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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20633_high_12 (Length: 670)

Name: NF20633_high_12
Description: NF20633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20633_high_12
NF20633_high_12
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (10-654)||(42668687-42669335)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 654
Target Start/End: Original strand, 42668687 - 42669335
Alignment:
Q  10 attattcttgatcagtttccatcccatgtttcatgtttctgacattacaaaattactatagttaatgatcacaacctcacgttctagttctaattctaat 109  Q
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T  42668687 attattcttgatcagtttccatcccatgtttcatgtttctgacattacaaaattactatagttaatgatcacaacctcacgttctagttctaattctaat 42668786  T
Q  110 taattagacccaacccaatataagcaatatatatctcattagtttttaatgaaggaacaaatttaatcccaatacaaccaaggtcccattggcaagggga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42668787 taattagacccaacccaatataagcaatatatatctcattagtttttaatgaaggaacaaatttaatcccaatacaaccaaggtcccattggcaagggga 42668886  T
Q  210 tcacctaattcatagctaaaaccgtactccgacatcaataatgatatgacatgaatatgtgtttataaatcgtagataatttttgctttaaaaattgata 309  Q
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T  42668887 tcacctaattcatagctaaaaccgtactccgacatcaataatgatataacatgaatatgtgtttataagttgtagataatttttgctttaaaaattgata 42668986  T
Q  310 atgtaaaattttatgatattaga----atttggtagaccgcttgctaccagattaccattatccggctaaccacttgatcacgctccagatgtccaatgg 405  Q
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T  42668987 atgtaaaattttatgatattagaatctatctggtagaccgcttgctaccagattaccattatccggctaaccacttgatcacgttccagatgtccagtgg 42669086  T
Q  406 tatctcgattacatgtttcgatatacataatataacaagtttatctaaatttcacaacaaatcatgttgatccatcaggtactactaccacatcttcatt 505  Q
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T  42669087 tatctcgattacatgtttcgatatacataatataacaagtttattcgaatttcacaacaaatcatgttgatccatcaggtactactaccacatcttcatt 42669186  T
Q  506 ctggatattttgatccatccatataacattaaccagaaagagaaaatacacacccgcaaacaaaatatcaaaatgaaccaaattaagatgaaacgtttac 605  Q
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T  42669187 ctggatattttgatccatccatataacattaaccagaaagagaaaatacacacccgcaaacaaaatatcaaaatgaaccaaattaagatgaaacgtttac 42669286  T
Q  606 atatacaacacggcacttataagtaactaactcaatcacccaatcaatt 654  Q
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T  42669287 atatacaacacggcacttataagtaactaactcaatcacccaattaatt 42669335  T

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