View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2062_high_3 (Length: 540)

Name: NF2062_high_3
Description: NF2062
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2062_high_3
NF2062_high_3
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (15-292)||(15037628-15037905)
chr1 (15-292)||(15002716-15002993)
chr1 (15-292)||(15011609-15011886)
chr1 (15-292)||(15017724-15018001)
chr1 (31-292)||(15041212-15041473)
chr1 (15-292)||(14531971-14532248)
chr1 (31-292)||(14521850-14522111)
chr1 (293-540)||(44203778-44204024)
chr1 (15-292)||(15033061-15033338)
chr1 (322-540)||(9036562-9036775)
chr1 (323-540)||(21054104-21054314)
chr1 (323-540)||(9987347-9987558)
chr1 (349-540)||(40282523-40282711)
chr1 (349-540)||(20622072-20622259)
chr1 (22-292)||(14468419-14468689)
chr1 (39-292)||(14483384-14483637)
chr1 (32-292)||(14504608-14504868)
chr1 (397-540)||(51765543-51765684)
chr1 (400-540)||(8550670-8550809)
chr1 (506-538)||(42297963-42297995)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (293-540)||(1560441-1560688)
chr7 (293-540)||(6594334-6594580)
chr7 (293-540)||(6592116-6592362)
chr7 (293-540)||(18388536-18388782)
chr7 (293-540)||(18391972-18392218)
chr7 (293-540)||(32060098-32060344)
chr7 (322-538)||(20344044-20344255)
chr7 (18-283)||(15664477-15664742)
chr7 (15-283)||(14606513-14606781)
chr7 (15-283)||(16025690-16025958)
chr7 (15-283)||(16173166-16173434)
chr7 (15-283)||(17849137-17849405)
chr7 (101-283)||(16103584-16103766)
chr7 (349-540)||(43503991-43504176)
chr7 (397-540)||(39731515-39731656)
chr7 (451-540)||(24789987-24790074)
chr7 (349-455)||(24790230-24790333)
chr7 (172-283)||(15676312-15676423)
chr7 (231-285)||(31159647-31159701)
chr7 (231-285)||(31241750-31241804)
chr7 (231-285)||(31140815-31140869)
chr7 (498-540)||(35854060-35854102)
chr7 (498-540)||(25766940-25766982)
chr7 (231-283)||(31103456-31103508)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (293-540)||(10593404-10593650)
chr5 (293-540)||(40380237-40380483)
chr5 (293-540)||(40382448-40382694)
chr5 (293-540)||(25078267-25078513)
chr5 (293-540)||(25136236-25136482)
chr5 (293-540)||(16544555-16544804)
chr5 (293-540)||(16546777-16547026)
chr5 (324-540)||(29720510-29720721)
chr5 (324-539)||(29722671-29722881)
chr5 (319-540)||(22536100-22536312)
chr5 (323-540)||(29750969-29751182)
chr5 (327-540)||(9789042-9789246)
chr5 (327-540)||(18441462-18441670)
chr5 (397-540)||(16409621-16409764)
chr5 (417-540)||(26178028-26178150)
chr5 (464-540)||(26170908-26170983)
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (20-292)||(13402-13674)
scaffold0400 (22-292)||(7104-7374)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (20-292)||(14045-14317)
scaffold0365 (22-292)||(7748-8018)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (293-540)||(25637573-25637822)
chr3 (293-540)||(4598299-4598545)
chr3 (290-540)||(3617596-3617845)
chr3 (293-540)||(4600520-4600766)
chr3 (292-540)||(10211541-10211789)
chr3 (293-540)||(10209321-10209568)
chr3 (293-540)||(10056365-10056612)
chr3 (293-540)||(10058587-10058834)
chr3 (293-540)||(10060809-10061056)
chr3 (293-540)||(10063031-10063278)
chr3 (293-540)||(10065253-10065500)
chr3 (293-540)||(10067452-10067699)
chr3 (322-540)||(45283132-45283345)
chr3 (345-540)||(54635270-54635462)
chr3 (322-540)||(6716645-6716859)
chr3 (327-540)||(7779821-7780026)
chr3 (396-540)||(801238-801376)
chr3 (397-540)||(23200020-23200160)
chr3 (399-540)||(23197823-23197961)
chr3 (498-540)||(9636106-9636148)
chr3 (506-538)||(43401789-43401821)
chr3 (506-538)||(49199457-49199489)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (293-540)||(13655805-13656054)
chr2 (293-540)||(12647162-12647408)
chr2 (349-540)||(6266837-6267023)
chr2 (397-540)||(4484211-4484352)
chr2 (397-540)||(30833492-30833633)
chr2 (327-540)||(32289710-32289916)
chr2 (400-540)||(36987961-36988098)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (293-540)||(6419-6667)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (293-540)||(8395749-8395996)
chr4 (293-540)||(8393540-8393787)
chr4 (292-535)||(7125053-7125295)
chr4 (293-535)||(7122834-7123075)
chr4 (293-540)||(5136211-5136459)
chr4 (293-540)||(5138436-5138684)
chr4 (349-540)||(31495143-31495338)
chr4 (506-538)||(2209862-2209894)
chr4 (506-538)||(50262689-50262721)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (293-540)||(25421452-25421698)
chr6 (293-540)||(6027393-6027638)
chr6 (293-540)||(13154061-13154308)
chr6 (293-540)||(34167226-34167472)
chr6 (293-540)||(33341878-33342127)
chr6 (293-540)||(34165004-34165251)
chr6 (322-540)||(16555015-16555228)
chr6 (322-540)||(16578327-16578540)
chr6 (322-540)||(16616840-16617053)
chr6 (322-540)||(16631571-16631784)
chr6 (322-540)||(16653258-16653471)
chr6 (292-430)||(6136078-6136216)
chr6 (322-540)||(27648006-27648210)
chr6 (293-405)||(13159051-13159164)
chr6 (417-540)||(412248-412369)
chr6 (349-540)||(3072596-3072781)
chr6 (348-540)||(6097285-6097473)
chr6 (498-540)||(2171512-2171554)
chr6 (349-442)||(2171366-2171456)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (293-540)||(2380-2626)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (293-540)||(15290670-15290917)
chr8 (293-540)||(15471039-15471286)
chr8 (292-540)||(42575099-42575346)
chr8 (322-540)||(25690100-25690313)
chr8 (322-540)||(3439649-3439861)
chr8 (327-540)||(2627882-2628087)
chr8 (417-540)||(42498340-42498459)
chr8 (32-114)||(17027515-17027597)
chr8 (32-114)||(17558007-17558089)
chr8 (423-460)||(32902096-32902133)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (336-540)||(11-214)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (336-540)||(3545-3748)
[»] scaffold0289 (2 HSPs)
scaffold0289 (18-283)||(4803-5068)
scaffold0289 (18-283)||(13636-13901)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (397-540)||(11042-11183)
scaffold0491 (397-540)||(8616-8757)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (498-540)||(11703-11745)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 15037628 - 15037905
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15037628 tcacaaatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagttatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 15037727  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15037728 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaataagagagtgaatatcattaaggatatagct 15037827  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15037828 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 15037905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 15002716 - 15002993
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15002716 tcacaaatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacggcttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatga 15002815  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  15002816 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggcgaatttgattggaataagagggtgaatatcattaaagatgtagct 15002915  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15002916 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 15002993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 15011609 - 15011886
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15011609 tcacaaatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacggcttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatga 15011708  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  15011709 attcttggagaagggtagcttggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaataagagggtgaatattattaaagatatagct 15011808  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15011809 aatgccttattctatctgcatcatgactgctcgcctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 15011886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 15017724 - 15018001
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15017724 tcacaaatgagattcatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacgggttttgtttacatcgactacactcatttttggtttatga 15017823  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  15017824 attcttggagaagggtagtgtggacatcattttgaaggacaatgaacaagctgctgaatttgattggaataagagggtgaatattattaaagatatagct 15017923  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15017924 aatgccttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctatagttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 15018001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 15041212 - 15041473
Alignment:
Q  31 tgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttggcgaagggt 130  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15041212 tgcttagacagaaatccgacatcgcaacattgtaaagttatatgggttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatgaattcttggagaagggt 15041311  T
Q  131 agcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctttatgctatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15041312 agcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctagtgaatttgattggaatagaagggtgaatgtcattaaagatatagctaatgctttatgctatc 15041411  T
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041412 tacatcatgattgttcccctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 15041473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14532248 - 14531971
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14532248 tcacaaatgagatccatgctttgaaagaaattcgacatcgcaatattgtgaagttatacggcttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatga 14532149  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  14532148 attcttggaaaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctgctgaatttgattggaataggagggtgaatgtcattaaagatatagct 14532049  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14532048 aatgctttatgctatctacatcatgactgctcacctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 14531971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14522111 - 14521850
Alignment:
Q  31 tgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttggcgaagggt 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14522111 tgctttgacagaaatccgacatcgcaacattgtaaagttatatgggttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatgaattcttggagaagggt 14522012  T
Q  131 agcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctttatgctatc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14522011 agcttggacaacattttgaaggacaatgaacaagctagtgaatttgattggagtaggagggtgaatatcattaaagatatagctaatgctttattctatc 14521912  T
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14521911 tacatcatgactgctcacctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 14521850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 44204024 - 44203778
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  44204024 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 44203925  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44203924 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 44203827  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44203826 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 44203778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 15033061 - 15033338
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15033061 tcacaaatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacgggttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatga 15033160  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| ||||||| |    
T  15033161 attcttggagaagggtagcatggacatcattttgaaggacaatgaacaagctcctgaatttgattggaataggagggtggatgttattaaagatatagct 15033260  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15033261 aatgctttatgctatatgcatcatgattgttcaccttcaattgttcatcgcgatatatccagcaagaatgtcattttg 15033338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9036775 - 9036562
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9036775 gatcgaaccacaccaatgcaaaggat---gatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacac 9036680  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9036679 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgtt 9036581  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9036580 cacccagttcggtccaaac 9036562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 323 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 21054314 - 21054104
Alignment:
Q  323 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 422  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  21054314 atcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 21054219  T
Q  423 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054218 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 21054122  T
Q  523 acccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21054121 acccagttcggtccaaac 21054104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 323 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9987558 - 9987347
Alignment:
Q  323 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 422  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  9987558 atcgaaccacaccaatacgaaaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 9987463  T
Q  423 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaac-aaatacaccaagagattggt 521  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  9987462 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgtt 9987366  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9987365 cacccagttcggtccaaac 9987347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282523
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaa-caaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag 447  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 40282613  T
Q  448 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40282612 tgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 40282523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622259
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 448  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 20622170  T
Q  449 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20622171 gagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 20622259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 14468419 - 14468689
Alignment:
Q  22 tgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttg 121  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||  || | ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14468419 tgagatccaagctttaacagaaatccgacatcgaaacattgtgaagttatgcggttattgttcacatccattgcactcatttttggtttatgagttcttg 14468518  T
Q  122 gcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctt 221  Q
    |  ||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||  |   ||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||      
T  14468519 gaaaagggtagcgtggacaagattttgaaagaagatgagcaagctactatgtttgactggaataggagggtgaatgtcattaaggatgtagctaatgcac 14468618  T
Q  222 tatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||| |||  ||||||||||| | || ||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||    
T  14468619 tatactacatgcatcatgatcgctcaccatcaattgttcatcgcgatatatccagtaagaatattgttttg 14468689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 14483384 - 14483637
Alignment:
Q  39 cagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttggcgaagggtagcatgga 138  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  14483384 cagaaatccgacatcgaaacattgtgaagttatacgggtattgttcacatctattgcactcatttttggtttatgagttcttggagaagggtagtctgga 14483483  T
Q  139 caacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctttatgctatctgcatcat 238  Q
     || |||||||| ||| |||| ||||||  ||  ||||  ||||| | ||| |||| |  |||||| ||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  14483484 taagattttgaaagacgatgagcaagctactgtgtttggctggaataggagggtgattgccattaaagatgtagctaatgctttatactacatgcatcat 14483583  T
Q  239 gattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    ||| | || ||| | || |||||| | ||||||||||| |||||| || |||||    
T  14483584 gatcgctcaccttcaatagttcatcgcgatatatccagtaagaatattgttttg 14483637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 292
Target Start/End: Original strand, 14504608 - 14504868
Alignment:
Q  32 gctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttggcgaagggta 131  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  14504608 gctttaacagaaagccgacatcgaaacattgtgaagttatacgggtattgttcacatccattgcactcatttttggtttatgagttcttggagaagggca 14504707  T
Q  132 gcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctttatgctatct 231  Q
    |  |||| || |||||||| ||| |||| |||||   |   ||||||||||| ||||| |||||   |||||| ||| ||| ||||||||||| |||  |    
T  14504708 gtctggataagattttgaaagacgatgagcaagccactatgtttgattggaataagagggtgaaatccattaaagatgtagctaatgctttatactacat 14504807  T
Q  232 gcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    |||||||||| | || ||| | ||||||||| | |||||||| || |||||| || |||||    
T  14504808 gcatcatgatcgctcacctgcaattgttcatcgcgatatatcgagtaagaatattgttttg 14504868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 51765684 - 51765543
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51765684 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 51765588  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  51765587 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 51765543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 540
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550809
Alignment:
Q  400 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-ag 496  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||| | |||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaaga--gagaag-aagagag 8550766  T
Q  497 aaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8550767 aaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 8550809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 538
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42297995
Alignment:
Q  506 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 42297995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 1560441 - 1560688
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  1560441 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagta 1560540  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560541 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 1560640  T
Q  493 gaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1560641 gaagaaaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaac 1560688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 6594334 - 6594580
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  6594334 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6594433  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6594434 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 6594531  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6594532 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 6594580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 6592116 - 6592362
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  6592116 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6592215  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6592216 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaag--gagggaa 6592313  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6592314 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 6592362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 18388536 - 18388782
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  18388536 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 18388635  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18388636 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaagagagggaa 18388733  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18388734 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 18388782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 18391972 - 18392218
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  18391972 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtt 18392071  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18392072 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 18392169  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18392170 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 18392218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 32060098 - 32060344
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  32060098 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 32060197  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32060198 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 32060295  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32060296 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaac 32060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 322 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20344255 - 20344044
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || | |||||| ||    
T  20344255 gatcgaaccacaccaatgcaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcgacaaaaaac 20344162  T
Q  422 ca---cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagat 517  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20344161 cagcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 20344065  T
Q  518 tggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  20344064 tgttcacccagttcggtccaa 20344044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15664742 - 15664477
Alignment:
Q  18 caaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaatt 117  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||     |||||||||||||| || ||    
T  15664742 caaatgagatccaagttctgacagaaattcggcatcgtaacattgtgaagctatatggattttgttcacacacacacttgtcgtttttggtttacgagtt 15664643  T
Q  118 cttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaat 217  Q
    | ||| ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || ||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  |||    
T  15664642 catggagaaaggtagtttggaaaagattttgaatgatgatgaagaagcaattgcatttggttggaaaaagagggtgaatgttattaaagatatagcgaat 15664543  T
Q  218 gctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15664542 gctttatgctatatgcaccatgattgcacccctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 15664477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 14606513 - 14606781
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||  ||     || ||||||||||||||    
T  14606513 tcacaaatgagatccaagctctgaccgaaattcgacatcgtaatattgtgaagttgtatggattttgctcacattcacagttgtcatttttggtttatga 14606612  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
     ||  | | ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||      
T  14606613 gtttgtagagaaaggtagtttggaaaagattttgaaagatgatgaagaagcaattgcatttgattggaataagagggtgaatgtcattaaagatgtagcc 14606712  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14606713 aatgctttatgctacatgcatcatgattgctcgcctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 14606781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 16025690 - 16025958
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||  ||     || ||||||||||||||    
T  16025690 tcacaaatgagatccaagctctgaccgaaattcgacatcgtaatattgtgaagttgtatggattttgctcacattcacagttgtcatttttggtttatga 16025789  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
     ||  | | ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||      
T  16025790 gtttgtagagaaaggtagtttggaaaagattttgaaagatgatgaagaagcaattgcatttgattggaataagagggtgaatgtcattaaagatgtagcc 16025889  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16025890 aatgctttatgctacatgcatcatgattgctcgcctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 16025958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 16173166 - 16173434
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||  ||     || ||||||||||||||    
T  16173166 tcacaaatgagatccaagctttgactgaaattcgacatcgtaatattgtgaatctgtatggattttgctcacattcacagttgtcatttttggtttatga 16173265  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
     ||  | | ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || |||| ||||||| ||| | |||||| ||||||| ||| ||| |    
T  16173266 gtttgtagagaaaggtagtttggaaaagattttgaaagatgatgaagaagcaattgcatttaattggaaaaagcgggtgaatgtcattaaagatgtagct 16173365  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16173366 aatgctttatgctatatgcaccatgattgctcgcctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 16173434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 17849137 - 17849405
Alignment:
Q  15 tcacaaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||  || |  ||| ||||||||||| ||    
T  17849137 tcacaagtgagatccaagctttgatagaaattcgacatcgtaacattgtgaagctgtatggattttgtttgcattcacgattctcatttttggtttacga 17849236  T
Q  115 attcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagtt 214  Q
     ||| |||  || || ||  | || ||||||||||| ||  |||| |||||   || |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||| ||| |    
T  17849237 tttcatgggaaaaggaagtgtagataacattttgaaagatgatgatcaagcaattgcatttgattggaataagcgggtgaatgtcattaaagatgtagct 17849336  T
Q  215 aatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17849337 aatgctctatgttatatgcatcatcattgctcacctccgattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 17849405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 283
Target Start/End: Original strand, 16103584 - 16103766
Alignment:
Q  101 tttttggtttatgaattcttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatca 200  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||| |||||  |||| || |||||||||||  ||||| ||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  16103584 tttttggtttatgagttcgtagagaaaggtagtttggagaaaattttgaaggatgatgaagaagcaattgcgtttgattggaacaagagagtgaatgtcc 16103683  T
Q  201 ttaaggatatagttaatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16103684 ttaaagatgtagctaatgctttatgctacatgcatcatgattgctcgcctccaattgttcacagagatatatcaagcaagaat 16103766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Original strand, 43503991 - 43504176
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 447  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |    
T  43503991 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaag 43504086  T
Q  448 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43504087 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaac 43504176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731515
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 39731560  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39731559 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 39731515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 451 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789987
Alignment:
Q  451 gaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 24789987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24790333 - 24790230
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 448  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24790333 atgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgc---gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggt 24790237  T
Q  449 gtgaaac 455  Q
    | |||||    
T  24790236 gagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15676423 - 15676312
Alignment:
Q  172 atttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatata 271  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  15676423 atttgattggaataagcgggtgaatgttattaaagatgtagctaatgctttatactatatgcaccatgattgctcacctccaattgttcatcgagatata 15676324  T
Q  272 tccagcaagaat 283  Q
    || |||||||||    
T  15676323 tcaagcaagaat 15676312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 31159647 - 31159701
Alignment:
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgt 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31159647 tgcatcatgattgttctcctcctattgttcatcgtgatatatcgagcaagaatgt 31159701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 31241750 - 31241804
Alignment:
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgt 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31241750 tgcatcatgattgttctcctcctattgttcatcgtgatatatcgagcaagaatgt 31241804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 31140815 - 31140869
Alignment:
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgt 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31140815 tgcatcatgattgttctcctcctattattcatcgtgatatatcaagcaagaatgt 31140869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 35854102 - 35854060
Alignment:
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35854102 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 35854060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 540
Target Start/End: Original strand, 25766940 - 25766982
Alignment:
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25766940 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaac 25766982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 31103456 - 31103508
Alignment:
Q  231 tgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||    
T  31103456 tgcatcatgattgctcacctcctattattcatcgtgatatatcgagcaagaat 31103508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10593650 - 10593404
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10593650 tgttgtgtatccccgtatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 10593551  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593550 tattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaa 10593452  T
Q  493 gaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10593451 gtagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 10593404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 40380483 - 40380237
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  40380483 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 40380384  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40380383 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 40380286  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40380285 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 40380237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 40382694 - 40382448
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  40382694 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 40382595  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40382594 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 40382497  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40382496 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 40382448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 25078513 - 25078267
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  25078513 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25078414  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25078413 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 25078316  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25078315 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 25078267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 25136482 - 25136236
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  25136482 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25136383  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25136382 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 25136285  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25136284 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 25136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16544804 - 16544555
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16544804 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 16544705  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 489  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16544704 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16544607  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544606 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 16544555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16547026 - 16546777
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  16547026 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagc 16546927  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 489  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16546926 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16546829  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546828 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 16546777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 324 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720510
Alignment:
Q  324 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 423  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29720624  T
Q  424 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29720527  T
Q  524 cccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||    
T  29720526 cccagttcggtccaaac 29720510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 324 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722671
Alignment:
Q  324 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 423  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29722784  T
Q  424 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29722687  T
Q  524 cccagttcggtccaaa 539  Q
    ||||||||||||||||    
T  29722686 cccagttcggtccaaa 29722671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 540
Target Start/End: Original strand, 22536100 - 22536312
Alignment:
Q  319 tcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaa-caaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||   |||||||| || |||||||    
T  22536100 tcggatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtat---gcaagcaacaatcaacaaa 22536193  T
Q  418 acaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagat 517  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22536194 aaac-acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 22536289  T
Q  518 tggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  22536290 tgttcacccagttcggtccaaac 22536312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 323 - 540
Target Start/End: Original strand, 29750969 - 29751182
Alignment:
Q  323 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 422  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | || | |||||||||| || ||||||||||||    
T  29750969 atcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 29751066  T
Q  423 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaac-aaatacaccaagagattggt 521  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  29751067 acctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgtt 29751163  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29751164 cacccagttcggtccaaac 29751182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 540
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789246
Alignment:
Q  327 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 426  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  9789042 aaccacaccaatacaaagtat---gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacct 9789134  T
Q  427 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacc 525  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  9789135 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatac-acaagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacc 9789231  T
Q  526 cagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||    
T  9789232 cagttcggtccaaac 9789246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 540
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441670
Alignment:
Q  327 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 426  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  18441462 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacct 18441554  T
Q  427 agatctaatctaggaaccaagtg----tgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattggt 521  Q
    ||||||||||||||||  |||||      ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  18441555 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatac-acaagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgtt 18441651  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18441652 cacccagttcggtccaaac 18441670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16409764 - 16409621
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16409764 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 16409668  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16409667 ggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 16409621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 417 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26178028
Alignment:
Q  417 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-ga 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  515 gattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaac 26178028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26170983 - 26170908
Alignment:
Q  464 acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26170983 acaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 26170908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 292
Target Start/End: Original strand, 13402 - 13674
Alignment:
Q  20 aatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattct 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13402 aatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacggcttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatgaatttt 13501  T
Q  120 tggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgc 219  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13502 tggagaagggtagcatgtacaacattttgaaggacaatgaacaagctgctgaatttgattggaataagagggtgaatatcattaaagatatagctaatgc 13601  T
Q  220 tttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13602 cttattctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 13674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 7104 - 7374
Alignment:
Q  22 tgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttg 121  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7104 tgagatccaagctttaactgaaatccggcatcgaaacattgtgaagttatacgggtattgttcacatccattgcactcatttttggtttatgagttcttg 7203  T
Q  122 gcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctt 221  Q
    | ||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||   | | ||  ||||||| | ||| || |||  |||||| | | ||| ||||||||    
T  7204 gagaaaggcagtgtggacaagattttgaaagacaatgaccaagcaattaagttgaattggaataggagggtaaatgccattaaaggtgtagctaatgctt 7303  T
Q  222 tatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    |||||||| |||||||  |||| || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7304 tatgctatatgcatcacaattgctcaccttcaattgttcatcgtgatatatccagcaagaatgttgttttg 7374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 292
Target Start/End: Original strand, 14045 - 14317
Alignment:
Q  20 aatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattct 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14045 aatgagatccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgtgaagttatacggcttttgttcacatcgactacactcatttttggtttatgaatttt 14144  T
Q  120 tggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgc 219  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14145 tggagaagggtagcatgtacaacattttgaaggacaatgaacaagctgctgaatttgattggaataagagggtgaatatcattaaagatatagctaatgc 14244  T
Q  220 tttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14245 cttattctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcatcgagatatatccagcaagaatgttattttg 14317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 7748 - 8018
Alignment:
Q  22 tgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaattcttg 121  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7748 tgagatccaagctttaactgaaatccggcatcgaaacattgtgaagttatacgggtattgttcacatccattgcactcatttttggtttatgagttcttg 7847  T
Q  122 gcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaatgctt 221  Q
    | ||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||   | | ||  ||||||| | ||| || |||  |||||| | | ||| ||||||||    
T  7848 gagaaaggcagtgtggacaagattttgaaagacaatgaccaagcaattaagttgaattggaataggagggtaaatgccattaaaggtgtagctaatgctt 7947  T
Q  222 tatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaatgttattttg 292  Q
    |||||||| |||||||  |||| || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7948 tatgctatatgcatcacaattgctcaccttcaattgttcatcgtgatatatccagcaagaatgttgttttg 8018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 25637822 - 25637573
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25637822 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtg 25637723  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagc-aacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637722 tattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagaggga 25637623  T
Q  492 agaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637622 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 25637573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 4598299 - 4598545
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  4598299 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4598398  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598399 tattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4598496  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598497 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 4598545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 290 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 3617845 - 3617596
Alignment:
Q  290 ttgtgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3617845 ttgtgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaa 3617746  T
Q  390 gagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagg 489  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3617745 gtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagg 3617648  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3617647 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 3617596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 4600520 - 4600766
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  4600520 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4600619  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600620 tattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4600717  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600718 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 4600766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 292 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10211789 - 10211541
Alignment:
Q  292 gtgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaag 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10211789 gtgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaag 10211690  T
Q  391 agtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211689 cttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggg 10211592  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211591 aagatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10211541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10209568 - 10209321
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  10209568 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10209469  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209468 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 10209371  T
Q  492 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10209370 agatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaac 10209321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10056612 - 10056365
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10056612 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10056513  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10056512 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10056416  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056415 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10056365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10058834 - 10058587
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10058834 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10058735  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10058734 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10058638  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058637 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10058587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10061056 - 10060809
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10061056 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10060957  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10060956 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10060860  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060859 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10060809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10063278 - 10063031
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10063278 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10063179  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10063178 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10063082  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063081 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10063031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10065500 - 10065253
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10065500 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10065401  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10065400 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10065304  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065303 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10065253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10067699 - 10067452
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10067699 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10067600  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10067599 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10067503  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067502 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 10067452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 45283345 - 45283132
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  45283345 gatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaataatcaacaaaacac 45283250  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 521  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  45283249 cacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 45283151  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  45283150 cactcagttcggtccaaac 45283132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 345 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 54635462 - 54635270
Alignment:
Q  345 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaacc 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54635462 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 54635364  T
Q  445 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54635363 aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 54635270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6716859 - 6716645
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaac-aaaaca 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| || | |||||||||| || |||| ||||||    
T  6716859 gatcgaaccacaccaatgcaaagagt---gatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaaccaaaaca 6716764  T
Q  421 ccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattg 519  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  6716763 ccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataa--aaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattg 6716666  T
Q  520 gtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6716665 ttcacccagttcggtccaaac 6716645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 540
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7780026
Alignment:
Q  327 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacc 425  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || |||||||| || ||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaag--taa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacc 7779913  T
Q  426 tagatctaatctaggaaccaagtg-tgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7779914 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatac-acaagcacaagataa--aaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcac 7780010  T
Q  525 ccagttcggtccaaac 540  Q
    ||| || |||||||||    
T  7780011 ccactttggtccaaac 7780026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 801376 - 801238
Alignment:
Q  396 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaag 493  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  801376 tgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca---caata--cacaagataaa--aggagagggaag 801285  T
Q  494 aagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  801284 aagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 801238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 23200020 - 23200160
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 495  Q
    |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  23200020 gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcataagataaa--aggagagggaagaa 23200116  T
Q  496 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23200117 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 23200160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 540
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23197961
Alignment:
Q  399 gcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 497  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagagaagagga 23197919  T
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23197920 aaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 23197961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 540
Target Start/End: Original strand, 9636106 - 9636148
Alignment:
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9636106 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaac 9636148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 538
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401821
Alignment:
Q  506 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 43401821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 538
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199489
Alignment:
Q  506 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 49199489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 13655805 - 13656054
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  13655805 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagta 13655904  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655905 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 13656004  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656005 gaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 13656054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 12647162 - 12647408
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  12647162 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 12647261  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12647262 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 12647359  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12647360 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 12647408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266837
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 448  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagt 6266927  T
Q  449 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaac-aaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |  ||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6266926 gaaaaacacaatac-acaagcacaagataaac--ggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 6266837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 4484211 - 4484352
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaag-caacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||  | |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4484211 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaa-gtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaaga 4484307  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4484308 agaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaac 4484352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 30833633 - 30833492
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30833633 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 30833537  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30833536 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaac 30833492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289710
Alignment:
Q  327 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacc 425  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||| |    |||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaataatcaacaataacaacacc 32289824  T
Q  426 tagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtca 523  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  32289823 tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttca 32289727  T
Q  524 cccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||    
T  32289726 cccagttcggtccaaac 32289710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 540
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988098
Alignment:
Q  400 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 497  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 36988056  T
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 36988098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6667 - 6419
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  6667 tgttgtgaatccccgagtctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6568  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat-aaacaaggagaggga 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6567 tattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagaggga 6468  T
Q  492 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6467 agaagaaaacaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 6419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 8395996 - 8395749
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  8395996 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 8395897  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8395896 tattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8395798  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8395797 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 8395749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 8393787 - 8393540
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      
T  8393787 tgttgtgaatccccggacctcaaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtt 8393688  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8393687 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8393589  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8393588 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 8393540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 292 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7125295 - 7125053
Alignment:
Q  292 gtgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7125295 gtgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 7125196  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7125195 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gaggga 7125098  T
Q  492 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtc 535  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7125097 agaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtc 7125053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 293 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7123075 - 7122834
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  7123075 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7122976  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7122975 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 7122878  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtc 535  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  7122877 gaagaaaacaataaacacaaagaaattgttcacccagttcggtc 7122834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 5136459 - 5136211
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5136459 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 5136360  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagagg 489  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5136359 ttattgagcaagcaagagacaacaaaacatca-ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagg 5136263  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136262 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 5136211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 5138684 - 5138436
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5138684 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 5138585  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagagg 489  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5138584 ttattgagcaagcaagagacaacaaaacatca-ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagg 5138488  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138487 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 5138436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495338
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 447  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||| || | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaag 31495240  T
Q  448 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac------aaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31495241 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 31495338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209862
Alignment:
Q  506 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 2209862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 538
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262721
Alignment:
Q  506 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaa 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaa 50262721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421452
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  25421698 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25421599  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25421598 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 25421501  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25421500 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 25421452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6027638 - 6027393
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  6027638 tgttgtgaatccccggatctccaagactggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtg 6027539  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  6027538 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa-atg--gagggaa 6027442  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6027441 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 6027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13154308 - 13154061
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13154308 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13154209  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13154208 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 13154111  T
Q  492 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154110 agaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 13154061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 34167472 - 34167226
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  34167472 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaaa 34167373  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34167372 tattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 34167275  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34167274 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 34167226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 33341878 - 33342127
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33341878 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 33341977  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 489  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33341978 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 33342075  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342076 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 33342127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 34165251 - 34165004
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  34165251 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 34165152  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 490  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34165151 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 34165055  T
Q  491 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165054 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 34165004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16555228 - 16555015
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16555228 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16555134  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16555133 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgt 16555035  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16555034 tcacccagttcggtccaaac 16555015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Original strand, 16578327 - 16578540
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16578327 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16578421  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16578422 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgt 16578520  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16578521 tcacccagttcggtccaaac 16578540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16617053 - 16616840
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16617053 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16616959  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16616958 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgt 16616860  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16616859 tcacccagttcggtccaaac 16616840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16631784 - 16631571
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16631784 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16631690  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16631689 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgt 16631591  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16631590 tcacccagttcggtccaaac 16631571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16653471 - 16653258
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  16653471 gatcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacac 16653377  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16653376 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagc-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgt 16653278  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16653277 tcacccagttcggtccaaac 16653258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 292 - 430
Target Start/End: Original strand, 6136078 - 6136216
Alignment:
Q  292 gtgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  6136078 gtgttgtgaatccccggacctccaaggccggatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 6136177  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136178 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 27648210 - 27648006
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| || |||||||||||    
T  27648210 gatcgaaccacaccaatacaag----aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacac 27648116  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||       |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  27648115 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactca-------atacacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 27648025  T
Q  522 cacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27648024 cacccagttcggtccaaac 27648006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 293 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13159164 - 13159051
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13159164 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13159065  T
Q  392 gtattgtgcaagca 405  Q
     ||||| |||||||    
T  13159064 ttattgagcaagca 13159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412248
Alignment:
Q  417 aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagag 515  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagag 412273  T
Q  516 attggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  412272 attgttcacccagttcggtccaaac 412248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 540
Target Start/End: Original strand, 3072596 - 3072781
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaccaag 447  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||| ||   |||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3072596 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaag 3072691  T
Q  448 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3072692 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 3072781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 540
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097473
Alignment:
Q  348 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaccaa 446  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||   |||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaa 6097380  T
Q  447 gtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||  ||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6097381 gtggaaaaacacaataca-caatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaac 6097473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 540
Target Start/End: Original strand, 2171512 - 2171554
Alignment:
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2171512 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 2171554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 442
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171456
Alignment:
Q  349 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 442  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||| ||   |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 2171456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2626
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagag 392  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  2380 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 2479  T
Q  393 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2480 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 2577  T
Q  493 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2578 gaagaaaacaataaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaac 2626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15290917 - 15290670
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15290917 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15290818  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290817 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15290720  T
Q  492 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15290719 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaac 15290670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 293 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15471286 - 15471039
Alignment:
Q  293 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaaga 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15471286 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15471187  T
Q  392 gtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 491  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15471186 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15471089  T
Q  492 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15471088 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaac 15471039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 292 - 540
Target Start/End: Original strand, 42575099 - 42575346
Alignment:
Q  292 gtgttgtgaatccccggatctccaagatc-ggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaag 390  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575099 gtgttgtgaatccccgagcctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaag 42575198  T
Q  391 agtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaa-caatcacaagataaacaaggagagg 489  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  42575199 cttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaaccaaacacaagat--acaaggagagg 42575294  T
Q  490 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575295 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaac 42575346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 25690313 - 25690100
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  25690313 gatcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaagaatcaacaaaacac 25690218  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacacc-aagagattg 519  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  25690217 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac-acactcacaagataa--aaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattg 25690121  T
Q  520 gtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  25690120 ttcacccagttcggtccaaac 25690100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 3439861 - 3439649
Alignment:
Q  322 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 421  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||   |||||||||| || |||||||||||    
T  3439861 gatcgaaccacaccaatactaaaaa-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcaacaaaacac 3439766  T
Q  422 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc-aagagattgg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||     
T  3439765 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 3439669  T
Q  521 tcacccagttcggtccaaac 540  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  3439668 tcatccagttcggtccaaac 3439649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627882
Alignment:
Q  327 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccac 424  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||| |    |||||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacac 2627995  T
Q  425 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 524  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  2627994 ctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcac 2627898  T
Q  525 ccagttcggtccaaac 540  Q
    ||||||||||||||||    
T  2627897 ccagttcggtccaaac 2627882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498340
Alignment:
Q  417 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 515  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||    
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagggaaacaaacacaccaa-ag 42498365  T
Q  516 attggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  42498364 attgttcacccagttcggtccaaac 42498340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Original strand, 17027515 - 17027597
Alignment:
Q  32 gctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||    
T  17027515 gctttaacagaaatccgacatagaaacattgctaagttatacgggtattgttcacatccattgcactcatttttagtttatga 17027597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Original strand, 17558007 - 17558089
Alignment:
Q  32 gctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatga 114  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||    
T  17558007 gctttaacagaaatccgacatagaaacattgctaagttatacgggtattgttcacatccattgcactcatttttagtttatga 17558089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 460
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902133
Alignment:
Q  423 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaa 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaa 32902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 336 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 11
Alignment:
Q  336 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 115  T
Q  436 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 534  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  114 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 17  T
Q  535 ccaaac 540  Q
    ||||||    
T  16 ccaaac 11  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 336 - 540
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3748
Alignment:
Q  336 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacccaacaaagagtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 3644  T
Q  436 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 534  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3645 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 3742  T
Q  535 ccaaac 540  Q
    ||||||    
T  3743 ccaaac 3748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4803
Alignment:
Q  18 caaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaatt 117  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||   ||     |||||||||||||| || ||    
T  5068 caaatgagatcaaagctttgacagaaattcgacattgtaacattgtgaagctatatggatattgttcacactcacacttgtcgtttttggtttacgagtt 4969  T
Q  118 cttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaat 217  Q
    | ||| ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || ||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  |||    
T  4968 catggagaaaggtagtctggaaaagattttgaaagatgatgaagaagcaattgcatttggttggaaaaagagggtgaatgttattaaagatatagcgaat 4869  T
Q  218 gctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4868 gctttatgctatatgcaccatgattgcacccctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13901 - 13636
Alignment:
Q  18 caaatgagaaccatgctttgacagaaattcgacatcgcaacattgttaagctatatgggttttgttcacatcgactacactcgtttttggtttatgaatt 117  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||   ||     |||||||||||||| || ||    
T  13901 caaatgagatcaaagctttgacagaaattcgacattgtaacattgtgaagctatatggatattgttcacactcacacttgtcgtttttggtttacgagtt 13802  T
Q  118 cttggcgaagggtagcatggacaacattttgaaggacaatgaacaagctggtgaatttgattggaacaagagagtgaatatcattaaggatatagttaat 217  Q
    | ||| ||| |||||  |||| || |||||||| ||  ||||| ||||   || ||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||  |||    
T  13801 catggagaaaggtagtctggaaaagattttgaaagatgatgaagaagcaattgcatttggttggaaaaagagggtgaatgttattaaagatatagcgaat 13702  T
Q  218 gctttatgctatctgcatcatgattgttcccctcctattgttcattgagatatatccagcaagaat 283  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13701 gctttatgctatatgcaccatgattgcacccctccaattgttcatcgagatatatcaagcaagaat 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11183
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 11138  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11139 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 11183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8757
Alignment:
Q  397 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 494  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--agaagagggaaga 8712  T
Q  495 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8713 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaac 8757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11703
Alignment:
Q  498 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaac 540  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11745 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaac 11703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University