View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20608_low_11 (Length: 425)

Name: NF20608_low_11
Description: NF20608
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20608_low_11
NF20608_low_11
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (2-418)||(8929387-8929803)
chr4 (29-408)||(8900570-8900949)
chr4 (12-416)||(8914467-8914871)
chr4 (31-418)||(8979075-8979462)
chr4 (35-408)||(9000158-9000531)
chr4 (26-416)||(8966240-8966630)
chr4 (25-416)||(8954733-8955124)
chr4 (35-408)||(9030593-9030966)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (31-416)||(9400259-9400644)
chr5 (29-409)||(20074028-20074408)
chr5 (68-132)||(31072051-31072115)
chr5 (68-132)||(31039729-31039793)
chr5 (68-132)||(31053219-31053283)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8929803 - 8929387
Alignment:
Q  2 taactactagtattctttatgttcaggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaaccc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8929803 taactactcgtattctttatgtttaggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggctatgactgccctaataaaaaaccc 8929704  T
Q  102 aagagtaatgaagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929703 aagagtaatgaagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaaaaaggattttctagacggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcg 8929604  T
Q  202 gtgataaaagagacattgagattgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929603 gtgataaaagagacattgagattgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaa 8929504  T
Q  302 aaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929503 aaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctat 8929404  T
Q  402 aaattttcttggacatg 418  Q
    |||||||||||||||||    
T  8929403 aaattttcttggacatg 8929387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8900949 - 8900570
Alignment:
Q  29 acatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaaga 128  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8900949 acatgcttgtagctgcaacggataccacatctgccacaatagtttgggctatgactgccttaataaaaaatccaagagtaatgaagaaagtgcaacaaga 8900850  T
Q  129 gattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtac 228  Q
    |||||||   |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8900849 gattaggaattcaagagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtgataaaagagacattgagattgtac 8900750  T
Q  229 ctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggt 328  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  | || || | |||||||||||||     
T  8900749 ctaccaggcccattgcttgtgccaagagaaacaagggaaaagtgcattataagtggctaccaaattcctgcaaaggcgattgtgtttgtgaatgcttggg 8900650  T
Q  329 ctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 408  Q
    ||||||||| |||| | ||  |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8900649 ctattcatacagacccagatgtttggaaaaacccagaagagttttatcctgaaagatttttagaaagttctataaatttt 8900570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8914871 - 8914467
Alignment:
Q  12 tattctttatgttcaggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatg 111  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8914871 tattctttatatgcagaatatgcttgtagcggcaacaggtaccacgtctgccacagcagtttgggctatgactgccttaataaaaaatccaagagtaatg 8914772  T
Q  112 aagaaagtacaagaagagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaag 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||| ||||||   ||| || ||||| ||||||||||    
T  8914771 aagaaagtacaacaagagattaggaattcaagagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacgaaatttgtcctacttaaaggcagtgataaaag 8914672  T
Q  212 agacattgagattgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagt 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | ||  ||||| ||| ||||| |||||  | |||||    
T  8914671 agacattgagattgtacctgccagccccattgcttgcgccaagagaaacaactgaaaaatgcactataaatggcttccaaattcccgcaaaggcgatagt 8914572  T
Q  312 atatgtgaatgcttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttctt 411  Q
     | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  8914571 gtttgtgaatgcttgggctattcatacagactcaaatgtttggaaaaacccagaagaattttatccagagagatttttagaaagttctttaaattttcat 8914472  T
Q  412 ggaca 416  Q
    |||||    
T  8914471 ggaca 8914467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 418
Target Start/End: Original strand, 8979075 - 8979462
Alignment:
Q  31 atgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagaga 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  8979075 atgcttgtagctgcaacagatactacatcagccacatcagtttgggctatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgagaaaagtgcaagaggaaa 8979174  T
Q  131 ttaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacct 230  Q
    |||||   |   ||| |||||| | |||| |||||| ||||||| | |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8979175 ttaggaacttgggaggtaaaaaagattttttagatgaagatgatattcaaaattctctatatttgaaggcagtgataaaagagacattaagattgtacct 8979274  T
Q  231 accagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtct 330  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |   ||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||| || |  ||| ||    
T  8979275 accagctccactgcttgtaccaagagaatcaagggaaacatgcattatcaatggctacaatattccagcccaaacaatattgtatgtaaacgtctgggct 8979374  T
Q  331 attcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttggacatg 418  Q
    ||||| |||||  || | | ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8979375 attcaaagagatcctaatacttggaaaaatccagaagaattttatcccgagagattcatagaaagttctataaattttattggacatg 8979462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9000531 - 9000158
Alignment:
Q  35 ttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattag 134  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||   ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  9000531 ttgtagctggaacagataccacagcagccacatcagtttgggctatgactgccttaatgaaaaacccaagagtaatgaggaaagtacaagatgaaattag 9000432  T
Q  135 gggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctacca 234  Q
        |   ||| | |||| | |||| |||||| ||||||| | ||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||    
T  9000431 aaatttgggaggtgaaaaagattttttagatgaagatgatattcaaaatttaccttatttgaaggcagtgattaaagagacgctaagattgcacctacca 9000332  T
Q  235 gctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattc 334  Q
    || ||  | ||| ||| ||||||| || | ||||| |||| | || |||| ||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9000331 gcccctctacttatgcaaagagaatcacgtgaaaattgcactataagtggatacaatattccagccaagacaatattgtatgtgaatgcttgggctattc 9000232  T
Q  335 atagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 408  Q
    | |||||| || |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000231 agagagaccctaatgtttggaaaaatccagaagaattttatcctgaaagattcttagaaagttctataaatttt 9000158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8966630 - 8966240
Alignment:
Q  26 aggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaaga 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||   ||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8966630 aggacatgcttgtagctgcaacagacaccacagcagccacatcagtttgggctataacctccctgataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaaga 8966531  T
Q  126 agagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattg 225  Q
    ||| |||||    |   ||  |||||| |  ||  |||| | | ||||| | |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8966530 agaaattagaaacttgggaagtaaaaaagaattcatagacgaaaatgatattcaaaatttcccatatttaaaggcagtgataaaagagacgttgagattg 8966431  T
Q  226 tacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgctt 325  Q
     |||||||  | ||| | ||| | ||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  8966430 cacctacctaccccactacttgttccaagagaatcaagagaaaagtgcattataagtggttacaagattccagccaacacaatagtgtatgtgaatgctt 8966331  T
Q  326 ggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttggaca 416  Q
    || ||||||| |||||| |    | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |  ||||||||||||||    
T  8966330 gggctattcaaagagacccaagtaattggaaaaatccagaagagttttatcccgagagattcttggaatgttcgacgaattttcttggaca 8966240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 416
Target Start/End: Original strand, 8954733 - 8955124
Alignment:
Q  25 caggacatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaag 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||    
T  8954733 caggatatgcttgtagctgcaaccgataccacatcagcagcatcagtttgggctatgactgctctaataaaaaaccctagagtaatgagtaaagtaaaag 8954832  T
Q  125 aagagattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatt-tcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagat 223  Q
    |||| || ||    |   |||||||||| | |||| || ||| ||||||| | ||||||| || | |||||||||||  |  | ||||||||| | ||||    
T  8954833 aagaaataagaaatttgggagttaaaaaagattttttatatgaagatgatattcaaaattgtcct-tatttgaaggctatagttaaagagacactaagat 8954931  T
Q  224 tgtacctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgc 323  Q
    |  |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| | |  ||||| || |   || |||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8954932 tacacctaccagccccactacttgtgccaagggaatctattgaaaattgtaccataagtggatacaacattcctgcaaagacaatattatatgtaaatgc 8955031  T
Q  324 ttggtctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttggaca 416  Q
    |||| ||||||| |||||  | || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8955032 ttgggctattcagagagatccagatatttggataaacccagaagaattttatcctgagagattcttagaaagttctataaattttattggaca 8955124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 408
Target Start/End: Original strand, 9030593 - 9030966
Alignment:
Q  35 ttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagattag 134  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |   ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||    
T  9030593 ttgtagccgcaacagataccacatcagccgcatcagtttgggctatgaccgccctaatgaaaaacccaagagtattggataaagtacaagaagaaatcag 9030692  T
Q  135 gggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacctacca 234  Q
        |   ||| |  ||| | || | |||||| || |||||| ||||||||    |||||||| || ||||| |||||||| || |||||| | ||||||    
T  9030693 aaacttgggaggtgcaaaagattatttagatgaaggtgatcttcaaaatttaccttatttgaatgcagtgattaaagagacgttaagattgcatctacca 9030792  T
Q  235 gctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtctattc 334  Q
    || ||||||||  || | |||||| || | ||||| |||| | ||  ||| ||| ||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9030793 gccccattgctcctgtctagagaatcacgtgaaaattgcactataaatggatacaatattccagccaggacaatattgtatgtgaatgcttgggctattc 9030892  T
Q  335 atagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaatttt 408  Q
    | ||||||  | |  ||||| || |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9030893 agagagaccataatgtttgggaaaacgcagaagaattttatcctgaaagattcttagaaagttctataaatttt 9030966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9400644 - 9400259
Alignment:
Q  31 atgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagaga 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9400644 atgcttgtagctgcaacagatacaacatcagctacattagtttgggcaatgactgtcctaataaagaaccctgcagtaatgaagaaagtacaacaagaga 9400545  T
Q  131 ttaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtacct 230  Q
    ||||| | |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||    
T  9400544 ttaggagttcaagagttaaaaaagactttttagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtcataaaagagacattgagattattcct 9400445  T
Q  231 accagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggtct 330  Q
    ||||  |||||||||  ||||||| ||  ||| ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9400444 accaaatccattgctactgccaagggagtcaatggaaatgtgcactataggtggttaccagattccagcaaagacaatagtgtatgtgaatgcttgggct 9400345  T
Q  331 attcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttcttggaca 416  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9400344 attcatagagactctaatgtttggaaagatccagaagagttttatccagagagattcttagaaagttctataaattttcttggaca 9400259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20074408 - 20074028
Alignment:
Q  29 acatgcttgtagccgcaacagataccacgtctgccacgatagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaaga 128  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20074408 acatgcttgttgctgcaacagataccacatcagccacaacagtatgggctatgactgcattaataaaaaatccaagagtaatgaagaaagtacaacaaga 20074309  T
Q  129 gattaggggatcaagagttaaaaagggttttctagatggagatgatctacaaaatttcgtctatttgaaggcggtgataaaagagacattgagattgtac 228  Q
    ||||||    |||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20074308 gattagaaattcaaaagttaaaaaagaatttatagatgaagatgatatacaaaatttctcctacttgaaggcagtgataaaagagacactgagattgtac 20074209  T
Q  229 ctaccagctccattgcttttgccaagagaaacaagggaaaagtgcattgtaggtggctaccatattcctgcaaaaacaatagtatatgtgaatgcttggt 328  Q
     | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||  |  |||| | |||||||||||||     
T  20074208 ttgccagccccattgcttgtgccaagagaaacaagggaaaagtgcactataggtggctaccaaattccggcaaaggcggtagtgtttgtgaatgcttggg 20074109  T
Q  329 ctattcatagagactctgaaatttggaaagatccggaagagttttatcctgagagattcttagagagttctataaattttc 409  Q
    ||||||||| |||| || |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  20074108 ctattcatacagaccctaatgtttggaaaaatccagaagaattttatcctgagagatttttagaaagttcgataaattttc 20074028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31072115 - 31072051
Alignment:
Q  68 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 132  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31072115 tagtttgggctatgactgcactaatgaagaatccaagagtgatgcagaaagtacaagaagagatt 31072051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31039793 - 31039729
Alignment:
Q  68 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 132  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31039793 tagtctgggctatgactgcgctaatgaagaatccaagagcgatgcagaaagtacaagaagagatt 31039729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31053283 - 31053219
Alignment:
Q  68 tagtgtgggcaatgactgccctaataaaaaacccaagagtaatgaagaaagtacaagaagagatt 132  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31053283 tagtctgggctatgactgcactaatgaagaatccaagagcgatgcagaaagtacaagaagagatt 31053219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University