagcataatcaaagcaataaagat 31056012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34682622 - 34682472
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaa-gtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34682622 gtgttgtgaattcgtacaaaaccacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa 34682523  T
Q  194 c-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaa 243  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  34682522 caaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaa 34682472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 39482746 - 39482901
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39482746 tgttgtgaattcagacaaaatcacacaaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaa----taa-caatagataaagtgtctccaaacaacaacaaca 39482840  T
Q  196 aaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39482841 aaaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagat 39482901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16940496 - 16940336
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16940496 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac 16940397  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||||||||||| ||||||||  ||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16940396 aaaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagat 16940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17011161 - 17011001
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  17011161 tgttgtgaattcggtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac 17011062  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     |||||||||||| ||||||||  ||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17011061 aaaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagat 17011001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14699285 - 14699127
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaat-cacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14699285 tgttgtgaattcggacaaaaaacacatcaatgaatatcaatgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 14699186  T
Q  195 aaaa-----cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaat 248  Q
    || |     ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  14699185 aacaaaaagcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaat 14699127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36758031 - 36757898
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaatct 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36758031 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaga-ct 36757933  T
Q  212 aagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
     ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  36757932 tagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 36757898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 254
Target Start/End: Original strand, 33117974 - 33118106
Alignment:
Q  123 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatctaagtttagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33117974 aatgaataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaaacatcaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagag 33118073  T
Q  222 atacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
      |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  33118074 caacaccacaagcataatcaaagtaataaagat 33118106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23078742 - 23078606
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  23078742 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacatacctagat 23078643  T
Q  210 ctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  23078642 ctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 23078606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 13569130 - 13569291
Alignment:
Q  89 ttggttgtgttgtgaattcag--acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagca 186  Q
    |||||| |||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  13569130 ttggttttgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaaca 13569229  T
Q  187 acaacaac--aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||||||  ||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  13569230 acaacaacaaaaaacaggcttagatctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagca 13569291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42039939 - 42039805
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||     
T  42039939 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacatacctagat- 42039841  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  42039840 taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 42039805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 34388686 - 34388821
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34388686 aaaatcacaccaataaataacgaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatatgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 34388785  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| | || |||||||    
T  34388786 taagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaaagca 34388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8390441 - 8390284
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag--acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390441 tgttgtgaattccggtacaaaatcacaccaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtatccaaacaacaacaa 8390342  T
Q  194 c-----aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    |     ||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  8390341 caacaaaaaccagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 8390284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10707523 - 10707439
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10707523 aaaatcacacccatgaataacaaagatgtgtggagcaaaagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa 10707439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28259445 - 28259361
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28259445 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtaataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaataacaaaa 28259361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 215
Target Start/End: Original strand, 40014744 - 40014858
Alignment:
Q  101 tgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca--aaa 198  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  40014744 tgaattcggacaaaatcacaccaatgacaaacaaagatgtatggagcaaaggaagtagtaatcaatgg--aaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaa 40014841  T
Q  199 cagacctaaatctaagt 215  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  40014842 cagtcctaaaactaagt 40014858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 3491563 - 3491666
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  3491563 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 3491661  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  3491662 caaaa 3491666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 25398339 - 25398408
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398339 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 25398408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 25403477 - 25403546
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403477 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 25403546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Original strand, 35397325 - 35397475
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||   | || || |  |||||||||||||||    
T  35397325 tgttgtgaattcggacaaaaacacaccaatga--aacaaagatgtgcggagcagaggaagtagtaatcaatgagtgaaatgacctcaagcaacaacaaca 35397422  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaat 248  Q
    ||| | ||||||||||| ||  ||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  35397423 aaatatacctaaatctatgtgcagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaat 35397475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Original strand, 32178403 - 32178459
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaatt-cagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa 150  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32178403 gtgttgtgaattgcatacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaa 32178459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27149150 - 27149052
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||  |  |||||||||||||||    
T  27149150 tgttgttaattcggacaaaatcacaccaatcaa--acaaagatgtgtggagcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtagcatcaagcaacaacaaca 27149053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11099112
Alignment:
Q  116 tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatga-agtggtaatcaattgataaagt-gtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  11099196 tcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaa 11099112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 40738688 - 40738752
Alignment:
Q  133 aaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaa 196  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  40738688 aaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatctatatgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaa 40738752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6794988 - 6794830
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6794988 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaaaaacaacgatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagaaaaagtgtctccaagcaacaacaaca 6794889  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   || |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  6794888 aaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaatagagat 6794830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 40844464 - 40844622
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40844464 tgttgtgaattcggacaaaattaca-caatgaataacaaagatgtgtggagtaaaagaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaaca 40844562  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  40844563 aaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaataaagat 40844622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 48438025 - 48438184
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  48438025 tgttgtgaattcggacaaaatcacatcaatgaataacaaggatgtgtggagcaaaggaaatggtaatcaatagataaagtatctccaagcaacaacaaca 48438124  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  48438125 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat 48438184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1417752 - 1417607
Alignment:
Q  109 gacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaa 208  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  1417752 gacaaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaacatacataaa 1417653  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  1417652 tctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagat 1417607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 1417075 - 1417232
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  1417075 gtgttgtgaattccggacaaaatcacaccaatgaataataaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 1417174  T
Q  194 caaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   || |||||| |||| ||||||||||||    
T  1417175 caaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaataaa 1417232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40593063 - 40592900
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcaga-caaaatcacaacaatgaataacaa---agatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaac 191  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40593063 tgttgtgaattcggaacaaaatcacaccaatgaataacaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaagcaacaac 40592964  T
Q  192 aac-aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  40592963 aacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaatatagat 40592900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 26298792 - 26298958
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcaga-caaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26298792 tgttgtgagttcagaacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggatcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaaacaacaacaac 26298891  T
Q  195 -------aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26298892 aacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 26298958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3716279 - 3716119
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3716279 tgttgtgaatttgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctacaagcaacaacaac 3716180  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  3716179 aaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaacaataaagat 3716119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24695439 - 24695281
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  24695439 tgttgtgaattcgtacaaaatcacacaaatgaataataaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtcttcaagcaacaacaaca 24695340  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  24695339 aaaacagagctaaatctaagtatagagcaaca-cacaagcataatcaaagcaataaagat 24695281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30710051 - 30709916
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30710051 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 30709952  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||    
T  30709951 taagtttagagcaacaccataagcataatcaaagca 30709916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 36028932 - 36029059
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36028932 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 36029031  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataa 238  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  36029032 taagtatagagcaacaccacaagcataa 36029059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 27026772 - 27026907
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa-caaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  27026772 aaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaagaaaaacagacctagatc 27026871  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  27026872 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 27026907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47924146 - 47924010
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  47924146 tgttgtgaattcggtactaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaaca-- 47924049  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaag 233  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  47924048 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaag 47924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 27038100 - 27038252
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcag-acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  27038100 tgttgtgaattcggtaaaaaatcacaccaatgaataactaagatgtgtggagcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac 27038199  T
Q  195 -aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
     |||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  27038200 aaaaacagatctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 27038252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 47649551 - 47649654
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47649551 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggaacaaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac 47649650  T
Q  195 aaaa 198  Q
    ||||    
T  47649651 aaaa 47649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 8126512 - 8126671
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac- 194  Q
    |||||||||||  || || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||     
T  8126512 tgttgtgaatttggataatatcataccaataaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtattcaatagatacaatgtctccaaccaacaacaaca 8126611  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  8126612 aaaacatacctaaatctaagtgtagagcaacaccacactcataatcaaagcaataaagat 8126671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8370747 - 8370612
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8370747 aaaatcacatcaatgaaaaataaagatgtgtggagtaaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctagatc 8370648  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  8370647 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 8370612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39040271 - 39040118
Alignment:
Q  94 tgtgttgtgaattcag--acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaac 191  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39040271 tgtgttgtgaattccggtaaaaaatcacaccaataaataataaagatgtgtggaacaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaac 39040172  T
Q  192 aacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  39040171 aacaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 39040118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3323839 - 3323752
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaa 183  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3323839 tgttgtgaattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgcataaagtgtctccaa 3323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 37466102 - 37466261
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctcc-aagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  || || ||     
T  37466102 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaataaataacaaagatgtgaggagcaaaggaaatggtaatcaatggattaagtgtctccaaaaaaaaaaaaaa 37466201  T
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||  |||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  37466202 aaaacagacattaatctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaaagcaataaagat 37466261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18554563 - 18554465
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  18554563 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaagaaagtggtaattaatagataaaatatctccaaacaacaacaac 18554465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Original strand, 16264174 - 16264311
Alignment:
Q  110 acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaa 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  16264174 acaaaatcacaccaatgaataacaaagacgtgtggagcaacagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacaatcctaga 16264273  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    ||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||    
T  16264274 tctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagca 16264311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 21711064 - 21711149
Alignment:
Q  123 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21711064 aatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggta---aatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaaatc 21711149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33386942 - 33386784
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33386942 tgttgtgaatccggacaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagtaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 33386844  T
Q  195 aaaa--cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||  ||||||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33386843 aaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagat 33386784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Original strand, 35925309 - 35925441
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatc 210  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  35925309 aaaaccacaccaatgaaaaacaaagatatgtggagcaaagcaggtggtaatcaatgtgtaaaatgtctccaagtaacaacaacaaaaacagacctagatc 35925408  T
Q  211 taagtttagagatacaccacaagtataaccaaa 243  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  35925409 taagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaa 35925441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3328558 - 3328473
Alignment:
Q  170 taaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa-cagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3328558 taaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagat 3328473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27986722 - 27986563
Alignment:
Q  94 tgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaaca 192  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||    
T  27986722 tgtgttgtgaattcggacaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtatggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaaca 27986624  T
Q  193 acaaaac-agacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||  |||||||  |||| || |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  27986623 acaaaaatagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagcaataaagat 27986563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27975191 - 27975114
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaa 207  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27975191 aacaaagatatgtggagtaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaaaacagacctaa 27975114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Original strand, 32143133 - 32143245
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32143133 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 32143231  T
Q  194 c-aaaacagaccta 206  Q
    | ||||||||||||    
T  32143232 caaaaacagaccta 32143245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 1305761 - 1305864
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaat-gaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa 193  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  1305761 tgttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaa 1305859  T
Q  194 caaaa 198  Q
    |||||    
T  1305860 caaaa 1305864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25929700 - 25929635
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggta 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25929700 gtgttgtgaattcggacaaaatcacaacaactaataacaaagatgtgtggaataaaggaagtggta 25929635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 27452770 - 27452870
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27452770 tgttgagaattcggacaaactaacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 27452868  T
Q  195 aa 196  Q
    ||    
T  27452869 aa 27452870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 1309668 - 1309769
Alignment:
Q  98 ttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  1309668 ttgtgaattcggataaaactcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaaca 1309766  T
Q  196 aaa 198  Q
    |||    
T  1309767 aaa 1309769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25929628 - 25929559
Alignment:
Q  185 caacaacaacaaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  25929628 caacaacaacaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagat 25929559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4387308 - 4387239
Alignment:
Q  95 gtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaat 166  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4387308 gtgttgttaattcctacaaaatcacagcaatgaa--acaaagatgtgtggagcaaaggaagtagtaatcaat 4387239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18553059 - 18553000
Alignment:
Q  195 aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18553059 aaaacagaactaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagat 18553000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3328601 - 3328561
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaag 136  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3328601 tgttgtgaattcgtacaaaatcacatcaatgaataacaaag 3328561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 17077 - 17233
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaaca 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  17077 tgttgtgaattcggacaaaatcacatgaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaaacaacaaca--a 17174  T
Q  196 aaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  17175 aaacatacctaaatctaagtatagagcaacaccacaagcataattaaagcaataaagat 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 10535 - 10699
Alignment:
Q  93 ttgtgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaac 191  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  10535 ttgtgttgtgtattcgtacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagcaaaaagaagtggtaatcgatagataaagttactccaagcaacaac 10634  T
Q  192 aac--aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10635 aacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 10699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 5491 - 5653
Alignment:
Q  96 tgttgtgaat-tcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  5491 tgttgtgaatctgagacaaaatcacaccaatgaataacaaagatgtgtggagtaaaggaagtggtaatcaatag-ttaagtgtctccaaacaacaacaac 5589  T
Q  195 ----aaaacagacctaaatctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
        |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5590 aacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 5653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 254
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2462
Alignment:
Q  110 acaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaa 208  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2317 acaaaatcacaccgaagaataacaaagatgtgtggagcaaaggaagtgttgatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacctaga 2416  T
Q  209 tctaagtttagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||| ||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2417 tctaagtgtagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagat 2462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 133566 - 133457
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagc-aaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaa- 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||     
T  133566 tgttgtgaattcggacaaaatcacaccaatgta-aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaa 133468  T
Q  194 -caaaacagac 203  Q
     ||||||||||    
T  133467 gcaaaacagac 133457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 85512 - 85646
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacagacctaaatct 211  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  85512 aaaatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtagagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaacagacctagatct 85611  T
Q  212 aagtttagagatacaccacaagtataaccaaagca 246  Q
    |||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  85612 aagtgtagagcaacatcacaagcataaccaaagca 85646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44227 - 44098
Alignment:
Q  114 aatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagacctaaatcta 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  44227 aatcacaccaatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagacct-aatct- 44130  T
Q  213 agtttagagatacaccacaagtataaccaaag 244  Q
    ||| |||||  |||||||||| |||| |||||    
T  44129 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 44098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37102 - 37007
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37102 aaaatcacaccgatgaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta 37007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 1234 - 1330
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataa-caaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaacagaccta 206  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1234 aaaatcacaccaatgaaaaaacaaagatgtgtggagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacagaccta 1330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 45100 - 45168
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100 aacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 45168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8670 - 8547
Alignment:
Q  132 caaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa--cagacctaaatctaagtttagagatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || |||||  |||||    
T  8670 caaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacacc 8573  T
Q  229 acaagtataaccaaagcaataaagat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8572 acaagtataaccaaaacaataaagat 8547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18204 - 18135
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18204 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 18135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24297 - 24228
Alignment:
Q  130 aacaaagatgtgtggagcaaatg-aagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24297 aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaa 24228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29777 - 29676
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  29777 tgttgtgaattcggtcaaaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 29678  T
Q  195 aa 196  Q
    ||    
T  29677 aa 29676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 43067 - 43168
Alignment:
Q  96 tgttgtgaattcagacaaaa-tcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaac 194  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  43067 tgttgtgaattcggtcaaaaatcacaccaatgaaaaacaaaaatgtgtgaagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 43166  T
Q  195 aa 196  Q
    ||    
T  43167 aa 43168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 23357 - 23446
Alignment:
Q  112 aaaatcacaacaatgaataacaaagatgtgtggagcaaatgaagtggtaatcaattgataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacag 201  Q
    ||||||||| |||| || |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| | ||  ||||||| |||||||||||||    
T  23357 aaaatcacaccaataaaaagtaaagatgtgttgagcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaaatatcctcaagcaataacaacaaaacag 23446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University