View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20633_low_72 (Length: 393)

Name: NF20633_low_72
Description: NF20633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20633_low_72
NF20633_low_72
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (18-384)||(5101429-5101795)
chr2 (18-384)||(5118988-5119354)
chr2 (26-310)||(5080187-5080471)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (25-369)||(14412497-14412841)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (17-369)||(16885722-16886077)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (20-342)||(25341411-25341733)
chr8 (20-352)||(25695791-25696123)
chr8 (20-368)||(25800709-25801057)
chr8 (20-342)||(25647443-25647765)
chr8 (17-342)||(25715621-25715946)
chr8 (23-360)||(23258638-23258963)
chr8 (36-342)||(25311446-25311752)
chr8 (23-352)||(25323090-25323419)
chr8 (17-352)||(25605065-25605400)
chr8 (20-282)||(24912451-24912713)
chr8 (20-282)||(25453413-25453675)
chr8 (20-318)||(25686081-25686379)
chr8 (20-342)||(24874764-24875086)
chr8 (20-342)||(25570317-25570639)
chr8 (23-368)||(22900091-22900436)
chr8 (23-368)||(25476095-25476440)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (20-352)||(16341-16673)
scaffold0070 (239-368)||(49843-49972)
[»] scaffold0830 (1 HSPs)
scaffold0830 (20-360)||(3819-4159)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (23-363)||(10324287-10324621)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5101795 - 5101429
Alignment:
Q  18 tttctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggtt 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5101795 tttccacacttccatttgacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactactcataatttgaactagatttctatgtcgaaggtt 5101696  T
Q  118 gcacattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcct 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101695 gcgcattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgcttctgccattgtcaagtcaagtactttaattgctatcatcttcccactagaaagcattcct 5101596  T
Q  218 tgatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactc 317  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5101595 tgatacacggatccaaagccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttgcactagttcataataggaaatcctttttggaactc 5101496  T
Q  318 ctatagtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttatgaattcgtagtattat 384  Q
    |||||||   |||||||| |||||||| ||||| | | ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  5101495 ctatagtgtgtaaacccctttcaagtgaatttttaccctttctccttttatgcattcgaagtattat 5101429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5119354 - 5118988
Alignment:
Q  18 tttctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggtt 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5119354 tttccacacttccatttgacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactactcataatttgaactagatttctatgtcgaaggtt 5119255  T
Q  118 gcacattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcct 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5119254 gcgcattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgcttctgccattgtcaagtcaagtactttaattgctatcatcttcccactagaaagcattcca 5119155  T
Q  218 tgatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactc 317  Q
    | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5119154 ttatacacggatccaaaaccacctcttccaagtaaattactgtcactgaatccattagttgcttgcacaagttcataataggaaatccttcttggaactc 5119055  T
Q  318 ctatagtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttatgaattcgtagtattat 384  Q
    ||| ||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5119054 ctagagcggataaactcctctcaagtggactgtcaacctttttccttttatgcattcgaagtattat 5118988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Original strand, 5080187 - 5080471
Alignment:
Q  26 cttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcacattg 125  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || | |||  |||||| |  ||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  5080187 cttccatttgacattaactccattaccaaagacctgaaattaacatttgaacaactggtgatgatctcaacaagatttcgatgccgaagattgcgcatag 5080286  T
Q  126 cattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgatacac 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5080287 cattgcattctgcattaaagctttttgttgttgcttccaatttcaagtcaagtactttaattgctaccatcttcccactagaaagcattccttgatacac 5080386  T
Q  226 agatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatccttttt 310  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  5080387 agatccaaagccaccctttcctagtaaattagtctcactaaatccattagttgcttgcacaagttcagaataggaaatccttttt 5080471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 14412497 - 14412841
Alignment:
Q  25 acttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcacatt 124  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  14412497 acttccgtttgacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactactgataatttggacgagatttctatgccggaggttgcgcatt 14412596  T
Q  125 gcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgataca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14412597 gcattgcattctgcatcaaagcttcttgaagtagcttccattgttaagtcaagtactttaactgctatcatcttcccaatagaaagcattcctttataca 14412696  T
Q  225 cagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctatagt 324  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  14412697 ctgatccaaaaccaccccttccaagtaaattagtctcgctgaatccattagttgcttggacgagttcataataggaaatccttattggaactcctacagt 14412796  T
Q  325 cgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttatg 369  Q
     |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14412797 ggataaacccctttcacgtggactttcaacctttttccttttatg 14412841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16886077 - 16885722
Alignment:
Q  17 ttttctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggt 116  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||   ||||||||||||  | ||||  | ||| ||||||||||| |||||      
T  16886077 ttttcaacacttccatttgacataaactccatcaccaatgacttgaaatctttatttgaacaacttgtaataacctcaacaagatttcgatgtcgaagaa 16885978  T
Q  117 tgcacattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcc 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  16885977 tgcgcattgcattgcattctgcgtcaaaacttcttgatgttgcttccatattcaagtcaagtactttaattgctaccatcttcccggtagaaagcattcc 16885878  T
Q  217 ttgatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaact 316  Q
     ||||||||||| || || || ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||     
T  16885877 ctgatacacagagccgaagcccccctttccaagtaagttactctcgctaaatccattagttgcttgcacaagttcataatatgaaatccttcttggaacc 16885778  T
Q  317 ccta---tagtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttatg 369  Q
    ||||    ||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16885777 cctaaatcagttgataaacccatttcaagtggattttcaacttttttctttttatg 16885722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 25341411 - 25341733
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| || || || |    
T  25341411 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgaacaactgctgataatcttaaccatatttcgatgtcgtagatttc 25341510  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  25341511 tcattgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaacggcaatcatctcaccatcaagaagcttgccct 25341609  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  25341610 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaatttcataataggatattcttcttggagctcc 25341709  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaag 342  Q
     | ||| || ||||||| ||||||    
T  25341710 caaagttgacaaacccctttcaag 25341733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Original strand, 25695791 - 25696123
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  25695791 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttc 25695890  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  25695891 tcatcgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaacggcaatcatctcaccatcaagaagcttcccct 25695989  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  25695990 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaagttcataataggatattcttcttggagctcc 25696089  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaagtggattttca 352  Q
     | ||| || ||||||| |||||| | |||||||    
T  25696090 caaagttgacaaacccctttcaagagtattttca 25696123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 368
Target Start/End: Original strand, 25800709 - 25801057
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||||| || || || |    
T  25800709 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccaaatttcgatgacgtagatttc 25800808  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| |||||| || || |||||||  |||  || |||| | || |    
T  25800809 tcatcgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttgactgcaatcatctcaccatcaggaagcttcccct 25800907  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  25800908 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaagttcataatacgatattcttcttggagctcc 25801007  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttat 368  Q
    || ||| || ||||||| |||||| | | |||||   |||||||||||||    
T  25801008 taaagttgacaaacccctttcaagagtagtttcattctttttccttttat 25801057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 25647443 - 25647765
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  25647443 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgatcaacttctgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttc 25647542  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||| || |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  25647543 tcattgcattacattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattgtaaa-tcaattactttaactgcaatcatctcaccatcaagaagcttcccct 25647641  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  25647642 gataaacagatccaaatgctccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaagttcataataggatattcttcttggagctcc 25647741  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaag 342  Q
    || ||| || ||||||| ||||||    
T  25647742 taaagttgacaaacccctttcaag 25647765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 25715621 - 25715946
Alignment:
Q  17 ttttctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| || || |    
T  25715621 ttttctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaacttctgataatctttaccagattccgatgtcgtagat 25715720  T
Q  117 tgcacattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattc 215  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| |||||| || || |||||||  |||  |  |||| |||    
T  25715721 ttctcatcgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattacttttactgcaatcatctcaccatcatgaagctttc 25715819  T
Q  216 cttgatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaac 315  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| || || ||| ||||| |    
T  25715820 cttgataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaatttcataataggatattcttcttggagc 25715919  T
Q  316 tcctatagtcgataaacccccttcaag 342  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  25715920 tcctaaagttgaaaaacccctttcaag 25715946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 23258638 - 23258963
Alignment:
Q  23 acacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcaca 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || | ||    
T  23258638 acacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagattggaacaactgctgataatcttaaccagatttcgatgccgtagatttctca 23258737  T
Q  123 ttgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgata 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||            ||  ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  || |||| | ||||||||    
T  23258738 ttgcattgcattctgcatcaaagctctttg------------tttgcaaatcaaatactttaactgcaatcatctcaccatcaggaagcttcccttgata 23258825  T
Q  223 cacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctata 322  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||||||||||      
T  23258826 cacagagccaaagccccccgttccaagtaaattgctctcattgaatccatttgttgcttgcacaagttcataatatgatattcttcttggaactcctaag 23258925  T
Q  323 gtcgataaacccccttcaagtggattttcaacattttt 360  Q
    || |||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  23258926 gttgataaacccctttcaacaatattttcaacattttt 23258963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 342
Target Start/End: Original strand, 25311446 - 25311752
Alignment:
Q  36 acataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcacattgcattgcattc 135  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || || || | |||||||||||||||    
T  25311446 acatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgaacaactgctgataatcttaaccagatttcgatgtcgtagatttctcattgcattgcattc 25311545  T
Q  136 tgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgatacacagatccaaa 234  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || ||||| ||||| |||||    
T  25311546 tgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaacggcaatcatctcaccatcaagaagcttgccctgataaacagagccaaa 25311644  T
Q  235 tccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctatagtcgataaaccc 334  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| || || ||| ||||| |||| | ||| || ||||||    
T  25311645 tcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaatttcataataggatattcttcttggagctcccaaagttgacaaaccc 25311744  T
Q  335 ccttcaag 342  Q
    | ||||||    
T  25311745 ctttcaag 25311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 352
Target Start/End: Original strand, 25323090 - 25323419
Alignment:
Q  23 acacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcaca 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || || | ||    
T  25323090 acacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactactgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttctca 25323189  T
Q  123 ttgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgat 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| |||| ||||    
T  25323190 ttgcattgcattctacatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaactgcaatcatctcaccatcaagaagctttccctgat 25323288  T
Q  222 acacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctat 321  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||| |||| || || ||| ||||| ||||||     
T  25323289 aaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcatttaatccattagttgcttgcaaaagttcataatatgatattcttcttggagctcctaa 25323388  T
Q  322 agtcgataaacccccttcaagtggattttca 352  Q
    ||| || ||||||| |||||| | |||||||    
T  25323389 agttgacaaacccctttcaagagtattttca 25323419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 25605065 - 25605400
Alignment:
Q  17 ttttctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||| || || |    
T  25605065 ttttctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccagattccgatgtcgtagat 25605164  T
Q  117 tgcacattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattc 215  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || ||||| |  |||  |  |||| | |    
T  25605165 ttctcatcgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaacggcaatcatttcaccatcaagaagcttgc 25605263  T
Q  216 cttgatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaac 315  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| |    
T  25605264 cctgataaacagatccaaatgctccccttccaaggaaattactctcattgaatccatttgttgcttgcacaagttcataatatgatattcttcttggagc 25605363  T
Q  316 tcctatagtcgataaacccccttcaagtggattttca 352  Q
    ||| | ||| || ||||||| | |||| | |||||||    
T  25605364 tcccaaagttgacaaaccccttccaagagtattttca 25605400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24912713 - 24912451
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  24912713 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttc 24912614  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  24912613 tcatcgcattgcattctacatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaactgcaatcatctcaccatcaagaagcttcccat 24912515  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttg 282  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24912514 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttg 24912451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 25453413 - 25453675
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  25453413 tctacacttccatttgacatgaattccattaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttc 25453512  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  25453513 tcattgcattgcattcttcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaactgcaatcatctcaccatcaagaagcttcccct 25453611  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttg 282  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25453612 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttg 25453675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 25686081 - 25686379
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  25686081 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttaaaatcaagatttgagcaactaccgataatctttactagatttcgatgtcgtagatttc 25686180  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  25686181 tcatcgcattgcattctgcatcaaagctcattgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaactgcaatcatctcaccatcaagaagcttcccat 25686279  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  25686280 gataaacagagccaaatcccccccttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgaacaagttcataataggatattcttcttggagctcc 25686379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24875086 - 24874764
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  24875086 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactactgataatctttaccagatttcgatgacgtagatttc 24874987  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||| || |||| |||||| || || || ||||  |||  || ||||   ||||    
T  24874986 tcattgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattgt-aaatcaaatactttgactgcaataatctcaccatcaggaagctcccctt 24874888  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||  |  |||||| |||| || || ||| || || ||||    
T  24874887 gatacacagagccaaagctcccccttccaagtaattttctctcattgaatccatttgttgcttacaaaagttcataatatgatattcttcttagagctcc 24874788  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaag 342  Q
    || ||  |||||||||| ||||||    
T  24874787 taaagctgataaacccctttcaag 24874764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 25570317 - 25570639
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || || |    
T  25570317 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactactgataatctttaccagatttcgatgtcgtagatttc 25570416  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||| || |||| |||||| || || || ||||  |||  || ||||   ||||    
T  25570417 tcattgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattgt-aaatcaaatactttgactgcaataatctcaccatcaggaagctcccctt 25570515  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||  |  |||||| |||| || || ||| || || ||||    
T  25570516 gatacacagagccaaagctcccccttccaagtaattttctctcattgaatccatttgttgctttcaaaagttcataatatgatattcttcttagagctcc 25570615  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaag 342  Q
    || ||  |||||||||| ||||||    
T  25570616 taaagctgataaacccctttcaag 25570639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22900436 - 22900091
Alignment:
Q  23 acacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcaca 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || | ||    
T  22900436 acacttccatttgacatgaactccatcaccaatgctttgaaatcaatatttgaacaactgctgataatcttaaccagatttcgatgccgtagatttctca 22900337  T
Q  123 ttgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgata 222  Q
     |||||||||||||  ||||||||| | | ||  | | ||     |||| ||||  |||||||| || |  ||||  ||| | |||||| | || | |||    
T  22900336 atgcattgcattctcgatcaaagctccgtaatttttcctccgagttcaaatcaatcactttaaccgcaaatatctcaccatttgaaagcttcccctcata 22900237  T
Q  223 cacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctata 322  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||| ||||| |||| | |    
T  22900236 cacagacccaaatcctccccttccaagcaaattactctcattaaatccatttgttgcttgcacaagctcataataagaaattcttcttggagctccaaga 22900137  T
Q  323 gtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttat 368  Q
    || ||||||   | |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  22900136 gttgataaatttctttcaagagtattttcaaccattttccttttat 22900091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 25476095 - 25476440
Alignment:
Q  23 acacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcaca 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||| || || || | |     
T  25476095 acacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcgagatttgaacaactacaaataatcttaacaagatttcgatgtcgtagatttctcg 25476194  T
Q  123 ttgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgat 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| ||| | || ||| |||| ||||||||| || |||||||   || |    ||  | ||  |||    
T  25476195 ttgcattgcattctacatcaaagctctttgcttttgcctctgactg-caaatcaattactttaaccgcaatcatctcatcattgcggagattcccccgat 25476293  T
Q  222 acacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctat 321  Q
    | ||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||     
T  25476294 atacagagccaaagcccccccgtccaagtaaattacactcattgaatccattagttgcttgcacaagttcataataggaaattcttcttagagctcctaa 25476393  T
Q  322 agtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttccttttat 368  Q
    ||| |||||||||| |||||| | ||||| ||  |||||||||||||    
T  25476394 agttgataaacccctttcaagagtattttgaatctttttccttttat 25476440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16673 - 16341
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||||| || || || |    
T  16673 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgagcaactgctgataatctttaccaaatttcgatgtcgtagatttc 16574  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttct-attgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  |||  |  |||| | || |    
T  16573 tcatcgcattgcattctgcatcaaagctctttgattttgcctctgattg-caaatcaattactttaacggcaatcatctcaccatcaagaagcttcccct 16475  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  16474 gataaacagagccaaatcccccacttccaaggaaattactctcattgaatccattagttgcttgcacaagttcataataggatattcttcttggagctcc 16375  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaagtggattttca 352  Q
    || ||| || ||||||| |||||| | |||||||    
T  16374 tagagttgacaaacccctttcaagagtattttca 16341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49972 - 49843
Alignment:
Q  239 ccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctatagtcgataaaccccctt 338  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||| || || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  49972 ccccgtccaagtaaattacactcactaaatccattagttgcttgcacaagttcataataggaaattcttcttagagctcctaaagttgataaaccccttt 49873  T
Q  339 caagtggattttcaacatttttccttttat 368  Q
    |||| | ||||| ||  |||| ||||||||    
T  49872 caagagtattttgaatcttttaccttttat 49843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0830 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0830
Description:

Target: scaffold0830; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4159 - 3819
Alignment:
Q  20 tctacacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgc 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || || || |    
T  4159 tctacacttccatttgacatgaactccatcaccaatgatttgaaatcaagatttgaacaactgctgataatcttaaccagatttcgatgtcgtagatttc 4060  T
Q  120 acattgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttc-tattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattcctt 218  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  ||| ||  |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||  ||| ||| |||| | || |    
T  4059 tcattgcattgcattctacatcaaaactctttgattttgcctcagattg-caaatcaattactttaactgcaatcatctcaccattaggaagcttcccct 3961  T
Q  219 gatacacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcc 318  Q
     ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||   ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || || ||| ||||| ||||    
T  3960 catacacagaaccaaagctcccccttccaagtaatttgctctcttcgaatccatttgttgcttccacaagttcataatatgatattcttcttggagctcc 3861  T
Q  319 tatagtcgataaacccccttcaagtggattttcaacattttt 360  Q
    ||  |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  3860 taatgctgataaacccctttcaaaagtattttcaacattttt 3819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 10324287 - 10324621
Alignment:
Q  23 acacttccatttaacataaactccatcactagagatttgaaatcaggatttgaacaactgctgataatttgaacgagatttcgatgccgaaggttgcaca 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || || | ||    
T  10324287 acacttccatttgacatgaactccagcaccaatgctttgaaatcatgatttgaacaactactgataatcttaaccagatttcgatgtcgtagatttctca 10324386  T
Q  123 ttgcattgcattctgcatcaaagcttcttgatgctgcttctattgtcaagtcaagtactttaacagctatcatcttcccactagaaagcattccttgata 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||       | |||| |||||| || || |||||||  ||   || |||||| || |||||    
T  10324387 ttacattgcattctgcatcaaagcttgttgattttgcctct------gaatcaattactttgactgcaatcatctcaccgtcaggaagcatcccctgata 10324480  T
Q  223 cacagatccaaatccaccccttccaagtaaattactctcactgaatccattagttgcttggacgagttcaaaataagaaatcctttttggaactcctata 322  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||  || |||||| |||| || || ||| ||| | |||||| |    
T  10324481 cacagagccaaagctcccccttccaagtaatttactctcattgaaaccatttgttgcttccacaagttcataatatgatattcttcttgtagctcctaaa 10324580  T
Q  323 gtcgataaacccccttcaagtggattttcaacatttttcct 363  Q
       |||||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  10324581 actgataattccctttcaagagtattttcaacgtttttcct 10324621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University