View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20598_low_1 (Length: 947)

Name: NF20598_low_1
Description: NF20598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20598_low_1
NF20598_low_1
[»] chr3 (99 HSPs)
chr3 (444-931)||(6110064-6110551)
chr3 (444-931)||(10572312-10572799)
chr3 (444-931)||(15600604-15601091)
chr3 (444-931)||(15607149-15607636)
chr3 (446-931)||(16482203-16482688)
chr3 (450-931)||(10579075-10579556)
chr3 (450-931)||(17780838-17781319)
chr3 (446-927)||(18522665-18523146)
chr3 (444-931)||(8490488-8490982)
chr3 (447-931)||(13211305-13211789)
chr3 (444-931)||(13248607-13249094)
chr3 (444-931)||(15357306-15357793)
chr3 (446-931)||(18519980-18520462)
chr3 (463-931)||(15341939-15342407)
chr3 (450-931)||(32056619-32057101)
chr3 (446-935)||(17199900-17200389)
chr3 (446-931)||(13516813-13517294)
chr3 (450-931)||(1647241-1647726)
chr3 (444-931)||(29924971-29925458)
chr3 (444-931)||(29974124-29974611)
chr3 (446-931)||(16200434-16200917)
chr3 (550-931)||(17136465-17136840)
chr3 (450-662)||(19089734-19089946)
chr3 (92-322)||(43306591-43306819)
chr3 (175-351)||(5128822-5128998)
chr3 (113-322)||(3068813-3069022)
chr3 (444-605)||(18640792-18640953)
chr3 (451-846)||(24253197-24253589)
chr3 (446-683)||(16200128-16200363)
chr3 (175-331)||(43303960-43304117)
chr3 (174-331)||(3063736-3063894)
chr3 (615-931)||(21034229-21034540)
chr3 (615-931)||(15846536-15846847)
chr3 (615-931)||(20147554-20147865)
chr3 (624-931)||(21398792-21399094)
chr3 (615-931)||(55427012-55427323)
chr3 (624-931)||(14890391-14890693)
chr3 (615-931)||(12299902-12300212)
chr3 (692-931)||(25978728-25978963)
chr3 (615-833)||(14147012-14147226)
chr3 (260-338)||(40593528-40593605)
chr3 (265-331)||(53012958-53013025)
chr3 (350-408)||(6109970-6110028)
chr3 (446-508)||(18534758-18534820)
chr3 (351-408)||(13248514-13248571)
chr3 (352-408)||(8490396-8490452)
chr3 (699-897)||(15526827-15527021)
chr3 (351-408)||(13211210-13211267)
chr3 (352-408)||(18640989-18641045)
chr3 (261-343)||(41218724-41218806)
chr3 (261-348)||(4580479-4580565)
chr3 (349-408)||(15607672-15607732)
chr3 (352-408)||(17136137-17136193)
chr3 (92-178)||(368791-368874)
chr3 (352-402)||(10579603-10579653)
chr3 (746-931)||(28088227-28088408)
chr3 (665-798)||(32280313-32280444)
chr3 (175-264)||(2472689-2472777)
chr3 (351-408)||(15351237-15351294)
chr3 (351-408)||(15357829-15357886)
chr3 (351-408)||(17200427-17200484)
chr3 (446-491)||(18510924-18510969)
chr3 (692-931)||(11787654-11787889)
chr3 (352-408)||(16482727-16482782)
chr3 (352-408)||(18519885-18519941)
chr3 (185-264)||(52708844-52708923)
chr3 (351-402)||(10572840-10572891)
chr3 (194-257)||(45168338-45168401)
chr3 (607-709)||(9504446-9504548)
chr3 (692-931)||(15317176-15317408)
chr3 (351-408)||(15601127-15601185)
chr3 (175-264)||(365593-365681)
chr3 (351-408)||(13516718-13516775)
chr3 (351-408)||(17781358-17781415)
chr3 (351-408)||(19089985-19090042)
chr3 (261-349)||(20398486-20398574)
chr3 (352-408)||(1647768-1647824)
chr3 (352-408)||(32057144-32057200)
chr3 (663-792)||(28953965-28954093)
chr3 (264-350)||(33620096-33620181)
chr3 (295-349)||(39913348-39913403)
chr3 (262-339)||(19949927-19950004)
chr3 (642-735)||(8251933-8252026)
chr3 (351-408)||(18510828-18510885)
chr3 (351-408)||(18522569-18522626)
chr3 (351-408)||(18534662-18534719)
chr3 (294-349)||(45168410-45168466)
chr3 (271-349)||(19795168-19795244)
chr3 (196-262)||(35908506-35908572)
chr3 (283-348)||(25857707-25857773)
chr3 (263-317)||(1151150-1151201)
chr3 (261-349)||(25340169-25340256)
chr3 (352-408)||(29924879-29924935)
chr3 (352-408)||(29974032-29974088)
chr3 (778-834)||(30464147-30464203)
chr3 (770-834)||(36138033-36138097)
chr3 (703-797)||(4189223-4189314)
chr3 (531-670)||(19345656-19345795)
chr3 (176-264)||(33175835-33175922)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (444-931)||(2041-2528)
scaffold0234 (444-931)||(10932-11419)
scaffold0234 (351-408)||(2564-2621)
scaffold0234 (351-408)||(11455-11512)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (444-931)||(18252030-18252517)
chr1 (444-931)||(18532234-18532721)
chr1 (444-931)||(27131130-27131616)
chr1 (446-931)||(27310297-27310782)
chr1 (446-931)||(16358755-16359240)
chr1 (444-931)||(3855639-3856126)
chr1 (450-931)||(36816354-36816834)
chr1 (446-803)||(21171081-21171438)
chr1 (450-931)||(27277278-27277756)
chr1 (444-764)||(22657108-22657429)
chr1 (650-931)||(22641594-22641871)
chr1 (92-322)||(13443906-13444135)
chr1 (175-351)||(50857444-50857620)
chr1 (478-852)||(12014085-12014457)
chr1 (175-331)||(8931153-8931309)
chr1 (456-733)||(9917837-9918106)
chr1 (600-931)||(23507056-23507385)
chr1 (615-931)||(19706439-19706750)
chr1 (615-931)||(43802365-43802676)
chr1 (615-931)||(28134723-28135034)
chr1 (739-931)||(9916497-9916688)
chr1 (478-729)||(12006461-12006712)
chr1 (615-931)||(9456107-9456418)
chr1 (615-931)||(20391239-20391550)
chr1 (615-931)||(20779645-20779956)
chr1 (615-931)||(22670257-22670568)
chr1 (615-931)||(42816989-42817300)
chr1 (104-259)||(23987581-23987736)
chr1 (181-322)||(13441612-13441746)
chr1 (615-931)||(22612483-22612794)
chr1 (129-264)||(28660701-28660835)
chr1 (624-911)||(633934-634216)
chr1 (615-931)||(47667485-47667785)
chr1 (699-931)||(8727741-8727969)
chr1 (352-408)||(18251936-18251992)
chr1 (352-408)||(18532757-18532813)
chr1 (263-342)||(12486314-12486392)
chr1 (175-264)||(31915550-31915638)
chr1 (141-264)||(10925740-10925859)
chr1 (352-408)||(27310821-27310877)
chr1 (692-834)||(29096789-29096928)
chr1 (263-353)||(40804571-40804660)
chr1 (109-264)||(8967738-8967893)
chr1 (699-831)||(21881475-21881604)
chr1 (615-756)||(35930573-35930713)
chr1 (266-343)||(42071413-42071489)
chr1 (352-408)||(16359280-16359336)
chr1 (175-257)||(40058102-40058184)
chr1 (112-191)||(40804701-40804780)
chr1 (351-408)||(21171479-21171536)
chr1 (699-834)||(51997353-51997485)
chr1 (350-408)||(3856164-3856222)
chr1 (199-264)||(12944116-12944182)
chr1 (199-261)||(31913380-31913442)
chr1 (351-405)||(36816881-36816935)
chr1 (262-354)||(12033638-12033730)
chr1 (351-404)||(22657469-22657522)
chr1 (818-931)||(28145723-28145835)
chr1 (450-519)||(30720625-30720694)
chr1 (208-264)||(50713713-50713770)
chr1 (199-260)||(43681465-43681528)
chr1 (222-257)||(10927199-10927234)
chr1 (352-408)||(27131652-27131704)
chr1 (632-758)||(26923553-26923678)
chr1 (474-551)||(3403248-3403325)
chr1 (474-551)||(3443494-3443571)
chr1 (185-265)||(9031016-9031096)
chr1 (761-822)||(24301713-24301774)
chr1 (352-408)||(27277800-27277856)
chr1 (770-829)||(10852402-10852461)
chr1 (264-315)||(42646624-42646674)
chr1 (175-264)||(10928289-10928377)
chr1 (208-264)||(8221488-8221545)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (444-931)||(27380972-27381459)
chr6 (444-931)||(27471355-27471842)
chr6 (446-931)||(17684189-17684674)
chr6 (444-931)||(17691160-17691647)
chr6 (444-931)||(29308890-29309377)
chr6 (444-931)||(29315850-29316336)
chr6 (446-931)||(11651725-11652210)
chr6 (446-931)||(188697-189182)
chr6 (446-714)||(16566257-16566525)
chr6 (692-931)||(27296877-27297116)
chr6 (658-931)||(16394165-16394438)
chr6 (446-914)||(13359010-13359474)
chr6 (690-927)||(25536915-25537152)
chr6 (711-930)||(16559193-16559412)
chr6 (446-662)||(25537148-25537364)
chr6 (92-331)||(3535967-3536207)
chr6 (172-331)||(3542178-3542337)
chr6 (161-351)||(30049829-30050019)
chr6 (161-351)||(30052116-30052306)
chr6 (179-348)||(29340810-29340980)
chr6 (482-828)||(17850321-17850663)
chr6 (467-797)||(27925772-27926103)
chr6 (483-748)||(20553492-20553755)
chr6 (62-216)||(11190516-11190669)
chr6 (615-931)||(16789062-16789373)
chr6 (615-931)||(22859888-22860199)
chr6 (615-931)||(27508347-27508658)
chr6 (615-931)||(1586108-1586419)
chr6 (615-917)||(27527947-27528244)
chr6 (261-351)||(11190412-11190500)
chr6 (627-921)||(2669476-2669768)
chr6 (615-790)||(18019981-18020152)
chr6 (114-257)||(18718139-18718279)
chr6 (113-259)||(8048904-8049049)
chr6 (463-862)||(8509941-8510338)
chr6 (615-909)||(10359073-10359360)
chr6 (615-931)||(14074471-14074782)
chr6 (642-747)||(28172754-28172859)
chr6 (482-834)||(20736425-20736773)
chr6 (615-931)||(8612906-8613221)
chr6 (354-408)||(17691683-17691737)
chr6 (351-408)||(27381495-27381552)
chr6 (351-408)||(27471878-27471935)
chr6 (351-408)||(29308797-29308854)
chr6 (351-408)||(29315757-29315814)
chr6 (196-260)||(11658936-11659000)
chr6 (692-834)||(21994655-21994794)
chr6 (261-343)||(26571071-26571152)
chr6 (175-264)||(27822118-27822207)
chr6 (175-264)||(33615504-33615593)
chr6 (351-408)||(17684712-17684769)
chr6 (111-175)||(24443009-24443073)
chr6 (175-227)||(29342061-29342113)
chr6 (352-406)||(11651630-11651684)
chr6 (351-408)||(25537405-25537462)
chr6 (261-348)||(3565652-3565739)
chr6 (284-350)||(2339157-2339223)
chr6 (645-759)||(19347092-19347205)
chr6 (622-834)||(19218427-19218630)
chr6 (623-803)||(22560311-22560487)
chr6 (130-264)||(14238436-14238568)
chr6 (692-931)||(17120505-17120740)
chr6 (775-914)||(28756145-28756283)
chr6 (451-506)||(31258065-31258120)
chr6 (351-408)||(13359512-13359569)
chr6 (818-931)||(33317055-33317167)
chr6 (699-834)||(5758577-5758709)
chr6 (615-719)||(13995151-13995254)
chr6 (360-408)||(16566563-16566611)
chr6 (185-257)||(18727115-18727186)
chr6 (790-844)||(28172899-28172954)
chr6 (199-260)||(1127258-1127320)
chr6 (622-834)||(4073574-4073781)
chr6 (199-264)||(12882123-12882189)
chr6 (263-321)||(13645898-13645955)
chr6 (352-408)||(189221-189280)
chr6 (262-321)||(2939780-2939837)
chr6 (366-408)||(16394484-16394526)
chr6 (283-317)||(19232329-19232363)
chr6 (1-50)||(11190699-11190748)
chr6 (460-525)||(22259925-22259990)
[»] chr4 (108 HSPs)
chr4 (444-931)||(55612683-55613170)
chr4 (444-931)||(19926480-19926967)
chr4 (444-931)||(26970463-26970950)
chr4 (446-931)||(18262214-18262699)
chr4 (444-931)||(5707320-5707807)
chr4 (444-931)||(26963640-26964127)
chr4 (444-931)||(868597-869084)
chr4 (444-931)||(5713948-5714435)
chr4 (446-931)||(18269070-18269560)
chr4 (444-931)||(10621053-10621540)
chr4 (444-931)||(10628132-10628619)
chr4 (446-931)||(28392854-28393339)
chr4 (456-931)||(8858179-8858654)
chr4 (456-931)||(8845215-8845690)
chr4 (446-931)||(4426336-4426808)
chr4 (450-931)||(5667849-5668327)
chr4 (450-931)||(35223576-35224047)
chr4 (452-935)||(20311299-20311781)
chr4 (174-353)||(6659330-6659508)
chr4 (699-931)||(10677303-10677534)
chr4 (699-931)||(10890943-10891174)
chr4 (444-559)||(12357136-12357251)
chr4 (615-931)||(15461488-15461799)
chr4 (615-931)||(34975542-34975853)
chr4 (482-756)||(56516094-56516368)
chr4 (446-915)||(5616215-5616681)
chr4 (470-830)||(21453961-21454319)
chr4 (615-931)||(2677004-2677315)
chr4 (615-931)||(15815012-15815323)
chr4 (615-931)||(18111043-18111354)
chr4 (615-931)||(3369023-3369334)
chr4 (615-931)||(17299959-17300270)
chr4 (450-668)||(10677538-10677753)
chr4 (450-668)||(10891178-10891393)
chr4 (615-931)||(18163153-18163464)
chr4 (615-931)||(20243928-20244239)
chr4 (615-931)||(26531604-26531915)
chr4 (261-351)||(13085178-13085268)
chr4 (615-931)||(4675983-4676294)
chr4 (625-931)||(5870419-5870720)
chr4 (615-931)||(1941715-1942026)
chr4 (692-915)||(19365586-19365806)
chr4 (113-264)||(13991318-13991468)
chr4 (645-931)||(32646523-32646807)
chr4 (55-264)||(7723959-7724163)
chr4 (692-914)||(19362477-19362695)
chr4 (615-829)||(32636475-32636685)
chr4 (261-351)||(13086221-13086311)
chr4 (104-264)||(54700527-54700686)
chr4 (261-331)||(22716590-22716661)
chr4 (351-408)||(5713855-5713912)
chr4 (351-408)||(26963547-26963604)
chr4 (351-408)||(26970370-26970427)
chr4 (352-408)||(19927003-19927059)
chr4 (263-322)||(22691253-22691312)
chr4 (261-331)||(22988556-22988627)
chr4 (351-408)||(10621576-10621633)
chr4 (711-931)||(30040489-30040705)
chr4 (352-408)||(5707228-5707284)
chr4 (176-264)||(7723665-7723751)
chr4 (352-408)||(12357044-12357100)
chr4 (354-408)||(868507-868561)
chr4 (628-706)||(24700213-24700291)
chr4 (699-931)||(9487625-9487853)
chr4 (680-834)||(33888594-33888743)
chr4 (692-915)||(5528495-5528714)
chr4 (352-408)||(10628655-10628711)
chr4 (352-408)||(17142372-17142428)
chr4 (671-798)||(34777850-34777975)
chr4 (352-408)||(55612594-55612650)
chr4 (262-343)||(2053095-2053176)
chr4 (131-260)||(7634084-7634212)
chr4 (714-931)||(11421096-11421309)
chr4 (174-264)||(24667657-24667746)
chr4 (352-406)||(28393380-28393434)
chr4 (699-915)||(9538033-9538244)
chr4 (351-408)||(18268975-18269032)
chr4 (352-408)||(4426847-4426903)
chr4 (615-834)||(4546071-4546286)
chr4 (261-352)||(9596853-9596944)
chr4 (175-264)||(19935487-19935575)
chr4 (104-165)||(22691327-22691388)
chr4 (265-348)||(4053062-4053145)
chr4 (493-560)||(39074278-39074346)
chr4 (92-258)||(50515822-50515978)
chr4 (174-260)||(40206153-40206238)
chr4 (208-264)||(21433595-21433652)
chr4 (359-408)||(55992680-55992729)
chr4 (208-267)||(18689553-18689613)
chr4 (209-264)||(38888023-38888079)
chr4 (202-260)||(10494907-10494966)
chr4 (199-261)||(22486799-22486861)
chr4 (266-341)||(54239531-54239604)
chr4 (204-261)||(18657070-18657128)
chr4 (367-408)||(5668371-5668412)
chr4 (803-852)||(24701361-24701410)
chr4 (264-349)||(38223117-38223200)
chr4 (360-408)||(8845118-8845166)
chr4 (360-408)||(8858082-8858130)
chr4 (368-408)||(18262136-18262176)
chr4 (267-354)||(34949082-34949169)
chr4 (581-661)||(39074190-39074270)
chr4 (494-553)||(11161913-11161972)
chr4 (263-322)||(19684822-19684880)
chr4 (600-682)||(9937933-9938015)
chr4 (354-408)||(20311207-20311261)
chr4 (227-264)||(9260573-9260610)
chr4 (227-264)||(13990729-13990766)
[»] chr7 (100 HSPs)
chr7 (444-931)||(29327784-29328271)
chr7 (446-927)||(15152445-15152926)
chr7 (444-931)||(11535782-11536269)
chr7 (444-931)||(11542700-11543187)
chr7 (446-931)||(12750828-12751313)
chr7 (450-931)||(12738542-12739023)
chr7 (446-931)||(18561009-18561485)
chr7 (446-937)||(18257559-18258047)
chr7 (450-931)||(13392157-13392637)
chr7 (1-277)||(13885984-13886261)
chr7 (446-665)||(15148144-15148363)
chr7 (9-297)||(1220274-1220562)
chr7 (175-351)||(13882686-13882862)
chr7 (175-322)||(859156-859303)
chr7 (175-322)||(1217160-1217307)
chr7 (232-351)||(13886245-13886364)
chr7 (64-264)||(1883489-1883689)
chr7 (624-931)||(8464999-8465301)
chr7 (615-931)||(2204543-2204854)
chr7 (615-931)||(18400095-18400406)
chr7 (615-931)||(18407079-18407390)
chr7 (615-931)||(48808496-48808807)
chr7 (615-931)||(15729742-15730053)
chr7 (615-931)||(18139338-18139649)
chr7 (615-931)||(19230879-19231190)
chr7 (615-919)||(30254129-30254428)
chr7 (692-931)||(41680968-41681203)
chr7 (691-931)||(2365169-2365407)
chr7 (124-264)||(1365672-1365810)
chr7 (142-264)||(1874538-1874660)
chr7 (477-702)||(7396221-7396450)
chr7 (615-919)||(47166871-47167170)
chr7 (466-662)||(2364917-2365112)
chr7 (615-931)||(10668901-10669213)
chr7 (112-216)||(4300525-4300629)
chr7 (261-351)||(4303363-4303453)
chr7 (261-352)||(31577269-31577360)
chr7 (450-724)||(39111819-39112092)
chr7 (643-756)||(10235361-10235474)
chr7 (625-909)||(24443349-24443628)
chr7 (615-931)||(28130552-28130863)
chr7 (518-757)||(3132748-3132986)
chr7 (175-260)||(4888686-4888770)
chr7 (582-747)||(7662569-7662733)
chr7 (351-408)||(11543223-11543280)
chr7 (113-264)||(24840143-24840287)
chr7 (699-931)||(34128647-34128875)
chr7 (352-408)||(2653275-2653331)
chr7 (352-408)||(12738443-12738499)
chr7 (692-931)||(18259124-18259359)
chr7 (197-264)||(27309636-27309704)
chr7 (351-408)||(11536305-11536362)
chr7 (351-408)||(12750732-12750789)
chr7 (351-408)||(15152349-15152406)
chr7 (616-834)||(19388544-19388762)
chr7 (185-264)||(1786683-1786763)
chr7 (699-834)||(14591924-14592056)
chr7 (699-834)||(16011515-16011647)
chr7 (622-909)||(25845498-25845780)
chr7 (622-909)||(25845917-25846199)
chr7 (351-407)||(29327689-29327745)
chr7 (625-733)||(47833875-47833983)
chr7 (615-893)||(19393462-19393735)
chr7 (706-832)||(31190537-31190660)
chr7 (183-241)||(29175780-29175838)
chr7 (699-831)||(22969024-22969153)
chr7 (352-408)||(15148049-15148105)
chr7 (209-264)||(27142666-27142722)
chr7 (199-261)||(5934607-5934670)
chr7 (782-857)||(22948499-22948574)
chr7 (202-264)||(3778735-3778797)
chr7 (175-264)||(7803031-7803120)
chr7 (131-260)||(8916334-8916462)
chr7 (199-264)||(11000849-11000915)
chr7 (743-931)||(15169290-15169474)
chr7 (199-260)||(30217819-30217879)
chr7 (783-920)||(39112138-39112275)
chr7 (351-407)||(13392029-13392085)
chr7 (624-724)||(19859122-19859221)
chr7 (101-216)||(22572344-22572459)
chr7 (261-317)||(22572475-22572530)
chr7 (261-351)||(5678299-5678388)
chr7 (261-351)||(5703351-5703440)
chr7 (199-264)||(1369805-1369871)
chr7 (199-264)||(11228721-11228787)
chr7 (208-260)||(1753630-1753683)
chr7 (494-559)||(10234179-10234244)
chr7 (352-408)||(18258087-18258143)
chr7 (3-49)||(1883737-1883783)
chr7 (689-731)||(7396469-7396511)
chr7 (203-257)||(8063831-8063885)
chr7 (310-351)||(4300470-4300511)
chr7 (267-351)||(4668258-4668342)
chr7 (208-264)||(11228981-11229038)
chr7 (444-476)||(2653207-2653239)
chr7 (352-408)||(18560913-18560969)
chr7 (202-264)||(6451776-6451839)
chr7 (263-317)||(32052989-32053041)
chr7 (284-343)||(32936869-32936926)
chr7 (199-264)||(35814871-35814936)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (444-930)||(21940665-21941151)
chr8 (446-931)||(22171491-22171974)
chr8 (450-931)||(6094129-6094610)
chr8 (450-931)||(24642655-24643135)
chr8 (3-349)||(22511875-22512220)
chr8 (668-931)||(15326422-15326685)
chr8 (668-931)||(15506791-15507054)
chr8 (3-298)||(22519175-22519469)
chr8 (3-351)||(37189780-37190127)
chr8 (92-351)||(42891584-42891840)
chr8 (92-343)||(22926564-22926816)
chr8 (446-645)||(28554885-28555084)
chr8 (175-348)||(22921850-22922023)
chr8 (92-351)||(42890311-42890561)
chr8 (175-343)||(22520799-22520967)
chr8 (174-351)||(6845249-6845426)
chr8 (790-931)||(28548393-28548534)
chr8 (183-331)||(23570516-23570665)
chr8 (456-915)||(38232115-38232570)
chr8 (540-864)||(14983710-14984030)
chr8 (450-577)||(24636860-24636987)
chr8 (619-816)||(24797224-24797419)
chr8 (615-931)||(8371253-8371564)
chr8 (615-931)||(21969324-21969635)
chr8 (615-931)||(12562114-12562425)
chr8 (208-331)||(23573515-23573639)
chr8 (615-931)||(27007517-27007828)
chr8 (615-931)||(27014660-27014971)
chr8 (615-931)||(27880487-27880798)
chr8 (615-931)||(28020668-28020979)
chr8 (142-264)||(2189689-2189810)
chr8 (262-351)||(18180770-18180859)
chr8 (615-931)||(22130609-22130920)
chr8 (615-931)||(25611186-25611497)
chr8 (104-264)||(2687742-2687901)
chr8 (625-931)||(22659494-22659795)
chr8 (113-264)||(26374900-26375050)
chr8 (615-931)||(21916667-21916978)
chr8 (615-931)||(45534273-45534584)
chr8 (615-931)||(26240475-26240786)
chr8 (465-822)||(2375027-2375386)
chr8 (92-216)||(18180630-18180753)
chr8 (474-751)||(32872741-32873019)
chr8 (104-264)||(16598249-16598409)
chr8 (615-834)||(18835341-18835556)
chr8 (175-264)||(18468649-18468737)
chr8 (692-931)||(6430953-6431188)
chr8 (700-834)||(8781971-8782102)
chr8 (352-408)||(21940573-21940629)
chr8 (352-408)||(22070108-22070164)
chr8 (99-264)||(24578702-24578866)
chr8 (175-260)||(24731231-24731316)
chr8 (351-408)||(22171395-22171452)
chr8 (351-404)||(24642555-24642608)
chr8 (352-408)||(6094031-6094087)
chr8 (351-408)||(28554790-28554847)
chr8 (728-915)||(20535226-20535409)
chr8 (285-351)||(26150602-26150669)
chr8 (824-921)||(24796731-24796826)
chr8 (692-931)||(2962932-2963171)
chr8 (174-261)||(24731035-24731122)
chr8 (643-721)||(29645553-29645631)
chr8 (818-935)||(2375411-2375528)
chr8 (671-723)||(10920427-10920479)
chr8 (262-342)||(15081494-15081572)
chr8 (261-349)||(38082173-38082260)
chr8 (482-545)||(10920234-10920297)
chr8 (261-352)||(4360891-4360983)
chr8 (227-264)||(2609547-2609584)
chr8 (262-343)||(9295256-9295335)
chr8 (185-264)||(14130165-14130244)
chr8 (209-264)||(20693799-20693855)
chr8 (643-698)||(24535514-24535569)
chr8 (175-234)||(26378031-26378089)
chr8 (122-264)||(31072069-31072216)
chr8 (351-405)||(2374946-2375000)
chr8 (818-936)||(36970439-36970556)
chr8 (227-264)||(2689146-2689183)
chr8 (870-931)||(8968015-8968076)
chr8 (352-389)||(24636605-24636642)
chr8 (782-827)||(29645675-29645720)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (444-931)||(6654-7141)
scaffold0390 (444-931)||(13670-14157)
scaffold0390 (351-408)||(7177-7234)
scaffold0390 (352-408)||(14193-14249)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (444-931)||(18288-18774)
scaffold0220 (352-408)||(18196-18252)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (444-931)||(21329968-21330455)
chr2 (444-931)||(18796506-18796993)
chr2 (446-937)||(18619807-18620296)
chr2 (113-351)||(27956093-27956330)
chr2 (92-343)||(2155887-2156139)
chr2 (175-351)||(27952318-27952494)
chr2 (114-353)||(31634015-31634254)
chr2 (478-931)||(36270199-36270650)
chr2 (174-331)||(22011368-22011526)
chr2 (174-351)||(33655540-33655717)
chr2 (174-354)||(31636247-31636427)
chr2 (478-919)||(18822115-18822556)
chr2 (509-931)||(20977957-20978360)
chr2 (606-931)||(22183206-22183528)
chr2 (113-264)||(33051618-33051769)
chr2 (619-917)||(6991847-6992146)
chr2 (142-264)||(36647293-36647414)
chr2 (615-931)||(30174368-30174679)
chr2 (615-931)||(24250032-24250343)
chr2 (450-589)||(19692598-19692737)
chr2 (564-754)||(18851956-18852146)
chr2 (114-259)||(28737911-28738054)
chr2 (615-931)||(24229215-24229526)
chr2 (601-756)||(19279445-19279600)
chr2 (175-264)||(15129390-15129478)
chr2 (692-919)||(15342014-15342237)
chr2 (261-349)||(8781429-8781515)
chr2 (352-408)||(21330493-21330549)
chr2 (768-931)||(17241034-17241196)
chr2 (699-933)||(29800545-29800775)
chr2 (261-351)||(22264348-22264437)
chr2 (175-259)||(2165899-2165983)
chr2 (97-264)||(32163694-32163860)
chr2 (701-906)||(41316305-41316506)
chr2 (641-733)||(36801899-36801992)
chr2 (699-834)||(21626824-21626955)
chr2 (199-264)||(23457646-23457712)
chr2 (261-322)||(44675308-44675368)
chr2 (699-834)||(19616509-19616641)
chr2 (699-833)||(40301034-40301164)
chr2 (186-264)||(5171596-5171674)
chr2 (186-264)||(21772375-21772452)
chr2 (112-178)||(23456638-23456704)
chr2 (200-264)||(32161993-32162058)
chr2 (209-264)||(12966477-12966532)
chr2 (864-931)||(41661694-41661761)
chr2 (175-264)||(1518193-1518281)
chr2 (264-351)||(18725683-18725770)
chr2 (263-348)||(2165838-2165924)
chr2 (262-348)||(5841221-5841305)
chr2 (199-260)||(8294582-8294644)
chr2 (615-733)||(24763751-24763868)
chr2 (351-408)||(19692773-19692830)
chr2 (784-852)||(36799757-36799826)
chr2 (770-834)||(28740922-28740986)
chr2 (209-259)||(23456580-23456631)
chr2 (230-264)||(4184929-4184963)
chr2 (199-260)||(28737841-28737903)
chr2 (615-660)||(12098609-12098654)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (444-931)||(24695186-24695673)
chr5 (446-931)||(19714218-19714703)
chr5 (444-931)||(18569581-18570070)
chr5 (450-931)||(19706939-19707419)
chr5 (12-351)||(21848802-21849147)
chr5 (557-809)||(39538701-39538953)
chr5 (450-798)||(22546872-22547217)
chr5 (448-931)||(17285470-17285935)
chr5 (175-351)||(40778786-40778962)
chr5 (448-931)||(17298621-17299088)
chr5 (510-837)||(18806850-18807175)
chr5 (449-704)||(27347425-27347679)
chr5 (757-935)||(27347252-27347428)
chr5 (824-931)||(24701950-24702057)
chr5 (615-931)||(20941018-20941329)
chr5 (615-931)||(25805385-25805696)
chr5 (615-931)||(31890-32201)
chr5 (615-931)||(12789663-12789974)
chr5 (615-931)||(22941241-22941552)
chr5 (615-931)||(23545913-23546224)
chr5 (111-264)||(19497240-19497393)
chr5 (615-931)||(24933306-24933617)
chr5 (615-931)||(31096807-31097118)
chr5 (626-919)||(20100255-20100543)
chr5 (444-553)||(39537962-39538071)
chr5 (615-931)||(5097642-5097953)
chr5 (615-931)||(12764990-12765305)
chr5 (712-837)||(18806490-18806613)
chr5 (712-837)||(18806670-18806793)
chr5 (615-931)||(7865430-7865745)
chr5 (351-408)||(24695709-24695766)
chr5 (450-553)||(31886537-31886640)
chr5 (615-931)||(9811733-9812048)
chr5 (615-931)||(12703874-12704189)
chr5 (682-837)||(18829377-18829530)
chr5 (615-931)||(26245093-26245404)
chr5 (109-173)||(9868337-9868400)
chr5 (352-408)||(19714742-19714798)
chr5 (692-935)||(26129689-26129928)
chr5 (261-343)||(19677217-19677298)
chr5 (350-408)||(19707462-19707520)
chr5 (846-935)||(28719471-28719558)
chr5 (352-408)||(27347722-27347778)
chr5 (175-264)||(18252416-18252504)
chr5 (175-261)||(8456380-8456465)
chr5 (185-264)||(22440858-22440936)
chr5 (348-408)||(18570108-18570168)
chr5 (470-756)||(33477193-33477479)
chr5 (199-264)||(492567-492633)
chr5 (854-931)||(39538958-39539035)
chr5 (352-407)||(39537870-39537925)
chr5 (175-264)||(26140343-26140431)
chr5 (262-348)||(35160815-35160899)
chr5 (175-206)||(21844437-21844468)
chr5 (702-798)||(31651917-31652009)
chr5 (494-562)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (444-931)||(7107-7594)
scaffold0433 (351-408)||(7014-7071)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (444-935)||(25706-26197)
scaffold0186 (351-407)||(26231-26287)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (444-912)||(993-1461)
scaffold0657 (352-408)||(901-957)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (446-935)||(5531-6013)
scaffold0063 (351-408)||(5435-5492)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (675-931)||(230111-230367)
scaffold0008 (446-627)||(230365-230545)
scaffold0008 (352-408)||(230584-230640)
[»] scaffold0110 (3 HSPs)
scaffold0110 (175-348)||(45262-45435)
scaffold0110 (155-248)||(46713-46806)
scaffold0110 (263-351)||(46792-46880)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (615-931)||(174-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (615-931)||(3675-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (615-931)||(119721-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (615-919)||(12961-13260)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (615-893)||(130262-130535)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (615-931)||(67374-67685)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (615-834)||(8296-8511)
[»] scaffold0240 (3 HSPs)
scaffold0240 (112-260)||(16051-16196)
scaffold0240 (121-261)||(14850-14988)
scaffold0240 (125-264)||(1658-1797)
[»] scaffold0531 (1 HSPs)
scaffold0531 (113-259)||(11527-11672)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (692-931)||(26609-26844)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (16-180)||(14920-15084)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (624-931)||(39988-40290)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (601-747)||(90019-90166)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (444-508)||(8446-8510)
scaffold0176 (351-408)||(8546-8603)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (351-408)||(23769-23826)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (701-903)||(8807-9005)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (351-408)||(16522-16579)
scaffold0326 (444-477)||(16615-16648)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (741-931)||(102-288)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (699-834)||(83111-83243)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (203-261)||(37714-37772)
scaffold0054 (211-264)||(49322-49375)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (351-408)||(41-98)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (352-408)||(8944-9000)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (699-931)||(11526-11758)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (262-351)||(8243-8331)
scaffold0251 (199-264)||(9702-9769)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (125-264)||(17640-17779)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (354-408)||(10202-10256)
scaffold0565 (463-494)||(10127-10158)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (663-754)||(45956-46051)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (352-388)||(1-37)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (692-931)||(53832-54066)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (473-709)||(92194-92432)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (199-264)||(145734-145800)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (711-807)||(11328-11421)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (351-404)||(5877-5930)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (196-260)||(16402-16466)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (284-317)||(28711-28744)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 6110064 - 6110551
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110064 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 6110163  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6110164 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6110263  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110264 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6110363  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6110364 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6110463  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110464 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10572799 - 10572312
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572799 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10572700  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10572699 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10572600  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572599 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10572500  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10572499 gaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtaga 10572400  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572399 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15601091 - 15600604
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601091 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15600992  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15600991 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15600892  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600891 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15600792  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15600791 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15600692  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15600691 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15607636 - 15607149
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607636 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15607537  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15607536 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15607437  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607436 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15607337  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15607336 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15607237  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15607236 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 16482688 - 16482203
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482688 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16482589  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16482588 cccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16482489  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482488 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16482389  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482388 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16482289  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482288 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10579556 - 10579075
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579556 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttaaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 10579457  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10579456 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 10579357  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579356 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 10579257  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10579256 tacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 10579157  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579156 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17781319 - 17780838
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781319 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 17781220  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17781219 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 17781120  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781119 atcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 17781020  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17781019 tacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17780920  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780919 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 927
Target Start/End: Original strand, 18522665 - 18523146
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522665 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18522764  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18522765 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagact 18522864  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18522865 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaa 18522964  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18522965 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18523064  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 927  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523065 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 8490488 - 8490982
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490488 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 8490587  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta-------ttatgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  8490588 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactacagacgattatgt 8490687  T
Q  637 aggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatcc 736  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8490688 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 8490787  T
Q  737 gccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 836  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490788 gccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 8490887  T
Q  837 ccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490888 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 447 - 931
Target Start/End: Original strand, 13211305 - 13211789
Alignment:
Q  447 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211305 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 13211404  T
Q  547 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13211405 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 13211504  T
Q  647 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 746  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211505 atgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 13211604  T
Q  747 tactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgt 846  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  13211605 tattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgt 13211704  T
Q  847 tggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211705 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 13248607 - 13249094
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248607 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 13248706  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13248707 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtaga 13248806  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13248807 ctgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatga 13248906  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13248907 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctaga 13249006  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249007 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15357793 - 15357306
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357793 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15357694  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15357693 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtaga 15357594  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357593 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatga 15357494  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357493 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15357394  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 18519980 - 18520462
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519980 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18520079  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520080 cccgttaaacataaggaaactattcttaaa---tccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18520176  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18520177 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgaga 18520276  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18520277 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatg 18520376  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520377 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 463 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15342407 - 15341939
Alignment:
Q  463 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342407 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagtttgttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 15342308  T
Q  563 aactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcaca 662  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15342307 acctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 15342208  T
Q  663 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 762  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15342207 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaa 15342108  T
Q  763 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgcttt 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15342107 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 15342008  T
Q  863 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342007 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 32057101 - 32056619
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32057101 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacatcaagtataactttattgtaagaccccg 32057002  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  32057001 ttaaacataaagaaactattcttaaagtgtccgtagtcaaactttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatg 32056902  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056901 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 32056802  T
Q  749 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttg 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32056801 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttg 32056702  T
Q  849 gagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056701 gagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 17200389 - 17199900
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200389 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgatac 17200290  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17200289 ccctttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagttaagctttattgagatgtgtgatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 17200190  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17200189 gatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgaga 17200090  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17200089 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatg 17199990  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199989 ttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 13516813 - 13517294
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516813 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttcatggaacattaagtataacttaattgtgagac 13516912  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13516913 cccgttaaacataaggaaacgattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagact 13517012  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13517013 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgaga 13517112  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13517113 atactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 13517208  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13517209 ttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 1647726 - 1647241
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataa----cttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1647726 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataattaacttaattgtgagac 1647627  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  1647626 cccgttaaacataaggaaactatttttaaagtatccgtaatcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagact 1647527  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  1647526 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgaga 1647427  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  1647426 atactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatg 1647327  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647326 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 29924971 - 29925458
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29924971 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29925070  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||    
T  29925071 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29925170  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  29925171 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29925270  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29925271 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29925370  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925371 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 29974124 - 29974611
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29974124 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29974223  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||    
T  29974224 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29974323  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  29974324 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29974423  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29974424 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29974523  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974524 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 16200434 - 16200917
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200434 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200532  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
     ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||    
T  16200533 tccaataaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactatt-tgtggagagact 16200631  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16200632 gatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgaga 16200731  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16200732 atactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16200831  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200832 ttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 550 - 931
Target Start/End: Original strand, 17136465 - 17136840
Alignment:
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17136465 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatg 17136564  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17136565 atcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 17136658  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17136659 tacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17136758  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136759 agtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 450 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19089946 - 19089734
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089946 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccct 19089847  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089846 ttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatg 19089747  T
Q  650 atcacatctcaca 662  Q
    |||||||||||||    
T  19089746 atcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 43306591 - 43306819
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43306591 caaactctgccctcgtcacag-ttgatctcccatggctgatc-cgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 43306688  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43306689 gtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcaacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 43306788  T
Q  292 gtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43306789 gtttccgtaatccaccagaattgagagaaaa 43306819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5128998 - 5128822
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128998 tgacgcagtacagaagcgtagggttagcaggcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 5128899  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128898 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 5128822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 113 - 322
Target Start/End: Original strand, 3068813 - 3069022
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3068813 gttgatctcccatggcttatcatgttaggaagagaacaggagaaacatgctctaataccaactgacgcagtacggaagcgtatggttagcaagcgctaaa 3068912  T
Q  213 cctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3068913 cctagatagaaaagaacaagtttgcaaggaaaaaacttgtaaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccaaaat 3069012  T
Q  313 tgagagaaaa 322  Q
    ||||||||||    
T  3069013 tgagagaaaa 3069022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 444 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 18640953 - 18640792
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640953 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18640854  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640853 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtg 18640792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 451 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 24253589 - 24253197
Alignment:
Q  451 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-cccca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24253589 atttctttattgattttgttttacttcaaaataataaagtccttagaatagctcgttcgtttgatggaacattaagtatgacttaatcgtgagatcccca 24253490  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||| |||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24253489 tcaaacataaggacactattcttaaagtatatgtggtcaaaatttattgtaaagtgaggtaacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatg 24253390  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||     
T  24253389 atcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataa 24253290  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgt 846  Q
    | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24253289 tgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgt 24253197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 446 - 683
Target Start/End: Original strand, 16200128 - 16200363
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200128 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagttcgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200226  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  16200227 cccattaaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatatcattaaagcatggagactatt-tgtggagagact 16200325  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 683  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200326 gatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 175 - 331
Target Start/End: Original strand, 43303960 - 43304117
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43303960 tgacgcagtacggaagcgtaaggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 43304059  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43304060 aacctattaaaataagggtttccgaaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaata 43304117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 331
Target Start/End: Original strand, 3063736 - 3063894
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3063736 ctgacgcagtacgaaagcgtagggttagcaagcgttaaacctagatagaaaagaaagagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 3063835  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3063836 aaacctatcaaaataagggttttcggaatcaaccagaattgagagaaaagtctcgaata 3063894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 21034229 - 21034540
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  21034229 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21034327  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21034328 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21034424  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  21034425 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 21034523  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21034524 gtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15846847 - 15846536
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15846847 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15846749  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15846748 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15846652  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15846651 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15846553  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15846552 gtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 20147865 - 20147554
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  20147865 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20147767  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20147766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20147670  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20147669 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20147571  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20147570 gcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 624 - 931
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  724 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 823  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 923  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  924 gaatcatg 931  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 55427012 - 55427323
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  55427012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 55427110  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  55427111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 55427207  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  55427208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 55427306  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  55427307 gtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 624 - 931
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  724 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 823  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 923  Q
    ||| |||| ||  |  |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  924 gaatcatg 931  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 12299902 - 12300212
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||    
T  12299902 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagt 12299999  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12300000 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12300096  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12300097 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12300195  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12300196 gtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 833
Target Start/End: Original strand, 14147012 - 14147226
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||     
T  14147012 taaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagg 14147110  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |    
T  14147111 aatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactc 14147207  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactat 833  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14147208 ttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 338
Target Start/End: Original strand, 40593528 - 40593605
Alignment:
Q  260 gggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40593528 gggttgcaagcgacaaacctatcaaa-taagggttttcggaatccaccaaaattgagagaaaatctcgaataattttat 40593605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53013025 - 53012958
Alignment:
Q  265 gcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53013025 gcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaata 53012958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 350 - 408
Target Start/End: Original strand, 6109970 - 6110028
Alignment:
Q  350 gttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109970 gttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 6110028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 446 - 508
Target Start/End: Original strand, 18534758 - 18534820
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18534758 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccatagaatagttagtcc 18534820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 13248514 - 13248571
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248514 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 13248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 8490396 - 8490452
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490396 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 8490452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 699 - 897
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 897  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 13211210 - 13211267
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13211210 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 13211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18641045 - 18640989
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18641045 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 18640989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41218806 - 41218724
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaat 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  41218806 ggttgtaagcgacaaacctatcaaa-taaggctttccggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaatattattattgaat 41218724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4580565 - 4580479
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4580565 ggttgcaagcgacaaacctatcaaa-taagggttttcagaatccactagaattgagagaaaattctcgaat-attttattgaatgaaaa 4580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15607732 - 15607672
Alignment:
Q  349 agttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15607732 agttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggctttgtatcatg 15607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 17136137 - 17136193
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17136137 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 17136193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 178
Target Start/End: Original strand, 368791 - 368874
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgac 178  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  368791 caaactctgccctcgtcatcggttgatctcccatggctgatc-cgttagaaaaaga--aggagaaacctgctctgataacaactgac 368874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10579653 - 10579603
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10579653 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgt 10579603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 746 - 931
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || ||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    | ||| |  || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088324 t-ggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 665 - 798
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280444
Alignment:
Q  665 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 764  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  765 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgata 32280444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Original strand, 2472689 - 2472777
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2472689 tgacgcagtacgaaagcgtaggct-agcaagcgctaaacctaaattgaaagagacaagtttgcaaccgacaaacttgtgaaaatagggtt 2472777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15351294 - 15351237
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15351294 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15351237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15357886 - 15357829
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15357886 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15357829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17200484 - 17200427
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17200484 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgggtttggctttgtagcatg 17200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 491
Target Start/End: Original strand, 18510924 - 18510969
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510924 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 18510969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-atattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  || |||||  |  | |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16482782 - 16482727
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482782 tgttagaataagccctaata-ccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 16482727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 18519885 - 18519941
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18519885 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 18519941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52708923 - 52708844
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaa-gaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  52708923 cggaagcgtagg-ttaacaagcgctaaacctagatagaaaaagaacaaatttgcaagcgataaacttgtgaaagtagggtt 52708844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10572891 - 10572840
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10572891 ttgttggaataagccctaatagccaacctatattgattgggtttgactttgt 10572840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 45168338 - 45168401
Alignment:
Q  194 agggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45168338 agggttagcaagtgctaaacctagattgaaataaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 45168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 607 - 709
Target Start/End: Original strand, 9504446 - 9504548
Alignment:
Q  607 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 706  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  9504446 gatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaata 9504545  T
Q  707 tta 709  Q
    |||    
T  9504546 tta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317176
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15601185 - 15601127
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15601185 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggatttgtatcatg 15601127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Original strand, 365593 - 365681
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  365593 tgacgcattacggaagcgtaggct-agcaaacgctaaacctaaaaagaaaataacaaattcccaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 365681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 13516718 - 13516775
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13516718 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgagtttggctgtgtatcatg 13516775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17781415 - 17781358
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17781415 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 17781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19090042 - 19089985
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19090042 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 19089985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 349
Target Start/End: Original strand, 20398486 - 20398574
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||| |||||    
T  20398486 ggttgcaagcgacaagtctatcaaa-taagggttttcggaatccaccagaattgagaaaaaagtctcgaatatttttcttaaataaaaaa 20398574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1647824 - 1647768
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647824 tgttggagtaagccctaatagctggtctatattgattgggtttggctttgtatcatg 1647768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32057200 - 32057144
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32057200 tgttggagtaagctctaatagccaatctatgttgattgggtttgactttgtatcatg 32057144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 792
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  663 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 761  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | |||| |||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  762 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 792  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Original strand, 33620096 - 33620181
Alignment:
Q  264 tgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagag-aaaatctcgaataattttattgaatcaaaaag 350  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  33620096 tgcaagcgcaaaacctatcaaa-taagggtttccagaatcctccagaattgagagaaaaatctcg-atatttttattgaattaaaaag 33620181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 349
Target Start/End: Original strand, 39913348 - 39913403
Alignment:
Q  295 tccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39913348 tccggaatccaccagaattgggagaaaagtctcgaatatttttattgaatcaaaaa 39913403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19950004 - 19949927
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttatt 339  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  19950004 gttgcaagcgacaaacttatcaaa-taagggtttttggaatccatcagaattgagagaaaagtctctaatatttttatt 19949927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 642 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 8252026 - 8251933
Alignment:
Q  642 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatc 735  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8252026 gactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatatttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 18510828 - 18510885
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18510828 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18510885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 18522569 - 18522626
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18522569 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 18534662 - 18534719
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18534662 ttgttgtagtaagccctaatagtcaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 18534719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Original strand, 45168410 - 45168466
Alignment:
Q  294 ttccggaatccaccagaa-ttgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45168410 ttccagaatccacaagaaattgagagaaaatctcgaataattttattgaataaaaaa 45168466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19795244 - 19795168
Alignment:
Q  271 gacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    |||||||||||  ||||||||  || || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19795244 gacaaacctatgcaaataagg--ttacgaaatccaccaaaatttagagaaaatctggaataattttattgaataaaaaa 19795168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 262
Target Start/End: Original strand, 35908506 - 35908572
Alignment:
Q  196 ggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaac-aagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataggg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35908506 ggttagcaagcgctaaacctagatag-aaagaacaaaatttgcaaacgacaaacttgtaaaaataggg 35908572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25857773 - 25857707
Alignment:
Q  283 aaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||    
T  25857773 aaaataagggtttccgaaatccaccacaattgagagaaaagtctcaaatattattattgaataaaaa 25857707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1151201 - 1151150
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgaga 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1151201 ttgcaagcaacaaacctatcaaaa---gggttttcggaatccaccagaattgaga 1151150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 349
Target Start/End: Original strand, 25340169 - 25340256
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||  ||||||||||||| |||||    
T  25340169 ggttgcacgcaacaaacctatcaaa-taagggtttctggaatccatcataattgagaaaagttgtcgataaattttattgaataaaaaa 25340256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 29924879 - 29924935
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29924879 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29924935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 29974032 - 29974088
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29974032 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29974088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 778 - 834
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464203
Alignment:
Q  778 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatg 30464203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 770 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  770 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 703 - 797
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189314
Alignment:
Q  703 aatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 797  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata--aaatattatg-aaggtgtcataaaatattctcatattgat 4189314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 670
Target Start/End: Original strand, 19345656 - 19345795
Alignment:
Q  531 acttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta 630  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||  | | ||| ||  ||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |    
T  19345656 acttaatcgtgagactccattaattataagaacactattcttaaagaatcctcaattaaggttcattgtgaagtggtataacattaaagcgtaaagatca 19345755  T
Q  631 ttatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatgg 670  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19345756 ttatgtgggtatactgatgatcacgtctcatagatcatgg 19345795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33175922 - 33175835
Alignment:
Q  176 gacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33175922 gacgcagt-cggaagcgtaggct-agcaaacgataaacctatattgaaaagagacaagtttgcaaaggacaaacttatgaaaatagggtt 33175835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2041
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 2429  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2428 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 2329  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 2229  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2228 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 2129  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2128 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 11419 - 10932
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 11320  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11319 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11220  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11219 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11120  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11119 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11020  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11019 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2621 - 2564
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2621 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11512 - 11455
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11512 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 18252030 - 18252517
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252030 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18252129  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18252130 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18252229  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252230 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18252329  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18252330 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18252429  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252430 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18532721 - 18532234
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532721 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18532622  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18532621 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagataga 18532522  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532521 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18532422  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18532421 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18532322  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532321 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27131616 - 27131130
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131616 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27131517  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27131516 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 27131417  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131416 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27131317  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27131316 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc-taga 27131218  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131217 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27310782 - 27310297
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310782 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 27310683  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    | | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27310682 cacgttgaacataaggaaactattcttaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 27310583  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310582 gatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 27310483  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310482 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 27310383  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310382 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 16359240 - 16358755
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359240 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagaataacttaattgtgagac 16359141  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16359140 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtaaccctagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 16359041  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359040 gatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16358941  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  16358940 atactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatg 16358841  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358840 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 3856126 - 3855639
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3856126 acaaggcatttctttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagcccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 3856027  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||    
T  3856026 accccattaaacataaggacattattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtaga 3855927  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3855926 ctgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatga 3855827  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3855826 gaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctaga 3855727  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3855726 tgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 36816834 - 36816354
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  36816834 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaatagttcgtctgtttaatggaacattaagtataaattaattgtgagactccg 36816735  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  36816734 ttaaacataaggacattattcttaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatg 36816635  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36816634 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 36816535  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36816534 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 36816436  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36816435 agtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 446 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 21171438 - 21171081
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171438 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttcatggaacattaaatataacttaattgtgagac 21171339  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  21171338 cccgttgaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 21171239  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171238 gatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 21171139  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171138 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27277756 - 27277278
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||| | ||||||       
T  27277756 catttctttgttgtttttgttttgtttcaaaataataacgtccctagaataattagtccatttaacggagcatta-gtgtgacttaatcgcgagacctt- 27277659  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||| |  || || | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  27277658 ttaaccgaaatgacattattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatg 27277559  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||     
T  27277558 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatat 27277459  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27277458 tgcatagtaaaagtcatg-aaagtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttgg 27277360  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277359 agtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 444 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 22657429 - 22657108
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgatttt-gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtga 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657429 acaagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtctgtttaatggaacattaaatataacttaattgtga 22657330  T
Q  543 gaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaag 642  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||    
T  22657329 gacccctttaaacataaggacacaattcttaaagtgtctctagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatag 22657230  T
Q  643 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatg 742  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  743 agaatactacatagtaaaagtt 764  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22657129 tgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 650 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 92 - 322
Target Start/End: Original strand, 13443906 - 13444135
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13443906 caaactctgccctcgtcatcagttgatctcccatggctgatc-cgttaggaaaagaacatgataaacctgctctgataccaactgacgcagttcggaagc 13444004  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 291  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13444005 atagggttaacaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataggattgcaagcgacaaacatatcaaaataagg 13444104  T
Q  292 gtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13444105 gtttccgtaatccaccagaattgagagaaaa 13444135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Original strand, 50857444 - 50857620
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50857444 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaataagtttgtaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 50857543  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50857544 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgtatcaaaaagt 50857620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 478 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12014457 - 12014085
Alignment:
Q  478 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 577  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||      
T  12014457 aaaataataaagtcactagaatacatagtccgtttaatggaatattaagtgtaaattaatcgttagatcccattaaacataatgatgttattcttaaaac 12014358  T
Q  578 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 677  Q
    ||||||||| |||||||  || |||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  12014357 atccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataagga 12014258  T
Q  678 gttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtca 777  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | | ||||   |||    
T  12014257 gttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tca 12014161  T
Q  778 taagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagt 852  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  12014160 caagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagt 12014085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 175 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8931309 - 8931153
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8931309 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagattgaaaaaaacaagtttgcaagcgataaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 8931210  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaata 331  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8931209 aacctatcaatataaggg-ttccggaatccaccagaaattgagagaaaatctcgaata 8931153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 456 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9918106 - 9917837
Alignment:
Q  456 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  ||||||||     
T  9918106 tttattgattttgttttgttacaaaataataaagtcactt------ttagtttgtttaatcgaacattaagtataacttgatcacgaga-tccattaaat 9918014  T
Q  556 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcaca 655  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||  |||| ||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||||    
T  9918013 ataaggacattattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcaca 9917914  T
Q  656 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattga 733  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9917913 tctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 600 - 931
Target Start/End: Original strand, 23507056 - 23507385
Alignment:
Q  600 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagat 699  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23507056 gaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagat 23507155  T
Q  700 ataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-a 798  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||  || ||| || |||  | |||||| ||||||||||||||| |    
T  23507156 ataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacgttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataa 23507252  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| ||||||||||    
T  23507253 gtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgacta 23507352  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507353 taaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 19706750 - 19706439
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19706750 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19706652  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19706651 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19706555  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  19706554 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 19706456  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19706455 gtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 43802676 - 43802365
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  43802676 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 43802578  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  43802577 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 43802481  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  43802480 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 43802382  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  43802381 gtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28135034 - 28134723
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28135034 taaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28134936  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28134935 aatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28134839  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || || ||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  28134838 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 28134740  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28134739 gtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 739 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  739 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 836  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  837 ccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || ||||||| ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12006712 - 12006461
Alignment:
Q  478 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||      
T  12006712 aaaataataaagtccctagaatagttagtctatttaatggaatattaagtgtgccttaatcgtgagaccccatgaaacataaggacattattattaaaac 12006613  T
Q  578 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 677  Q
    || ||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| | |||||| | ||||||    ||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||    
T  12006612 attcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacgaatcattgataagga 12006513  T
Q  678 gttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattgga 729  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006512 gttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 9456107 - 9456418
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9456107 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 9456205  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  9456206 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 9456302  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  9456303 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 9456401  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  9456402 gcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 20391550 - 20391239
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  20391550 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagt 20391452  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | |    
T  20391451 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctc 20391355  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20391354 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20391256  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20391255 gtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 20779956 - 20779645
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  20779956 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20779858  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20779857 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20779761  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20779760 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20779662  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20779661 gcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22670568 - 22670257
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22670568 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22670470  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22670469 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22670373  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22670372 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22670274  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22670273 gcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 42817300 - 42816989
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  42817300 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 42817202  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  42817201 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 42817105  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  42817104 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 42817006  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  42817005 gcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23987736 - 23987581
Alignment:
Q  104 tcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagca 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  23987736 tcgtcaccggttgatctcccatgcctgatcacgctaggaaaagaacaagagaaacctgctttaataccaactgacgcaattcggaagcgtaggg-tagca 23987638  T
Q  204 agcactaaacctagatag-aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23987637 agcgctgaacctagatagaaaaagaacaactttgcaaacgacaaacttgtgaaaata 23987581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 322
Target Start/End: Original strand, 13441612 - 13441746
Alignment:
Q  181 agtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaaccta 280  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13441612 agtacggaagagtatggttagcaagcgctaaacttagatagaaaagaacaattttgcaagcg-------tgtgaaaatagggttgcaagcgaaaaaccta 13441704  T
Q  281 tcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13441705 ttaaaataaggatttccggaatccatcagaattgagagaaaa 13441746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 22612483 - 22612794
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  22612483 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagt 22612581  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22612582 aatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22612678  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22612679 ttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatgg 22612777  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
     ||||  ||||||||||    
T  22612778 ctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 28660701 - 28660835
Alignment:
Q  129 tgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28660701 tgatcacgttaggaaaagaacatggaaaacctactctgataccaactgacgtagt-cggaagcgtaggat-agcaaacgctaaacctagatagataagaa 28660798  T
Q  229 -caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28660799 acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 28660835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 624 - 911
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634216
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  724 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 823  Q
    | |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 634129  T
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634130 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 47667785 - 47667485
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47667785 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagt 47667687  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||           |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  47667686 aatatttatattggattgacccaccgtga-----------agt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 47667601  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  47667600 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 47667502  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  47667501 gtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||  || ||||||  ||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 18251936 - 18251992
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251936 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18532813 - 18532757
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532813 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18532757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 342
Target Start/End: Original strand, 12486314 - 12486392
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaa 342  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12486314 ttgcaagcaacaaacctattaaa-taagggttttcggaatccaccaaaattgagagaaaatctcgaataattttattgaa 12486392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31915638 - 31915550
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31915638 tgacgtagtacggaagcgcaggct-agcaagcactaaacttaggttgaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 31915550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10925859 - 10925740
Alignment:
Q  141 aaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaag 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  10925859 aaaaaaaacaggagaaacctgctttgatactaacagacgcagt-cggaagcgga-ggctagcaagcgctaaacctaaattgaaa--aacaattttgcaag 10925764  T
Q  241 cgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  10925763 cgacaaacttgtaaaaatatggtt 10925740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27310877 - 27310821
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27310877 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 27310821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 692 - 834
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096928
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatg 29096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40804660 - 40804571
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagttg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  40804660 ttgcaagcgacaaacctatcaaa-tacgggtttccaaaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaat-atattattgaatgaaaaagttg 40804571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 8967738 - 8967893
Alignment:
Q  109 accggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcac 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| || || | |||  ||||||||| | |||||| | || | ||||||      
T  8967738 accggttgatctcccatggctgatcacattacgaaaaggacaggagaaacctactatggtgccacttgacgcagt-ccgaagcg-aaggctcgcaagcgt 8967835  T
Q  209 taaacctagat--agaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  8967836 taaacctagatagagaaaagaacaagtttgcaaatgacaaacctatgaaaatagggtt 8967893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 699 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 831  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 615 - 756
Target Start/End: Original strand, 35930573 - 35930713
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  35930573 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 35930671  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 756  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930672 aatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 343
Target Start/End: Original strand, 42071413 - 42071489
Alignment:
Q  266 caagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42071413 caagtgacaaacctatcaaa-taagcgtttctggaatccatcataattgagagagaatctcgaataattttattgaat 42071489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16359336 - 16359280
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16359336 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggttaggatttgtatcatg 16359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Original strand, 40058102 - 40058184
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaac-aagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40058102 tgacgcggtacggaagcgtaggct-agcaagcagtaaacctaaatagaaaagaaataagtttgcaagcgacaaacttatgaaaa 40058184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40804780 - 40804701
Alignment:
Q  112 ggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  40804780 ggttgatctcccatggctgatcgcgttaggaaaagaacaggagaaacatggactgataccaactgatccagaacggaagc 40804701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21171536 - 21171479
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21171536 ttgttggagtaagctctaatagccaatctatatggattgagtttggctttgtatcatg 21171479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     || | ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3856222 - 3856164
Alignment:
Q  350 gttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3856222 gttgttggagtaggccctaatagccaatccatcttgattgggtttgactttgtatcatg 3856164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12944182 - 12944116
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12944182 tagcaagcgctaaatctagattgaaaagaaacaagtttgcaaacgacaaacttgtaaaaatagggtt 12944116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31913442 - 31913380
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31913442 tagcaagcgctaaacctaggttgaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtaaaaatagg 31913380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 36816935 - 36816881
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 405  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816935 ttgtcggattaagccctaatattcaatctatattgattgggtttggctttgtatc 36816881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 12033638 - 12033730
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagttgt 354  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  12033638 gttgcaagcgacaaacttatc-aaatgagggtttacataatccattagaattgagagaaaagtctcgaatatttttattaaataaaaaagttgt 12033730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22657522 - 22657469
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 404  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22657522 ttgttggagtaagccttaatagccaatatatattgattgagtttggctttgtat 22657469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 818 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  818 gacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 917  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  918 ctccatgaatcatg 931  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 450 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 30720694 - 30720625
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaa 519  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30720694 catttttttattggttttattttgttttaaaataataaagttcctggaataattagttcgtttaatggaa 30720625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50713770 - 50713713
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50713770 ctaaacctagattgaaaagagacaagttcgcaggcgacaaacttgtgaaaatagggtt 50713713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43681528 - 43681465
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa--caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43681528 tagcaagcgctaaacctagattgaaaaaaaaacaagtttgcaagcgacaaatttgtgaaaatag 43681465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10927234 - 10927199
Alignment:
Q  222 aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927234 aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 10927199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27131704 - 27131652
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  27131704 tgttggaataagccctaatagccaatctat----gttgggtttggctttgtatcatg 27131652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 632 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  632 tatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggatt 731  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  732 gatccgccatgagaatactacatagta 758  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Original strand, 3403248 - 3403325
Alignment:
Q  474 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 551  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3403248 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3443571 - 3443494
Alignment:
Q  474 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 551  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3443571 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9031096 - 9031016
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttg 265  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  9031096 cggaagcgtaggct-agcaagtactaaacctatattgaaaaggaataagtttgcaagcaataaacttatgaaaatagggttg 9031016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 761 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 24301774 - 24301713
Alignment:
Q  761 agttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 822  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24301774 agttatgttaagtatcataagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacct 24301713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27277856 - 27277800
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||    
T  27277856 tgttggagtaagccctaatagccaatctatgttaattatgtttgactttgtatcatg 27277800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 770 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  770 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 829  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42646674 - 42646624
Alignment:
Q  264 tgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattga 315  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42646674 tgcaaacgacaaacctatcaaa-taagggtttccagaatccaccaaaattga 42646624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10928377 - 10928289
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10928377 tgacgcagta-ggaagcgtaggct-agcaagtgctaaacctagattaaaaagatataagtttgtaagtgacaaacttgtgaaaataaggtt 10928289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8221545 - 8221488
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8221545 ctaaaccaagattgaatagagacaagtttgcaaacgacaaacttatgaaaatagggtt 8221488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27381459 - 27380972
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381459 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27381360  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27381359 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27381260  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381259 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27381160  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27381159 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27381060  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381059 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27471842 - 27471355
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471842 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27471743  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27471742 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27471643  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471642 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27471543  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27471542 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27471443  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471442 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17684674 - 17684189
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684674 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 17684575  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684574 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 17684475  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684474 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 17684375  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17684374 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 17684275  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684274 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17691647 - 17691160
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691647 acaaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 17691548  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17691547 accccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 17691448  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691447 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 17691348  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17691347 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17691248  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691247 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 29308890 - 29309377
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308890 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29308989  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29308990 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29309089  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309090 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29309189  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29309190 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29309289  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309290 tgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 29315850 - 29316336
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315850 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29315949  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29315950 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29316049  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316050 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29316149  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316150 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29316249  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316250 tgttggag-tcagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 11651725 - 11652210
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651725 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 11651824  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11651825 cccattaaaaataaggaaactattctaaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 11651924  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651925 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 11652024  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11652025 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 11652124  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652125 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 189182 - 188697
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189182 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 189083  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  189082 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 188983  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188982 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 188883  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  188882 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 188783  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188782 ttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 446 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 16566525 - 16566257
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566525 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16566426  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16566425 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16566326  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16566325 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 658 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  658 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 757  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  758 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagt 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  858 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 446 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 13359474 - 13359010
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13359474 aaggcatttatttatttattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgcttaatggagcattaagtataacttaatcgtgaaac 13359375  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
     |||||||||||||  | | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |  |||||    
T  13359374 tccattaaacataaaaacattatttttaaagtatccgtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagact 13359275  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||   | ||||  ||    
T  13359274 gatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccat--ga 13359177  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagat 844  Q
    |||||||||  | ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13359176 atactacat--tgaaaattatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagat 13359080  T
Q  845 gttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || ||||| ||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359079 gtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 690 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  690 tcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 789  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  790 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 889  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  890 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 927  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 711 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 16559412 - 16559193
Alignment:
Q  711 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559412 gagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 16559313  T
Q  811 acccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 910  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559312 acccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 16559213  T
Q  911 atgggtactccatgaatcat 930  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16559212 atgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 446 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25537364 - 25537148
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537364 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtccgtttaatggaacattaagtataactttattgtgagac 25537265  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25537264 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagact 25537165  T
Q  646 gatgatcacatctcaca 662  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537164 gatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3536207 - 3535967
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctg-atcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaag 190  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3536207 caaattctgccctagtgaccgattgatctcccatggctggatcacgttcacgaaagaacaggggaaacctgctctgatgtcaactgacgcagtacggaag 3536108  T
Q  191 cgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataag 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3536107 cgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataag 3536008  T
Q  291 ggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaata 331  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3536007 gg-ttccggaatccaccagaaattgagagaaaatctcgaata 3535967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3542337 - 3542178
Alignment:
Q  172 aactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3542337 aactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgtaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcg 3542238  T
Q  272 acaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaata 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3542237 acaaacctatcaaaataaggg-ttccggaatccaccagaaattgagagaaaatctcgaata 3542178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 161 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30050019 - 30049829
Alignment:
Q  161 gctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050019 gctctgatgccaactgacgcagtacggaagcgaagggttagcaagcgctaaacctatatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 30049920  T
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccacc-agaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  30049919 agttgcaagcgacaaacctatcaaaattaggg-ttccggaatccaccaaaaattgagagaaaatctcgaatattattaatgaataaaaaagt 30049829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30052306 - 30052116
Alignment:
Q  161 gctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30052306 gctctgatgccaactgacgcagtatggaatcgaagggttagaaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 30052207  T
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccacc-agaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  30052206 agttgcaagcgacaaacctatcaaaattaggg-ttccggaatccaccaaaaattgagagaaaatctcgaatattattaatgaataaaaaagt 30052116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Original strand, 29340810 - 29340980
Alignment:
Q  179 gcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29340810 gcagtacggaagcgtagggttagcaggcgctaaacctagatagaaaaaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttacaagcgacaaacc 29340909  T
Q  279 tatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  29340910 tatcaaaataaaggtttccggaatccactagaattgagagaaaagtctcgaatattattaatgaataaaaa 29340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 482 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 17850663 - 17850321
Alignment:
Q  482 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatcc 581  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  17850663 taataaagtccctataatagctagtttgtttgttggaacattatgtaagacttaattgtgatatccaattaaaaacaaggacactattcttaaattatcc 17850564  T
Q  582 gtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 681  Q
     |||||||||||| ||| |||||   ||| |||| ||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||    
T  17850563 atagtcaagcttt-ttgtgaagtcaaataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagtta 17850465  T
Q  682 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 781  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||  |     |||||  |||| |||||||    
T  17850464 tcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat--tgggttttatg-taagtatcataag 17850368  T
Q  782 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 828  Q
     |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850367 ttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 797
Target Start/End: Original strand, 27925772 - 27926103
Alignment:
Q  467 tgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacat---taagtata--acttaattgtgagaccccattaaacataagg 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||   ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||  |||     
T  27925772 tgttttgtttcaaaataataaagtccttagaataactagtatgtttaacggaacataattaagtgtgtgacttaatcgtgagactccattaaactaaaga 27925871  T
Q  562 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcac 661  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  27925872 aaattattcttaaagtatctctagtcaaactttatttggaagtggtatagcattgaagcacaaagactattatgtggataaactgatgatctcatctcac 27925971  T
Q  662 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 761  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||    
T  27925972 ggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactacacag--aaa 27926068  T
Q  762 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 797  Q
     ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926069 attatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 20553755 - 20553492
Alignment:
Q  483 aataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccg 582  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  20553755 aataaagtctctaggatagctagtccgtttaatgaaatattaagtacgacttaatcgtgagatcccattaaatataagaatattattcttaaagcatccg 20553656  T
Q  583 tagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 682  Q
    |||| ||  ||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  20553655 tagtgaatttttattgtgaagtgagataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatat 20553556  T
Q  683 caagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 748  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20553555 caaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11190669 - 11190516
Alignment:
Q  62 acagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctg 161  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11190669 acagagctttggcggtcgcaattaaactgtcaaattctccttttgtaaccggttgatctcctatggctgatcacgttaggaaacgaacaggagaaacctg 11190570  T
Q  162 ctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaaccta 216  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11190569 ctctgataccaactgaagcaatacggaagc-aagggttagcaaacactaaaccta 11190516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 16789062 - 16789373
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  16789062 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 16789160  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  16789161 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 16789257  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  16789258 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 16789356  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  16789357 gcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22860199 - 22859888
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22860199 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22860101  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22860100 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22860004  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22860003 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22859905  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22859904 gcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27508658 - 27508347
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27508658 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27508560  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27508559 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27508463  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27508462 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27508364  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27508363 gtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 1586419 - 1586108
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  1586419 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 1586321  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  1586320 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 1586224  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1586223 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 1586125  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1586124 gtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 615 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 27528244 - 27527947
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27528244 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27528146  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27528145 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27528049  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27528048 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27527950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11190500 - 11190412
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11190500 ggttgcaagcgacaaacctatcaaa-taagg-tttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 11190412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 627 - 921
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  627 actattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatatt 726  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  727 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 825  Q
     ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  826 accactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 921  Q
    | || |||||||  ||||||| |||||   || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 18020152 - 18019981
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18020152 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18020054  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 790  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18020053 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 257
Target Start/End: Original strand, 18718139 - 18718279
Alignment:
Q  114 ttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaac 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||    
T  18718139 ttgatctcccatggctgatcatgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaacggacgcagtacagaagtgta-ggctagcaagcgctaaac 18718237  T
Q  214 ctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    |||||| |||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  18718238 ctagattgaaaaagacaaattcgcaa--gacaaacttgtgaaaa 18718279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 8048904 - 8049049
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacc-tgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaa 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  8048904 gttgatctcccatggctaatc-cgttaggaaaagaacaggagaaaccatgctctgataccaactgacccaatacagaagcgtaggct-agcaagcattaa 8049001  T
Q  212 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8049002 tcctagattaaaaagaaaaagtttgcaagtgacaaacttgtgaaaata 8049049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 862
Target Start/End: Original strand, 8509941 - 8510338
Alignment:
Q  463 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc-attaaacataagg 561  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| || |||    
T  8509941 attttattttgttttaaaataataaagtctatagaataattagtctatttgatggaacattatgtacgacttaattatgagacccccattaaatatgagg 8510040  T
Q  562 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg-atcacatctca 660  Q
    |   |||| | |||||||  ||||| ||||||| ||  ||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||  | | |  |||| || |||||  |    
T  8510041 atgatattattaaagtatatgtagttaagctttattatgaaatgagatagcattaaaacataaagactattatgtgcgtaaa--gatgtataacatcgta 8510138  T
Q  661 cagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 759  Q
    || |||| || |||  ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  |    
T  8510139 catatcacgggtaagtagttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--a 8510236  T
Q  760 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgc 859  Q
    | |||||| || ||||||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  8510237 atgttatgtaa-gtgtcattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtac 8510335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 615 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 10359360 - 10359073
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  10359360 taaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggt 10359263  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  10359262 aatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 10359167  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 909  Q
    || ||| |||||||||||||  || |||||| |||| | | ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359166 ttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 14074471 - 14074782
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||  ||||    
T  14074471 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagt 14074569  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | |    
T  14074570 aatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctc 14074666  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| | || |  ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  14074667 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 14074765  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  14074766 gtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 642 - 747
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  642 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccat 741  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  742 gagaat 747  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 482 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 20736773 - 20736425
Alignment:
Q  482 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 579  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  20736773 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacattattcttaaatgtat 20736675  T
Q  580 ccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagt 679  Q
    | |||||||||||||  | |||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    | || ||||  |||     
T  20736674 ctgtagtcaagctttaataagaactgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgtgttatagatat-gaga 20736576  T
Q  680 tatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 779  Q
    ||| |||| |  | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||    
T  20736575 tattaagtttata-ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcata 20736480  T
Q  780 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  20736479 agatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatg 20736425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 8612906 - 8613221
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8612906 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 8613004  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 811  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  8613005 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 8613102  T
Q  812 cccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  8613103 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 8613201  T
Q  912 tgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  8613202 tgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17691737 - 17691683
Alignment:
Q  354 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691737 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 17691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27381552 - 27381495
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381552 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27381495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27471935 - 27471878
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471935 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 29308797 - 29308854
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308797 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29308854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 29315757 - 29315814
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29315757 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29315814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11659000 - 11658936
Alignment:
Q  196 ggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11659000 ggttagcaagcactaaacctagattgaaaagaacaaatttgcaagcgataaacttgtgaaaatag 11658936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 692 - 834
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26571152 - 26571071
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26571152 ggttgcaagcgacaaatctattaaa-taggggttttcggaatccgctagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 26571071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Original strand, 27822118 - 27822207
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27822118 tgacgcagtacggaagcgtaggct-agcaaacgctaaacctaaatagaaaaggaacaagttttcaagcgacaaacttgtgaaaacagggtt 27822207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Original strand, 33615504 - 33615593
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaa-gaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33615504 tgacgcattacggaaacgtaggctaa-caagcgcaaaacctagatagaaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 33615593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17684769 - 17684712
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17684769 ttgttggaataagccctaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 17684712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 24443009 - 24443073
Alignment:
Q  111 cggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaact 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24443009 cggttgatcgcccatggctgatcacgttaggaaaagaacaagagaaacatgctctgataccaact 24443073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29342113 - 29342061
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29342113 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaaga 29342061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 406
Target Start/End: Original strand, 11651630 - 11651684
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651630 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatca 11651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25537462 - 25537405
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25537462 ttgttggattaagccctaatagccaatctatattgactgagtttggctttgtatcatg 25537405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3565739 - 3565652
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3565739 ggttgtaagcgataaacctatcaaa-taagagtttccaaaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaatatttttattgaatgaaaa 3565652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 350
Target Start/End: Original strand, 2339157 - 2339223
Alignment:
Q  284 aaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaag 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2339157 aaataagggtttccgaaatccaccagaattgagagaaaagtctcg-ataattttattgaatgaaaaag 2339223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 645 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 19347205 - 19347092
Alignment:
Q  645 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgag 744  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | ||||| ||    
T  19347205 tgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactgccattag 19347107  T
Q  745 aatactacatagtaa 759  Q
    |||||||||||||||    
T  19347106 aatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 834
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  622 tagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt 721  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  722 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 821  Q
    ||||||     | || || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 atattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  822 tgaaaccactatg 834  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 623 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  623 agagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattta 722  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  723 tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 803  Q
    || || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14238568 - 14238436
Alignment:
Q  130 gatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaa- 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||  |  ||| | |||| | ||||| |||||||| || || ||||||||     
T  14238568 gatcatgttaggaaaagaacaggagaaacctactctattaccaaatgacacatca--gaaacataggct-agcaaacactaaacataaattgaaaagaaa 14238472  T
Q  229 caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14238471 caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataaggtt 14238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 775 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  775 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaa 874  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  875 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 451 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31258120 - 31258065
Alignment:
Q  451 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagt 506  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31258120 atttctttattgcttttgttttgtttcaaaataataaagtctctaaaataattagt 31258065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13359569 - 13359512
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13359569 ttgtgggagtaagtcctaatagccaatctatattcattgggtttgactttgtatcatg 13359512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 818 - 931
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  818 gacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 917  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  918 ctccatgaatcatg 931  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758577
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 5758577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 13995254 - 13995151
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13995254 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 13995156  T
Q  715 aatat 719  Q
    |||||    
T  13995155 aatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16566611 - 16566563
Alignment:
Q  360 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16566611 taagccctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 16566563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18727186 - 18727115
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18727186 cggaagcgtaggct-agcaaacgctaaacctagattgaaaaacacaagttcgcaagcgacaaacttgtgaaaa 18727115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 790 - 844
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172954
Alignment:
Q  790 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagat 844  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagat 28172954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1127320 - 1127258
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1127320 tagcgagcgctaaacctagattaaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaatttgtgaaaatag 1127258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 622 - 834
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  622 tagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt 721  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | |||||||||   |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  722 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 821  Q
    ||||| |||||| |  || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacataatat--gttatgaaaatt--cataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  822 tgaaaccactatg 834  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12882189 - 12882123
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12882189 tagcaaacactgaacctagattgagaagagacaagttttaaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 12882123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Original strand, 13645898 - 13645955
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaa 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13645898 ttgcaagcaacaaacctattaaa-taagggtttccggaatctaacagaattgagagaaa 13645955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 189280 - 189221
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatcta---tattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189280 tgttggagtaagccctaataatcaatctagtatattgattgggtttggctttgtatcatg 189221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 2939780 - 2939837
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  2939780 gttgcaagcgacaaacctatc-aaataa-ggttttcgaaatccaccataattgagagaaa 2939837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 366 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16394526 - 16394484
Alignment:
Q  366 ctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16394526 ctaatagacaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 16394484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19232363 - 19232329
Alignment:
Q  283 aaaataagggtttccggaatccaccagaattgaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19232363 aaaataagggtttccggaatccaccaaaattgaga 19232329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11190748 - 11190699
Alignment:
Q  1 tagttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  11190748 tagttgcagttgttgttgttgcggttgtcaatcttagttgtcaaccccgt 11190699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 460 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22259990 - 22259925
Alignment:
Q  460 ttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaa 525  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||    
T  22259990 ttgattttgttatgttgcaaaataataaactccctaaaataactagtccatttaatataacattaa 22259925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 108)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 55612683 - 55613170
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612683 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 55612782  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55612783 accccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 55612882  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612883 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 55612982  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55612983 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 55613082  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613083 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 19926967 - 19926480
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926967 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 19926868  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19926867 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 19926768  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926767 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 19926668  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19926667 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 19926568  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926567 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 26970463 - 26970950
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970463 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 26970562  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26970563 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26970662  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970663 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26970762  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26970763 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26970862  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970863 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 18262214 - 18262699
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262214 aaggcatttctttattgattttgtttcgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18262313  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18262314 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18262413  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262414 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 18262513  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262514 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18262613  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262614 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 5707320 - 5707807
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707320 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5707419  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5707420 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5707519  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707520 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5707619  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5707620 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5707719  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707720 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 26963640 - 26964127
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963640 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26963739  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26963740 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26963839  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963840 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26963939  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26963940 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26964039  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964040 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 868597 - 869084
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868597 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 868696  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  868697 accccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 868796  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868797 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 868896  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 868996  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868997 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 5713948 - 5714435
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713948 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagcccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5714047  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5714048 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5714147  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714148 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5714247  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5714248 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5714347  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714348 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 18269070 - 18269560
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgatttt-----gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 540  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269070 aaggcatttctttattgattttgttttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 18269169  T
Q  541 gagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagga 640  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18269170 gagaccccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 18269269  T
Q  641 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgcca 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269270 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 18269369  T
Q  741 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccat 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18269370 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 18269469  T
Q  841 agatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269470 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10621540 - 10621053
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621540 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10621441  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621440 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10621341  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621340 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10621241  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10621240 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10621141  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621140 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10628619 - 10628132
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628619 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10628520  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10628519 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10628420  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628419 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10628320  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10628319 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10628220  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628219 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28393339 - 28392854
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393339 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28393240  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28393239 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 28393140  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393139 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 28393040  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28393039 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatg 28392940  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392939 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 456 - 931
Target Start/End: Original strand, 8858179 - 8858654
Alignment:
Q  456 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8858179 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8858278  T
Q  556 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcaca 655  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  8858279 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8858378  T
Q  656 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858379 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8858478  T
Q  756 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttga 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8858479 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8858578  T
Q  856 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858579 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 456 - 931
Target Start/End: Original strand, 8845215 - 8845690
Alignment:
Q  456 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8845215 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8845314  T
Q  556 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcaca 655  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  8845315 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8845414  T
Q  656 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845415 tctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8845514  T
Q  756 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttga 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8845515 gtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8845614  T
Q  856 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845615 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 4426808 - 4426336
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426808 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 4426709  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4426708 cccgttaaacataaggaa-ctattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 4426610  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426609 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 4426510  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4426509 atactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 4426422  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426421 ttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 5668327 - 5667849
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| |    
T  5668327 catttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctatttaatggagcattaagtgtgatttaatcgtgagaccc-a 5668229  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatcc--gtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactga 647  Q
    |||||   ||||| | |||||| |||||||    ||||||||||||| ||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||    
T  5668228 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccga 5668129  T
Q  648 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 747  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  5668128 tgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaat 5668031  T
Q  748 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgtt 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5668030 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgtt 5667931  T
Q  848 ggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667930 g--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Original strand, 35223576 - 35224047
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || |           
T  35223576 catttctttgttgattttgttttgttttaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtaa------- 35223668  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
       |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  35223669 ---aacgaaaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatg 35223765  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35223766 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatac 35223865  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35223866 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttgg 35223965  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35223966 agtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 452 - 935
Target Start/End: Original strand, 20311299 - 20311781
Alignment:
Q  452 tttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311299 tttctttattgattttgttttgttttaaaataataaagtacttataatagttaatatgttcaatggagcattaaggtataacttaattgtgagaccccat 20311398  T
Q  551 taaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatga 650  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||||  || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  20311399 taaacataaggacactgtttttaaagtatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatga 20311498  T
Q  651 tcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatact 750  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  20311499 tcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatact 20311598  T
Q  751 acatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    ||||||  | |||||||  || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  20311599 acatag--acagttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtagg 20311695  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    | | |||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311696 attcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 174 - 353
Target Start/End: Original strand, 6659330 - 6659508
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6659330 ctgacgcagtacggaagtgtagg-ttagcaagcgctaaatctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 6659428  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagttg 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6659429 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaatagttttagtgaatcaaaaagttg 6659508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 559
Target Start/End: Original strand, 12357136 - 12357251
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357136 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 12357235  T
Q  544 accccattaaacataa 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357236 accccattaaacataa 12357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 15461488 - 15461799
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15461488 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15461586  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15461587 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15461683  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15461684 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15461782  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15461783 gtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 34975542 - 34975853
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34975542 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 34975640  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  34975641 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 34975737  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  34975738 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 34975836  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  34975837 gtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 482 - 756
Target Start/End: Original strand, 56516094 - 56516368
Alignment:
Q  482 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaagtatc 580  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||  ||| | ||||||  |||||||    
T  56516094 taataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaa-catatagaacattattcttgaagtatc 56516192  T
Q  581 cgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 680  Q
      |||||||||||| ||| |||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56516193 tatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagtt 56516292  T
Q  681 atcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 756  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516293 atcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 446 - 915
Target Start/End: Original strand, 5616215 - 5616681
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||| |||  |||||     
T  5616215 aaggcatttctttattcattttgttttgtttcaaaataataaagttcctaaaataattagtctatttcttggaacattaagtctgactaaatcatgagat 5616314  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa--gctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||| ||||||   |||| | |||||| ||||||||||| |||||  | ||| ||  ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||    
T  5616315 cccgttaaactagaggacattattcttaaagtatccgttgtcaaaggttttattatgaattgggatattaataaagcattgagactattatgtatgtaga 5616414  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
     |||||| |||||||||  | ||||  || | ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  || |||    
T  5616415 ttgatgaccacatctcatgggtcataaat-atgagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtga 5616513  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  || ||||    
T  5616514 gaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctaga 5616610  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 915  Q
    || |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616611 tg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 470 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 21454319 - 21453961
Alignment:
Q  470 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactat 568  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||  |||| || | |||    
T  21454319 tttgtttcaaagtaataaagttcttagaatagttagtttgattaatggaacattaaaatgtgacttaatattgagaccccattaattataatgacattat 21454220  T
Q  569 tctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcat 668  Q
    | | ||| ||||  ||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| ||||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||  ||||   ||| ||    
T  21454219 ttttaaaatatctatagtcaaactttattgtgaaatgagataacaataatgcataaagattattatgtgagtagattgatgatcatctctcgg-gataat 21454121  T
Q  669 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga 768  Q
    |||    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  21454120 ggactt-gagatatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgt 21454023  T
Q  769 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 830  Q
    ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454022 aaaatatcataagatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 2677004 - 2677315
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2677004 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2677102  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2677103 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2677199  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2677200 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2677298  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2677299 gcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 15815012 - 15815323
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15815012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15815110  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15815111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15815207  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15815208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15815306  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  15815307 gcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18111354 - 18111043
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18111354 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18111256  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18111255 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18111159  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18111158 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18111060  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18111059 gcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 3369334 - 3369023
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3369334 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3369236  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3369235 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3369139  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  | |||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3369138 ttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3369040  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  3369039 gtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17300270 - 17299959
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  17300270 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 17300172  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  17300171 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 17300075  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  17300074 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatga 17299976  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  17299975 gcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10677753 - 10677538
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10677753 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10677655  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10677654 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10677557  T
Q  650 atcacatctcacagatcat 668  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10677556 atcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10891393 - 10891178
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10891393 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10891295  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  10891294 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10891197  T
Q  650 atcacatctcacagatcat 668  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10891196 atcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 18163153 - 18163464
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  18163153 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 18163251  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  18163252 aatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 18163348  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18163349 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18163447  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18163448 gtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 20243928 - 20244239
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  20243928 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 20244026  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  20244027 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 20244123  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20244124 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20244222  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20244223 gtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 26531604 - 26531915
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  26531604 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagt 26531702  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  26531703 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 26531799  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26531800 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 26531898  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  26531899 gcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Original strand, 13085178 - 13085268
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13085178 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggttttcggaatccaccaaaattgagagaaaatctcgaataattttattgaataaaaaagt 13085268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 4676294 - 4675983
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  4676294 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 4676196  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  4676195 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 4676099  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  4676098 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 4676000  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  4675999 gtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 625 - 931
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  625 agactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttata 724  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  725 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 824  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  825 aaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 924  Q
    ||||||||||  |  |||||| |||| |  |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  925 aatcatg 931  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 1941715 - 1942026
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  1941715 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 1941813  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  1941814 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 1941910  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1941911 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 1942009  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1942010 gtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 692 - 915
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 790  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  791 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 890  Q
     | ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  || |||||| |||| |  |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  891 gatgactataaagttggttgatggg 915  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 13991318 - 13991468
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  13991318 gttgatctaccatgactgatcacgttagaaaatgaacatgataaatttgctttgataccaactgacgcagt-cggaagcgta-ggctagcaagcgctaaa 13991415  T
Q  213 cctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  13991416 tctagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacatgcgaaaataaggtt 13991468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 645 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  645 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgag 744  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  |||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  745 aatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||| |||||||  ||| |||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||  |||| | || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Original strand, 7723959 - 7724163
Alignment:
Q  55 tgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctg-atcacgttagaaaaagaacagga 153  Q
    |||||| |||||||||||   | ||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7723959 tgatctcacagagctttgatagtcgcatctaaaccgtcaaaatctgccctcgtaactggttgatcaaccatggttgaatcacgttagaaaaagaacagga 7724058  T
Q  154 gaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgt 252  Q
    ||||| ||||   ||| |||||||| |||||| ||| ||||  | |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||   |    
T  7724059 gaaacttgct---atatcaactgacacagtacagaaacgta-tgctagcaagtgctaaacctatattgaaaagaagcaagtttgcgagcgacaaac---t 7724151  T
Q  253 gaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||    
T  7724152 gaaaatagggtt 7724163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 692 - 914
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| || | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgg 914  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 829
Target Start/End: Original strand, 32636475 - 32636685
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  32636475 taaagcgtggagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagt 32636573  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  32636574 aatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 32636670  T
Q  815 ttcgacctgaaacca 829  Q
    | |||| ||||||||    
T  32636671 tccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Original strand, 13086221 - 13086311
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13086221 ggttgtaagcgacaaacctatcaaaataagagttttcagaatccattagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaattaaaaagt 13086311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Original strand, 54700527 - 54700686
Alignment:
Q  104 tcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagca 203  Q
    |||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| || |||||    
T  54700527 tcgtcaccggttgatctctaatgactgatcacgttgggaaaaaatcaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagt-cgagagtgta-ggctagca 54700624  T
Q  204 agcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    | | ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54700625 aacgctaaacctatattgaaaagaaacaagtttgcaagtgacaaacttgtgagaatagggtt 54700686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22716661 - 22716590
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22716661 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaaaaagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaata 22716590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 5713855 - 5713912
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713855 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 5713912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 26963547 - 26963604
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963547 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26963604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 26970370 - 26970427
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970370 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26970427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19927059 - 19927003
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927059 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19927003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22691312 - 22691253
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691312 ttgcaagcgacaaacctatcgaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 22691253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 331
Target Start/End: Original strand, 22988556 - 22988627
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22988556 ggttgcaagcgacaaacctatcgaaaaaagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaata 22988627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10621633 - 10621576
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621633 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 10621576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  711 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 810  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  811 acccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 910  Q
    || ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  911 atgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 5707228 - 5707284
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5707228 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 5707284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Original strand, 7723665 - 7723751
Alignment:
Q  176 gacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7723665 gacgcagtacagaagcgtaggct-agcaagcgctaaac-tagattgaaaagaacaagtttgcaagctacaaacttgtgaaaatagggtt 7723751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 12357044 - 12357100
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12357044 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggatttggctttgtatcatg 12357100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 408
Target Start/End: Original strand, 868507 - 868561
Alignment:
Q  354 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868507 ttggaataaaccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 868561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 628 - 706
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  628 ctattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 706  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 680 - 834
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  680 tatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 779  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  780 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 692 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  || ||||||| ||| |  |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  892 atgactataaagttggttgatggg 915  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10628711 - 10628655
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10628711 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttgactttgtatcatg 10628655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17142428 - 17142372
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17142428 tgttggaaaaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatcatg 17142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 671 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  671 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 770  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  771 agtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 55612594 - 55612650
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612594 tgttagaataagccctaataaccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 55612650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Original strand, 2053095 - 2053176
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattga-gagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  2053095 gttgcaagcgacaaatctatcaaa-taagggtttccgaaatccactagaattgaggaaaaagtctcgaataattttattgaat 2053176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7634212 - 7634084
Alignment:
Q  131 atcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaa-gaac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  7634212 atcatgttaggaaaagaacaagagaaacctactctgttaccaactgacgcagt-cagaagcgta-tgctagtaagcgttaaacctagattgaaaaggaac 7634115  T
Q  230 aagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  7634114 aagtttgcaaacgataaacttgtggaaatag 7634084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 714 - 931
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  714 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 813  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  814 cttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 913  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | |  |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  914 ggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24667746 - 24667657
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24667746 ctgacgcagtatggaagcgtaggct-agcaagcgttaaacctagatagaaaagaagaagctcgcaggcaacaaacttgtgaaaatagggtt 24667657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28393434 - 28393380
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28393434 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatca 28393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 699 - 915
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| |  |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  899 taaagttggttgatggg 915  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 18268975 - 18269032
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18268975 ttgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18269032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4426903 - 4426847
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426903 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggctctgtatcatg 4426847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 615 - 834
Target Start/End: Original strand, 4546071 - 4546286
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  4546071 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 4546169  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  4546170 aatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 4546266  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  4546267 tttgacctaaaaccactatg 4546286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9596944 - 9596853
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagtt 352  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  9596944 ggttgcaaacgataaacctatcaaa-taagggtttccataatccaccagaattgagagaaaagtctcaaatattcttattgaatgaaaaagtt 9596853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19935575 - 19935487
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19935575 tgacgcagtacagaagcgtaggct-agccagcgctaaactcagatagaaaaaaataaatttgcaagcgacaaacttatgaaaatagggtt 19935487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22691388 - 22691327
Alignment:
Q  104 tcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctct 165  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22691388 tcgtcaccagttgatctcccatggctgatcactttaggaaaagaacaggagaaacctgctct 22691327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4053145 - 4053062
Alignment:
Q  265 gcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4053145 gcaagcgacaaacctatcaag-taaggattttcgaaatccaccataattgagagaaaagtctcgaatatttttattgaatgaaaa 4053062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 39074346 - 39074278
Alignment:
Q  493 ctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataag 560  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39074346 ctagaataattagtccgtttaaattgaacattaagtatgacttaatcatgagaccccattaaacataag 39074278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 258
Target Start/End: Original strand, 50515822 - 50515978
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||          ||||||||| ||| |||||||    
T  50515822 caaactctgctctcgtcactggttgatctcccattgctgatcacgttacaaaaagaacatgagaaacct---------tcaactgacgtagt-cggaagc 50515911  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaat 258  Q
    | | || |||||||| ||| || ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50515912 gga-ggctagcaagcgctacacttagactgagaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaat 50515978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40206238 - 40206153
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40206238 ctgacgcactacggaagcgtaggct-agcaagcgctaaatctaaattgaaagagacaagttcgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 40206153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Original strand, 21433595 - 21433652
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaa-gaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21433595 ctaaacctagatagaaaaagaacaaattcgcaagcgacaaacttatgaaaatagggtt 21433652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 408
Target Start/End: Original strand, 55992680 - 55992729
Alignment:
Q  359 ataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55992680 ataagccctaatagccaatttgtattgattgggtttgactttgtatcatg 55992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 18689553 - 18689613
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaagaacaa-gtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgca 267  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18689553 ctaaacctagattgaaaagaaaaaagtttgcatgcgacaaacttgtaaaaatagggttgca 18689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 264
Target Start/End: Original strand, 38888023 - 38888079
Alignment:
Q  209 taaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38888023 taaacctagattgaaaataaacaaatttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 38888079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10494966 - 10494907
Alignment:
Q  202 caagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10494966 caagcaccaaacctagatggaaaagaaacaagtttgcaagtgacaaacctgtgaaaatag 10494907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Original strand, 22486799 - 22486861
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaa-gaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22486799 tagcaagcgctaaacctatatagaaaaagaccaagtttgcaagcgac-aacttgtgaaaatagg 22486861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54239604 - 54239531
Alignment:
Q  266 caagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattga 341  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  54239604 caagggacaaacctatcaaa-taagggttttcggaatccaccaaaattgagaaaagttctcg-ataattttattga 54239531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 261
Target Start/End: Original strand, 18657070 - 18657128
Alignment:
Q  204 agcactaaacctagatagaaaagaacaa-gtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18657070 agcactaaacctagattgaaaagaaaaaagtttgcatgcgacaaacttgtaaaaatagg 18657128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5668412 - 5668371
Alignment:
Q  367 taatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5668412 taatagccaatctatattgattgtgtttggttttgtatcatg 5668371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701410
Alignment:
Q  803 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagt 852  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagt 24701410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 349
Target Start/End: Original strand, 38223117 - 38223200
Alignment:
Q  264 tgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||| |||||    
T  38223117 tgcaaacgacaaacctatcaaa-taagggtttacagaatccactagaattgaga-aaagtctcgataatttttattgaatgaaaaa 38223200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Original strand, 8845118 - 8845166
Alignment:
Q  360 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845118 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8845166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Original strand, 8858082 - 8858130
Alignment:
Q  360 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858082 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8858130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 408
Target Start/End: Original strand, 18262136 - 18262176
Alignment:
Q  368 aatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18262136 aatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Original strand, 34949082 - 34949169
Alignment:
Q  267 aagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagttgt 354  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  34949082 aagcgataaacctattaaatta-gggtttctgaaatccacccgatttgagagaaaagtctcgaatatttttattgaataaaatagttgt 34949169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 581 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 39074270 - 39074190
Alignment:
Q  581 cgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcac 661  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||  || || ||||||||||||||    
T  39074270 cgtagtcatactttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11161972 - 11161913
Alignment:
Q  494 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaa 553  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  11161972 tagaatagttaatcagtttaatggaacacaaagtgtgacttaattgtgagactccattaa 11161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Original strand, 19684822 - 19684880
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  19684822 ttgcaagcgacaaacctatc-aaacaagggtttccagaattcaatagaattgagagaaaa 19684880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 600 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9938015 - 9937933
Alignment:
Q  600 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 682  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||| || ||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938015 gaagtgagatagcatcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 408
Target Start/End: Original strand, 20311207 - 20311261
Alignment:
Q  354 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20311207 ttggagtaagctgtaatagccaatctgtattcattggatttggctttgtatcatg 20311261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9260610 - 9260573
Alignment:
Q  227 aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9260610 aacaagtttgcaaacgacaaacttgcgaaaatagggtt 9260573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 13990729 - 13990766
Alignment:
Q  227 aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13990729 aacaagtttgcaagtaacaaacttgtgaaaatagggtt 13990766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 29327784 - 29328271
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327784 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29327883  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29327884 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29327983  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327984 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29328083  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29328084 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29328183  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328184 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 927
Target Start/End: Original strand, 15152445 - 15152926
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152445 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 15152544  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15152545 cccgttaaacatacggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15152644  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152645 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 15152744  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15152745 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 15152844  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 927  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152845 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 11536269 - 11535782
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536269 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtacaacttaattgtgag 11536170  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11536169 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11536070  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536069 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11535970  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11535969 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11535870  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535869 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 11543187 - 11542700
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543187 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtcag 11543088  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11543087 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11542988  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542987 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11542888  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11542887 gaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11542788  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542787 tgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 12750828 - 12751313
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750828 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgagac 12750927  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  12750928 ctcgttaaacataaagaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagact 12751027  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751028 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 12751127  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12751128 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatg 12751227  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751228 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Original strand, 12738542 - 12739023
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12738542 catttctttattgattttattttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtttgtttaatgaaacattaattataacttaattgtgagaccttg 12738641  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  12738642 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaag 12738741  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738742 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatac 12738841  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  12738842 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgt 12738941  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738942 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 18561009 - 18561485
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561009 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgagac 18561108  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18561109 cccgttaaacattaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 18561208  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  18561209 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgaga 18561308  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18561309 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatg 18561399  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561400 ttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 446 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 18258047 - 18257559
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18258047 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgacttaattgtgagac 18257948  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| |  ||| |    
T  18257947 cccattaaacacaaggacattattcttaaagtatccgtagtcaagtttttttgttaagtaggataacaataatgcataaagactattatgtggatagatt 18257848  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || | |||    
T  18257847 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcaga 18257748  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||    
T  18257747 atattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 18257650  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 937  Q
     |||| |  ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257649 -tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Original strand, 13392157 - 13392637
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  13392157 catttctttgttgactttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaacaattagtctgcttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc-a 13392255  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | | || |||  ||||    
T  13392256 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatcaatagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatg 13392355  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  13392356 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatat 13392455  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13392456 tacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttgg 13392555  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392556 agtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 13885984 - 13886261
Alignment:
Q  1 tagttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13885984 tagttgcggttgttgttgttgatgttgtcaatcttagctgtcaacgccgtcaactgatctaaaagagctttggcggccgcatttaaactgccaaactctg 13886083  T
Q  101 ccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttaga-aaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggtt 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13886084 ccctcgtaatcggttgatctcccatggctgatcacgttagggaaaagaacaggagaaacctgctctaataccaactgacgcagtacggaagcgtagggtt 13886183  T
Q  200 agcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaac 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13886184 agcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataggtttgcaagcgacaaac 13886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 446 - 665
Target Start/End: Original strand, 15148144 - 15148363
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148144 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttgattgaacattaagtataacttaattgtgagac 15148243  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148244 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15148343  T
Q  646 gatgatcacatctcacagat 665  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15148344 gatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 1220274 - 1220562
Alignment:
Q  9 gttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgta 108  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1220274 gttgttgttgttgatgttgccgatcttagctgccaacgtcagcatctgatctaacagagctttggcggccgtatttaaactgccaaattctgtcctcgta 1220373  T
Q  109 accggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctg-ctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagca 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |     
T  1220374 accggttgatctcccatggctgatc-cgttaggaaaagaacaggagaaaccaggctctgataccaactaacgtagtacagaagcgtagggttagcaaacg 1220472  T
Q  208 ctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttcc 297  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1220473 ctaaacctacatagaaatgaacaagtttgcaaacgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaatagaggtttcc 1220562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Original strand, 13882686 - 13882862
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882686 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 13882785  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13882786 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcaaataattttattgaatcaaaaagt 13882862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 175 - 322
Target Start/End: Original strand, 859156 - 859303
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  859156 tgacgcaatacggaagcgtaggattagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 859255  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  859256 aacctatcaaaataaaggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 859303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 175 - 322
Target Start/End: Original strand, 1217160 - 1217307
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217160 tgacgcaatacggaagcgtaggattagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 1217259  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217260 aacctatcaaaataaaggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 1217307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 13886245 - 13886364
Alignment:
Q  232 gtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaata 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13886245 gtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataggtttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccagaatccaccataattgagagaaaatctcgaatg 13886344  T
Q  332 attttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13886345 attttattgaatcaaaaagt 13886364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1883689 - 1883489
Alignment:
Q  64 agagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgct 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  1883689 agagctttggcggccgcaattaaaccgtgaaattctaccatcgtaaccggttgatctcccatgactgatcacgttaggaaaagaacaggagatacgagct 1883590  T
Q  164 ctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataggg 262  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1883589 ctgacaccaactaacgtagtacgtaagcgta-tgctagcaaacactaaacctagattgaaaagaaacaagtttgcaaacgacaaacttgtgaaaataagg 1883491  T
Q  263 tt 264  Q
    ||    
T  1883490 tt 1883489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 624 - 931
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  724 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 823  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 923  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  924 gaatcatg 931  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 2204543 - 2204854
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2204543 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2204641  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2204642 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2204738  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2204739 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2204837  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2204838 gcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 18400095 - 18400406
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18400095 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18400193  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18400194 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18400290  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18400291 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18400389  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18400390 gcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 18407079 - 18407390
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18407079 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18407177  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18407178 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18407274  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18407275 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18407373  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18407374 gcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 48808807 - 48808496
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  48808807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 48808709  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  48808708 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 48808612  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  48808611 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 48808513  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  48808512 gcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 15729742 - 15730053
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  15729742 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 15729840  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  15729841 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 15729937  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15729938 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15730036  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15730037 gtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18139649 - 18139338
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18139649 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagt 18139551  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18139550 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18139454  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  18139453 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgg 18139355  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18139354 gtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 19230879 - 19231190
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19230879 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19230977  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19230978 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19231074  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || || ||| |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  19231075 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 19231173  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19231174 gtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Original strand, 30254129 - 30254428
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  30254129 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30254227  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || |    
T  30254228 aatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactc 30254324  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || ||| |||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  30254325 ttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 30254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 691 - 931
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  691 cacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 790  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  791 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 889  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||  ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  890 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1365810 - 1365672
Alignment:
Q  124 atggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaa 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||| |||    
T  1365810 atggctgatcatgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgac-tagtacggaaggata-ggctagcaagcgctaaacctagattgaa 1365713  T
Q  224 aagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  1365712 aggaacaagtttgtaagcgatgaacttgtgaaaatagggtt 1365672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1874660 - 1874538
Alignment:
Q  142 aaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaag 240  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||     
T  1874660 aaaagaacaggagatacctgctccgataccaactgacgtagtacggaagcgta-tgttagcaaacactaaaccttgattgaaaagaaacaagtttgcaaa 1874562  T
Q  241 cgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  1874561 cgacaaacttgtgaaaataaggtt 1874538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 702
Target Start/End: Original strand, 7396221 - 7396450
Alignment:
Q  477 caaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 575  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  7396221 caaaataaaaatgtcgctagaatagttagttcatttaaatggaacattaagtatgacttaatcttgagaccctattaaacataagaaaattattcttaaa 7396320  T
Q  576 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgt--aggaag-actgatgatcacatctcacagatcatggat 672  Q
      ||  |||||||||| ||  || ||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7396321 acatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaat 7396420  T
Q  673 aaagagttatcaagtcttcacatagatata 702  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396421 aaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 47167170 - 47166871
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  47167170 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagt 47167072  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  47167071 aatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 47166975  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  47166974 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 47166876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 466 - 662
Target Start/End: Original strand, 2364917 - 2365112
Alignment:
Q  466 ttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac 565  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||  || || |     
T  2364917 ttgttatgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctttctaatggaacattaagtgtggcttaatcgtgagaacccattaaactaaatgacat 2365016  T
Q  566 tattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcaca 662  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | || ||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2365017 tattcttaaaatattcgtagtcaa-ccttattgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10669213 - 10668901
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  10669213 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 10669115  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacc 813  Q
    |||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | |     
T  10669114 aatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgct 10669018  T
Q  814 cttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 913  Q
    ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||    
T  10669017 cttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatg 10668919  T
Q  914 ggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  10668918 ggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4300629 - 4300525
Alignment:
Q  112 ggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaa 211  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||    
T  4300629 ggttgatctctcatggctgatcacattaggaaaagaactggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcaaaggttaagcaagcgctaa 4300530  T
Q  212 accta 216  Q
    |||||    
T  4300529 accta 4300525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4303453 - 4303363
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcga-caaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4303453 ggttgcaagcgaacaaacctattaaa-taagggttttcggaatccactagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 4303363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 352
Target Start/End: Original strand, 31577269 - 31577360
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagtt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31577269 ggttgcaagcgacaaacctatcaaa-taagggtttccgaaatccaccagaattgagagaaaagtcttgaatatttttattgaatgaaaaagtt 31577360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 450 - 724
Target Start/End: Original strand, 39111819 - 39112092
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||  |     
T  39111819 catttctttattaattttgttttatttcaaaa-aataaagtccctagaatagcgagtccgtttaatgaaacattaagtacgacttaatcacaagacatct 39111917  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||| ||| |  |||| |||||| ||| |||  |  ||| |||||||  ||||||||||||||   || ||||| |||    
T  39111918 ttaaacataaggacactatttcaaaaatattcacagtccagctttattgtgaaacgaaataacattaaaatatagagactattataagggtagactaatg 39112017  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttata 724  Q
     | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39112018 gtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 643 - 756
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235474
Alignment:
Q  643 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||  | |||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  743 agaatactacatag 756  Q
    |||||  |||||||    
T  10235461 agaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 625 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  625 agactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttata 724  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  725 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 824  Q
     | |||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  825 aaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 909  Q
    ||||| ||||  || |||||| |||| |  |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 28130552 - 28130863
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||| | | |||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||||    
T  28130552 taaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagt 28130650  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| || |  |||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  |    
T  28130651 aatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattc 28130747  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || ||||||||| |||||||  || ||||||| ||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28130748 ttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 28130846  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28130847 gtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 518 - 757
Target Start/End: Original strand, 3132748 - 3132986
Alignment:
Q  518 aacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaa 617  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||  ||| || || |||  |  ||| ||| | |  | |||    
T  3132748 aacattaagtgtaacttaattgtgagaccccattaaacataaggtcattattatgaaagtatttgtaatctagttttacttggaattggaaaaatagtaa 3132847  T
Q  618 agcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaat 717  Q
     ||||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||    
T  3132848 tgcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taat 3132946  T
Q  718 atttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 757  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132947 atttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 260
Target Start/End: Original strand, 4888686 - 4888770
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4888686 tgacgcaatacggaagcgtaggct-agcatgcgctgaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacctgtgaaaatag 4888770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 582 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 7662733 - 7662569
Alignment:
Q  582 gtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 681  Q
    ||||||||| |||  || ||||| ||||| |||||||| | |  || |||||||| |  | ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||    
T  7662733 gtagtcaagatttagtgtgaagtaggatagcattaaagtacattgattattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaactta 7662634  T
Q  682 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7662633 tcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11543280 - 11543223
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11543280 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 11543223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24840287 - 24840143
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||  |     |||  ||||    
T  24840287 gttgatctctcatggccgatcacgttaggaaaagaataggagaaatccgctctgataccaactgacgtagt-cgcaagtgtagact-----agc--taaa 24840196  T
Q  213 cctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24840195 cctagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 24840143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2653331 - 2653275
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2653331 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggattggctttgtatcatg 2653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 12738443 - 12738499
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738443 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12738499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  || ||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 264
Target Start/End: Original strand, 27309636 - 27309704
Alignment:
Q  197 gttagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27309636 gttagcaagcgctaaacctagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 27309704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11536362 - 11536305
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11536362 ttgttggaataagccctaatagccactctatattgattggttttggctttgtatcatg 11536305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 12750732 - 12750789
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750732 ttgttggagtaagccctaatagctaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 15152349 - 15152406
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15152349 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 15152406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 834
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388762
Alignment:
Q  616 aaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagta 715  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || ||||||||||| |||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  716 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 813  Q
    ||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  814 cttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatg 19388762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1786763 - 1786683
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1786763 cggaagcgtaggattagcaagtgctaaacctagatagaaaaataacaagtttgcaagcgacaaacatgcgaaaatagggtt 1786683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 622 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  622 tagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt 721  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | ||||||| |||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  722 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 821  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  822 tgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 909  Q
    |||||||| ||||  || |||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 622 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  622 tagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt 721  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | ||||||| |||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  722 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 821  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  822 tgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 909  Q
    |||||||| ||||  || |||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 29327689 - 29327745
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29327689 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcat 29327745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 625 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  625 agactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttata 724  Q
    ||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  725 ttggattga 733  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 615 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 19393735 - 19393462
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  19393735 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 19393637  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| |    
T  19393636 aatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactc 19393540  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 893  Q
    || |||||||| ||| ||||  || |||||||| || |  |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393539 ttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 706 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190537
Alignment:
Q  706 attatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 805  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  806 attccacccttcgacctgaaaccacta 832  Q
    ||  |||  || |||||||||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccacta 31190537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29175838 - 29175780
Alignment:
Q  183 tacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29175838 tacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagattgaaaagaaaaagtttgcaagc 29175780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 699 - 831
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 831  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 15148049 - 15148105
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15148049 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattaattgggtttggttttgtatcatg 15148105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27142722 - 27142666
Alignment:
Q  209 taaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27142722 taaacctagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 27142666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5934670 - 5934607
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5934670 tagcaagcgctaaacctagattgaaaagaaacaaatttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 5934607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 782 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  782 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagt 857  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Original strand, 3778735 - 3778797
Alignment:
Q  202 caagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3778735 caagcactaaatatagattgaaatgaacaagtttgcaagcgagaaacttgtgaaaatagggtt 3778797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Original strand, 7803031 - 7803120
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7803031 tgacgcagtacggaagcgtagg-ttagcaagggttaaacctaggtcgaaaagaaacaagtttgcaagcaacaaacttatgaaaataaggtt 7803120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Original strand, 8916334 - 8916462
Alignment:
Q  131 atcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaa-gaac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||| ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  8916334 atcatgttaggaaaagaacaagagaaacctactctgttaccaactgacgcagt-cagaagcgta-tgctagtaagcgttaaacctagatttaaaatgaac 8916431  T
Q  230 aagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  8916432 aagtttgcaaacgataaacttgtggaaatag 8916462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 11000849 - 11000915
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11000849 tagcaagcgctaaacctagattgaaaagaaacaagttcgcaagcgacaaactagtgaaaatagggtt 11000915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  743 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatag 842  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||  ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  843 atgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||| || | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30217879 - 30217819
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30217879 tagcaagcgctaaacctagattgaaa-gaacaagttcgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 30217819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 783 - 920
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  783 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 882  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||  ||||||| ||| |  |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  883 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 920  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 13392029 - 13392085
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 407  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13392029 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgtgtttgactttgtatcat 13392085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 624 - 724
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 22572344 - 22572459
Alignment:
Q  101 ccctcgtaaccggttgatcacccatggctga-tcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggtt 199  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  22572344 ccctcgtaactagttgatctctcatggttgaatcacgttcacaaaagaacatgggaaacctgctctgatgccaactgacgcagaacggaagc-aaggatt 22572442  T
Q  200 agcaagcactaaaccta 216  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22572443 agcaagcgctaaaccta 22572459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Original strand, 22572475 - 22572530
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgaga 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22572475 ggttgcaagcgacaaatctatcaaa-taagggtttccggaatccacaagaattgaga 22572530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Original strand, 5678299 - 5678388
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5678299 ggttacaagcgacaaacctatcaaa-taagggttcacata-tacaccagaattgagagaaaagtctcgaataattttattgaatgaaaaagt 5678388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Original strand, 5703351 - 5703440
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5703351 ggttacaagcgacaaacctatcaaa-taagggttcacata-tacaccagaattgagagaaaagtctcgaataattttattgaatgaaaaagt 5703440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1369871 - 1369805
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1369871 tagcaagcgttaaacctagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgataaacttgttaaaatagggtt 1369805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11228787 - 11228721
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11228787 tagcaaacactaaaccttgataaaaaagaaacaagtttggaagcgacaaacttgtggaaatagggtt 11228721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Original strand, 1753630 - 1753683
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1753630 ctaaacctaaattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 1753683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 559
Target Start/End: Original strand, 10234179 - 10234244
Alignment:
Q  494 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 559  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10234179 tagaatagttagtccgtttaatgaaccattaaatataacttaatcatgagattccattaaacataa 10234244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18258143 - 18258087
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18258143 tgttggagtaagccctgatagccaatctagattgattggttttggccttgtatcatg 18258087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 1883783 - 1883737
Alignment:
Q  3 gttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccg 49  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1883783 gttgcggttgttgttgttgatgttgtcgatcttagctgtcaacgccg 1883737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 689 - 731
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  689 ttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggatt 731  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Original strand, 8063831 - 8063885
Alignment:
Q  203 aagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaa 257  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8063831 aagcactagatctagattgaaaagaacaagtttgcaagcgataaatttgtgaaaa 8063885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4300511 - 4300470
Alignment:
Q  310 aattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4300511 aattgagagaaaatctcaaataatttgattgaatcaaaaagt 4300470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 351
Target Start/End: Original strand, 4668258 - 4668342
Alignment:
Q  267 aagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  4668258 aagcgacaaacctattaaa-taagggtttccataatccacctgaattaagagaaaagtctcgaatattttttttcaatgaaaaagt 4668342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11229038 - 11228981
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaa-gaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11229038 ctaaacctagattgaaaaagaacaagtttgcaggcgacaaacgtgtgaaaaaagggtt 11228981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 2653239 - 2653207
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653239 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 2653207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 18560913 - 18560969
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18560913 tgttggagtaagcccttaaaggcaatctatgttgattgggcttggctttgtatcatg 18560969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Original strand, 6451776 - 6451839
Alignment:
Q  202 caagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6451776 caagcgctaaatctagattgaaaggaaacaagtttgcaagcgacaaacctgtgaaaataaggtt 6451839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32053041 - 32052989
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgaga 317  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32053041 ttgcaagcgacaaatctgtcaaaa--agggtttccgaaatccaccagaattgaga 32052989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 343
Target Start/End: Original strand, 32936869 - 32936926
Alignment:
Q  284 aaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  32936869 aaataagggttttcggaatccaccataattgaga-aaattctcg-ataattttattgaat 32936926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35814936 - 35814871
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35814936 tagcaaacactaaatctagattgaaagaaccaactttgcaagcgacaaacttgtaaaaataaggtt 35814871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 930
Target Start/End: Original strand, 21940665 - 21941151
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940665 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21940764  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21940765 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 21940864  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940865 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 21940964  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21940965 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21941064  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 930  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941065 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Original strand, 22171491 - 22171974
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171491 aaggcatttccttattgattttgttttatttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 22171590  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22171591 cccattaaacata--gaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 22171688  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171689 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 22171788  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171789 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 22171888  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171889 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Original strand, 6094129 - 6094610
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6094129 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 6094228  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||    
T  6094229 ttaaacataaggaaactatttttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatg 6094328  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094329 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 6094428  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6094429 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttgg 6094528  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094529 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Original strand, 24642655 - 24643135
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642655 catttctttattgattttgttttgtttcaaaatcataaagtccctagaattgttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24642754  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  24642755 ttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatg 24642854  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642855 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatac 24642954  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642955 tacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 24643053  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 agtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Original strand, 22511875 - 22512220
Alignment:
Q  3 gttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgcc 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22511875 gttgcggttgttgatgttgatgttgtcaatcttagccgttaacgccaccatctaatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgcc 22511974  T
Q  103 ctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagc 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22511975 ctcgtaaccggttgatctcccatggctgatc-cattaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagtgtagggttagc 22512073  T
Q  203 aagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaat 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22512074 aagcgctaaacctaggtagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagtgacaaacctatcaaaataagggtttccgaaat 22512173  T
Q  303 ccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22512174 ccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaataaaaaa 22512220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 668 - 931
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  668 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 767  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  768 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcac 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  868 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 668 - 931
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  668 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 767  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  768 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcac 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  868 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Original strand, 22519175 - 22519469
Alignment:
Q  3 gttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgcc 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22519175 gttgcggttgttgatgttgatgttgtcaatcttagccgttaacgccaccatctaatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgcc 22519274  T
Q  103 ctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagc 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22519275 ctcgtaaccggttgatctcccatggctgatc-cattaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagtgtagggttagc 22519373  T
Q  203 aagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccg 298  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22519374 aagcgctaaacctaggtagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagtgacaaacctatcaaaataagggtttccg 22519469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37190127 - 37189780
Alignment:
Q  3 gttgcagttgttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgcc 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37190127 gttgcggttgttgatgttgatgttgtcaatcttagtcgttaacgccaccatctgatctaagagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattttgcc 37190028  T
Q  103 ctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagc 202  Q
    ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37190027 ctcataagtggttgatctcccatggctgatcacgttaggaaaagaacagaagaaatctgctctgataccaattgacgcagtacggaagcttagggttagc 37189928  T
Q  203 aagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaat 302  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37189927 aagctctaaaactagatagaaaagaataagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataaggg-ttccgaaat 37189829  T
Q  303 ccaccag-aattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  37189828 ccaccagaaattgaga-aaaatctcgaatattattaatgaataaaaaagt 37189780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 92 - 351
Target Start/End: Original strand, 42891584 - 42891840
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42891584 caaactctgccctcgtcatcagttgatctcccatggctgatc-cgttaggaaaagta--ggagaaacctgctttgataccaactgacgcaatacggaagc 42891680  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 291  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42891681 gtagggctagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 42891780  T
Q  292 gtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42891781 gtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcaaataattttattgaatcaaaaagt 42891840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Original strand, 22926564 - 22926816
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctg-atcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaag 190  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22926564 caaattctgccctagtgaccggttgatctcctatggctggatcacgttcacgaaagaacaggggaaacctgctctgatgccaactgacgtagtacggaag 22926663  T
Q  191 cgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataag 290  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926664 cgtagggttagaaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataag 22926763  T
Q  291 ggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22926764 ggtttctggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaatatttttattgaat 22926816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 446 - 645
Target Start/End: Original strand, 28554885 - 28555084
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554885 aaggcatttctttattgattttgtttagtttcaaaataataaaatacctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28554984  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28554985 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 175 - 348
Target Start/End: Original strand, 22921850 - 22922023
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921850 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaataagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 22921949  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921950 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaa 22922023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42890561 - 42890311
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  42890561 caaactctgccctcgtcatcagttgatctcccatggctgatct-gttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcaattag-aagc 42890464  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 291  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42890463 gtaggct-agcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggctgcaagcgacaaacctatcaaaataagg 42890365  T
Q  292 gtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42890364 gtttccggaatccacca------agagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 42890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 343
Target Start/End: Original strand, 22520799 - 22520967
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22520799 tgacgcaataaggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctaggtagaaaagatcaagtttgcaagcgacaaatttgtgaaaatagggttgcaagtgaca 22520898  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22520899 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 22520967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 174 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6845426 - 6845249
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6845426 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttacaagcgataaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 6845327  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccacc-agaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  6845326 aaacctatcaaaataagggttt-cggaatccaccaaaaattgagagaaaatctcgaatattattaatgaatcaaaaagt 6845249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 790 - 931
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  790 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  890 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23570665 - 23570516
Alignment:
Q  183 tacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23570665 tacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaataaggttgcaagcgacaaacctatc 23570566  T
Q  283 aaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23570565 aaaataagggtttccagaatgcaccagaattgagagaaaagtctcgaata 23570516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 456 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 38232570 - 38232115
Alignment:
Q  456 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  38232570 tttattgattttgttttatttcaaaataataaa-tctctagaatagttagtctgtttaataaatttttaggtataacttaatcatgacactccattaaac 38232472  T
Q  556 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcaca 655  Q
     |||  | | |||||| |||||||  |||||||| |||| |||  ||||| ||||   |||||||||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38232471 gtaaa-atagtattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgtaaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcaca 38232373  T
Q  656 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38232372 tctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacata 38232273  T
Q  756 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttg 854  Q
    |  ||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    | |||||| | ||||| | ||| |    
T  38232272 g--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcg 38232176  T
Q  855 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 915  Q
    ||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232175 agtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 540 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 14984030 - 14983710
Alignment:
Q  540 tgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagg 639  Q
    |||||||| |||||||   |||| | |||||| ||||||||  || ||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  14984030 tgagacccaattaaactataggacattattcttaaagtatctataatcaaaatttattgtgaagtgggataacattaa-gaatagggactattatgtggg 14983932  T
Q  640 aagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgcc 739  Q
     ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  14983931 tagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgcc 14983833  T
Q  740 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 838  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14983832 atgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtacc 14983736  T
Q  839 atagatgttggagttgagtgctttgt 864  Q
     |||||||  |||| |||| ||||||    
T  14983735 ctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 450 - 577
Target Start/End: Original strand, 24636860 - 24636987
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24636860 catttctttcttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccttttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24636959  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagt 577  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24636960 ttaaacataaggaaactattcttaaagt 24636987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 619 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  619 gcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaata 718  Q
    ||||||||||||||||||  | | | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  719 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 816  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 8371564 - 8371253
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371564 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8371369  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  8371368 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgg 8371270  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8371269 gtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 21969324 - 21969635
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  21969324 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21969422  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21969423 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21969519  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  21969520 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 21969618  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21969619 gtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 12562114 - 12562425
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  12562114 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 12562212  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12562213 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12562309  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  12562310 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 12562408  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12562409 gtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23573639 - 23573515
Alignment:
Q  208 ctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccacc 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23573639 ctaaagctagatagaaaataacaagtttacaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccgaaatccacc 23573540  T
Q  308 agaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
      ||||||||||||| |||||||||    
T  23573539 taaattgagagaaaagtctcgaata 23573515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27007828 - 27007517
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27007828 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27007730  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27007729 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27007633  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27007632 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27007534  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27007533 gcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27014971 - 27014660
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27014971 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27014873  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27014872 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27014776  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27014775 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27014677  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27014676 gcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27880798 - 27880487
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27880798 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27880700  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27880699 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27880603  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27880602 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27880504  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27880503 gcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28020979 - 28020668
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28020979 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28020881  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28020880 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28020784  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28020783 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 28020685  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  28020684 gcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Original strand, 2189689 - 2189810
Alignment:
Q  142 aaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2189689 aaaagaacatgagaaacatgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtaggct-agcaagcgctaaacctcgattgaaaagaacaagtttgcaagc 2189787  T
Q  242 gacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  2189788 gacaaacttgtgaaaataaggtt 2189810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 351
Target Start/End: Original strand, 18180770 - 18180859
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180770 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccagaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 18180859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22130920 - 22130609
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22130920 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22130822  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22130821 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22130725  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22130724 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 22130626  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22130625 gcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 25611186 - 25611497
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  25611186 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25611284  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| |    
T  25611285 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactc 25611381  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||    
T  25611382 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgg 25611480  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  25611481 gcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2687901 - 2687742
Alignment:
Q  104 tcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagca 203  Q
    |||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |  ||||     
T  2687901 tcgtcaccagttgatcttccatggttgatcacgttatgaaaagaacaggagaaacctgctctgataccacctgatgcagt-cggaagcg-aagactagcg 2687804  T
Q  204 agcactaaacctagatag-aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2687803 agcgctaaacctagatagaaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 2687742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 625 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  625 agactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttata 724  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  725 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 824  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  825 aaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 924  Q
    ||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  925 aatcatg 931  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26375050 - 26374900
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  | ||||||||  |||     
T  26375050 gttgatctcccatgggtgatcatgttaggaaaagaataggagaaacctgctctgataccaactgatgcagtaggaaagcgta-agctagcaagcgttaag 26374952  T
Q  213 cctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26374951 cctagattgaaaagaacaagttcgcaagcgacaaacttgtaaaaatagggtt 26374900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 21916667 - 21916978
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  21916667 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagt 21916765  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21916766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21916862  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||    
T  21916863 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgg 21916961  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  21916962 gcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 45534584 - 45534273
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  45534584 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 45534486  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  45534485 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 45534389  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  45534388 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 45534290  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  45534289 gtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 26240475 - 26240786
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||| ||||    
T  26240475 taaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagt 26240573  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | |    
T  26240574 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctc 26240670  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || ||||| |||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  26240671 ttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 26240769  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26240770 gtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 465 - 822
Target Start/End: Original strand, 2375027 - 2375386
Alignment:
Q  465 tttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaa 564  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||| |||||||||| | | |    
T  2375027 tttgttttgtttcaaaataataaactccctataataattagtcaatttaatggaacatttatgatgacttaatcatgaaaccc-attaaacatacgaata 2375125  T
Q  565 ctattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgat-------gatcacatc 657  Q
     |||| | |||||||  ||||||| | ||| ||| || ||| |||| |||||||| |||   ||||||| || || ||| ||||       |||||||||    
T  2375126 ttatttttaaagtatatgtagtcacgatttattgcga-gtgagataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatc 2375224  T
Q  658 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 757  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||      
T  2375225 acacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata-- 2375322  T
Q  758 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 822  Q
    |||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375323 aaaagttatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 216
Target Start/End: Original strand, 18180630 - 18180753
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagc 191  Q
    |||| ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18180630 caaactctgccctcgtcataagttgatctcccatggctgatcatgttaggaaaagaacaggagaaacctgctttgataccaactgacgcagtacggaagc 18180729  T
Q  192 gtagggttagcaagcactaaaccta 216  Q
    ||| || |||||||| |||||||||    
T  18180730 gta-ggctagcaagcgctaaaccta 18180753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 474 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 32873019 - 32872741
Alignment:
Q  474 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttta-atggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctc 572  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | |  || | || | |     
T  32873019 tttcaaaataataaagtccttataatagttcatccatttatatagaacattaagtatgacttaattgtgagatctcattgaaaagagtgacaatactatt 32872920  T
Q  573 aaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggat 672  Q
    ||| |||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |   |||| | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  32872919 aaaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaat 32872820  T
Q  673 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 751  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||  | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872819 aaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16598409 - 16598249
Alignment:
Q  104 tcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagca 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||  | ||||||||    
T  16598409 tcgtcaccggttgatctcccatggatgctcaagttaggaaaaggacaggagaaacctactctaataccaactaacgtaaaacggaagc-aatggttagca 16598311  T
Q  204 agcactaaacctaga-tagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16598310 agcgctaaacttagattagaaagaaacaagtttgcacgcgacaaacttgtgaaaatagggtt 16598249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 615 - 834
Target Start/End: Original strand, 18835341 - 18835556
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  18835341 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagt 18835439  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |    
T  18835440 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactc 18835536  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  18835537 ttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18468737 - 18468649
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468737 tgacgcagtacagaagca-agggttagcaagcgctaaacctaggtagaaaagaacaagcttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 18468649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 700 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781971
Alignment:
Q  700 ataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 799  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  800 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatg 8781971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 21940573 - 21940629
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940573 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 21940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 22070108 - 22070164
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22070108 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 22070164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 24578702 - 24578866
Alignment:
Q  99 tgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggt 198  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||  |   |    
T  24578702 tgccctcgtcatcggttgatcttccatggctgatcacgtacgaaaa-gaataggagaaacctgctctgataccaattgacgcaaaacaaaagc-aaaaat 24578799  T
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  24578800 tagaaagcgctaaacctagatcgaaaagaaacaagtttgcaagcggtaaatctgtgaaaatagggtt 24578866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24731316 - 24731231
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24731316 tgacgcagtacgggagcgtaggct-agcaagcgctaaacctagattgaaaaggaacaagtttgcaagcaacaaacttgtgaaaatag 24731231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 22171395 - 22171452
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22171395 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgattttgtatcatg 22171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 404
Target Start/End: Original strand, 24642555 - 24642608
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642555 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 24642608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 6094031 - 6094087
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6094031 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 6094087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 28554790 - 28554847
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554790 ttgttggagtaagccctaatagccaatctttgttgattgggtttggctttgtatcatg 28554847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 728 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  728 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 827  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  828 cactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 915  Q
    |||||||  || || ||  |||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26150669 - 26150602
Alignment:
Q  285 aataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26150669 aataaggatttccagaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaatatttttattgaatgaaaaagt 26150602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 921  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 788  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  ||||||    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  789 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 888  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  || |||| | |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  889 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24731122 - 24731035
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24731122 ctgacgcagtacagaaccgtaggct-agcaagcgctaaatttagattgaaaaggaacaagtttgcaagcaacaaacttgtgaaaatagg 24731035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 721
Target Start/End: Original strand, 29645553 - 29645631
Alignment:
Q  643 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatattt 721  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645553 actgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 818 - 935
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  818 gacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 917  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  918 ctccatgaatcatgatga 935  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 723
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  671 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15081572 - 15081494
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaa 342  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  15081572 gttgcaagcgacaaacctgtc-aaataaaggtttccagaatccacaagaattgagaaaagttctcg-ataattttattgaa 15081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 349
Target Start/End: Original strand, 38082173 - 38082260
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  ||||||  | ||||||||||| |||||    
T  38082173 ggttgcaagcgacaaacatatcaaa-taagggtttcaggaatctatcagaattgagaaaagttctcgataatttttattgaatgaaaaa 38082260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 545
Target Start/End: Original strand, 10920234 - 10920297
Alignment:
Q  482 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10920234 taataaaattcctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgagttaatcgtgagac 10920297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 352
Target Start/End: Original strand, 4360891 - 4360983
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa--tctcgaataattttattgaatcaaaaagtt 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||| |  |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4360891 ggttgcaagcgacaaacctattaaa-taaaggtttctagaatccatcgaaattgagaaaaaaagtctcgaatatttttattgaatgaaaaagtt 4360983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 2609547 - 2609584
Alignment:
Q  227 aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2609547 aacaagtttgcaagtgacaaacttgtgaaaatagggtt 2609584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9295335 - 9295256
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaat 343  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  9295335 gttgcaagcgacaaatctgtcaaa-tatgagtttctggaatccaccagaattgagaaaagttctcg-ataattttattgaat 9295256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14130244 - 14130165
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14130244 cggaagcgtaggctt-gcaagcgttaaatctagatcgaaaagagacaagtttgcaagcgataaatttgtgaaaataaggtt 14130165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20693855 - 20693799
Alignment:
Q  209 taaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20693855 taaacctagattgaaaataaacaagtttgcaagcgacaaatttgtgaaaatatggtt 20693799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 643 - 698
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  643 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 698  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26378089 - 26378031
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26378089 tgacgtagtacggaagcgtaggct-agcaagcgctaaatctagattgaaaagaacaagtt 26378031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 264
Target Start/End: Original strand, 31072069 - 31072216
Alignment:
Q  122 ccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatag 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||||| |    
T  31072069 ccatggctgatcatgttacgaaaagaactagagaaagttgctctgatactaactaacgcagt-caaaagcgta-ggctagcaagcgctaaacctagattg 31072166  T
Q  222 -------aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
           |||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  31072167 agaaattaaaaaaaaaagtttgcaagagataaacttatgaaaatagggtt 31072216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 405
Target Start/End: Original strand, 2374946 - 2375000
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 405  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2374946 ttgttggaataagccctaataataaatatgtattgattggatttggctttgtatc 2375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 818 - 936
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  818 gacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 917  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||| |  ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  918 ctccatgaatcatgatgat 936  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2689183 - 2689146
Alignment:
Q  227 aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2689183 aacaagtttgcaagcgacaaaactgtgaaaatagggtt 2689146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 870 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  870 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 389
Target Start/End: Original strand, 24636605 - 24636642
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattg 389  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636605 tgttggagtaagccataatagccaatctatattgattg 24636642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 782 - 827
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645720
Alignment:
Q  782 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 827  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaac 29645720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6654
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7141 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 7042  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7041 accctattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6942  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6941 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6842  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6841 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6742  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13670
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14157 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctacaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 14058  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14057 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 13958  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 13858  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13857 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 13758  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13757 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7177
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7234 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14193
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14249 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 14193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18774
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18288 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18387  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18388 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18487  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18488 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18587  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18588 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18687  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18688 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 18196 - 18252
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 21330455 - 21329968
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330455 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21330356  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21330355 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtgga 21330256  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330255 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 21330156  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330155 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21330056  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21330055 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 18796506 - 18796993
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796506 acaaggaatttatttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18796605  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||| | || |||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  18796606 acctcttttaacataaggatattattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtaga 18796705  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18796706 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatga 18796805  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18796806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaa 18796905  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796906 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 446 - 937
Target Start/End: Original strand, 18619807 - 18620296
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18619807 aaggaatttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctataataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaattatgagac 18619906  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    || |||||||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| || || |     
T  18619907 cc-attaaacaaaaggatattattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggcc 18620005  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  18620006 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgaga 18620105  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  18620106 atactacatagtaaaagttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatg 18620204  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 937  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620205 ttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 113 - 351
Target Start/End: Original strand, 27956093 - 27956330
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27956093 gttgatctcccatggctgatc-cgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaa 27956191  T
Q  213 cctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956192 cctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacctatgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatgaaaataagggtttccggaatccaccagaat 27956291  T
Q  313 tgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956292 tgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 27956330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 92 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2156139 - 2155887
Alignment:
Q  92 caaattctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctg-atcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaag 190  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2156139 caaattctgccctagtaaccg-ttgatctcccatggctggatcacgttcacgaaagaacaggggaaacctgctctgatgccaactgacgcagtacggaag 2156041  T
Q  191 cgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataag 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156040 cgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcgagcgacaaacttgtgaaaataggattgcaagcgacaaacctatcaaaataag 2155941  T
Q  291 ggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaat 343  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  2155940 ggttttcggaatccatcagaattgagagaaaagtcttgaatattattattgaat 2155887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Original strand, 27952318 - 27952494
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27952318 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 27952417  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27952418 aacctttgaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 27952494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31634254 - 31634015
Alignment:
Q  114 ttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaac 213  Q
    |||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31634254 ttgatctcccatagttgatcatgctaggaaaagaacaggagaaacctgctatgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaaacgctaaac 31634155  T
Q  214 ctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31634154 ctagatagaaaagaacaagtttgctagcgacaaacttgtgaaaataggattgcaagcgacaaacctatcaaaataagggttt-cggaatccaccagaaat 31634056  T
Q  313 tgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagttg 353  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||    
T  31634055 tgagagaaaatctcaaatattattaatgaataaaaaagttg 31634015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 478 - 931
Target Start/End: Original strand, 36270199 - 36270650
Alignment:
Q  478 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||  |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||| |||     
T  36270199 aaaataataaagtccctagaatagttagtttacttaaatgaaatgttaagtgtgacttaatcgtgagacatcattaaacacaatgacactattcttaaaa 36270298  T
Q  577 tatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 676  Q
     ||||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||   |||| || ||||    
T  36270299 catccgtaatcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaag 36270398  T
Q  677 agttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtc 776  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||    
T  36270399 agttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtc 36270495  T
Q  777 ataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaa 875  Q
    | |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| || | ||||||  || | ||||    
T  36270496 acaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaa 36270594  T
Q  876 cgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270595 agtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22011526 - 22011368
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22011526 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagtgacaaacttgtgaaaatagggttggaagcgac 22011427  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaata 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22011426 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaata 22011368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33655717 - 33655540
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33655717 ctgacgcagtacggaagtgtagg-ttagcaagcgctaaacctagatagaaaaatacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaaacgac 33655619  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33655618 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatgaaaaagt 33655540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31636427 - 31636247
Alignment:
Q  174 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31636427 ctgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaacctagatagaaaagaactagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatatggttgcaagcgac 31636328  T
Q  274 aaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagttgt 354  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  31636327 aaacctatcaaaataaggg-ttccggaatccaccagaaattgagagaaaatcttgaatattattaatgaataaaaaagttgt 31636247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 478 - 919
Target Start/End: Original strand, 18822115 - 18822556
Alignment:
Q  478 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaaca-ttaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 575  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18822115 aaaataataaagtctatagaattgttagttcgtttaaatggaaaaattaagtgtggcttaatcgtgagacaccattaaacacaaggacactattcttaaa 18822214  T
Q  576 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 675  Q
      ||  ||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  18822215 acatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataag 18822314  T
Q  676 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 775  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||| ||||  |    
T  18822315 gagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-at 18822411  T
Q  776 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaa 874  Q
    |  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||| |||| |   |||  ||    
T  18822412 ctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataa 18822511  T
Q  875 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 919  Q
    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822512 acgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 509 - 931
Target Start/End: Original strand, 20977957 - 20978360
Alignment:
Q  509 gtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtggga 608  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  || |||||| ||    
T  20977957 gtttaatggaacattaagaataatttaatcatgagatcccattaaaaataaggaaattattcttaaaacatccgtagtcaagctttaatgtgaagtgaga 20978056  T
Q  609 tatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 708  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20978057 tatcactaaagcatagagactattatgtggatagac-----------------agatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattatt 20978139  T
Q  709 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20978140 atgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--aaaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtat 20978236  T
Q  808 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 907  Q
    ||||| ||| ||| ||| || |||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |     
T  20978237 tccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtactttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcga 20978336  T
Q  908 ttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978337 ttgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 606 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 22183528 - 22183206
Alignment:
Q  606 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 705  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183528 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 22183429  T
Q  706 attatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 804  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  22183428 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 22183333  T
Q  805 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 904  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||  | ||||| ||||| |||| ||||||     | ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22183332 tattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagt 22183233  T
Q  905 tggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183232 cgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33051769 - 33051618
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaa 212  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  33051769 gttgatctctcatggctgatcacgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgtagtacggaagctta-ggctagcaagcgctaaa 33051671  T
Q  213 cctagatag-aaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33051670 cctaaattgaaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttttgaaaatagggtt 33051618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 619 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  619 gcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattatgagtaa 716  Q
    ||||| ||| |||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  717 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 815  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||| |||||  ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattatg-taagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  816 tcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36647414 - 36647293
Alignment:
Q  142 aaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36647414 aaaagaacatgagaaacatgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtaggct-agcaagcgctaaacctcgattgaaaagaacaagtttgcaagc 36647316  T
Q  242 gacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36647315 gacaaacttgtgaaaatagggtt 36647293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174679
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  30174368 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30174466  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  30174467 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 30174563  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  30174564 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 30174662  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  30174663 gcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 24250343 - 24250032
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  24250343 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 24250245  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  24250244 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 24250148  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24250147 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24250049  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  24250048 gcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 450 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19692737 - 19692598
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| | ||    
T  19692737 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagcctgacttaatcatgagatctca 19692638  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa 589  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19692637 ttaaactaaaggaaattattcttaaagtatccttagtcaa 19692598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 564 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 18852146 - 18851956
Alignment:
Q  564 actattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacag 663  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||   || |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |    
T  18852146 actattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacgg 18852047  T
Q  664 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 754  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18852046 atcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28738054 - 28737911
Alignment:
Q  114 ttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaac 213  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||||||    
T  28738054 ttgatctcccatggctgatcatgttaggaaaagcacaagagaaatctgctctgataccaactgacgcagt-cggaagcgta-gtctagcaagtgctaaac 28737957  T
Q  214 ctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28737956 ctagattgaaaagagcaagtttgcaagcgacaaacttttgaaaata 28737911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 24229526 - 24229215
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  24229526 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 24229428  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  24229427 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 24229331  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || | | |||||||||||||  || |||||| | || |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  24229330 ttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagg 24229232  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24229231 gtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 601 - 756
Target Start/End: Original strand, 19279445 - 19279600
Alignment:
Q  601 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagata 700  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||   |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19279445 aagtgggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagata 19279544  T
Q  701 taaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 756  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279545 tagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15129478 - 15129390
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15129478 tgacgtagtacggaagcgtaggct-agcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagttcgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 15129390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 692 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || |||||| || | |  | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtact 919  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8781515 - 8781429
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8781515 ggttgcaagcgacaaacctatcaaa-taagggtttc-gaaatccaccagaattgagagtaaatctcgaataattttattgaatgaaaaa 8781429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21330549 - 21330493
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330549 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 21330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 768 - 931
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  768 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcac 867  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttca-ccttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  868 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 699 - 933
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 898  Q
     |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||| |  |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  899 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatgat 933  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22264437 - 22264348
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264437 ggttgcaagagacaaacctatcgaa-taaaggtttctagaatccatcagaattgagataaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 22264348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2165983 - 2165899
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  2165983 tgacgcagtacgacagcgtagggttaacaagcgttaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcaacaaacttatcaaaata 2165899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 32163694 - 32163860
Alignment:
Q  97 tctgccctcgtaaccggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagg 196  Q
    ||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||| | |    
T  32163694 tctgccctcgttataagttgatctcccatggttgatcacgttaggaaaagaatagaagaaatatgctctaataccaactgacgcagt-cagaagcg-aag 32163791  T
Q  197 gttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    | ||| ||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32163792 gctagaaagcgttaaacctagattgaaaagaaataagtttgtaagcgtcaaacttgtgaaaatatggtt 32163860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 701 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  701 taaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  801 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 900  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  || ||||||| ||| || || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatgt-ggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  901 aagttg 906  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 641 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 36801992 - 36801899
Alignment:
Q  641 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattatgagtaatatttatattggattga 733  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  36801992 agactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgct--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23457712 - 23457646
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457712 tagcaagcgctaaacctagattgaaaataaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 23457646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 322
Target Start/End: Original strand, 44675308 - 44675368
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44675308 ggttgcaagcgacatacctatcaaa-taagggttttcggaatccaccagaattgagagaaaa 44675368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616641
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 19616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 699 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 833  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Original strand, 5171596 - 5171674
Alignment:
Q  186 ggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaaga-acaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5171596 ggaagcgtagg-ttaacaagcgctaaatctagattgaaaagagacaagtttgcaagcgacaaacttgtaaaaatagggtt 5171674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21772452 - 21772375
Alignment:
Q  186 ggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21772452 ggaagcgtagg-ttagccaacgctaaacttagattgaaaaaaacaagtttgcaagcgacaaacttatgaaaatagggtt 21772375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23456704 - 23456638
Alignment:
Q  112 ggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgac 178  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  23456704 ggttgatctctcatggctgatcacgttaggaaaagaacaaaagaaacttgctctgataccaactgac 23456638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 32161993 - 32162058
Alignment:
Q  200 agcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32161993 agcaagcgttaaacctagatcgaaaagaaacaagtttgcaagtgacaaacttgtgaaaatagggtt 32162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12966532 - 12966477
Alignment:
Q  209 taaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12966532 taaatctagattgaaaagaacaagttcgcaagcgacgaacttgtgaaaatagggtt 12966477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 864 - 931
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  864 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1518281 - 1518193
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1518281 tgacgcagtacggaagcgta-tcctagcaagcgcttaacctagattgaaagggacaagttcgcaagcgacgaacttatgaaaatagggtt 1518193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 351
Target Start/End: Original strand, 18725683 - 18725770
Alignment:
Q  264 tgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  18725683 tgcaagcgacaaacctatc-aaataaaggtttctggattccactaaaattaagagaaaagtttcaaataattttattgaatgaaaaagt 18725770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2165924 - 2165838
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  2165924 ttgcaagcaacaaacttatcaaaataaatgttttcagaatccaccaaaattgagagaaaagtctcgaatattattaatgaataaaaa 2165838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5841305 - 5841221
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5841305 gttgcaagcgacaaacctgtc-aaacaggggttttcggaatccacaagaattgagaaaagttctcg-ataattttattgaatgaaaa 5841221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8294644 - 8294582
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaa-aagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8294644 tagcaagtgctaaacttagatagaagaagaacacgtttgcaagcgacaaacttgtaaaaatag 8294582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 615 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 24763868 - 24763751
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24763868 taaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagt 24763770  T
Q  715 aatatttatattggattga 733  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763769 aatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19692830 - 19692773
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19692830 ttgttggagtaagccttaatagccaatctgtatttattaggtttggttttgtatcatg 19692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 784 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799757
Alignment:
Q  784 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagt 852  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagt 36799757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 770 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740922
Alignment:
Q  770 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatg 28740922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23456631 - 23456580
Alignment:
Q  209 taaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23456631 taaacctatattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttttgaaaata 23456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4184963 - 4184929
Alignment:
Q  230 aagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4184963 aagttcgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 4184929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28737903 - 28737841
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgac-aaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28737903 tagcaagcgctaaacctaaattgaaaagagtaagtttgcaagagacaaaacttgtgaaaatag 28737841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 12098654 - 12098609
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctca 660  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  12098654 taaaacatagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 24695673 - 24695186
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695673 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 24695574  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24695573 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtaga 24695474  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695473 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 24695374  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24695373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 24695274  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695273 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 19714703 - 19714218
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714703 aaggcatttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 19714604  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19714603 cccgttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 19714504  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714503 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 19714404  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatg 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19714403 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 19714304  T
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714303 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 18570070 - 18569581
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570070 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18569971  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  18569970 accccgttaaacataaggaaactactcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtaga 18569871  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccat 741  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18569870 ctgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccat 18569771  T
Q  742 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccata 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569770 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 18569671  T
Q  842 gatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569670 catgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 19707419 - 19706939
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19707419 catttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 19707320  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19707319 ttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatg 19707220  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707219 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 19707120  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttgg 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||    
T  19707119 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattgg 19707021  T
Q  850 agttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707020 agtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 21848802 - 21849147
Alignment:
Q  12 gttgttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgtaacc 111  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  21848802 gttgttgttgatgttgccgatcttagccgtcaacgccaccatatgatctaacagagctttggcggccgtatttaaaccgtcaaattatgtcctcgtaacc 21848901  T
Q  112 ggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21848902 ggttgatctcccatggctgatcacgttagggaaaaaacaggagaaacctgctctgataccaaccgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcgccaa 21849001  T
Q  212 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacctatc------aaaataagggtttccggaatcca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| |||| |||||||||    
T  21849002 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgacaaacttatcaaaataaaaataagtgttttcggaatcca 21849101  T
Q  306 ccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849102 ctagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 21849147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 557 - 809
Target Start/End: Original strand, 39538701 - 39538953
Alignment:
Q  557 taaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacat 656  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  39538701 taaggacactattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatat 39538800  T
Q  657 ctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 756  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  39538801 ttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatag 39538900  T
Q  757 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 809  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538901 taaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 450 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 22547217 - 22546872
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22547217 catttatttattcattttgttttattttaaaataataaaaccgctataatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaatcgtgagatctca 22547118  T
Q  550 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatg 649  Q
    ||||| ||| ||| | |||| | ||||||| || |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||    
T  22547117 ttaaatatatggacattatttttaaagtattcgcagtcaaactttattgtgaagtgagataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatg 22547018  T
Q  650 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 749  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22547017 atcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatac 22546918  T
Q  750 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546917 tacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 448 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17285935 - 17285470
Alignment:
Q  448 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 547  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  17285935 ggcatttatttattgattttgttatgtttcaaaataataatctccagagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgaaaccc 17285836  T
Q  548 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactga 647  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| ||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||                ||    
T  17285835 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgtgaattgggatagtattaaagcatatagact----------------ga 17285752  T
Q  648 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 747  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17285751 tgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaat 17285652  T
Q  748 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgt 846  Q
    |||||||||  ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | |    
T  17285651 actacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggttt 17285555  T
Q  847 tggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     ||| | |||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285554 aggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 175 - 351
Target Start/End: Original strand, 40778786 - 40778962
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40778786 tgacgcagtacggaagcgcagggttaacaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtaaaaatagggttgcaagcgaca 40778885  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40778886 aacctatcaaaataagggtttctggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 40778962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 448 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17299088 - 17298621
Alignment:
Q  448 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 547  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||    
T  17299088 ggcatttatttattgattttgttatgtttataaataataatatccagagaatagttagtccgattaatggaacattaagtgcgacttaatcgtgaaaccc 17298989  T
Q  548 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactga 647  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  ||||||||||  ||||||||||| |||||            || |||    
T  17298988 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgttaagtgggatagtattaaagcatatagact------------ga-tga 17298902  T
Q  648 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 747  Q
    | | ||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17298901 tca-cacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaat 17298803  T
Q  748 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgt 846  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17298802 actacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggttt 17298706  T
Q  847 tggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
     ||||| |||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298705 aggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 510 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 18807175 - 18806850
Alignment:
Q  510 tttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa-ggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtggga 608  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| || ||| |||||  ||    
T  18807175 tttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgagacaccattaaa-ataatggacattattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaaga 18807077  T
Q  609 tatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 708  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807076 taacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 18806977  T
Q  709 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 807  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18806976 agaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtat 18806880  T
Q  808 tccacccttcgacctgaaaccactatgtac 837  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806879 tccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 449 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 27347679 - 27347425
Alignment:
Q  449 gcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc 548  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||     
T  27347679 gcatttctttgttgattttgttttgattcaaaataataaagtccttagaataattaatctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc- 27347581  T
Q  549 attaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgat 648  Q
    |||||||  ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||    
T  27347580 attaaacgaaaggacattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgat 27347481  T
Q  649 gatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347480 gatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 757 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  757 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgag 856  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  857 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 824 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 923  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  924 gaatcatg 931  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 20941018 - 20941329
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  20941018 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20941116  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20941117 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20941213  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  20941214 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 20941312  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20941313 gtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 25805696 - 25805385
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  25805696 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25805598  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  25805597 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 25805501  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    ||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  25805500 ttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 25805402  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  25805401 gtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 31890 - 32201
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31890 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 31988  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31989 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 32085  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  32086 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 32184  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  32185 gcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 12789974 - 12789663
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  12789974 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagt 12789876  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | |    
T  12789875 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctc 12789779  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12789778 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12789680  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12789679 gtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 22941241 - 22941552
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  22941241 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagt 22941339  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22941340 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22941436  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22941437 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 22941535  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  22941536 gtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 23545913 - 23546224
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  23545913 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 23546011  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  23546012 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 23546108  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  23546109 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 23546207  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  23546208 gcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 264
Target Start/End: Original strand, 19497240 - 19497393
Alignment:
Q  111 cggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcacta 210  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||    
T  19497240 cggttgatctcccatggtggatcacgttaggaaaagaacaggagaaacctgctctgatatcaactgacgcggtacggaag-taaggattagcaagcgcta 19497338  T
Q  211 aacctag-atagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497339 aatgtagaaaaaaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 19497393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 24933617 - 24933306
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  24933617 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 24933519  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  24933518 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 24933422  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24933421 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24933323  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24933322 gtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 31096807 - 31097118
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  || ||||    
T  31096807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagt 31096905  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31096906 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 31097002  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||| ||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  31097003 ttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 31097101  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  31097102 gtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 626 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  626 gactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatat 725  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| ||||||| |||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  726 tggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 825  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  826 accactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 919  Q
    |||||||||  ||  ||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Original strand, 39537962 - 39538071
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39537962 acaagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaatggttaagtccttagaatagttggttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 39538061  T
Q  544 accccattaa 553  Q
    ||| ||||||    
T  39538062 acctcattaa 39538071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 5097642 - 5097953
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  5097642 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagt 5097740  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  5097741 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 5097837  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  ||  ||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||    
T  5097838 ttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgg 5097936  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||   ||||||||||    
T  5097937 gtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 12765305 - 12764990
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  12765305 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12765207  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 811  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12765206 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcg 12765109  T
Q  812 cccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |  | |||| |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12765108 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12765010  T
Q  912 tgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12765009 tgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 712 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 18806613 - 18806490
Alignment:
Q  712 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattcc 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18806613 agtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattcc 18806517  T
Q  811 acccttcgacctgaaaccactatgtac 837  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806516 acccttcaacctgaaaccactatgtac 18806490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 712 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 18806793 - 18806670
Alignment:
Q  712 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattcc 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18806793 agtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattcc 18806697  T
Q  811 acccttcgacctgaaaccactatgtac 837  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806696 acccttcaacctgaaaccactatgtac 18806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 7865745 - 7865430
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  7865745 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 7865647  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 811  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  7865646 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 7865549  T
Q  812 cccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  7865548 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 7865450  T
Q  912 tgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  7865449 tgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24695766 - 24695709
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695766 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 24695709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 450 - 553
Target Start/End: Original strand, 31886537 - 31886640
Alignment:
Q  450 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31886537 catttctttagtgattttgttttgtttcaaattaataaagtccttagaataattagttcatttaattgaacatcaagtacgacttaatcgtgagactcca 31886636  T
Q  550 ttaa 553  Q
    ||||    
T  31886637 ttaa 31886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9812048 - 9811733
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  9812048 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 9811950  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 811  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  9811949 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 9811852  T
Q  812 cccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |  | |||| |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  9811851 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 9811753  T
Q  912 tgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  9811752 tgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 12704189 - 12703874
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  12704189 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12704091  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 811  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12704090 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 12703993  T
Q  812 cccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 911  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |  | |||| |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12703992 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12703894  T
Q  912 tgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12703893 tgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 682 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829377
Alignment:
Q  682 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 781  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  782 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 837  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtac 18829377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 26245093 - 26245404
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||| ||||    
T  26245093 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagt 26245191  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    |||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | |    
T  26245192 aatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctc 26245288  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||| ||||  |  |||||  |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||    
T  26245289 ttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgg 26245387  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26245388 gtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 173
Target Start/End: Original strand, 9868337 - 9868400
Alignment:
Q  109 accggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaa 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9868337 accggttgatctcccatggctgatcacgttagaaaaagaacagga-aaacctgctctgataccaa 9868400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19714798 - 19714742
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714798 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19714742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 692 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  |  |||||| |||| |  |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 343
Target Start/End: Original strand, 19677217 - 19677298
Alignment:
Q  261 ggttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaa-tctcgaataattttattgaat 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19677217 ggttgcaagcgacaaacctttcaaa-taagggttttcggaatccaccagaattgagagaaaagtctcgaat-attttattgaat 19677298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19707520 - 19707462
Alignment:
Q  350 gttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19707520 gttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 19707462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 846 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  846 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27347778 - 27347722
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347778 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgcgtttggctttgtatcatg 27347722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18252504 - 18252416
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaa-agaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18252504 tgacgcagt-cggaagtgtaggctta-caagcgttaaacctagatagaaatagaacaagtttgcaagcgacaaacctgtgaaaatagggtt 18252416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Original strand, 8456380 - 8456465
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaag-aacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8456380 tgacgcagt-cggaagcgtagggt-agcaagcgctaaacctagattgaaaagaaacaagttcgcaagcgacgaacttgtaaaaatagg 8456465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22440936 - 22440858
Alignment:
Q  185 cggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22440936 cggaagcgtaggct-agcaagtgctaaacctagatagaaaagaacatgttcgcaagcgacaaacttatgataatagggtt 22440858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 348 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18570168 - 18570108
Alignment:
Q  348 aagttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18570168 aagttgttcgagtaagctctaatagctaatctatattaattgggtttggctttgtatcatg 18570108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33477479 - 33477193
Alignment:
Q  470 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac-tat 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| |||||| |||||| |  | | |    
T  33477479 tttgtttcaaaataataaagtccttacaatagttaggctgattaatggatcattaagtgtgatctaatcgtgagacctcattaatcataagcacgcttgt 33477380  T
Q  569 tctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcat 668  Q
    ||| ||| |||  ||| ||||| |||     ||||||| ||| || ||| || || | ||||||||||  | | |||||| ||||||| ||| || ||||    
T  33477379 tcttaaactatatgtattcaagttttacgatgaagtggaataacaataatgcgtaaaaactattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcat 33477280  T
Q  669 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 756  Q
    |||| | ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477279 ggat-atgaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 492633 - 492567
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  492633 tagcaagcgctaaatttagattgaaaagaaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaagatagggtt 492567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 854 - 931
Target Start/End: Original strand, 39538958 - 39539035
Alignment:
Q  854 gagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538958 gagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 407
Target Start/End: Original strand, 39537870 - 39537925
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  39537870 tgttggattaagccctaatagccaatctatgttgactgagtttagctttgtatcat 39537925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26140431 - 26140343
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaa-agaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26140431 tgacgcagt-cggaagcatagg-ttagcaaacgctaaatctagattgaaagaaaacaagattgcaagcgacaaacttatgaaaatagggtt 26140343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Original strand, 35160815 - 35160899
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  35160815 gttgcaaacgacaaacctgtcaaa-taagggtttcaggattccaccagaattaagaaaagttctcg-ataattttattgaatgaaaa 35160899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 206
Target Start/End: Original strand, 21844437 - 21844468
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844437 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagc 21844468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 702 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  702 aaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 562
Target Start/End: Original strand, 11479420 - 11479489
Alignment:
Q  494 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc-cattaaacataagga 562  Q
    ||||||| |||||  |||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11479420 tagaataattagtgtgtttaatgaaatattaagtgtgacttgattgtgagaccctcattaaacataagga 11479489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 931
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7594
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 acaaggtatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatagaacattaagtataacttaattgtgag 7206  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7207 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 7306  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7307 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 7406  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7407 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctaga 7506  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 7014 - 7071
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7014 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgcatcatg 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 26197 - 25706
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26197 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccatttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26098  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26097 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgaaaagtgggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtaga 25998  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 25898  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 25798  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25797 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26287 - 26231
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287 ttgttggaataagccctaatagtcaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 26231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 444 - 912
Target Start/End: Original strand, 993 - 1461
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 543  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  993 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgag 1092  T
Q  544 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaaga 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1093 accccattaaacataaagaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 1192  T
Q  644 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1193 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatga 1292  T
Q  744 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1293 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 1392  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 912  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 901 - 957
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 446 - 935
Target Start/End: Original strand, 5531 - 6013
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5531 aaggcatttctttattgatttatttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 5630  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagact 645  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  5631 cccgttaaacataaggaaattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 5730  T
Q  646 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 745  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5731 gatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtga 5830  T
Q  746 atactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccataga 843  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5831 atactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctaga 5921  T
Q  844 tgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 935  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5922 tgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 5435 - 5492
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5435 ttgttgaagtaagccctaatagccaatctatattgtttgggtttggctttgtatcatg 5492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 675 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  675 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  775 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaa 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  875 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 446 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 230545 - 230365
Alignment:
Q  446 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230545 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcttataatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 230446  T
Q  546 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 627  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230445 ccc-ttaaacataaggaaaccattcttaaagtatttgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 230640 - 230584
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230640 tgttggagtaagcaataatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 230584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 348
Target Start/End: Original strand, 45262 - 45435
Alignment:
Q  175 tgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggttgcaagcgaca 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45262 tgacacagtacggaagcgtagggttagcaagcgctaaaattagataagaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttatgaaaataaggttgcaagcgaca 45361  T
Q  275 aacctatcaaaataagggtttccggaatccaccag-aattgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  45362 aacctatcaaaataaggg-ttccagaatccaccagaaattgagagaaaatctcgaatattattaatgaataaaaa 45435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 248
Target Start/End: Original strand, 46713 - 46806
Alignment:
Q  155 aaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaac 248  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46713 aaaccggctctgatgccaactgacgcagtacggaagcgtagggtgagcaagcgctaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaac 46806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 351
Target Start/End: Original strand, 46792 - 46880
Alignment:
Q  263 ttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaa-ttgagagaaaatctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  46792 ttgcaagcgacaaacctatcaaaattaaggtt-ccggaatccaccaaaaattgagagaaaatctcgaatattattaatgaataaaaaagt 46880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 174 - 485
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  174 taaagcgtcgagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 272  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  273 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 369  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  370 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 468  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  469 gtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3675
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  3986 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3888  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3887 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3791  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3790 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3692  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  3691 gcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Original strand, 119721 - 120032
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  119721 taaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 119819  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  119820 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 119916  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  119917 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 120015  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||  ||||||||||    
T  120016 gcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 615 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 13260 - 12961
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  13260 taaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 13162  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |    
T  13161 aatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactc 13065  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  13064 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgg 12966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 615 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 130535 - 130262
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  130535 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 130437  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  130436 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 130340  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 893  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130339 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 615 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 67685 - 67374
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  67685 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 67587  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  67586 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 67490  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 914  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||| |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  67489 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 67391  T
Q  915 gtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||  ||||||||||    
T  67390 gtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 834
Target Start/End: Original strand, 8296 - 8511
Alignment:
Q  615 taaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagt 714  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  8296 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 8394  T
Q  715 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 814  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8395 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8491  T
Q  815 ttcgacctgaaaccactatg 834  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8492 ttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16196 - 16051
Alignment:
Q  112 ggttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaa 211  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||  ||||    
T  16196 ggttgatctctcatggctgatcacattaggaaaagaactggagaaacctgctctgataccaactgacgcagt-cggaa-cgta-ggctaacaagtgctaa 16100  T
Q  212 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  16099 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagtgacaaacatctgaaaatag 16051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14988 - 14850
Alignment:
Q  121 cccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaaacctagata 220  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || |||||||| |||||||| |||     
T  14988 cccatggctgattaagttaggaaaagaacgggagaaacctgctctgataccaactgacgcaat-tagaagcgta-ggctagcaagcgctaaaccttgatt 14891  T
Q  221 gaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14890 gaaataaataagttggcaagcgaaaaacttgtgaaaatagg 14850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1797 - 1658
Alignment:
Q  125 tggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgt-agggttagcaagcactaaacctagatagaa 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||| | || | || |  | ||||||||  ||||||||||| |||    
T  1797 tggctgatcacgttaggaaaagaataggagaaacttactctgataccaactaacacagt-cagacgtgtaattgctagcaagcgttaaacctagattgaa 1699  T
Q  224 aagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  1698 agaaacaagtttgcaaacgacaaacttgtcaaaatatggtt 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0531 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0531
Description:

Target: scaffold0531; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 11527 - 11672
Alignment:
Q  113 gttgatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacc-tgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagggttagcaagcactaa 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  11527 gttgatctcccatggctaatc-cgttaggaaaagaacaggagaaaccatgctctgataccaactgacccaatacagaagcgtaggct-agcaagcattaa 11624  T
Q  212 acctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaata 259  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11625 tcctagattaaaaagaaaaagtttgcaagtgacaaacttgtgaaaata 11672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| | ||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 14920 - 15084
Alignment:
Q  16 ttgttgatgttgtcaatcttagccgtcaacgccgtcgactgatctaacagagctttggcggccgcatttaaactgccaaattctgccctcgtaaccggtt 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||  ||  ||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  14920 ttgttgatcttgtcaatcatagctgtcaatgtcgtcatctagtctgacatatttttgacggccgcaattaaactgttaaattctgcccttgtaaccggtt 15019  T
Q  116 gatcacccatggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgc 180  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15020 gatctcccatggctgatcaagttagtaaaagaacacaagaaacctgctctgatatcaactgacgc 15084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 624 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  624 gagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  724 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 823  Q
    |  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  824 aaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 923  Q
    |||||||||||  || || ||  |||| |  |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  924 gaatcatg 931  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 601 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 90019
Alignment:
Q  601 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagat 699  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  90166 aagtgggataatattaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagat 90067  T
Q  700 ataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 747  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90066 ataaatattacgtataacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 444 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8446
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 8446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8603 - 8546
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8603 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggttcggctttgtatcatg 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23826 - 23769
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23826 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 701 - 903
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  701 taaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 800  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  801 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 900  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||  |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Original strand, 16522 - 16579
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16522 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttatatcatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 477
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16648
Alignment:
Q  444 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615 acaaggcatttctttattgattttgttttgnttc 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 741 - 931
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  741 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccat 840  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  || |    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  841 agatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    |||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 699 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 798  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  799 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 834  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37772 - 37714
Alignment:
Q  203 aagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagg 261  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37772 aagcgctaaacctagattgaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttatgaaaatagg 37714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 49375 - 49322
Alignment:
Q  211 aacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49375 aacctagattgagaagaacaagtttgcaagcgacaaacttatgaaaatagggtt 49322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 98 - 41
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  98 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Original strand, 8944 - 9000
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8944 tgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 699 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  699 tataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 795  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  796 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 895  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  || ||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  896 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 351
Target Start/End: Original strand, 8243 - 8331
Alignment:
Q  262 gttgcaagcgacaaacctatcaaaataagggtttccggaatccaccagaattgagagaaa-atctcgaataattttattgaatcaaaaagt 351  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  8243 gttgcaagcgacaaacctgtcaaa-taagggtttctggaatccatcagaattgagaaaaagatctcgaa-aatttgattgaatgaaaaagt 8331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9769 - 9702
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgac--aaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  9769 tagcaagcggtaaacctagattgaaaagaacaagtttccaagcgactaacacttgtgaaaatagggtt 9702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17779 - 17640
Alignment:
Q  125 tggctgatcacgttagaaaaagaacaggagaaacctgctctgataccaactgacgcagtacggaagcgtagg-gttagcaagcactaaacctagatagaa 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||| | || | |||   | ||||||||  ||||||||||| |||    
T  17779 tggctgatcacgttaggaaaagaatagtagaaacttactctgataccaactaacacagt-cagacgtgtaattgctagcaagcgttaaacctagattgaa 17681  T
Q  224 aagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17680 agaaacaagtttgcaaacgacaaacttgtcaaaatatggtt 17640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10256 - 10202
Alignment:
Q  354 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 408  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10256 ttggagtaagctctaatagccaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10158 - 10127
Alignment:
Q  463 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 754
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  663 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----tatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 754  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  352 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 931
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  692 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 791  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  792 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccatagatgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 891  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  || ||| || |||| |  |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  892 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 931  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 709
Target Start/End: Original strand, 92194 - 92432
Alignment:
Q  473 gtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattct 571  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||  | |  | ||||||    
T  92194 gttttaaagtaataaagtctctagaatatctagttattttaaatggaacattaagtataacttaatcgtgagacagcaataaacagcaaggcattattct 92293  T
Q  572 caaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcatt-aaagcatagagactattatgtaggaagactgatgatcacatctcacagatcatgg 670  Q
     |||  || ||||||||||||||  || | || |||||| | || ||| | |||| |||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  92294 taaaacattcgtagtcaagctttagtgtggagagggataactttaaaatcttagaaactattatatggctagactgatgattacatgtcacgagtcatgg 92393  T
Q  671 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 709  Q
    |||| || |||||||||| || || | ||||||||||||    
T  92394 ataaggaattatcaagtcatcgcacatatataaatatta 92432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 145800 - 145734
Alignment:
Q  199 tagcaagcactaaacctagatagaaaagaa-caagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatagggtt 264  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  145800 tagcaatcgctaaacctagattgaaaaaaatcaagtttgcaagcgacaagcttgtaaaaatagggtt 145734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 711 - 807
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  711 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 807  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 404
Target Start/End: Original strand, 5877 - 5930
Alignment:
Q  351 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 404  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5877 ttgttggagtaagtcataatagccaatctatattgattgagtttgactttgtat 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16466 - 16402
Alignment:
Q  196 ggttagcaagcactaaacctagatagaaaagaacaagtttgcaagcgacaaacttgtgaaaatag 260  Q
    |||||| || ||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16466 ggttagtaaacactaaacctagattaaaaaaaatgagtttgcaagcgacaaacttgagaaaatag 16402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 317
Target Start/End: Original strand, 28711 - 28744
Alignment:
Q  284 aaataagggtttccggaatccaccagaattgaga 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28711 aaataagggtttccggaatctaccagaattgaga 28744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University