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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20593_low_1 (Length: 817)

Name: NF20593_low_1
Description: NF20593
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20593_low_1
NF20593_low_1
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (18-769)||(670615-671366)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 585; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 671366 - 670615
Alignment:
Q  18 ttatgatacagaagcacacgaattcaacagattagcatatat--gaatatgaattataattaaaagaatcactaagatcctataataattatgattttta 115  Q
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T  671366 ttatgatacagaagcacacgaattcaacaaattagcatatatatgaatatgaattataattaaaagaatcactaagatcctataataattatgattttta 671267  T
Q  116 taccaaagctgtggtttgaaatgattctcgcttctcaacttttcacataaattctcctgtcaaaagaaacttttcataaattctctcatctttgtaattg 215  Q
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T  671266 taccaaagctgtggtttgaaatgattctcgcttctcaacttttcacataaattctcctgtcaaaagaaacttttcataaattctctcatctttgtaattg 671167  T
Q  216 tgaacaagtttataaagannnnnnnncccttacatgtggaccaagaaatacctcagtttannnnnnnnnnnnnaatgaaaaatctcaaccttagtttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||    
T  671166 tgaacaagtttataaagattttttttcccttacatgtggaccaagaaatacctcagtttattttttatttttttatgaaaaatctcaaccttagtttttc 671067  T
Q  316 cattttatatnnnnnnnnttatgacatatttattacatggatactagttagnnnnnnncttctttctaactcatcataattagagtttttgaaaatcaaa 415  Q
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T  671066 cattttatataaaaaaa-ttatgacatatttattacatggatactagttagtttttttcttctttctaactcatcataattagagtttttgaaaatcaaa 670968  T
Q  416 ctcagatttcttttcatcagttatgttatcaactcgttgatagatactagttattttctttcagacgtgaacaactcaatgacaacattaacacat---- 511  Q
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T  670967 ctcagatttcttttcatcagttatgttatcaactcgttgatagatactagttattttctttcagacgtgaacaactcaatgacaacattaacacatacat 670868  T
Q  512 catgtaatttacactgcttatacacggagtcgcatgtttcaatttggaagattacgatttcaaatctcatcgaggcatggtatggcatggcatgaggtga 611  Q
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T  670867 catgtaatttacactgcttatacacggagtcgcatgtttcaatttggaagattacgatttcaaatctcatcgtggcatgg-----catggcatgaggtga 670773  T
Q  612 ctataagcataaacatgaaaagacctattctcatccataccatactatagtgagtgagtattaatgtgacacactgcccaaattccattagacccttatc 711  Q
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T  670772 ctataagcataaacatgaaaagacctattctcatccataccatactatagtgagtgagtattaatgtgacacactgcccaaattccattagacccttatc 670673  T
Q  712 caacgctaactcattctttttgtatcctgtgcatttagtggcgaataataatattatt 769  Q
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T  670672 caacgctaactcattctttttgtatcctgtgcatttagtggcgaataataatattatt 670615  T

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