View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20633_low_8 (Length: 691)

Name: NF20633_low_8
Description: NF20633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20633_low_8
NF20633_low_8
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (168-674)||(54634999-54635505)
chr3 (168-673)||(6716375-6716881)
chr3 (179-667)||(45282864-45283356)
chr3 (190-665)||(3617333-3617813)
chr3 (190-673)||(25637304-25637793)
chr3 (190-665)||(4600549-4601028)
chr3 (190-665)||(4598328-4598807)
chr3 (190-665)||(10211279-10211758)
chr3 (190-665)||(10209059-10209538)
chr3 (190-665)||(10056103-10056582)
chr3 (190-665)||(10058325-10058804)
chr3 (190-665)||(10060547-10061026)
chr3 (190-665)||(10062769-10063248)
chr3 (190-665)||(10064991-10065470)
chr3 (198-666)||(800973-801435)
chr3 (195-585)||(7779821-7780208)
chr3 (195-674)||(23199957-23200438)
chr3 (265-674)||(23197824-23198239)
chr3 (458-665)||(10067213-10067418)
chr3 (265-674)||(9636010-9636428)
chr3 (514-673)||(6718559-6718718)
chr3 (215-669)||(5257983-5258440)
chr3 (377-669)||(45095037-45095335)
chr3 (215-669)||(5260162-5260619)
chr3 (265-657)||(19683774-19684173)
chr3 (269-669)||(37408331-37408737)
chr3 (265-669)||(7764340-7764747)
chr3 (265-667)||(7762140-7762548)
chr3 (265-657)||(9581167-9581565)
chr3 (190-420)||(10067435-10067669)
chr3 (377-548)||(34491212-34491383)
chr3 (377-657)||(39153358-39153645)
chr3 (370-548)||(49199458-49199638)
chr3 (377-669)||(40735255-40735554)
chr3 (370-548)||(43401790-43401970)
chr3 (381-548)||(4569952-4570120)
chr3 (377-548)||(29196383-29196555)
chr3 (377-669)||(40734370-40734669)
chr3 (265-669)||(5236343-5236752)
chr3 (370-544)||(30236129-30236303)
chr3 (377-668)||(32744433-32744721)
chr3 (198-657)||(760731-761189)
chr3 (267-669)||(51398686-51399094)
chr3 (377-633)||(29682267-29682530)
chr3 (377-548)||(44331545-44331716)
chr3 (373-548)||(43403736-43403913)
chr3 (381-548)||(6095600-6095767)
chr3 (377-548)||(44700476-44700646)
chr3 (388-545)||(22835010-22835167)
chr3 (377-546)||(31314447-31314616)
chr3 (381-548)||(41819523-41819691)
chr3 (381-548)||(54593704-54593871)
chr3 (265-548)||(29810868-29811150)
chr3 (381-548)||(46860474-46860642)
chr3 (370-490)||(40913352-40913471)
chr3 (388-548)||(53921511-53921671)
chr3 (377-548)||(29813063-29813234)
chr3 (388-546)||(32891105-32891264)
chr3 (370-529)||(46173377-46173535)
chr3 (377-657)||(16498914-16499200)
chr3 (381-488)||(55301972-55302079)
chr3 (377-545)||(9666463-9666632)
chr3 (377-548)||(23391906-23392077)
chr3 (370-456)||(47304344-47304429)
chr3 (431-543)||(4055813-4055926)
chr3 (420-548)||(51352150-51352278)
chr3 (476-548)||(5433971-5434046)
chr3 (606-674)||(7782375-7782442)
chr3 (389-448)||(27305719-27305777)
chr3 (592-669)||(29812935-29813010)
chr3 (381-449)||(2075076-2075143)
chr3 (265-307)||(9634707-9634750)
chr3 (431-490)||(4075520-4075581)
chr3 (419-548)||(36018852-36018982)
chr3 (477-536)||(28253363-28253423)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (168-665)||(25689838-25690335)
chr8 (168-667)||(3439385-3439886)
chr8 (190-665)||(15290408-15290887)
chr8 (190-665)||(15470777-15471256)
chr8 (190-665)||(42575130-42575608)
chr8 (195-674)||(2627609-2628087)
chr8 (215-669)||(31218129-31218586)
chr8 (265-669)||(34254217-34254624)
chr8 (265-669)||(17982525-17982935)
chr8 (265-657)||(34256393-34256788)
chr8 (265-669)||(42498066-42498477)
chr8 (216-669)||(19945199-19945656)
chr8 (265-669)||(44303726-44304137)
chr8 (378-671)||(1746216-1746516)
chr8 (287-669)||(12702542-12702934)
chr8 (282-669)||(43036295-43036687)
chr8 (269-669)||(15212658-15213064)
chr8 (377-671)||(33352020-33352321)
chr8 (381-548)||(4283524-4283691)
chr8 (377-671)||(27811148-27811449)
chr8 (381-548)||(42434992-42435159)
chr8 (269-669)||(4731530-4731936)
chr8 (377-546)||(40321082-40321251)
chr8 (381-548)||(18655400-18655567)
chr8 (387-548)||(18141821-18141981)
chr8 (265-669)||(30143214-30143622)
chr8 (377-548)||(3303667-3303838)
chr8 (377-548)||(40221745-40221916)
chr8 (377-657)||(6598856-6599143)
chr8 (377-657)||(6674309-6674596)
chr8 (419-548)||(30291606-30291737)
chr8 (370-546)||(10930189-10930365)
chr8 (407-545)||(40328782-40328922)
chr8 (377-494)||(5689326-5689442)
chr8 (377-494)||(41366612-41366727)
chr8 (377-473)||(4743211-4743306)
chr8 (431-548)||(9765745-9765863)
chr8 (381-544)||(11383989-11384152)
chr8 (361-548)||(19491680-19491867)
chr8 (381-548)||(8965692-8965859)
chr8 (419-545)||(44353796-44353923)
chr8 (387-548)||(1292471-1292631)
chr8 (377-545)||(1345368-1345536)
chr8 (386-494)||(10015136-10015241)
chr8 (381-530)||(4162516-4162663)
chr8 (605-669)||(19948554-19948617)
chr8 (381-463)||(4733792-4733873)
chr8 (386-494)||(18106087-18106191)
chr8 (546-657)||(10929685-10929794)
chr8 (572-667)||(4733683-4733777)
chr8 (472-543)||(29796413-29796485)
chr8 (198-246)||(43036720-43036767)
chr8 (265-307)||(1746105-1746148)
chr8 (199-246)||(4734004-4734051)
chr8 (288-327)||(32902096-32902135)
chr8 (476-543)||(1822297-1822365)
chr8 (476-543)||(1856742-1856810)
chr8 (198-246)||(3303494-3303541)
chr8 (392-463)||(8153844-8153914)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (168-674)||(27647737-27648232)
chr6 (190-674)||(16554744-16555228)
chr6 (190-674)||(16631300-16631784)
chr6 (190-674)||(16578327-16578811)
chr6 (190-674)||(16616569-16617053)
chr6 (190-674)||(16652987-16653471)
chr6 (190-665)||(25421189-25421669)
chr6 (190-665)||(6027132-6027609)
chr6 (190-665)||(34166964-34167443)
chr6 (190-665)||(33341908-33342389)
chr6 (190-665)||(34164742-34165221)
chr6 (198-665)||(3072580-3073045)
chr6 (195-674)||(411976-412437)
chr6 (190-568)||(13153893-13154278)
chr6 (210-667)||(6097281-6097728)
chr6 (215-669)||(2171366-2171827)
chr6 (7-167)||(11423307-11423467)
chr6 (265-669)||(31404561-31404970)
chr6 (198-669)||(30834357-30834832)
chr6 (265-669)||(16452214-16452625)
chr6 (377-669)||(5406196-5406494)
chr6 (377-669)||(5410521-5410819)
chr6 (265-669)||(5413281-5413688)
chr6 (21-167)||(11437843-11437992)
chr6 (265-669)||(9182917-9183327)
chr6 (282-671)||(33160254-33160652)
chr6 (381-548)||(21588931-21589098)
chr6 (381-548)||(21593664-21593831)
chr6 (372-548)||(3808699-3808877)
chr6 (381-545)||(17758026-17758191)
chr6 (381-548)||(2972940-2973107)
chr6 (377-657)||(16568927-16569193)
chr6 (265-477)||(5408956-5409164)
chr6 (381-548)||(17762990-17763158)
chr6 (17-129)||(11430492-11430604)
chr6 (190-295)||(6136108-6136216)
chr6 (381-546)||(26830124-26830289)
chr6 (381-634)||(28137409-28137669)
chr6 (381-545)||(5043630-5043795)
chr6 (373-494)||(603081-603201)
chr6 (381-548)||(22424826-22424995)
chr6 (377-545)||(26954283-26954450)
chr6 (377-669)||(33211182-33211481)
chr6 (404-548)||(3038926-3039071)
chr6 (381-494)||(26800642-26800755)
chr6 (190-256)||(13159066-13159134)
chr6 (431-548)||(4045423-4045542)
chr6 (190-233)||(16552976-16553019)
chr6 (190-233)||(16629532-16629575)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (168-674)||(29720238-29720743)
chr5 (191-674)||(29750969-29751454)
chr5 (168-674)||(29722398-29722903)
chr5 (190-667)||(22536103-22536574)
chr5 (190-674)||(10593133-10593621)
chr5 (190-665)||(25078004-25078484)
chr5 (190-665)||(25135973-25136453)
chr5 (190-665)||(40379976-40380454)
chr5 (190-665)||(40382187-40382665)
chr5 (190-665)||(16544293-16544774)
chr5 (190-665)||(16546515-16546996)
chr5 (195-674)||(9789042-9789518)
chr5 (195-674)||(18441462-18441942)
chr5 (198-674)||(16409349-16409824)
chr5 (195-674)||(26177757-26178234)
chr5 (195-674)||(26170648-26171114)
chr5 (215-669)||(30182461-30182917)
chr5 (265-669)||(25412634-25413042)
chr5 (215-669)||(13342933-13343389)
chr5 (195-669)||(36073863-36074340)
chr5 (282-674)||(13239619-13240016)
chr5 (282-667)||(32636698-32637088)
chr5 (377-529)||(37439161-37439313)
chr5 (381-548)||(213465-213633)
chr5 (377-669)||(13488075-13488374)
chr5 (381-548)||(40147261-40147428)
chr5 (269-669)||(39468439-39468845)
chr5 (370-548)||(28278316-28278493)
chr5 (377-669)||(42428427-42428726)
chr5 (265-669)||(30682809-30683216)
chr5 (381-548)||(5058047-5058212)
chr5 (377-669)||(28750652-28750951)
chr5 (381-657)||(16451965-16452247)
chr5 (381-657)||(31182857-31183138)
chr5 (377-669)||(533641-533940)
chr5 (361-633)||(33831588-33831866)
chr5 (377-545)||(8565943-8566111)
chr5 (377-665)||(537901-538196)
chr5 (404-548)||(13695713-13695859)
chr5 (383-548)||(27637615-27637781)
chr5 (377-665)||(42426232-42426527)
chr5 (379-542)||(316769-316933)
chr5 (377-456)||(19806456-19806534)
chr5 (381-534)||(16640941-16641091)
chr5 (379-494)||(33906028-33906144)
chr5 (392-545)||(9049354-9049506)
chr5 (381-548)||(27015531-27015690)
chr5 (377-544)||(38747009-38747176)
chr5 (381-545)||(3075659-3075823)
chr5 (386-446)||(4160702-4160762)
chr5 (432-494)||(10054867-10054929)
chr5 (377-494)||(42309932-42310048)
chr5 (638-674)||(16407913-16407949)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (179-672)||(20343773-20344266)
chr7 (190-665)||(18388565-18389043)
chr7 (190-665)||(18392001-18392479)
chr7 (190-665)||(6594363-6594841)
chr7 (190-665)||(6592145-6592623)
chr7 (190-665)||(32060127-32060609)
chr7 (332-665)||(24789724-24790059)
chr7 (198-673)||(43503975-43504448)
chr7 (265-674)||(39731243-39731653)
chr7 (478-674)||(1562103-1562296)
chr7 (190-471)||(1560470-1560757)
chr7 (269-669)||(35853787-35854194)
chr7 (198-670)||(48408673-48409152)
chr7 (198-669)||(25766780-25767250)
chr7 (377-674)||(29990922-29991225)
chr7 (198-669)||(4178647-4179118)
chr7 (265-669)||(23554912-23555323)
chr7 (265-618)||(25615785-25616137)
chr7 (377-669)||(14379858-14380157)
chr7 (377-548)||(34310712-34310884)
chr7 (282-668)||(19502051-19502443)
chr7 (377-669)||(14069830-14070129)
chr7 (377-669)||(30024729-30025028)
chr7 (370-548)||(22269973-22270150)
chr7 (269-548)||(27347817-27348095)
chr7 (210-320)||(24790230-24790338)
chr7 (377-548)||(41317431-41317602)
chr7 (381-548)||(8359316-8359485)
chr7 (377-657)||(41649008-41649293)
chr7 (265-669)||(43864116-43864526)
chr7 (265-548)||(18126644-18126928)
chr7 (383-548)||(29608737-29608902)
chr7 (267-548)||(48489431-48489711)
chr7 (385-548)||(6431971-6432134)
chr7 (381-494)||(32358055-32358167)
chr7 (401-669)||(48491451-48491727)
chr7 (377-671)||(31732966-31733267)
chr7 (419-669)||(47673981-47674239)
chr7 (361-530)||(2390301-2390469)
chr7 (377-669)||(47676133-47676432)
chr7 (377-669)||(1113529-1113828)
chr7 (381-548)||(3258995-3259162)
chr7 (265-674)||(4586028-4586443)
chr7 (377-548)||(8153342-8153513)
chr7 (377-657)||(38671219-38671506)
chr7 (381-548)||(48599335-48599502)
chr7 (265-548)||(26417316-26417598)
chr7 (381-548)||(4508707-4508874)
chr7 (386-543)||(22328395-22328556)
chr7 (386-548)||(2360978-2361140)
chr7 (381-548)||(4253529-4253697)
chr7 (546-669)||(24514934-24515056)
chr7 (377-545)||(495980-496148)
chr7 (388-529)||(23565069-23565210)
chr7 (377-548)||(36146405-36146576)
chr7 (381-545)||(31105394-31105558)
chr7 (381-494)||(4510549-4510661)
chr7 (381-494)||(4512391-4512503)
chr7 (370-494)||(6359942-6360065)
chr7 (381-528)||(18396338-18396486)
chr7 (378-523)||(2759195-2759339)
chr7 (291-548)||(36574434-36574683)
chr7 (377-463)||(24525499-24525584)
chr7 (377-548)||(12097864-12098027)
chr7 (476-548)||(23343975-23344048)
chr7 (477-548)||(24525992-24526065)
chr7 (379-455)||(30814530-30814605)
chr7 (388-463)||(31518988-31519063)
chr7 (572-669)||(48489303-48489399)
chr7 (476-544)||(1360248-1360316)
chr7 (605-665)||(18126520-18126579)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (168-668)||(9036298-9036799)
chr1 (215-674)||(40282251-40282711)
chr1 (167-674)||(21053832-21054336)
chr1 (168-674)||(9987076-9987579)
chr1 (215-665)||(20622072-20622523)
chr1 (190-665)||(44203517-44203995)
chr1 (195-674)||(51765262-51765747)
chr1 (263-669)||(20762544-20762952)
chr1 (265-657)||(8550670-8551071)
chr1 (265-549)||(13316238-13316521)
chr1 (265-671)||(3156736-3157147)
chr1 (287-669)||(3189203-3189590)
chr1 (287-669)||(3198020-3198407)
chr1 (287-669)||(3206859-3207246)
chr1 (377-669)||(28220223-28220522)
chr1 (381-548)||(37168297-37168465)
chr1 (269-667)||(44455034-44455438)
chr1 (265-669)||(31659110-31659520)
chr1 (370-548)||(42297964-42298143)
chr1 (381-548)||(13547090-13547257)
chr1 (368-548)||(29136247-29136427)
chr1 (377-657)||(834164-834451)
chr1 (381-548)||(13549001-13549168)
chr1 (377-669)||(28223418-28223717)
chr1 (377-548)||(28265551-28265722)
chr1 (381-548)||(31925708-31925875)
chr1 (381-548)||(47255340-47255508)
chr1 (265-669)||(37503443-37503850)
chr1 (265-669)||(37559751-37560165)
chr1 (381-548)||(11348698-11348865)
chr1 (265-548)||(49918350-49918632)
chr1 (381-548)||(7482231-7482399)
chr1 (377-548)||(37033068-37033241)
chr1 (377-548)||(4552634-4552805)
chr1 (377-548)||(50169207-50169378)
chr1 (381-548)||(47115171-47115340)
chr1 (377-548)||(45644351-45644523)
chr1 (381-548)||(193611-193778)
chr1 (377-657)||(3847118-3847405)
chr1 (379-548)||(19754494-19754664)
chr1 (361-548)||(23555248-23555433)
chr1 (404-669)||(1833394-1833667)
chr1 (385-548)||(34603576-34603740)
chr1 (377-657)||(13659333-13659620)
chr1 (377-548)||(50167172-50167343)
chr1 (377-657)||(196904-197192)
chr1 (377-545)||(46064921-46065089)
chr1 (572-669)||(13316518-13316614)
chr1 (361-548)||(41360914-41361101)
chr1 (377-668)||(13137973-13138269)
chr1 (17-161)||(44907188-44907332)
chr1 (381-463)||(28242391-28242472)
chr1 (377-669)||(10925095-10925397)
chr1 (377-548)||(19752685-19752857)
chr1 (405-543)||(22079322-22079461)
chr1 (431-543)||(13938143-13938256)
chr1 (401-668)||(15820180-15820455)
chr1 (377-548)||(30476443-30476614)
chr1 (361-463)||(36683766-36683866)
chr1 (381-455)||(37876767-37876840)
chr1 (377-545)||(40122193-40122363)
chr1 (409-494)||(5459961-5460046)
chr1 (468-543)||(12318609-12318685)
chr1 (381-527)||(927977-928123)
chr1 (420-494)||(16455676-16455750)
chr1 (475-548)||(37879005-37879079)
chr1 (476-545)||(8871143-8871213)
chr1 (390-534)||(37282701-37282846)
chr1 (477-529)||(6378603-6378655)
chr1 (462-526)||(48382441-48382505)
chr1 (596-669)||(49918221-49918292)
chr1 (468-534)||(3460710-3460778)
chr1 (265-304)||(10925464-10925504)
chr1 (467-530)||(32736952-32737015)
chr1 (467-530)||(35109493-35109556)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (215-670)||(6266569-6267023)
chr2 (190-665)||(12647191-12647669)
chr2 (190-568)||(13655834-13656220)
chr2 (195-671)||(32289442-32289916)
chr2 (198-674)||(4484151-4484632)
chr2 (198-671)||(30833215-30833693)
chr2 (265-669)||(4503019-4503428)
chr2 (265-669)||(45099627-45100036)
chr2 (377-669)||(5723252-5723550)
chr2 (265-669)||(36205551-36205959)
chr2 (265-669)||(36987961-36988371)
chr2 (377-669)||(2334414-2334713)
chr2 (265-669)||(6594890-6595302)
chr2 (265-669)||(38312112-38312522)
chr2 (381-548)||(45726929-45727096)
chr2 (282-548)||(29867869-29868133)
chr2 (377-545)||(34139767-34139936)
chr2 (377-657)||(723741-724028)
chr2 (377-657)||(14633822-14634110)
chr2 (401-657)||(42362236-42362500)
chr2 (377-657)||(11151588-11151875)
chr2 (381-548)||(35446885-35447052)
chr2 (377-548)||(36318006-36318177)
chr2 (377-548)||(36773562-36773733)
chr2 (265-548)||(17057255-17057537)
chr2 (265-548)||(17085238-17085520)
chr2 (377-657)||(11690385-11690672)
chr2 (381-548)||(26353184-26353351)
chr2 (383-548)||(1631735-1631900)
chr2 (381-543)||(33648176-33648340)
chr2 (370-548)||(24398055-24398237)
chr2 (381-494)||(17490149-17490261)
chr2 (377-548)||(33162447-33162618)
chr2 (417-548)||(13121769-13121899)
chr2 (368-548)||(42288099-42288278)
chr2 (377-456)||(17450671-17450748)
chr2 (381-494)||(7451173-7451284)
chr2 (377-548)||(11067305-11067476)
chr2 (377-455)||(39284930-39285007)
chr2 (431-548)||(7815323-7815441)
chr2 (572-669)||(39284757-39284853)
chr2 (380-539)||(24197906-24198065)
chr2 (392-490)||(28671989-28672088)
chr2 (379-425)||(16388519-16388565)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (190-665)||(8395489-8395967)
chr4 (190-665)||(8393280-8393758)
chr4 (190-665)||(7124785-7125265)
chr4 (190-665)||(7122566-7123046)
chr4 (190-665)||(5138174-5138654)
chr4 (190-665)||(5135948-5136429)
chr4 (215-674)||(31495143-31495611)
chr4 (198-669)||(13992114-13992582)
chr4 (265-669)||(56178522-56178932)
chr4 (381-669)||(29999806-30000101)
chr4 (265-669)||(48142914-48143330)
chr4 (265-669)||(52095248-52095658)
chr4 (265-669)||(5369968-5370382)
chr4 (377-669)||(9927455-9927753)
chr4 (370-544)||(2209717-2209893)
chr4 (269-671)||(34570304-34570712)
chr4 (377-669)||(12739547-12739846)
chr4 (377-669)||(5429551-5429850)
chr4 (384-548)||(41964415-41964580)
chr4 (269-669)||(37740498-37740903)
chr4 (381-548)||(40632445-40632612)
chr4 (370-548)||(26364236-26364414)
chr4 (377-669)||(26175633-26175932)
chr4 (377-548)||(36463386-36463557)
chr4 (370-548)||(54883020-54883198)
chr4 (377-546)||(46147388-46147557)
chr4 (381-548)||(46703500-46703669)
chr4 (377-548)||(47038408-47038577)
chr4 (265-669)||(52082549-52082953)
chr4 (381-548)||(12073392-12073560)
chr4 (377-529)||(12743922-12744073)
chr4 (377-529)||(12745311-12745462)
chr4 (381-548)||(41639426-41639593)
chr4 (377-548)||(48893635-48893810)
chr4 (419-669)||(12747794-12748052)
chr4 (379-548)||(36994524-36994693)
chr4 (381-545)||(379383-379548)
chr4 (381-530)||(6655975-6656123)
chr4 (370-546)||(12119540-12119718)
chr4 (379-668)||(54199906-54200201)
chr4 (377-657)||(5871704-5871991)
chr4 (381-548)||(8648139-8648306)
chr4 (401-548)||(8665408-8665556)
chr4 (377-548)||(45687179-45687351)
chr4 (381-494)||(50673848-50673960)
chr4 (370-494)||(50262690-50262814)
chr4 (381-548)||(6542180-6542349)
chr4 (377-545)||(52467351-52467519)
chr4 (377-548)||(27416962-27417133)
chr4 (381-548)||(37229722-37229890)
chr4 (381-548)||(4587958-4588126)
chr4 (381-541)||(5207843-5208003)
chr4 (389-494)||(35662496-35662600)
chr4 (421-529)||(12744087-12744195)
chr4 (421-548)||(12745476-12745604)
chr4 (381-548)||(31474150-31474318)
chr4 (386-533)||(26699447-26699596)
chr4 (282-463)||(29254580-29254758)
chr4 (377-474)||(13009441-13009536)
chr4 (592-669)||(52093885-52093960)
chr4 (431-548)||(24969112-24969230)
chr4 (377-463)||(3913534-3913618)
chr4 (405-494)||(33989899-33989989)
chr4 (462-543)||(44967910-44967992)
chr4 (381-548)||(51337064-51337231)
chr4 (407-456)||(33089972-33090021)
chr4 (370-546)||(21688250-21688427)
chr4 (290-327)||(29056573-29056610)
chr4 (476-544)||(48142473-48142542)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (190-665)||(2409-2887)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (214-665)||(3557-4009)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (190-673)||(6150-6638)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (195-674)||(10979-11463)
scaffold0491 (195-674)||(8553-9037)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (215-669)||(434405-434863)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (265-669)||(789-1198)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (215-548)||(11557-11895)
scaffold0286 (598-669)||(22216-22286)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (214-413)||(1-202)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (198-548)||(114602-114949)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (265-548)||(20301-20583)
scaffold0066 (592-669)||(20636-20711)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (381-548)||(7327-7494)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (381-548)||(18004-18171)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (381-492)||(10546-10656)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (377-657)||(149094-149381)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 54635505 - 54634999
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaa 267  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54635505 tgttgtggattccgatcgcctagatcgagtcacaccaatactaaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaa 54635406  T
Q  268 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54635405 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 54635307  T
Q  368 agcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54635306 agcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 54635207  T
Q  467 gatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635206 gatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctct 54635107  T
Q  567 ctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635106 ctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctctc 54635007  T
Q  667 ttccaact 674  Q
    ||||||||    
T  54635006 ttccaact 54634999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6716881 - 6716375
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6716881 tgttgtgaattccgatcacctagatcgaaccacaccaatgcaaa-gagtgatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaa 6716783  T
Q  268 gcaataatcaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716782 gcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 6716683  T
Q  367 aagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaag 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6716682 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 6716583  T
Q  466 ggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716582 ggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 6716483  T
Q  566 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716482 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctct 6716383  T
Q  666 cttccaac 673  Q
    ||||||||    
T  6716382 cttccaac 6716375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 179 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45283356 - 45282864
Alignment:
Q  179 ccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaa 278  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45283356 ccgatcgcctagatcgaaccacaccaatacaaa-gaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaataatcaa 45283258  T
Q  279 caaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaag 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283257 caaaacaccacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaag 45283159  T
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaa---gggataca 472  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||    
T  45283158 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggataca 45283059  T
Q  473 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45283058 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgc 45282959  T
Q  573 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45282958 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaagtctctctctct 45282864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 3617813 - 3617333
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  3617813 gatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 3617714  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  3617713 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 3617614  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  3617613 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 3617514  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617513 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 3617414  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3617413 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 3617333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 190 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25637793 - 25637304
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||  || |||||||||||    
T  25637793 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtgtattgtgcaagcaggaaacaacaaaacac 25637694  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaagga-tcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25637693 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattg 25637594  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  25637593 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtta 25637494  T
Q  481 caagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25637493 caagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 25637396  T
Q  581 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637395 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatac-ccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 25637304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 4600549 - 4601028
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||| | || |||||||||||    
T  4600549 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagccagaaacaacaaaacac 4600648  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgt 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  4600649 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 4600746  T
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  4600747 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttac 4600846  T
Q  482 aagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4600847 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 4600944  T
Q  581 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4600945 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 4601028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 4598328 - 4598807
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| || ||| |||||||    
T  4598328 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaataaaacac 4598427  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgt 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  4598428 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgg 4598525  T
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  4598526 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 4598625  T
Q  482 aagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  4598626 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtt 4598723  T
Q  581 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4598724 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 4598807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10211758 - 10211279
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  10211758 gatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 10211659  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgt 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||     
T  10211658 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattgg 10211561  T
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  10211560 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10211461  T
Q  482 aagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10211460 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtt 10211363  T
Q  581 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10211362 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 10211279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10209538 - 10209059
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  10209538 gatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 10209439  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgt 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||     
T  10209438 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacacaaagagattgg 10209341  T
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  10209340 tcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttac 10209241  T
Q  482 aagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10209240 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtt 10209143  T
Q  581 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10209142 tcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 10209059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10056582 - 10056103
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10056582 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10056484  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10056483 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10056386  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  10056385 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10056286  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10056285 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10056188  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10056187 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 10056103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10058804 - 10058325
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10058804 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10058706  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10058705 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10058608  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  10058607 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10058508  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10058507 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10058410  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10058409 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 10058325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10061026 - 10060547
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10061026 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10060928  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10060927 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10060830  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  10060829 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10060730  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10060729 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10060632  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10060631 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 10060547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10063248 - 10062769
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10063248 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10063150  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10063149 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10063052  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  10063051 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10062952  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10062951 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10062854  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10062853 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 10062769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10065470 - 10064991
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10065470 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10065372  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10065371 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10065274  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  10065273 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 10065174  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10065173 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 10065076  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10065075 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 10064991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 198 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 801435 - 800973
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacac--cacctagat 295  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  801435 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaat-aaagtgtgtg--caagcaataatcaacaaaaaacagcacctagat 801340  T
Q  296 ctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcg 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || |     |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  801339 ctaatctaggaaacaagtg-gaaaaacacaata-----cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcg 801246  T
Q  396 gtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-c 492  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||      
T  801245 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagat 801146  T
Q  493 ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-t 591  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||      
T  801145 ttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcc 801047  T
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  801046 caacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttcttcctttgatttcccaagtttctctctc 800973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 195 - 585
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7780208
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaa-caccacctag 293  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaaaaacagcacctag 7779916  T
Q  294 atctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagt 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  7779917 atctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccact 7780015  T
Q  393 tcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag- 491  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7780016 ttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattaga 7780115  T
Q  492 cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780116 tttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Original strand, 23199957 - 23200438
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctaga 294  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  23199957 aaccacaccaatacaaa-gtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataaaacacctaga 23200052  T
Q  295 tctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccag 391  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23200053 tctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcat---aagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccag 23200148  T
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  23200149 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaatta 23200247  T
Q  491 gc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 582  Q
    || ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||     
T  23200248 gctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 23200346  T
Q  583 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200347 caatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 23200438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 265 - 674
Target Start/End: Original strand, 23197824 - 23198239
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaa 361  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||   |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  23197824 caagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaag---cacaagataaaaggagagagaagaggaa 23197920  T
Q  362 aacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctaca 461  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  23197921 aacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttaca 23198019  T
Q  462 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagaca 552  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||    
T  23198020 aaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagaca 23198117  T
Q  553 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||     
T  23198118 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttt 23198216  T
Q  652 ccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  23198217 ccaagtttctctctcttccaact 23198239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 458 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 10067418 - 10067213
Alignment:
Q  458 tacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactca 556  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10067418 tacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactca 10067319  T
Q  557 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaag 656  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10067318 atgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10067222  T
Q  657 tctctctct 665  Q
    |||||||||    
T  10067221 tctctctct 10067213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 265 - 674
Target Start/End: Original strand, 9636010 - 9636428
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||  |||||   ||||||||||||||| || | |||       
T  9636010 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaag---cacaagataaaaggg-agagcagagag 9636105  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9636106 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac 9636205  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaag 549  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       ||||||    
T  9636206 aaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaag 9636303  T
Q  550 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgat 648  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9636304 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttcttcctttgat 9636402  T
Q  649 ttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9636403 ttcccaagtttctctctcttccaact 9636428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 514 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718559
Alignment:
Q  514 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  614 aaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 673  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 6718559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Original strand, 5257983 - 5258440
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5257983 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 5258079  T
Q  313 tgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 410  Q
    ||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5258080 tgaaaagcacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacct 5258173  T
Q  411 actctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccat 508  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  5258174 actctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 5258272  T
Q  509 gaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 598  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  5258273 gaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 5258371  T
Q  599 agagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5258372 agaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttctccctttgatttctcaagtttctctctcttc 5258440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095037
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa- 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||     
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 45095237  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  45095236 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 45095138  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  45095137 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcttttgatttcccaagtttctctctc 45095040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Original strand, 5260162 - 5260619
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |    
T  5260162 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaag 5260258  T
Q  313 tgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 410  Q
    ||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5260259 tgaaaagcacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacct 5260352  T
Q  411 actctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccat 508  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  5260353 actttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 5260451  T
Q  509 gaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 598  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  5260452 gaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 5260550  T
Q  599 agagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5260551 agaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 5260619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 657
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684173
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa-acaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 19683871  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  19683872 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 19683969  T
Q  463 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  19683970 aagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagaca 19684068  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
     ||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |    ||||||||||    
T  19684069 ttcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgattt 19684166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 37408737 - 37408331
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||  |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||||||    
T  37408737 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaa 37408640  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  37408639 acacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 37408542  T
Q  467 gatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  37408541 gatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 37408443  T
Q  557 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaa 655  Q
    || ||| || ||    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  37408442 ataattttcactcactaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaa 37408345  T
Q  656 gtctctctctcttc 669  Q
    || |||||||||||    
T  37408344 gtttctctctcttc 37408331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7764747 - 7764340
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  7764747 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaa 7764650  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  7764649 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 7764552  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacac 553  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||    
T  7764551 aagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc--tctcaccaatgaacaagacac 7764455  T
Q  554 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcc 652  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  7764454 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-aatctaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttcc 7764357  T
Q  653 caagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| |||||||||||    
T  7764356 caagtttctctctcttc 7764340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 265 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7762548 - 7762140
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  7762548 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 7762451  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  7762450 acaaacacatcat-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 7762353  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagaca 552  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||    
T  7762352 aagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagaca 7762254  T
Q  553 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||  | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  7762253 ctcaatgattttcactcaccaaggtgttcacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttc 7762156  T
Q  652 ccaagtctctctctct 667  Q
    |||||| |||||||||    
T  7762155 ccaagtttctctctct 7762140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 9581565 - 9581167
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| |  | ||||| |||||  ||||| |||||   ||    
T  9581565 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaa--gggagagaagagagaa 9581468  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  9581467 acaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 9581370  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacac 553  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||    
T  9581369 aagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacac 9581271  T
Q  554 tcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    ||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |    |||||||||||    
T  9581270 tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttc 9581173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10067669 - 10067435
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  10067669 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 10067571  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10067570 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 10067473  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagagg 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10067472 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |    
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 34491286  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491285 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153645
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagggatacaaatg 39153455  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  39153456 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttc- 39153553  T
Q  567 cttta--caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
     || |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  39153554 attcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 39153645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 49199458 - 49199638
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  49199458 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 49199556  T
Q  470 acaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199557 acaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735255
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaact 40735457  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  40735456 ggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40735358  T
Q  567 c-tttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    | ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  40735357 cttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 40735260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 43401790 - 43401970
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  43401790 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 43401888  T
Q  470 acaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401889 aaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 29196480  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196481 ggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734370
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 40734572  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  40734571 tgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40734473  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctct 663  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| |    
T  40734472 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgattttccaagtttctgt 40734376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 5236343 - 5236752
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| | |  | || ||||||||||| |||   ||| |||     
T  5236343 caagcaataatcaacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa- 5236441  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
     ||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  5236442 -caaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaa 5236537  T
Q  463 aagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  5236538 a-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 5236635  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||| |||||    
T  5236636 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctccttcgattt 5236733  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  5236734 cccaagtttctctctcttc 5236752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30236303 - 30236129
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  30236303 caccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 30236206  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236205 acaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 377 - 668
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744721
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 32744530  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttaca 573  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||   ||    
T  32744531 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaatgattttcactcacca 32744627  T
Q  574 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctctt 668  Q
    | |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32744628 atgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctctt 32744721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 761189 - 760731
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatc 296  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||     ||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  761189 cacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaa-aatcaaagtgaac--tcaagcaataa-caacaatagcagcacctagatc 761095  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcg 395  Q
    ||||||||||| ||| |||| || | |||||| |  | || ||||||||    ||| |||||   |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||     
T  761094 taatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa----gagagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttca 761000  T
Q  396 gtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  760999 gtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctt 760902  T
Q  495 -gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttccc 584  Q
      ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||       
T  760901 aaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttata 760803  T
Q  585 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  760802 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaagt 760731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 267 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 51399094 - 51398686
Alignment:
Q  267 agcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaac 364  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |||    
T  51399094 agcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggaac 51398997  T
Q  365 aaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaa 464  Q
    |||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  51398996 aaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaa 51398900  T
Q  465 gggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacact 554  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||       | |||||||||    
T  51398899 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacact 51398801  T
Q  555 caatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcc 652  Q
    |||||||| || ||  | |||||||||| | || |||  |||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| | |  ||||||||||||    
T  51398800 caatgattttcactcatccaaggtgtttacaatatttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 51398703  T
Q  653 caagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  51398702 caagtttctatctcttc 51398686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682267
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 29682433  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  29682432 ggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttca 29682334  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaa 633  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29682333 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaa 29682267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||| |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 44331619  T
Q  477 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44331618 gcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 373 - 548
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403913
Alignment:
Q  373 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggataca 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaa 43403834  T
Q  473 aaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | |   |||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403835 acatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaata 44700572  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700573 ggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 388 - 545
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  388 ccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 486  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaa 22835107  T
Q  487 attagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22835108 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314447
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||      
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa-agatacaaatg 31314519  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 546  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314518 ggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29811150 - 29810868
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  29811150 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagatga 29811053  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||  || ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  29811052 acaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtttaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 29810956  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  29810955 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 40913471 - 40913352
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||    
T  40913471 caccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaagagat 40913374  T
Q  470 acaaaag-gttacaagaaatta 490  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  40913373 acaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 388 - 548
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  388 ccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaa 53921608  T
Q  487 attagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||| || ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921609 attagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||| ||||      
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatgcaaatg 29813137  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813136 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  388 ccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 486  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 32891167  T
Q  487 attagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 546  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891166 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 46173535 - 46173377
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||    
T  46173535 caccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagat 46173438  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173437 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16498914
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||      
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 16499103  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | || |  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  16499102 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 16499005  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||| | |  |||||||||||||||||    
T  16499004 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaagt 16498914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 488
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  480 acaagaaat 488  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666632
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || || ||| |    
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagagg-tataaatg 9666560  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9666561 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcac 9666632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392077
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||      
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgatacaaatg 23392003  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23392004 ggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 47304429 - 47304344
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 456  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47304429 caccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 47304344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 543
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta 527  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttcta 4055910  T
Q  528 cccttttcccaatctc 543  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4055911 cccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 548
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  420 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccc 518  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||  |||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  519 taatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 548
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 674
Target Start/End: Original strand, 7782375 - 7782442
Alignment:
Q  606 ctctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7782375 ctctaatcaaaga-ctctaaaacctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 7782442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 448
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  389 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatca 448  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 592 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 29813010 - 29812935
Alignment:
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29813010 caacccaagaga-actttaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 29812935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 449
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075143
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaa 449  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Original strand, 9634707 - 9634750
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9634707 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 9634750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075581
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa--aggttacaagaaatta 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36018982 - 36018852
Alignment:
Q  419 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaa 515  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||    
T  36018982 ggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaac-aa 36018886  T
Q  516 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018885 ccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 536
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  477 gttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 536  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25690335 - 25689838
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaa 267  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25690335 tgttgtgaatcccgacctccaagatcgaaccacaccaatacaaa-gaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaa 25690237  T
Q  268 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa- 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25690236 gcaagaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacac-tcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaac 25690138  T
Q  367 aagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaag 465  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25690137 aaacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 25690038  T
Q  466 ggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690037 ggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 25689938  T
Q  566 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689937 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 25689838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3439886 - 3439385
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctcc---ttgatcgaaccacaccaatac-aaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgt 263  Q
    ||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3439886 tgttgtgaattccgatcaccacttagatcgaaccacaccaatactaaaaaaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtg- 3439788  T
Q  264 tcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaa 363  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3439787 -caagcaacaatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 3439690  T
Q  364 caaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3439689 caaaagcaccaaagagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 3439590  T
Q  463 aagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439589 aagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt 3439490  T
Q  563 ctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctc 662  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3439489 ttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttctcaagtctctc 3439390  T
Q  663 tctct 667  Q
    |||||    
T  3439389 tctct 3439385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 15290887 - 15290408
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | |  ||||||| || |||||| ||||    
T  15290887 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 15290788  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |    
T  15290787 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggac 15290688  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  15290687 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 15290588  T
Q  484 gaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 582  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15290587 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttc 15290490  T
Q  583 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15290489 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 15290408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 15471256 - 15470777
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | |  ||||||| || |||||| ||||    
T  15471256 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 15471157  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |    
T  15471156 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggac 15471057  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  15471056 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 15470957  T
Q  484 gaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 582  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15470956 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttc 15470859  T
Q  583 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15470858 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 15470777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 42575130 - 42575608
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  42575130 gatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 42575229  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgtt 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  42575230 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacca--aacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggt 42575327  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttaca 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  42575328 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 42575427  T
Q  483 agaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 581  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42575428 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 42575525  T
Q  582 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42575526 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaagtctctctct 42575608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627609
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataa-tcaacaa-aacaccaccta 292  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagcaaaaaatcaacaataacaacaccta 2627992  T
Q  293 gatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2627991 gatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcacccagt 2627893  T
Q  393 tcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaatta 490  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  2627892 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaatta 2627793  T
Q  491 g-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2627792 gatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtt 2627694  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2627693 tcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 2627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31218586 - 31218129
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31218586 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaag 31218490  T
Q  313 tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 412  Q
    ||| || |||||||||   | |||||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218489 tgaaaagcacaaaacata-agcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 31218394  T
Q  413 tctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatga 510  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  31218393 tctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga 31218295  T
Q  511 acaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaag 600  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  31218294 ac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 31218196  T
Q  601 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31218195 aga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 31218129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 34254217 - 34254624
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  34254217 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 34254311  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  34254312 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac 34254410  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  34254411 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagac 34254508  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  34254509 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttc 34254606  T
Q  652 ccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| |||||||||||    
T  34254607 ccaagtttctctctcttc 34254624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 17982935 - 17982525
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||       
T  17982935 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagag 17982841  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  17982840 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttc 17982743  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 549  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||    
T  17982742 caaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 17982644  T
Q  550 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgat 648  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17982643 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgat 17982546  T
Q  649 ttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  17982545 ttcccaagtttctctctcttc 17982525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 265 - 657
Target Start/End: Original strand, 34256393 - 34256788
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  34256393 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 34256487  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34256488 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 34256586  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||    
T  34256587 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagac 34256684  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    ||||||||||| || |    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  34256685 actcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttc 34256782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 42498477 - 42498066
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |  | || ||||||||||| |||  |||| | ||    
T  42498477 caagcaataattaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaa 42498380  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  42498379 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 42498282  T
Q  463 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||    
T  42498281 aagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagac 42498183  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | | ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  42498182 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaacgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 42498085  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  42498084 cccaagtttctctctcttc 42498066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 669
Target Start/End: Original strand, 19945199 - 19945656
Alignment:
Q  216 tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagt 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19945199 tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagt 19945295  T
Q  314 gagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 411  Q
    || || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19945296 gaaaagcacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgaccta 19945389  T
Q  412 ctctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccat 508  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  19945390 ctctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 19945488  T
Q  509 gaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 598  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||    
T  19945489 gaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgaccca 19945587  T
Q  599 agagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19945588 agaga-actctaatcaaag-actctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttgtctctcttc 19945656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44304137 - 44303726
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  44304137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 44304043  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  44304042 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta- 44303945  T
Q  461 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caa 548  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       |||    
T  44303944 aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaa 44303846  T
Q  549 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttga 647  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||    
T  44303845 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtttcctttga 44303748  T
Q  648 tttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  44303747 tttctcaagtttctctctcttc 44303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 378 - 671
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746516
Alignment:
Q  378 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-g 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagg 1746313  T
Q  477 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  1746314 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 1746412  T
Q  567 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  1746413 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagaga-actctaatc-aaggaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctct 1746510  T
Q  666 cttcca 671  Q
    ||||||    
T  1746511 cttcca 1746516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 669
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702934
Alignment:
Q  287 cacctagatctaatctaggaaac--aagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 384  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||| |  | |||||||||||  ||||| |||||   |||||||   ||||| ||||||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaa--gggagagaagagagaaacaaacataccaa-agattgtt 12702638  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaa 483  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| || |||||| ||||||||    
T  12702639 gacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagacacaaaagggttacaa 12702736  T
Q  484 gaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc------ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 569  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||       ||||||||| ||||||| || ||     
T  12702737 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactc 12702835  T
Q  570 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctctt 668  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12702836 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaagtttctctctctt 12702933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 282 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43036687 - 43036295
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || | |||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    ||||||  |||||| ||||    
T  43036687 aacaccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggaacaaacacaccaa-agat 43036591  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |  ||    
T  43036590 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgaatt 43036493  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-t 569  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  43036492 acaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 43036394  T
Q  570 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctctt 668  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43036393 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctctt 43036296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15213064 - 15212658
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||| | |  | || ||||||||  ||||| |||||    |||||    
T  15213064 caataatcaacaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggaacaa 15212967  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||     
T  15212966 acacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaaga 15212870  T
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||    
T  15212869 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattca 15212771  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttccca 654  Q
    |||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  | ||||||||||||    
T  15212770 atgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcatttgatttccca 15212673  T
Q  655 agtctctctctcttc 669  Q
    ||| |||||||||||    
T  15212672 agtttctctctcttc 15212658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 377 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352020
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33352224  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  33352223 ggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 33352125  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
     |    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||| ||||||    
T  33352124 atcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttaccttctttgatttcccaagtttctctc 33352027  T
Q  665 tcttcca 671  Q
    |||||||    
T  33352026 tcttcca 33352020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 377 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811148
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||      
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatg 27811352  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  27811351 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 27811253  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  27811252 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaattttctctc 27811155  T
Q  665 tcttcca 671  Q
    |||||||    
T  27811154 tcttcca 27811148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4731936 - 4731530
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |||||    
T  4731936 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggaacaa 4731839  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  4731838 acacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 4731742  T
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  4731741 gatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 4731643  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttccca 654  Q
    |||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||  ||    
T  4731642 atgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttttca 4731545  T
Q  655 agtctctctctcttc 669  Q
    ||| |||||||||||    
T  4731544 agtttctctctcttc 4731530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 377 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatac-aaaa 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||      
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttac-aaagagatactaatg 40321154  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 546  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321153 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 485  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaaga 18141884  T
Q  486 aattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141883 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 30143622 - 30143214
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  30143622 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 30143525  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| || |||||| || ||| ||||||||  ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  30143524 acaaacacaccaa-agattgttgactcagttcagttcaa-cttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 30143428  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-----gacact 554  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||      | ||     
T  30143427 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagaca 30143329  T
Q  555 caatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcc 652  Q
    |||||||| || ||    ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||    
T  30143328 caatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 30143231  T
Q  653 caagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| |||||||||||    
T  30143230 caagtttctctctcttc 30143214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303838
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 3303764  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3303765 agttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatg 40221819  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221818 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598856
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||      
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6599046  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||     
T  6599045 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6598947  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  6598946 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaagt 6598856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674309
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||      
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6674499  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||     
T  6674498 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6674400  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  6674399 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaagt 6674309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30291737 - 30291606
Alignment:
Q  419 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaac 516  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||     
T  30291737 ggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaa 30291639  T
Q  517 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291638 cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 546
Target Start/End: Original strand, 10930189 - 10930365
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||    
T  10930189 caccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagat 10930286  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 546  Q
    | |||  |||||||||||||||||||  || || |||| | || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930287 ataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  407 acctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  504 accatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689326
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 5689345  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5689344 ggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 494
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366727
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagggatacaaata 41366708  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt 494  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  41366709 ggttaaaagaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 473
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743306
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaa 473  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac 528  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 9765766  T
Q  529 cc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  9765765 ccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||| |||||| | |||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 544  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 19491680 - 19491867
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| | | ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  19491680 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac 19491778  T
Q  461 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491779 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-tt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||   |||||| || ||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaa-gagatataaaagggtt 8965789  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||||||| ||| | |||  |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  419 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaac 516  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 44353826  T
Q  517 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 548
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaga 1292567  T
Q  486 aattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292568 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 1345368 - 1345536
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggataca-aaa 475  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | | |||| |||||| |      
T  1345368 agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacatatg 1345465  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1345466 ggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcac 1345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015136
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttcct--aaaagagatacaaatgagttacaag 10015146  T
Q  485 aaattagctt 494  Q
    ||||||||||    
T  10015145 aaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162516
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc 530  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 669
Target Start/End: Original strand, 19948554 - 19948617
Alignment:
Q  605 actctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19948554 actctaatcaaaga-ctctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 19948617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733792
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 494
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaaag--atacaaatgagttacaag 18106181  T
Q  485 aaattagctt 494  Q
    ||||||||||    
T  18106182 aaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 546 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 10929794 - 10929685
Alignment:
Q  546 caagacactcaatgattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctt 644  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | |||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| | |  ||||    
T  10929794 caagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaatgttcccaacccaagaga-actctaatcaaagacccc--aaccctaaagttacctcctt 10929698  T
Q  645 tgatttcccaagt 657  Q
    |||||||||||||    
T  10929697 tgatttcccaagt 10929685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 572 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4733777 - 4733683
Alignment:
Q  572 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  4733777 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcttttgatttcccaagtttctctctct 4733683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 472 - 543
Target Start/End: Original strand, 29796413 - 29796485
Alignment:
Q  472 aaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29796413 aaaatgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43036767 - 43036720
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43036767 cacaccaatacaaaa-aatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 43036720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Original strand, 1746105 - 1746148
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1746105 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 1746148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4734051 - 4734004
Alignment:
Q  199 acaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 246  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4734051 acaccaatacaaaccaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 4734004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902135
Alignment:
Q  288 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaaac 32902135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Original strand, 3303494 - 3303541
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 246  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3303494 cacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaacca 3303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactct-gaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 27648232 - 27647737
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27648232 tgttgtgaattccgatcacctagatcgaaccacaccaatacaa--gaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgtgtgcaa 27648135  T
Q  268 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27648134 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaataca-------caagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 27648042  T
Q  368 agcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaaggg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27648041 agcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 27647942  T
Q  468 atacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647941 atacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc 27647842  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647841 --tacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagtctctctctct 27647744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16555228 - 16554744
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  16555228 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccac 16555131  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16555130 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16555032  T
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555031 cccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16554932  T
Q  486 aattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554931 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16554832  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16554831 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgattccccaagtctctctcacttccaact 16554744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16631784 - 16631300
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  16631784 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccac 16631687  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16631686 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16631588  T
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631587 cccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16631488  T
Q  486 aattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631487 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16631388  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16631387 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgattccccaagtctctctcacttccaact 16631300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Original strand, 16578327 - 16578811
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  16578327 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccac 16578424  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16578425 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16578523  T
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578524 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16578623  T
Q  486 aattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16578624 aattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttccca 16578723  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16578724 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgattccccaagtctctctcacttccaact 16578811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16617053 - 16616569
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  16617053 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccac 16616956  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16616955 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16616857  T
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616856 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16616757  T
Q  486 aattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16616756 aattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttccca 16616657  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16616656 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgattccccaagtctctctcacttccaact 16616569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16653471 - 16652987
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  16653471 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccac 16653374  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16653373 ctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16653275  T
Q  387 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaaga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653274 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16653175  T
Q  486 aattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653174 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16653075  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16653074 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgattctccaagtctctctcacttccaact 16652987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25421669 - 25421189
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  25421669 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25421570  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25421569 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 25421470  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25421469 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 25421370  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421369 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 25421270  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25421269 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 25421189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6027609 - 6027132
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||| | || ||||||| || |||||||||||    
T  6027609 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6027510  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  6027509 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatgg-agggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 6027411  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6027410 acccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 6027311  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6027310 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 6027213  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6027212 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 6027132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 34167443 - 34166964
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  34167443 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacac 34167344  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34167343 cacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 34167244  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34167243 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 34167144  T
Q  484 gaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 582  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34167143 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 34167046  T
Q  583 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34167045 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 34166964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 33341908 - 33342389
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||| || |||||||||||    
T  33341908 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 33342007  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa---aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagatt 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33342008 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 33342105  T
Q  382 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggtt 479  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||| |||||    
T  33342106 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggtt 33342205  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 578  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33342206 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtg 33342303  T
Q  579 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342304 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 33342389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 34165221 - 34164742
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | |  ||||||| || ||||||| |||    
T  34165221 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-cac 34165123  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattg 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  34165122 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattg 34165025  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  34165024 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtta 34164925  T
Q  481 caagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34164924 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgt 34164827  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34164826 ttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 34164742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 198 - 665
Target Start/End: Original strand, 3072580 - 3073045
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaac-accacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  3072580 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaaaaatagcacatagatc 3072675  T
Q  297 taatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcgg 396  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3072676 taatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgg 3072774  T
Q  397 tccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-ct 493  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |    
T  3072775 tccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatt 3072874  T
Q  494 tgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tc 592  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  3072875 tgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttccc 3072973  T
Q  593 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3072974 aacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagtttctctct 3073045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 412437 - 411976
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctaga 294  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||||    
T  412437 aaccacaccaataccaa-gtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtg------------------caacagcacctaga 412357  T
Q  295 tctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcacc-aagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  412356 tctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaatac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagtt 412258  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag 491  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  412257 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattag 412158  T
Q  492 -cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 590  Q
      |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  412157 atttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttt 412059  T
Q  591 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  412058 tcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttctcaagtttctctctcttccaact 411976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 13154278 - 13153893
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | |  ||||||| || |||||| ||||    
T  13154278 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacac 13154179  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||    
T  13154178 cacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtc 13154079  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13154078 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 13153979  T
Q  484 gaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 568  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153978 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 210 - 667
Target Start/End: Original strand, 6097281 - 6097728
Alignment:
Q  210 aaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  6097281 aaagaatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaa 6097377  T
Q  309 caagtg-agaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttg 406  Q
    |||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097378 caagtggaaaaacacaatacaca-atcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 6097476  T
Q  407 acctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcac 505  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||           |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6097477 acctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcac 6097566  T
Q  506 catgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 604  Q
     | |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  6097567 aaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagat 6097665  T
Q  605 actctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6097666 actctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctct 6097728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171827
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 2171462  T
Q  313 tgagaaa---cacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 409  Q
    ||| |||   || ||||||   | ||||||||||||||| || |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171463 tgaaaaaaaacataaaacaca-agcacaagataaaaggg-agagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 2171560  T
Q  410 tactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccat 508  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  2171561 tactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 2171659  T
Q  509 gaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 599  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  2171660 gaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 2171758  T
Q  600 gagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2171759 gagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttc 2171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 11423307 - 11423467
Alignment:
Q  7 gagagatgaatgtgaggttggaaaatgaaatttgaaatcttgtgagtttataaagaatcttttagaaggtggcatttttggattcatttcaatgaaagaa 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11423307 gagagaagaatgtgaggttggaaaatgaaatttaaaatcttgtgagtttataaagaatcttttagaaggtggcatttttggattcatttcaatgaaagaa 11423406  T
Q  107 gaagcttcatcataagcatcaagagaagttctaaaggagtcatcaaggctttctacaagtg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11423407 gaagcttcatcataagcatcaagagaagttctaaaggagtcatcaaggctttctacaagtg 11423467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 31404561 - 31404970
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  31404561 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 31404655  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31404656 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 31404754  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  31404755 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagac 31404852  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  31404853 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgattt 31404951  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31404952 cccaagtttctctctcttc 31404970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 198 - 669
Target Start/End: Original strand, 30834357 - 30834832
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | | |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30834357 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 30834452  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacaca-aaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttc 394  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||| |  | || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  30834453 taatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagataaacaaacacaccaa-agattattcacccagttc 30834549  T
Q  395 ggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc- 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  30834550 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagct 30834648  T
Q  493 ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   | |||||||| |    
T  30834649 ttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttac 30834747  T
Q  584 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30834748 aatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaagtttctctctcttc 30834832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 16452214 - 16452625
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||  ||||| |  | || |||||||| |||  ||||       
T  16452214 caagcaataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagca--aaaatataaaaggagag--aagagag 16452309  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16452310 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttc 16452407  T
Q  461 aaaagggata-caaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 549  Q
     |||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||    
T  16452408 caaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 16452506  T
Q  550 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgat 648  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||  |||||||    
T  16452507 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaactctaaagttgcttactttgat 16452604  T
Q  649 ttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  16452605 ttcccaagtttctctctcttc 16452625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 5406196 - 5406494
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa- 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||     
T  5406196 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 5406294  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  5406295 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5406393  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5406394 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctc 5406491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 5410521 - 5410819
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa- 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||     
T  5410521 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 5410619  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  5410620 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5410718  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5410719 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctc 5410816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 5413281 - 5413688
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  5413281 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 5413375  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5413376 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 5413473  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  5413474 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagac 5413571  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  5413572 actcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgattt 5413669  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  5413670 cccaagtttctctatcttc 5413688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 11437843 - 11437992
Alignment:
Q  21 aggttggaaaatgaaatttgaaatcttgtgagtttataaagaatcttttagaaggtggcatttttggattcatttcaatgaaagaagaagcttcatcata 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11437843 aggttggaaaatcaaatttgaaatcttgtgagtttataaagaatcttcttgaagatggcattcttggatccatttcaatgaaggaagaagcttcatcaga 11437942  T
Q  121 agcatcaagagaagttctaaaggagt---catcaaggctttctacaagtg 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| ||||    
T  11437943 agcatcaagataagttctaaaggaagaaccatcaaggctttctactagtg 11437992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 9182917 - 9183327
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||         
T  9182917 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggg 9183014  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 9183111  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||    
T  9183112 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 9183210  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  9183211 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 9183308  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  9183309 cccaagtttctctctcttc 9183327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 282 - 671
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160652
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||| || || |||||   |||||||  |||||| ||||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaagg-agagaagagagaaacaaacacaccaa-agat 33160351  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  33160352 tgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 33160450  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcacc-------aagacactcaatga-ttctctct 568  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||| || || ||    
T  33160451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcact 33160549  T
Q  569 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaag-tctctctctc 666  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| | |  ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  33160550 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgattccccaagttttctctctc 33160647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 372 - 548
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  372 ccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatac 471  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac 3808797  T
Q  472 aaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808798 aaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 2973037  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973038 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568927
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||            |    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa------------g 16569107  T
Q  477 gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt-taca 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||| || |||   ||    
T  16569106 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttaccca 16569010  T
Q  574 aggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  |  | |||||||||||||||||    
T  16569009 aggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaatttaattcctttgatttcccaagt 16568927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 477
Target Start/End: Original strand, 5408956 - 5409164
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  5408956 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 5409050  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5409051 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 5409148  T
Q  461 aaaagggatacaaaagg 477  Q
     |||| |||||||||||    
T  5409149 -aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagtt 17763060  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 11430492 - 11430604
Alignment:
Q  17 tgtgaggttggaaaatgaaatttgaaatcttgtgagtttataaagaatcttttagaaggtggcatttttggattcatttcaatgaaagaagaagcttcat 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  11430492 tgtgaagttggaaaatcaaattttaaatcttgtgagtttatgaaaaatcttctagaaggtggcattcttggatccatttcaatgaaggaagaaccttcat 11430591  T
Q  117 cataagcatcaag 129  Q
    ||| | |||||||    
T  11430592 catcatcatcaag 11430604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Original strand, 6136108 - 6136216
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-gtgttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  6136108 gatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6136207  T
Q  287 cacctagat 295  Q
    |||||||||    
T  6136208 cacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-tt 479  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 546  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 634
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137669
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-t 569  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 28137605  T
Q  570 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaag 634  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28137606 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaag 28137669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 494
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603201
Alignment:
Q  373 caagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggataca 472  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagataca 603178  T
Q  473 aa-aggttacaagaaattagctt 494  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  603179 aatgggttacaagaaattagctt 603201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa---gg 477  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  478 ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| | |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacagatg 26954380  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 545  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954381 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211481
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||| |||||| | |||||||| |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg 33211279  T
Q  477 -gttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag-------acactcaatgattctct 566  Q
     | |||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||     
T  33211280 agctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaa-ccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttca 33211378  T
Q  567 ctttac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
     |   | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33211379 gtgacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaactgtaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 33211476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 548
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  404 ttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 501  Q
    |||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  502 tcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  479 tacaagaaattagctt 494  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13159134 - 13159066
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  13159134 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaag 13159066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctac 528  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  529 ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  4045442 cattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16553019 - 16552976
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaagg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16553019 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaagg 16552976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16629575 - 16629532
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaagg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16629575 gatcgaaccacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaagg 16629532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29720743 - 29720238
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaaga-atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttca 266  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29720743 tgttgtgaattccgatctcaag--tcgaaccacaccaatacaagaaatatgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtaca 29720646  T
Q  267 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720645 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 29720547  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29720546 agacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 29720447  T
Q  467 gatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29720446 gatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 29720347  T
Q  566 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29720346 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctct 29720247  T
Q  666 cttccaact 674  Q
    |||||||||    
T  29720246 cttccaact 29720238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 191 - 674
Target Start/End: Original strand, 29750969 - 29751454
Alignment:
Q  191 atcgaaccacaccaatacaaaaga-atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccac 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29750969 atcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccac 29751068  T
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaagagattgttcacc 388  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29751069 ctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacc 29751167  T
Q  389 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751168 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 29751267  T
Q  489 tagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 587  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29751268 tagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 29751367  T
Q  588 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751368 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 29751454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29722903 - 29722398
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaaga-atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttca 266  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29722903 tgttgtgaattccgatctcaag--tcgaaccacaccaatacaagaaatatggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtaca 29722806  T
Q  267 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722805 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 29722707  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29722706 agacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 29722607  T
Q  467 gatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29722606 gatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 29722507  T
Q  566 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29722506 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctct 29722407  T
Q  666 cttccaact 674  Q
     ||||||||    
T  29722406 tttccaact 29722398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 667
Target Start/End: Original strand, 22536103 - 22536574
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacacca 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || |    
T  22536103 gatcgaaccacaccaatacaaa-gaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtatg--caagcaacaatcaacaaaaaac-a 22536198  T
Q  289 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacc 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536199 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacaca-atcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacc 22536297  T
Q  389 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536298 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 22536397  T
Q  489 tagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 588  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  22536398 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcccatgt 22536495  T
Q  589 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536496 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 22536574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 10593621 - 10593133
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||    
T  10593621 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacac 10593522  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  10593521 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaagagattgtt 10593423  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10593422 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 10593323  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593322 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 10593223  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593222 catgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttccccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 10593133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25078484 - 25078004
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  25078484 gatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25078385  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25078384 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 25078285  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25078284 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 25078185  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078184 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 25078085  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25078084 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 25078004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25136453 - 25135973
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  25136453 gatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 25136354  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25136353 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 25136254  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25136253 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 25136154  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136153 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 25136054  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25136053 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 25135973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 40380454 - 40379976
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  40380454 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 40380355  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  40380354 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 40380255  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  40380254 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 40380155  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40380154 gaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 40380057  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40380056 catgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 40379976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 40382665 - 40382187
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  40382665 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 40382566  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  40382565 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 40382466  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  40382465 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 40382366  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40382365 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 40382268  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40382267 catgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 40382187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 16544774 - 16544293
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  16544774 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 16544675  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa---aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagatt 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  16544674 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 16544577  T
Q  382 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggtt 479  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16544576 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtt 16544477  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 578  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16544476 atgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtg 16544379  T
Q  579 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544378 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 16544293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 16546996 - 16546515
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  | | |  ||||||| || |||||||||||    
T  16546996 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacac 16546897  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaa-aacaaggatcacaagataaa---aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagatt 381  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |  | |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  16546896 cacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaacta--aacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 16546799  T
Q  382 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggtt 479  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16546798 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggtt 16546699  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 578  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16546698 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtg 16546601  T
Q  579 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546600 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 16546515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789518
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctaga 294  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9789042 aaccacaccaatacaaa-gtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgtgtg--caagcaaaaatcaacaaaacagcacctaga 9789137  T
Q  295 tctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagtt 393  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||   | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9789138 tctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacaca-agcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagtt 9789236  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag- 491  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  9789237 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattaga 9789336  T
Q  492 cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt- 590  Q
     ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||     
T  9789337 tttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatgtttc 9789435  T
Q  591 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9789436 ccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 9789518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441942
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctaga 294  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18441462 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaaaacagcacctaga 18441557  T
Q  295 tctaatctaggaaacaagtgagaaa----cacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcaccc 389  Q
    |||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||   | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  18441558 tctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacaca-agcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcaccc 18441656  T
Q  390 agttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaat 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18441657 agttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaat 18441756  T
Q  489 tag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 587  Q
    |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  18441757 tagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccatg 18441855  T
Q  588 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18441856 tttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 18441942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 198 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16409824 - 16409349
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16409824 cacaccaatacaaa-gtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 16409729  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttc 394  Q
    ||||||||||||||| |||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16409728 taatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttc 16409630  T
Q  395 ggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-c 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||      
T  16409629 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagat 16409530  T
Q  493 ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-t 591  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||      
T  16409529 ttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcc 16409431  T
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16409430 caacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 16409349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26178234 - 26177757
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  | |||| |||||||    
T  26178234 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaatgataacaacacctag 26178139  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccag 391  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26178138 atctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccag 26178040  T
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26178039 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 26177940  T
Q  491 g-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    |  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||||    
T  26177939 gatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtt 26177842  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26177841 tcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 26177757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26171114 - 26170648
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| |  | |||| |||||||    
T  26171114 aaccacaccaatacgaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcgatgataacaacacctag 26171019  T
Q  294 atctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccag 391  Q
    |||||||||||||| |||  ||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26171018 atctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccag 26170920  T
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 491  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||           |||||||||||||||    
T  26170919 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattag 26170830  T
Q  492 -cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 590  Q
      ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||    
T  26170829 atttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgttt 26170732  T
Q  591 -tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
      ||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26170731 cccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 26170648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 30182917 - 30182461
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30182917 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaag 30182821  T
Q  313 tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 412  Q
    ||| || |||||||||   | |||||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30182820 tgaaaagcacaaaacaca-agcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacatac 30182725  T
Q  413 tctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatga 510  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  30182724 tctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga 30182626  T
Q  511 acaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaaga 601  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  30182625 ac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaaga 30182527  T
Q  602 gatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30182526 ga-actctaatcaaag-accctaatccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 30182461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25413042 - 25412634
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||||  |||||   || ||||||||||| |||  ||||       
T  25413042 caagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaag---caaaagataaaaggagag--aagagag 25412948  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25412947 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 25412849  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  25412848 -aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagac 25412751  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | |  ||||||||||    
T  25412750 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaatgttgcctcctttgattt 25412653  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25412652 cccaagtttctctctcttc 25412634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13343389 - 13342933
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13343389 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaag 13343293  T
Q  313 tgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 410  Q
    ||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13343292 tgaaaagcacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacatgacct 13343199  T
Q  411 actctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccat 508  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  13343198 actctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaa 13343101  T
Q  509 gaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaaccca 598  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||    
T  13343100 gaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 13343002  T
Q  599 agagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343001 agaga-actctaatcagag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 13342933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 669
Target Start/End: Original strand, 36073863 - 36074340
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36073863 aaccacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctag 36073958  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 390  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||| |||    
T  36073959 atctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaag---caaaacataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcatcca 36074052  T
Q  391 gttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36074053 gttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaatt 36074150  T
Q  490 agc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 577  Q
    ||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  36074151 agctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 36074249  T
Q  578 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074250 gtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 36074340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 282 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 13240016 - 13239619
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| | ||    
T  13240016 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaa-at 13239920  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  13239919 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 13239821  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttt 570  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || ||      
T  13239820 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 13239722  T
Q  571 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |  |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  13239721 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccataaagttacctcctttgattttctaagtttctctctcttc 13239624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 282 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636698
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||  |  | |||||||||||  |||||||||||   |||||||  |||||| ||||    
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaa--gggagggaagagagaaacaaacacaccaa-agat 32636992  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  32636991 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32636894  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattctctct-t 569  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||| || ||      
T  32636893 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactca 32636795  T
Q  570 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctct 667  Q
      |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32636794 cccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctct 32636698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 37439215  T
Q  477 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439214 agttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488075
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 13488277  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||||||| ||| ||     
T  13488276 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttca 13488178  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  13488177 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 13488080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Original strand, 39468439 - 39468845
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| | || |||||||||||  ||||| |||||    |||||    
T  39468439 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaa--gggagagaagagaggaacaa 39468536  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  ||| || |||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | | | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  39468537 acacactaa-agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 39468633  T
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  39468634 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactca 39468732  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttccca 654  Q
    |||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  39468733 atgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatgaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttccca 39468830  T
Q  655 agtctctctctcttc 669  Q
    ||| |||||||||||    
T  39468831 agtttctctctcttc 39468845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28278493 - 28278316
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||    
T  28278493 caccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagat 28278397  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278396 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428726
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42428524  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  42428525 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 42428623  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctct 663  Q
    ||    |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42428624 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaagtttctct 42428720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 30682809 - 30683216
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||   |  | || ||||||||||| |||   ||| |||     
T  30682809 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa- 30682907  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagt--tcctac 460  Q
     ||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  30682908 -caaacacaccaa-agattgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttac 30683003  T
Q  461 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 550  Q
    ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||    
T  30683004 aaa-gaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaaga 30683098  T
Q  551 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatt 649  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | |  ||| |||||    
T  30683099 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaaattacctcctctgatt 30683196  T
Q  650 tcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30683197 tcccaagtttctctctcttc 30683216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcac--agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 28750652 - 28750951
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||      
T  28750652 agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 28750749  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  28750750 ggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28750848  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28750849 ctcacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 28750946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16451965
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 16452150  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctcttt 570  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||| || |||     
T  16452149 acaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcactta 16452051  T
Q  571 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  16452050 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 16451965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182857
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaa-gggatacaaatggtta 31183041  T
Q  481 caagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttac 572  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |    
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31182942  T
Q  573 -aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
     ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  31182941 taaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 31182857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533641
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 533843  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||| ||     
T  533842 ggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttca 533744  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  533743 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccccaaccctaaagttacctcctttgatttcccaaatttctctc 533646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831588
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac 33831769  T
Q  461 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caaga 550  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        ||||    
T  33831768 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataaga 33831671  T
Q  551 cactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaa 633  Q
    |||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33831670 cactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaa 33831588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566111
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||      
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-agagggatacaaatg 8566040  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  8566041 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcac 8566111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 537901
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 538099  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||| ||     
T  538098 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttca 538000  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  537999 ctcacccaaggtgtttacgatgtttcccaagccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagtttctctc 537902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 548
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  404 ttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 501  Q
    |||||||||| | ||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  502 tcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 548
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggtta 480  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  481 caagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 665
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426527
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |    
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg 42426329  T
Q  477 g-ttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattctct 566  Q
    | || |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||       |||||||||| ||| ||     
T  42426330 ggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttca 42426428  T
Q  567 ctttac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||   | ||||||||| | |||||| | || | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  42426429 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 42426526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 379 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg- 477  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||| |||||| |   |||| |||||||||||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  478 ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 542  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806456
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttc 19806456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 534
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641091
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttac-aaagagatacaaaagagtt 16641035  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccctttt 534  Q
    |  |||||| |||||  ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641036 atcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg- 477  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| |||||||| |||||| |   |||| |||||||||||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  478 ttacaagaaattagctt 494  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 545
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049506
Alignment:
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 490  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatta 9049451  T
Q  491 gctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 545  Q
    ||||  ||||| ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049452 gcttcaacaagctca-caaaaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  481 caagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
          ||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  |||   ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||  | | |||| ||||||||      
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtt-tttccaaagagatacaaatg 38747079  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 544  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747078 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075823
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |   ||||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaa-agatacaaatgggtt 3075756  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||| || | |||| |||| | ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3075757 acaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcac 3075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactat 446  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 432 - 494
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  432 tctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 494
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310048
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| | | ||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaa-gagatacaaaag 42310029  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt 494  Q
     ||||||||||||||||||    
T  42310030 agttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 638 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16407949 - 16407913
Alignment:
Q  638 ctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16407949 ctccctttgattttccaagtttctctctcttccaact 16407913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 179 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 20344266 - 20343773
Alignment:
Q  179 ccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaa 278  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  20344266 ccgatcgcctagatcgaaccacaccaatgcaaa-gaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaatcga 20344170  T
Q  279 caaaacacca---cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa 375  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20344169 caaaaaaccagcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa 20344071  T
Q  376 -gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaa 473  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20344070 agagattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaa 20343972  T
Q  474 aaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttaca 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343971 aaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttaca 20343872  T
Q  574 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaa 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20343871 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaagtctctctctcttccaa 20343773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 18388565 - 18389043
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  18388565 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 18388664  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  18388665 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 18388764  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  18388765 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 18388864  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18388865 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 18388962  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18388963 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 18389043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 18392001 - 18392479
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  18392001 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 18392100  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  18392101 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 18392200  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  18392201 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 18392300  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18392301 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 18392398  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18392399 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 18392479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 6594363 - 6594841
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  6594363 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6594462  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  6594463 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 6594562  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6594563 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 6594662  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6594663 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 6594760  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6594761 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 6594841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 6592145 - 6592623
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  6592145 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 6592244  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  6592245 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 6592344  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6592345 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 6592444  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6592445 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 6592542  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6592543 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 6592623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 32060127 - 32060609
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  32060127 gatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 32060226  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  32060227 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 32060326  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaa--gggatacaaaaggttac 481  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||| |||||||    
T  32060327 accaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttac 32060426  T
Q  482 aagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060427 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 32060526  T
Q  582 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32060527 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-accctttgatttcccaagtctctctct 32060609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 332 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 24790059 - 24789724
Alignment:
Q  332 atcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgta 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24790059 atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagta 24789960  T
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24789959 ctctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacc 24789860  T
Q  530 cttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789859 cttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccc 24789760  T
Q  630 taaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789759 tagagttgctccctttgatttcccaagtctctctct 24789724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 198 - 673
Target Start/End: Original strand, 43503975 - 43504448
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 297  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  43503975 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatct 43504070  T
Q  298 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcgg 396  Q
    |||||||||| ||| |||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  43504071 aatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcga 43504169  T
Q  397 tccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-ct 493  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |    
T  43504170 tccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatt 43504269  T
Q  494 tgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tc 592  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  43504270 tgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttccc 43504368  T
Q  593 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 673  Q
    || ||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43504369 aagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagtttctctctcttccaac 43504448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 265 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 39731653 - 39731243
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39731653 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaag---cacaagataaaaggagagggaagagga 39731557  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39731556 aaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac 39731458  T
Q  461 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaat 558  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39731457 aaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaat 39731359  T
Q  559 gattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    |||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  39731358 gattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagt 39731260  T
Q  658 ctctctctcttccaact 674  Q
     ||||||||||||||||    
T  39731259 ttctctctcttccaact 39731243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 478 - 674
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562296
Alignment:
Q  478 ttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  578 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgattccccaagtctctctctcttccaact 1562296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 190 - 471
Target Start/End: Original strand, 1560470 - 1560757
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  1560470 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 1560569  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1560570 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 1560669  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatac 471  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1560670 tacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 35854194 - 35853787
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||   | ||||||||||||||| || |||||   ||||||    
T  35854194 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggg-agagaagagagaaacaa 35854097  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  35854096 acacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 35853998  T
Q  467 gatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  35853997 gatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 35853899  T
Q  557 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaa 655  Q
    |||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||    
T  35853898 atgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcctaa 35853801  T
Q  656 gtctctctctcttc 669  Q
    || |||||||||||    
T  35853800 gtttctctctcttc 35853787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 198 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 48409152 - 48408673
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48409152 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 48409057  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||| | ||| |||| || ||||||  ||||| |  | |||||||||||| || |||||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48409056 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagca--aaaagataaaaggg-agagaagagagaaacaaacacaccaagaaattgttcacccagtt 48408960  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag 491  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  48408959 cggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattag 48408860  T
Q  492 c-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 582  Q
    | |||||||||| || | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||     
T  48408859 ctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 48408761  T
Q  583 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttcc 670  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48408760 caatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttcc 48408673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 198 - 669
Target Start/End: Original strand, 25766780 - 25767250
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||  || ||||||| | |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25766780 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataa-caaagtgagcg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 25766875  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||||||  ||||| |  | |||||||||||| || ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25766876 taatctaggtatcaaagtgaaaaacacaaatcacaagca--aaaagataaaaggg-agagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagtt 25766972  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattag 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  25766973 cggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattag 25767071  T
Q  492 ctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |    
T  25767072 ctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa 25767170  T
Q  586 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| | |   |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25767171 tgtttccca---aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttctcaagtttctctctcttc 25767250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 377 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990922
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa- 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||  |||| |||||||||     
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttatta-gaaagagatacaaaag 29991127  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  29991126 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 29991028  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29991027 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaagtttctctct 29990931  T
Q  666 cttccaact 674  Q
    |||| ||||    
T  29990930 cttcaaact 29990922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4179118 - 4178647
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4179118 cacaccaatacaaacta-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgt--aagcaataatcaacaataacagcacctagatc 4179023  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  4179022 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagtt 4178929  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 492  Q
     ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4178928 tggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 4178831  T
Q  493 -ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
     ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  4178830 tttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 4178732  T
Q  584 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4178731 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaagtttctctctcttc 4178647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23555323 - 23554912
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| || |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  23555323 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 23555226  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  23555225 acaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 23555128  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||    
T  23555127 aagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagac 23555029  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||| | |  ||||||||||    
T  23555028 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctgaagttacctcctttgattt 23554931  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23554930 cccaagtttctctctcttc 23554912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga-- 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |  | |||||||||||    ||| ||||||||      
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaa----gagagaagaagaga 25616042  T
Q  361 -aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttccta 459  Q
     |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  25616041 gaaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctta 25615943  T
Q  460 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactca 556  Q
    |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  25615942 caaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactca 25615848  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 618  Q
    |||||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615847 atgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380157
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14379955  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  14379956 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14380054  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14380055 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 14380152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |    
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 34310810  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310811 tgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 282 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19502443 - 19502051
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||| |  | ||||| |||||  ||||| |||||   |||||||  |||||| ||||    
T  19502443 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaa--gggagagaagagagaaacaaacacaccaa-agat 19502347  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  19502346 tgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagtt 19502248  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctt 569  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||     
T  19502247 acaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactc 19502149  T
Q  570 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctctt 668  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  | ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  19502148 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcatttgatttctcaagtttgtctctctt 19502051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070129
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14069927  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  14069928 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14070026  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14070027 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 14070124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30025028
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||      
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 30024826  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  30024827 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 30024925  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  30024926 ctcacccaaggtgtttacaacgtttttcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 30025023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22270150 - 22269973
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||    
T  22270150 caccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttac-aaagagat 22270054  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270053 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27348095 - 27347817
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |  | || ||||||||  | ||| |||||    |||||    
T  27348095 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--gtgagagaagagaggaacaa 27347998  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  27347997 acacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 27347901  T
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347900 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24790338 - 24790230
Alignment:
Q  210 aaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790338 aaagtatgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgcgtg--caagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 24790241  T
Q  310 aagtgagaaac 320  Q
    | |||||||||    
T  24790240 aggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41317528  T
Q  477 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317529 gattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649293
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41649105  T
Q  476 ggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  41649106 ggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 41649204  T
Q  568 tt-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  41649205 ttacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaataaaaga--ccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaagt 41649293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43864526 - 43864116
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  43864526 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 43864429  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||  ||| |    
T  43864428 acaaacacaccatct-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttac-a 43864332  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||    
T  43864331 aagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagaca 43864233  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  43864232 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 43864135  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  43864134 cccaagtttctctctcttc 43864116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18126928 - 18126644
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || |||||||| || |||  || |    |    
T  18126928 caagcaataatcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagagga 18126829  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  18126828 acaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttac-a 18126732  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttg-acaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18126731 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 383 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttac 481  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  482 aagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48489711 - 48489431
Alignment:
Q  267 agcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaac 364  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || |||||||| || |||   ||| |||  |    
T  48489711 agcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaa--c 48489614  T
Q  365 aaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaa 464  Q
    |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||  | | |||    
T  48489613 aaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgc-aaa 48489517  T
Q  465 gggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489516 gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaa 483  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  484 gaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491451
Alignment:
Q  401 aacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 498  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  499 agttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    ||| |||||| | |||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtt 48491530  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  48491529 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttatcaagtttctctctcttc 48491451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 671
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733267
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 31733063  T
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  31733064 ggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31733162  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |  | ||||||||| ||||| ||||||    
T  31733163 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcttttgatttctcaagtttctctc 31733260  T
Q  665 tcttcca 671  Q
    |||||||    
T  31733261 tcttcca 31733267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 669
Target Start/End: Original strand, 47673981 - 47674239
Alignment:
Q  419 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaac 516  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||    
T  47673981 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 47674078  T
Q  517 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatac 606  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  47674079 cctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-ac 47674177  T
Q  607 tctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||||| ||| | |||| | ||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47674178 tctaatcaaag-accttcaaccttgaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 47674239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 361 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 2390469 - 2390301
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||  |||    
T  2390469 aaacaacaacaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattac 2390371  T
Q  461 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc 530  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390370 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676432
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||      
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttac-aaagagatacaaatg 47676230  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||| ||||| ||     
T  47676231 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttca 47676329  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctct 663  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47676330 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaagtttctct 47676426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1113828 - 1113529
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||| |    
T  1113828 agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg 1113731  T
Q  477 g-ttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    | ||| ||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  1113730 ggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 1113632  T
Q  567 ctttac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||   | ||| ||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  1113631 ctcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaagtttctctc 1113534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||| |||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4586443 - 4586028
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  4586443 caagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa--gggagagaagagagga 4586346  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  ||| || |||||||  ||||||||||||||||  ||||| || | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  4586345 acaaacacacgaa-agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 4586249  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  4586248 aagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 4586150  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||  | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  4586149 ctcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-agcctcaaccctaaagttacatcctttgattt 4586052  T
Q  651 cccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||    
T  4586051 cccaagtttttctctcttctaact 4586028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatg 8153416  T
Q  477 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153415 agttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671506
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | | ||| |||||   |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |    
T  38671219 agattgttgacccagttcggtcc-aacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagtgatacaaatg 38671316  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  38671317 tgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcg 38671415  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  38671416 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 38671506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagct-cttccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26417598 - 26417316
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| || | |||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  26417598 caagcaataatcaacaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 26417501  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  || | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  26417500 acaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-a 26417404  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417403 aagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 386 - 543
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| || || |||||   |||| |||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 543  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 548
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaag 2361075  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361076 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253697
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-tt 479  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| | | |||| |||| |||||| ||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 546 - 669
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515056
Alignment:
Q  546 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctt 644  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgcttcctt 24515031  T
Q  645 tgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24515032 tgatttcccaagtttctctctcttc 24515056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 495980 - 496148
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||      
T  495980 agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatg 496077  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496078 ggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 388 - 529
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  388 ccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 486  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaa 23565166  T
Q  487 attagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    ||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565167 attagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146576
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36146502  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146503 ggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105558
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||  ||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggtt 31105491  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510661
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagctt 4510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512503
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagctt 4512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 494
Target Start/End: Original strand, 6359942 - 6360065
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | | | | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  6359942 caccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagat 6360039  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
T  6360040 acaaatgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396338
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggtta 480  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||| |   |||| ||||||||| ||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgtta 18396387  T
Q  481 caagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac 528  Q
    ||| ||| ||| ||  ||||  || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18396386 caaaaaaataggttcaacaaactctccaagaacaaaacctaatttctac 18396338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 523
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  378 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag- 476  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| |     
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatga 2759292  T
Q  477 gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatt 523  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2759293 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 548
Target Start/End: Original strand, 36574434 - 36574683
Alignment:
Q  291 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |  | ||||||||    ||| ||||||  |||||||  || ||||| || ||| |||||    
T  36574434 tagatctaatctaggaatcaagtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaa----gagagaagaa--aaacaaacacatcaagaaat-gtttaccca 36574526  T
Q  391 gttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatt 489  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||  |||||||| |||||||||| |||||| |   |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  36574527 gtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaatt 36574624  T
Q  490 agctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||  ||||  |||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574625 agcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 463
Target Start/End: Original strand, 24525499 - 24525584
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24525499 agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12098027
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||        || ||||||||      
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt--------agagatacaaatg 12097953  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097954 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 548
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  477 gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814530
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 455  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  388 ccagttcggtccaaacttgacctactctagag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 48489399 - 48489303
Alignment:
Q  572 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48489399 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccatcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctatcttc 48489303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 544
Target Start/End: Original strand, 1360248 - 1360316
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 544  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1360248 ggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaaga-caaaacctaatttctacctttttcccaatctca 1360316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 18126579 - 18126520
Alignment:
Q  605 actctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18126579 actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctct 18126520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9036799 - 9036298
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctcc--ttgatcgaaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttc 265  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9036799 tgttgtgaattccgatccccactagatcgaaccacaccaatgcaaagga-tgatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgc 9036701  T
Q  266 aagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaa 363  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9036700 aagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaca-atcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa 9036602  T
Q  364 caaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9036601 caaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaa 9036502  T
Q  464 agggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036501 agggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattc 9036402  T
Q  564 tctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9036401 tctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgatttcccaagtctctct 9036303  T
Q  664 ctctt 668  Q
    |||||    
T  9036302 ctctt 9036298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 215 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282251
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 40282612  T
Q  314 gagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 413  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282611 gagaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 40282513  T
Q  414 ctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaac 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  40282512 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaac 40282413  T
Q  513 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 612  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282412 taaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 40282313  T
Q  613 caaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40282312 caaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 40282251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 167 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 21054336 - 21053832
Alignment:
Q  167 gtgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaaga-atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttc 265  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21054336 gtgttgtgaattccgatctcaa--atcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgtgtg--c 21054241  T
Q  266 aagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaaca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21054240 aagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaca 21054142  T
Q  366 aaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaag 465  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21054141 aatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 21054042  T
Q  466 ggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21054041 ggatacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 21053942  T
Q  565 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21053941 ttctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctc 21053842  T
Q  665 tcttccaact 674  Q
    ||||||||||    
T  21053841 tcttccaact 21053832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 9987579 - 9987076
Alignment:
Q  168 tgttgtgaattccgatctccttgatcgaaccacaccaatacaaaaga-atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttca 266  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  9987579 tgttgtgaattccgatctcaa--atcgaaccacaccaatacgaaaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgtgtg--ca 9987484  T
Q  267 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987483 agcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 9987385  T
Q  367 aag-caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaag 465  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  9987384 aagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaag 9987285  T
Q  466 ggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattct 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9987284 ggatacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 9987186  T
Q  565 ctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9987185 ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctatctc 9987086  T
Q  665 tcttccaact 674  Q
    ||||||||||    
T  9987085 tcttccaact 9987076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 215 - 665
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622523
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 20622171  T
Q  315 agaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 414  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622172 agaaacacaatacaca-atcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 20622270  T
Q  415 tagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaa--gggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaa 511  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  20622271 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaa 20622370  T
Q  512 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaa 611  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622371 caa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaa 20622469  T
Q  612 tcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20622470 tcaaagaaccctaaaccctagagttgctccatttgatttcccaagtctctctct 20622523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 44203995 - 44203517
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  44203995 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 44203896  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44203895 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 44203796  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  44203795 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 44203696  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44203695 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 44203598  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44203597 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 44203517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 51765747 - 51765262
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||   ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51765747 aaccacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaa---gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctag 51765652  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 390  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  51765651 atctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaag---cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcaccca 51765556  T
Q  391 gttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaat 488  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  51765555 gttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaat 51765456  T
Q  489 tagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgt 579  Q
    |||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||  | ||   ||||||||    
T  51765455 tagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgt 51765356  T
Q  580 ttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    || | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51765355 ttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctcactcttccaact 51765262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 20762952 - 20762544
Alignment:
Q  263 ttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   |    
T  20762952 ttcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagaga 20762859  T
Q  362 aacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctaca 461  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  20762858 aacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 20762761  T
Q  462 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caaga 550  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       |||||    
T  20762760 gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaaga 20762662  T
Q  551 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatt 649  Q
     ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20762661 tactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatt 20762564  T
Q  650 tcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  20762563 tcccaagtttctctctcttc 20762544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 657
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8551071
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaaga-agaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |  | |||||||||||  | || | |||| ||||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaa 8550768  T
Q  362 aacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctaca 461  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  8550769 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 8550866  T
Q  462 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  8550867 aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagac 8550965  T
Q  552 actcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatt 649  Q
    ||||||||||| || ||    ||| |||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |    |||||||||    
T  8550966 actcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcttaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatt 8551063  T
Q  650 tcccaagt 657  Q
    ||||||||    
T  8551064 tcccaagt 8551071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 265 - 549
Target Start/End: Original strand, 13316238 - 13316521
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||       
T  13316238 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagag 13316332  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  13316333 aaacaaactcactaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagtt-cttc 13316430  T
Q  461 aaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 549  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316431 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 3157147 - 3156736
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  3157147 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 3157050  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  3157049 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 3156953  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||    
T  3156952 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 3156854  T
Q  553 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    |||||||||| || ||   || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  3156853 ctcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttc 3156756  T
Q  652 ccaagtctctctctcttcca 671  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  3156755 ccaagtttctctctcttcca 3156736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3189590 - 3189203
Alignment:
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||    
T  3189590 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3189494  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3189493 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3189395  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaag 575  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||   ||||    
T  3189394 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaag 3189296  T
Q  576 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3189295 gtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 3189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3198407 - 3198020
Alignment:
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||    
T  3198407 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3198311  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3198310 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3198212  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaag 575  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||   ||||    
T  3198211 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaag 3198113  T
Q  576 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3198112 gtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 3198020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3207246 - 3206859
Alignment:
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   |||||||  |||||| |||||||||    
T  3207246 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-agattgttc 3207150  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3207149 acccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacagg 3207051  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaag 575  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||   ||||    
T  3207050 aaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaag 3206952  T
Q  576 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3206951 gtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 3206859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220522
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28220320  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||||||| ||     
T  28220321 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 28220419  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28220420 ctcacccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 28220517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44455438 - 44455034
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |  | || ||||||||  || || |||||    |||||    
T  44455438 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaa--ggaagagaagagaggaacaa 44455341  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||      
T  44455340 acacaccaa-agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-a 44455244  T
Q  467 gatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  44455243 gatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 44455145  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttccca 654  Q
    ||| || || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||| |||    
T  44455144 atggttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttacca 44455047  T
Q  655 agtctctctctct 667  Q
    ||| |||||||||    
T  44455046 agtttctctctct 44455034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31659520 - 31659110
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| || | || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  |||| |||     
T  31659520 caagcaataatcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaat 31659421  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    | | |  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  31659420 aaaca--caccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-a 31659326  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||    
T  31659325 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagaca 31659227  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  31659226 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 31659129  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31659128 cccaagtttctctctcttc 31659110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 42297964 - 42298143
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  42297964 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 42298062  T
Q  470 acaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298063 acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29136427 - 29136247
Alignment:
Q  368 agcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaaggg 467  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||      
T  29136427 agcaccaagaaat-gttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttac-aaagaa 29136330  T
Q  468 atacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136329 atacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834451
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 834261  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  834262 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 834360  T
Q  567 c-tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    |     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  834361 cgcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 834451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  480 acaagaaatta-gcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223717
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28223515  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  28223516 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28223614  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28223615 ctcacccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 28223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265722
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||      
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 28265648  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265649 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 37503443 - 37503850
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||    | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  37503443 caagcaataatcaacaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 37503540  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  37503541 acaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 37503637  T
Q  463 aagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacac 553  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||||    
T  37503638 aagagatac--aaggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 37503734  T
Q  554 tcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    ||||||||| || ||    |||||||||| | || |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||   |  |||||||||||    
T  37503735 tcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatattttccaacccaataga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtcacctcctttgatttc 37503832  T
Q  652 ccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| |||||||||||    
T  37503833 ccaagtttctctctcttc 37503850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 37559751 - 37560165
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaa-tctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || |||||||| |||||| |||||        
T  37559751 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa-ggggagagaagagagg 37559849  T
Q  362 aacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  37559850 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttac 37559947  T
Q  461 aaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt--gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caag 549  Q
    ||| | |||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||    
T  37559948 aaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaag 37560045  T
Q  550 acactcaatgattctctctttac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttga 647  Q
    ||||||||||||| || ||   | || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |  | |||||    
T  37560046 acactcaatgattttcactcacctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccttaaagttacctcatttga 37560143  T
Q  648 tttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  37560144 tttctcaagtttctctctcttc 37560165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-gaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49918632 - 49918350
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||  ||| || |||||| | |  | || ||||||||||| |||   ||| |||     
T  49918632 caagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa- 49918534  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
     ||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  49918533 -caaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 49918438  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918437 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa- 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatgcaaaat 37033166  T
Q  476 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033167 ggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552805
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagggatacaaagg 4552731  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4552732 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169378
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||| |    
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttac-aaagagatacaaatg 50169304  T
Q  477 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169305 agttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||| |||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 45644448  T
Q  477 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644449 agttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847405
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 3847215  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  3847216 ggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 3847314  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  3847315 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcgaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 3847405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 379 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-agg 477  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcgg 19754567  T
Q  478 ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754566 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 23555248 - 23555433
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| || ||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23555248 aaacaaacgcaccaagaaat-gtttactcagttcgatccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac 23555344  T
Q  461 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555345 -aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833394
Alignment:
Q  404 ttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 501  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  502 tcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-t 591  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||      
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 1833470  T
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1833469 caatccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccttaaagttatct-cctttgatttcccaagtttctctctcttc 1833394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603576
Alignment:
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttaca 482  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||| ||||  |||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttaca 34603643  T
Q  483 agaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603642 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659620
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||      
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 13659430  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  13659431 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 13659529  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||| | |  |||||||||||||||||    
T  13659530 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaagt 13659620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167343
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||      
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 50167269  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167270 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197192
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa 475  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaat 197001  T
Q  476 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 565  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  197002 gagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 197100  T
Q  566 tct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||| ||||||    
T  197101 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagt 197192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064921
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||| | |    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacacatg 46064992  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 545  Q
     ||||||||||||||||||  || || |||| | ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  46064991 agttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcac 46064921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 669
Target Start/End: Original strand, 13316518 - 13316614
Alignment:
Q  572 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13316518 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaagtttctctctcttc 13316614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41361101 - 41360914
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| | | ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  41361101 aaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtcc-aatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac 41361003  T
Q  461 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41361002 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 668
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138269
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||||      
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatgcaaatg 13138070  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |  ||||||||||| || |||  |||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  13138071 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga--cctaatttctatccatttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 13138168  T
Q  568 t-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |    |||||||||| | ||||||  || ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||    
T  13138169 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctct 13138266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44907332 - 44907188
Alignment:
Q  17 tgtgaggttggaaaatgaaatttga---aatcttgtgagtttataaagaatcttttagaaggtggcatttttggattcatttcaatgaaagaagaagctt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||    |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||   | |||| ||    
T  44907332 tgtgaggttggaaaatcaaatttgttggaatcatgtgaattcatgaagaatcttttagaaggtggcattcttggatccatctcaatga---aggaagttt 44907236  T
Q  114 catcataagcatcaagagaagttctaaaggagtcatcaaggctttcta 161  Q
    ||||||| ||||| || | || ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  44907235 catcatatgcatctagggtagatctaaaggagctatctaggctttcta 44907188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925095
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc--ctacaaaagggatacaaa 474  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||  ||   |||| ||||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaa 10925299  T
Q  475 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 564  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||| || ||||  |||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  10925298 tgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 10925200  T
Q  565 ctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctc 662  Q
    | ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||||    
T  10925199 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagtttctc 10925102  T
Q  663 tctcttc 669  Q
    |||||||    
T  10925101 tctcttc 10925095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatc 19752760  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752759 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  405 tgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagtt 502  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  503 caccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    ||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13938256 - 13938143
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagcttg-acaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta 527  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  13938256 ctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttctccaagaacaa--cctaatttcta 13938159  T
Q  528 cccttttcccaatctc 543  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13938158 cccatttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820180
Alignment:
Q  401 aacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 498  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  499 agttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    || |||| | ||||||| |||||||| ||||| | || ||||| ||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 15820258  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctctt 668  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15820257 tcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcttttgatttcccaagtttttctctctt 15820180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 30476443 - 30476614
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | | | | ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||| |    
T  30476443 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg 30476540  T
Q  477 g-ttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | |||||| |||||| ||| | ||||||||  | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476541 ggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaa-ccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttac 36683769  T
Q  461 aaa 463  Q
    |||    
T  36683768 aaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 455
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876840
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 455  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagtt 37876840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122363
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa 474  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaa 40122290  T
Q  475 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
     | |||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122291 tgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  409 ctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 543
Target Start/End: Original strand, 12318609 - 12318685
Alignment:
Q  468 atacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318609 atacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 527
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-tt 479  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  | | | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||  |||||| | ||| ||||||| ||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaa-gagatccaaaagggtt 928074  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttcta 527  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455676
Alignment:
Q  420 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 548
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  475 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 545
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 545  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 534
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282846
Alignment:
Q  390 agttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaat 488  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||  || |||||| |   |||| ||| ||||| |||||| | ||||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaat 37282799  T
Q  489 tagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccctttt 534  Q
    ||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37282800 tagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 6378655 - 6378603
Alignment:
Q  477 gttacaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6378655 gttacaaaaaattagctt-acaatgttcaacatgaacaaaccctaatttctacc 6378603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  462 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttct 526  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 49918292 - 49918221
Alignment:
Q  596 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49918292 ccaagaga-actctaatcaaaga-ccttcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 49918221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3460778 - 3460710
Alignment:
Q  468 atacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccctttt 534  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  3460778 atacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaccctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10925504 - 10925464
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctag 304  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10925504 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctag 10925464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc 530  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc 530  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagctt-aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 215 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266569
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgt--aagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtg 6266926  T
Q  315 agaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 413  Q
    | |||||||| |||   | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266925 aaaaacacaatacaca-agcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 6266827  T
Q  414 ctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaac 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  6266826 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac 6266727  T
Q  513 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266726 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 6266627  T
Q  613 caaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttcc 670  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266626 caaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctctcttcc 6266569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 12647191 - 12647669
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  12647191 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 12647290  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  12647291 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 12647390  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  12647391 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 12647490  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12647491 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 12647588  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12647589 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 12647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 190 - 568
Target Start/End: Original strand, 13655834 - 13656220
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  13655834 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 13655933  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaa-gagattg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  13655934 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattg 13656033  T
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13656034 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttac 13656133  T
Q  482 aagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 568  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656134 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 195 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289442
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaagtaa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagcaataatcaacaataacaacacctag 32289821  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccag 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||||   | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  32289820 atctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacaca-agcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcacccag 32289722  T
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32289721 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaatta 32289622  T
Q  491 g-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    |  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||||    
T  32289621 gatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtt 32289524  T
Q  590 ttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttcca 671  Q
    | | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32289523 tccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttcca 32289442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 198 - 674
Target Start/End: Original strand, 4484151 - 4484632
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4484151 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 4484246  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcg 395  Q
    ||||||||||||||| |||| || || ||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||     
T  4484247 taatctaggaaacaaagtgaaaagca-aaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttct 4484344  T
Q  396 gtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 493  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4484345 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 4484444  T
Q  494 tgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 585  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | |    
T  4484445 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaa 4484543  T
Q  586 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484544 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 4484632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 198 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 30833693 - 30833215
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  |   |||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30833693 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaatta---tgtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 30833598  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30833597 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaag---cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagtt 30833502  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 492  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30833501 cagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaac 30833402  T
Q  493 -ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
     ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   ||| |||||| |    
T  30833401 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttac 30833303  T
Q  584 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttcca 671  Q
     ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30833302 aatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctttctcttcca 30833215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 4503019 - 4503428
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||   | |||||||||||||| |||  ||||   ||    
T  4503019 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacaca-agcacaagataaaaggagag--aagagagaa 4503115  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |    
T  4503116 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--ca 4503212  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagac 551  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | ||||||    
T  4503213 aagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagac 4503311  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||    
T  4503312 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaaccctaaagttgcttcctttgattt 4503409  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4503410 cccaagtttctctctcttc 4503428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45100036 - 45099627
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||  |||||   || || |||||||| |||  ||||       
T  45100036 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaag---caaaatataaaaggagag--aagagag 45099942  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |      
T  45099941 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-- 45099845  T
Q  461 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caag 549  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||    
T  45099844 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaag 45099746  T
Q  550 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgat 648  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  45099745 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgat 45099648  T
Q  649 ttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  45099647 ttcccaagtttctctctcttc 45099627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723550
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatac-aaaa 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaa 5723350  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  5723351 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5723449  T
Q  568 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5723450 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctc 5723547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 36205551 - 36205959
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||  |||||   || || |||||||| |||  ||||       
T  36205551 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcagaaaccacaag---caaaatataaaaggagag--aagagag 36205645  T
Q  361 aaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctac 460  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||| |      
T  36205646 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-- 36205742  T
Q  461 aaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caaga 550  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||    
T  36205743 caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaaga 36205841  T
Q  551 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatt 649  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  36205842 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatt 36205939  T
Q  650 tcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  36205940 tcccaagtttctctctcttc 36205959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988371
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| | |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 36988058  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36988059 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 36988156  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       |||||||    
T  36988157 aagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagaca 36988255  T
Q  553 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  36988256 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttc 36988353  T
Q  652 ccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| |||||||||||    
T  36988354 ccaagtttctctctcttc 36988371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334713
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 2334512  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  2334513 agttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 2334611  T
Q  567 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2334612 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa-taccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctct 2334709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 6594890 - 6595302
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |  | || |||||||||||| || |||||   ||    
T  6594890 caagtaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggg-agagaagagagaa 6594988  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  6594989 acaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-a 6595086  T
Q  463 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagac 551  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||       ||||||    
T  6595087 aagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagac 6595185  T
Q  552 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    || ||||||||||| || | ||| |||||| | || |||  || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  | ||||||||    
T  6595186 acccaatgattctcactctccaaagtgtttacaatttttcccagcccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcatttgattt 6595283  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    || |||| |||||||||||    
T  6595284 cctaagtttctctctcttc 6595302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 38312522 - 38312112
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  38312522 caagcaacaatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 38312425  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||| |    
T  38312424 acaaacacatcaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttac-a 38312328  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  38312327 aagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 38312229  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||   ||||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  38312228 ctcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctcaaccctaaagttacctcctttgattt 38312131  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  38312130 cccaaatttctctctcttc 38312112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 282 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867869
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||| |  | ||||||||||| || |||  ||||   |||||||  || ||| ||||    
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-agat 29868037  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  29868036 tattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 29867939  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29867938 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34139936
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggataca-aaa 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |      
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatg 34139865  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34139866 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcac 34139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 723741 - 724028
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||      
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 723838  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  723839 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 723937  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  723938 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 724028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14634110
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||      
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatg 14633920  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  14633921 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 14634019  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| | |  |||||||||||||||||    
T  14634020 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaa-aaccctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaagt 14634110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362236
Alignment:
Q  401 aacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 498  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  499 agttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
    || |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 42362303  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  42362302 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 42362236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151875
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||      
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 11151685  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||| ||||||||||| ||     
T  11151686 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttca 11151784  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  11151785 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 11151875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318177
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36318103  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318104 ggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773562
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36773636  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773635 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Original strand, 17057255 - 17057537
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || |||||||| |  | || |||||||| || |||   ||| |||     
T  17057255 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa- 17057353  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
     ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  17057354 -caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 17057449  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17057450 aagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17057537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Original strand, 17085238 - 17085520
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || |||||||| |  | || |||||||| || |||   ||| |||     
T  17085238 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa- 17085336  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
     ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  17085337 -caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 17085432  T
Q  463 aagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||| |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17085433 aagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17085520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690385
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | | | |||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||      
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttac-aaagggatacaaatg 11690575  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  11690574 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 11690476  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  11690475 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 11690385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||| |||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgtt 26353254  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353253 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 383 - 548
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  383 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttac 481  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  482 aagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggtt 479  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||  |||||||| ||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24398237 - 24398055
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |   |||| |||    
T  24398237 caccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagat 24398138  T
Q  470 acaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398137 acaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162618
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||      
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-agagagatacaaatg 33162544  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162545 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13121899 - 13121769
Alignment:
Q  417 gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaa 515  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||||    
T  13121899 gaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaa 13121802  T
Q  516 ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121801 ccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 548
Target Start/End: Original strand, 42288099 - 42288278
Alignment:
Q  368 agcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaaggg 467  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||      
T  42288099 agcaccaagaaattattgacccagttcggtcc-aacttgacctaatct-ggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttac-aaagaa 42288195  T
Q  468 atacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288196 atacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450671
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactct-gtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |  ||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgaatt 7451188  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  7451187 acaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067305
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| ||||||| ||| || |||||| ||| |||| ||||||||      
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 11067379  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067378 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284930
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 548
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac 528  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  529 ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 39284853 - 39284757
Alignment:
Q  572 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39284853 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 39284757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24198065 - 24197906
Alignment:
Q  380 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaaggt 478  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||| ||   |||| |||||||  |||    
T  24198065 ttgtttacccagttcggcccaaacgtgacctacgtctggagaagata--gatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaag-ggt 24197969  T
Q  479 tacaagaaattagcttg--acaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaa 539  Q
    |||||||||||||| |   |||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  24197968 tacaagaaattagccttcaacaagttctccaagaaaaaactttaatttctacccttttcccaa 24197906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  392 ttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 490  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16388565 - 16388519
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagaga 425  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16388565 attgtttacccagtttggtccaaaaatgacctactctagaggagaga 16388519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 8395967 - 8395489
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  8395967 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacac 8395868  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggg-gagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgtt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8395867 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgtt 8395768  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8395767 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 8395668  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8395667 gaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 8395570  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8395569 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 8395489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 8393758 - 8393280
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  8393758 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 8393659  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggg-gagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgtt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8393658 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgtt 8393559  T
Q  385 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcctacaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8393558 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 8393459  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8393458 gaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 8393361  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8393360 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaggtctctctct 8393280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 7125265 - 7124785
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  7125265 gatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 7125166  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  7125165 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttc 7125066  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  7125065 acccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 7124966  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124965 gaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 7124866  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7124865 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 7124785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 7123046 - 7122566
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  7123046 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 7122947  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  7122946 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacacaaagaaattgttc 7122847  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  7122846 acccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 7122747  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122746 gaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 7122647  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7122646 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 7122566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 5138654 - 5138174
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| |  ||||||||||     
T  5138654 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacat 5138555  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacaca--aaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagatt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || |||  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  5138554 cac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaa--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 5138458  T
Q  382 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtt 479  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  5138457 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtt 5138358  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 578  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  5138357 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggta 5138260  T
Q  579 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5138259 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtttctctct 5138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 5136429 - 5135948
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| |  ||||||||||     
T  5136429 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacat 5136330  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacaca--aaacaaggatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagatt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  || |||  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  5136329 cac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaa--aacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagatt 5136233  T
Q  382 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ctacaaaagggatacaaaaggtt 479  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  5136232 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggtt 5136133  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaa-gttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtg 578  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  5136132 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggta 5136035  T
Q  579 tttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5136034 tttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtttctctct 5135948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 215 - 674
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495611
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatcaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagt 31495241  T
Q  314 gagaaacacaaaaca-------aggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 406  Q
    || || || ||||||       | ||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495242 gaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 31495341  T
Q  407 acctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttc 503  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||    
T  31495342 acctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttc 31495441  T
Q  504 accatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagag 602  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31495442 acaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagag 31495540  T
Q  603 atactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    |  |||||||||||| ||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31495541 aagctctaatcaaag-actataaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 31495611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 198 - 669
Target Start/End: Original strand, 13992114 - 13992582
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13992114 cacaccaatacgaaata-tgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 13992209  T
Q  297 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagtt 393  Q
    ||||||||| | ||| |||| || ||||||  ||||| |  | |||||||||||| || |||||   |||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  13992210 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagca--aaaagataaaaggg-agagaagagagaaacaaacacaccaa-agattgttcacctagtt 13992305  T
Q  394 cggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag- 491  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  13992306 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac--aagagatacaaaagagttacaagaaattaga 13992403  T
Q  492 cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtt 589  Q
     ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||    
T  13992404 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtt 13992502  T
Q  590 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13992503 tcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaagtttctctctcttc 13992582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 56178522 - 56178932
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  56178522 caagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 56178619  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  56178620 acaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 56178717  T
Q  463 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  56178718 aagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 56178816  T
Q  553 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttc 651  Q
    |||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||||||||    
T  56178817 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttacctcctttgatttc 56178914  T
Q  652 ccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| |||||||||||    
T  56178915 ccaagtttctctctcttc 56178932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 381 - 669
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000101
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagtt 29999905  T
Q  480 acaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttta 571  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||       
T  29999906 acaagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcac 30000004  T
Q  572 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30000005 caaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaagtttctctctcttc 30000101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 48143330 - 48142914
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaa----cacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaa 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    |||||||  |  | || ||||||||||| |||  ||||     
T  48143330 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagag 48143233  T
Q  359 gaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcct 458  Q
      |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  48143232 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 48143134  T
Q  459 acaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------ca 547  Q
    |   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||    
T  48143133 a-tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaaca 48143036  T
Q  548 agacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctcccttt 645  Q
    ||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||    
T  48143035 agacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctccttt 48142938  T
Q  646 gatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  48142937 gatttcccaagtttctctctcttc 48142914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 52095248 - 52095658
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| | || || |||||||| |  |  | ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  52095248 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagag--aagagagaa 52095345  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  52095346 acaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttac-a 52095442  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  52095443 aagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 52095541  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
    |||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  52095542 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-tccctcaaccctaaagttacctcctttgattt 52095639  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  52095640 cccaagtttctctctcttc 52095658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370382
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 5370065  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||| ||| |    
T  5370066 acaaacacatcaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttac-a 5370163  T
Q  463 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc----cttttcccaatctcac-------caa 548  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||     |||| ||||||||||       |||    
T  5370164 aagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaa 5370262  T
Q  549 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagct-tctccctttg 646  Q
    |||||||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  5370263 gacactcaatgattttcactcaccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagaga-actataatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttg 5370359  T
Q  647 atttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  5370360 atttctcaagtttctctctcttc 5370382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 9927455 - 9927753
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  9927455 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9927552  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||| ||||| ||     
T  9927553 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttca 9927651  T
Q  567 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  9927652 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctct 9927749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 370 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2209893 - 2209717
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  2209893 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 2209795  T
Q  470 acaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 544  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209794 acaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 671
Target Start/End: Original strand, 34570304 - 34570712
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||||| |||   ||| |||  |||    
T  34570304 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caa 34570401  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  34570402 acacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 34570498  T
Q  467 gatacaa-aaggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||    
T  34570499 gatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 34570597  T
Q  557 atgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttccca 654  Q
    |||||| || ||    |||| ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  34570598 atgattttcactcacccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagctacctcctttgatttccca 34570695  T
Q  655 agtctctctctcttcca 671  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  34570696 agtttctctctgttcca 34570712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739846
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||      
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatg 12739644  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||  |     
T  12739645 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttcca 12739743  T
Q  567 ctttac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||   | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  12739744 ctcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctc 12739841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429551
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||      
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 5429753  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  5429752 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5429654  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  5429653 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaagtttctctc 5429556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggttac 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  482 aagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    || ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 37740903 - 37740498
Alignment:
Q  269 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |||||    
T  37740903 caataatcaacaataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagaggaacaa 37740806  T
Q  367 aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagg 466  Q
    |  ||| || | |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  37740805 acacacaaaaa-attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 37740709  T
Q  467 gatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 556  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       |||||||||||    
T  37740708 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactca 37740610  T
Q  557 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaa 655  Q
     ||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | |  |||||||||||||||    
T  37740609 gtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaacttacctcctttgatttcccaa 37740512  T
Q  656 gtctctctctcttc 669  Q
    || |||||||||||    
T  37740511 gtttctctctcttc 37740498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26364414 - 26364236
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||    
T  26364414 caccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttac-aaagagat 26364317  T
Q  470 acaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364316 acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 669
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175932
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 26175730  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  26175731 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 26175829  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctc 664  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26175830 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacaga-actttaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctc 26175927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||      
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36463483  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463484 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 54883198 - 54883020
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  54883198 caccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagat 54883101  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883100 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 377 - 546
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 46147485  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 546  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147486 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa--ggt 478  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  479 tacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038577
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||| |    
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttac-aaacagatacaaatg 47038505  T
Q  477 gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038506 attacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Original strand, 52082549 - 52082953
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagt-gagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||   || || || ||||| |  | || ||||||||||| |||  ||||   ||    
T  52082549 caagcaataatcaacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 52082646  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||       |||||||||||| ||| |||||    
T  52082647 acaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaa 52082738  T
Q  463 aagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 552  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  52082739 a-gagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaa-ccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 52082836  T
Q  553 ctcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgattt 650  Q
     ||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||    
T  52082837 gtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 52082934  T
Q  651 cccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  52082935 cccaagtttctctctcttc 52082953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 529
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12744019  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744020 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 377 - 529
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||      
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12745408  T
Q  476 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745409 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893810
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 48893732  T
Q  477 -gttacaagaaattagctt-gacaagttc----accatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893733 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 669
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12748052
Alignment:
Q  419 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaac 516  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12747891  T
Q  517 cctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 606  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||  | ||   | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 12747990  T
Q  607 tctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12747991 tctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctcttc 12748052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 379 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-agg 477  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggg 36994596  T
Q  478 ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994595 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc 530  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12119718 - 12119540
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |   |||| |||    
T  12119718 caccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagat 12119620  T
Q  470 acaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 546  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119619 acaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 668
Target Start/End: Original strand, 54199906 - 54200201
Alignment:
Q  379 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-agg 477  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||    
T  54199906 attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 54200002  T
Q  478 ttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 568  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  54200003 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 54200101  T
Q  569 -ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctc 666  Q
        ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  54200102 cacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcctaagtttctctctc 54200199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871704
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||      
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgataaaaatg 5871894  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  5871893 ggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5871795  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  5871794 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccataaccctaaagttacctcctttgatttcccaagt 5871704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  401 aacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  499 agttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    || || | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag 476  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||| |    
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 45687276  T
Q  477 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687277 agttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  480 acaagaaattagctt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 494
Target Start/End: Original strand, 50262690 - 50262814
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  50262690 caccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagat 50262788  T
Q  470 acaaa-aggttacaagaaattagctt 494  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
T  50262789 acaaatgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542349
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-tt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |     
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaaggcta 6542277  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542278 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 545
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467519
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||      
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattac-aaagtgatacaaatg 52467448  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 545  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52467449 ggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcac 52467519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 548
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||      
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 27417059  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417060 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa-agggatacaaaaggtt 479  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||  ||| ||| ||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||| ||||| |||| | |||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587958
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggtt 479  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 4588029  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| | || | ||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4588028 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 541
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa-agggatacaaaaggtt 479  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  ||||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaag-ggtt 5207940  T
Q  480 acaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 541  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662496
Alignment:
Q  389 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 487  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  488 ttagctt 494  Q
    |||||||    
T  35662502 ttagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 529
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  421 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccc 518  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12744184  T
Q  519 taatttctacc 529  Q
    |||||||||||    
T  12744185 taatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 548
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  421 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccc 518  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12745573  T
Q  519 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474150
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   |||||||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||| | |||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagtt 31474221  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||  | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474220 acaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 533
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaag 484  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||| ||| || |||||| |   |||| |||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  485 aaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt 533  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29254758 - 29254580
Alignment:
Q  282 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |  | || |||||||| || |||   ||| |||  ||||  |||||| ||||    
T  29254758 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaa--caaacacaccaa-agat 29254662  T
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29254661 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 29254580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 474
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009536
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa 474  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 592 - 669
Target Start/End: Original strand, 52093885 - 52093960
Alignment:
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52093885 caacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttc 52093960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  431 ctctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac 528  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  529 cc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913534
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaa 463  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  405 tgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 494  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||  |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 543
Target Start/End: Original strand, 44967910 - 44967992
Alignment:
Q  462 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 543  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| || ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967910 aaagagatacaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337064
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtcc-aacttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  480 acaagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089972
Alignment:
Q  407 acctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttc 33089972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21688427 - 21688250
Alignment:
Q  370 caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggat 469  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||| ||||| || |  ||| |||    
T  21688427 caccaagaaattgttgactcaattcggtctaa-cttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagtt-cttccgaagagat 21688330  T
Q  470 acaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcacc 546  Q
    ||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21688329 acaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcacc 21688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29056610 - 29056573
Alignment:
Q  290 ctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaac 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29056610 ctagatctaatctaggaatcaagtgaaaaacacaaaac 29056573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 544
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  476 ggttacaagaaattagcttga-caagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 544  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 665
Target Start/End: Original strand, 2409 - 2887
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||||||||    
T  2409 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 2508  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttc 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  2509 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaaagattgttc 2608  T
Q  386 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  2609 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaa 2708  T
Q  484 gaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2709 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 2806  T
Q  584 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2807 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 2887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 214 - 665
Target Start/End: Original strand, 3557 - 4009
Alignment:
Q  214 aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 312  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3557 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 3656  T
Q  313 tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 411  Q
    || |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3657 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 3756  T
Q  412 ctctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcaccatg 509  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3757 ctctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatg 3856  T
Q  510 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 609  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3857 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 3954  T
Q  610 aatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctct 665  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3955 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctct 4009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 190 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6150
Alignment:
Q  190 gatcgaaccacaccaatacaaa--agaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||| ||||    
T  6638 gatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaatacac 6539  T
Q  287 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaa---ggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgt 383  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||     
T  6538 cacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacacaaagagattgg 6439  T
Q  384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcct-acaaaagggatacaaaaggttac 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  | ||||    
T  6438 tcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttac 6339  T
Q  482 aagaaattagcttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6338 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 6241  T
Q  582 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttgcccctttgatttcccaagtctctctctcttccaac 6150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Original strand, 10979 - 11463
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||   | | ||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10979 aaccacaccaatacaaa-gtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatga-ctaagtgggtg--caagcaataatcaacaataacaacacctag 11074  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 390  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11075 atctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaag---cacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcaccca 11170  T
Q  391 gttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11171 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaatt 11270  T
Q  490 ag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    ||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   |||||||||    
T  11271 agattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtt 11369  T
Q  581 tcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    | | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11370 tacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 11463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 195 - 674
Target Start/End: Original strand, 8553 - 9037
Alignment:
Q  195 aaccacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctag 293  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||| |||||||   | | ||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8553 aaccacaccaatacaaa-gtatgatacgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatga-ctaagtgggtg--caagcaataatcaacaataacaacacctag 8648  T
Q  294 atctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcaccca 390  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||   |||||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  8649 atctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaag---cacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-agattgttcaccca 8744  T
Q  391 gttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8745 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaatt 8844  T
Q  490 ag-cttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 580  Q
    ||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||| ||  | ||   |||||| ||    
T  8845 agattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatggtttacactcaccaaggtctt 8943  T
Q  581 tcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaact 674  Q
    | | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8944 tacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaagcctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaact 9037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 215 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 434863 - 434405
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-g 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||   |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  434863 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattattaaa---gtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaag 434767  T
Q  313 tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 412  Q
    ||| || |||||||||   | ||||||||||||||| || |||||   |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434766 tgaaaagcacaaaacaca-agcacaagataaaaggg-agagaagagagaaacaaacacaccaa-atattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 434670  T
Q  413 tctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatga 510  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  434669 tctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaga 434571  T
Q  511 acaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaag 600  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  434570 ac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaag 434472  T
Q  601 agatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  434471 aga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttc 434405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 265 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1198 - 789
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaa--acaaggatcacaagataaaaggggagggaagaaga 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||  |||||   || |  |||||||| |||  ||||       
T  1198 caagcaataatcaacaataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaaccacaag---caaagtataaaaggagag--aagagag 1104  T
Q  361 aaacaaaag-caccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttccta 459  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |     
T  1103 aaacaaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt- 1006  T
Q  460 caaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caag 549  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      ||||    
T  1005 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaag 908  T
Q  550 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgat 648  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  907 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctgcctttgat 810  T
Q  649 ttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  809 ttcccaagtttctctctcttc 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11895 - 11557
Alignment:
Q  215 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagat-ctaatctaggaa-acaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11895 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatactaatctaggaatacaa 11799  T
Q  312 -gtg----agaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 406  Q
     |||    | |||||  |||  |  | ||||||||||||||| || |||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11798 agtggaaaaaaaacaataaaacacaagcacaagataaaaggg-agagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 11700  T
Q  407 acctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttca 504  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11699 acctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttca 11601  T
Q  505 ccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11600 caaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22216
Alignment:
Q  598 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttc 22216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 214 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 1
Alignment:
Q  214 aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gttcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 312  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 103  T
Q  313 tgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 411  Q
    || |||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 3  T
Q  412 ct 413  Q
    ||    
T  2 ct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 114949 - 114602
Alignment:
Q  198 cacaccaatacaaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgttcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 296  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||   | ||||  |||    ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  114949 cacaccaatacaaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataacca-atatcaaa--gtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatc 114853  T
Q  297 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttcacccagttcg 395  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||  |  | |||||||||  |||| |||||   ||||||   |||||| |||||||||| ||||||||    
T  114852 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaa--ggagagaagagagaaacaagcacaccaa-agattgttcatccagttcg 114756  T
Q  396 gtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-t 493  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  114755 gtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctt 114657  T
Q  494 tgacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  114656 tgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Original strand, 20301 - 20583
Alignment:
Q  265 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaaaacaaggatcacaagataaaaggggagggaagaagaaa 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |  | || ||||||||  ||||| |||||    |    
T  20301 caagcaataattaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--gggagagaagagagga 20398  T
Q  363 acaaaagcaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaa 462  Q
    |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  20399 acaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttac-a 20495  T
Q  463 aagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 548  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20496 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 669
Target Start/End: Original strand, 20636 - 20711
Alignment:
Q  592 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagtctctctctcttc 669  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20636 caacccaagata-actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccaaagtttctctctcttc 20711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-aggtt 479  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 548
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaag-gtt 479  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  480 acaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 548  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10546
Alignment:
Q  381 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaaa-ggtt 479  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  480 acaagaaattagc 492  Q
    |||| ||||||||    
T  10558 acaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 657
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149381
Alignment:
Q  377 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcctacaaaagggatacaaa-a 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||      
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 149191  T
Q  476 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcaccatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 566  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  149192 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 149290  T
Q  567 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctaaagcttctccctttgatttcccaagt 657  Q
    ||    |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||| | |  |||||||||||||||||    
T  149291 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaagt 149381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University