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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20625_low_4 (Length: 591)

Name: NF20625_low_4
Description: NF20625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20625_low_4
NF20625_low_4
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (24-296)||(5948058-5948343)
chr1 (300-578)||(42736953-42737234)
chr1 (296-528)||(23616024-23616258)
chr1 (296-528)||(20582509-20582743)
chr1 (296-528)||(23647355-23647589)
chr1 (296-528)||(23731745-23731979)
chr1 (296-503)||(5942968-5943177)
chr1 (312-528)||(29018748-29018966)
chr1 (296-528)||(34747723-34747957)
chr1 (296-528)||(21443039-21443276)
chr1 (296-528)||(22867573-22867808)
chr1 (296-503)||(11921549-11921758)
chr1 (296-528)||(39506187-39506424)
chr1 (296-503)||(4652490-4652699)
chr1 (296-528)||(19082086-19082317)
chr1 (296-528)||(19129974-19130205)
chr1 (300-528)||(7112199-7112419)
chr1 (296-528)||(13522233-13522471)
chr1 (296-467)||(5296805-5296978)
chr1 (341-509)||(37691566-37691736)
chr1 (356-528)||(52020653-52020827)
chr1 (304-528)||(52348794-52349020)
chr1 (296-454)||(28050158-28050318)
chr1 (296-433)||(29019192-29019326)
chr1 (339-443)||(11932981-11933087)
chr1 (296-378)||(10787698-10787780)
chr1 (418-525)||(29019343-29019450)
chr1 (296-363)||(40375014-40375081)
chr1 (446-528)||(28051726-28051808)
chr1 (309-400)||(51052870-51052961)
chr1 (295-348)||(41072972-41073025)
chr1 (300-344)||(34608764-34608808)
chr1 (323-389)||(19475619-19475685)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (296-528)||(42709120-42709354)
chr8 (312-528)||(16682270-16682488)
chr8 (296-528)||(41529606-41529840)
chr8 (296-528)||(288486-288719)
chr8 (296-528)||(39028479-39028713)
chr8 (296-528)||(24983270-24983506)
chr8 (300-528)||(8387802-8388032)
chr8 (329-528)||(40940554-40940755)
chr8 (296-526)||(33022200-33022432)
chr8 (296-528)||(18307146-18307380)
chr8 (296-518)||(30438611-30438835)
chr8 (311-503)||(1431890-1432085)
chr8 (295-345)||(13773784-13773834)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (296-528)||(39956979-39957213)
chr7 (296-528)||(44155995-44156229)
chr7 (296-502)||(47396383-47396591)
chr7 (296-528)||(37534454-37534679)
chr7 (300-528)||(24482020-24482251)
chr7 (296-528)||(32985344-32985578)
chr7 (296-528)||(31579870-31580103)
chr7 (296-465)||(39581099-39581269)
chr7 (313-528)||(38433193-38433412)
chr7 (299-528)||(576328-576542)
chr7 (352-499)||(39778774-39778923)
chr7 (296-466)||(6496501-6496668)
chr7 (311-429)||(48104869-48104989)
chr7 (313-464)||(19925804-19925957)
chr7 (315-397)||(34950805-34950887)
chr7 (296-333)||(39778735-39778772)
chr7 (480-527)||(39581312-39581359)
chr7 (354-428)||(16717526-16717604)
chr7 (354-428)||(17691736-17691814)
chr7 (339-464)||(32953069-32953190)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (296-528)||(36899261-36899494)
chr4 (300-528)||(43318268-43318497)
chr4 (300-528)||(44519822-44520052)
chr4 (298-528)||(29004497-29004731)
chr4 (296-527)||(3735822-3736055)
chr4 (296-527)||(36311688-36311921)
chr4 (296-527)||(36325897-36326130)
chr4 (297-528)||(2832288-2832522)
chr4 (296-528)||(6201619-6201853)
chr4 (296-508)||(47526645-47526858)
chr4 (311-528)||(40696395-40696613)
chr4 (300-498)||(38054953-38055154)
chr4 (296-475)||(4440500-4440680)
chr4 (296-528)||(7526012-7526248)
chr4 (304-517)||(36662065-36662283)
chr4 (307-499)||(707855-708051)
chr4 (304-528)||(17991887-17992113)
chr4 (333-499)||(728602-728772)
chr4 (296-528)||(30260187-30260419)
chr4 (311-503)||(54131524-54131718)
chr4 (300-433)||(13937261-13937396)
chr4 (460-527)||(19730813-19730880)
chr4 (462-528)||(4441145-4441211)
chr4 (295-388)||(30059619-30059712)
chr4 (295-378)||(4895332-4895415)
chr4 (295-389)||(10373887-10373981)
chr4 (303-345)||(19729672-19729714)
chr4 (295-388)||(30029619-30029712)
chr4 (295-388)||(30045888-30045981)
chr4 (300-400)||(17256379-17256479)
chr4 (316-425)||(37066788-37066904)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (300-528)||(43512280-43512510)
chr3 (309-528)||(42934507-42934728)
chr3 (300-501)||(45876361-45876564)
chr3 (296-528)||(9598833-9599067)
chr3 (296-528)||(45698327-45698561)
chr3 (296-528)||(3696238-3696465)
chr3 (296-503)||(17476036-17476246)
chr3 (295-497)||(40319929-40320133)
chr3 (303-528)||(16075979-16076206)
chr3 (335-528)||(34947872-34948069)
chr3 (381-528)||(36633886-36634035)
chr3 (307-524)||(52107667-52107866)
chr3 (296-520)||(44162080-44162286)
chr3 (319-459)||(10380757-10380899)
chr3 (391-527)||(31731267-31731403)
chr3 (296-400)||(36980869-36980974)
chr3 (296-400)||(37006308-37006413)
chr3 (446-528)||(9588428-9588509)
chr3 (448-528)||(36980753-36980833)
chr3 (448-528)||(37006192-37006272)
chr3 (302-373)||(9371090-9371161)
chr3 (295-373)||(36660418-36660496)
chr3 (296-334)||(31731220-31731258)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (296-526)||(7784169-7784401)
chr5 (296-528)||(19263051-19263285)
chr5 (296-528)||(791224-791460)
chr5 (296-528)||(16467311-16467548)
chr5 (311-527)||(6829189-6829406)
chr5 (300-528)||(33053179-33053410)
chr5 (296-483)||(29241074-29241263)
chr5 (309-502)||(294684-294877)
chr5 (378-528)||(35169916-35170068)
chr5 (311-503)||(13610377-13610571)
chr5 (311-503)||(33641858-33642052)
chr5 (311-528)||(5250657-5250876)
chr5 (296-374)||(35169343-35169421)
chr5 (300-378)||(36244840-36244918)
chr5 (481-528)||(29241589-29241636)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (296-528)||(23865481-23865713)
chr2 (311-528)||(24079800-24080020)
chr2 (300-504)||(37200066-37200272)
chr2 (296-503)||(44196105-44196314)
chr2 (298-528)||(44719572-44719802)
chr2 (296-527)||(43843469-43843696)
chr2 (296-478)||(4233040-4233224)
chr2 (295-426)||(32738163-32738296)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (296-528)||(120199-120433)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (296-528)||(216580-216813)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (296-488)||(31297839-31298033)
[»] scaffold1797 (2 HSPs)
scaffold1797 (339-388)||(422-471)
scaffold1797 (311-347)||(737-773)
[»] scaffold1637 (1 HSPs)
scaffold1637 (339-388)||(18-67)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (295-364)||(4488-4557)
[»] scaffold0578 (1 HSPs)
scaffold0578 (323-389)||(6472-6538)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5948343 - 5948058
Alignment:
Q  24 agtaattcgtccaggtggaggaaagattgatttataaagttacactaaatgcatgtcttttgacaatacgggaataaataggtgaaataaaccgaattcg 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5948343 agtaactcgtccaggtggaggaaagattgatttataaagttacactaaatgcatgtcttttgacaatacgggaataaattggtgaaataaaccgaattcg 5948244  T
Q  124 aagggtcaaacaccaatgatgattagaccacaaagagcaatttaagtctgtc-------------gacagaaaaggtcacacaggtgaatacatgatggc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5948243 aagggtcaaacaccaatgatgattagaccacaaagagcaatttaagtctgtcgacacaatgagtcgacagaaaaggtcacacaggtgaatacgtgatggc 5948144  T
Q  211 tacccattttctttttgggtaatagaatatcttttcttgataagttaaactcctttgtaaacttgaaagataaacaagtgaatgtg 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5948143 cacccattttctttttgggtaatagaatatcttttcttgataagttaaactcctttgtaaacttgaaagataaacaagtgaatgtg 5948058  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 300 - 578
Target Start/End: Original strand, 42736953 - 42737234
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42736953 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattagttttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttat 42737052  T
Q  400 tattt--gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42737053 tatatatgtgtgtatttattaagatattcatcatatataaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 42737152  T
Q  498 gtctaattcggacaacgccggataaataca-cggtacatatacaaatttcataagtgagaaatgcatgaaactgacgttgtt 578  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42737153 gtgtaacccggacaacgccgggtaaatacacccgtacatatacaaatttcataggtgagaaatgcatgaaactgacgttgtt 42737234  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 23616024 - 23616258
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23616024 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 23616123  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23616124 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatgtaatttttttatcttcttga 23616223  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| | |  |||||||| |||||||||    
T  23616224 atatgtctaatccaggaaacgccgggtaaatacac 23616258  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 20582509 - 20582743
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20582509 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatctgtatctgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 20582608  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20582609 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatataatttttttatcttcttga 20582708  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  20582709 atatgtctaacccgggcaacgtcgggtaaatacac 20582743  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 23647355 - 23647589
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23647355 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 23647454  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23647455 ttattatatttatgtgtatttattaagatattcatcctattccattccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttgtttatcttcttga 23647554  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| | |  |||||||| |||||||||    
T  23647555 atatgtctaatgcaggaaacgccgggtaaatacac 23647589  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 23731745 - 23731979
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23731745 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 23731844  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23731845 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaatcggtgataaattttacttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 23731944  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23731945 atatgtctaatccgagcaacgccgggtaaatacac 23731979  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 296 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5943177 - 5942968
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5943177 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 5943078  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5943077 ttattatatttgtgtgtatttattaatatattaatcgtatatcaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 5942978  T
Q  494 atatgtctaa 503  Q
    ||||||||||    
T  5942977 atatgtctaa 5942968  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 312 - 528
Target Start/End: Original strand, 29018748 - 29018966
Alignment:
Q  312 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  29018748 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtg 29018847  T
Q  410 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  29018848 tatttattaagatattaatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacaaataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggg 29018947  T
Q  510 caacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| || |||||||||    
T  29018948 caacgctgggtaaatacac 29018966  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34747957 - 34747723
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34747957 gttaattttattctatatctgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatatatttacgagtatttataatatggtatatt 34747858  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34747857 ttattatatttgtgtgtatttattaagatatttatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacacataatttttttatcttcttga 34747758  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||    
T  34747757 atatgtctaacccgagcaatgccggataaatacac 34747723  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21443276 - 21443039
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21443276 gttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctagatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatgatatatt 21443177  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa---ttattttatcttct 490  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  21443176 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattttttttttatcttct 21443077  T
Q  491 tgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||  || | |||||||| || ||||||    
T  21443076 tgaatatgtctaacccgaaaaacgccgggtagatacac 21443039  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22867808 - 22867573
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  22867808 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatttataaaattacgagtatttataatatggtatatt 22867709  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttg 492  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22867708 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttatatcaatccgtgataaattttatttgtggatatcatacatataattttttttatcttcttg 22867609  T
Q  493 aatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  22867608 aatatgtctaacccgggcaacgccgagtaaatacac 22867573  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 296 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11921758 - 11921549
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11921758 gttaattttattatatatgtgataatatttttactaaattcaattaattttatctgcatttgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 11921659  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11921658 ttattatatttgtgtgtatctattatgatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 11921559  T
Q  494 atatgtctaa 503  Q
    ||||||||||    
T  11921558 atatgtctaa 11921549  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 39506187 - 39506424
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcttta--tgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacata 393  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39506187 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtata 39506286  T
Q  394 ttttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttct 490  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39506287 ttttattatatttgtgtgtacttattaagatattcatcctataccaatccataataaattttattttcggatatcatacatataattttttttatcttct 39506386  T
Q  491 tgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  39506387 tgaatatttctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 39506424  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 296 - 503
Target Start/End: Original strand, 4652490 - 4652699
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4652490 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatatgtatgtgtatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 4652589  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  4652590 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccatgataaattttatttgcggacatcatagatataatttttttatcatcttga 4652689  T
Q  494 atatgtctaa 503  Q
    ||||||||||    
T  4652690 atatgtctaa 4652699  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 19082086 - 19082317
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19082086 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttaatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatgatatatt 19082185  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  19082186 ttattatatttatgtgtatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatata---attttatctttttga 19082282  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| |||  || |||||||||| |||||||||    
T  19082283 atatgtataacccgaacaacgccgggtaaatacac 19082317  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 19129974 - 19130205
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19129974 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttaatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatgatatatt 19130073  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  19130074 ttattatatttatgtgtatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatata---attttatctttttga 19130170  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| |||  || |||||||||| |||||||||    
T  19130171 atatgtataacccgaacaacgccgggtaaatacac 19130205  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 7112419 - 7112199
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            
T  7112419 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgata-------- 7112328  T
Q  400 tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgt 499  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7112327 tatttgtgtgtatctattaagatattcatcttataccaatccatgataaattttatttacgaatatcatacatgtaatttttttatcttcttgaatatgt 7112228  T
Q  500 ctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  7112227 ctaatccgggcaacgctggataaatacac 7112199  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13522471 - 13522233
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13522471 gttaattttattctatatttgttagtatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 13522372  T
Q  396 ttat--tatttgtgtg----tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttc 489  Q
    ||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13522371 ttatcatatttgtgtgtatttatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttgtagatatcatacatataagttttttatcttc 13522272  T
Q  490 ttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||| | |||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  13522271 ttgaatatatgtaacccgggcaacgccgggtaaatacac 13522233  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5296978 - 5296805
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  5296978 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtagttataatatggtaaatt 5296879  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatca 467  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296878 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatca 5296805  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 341 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37691736 - 37691566
Alignment:
Q  341 aattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaa 438  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  37691736 aatttcatctgtatgtgcatgtataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaa 37691637  T
Q  439 tccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37691636 tccgtgataaattttatttgcggatataatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcgga 37691566  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 356 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52020827 - 52020653
Alignment:
Q  356 tgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaatttt 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  52020827 tgcatcaataaatttacgagtatttataatatggtatatttcattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaattcgtaataaatttt 52020728  T
Q  454 atttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  52020727 atttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacaatgccggataaatacac 52020653  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 304 - 528
Target Start/End: Original strand, 52348794 - 52349020
Alignment:
Q  304 tattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatt 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||     
T  52348794 tattctatatgtgttaatatttttactaaatcccgtta-ttttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttattttattata 52348892  T
Q  404 t--gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttctt-gaatatgtc 500  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  52348893 ttcgtgtgtatttatcaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacataaaattttttgatcttcttaaaatatgtc 52348992  T
Q  501 taattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52348993 taactcggacaatgccggataaatacac 52349020  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 296 - 454
Target Start/End: Original strand, 28050158 - 28050318
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  28050158 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatttgcatctataaatttatgagtatttataatatggtatatt 28050257  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaatttta 454  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  28050258 tgattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaattcgtgataaatttta 28050318  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 296 - 433
Target Start/End: Original strand, 29019192 - 29019326
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  29019192 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatatgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg---tatt 29019288  T
Q  396 ttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 433  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29019289 attatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 29019326  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 339 - 443
Target Start/End: Original strand, 11932981 - 11933087
Alignment:
Q  339 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtc 436  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11932981 ttaattttatctatatgtgcatctataaattcacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatttc 11933080  T
Q  437 aatccgt 443  Q
    |||||||    
T  11933081 aatccgt 11933087  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10787780 - 10787698
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtat 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10787780 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatgtataaatttacgagtat 10787698  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 418 - 525
Target Start/End: Original strand, 29019343 - 29019450
Alignment:
Q  418 aagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccg 517  Q
    |||||||||||| |||  | || ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  29019343 aagatattcatcatatacctattcgttataaattttatttgcggatattatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgaacaacgccg 29019442  T
Q  518 gataaata 525  Q
    ||||||||    
T  29019443 gataaata 29019450  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 363
Target Start/End: Original strand, 40375014 - 40375081
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatcta 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40375014 gttaattatattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatcta 40375081  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 446 - 528
Target Start/End: Original strand, 28051726 - 28051808
Alignment:
Q  446 taaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28051726 taaattttatttgcagatattatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccggacaacgccgaataaatacac 28051808  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 400
Target Start/End: Original strand, 51052870 - 51052961
Alignment:
Q  309 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttatt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||   ||| ||| |||||||  |||||||||    
T  51052870 tatatgtgttaataattttactaaatccaattaattttatccgcatgcgcatctattaatttataggtacttaaaatatgatttattttatt 51052961  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Original strand, 41072972 - 41073025
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttat 348  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41072972 tgtttattttattctatatgtgttaataattttactaaattcagttaattttat 41073025  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34608808 - 34608764
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaatt 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34608808 attttattttatatgtgttaataattttactaaatctaattaatt 34608764  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19475685 - 19475619
Alignment:
Q  323 tttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 389  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19475685 tttttactaaattctataaatatcatctgcatgtgcatctataaatttacgagtacttaaaatatga 19475619  T

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Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 42709120 - 42709354
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42709120 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 42709219  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709220 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 42709319  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  42709320 atatgtctaatccggacaacgtcagataaatacac 42709354  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 312 - 528
Target Start/End: Original strand, 16682270 - 16682488
Alignment:
Q  312 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtg 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  16682270 atgtgttaatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtg 16682369  T
Q  410 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16682370 tatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgga 16682469  T
Q  510 caacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16682470 caacgccggataaatacac 16682488  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 41529606 - 41529840
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41529606 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 41529705  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41529706 ttattatatttttgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttattttcggatatcatacatataatttttttatcttcttaa 41529805  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  41529806 atatgtctaaccagggcaacaccggataaatacac 41529840  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 288486 - 288719
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  288486 gttaattttattatatatgtgttaatatttt-actaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 288584  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  288585 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaattcatgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 288684  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||   || ||||||||| |||||||||    
T  288685 atatgtctaacctgggcaacgccgggtaaatacac 288719  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 39028479 - 39028713
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39028479 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtttgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 39028578  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39028579 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatacaaatccgtgataaattttatttgcgggtatcatacatacaatttttttatcttcttga 39028678  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39028679 atatgtctaacctggacaacgccggataaatacac 39028713  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 24983270 - 24983506
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24983270 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatttgcatctataaatttacgagtatttataatatgatgtatt 24983369  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttctt 491  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24983370 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccattataaattttatttatggatatcatacatataatttttttttatcttctt 24983469  T
Q  492 gaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24983470 aaatatgtctaacccggacaacgccggataaatacac 24983506  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8388032 - 8387802
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8388032 attttattctatatgtgttaatatttttattaaatccaattagttttatctgtatgtgcatctataactttacgaatatttataatatggtatattttat 8387933  T
Q  400 tat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8387932 tatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacttataatttttttatcttcttgaatat 8387833  T
Q  498 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| | | |||||| ||| |||||||||    
T  8387832 gtctaactggaacaacgtcgggtaaatacac 8387802  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 329 - 528
Target Start/End: Original strand, 40940554 - 40940755
Alignment:
Q  329 ctaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattc 426  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40940554 ctaaatccaattaattttatttgtatgtacatctataaatttacgagtatttataatatggtatatttttttatatttgtgtgtatttattaagatattc 40940653  T
Q  427 atcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatac 526  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  40940654 atcatatagcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaacatgtctaattcggacaacgtcaggtaaatac 40940753  T
Q  527 ac 528  Q
    ||    
T  40940754 ac 40940755  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 296 - 526
Target Start/End: Original strand, 33022200 - 33022432
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33022200 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaattcctttaattttatctctatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtttatt 33022299  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  33022300 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcgtcacatgccaatctgtgataaaatttatttgtggatatcatacatagaaatttttgatcttcttga 33022399  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatac 526  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||||    
T  33022400 atatatctaacccgaacaacaccggataaatac 33022432  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18307380 - 18307146
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   || |    
T  18307380 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaattccattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttgtaataaggtttact 18307281  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||  |   ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  18307280 ttattatattcgtgtgtatttattaagatatttgtgacataccaatccgtaataaattttatttgcggatataatacatagaattttttgatcttcttga 18307181  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  18307180 atatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 18307146  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 296 - 518
Target Start/End: Original strand, 30438611 - 30438835
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  30438611 gttaatcttattctatatgcgttaatatttttactaaatcccgttaattttatctgtatgtggatatataaatttacgagtatttataatatggtttatt 30438710  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  30438711 ttattatattcgtgtgtatttattaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacatagaattttttgatcttcttga 30438810  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccgg 518  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    
T  30438811 atatgtctaacccgggcaacgccgg 30438835  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 311 - 503
Target Start/End: Original strand, 1431890 - 1432085
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttt-tactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtg 407  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | |    
T  1431890 tatgtggtaatattttttactaaatccagctaattttctctgtttgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatttattctattctattcgag 1431989  T
Q  408 tgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 503  Q
    ||||  |||||||||||||| |   |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  1431990 tgtacctattaagatattcaactgttaccaatctgtgataaattttatttgcggataccatacatataattttttggttttcttgaatatgtctaa 1432085  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 345
Target Start/End: Original strand, 13773784 - 13773834
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 345  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13773784 tgttaattatattctatgtgtgttaataattttagtaaatccaattaattt 13773834  T

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Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39957213 - 39956979
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39957213 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgttatatt 39957114  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39957113 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatataatttttttatcttcttga 39957014  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  39957013 atatgtctaacccgtgcaacgccggataaatacac 39956979  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 44155995 - 44156229
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44155995 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccagttaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 44156094  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44156095 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 44156194  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  44156195 atatgtctaatccggacaacaccagataaatacac 44156229  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 502
Target Start/End: Original strand, 47396383 - 47396591
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47396383 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtccatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 47396482  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47396483 ttattatatttgtatgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatatattttttttatcttcttga 47396582  T
Q  494 atatgtcta 502  Q
    |||||||||    
T  47396583 atatgtcta 47396591  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37534679 - 37534454
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |          
T  37534679 gttaattttattatatatgtgttaatacttttactaaatctaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatttta------ 37534586  T
Q  396 ttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaat 495  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37534585 ttat-atttgtgtgtatttattaagatattcatcctattctaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatataatttttttatcttcttgaat 37534487  T
Q  496 atgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37534486 atgtctaactcgggcaacgccggataaatacac 37534454  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Original strand, 24482020 - 24482251
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24482020 attttattttatatttgttaatatttttactaaatccaattaaatttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttat 24482119  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaata 496  Q
      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  24482120 tatatttgtgtatatctattaagatattcatcctataccaatccgtaataaattttatttgcgaatatcatacatataattttttttatctttttgaata 24482219  T
Q  497 tgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||| |||  | | |||||||||||||||||||    
T  24482220 tgtttaaccctgccaacgccggataaatacac 24482251  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 32985344 - 32985578
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32985344 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcacttataaatttacgagtatttataatatgatatatt 32985443  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttg 492  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||     
T  32985444 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatatcaatccttgataaa-tttatttgcggatctaatagatataattttttttatcttctta 32985542  T
Q  493 aatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||| |||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  32985543 aatatgtgtaatccgagcaacgcggaataaatacac 32985578  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31580103 - 31579870
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  31580103 gttaattttattctatatgtgttaatatatttactaaatccaat-aattttatctctacgtgcatcaataaatttatgagtatttataatatagtatatt 31580005  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31580004 ttattatatttgtgtgtatttatgaagatattcatcctataccaatccatgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 31579905  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    | |||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  31579904 aaatgtctgacccagacaacgccgggtaaatacac 31579870  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 296 - 465
Target Start/End: Original strand, 39581099 - 39581269
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39581099 gttaattttattatttatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 39581198  T
Q  396 ttattatttgtgtgt-atttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatat 465  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39581199 ttattatatttgtgtaatttattatgatattcatcatatttcaattcgtgataaattttatttgcggatat 39581269  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 313 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 38433412 - 38433193
Alignment:
Q  313 tgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttata--atatgacatattttattat--ttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||    
T  38433412 tgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttatagaatatggtatattttattatatttgtgt 38433313  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 508  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||  ||     
T  38433312 gtatttattaagatattcatcttattcaaatccgcgataaattttatttgcggatatcatacatataattttttcatcttcttaaatatttataacccga 38433213  T
Q  509 acaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  38433212 acaacgccagataaatacac 38433193  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 576542 - 576328
Alignment:
Q  299 aattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttta 398  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||              
T  576542 aattttattctatatgtattaatatttttactaaatcctattaattttatctttatgtgcatctataaatttaagagtatttat----tg---------- 576457  T
Q  399 ttatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatg 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  576456 -tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatatatataatttttttatcttcttgaatatg 576358  T
Q  499 tctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  576357 tctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 576328  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 352 - 499
Target Start/End: Original strand, 39778774 - 39778923
Alignment:
Q  352 tatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaa 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39778774 tatgtgcatctataaatttacgagtatttctaatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaa 39778873  T
Q  450 ttttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39778874 ttttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgt 39778923  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 296 - 466
Target Start/End: Original strand, 6496501 - 6496668
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  6496501 gttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtacgcgcatctataaatttatgagtatttataatataatatatt 6496600  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatc 466  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6496601 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcccat---aa--cgtgataaattttatttgcggatatc 6496668  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 311 - 429
Target Start/End: Original strand, 48104869 - 48104989
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||    
T  48104869 tatgtattaatatttttactaaatccaattaattttatctatatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtacattttattatatttgtgt 48104968  T
Q  409 gtatttattaagatattcatc 429  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48104969 gtatttattaagatattcatc 48104989  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 464
Target Start/End: Original strand, 19925804 - 19925957
Alignment:
Q  313 tgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgt 410  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||||    
T  19925804 tgtgttaatatttttagtaaatttagttaattttatttgtctgcgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttgttctattcgcgtgt 19925903  T
Q  411 atttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggata 464  Q
    |  ||||||||||||| ||| ||  | |||| | | || |||||||||||||||    
T  19925904 acctattaagatattcgtcccataacgatcctttaaaatttttatttgcggata 19925957  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34950887 - 34950805
Alignment:
Q  315 tgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttt 397  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34950887 tgttaatatttttactaaattaagttaattttatctgtttatgcatctataaatttactagtatttataatataatatatttt 34950805  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 39778735 - 39778772
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778735 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaa 39778772  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 527
Target Start/End: Original strand, 39581312 - 39581359
Alignment:
Q  480 ttttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  39581312 ttttatcttcttgaatatatctaacccggacaacgccagataaataca 39581359  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 428
Target Start/End: Original strand, 16717526 - 16717604
Alignment:
Q  354 tgtgcatctata--aatttacgagtatttataatatgacatattttatt--atttgtgtgtatttattaagatattcat 428  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16717526 tgtgcatctatattaatttacgggtatttaaaatatgatttattctattctattcgtgtgtattcattaagatattcat 16717604  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 428
Target Start/End: Original strand, 17691736 - 17691814
Alignment:
Q  354 tgtgcatctata--aatttacgagtatttataatatgacatattttatt--atttgtgtgtatttattaagatattcat 428  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17691736 tgtgcatctatattaatttacgggtatttaaaatatgatttattctattctattcgtgtgtattcattaagatattcat 17691814  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 464
Target Start/End: Original strand, 32953069 - 32953190
Alignment:
Q  339 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaa 438  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||  |  ||| || |    
T  32953069 ttaattttatctgcatgtgcatctattaatttacgggtactaaaaatatg----atttttttattcgtgtgtactcattaagatatttgtgttatatcta 32953164  T
Q  439 tccgtgataaattttatttgcggata 464  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||    
T  32953165 ttcgtggtaaattttatatgcggata 32953190  T

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Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 36899261 - 36899494
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  36899261 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtg-atctataaatttacgagtaattataatatggtatatt 36899359  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36899360 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtaataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 36899459  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  36899460 atatgtctaatccgggcaacgccgggtaaatacac 36899494  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43318497 - 43318268
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43318497 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatatgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttat 43318398  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43318397 tatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgc-gatatcatacatataatttttttatcttcttgaatat 43318299  T
Q  498 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43318298 gtctaactcggacaacgccgggtaaatacac 43318268  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Original strand, 44519822 - 44520052
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44519822 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttat 44519921  T
Q  400 tat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44519922 tatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatat 44520021  T
Q  498 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
     |||| | | | ||||||||| |||||||||    
T  44520022 atctattccaggcaacgccgggtaaatacac 44520052  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 298 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29004731 - 29004497
Alignment:
Q  298 taattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat--t 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |    
T  29004731 taattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttagaatatgatatatatt 29004632  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29004631 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcataaatataatttttttatcttcttga 29004532  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  29004531 atatgtctaacccgggcaacgccggataaatacac 29004497  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 3735822 - 3736055
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3735822 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 3735921  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3735922 ttattatatttgtgtttatttattaagatattcatcctatactaattcgtgataaattttattcgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 3736021  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    ||||||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  3736022 atatgtctaacccgaataacgccgggtaaataca 3736055  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 36311688 - 36311921
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36311688 gttaattttattctatacgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 36311787  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36311788 ttattatatttgtgtgtatttattaagatatccatcatataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 36311887  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||    
T  36311888 atatgtctaacccggacagcgtcgggtaaataca 36311921  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 36325897 - 36326130
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36325897 gttaattttattctatacgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 36325996  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36325997 ttattatatttgtgtgtatttattaagatatccatcatataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttga 36326096  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||    
T  36326097 atatgtctaacccggacagcgtcgggtaaataca 36326130  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 297 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2832522 - 2832288
Alignment:
Q  297 ttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  2832522 ttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccacttgattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttatgatatggtatattt 2832423  T
Q  397 tat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttga 493  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2832422 tattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatctgtgataatttttatttgcggatatcatacatataattttttttatcttcttga 2832323  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  2832322 atatgtctaacccggacaacgccagataaatacac 2832288  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 6201853 - 6201619
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6201853 gttaattttattctatatgtgtaaatatttttactaaatccaattaattttatctgaatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 6201754  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6201753 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttattga 6201654  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||  |||||| || |||||||||    
T  6201653 atatgtctaacccgagcaacgctgggtaaatacac 6201619  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Original strand, 47526645 - 47526858
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  47526645 gttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatccaattagttttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatataatatatt 47526744  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47526745 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataataatccttgataaattttattag-agatatcatacatataatttttttatcttcttga 47526843  T
Q  494 atatgtctaattcgg 508  Q
    |||| ||||||||||    
T  47526844 atatatctaattcgg 47526858  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 311 - 528
Target Start/End: Original strand, 40696395 - 40696613
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  40696395 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatatgcatgtgcatttataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgt 40696494  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 508  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||     
T  40696495 gtatttattaagatattcatcatataccaatccatgataaattttatttgcgg-tatcatacatataatttgtttatcttcttgaatatgtctaacccga 40696593  T
Q  509 acaacgccggataaatacac 528  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  40696594 ataacgccggataaatacac 40696613  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 300 - 498
Target Start/End: Original strand, 38054953 - 38055154
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38054953 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcggtatgtgcatcaataaatttacgagtatttataatatgatatattttat 38055052  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaata 496  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  38055053 tatatttgtatgtatttattaagatattcatcctattccaagccgtgataaattttatttgcggatatctttcatataattttttttatcttcttgaata 38055152  T
Q  497 tg 498  Q
    ||    
T  38055153 tg 38055154  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 475
Target Start/End: Original strand, 4440500 - 4440680
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4440500 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaa-ttacgagtatttataatatgatatatt 4440598  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 475  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4440599 ttattatatttgtgtgtatatattaagatatttatcctatttcaattcgcgataaattttatttgcggatatcaaacatata 4440680  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 7526012 - 7526248
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  7526012 gttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatcccattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttatt 7526111  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  7526112 ttattatattcgtgtgtatttattaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtagatatcatacatagaatttgttgatcttcttga 7526211  T
Q  494 atatg--tctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  7526212 atatgtctctaatccgggcaacgccgggtaaatacac 7526248  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 304 - 517
Target Start/End: Original strand, 36662065 - 36662283
Alignment:
Q  304 tattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat- 402  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  36662065 tattctatatgtcttaatacttttactaaatccaattaattttatttgtatgtacatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttgttata 36662164  T
Q  403 -ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa---ttattttatcttcttgaatatg 498  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||    
T  36662165 tttgtatgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattttttttttatattcttcaatatg 36662264  T
Q  499 tctaattcggacaacgccg 517  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  36662265 tctaactcaggcaacgccg 36662283  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 307 - 499
Target Start/End: Original strand, 707855 - 708051
Alignment:
Q  307 tatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tattt 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  707855 tatatatatgttaatatttttactaaatcctattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatattt 707954  T
Q  405 gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttcttgaatatgt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  707955 gtgtgtatttattaagatattcatcatattccgatcggtgataaattttatttgcagatatcgtacatataatttttttttatctttttgaatatgt 708051  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 304 - 528
Target Start/End: Original strand, 17991887 - 17992113
Alignment:
Q  304 tattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatt 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||     
T  17991887 tattctatatgtgttaatatttttactaaatcccgtta-ttttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttattttattata 17991985  T
Q  404 t--gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttctt-gaatatgtc 500  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  17991986 ttcgtgtgtatttatcaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacataaaattttttgatcttcttaaaatatgtc 17992085  T
Q  501 taattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17992086 taactcggacaatgccggataaatacac 17992113  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 333 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 728772 - 728602
Alignment:
Q  333 atccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcc 430  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  728772 atcctattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatca 728673  T
Q  431 tatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttcttgaatatgt 499  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  728672 tattccgatcggtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttttatctttttgaatatgt 728602  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30260419 - 30260187
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  30260419 gttaattttattctatatgtgttaatattttt-ctaaattccgttaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtttatt 30260321  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |   ||    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  30260320 ttattatattcgtgtgtatttattaagatattcgtgacatacatatccgtgataaaatttattcgtggatatcatacatagaattttttgattttcttga 30260221  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  30260220 atatgtctaacccggacaacgctgg-taaatacac 30260187  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 311 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 54131718 - 54131524
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  54131718 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaatttcatatgtctgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctatttgtgt 54131619  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 503  Q
    |||  |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  54131618 gtacatattaagatattcaacccataccaatccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 54131524  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 433
Target Start/End: Original strand, 13937261 - 13937396
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |  || || || ||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  13937261 attttattctatatgtgttaataattttactaaatacaatcaatttcatttgcatatgtatttattaatttacgagtatttaaaatatgatttcttttat 13937360  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 433  Q
      ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||    
T  13937361 tatatttatatgtatccattaagatattcgtcctat 13937396  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19730880 - 19730813
Alignment:
Q  460 ggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  19730880 ggatatcatacatataattttttcatcttcttgaataagtctaacccgggcaacgccgggtaaataca 19730813  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 462 - 528
Target Start/End: Original strand, 4441145 - 4441211
Alignment:
Q  462 atatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  4441145 atatcaaacatataatttttttatctgcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 4441211  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 388
Target Start/End: Original strand, 30059619 - 30059712
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 388  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30059619 tgtttattttattctatatgtgctaataattttactaaatctagttaatttcatatgtatgtgcatctattaatttaagtgtacttaaaatatg 30059712  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4895415 - 4895332
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtat 378  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | | |||| || |||||||||||||||||    
T  4895415 tgtttattttattctatatatgttaataattttactaaattcagttaattatatttgtttgtgtatatataaatttacgagtat 4895332  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10373981 - 10373887
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 389  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||| | |||||||  ||| ||| |||||||    
T  10373981 tgtttattttattctatatgttttaataattttactaaatcaaattaatttcatctgcatgtgtatctgttaatttacatgtacttaaaatatga 10373887  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19729714 - 19729672
Alignment:
Q  303 ttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19729714 ttattctatatgtgttaataattttactaaatccaattaattt 19729672  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 388
Target Start/End: Original strand, 30029619 - 30029712
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 388  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30029619 tgtttattttatcctatgtgtgttaataattttactaaatccagttaatttcatccgcatgtgcatctattaatttaagggtacttaaaatatg 30029712  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 388
Target Start/End: Original strand, 30045888 - 30045981
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 388  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30045888 tgtttattttatcctatgtgtgttaataattttactaaatccagttaatttcatccgcatgtgcatctattaatttaagggtacttaaaatatg 30045981  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17256479 - 17256379
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |  |||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||  ||||||||    
T  17256479 attttattctatatatgttaataattttactaaattcaattaatttattttgcatgtgcatctattaatttatgtgtacttgaaatatgatttattttat 17256380  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  17256379 t 17256379  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 425
Target Start/End: Original strand, 37066788 - 37066904
Alignment:
Q  316 gttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat-------tatttgtgt 408  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||  | ||||||       |||||||||    
T  37066788 gttaataattttactaaattcaattaatttcatcggtttgtgcatctattaatttatgggtatttaaaatgtgatttgttttattttattctatttgtgt 37066887  T
Q  409 gtatttattaagatatt 425  Q
    ||||| |||||||||||    
T  37066888 gtattcattaagatatt 37066904  T

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Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43512510 - 43512280
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43512510 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctctatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttat 43512411  T
Q  400 tat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43512410 tatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttacggatatcaaacatataatttttttatcttctagaatat 43512311  T
Q  498 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43512310 gtctaatccggacaacgccagataaatacac 43512280  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 309 - 528
Target Start/End: Original strand, 42934507 - 42934728
Alignment:
Q  309 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  42934507 tatatgtgttaatatttttaccaaatctaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttattatatttgt 42934606  T
Q  407 gtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattc 506  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42934607 gtatatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaactc 42934706  T
Q  507 ggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  42934707 ggacaacgtcggataaatacac 42934728  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 300 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45876564 - 45876361
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45876564 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatcaaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttat 45876465  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45876464 tatatttgtgtgtatttatcaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatagatataatttttttatcttcttgaatat 45876365  T
Q  498 gtct 501  Q
    ||||    
T  45876364 gtct 45876361  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9599067 - 9598833
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9599067 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaacccagttaattttatctgtacgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 9598968  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  9598967 ttattatatttgtgtgtatttcttaagatattcatcctatatcaatctgtgataaattttatttgcagatatcatatagagaattattttctcttcttga 9598868  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  9598867 atatgtctaactcgggcaacgccaggtaaatacac 9598833  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 45698561 - 45698327
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45698561 gttaattttattatatatgtgttgatatttttactaaatccaattaattttacatgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 45698462  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45698461 ttattatatttgtgtgtatttattaagatatttattttataccaatccgtgataaattttatttgtggatatcatacatataatttttttatcttcttga 45698362  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||| || | |||| | ||||||||||||    
T  45698361 atatgtctaactcaggcaacactggataaatacac 45698327  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3696465 - 3696238
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3696465 gttaattttattatat--gtgttaatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 3696368  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3696367 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataagttttatttgcg-----aatacatataatttttttatcttcttga 3696273  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3696272 atatgtctaactcggacaacgccagataaatacac 3696238  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 503
Target Start/End: Original strand, 17476036 - 17476246
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17476036 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatctgtatgtgcatttataaattttcgagtatttataatatggtatatt 17476135  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttg 492  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17476136 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcatacatataattttttttatcttcttg 17476235  T
Q  493 aatatgtctaa 503  Q
    |||||||||||    
T  17476236 aatatgtctaa 17476246  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 497
Target Start/End: Original strand, 40319929 - 40320133
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  40319929 tgttaattttattatatatgtgtcaatatttttactaaatgcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttatgagcatttataatatgatatat 40320028  T
Q  395 tttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttg 492  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  40320029 tttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaatccatgataaattttatttgcggatattatacatataatgtttttatcttcttg 40320128  T
Q  493 aatat 497  Q
    |||||    
T  40320129 aatat 40320133  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 303 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16076206 - 16075979
Alignment:
Q  303 ttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16076206 ttattgtatatgtgttaatatttttattaaattcacttaattttatttgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattat 16076107  T
Q  403 --ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtc 500  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16076106 atttgtttgtatttattaagatattcatcatatatcaatccatgataaattttatttgtggttatcatacatataatttttttatcttcttaaatatgtc 16076007  T
Q  501 taattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||  ||  ||||||  |||||||||||    
T  16076006 taacccgagcaacgcgagataaatacac 16075979  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 335 - 528
Target Start/End: Original strand, 34947872 - 34948069
Alignment:
Q  335 ccaattaatttt-atctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcct 431  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947872 ccaattaatttttatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcct 34947971  T
Q  432 atgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||    
T  34947972 atatcaatccgtgataaattttattcgcggatatcatacatataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccaggcaacgccaggtaaatacac 34948069  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 36633886 - 36634035
Alignment:
Q  381 ataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633886 ataatatgacatattttattatatttgtgtgtattcattaagatattcatcctattccaatcccttataaattttatttgcggatatcatacatataatt 36633985  T
Q  479 attttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36633986 tttttatcttcttgaatatgtctaactcgggcaacgccggataaatacac 36634035  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 307 - 524
Target Start/End: Original strand, 52107667 - 52107866
Alignment:
Q  307 tatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     
T  52107667 tatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcagtatgtgcatatataaatttacgagtatttataatatga----------------- 52107749  T
Q  407 gtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattc 506  Q
     | ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  52107750 -tatatttattaagatattcatcctattccaatccgctataaattttatttatggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaaccc 52107848  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44162286 - 44162080
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44162286 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatttgtatatgcatc--taaatttacgagtatttataatatgatttatt 44162189  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||                  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44162188 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatc------------------cggatatcatacatataatttttttatcttcttga 44162107  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggat 520  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||    
T  44162106 atatgtctaactcgagcaacgccggat 44162080  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 319 - 459
Target Start/End: Original strand, 10380757 - 10380899
Alignment:
Q  319 aatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttat 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10380757 aatatatttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttaaaatatggtgtattttattatatttatgtgtatttat 10380856  T
Q  417 taagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgc 459  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  10380857 taagatattcatcctatattaatccgtaataaattttatttgc 10380899  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 391 - 527
Target Start/End: Original strand, 31731267 - 31731403
Alignment:
Q  391 atattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttc 489  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||     
T  31731267 atattttattatatttgtgtatttattaagatattcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcggataatatatatataattttttttatcttt 31731366  T
Q  490 ttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  31731367 ttgaatatgtctaa-tcgggcaacgccgggtaaataca 31731403  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36980974 - 36980869
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatattttt-actaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  36980974 gttaattttattctatatgtgttaatattttttattaaatctagttaattttatttgattgtgcatctataaatttacgaatacttataatatgatttat 36980875  T
Q  395 tttatt 400  Q
    ||||||    
T  36980874 tttatt 36980869  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37006413 - 37006308
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatattttt-actaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  37006413 gttaattttattctatatgtgttaatattttttattaaatctagttaattttatttgattgtgcatctataaatttacgaatacttataatatgatttat 37006314  T
Q  395 tttatt 400  Q
    ||||||    
T  37006313 tttatt 37006308  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 528
Target Start/End: Original strand, 9588428 - 9588509
Alignment:
Q  446 taaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  9588428 taaattttatttgcggatatcatatatataatttctttatcttcttgaatgtgtctaa-ccgaacaatgccggataaatacac 9588509  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 36980833 - 36980753
Alignment:
Q  448 aattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  36980833 aattttatttgcggataccatacataaatttttttgatcttcttgattatgtctaacccagacaacaccggataaatacac 36980753  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37006272 - 37006192
Alignment:
Q  448 aattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  37006272 aattttatttgcggataccatacataaatttttttgatcttcttgattatgtctaacccagacaacaccggataaatacac 37006192  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9371161 - 9371090
Alignment:
Q  302 tttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacg 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||    
T  9371161 tttattatatatgtgttaataattttacaaactccaattaatttcatccgttggtgcatctattaatttacg 9371090  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36660496 - 36660418
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacg 373  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  36660496 tgtttattatattttatatgtgttaataattttaataaatcaaattaatctcatcctcatgtgcatctattaatttacg 36660418  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 334
Target Start/End: Original strand, 31731220 - 31731258
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31731220 gttaattttattttatatgtgttaatattattactaaat 31731258  T

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Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 296 - 526
Target Start/End: Original strand, 7784169 - 7784401
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7784169 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtacatctataaattcacgagtatttataatatgatatatt 7784268  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7784269 ttattatatttgtgtgcatttattaagatatccatcttatttcaatccgtgataaattttatttgtggatatcatacatataatttttttatcttcttga 7784368  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatac 526  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  7784369 atatgtctaatacggacaaccccgagtaaatac 7784401  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19263285 - 19263051
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19263285 gttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatgaatttacgagtatttataatatggtatatt 19263186  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19263185 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattcttttatctttttga 19263086  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  19263085 atatgtcaaacccggacaacaccgcataaatacac 19263051  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 791224 - 791460
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  791224 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtttttgtatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 791323  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttctt 491  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  791324 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccatgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttttatcttctt 791423  T
Q  492 gaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  791424 gaatatgtctaatccagacaacgctggataaatacac 791460  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Original strand, 16467311 - 16467548
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtattt-ataatatgacatat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  16467311 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaattaacgagtattttataatatggtatat 16467410  T
Q  395 tttattat--ttgtgtgtattt--attaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttct 490  Q
    ||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16467411 tttattatgtttgtttgtatttttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcgaataacatacatataatttttttatcttct 16467510  T
Q  491 tgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  16467511 tgaatatgtctaacccgggcaacgccagataaatacac 16467548  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 311 - 527
Target Start/End: Original strand, 6829189 - 6829406
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  6829189 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttaccagtatttataacatgatatattttattatatttgtgt 6829288  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6829289 gtatttattaagatattcatcctataccaatccataataaattttatttacgaatatcatacatataatatttttatcttcttaaatatgtctaatccgg 6829388  T
Q  509 acaacgccggataaataca 527  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  6829389 -caacgccagataaataca 6829406  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 300 - 528
Target Start/End: Original strand, 33053179 - 33053410
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  33053179 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttatgatatggtgtattttat 33053278  T
Q  400 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaata 496  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  33053279 tatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatgcatataattttttttatcttcttaaata 33053378  T
Q  497 tgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||  |  ||||||| | ||||||||||    
T  33053379 tgtctaacccaaacaacgctgaataaatacac 33053410  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 483
Target Start/End: Original strand, 29241074 - 29241263
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  29241074 gttaattttattatatatgtgttaatatttttattaaatccaattaattttatatgtacgtgcatctataaatttacgagtatttataatttggtctatt 29241173  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattatttt 483  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29241174 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattttttt 29241263  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 309 - 502
Target Start/End: Original strand, 294684 - 294877
Alignment:
Q  309 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatttgtg- 407  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  294684 tatatgtgttaatactttttctaaatccaattaattttatcagtatg--catctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatttttgg 294781  T
Q  408 -tgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtcta 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  294782 gtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatttcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtcta 294877  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Original strand, 35169916 - 35170068
Alignment:
Q  378 tttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 475  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35169916 tttataatatgatataatttattatatttctgtgtatttattaagattttcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 35170015  T
Q  476 attattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35170016 atttttttatcttcttgaatatgtctaactcgagcaacgccggataaatacac 35170068  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 311 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13610571 - 13610377
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  13610571 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaattttatatgtctgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctattcgtgt 13610472  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 503  Q
    |||  |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  13610471 gtacatattaagatattcaactcataccaatccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 13610377  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 311 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33642052 - 33641858
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  33642052 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaatttcatatgtccgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctattcgtgt 33641953  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 503  Q
    |||  |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  33641952 gtacatattaagatattcaacccataccaacccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 33641858  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 528
Target Start/End: Original strand, 5250657 - 5250876
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||| ||||  |||| ||||    
T  5250657 tatgtgttaatatttatactaaatccaattaattttatatgtatgtgcatctataaatttatgatcatttataatatggtttatgttattctattcgtgt 5250756  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 508  Q
    |||  ||||||| |||||||||  |  ||||| | ||||||||||||||||  ||  | ||| || |||| |||  | ||||||||||| |||||  |||    
T  5250757 gtacctattaaggtattcatcccctaccaatctgcgataaattttatttgcaaatgccgtacttagaattttttggttttcttgaatatatctaacccgg 5250856  T
Q  509 acaacgccggataaatacac 528  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  5250857 gcaacgtcggataaatacac 5250876  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Original strand, 35169343 - 35169421
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  35169343 gttaattttattctatatgtgttagtatttttactaaatccaattaattttatttgtacgtgtatatataaatttacga 35169421  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36244918 - 36244840
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtat 378  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  36244918 attttattctgtatatgttaataattttactaaatccagttaattatatttgtctgtgcatctataaatttacgagtat 36244840  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 528
Target Start/End: Original strand, 29241589 - 29241636
Alignment:
Q  481 tttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  29241589 tttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 29241636  T

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Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23865713 - 23865481
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23865713 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 23865614  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  23865613 ttattatatttgtgtatatttattaagatattcatcatattccaatccgtgataaattttatttgtggatatcatac--ataatttttttatcttcttaa 23865516  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  23865515 atatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 23865481  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 311 - 528
Target Start/End: Original strand, 24079800 - 24080020
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 408  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  24079800 tatgtgataatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatataatatattttattatatttgtgt 24079899  T
Q  409 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcg 507  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24079900 gtatttattaagatatttatcttatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccg 24079999  T
Q  508 gacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  24080000 gacaacgccgggtaaatacac 24080020  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 300 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 37200272 - 37200066
Alignment:
Q  300 attttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 399  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37200272 attttattctatatatgttaataattttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatacatttacgagtatttataatatggtatattttat 37200173  T
Q  400 tat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 497  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37200172 tatatttgtgtgtatttattaagatatttatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacttataatttttttatcttcttgaatat 37200073  T
Q  498 gtctaat 504  Q
    |||||||    
T  37200072 gtctaat 37200066  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 296 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44196314 - 44196105
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44196314 gttaattttattctatatttgttaatatttttactaaaaccaatttattttat-tgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 44196216  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttg 492  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44196215 ttattatatttgtgtgcatttattaagatattcatccgaaaccaatccgtgataatttttatttgcggatatcatacatataattttttttatcttcttg 44196116  T
Q  493 aatatgtctaa 503  Q
    |||||||||||    
T  44196115 aatatgtctaa 44196105  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 298 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44719802 - 44719572
Alignment:
Q  298 taattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44719802 taattttattatatatgtgttaatatttttattaaacccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatttt 44719703  T
Q  398 at--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaat 495  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||  ||  ||||||||||||    
T  44719702 attatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaatccgtgataaa-tttatttacaaatatcata-atataatatttaaatcttcttgaat 44719605  T
Q  496 atgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    || | |||  || |||||||||  |||||||||    
T  44719604 atatgtaacccgaacaacgccgagtaaatacac 44719572  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 43843469 - 43843696
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||    
T  43843469 gttaattttattcaatatgtgttaatatttttattaaatccctttaattttatctctatgtgtatctataaatttacaagta-ttgtaatatgatttatt 43843567  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||     |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  43843568 ttattatattcatgtgtatttattaagatattcgtcacataccaat-----ataaattttatttgtggatatcatacatagaattttttgatcttcttga 43843662  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaataca 527  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  43843663 atatgtctaacccggacaacgccgggtaattaca 43843696  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 478
Target Start/End: Original strand, 4233040 - 4233224
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4233040 gttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatcccgttaattgtatctgtatgtgcattcataaatttacgagtatttataatatgatttatt 4233139  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatt 478  Q
    ||||  |||| || |||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  4233140 ttattatattcgtatgtatttattaaaatattcatcacatatcaatccatgataaaatttatttatgaatatcatacatagaatt 4233224  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 32738296 - 32738163
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat 394  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |  || || || ||| |||||| | ||| ||| |||||||  ||     
T  32738296 tgtttattttattttatatgtgttaatagttttactaaattcagttaattttatttgcatttgtatgtattaatttatgggtacttaaaatatgatgtac 32738197  T
Q  395 ttta--ttatttgtgtgtatttattaagatattc 426  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32738196 tttatgttatttgtgtgtatccattaagatattc 32738163  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 120433 - 120199
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  120433 gttaattttattctacatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatatt 120334  T
Q  396 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  120333 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatacctatccatgataaattttatttgcaaatattatacatataatttttttatcttcttga 120234  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||    
T  120233 atatgtctaacccgggcaacaccgggtaaatacac 120199  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 216813 - 216580
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  216813 gttaattttattatatatatgt-aatatttttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 216715  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 493  Q
    || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  216714 ttgttatatttgtatgtatttattaagatattcatccaattccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcatacttataatttttttatcttcttga 216615  T
Q  494 atatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 528  Q
    |||||||||| |||  |||| |||| |||||||||    
T  216614 atatgtctaactcgcgcaacaccgggtaaatacac 216580  T

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Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 296 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 31298033 - 31297839
Alignment:
Q  296 gttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 395  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  31298033 gttaattttattctatatgggttaatatttgtactaaatccaattaattttatctttatgtgcgtttatgaatttactagtatttattatatgatatatt 31297934  T
Q  396 ttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatctt 488  Q
     ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31297933 atattatatttgtgtgtatttatttaaatattcatcctatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatctt 31297839  T

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Target: scaffold1797 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1797
Description:

Target: scaffold1797; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 422
Alignment:
Q  339 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 388  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  471 ttaattttatatgtatgtgcatctataaatttacgagcatttataatatg 422  T

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Target: scaffold1797; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 737
Alignment:
Q  311 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttta 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttta 737  T

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Target: scaffold1637 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1637
Description:

Target: scaffold1637; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 388
Target Start/End: Original strand, 18 - 67
Alignment:
Q  339 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 388  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18 ttaattttatatgtatgtgcatctataaatttacgagcatttataatatg 67  T

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Target: scaffold0839 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 4488 - 4557
Alignment:
Q  295 tgttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctat 364  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4488 tgtttattatattctatatgtgttaataattttactgaatccaattaatttcatctgcatgtgcatctat 4557  T

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Target: scaffold0578 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0578
Description:

Target: scaffold0578; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6538 - 6472
Alignment:
Q  323 tttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 389  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6538 tttttactaaattctataaatatcatctgcatgtgcatctataaatttacgagtacttaaaatatga 6472  T

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