View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20633_high_166 (Length: 247)

Name: NF20633_high_166
Description: NF20633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20633_high_166
NF20633_high_166
[»] chr8 (107 HSPs)
chr8 (13-225)||(5853007-5853218)
chr8 (13-225)||(1484638-1484849)
chr8 (13-225)||(14409159-14409370)
chr8 (13-225)||(24485758-24485970)
chr8 (13-225)||(4542088-4542299)
chr8 (13-225)||(14824011-14824222)
chr8 (16-226)||(20045913-20046122)
chr8 (15-211)||(15202895-15203091)
chr8 (13-225)||(22001989-22002200)
chr8 (13-225)||(27472131-27472343)
chr8 (13-225)||(16413030-16413242)
chr8 (13-225)||(18677779-18677991)
chr8 (16-225)||(16198130-16198339)
chr8 (17-225)||(32121964-32122172)
chr8 (13-211)||(20403529-20403727)
chr8 (16-225)||(24048847-24049055)
chr8 (13-211)||(19896571-19896769)
chr8 (13-225)||(4483516-4483728)
chr8 (13-225)||(15070796-15071008)
chr8 (13-225)||(16401639-16401851)
chr8 (13-225)||(38549719-38549931)
chr8 (13-198)||(19936622-19936807)
chr8 (13-225)||(1326646-1326858)
chr8 (38-217)||(25657892-25658071)
chr8 (42-211)||(45290385-45290554)
chr8 (13-168)||(19896807-19896962)
chr8 (13-167)||(14397455-14397609)
chr8 (13-169)||(15202700-15202856)
chr8 (13-168)||(20403765-20403920)
chr8 (13-168)||(32122214-32122369)
chr8 (13-168)||(27471938-27472093)
chr8 (13-168)||(38549526-38549681)
chr8 (13-168)||(16401254-16401408)
chr8 (16-168)||(15071046-15071198)
chr8 (13-168)||(16412837-16412992)
chr8 (13-168)||(38549334-38549488)
chr8 (13-136)||(45290262-45290385)
chr8 (13-168)||(15202507-15202662)
chr8 (17-168)||(16401450-16401601)
chr8 (13-168)||(19897000-19897155)
chr8 (21-160)||(24049104-24049243)
chr8 (13-168)||(19936429-19936584)
chr8 (13-146)||(11361024-11361157)
chr8 (24-94)||(32810263-32810333)
chr8 (176-225)||(13425336-13425385)
chr8 (176-225)||(20982498-20982547)
chr8 (176-225)||(20982604-20982653)
chr8 (38-148)||(15319988-15320098)
chr8 (38-148)||(15500357-15500467)
chr8 (50-148)||(24717722-24717820)
chr8 (176-225)||(38549988-38550037)
chr8 (50-168)||(1484887-1485005)
chr8 (176-225)||(20403463-20403511)
chr8 (79-148)||(29759429-29759498)
chr8 (176-225)||(32810167-32810215)
chr8 (176-225)||(45290572-45290620)
chr8 (38-148)||(272163-272273)
chr8 (38-148)||(643576-643686)
chr8 (38-148)||(829382-829492)
chr8 (130-168)||(5852931-5852969)
chr8 (187-225)||(13425241-13425279)
chr8 (130-168)||(14409083-14409121)
chr8 (38-136)||(17150615-17150713)
chr8 (130-168)||(20045834-20045872)
chr8 (50-148)||(22007097-22007195)
chr8 (176-225)||(1326915-1326963)
chr8 (79-148)||(13663129-13663198)
chr8 (176-225)||(15203109-15203157)
chr8 (176-225)||(16401908-16401956)
chr8 (176-225)||(19896505-19896553)
chr8 (177-225)||(19936882-19936929)
chr8 (137-168)||(16401185-16401216)
chr8 (38-128)||(223304-223394)
chr8 (38-128)||(688075-688165)
chr8 (38-128)||(736927-737017)
chr8 (38-128)||(860822-860912)
chr8 (130-168)||(4483765-4483803)
chr8 (130-168)||(14824260-14824298)
chr8 (38-148)||(22089372-22089482)
chr8 (50-120)||(39364118-39364188)
chr8 (38-120)||(44477018-44477100)
chr8 (38-120)||(44480280-44480362)
chr8 (50-120)||(44522814-44522884)
chr8 (177-210)||(6573743-6573776)
chr8 (177-210)||(17438110-17438143)
chr8 (177-210)||(17979142-17979175)
chr8 (177-210)||(18819393-18819426)
chr8 (177-210)||(20517910-20517943)
chr8 (177-210)||(22207536-22207569)
chr8 (177-210)||(22258951-22258984)
chr8 (177-210)||(22355991-22356024)
chr8 (177-210)||(22473856-22473889)
chr8 (177-210)||(22473919-22473952)
chr8 (177-210)||(23669841-23669874)
chr8 (177-210)||(23669967-23670000)
chr8 (177-210)||(23670030-23670063)
chr8 (177-210)||(36405773-36405806)
chr8 (177-210)||(38988655-38988688)
chr8 (177-210)||(38988771-38988804)
chr8 (177-210)||(38988834-38988867)
chr8 (177-210)||(39019752-39019785)
chr8 (177-210)||(39019868-39019901)
chr8 (177-210)||(39019931-39019964)
chr8 (178-210)||(4381456-4381488)
chr8 (38-114)||(8728313-8728389)
chr8 (178-210)||(18817125-18817157)
chr8 (54-106)||(19866496-19866548)
[»] chr7 (109 HSPs)
chr7 (13-225)||(14948837-14949048)
chr7 (13-225)||(15376428-15376639)
chr7 (13-225)||(20384838-20385049)
chr7 (13-225)||(32125727-32125938)
chr7 (13-225)||(16410295-16410506)
chr7 (13-225)||(27217096-27217308)
chr7 (13-226)||(18627801-18628013)
chr7 (13-225)||(456557-456769)
chr7 (13-225)||(16232756-16232968)
chr7 (13-226)||(18640507-18640719)
chr7 (13-225)||(21189310-21189521)
chr7 (13-225)||(41523153-41523365)
chr7 (13-225)||(41525615-41525827)
chr7 (13-225)||(14269671-14269883)
chr7 (13-225)||(15081556-15081768)
chr7 (13-225)||(18430948-18431159)
chr7 (13-225)||(8940515-8940731)
chr7 (16-225)||(26355699-26355907)
chr7 (16-225)||(26358151-26358359)
chr7 (13-225)||(13869584-13869796)
chr7 (13-225)||(16213920-16214132)
chr7 (13-211)||(11972798-11972996)
chr7 (13-198)||(24702491-24702676)
chr7 (13-198)||(24704938-24705123)
chr7 (13-225)||(11303483-11303695)
chr7 (13-225)||(8468971-8469183)
chr7 (13-225)||(23664667-23664879)
chr7 (13-225)||(29796846-29797058)
chr7 (13-225)||(29800665-29800877)
chr7 (53-225)||(11393041-11393213)
chr7 (13-225)||(16108403-16108615)
chr7 (24-225)||(45847380-45847581)
chr7 (69-211)||(13841304-13841446)
chr7 (13-168)||(14269285-14269440)
chr7 (13-168)||(38897749-38897904)
chr7 (13-167)||(25926844-25926998)
chr7 (16-168)||(14156603-14156755)
chr7 (13-168)||(8940769-8940923)
chr7 (13-168)||(10501108-10501263)
chr7 (13-168)||(14156793-14156944)
chr7 (16-167)||(1856947-1857097)
chr7 (13-167)||(13918117-13918272)
chr7 (13-168)||(14269478-14269633)
chr7 (21-168)||(16214170-16214317)
chr7 (13-168)||(8940962-8941117)
chr7 (16-135)||(10500945-10501064)
chr7 (13-168)||(21189117-21189272)
chr7 (21-162)||(15081371-15081512)
chr7 (13-168)||(17985099-17985254)
chr7 (50-168)||(45847213-45847331)
chr7 (81-169)||(11310239-11310327)
chr7 (171-225)||(38897995-38898049)
chr7 (20-71)||(23461813-23461864)
chr7 (176-225)||(45847638-45847687)
chr7 (50-168)||(15376272-15376390)
chr7 (50-168)||(20384682-20384800)
chr7 (51-148)||(11286976-11287073)
chr7 (176-225)||(11972732-11972780)
chr7 (38-148)||(125965-126075)
chr7 (38-148)||(7822013-7822123)
chr7 (38-148)||(7829324-7829434)
chr7 (130-168)||(16410544-16410582)
chr7 (130-168)||(18628051-18628089)
chr7 (130-168)||(18640757-18640795)
chr7 (39-77)||(20110741-20110779)
chr7 (130-168)||(26355620-26355658)
chr7 (130-168)||(26358072-26358110)
chr7 (38-148)||(27102511-27102621)
chr7 (38-148)||(27109859-27109969)
chr7 (38-148)||(27175705-27175815)
chr7 (38-148)||(38784603-38784713)
chr7 (177-234)||(9743795-9743852)
chr7 (176-225)||(14269940-14269988)
chr7 (176-225)||(15081825-15081873)
chr7 (176-225)||(38898106-38898154)
chr7 (177-225)||(25941523-25941571)
chr7 (50-128)||(10000996-10001074)
chr7 (38-120)||(10896370-10896452)
chr7 (13-83)||(11310133-11310202)
chr7 (130-168)||(13869833-13869871)
chr7 (176-210)||(20619575-20619609)
chr7 (38-108)||(23664499-23664569)
chr7 (130-168)||(27217346-27217384)
chr7 (177-210)||(8473054-8473087)
chr7 (177-210)||(8514393-8514426)
chr7 (177-210)||(8851889-8851922)
chr7 (176-225)||(8940410-8940458)
chr7 (177-210)||(13745506-13745539)
chr7 (177-210)||(13745569-13745602)
chr7 (177-210)||(14153622-14153655)
chr7 (177-210)||(15119972-15120005)
chr7 (177-210)||(15576619-15576652)
chr7 (51-120)||(29004416-29004485)
chr7 (177-210)||(33556906-33556939)
chr7 (177-210)||(33556968-33557001)
chr7 (177-210)||(36301549-36301582)
chr7 (177-210)||(37538498-37538531)
chr7 (177-210)||(37538652-37538685)
chr7 (177-210)||(43747766-43747799)
chr7 (177-210)||(48213658-48213691)
chr7 (178-210)||(4691559-4691591)
chr7 (175-207)||(14153671-14153703)
chr7 (38-114)||(14188670-14188746)
chr7 (38-114)||(15167575-15167651)
chr7 (178-210)||(15576494-15576526)
chr7 (177-209)||(15576556-15576588)
chr7 (52-136)||(15951607-15951691)
chr7 (178-210)||(20253005-20253037)
chr7 (178-210)||(43747829-43747861)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (13-225)||(21923006-21923217)
chr1 (13-225)||(13989102-13989313)
chr1 (13-225)||(21474801-21475013)
chr1 (13-211)||(29298491-29298689)
chr1 (13-211)||(31612615-31612813)
chr1 (13-225)||(21841003-21841214)
chr1 (13-211)||(29776990-29777188)
chr1 (13-211)||(22122729-22122927)
chr1 (13-218)||(27161301-27161506)
chr1 (13-225)||(16274970-16275183)
chr1 (13-225)||(15859723-15859934)
chr1 (13-225)||(16362154-16362366)
chr1 (13-195)||(13227129-13227311)
chr1 (13-225)||(23593448-23593660)
chr1 (13-211)||(22050551-22050749)
chr1 (13-195)||(29535317-29535499)
chr1 (14-168)||(31612851-31613005)
chr1 (16-168)||(15859520-15859672)
chr1 (13-168)||(29298727-29298882)
chr1 (16-161)||(9044722-9044867)
chr1 (16-168)||(29777226-29777378)
chr1 (13-168)||(22122535-22122691)
chr1 (21-168)||(31613044-31613191)
chr1 (23-168)||(27161118-27161263)
chr1 (21-158)||(40129387-40129524)
chr1 (20-168)||(16274784-16274932)
chr1 (16-168)||(16401407-16401559)
chr1 (13-93)||(43543269-43543349)
chr1 (98-168)||(10812612-10812682)
chr1 (16-109)||(10812723-10812816)
chr1 (176-225)||(16275240-16275289)
chr1 (50-168)||(13989351-13989469)
chr1 (176-225)||(22050767-22050815)
chr1 (176-225)||(29776924-29776972)
chr1 (52-148)||(21650883-21650979)
chr1 (176-211)||(29298438-29298473)
chr1 (38-148)||(17003909-17004019)
chr1 (50-148)||(21858592-21858690)
chr1 (176-225)||(29298372-29298420)
chr1 (176-225)||(31612549-31612597)
chr1 (177-225)||(22824136-22824184)
chr1 (41-120)||(18060577-18060656)
chr1 (180-218)||(1642854-1642892)
chr1 (138-168)||(21474733-21474763)
chr1 (50-148)||(44035830-44035928)
chr1 (177-210)||(7321576-7321609)
chr1 (177-210)||(7321639-7321672)
chr1 (177-210)||(12710178-12710211)
chr1 (177-210)||(18120835-18120868)
chr1 (176-225)||(22122945-22122993)
chr1 (177-210)||(24720419-24720452)
chr1 (21-54)||(43630311-43630344)
chr1 (177-210)||(44891754-44891787)
chr1 (177-210)||(50544145-50544178)
chr1 (178-210)||(6833571-6833603)
chr1 (177-225)||(21244669-21244717)
chr1 (177-225)||(27161518-27161565)
chr1 (178-210)||(50544208-50544240)
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (13-225)||(2290895-2291106)
chr6 (13-225)||(18334307-18334518)
chr6 (13-225)||(24422783-24422994)
chr6 (13-225)||(33862030-33862241)
chr6 (13-225)||(33864514-33864725)
chr6 (17-225)||(1540630-1540837)
chr6 (13-221)||(12742557-12742765)
chr6 (13-225)||(1598293-1598504)
chr6 (13-225)||(8055265-8055477)
chr6 (13-225)||(25535643-25535855)
chr6 (13-225)||(30676424-30676636)
chr6 (13-225)||(34963609-34963821)
chr6 (13-225)||(19847686-19847894)
chr6 (13-225)||(31630255-31630467)
chr6 (13-225)||(26924355-26924566)
chr6 (27-225)||(17377576-17377774)
chr6 (13-225)||(19858637-19858845)
chr6 (16-225)||(25688738-25688947)
chr6 (13-225)||(18914168-18914380)
chr6 (13-225)||(19005387-19005599)
chr6 (13-225)||(22782463-22782674)
chr6 (13-215)||(28289051-28289253)
chr6 (13-225)||(23992659-23992870)
chr6 (13-225)||(12942437-12942637)
chr6 (13-168)||(1879-2034)
chr6 (13-168)||(8838-8993)
chr6 (13-168)||(1598542-1598697)
chr6 (13-164)||(26924162-26924313)
chr6 (21-168)||(19005637-19005784)
chr6 (13-168)||(19847493-19847648)
chr6 (13-164)||(18914615-18914766)
chr6 (13-167)||(23415258-23415412)
chr6 (13-168)||(25688988-25689143)
chr6 (13-167)||(27557016-27557170)
chr6 (13-168)||(1598735-1598890)
chr6 (13-168)||(30676231-30676386)
chr6 (19-164)||(18914422-18914567)
chr6 (13-121)||(15892123-15892231)
chr6 (13-168)||(87-242)
chr6 (13-168)||(31630062-31630217)
chr6 (36-168)||(25689181-25689313)
chr6 (13-106)||(17883212-17883305)
chr6 (49-168)||(25737128-25737247)
chr6 (125-198)||(15875664-15875737)
chr6 (78-168)||(22981326-22981416)
chr6 (78-168)||(23806992-23807082)
chr6 (13-75)||(25737028-25737090)
chr6 (13-67)||(9031-9085)
chr6 (176-225)||(31630524-31630573)
chr6 (38-148)||(16240296-16240406)
chr6 (38-148)||(16556944-16557054)
chr6 (38-148)||(16633500-16633610)
chr6 (38-148)||(16650174-16650284)
chr6 (50-168)||(18334151-18334269)
chr6 (50-148)||(19984130-19984228)
chr6 (50-168)||(24423032-24423150)
chr6 (176-225)||(19005282-19005330)
chr6 (38-148)||(25904474-25904585)
chr6 (38-148)||(10487971-10488081)
chr6 (38-148)||(16377247-16377357)
chr6 (38-148)||(16384571-16384681)
chr6 (38-128)||(27654596-27654686)
chr6 (130-168)||(33864763-33864801)
chr6 (50-148)||(35016015-35016113)
chr6 (176-225)||(15875542-15875590)
chr6 (176-225)||(18914063-18914111)
chr6 (13-45)||(22981454-22981486)
chr6 (13-45)||(23806922-23806954)
chr6 (50-148)||(22226580-22226679)
chr6 (138-168)||(2290827-2290857)
chr6 (38-120)||(18455448-18455530)
chr6 (176-210)||(18928118-18928152)
chr6 (50-128)||(21776107-21776185)
chr6 (38-148)||(22593581-22593691)
chr6 (130-168)||(22782712-22782750)
chr6 (176-222)||(25920948-25920994)
chr6 (130-168)||(26924086-26924124)
chr6 (177-210)||(10445380-10445413)
chr6 (177-210)||(13284938-13284971)
chr6 (177-210)||(20411319-20411352)
chr6 (177-210)||(20411382-20411415)
chr6 (177-210)||(29044492-29044525)
chr6 (177-210)||(32259103-32259136)
chr6 (177-210)||(35056632-35056665)
chr6 (177-210)||(35056695-35056728)
chr6 (177-210)||(35056748-35056781)
chr6 (50-94)||(10905416-10905460)
chr6 (38-146)||(19609582-19609690)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (13-225)||(15118067-15118278)
chr4 (13-225)||(44615524-44615736)
chr4 (13-225)||(50222054-50222265)
chr4 (13-225)||(29267589-29267801)
chr4 (13-225)||(52872787-52872999)
chr4 (13-211)||(11969-12167)
chr4 (13-226)||(7640901-7641113)
chr4 (13-225)||(14970421-14970633)
chr4 (13-211)||(52312812-52313009)
chr4 (13-198)||(1837234-1837419)
chr4 (13-225)||(15534417-15534629)
chr4 (13-225)||(44772798-44773009)
chr4 (13-225)||(362416-362628)
chr4 (13-225)||(3515243-3515455)
chr4 (13-219)||(14746226-14746432)
chr4 (13-225)||(15495888-15496100)
chr4 (13-225)||(19617781-19617993)
chr4 (13-225)||(36038106-36038318)
chr4 (13-225)||(49547488-49547700)
chr4 (13-198)||(19857841-19858026)
chr4 (15-225)||(19242936-19243146)
chr4 (13-225)||(14048813-14049025)
chr4 (13-166)||(362668-362821)
chr4 (13-168)||(52872594-52872749)
chr4 (13-168)||(18214725-18214880)
chr4 (13-168)||(3515493-3515648)
chr4 (13-168)||(14746033-14746188)
chr4 (13-168)||(14970228-14970383)
chr4 (13-168)||(19858064-19858219)
chr4 (13-168)||(19617588-19617743)
chr4 (13-168)||(52313240-52313395)
chr4 (21-168)||(362859-363006)
chr4 (13-168)||(52313047-52313202)
chr4 (34-168)||(15495716-15495850)
chr4 (122-225)||(18214992-18215095)
chr4 (58-168)||(14185621-14185731)
chr4 (13-187)||(30147189-30147363)
chr4 (130-225)||(18239251-18239345)
chr4 (148-225)||(15355068-15355145)
chr4 (50-168)||(22725284-22725401)
chr4 (13-75)||(12778397-12778459)
chr4 (16-71)||(14185525-14185580)
chr4 (13-60)||(18214918-18214965)
chr4 (38-148)||(14951270-14951380)
chr4 (176-225)||(19857718-19857767)
chr4 (98-164)||(14745925-14745991)
chr4 (50-146)||(55377197-55377293)
chr4 (13-68)||(22725439-22725494)
chr4 (38-148)||(14995644-14995754)
chr4 (50-168)||(15117911-15118029)
chr4 (50-148)||(25120046-25120144)
chr4 (176-225)||(12185-12233)
chr4 (176-225)||(15355202-15355250)
chr4 (176-225)||(18215152-18215200)
chr4 (47-148)||(43281694-43281795)
chr4 (176-225)||(52312746-52312794)
chr4 (20-60)||(15489677-15489717)
chr4 (38-136)||(16731688-16731786)
chr4 (38-128)||(18247759-18247849)
chr4 (38-128)||(47357203-47357293)
chr4 (131-168)||(44772723-44772760)
chr4 (38-146)||(15287858-15287966)
chr4 (38-146)||(15294968-15295076)
chr4 (50-168)||(7640745-7640863)
chr4 (38-120)||(630279-630361)
chr4 (50-148)||(5683367-5683465)
chr4 (176-210)||(9923591-9923625)
chr4 (38-128)||(10643766-10643856)
chr4 (38-120)||(13046021-13046103)
chr4 (176-210)||(14746495-14746529)
chr4 (50-128)||(22355071-22355149)
chr4 (176-210)||(25513032-25513066)
chr4 (177-210)||(10272793-10272826)
chr4 (177-210)||(12622677-12622710)
chr4 (177-210)||(13164411-13164444)
chr4 (177-210)||(13164523-13164556)
chr4 (177-210)||(14508055-14508088)
chr4 (177-210)||(15041855-15041888)
chr4 (177-210)||(15112536-15112569)
chr4 (176-225)||(15496949-15496997)
chr4 (51-88)||(18218875-18218912)
chr4 (176-225)||(19618050-19618098)
chr4 (177-210)||(25512939-25512972)
chr4 (177-210)||(26445174-26445207)
chr4 (177-210)||(26922468-26922501)
chr4 (177-210)||(40229671-40229704)
chr4 (177-210)||(46740441-46740474)
chr4 (177-210)||(46740567-46740600)
chr4 (176-225)||(52873056-52873104)
chr4 (177-210)||(55582553-55582586)
chr4 (178-210)||(35660202-35660234)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (13-225)||(17463414-17463625)
chr3 (13-225)||(34159562-34159773)
chr3 (16-225)||(55476727-55476935)
chr3 (13-225)||(15977769-15977980)
chr3 (13-225)||(16453995-16454207)
chr3 (13-225)||(6468849-6469060)
chr3 (13-225)||(45606621-45606833)
chr3 (16-225)||(12119371-12119580)
chr3 (13-198)||(28848336-28848521)
chr3 (13-225)||(46822497-46822709)
chr3 (8-211)||(41124189-41124392)
chr3 (13-225)||(7781061-7781273)
chr3 (13-225)||(13153970-13154181)
chr3 (13-225)||(13544261-13544471)
chr3 (13-211)||(38961552-38961751)
chr3 (16-225)||(53301221-53301430)
chr3 (13-225)||(10247438-10247649)
chr3 (13-225)||(12567796-12568007)
chr3 (13-211)||(16282472-16282670)
chr3 (13-225)||(13151505-13151716)
chr3 (13-225)||(13436535-13436747)
chr3 (13-225)||(27165488-27165700)
chr3 (13-225)||(54521058-54521270)
chr3 (13-211)||(17444478-17444676)
chr3 (13-211)||(25237093-25237291)
chr3 (13-225)||(8499756-8499968)
chr3 (13-225)||(15412667-15412879)
chr3 (13-225)||(10557144-10557356)
chr3 (13-225)||(24513912-24514124)
chr3 (13-211)||(25229506-25229704)
chr3 (13-185)||(20629906-20630078)
chr3 (13-213)||(29544556-29544756)
chr3 (13-167)||(15465448-15465602)
chr3 (16-168)||(27165738-27165890)
chr3 (16-175)||(10379613-10379772)
chr3 (13-168)||(41124425-41124580)
chr3 (13-168)||(55319018-55319173)
chr3 (21-168)||(10557394-10557541)
chr3 (13-167)||(5223677-5223831)
chr3 (16-165)||(8500009-8500158)
chr3 (15-167)||(26054981-26055133)
chr3 (90-225)||(12305381-12305516)
chr3 (37-168)||(14567430-14567561)
chr3 (13-168)||(46822747-46822902)
chr3 (13-168)||(55318825-55318980)
chr3 (23-168)||(53301035-53301180)
chr3 (21-168)||(38961367-38961514)
chr3 (13-168)||(13937494-13937649)
chr3 (13-168)||(20629713-20629868)
chr3 (13-168)||(16282279-16282434)
chr3 (47-169)||(36528447-36528569)
chr3 (13-168)||(17444285-17444440)
chr3 (24-168)||(17393201-17393345)
chr3 (58-168)||(16358234-16358344)
chr3 (61-169)||(3264323-3264431)
chr3 (13-89)||(16358382-16358458)
chr3 (19-92)||(15007868-15007941)
chr3 (13-75)||(36528348-36528410)
chr3 (176-225)||(9707484-9707533)
chr3 (104-168)||(15007988-15008052)
chr3 (13-68)||(8899418-8899473)
chr3 (23-69)||(10555766-10555812)
chr3 (38-160)||(25058286-25058408)
chr3 (13-58)||(12305525-12305570)
chr3 (176-225)||(25237027-25237075)
chr3 (50-168)||(34159811-34159929)
chr3 (176-225)||(8899330-8899378)
chr3 (176-225)||(16282689-16282737)
chr3 (176-225)||(17444694-17444742)
chr3 (176-225)||(38961769-38961817)
chr3 (176-225)||(41124123-41124171)
chr3 (52-148)||(16934824-16934920)
chr3 (50-168)||(55476976-55477094)
chr3 (38-148)||(1468613-1468723)
chr3 (38-128)||(14528624-14528714)
chr3 (13-67)||(14567599-14567653)
chr3 (130-168)||(17463663-17463701)
chr3 (50-148)||(49231768-49231866)
chr3 (78-148)||(51158683-51158753)
chr3 (177-222)||(18700200-18700245)
chr3 (13-75)||(3264468-3264530)
chr3 (130-168)||(6468773-6468811)
chr3 (38-128)||(8276473-8276563)
chr3 (130-168)||(15412916-15412954)
chr3 (38-120)||(16979504-16979586)
chr3 (38-120)||(18889958-18890040)
chr3 (38-148)||(30152450-30152560)
chr3 (177-210)||(3528206-3528239)
chr3 (176-225)||(11913928-11913976)
chr3 (177-210)||(17207568-17207601)
chr3 (177-210)||(25201248-25201281)
chr3 (177-210)||(50351882-50351915)
chr3 (177-225)||(15025934-15025982)
chr3 (177-209)||(17207632-17207664)
chr3 (38-114)||(18893224-18893300)
chr3 (177-225)||(25201349-25201397)
chr3 (178-210)||(50351664-50351696)
chr3 (178-210)||(54330969-54331001)
[»] chr2 (109 HSPs)
chr2 (13-225)||(18809179-18809390)
chr2 (13-225)||(23711728-23711939)
chr2 (13-226)||(26505614-26505826)
chr2 (13-226)||(26508092-26508304)
chr2 (13-225)||(39682549-39682761)
chr2 (13-225)||(28577335-28577546)
chr2 (13-225)||(45027619-45027830)
chr2 (13-211)||(24368076-24368274)
chr2 (13-198)||(23135842-23136027)
chr2 (13-225)||(23706931-23707143)
chr2 (13-225)||(24897910-24898121)
chr2 (13-225)||(24905347-24905558)
chr2 (13-211)||(21154722-21154920)
chr2 (16-225)||(571633-571842)
chr2 (13-225)||(20261455-20261667)
chr2 (13-225)||(24900393-24900604)
chr2 (13-225)||(24902870-24903081)
chr2 (13-225)||(24907822-24908033)
chr2 (13-211)||(22105715-22105913)
chr2 (19-225)||(23709253-23709458)
chr2 (13-211)||(41523787-41523985)
chr2 (13-225)||(24918376-24918588)
chr2 (13-225)||(23131098-23131310)
chr2 (13-225)||(23133565-23133777)
chr2 (17-225)||(24671261-24671469)
chr2 (13-225)||(34402236-34402448)
chr2 (13-211)||(6726297-6726495)
chr2 (15-225)||(24642465-24642675)
chr2 (13-225)||(24681680-24681892)
chr2 (13-225)||(10684477-10684689)
chr2 (13-225)||(24529261-24529473)
chr2 (13-225)||(38967715-38967927)
chr2 (13-210)||(32039213-32039410)
chr2 (13-198)||(32214645-32214830)
chr2 (61-225)||(25616417-25616581)
chr2 (16-168)||(41523597-41523749)
chr2 (13-168)||(22105951-22106106)
chr2 (13-146)||(23931775-23931908)
chr2 (13-168)||(21154529-21154684)
chr2 (13-168)||(24529068-24529223)
chr2 (13-168)||(24918626-24918781)
chr2 (24-168)||(6726533-6726677)
chr2 (13-168)||(23709054-23709209)
chr2 (13-164)||(41523401-41523552)
chr2 (13-166)||(32214451-32214604)
chr2 (13-168)||(21154336-21154491)
chr2 (13-168)||(24368312-24368467)
chr2 (13-168)||(24681930-24682085)
chr2 (13-165)||(23931949-23932101)
chr2 (13-168)||(23706547-23706702)
chr2 (13-163)||(23706739-23706889)
chr2 (13-168)||(24671511-24671666)
chr2 (20-166)||(45027433-45027579)
chr2 (13-70)||(31345570-31345627)
chr2 (103-167)||(31345490-31345554)
chr2 (176-225)||(38967610-38967658)
chr2 (50-168)||(18809428-18809546)
chr2 (176-226)||(24368009-24368058)
chr2 (38-148)||(24686597-24686707)
chr2 (47-148)||(67339-67440)
chr2 (176-225)||(6726231-6726279)
chr2 (79-160)||(16900803-16900884)
chr2 (79-160)||(16994194-16994275)
chr2 (116-168)||(24642373-24642425)
chr2 (38-148)||(11232212-11232322)
chr2 (38-128)||(19887274-19887364)
chr2 (38-148)||(22514059-22514169)
chr2 (130-168)||(23131347-23131385)
chr2 (130-168)||(23711652-23711690)
chr2 (130-168)||(26505864-26505902)
chr2 (130-168)||(26508342-26508380)
chr2 (38-148)||(27261332-27261442)
chr2 (130-168)||(27920403-27920441)
chr2 (50-168)||(28577584-28577702)
chr2 (38-148)||(28776661-28776771)
chr2 (130-168)||(32039137-32039175)
chr2 (130-168)||(34402161-34402199)
chr2 (180-225)||(21154942-21154986)
chr2 (176-225)||(22105649-22105697)
chr2 (176-225)||(23707200-23707248)
chr2 (176-225)||(24642732-24642780)
chr2 (176-225)||(24681575-24681623)
chr2 (79-148)||(34823750-34823819)
chr2 (52-148)||(12727711-12727807)
chr2 (177-225)||(22686062-22686110)
chr2 (176-219)||(41524003-41524045)
chr2 (138-168)||(571883-571913)
chr2 (38-120)||(6483113-6483195)
chr2 (38-120)||(21081347-21081429)
chr2 (130-168)||(23133814-23133852)
chr2 (179-225)||(24671156-24671201)
chr2 (177-235)||(36736894-36736952)
chr2 (138-168)||(39682799-39682829)
chr2 (177-210)||(1384411-1384444)
chr2 (177-210)||(20915476-20915509)
chr2 (177-210)||(21316436-21316469)
chr2 (177-210)||(21336329-21336362)
chr2 (177-210)||(21368353-21368386)
chr2 (177-210)||(21368406-21368439)
chr2 (177-210)||(22690052-22690085)
chr2 (177-210)||(22694648-22694681)
chr2 (177-210)||(23799498-23799531)
chr2 (176-225)||(24918271-24918319)
chr2 (177-210)||(25587416-25587449)
chr2 (177-210)||(28345851-28345884)
chr2 (178-210)||(1384349-1384381)
chr2 (132-168)||(23708980-23709016)
chr2 (50-110)||(34135059-34135119)
chr2 (50-94)||(44584588-44584632)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (13-225)||(94647-94858)
scaffold0023 (13-225)||(17154-17366)
scaffold0023 (13-168)||(16961-17116)
scaffold0023 (50-168)||(94896-95014)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (13-222)||(10732655-10732863)
chr5 (13-225)||(17516878-17517090)
chr5 (13-225)||(20909248-20909459)
chr5 (13-225)||(264483-264694)
chr5 (13-225)||(42245080-42245291)
chr5 (13-223)||(2154346-2154556)
chr5 (13-225)||(39245372-39245583)
chr5 (13-211)||(20917561-20917759)
chr5 (13-225)||(20901635-20901847)
chr5 (13-211)||(32027695-32027893)
chr5 (13-225)||(29346216-29346427)
chr5 (13-225)||(29348689-29348900)
chr5 (13-225)||(29351162-29351373)
chr5 (16-211)||(29330233-29330427)
chr5 (16-225)||(38619672-38619881)
chr5 (13-225)||(37804617-37804829)
chr5 (16-225)||(23064749-23064958)
chr5 (13-225)||(39363620-39363832)
chr5 (38-225)||(9776594-9776781)
chr5 (13-168)||(17516492-17516647)
chr5 (13-168)||(20901442-20901597)
chr5 (13-168)||(295989-296144)
chr5 (13-168)||(17516685-17516840)
chr5 (13-168)||(32028318-32028473)
chr5 (13-168)||(32028124-32028280)
chr5 (13-168)||(2154153-2154308)
chr5 (13-168)||(29330468-29330623)
chr5 (13-168)||(295796-295951)
chr5 (13-168)||(32028511-32028666)
chr5 (13-168)||(20917368-20917523)
chr5 (13-168)||(32027931-32028086)
chr5 (176-225)||(20901904-20901953)
chr5 (38-148)||(22883903-22884013)
chr5 (50-148)||(27183180-27183278)
chr5 (50-168)||(264327-264445)
chr5 (38-136)||(43444008-43444106)
chr5 (176-225)||(29330167-29330215)
chr5 (176-225)||(32027629-32027677)
chr5 (176-211)||(20917777-20917812)
chr5 (38-128)||(11923-12013)
chr5 (130-168)||(20909497-20909535)
chr5 (176-222)||(20917830-20917875)
chr5 (38-148)||(21933242-21933352)
chr5 (38-148)||(21939412-21939522)
chr5 (38-128)||(25426197-25426287)
chr5 (38-148)||(35581340-35581450)
chr5 (38-148)||(36990638-36990748)
chr5 (130-168)||(39245621-39245659)
chr5 (130-168)||(39363869-39363907)
chr5 (79-148)||(1220384-1220453)
chr5 (79-148)||(10778832-10778901)
chr5 (177-218)||(24067282-24067323)
chr5 (38-146)||(7424879-7424987)
chr5 (50-168)||(23064999-23065117)
chr5 (50-125)||(31478959-31479034)
chr5 (176-210)||(8833821-8833855)
chr5 (38-128)||(11342210-11342300)
chr5 (38-120)||(19511781-19511863)
chr5 (176-210)||(21503316-21503350)
chr5 (38-120)||(22367094-22367176)
chr5 (176-210)||(26761796-26761830)
chr5 (177-210)||(8833885-8833918)
chr5 (177-222)||(14026533-14026578)
chr5 (177-210)||(14026596-14026629)
chr5 (177-210)||(14026659-14026692)
chr5 (177-210)||(16062684-16062717)
chr5 (177-210)||(16062845-16062878)
chr5 (177-210)||(18743840-18743873)
chr5 (177-210)||(20198318-20198351)
chr5 (177-210)||(21399733-21399766)
chr5 (177-210)||(21399796-21399829)
chr5 (177-210)||(26749356-26749389)
chr5 (177-210)||(26749419-26749452)
chr5 (177-210)||(30611369-30611402)
chr5 (178-210)||(1628044-1628076)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (13-225)||(6183-6394)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (13-225)||(134447-134658)
scaffold0028 (13-225)||(136916-137127)
scaffold0028 (13-225)||(139385-139596)
scaffold0028 (13-225)||(141854-142065)
scaffold0028 (13-225)||(144323-144534)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (16-225)||(40636-40844)
scaffold0044 (38-160)||(37848-37969)
scaffold0044 (130-168)||(40885-40923)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (13-225)||(38057-38269)
scaffold0134 (50-168)||(38307-38425)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-225)||(20983-21193)
[»] scaffold0230 (5 HSPs)
scaffold0230 (13-225)||(14183-14395)
scaffold0230 (13-225)||(23245-23457)
scaffold0230 (13-168)||(22892-23047)
scaffold0230 (82-168)||(23121-23207)
scaffold0230 (13-52)||(20725-20764)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (13-225)||(13628-13840)
scaffold0444 (130-168)||(13878-13916)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (13-225)||(9478-9689)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (13-225)||(4930-5142)
scaffold0716 (13-168)||(5180-5335)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (13-225)||(238-450)
scaffold0494 (176-225)||(507-556)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-225)||(11525-11737)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (13-218)||(4017-4222)
scaffold0741 (13-168)||(3824-3979)
scaffold0741 (13-164)||(3631-3782)
scaffold0741 (116-168)||(3541-3593)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (13-198)||(6714-6899)
scaffold0574 (13-168)||(6937-7092)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (13-225)||(30255-30467)
scaffold0149 (13-168)||(30505-30660)
scaffold0149 (178-225)||(30149-30196)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (13-225)||(443-655)
scaffold1792 (13-168)||(853-1008)
scaffold1792 (82-168)||(693-779)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (13-225)||(3259-3471)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (13-225)||(10027-10239)
scaffold0043 (13-168)||(10277-10432)
scaffold0043 (14-168)||(10470-10624)
scaffold0043 (176-210)||(9936-9970)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (16-225)||(825-1034)
scaffold0747 (19-168)||(1075-1224)
scaffold0747 (24-136)||(1227-1338)
scaffold0747 (176-225)||(720-768)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (13-225)||(6650-6862)
scaffold0317 (21-168)||(6465-6612)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (13-201)||(42999-43187)
scaffold0040 (51-225)||(13379-13553)
scaffold0040 (13-168)||(43225-43380)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (13-204)||(7996-8187)
scaffold0278 (8-168)||(8225-8385)
scaffold0278 (17-165)||(8421-8569)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-195)||(68227-68409)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (13-210)||(11054-11251)
scaffold0306 (31-225)||(15158-15352)
scaffold0306 (21-168)||(10869-11016)
scaffold0306 (13-168)||(15398-15552)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (39-218)||(53612-53791)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (58-225)||(1664-1831)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (13-168)||(1740-1895)
scaffold1296 (13-75)||(1640-1702)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (13-167)||(31497-31651)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-179)||(501347-501512)
scaffold0001 (13-168)||(501550-501705)
scaffold0001 (50-106)||(139589-139645)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (78-225)||(57717-57864)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (23-225)||(38380-38582)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-168)||(18423-18578)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (13-167)||(17947-18101)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (13-168)||(8311-8466)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (17-167)||(7408-7558)
scaffold0711 (20-168)||(7219-7367)
scaffold0711 (78-166)||(7084-7172)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (13-167)||(33465-33619)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (91-225)||(11009-11142)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (13-167)||(39626-39780)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (13-167)||(19803-19957)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (112-211)||(28091-28190)
scaffold0114 (176-225)||(28025-28073)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (13-168)||(36913-37068)
scaffold0151 (42-168)||(36749-36875)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (164-225)||(10647-10708)
scaffold0513 (176-223)||(10765-10811)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (16-160)||(113317-113461)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (13-75)||(75619-75681)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (38-148)||(6195-6305)
scaffold0335 (176-210)||(1099-1133)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (38-148)||(8566-8676)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (38-148)||(30470-30580)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (20-75)||(405-460)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (38-148)||(725-835)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (152-198)||(15030-15076)
scaffold0106 (176-210)||(15150-15184)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (176-225)||(9967-10016)
scaffold0145 (178-222)||(10023-10067)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (38-148)||(1375-1485)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (50-148)||(6941-7039)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (78-148)||(12520-12590)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (50-148)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (50-148)||(40628-40726)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (38-148)||(38375-38485)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (38-148)||(110064-110174)
scaffold0035 (38-148)||(118565-118675)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (50-146)||(15780-15876)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (38-148)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (38-148)||(28469-28579)
scaffold0213 (178-210)||(18521-18553)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (50-136)||(53958-54044)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (50-148)||(19911-20009)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (78-148)||(39965-40035)
scaffold0034 (78-148)||(45448-45518)
scaffold0034 (78-148)||(79003-79073)
scaffold0034 (177-222)||(120190-120235)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (177-210)||(7319-7352)
scaffold0639 (177-210)||(7382-7415)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (177-210)||(2564-2597)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (177-210)||(688-721)
scaffold0462 (177-210)||(6194-6227)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (177-210)||(10000-10033)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (79-148)||(1296-1365)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (177-210)||(29847-29880)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (177-210)||(3151-3184)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (177-210)||(24654-24687)
scaffold0162 (177-210)||(24717-24750)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (177-210)||(7508-7541)
scaffold0108 (178-210)||(7445-7477)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (177-210)||(36287-36320)
scaffold0086 (177-209)||(36350-36382)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (177-210)||(62024-62057)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (177-210)||(46667-46700)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (177-210)||(142776-142809)
scaffold0020 (46-82)||(103716-103752)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (177-210)||(29395-29428)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (38-146)||(912-1020)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (178-210)||(16294-16326)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 107)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 5853007 - 5853218
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853007 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 5853106  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5853107 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 5853205  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  5853206 tgaatacgatatt 5853218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1484849 - 1484638
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1484750  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1484749 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 1484651  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  1484650 tgaatacgatatt 1484638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 14409159 - 14409370
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409159 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14409258  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14409259 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14409357  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14409358 tgaatacgatatt 14409370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24485758 - 24485970
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485758 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24485857  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24485858 aatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24485957  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24485958 tgaatacgatatt 24485970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 4542088 - 4542299
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4542088 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaa 4542187  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4542188 aatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 4542286  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  4542287 tgaatacgatatt 4542299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14824222 - 14824011
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824222 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14824123  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  14824122 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14824024  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    | |||||||||||    
T  14824023 taaatacgatatt 14824011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 20045913 - 20046122
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045913 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaag 20046012  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20046013 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtga 20046111  T
Q  216 atacgatattt 226  Q
    |||||||||||    
T  20046112 atacgatattt 20046122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Original strand, 15202895 - 15203091
Alignment:
Q  15 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202895 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 15202994  T
Q  115 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15202995 gaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttt 15203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22002200 - 22001989
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22002200 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 22002101  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22002100 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 22002002  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  22002001 tgaatacgatatt 22001989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 27472131 - 27472343
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27472131 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27472230  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472231 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27472330  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  27472331 tgaatacgatatt 27472343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 16413030 - 16413242
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16413030 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaa 16413129  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413130 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16413229  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  16413230 tgaatacgatatt 16413242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18677779 - 18677991
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18677779 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 18677878  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18677879 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttg 18677978  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  18677979 tgaatacgatatt 18677991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16198339 - 16198130
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16198339 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaa 16198240  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
     |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16198239 tatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 16198140  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  16198139 atacgatatt 16198130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32122172 - 32121964
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32122172 aaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatg 32122073  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32122072 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaa 32121973  T
Q  217 tacgatatt 225  Q
    |||||||||    
T  32121972 tacgatatt 32121964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20403727 - 20403529
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20403727 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaa 20403628  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403627 aaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20403529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24049055 - 24048847
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24049055 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaac 24048956  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24048955 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 24048857  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  24048856 atacgatatt 24048847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19896769 - 19896571
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  19896769 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaa 19896670  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19896669 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgttt 19896571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4483728 - 4483516
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4483728 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 4483629  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4483628 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 4483529  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  4483528 tgaatatgatatt 4483516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15071008 - 15070796
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15071008 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaa 15070909  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15070908 aatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15070809  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15070808 tgaatacgatatt 15070796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 16401639 - 16401851
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16401639 atgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 16401738  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16401739 aaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 16401838  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  16401839 tgaatactatatt 16401851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 38549719 - 38549931
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38549719 atgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38549818  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38549819 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38549918  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  38549919 tgaatacgatatt 38549931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 19936622 - 19936807
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  19936622 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaa 19936721  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19936722 aaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatg 19936807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 1326646 - 1326858
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1326646 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1326745  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1326746 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttg 1326845  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    | |||||||||||    
T  1326846 taaatacgatatt 1326858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658071
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaat 25658071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 211
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290554
Alignment:
Q  42 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  142 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgttt 45290554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19896962 - 19896807
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896962 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19896863  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896862 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 14397455 - 14397609
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14397455 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14397554  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397555 aatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 15202700 - 15202856
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15202700 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 15202799  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 169  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202800 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20403920 - 20403765
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20403920 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20403821  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403820 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32122369 - 32122214
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  32122369 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 32122270  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122269 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 27471938 - 27472093
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27471938 atgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 27472037  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472038 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 38549526 - 38549681
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38549526 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaa 38549625  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549626 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 16401254 - 16401408
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401254 atgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 16401352  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401353 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15071198 - 15071046
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  15071198 aaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaa 15071099  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071098 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 16412837 - 16412992
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  16412837 atgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 16412936  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412937 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 38549334 - 38549488
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38549334 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaa 38549433  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549434 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 45290262 - 45290385
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290262 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45290361  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttat 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  45290362 aaggatttatagaacttgagttat 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 15202507 - 15202662
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15202507 atgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaa 15202606  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202607 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 16401450 - 16401601
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  16401450 aaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatg 16401549  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401550 atttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19897155 - 19897000
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19897155 atgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 19897056  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897055 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24049243 - 24049104
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  24049243 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 24049144  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049143 ataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 19936429 - 19936584
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||| || | | ||    
T  19936429 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaa 19936528  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936529 aacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11361157 - 11361024
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11361157 atgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaa 11361058  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    || |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  11361057 aacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32810333 - 32810263
Alignment:
Q  24 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 94  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  32810333 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425385
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 13425385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982547
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 20982547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982653
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 20982653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550037
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 38550037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403463
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 20403463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810167
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 32810167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290620
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 45290620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 5852931 - 5852969
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852931 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425279
Alignment:
Q  187 aattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 13425279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 14409083 - 14409121
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409083 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 17150615 - 17150713
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  17150615 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttat 17150713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 20045834 - 20045872
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045834 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007195
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22007097 ggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326963
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 1326963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203157
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatatt 15203157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401956
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 16401956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896505
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatatt 19896505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936929
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 19936929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 168
Target Start/End: Original strand, 16401185 - 16401216
Alignment:
Q  137 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401185 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223394
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 223394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688165
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 688165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737017
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 737017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860912
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 860912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4483803 - 4483765
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483803 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14824298 - 14824260
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824298 gagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 22089372 - 22089482
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||| |||||||     
T  22089372 gaattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatg 22089471  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  22089472 atcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 44477100 - 44477018
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44477100 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 44480362 - 44480280
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44480362 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 6573743 - 6573776
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6573743 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6573776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 17438110 - 17438143
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17438110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17438143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 17979142 - 17979175
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979142 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17979175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 18819393 - 18819426
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18819393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18819426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 20517910 - 20517943
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20517910 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20517943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22207569 - 22207536
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22207569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22207536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 22258951 - 22258984
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22258951 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22356024 - 22355991
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22356024 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22355991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22473889 - 22473856
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22473889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22473952 - 22473919
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22473952 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23669874 - 23669841
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23669874 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23669841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23670000 - 23669967
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23670000 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23669967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23670063 - 23670030
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23670063 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23670030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 36405773 - 36405806
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36405773 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36405806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38988688 - 38988655
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38988688 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 38988655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988771
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 38988771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38988867 - 38988834
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38988867 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 38988834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39019785 - 39019752
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39019785 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 39019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019868
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 39019868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39019964 - 39019931
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39019964 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 39019931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 4381456 - 4381488
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4381456 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 4381488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Original strand, 8728313 - 8728389
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  8728313 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaa 8728389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 18817125 - 18817157
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18817125 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18817157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  54 taaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttga 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 109)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 14948837 - 14949048
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948837 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14948936  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14948937 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14949035  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14949036 tgaatacgatatt 14949048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15376428 - 15376639
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376428 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15376527  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15376528 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15376626  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15376627 tgaatacgatatt 15376639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 20384838 - 20385049
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384838 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20384937  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20384938 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 20385036  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  20385037 tgaatacgatatt 20385049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32125938 - 32125727
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32125938 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 32125839  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32125838 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 32125740  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  32125739 tgaatacgatatt 32125727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16410506 - 16410295
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410506 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16410407  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16410406 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttg 16410308  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  16410307 tgaatacgatatt 16410295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27217308 - 27217096
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217308 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 27217209  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27217208 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27217109  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  27217108 tgaatacgatatt 27217096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18628013 - 18627801
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628013 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18627914  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18627913 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttg 18627815  T
Q  213 tgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  18627814 tgaatacgatattt 18627801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 456769 - 456557
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456769 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 456670  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  456669 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 456570  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  456569 tgaatacgatatt 456557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16232968 - 16232756
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232968 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaa 16232869  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232868 aaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16232769  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  16232768 tgaatacgatatt 16232756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18640719 - 18640507
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640719 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaa 18640620  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18640619 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttg 18640521  T
Q  213 tgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  18640520 tgaatacgatattt 18640507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 21189310 - 21189521
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189310 atgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaa 21189409  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189410 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttg 21189508  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  21189509 tgaatacgatatt 21189521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41523365 - 41523153
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523365 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41523266  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41523265 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41523166  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  41523165 tgaatacgatatt 41523153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41525827 - 41525615
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525827 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41525728  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41525727 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41525628  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  41525627 tgaatacgatatt 41525615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 14269671 - 14269883
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14269671 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaa 14269770  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14269771 aaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14269870  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14269871 tgaatacgatatt 14269883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15081556 - 15081768
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081556 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15081655  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15081656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15081755  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  15081756 tgaatactatatt 15081768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18431159 - 18430948
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18431159 atgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaa 18431060  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18431059 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18430961  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  18430960 tgaatacgatatt 18430948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8940731 - 8940515
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940731 atgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 8940632  T
Q  109 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8940631 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8940532  T
Q  209 tttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8940531 tttgtgaatactatatt 8940515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355907
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26355699 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26355798  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26355799 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaa 26355897  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  26355898 atacgatatt 26355907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 26358151 - 26358359
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26358151 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26358250  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26358251 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaa 26358349  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  26358350 atacgatatt 26358359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13869796 - 13869584
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13869796 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13869697  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13869696 aaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13869597  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13869596 tgaatacgatatt 13869584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16214132 - 16213920
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214132 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16214033  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16214032 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16213933  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  16213932 tgaatacgatatt 16213920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11972996 - 11972798
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972996 atgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11972897  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11972896 aaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgttt 11972798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24702676 - 24702491
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702676 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24702577  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24702576 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg 24702491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24705123 - 24704938
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705123 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24705024  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24705023 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg 24704938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11303695 - 11303483
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303695 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11303596  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  11303595 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 11303496  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  11303495 tgaatacgatatt 11303483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8469183 - 8468971
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8469183 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaa 8469084  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  8469083 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttt 8468984  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  8468983 tgaatacgatatt 8468971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23664667 - 23664879
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664667 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23664766  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  23664767 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 23664866  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23664867 tgaatacgatatt 23664879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29797058 - 29796846
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29797058 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29796959  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  29796958 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29796859  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  29796858 tgaatacgatatt 29796846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29800877 - 29800665
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800877 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29800778  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  29800777 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29800678  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  29800677 tgaatacgatatt 29800665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393213
Alignment:
Q  53 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  153 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 11393213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 16108403 - 16108615
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108403 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaa 16108502  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  16108503 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 16108602  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  16108603 tgaatacaatatt 16108615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 45847380 - 45847581
Alignment:
Q  24 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45847380 tattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttata 45847479  T
Q  124 gaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgata 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45847480 gaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgata 45847579  T
Q  224 tt 225  Q
    ||    
T  45847580 tt 45847581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841304
Alignment:
Q  69 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  169 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 13841304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 14269285 - 14269440
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  14269285 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaa 14269384  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269385 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 38897749 - 38897904
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38897749 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 38897848  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897849 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 25926844 - 25926998
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  25926844 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 25926943  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926944 aaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 14156603 - 14156755
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156603 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 14156702  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156703 gatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8940923 - 8940769
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8940923 atgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 8940825  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940824 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 10501108 - 10501263
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10501108 atgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 10501207  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501208 atggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 14156793 - 14156944
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14156793 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14156888  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156889 aaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 1856947 - 1857097
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||     
T  1856947 aaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaac 1857045  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857046 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 13918117 - 13918272
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  13918117 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtca 13918216  T
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918217 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 14269478 - 14269633
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  14269478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaa 14269577  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269578 aaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16214317 - 16214170
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  16214317 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagattt 16214218  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214217 atagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8941117 - 8940962
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  8941117 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaa 8941018  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941017 aatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 10500945 - 10501064
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500945 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 10501044  T
Q  116 gatttatagaactagagtta 135  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  10501045 gatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 21189117 - 21189272
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  21189117 atgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaa 21189216  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189217 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 15081371 - 15081512
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  15081371 tggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgattt 15081470  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaca 162  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15081471 atagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 17985099 - 17985254
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||||||| | |||    
T  17985099 atgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaa 17985198  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985199 aatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  81 ttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898049
Alignment:
Q  171 ttgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 38898049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Original strand, 23461813 - 23461864
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 71  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461813 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847687
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 45847687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  51 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972732
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 11972732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 126075 - 125965
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||     
T  126075 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatg 125976  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  125975 atcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16410582 - 16410544
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410582 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18628089 - 18628051
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628089 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18640795 - 18640757
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640795 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110741
Alignment:
Q  39 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataa 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataa 20110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 26355620 - 26355658
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355620 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 26358072 - 26358110
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358072 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743852
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatttgatgatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgtatgatgt 9743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14269988
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 14269988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081873
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 15081873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898154
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 38898154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001074
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 10001074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 10896370 - 10896452
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  10896370 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11310202 - 11310133
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgtta 83  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11310202 atgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13869871 - 13869833
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869871 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20619609 - 20619575
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20619609 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20619575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Original strand, 23664499 - 23664569
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 108  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  23664499 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgact 23664569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27217384 - 27217346
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217384 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8473087 - 8473054
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8473087 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8473054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 8514393 - 8514426
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8514393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8514426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 8851889 - 8851922
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8851889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8851922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940410
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 8940410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 13745506 - 13745539
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13745506 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13745539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745602
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13745602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 14153622 - 14153655
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14153622 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14153655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 15119972 - 15120005
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15119972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15120005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 15576619 - 15576652
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15576619 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15576652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29004485 - 29004416
Alignment:
Q  51 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004485 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 33556906 - 33556939
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33556906 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 33556939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 33556968 - 33557001
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33556968 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 33557001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 36301549 - 36301582
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36301549 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36301582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37538531 - 37538498
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37538531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 37538498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37538685 - 37538652
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37538685 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 37538652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43747799 - 43747766
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43747799 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 43747766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 48213658 - 48213691
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48213658 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 48213691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 4691559 - 4691591
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4691559 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 4691591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 207
Target Start/End: Original strand, 14153671 - 14153703
Alignment:
Q  175 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14153671 atatgattgatgaattattatatgaatgtatat 14153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Original strand, 14188670 - 14188746
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  14188670 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa 14188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15167651 - 15167575
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15167651 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaa 15167575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 15576494 - 15576526
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15576494 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15576526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Original strand, 15576556 - 15576588
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15576556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 15576588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 15951607 - 15951691
Alignment:
Q  52 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15951607 tgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttat 15951691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 20253005 - 20253037
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20253005 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20253037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43747861 - 43747829
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43747861 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 43747829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923006 - 21923217
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923006 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21923105  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21923106 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 21923204  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  21923205 tgaatacgatatt 21923217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13989313 - 13989102
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989313 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13989214  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13989213 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 13989115  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13989114 tgaatacgatatt 13989102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 21474801 - 21475013
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474801 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21474900  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21474901 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 21475000  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  21475001 tgaatacgatatt 21475013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29298689 - 29298491
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298689 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 29298590  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298589 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29298491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31612813 - 31612615
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31612813 atgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaa 31612714  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612713 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 31612615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21841214 - 21841003
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841214 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21841115  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21841114 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 21841016  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  21841015 tgaatatgatatt 21841003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29777188 - 29776990
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29777188 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaa 29777089  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777088 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29776990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 22122729 - 22122927
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122729 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22122828  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122829 aacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 22122927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 27161301 - 27161506
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27161301 atgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27161400  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27161401 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttta 27161500  T
Q  213 tgaata 218  Q
    ||||||    
T  27161501 tgaata 27161506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 16274970 - 16275183
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaa-tgccgttggtttgacttca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||    
T  16274970 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttca 16275069  T
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16275070 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 16275169  T
Q  212 gtgaatacgatatt 225  Q
    |||||| |||||||    
T  16275170 gtgaattcgatatt 16275183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15859723 - 15859934
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15859723 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaa 15859822  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  15859823 aagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttg 15859921  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
     ||||||||||||    
T  15859922 cgaatacgatatt 15859934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16362366 - 16362154
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16362366 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaa 16362267  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16362266 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16362167  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    | |||||||||||    
T  16362166 ttaatacgatatt 16362154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13227311 - 13227129
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13227311 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13227212  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227211 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23593448 - 23593660
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23593448 atgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23593547  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23593548 aataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23593647  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23593648 tgaatacgatatt 23593660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 22050551 - 22050749
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||| | |  ||||    
T  22050551 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaa 22050650  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050651 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 22050749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29535499 - 29535317
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29535499 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaa 29535400  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 195  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535399 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31613005 - 31612851
Alignment:
Q  14 tgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31613005 tgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 31612906  T
Q  114 aggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612905 acgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 15859520 - 15859672
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  15859520 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaac 15859619  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859620 tatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29298882 - 29298727
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  29298882 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaa 29298783  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298782 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 9044722 - 9044867
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||     
T  9044722 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaac 9044821  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcac 161  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9044822 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29777378 - 29777226
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||     
T  29777378 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaac 29777279  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777278 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 22122535 - 22122691
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttca 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22122535 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttca 22122634  T
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122635 aaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31613191 - 31613044
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  31613191 tggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgattt 31613092  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613091 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 27161118 - 27161263
Alignment:
Q  23 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttat 122  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||    
T  27161118 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttat 27161217  T
Q  123 agaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161218 agaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40129524 - 40129387
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  40129524 tggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgattt 40129425  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggt 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129424 atagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 16274784 - 16274932
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 119  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||    
T  16274784 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatt 16274883  T
Q  120 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274884 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16401559 - 16401407
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| | || |  ||||    
T  16401559 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaag 16401460  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401459 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 43543349 - 43543269
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43543349 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  98 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 109
Target Start/End: Original strand, 10812723 - 10812816
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  10812723 aaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgactt 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275289
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatatt 16275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050815
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 22050815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776924
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 29776924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  52 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298438
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29298438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21858690 - 21858592
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21858690 ggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298372
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 29298372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612549
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatatt 31612549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 120
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060656
Alignment:
Q  41 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattt 18060656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1642892 - 1642854
Alignment:
Q  180 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1642892 attgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 1642854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Original strand, 21474733 - 21474763
Alignment:
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474733 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7321576 - 7321609
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7321576 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7321609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7321639 - 7321672
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7321639 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7321672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710178
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 12710178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18120868 - 18120835
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18120868 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18120835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22122993
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatatt 22122993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 24720419 - 24720452
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24720419 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24720452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 54
Target Start/End: Original strand, 43630311 - 43630344
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43630311 tggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44891787 - 44891754
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44891787 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 44891754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50544178 - 50544145
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50544178 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50544145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6833603 - 6833571
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6833603 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6833571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 21244669 - 21244717
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21244669 atgattgataaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 21244717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161565
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 27161565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50544240 - 50544208
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50544240 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50544208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 2290895 - 2291106
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290895 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2290994  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2290995 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 2291093  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  2291094 tgaatacgatatt 2291106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18334307 - 18334518
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334307 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18334406  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18334407 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18334505  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  18334506 tgaatacgatatt 18334518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24422994 - 24422783
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422994 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24422895  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24422894 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24422796  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24422795 tgaatacgatatt 24422783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33862241 - 33862030
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862241 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33862142  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33862141 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 33862043  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  33862042 tgaatacgatatt 33862030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33864725 - 33864514
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864725 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33864626  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33864625 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 33864527  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  33864526 tgaatacgatatt 33864514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 1540630 - 1540837
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540630 aaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 1540729  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1540730 atttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaa 1540828  T
Q  217 tacgatatt 225  Q
    |||||||||    
T  1540829 tacgatatt 1540837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12742765 - 12742557
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742765 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12742666  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12742665 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 12742566  T
Q  213 tgaatacga 221  Q
    |||||||||    
T  12742565 tgaatacga 12742557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1598504 - 1598293
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598504 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1598405  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1598404 aaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 1598306  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  1598305 tgaatacgatatt 1598293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8055477 - 8055265
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8055477 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 8055378  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8055377 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8055278  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  8055277 tgaatacgatatt 8055265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25535855 - 25535643
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25535855 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 25535756  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25535755 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 25535656  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  25535655 tgaatacgatatt 25535643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 30676424 - 30676636
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676424 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 30676523  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676524 aataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30676623  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  30676624 tgaatacgatatt 30676636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34963821 - 34963609
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 34963722  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34963721 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 34963622  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  34963621 tgaatacgatatt 34963609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 19847686 - 19847894
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19847686 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat----gctagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 19847781  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19847782 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19847881  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  19847882 tgaatacgatatt 19847894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 31630255 - 31630467
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31630255 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 31630354  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31630355 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 31630454  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  31630455 tgaatacgatatt 31630467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 26924355 - 26924566
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924355 atgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26924454  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26924455 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 26924553  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  26924554 tgaatacgatatt 26924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377774
Alignment:
Q  27 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  127 ctagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 17377774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 19858637 - 19858845
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858637 atgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19858733  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19858734 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctg 19858832  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  19858833 tgaatacgatatt 19858845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25688947 - 25688738
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25688947 aaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaag 25688848  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25688847 gatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtga 25688748  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  25688747 atacgatatt 25688738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18914380 - 18914168
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18914380 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaa 18914281  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18914280 aaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 18914181  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    | |||||||||||    
T  18914180 taaatacgatatt 18914168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19005599 - 19005387
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005599 atgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 19005500  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19005499 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttg 19005400  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||| |||||||    
T  19005399 tgaatgcgatatt 19005387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22782674 - 22782463
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782674 atgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22782575  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22782574 aagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 22782476  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  22782475 tgaatatgatatt 22782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 28289051 - 28289253
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28289051 atgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 28289150  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  28289151 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 28289250  T
Q  213 tga 215  Q
    |||    
T  28289251 tga 28289253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23992870 - 23992659
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  23992870 atgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaa 23992771  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23992770 aacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 23992672  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23992671 tgaatacgatatt 23992659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12942637 - 12942437
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12942637 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12942550  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  12942549 aaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 12942450  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  12942449 tgaatacgatatt 12942437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 1879 - 2034
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1978  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1979 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 8838 - 8993
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  8838 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 8937  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8938 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1598697 - 1598542
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1598697 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 1598598  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598597 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 26924162 - 26924313
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26924162 atgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 26924261  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924262 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19005784 - 19005637
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19005784 tggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgattt 19005685  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005684 atagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 19847493 - 19847648
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||| ||||    
T  19847493 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaa 19847592  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847593 aacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18914766 - 18914615
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18914766 atgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaa 18914667  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914666 aaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23415412 - 23415258
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23415412 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaa 23415313  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415312 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25689143 - 25688988
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  25689143 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaa 25689044  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689043 aaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27557170 - 27557016
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  27557170 atgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaa 27557071  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557070 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1598890 - 1598735
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  1598890 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaa 1598791  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598790 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 30676231 - 30676386
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||    
T  30676231 atgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaa 30676330  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676331 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18914567 - 18914422
Alignment:
Q  19 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||    
T  18914567 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgat 18914468  T
Q  119 ttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914467 tgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 15892123 - 15892231
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892123 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15892222  T
Q  113 aaggattta 121  Q
    |||||||||    
T  15892223 aaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 87 - 242
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  87 atgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 186  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  187 aacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 31630062 - 31630217
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31630062 atgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 31630161  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630162 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25689313 - 25689181
Alignment:
Q  36 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagtta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  25689313 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 25689214  T
Q  136 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689213 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 17883212 - 17883305
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17883212 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  49 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  149 gcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875664
Alignment:
Q  125 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 15875664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25737090 - 25737028
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737090 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 9031 - 9085
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9031 atgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630573
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 31630573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||     
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||| |||||||     
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005282
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 19005282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaactagagttat 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||| |||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  137 agtcaaattact 148  Q
      ||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654686
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 27654686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33864801 - 33864763
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864801 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 35016015 - 35016113
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  35016015 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875542
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 15875542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914063
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatatt 18914063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Original strand, 22981454 - 22981486
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981454 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 23806954 - 23806922
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23806954 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 22226580 - 22226679
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22226580 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Original strand, 2290827 - 2290857
Alignment:
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290827 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 18455448 - 18455530
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||    
T  18455448 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18928152 - 18928118
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18928152 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18928118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776185
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaact 21776185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 22593581 - 22593691
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||     
T  22593581 gaattgggtttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatg 22593680  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  22593681 atcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22782750 - 22782712
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782750 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25920994 - 25920948
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  25920994 tatgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatacgat 25920948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 26924086 - 26924124
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924086 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10445413 - 10445380
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10445413 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10445380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13284971 - 13284938
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13284971 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13284938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 20411319 - 20411352
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20411319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20411352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 20411382 - 20411415
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20411382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20411415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29044525 - 29044492
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29044525 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29044492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259103
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 32259103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35056665 - 35056632
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35056665 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35056632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35056728 - 35056695
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35056728 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35056695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056748
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35056748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 94  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| |||     
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  138 gtcaaatta 146  Q
     ||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15118067 - 15118278
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118067 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15118166  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15118167 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15118265  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15118266 tgaatacgatatt 15118278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44615736 - 44615524
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615736 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 44615637  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615636 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 44615537  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  44615536 tgaatacgatatt 44615524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 50222054 - 50222265
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222054 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 50222153  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50222154 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 50222252  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  50222253 tgaatacgatatt 50222265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29267801 - 29267589
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29267801 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 29267702  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29267701 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 29267602  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
     ||||||||||||    
T  29267601 cgaatacgatatt 29267589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 52872787 - 52872999
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872787 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 52872886  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52872887 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 52872986  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  52872987 tgaatacgatatt 52872999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 11969 - 12167
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11969 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12068  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12069 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 7640901 - 7641113
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7640901 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaa 7641000  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7641001 aaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttg 7641099  T
Q  213 tgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  7641100 tgaatacgatattt 7641113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 14970421 - 14970633
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970421 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14970520  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14970521 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 14970620  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14970621 tgaatacgatatt 14970633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52313009 - 52312812
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52313009 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaa 52312910  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312909 aaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 52312812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 1837234 - 1837419
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1837234 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaa 1837333  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837334 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 1837419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15534629 - 15534417
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534629 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15534530  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  15534529 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 15534430  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15534429 tgaatacgatatt 15534417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 44772798 - 44773009
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44772798 atgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 44772897  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44772898 aaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttg 44772996  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  44772997 tgaatacgatatt 44773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 362628 - 362416
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  362628 atgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaa 362529  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  362528 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 362429  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  362428 tgaatacgatatt 362416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3515455 - 3515243
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515455 atgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3515356  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  3515355 aatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttg 3515256  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  3515255 tgaatacgatatt 3515243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 14746226 - 14746432
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14746226 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaa 14746325  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14746326 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttg 14746425  T
Q  213 tgaatac 219  Q
    |||||||    
T  14746426 tgaatac 14746432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 15495888 - 15496100
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15495888 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcga 15495987  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15495988 aaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttc 15496087  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15496088 tgaatacgatatt 15496100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 19617781 - 19617993
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19617781 atgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaa 19617880  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19617881 aaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19617980  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  19617981 tgaatactatatt 19617993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36038318 - 36038106
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36038318 atgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 36038219  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  36038218 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttg 36038119  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  36038118 tgaatacgatatt 36038106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 49547488 - 49547700
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547488 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 49547587  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  49547588 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 49547687  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  49547688 tgaatacgatatt 49547700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19858026 - 19857841
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858026 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19857927  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    ||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857926 aataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 19857841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19243146 - 19242936
Alignment:
Q  15 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19243146 gaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaa 19243047  T
Q  115 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtg 214  Q
     ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19243046 cgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 19242947  T
Q  215 aatacgatatt 225  Q
    |||||||||||    
T  19242946 aatacgatatt 19242936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14049025 - 14048813
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049025 atgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14048926  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14048925 aaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttg 14048826  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14048825 tgaatacgatatt 14048813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 362821 - 362668
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  362821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaa 362722  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 166  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362721 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 52872594 - 52872749
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  52872594 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaa 52872693  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872694 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 18214725 - 18214880
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18214725 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 18214824  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214825 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3515648 - 3515493
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  3515648 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaa 3515549  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515548 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 14746033 - 14746188
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14746033 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 14746132  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746133 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 14970228 - 14970383
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14970228 atgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 14970327  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970328 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19858219 - 19858064
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19858219 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 19858120  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858119 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 19617588 - 19617743
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||    
T  19617588 atgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaa 19617687  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617688 aatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52313395 - 52313240
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52313395 atgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 52313296  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313295 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 363006 - 362859
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  363006 tggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagattt 362907  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362906 atagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52313202 - 52313047
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  52313202 atgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaa 52313103  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313102 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  34 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  134 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215095
Alignment:
Q  122 tagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacga 221  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  222 tatt 225  Q
    ||||    
T  18215092 tatt 18215095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  58 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 157  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  158 tcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30147363 - 30147189
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || | |  ||   |||| | ||||| ||||  |||    
T  30147363 atgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaa 30147264  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 187  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147263 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Original strand, 18239251 - 18239345
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18239251 gagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18239345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355145
Alignment:
Q  148 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatatt 15355145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 12778397 - 12778459
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778397 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14185580 - 14185525
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14185580 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtag 14185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 18214918 - 18214965
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214918 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14951380 - 14951270
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  14951380 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 14951281  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  14951280 atcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857718
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 19857718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  98 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Original strand, 22725439 - 22725494
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 68  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22725439 atgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12233
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 12233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355250
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 15355250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215200
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18215200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  47 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  147 ct 148  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312746
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 52312746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 15489677 - 15489717
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 60  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15489677 ctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731688
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247759
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 18247759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357203
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaact 47357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 168
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  131 agttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||     
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  138 gtcaaatta 146  Q
     ||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||     
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  138 gtcaaatta 146  Q
     ||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 7640745 - 7640863
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| || ||||||||    
T  7640745 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggttaaattact 7640843  T
Q  149 gcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7640844 gcacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 630279 - 630361
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  630279 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9923625 - 9923591
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9923625 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 9923591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643766
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaact 10643766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 13046021 - 13046103
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13046021 gaattggctttaggtgtaaacatgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgattt 13046103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746529
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 14746529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355149
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 22355149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25513066 - 25513032
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25513066 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25513032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10272826 - 10272793
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10272826 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10272793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12622710 - 12622677
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12622710 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 12622677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13164444 - 13164411
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13164444 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13164411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13164556 - 13164523
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13164556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13164523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14508088 - 14508055
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14508088 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14508055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 15041855 - 15041888
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15041855 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15041888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15112569 - 15112536
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15112569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15112536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15496997
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatatt 15496997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 88
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218912
Alignment:
Q  51 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagcttt 88  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618098
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 19618098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25512972 - 25512939
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25512972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26445207 - 26445174
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26445207 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26445174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 26922468 - 26922501
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26922468 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26922501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40229704 - 40229671
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40229704 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 40229671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46740474 - 46740441
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740474 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46740441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46740600 - 46740567
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740600 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46740567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873104
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 52873104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 55582586 - 55582553
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55582586 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 55582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35660234 - 35660202
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35660234 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35660202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17463625 - 17463414
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463625 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17463526  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17463525 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 17463427  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  17463426 tgaatacgatatt 17463414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34159773 - 34159562
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159773 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 34159674  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34159673 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 34159575  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  34159574 tgaatacgatatt 34159562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55476935 - 55476727
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476935 aaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 55476836  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55476835 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtga 55476737  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  55476736 atacgatatt 55476727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15977980 - 15977769
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977980 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15977881  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977880 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15977782  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15977781 tgaatacgatatt 15977769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 16453995 - 16454207
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453995 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16454094  T
Q  113 aa-ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16454095 aatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-tt 16454193  T
Q  212 gtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||    
T  16454194 gtgaatacgatatt 16454207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 6468849 - 6469060
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6468948  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6468949 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 6469047  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  6469048 tgaatacgatatt 6469060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 45606621 - 45606833
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606621 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45606720  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45606721 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 45606820  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  45606821 tgaatacgatatt 45606833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 12119371 - 12119580
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119371 aaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 12119470  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12119471 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 12119570  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  12119571 atacgatatt 12119580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 28848336 - 28848521
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848336 atgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28848435  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848436 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 28848521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46822709 - 46822497
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822709 atgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 46822610  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46822609 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 46822510  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  46822509 tgaatacgatatt 46822497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41124392 - 41124189
Alignment:
Q  8 gtgagatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgac 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41124392 gtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgac 41124293  T
Q  108 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124292 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatat 41124193  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  41124192 gttt 41124189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 7781061 - 7781273
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781061 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 7781160  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7781161 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 7781260  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  7781261 tgaatacgatatt 7781273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 13153970 - 13154181
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13153970 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13154069  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13154070 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 13154168  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13154169 tgaatacgatatt 13154181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13544471 - 13544261
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544471 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13544372  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13544371 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 13544274  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13544273 tgaatacgatatt 13544261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 38961552 - 38961751
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg-ccgttggtttgacttca 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38961552 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttca 38961651  T
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961652 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 38961751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 53301221 - 53301430
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301221 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 53301320  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53301321 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 53301420  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  53301421 atacgatatt 53301430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 10247438 - 10247649
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247438 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10247537  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  10247538 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 10247636  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  10247637 tgaatacgatatt 10247649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12568007 - 12567796
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12568007 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12567908  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12567907 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 12567809  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  12567808 tgaatacgatatt 12567796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 16282472 - 16282670
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16282472 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaa 16282571  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282572 aaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 16282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 13151505 - 13151716
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13151505 atgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13151604  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13151605 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttg 13151703  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13151704 tgaatacgatatt 13151716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13436747 - 13436535
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436747 atgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13436648  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13436647 aaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttg 13436548  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13436547 tgaatacgatatt 13436535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27165700 - 27165488
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27165700 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 27165601  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27165600 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27165501  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  27165500 tgaatacgatatt 27165488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54521270 - 54521058
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521270 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 54521171  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  54521170 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 54521071  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  54521070 tgaatacgatatt 54521058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 17444478 - 17444676
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17444478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 17444577  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444578 aaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 17444676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25237291 - 25237093
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  25237291 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25237192  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237191 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 25237093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8499968 - 8499756
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499968 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 8499869  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8499868 aaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8499769  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  8499768 tgaatacgatatt 8499756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15412879 - 15412667
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15412879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 15412780  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15412779 aaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15412680  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  15412679 tgaatacgatatt 15412667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10557356 - 10557144
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10557356 atgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaa 10557257  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10557256 aaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 10557157  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||| |||||||    
T  10557156 tgaattcgatatt 10557144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24514124 - 24513912
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24514124 atgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 24514025  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24514024 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24513925  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  24513924 tgaatactatatt 24513912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25229704 - 25229506
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  25229704 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25229605  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229604 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 25229506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 20629906 - 20630078
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629906 atgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20630005  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630006 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 29544556 - 29544756
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29544556 atgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaa 29544655  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  29544656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttg 29544755  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  29544756 t 29544756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15465602 - 15465448
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15465602 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 15465503  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465502 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27165890 - 27165738
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  27165890 aaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 27165791  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165790 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10379772 - 10379613
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  10379772 aaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaac 10379673  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 175  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379672 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41124580 - 41124425
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41124580 atgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41124481  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124480 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 55319018 - 55319173
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55319018 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 55319117  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319118 aacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10557541 - 10557394
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  10557541 tggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgattt 10557442  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557441 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5223831 - 5223677
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  5223831 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 5223732  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223731 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8500158 - 8500009
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  8500158 aaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 8500059  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500058 gatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 26054981 - 26055133
Alignment:
Q  15 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  26054981 gaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaa 26055080  T
Q  115 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
     ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055081 cgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305381
Alignment:
Q  90 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  190 tagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 12305381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  37 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  137 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46822902 - 46822747
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  46822902 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 46822803  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822802 aacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 55318825 - 55318980
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55318825 atgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 55318924  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318925 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 53301035 - 53301180
Alignment:
Q  23 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttat 122  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  53301035 gtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat 53301134  T
Q  123 agaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301135 agaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 38961367 - 38961514
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  38961367 tggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 38961466  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961467 atagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 13937494 - 13937649
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13937494 atgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 13937593  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937594 aacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 20629713 - 20629868
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  20629713 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaa 20629812  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629813 agcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 16282279 - 16282434
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| || |||  ||||    
T  16282279 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaa 16282378  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282379 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  47 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  147 ctgcacgtaggtcacagtgaata 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 17444285 - 17444440
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||| | || ||||    
T  17444285 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaa 17444384  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444385 aacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17393345 - 17393201
Alignment:
Q  24 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17393345 tattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgattttta 17393246  T
Q  124 gaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393245 gaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  58 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 157  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  158 tcacagtgaat 168  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  61 gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  161 cagtgaata 169  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 16358382 - 16358458
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16358382 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15007941 - 15007868
Alignment:
Q  19 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaa 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15007941 actggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 36528410 - 36528348
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36528410 atgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707533
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 9707533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  104 tgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8899473 - 8899418
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899473 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  23 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 12305570 - 12305525
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305570 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237027
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 25237027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899330
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 8899330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282737
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 16282737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444742
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 17444742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961817
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 38961817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124123
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 41124123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  52 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 55477094 - 55476976
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| |||||||||||    
T  55477094 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggtcaaattact 55476996  T
Q  149 gcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55476995 gcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528714
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaact 14528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 14567599 - 14567653
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 67  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567599 atgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17463701 - 17463663
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463701 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 49231866 - 49231768
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  49231866 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 3264468 - 3264530
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3264468 atgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtat 3264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 6468773 - 6468811
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468773 gagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276563
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaact 8276563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15412954 - 15412916
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412954 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16979586 - 16979504
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  16979586 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 16979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18890040 - 18889958
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  18890040 gaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30152560 - 30152450
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||     
T  30152560 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatg 30152461  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  30152460 atcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 3528206 - 3528239
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3528206 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3528239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913976
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatatt 11913976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17207601 - 17207568
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17207601 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17207568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25201281 - 25201248
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25201281 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25201248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 50351882 - 50351915
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50351882 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025982
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatatt 15025982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17207664 - 17207632
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17207664 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 17207632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18893300 - 18893224
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  18893300 gaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa 18893224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201349
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatatt 25201349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351696
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50351696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 54330969 - 54331001
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54330969 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 54331001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 109)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18809390 - 18809179
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809390 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18809291  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18809290 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18809192  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  18809191 tgaatacgatatt 18809179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23711728 - 23711939
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711728 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23711827  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23711828 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 23711926  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23711927 tgaatacgatatt 23711939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26505826 - 26505614
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505826 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26505727  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26505726 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 26505628  T
Q  213 tgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  26505627 tgaatacgatattt 26505614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26508304 - 26508092
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508304 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 26508205  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26508204 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 26508106  T
Q  213 tgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||    
T  26508105 tgaatacgatattt 26508092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39682761 - 39682549
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682761 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39682662  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39682661 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 39682562  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  39682561 tgaatacgatatt 39682549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28577546 - 28577335
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577546 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28577447  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28577446 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 28577348  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  28577347 tgaatacaatatt 28577335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 45027619 - 45027830
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45027619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 45027718  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45027719 aaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 45027817  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  45027818 tgaatacgatatt 45027830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24368274 - 24368076
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368274 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24368175  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368174 aatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 24368076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23136027 - 23135842
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23136027 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaa 23135928  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135927 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 23135842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23706931 - 23707143
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23706931 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 23707030  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707031 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23707130  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  23707131 tgaatactatatt 23707143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24897910 - 24898121
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24897910 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24898009  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24898010 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24898108  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24898109 tgaatacgatatt 24898121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24905347 - 24905558
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24905347 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24905446  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24905447 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24905545  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24905546 tgaatacgatatt 24905558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 21154722 - 21154920
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154722 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21154821  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154822 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 21154920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 571842 - 571633
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  571842 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaag 571743  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  571742 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 571643  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  571642 atacgatatt 571633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20261667 - 20261455
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261667 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20261568  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20261567 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 20261468  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  20261467 tgaatacgatatt 20261455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24900393 - 24900604
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24900393 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24900492  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24900493 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttg 24900591  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24900592 tgaatacgatatt 24900604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24902870 - 24903081
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24902870 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24902969  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24902970 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttg 24903068  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24903069 tgaatacgatatt 24903081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24907822 - 24908033
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24907822 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24907921  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24907922 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24908020  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24908021 tgaatacgatatt 24908033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22105913 - 22105715
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105913 atgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22105814  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105813 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 22105715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 23709253 - 23709458
Alignment:
Q  19 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23709253 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggat 23709352  T
Q  119 ttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23709353 ttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaata 23709451  T
Q  219 cgatatt 225  Q
    |||||||    
T  23709452 cgatatt 23709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 41523787 - 41523985
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41523787 atgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaa 41523886  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41523887 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgttt 41523985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24918588 - 24918376
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918588 atgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 24918489  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24918488 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24918389  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  24918388 tgaatactatatt 24918376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23131310 - 23131098
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23131310 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23131211  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23131210 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23131111  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  23131110 tgaatatgatatt 23131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23133777 - 23133565
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133777 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23133678  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23133677 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23133578  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  23133577 tgaatatgatatt 23133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24671469 - 24671261
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24671469 aaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaagg 24671370  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24671369 atttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 24671270  T
Q  217 tacgatatt 225  Q
    ||| |||||    
T  24671269 tactatatt 24671261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 34402236 - 34402448
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34402236 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 34402335  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34402336 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 34402435  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  34402436 tgaatatgatatt 34402448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6726495 - 6726297
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726495 atgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 6726396  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6726395 aaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgttt 6726297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Original strand, 24642465 - 24642675
Alignment:
Q  15 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24642465 gaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 24642564  T
Q  115 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtg 214  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24642565 ggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 24642664  T
Q  215 aatacgatatt 225  Q
    ||||| |||||    
T  24642665 aatactatatt 24642675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24681892 - 24681680
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  24681892 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttcca 24681793  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24681792 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24681693  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  24681692 tgaatactatatt 24681680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 10684477 - 10684689
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684477 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10684576  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  10684577 aaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 10684676  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  10684677 tgaatacgatatt 10684689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24529261 - 24529473
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529261 atgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24529360  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24529361 aaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24529460  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  24529461 tgaatacgatatt 24529473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38967927 - 38967715
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38967927 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38967828  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38967827 aagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38967728  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  38967727 tgaatactatatt 38967715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 32039213 - 32039410
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32039213 atgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 32039312  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32039313 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 32039410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 32214645 - 32214830
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32214645 atgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 32214744  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214745 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 32214830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616417
Alignment:
Q  61 gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  161 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 25616417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 41523597 - 41523749
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  41523597 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaat 41523696  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523697 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22106106 - 22105951
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  22106106 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 22106007  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106006 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23931908 - 23931775
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931908 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23931809  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23931808 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 21154529 - 21154684
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21154529 atgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 21154628  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154629 aacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 24529068 - 24529223
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24529068 atgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 24529167  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529168 aatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24918781 - 24918626
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24918781 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaa 24918682  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918681 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6726677 - 6726533
Alignment:
Q  24 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 123  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6726677 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 6726578  T
Q  124 gaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726577 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 23709054 - 23709209
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23709054 atgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23709153  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709154 aacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 41523401 - 41523552
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41523401 atgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41523500  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523501 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 32214451 - 32214604
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  32214451 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaa 32214550  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 166  Q
    ||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214551 aacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 21154336 - 21154491
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  21154336 atgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 21154435  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154436 aatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24368467 - 24368312
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24368467 atgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 24368368  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368367 aacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24682085 - 24681930
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  24682085 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaa 24681986  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681985 aaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23932101 - 23931949
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  23932101 atgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaa 23932002  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 165  Q
    || |||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23932001 aacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 23706547 - 23706702
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  |  ||||    
T  23706547 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaa 23706646  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706647 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 23706739 - 23706889
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23706739 atgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaa 23706838  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacag 163  Q
    || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23706839 aacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24671666 - 24671511
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||    
T  24671666 atgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaa 24671567  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671566 aaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 45027433 - 45027579
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 119  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  45027433 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatt 45027532  T
Q  120 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 166  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027533 tatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31345627 - 31345570
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345627 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  103 ttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967610
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 38967610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24368009
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattt 24368009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| | |||||     
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  47 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  147 ct 148  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726231
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 6726231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887364
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 19887364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23131385 - 23131347
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131385 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 23711652 - 23711690
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711652 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26505902 - 26505864
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505902 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26508380 - 26508342
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508380 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27261442 - 27261332
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||     
T  27261442 gaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatg 27261343  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  27261342 atcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 27920403 - 27920441
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920403 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 32039137 - 32039175
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039137 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Original strand, 34402161 - 34402199
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402161 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21154986
Alignment:
Q  180 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 21154986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105649
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatatt 22105649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707248
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 23707248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642780
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 24642780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681575
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 24681575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12727807 - 12727711
Alignment:
Q  52 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12727807 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 219
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 571913 - 571883
Alignment:
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571913 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6483195 - 6483113
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483195 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 21081347 - 21081429
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  21081347 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgattt 21081429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23133852 - 23133814
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133852 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671156
Alignment:
Q  179 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 24671156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 235
Target Start/End: Original strand, 36736894 - 36736952
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatttgatgatgtc 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||  ||||||||    
T  36736894 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgtc 36736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39682829 - 39682799
Alignment:
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682829 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 1384411 - 1384444
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1384411 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1384444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20915509 - 20915476
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20915509 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 21316436 - 21316469
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21316436 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21316469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 21336329 - 21336362
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21336329 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21336362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21368386 - 21368353
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21368386 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21368353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368406
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21368406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22690085 - 22690052
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22690085 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22690052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22694681 - 22694648
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22694681 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22694648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799498
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23799498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918271
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatatt 24918271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 25587416 - 25587449
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25587416 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25587449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 28345851 - 28345884
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28345851 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 28345884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 1384349 - 1384381
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1384349 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1384381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  132 gttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Original strand, 34135059 - 34135119
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135059 ggtgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 94858 - 94647
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94858 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 94759  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  94758 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 94660  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  94659 tgaatacgatatt 94647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 17154 - 17366
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17154 atgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17253  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17254 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttg 17353  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  17354 tgaatacgatatt 17366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 16961 - 17116
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  16961 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaa 17060  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || | ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17061 aaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 10732655 - 10732863
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732655 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10732754  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10732755 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 10732853  T
Q  213 tgaatacgat 222  Q
    ||||||||||    
T  10732854 tgaatacgat 10732863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 17516878 - 17517090
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516878 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17516977  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17516978 aaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 17517077  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  17517078 tgaatacgatatt 17517090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909459 - 20909248
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909459 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20909360  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20909359 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 20909261  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  20909260 tgaatacgatatt 20909248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 264483 - 264694
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  264483 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 264582  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  264583 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 264681  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  264682 tgaatacgatatt 264694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 42245080 - 42245291
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245080 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 42245179  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245180 atggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 42245278  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  42245279 tgaatacgatatt 42245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 2154346 - 2154556
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154346 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2154445  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154446 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 2154545  T
Q  213 tgaatacgata 223  Q
    |||||||||||    
T  2154546 tgaatacgata 2154556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39245583 - 39245372
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245583 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39245484  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39245483 aaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 39245385  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  39245384 tgaatacgatatt 39245372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 20917561 - 20917759
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917561 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20917660  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917661 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20917759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 20901635 - 20901847
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20901635 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 20901734  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20901735 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 20901834  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  20901835 tgaatacgatatt 20901847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32027893 - 32027695
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027893 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 32027794  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027793 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 32027695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29346427 - 29346216
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346427 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29346328  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  29346327 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29346229  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  29346228 tgaatacgatatt 29346216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29348900 - 29348689
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29348900 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29348801  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  29348800 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29348702  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  29348701 tgaatacgatatt 29348689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29351373 - 29351162
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29351373 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29351274  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  29351273 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29351175  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  29351174 tgaatacgatatt 29351162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29330427 - 29330233
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29330427 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaag 29330328  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330327 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29330233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38619881 - 38619672
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619881 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 38619782  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38619781 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 38619682  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  38619681 atacgatatt 38619672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 37804617 - 37804829
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804617 atgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 37804716  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37804717 aaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 37804816  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  37804817 tgaatacgatatt 37804829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23064958 - 23064749
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23064958 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaag 23064859  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23064858 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 23064759  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  23064758 atacgatatt 23064749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39363832 - 39363620
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39363832 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaa 39363733  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39363732 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 39363633  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  39363632 tgaatatgatatt 39363620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776594
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 9776594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 17516492 - 17516647
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  17516492 atgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 17516591  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516592 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 20901442 - 20901597
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20901442 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20901541  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901542 aacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 295989 - 296144
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  295989 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaa 296088  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296089 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 17516685 - 17516840
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  17516685 atgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 17516784  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516785 aaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32028473 - 32028318
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  32028473 atgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaa 32028374  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028373 aacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32028280 - 32028124
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg-tttgacttca 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  32028280 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtca 32028181  T
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028180 aaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 2154153 - 2154308
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  2154153 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaa 2154252  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154253 aacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29330623 - 29330468
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  29330623 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaa 29330524  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330523 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 295796 - 295951
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||  || | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  295796 atgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaa 295895  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295896 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32028666 - 32028511
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  32028666 atgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaa 32028567  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028566 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 20917368 - 20917523
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20917368 atgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaa 20917467  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917468 aatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32028086 - 32027931
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  32028086 atgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaa 32027987  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027986 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901953
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 20901953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 264327 - 264445
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  264327 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 264426  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  264427 cacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444106
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttat 43444106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330167
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 29330167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027629
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 32027629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 211
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917812
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20917812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11923
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 11923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20909535 - 20909497
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909535 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 222
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917875
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgat 20917875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426197
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 25426197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39245659 - 39245621
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245659 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39363907 - 39363869
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363907 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||     
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  138 gtcaaatta 146  Q
     ||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23065117 - 23064999
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| ||| |||||||    
T  23065117 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggtccaattact 23065019  T
Q  149 gcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23065018 gcacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31479034 - 31478959
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataga 125  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31479034 ggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttaga 31478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 8833821 - 8833855
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8833821 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8833855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11342300 - 11342210
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 128  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  11342300 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 11342210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19511863 - 19511781
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  19511863 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21503350 - 21503316
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21503350 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21503316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367176
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattt 22367176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26761830 - 26761796
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26761830 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26761796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 8833885 - 8833918
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8833885 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8833918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 14026533 - 14026578
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14026533 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatacgat 14026578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 14026596 - 14026629
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14026596 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14026629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 14026659 - 14026692
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14026659 atgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtt 14026692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16062717 - 16062684
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16062717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 16062684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16062878 - 16062845
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16062878 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 16062845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18743873 - 18743840
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18743873 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18743840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 20198318 - 20198351
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20198318 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20198351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 21399733 - 21399766
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21399733 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 21399796 - 21399829
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21399796 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26749389 - 26749356
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26749389 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26749356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26749452 - 26749419
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26749452 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26749419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30611402 - 30611369
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30611402 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 30611369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 1628044 - 1628076
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1628044 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1628076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6394 - 6183
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394 atgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6295  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6294 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 6196  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  6195 tgaatacgatatt 6183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 134658 - 134447
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134658 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 134559  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  134558 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 134460  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  134459 tgaatacgatatt 134447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 137127 - 136916
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137127 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 137028  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  137027 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 136929  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  136928 tgaatacgatatt 136916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 139596 - 139385
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139596 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 139497  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  139496 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 139398  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  139397 tgaatacgatatt 139385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 142065 - 141854
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142065 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 141966  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  141965 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 141867  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  141866 tgaatacgatatt 141854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 144534 - 144323
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144534 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 144435  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  144434 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 144336  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  144335 tgaatacgatatt 144323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40844 - 40636
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40844 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 40745  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40744 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtga 40646  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    ||||||||||    
T  40645 atacgatatt 40636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  138 gtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40923 - 40885
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38269 - 38057
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38269 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 38170  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38169 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38070  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  38069 tgaatacgatatt 38057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  150 cacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 20983
Alignment:
Q  15 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 21094  T
Q  115 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21093 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 20994  T
Q  215 aatacgatatt 225  Q
    |||||||||||    
T  20993 aatacgatatt 20983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 5)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14395 - 14183
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14395 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14296  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14295 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14196  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  14195 tgaatacgatatt 14183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23245 - 23457
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23245 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23344  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23345 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23444  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23445 tgaatacgatatt 23457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 22892 - 23047
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22892 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 22991  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22992 aacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  82 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 52
Target Start/End: Original strand, 20725 - 20764
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggt 52  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20725 atgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13628
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13741  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13740 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13641  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  13640 tgaatacgatatt 13628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13916 - 13878
Alignment:
Q  130 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13916 gagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9689 - 9478
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9689 atgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaa 9590  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9589 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 9491  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||    
T  9490 tgaatatgatatt 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5142 - 4930
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5142 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaa 5043  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5042 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4943  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  4942 tgaatacgatatt 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5335 - 5180
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  5335 atgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaa 5236  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5235 aacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 238 - 450
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 337  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  338 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 437  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  438 tgaatacgatatt 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 507 - 556
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11525
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11737 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaa 11638  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11637 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 11538  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  11537 tgaatacgatatt 11525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 4017 - 4222
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4017 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 4116  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4117 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4216  T
Q  213 tgaata 218  Q
    ||||||    
T  4217 tgaata 4222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 3824 - 3979
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  3824 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 3923  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3924 aacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 3631 - 3782
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  3631 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaa 3730  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 164  Q
    || |||||||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3731 aacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6714
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6800  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6799 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 6714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6937
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7092 atgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 6993  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6992 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30467 - 30255
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30467 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaa 30368  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30367 aaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30268  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  30267 tgaatacgatatt 30255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30660 - 30505
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  30660 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaa 30561  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30560 aacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30149
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatatt 30149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 655 - 443
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 556  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  555 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttg 456  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  455 tgaatacgatatt 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1008 - 853
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1008 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 909  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  908 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  82 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3471 - 3259
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3471 atgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3372  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3371 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 3272  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  3271 tgaatacgatatt 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10239 - 10027
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10239 atgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 10140  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10139 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttg 10040  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||||    
T  10039 tgaatacgatatt 10027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10432 - 10277
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10432 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaa 10333  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10332 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10624 - 10470
Alignment:
Q  14 tgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  10624 tgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaa 10525  T
Q  114 aggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    | ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10524 aagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 825
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1034 aaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaat 935  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtga 215  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  934 tatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtga 835  T
Q  216 atacgatatt 225  Q
    |||| |||||    
T  834 atactatatt 825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  19 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  119 ttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1227
Alignment:
Q  24 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  1338 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttata 1240  T
Q  124 gaactagagttat 136  Q
    ||||| |||||||    
T  1239 gaacttgagttat 1227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 720
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatatt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 6650 - 6862
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  6650 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 6749  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6750 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 6849  T
Q  213 tgaatacgatatt 225  Q
    ||||||| |||||    
T  6850 tgaatactatatt 6862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6612
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  6465 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 6564  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6565 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43187 - 42999
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43187 atgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 43088  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43087 aagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgaat 42999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13553
Alignment:
Q  51 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  151 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 13553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43380 - 43225
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43380 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 43281  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43280 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 7996
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8187 atgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 8088  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 204  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8087 aaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8385 - 8225
Alignment:
Q  8 gtgagatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgac 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8385 gtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgac 8286  T
Q  108 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8285 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8569 - 8421
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |    
T  8569 aaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaag 8470  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 165  Q
    ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8469 atttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 68409 - 68227
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  68409 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaa 68310  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68309 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11251
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  11054 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 11153  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11154 aacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15158
Alignment:
Q  31 tggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactag 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  131 agttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatatt 15158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11016
Alignment:
Q  21 tggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  10869 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 10968  T
Q  121 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15552 - 15398
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  15552 atgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaa 15454  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15453 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53791
Alignment:
Q  39 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  139 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 53791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1664
Alignment:
Q  58 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 157  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  158 tcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatatt 1664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1740
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1895 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 1796  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1702 - 1640
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1702 atgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31651 - 31497
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31651 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 31552  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31551 aacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 501512 - 501347
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501512 atgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 501414  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 179  Q
    || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501413 aatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 501705 - 501550
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  501705 atgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 501606  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501605 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttga 106  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57717
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaata 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 57717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 38380 - 38582
Alignment:
Q  23 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttat 122  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38380 gtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttat 38479  T
Q  123 agaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    |||| | |||||||  ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38480 agaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 38579  T
Q  223 att 225  Q
    |||    
T  38580 att 38582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18578 - 18423
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  18578 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaa 18479  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18478 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18101 - 17947
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  18101 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaa 18002  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18001 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8311
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8466 atgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 8367  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8366 aaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7558
Alignment:
Q  17 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  7408 aaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatg 7507  T
Q  117 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7508 atttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 7219 - 7367
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||    
T  7219 ctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatt 7318  T
Q  120 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7319 tataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 166
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33465
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  33619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaa 33520  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33519 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 11009
Alignment:
Q  91 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  191 agtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatatt 11009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39780 - 39626
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  39780 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaa 39681  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39680 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 19803 - 19957
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  19803 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 19902  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 167  Q
    || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19903 aacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28091
Alignment:
Q  112 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28025
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 28025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 36913 - 37068
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 112  Q
    |||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36913 atgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 37012  T
Q  113 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37013 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  42 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  142 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10708
Alignment:
Q  164 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 10708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10811
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgata 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 113461 - 113317
Alignment:
Q  16 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 115  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  113461 aaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaat 113362  T
Q  116 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 160  Q
    || || ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  113361 gagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 75619 - 75681
Alignment:
Q  13 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75619 atgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1099
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1133 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||     
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 460 - 405
Alignment:
Q  20 ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  460 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtat 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15076
Alignment:
Q  152 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatg 15076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15184
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 15184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9967
Alignment:
Q  176 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatatt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatatt 9967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10023
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgat 10023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1375
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||| |||||||     
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  1385 atcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7039
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6941 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Original strand, 12520 - 12590
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12520 atgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15876 - 15780
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  15876 ggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  138 gtcaaattact 148  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18553 - 18521
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18553 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54044 - 53958
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  54044 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttat 53958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Original strand, 19911 - 20009
Alignment:
Q  50 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19911 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  78 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 120235 - 120190
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgat 222  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  120235 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 120190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7352
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7382 - 7415
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2597
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2564 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 721 - 688
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  721 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6227 - 6194
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6227 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10033 - 10000
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10033 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  79 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 148  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29880 - 29847
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29880 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3184 - 3151
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3184 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 24654 - 24687
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24654 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 24717 - 24750
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7508 - 7541
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7508 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7477
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7445 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 36287 - 36320
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36287 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Original strand, 36350 - 36382
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36350 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 36382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 62057 - 62024
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62057 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 62024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 46667 - 46700
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46667 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 142809 - 142776
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  142809 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 142776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 103752 - 103716
Alignment:
Q  46 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgtt 82  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  103752 cttaggtgtaaacatgaaaattgtaggtataaatgtt 103716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29428 - 29395
Alignment:
Q  177 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29428 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 912
Alignment:
Q  38 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 137  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| || ||||     
T  1020 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatg 921  T
Q  138 gtcaaatta 146  Q
     ||||||||    
T  920 atcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16294
Alignment:
Q  178 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 16294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University